GetPt() changed to GetSignedPt(). Get1Pt() changed to GetSigned1Pt() (Markus)
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCseed.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16
17
18
19 //-----------------------------------------------------------------
20 //           Implementation of the TPC seed class
21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
23 //-----------------------------------------------------------------
24 #include "TClonesArray.h"
25 #include "AliTPCseed.h"
26 #include "AliTPCReconstructor.h"
27
28 ClassImp(AliTPCseed)
29
30
31
32 AliTPCseed::AliTPCseed():
33   AliTPCtrack(),
34   fEsd(0x0),
35   fClusterOwner(kFALSE),
36   fPoints(0x0),
37   fEPoints(0x0),
38   fRow(0),
39   fSector(-1),
40   fRelativeSector(-1),
41   fCurrentSigmaY2(1e10),
42   fCurrentSigmaZ2(1e10),
43   fErrorY2(1e10),
44   fErrorZ2(1e10),
45   fCurrentCluster(0x0),
46   fCurrentClusterIndex1(-1),
47   fInDead(kFALSE),
48   fIsSeeding(kFALSE),
49   fNoCluster(0),
50   fSort(0),
51   fBSigned(kFALSE),
52   fSeedType(0),
53   fSeed1(-1),
54   fSeed2(-1),
55   fMAngular(0),
56   fCircular(0),
57   fClusterMap(159),
58   fSharedMap(159)
59 {
60   //
61   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
62   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
63   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
64   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
65   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
66     fDEDX[i] = 0.;
67     fSDEDX[i] = 1e10;
68     fNCDEDX[i] = 0;
69   }
70   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
71   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
72   for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
73 }
74
75 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
76   AliTPCtrack(s),
77   fEsd(0x0),
78   fClusterOwner(clusterOwner),
79   fPoints(0x0),
80   fEPoints(0x0),
81   fRow(0),
82   fSector(-1),
83   fRelativeSector(-1),
84   fCurrentSigmaY2(1e10),
85   fCurrentSigmaZ2(1e10),
86   fErrorY2(1e10),
87   fErrorZ2(1e10),
88   fCurrentCluster(0x0),
89   fCurrentClusterIndex1(-1),
90   fInDead(kFALSE),
91   fIsSeeding(kFALSE),
92   fNoCluster(0),
93   fSort(0),
94   fBSigned(kFALSE),
95   fSeedType(0),
96   fSeed1(-1),
97   fSeed2(-1),
98   fMAngular(0),
99   fCircular(0),
100   fClusterMap(s.fClusterMap),
101   fSharedMap(s.fSharedMap)
102 {
103   //---------------------
104   // dummy copy constructor
105   //-------------------------
106   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
107     fClusterPointer[i]=0;
108     if (fClusterOwner){
109       if (s.fClusterPointer[i])
110         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
111     }else{
112       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
113     }
114     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
115   }
116   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
117   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
118   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
119     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
120     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
121     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
122   }
123   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
124
125 }
126
127
128 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
129   AliTPCtrack(t),
130   fEsd(0x0),
131   fClusterOwner(kFALSE),
132   fPoints(0x0),
133   fEPoints(0x0),
134   fRow(0),
135   fSector(-1),
136   fRelativeSector(-1),
137   fCurrentSigmaY2(1e10),
138   fCurrentSigmaZ2(1e10),
139   fErrorY2(1e10),
140   fErrorZ2(1e10),
141   fCurrentCluster(0x0),
142   fCurrentClusterIndex1(-1),
143   fInDead(kFALSE),
144   fIsSeeding(kFALSE),
145   fNoCluster(0),
146   fSort(0),
147   fBSigned(kFALSE),
148   fSeedType(0),
149   fSeed1(-1),
150   fSeed2(-1),
151   fMAngular(0),
152   fCircular(0),
153   fClusterMap(159),
154   fSharedMap(159)
155 {
156   //
157   // Constructor from AliTPCtrack
158   //
159   fFirstPoint =0;
160   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
161   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
162     fClusterPointer[i] = 0;
163     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
164     if (index>=-1){ 
165       SetClusterIndex2(i,index);
166     }
167     else{
168       SetClusterIndex2(i,-3); 
169     }    
170   }
171   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
172     fDEDX[i] = 0.;
173     fSDEDX[i] = 1e10;
174     fNCDEDX[i] = 0;
175   }
176   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
177   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
178   for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
179 }
180
181 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
182                        const Double_t cc[15], Int_t index):      
183   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
184   fEsd(0x0),
185   fClusterOwner(kFALSE),
186   fPoints(0x0),
187   fEPoints(0x0),
188   fRow(0),
189   fSector(-1),
190   fRelativeSector(-1),
191   fCurrentSigmaY2(1e10),
192   fCurrentSigmaZ2(1e10),
193   fErrorY2(1e10),
194   fErrorZ2(1e10),
195   fCurrentCluster(0x0),
196   fCurrentClusterIndex1(-1),
197   fInDead(kFALSE),
198   fIsSeeding(kFALSE),
199   fNoCluster(0),
200   fSort(0),
201   fBSigned(kFALSE),
202   fSeedType(0),
203   fSeed1(-1),
204   fSeed2(-1),
205   fMAngular(0),
206   fCircular(0),
207   fClusterMap(159),
208   fSharedMap(159)
209 {
210   //
211   // Constructor
212   //
213   fFirstPoint =0;
214   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
215   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
216   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
217   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
218     fDEDX[i] = 0.;
219     fSDEDX[i] = 1e10;
220     fNCDEDX[i] = 0;
221   }
222   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
223 }
224
225 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
226   //
227   // destructor
228   if (fPoints) delete fPoints;
229   fPoints =0;
230   if (fEPoints) delete fEPoints;
231   fEPoints = 0;
232   fNoCluster =0;
233   if (fClusterOwner){
234     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
