TPC/AliTPCseed.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17
  18
  19 //-----------------------------------------------------------------
  20 //           Implementation of the TPC seed class
  21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
  22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
  23 //-----------------------------------------------------------------
  24 #include "TClonesArray.h"
  25 #include "AliTPCseed.h"
  26 #include "AliTPCReconstructor.h"
  27
  28 ClassImp(AliTPCseed)
  29
  30
  31
  32 AliTPCseed::AliTPCseed():
  33   AliTPCtrack(),
  34   fEsd(0x0),
  35   fClusterOwner(kFALSE),
  36   fPoints(0x0),
  37   fEPoints(0x0),
  38   fRow(0),
  39   fSector(-1),
  40   fRelativeSector(-1),
  41   fCurrentSigmaY2(1e10),
  42   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  43   fErrorY2(1e10),
  44   fErrorZ2(1e10),
  45   fCurrentCluster(0x0),
  46   fCurrentClusterIndex1(-1),
  47   fInDead(kFALSE),
  48   fIsSeeding(kFALSE),
  49   fNoCluster(0),
  50   fSort(0),
  51   fBSigned(kFALSE),
  52   fSeedType(0),
  53   fSeed1(-1),
  54   fSeed2(-1),
  55   fMAngular(0),
  56   fCircular(0)
  57 {
  58   //
  59   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
  60   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
  61   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
  62   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  63   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
  64     fDEDX[i] = 0.;
  65     fSDEDX[i] = 1e10;
  66     fNCDEDX[i] = 0;
  67   }
  68   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
  69 }
  70
  71 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
  72   AliTPCtrack(s),
  73   fEsd(0x0),
  74   fClusterOwner(clusterOwner),
  75   fPoints(0x0),
  76   fEPoints(0x0),
  77   fRow(0),
  78   fSector(-1),
  79   fRelativeSector(-1),
  80   fCurrentSigmaY2(1e10),
  81   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  82   fErrorY2(1e10),
  83   fErrorZ2(1e10),
  84   fCurrentCluster(0x0),
  85   fCurrentClusterIndex1(-1),
  86   fInDead(kFALSE),
  87   fIsSeeding(kFALSE),
  88   fNoCluster(0),
  89   fSort(0),
  90   fBSigned(kFALSE),
  91   fSeedType(0),
  92   fSeed1(-1),
  93   fSeed2(-1),
  94   fMAngular(0),
  95   fCircular(0)
  96 {
  97   //---------------------
  98   // dummy copy constructor
  99   //-------------------------
 100   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 101     fClusterPointer[i]=0;
 102     if (fClusterOwner){
 103       if (s.fClusterPointer[i])
 104         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
 105     }else{
 106       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
 107     }
 108     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
 109   }
 110   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
 111   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
 112   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 113     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
 114     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
 115     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
 116   }
 117   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
 118 }
 119
 120
 121 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
 122   AliTPCtrack(t),
 123   fEsd(0x0),
 124   fClusterOwner(kFALSE),
 125   fPoints(0x0),
 126   fEPoints(0x0),
 127   fRow(0),
 128   fSector(-1),
 129   fRelativeSector(-1),
 130   fCurrentSigmaY2(1e10),
 131   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 132   fErrorY2(1e10),
 133   fErrorZ2(1e10),
 134   fCurrentCluster(0x0),
 135   fCurrentClusterIndex1(-1),
 136   fInDead(kFALSE),
 137   fIsSeeding(kFALSE),
 138   fNoCluster(0),
 139   fSort(0),
 140   fBSigned(kFALSE),
 141   fSeedType(0),
 142   fSeed1(-1),
 143   fSeed2(-1),
 144   fMAngular(0),
 145   fCircular(0)
 146 {
 147   //
 148   // Constructor from AliTPCtrack
 149   //
 150   fFirstPoint =0;
 151   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 152   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 153     fClusterPointer[i] = 0;
 154     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
 155     if (index>=-1){
 156       SetClusterIndex2(i,index);
 157     }
 158     else{
 159       SetClusterIndex2(i,-3);
 160     }
 161   }
 162   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 163     fDEDX[i] = 0.;
 164     fSDEDX[i] = 1e10;
 165     fNCDEDX[i] = 0;
 166   }
 167   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 168 }
 169
 170 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
 171                        const Double_t cc[15], Int_t index):
 172   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
 173   fEsd(0x0),
 174   fClusterOwner(kFALSE),
 175   fPoints(0x0),
 176   fEPoints(0x0),
 177   fRow(0),
 178   fSector(-1),
 179   fRelativeSector(-1),
 180   fCurrentSigmaY2(1e10),
 181   fCurrentSigmaZ2(1e10),
 182   fErrorY2(1e10),
 183   fErrorZ2(1e10),
 184   fCurrentCluster(0x0),
 185   fCurrentClusterIndex1(-1),
 186   fInDead(kFALSE),
 187   fIsSeeding(kFALSE),
 188   fNoCluster(0),
 189   fSort(0),
 190   fBSigned(kFALSE),
 191   fSeedType(0),
 192   fSeed1(-1),
 193   fSeed2(-1),
 194   fMAngular(0),
 195   fCircular(0)
 196 {
 197   //
 198   // Constructor
 199   //
 200   fFirstPoint =0;
 201   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 202   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 203   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 204   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 205     fDEDX[i] = 0.;
 206     fSDEDX[i] = 1e10;
 207     fNCDEDX[i] = 0;
 208   }
 209   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 210 }
 211
 212 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
 213   //
 214   // destructor
 215   if (fPoints) delete fPoints;
 216   fPoints =0;
 217   if (fEPoints) delete fEPoints;
 218   fEPoints = 0;
 219   fNoCluster =0;
 220   if (fClusterOwner){
 221     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
 222       delete fClusterPointer[icluster];
 223     }
 224   }
 225 }
 226
