Protection against negative covariance in curvature observed for short laser tracks...
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCseed.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16
17
18
19 //-----------------------------------------------------------------
20 //           Implementation of the TPC seed class
21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
23 //-----------------------------------------------------------------
24 #include "TClonesArray.h"
25 #include "AliTPCseed.h"
26 #include "AliTPCReconstructor.h"
27
28 ClassImp(AliTPCseed)
29
30
31
32 AliTPCseed::AliTPCseed():
33   AliTPCtrack(),
34   fEsd(0x0),
35   fClusterOwner(kFALSE),
36   fPoints(0x0),
37   fEPoints(0x0),
38   fRow(0),
39   fSector(-1),
40   fRelativeSector(-1),
41   fCurrentSigmaY2(1e10),
42   fCurrentSigmaZ2(1e10),
43   fErrorY2(1e10),
44   fErrorZ2(1e10),
45   fCurrentCluster(0x0),
46   fCurrentClusterIndex1(-1),
47   fInDead(kFALSE),
48   fIsSeeding(kFALSE),
49   fNoCluster(0),
50   fSort(0),
51   fBSigned(kFALSE),
52   fSeedType(0),
53   fSeed1(-1),
54   fSeed2(-1),
55   fMAngular(0),
56   fCircular(0)
57 {
58   //
59   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
60   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
61   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
62   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
63   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
64     fDEDX[i] = 0.;
65     fSDEDX[i] = 1e10;
66     fNCDEDX[i] = 0;
67   }
68   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
69 }
70
71 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
72   AliTPCtrack(s),
73   fEsd(0x0),
74   fClusterOwner(clusterOwner),
75   fPoints(0x0),
76   fEPoints(0x0),
77   fRow(0),
78   fSector(-1),
79   fRelativeSector(-1),
80   fCurrentSigmaY2(1e10),
81   fCurrentSigmaZ2(1e10),
82   fErrorY2(1e10),
83   fErrorZ2(1e10),
84   fCurrentCluster(0x0),
85   fCurrentClusterIndex1(-1),
86   fInDead(kFALSE),
87   fIsSeeding(kFALSE),
88   fNoCluster(0),
89   fSort(0),
90   fBSigned(kFALSE),
91   fSeedType(0),
92   fSeed1(-1),
93   fSeed2(-1),
94   fMAngular(0),
95   fCircular(0)
96 {
97   //---------------------
98   // dummy copy constructor
99   //-------------------------
100   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
101     fClusterPointer[i]=0;
102     if (fClusterOwner){
103       if (s.fClusterPointer[i])
104         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
105     }else{
106       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
107     }
108     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
109   }
110   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
111   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
112   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
113     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
114     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
115     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
116   }
117   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
118 }
119
120
121 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
122   AliTPCtrack(t),
123   fEsd(0x0),
124   fClusterOwner(kFALSE),
125   fPoints(0x0),
126   fEPoints(0x0),
127   fRow(0),
128   fSector(-1),
129   fRelativeSector(-1),
130   fCurrentSigmaY2(1e10),
131   fCurrentSigmaZ2(1e10),
132   fErrorY2(1e10),
133   fErrorZ2(1e10),
134   fCurrentCluster(0x0),
135   fCurrentClusterIndex1(-1),
136   fInDead(kFALSE),
137   fIsSeeding(kFALSE),
138   fNoCluster(0),
139   fSort(0),
140   fBSigned(kFALSE),
141   fSeedType(0),
142   fSeed1(-1),
143   fSeed2(-1),
144   fMAngular(0),
145   fCircular(0)
146 {
147   //
148   // Constructor from AliTPCtrack
149   //
150   fFirstPoint =0;
151   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
152   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
153     fClusterPointer[i] = 0;
154     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
155     if (index>=-1){ 
156       SetClusterIndex2(i,index);
157     }
158     else{
159       SetClusterIndex2(i,-3); 
160     }    
161   }
162   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
163     fDEDX[i] = 0.;
164     fSDEDX[i] = 1e10;
165     fNCDEDX[i] = 0;
166   }
167   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
168 }
169
170 AliTPCseed::AliTPCseed(UInt_t index,  const Double_t xx[5],
171                        const Double_t cc[15], 
172                        Double_t xr, Double_t alpha):      
173   AliTPCtrack(index, xx, cc, xr, alpha),
174   fEsd(0x0),
175   fClusterOwner(kFALSE),
176   fPoints(0x0),
