Bug fix: Take into account R distortion in the calculation of chi2.
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCseed.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16
17
18
19 //-----------------------------------------------------------------
20 //           Implementation of the TPC seed class
21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
23 //-----------------------------------------------------------------
24 #include "TClonesArray.h"
25 #include "AliTPCseed.h"
26 #include "AliTPCReconstructor.h"
27 #include "AliTPCClusterParam.h"
28 #include "AliTPCCalPad.h"
29 #include "AliTPCCalROC.h"
30 #include "AliTPCcalibDB.h"
31 #include "AliTPCParam.h"
32
33
34
35 ClassImp(AliTPCseed)
36
37
38
39 AliTPCseed::AliTPCseed():
40   AliTPCtrack(),
41   fEsd(0x0),
42   fClusterOwner(kFALSE),
43   fRow(0),
44   fSector(-1),
45   fRelativeSector(-1),
46   fCurrentSigmaY2(1e10),
47   fCurrentSigmaZ2(1e10),
48   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
49   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
50   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
51   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
52   //
53   fErrorY2(1e10),
54   fErrorZ2(1e10),
55   fCurrentCluster(0x0),
56   fCurrentClusterIndex1(-1),
57   fInDead(kFALSE),
58   fIsSeeding(kFALSE),
59   fNoCluster(0),
60   fSort(0),
61   fBSigned(kFALSE),
62   fSeedType(0),
63   fSeed1(-1),
64   fSeed2(-1),
65   fMAngular(0),
66   fCircular(0),
67   fClusterMap(159),
68   fSharedMap(159)
69 {
70   //
71   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
72   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
73   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
74   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
75   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
76     fDEDX[i] = 0.;
77     fSDEDX[i] = 1e10;
78     fNCDEDX[i] = 0;
79   }
80   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
81   //  for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
82   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
83   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
84   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
85
86 }
87
88 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
89   AliTPCtrack(s),
90   fEsd(0x0),
91   fClusterOwner(clusterOwner),
92   fRow(0),
93   fSector(-1),
94   fRelativeSector(-1),
95   fCurrentSigmaY2(-1),
96   fCurrentSigmaZ2(-1),
97   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
98   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
99   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
100   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
101   fErrorY2(1e10),
102   fErrorZ2(1e10),
103   fCurrentCluster(0x0),
104   fCurrentClusterIndex1(-1),
105   fInDead(kFALSE),
106   fIsSeeding(kFALSE),
107   fNoCluster(0),
108   fSort(0),
109   fBSigned(kFALSE),
110   fSeedType(0),
111   fSeed1(-1),
112   fSeed2(-1),
113   fMAngular(0),
114   fCircular(0),
115   fClusterMap(s.fClusterMap),
116   fSharedMap(s.fSharedMap)
117 {
118   //---------------------
119   // dummy copy constructor
120   //-------------------------
121   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
122     fClusterPointer[i]=0;
123     if (fClusterOwner){
124       if (s.fClusterPointer[i])
125         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
126     }else{
127       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
128     }
129     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
130   }
131   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
132   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
133   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
134     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
135     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
136     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
137   }
138   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
139
140 }
141
142
143 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
144   AliTPCtrack(t),
145   fEsd(0x0),
146   fClusterOwner(kFALSE),
147   fRow(0),
148   fSector(-1),
149   fRelativeSector(-1),
150   fCurrentSigmaY2(-1),
151   fCurrentSigmaZ2(-1),
152   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
153   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
154   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
155   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
156   fErrorY2(1e10),
157   fErrorZ2(1e10),
158   fCurrentCluster(0x0),
159   fCurrentClusterIndex1(-1),
160   fInDead(kFALSE),
161   fIsSeeding(kFALSE),
162   fNoCluster(0),
163   fSort(0),
164   fBSigned(kFALSE),
165   fSeedType(0),
166   fSeed1(-1),
167   fSeed2(-1),
168   fMAngular(0),
169   fCircular(0),
170   fClusterMap(159),
171   fSharedMap(159)
172 {
173   //
174   // Constructor from AliTPCtrack
175   //
176   fFirstPoint =0;
177   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
178   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
179     fClusterPointer[i] = 0;
180     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
181     if (index>=-1){ 
182       SetClusterIndex2(i,index);
183     }
184     else{
185       SetClusterIndex2(i,-3); 
186     }    
187   }
188   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
189     fDEDX[i] = 0.;
190     fSDEDX[i] = 1e10;
191     fNCDEDX[i] = 0;
192   }
193   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
194   
195   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
196   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
197   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
198   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
199
200 }
201
202 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
203                        const Double_t cc[15], Int_t index):      
204   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
205   fEsd(0x0),
206   fClusterOwner(kFALSE),
207   fRow(0),
208   fSector(-1),
209   fRelativeSector(-1),
210   fCurrentSigmaY2(-1),
211   fCurrentSigmaZ2(-1),
212   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
213   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
214   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
215   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
216   fErrorY2(1e10),
217   fErrorZ2(1e10),
218   fCurrentCluster(0x0),
219   fCurrentClusterIndex1(-1),
220   fInDead(kFALSE),
221   fIsSeeding(kFALSE),
222   fNoCluster(0),
223   fSort(0),
224   fBSigned(kFALSE),
225   fSeedType(0),
226   fSeed1(-1),
227   fSeed2(-1),
228   fMAngular(0),
229   fCircular(0),
230   fClusterMap(159),
231   fSharedMap(159)
232 {
233   //
234   // Constructor
235   //
236   fFirstPoint =0;
237   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
238   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
239   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
240   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
241     fDEDX[i] = 0.;
242     fSDEDX[i] = 1e10;
243     fNCDEDX[i] = 0;
244   }
245   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
246 }
247
248 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
249   //
250   // destructor
251   fNoCluster =0;
252   if (fClusterOwner){
253     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
254       delete fClusterPointer[icluster];
255     }
256   }
257
258 }
259 //_________________________________________________
260 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
261 {
262   //
263   // assignment operator 
264   //
265   if(this!=&param){
266     AliTPCtrack::operator=(param);
267     fEsd =param.fEsd; 
268     for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i]; // this is not allocated by AliTPCSeed
269     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
270     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
271     // but deleted in the dtor... strange...
