Fixes for some mem-leaks: most changes where pretty basic (i.e. adding deletes).
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCseed.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16
17
18
19 //-----------------------------------------------------------------
20 //           Implementation of the TPC seed class
21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
23 //-----------------------------------------------------------------
24 #include "TClonesArray.h"
25 #include "AliTPCseed.h"
26 #include "AliTPCReconstructor.h"
27
28 ClassImp(AliTPCseed)
29
30
31
32 AliTPCseed::AliTPCseed():
33   AliTPCtrack(),
34   fEsd(0x0),
35   fClusterOwner(kFALSE),
36   fPoints(0x0),
37   fEPoints(0x0),
38   fRow(0),
39   fSector(-1),
40   fRelativeSector(-1),
41   fCurrentSigmaY2(1e10),
42   fCurrentSigmaZ2(1e10),
43   fErrorY2(1e10),
44   fErrorZ2(1e10),
45   fCurrentCluster(0x0),
46   fCurrentClusterIndex1(-1),
47   fInDead(kFALSE),
48   fIsSeeding(kFALSE),
49   fNoCluster(0),
50   fSort(0),
51   fBSigned(kFALSE),
52   fSeedType(0),
53   fSeed1(-1),
54   fSeed2(-1),
55   fMAngular(0),
56   fCircular(0),
57   fClusterMap(159),
58   fSharedMap(159)
59 {
60   //
61   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
62   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
63   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
64   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
65   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
66     fDEDX[i] = 0.;
67     fSDEDX[i] = 1e10;
68     fNCDEDX[i] = 0;
69   }
70   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
71   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
72   for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
73 }
74
75 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
76   AliTPCtrack(s),
77   fEsd(0x0),
78   fClusterOwner(clusterOwner),
79   fPoints(0x0),
80   fEPoints(0x0),
81   fRow(0),
82   fSector(-1),
83   fRelativeSector(-1),
84   fCurrentSigmaY2(1e10),
85   fCurrentSigmaZ2(1e10),
86   fErrorY2(1e10),
87   fErrorZ2(1e10),
88   fCurrentCluster(0x0),
89   fCurrentClusterIndex1(-1),
90   fInDead(kFALSE),
91   fIsSeeding(kFALSE),
92   fNoCluster(0),
93   fSort(0),
94   fBSigned(kFALSE),
95   fSeedType(0),
96   fSeed1(-1),
97   fSeed2(-1),
98   fMAngular(0),
99   fCircular(0),
100   fClusterMap(s.fClusterMap),
101   fSharedMap(s.fSharedMap)
102 {
103   //---------------------
104   // dummy copy constructor
105   //-------------------------
106   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
107     fClusterPointer[i]=0;
108     if (fClusterOwner){
109       if (s.fClusterPointer[i])
110         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
111     }else{
112       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
113     }
114     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
115   }
116   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
117   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
118   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
119     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
120     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
121     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
122   }
123   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
124
125 }
126
127
128 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
129   AliTPCtrack(t),
130   fEsd(0x0),
131   fClusterOwner(kFALSE),
132   fPoints(0x0),
133   fEPoints(0x0),
134   fRow(0),
135   fSector(-1),
136   fRelativeSector(-1),
137   fCurrentSigmaY2(1e10),
138   fCurrentSigmaZ2(1e10),
139   fErrorY2(1e10),
140   fErrorZ2(1e10),
141   fCurrentCluster(0x0),
142   fCurrentClusterIndex1(-1),
143   fInDead(kFALSE),
144   fIsSeeding(kFALSE),
145   fNoCluster(0),
146   fSort(0),
147   fBSigned(kFALSE),
148   fSeedType(0),
149   fSeed1(-1),
150   fSeed2(-1),
151   fMAngular(0),
152   fCircular(0),
153   fClusterMap(159),
154   fSharedMap(159)
155 {
156   //
157   // Constructor from AliTPCtrack
158   //
159   fFirstPoint =0;
160   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
161   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
162     fClusterPointer[i] = 0;
163     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
164     if (index>=-1){ 
165       SetClusterIndex2(i,index);
166     }
167     else{
168       SetClusterIndex2(i,-3); 
169     }    
170   }
171   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
172     fDEDX[i] = 0.;
173     fSDEDX[i] = 1e10;
174     fNCDEDX[i] = 0;
175   }
176   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
177   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
178   for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
179 }
180
181 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
182                        const Double_t cc[15], Int_t index):      
183   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
184   fEsd(0x0),
185   fClusterOwner(kFALSE),
186   fPoints(0x0),
187   fEPoints(0x0),
188   fRow(0),
189   fSector(-1),
190   fRelativeSector(-1),
191   fCurrentSigmaY2(1e10),
192   fCurrentSigmaZ2(1e10),
193   fErrorY2(1e10),
194   fErrorZ2(1e10),
195   fCurrentCluster(0x0),
196   fCurrentClusterIndex1(-1),
197   fInDead(kFALSE),
198   fIsSeeding(kFALSE),
199   fNoCluster(0),
200   fSort(0),
201   fBSigned(kFALSE),
202   fSeedType(0),
203   fSeed1(-1),
204   fSeed2(-1),
205   fMAngular(0),
206   fCircular(0),
207   fClusterMap(159),
208   fSharedMap(159)
209 {
210   //
211   // Constructor
212   //
213   fFirstPoint =0;
214   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
215   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
216   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
217   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
218     fDEDX[i] = 0.;
219     fSDEDX[i] = 1e10;
220     fNCDEDX[i] = 0;
221   }
222   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
223 }
224
225 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
226   //
227   // destructor
228   if (fPoints) delete fPoints;
229   fPoints =0;
230   if (fEPoints) delete fEPoints;
231   fEPoints = 0;
232   fNoCluster =0;
233   if (fClusterOwner){
234     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
235       delete fClusterPointer[icluster];
236     }
237   }
238   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
239   for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
240 }
241 //_________________________________________________
242 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
243 {
244   //
245   // assignment operator 
246   //
247   if(this!=&param){