177   fEPoints(0x0),
178   fRow(0),
179   fSector(-1),
180   fRelativeSector(-1),
181   fCurrentSigmaY2(1e10),
182   fCurrentSigmaZ2(1e10),
183   fErrorY2(1e10),
184   fErrorZ2(1e10),
185   fCurrentCluster(0x0),
186   fCurrentClusterIndex1(-1),
187   fInDead(kFALSE),
188   fIsSeeding(kFALSE),
189   fNoCluster(0),
190   fSort(0),
191   fBSigned(kFALSE),
192   fSeedType(0),
193   fSeed1(-1),
194   fSeed2(-1),
195   fMAngular(0),
196   fCircular(0)
197 {
198   //
199   // Constructor
200   //
201   fFirstPoint =0;
202   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
203   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
204   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
205   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
206     fDEDX[i] = 0.;
207     fSDEDX[i] = 1e10;
208     fNCDEDX[i] = 0;
209   }
210   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
211 }
212
213 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
214   //
215   // destructor
216   if (fPoints) delete fPoints;
217   fPoints =0;
218   if (fEPoints) delete fEPoints;
219   fEPoints = 0;
220   fNoCluster =0;
221   if (fClusterOwner){
222     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
223       delete fClusterPointer[icluster];
224     }
225   }
226 }
227
228 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
229 {
230   //
231   // 
232   return &fTrackPoints[i];
233 }
234
235 void AliTPCseed::RebuildSeed()
236 {
237   //
238   // rebuild seed to be ready for storing
239   AliTPCclusterMI cldummy;
240   cldummy.SetQ(0);
241   AliTPCTrackPoint pdummy;
242   pdummy.GetTPoint().fIsShared = 10;
243   for (Int_t i=0;i<160;i++){
244     AliTPCclusterMI * cl0 = fClusterPointer[i];
245     AliTPCTrackPoint *trpoint = (AliTPCTrackPoint*)fPoints->UncheckedAt(i);     
246     if (cl0){
247       trpoint->GetTPoint() = *(GetTrackPoint(i));
248       trpoint->GetCPoint() = *cl0;
249       trpoint->GetCPoint().SetQ(TMath::Abs(cl0->GetQ()));
250     }
251     else{
252       *trpoint = pdummy;
253       trpoint->GetCPoint()= cldummy;
254     }
255     
256   }
257
258 }
259
260
261 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
262 {
263   //
264   //
265   // return cluster for n rows bellow first point
266   Int_t nfoundable = 1;
267   Int_t nfound      = 1;
268   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
269     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
270     if (index!=-1) nfoundable++;
271     if (index>0) nfound++;
272   }
273   if (nfoundable<n) return 0;
274   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
275
276 }
277
278
279 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
280 {
281   // get cluster stat.  on given region
282   //
283   found       = 0;
284   foundable   = 0;
285   shared      =0;
286   for (Int_t i=first;i<last; i++){
287     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
288     if (index!=-1) foundable++;
289     if (fClusterPointer[i]) {
290       found++;
291     }
292     else 
293       continue;
294
295     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
296       shared++;
297       continue;
298     }
299     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
300     //
301     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
302       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
303         shared++;
304         continue;
305       }
306     }
307     if ( fClusterPointer[i+1]){
308       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
309         shared++;
310         continue;
311       }
312     }
313     
314   }
315   //if (shared>found){
316     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
317   //}
318 }
319
320
321
322
323
324 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
325 {
326   //
327   //
328   SetNumberOfClusters(0);
329   fNFoundable = 0;
330   SetChi2(0);
331   ResetCovariance();
332   /*
333   if (fTrackPoints){
334     for (Int_t i=0;i<8;i++){
335       delete [] fTrackPoints[i];
336     }
337     delete fTrackPoints;
338     fTrackPoints =0;
339   }
340   */
341
342   if (all){   
343     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
344     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
345   }
346
347 }
348
349
350 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
351 {
352
353   //------------------------------------------------------------------
354   //This function makes a track forget its history :)  
355   //------------------------------------------------------------------
356   if (factor<=0) {
357     ResetCovariance();
358     return;
359   }
360   fC00*=factor;