272     fRow            = param.fRow;
273     fSector         = param.fSector;
274     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
275     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
276     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
277     fErrorY2        = param.fErrorY2;
278     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
279     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
280     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1; 
281     fInDead         = param.fInDead;
282     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
283     fNoCluster      = param.fNoCluster;
284     fSort           = param.fSort;
285     fBSigned        = param.fBSigned;
286     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
287       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
288       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
289       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
290     }
291     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
292     
293     fSeedType = param.fSeedType;
294     fSeed1    = param.fSeed1;
295     fSeed2    = param.fSeed2;
296     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
297     fMAngular = param.fMAngular;
298     fCircular = param.fCircular;
299     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
300     fClusterMap = param.fClusterMap;
301     fSharedMap = param.fSharedMap;
302   }
303   return (*this);
304 }
305 //____________________________________________________
306 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
307 {
308   //
309   // 
310   return &fTrackPoints[i];
311 }
312
313
314
315 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
316 {
317   //
318   //
319   // return cluster for n rows bellow first point
320   Int_t nfoundable = 1;
321   Int_t nfound      = 1;
322   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
323     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
324     if (index!=-1) nfoundable++;
325     if (index>0) nfound++;
326   }
327   if (nfoundable<n) return 0;
328   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
329
330 }
331
332
333 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
334 {
335   // get cluster stat.  on given region
336   //
337   found       = 0;
338   foundable   = 0;
339   shared      =0;
340   for (Int_t i=first;i<last; i++){
341     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
342     if (index!=-1) foundable++;
343     if (index&0x8000) continue;
344     if (fClusterPointer[i]) {
345       found++;
346     }
347     else 
348       continue;
349
350     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
351       shared++;
352       continue;
353     }
354     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
355     //
356     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
357       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
358         shared++;
359         continue;
360       }
361     }
362     if ( fClusterPointer[i+1]){
363       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
364         shared++;
365         continue;
366       }
367     }
368     
369   }
370   //if (shared>found){
371     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
372   //}
373 }
374
375
376
377
378
379 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
380 {
381   //
382   //
383   SetNumberOfClusters(0);
384   fNFoundable = 0;
385   SetChi2(0);
386   ResetCovariance(10.);
387   /*
388   if (fTrackPoints){
389     for (Int_t i=0;i<8;i++){
390       delete [] fTrackPoints[i];
391     }
392     delete fTrackPoints;
393     fTrackPoints =0;
394   }
395   */
396
397   if (all){   
398     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
399     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
400   }
401
402 }
403
404
405 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
406 {
407
408   //------------------------------------------------------------------
409   //This function makes a track forget its history :)  
410   //------------------------------------------------------------------
411   if (factor<=0) {
412     ResetCovariance(10.);
413     return;
414   }
415   ResetCovariance(factor);
416
417   SetNumberOfClusters(0);
418   fNFoundable =0;
419   SetChi2(0);
420   fRemoval = 0;
421   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
422   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
423   fNoCluster     = 0;
424   //fFirstPoint = 160;
425   //fLastPoint  = 0;
426 }
427
428
429
430
431 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
432 {
433   //-----------------------------------------------------------------
434   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
435   // doesn't change internal state of the track
436   //-----------------------------------------------------------------
437   
438   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
439
440   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {   
441     return 0;
442   }
443
444   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
445   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt((1.-c1)*(1.+c1));
446   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt((1.-c2)*(1.+c2));
447   
448   y = GetY();
449   z = GetZ();
450   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
451   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
452   
453   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
454   Double_t dz = 0;
455   //
456   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
457   /*
458   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
459     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
460   }else{
461     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
462   }
463   */
464   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
465   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
466   //
467   y+=dy;
468   z+=dz;
469   
470
471   return 1;  
472 }
473
474
475 //_____________________________________________________________________________
476 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const 
477 {
478   //-----------------------------------------------------------------
479   // This function calculates a predicted chi2 increment.
