]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blob - TPC/AliTPCseed.cxx
Adding correction for the radial shift (Marian)
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCseed.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16
17
18
19 //-----------------------------------------------------------------
20 //           Implementation of the TPC seed class
21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
23 //-----------------------------------------------------------------
24 #include "TClonesArray.h"
25 #include "AliTPCseed.h"
26 #include "AliTPCReconstructor.h"
27 #include "AliTPCClusterParam.h"
28 #include "AliTPCCalPad.h"
29 #include "AliTPCCalROC.h"
30 #include "AliTPCcalibDB.h"
31 #include "AliTPCParam.h"
32
33
34
35 ClassImp(AliTPCseed)
36
37
38
39 AliTPCseed::AliTPCseed():
40   AliTPCtrack(),
41   fEsd(0x0),
42   fClusterOwner(kFALSE),
43   fRow(0),
44   fSector(-1),
45   fRelativeSector(-1),
46   fCurrentSigmaY2(1e10),
47   fCurrentSigmaZ2(1e10),
48   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
49   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
50   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
51   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
52   //
53   fErrorY2(1e10),
54   fErrorZ2(1e10),
55   fCurrentCluster(0x0),
56   fCurrentClusterIndex1(-1),
57   fInDead(kFALSE),
58   fIsSeeding(kFALSE),
59   fNoCluster(0),
60   fSort(0),
61   fBSigned(kFALSE),
62   fSeedType(0),
63   fSeed1(-1),
64   fSeed2(-1),
65   fMAngular(0),
66   fCircular(0),
67   fClusterMap(159),
68   fSharedMap(159)
69 {
70   //
71   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
72   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
73   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
74   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
75   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
76     fDEDX[i] = 0.;
77     fSDEDX[i] = 1e10;
78     fNCDEDX[i] = 0;
79   }
80   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
81   //  for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
82   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
83   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
84   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
85
86 }
87
88 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
89   AliTPCtrack(s),
90   fEsd(0x0),
91   fClusterOwner(clusterOwner),
92   fRow(0),
93   fSector(-1),
94   fRelativeSector(-1),
95   fCurrentSigmaY2(-1),
96   fCurrentSigmaZ2(-1),
97   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
98   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
99   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
100   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
101   fErrorY2(1e10),
102   fErrorZ2(1e10),
103   fCurrentCluster(0x0),
104   fCurrentClusterIndex1(-1),
105   fInDead(kFALSE),
106   fIsSeeding(kFALSE),
107   fNoCluster(0),
108   fSort(0),
109   fBSigned(kFALSE),
110   fSeedType(0),
111   fSeed1(-1),
112   fSeed2(-1),
113   fMAngular(0),
114   fCircular(0),
115   fClusterMap(s.fClusterMap),
116   fSharedMap(s.fSharedMap)
117 {
118   //---------------------
119   // dummy copy constructor
120   //-------------------------
121   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
122     fClusterPointer[i]=0;
123     if (fClusterOwner){
124       if (s.fClusterPointer[i])
125         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
126     }else{
127       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
128     }
129     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
130   }
131   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
132   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
133   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
134     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
135     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
136     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
137   }
138   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
139
140 }
141
142
143 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
144   AliTPCtrack(t),
145   fEsd(0x0),
146   fClusterOwner(kFALSE),
147   fRow(0),
148   fSector(-1),
149   fRelativeSector(-1),
150   fCurrentSigmaY2(-1),
151   fCurrentSigmaZ2(-1),
152   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
153   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
154   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
155   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
156   fErrorY2(1e10),
157   fErrorZ2(1e10),
158   fCurrentCluster(0x0),
159   fCurrentClusterIndex1(-1),
160   fInDead(kFALSE),
161   fIsSeeding(kFALSE),
162   fNoCluster(0),
163   fSort(0),
164   fBSigned(kFALSE),
165   fSeedType(0),
166   fSeed1(-1),
167   fSeed2(-1),
168   fMAngular(0),
169   fCircular(0),
170   fClusterMap(159),
171   fSharedMap(159)
172 {
173   //
174   // Constructor from AliTPCtrack
175   //
176   fFirstPoint =0;
177   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
178   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
179     fClusterPointer[i] = 0;
180     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
181     if (index>=-1){ 
182       SetClusterIndex2(i,index);
183     }
184     else{
185       SetClusterIndex2(i,-3); 
186     }    
187   }
188   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
189     fDEDX[i] = 0.;
190     fSDEDX[i] = 1e10;
191     fNCDEDX[i] = 0;
192   }
193   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
194   
195   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
196   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
197   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
198   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