361   fC10*=0;  fC11*=factor;
362   fC20*=0;  fC21*=0;  fC22*=factor;
363   fC30*=0;  fC31*=0;  fC32*=0;  fC33*=factor;
364   fC40*=0;  fC41*=0;  fC42*=0;  fC43*=0;  fC44*=factor;
365   SetNumberOfClusters(0);
366   fNFoundable =0;
367   SetChi2(0);
368   fRemoval = 0;
369   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
370   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
371   fNoCluster     = 0;
372   //fFirstPoint = 160;
373   //fLastPoint  = 0;
374 }
375
376
377
378
379 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
380 {
381   //-----------------------------------------------------------------
382   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
383   // doesn't change internal state of the track
384   //-----------------------------------------------------------------
385   
386   Double_t x1=fX, x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
387
388   if (TMath::Abs(fP4*xk - fP2) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {   
389     return 0;
390   }
391
392   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
393   Double_t c1=fP4*x1 - fP2, r1=sqrt(1.- c1*c1);
394   Double_t c2=fP4*x2 - fP2, r2=sqrt(1.- c2*c2);
395   
396   y = fP0;
397   z = fP1;
398   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
399   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
400   
401   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
402   Double_t dz = 0;
403   //
404   Double_t delta = fP4*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
405   /*
406   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
407     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
408   }else{
409     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
410   }
411   */
412   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
413   dz =  fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
414   //
415   y+=dy;
416   z+=dz;
417   
418
419   return 1;  
420 }
421
422
423 //_____________________________________________________________________________
424 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const 
425 {
426   //-----------------------------------------------------------------
427   // This function calculates a predicted chi2 increment.
428   //-----------------------------------------------------------------
429   //Double_t r00=c->GetSigmaY2(), r01=0., r11=c->GetSigmaZ2();
430   Double_t r00=fErrorY2, r01=0., r11=fErrorZ2;
431   r00+=fC00; r01+=fC10; r11+=fC11;
432
433   Double_t det=r00*r11 - r01*r01;
434   if (TMath::Abs(det) < 1.e-10) {
435     //Int_t n=GetNumberOfClusters();
436     //if (n>4) cerr<<n<<" AliKalmanTrack warning: Singular matrix !\n";
437     return 1e10;
438   }
439   Double_t tmp=r00; r00=r11; r11=tmp; r01=-r01;
440   
441   Double_t dy=c->GetY() - fP0, dz=c->GetZ() - fP1;
442   
443   return (dy*r00*dy + 2*r01*dy*dz + dz*r11*dz)/det;
444 }
445
446
447 //_________________________________________________________________________________________
448
449
450 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
451   //-----------------------------------------------------------------
452   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
453   //-----------------------------------------------------------------
454   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
455   const Double_t kfC44mean = 0.0001; 
456   if (fSort == 0){
457     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
458     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
459     Double_t z2 = t->GetZ();
460     Double_t z1 = GetZ();
461     if (z2>z1) return 1;
462     if (z2<z1) return -1;
463     return 0;
464   }
465   else {
466     if (t->fC44<0){
467       AliError("Non positive covariance");
468       t->Dump();
469       return -1;
470     }
471     if (fC44<0){
472       AliError("Non positive covariance");
473       Dump();
474       return 1;
475     }
476     //
477     Float_t f2 =1;
478     f2 = 1./(kfC44mean+TMath::Sqrt(TMath::Abs(t->fC44)));
479     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
480
481     Float_t f1 =1;
482     f1 = 1./(kfC44mean+TMath::Sqrt(TMath::Abs(fC44)));
483
484     if (fBConstrain)   f1=1.2;
485  
486     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
487     else return +1;
488   }
489 }
490
491
492
493
494 //_____________________________________________________________________________
495 Int_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, UInt_t /*index*/) {
496   //-----------------------------------------------------------------
497   // This function associates a cluster with this track.
