TPC/AliTPCseed.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17
  18
  19 //-----------------------------------------------------------------
  20 //
  21 //           Implementation of the TPC seed class
  22 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
  23 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
  24 //-----------------------------------------------------------------
  25 #include "TClonesArray.h"
  26 #include "TGraphErrors.h"
  27 #include "AliTPCseed.h"
  28 #include "AliTPCReconstructor.h"
  29 #include "AliTPCClusterParam.h"
  30 #include "AliTPCCalPad.h"
  31 #include "AliTPCCalROC.h"
  32 #include "AliTPCcalibDB.h"
  33 #include "AliTPCParam.h"
  34 #include "AliMathBase.h"
  35 #include "AliTPCTransform.h"
  36 #include "AliSplineFit.h"
  37 #include "AliCDBManager.h"
  38 #include "AliTPCcalibDButil.h"
  39
  40
  41 ClassImp(AliTPCseed)
  42
  43
  44
  45 AliTPCseed::AliTPCseed():
  46   AliTPCtrack(),
  47   fEsd(0x0),
  48   fClusterOwner(kFALSE),
  49   fRow(0),
  50   fSector(-1),
  51   fRelativeSector(-1),
  52   fCurrentSigmaY2(1e10),
  53   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  54   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
  55   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
  56   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
  57   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
  58   //
  59   fErrorY2(1e10),
  60   fErrorZ2(1e10),
  61   fCurrentCluster(0x0),
  62   fCurrentClusterIndex1(-1),
  63   fInDead(kFALSE),
  64   fIsSeeding(kFALSE),
  65   fNoCluster(0),
  66   fSort(0),
  67   fBSigned(kFALSE),
  68   fSeedType(0),
  69   fSeed1(-1),
  70   fSeed2(-1),
  71   fMAngular(0),
  72   fCircular(0),
  73   fPoolID(-1)
  74 {
  75   //
  76   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
  77   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
  78   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
  79   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  80   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
  81     fDEDX[i] = 0.;
  82     fSDEDX[i] = 1e10;
  83     fNCDEDX[i] = 0;
  84     fNCDEDXInclThres[i] = 0;
  85   }
  86   fDEDX[4] = 0;
  87   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
  88 }
  89
  90 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
  91   AliTPCtrack(s),
  92   fEsd(0x0),
  93   fClusterOwner(clusterOwner),
  94   fRow(0),
  95   fSector(-1),
  96   fRelativeSector(-1),
  97   fCurrentSigmaY2(-1),
  98   fCurrentSigmaZ2(-1),
  99   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 100   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 101   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
 102   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 103   fErrorY2(1e10),
 104   fErrorZ2(1e10),
 105   fCurrentCluster(0x0),
 106   fCurrentClusterIndex1(-1),
 107   fInDead(kFALSE),
 108   fIsSeeding(kFALSE),
 109   fNoCluster(0),
 110   fSort(0),
 111   fBSigned(kFALSE),
 112   fSeedType(0),
 113   fSeed1(-1),
 114   fSeed2(-1),
 115   fMAngular(0),
 116   fCircular(0),
 117   fPoolID(-1)
 118 {
 119   //---------------------
 120   // dummy copy constructor
 121   //-------------------------
 122   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 123     fClusterPointer[i]=0;
 124     if (fClusterOwner){
 125       if (s.fClusterPointer[i])
 126         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
 127     }else{
 128       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
 129     }
 130     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
 131   }
 132   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
 133   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
 134   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 135     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
 136     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
 137     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
 138     fNCDEDXInclThres[i] = s.fNCDEDXInclThres[i];
 139   }
 140   fDEDX[4] = s.fDEDX[4];
 141   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
 142
 143 }
 144
 145
 146 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
 147   AliTPCtrack(t),
 148   fEsd(0x0),
 149   fClusterOwner(kFALSE),
 150   fRow(0),
 151   fSector(-1),
 152   fRelativeSector(-1),
 153   fCurrentSigmaY2(-1),
 154   fCurrentSigmaZ2(-1),
 155   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 156   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 157   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
 158   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 159   fErrorY2(1e10),
 160   fErrorZ2(1e10),
 161   fCurrentCluster(0x0),
 162   fCurrentClusterIndex1(-1),
 163   fInDead(kFALSE),
 164   fIsSeeding(kFALSE),
 165   fNoCluster(0),
 166   fSort(0),
 167   fBSigned(kFALSE),
 168   fSeedType(0),
 169   fSeed1(-1),
 170   fSeed2(-1),
 171   fMAngular(0),
 172   fCircular(0),
 173   fPoolID(-1)
 174 {
 175   //
 176   // Constructor from AliTPCtrack
 177   //
 178   fFirstPoint =0;
 179   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 180   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 181     fClusterPointer[i] = 0;
 182     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
 183     if (index>=-1){
 184       SetClusterIndex2(i,index);
 185     }
 186     else{
 187       SetClusterIndex2(i,-3);
 188     }
 189   }
 190   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 191     fDEDX[i] = 0.;
 192     fSDEDX[i] = 1e10;
 193     fNCDEDX[i] = 0;
 194     fNCDEDXInclThres[i] = 0;
 195   }
 196     fDEDX[4] = 0;
 197   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 198 }
 199
 200 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
 201                        const Double_t cc[15], Int_t index):
 202   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
 203   fEsd(0x0),
 204   fClusterOwner(kFALSE),
 205   fRow(0),
 206   fSector(-1),
 207   fRelativeSector(-1),
 208   fCurrentSigmaY2(-1),
 209   fCurrentSigmaZ2(-1),
 210   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 211   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 212   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
 213   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 214   fErrorY2(1e10),
 215   fErrorZ2(1e10),
 216   fCurrentCluster(0x0),
 217   fCurrentClusterIndex1(-1),
 218   fInDead(kFALSE),
 219   fIsSeeding(kFALSE),
 220   fNoCluster(0),
 221   fSort(0),
 222   fBSigned(kFALSE),
 223   fSeedType(0),
 224   fSeed1(-1),
 225   fSeed2(-1),
 226   fMAngular(0),
 227   fCircular(0),
 228   fPoolID(-1)
 229 {
 230   //
 231   // Constructor
 232   //
 233   fFirstPoint =0;
 234   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 235   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 236   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 237   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 238     fDEDX[i] = 0.;
 239     fSDEDX[i] = 1e10;
 240     fNCDEDX[i] = 0;
 241     fNCDEDXInclThres[i] = 0;
 242   }
 243     fDEDX[4] = 0;
 244   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 245 }
 246
 247 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
 248   //
 249   // destructor
 250   fNoCluster =0;
 251   if (fClusterOwner){
 252     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
 253       delete fClusterPointer[icluster];
 254     }
 255   }
 256
 257 }
 258 //_________________________________________________
 259 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
 260 {
 261   //
 262   // assignment operator
 263   // don't touch pool ID
 264   //
 265   if(this!=&param){
 266     AliTPCtrack::operator=(param);
 267     fEsd =param.fEsd;
 268     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
 269     if (!fClusterOwner) for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i];
 270     else                for(Int_t i = 0;i<160;++i) {
 271         delete fClusterPointer[i];
 272         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(param.fClusterPointer[i]));
 273       }
 274     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
 275     // but deleted in the dtor... strange...