235       delete fClusterPointer[icluster];
236     }
237   }
238   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
239   for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
240 }
241 //_________________________________________________
242 AliTPCseed & AliTPCseed::operator =(const AliTPCseed & param)
243 {
244   //
245   // assignment operator - dummy
246   //
247   fRow=param.fRow;
248   return (*this);
249 }
250 //____________________________________________________
251 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
252 {
253   //
254   // 
255   return &fTrackPoints[i];
256 }
257
258 void AliTPCseed::RebuildSeed()
259 {
260   //
261   // rebuild seed to be ready for storing
262   AliTPCclusterMI cldummy;
263   cldummy.SetQ(0);
264   AliTPCTrackPoint pdummy;
265   pdummy.GetTPoint().SetShared(10);
266   for (Int_t i=0;i<160;i++){
267     AliTPCclusterMI * cl0 = fClusterPointer[i];
268     AliTPCTrackPoint *trpoint = (AliTPCTrackPoint*)fPoints->UncheckedAt(i);     
269     if (cl0){
270       trpoint->GetTPoint() = *(GetTrackPoint(i));
271       trpoint->GetCPoint() = *cl0;
272       trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
273     }
274     else{
275       *trpoint = pdummy;
276       trpoint->GetCPoint()= cldummy;
277     }
278     
279   }
280
281 }
282
283
284 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
285 {
286   //
287   //
288   // return cluster for n rows bellow first point
289   Int_t nfoundable = 1;
290   Int_t nfound      = 1;
291   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
292     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
293     if (index!=-1) nfoundable++;
294     if (index>0) nfound++;
295   }
296   if (nfoundable<n) return 0;
297   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
298
299 }
300
301
302 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
303 {
304   // get cluster stat.  on given region
305   //
306   found       = 0;
307   foundable   = 0;
308   shared      =0;
309   for (Int_t i=first;i<last; i++){
310     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
311     if (index!=-1) foundable++;
312     if (fClusterPointer[i]) {
313       found++;
314     }
315     else 
316       continue;
317
318     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
319       shared++;
320       continue;
321     }
322     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
323     //
324     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
325       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
326         shared++;
327         continue;
328       }
329     }
330     if ( fClusterPointer[i+1]){
331       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
332         shared++;
333         continue;
334       }
335     }
336     
337   }
338   //if (shared>found){
339     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
340   //}
341 }
342
343
344
345
346
347 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
348 {
349   //
350   //
351   SetNumberOfClusters(0);
352   fNFoundable = 0;
353   SetChi2(0);
354   ResetCovariance(10.);
355   /*
356   if (fTrackPoints){
357     for (Int_t i=0;i<8;i++){
358       delete [] fTrackPoints[i];
359     }
360     delete fTrackPoints;
361     fTrackPoints =0;
362   }
363   */
364
365   if (all){   
366     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
367     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
368   }
369
370 }
371
372
373 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
374 {
375
376   //------------------------------------------------------------------
377   //This function makes a track forget its history :)  
378   //------------------------------------------------------------------
379   if (factor<=0) {
380     ResetCovariance(10.);
381     return;
382   }
383   ResetCovariance(factor);
384
385   SetNumberOfClusters(0);
386   fNFoundable =0;
387   SetChi2(0);
388   fRemoval = 0;
389   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
390   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
391   fNoCluster     = 0;
392   //fFirstPoint = 160;
393   //fLastPoint  = 0;
394 }
395
396
397
398
399 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
400 {
401   //-----------------------------------------------------------------
402   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
403   // doesn't change internal state of the track
404   //-----------------------------------------------------------------
405   
406   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
407
408   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {   
409     return 0;
410   }
411
412   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
413   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt(1.- c1*c1);
414   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt(1.- c2*c2);
415   
416   y = GetY();
417   z = GetZ();
418   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
419   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
420   
421   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
422   Double_t dz = 0;
423   //
424   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
425   /*
426   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
427     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
428   }else{
429     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
430   }
431   */
432   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
433   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
434   //
435   y+=dy;
436   z+=dz;
437   
438
439   return 1;  
440 }
441
442
443 //_____________________________________________________________________________
444 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const 
445 {
446   //-----------------------------------------------------------------
447   // This function calculates a predicted chi2 increment.
448   //-----------------------------------------------------------------
449   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
450   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
451   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
452 }
453
454 //_________________________________________________________________________________________
455
456