498   //-----------------------------------------------------------------
499   Double_t r00=fErrorY2, r01=0., r11=fErrorZ2;
500
501   r00+=fC00; r01+=fC10; r11+=fC11;
502   Double_t det=r00*r11 - r01*r01;
503   Double_t tmp=r00; r00=r11/det; r11=tmp/det; r01=-r01/det;
504
505   Double_t k00=fC00*r00+fC10*r01, k01=fC00*r01+fC10*r11;
506   Double_t k10=fC10*r00+fC11*r01, k11=fC10*r01+fC11*r11;
507   Double_t k20=fC20*r00+fC21*r01, k21=fC20*r01+fC21*r11;
508   Double_t k30=fC30*r00+fC31*r01, k31=fC30*r01+fC31*r11;
509   Double_t k40=fC40*r00+fC41*r01, k41=fC40*r01+fC41*r11;
510
511   Double_t dy=c->GetY() - fP0, dz=c->GetZ() - fP1;
512   Double_t cur=fP4 + k40*dy + k41*dz, eta=fP2 + k20*dy + k21*dz;
513   if (TMath::Abs(cur*fX-eta) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
514     return 0;
515   }
516
517   fP0 += k00*dy + k01*dz;
518   fP1 += k10*dy + k11*dz;
519   fP2  = eta;
520   fP3 += k30*dy + k31*dz;
521   fP4  = cur;
522
523   Double_t c01=fC10, c02=fC20, c03=fC30, c04=fC40;
524   Double_t c12=fC21, c13=fC31, c14=fC41;
525
526   fC00-=k00*fC00+k01*fC10; fC10-=k00*c01+k01*fC11;
527   fC20-=k00*c02+k01*c12;   fC30-=k00*c03+k01*c13;
528   fC40-=k00*c04+k01*c14; 
529
530   fC11-=k10*c01+k11*fC11;
531   fC21-=k10*c02+k11*c12;   fC31-=k10*c03+k11*c13;
532   fC41-=k10*c04+k11*c14; 
533
534   fC22-=k20*c02+k21*c12;   fC32-=k20*c03+k21*c13;
535   fC42-=k20*c04+k21*c14; 
536
537   fC33-=k30*c03+k31*c13;
538   fC43-=k40*c03+k41*c13; 
539
540   fC44-=k40*c04+k41*c14; 
541
542   Int_t n=GetNumberOfClusters();
543   //  fIndex[n]=index;
544   SetNumberOfClusters(n+1);
545   SetChi2(GetChi2()+chisq);
546
547   return 1;
548 }
549
550
551
552 //_____________________________________________________________________________
553 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
554   //-----------------------------------------------------------------
555   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
556   //-----------------------------------------------------------------
557
558   Float_t amp[200];
559   Float_t angular[200];
560   Float_t weight[200];
561   Int_t index[200];
562   //Int_t nc = 0;
563   //  TClonesArray & arr = *fPoints; 
564   Float_t meanlog = 100.;
565   
566   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
567   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
568   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
569   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
570   //
571   //
572   fNShared =0;
573
574   for (Int_t of =0; of<4; of++){    
575     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
576       {
577         Int_t index = fIndex[i];
578         if (index<0||index&0x8000) continue;
579
580         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
581         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
582         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
583         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
584         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
585
586         if (point==0) continue;
587         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
588         if (cl==0) continue;    
589         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
590         if (cl->IsUsed(11)) {
591           fNShared++;
592           continue;
593         }
594         Int_t   type   = cl->GetType();
595         //if (point->fIsShared){
596         //  fNShared++;
597         //  continue;
598         //}
599         //if (pointm) 
600         //  if (pointm->fIsShared) continue;
601         //if (pointp) 
602         //  if (pointp->fIsShared) continue;
603
604         if (type<0) continue;
605         //if (type>10) continue;       
606         //if (point->GetErrY()==0) continue;
607         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
608
609         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
610         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
611         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue; 
612
613
614         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
615         if (cl->GetMax()<5) continue;
616         Float_t angley = point->GetAngleY();
617         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
618
619         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
620         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
621         /*
622         Float_t ns = 1.;
623         if (pointm){
624           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
625           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
626           ns+=1.;
627         }
628         if (pointp){
629           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
630           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
631           ns+=1.;
632         }
633         rsigmay/=ns;
634         rsigmaz/=ns;
635         */
636
637         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
638
639         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
640         if (i>64){
641           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
642           ampc = 1.*cl->GetMax();
643           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();          
644           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
645           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
646           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
647           //Float_t dz = 
648           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
649           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
650           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
651           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
652           //ampc               *=zfactor; 
653         }
654         else{ 
655           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax(); 
656           ampc = 1.0*cl->GetMax(); 
657           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ(); 
658           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
659           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
660           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
661           //Float_t dz = 
662           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
663
664           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
665           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
666           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
667           //ampc               *=zfactor; 
668
669         }
670         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
671         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
672         Float_t w      =  1.;
673         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5); 