199
200 }
201
202 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
203                        const Double_t cc[15], Int_t index):      
204   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
205   fEsd(0x0),
206   fClusterOwner(kFALSE),
207   fRow(0),
208   fSector(-1),
209   fRelativeSector(-1),
210   fCurrentSigmaY2(-1),
211   fCurrentSigmaZ2(-1),
212   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
213   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
214   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
215   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
216   fErrorY2(1e10),
217   fErrorZ2(1e10),
218   fCurrentCluster(0x0),
219   fCurrentClusterIndex1(-1),
220   fInDead(kFALSE),
221   fIsSeeding(kFALSE),
222   fNoCluster(0),
223   fSort(0),
224   fBSigned(kFALSE),
225   fSeedType(0),
226   fSeed1(-1),
227   fSeed2(-1),
228   fMAngular(0),
229   fCircular(0),
230   fClusterMap(159),
231   fSharedMap(159)
232 {
233   //
234   // Constructor
235   //
236   fFirstPoint =0;
237   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
238   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
239   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
240   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
241     fDEDX[i] = 0.;
242     fSDEDX[i] = 1e10;
243     fNCDEDX[i] = 0;
244   }
245   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
246 }
247
248 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
249   //
250   // destructor
251   fNoCluster =0;
252   if (fClusterOwner){
253     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
254       delete fClusterPointer[icluster];
255     }
256   }
257
258 }
259 //_________________________________________________
260 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
261 {
262   //
263   // assignment operator 
264   //
265   if(this!=&param){
266     AliTPCtrack::operator=(param);
267     fEsd =param.fEsd; 
268     for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i]; // this is not allocated by AliTPCSeed
269     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
270     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
271     // but deleted in the dtor... strange...
272     fRow            = param.fRow;
273     fSector         = param.fSector;
274     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
275     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
276     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
277     fErrorY2        = param.fErrorY2;
278     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
279     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
280     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1; 
281     fInDead         = param.fInDead;
282     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
283     fNoCluster      = param.fNoCluster;
284     fSort           = param.fSort;
285     fBSigned        = param.fBSigned;
286     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
287       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
288       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
289       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
290     }
291     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
292     
293     fSeedType = param.fSeedType;
294     fSeed1    = param.fSeed1;
295     fSeed2    = param.fSeed2;
296     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
297     fMAngular = param.fMAngular;
298     fCircular = param.fCircular;
299     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
300     fClusterMap = param.fClusterMap;
301     fSharedMap = param.fSharedMap;
302   }
303   return (*this);
304 }
305 //____________________________________________________
306 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
307 {
308   //
309   // 
310   return &fTrackPoints[i];
311 }
312
313
314
315 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
316 {
317   //
318   //
319   // return cluster for n rows bellow first point
320   Int_t nfoundable = 1;
321   Int_t nfound      = 1;
322   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
323     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
324     if (index!=-1) nfoundable++;
325     if (index>0) nfound++;
326   }
327   if (nfoundable<n) return 0;
328   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
329
330 }
331
332
333 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
334 {
335   // get cluster stat.  on given region
336   //
337   found       = 0;
338   foundable   = 0;
339   shared      =0;
340   for (Int_t i=first;i<last; i++){
341     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
342     if (index!=-1) foundable++;
343     if (index&0x8000) continue;
344     if (fClusterPointer[i]) {
345       found++;
346     }
347     else 
348       continue;
349
350     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
351       shared++;
352       continue;
353     }
354     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
355     //
356     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
357       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
358         shared++;
359         continue;
360       }
361     }
362     if ( fClusterPointer[i+1]){
363       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
364         shared++;
365         continue;
366       }
367     }
368     
369   }
370   //if (shared>found){
371     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
372   //}
373 }
374
375
376
377
378
379 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
380 {
381   //
382   //
383   SetNumberOfClusters(0);
384   fNFoundable = 0;
385   SetChi2(0);
386   ResetCovariance(10.);
387   /*