480   //-----------------------------------------------------------------
481   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
482   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
483
484   Float_t dx = ((AliTPCclusterMI*)c)->GetX()-GetX();
485   if (TMath::Abs(dx)>0){
486     Float_t ty = TMath::Tan(TMath::ASin(GetSnp()));
487     Float_t dy = dx*ty;
488     Float_t dz = dx*TMath::Sqrt(1.+ty*ty)*GetTgl();
489     p[0] = c->GetY()-dy;  
490     p[1] = c->GetZ()-dz;  
491   }
492   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
493 }
494
495 //_________________________________________________________________________________________
496
497
498 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
499   //-----------------------------------------------------------------
500   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
501   //-----------------------------------------------------------------
502   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
503
504   if (fSort == 0){
505     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
506     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
507     Double_t z2 = t->GetZ();
508     Double_t z1 = GetZ();
509     if (z2>z1) return 1;
510     if (z2<z1) return -1;
511     return 0;
512   }
513   else {
514     Float_t f2 =1;
515     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
516     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
517
518     Float_t f1 =1;
519     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
520
521     if (fBConstrain)   f1=1.2;
522  
523     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
524     else return +1;
525   }
526 }
527
528
529
530
531 //_____________________________________________________________________________
532 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t index)
533 {
534   //-----------------------------------------------------------------
535   // This function associates a cluster with this track.
536   //-----------------------------------------------------------------
537   Int_t n=GetNumberOfClusters();
538   Int_t idx=GetClusterIndex(n);    // save the current cluster index
539
540   AliCluster cl(*c);  cl.SetSigmaY2(fErrorY2); cl.SetSigmaZ2(fErrorZ2);
541   Float_t dx = ((AliTPCclusterMI*)c)->GetX()-GetX();
542   if (TMath::Abs(dx)>0){
543     Float_t ty = TMath::Tan(TMath::ASin(GetSnp()));
544     Float_t dy = dx*ty;
545     Float_t dz = dx*TMath::Sqrt(1.+ty*ty)*GetTgl();
546     cl.SetY(c->GetY()-dy);  
547     cl.SetZ(c->GetZ()-dz);  
548   }
549
550   if (!AliTPCtrack::Update(&cl,chisq,index)) return kFALSE;
551   
552   if (fCMeanSigmaY2p30<0){
553     fCMeanSigmaY2p30= c->GetSigmaY2();   //! current mean sigma Y2 - mean30%
554     fCMeanSigmaZ2p30= c->GetSigmaZ2();   //! current mean sigma Z2 - mean30%    
555     fCMeanSigmaY2p30R = 1;   //! current mean sigma Y2 - mean5%
556     fCMeanSigmaZ2p30R = 1;   //! current mean sigma Z2 - mean5%
557   }
558   //
559   fCMeanSigmaY2p30= 0.70*fCMeanSigmaY2p30 +0.30*c->GetSigmaY2();   
560   fCMeanSigmaZ2p30= 0.70*fCMeanSigmaZ2p30 +0.30*c->GetSigmaZ2();  
561   if (fCurrentSigmaY2>0){
562     fCMeanSigmaY2p30R = 0.7*fCMeanSigmaY2p30R  +0.3*c->GetSigmaY2()/fCurrentSigmaY2;  
563     fCMeanSigmaZ2p30R = 0.7*fCMeanSigmaZ2p30R  +0.3*c->GetSigmaZ2()/fCurrentSigmaZ2;   
564   }
565
566
567   SetClusterIndex(n,idx);          // restore the current cluster index
568   return kTRUE;
569 }
570
571
572
573 //_____________________________________________________________________________
574 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
575   //-----------------------------------------------------------------
576   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
577   //-----------------------------------------------------------------
578   AliTPCParam *param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
579   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
580   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
581   Int_t row2 = row1+param->GetNRowUp2();
582   //
583   //
584   //
585   fDEDX[0]      = CookdEdxNorm(low,up,0 ,i1  ,i2,  kTRUE,kFALSE,2,0);
586   fDEDX[1]      = CookdEdxNorm(low,up,0 ,0   ,row0,kTRUE,kFALSE,2,0);
587   fDEDX[2]      = CookdEdxNorm(low,up,0 ,row0,row1,kTRUE,kFALSE,2,0);
588   fDEDX[3]      = CookdEdxNorm(low,up,0 ,row1,row2,kTRUE,kFALSE,2,0);
589   //
590   fSDEDX[0]     = CookdEdxNorm(low,up,0 ,i1  ,i2,  kTRUE,kFALSE,2,1);
591   fSDEDX[1]     = CookdEdxNorm(low,up,0 ,0   ,row0,kTRUE,kFALSE,2,1);
592   fSDEDX[2]     = CookdEdxNorm(low,up,0 ,row0,row1,kTRUE,kFALSE,2,1);
593   fSDEDX[3]     = CookdEdxNorm(low,up,0 ,row1,row2,kTRUE,kFALSE,2,1);
594   //
595   fNCDEDX[0]    = TMath::Nint(CookdEdxNorm(low,up,0 ,i1  ,i2,  kTRUE,kFALSE,2,2));
596   fNCDEDX[1]    = TMath::Nint(CookdEdxNorm(low,up,0 ,0   ,row0,kTRUE,kFALSE,2,2));
597   fNCDEDX[2]    = TMath::Nint(CookdEdxNorm(low,up,0 ,row0,row1,kTRUE,kFALSE,2,2));
598   fNCDEDX[3]    = TMath::Nint(CookdEdxNorm(low,up,0 ,row1,row2,kTRUE,kFALSE,2,2));
599
600   SetdEdx(fDEDX[0]);
601   return fDEDX[0];
602
603 //  return CookdEdxNorm(low,up,0,i1,i2,1,0,2);
604
605
606 //   Float_t amp[200];
607 //   Float_t angular[200];
608 //   Float_t weight[200];
609 //   Int_t index[200];
610 //   //Int_t nc = 0;
611 //   Float_t meanlog = 100.;
612   
613 //   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