 276     fRow            = param.fRow;
 277     fSector         = param.fSector;
 278     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
 279     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
 280     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
 281     fErrorY2        = param.fErrorY2;
 282     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
 283     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
 284     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1;
 285     fInDead         = param.fInDead;
 286     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
 287     fNoCluster      = param.fNoCluster;
 288     fSort           = param.fSort;
 289     fBSigned        = param.fBSigned;
 290     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
 291       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
 292       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
 293       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
 294       fNCDEDXInclThres[i] = param.fNCDEDXInclThres[i];
 295     }
 296       fDEDX[4]   = param.fDEDX[4];
 297     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
 298
 299     fSeedType = param.fSeedType;
 300     fSeed1    = param.fSeed1;
 301     fSeed2    = param.fSeed2;
 302     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
 303     fMAngular = param.fMAngular;
 304     fCircular = param.fCircular;
 305     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
 306   }
 307   return (*this);
 308 }
 309 //____________________________________________________
 310 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
 311 {
 312   //
 313   //
 314   return &fTrackPoints[i];
 315 }
 316
 317
 318
 319 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
 320 {
 321   //
 322   //
 323   // return cluster for n rows bellow first point
 324   Int_t nfoundable = 1;
 325   Int_t nfound      = 1;
 326   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
 327     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 328     if (index!=-1) nfoundable++;
 329     if (index>0) nfound++;
 330   }
 331   if (nfoundable<n) return 0;
 332   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
 333
 334 }
 335
 336
 337 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
 338 {
 339   // get cluster stat.  on given region
 340   //
 341   found       = 0;
 342   foundable   = 0;
 343   shared      =0;
 344   for (Int_t i=first;i<last; i++){
 345     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 346     if (index!=-1) foundable++;
 347     if (index&0x8000) continue;
 348     if (fClusterPointer[i]) {
 349       found++;
 350     }
 351     else
 352       continue;
 353
 354     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
 355       shared++;
 356       continue;
 357     }
 358     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
 359     //
 360     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
 361       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
 362         shared++;
 363         continue;
 364       }
 365     }
 366     if ( fClusterPointer[i+1]){
 367       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
 368         shared++;
 369         continue;
 370       }
 371     }
 372
 373   }
 374   //if (shared>found){
 375     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
 376   //}
 377 }
 378
 379
 380
 381
 382
 383 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 384 {
 385   //
 386   //
 387   SetNumberOfClusters(0);
 388   fNFoundable = 0;
 389   SetChi2(0);
 390   ResetCovariance(10.);
 391   /*
 392   if (fTrackPoints){
 393     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 394       delete [] fTrackPoints[i];
 395     }
 396     delete fTrackPoints;
 397     fTrackPoints =0;
 398   }
 399   */
 400
 401   if (all){
 402     for (Int_t i=200;i--;) SetClusterIndex2(i,-3);
 403     if (!fClusterOwner) for (Int_t i=160;i--;) fClusterPointer[i]=0;
 404     else                for (Int_t i=160;i--;) {delete fClusterPointer[i]; fClusterPointer[i]=0;}
 405   }
 406
 407 }
 408
 409
 410 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 411 {
 412
 413   //------------------------------------------------------------------
 414   //This function makes a track forget its history :)
 415   //------------------------------------------------------------------
 416   if (factor<=0) {
 417     ResetCovariance(10.);
 418     return;
 419   }
 420   ResetCovariance(factor);
 421
 422   SetNumberOfClusters(0);
 423   fNFoundable =0;
 424   SetChi2(0);
 425   fRemoval = 0;
 426   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 427   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 428   fNoCluster     = 0;
 429   //fFirstPoint = 160;
 430   //fLastPoint  = 0;
 431 }
 432
 433
 434
 435
 436 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 437 {
 438   //-----------------------------------------------------------------
 439   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 440   // doesn't change internal state of the track
 441   //-----------------------------------------------------------------
 442
 443   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 444
 445   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 446     return 0;
 447   }
 448
 449   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 450   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt((1.-c1)*(1.+c1));
 451   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt((1.-c2)*(1.+c2));
 452
 453   y = GetY();
 454   z = GetZ();
 455   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 456   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 457
 458   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 459   Double_t dz = 0;
 460   //
 461   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 462   /*
 463   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 464     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 465   }else{
 466     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 467   }
 468   */
 469   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 470   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
 471   //
 472   y+=dy;
 473   z+=dz;
 474
 475
 476   return 1;
 477 }
 478
 479
 480 //_____________________________________________________________________________
 481 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const
 482 {
 483   //-----------------------------------------------------------------
 484   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 485   //-----------------------------------------------------------------
 486   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 487   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 488
 489   Float_t dx = ((AliTPCclusterMI*)c)->GetX()-GetX();
 490   if (TMath::Abs(dx)>0){
 491     Float_t ty = TMath::Tan(TMath::ASin(GetSnp()));
 492     Float_t dy = dx*ty;
 493     Float_t dz = dx*TMath::Sqrt(1.+ty*ty)*GetTgl();
 494     p[0] = c->GetY()-dy;
 495     p[1] = c->GetZ()-dz;
 496   }
 497   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
 498 }
 499
 500 //_________________________________________________________________________________________
 501
 502
 503 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 504   //-----------------------------------------------------------------
 505   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 506   //-----------------------------------------------------------------
 507   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 508
 509   if (fSort == 0){
 510     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 511     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 512     Double_t z2 = t->GetZ();
 513     Double_t z1 = GetZ();
 514     if (z2>z1) return 1;
 515     if (z2<z1) return -1;
 516     return 0;
 517   }
 518   else {
 519     Float_t f2 =1;
 520     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
 521     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 522
 523     Float_t f1 =1;
 524     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
 525
 526     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 527
 528     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 529     else return +1;
 530   }
 531 }
 532
 533
 534
 535
 536 //_____________________________________________________________________________
 537 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t index)
 538 {
 539   //-----------------------------------------------------------------
 540   // This function associates a cluster with this track.