248     AliTPCtrack::operator=(param);
249     fEsd =param.fEsd; 
250     for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i]; // this is not allocated by AliTPCSeed
251     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
252     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
253     // but deleted in the dtor... strange...
254     // fPoints =
255     // fEPoints =
256     fRow            = param.fRow;
257     fSector         = param.fSector;
258     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
259     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
260     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
261     fErrorY2        = param.fErrorY2;
262     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
263     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
264     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1; 
265     fInDead         = param.fInDead;
266     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
267     fNoCluster      = param.fNoCluster;
268     fSort           = param.fSort;
269     fBSigned        = param.fBSigned;
270     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
271       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
272       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
273       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
274     }
275     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
276     
277     fSeedType = param.fSeedType;
278     fSeed1    = param.fSeed1;
279     fSeed2    = param.fSeed2;
280     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
281     fMAngular = param.fMAngular;
282     fCircular = param.fCircular;
283     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
284     fClusterMap = param.fClusterMap;
285     fSharedMap = param.fSharedMap;
286   }
287   return (*this);
288 }
289 //____________________________________________________
290 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
291 {
292   //
293   // 
294   return &fTrackPoints[i];
295 }
296
297 void AliTPCseed::RebuildSeed()
298 {
299   //
300   // rebuild seed to be ready for storing
301   AliTPCclusterMI cldummy;
302   cldummy.SetQ(0);
303   AliTPCTrackPoint pdummy;
304   pdummy.GetTPoint().SetShared(10);
305   for (Int_t i=0;i<160;i++){
306     AliTPCclusterMI * cl0 = fClusterPointer[i];
307     AliTPCTrackPoint *trpoint = (AliTPCTrackPoint*)fPoints->UncheckedAt(i);     
308     if (cl0){
309       trpoint->GetTPoint() = *(GetTrackPoint(i));
310       trpoint->GetCPoint() = *cl0;
311       trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
312     }
313     else{
314       *trpoint = pdummy;
315       trpoint->GetCPoint()= cldummy;
316     }
317     
318   }
319
320 }
321
322
323 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
324 {
325   //
326   //
327   // return cluster for n rows bellow first point
328   Int_t nfoundable = 1;
329   Int_t nfound      = 1;
330   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
331     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
332     if (index!=-1) nfoundable++;
333     if (index>0) nfound++;
334   }
335   if (nfoundable<n) return 0;
336   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
337
338 }
339
340
341 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
342 {
343   // get cluster stat.  on given region
344   //
345   found       = 0;
346   foundable   = 0;
347   shared      =0;
348   for (Int_t i=first;i<last; i++){
349     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
350     if (index!=-1) foundable++;
351     if (fClusterPointer[i]) {
352       found++;
353     }
354     else 
355       continue;
356
357     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
358       shared++;
359       continue;
360     }
361     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
362     //
363     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
364       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
365         shared++;
366         continue;
367       }
368     }
369     if ( fClusterPointer[i+1]){
370       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
371         shared++;
372         continue;
373       }
374     }
375     
376   }
377   //if (shared>found){
378     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
379   //}
380 }
381
382
383
384
385
386 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
387 {
388   //
389   //
390   SetNumberOfClusters(0);
391   fNFoundable = 0;
392   SetChi2(0);
393   ResetCovariance(10.);
394   /*
395   if (fTrackPoints){
396     for (Int_t i=0;i<8;i++){
397       delete [] fTrackPoints[i];
398     }
399     delete fTrackPoints;
400     fTrackPoints =0;
401   }
402   */
403
404   if (all){   
405     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
406     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
407   }
408
409 }
410
411
412 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
413 {
414
415   //------------------------------------------------------------------
416   //This function makes a track forget its history :)  
417   //------------------------------------------------------------------
418   if (factor<=0) {
419     ResetCovariance(10.);
420     return;
421   }
422   ResetCovariance(factor);
423
424   SetNumberOfClusters(0);
425   fNFoundable =0;
426   SetChi2(0);
427   fRemoval = 0;
428   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
429   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
430   fNoCluster     = 0;
431   //fFirstPoint = 160;
432   //fLastPoint  = 0;
433 }
434
435
436
437
438 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
439 {
440   //-----------------------------------------------------------------
441   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
442   // doesn't change internal state of the track
443   //-----------------------------------------------------------------
444   
445   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
446
447   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {   
448     return 0;
449   }
450
451   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
452   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt(1.- c1*c1);
453   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt(1.- c2*c2);
454   
455   y = GetY();
456   z = GetZ();
457   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
458   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
459   
460   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
461   Double_t dz = 0;
462   //
463   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