614 //   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
615 //   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
616 //   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
617 //   //
618 //   //
619 //   fNShared =0;
620
621 //   Float_t gainGG = 1;
622 //   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
623 //     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000.;  //relative gas gain
624 //   }
625
626
627 //   for (Int_t of =0; of<4; of++){    
628 //     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
629 //       {
630 //      Int_t clindex = fIndex[i];
631 //      if (clindex<0||clindex&0x8000) continue;
632
633 //      //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
634 //      AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
635 //      //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
636 //      //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
637 //      //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
638
639 //      if (point==0) continue;
640 //      AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
641 //      if (cl==0) continue;    
642 //      if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
643 //      if (cl->IsUsed(11)) {
644 //        fNShared++;
645 //        continue;
646 //      }
647 //      Int_t   type   = cl->GetType();
648 //      //if (point->fIsShared){
649 //      //  fNShared++;
650 //      //  continue;
651 //      //}
652 //      //if (pointm) 
653 //      //  if (pointm->fIsShared) continue;
654 //      //if (pointp) 
655 //      //  if (pointp->fIsShared) continue;
656
657 //      if (type<0) continue;
658 //      //if (type>10) continue;       
659 //      //if (point->GetErrY()==0) continue;
660 //      //if (point->GetErrZ()==0) continue;
661
662 //      //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
663 //      //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
664 //      //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue; 
665
666
667 //      //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
668 //      if (cl->GetMax()<5) continue;
669 //      Float_t angley = point->GetAngleY();
670 //      Float_t anglez = point->GetAngleZ();
671
672 //      Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
673 //      Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
674 //      /*
675 //      Float_t ns = 1.;
676 //      if (pointm){
677 //        rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
678 //        rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
679 //        ns+=1.;
680 //      }
681 //      if (pointp){
682 //        rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
683 //        rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
684 //        ns+=1.;
685 //      }
686 //      rsigmay/=ns;
687 //      rsigmaz/=ns;
688 //      */
689
690 //      Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
691
692 //      Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
693 //      if (i>64){
694 //        //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
695 //        ampc = 1.*cl->GetMax();
696 //        //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();          
697 //        //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
698 //        //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
699 //        // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
700 //        //Float_t dz = 
701 //        //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
702 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
703 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
704 //        //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
705 //        //ampc               *=zfactor; 
706 //      }
707 //      else{ 
708 //        //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax(); 
709 //        ampc = 1.0*cl->GetMax(); 
710 //        //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ(); 
711 //        //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
712 //        // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
713 //        //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
714 //        //Float_t dz = 
715 //        //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
716
717 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
718 //        //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
719 //        //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
720 //        //ampc               *=zfactor; 
721
722 //      }
723 //      ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
724 //      //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
725 //      Float_t w      =  1.;
726 //      //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5); 
727 //      //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
728 //      if (i<64) {
729 //        ampc /= 0.6;
730 //        //ampc /= (1+0.0008*z);
731 //      } else
732 //        if (i>128){
733 //          ampc /=1.5;
734 //          //ampc /= (1+0.0008*z);
735 //        }else{
736 //          //ampc /= (1+0.0008*z);
737 //        }
738         
739 //      if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
740 //        // w*= 2.;
741           
742 //        continue;
743 //      }
744 //      if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