 541   //-----------------------------------------------------------------
 542   Int_t n=GetNumberOfClusters();
 543   Int_t idx=GetClusterIndex(n);    // save the current cluster index
 544
 545   AliTPCclusterMI cl(*(AliTPCclusterMI*)c);  cl.SetSigmaY2(fErrorY2); cl.SetSigmaZ2(fErrorZ2);
 546
 547   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
 548
 549   Float_t ty = TMath::Tan(TMath::ASin(GetSnp()));
 550
 551   if(  parcl ){
 552     Int_t padSize = 0;                          // short pads
 553     if (cl.GetDetector() >= 36) {
 554       padSize = 1;                              // medium pads
 555       if (cl.GetRow() > 63) padSize = 2; // long pads
 556     }
 557     Float_t waveCorr = parcl->GetWaveCorrection( padSize, cl.GetZ(), cl.GetMax(),cl.GetPad(), ty );
 558     cl.SetY( cl.GetY() - waveCorr );
 559   }
 560
 561   Float_t dx = ((AliTPCclusterMI*)c)->GetX()-GetX();
 562   if (TMath::Abs(dx)>0){
 563     Float_t dy = dx*ty;
 564     Float_t dz = dx*TMath::Sqrt(1.+ty*ty)*GetTgl();
 565     cl.SetY(cl.GetY()-dy);
 566     cl.SetZ(cl.GetZ()-dz);
 567   }
 568
 569
 570   if (!AliTPCtrack::Update(&cl,chisq,index)) return kFALSE;
 571
 572   if (fCMeanSigmaY2p30<0){
 573     fCMeanSigmaY2p30= c->GetSigmaY2();   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 574     fCMeanSigmaZ2p30= c->GetSigmaZ2();   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 575     fCMeanSigmaY2p30R = 1;   //! current mean sigma Y2 - mean5%
 576     fCMeanSigmaZ2p30R = 1;   //! current mean sigma Z2 - mean5%
 577   }
 578   //
 579   fCMeanSigmaY2p30= 0.70*fCMeanSigmaY2p30 +0.30*c->GetSigmaY2();
 580   fCMeanSigmaZ2p30= 0.70*fCMeanSigmaZ2p30 +0.30*c->GetSigmaZ2();
 581   if (fCurrentSigmaY2>0){
 582     fCMeanSigmaY2p30R = 0.7*fCMeanSigmaY2p30R  +0.3*c->GetSigmaY2()/fCurrentSigmaY2;
 583     fCMeanSigmaZ2p30R = 0.7*fCMeanSigmaZ2p30R  +0.3*c->GetSigmaZ2()/fCurrentSigmaZ2;
 584   }
 585
 586
 587   SetClusterIndex(n,idx);          // restore the current cluster index
 588   return kTRUE;
 589 }
 590
 591
 592
 593 //_____________________________________________________________________________
 594 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t /* onlyused */) {
 595   //-----------------------------------------------------------------
 596   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 597   //-----------------------------------------------------------------
 598   // CookdEdxAnalytical(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, Int_t returnVal)
 599   AliTPCParam *param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
 600
 601   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
 602   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
 603   Int_t row2 = row1+param->GetNRowUp2();
 604   const AliTPCRecoParam * recoParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform()->GetCurrentRecoParam();
 605   Int_t useTot = 0;
 606   if (recoParam) useTot = (recoParam->GetUseTotCharge())? 0:1;
 607   //
 608   //
 609   //
 610   fDEDX[0]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,i1  ,i2,   0);
 611   fDEDX[1]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,0   ,row0, 0);
 612   fDEDX[2]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row0,row1, 0);
 613   fDEDX[3]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row1,row2, 0);
 614   fDEDX[4]      = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row0,row2, 0); // full OROC truncated mean
 615   //
 616   fSDEDX[0]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,i1  ,i2,   1);
 617   fSDEDX[1]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,0   ,row0, 1);
 618   fSDEDX[2]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row0,row1, 1);
 619   fSDEDX[3]     = CookdEdxAnalytical(low,up,useTot ,row1,row2, 1);
 620   //
 621   fNCDEDX[0]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, i1  , i2));
 622   fNCDEDX[1]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, 0   , row0));
 623   fNCDEDX[2]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, row0, row1));
 624   fNCDEDX[3]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 1, row1, row2));
 625   //
 626   fNCDEDXInclThres[0]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, i1  , i2));
 627   fNCDEDXInclThres[1]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, 0   , row0));
 628   fNCDEDXInclThres[2]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, row0, row1));
 629   fNCDEDXInclThres[3]    = TMath::Nint(GetTPCClustInfo(2, 2, row1, row2));
 630   //
 631   SetdEdx(fDEDX[0]);
 632   return fDEDX[0];
 633
 634 //  return CookdEdxNorm(low,up,0,i1,i2,1,0,2);
 635
 636
 637 //   Float_t amp[200];
 638 //   Float_t angular[200];
 639 //   Float_t weight[200];
 640 //   Int_t index[200];
 641 //   //Int_t nc = 0;
 642 //   Float_t meanlog = 100.;
 643
 644 //   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 645 //   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 646 //   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 647 //   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 648 //   //
 649 //   //
 650 //   fNShared =0;
 651
 652 //   Float_t gainGG = 1;
 653 //   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
 654 //     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000.;  //relative gas gain
 655 //   }
 656
 657
 658 //   for (Int_t of =0; of<4; of++){
 659 //     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
 660 //       {
 661 //      Int_t clindex = fIndex[i];
 662 //      if (clindex<0||clindex&0x8000) continue;
 663
 664 //      //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
 665 //      AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
 666 //      //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
 667 //      //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
 668 //      //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
 669
 670 //      if (point==0) continue;
 671 //      AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
 672 //      if (cl==0) continue;
 673 //      if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
 674 //      if (cl->IsUsed(11)) {
 675 //        fNShared++;
 676 //        continue;
 677 //      }
 678 //      Int_t   type   = cl->GetType();
 679 //      //if (point->fIsShared){
 680 //      //  fNShared++;
 681 //      //  continue;
 682 //      //}
 683 //      //if (pointm)
 684 //      //  if (pointm->fIsShared) continue;
 685 //      //if (pointp)
 686 //      //  if (pointp->fIsShared) continue;
 687
 688 //      if (type<0) continue;
 689 //      //if (type>10) continue;
 690 //      //if (point->GetErrY()==0) continue;
 691 //      //if (point->GetErrZ()==0) continue;
 692
 693 //      //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
 694 //      //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
 695 //      //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
 696
 697
 698 //      //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 699 //      if (cl->GetMax()<5) continue;
 700 //      Float_t angley = point->GetAngleY();
 701 //      Float_t anglez = point->GetAngleZ();
 702
 703 //      Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
 704 //      Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
 705 //      /*
 706 //      Float_t ns = 1.;
 707 //      if (pointm){
 708 //        rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
 709 //        rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
 710 //        ns+=1.;
 711 //      }
 712 //      if (pointp){
 713 //        rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
 714 //        rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
 715 //        ns+=1.;
 716 //      }
 717 //      rsigmay/=ns;
 718 //      rsigmaz/=ns;
 719 //      */
 720
 721 //      Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
 722