464   /*
465   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
466     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
467   }else{
468     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
469   }
470   */
471   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
472   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
473   //
474   y+=dy;
475   z+=dz;
476   
477
478   return 1;  
479 }
480
481
482 //_____________________________________________________________________________
483 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const 
484 {
485   //-----------------------------------------------------------------
486   // This function calculates a predicted chi2 increment.
487   //-----------------------------------------------------------------
488   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
489   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
490   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
491 }
492
493 //_________________________________________________________________________________________
494
495
496 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
497   //-----------------------------------------------------------------
498   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
499   //-----------------------------------------------------------------
500   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
501
502   if (fSort == 0){
503     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
504     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
505     Double_t z2 = t->GetZ();
506     Double_t z1 = GetZ();
507     if (z2>z1) return 1;
508     if (z2<z1) return -1;
509     return 0;
510   }
511   else {
512     Float_t f2 =1;
513     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
514     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
515
516     Float_t f1 =1;
517     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
518
519     if (fBConstrain)   f1=1.2;
520  
521     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
522     else return +1;
523   }
524 }
525
526
527
528
529 //_____________________________________________________________________________
530 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t /*index*/)
531 {
532   //-----------------------------------------------------------------
533   // This function associates a cluster with this track.
534   //-----------------------------------------------------------------
535   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
536   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
537
538   if (!AliExternalTrackParam::Update(p,cov)) return kFALSE;
539
540   Int_t n=GetNumberOfClusters();
541   //  fIndex[n]=index;
542   SetNumberOfClusters(n+1);
543   SetChi2(GetChi2()+chisq);
544
545   return kTRUE;
546 }
547
548
549
550 //_____________________________________________________________________________
551 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
552   //-----------------------------------------------------------------
553   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
554   //-----------------------------------------------------------------
555
556   Float_t amp[200];
557   Float_t angular[200];
558   Float_t weight[200];
559   Int_t index[200];
560   //Int_t nc = 0;
561   //  TClonesArray & arr = *fPoints; 
562   Float_t meanlog = 100.;
563   
564   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
565   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
566   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
567   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
568   //
569   //
570   fNShared =0;
571
572   for (Int_t of =0; of<4; of++){    
573     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
574       {
575         Int_t index = fIndex[i];
576         if (index<0||index&0x8000) continue;
577
578         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
579         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
580         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
581         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
582         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
583
584         if (point==0) continue;
585         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
586         if (cl==0) continue;    
587         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
588         if (cl->IsUsed(11)) {
589           fNShared++;
590           continue;
591         }
592         Int_t   type   = cl->GetType();
593         //if (point->fIsShared){
594         //  fNShared++;
595         //  continue;
596         //}
597         //if (pointm) 
598         //  if (pointm->fIsShared) continue;
599         //if (pointp) 
600         //  if (pointp->fIsShared) continue;
601
602         if (type<0) continue;
603         //if (type>10) continue;       
604         //if (point->GetErrY()==0) continue;
605         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
606
607         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
608         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
609         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue; 
610
611
612         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
613         if (cl->GetMax()<5) continue;
614         Float_t angley = point->GetAngleY();
615         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
616
617         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
618         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
619         /*
620         Float_t ns = 1.;
621         if (pointm){
622           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
623           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
624           ns+=1.;
625         }
626         if (pointp){
627           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
628           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
629           ns+=1.;
630         }
631         rsigmay/=ns;
632         rsigmaz/=ns;
633         */
634
635         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
636
637         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
638         if (i>64){
639           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
640           ampc = 1.*cl->GetMax();
641           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();          
642           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
643           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
644           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