745 //      amp[nc[of]]        = ampc;
746 //      amp[nc[of]]       /=gainGG;
747 //      angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
748 //      weight[nc[of]]     = w;
749 //      nc[of]++;
750 //       }
751     
752 //     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
753 //     Float_t sumamp=0;
754 //     Float_t sumamp2=0;
755 //     Float_t sumw=0;
756 //     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
757 //     meanlog = 50;
758 //     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
759 //       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
760 //       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
761 //       //
762 //       sumw    += weight[index[i]]; 
763 //       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
764 //       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
765 //       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
766 //     }
767 //     if (sumw<1){ 
768 //       SetdEdx(0);  
769 //     }
770 //     else {
771 //       norm[of] /= sumw;
772 //       mean[of]  = sumamp/sumw;
773 //       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
774 //       if (sigma[of]>0.1) 
775 //      sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
776 //       else
777 //      sigma[of] = 1000;
778       
779 //     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
780 //     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
781 //     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
782 //     }
783 //   }
784
785 //   Float_t dedx =0;
786 //   fSdEdx =0;
787 //   fMAngular =0;
788 //   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
789 //   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
790
791   
792 //   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/ 
793 //   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
794
795 //   Int_t norm2 = 0;
796 //   Int_t norm3 = 0;
797 //   for (Int_t i =0;i<4;i++){
798 //     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
799 //       dedx      += mean[i] *nc[i];
800 //       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
801 //       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
802 //       norm2     += nc[i];
803 //       norm3     += nc[i]-2;
804 //     }
805 //     fDEDX[i]  = mean[i];             
806 //     fSDEDX[i] = sigma[i];            
807 //     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
808 //   }
809
810 //   if (norm3>0){
811 //     dedx   /=norm2;
812 //     fSdEdx /=norm3;
813 //     fMAngular/=norm2;
814 //   }
815 //   else{
816 //     SetdEdx(0);
817 //     return 0;
818 //   }
819 //   //  Float_t dedx1 =dedx;
820 //   /*
821 //   dedx =0;
822 //   for (Int_t i =0;i<4;i++){
823 //     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
824 //       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
825 //       dedx      += mean[i] *nc[i];
826 //     }
827 //     fDEDX[i]  = mean[i];                
828 //   }
829 //   dedx /= norm2;
830 //   */
831
832   
833 //   SetdEdx(dedx);
834 //   return dedx;
835 }
836 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
837   //
838   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
839   //
840   Double_t bg2=bg*bg;
841   Double_t bethe;
842   if (bg<3.5e1) 
843     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
844   else // Density effect ( approximately :) 
845     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
846   return bethe/11.091;
847 }
848
849 void AliTPCseed::CookPID()
850 {
851   //
852   // cook PID information according dEdx
853   //
854   Double_t fRange = 10.;
855   Double_t fRes   = 0.1;
856   Double_t fMIP   = 47.;
857   //
858   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
859   Double_t sumr =0;
860   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
861     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
862     Double_t mom=GetP();
863     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
864     Double_t bethe=Bethe(mom/mass); 
865     Double_t sigma=fRes*bethe;
866     if (sigma>0.001){
867       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
868         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
869         sumr+=fTPCr[j];
870         continue;
871       }
872       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
873       sumr+=fTPCr[j];
874     }
875     else{
876       fTPCr[j]=1.;
877       sumr+=fTPCr[j];
878     }
879   }
880   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
881     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
882   }
883 }
884
885 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
886 //-----------------------------------------------------------------
887 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
888 //-----------------------------------------------------------------
889   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
890     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt((1.-c1)*(1.+c1));
891     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
892     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
893     Double_t r2=TMath::Sqrt((1.-c2)*(1.+c2));
894     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
895 }
896
897 void AliTPCseed::SetClusterMapBit(int ibit, Bool_t state)
898 {
899   fClusterMap[ibit] = state;