388   if (fTrackPoints){
389     for (Int_t i=0;i<8;i++){
390       delete [] fTrackPoints[i];
391     }
392     delete fTrackPoints;
393     fTrackPoints =0;
394   }
395   */
396
397   if (all){   
398     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
399     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
400   }
401
402 }
403
404
405 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
406 {
407
408   //------------------------------------------------------------------
409   //This function makes a track forget its history :)  
410   //------------------------------------------------------------------
411   if (factor<=0) {
412     ResetCovariance(10.);
413     return;
414   }
415   ResetCovariance(factor);
416
417   SetNumberOfClusters(0);
418   fNFoundable =0;
419   SetChi2(0);
420   fRemoval = 0;
421   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
422   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
423   fNoCluster     = 0;
424   //fFirstPoint = 160;
425   //fLastPoint  = 0;
426 }
427
428
429
430
431 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
432 {
433   //-----------------------------------------------------------------
434   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
435   // doesn't change internal state of the track
436   //-----------------------------------------------------------------
437   
438   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
439
440   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {   
441     return 0;
442   }
443
444   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
445   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt(1.- c1*c1);
446   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt(1.- c2*c2);
447   
448   y = GetY();
449   z = GetZ();
450   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
451   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
452   
453   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
454   Double_t dz = 0;
455   //
456   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
457   /*
458   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
459     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
460   }else{
461     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
462   }
463   */
464   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
465   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
466   //
467   y+=dy;
468   z+=dz;
469   
470
471   return 1;  
472 }
473
474
475 //_____________________________________________________________________________
476 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const 
477 {
478   //-----------------------------------------------------------------
479   // This function calculates a predicted chi2 increment.
480   //-----------------------------------------------------------------
481   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
482   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
483   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
484 }
485
486 //_________________________________________________________________________________________
487
488
489 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
490   //-----------------------------------------------------------------
491   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
492   //-----------------------------------------------------------------
493   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
494
495   if (fSort == 0){
496     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
497     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
498     Double_t z2 = t->GetZ();
499     Double_t z1 = GetZ();
500     if (z2>z1) return 1;
501     if (z2<z1) return -1;
502     return 0;
503   }
504   else {
505     Float_t f2 =1;
506     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
507     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
508
509     Float_t f1 =1;
510     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
511
512     if (fBConstrain)   f1=1.2;
513  
514     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
515     else return +1;
516   }
517 }
518
519
520
521
522 //_____________________________________________________________________________
523 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t index)
524 {
525   //-----------------------------------------------------------------
526   // This function associates a cluster with this track.
527   //-----------------------------------------------------------------
528   Int_t n=GetNumberOfClusters();
529   Int_t idx=GetClusterIndex(n);    // save the current cluster index
530
531   AliCluster cl(*c);  cl.SetSigmaY2(fErrorY2); cl.SetSigmaZ2(fErrorZ2);
532   Float_t dx = ((AliTPCclusterMI*)c)->GetX()-GetX();
533   if (TMath::Abs(dx)>0){
534     Float_t ty = TMath::Tan(TMath::ASin(GetSnp()));
535     Float_t dy = dx*ty;
536     Float_t dz = dx*TMath::Sqrt(1.+ty*ty)*GetTgl();
537     cl.SetY(c->GetY()-dy);  
538     cl.SetZ(c->GetZ()-dz);  
539   }
540
541   if (!AliTPCtrack::Update(&cl,chisq,index)) return kFALSE;
542   
543   if (fCMeanSigmaY2p30<0){
544     fCMeanSigmaY2p30= c->GetSigmaY2();   //! current mean sigma Y2 - mean30%
545     fCMeanSigmaZ2p30= c->GetSigmaZ2();   //! current mean sigma Z2 - mean30%    
546     fCMeanSigmaY2p30R = 1;   //! current mean sigma Y2 - mean5%
547     fCMeanSigmaZ2p30R = 1;   //! current mean sigma Z2 - mean5%
548   }
549   //
550   fCMeanSigmaY2p30= 0.70*fCMeanSigmaY2p30 +0.30*c->GetSigmaY2();   
551   fCMeanSigmaZ2p30= 0.70*fCMeanSigmaZ2p30 +0.30*c->GetSigmaZ2();  
552   if (fCurrentSigmaY2>0){
553     fCMeanSigmaY2p30R = 0.7*fCMeanSigmaY2p30R  +0.3*c->GetSigmaY2()/fCurrentSigmaY2;  