 227 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
 228 {
 229   //
 230   //
 231   return &fTrackPoints[i];
 232 }
 233
 234 void AliTPCseed::RebuildSeed()
 235 {
 236   //
 237   // rebuild seed to be ready for storing
 238   AliTPCclusterMI cldummy;
 239   cldummy.SetQ(0);
 240   AliTPCTrackPoint pdummy;
 241   pdummy.GetTPoint().SetShared(10);
 242   for (Int_t i=0;i<160;i++){
 243     AliTPCclusterMI * cl0 = fClusterPointer[i];
 244     AliTPCTrackPoint *trpoint = (AliTPCTrackPoint*)fPoints->UncheckedAt(i);
 245     if (cl0){
 246       trpoint->GetTPoint() = *(GetTrackPoint(i));
 247       trpoint->GetCPoint() = *cl0;
 248       trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
 249     }
 250     else{
 251       *trpoint = pdummy;
 252       trpoint->GetCPoint()= cldummy;
 253     }
 254
 255   }
 256
 257 }
 258
 259
 260 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
 261 {
 262   //
 263   //
 264   // return cluster for n rows bellow first point
 265   Int_t nfoundable = 1;
 266   Int_t nfound      = 1;
 267   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
 268     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 269     if (index!=-1) nfoundable++;
 270     if (index>0) nfound++;
 271   }
 272   if (nfoundable<n) return 0;
 273   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
 274
 275 }
 276
 277
 278 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
 279 {
 280   // get cluster stat.  on given region
 281   //
 282   found       = 0;
 283   foundable   = 0;
 284   shared      =0;
 285   for (Int_t i=first;i<last; i++){
 286     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 287     if (index!=-1) foundable++;
 288     if (fClusterPointer[i]) {
 289       found++;
 290     }
 291     else
 292       continue;
 293
 294     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
 295       shared++;
 296       continue;
 297     }
 298     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
 299     //
 300     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
 301       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
 302         shared++;
 303         continue;
 304       }
 305     }
 306     if ( fClusterPointer[i+1]){
 307       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
 308         shared++;
 309         continue;
 310       }
 311     }
 312
 313   }
 314   //if (shared>found){
 315     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
 316   //}
 317 }
 318
 319
 320
 321
 322
 323 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 324 {
 325   //
 326   //
 327   SetNumberOfClusters(0);
 328   fNFoundable = 0;
 329   SetChi2(0);
 330   ResetCovariance(10.);
 331   /*
 332   if (fTrackPoints){
 333     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 334       delete [] fTrackPoints[i];
 335     }
 336     delete fTrackPoints;
 337     fTrackPoints =0;
 338   }
 339   */
 340
 341   if (all){
 342     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 343     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 344   }
 345
 346 }
 347
 348
 349 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 350 {
 351
 352   //------------------------------------------------------------------
 353   //This function makes a track forget its history :)
 354   //------------------------------------------------------------------
 355   if (factor<=0) {
 356     ResetCovariance(10.);
 357     return;
 358   }
 359   ResetCovariance(factor);
 360
 361   SetNumberOfClusters(0);
 362   fNFoundable =0;
 363   SetChi2(0);
 364   fRemoval = 0;
 365   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 366   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 367   fNoCluster     = 0;
 368   //fFirstPoint = 160;
 369   //fLastPoint  = 0;
 370 }
 371
 372
 373
 374
 375 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 376 {
 377   //-----------------------------------------------------------------
 378   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 379   // doesn't change internal state of the track
 380   //-----------------------------------------------------------------
 381
 382   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 383
 384   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 385     return 0;
 386   }
 387
 388   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 389   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt(1.- c1*c1);
 390   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt(1.- c2*c2);
 391
 392   y = GetY();
 393   z = GetZ();
 394   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 395   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 396
 397   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 398   Double_t dz = 0;
 399   //
 400   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 401   /*
 402   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 403     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 404   }else{
 405     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 406   }
 407   */
 408   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 409   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
 410   //
 411   y+=dy;
 412   z+=dz;
 413
 414
 415   return 1;
 416 }
 417
 418
 419 //_____________________________________________________________________________
 420 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const
 421 {
 422   //-----------------------------------------------------------------
 423   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 424   //-----------------------------------------------------------------
 425   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 426   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 427   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
 428 }
 429
 430 //_________________________________________________________________________________________
 431
 432
 433 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 434   //-----------------------------------------------------------------
 435   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 436   //-----------------------------------------------------------------