457 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
458   //-----------------------------------------------------------------
459   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
460   //-----------------------------------------------------------------
461   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
462
463   if (fSort == 0){
464     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
465     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
466     Double_t z2 = t->GetZ();
467     Double_t z1 = GetZ();
468     if (z2>z1) return 1;
469     if (z2<z1) return -1;
470     return 0;
471   }
472   else {
473     Float_t f2 =1;
474     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
475     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
476
477     Float_t f1 =1;
478     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
479
480     if (fBConstrain)   f1=1.2;
481  
482     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
483     else return +1;
484   }
485 }
486
487
488
489
490 //_____________________________________________________________________________
491 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t /*index*/)
492 {
493   //-----------------------------------------------------------------
494   // This function associates a cluster with this track.
495   //-----------------------------------------------------------------
496   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
497   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
498
499   if (!AliExternalTrackParam::Update(p,cov)) return kFALSE;
500
501   Int_t n=GetNumberOfClusters();
502   //  fIndex[n]=index;
503   SetNumberOfClusters(n+1);
504   SetChi2(GetChi2()+chisq);
505
506   return kTRUE;
507 }
508
509
510
511 //_____________________________________________________________________________
512 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
513   //-----------------------------------------------------------------
514   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
515   //-----------------------------------------------------------------
516
517   Float_t amp[200];
518   Float_t angular[200];
519   Float_t weight[200];
520   Int_t index[200];
521   //Int_t nc = 0;
522   //  TClonesArray & arr = *fPoints; 
523   Float_t meanlog = 100.;
524   
525   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
526   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
527   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
528   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
529   //
530   //
531   fNShared =0;
532
533   for (Int_t of =0; of<4; of++){    
534     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
535       {
536         Int_t index = fIndex[i];
537         if (index<0||index&0x8000) continue;
538
539         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
540         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
541         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
542         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
543         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
544
545         if (point==0) continue;
546         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
547         if (cl==0) continue;    
548         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
549         if (cl->IsUsed(11)) {
550           fNShared++;
551           continue;
552         }
553         Int_t   type   = cl->GetType();
554         //if (point->fIsShared){
555         //  fNShared++;
556         //  continue;
557         //}
558         //if (pointm) 
559         //  if (pointm->fIsShared) continue;
560         //if (pointp) 
561         //  if (pointp->fIsShared) continue;
562
563         if (type<0) continue;
564         //if (type>10) continue;       
565         //if (point->GetErrY()==0) continue;
566         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
567
568         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
569         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
570         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue; 
571
572
573         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
574         if (cl->GetMax()<5) continue;
575         Float_t angley = point->GetAngleY();
576         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
577
578         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
579         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
580         /*
581         Float_t ns = 1.;
582         if (pointm){
583           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
584           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
585           ns+=1.;
586         }
587         if (pointp){
588           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
589           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
590           ns+=1.;
591         }
592         rsigmay/=ns;
593         rsigmaz/=ns;
594         */
595
596         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
597
598         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
599         if (i>64){
600           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
601           ampc = 1.*cl->GetMax();
602           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();          
603           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
604           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
605           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
606           //Float_t dz = 
607           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
608           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
609           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
610           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
611           //ampc               *=zfactor; 
612         }
613         else{ 
614           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax(); 
615           ampc = 1.0*cl->GetMax(); 
616           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ(); 
617           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
618           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