554     fCMeanSigmaZ2p30R = 0.7*fCMeanSigmaZ2p30R  +0.3*c->GetSigmaZ2()/fCurrentSigmaZ2;   
555   }
556
557
558   SetClusterIndex(n,idx);          // restore the current cluster index
559   return kTRUE;
560 }
561
562
563
564 //_____________________________________________________________________________
565 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
566   //-----------------------------------------------------------------
567   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
568   //-----------------------------------------------------------------
569
570   Float_t amp[200];
571   Float_t angular[200];
572   Float_t weight[200];
573   Int_t index[200];
574   //Int_t nc = 0;
575   Float_t meanlog = 100.;
576   
577   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
578   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
579   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
580   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
581   //
582   //
583   fNShared =0;
584
585   Float_t gainGG = 1;
586   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
587     gainGG= AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain()/20000.;  //relative gas gain
588   }
589
590
591   for (Int_t of =0; of<4; of++){    
592     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
593       {
594         Int_t index = fIndex[i];
595         if (index<0||index&0x8000) continue;
596
597         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
598         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
599         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
600         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
601         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
602
603         if (point==0) continue;
604         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
605         if (cl==0) continue;    
606         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
607         if (cl->IsUsed(11)) {
608           fNShared++;
609           continue;
610         }
611         Int_t   type   = cl->GetType();
612         //if (point->fIsShared){
613         //  fNShared++;
614         //  continue;
615         //}
616         //if (pointm) 
617         //  if (pointm->fIsShared) continue;
618         //if (pointp) 
619         //  if (pointp->fIsShared) continue;
620
621         if (type<0) continue;
622         //if (type>10) continue;       
623         //if (point->GetErrY()==0) continue;
624         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
625
626         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
627         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
628         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue; 
629
630
631         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
632         if (cl->GetMax()<5) continue;
633         Float_t angley = point->GetAngleY();
634         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
635
636         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
637         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
638         /*
639         Float_t ns = 1.;
640         if (pointm){
641           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
642           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
643           ns+=1.;
644         }
645         if (pointp){
646           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
647           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
648           ns+=1.;
649         }
650         rsigmay/=ns;
651         rsigmaz/=ns;
652         */
653
654         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
655
656         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
657         if (i>64){
658           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
659           ampc = 1.*cl->GetMax();
660           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();          
661           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
662           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
663           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
664           //Float_t dz = 
665           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
666           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
667           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
668           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
669           //ampc               *=zfactor; 
670         }
671         else{ 
672           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax(); 
673           ampc = 1.0*cl->GetMax(); 
674           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ(); 
675           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
676           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
677           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
678           //Float_t dz = 
679           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
680
681           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
682           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
683           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
684           //ampc               *=zfactor; 
685
686         }
687         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
688         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
689         Float_t w      =  1.;
690         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5); 
691         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
692         if (i<64) {
693           ampc /= 0.6;
694           //ampc /= (1+0.0008*z);
695         } else
696           if (i>128){
697             ampc /=1.5;