 437   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 438
 439   if (fSort == 0){
 440     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 441     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 442     Double_t z2 = t->GetZ();
 443     Double_t z1 = GetZ();
 444     if (z2>z1) return 1;
 445     if (z2<z1) return -1;
 446     return 0;
 447   }
 448   else {
 449     Float_t f2 =1;
 450     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(TMath::Abs(t->Get1Pt())+0.0066);
 451     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 452
 453     Float_t f1 =1;
 454     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(TMath::Abs(Get1Pt())+0.0066);
 455
 456     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 457
 458     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 459     else return +1;
 460   }
 461 }
 462
 463
 464
 465
 466 //_____________________________________________________________________________
 467 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t /*index*/)
 468 {
 469   //-----------------------------------------------------------------
 470   // This function associates a cluster with this track.
 471   //-----------------------------------------------------------------
 472   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 473   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 474
 475   if (!AliExternalTrackParam::Update(p,cov)) return kFALSE;
 476
 477   Int_t n=GetNumberOfClusters();
 478   //  fIndex[n]=index;
 479   SetNumberOfClusters(n+1);
 480   SetChi2(GetChi2()+chisq);
 481
 482   return kTRUE;
 483 }
 484
 485
 486
 487 //_____________________________________________________________________________
 488 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
 489   //-----------------------------------------------------------------
 490   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 491   //-----------------------------------------------------------------
 492
 493   Float_t amp[200];
 494   Float_t angular[200];
 495   Float_t weight[200];
 496   Int_t index[200];
 497   //Int_t nc = 0;
 498   //  TClonesArray & arr = *fPoints;
 499   Float_t meanlog = 100.;
 500
 501   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 502   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 503   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 504   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 505   //
 506   //
 507   fNShared =0;
 508
 509   for (Int_t of =0; of<4; of++){
 510     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
 511       {
 512         Int_t index = fIndex[i];
 513         if (index<0||index&0x8000) continue;
 514
 515         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
 516         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
 517         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
 518         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
 519         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
 520
 521         if (point==0) continue;
 522         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
 523         if (cl==0) continue;
 524         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
 525         if (cl->IsUsed(11)) {
 526           fNShared++;
 527           continue;
 528         }
 529         Int_t   type   = cl->GetType();
 530         //if (point->fIsShared){
 531         //  fNShared++;
 532         //  continue;
 533         //}
 534         //if (pointm)
 535         //  if (pointm->fIsShared) continue;
 536         //if (pointp)
 537         //  if (pointp->fIsShared) continue;
 538
 539         if (type<0) continue;
 540         //if (type>10) continue;
 541         //if (point->GetErrY()==0) continue;
 542         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
 543
 544         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
 545         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
 546         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
 547
 548
 549         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 550         if (cl->GetMax()<5) continue;
 551         Float_t angley = point->GetAngleY();
 552         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
 553
 554         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
 555         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
 556         /*
 557         Float_t ns = 1.;
 558         if (pointm){
 559           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
 560           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
 561           ns+=1.;
 562         }
 563         if (pointp){
 564           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
 565           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
 566           ns+=1.;
 567         }
 568         rsigmay/=ns;
 569         rsigmaz/=ns;
 570         */
 571
 572         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
 573
 574         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 575         if (i>64){
 576           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
 577           ampc = 1.*cl->GetMax();
 578           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
 579           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 580           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
 581           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 582           //Float_t dz =
 583           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 584           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 585           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 586           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 587           //ampc               *=zfactor;
 588         }
 589         else{
 590           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
 591           ampc = 1.0*cl->GetMax();
 592           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