619           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
620           //Float_t dz = 
621           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
622
623           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
624           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
625           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
626           //ampc               *=zfactor; 
627
628         }
629         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
630         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
631         Float_t w      =  1.;
632         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5); 
633         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
634         if (i<64) {
635           ampc /= 0.6;
636           //ampc /= (1+0.0008*z);
637         } else
638           if (i>128){
639             ampc /=1.5;
640             //ampc /= (1+0.0008*z);
641           }else{
642             //ampc /= (1+0.0008*z);
643           }
644         
645         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
646           // w*= 2.;
647           
648           continue;
649         }
650         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
651         amp[nc[of]]        = ampc;
652         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
653         weight[nc[of]]     = w;
654         nc[of]++;
655       }
656     
657     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
658     Float_t sumamp=0;
659     Float_t sumamp2=0;
660     Float_t sumw=0;
661     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
662     meanlog = 50;
663     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
664       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
665       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
666       //
667       sumw    += weight[index[i]]; 
668       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
669       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
670       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
671     }
672     if (sumw<1){ 
673       SetdEdx(0);  
674     }
675     else {
676       norm[of] /= sumw;
677       mean[of]  = sumamp/sumw;
678       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
679       if (sigma[of]>0.1) 
680         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
681       else
682         sigma[of] = 1000;
683       
684     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
685     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
686     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
687     }
688   }
689
690   Float_t dedx =0;
691   fSdEdx =0;
692   fMAngular =0;
693   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
694   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
695
696   
697   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/ 
698   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
699
700   Int_t norm2 = 0;
701   Int_t norm3 = 0;
702   for (Int_t i =0;i<4;i++){
703     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
704       dedx      += mean[i] *nc[i];
705       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
706       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
707       norm2     += nc[i];
708       norm3     += nc[i]-2;
709     }
710     fDEDX[i]  = mean[i];             
711     fSDEDX[i] = sigma[i];            
712     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
713   }
714
715   if (norm3>0){
716     dedx   /=norm2;
717     fSdEdx /=norm3;
718     fMAngular/=norm2;
719   }
720   else{
721     SetdEdx(0);
722     return 0;
723   }
724   //  Float_t dedx1 =dedx;
725   /*
726   dedx =0;
727   for (Int_t i =0;i<4;i++){
728     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
729       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
730       dedx      += mean[i] *nc[i];
731     }
732     fDEDX[i]  = mean[i];                
733   }
734   dedx /= norm2;
735   */
736
737   
738   SetdEdx(dedx);
739   return dedx;
740 }
741 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
742   //
743   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
744   //
745   Double_t bg2=bg*bg;
746   Double_t bethe;
747   if (bg<3.5e1) 
748     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
749   else // Density effect ( approximately :) 
750     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
751   return bethe/11.091;
752 }
753
754 void AliTPCseed::CookPID()
755 {
756   //
757   // cook PID information according dEdx
758   //
759   Double_t fRange = 10.;
760   Double_t fRes   = 0.1;
761   Double_t fMIP   = 47.;
762   //
763   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
764   Double_t sumr =0;
765   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
766     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
767     Double_t mom=GetP();
768     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
769     Double_t bethe=Bethe(mom/mass); 
770     Double_t sigma=fRes*bethe;
771     if (sigma>0.001){
772       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
773         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
774         sumr+=fTPCr[j];
775         continue;
776       }
777       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
778       sumr+=fTPCr[j];
779     }
780     else{
781       fTPCr[j]=1.;
782       sumr+=fTPCr[j];
783     }
784   }
785   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
786     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
787   }
788 }
789
790 /*
791 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
792   //-----------------------------------------------------------------
793   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
794   //-----------------------------------------------------------------
795
796   Float_t amp[200];
797   Float_t angular[200];
798   Float_t weight[200];
799   Int_t index[200];
800   Bool_t inlimit[200];
801   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
802   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
803   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
804   
805
806   //
807   Float_t meanlog = 100.;