698             //ampc /= (1+0.0008*z);
699           }else{
700             //ampc /= (1+0.0008*z);
701           }
702         
703         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
704           // w*= 2.;
705           
706           continue;
707         }
708         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
709         amp[nc[of]]        = ampc;
710         amp[nc[of]]       /=gainGG;
711         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
712         weight[nc[of]]     = w;
713         nc[of]++;
714       }
715     
716     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
717     Float_t sumamp=0;
718     Float_t sumamp2=0;
719     Float_t sumw=0;
720     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
721     meanlog = 50;
722     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
723       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
724       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
725       //
726       sumw    += weight[index[i]]; 
727       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
728       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
729       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
730     }
731     if (sumw<1){ 
732       SetdEdx(0);  
733     }
734     else {
735       norm[of] /= sumw;
736       mean[of]  = sumamp/sumw;
737       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
738       if (sigma[of]>0.1) 
739         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
740       else
741         sigma[of] = 1000;
742       
743     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
744     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
745     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
746     }
747   }
748
749   Float_t dedx =0;
750   fSdEdx =0;
751   fMAngular =0;
752   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
753   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
754
755   
756   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/ 
757   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
758
759   Int_t norm2 = 0;
760   Int_t norm3 = 0;
761   for (Int_t i =0;i<4;i++){
762     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
763       dedx      += mean[i] *nc[i];
764       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
765       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
766       norm2     += nc[i];
767       norm3     += nc[i]-2;
768     }
769     fDEDX[i]  = mean[i];             
770     fSDEDX[i] = sigma[i];            
771     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
772   }
773
774   if (norm3>0){
775     dedx   /=norm2;
776     fSdEdx /=norm3;
777     fMAngular/=norm2;
778   }
779   else{
780     SetdEdx(0);
781     return 0;
782   }
783   //  Float_t dedx1 =dedx;
784   /*
785   dedx =0;
786   for (Int_t i =0;i<4;i++){
787     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
788       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
789       dedx      += mean[i] *nc[i];
790     }
791     fDEDX[i]  = mean[i];                
792   }
793   dedx /= norm2;
794   */
795
796   
797   SetdEdx(dedx);
798   return dedx;
799 }
800 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
801   //
802   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
803   //
804   Double_t bg2=bg*bg;
805   Double_t bethe;
806   if (bg<3.5e1) 
807     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
808   else // Density effect ( approximately :) 
809     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
810   return bethe/11.091;
811 }
812
813 void AliTPCseed::CookPID()
814 {
815   //
816   // cook PID information according dEdx
817   //
818   Double_t fRange = 10.;
819   Double_t fRes   = 0.1;
820   Double_t fMIP   = 47.;
821   //
822   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
823   Double_t sumr =0;
824   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
825     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
826     Double_t mom=GetP();
827     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
828     Double_t bethe=Bethe(mom/mass); 
829     Double_t sigma=fRes*bethe;
830     if (sigma>0.001){
831       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
832         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
833         sumr+=fTPCr[j];
834         continue;
835       }
836       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
837       sumr+=fTPCr[j];
838     }
839     else{
840       fTPCr[j]=1.;
841       sumr+=fTPCr[j];
842     }
843   }
844   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
845     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
846   }
847 }
848
849 /*
850 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
851   //-----------------------------------------------------------------
852   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
853   //-----------------------------------------------------------------
854
855   Float_t amp[200];
856   Float_t angular[200];
857   Float_t weight[200];
858   Int_t index[200];
859   Bool_t inlimit[200];
860   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
861   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
862   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
863   
864
865   //
866   Float_t meanlog = 100.;
867   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
868
869   Float_t amean     =0;
870   Float_t asigma    =0;
871   Float_t anc       =0;
872   Float_t anorm     =0;
873
874   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
875   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
876   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