 723 //      Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 724 //      if (i>64){
 725 //        //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
 726 //        ampc = 1.*cl->GetMax();
 727 //        //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
 728 //        //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 729 //        //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
 730 //        // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 731 //        //Float_t dz =
 732 //        //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 733 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 734 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 735 //        //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 736 //        //ampc               *=zfactor;
 737 //      }
 738 //      else{
 739 //        //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
 740 //        ampc = 1.0*cl->GetMax();
 741 //        //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
 742 //        //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 743 //        // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
 744 //        //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 745 //        //Float_t dz =
 746 //        //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 747
 748 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 749 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 750 //        //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 751 //        //ampc               *=zfactor;
 752
 753 //      }
 754 //      ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 755 //      //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
 756 //      Float_t w      =  1.;
 757 //      //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
 758 //      //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
 759 //      if (i<64) {
 760 //        ampc /= 0.6;
 761 //        //ampc /= (1+0.0008*z);
 762 //      } else
 763 //        if (i>128){
 764 //          ampc /=1.5;
 765 //          //ampc /= (1+0.0008*z);
 766 //        }else{
 767 //          //ampc /= (1+0.0008*z);
 768 //        }
 769
 770 //      if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 771 //        // w*= 2.;
 772
 773 //        continue;
 774 //      }
 775 //      if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 776 //      amp[nc[of]]        = ampc;
 777 //      amp[nc[of]]       /=gainGG;
 778 //      angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 779 //      weight[nc[of]]     = w;
 780 //      nc[of]++;
 781 //       }
 782
 783 //     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
 784 //     Float_t sumamp=0;
 785 //     Float_t sumamp2=0;
 786 //     Float_t sumw=0;
 787 //     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
 788 //     meanlog = 50;
 789 //     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
 790 //       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
 791 //       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 792 //       //
 793 //       sumw    += weight[index[i]];
 794 //       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
 795 //       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
 796 //       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
 797 //     }
 798 //     if (sumw<1){
 799 //       SetdEdx(0);
 800 //     }
 801 //     else {
 802 //       norm[of] /= sumw;
 803 //       mean[of]  = sumamp/sumw;
 804 //       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 805 //       if (sigma[of]>0.1)
 806 //      sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 807 //       else
 808 //      sigma[of] = 1000;
 809
 810 //     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 811 //     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
 812 //     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
 813 //     }
 814 //   }
 815
 816 //   Float_t dedx =0;
 817 //   fSdEdx =0;
 818 //   fMAngular =0;
 819 //   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
 820 //   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
 821
 822
 823 //   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
 824 //   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
 825
 826 //   Int_t norm2 = 0;
 827 //   Int_t norm3 = 0;
 828 //   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 829 //     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 830 //       dedx      += mean[i] *nc[i];
 831 //       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
 832 //       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 833 //       norm2     += nc[i];
 834 //       norm3     += nc[i]-2;
 835 //     }
 836 //     fDEDX[i]  = mean[i];
 837 //     fSDEDX[i] = sigma[i];
 838 //     fNCDEDX[i]= nc[i];
 839 //   }
 840
 841 //   if (norm3>0){
 842 //     dedx   /=norm2;
 843 //     fSdEdx /=norm3;
 844 //     fMAngular/=norm2;
 845 //   }
 846 //   else{
 847 //     SetdEdx(0);
 848 //     return 0;
 849 //   }
 850 //   //  Float_t dedx1 =dedx;
 851 //   /*
 852 //   dedx =0;
 853 //   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 854 //     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 855 //       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 856 //       dedx      += mean[i] *nc[i];
 857 //     }
 858 //     fDEDX[i]  = mean[i];
 859 //   }
 860 //   dedx /= norm2;
 861 //   */
 862
 863
 864 //   SetdEdx(dedx);
 865 //   return dedx;
 866 }
 867
 868 void AliTPCseed::CookPID()
 869 {
 870   //
 871   // cook PID information according dEdx
 872   //
 873   Double_t fRange = 10.;
 874   Double_t fRes   = 0.1;
 875   Double_t fMIP   = 47.;
 876   //
 877   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
 878   Double_t sumr =0;
 879   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 880     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 881     Double_t mom=GetP();
 882     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
 883     Double_t bethe=AliMathBase::BetheBlochAleph(mom/mass);
 884     Double_t sigma=fRes*bethe;
 885     if (sigma>0.001){
 886       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
 887         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
 888         sumr+=fTPCr[j];
 889         continue;
 890       }
 891       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
 892       sumr+=fTPCr[j];
 893     }
 894     else{
 895       fTPCr[j]=1.;
 896       sumr+=fTPCr[j];
 897     }
 898   }
 899   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 900     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
 901   }
 902 }
 903
 904 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
 905 //-----------------------------------------------------------------
 906 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
 907 //-----------------------------------------------------------------
 908   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
 909     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt((1.-c1)*(1.+c1));
 910     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
 911     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
 912     Double_t r2=TMath::Sqrt((1.-c2)*(1.+c2));
 913     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
 914 }
 915
 916
 917
 918 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxNorm(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, Bool_t shapeNorm,Int_t posNorm, Int_t padNorm, Int_t returnVal){
 919
 920   //
 921   // calculates dedx using the cluster
 922   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
 923   // type   -  1 - max charge  or 0- total charge in cluster
 924   //           //2- max no corr 3- total+ correction
 925   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
 926   // shapeNorm - kTRUE  -taken from OCDB
 927   //
 928   // posNorm   - usage of pos normalization