 593           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 594           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
 595           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 596           //Float_t dz =
 597           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 598
 599           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 600           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 601           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 602           //ampc               *=zfactor;
 603
 604         }
 605         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 606         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
 607         Float_t w      =  1.;
 608         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
 609         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
 610         if (i<64) {
 611           ampc /= 0.6;
 612           //ampc /= (1+0.0008*z);
 613         } else
 614           if (i>128){
 615             ampc /=1.5;
 616             //ampc /= (1+0.0008*z);
 617           }else{
 618             //ampc /= (1+0.0008*z);
 619           }
 620
 621         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 622           // w*= 2.;
 623
 624           continue;
 625         }
 626         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 627         amp[nc[of]]        = ampc;
 628         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 629         weight[nc[of]]     = w;
 630         nc[of]++;
 631       }
 632
 633     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
 634     Float_t sumamp=0;
 635     Float_t sumamp2=0;
 636     Float_t sumw=0;
 637     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
 638     meanlog = 50;
 639     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
 640       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
 641       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 642       //
 643       sumw    += weight[index[i]];
 644       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
 645       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
 646       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
 647     }
 648     if (sumw<1){
 649       SetdEdx(0);
 650     }
 651     else {
 652       norm[of] /= sumw;
 653       mean[of]  = sumamp/sumw;
 654       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 655       if (sigma[of]>0.1)
 656         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 657       else
 658         sigma[of] = 1000;
 659
 660     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 661     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
 662     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
 663     }
 664   }
 665
 666   Float_t dedx =0;
 667   fSdEdx =0;
 668   fMAngular =0;
 669   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
 670   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
 671
 672
 673   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
 674   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
 675
 676   Int_t norm2 = 0;
 677   Int_t norm3 = 0;
 678   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 679     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 680       dedx      += mean[i] *nc[i];
 681       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
 682       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 683       norm2     += nc[i];
 684       norm3     += nc[i]-2;
 685     }
 686     fDEDX[i]  = mean[i];
 687     fSDEDX[i] = sigma[i];
 688     fNCDEDX[i]= nc[i];
 689   }
 690
 691   if (norm3>0){
 692     dedx   /=norm2;
 693     fSdEdx /=norm3;
 694     fMAngular/=norm2;
 695   }
 696   else{
 697     SetdEdx(0);
 698     return 0;
 699   }
 700   //  Float_t dedx1 =dedx;
 701   /*
 702   dedx =0;
 703   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 704     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 705       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 706       dedx      += mean[i] *nc[i];
 707     }
 708     fDEDX[i]  = mean[i];
 709   }
 710   dedx /= norm2;
 711   */
 712
 713
 714   SetdEdx(dedx);
 715   return dedx;
 716 }
 717 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
 718   //
 719   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
 720   //
 721   Double_t bg2=bg*bg;
 722   Double_t bethe;
 723   if (bg<3.5e1)
 724     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
 725   else // Density effect ( approximately :)
 726     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
 727   return bethe/11.091;
 728 }
 729
 730 void AliTPCseed::CookPID()
 731 {
 732   //
 733   // cook PID information according dEdx
 734   //
 735   Double_t fRange = 10.;
 736   Double_t fRes   = 0.1;
 737   Double_t fMIP   = 47.;
 738   //
 739   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
 740   Double_t sumr =0;
 741   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 742     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 743     Double_t mom=GetP();
 744     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
 745     Double_t bethe=Bethe(mom/mass);
 746     Double_t sigma=fRes*bethe;
 747     if (sigma>0.001){
 748       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
 749         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
 750         sumr+=fTPCr[j];
 751         continue;
 752       }
 753       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
 754       sumr+=fTPCr[j];
 755     }
 756     else{
 757       fTPCr[j]=1.;
 758       sumr+=fTPCr[j];
 759     }
 760   }
 761   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 762     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
 763   }
 764 }
 765
 766 /*
 767 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
 768   //-----------------------------------------------------------------
 769   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 770   //-----------------------------------------------------------------
 771
 772   Float_t amp[200];
 773   Float_t angular[200];
 774   Float_t weight[200];
 775   Int_t index[200];