877   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
878   //
879   //
880   fNShared =0;
881
882   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){    
883   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
884   for (Int_t i =0; i<160;i++)
885     {
886         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
887         if (point==0) continue;
888         if (point->fIsShared){
889           fNShared++;     
890           continue;
891         }
892         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
893         if (type<0) continue;
894         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
895         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
896         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
897         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
898         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
899         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
900
901         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
902         if (i>64){
903           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
904         }
905         else{ 
906           ampc = point->GetCPoint().GetMax(); 
907         }
908         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
909         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
910
911         Float_t w      =  1.;
912         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
913         if (i<64) {
914           ampc /= 0.63;
915         } else
916           if (i>128){
917             ampc /=1.51;
918           }             
919         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight                 
920           continue;
921         }
922         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
923         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
924         amp[i]        = ampc/angular[i];
925         weight[i]     = w;
926         anc++;
927     }
928
929   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
930   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){      
931     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
932   }
933   
934   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
935   meanlog =10000.;
936   for (Int_t of =0; of<3; of++){    
937     Float_t sumamp=0;
938     Float_t sumamp2=0;
939     Float_t sumw=0;    
940    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
941       {
942         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
943         Float_t ampl      = amp[i];
944         ///angular[i];
945         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
946         //
947         sumw    += weight[i]; 
948         sumamp  += weight[i]*ampl;
949         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
950         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
951         nc[of]++;
952       }
953    if (sumw<1){ 
954      SetdEdx(0);  
955    }
956    else {
957      norm[of] /= sumw;
958      mean[of]  = sumamp/sumw;
959      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
960      if (sigma[of]>0.1) 
961        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
962      else
963        sigma[of] = 1000;      
964      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
965    }
966   }
967     
968   Float_t dedx =0;
969   fSdEdx =0;
970   fMAngular =0;
971   //
972   Int_t norm2 = 0;
973   Int_t norm3 = 0;
974   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
975   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
976
977   for (Int_t i =0;i<3;i++){
978     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
979       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
980       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
981       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
982       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
983       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
984     }
985     fDEDX[i]  = mean[i];             
986     fSDEDX[i] = sigma[i];            
987     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
988   }
989
990   if (norm3>0){
991     dedx   /=norm2;
992     fSdEdx /=norm3;
993     fMAngular/=norm2;
994   }
995   else{
996     SetdEdx(0);
997     return;
998   }
999   //  Float_t dedx1 =dedx;
1000   
1001   dedx =0;
1002   Float_t norm4 = 0;
1003   for (Int_t i =0;i<3;i++){
1004     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
1005       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
1006       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
1007       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
1008     }
1009     fDEDX[i]  = mean[i];                
1010   }
1011   if (norm4>0) dedx /= norm4;
1012   
1013
1014   
1015   SetdEdx(dedx);
1016     
1017   //mi deDX
1018
1019 }
1020 */
1021 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
1022 //-----------------------------------------------------------------
1023 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
1024 //-----------------------------------------------------------------
1025   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
1026     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt(1.- c1*c1);
1027     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
1028     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
1029     Double_t r2=TMath::Sqrt(1.- c2*c2);
1030     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
1031 }
1032
1033 void AliTPCseed::SetClusterMapBit(int ibit, Bool_t state)
1034 {
1035   fClusterMap[ibit] = state;
1036 }
1037 Bool_t AliTPCseed::GetClusterMapBit(int ibit)
1038 {
1039   return fClusterMap[ibit];
1040 }
1041 void AliTPCseed::SetSharedMapBit(int ibit, Bool_t state)