 929   // padNorm   - pad type normalization
 930   // returnVal - 0 return mean
 931   //           - 1 return RMS
 932   //           - 2 return number of clusters
 933   //
 934   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
 935   //
 936   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
 937   AliTPCParam * param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
 938   if (!parcl)  return 0;
 939   if (!param) return 0;
 940   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
 941   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
 942
 943   Float_t amp[160];
 944   Int_t   indexes[160];
 945   Int_t   ncl=0;
 946   //
 947   //
 948   Float_t gainGG      = 1;  // gas gain factor -always enabled
 949   Float_t gainPad     = 1;  // gain map  - used always
 950   Float_t corrShape   = 1;  // correction due angular effect, diffusion and electron attachment
 951   Float_t corrPos     = 1;  // local position correction - if posNorm enabled
 952   Float_t corrPadType = 1;  // pad type correction - if padNorm enabled
 953   Float_t corrNorm    = 1;  // normalization factor - set Q to channel 50
 954   //
 955   //
 956   //
 957   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
 958     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000;  //relative gas gain
 959   }
 960
 961   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
 962   const Float_t kedgey =3.;
 963   //
 964   //
 965   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
 966     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
 967     if (!cluster) continue;
 968     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
 969     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetMax():cluster->GetQ();
 970     Int_t  ipad= 0;
 971     if (irow>=row0) ipad=1;
 972     if (irow>=row1) ipad=2;
 973     //
 974     //
 975     //
 976     AliTPCCalPad * gainMap =  AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor();
 977     if (gainMap) {
 978       //
 979       // Get gainPad - pad by pad calibration
 980       //
 981       Float_t factor = 1;
 982       AliTPCCalROC * roc = gainMap->GetCalROC(cluster->GetDetector());
 983       if (irow < row0) { // IROC
 984         factor = roc->GetValue(irow, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
 985       } else {         // OROC
 986         factor = roc->GetValue(irow - row0, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
 987       }
 988       if (factor>0.5) gainPad=factor;
 989     }
 990     //
 991     //do position and angular normalization
 992     //
 993     if (shapeNorm){
 994       if (type<=1){
 995         //
 996         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
 997         Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
 998         Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
 999
1000         Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
1001         corrShape  = parcl->Qnorm(ipad,type,dr,ty,tz);
1002       }
1003     }
1004
1005     if (posNorm>0){
1006       //
1007       // Do position normalization - relative distance to
1008       // center of pad- time bin
1009       // Work in progress
1010       //      corrPos = parcl->QnormPos(ipad,type, cluster->GetPad(),
1011       //                                cluster->GetTimeBin(), cluster->GetZ(),
1012       //                                cluster->GetSigmaY2(),cluster->GetSigmaZ2(),
1013       //                                cluster->GetMax(),cluster->GetQ());
1014       // scaled response function
1015       Float_t yres0 = parcl->GetRMS0(0,ipad,0,0)/param->GetPadPitchWidth(cluster->GetDetector());
1016       Float_t zres0 = parcl->GetRMS0(1,ipad,0,0)/param->GetZWidth();
1017       //
1018
1019       AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1020       Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
1021       Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
1022
1023       if (type==1) corrPos =
1024         parcl->QmaxCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1025                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,0.4);
1026       if (type==0) corrPos =
1027         parcl->QtotCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1028                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,cluster->GetQ(),2.5,0.4);
1029       if (posNorm==3){
1030         Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
1031         Double_t signtgl = (cluster->GetZ()*point->GetAngleZ()>0)? 1:-1;
1032         Double_t p2 = TMath::Abs(TMath::Sin(TMath::ATan(ty)));
1033         Float_t corrHis = parcl->QnormHis(ipad,type,dr,p2,TMath::Abs(point->GetAngleZ())*signtgl);
1034         if (corrHis>0) corrPos*=corrHis;
1035       }
1036
1037     }
1038
1039     if (padNorm==1){
1040       //taken from OCDB
1041       if (type==0 && parcl->QpadTnorm()) corrPadType = (*parcl->QpadTnorm())[ipad];
1042       if (type==1 && parcl->QpadMnorm()) corrPadType = (*parcl->QpadMnorm())[ipad];
1043
1044     }
1045     if (padNorm==2){
1046       corrPadType  =param->GetPadPitchLength(cluster->GetDetector(),cluster->GetRow());
1047       //use hardwired - temp fix
1048       if (type==0) corrNorm=3.;
1049       if (type==1) corrNorm=1.;
1050     }
1051     //
1052     amp[ncl]=charge;
1053     amp[ncl]/=gainGG;
1054     amp[ncl]/=gainPad;
1055     amp[ncl]/=corrShape;
1056     amp[ncl]/=corrPadType;
1057     amp[ncl]/=corrPos;
1058     amp[ncl]/=corrNorm;
1059     //
1060     ncl++;
1061   }
1062
1063   if (type>3) return ncl;
1064   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1065
1066   if (ncl<10) return 0;
1067
1068   Float_t suma=0;
1069   Float_t suma2=0;
1070   Float_t sumn=0;
1071   Int_t icl0=TMath::Nint(ncl*low);
1072   Int_t icl1=TMath::Nint(ncl*up);
1073   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1074     suma+=amp[indexes[icl]];
1075     suma2+=amp[indexes[icl]]*amp[indexes[icl]];
1076     sumn++;
1077   }
1078   Float_t mean =suma/sumn;
1079   Float_t rms  =TMath::Sqrt(TMath::Abs(suma2/sumn-mean*mean));
1080   //
1081   // do time-dependent correction for pressure and temperature variations
1082   UInt_t runNumber = 1;
1083   Float_t corrTimeGain = 1;
1084   AliTPCTransform * trans = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform();
1085   const AliTPCRecoParam * recoParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform()->GetCurrentRecoParam();
1086   if (trans && recoParam->GetUseGainCorrectionTime()>0) {
1087     runNumber = trans->GetCurrentRunNumber();
1088     //AliTPCcalibDB::Instance()->SetRun(runNumber);
1089     TObjArray * timeGainSplines = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTimeGainSplinesRun(runNumber);
1090     if (timeGainSplines) {
1091       UInt_t time = trans->GetCurrentTimeStamp();
1092       AliSplineFit * fitMIP = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(0);
1093       AliSplineFit * fitFPcosmic = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(1);
1094       if (fitMIP) {
1095         corrTimeGain = AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitMIP, time);/*fitMIP->Eval(time);*/
1096       } else {
1097         if (fitFPcosmic) corrTimeGain = AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitFPcosmic, time);/*fitFPcosmic->Eval(time);*/
1098       }
1099     }
1100   }
1101   mean /= corrTimeGain;
1102   rms /= corrTimeGain;
1103   //
1104   if (returnVal==1) return rms;
1105   if (returnVal==2) return ncl;
1106   return mean;
1107 }
1108
1109 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxAnalytical(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, Int_t returnVal, Int_t rowThres, Int_t mode){
1110
1111   //
1112   // calculates dedx using the cluster
1113   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
1114   // type   -  1 - max charge  or 0- total charge in cluster