 776   Bool_t inlimit[200];
 777   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
 778   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
 779   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
 780
 781
 782   //
 783   Float_t meanlog = 100.;
 784   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
 785
 786   Float_t amean     =0;
 787   Float_t asigma    =0;
 788   Float_t anc       =0;
 789   Float_t anorm     =0;
 790
 791   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 792   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 793   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 794   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 795   //
 796   //
 797   fNShared =0;
 798
 799   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){
 800   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 801   for (Int_t i =0; i<160;i++)
 802     {
 803         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
 804         if (point==0) continue;
 805         if (point->fIsShared){
 806           fNShared++;
 807           continue;
 808         }
 809         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
 810         if (type<0) continue;
 811         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 812         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
 813         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
 814         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
 815         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
 816         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
 817
 818         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 819         if (i>64){
 820           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
 821         }
 822         else{
 823           ampc = point->GetCPoint().GetMax();
 824         }
 825         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 826         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
 827
 828         Float_t w      =  1.;
 829         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
 830         if (i<64) {
 831           ampc /= 0.63;
 832         } else
 833           if (i>128){
 834             ampc /=1.51;
 835           }
 836         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 837           continue;
 838         }
 839         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 840         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 841         amp[i]        = ampc/angular[i];
 842         weight[i]     = w;
 843         anc++;
 844     }
 845
 846   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
 847   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){
 848     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
 849   }
 850
 851   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
 852   meanlog =10000.;
 853   for (Int_t of =0; of<3; of++){
 854     Float_t sumamp=0;
 855     Float_t sumamp2=0;
 856     Float_t sumw=0;
 857    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 858       {
 859         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
 860         Float_t ampl      = amp[i];
 861         ///angular[i];
 862         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 863         //
 864         sumw    += weight[i];
 865         sumamp  += weight[i]*ampl;
 866         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
 867         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
 868         nc[of]++;
 869       }
 870    if (sumw<1){
 871      SetdEdx(0);
 872    }
 873    else {
 874      norm[of] /= sumw;
 875      mean[of]  = sumamp/sumw;
 876      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 877      if (sigma[of]>0.1)
 878        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 879      else
 880        sigma[of] = 1000;
 881      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 882    }
 883   }
 884
 885   Float_t dedx =0;
 886   fSdEdx =0;
 887   fMAngular =0;
 888   //
 889   Int_t norm2 = 0;
 890   Int_t norm3 = 0;
 891   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
 892   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
 893
 894   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 895     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 896       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
 897       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 898       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 899       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
 900       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 901     }
 902     fDEDX[i]  = mean[i];
 903     fSDEDX[i] = sigma[i];
 904     fNCDEDX[i]= nc[i];
 905   }
 906
 907   if (norm3>0){
 908     dedx   /=norm2;
 909     fSdEdx /=norm3;
 910     fMAngular/=norm2;
 911   }
 912   else{
 913     SetdEdx(0);
 914     return;
 915   }
 916   //  Float_t dedx1 =dedx;
 917
 918   dedx =0;
 919   Float_t norm4 = 0;
 920   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 921     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
 922       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 923       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
 924       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
 925     }
 926     fDEDX[i]  = mean[i];
 927   }
 928   if (norm4>0) dedx /= norm4;
 929
 930
 931
 932   SetdEdx(dedx);
 933
 934   //mi deDX
 935
 936 }
 937 */
 938 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
 939 //-----------------------------------------------------------------
 940 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
 941 //-----------------------------------------------------------------
 942   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
 943     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt(1.- c1*c1);
 944     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
 945     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
 946     Double_t r2=TMath::Sqrt(1.- c2*c2);
 947     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
 948 }
 949