900 }
901 Bool_t AliTPCseed::GetClusterMapBit(int ibit)
902 {
903   return fClusterMap[ibit];
904 }
905 void AliTPCseed::SetSharedMapBit(int ibit, Bool_t state)
906 {
907   fSharedMap[ibit] = state;
908 }
909 Bool_t AliTPCseed::GetSharedMapBit(int ibit)
910 {
911   return fSharedMap[ibit];
912 }
913
914
915
916
917
918 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxNorm(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, Bool_t shapeNorm,Bool_t posNorm, Int_t padNorm, Int_t returnVal){
919  
920   //
921   // calculates dedx using the cluster
922   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
923   // type   -  1 - max charge  or 0- total charge in cluster 
924   //           //2- max no corr 3- total+ correction
925   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
926   // shapeNorm - kTRUE  -taken from OCDB
927   //           
928   // posNorm   - usage of pos normalization 
929   // padNorm   - pad type normalization
930   // returnVal - 0 return mean
931   //           - 1 return RMS
932   //           - 2 return number of clusters
933   //           
934   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
935   //
936   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
937   AliTPCParam * param = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
938   if (!parcl)  return 0;
939   if (!param) return 0;
940   Int_t row0 = param->GetNRowLow();
941   Int_t row1 = row0+param->GetNRowUp1();
942
943   Float_t amp[160];
944   Int_t   indexes[160];
945   Int_t   ncl=0;
946   //
947   //
948   Float_t gainGG      = 1;  // gas gain factor -always enabled
949   Float_t gainPad     = 1;  // gain map  - used always
950   Float_t corrShape   = 1;  // correction due angular effect, diffusion and electron attachment
951   Float_t corrPos     = 1;  // local position correction - if posNorm enabled
952   Float_t corrPadType = 1;  // pad type correction - if padNorm enabled
953   Float_t corrNorm    = 1;  // normalization factor - set Q to channel 50
954   //   
955   //
956   //
957   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
958     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000;  //relative gas gain
959   }
960
961   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
962   const Float_t kedgey =3.;
963   //
964   //
965   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
966     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
967     if (!cluster) continue;
968     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
969     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetMax():cluster->GetQ();
970     Int_t  ipad= 0;
971     if (irow>=row0) ipad=1;
972     if (irow>=row1) ipad=2;    
973     //
974     //
975     //
976     AliTPCCalPad * gainMap =  AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor();
977     if (gainMap) {
978       //
979       // Get gainPad - pad by pad calibration
980       //
981       Float_t factor = 1;      
982       AliTPCCalROC * roc = gainMap->GetCalROC(cluster->GetDetector());
983       if (irow < row0) { // IROC
984         factor = roc->GetValue(irow, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
985       } else {         // OROC
986         factor = roc->GetValue(irow - row0, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
987       }
988       if (factor>0.5) gainPad=factor;
989     }
990     //
991     //do position and angular normalization
992     //
993     if (shapeNorm){
994       if (type<=1){
995         //      
996         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
997         Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
998         Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
999         
1000         Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
1001         corrShape  = parcl->Qnorm(ipad,type,dr,ty,tz);
1002       }
1003     }
1004     
1005     if (posNorm){
1006       //
1007       // Do position normalization - relative distance to 
1008       // center of pad- time bin
1009       // Work in progress
1010       //      corrPos = parcl->QnormPos(ipad,type, cluster->GetPad(),
1011       //                                cluster->GetTimeBin(), cluster->GetZ(),
1012       //                                cluster->GetSigmaY2(),cluster->GetSigmaZ2(),
1013       //                                cluster->GetMax(),cluster->GetQ());
1014       AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1015       Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
1016       Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ()*TMath::Sqrt(1+ty*ty));
1017       
1018       if (type==1) corrPos = 
1019         parcl->QmaxCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(), 
1020                               TMath::Nint(cluster->GetTimeBin()),ty,tz,0.5,0.2,1.6);
1021       if (type==0) corrPos = 
1022         parcl->QtotCorrection(cluster->GetDetector(), cluster->GetRow(),cluster->GetPad(), 
1023                               TMath::Nint(cluster->GetTimeBin()),ty,tz,0.5,0.2,cluster->GetQ(),2.5,1.6);
1024     }
1025
1026     if (padNorm==1){
1027       //taken from OCDB
1028       if (type==0 && parcl->fQpadTnorm) corrPadType = (*parcl->fQpadTnorm)[ipad];
1029       if (type==1 && parcl->fQpadTnorm) corrPadType = (*parcl->fQpadMnorm)[ipad];
1030
1031     }
1032     if (padNorm==2){