808   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
809
810   Float_t amean     =0;
811   Float_t asigma    =0;
812   Float_t anc       =0;
813   Float_t anorm     =0;
814
815   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
816   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
817   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
818   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
819   //
820   //
821   fNShared =0;
822
823   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){    
824   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
825   for (Int_t i =0; i<160;i++)
826     {
827         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
828         if (point==0) continue;
829         if (point->fIsShared){
830           fNShared++;     
831           continue;
832         }
833         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
834         if (type<0) continue;
835         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
836         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
837         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
838         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
839         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
840         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
841
842         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
843         if (i>64){
844           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
845         }
846         else{ 
847           ampc = point->GetCPoint().GetMax(); 
848         }
849         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
850         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
851
852         Float_t w      =  1.;
853         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
854         if (i<64) {
855           ampc /= 0.63;
856         } else
857           if (i>128){
858             ampc /=1.51;
859           }             
860         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight                 
861           continue;
862         }
863         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
864         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
865         amp[i]        = ampc/angular[i];
866         weight[i]     = w;
867         anc++;
868     }
869
870   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
871   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){      
872     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
873   }
874   
875   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
876   meanlog =10000.;
877   for (Int_t of =0; of<3; of++){    
878     Float_t sumamp=0;
879     Float_t sumamp2=0;
880     Float_t sumw=0;    
881    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
882       {
883         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
884         Float_t ampl      = amp[i];
885         ///angular[i];
886         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
887         //
888         sumw    += weight[i]; 
889         sumamp  += weight[i]*ampl;
890         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
891         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
892         nc[of]++;
893       }
894    if (sumw<1){ 
895      SetdEdx(0);  
896    }
897    else {
898      norm[of] /= sumw;
899      mean[of]  = sumamp/sumw;
900      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
901      if (sigma[of]>0.1) 
902        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
903      else
904        sigma[of] = 1000;      
905      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
906    }
907   }
908     
909   Float_t dedx =0;
910   fSdEdx =0;
911   fMAngular =0;
912   //
913   Int_t norm2 = 0;
914   Int_t norm3 = 0;
915   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
916   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
917
918   for (Int_t i =0;i<3;i++){
919     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
920       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
921       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
922       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
923       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
924       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
925     }
926     fDEDX[i]  = mean[i];             
927     fSDEDX[i] = sigma[i];            
928     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
929   }
930
931   if (norm3>0){
932     dedx   /=norm2;
933     fSdEdx /=norm3;
934     fMAngular/=norm2;
935   }
936   else{
937     SetdEdx(0);
938     return;
939   }
940   //  Float_t dedx1 =dedx;
941   
942   dedx =0;
943   Float_t norm4 = 0;
944   for (Int_t i =0;i<3;i++){
945     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
946       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
947       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
948       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
949     }
950     fDEDX[i]  = mean[i];                
951   }
952   if (norm4>0) dedx /= norm4;
953   
954
955   
956   SetdEdx(dedx);
957     
958   //mi deDX
959
960 }
961 */
962 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
963 //-----------------------------------------------------------------
964 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
965 //-----------------------------------------------------------------
966   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
967     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt(1.- c1*c1);
968     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
969     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
970     Double_t r2=TMath::Sqrt(1.- c2*c2);
971     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
972 }
973
974 void AliTPCseed::SetClusterMapBit(int ibit, Bool_t state)
975 {
976   fClusterMap[ibit] = state;
977 }
978 Bool_t AliTPCseed::GetClusterMapBit(int ibit)
979 {
980   return fClusterMap[ibit];
981 }
982 void AliTPCseed::SetSharedMapBit(int ibit, Bool_t state)
983 {
984   fSharedMap[ibit] = state;
985 }
986 Bool_t AliTPCseed::GetSharedMapBit(int ibit)
987 {
988   return fSharedMap[ibit];
989 }