645           //Float_t dz = 
646           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
647           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
648           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
649           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
650           //ampc               *=zfactor; 
651         }
652         else{ 
653           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax(); 
654           ampc = 1.0*cl->GetMax(); 
655           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ(); 
656           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
657           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
658           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
659           //Float_t dz = 
660           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
661
662           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
663           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
664           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
665           //ampc               *=zfactor; 
666
667         }
668         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
669         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
670         Float_t w      =  1.;
671         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5); 
672         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
673         if (i<64) {
674           ampc /= 0.6;
675           //ampc /= (1+0.0008*z);
676         } else
677           if (i>128){
678             ampc /=1.5;
679             //ampc /= (1+0.0008*z);
680           }else{
681             //ampc /= (1+0.0008*z);
682           }
683         
684         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
685           // w*= 2.;
686           
687           continue;
688         }
689         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
690         amp[nc[of]]        = ampc;
691         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
692         weight[nc[of]]     = w;
693         nc[of]++;
694       }
695     
696     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
697     Float_t sumamp=0;
698     Float_t sumamp2=0;
699     Float_t sumw=0;
700     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
701     meanlog = 50;
702     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
703       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
704       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
705       //
706       sumw    += weight[index[i]]; 
707       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
708       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
709       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
710     }
711     if (sumw<1){ 
712       SetdEdx(0);  
713     }
714     else {
715       norm[of] /= sumw;
716       mean[of]  = sumamp/sumw;
717       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
718       if (sigma[of]>0.1) 
719         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
720       else
721         sigma[of] = 1000;
722       
723     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
724     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
725     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
726     }
727   }
728
729   Float_t dedx =0;
730   fSdEdx =0;
731   fMAngular =0;
732   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
733   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
734
735   
736   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/ 
737   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
738
739   Int_t norm2 = 0;
740   Int_t norm3 = 0;
741   for (Int_t i =0;i<4;i++){
742     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
743       dedx      += mean[i] *nc[i];
744       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
745       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
746       norm2     += nc[i];
747       norm3     += nc[i]-2;
748     }
749     fDEDX[i]  = mean[i];             
750     fSDEDX[i] = sigma[i];            
751     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
752   }
753
754   if (norm3>0){
755     dedx   /=norm2;
756     fSdEdx /=norm3;
757     fMAngular/=norm2;
758   }
759   else{
760     SetdEdx(0);
761     return 0;
762   }
763   //  Float_t dedx1 =dedx;
764   /*
765   dedx =0;
766   for (Int_t i =0;i<4;i++){
767     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
768       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
769       dedx      += mean[i] *nc[i];
770     }
771     fDEDX[i]  = mean[i];                
772   }
773   dedx /= norm2;
774   */
775
776   
777   SetdEdx(dedx);
778   return dedx;
779 }
780 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
781   //
782   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
783   //
784   Double_t bg2=bg*bg;
785   Double_t bethe;
786   if (bg<3.5e1) 
787     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
788   else // Density effect ( approximately :) 
789     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
790   return bethe/11.091;
791 }
792
793 void AliTPCseed::CookPID()
794 {
795   //
796   // cook PID information according dEdx
797   //
798   Double_t fRange = 10.;
799   Double_t fRes   = 0.1;
800   Double_t fMIP   = 47.;
801   //
802   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
803   Double_t sumr =0;
804   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
805     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
806     Double_t mom=GetP();
807     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
808     Double_t bethe=Bethe(mom/mass); 
809     Double_t sigma=fRes*bethe;
810     if (sigma>0.001){
811       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
812         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
813         sumr+=fTPCr[j];
814         continue;
815       }
816       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
817       sumr+=fTPCr[j];
818     }
819     else{
820       fTPCr[j]=1.;
821       sumr+=fTPCr[j];
822     }
823   }
824   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
825     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
826   }
827 }
828
829 /*
830 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
831   //-----------------------------------------------------------------
832   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
833   //-----------------------------------------------------------------
834
835   Float_t amp[200];