1033       corrPadType  =param->GetPadPitchLength(cluster->GetDetector(),cluster->GetRow());
1034       //use hardwired - temp fix
1035       if (type==0) corrNorm=3.;
1036       if (type==1) corrNorm=1.;
1037     }
1038     //
1039     amp[ncl]=charge;
1040     amp[ncl]/=gainGG;
1041     amp[ncl]/=gainPad;
1042     amp[ncl]/=corrShape;
1043     amp[ncl]/=corrPadType;
1044     amp[ncl]/=corrPos;
1045     amp[ncl]/=corrNorm; 
1046     //
1047     ncl++;
1048   }
1049
1050   if (type>3) return ncl; 
1051   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1052
1053   if (ncl<10) return 0;
1054   
1055   Float_t suma=0;
1056   Float_t suma2=0;  
1057   Float_t sumn=0;
1058   Int_t icl0=TMath::Nint(ncl*low);
1059   Int_t icl1=TMath::Nint(ncl*up);
1060   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1061     suma+=amp[indexes[icl]];
1062     suma2+=amp[indexes[icl]]*amp[indexes[icl]];
1063     sumn++;
1064   }
1065   Float_t mean =suma/sumn;
1066   Float_t rms  =TMath::Sqrt(TMath::Abs(suma2/sumn-mean*mean));
1067   if (returnVal==1) return rms;
1068   if (returnVal==2) return ncl;
1069   return mean;
1070 }
1071
1072
1073 Double_t AliTPCseed::BetheMass(Double_t mass){
1074   //
1075   // return bethe-bloch
1076   //
1077   Float_t bg= P()/mass; 
1078   const Double_t kp1=0.76176e-1;
1079   const Double_t kp2=10.632;
1080   const Double_t kp3=0.13279e-4;
1081   const Double_t kp4=1.8631;
1082   const Double_t kp5=1.9479;
1083
1084   Double_t dbg = (Double_t) bg;
1085
1086   Double_t beta = dbg/TMath::Sqrt(1.+dbg*dbg);
1087
1088   Double_t aa = TMath::Power(beta,kp4);
1089   Double_t bb = TMath::Power(1./dbg,kp5);
1090
1091   bb=TMath::Log(kp3+bb);
1092   
1093   return ((Float_t)((kp2-aa-bb)*kp1/aa));
1094 }
1095
1096
1097 Float_t  AliTPCseed::CookShape(Int_t type){
1098   //
1099   //
1100   //
1101  //-----------------------------------------------------------------
1102   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
1103   //-----------------------------------------------------------------
1104   Float_t means=0;
1105   Float_t meanc=0;
1106   for (Int_t i =0; i<160;i++)    {
1107     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
1108     if (point==0) continue;
1109
1110     AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
1111     if (cl==0) continue;        
1112     
1113     Float_t rsigmay =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1114     Float_t rsigmaz =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaZ());
1115     Float_t rsigma =   (rsigmay+rsigmaz)*0.5;
1116     if (type==0) means+=rsigma;
1117     if (type==1) means+=rsigmay;
1118     if (type==2) means+=rsigmaz;
1119     meanc++;
1120   }
1121   Float_t mean = (meanc>0)? means/meanc:0;
1122   return mean;
1123 }
1124
1125
1126
1127 Int_t  AliTPCseed::RefitTrack(AliTPCseed *seed, AliExternalTrackParam * parin, AliExternalTrackParam * parout){
1128   //
1129   // Refit the track
1130   // return value - number of used clusters
1131   // 
1132   //
1133   const Int_t kMinNcl =10;
1134   AliTPCseed *track=new AliTPCseed(*seed);
1135   Int_t sector=-1;
1136   // reset covariance
1137   //
1138   Double_t covar[15];
1139   for (Int_t i=0;i<15;i++) covar[i]=0;
1140   covar[0]=10.*10.;
1141   covar[2]=10.*10.;
1142   covar[5]=10.*10./(64.*64.);
1143   covar[9]=10.*10./(64.*64.);
1144   covar[14]=1*1;
1145   //
1146
1147   Float_t xmin=1000, xmax=-10000;
1148   Int_t imin=158, imax=0;
1149   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
1150     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1151     if (!c) continue;
1152     if (sector<0) sector = c->GetDetector();
1153     if (c->GetX()<xmin) xmin=c->GetX();
1154     if (c->GetX()>xmax) xmax=c->GetX();
1155     if (i<imin) imin=i;
1156     if (i>imax) imax=i;
1157   }
1158   if(imax-imin<kMinNcl) {
1159     delete track;
1160     return 0 ;
1161   }
1162   // Not succes to rotate
1163   if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1164     delete track;
1165     return 0;
1166   }
1167   //
1168   //
1169   // fit from inner to outer row
1170   //
1171   AliExternalTrackParam paramIn;
1172   AliExternalTrackParam paramOut;
1173   Bool_t isOK=kTRUE;
1174   Int_t ncl=0;
1175   //
1176   //
1177   //
1178   for (Int_t i=imin; i<=imax; i++){
1179     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1180     if (!c) continue;
1181     //    if (RejectCluster(c,track)) continue;
1182     sector = (c->GetDetector()%18);
1183     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1184       //continue;
1185     }
1186     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1187     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1188     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1189       isOK=kFALSE;
1190     }
1191     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1192   }
1193   if (!isOK) { delete track; return 0;}
1194   track->AddCovariance(covar);
1195   //
1196   //
1197   //
1198   for (Int_t i=imax; i>=imin; i--){
1199     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1200     if (!c) continue;
1201     //if (RejectCluster(c,track)) continue;
1202     sector = (c->GetDetector()%18);
1203     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1204       //continue;
1205     }