1115   //           //2- max no corr 3- total+ correction
1116   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
1117   //
1118   // posNorm   - usage of pos normalization
1119   // returnVal - 0  return mean
1120   //           - 1  return RMS
1121   //           - 2  return number of clusters
1122   //           - 3  ratio
1123   //           - 4  mean upper half
1124   //           - 5  mean  - lower half
1125   //           - 6  third moment
1126   // mode      - 0 - linear
1127   //           - 1 - logatithmic
1128   // rowThres  - number of rows before and after given pad row to check for clusters below threshold
1129   //
1130   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
1131   //
1132   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1133   AliTPCParam * param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
1134   if (!parcl)  return 0;
1135   if (!param) return 0;
1136   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
1137   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
1138
1139   Float_t amp[160];
1140   Int_t   indexes[160];
1141   Int_t   ncl=0;
1142   Int_t   nclBelowThr = 0; // counts number of clusters below threshold
1143   //
1144   //
1145   Float_t gainGG      = 1;  // gas gain factor -always enabled
1146   Float_t gainPad     = 1;  // gain map  - used always
1147   Float_t corrPos     = 1;  // local position correction - if posNorm enabled
1148   //
1149   //
1150   //
1151   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
1152     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000;  //relative gas gain
1153   }
1154   //
1155   // extract time-dependent correction for pressure and temperature variations
1156   //
1157   UInt_t runNumber = 1;
1158   Float_t corrTimeGain = 1;
1159   TObjArray * timeGainSplines = 0x0;
1160   TGraphErrors * grPadEqual = 0x0;
1161   TGraphErrors*  grChamberGain[3]={0x0,0x0,0x0};
1162   //
1163   AliTPCTransform * trans = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform();
1164   const AliTPCRecoParam * recoParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTransform()->GetCurrentRecoParam();
1165   //
1166   if (recoParam->GetNeighborRowsDedx() == 0) rowThres = 0;
1167   //
1168   if (trans) {
1169       runNumber = trans->GetCurrentRunNumber();
1170       //AliTPCcalibDB::Instance()->SetRun(runNumber);
1171       timeGainSplines = AliTPCcalibDB::Instance()->GetTimeGainSplinesRun(runNumber);
1172       if (timeGainSplines && recoParam->GetUseGainCorrectionTime()>0) {
1173         UInt_t time = trans->GetCurrentTimeStamp();
1174         AliSplineFit * fitMIP = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(0);
1175         AliSplineFit * fitFPcosmic = (AliSplineFit *) timeGainSplines->At(1);
1176         if (fitMIP) {
1177           corrTimeGain =  AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitMIP, time); /*fitMIP->Eval(time);*/
1178         } else {
1179           if (fitFPcosmic) corrTimeGain = AliTPCcalibDButil::EvalGraphConst(fitFPcosmic, time); /*fitFPcosmic->Eval(time); */
1180         }
1181         //
1182         if (type==1) grPadEqual = (TGraphErrors * ) timeGainSplines->FindObject("TGRAPHERRORS_MEANQMAX_PADREGIONGAIN_BEAM_ALL");
1183         if (type==0) grPadEqual = (TGraphErrors * ) timeGainSplines->FindObject("TGRAPHERRORS_MEANQTOT_PADREGIONGAIN_BEAM_ALL");
1184         const char* names[3]={"SHORT","MEDIUM","LONG"};
1185         for (Int_t iPadRegion=0; iPadRegion<3; ++iPadRegion)
1186           grChamberGain[iPadRegion]=(TGraphErrors*)timeGainSplines->FindObject(Form("TGRAPHERRORS_MEAN_CHAMBERGAIN_%s_BEAM_ALL",names[iPadRegion]));
1187       }
1188   }
1189
1190   const Float_t kClusterShapeCut = 1.5; // IMPPRTANT TO DO: move value to AliTPCRecoParam
1191   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
1192   const Float_t kedgey =3.;
1193   //
1194   //
1195   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
1196     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
1197     if (!cluster && irow > 1 && irow < 157) {
1198       Bool_t isClBefore = kFALSE;
1199       Bool_t isClAfter  = kFALSE;
1200       for(Int_t ithres = 1; ithres <= rowThres; ithres++) {
1201         AliTPCclusterMI * clusterBefore = GetClusterPointer(irow - ithres);
1202         if (clusterBefore) isClBefore = kTRUE;
1203         AliTPCclusterMI * clusterAfter  = GetClusterPointer(irow + ithres);
1204         if (clusterAfter) isClAfter = kTRUE;
1205       }
1206       if (isClBefore && isClAfter) nclBelowThr++;
1207     }
1208     if (!cluster) continue;
1209     //
1210     //
1211     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
1212     //
1213     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1214     if (point==0) continue;
1215     Float_t rsigmay = TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1216     if (rsigmay > kClusterShapeCut) continue;
1217     //
1218     if (cluster->IsUsed(11)) continue; // remove shared clusters for PbPb
1219     //
1220     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetMax():cluster->GetQ();
1221     Int_t  ipad= 0;
1222     if (irow>=row0) ipad=1;
1223     if (irow>=row1) ipad=2;
1224     //
1225     //
1226     //
1227     AliTPCCalPad * gainMap =  AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor();
1228     if (gainMap) {
1229       //
1230       // Get gainPad - pad by pad calibration
1231       //
1232       Float_t factor = 1;
1233       AliTPCCalROC * roc = gainMap->GetCalROC(cluster->GetDetector());
1234       if (irow < row0) { // IROC
1235         factor = roc->GetValue(irow, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
1236       } else {         // OROC
1237         factor = roc->GetValue(irow - row0, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
1238       }
1239       if (factor>0.3) gainPad=factor;
1240     }
1241     //
1242     // Do position normalization - relative distance to
1243     // center of pad- time bin
1244
1245     Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
1246     Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
1247     Float_t yres0 = parcl->GetRMS0(0,ipad,0,0)/param->GetPadPitchWidth(cluster->GetDetector());
1248     Float_t zres0 = parcl->GetRMS0(1,ipad,0,0)/param->GetZWidth();
1249
1250     yres0 *=parcl->GetQnormCorr(ipad, type,0);
1251     zres0 *=parcl->GetQnormCorr(ipad, type,1);
1252     Float_t effLength=parcl->GetQnormCorr(ipad, type,4)*0.5;
1253     Float_t effDiff  =(parcl->GetQnormCorr(ipad, type,2)+parcl->GetQnormCorr(ipad, type,3))*0.5;
1254     //
1255     if (type==1) {
1256       corrPos = parcl->GetQnormCorr(ipad, type,5)*
1257         parcl->QmaxCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1258                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,effLength,effDiff);
1259       Float_t drm   = 0.5-TMath::Abs(cluster->GetZ()/250.);
1260       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,0)*drm);
1261       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,1)*ty*ty);
1262       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,2)*tz*tz);
1263       //
1264     }
1265     if (type==0) {
1266       corrPos = parcl->GetQnormCorr(ipad, type,5)*
1267         parcl->QtotCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(),
1268                               cluster->GetTimeBin(),ty,tz,yres0,zres0,cluster->GetQ(),2.5,effLength,effDiff);
1269
1270       Float_t drm   = 0.5-TMath::Abs(cluster->GetZ()/250.);
1271       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,0)*drm);
1272       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,1)*ty*ty);
1273       corrPos*=(1+parcl->GetQnormCorr(ipad, type+2,2)*tz*tz);
1274       //
1275     }
1276     //
1277     // pad region equalization outside of cluster param
1278     //
1279     Float_t gainEqualPadRegion = 1;
1280     if (grPadEqual && recoParam->GetUseGainCorrectionTime()>0) gainEqualPadRegion = grPadEqual->Eval(ipad);