836   Float_t angular[200];
837   Float_t weight[200];
838   Int_t index[200];
839   Bool_t inlimit[200];
840   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
841   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
842   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
843   
844
845   //
846   Float_t meanlog = 100.;
847   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
848
849   Float_t amean     =0;
850   Float_t asigma    =0;
851   Float_t anc       =0;
852   Float_t anorm     =0;
853
854   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
855   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
856   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
857   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
858   //
859   //
860   fNShared =0;
861
862   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){    
863   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
864   for (Int_t i =0; i<160;i++)
865     {
866         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
867         if (point==0) continue;
868         if (point->fIsShared){
869           fNShared++;     
870           continue;
871         }
872         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
873         if (type<0) continue;
874         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
875         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
876         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
877         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
878         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
879         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
880
881         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
882         if (i>64){
883           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
884         }
885         else{ 
886           ampc = point->GetCPoint().GetMax(); 
887         }
888         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
889         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
890
891         Float_t w      =  1.;
892         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
893         if (i<64) {
894           ampc /= 0.63;
895         } else
896           if (i>128){
897             ampc /=1.51;
898           }             
899         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight                 
900           continue;
901         }
902         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
903         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
904         amp[i]        = ampc/angular[i];
905         weight[i]     = w;
906         anc++;
907     }
908
909   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
910   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){      
911     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
912   }
913   
914   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
915   meanlog =10000.;
916   for (Int_t of =0; of<3; of++){    
917     Float_t sumamp=0;
918     Float_t sumamp2=0;
919     Float_t sumw=0;    
920    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
921       {
922         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
923         Float_t ampl      = amp[i];
924         ///angular[i];
925         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
926         //
927         sumw    += weight[i]; 
928         sumamp  += weight[i]*ampl;
929         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
930         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
931         nc[of]++;
932       }
933    if (sumw<1){ 
934      SetdEdx(0);  
935    }
936    else {
937      norm[of] /= sumw;
938      mean[of]  = sumamp/sumw;
939      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
940      if (sigma[of]>0.1) 
941        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
942      else
943        sigma[of] = 1000;      
944      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
945    }
946   }
947     
948   Float_t dedx =0;
949   fSdEdx =0;
950   fMAngular =0;
951   //
952   Int_t norm2 = 0;
953   Int_t norm3 = 0;
954   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
955   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
956
957   for (Int_t i =0;i<3;i++){
958     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
959       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
960       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
961       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
962       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
963       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
964     }
965     fDEDX[i]  = mean[i];             
966     fSDEDX[i] = sigma[i];            
967     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
968   }
969
970   if (norm3>0){
971     dedx   /=norm2;
972     fSdEdx /=norm3;
973     fMAngular/=norm2;
974   }
975   else{
976     SetdEdx(0);
977     return;
978   }
979   //  Float_t dedx1 =dedx;
980   
981   dedx =0;
982   Float_t norm4 = 0;
983   for (Int_t i =0;i<3;i++){
984     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
985       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
986       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
987       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
988     }
989     fDEDX[i]  = mean[i];                
990   }
991   if (norm4>0) dedx /= norm4;
992   
993
994   
995   SetdEdx(dedx);
996     
997   //mi deDX
998
999 }
1000 */
1001 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
1002 //-----------------------------------------------------------------
1003 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
1004 //-----------------------------------------------------------------
1005   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
1006     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt(1.- c1*c1);
1007     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
1008     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
1009     Double_t r2=TMath::Sqrt(1.- c2*c2);
1010     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
1011 }
1012
1013 void AliTPCseed::SetClusterMapBit(int ibit, Bool_t state)
1014 {
1015   fClusterMap[ibit] = state;
1016 }
1017 Bool_t AliTPCseed::GetClusterMapBit(int ibit)
1018 {
1019   return fClusterMap[ibit];
1020 }
1021 void AliTPCseed::SetSharedMapBit(int ibit, Bool_t state)
1022 {
1023   fSharedMap[ibit] = state;
1024 }
1025 Bool_t AliTPCseed::GetSharedMapBit(int ibit)
1026 {
1027   return fSharedMap[ibit];
1028 }