1206     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1207     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1208     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1209       isOK=kFALSE;
1210     }
1211     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1212   }
1213   //if (!isOK) { delete track; return 0;}
1214   paramIn = *track;
1215   track->AddCovariance(covar);
1216   //
1217   //
1218   for (Int_t i=imin; i<=imax; i++){
1219     AliTPCclusterMI *c=track->GetClusterPointer(i);
1220     if (!c) continue;
1221     sector = (c->GetDetector()%18);
1222     if (!track->Rotate(TMath::DegToRad()*(sector%18*20.+10.)-track->GetAlpha())) {
1223       //continue;
1224     }
1225     ncl++;
1226     //if (RejectCluster(c,track)) continue;
1227     Double_t r[3]={c->GetX(),c->GetY(),c->GetZ()};
1228     Double_t cov[3]={0.01,0.,0.01}; //TODO: correct error parametrisation
1229     if (!track->PropagateTo(r[0])) {
1230       isOK=kFALSE;
1231     }
1232     if ( !((static_cast<AliExternalTrackParam*>(track)->Update(&r[1],cov)))) isOK=kFALSE;
1233   }
1234   //if (!isOK) { delete track; return 0;}
1235   paramOut=*track;
1236   //
1237   //
1238   //
1239   if (parin) (*parin)=paramIn;
1240   if (parout) (*parout)=paramOut;
1241   return ncl;
1242 }
1243
1244
1245
1246 Bool_t AliTPCseed::RefitTrack(AliTPCseed* /*seed*/, Bool_t /*out*/){
1247   //
1248   //
1249   //
1250   return kFALSE;
1251 }
1252
1253
1254
1255
1256
1257
1258 void  AliTPCseed::GetError(AliTPCclusterMI* cluster, AliExternalTrackParam * param, 
1259                                   Double_t& erry, Double_t &errz)
1260 {
1261   //
1262   // Get cluster error at given position
1263   //
1264   AliTPCClusterParam *clusterParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1265   Double_t tany,tanz;  
1266   Double_t snp1=param->GetSnp();
1267   tany=snp1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1268   //
1269   Double_t tgl1=param->GetTgl();
1270   tanz=tgl1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1271   //
1272   Int_t padSize = 0;                          // short pads
1273   if (cluster->GetDetector() >= 36) {
1274     padSize = 1;                              // medium pads 
1275     if (cluster->GetRow() > 63) padSize = 2; // long pads
1276   }
1277
1278   erry  = clusterParam->GetError0Par( 0, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tany) );
1279   errz  = clusterParam->GetError0Par( 1, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tanz) );
1280 }
1281
1282
1283 void  AliTPCseed::GetShape(AliTPCclusterMI* cluster, AliExternalTrackParam * param, 
1284                                   Double_t& rmsy, Double_t &rmsz)
1285 {
1286   //
1287   // Get cluster error at given position
1288   //
1289   AliTPCClusterParam *clusterParam = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1290   Double_t tany,tanz;  
1291   Double_t snp1=param->GetSnp();
1292   tany=snp1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1293   //
1294   Double_t tgl1=param->GetTgl();
1295   tanz=tgl1/TMath::Sqrt((1.-snp1)*(1.+snp1));
1296   //
1297   Int_t padSize = 0;                          // short pads
1298   if (cluster->GetDetector() >= 36) {
1299     padSize = 1;                              // medium pads 
1300     if (cluster->GetRow() > 63) padSize = 2; // long pads
1301   }
1302
1303   rmsy  = clusterParam->GetRMSQ( 0, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tany), TMath::Abs(cluster->GetMax()) );
1304   rmsz  = clusterParam->GetRMSQ( 1, padSize, (250.0 - TMath::Abs(cluster->GetZ())), TMath::Abs(tanz) ,TMath::Abs(cluster->GetMax()));
1305 }
1306
1307
1308
1309 Double_t AliTPCseed::GetQCorrGeom(Float_t ty, Float_t tz){
1310   //Geoetrical
1311   //ty    - tangent in local y direction
1312   //tz    - tangent 
1313   //
1314   Float_t norm=TMath::Sqrt(1+ty*ty+tz*tz);
1315   return norm;
1316 }
1317
1318 Double_t AliTPCseed::GetQCorrShape(Int_t ipad, Int_t type,Float_t z, Float_t ty, Float_t tz, Float_t /*q*/, Float_t /*thr*/){
1319   //
1320   // Q normalization
1321   //
1322   // return value =  Q Normalization factor
1323   // Normalization - 1 - shape factor part for full drift          
1324   //                 1 - electron attachment for 0 drift
1325
1326   // Input parameters:
1327   //
1328   // ipad - 0 short pad
1329   //        1 medium pad
1330   //        2 long pad
1331   //
1332   // type - 0 qmax
1333   //      - 1 qtot
1334   //
1335   //z     - z position (-250,250 cm)
1336   //ty    - tangent in local y direction
1337   //tz    - tangent 
1338   //
1339
1340   AliTPCClusterParam * paramCl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1341   AliTPCParam   * paramTPC = AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters();
1342  
1343   if (!paramCl) return 1;
1344   //
1345   Double_t dr =  250.-TMath::Abs(z); 
1346   Double_t sy =  paramCl->GetRMS0( 0,ipad, dr, TMath::Abs(ty));
1347   Double_t sy0=  paramCl->GetRMS0(0,ipad, 250, 0);
1348   Double_t sz =  paramCl->GetRMS0( 1,ipad, dr, TMath::Abs(tz));
1349   Double_t sz0=  paramCl->GetRMS0(1,ipad, 250, 0);
1350
1351   Double_t sfactorMax = TMath::Sqrt(sy0*sz0/(sy*sz));
1352
1353  
1354   Double_t dt = 1000000*(dr/paramTPC->GetDriftV());  //time in microsecond
1355   Double_t attProb = TMath::Exp(-paramTPC->GetAttCoef()*paramTPC->GetOxyCont()*dt);
1356   //
1357   //
1358   if (type==0) return sfactorMax*attProb;
1359
1360   return attProb;
1361
1362
1363 }
1364