1281     //
1282     // chamber-by-chamber equalization outside gain map
1283     //
1284     Float_t gainChamber = 1;
1285     if (grChamberGain[ipad] && recoParam->GetUseGainCorrectionTime()>0) gainChamber = grChamberGain[ipad]->Eval(cluster->GetDetector());
1286     //
1287     amp[ncl]=charge;
1288     amp[ncl]/=gainGG;
1289     amp[ncl]/=gainPad;
1290     amp[ncl]/=corrPos;
1291     amp[ncl]/=gainEqualPadRegion;
1292     amp[ncl]/=gainChamber;
1293     //
1294     ncl++;
1295   }
1296
1297   if (type==2) return ncl;
1298   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1299   //
1300   if (ncl<10) return 0;
1301   //
1302   Double_t * ampWithBelow = new Double_t[ncl + nclBelowThr];
1303   for(Int_t iCl = 0; iCl < ncl + nclBelowThr; iCl++) {
1304     if (iCl < nclBelowThr) {
1305       ampWithBelow[iCl] = amp[indexes[0]];
1306     } else {
1307       ampWithBelow[iCl] = amp[indexes[iCl - nclBelowThr]];
1308     }
1309   }
1310   //printf("DEBUG: %i shit %f", nclBelowThr, amp[indexes[0]]);
1311   //
1312   Float_t suma=0;
1313   Float_t suma2=0;
1314   Float_t suma3=0;
1315   Float_t sumaS=0;
1316   Float_t sumn=0;
1317   // upper,and lower part statistic
1318   Float_t sumL=0, sumL2=0, sumLN=0;
1319   Float_t sumD=0, sumD2=0, sumDN=0;
1320
1321   Int_t icl0=TMath::Nint((ncl + nclBelowThr)*low);
1322   Int_t icl1=TMath::Nint((ncl + nclBelowThr)*up);
1323   Int_t iclm=TMath::Nint((ncl + nclBelowThr)*(low +(up+low)*0.5));
1324   //
1325   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1326     if (ampWithBelow[icl]<0.1) continue;
1327     Double_t camp=ampWithBelow[icl]/corrTimeGain;
1328     if (mode==1) camp= TMath::Log(camp);
1329     if (icl<icl1){
1330       suma+=camp;
1331       suma2+=camp*camp;
1332       suma3+=camp*camp*camp;
1333       sumaS+=TMath::Power(TMath::Abs(camp),1./3.);
1334       sumn++;
1335     }
1336     if (icl>iclm){
1337       sumL+=camp;
1338       sumL2+=camp*camp;
1339       sumLN++;
1340       }
1341     if (icl<=iclm){
1342       sumD+=camp;
1343       sumD2+=camp*camp;
1344       sumDN++;
1345     }
1346   }
1347   //
1348   Float_t mean = 0;
1349   Float_t meanL = 0;
1350   Float_t meanD = 0;           // lower half mean
1351   if (sumn > 1e-30)   mean =suma/sumn;
1352   if (sumLN > 1e-30)  meanL =sumL/sumLN;
1353   if (sumDN > 1e-30)  meanD =(sumD/sumDN);
1354   /*
1355   Float_t mean =suma/sumn;
1356   Float_t meanL = sumL/sumLN;
1357   Float_t meanD =(sumD/sumDN);           // lower half mean
1358   */
1359
1360   Float_t rms = 0;
1361   Float_t mean2=0;
1362   Float_t mean3=0;
1363   Float_t meanS=0;
1364
1365   if(sumn>0){
1366     rms = TMath::Sqrt(TMath::Abs(suma2/sumn-mean*mean));
1367     mean2=suma2/sumn;
1368     mean3=suma3/sumn;
1369     meanS=sumaS/sumn;
1370   }
1371
1372   if (mean2>0) mean2=TMath::Power(TMath::Abs(mean2),1./2.);
1373   if (mean3>0) mean3=TMath::Power(TMath::Abs(mean3),1./3.);
1374   if (meanS>0) meanS=TMath::Power(TMath::Abs(meanS),3.);
1375   //
1376   if (mode==1) mean=TMath::Exp(mean);
1377   if (mode==1) meanL=TMath::Exp(meanL);  // upper truncation
1378   if (mode==1) meanD=TMath::Exp(meanD);  // lower truncation
1379   //
1380   delete [] ampWithBelow;
1381
1382
1383   //
1384   if (returnVal==1) return rms;
1385   if (returnVal==2) return ncl;
1386   if (returnVal==3) return Double_t(nclBelowThr)/Double_t(nclBelowThr+ncl);
1387   if (returnVal==4) return meanL;
1388   if (returnVal==5) return meanD;
1389   if (returnVal==6) return mean2;
1390   if (returnVal==7) return mean3;
1391   if (returnVal==8) return meanS;
1392   return mean;
1393 }
1394
1395
1396
1397
1398 Float_t  AliTPCseed::CookShape(Int_t type){
1399   //
1400   //
1401   //
1402  //-----------------------------------------------------------------
1403   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
1404   //-----------------------------------------------------------------
1405   Float_t means=0;
1406   Float_t meanc=0;
1407   for (Int_t i =0; i<160;i++)    {
1408     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
1409     if (point==0) continue;
1410
1411     AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
1412     if (cl==0) continue;
1413
1414     Float_t rsigmay =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1415     Float_t rsigmaz =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaZ());
1416     Float_t rsigma =   (rsigmay+rsigmaz)*0.5;
1417     if (type==0) means+=rsigma;
1418     if (type==1) means+=rsigmay;
1419     if (type==2) means+=rsigmaz;
1420     meanc++;
1421   }
1422   Float_t mean = (meanc>0)? means/meanc:0;
1423   return mean;
1424 }
1425
1426
1427
1428 Int_t  AliTPCseed::RefitTrack(AliTPCseed *seed, AliExternalTrackParam * parin, AliExternalTrackParam * parout){
1429   //
1430   // Refit the track
1431   // return value - number of used clusters
1432   //
1433   //
1434   const Int_t kMinNcl =10;
1435   AliTPCseed *track=new AliTPCseed(*seed);
1436   Int_t sector=-1;
1437   // reset covariance
1438   //
1439   Double_t covar[15];
1440   for (Int_t i=0;i<15;i++) covar[i]=0;
1441   covar[0]=10.*10.;
1442   covar[2]=10.*10.;
1443   covar[5]=10.*10./(64.*64.);
1444   covar[9]=10.*10./(64.*64.);
1445   covar[14]=1*1;
1446   //
1447
1448   Float_t xmin=1000, xmax=-10000;
1449   Int_t imin=158, imax=0;
1450   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
1451     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1452     if (!c || (track->GetClusterIndex(i) & 0x8000)) continue;
1453     if (sector<0) sector = c->GetDetector();
1454     if (c->GetX()<xmin) xmin=c->GetX();
1455     if (c->GetX()>xmax) xmax=c->GetX();
1456     if (i<imin) imin=i;
1457     if (i>imax) imax=i;
1458   }
1459   if(imax-imin<kMinNcl) {
1460     delete track;
1461     return 0 ;
1462   }
1463   // Not succes to rotate
1464   if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1465     delete track;
1466     return 0;
1467   }
1468   //
1469   //
1470   // fit from inner to outer row
1471   //
1472   AliExternalTrackParam paramIn;
1473   AliExternalTrackParam paramOut;
1474   Bool_t isOK=kTRUE;
1475   Int_t ncl=0;
1476   //
1477   //
1478   //
1479   for (Int_t i=imin; i<=imax; i++){
1480     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1481     if (!c || (track->GetClusterIndex(i) & 0x8000)) continue;
1482     //    if (RejectCluster(c,track)) continue;
1483     sector = (c->GetDetector()%18);
1484     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1485       //continue;
1486     }
1487     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1488     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1489     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1490       isOK=kFALSE;
1491     }
1492     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1493   }
1494   if (!isOK) { delete track; return 0;}
1495   track->AddCovariance(covar);
1496   //
1497   //
1498   //
1499   for (Int_t i=imax; i>=imin; i--){
1500     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1501     if (!c || (track->GetClusterIndex(i) & 0x8000)) continue;
1502     //if (RejectCluster(c,track)) continue;
1503     sector = (c->GetDetector()%18);
1504     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1505       //continue;
1506     }
1507     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1508     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1509     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1510       isOK=kFALSE;
1511     }
1512     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1513   }
1514   //if (!isOK) { delete track; return 0;}
1515   paramIn = *track;
1516   track->AddCovariance(covar);
1517   //
1518   //
1519   for (Int_t i=imin; i<=imax; i++){
1520     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1521     if (!c || (track->GetClusterIndex(i) & 0x8000)) continue;
1522     sector = (c->GetDetector()%18);