1042 {
1043   fSharedMap[ibit] = state;
1044 }
1045 Bool_t AliTPCseed::GetSharedMapBit(int ibit)
1046 {
1047   return fSharedMap[ibit];
1048 }
1049
1050
1051
1052
1053
1054 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxNorm(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, AliTPCCalPad * gainMap, Bool_t posNorm, Bool_t padNorm){
1055  
1056   //
1057   // calculates dedx using the cluster
1058   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
1059   // type   -  1 - max charge  or 0- total charge in cluster 
1060   //           //2- max no corr 3- total+ correction
1061   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
1062   //
1063   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
1064   //
1065   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCClusterParam::Instance();
1066   if (!parcl) parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1067   if (!parcl) return 0;
1068   Float_t amp[160];
1069   Int_t   indexes[160];
1070   Int_t   ncl=0;
1071   //
1072   //
1073   Float_t gainGG = 1;
1074   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
1075     gainGG= 20000./AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain();  //relative gas gain
1076   }
1077
1078   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
1079   const Float_t kedgey =3.;
1080   //
1081   //
1082   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
1083     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
1084     if (!cluster) continue;
1085     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
1086     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetMax():cluster->GetQ();
1087     if (!gainMap) gainMap =  AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor();
1088     if (gainMap) {      
1089       Float_t factor = 1;      
1090       AliTPCCalROC * roc = gainMap->GetCalROC(cluster->GetDetector());
1091       if (irow < 63) { // IROC
1092         factor = roc->GetValue(irow, TMath::Nint(cluster->GetPad()))*1.55;
1093       } else {         // OROC
1094         factor = roc->GetValue(irow - 63, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
1095       }
1096       if (factor>0.5) charge/=factor;
1097     }
1098     
1099     //do normalization
1100     Float_t corr=1;
1101     Int_t  ipad= 0;
1102     if (irow>62) ipad=1;
1103     if (irow>127) ipad=2;    
1104     if (type<=1){
1105       //        
1106       AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1107       Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
1108       Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ());
1109       
1110       Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
1111       corr  = parcl->Qnorm(ipad,type,dr,ty,tz);
1112     }
1113     amp[ncl]=charge/corr;
1114     amp[ncl]/=gainGG;
1115     if (posNorm){
1116       //
1117       //
1118       //
1119       corr = parcl->QnormPos(ipad,type, cluster->GetPad(),cluster->GetTimeBin(), cluster->GetZ(),
1120                              cluster->GetSigmaY2(),cluster->GetSigmaZ2(),cluster->GetMax(),cluster->GetQ());
1121       amp[ncl]/=corr;
1122     }
1123
1124
1125     amp[ncl] *= 2.0;     // put mean value to channel 50
1126     if (padNorm){
1127       corr=1;
1128       if (type==0 && parcl->fQpadTnorm) corr = (*parcl->fQpadTnorm)[ipad];
1129       if (type==1 && parcl->fQpadTnorm) corr = (*parcl->fQpadMnorm)[ipad];
1130       amp[ncl]/=corr;
1131     }
1132
1133     // if (ipad==0) {
1134 //       amp[ncl] /= 0.65; // this we will take form OCDB
1135 //     } else
1136 //       if (ipad==2){
1137 //      amp[ncl] /=1.57;
1138 //       }else{
1139 //       }      
1140     ncl++;
1141   }
1142
1143   if (type>3) return ncl; 
1144   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1145
1146   if (ncl<10) return 0;
1147   
1148   Float_t suma=0;
1149   Float_t sumn=0;
1150   Int_t icl0=TMath::Nint(ncl*low);
1151   Int_t icl1=TMath::Nint(ncl*up);
1152   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1153     suma+=amp[indexes[icl]];
1154     sumn++;
1155   }
1156   return suma/sumn;
1157
1158 }
1159
1160 Double_t AliTPCseed::BetheMass(Double_t mass){
1161   //
1162   // return bethe-bloch
1163   //
1164   Float_t bg= P()/mass; 
1165   const Double_t kp1=0.76176e-1;
1166   const Double_t kp2=10.632;
1167   const Double_t kp3=0.13279e-4;
1168   const Double_t kp4=1.8631;
1169   const Double_t kp5=1.9479;
1170
1171   Double_t dbg = (Double_t) bg;
1172
1173   Double_t beta = dbg/TMath::Sqrt(1.+dbg*dbg);
1174
1175   Double_t aa = TMath::Power(beta,kp4);
1176   Double_t bb = TMath::Power(1./dbg,kp5);
1177
1178   bb=TMath::Log(kp3+bb);
1179   
1180   return ((Float_t)((kp2-aa-bb)*kp1/aa));
1181 }
1182
1183
1184 Float_t  AliTPCseed::CookShape(Int_t type){
1185   //
1186   //
1187   //
1188  //-----------------------------------------------------------------
1189   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
1190   //-----------------------------------------------------------------
1191   Float_t means=0;
1192   Float_t meanc=0;
1193   for (Int_t i =0; i<160;i++)    {
1194     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
1195     if (point==0) continue;
1196
1197     AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
1198     if (cl==0) continue;        
1199     
1200     Float_t rsigmay =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1201     Float_t rsigmaz =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaZ());
1202     Float_t rsigma =   (rsigmay+rsigmaz)*0.5;
1203     if (type==0) means+=rsigma;
1204     if (type==1) means+=rsigmay;
1205     if (type==2) means+=rsigmaz;
1206     meanc++;
1207   }
1208   Float_t mean = (meanc>0)? means/meanc:0;
1209   return mean;
1210 }