1523     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1524       //continue;
1525     }
1526     ncl++;
1527     //if (RejectCluster(c,track)) continue;
1528     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1529     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1530     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1531       isOK=kFALSE;
1532     }
1533     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1534   }
1535   //if (!isOK) { delete track; return 0;}
1536   paramOut=*track;
1537   //
1538   //
1539   //
1540   if (parin) (*parin)=paramIn;
1541   if (parout) (*parout)=paramOut;
1542   delete track;
1543   return ncl;
1544 }
1545
1546
1547
1548 Bool_t AliTPCseed::RefitTrack(AliTPCseed* /*seed*/, Bool_t /*out*/){
1549   //
1550   //
1551   //
1552   return kFALSE;
1553 }
1554
1555
1556
1557
1558
1559
1560 void  AliTPCseed::GetError(AliTPCclusterMI* cluster, AliExternalTrackParam * param,
1561                                   Double_t& erry, Double_t &errz)
1562 {
1563   //
1564   // Get cluster error at given position
1565   //
1566   AliTPCClusterParam *clusterParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1567   Double_t tany,tanz;
1568   Double_t snp1=param->GetSnp();
1569   tany=snp1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1570   //
1571   Double_t tgl1=param->GetTgl();
1572   tanz=tgl1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1573   //
1574   Int_t padSize = 0;                          // short pads
1575   if (cluster->GetDetector() >= 36) {
1576     padSize = 1;                              // medium pads
1577     if (cluster->GetRow() > 63) padSize = 2; // long pads
1578   }
1579
1580   erry  = clusterParam->GetError0Par( 0, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tany) );
1581   errz  = clusterParam->GetError0Par( 1, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tanz) );
1582 }
1583
1584
1585 void  AliTPCseed::GetShape(AliTPCclusterMI* cluster, AliExternalTrackParam * param,
1586                                   Double_t& rmsy, Double_t &rmsz)
1587 {
1588   //
1589   // Get cluster error at given position
1590   //
1591   AliTPCClusterParam *clusterParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1592   Double_t tany,tanz;
1593   Double_t snp1=param->GetSnp();
1594   tany=snp1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1595   //
1596   Double_t tgl1=param->GetTgl();
1597   tanz=tgl1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1598   //
1599   Int_t padSize = 0;                          // short pads
1600   if (cluster->GetDetector() >= 36) {
1601     padSize = 1;                              // medium pads
1602     if (cluster->GetRow() > 63) padSize = 2; // long pads
1603   }
1604
1605   rmsy  = clusterParam->GetRMSQ( 0, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tany), TMath::Abs(cluster->GetMax()) );
1606   rmsz  = clusterParam->GetRMSQ( 1, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tanz) ,TMath::Abs(cluster->GetMax()));
1607 }
1608
1609
1610
1611 Double_t AliTPCseed::GetQCorrGeom(Float_t ty, Float_t tz){
1612   //Geoetrical
1613   //ty    - tangent in local y direction
1614   //tz    - tangent
1615   //
1616   Float_t norm=TMath::Sqrt(1+ty*ty+tz*tz);
1617   return norm;
1618 }
1619
1620 Double_t AliTPCseed::GetQCorrShape(Int_t ipad, Int_t type,Float_t z, Float_t ty, Float_t tz, Float_t /*q*/, Float_t /*thr*/){
1621   //
1622   // Q normalization
1623   //
1624   // return value =  Q Normalization factor
1625   // Normalization - 1 - shape factor part for full drift
1626   //                 1 - electron attachment for 0 drift
1627
1628   // Input parameters:
1629   //
1630   // ipad - 0 short pad
1631   //        1 medium pad
1632   //        2 long pad
1633   //
1634   // type - 0 qmax
1635   //      - 1 qtot
1636   //
1637   //z     - z position (-250,250 cm)
1638   //ty    - tangent in local y direction
1639   //tz    - tangent
1640   //
1641
1642   AliTPCClusterParam * paramCl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1643   AliTPCParam   * paramTPC = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
1644
1645   if (!paramCl) return 1;
1646   //
1647   Double_t dr =  250.-TMath::Abs(z);
1648   Double_t sy =  paramCl->GetRMS0( 0,ipad, dr, TMath::Abs(ty));
1649   Double_t sy0=  paramCl->GetRMS0(0,ipad, 250, 0);
1650   Double_t sz =  paramCl->GetRMS0( 1,ipad, dr, TMath::Abs(tz));
1651   Double_t sz0=  paramCl->GetRMS0(1,ipad, 250, 0);
1652
1653   Double_t sfactorMax = TMath::Sqrt(sy0*sz0/(sy*sz));
1654
1655
1656   Double_t dt = 1000000*(dr/paramTPC->GetDriftV());  //time in microsecond
1657   Double_t attProb = TMath::Exp(-paramTPC->GetAttCoef()*paramTPC->GetOxyCont()*dt);
1658   //
1659   //
1660   if (type==0) return sfactorMax*attProb;
1661
1662   return attProb;
1663
1664
1665 }
1666
1667
1668 //_______________________________________________________________________
1669 Float_t AliTPCseed::GetTPCClustInfo(Int_t nNeighbours, Int_t type, Int_t row0, Int_t row1)
1670 {
1671   //
1672   // TPC cluster information
1673   // type 0: get fraction of found/findable clusters with neighbourhood definition
1674   //      1: found clusters
1675   //      2: findable (number of clusters above and below threshold)
1676   //
1677   // definition of findable clusters:
1678   //            a cluster is defined as findable if there is another cluster
1679   //           within +- nNeighbours pad rows. The idea is to overcome threshold
1680   //           effects with a very simple algorithm.
1681   //
1682
1683   const Float_t kClusterShapeCut = 1.5; // IMPPRTANT TO DO: move value to AliTPCRecoParam
1684   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
1685   const Float_t kedgey =3.;
1686
1687   Float_t ncl = 0;
1688   Float_t nclBelowThr = 0; // counts number of clusters below threshold
1689
1690   for (Int_t irow=row0; irow<row1; irow++){
1691     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
1692
1693     if (!cluster && irow > 1 && irow < 157) {
1694       Bool_t isClBefore = kFALSE;
1695       Bool_t isClAfter  = kFALSE;
1696       for(Int_t ithres = 1; ithres <= nNeighbours; ithres++) {
1697         AliTPCclusterMI * clusterBefore = GetClusterPointer(irow - ithres);
1698         if (clusterBefore) isClBefore = kTRUE;
1699         AliTPCclusterMI * clusterAfter  = GetClusterPointer(irow + ithres);
1700         if (clusterAfter) isClAfter = kTRUE;
1701       }
1702       if (isClBefore && isClAfter) nclBelowThr++;
1703     }
1704     if (!cluster) continue;
1705     //
1706     //
1707     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
1708     //
1709     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1710     if (point==0) continue;
1711     Float_t rsigmay = TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1712     if (rsigmay > kClusterShapeCut) continue;
1713     //
1714     if (cluster->IsUsed(11)) continue; // remove shared clusters for PbPb
1715     ncl++;
1716   }
1717
1718   if(ncl<10)
1719     return 0;
1720   if(type==0)
1721     if(nclBelowThr+ncl>0)
1722       return ncl/(nclBelowThr+ncl);
1723   if(type==1)
1724     return ncl;
1725   if(type==2)
1726     return ncl+nclBelowThr;
1727   return 0;
1728 }
1729 //_______________________________________________________________________
1730 Int_t AliTPCseed::GetNumberOfClustersIndices() {
1731   Int_t ncls = 0;
1732   for (int i=0; i < 160; i++) {
1733     if ((fIndex[i] & 0x8000) == 0)
1734       ncls++;
1735   }
1736   return ncls;
1737 }
1738
1739 //_______________________________________________________________________
1740 void AliTPCseed::Clear(Option_t*)
1741 {
1742   // formally seed may allocate memory for clusters (althought this should not happen for
1743   // the seeds in the pool). Hence we need this method for fwd. compatibility
1744   if (fClusterOwner) for (int i=160;i--;) {delete fClusterPointer[i]; fClusterPointer[i] = 0;}
1745 }