674         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
675         if (i<64) {
676           ampc /= 0.6;
677           //ampc /= (1+0.0008*z);
678         } else
679           if (i>128){
680             ampc /=1.5;
681             //ampc /= (1+0.0008*z);
682           }else{
683             //ampc /= (1+0.0008*z);
684           }
685         
686         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
687           // w*= 2.;
688           
689           continue;
690         }
691         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
692         amp[nc[of]]        = ampc;
693         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
694         weight[nc[of]]     = w;
695         nc[of]++;
696       }
697     
698     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
699     Float_t sumamp=0;
700     Float_t sumamp2=0;
701     Float_t sumw=0;
702     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
703     meanlog = 50;
704     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
705       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
706       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
707       //
708       sumw    += weight[index[i]]; 
709       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
710       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
711       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
712     }
713     if (sumw<1){ 
714       SetdEdx(0);  
715     }
716     else {
717       norm[of] /= sumw;
718       mean[of]  = sumamp/sumw;
719       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
720       if (sigma[of]>0.1) 
721         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
722       else
723         sigma[of] = 1000;
724       
725     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
726     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
727     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
728     }
729   }
730
731   Float_t dedx =0;
732   fSdEdx =0;
733   fMAngular =0;
734   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
735   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
736
737   
738   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/ 
739   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
740
741   Int_t norm2 = 0;
742   Int_t norm3 = 0;
743   for (Int_t i =0;i<4;i++){
744     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
745       dedx      += mean[i] *nc[i];
746       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
747       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
748       norm2     += nc[i];
749       norm3     += nc[i]-2;
750     }
751     fDEDX[i]  = mean[i];             
752     fSDEDX[i] = sigma[i];            
753     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
754   }
755
756   if (norm3>0){
757     dedx   /=norm2;
758     fSdEdx /=norm3;
759     fMAngular/=norm2;
760   }
761   else{
762     SetdEdx(0);
763     return 0;
764   }
765   //  Float_t dedx1 =dedx;
766   /*
767   dedx =0;
768   for (Int_t i =0;i<4;i++){
769     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
770       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
771       dedx      += mean[i] *nc[i];
772     }
773     fDEDX[i]  = mean[i];                
774   }
775   dedx /= norm2;
776   */
777
778   
779   SetdEdx(dedx);
780   return dedx;
781 }
782 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
783   //
784   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
785   //
786   Double_t bg2=bg*bg;
787   Double_t bethe;
788   if (bg<3.5e1) 
789     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
790   else // Density effect ( approximately :) 
791     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
792   return bethe/11.091;
793 }
794
795 void AliTPCseed::CookPID()
796 {
797   //
798   // cook PID information according dEdx
799   //
800   Double_t fRange = 10.;
801   Double_t fRes   = 0.1;
802   Double_t fMIP   = 47.;
803   //
804   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
805   Double_t sumr =0;
806   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
807     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
808     Double_t mom=P();
809     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
810     Double_t bethe=Bethe(mom/mass); 
811     Double_t sigma=fRes*bethe;
812     if (sigma>0.001){
813       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
814         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
815         sumr+=fTPCr[j];
816         continue;
817       }
818       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
819       sumr+=fTPCr[j];
820     }
821     else{
822       fTPCr[j]=1.;
823       sumr+=fTPCr[j];
824     }
825   }
826   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
827     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
828   }
829 }
830
831 /*
832 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
833   //-----------------------------------------------------------------
834   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
835   //-----------------------------------------------------------------
836
837   Float_t amp[200];
838   Float_t angular[200];
839   Float_t weight[200];
840   Int_t index[200];
841   Bool_t inlimit[200];
842   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
843   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
844   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
845   
846
847   //
848   Float_t meanlog = 100.;
849   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
850
851   Float_t amean     =0;
852   Float_t asigma    =0;
853   Float_t anc       =0;
854   Float_t anorm     =0;
855
856   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
857   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
858   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
859   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
860   //
861   //
862   fNShared =0;
863
864   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){    
865   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
866   for (Int_t i =0; i<160;i++)
867     {
868         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
869         if (point==0) continue;
870         if (point->fIsShared){
871           fNShared++;     
872           continue;
873         }
874         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
875         if (type<0) continue;
876         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
877         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
878         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
879         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
880         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
881         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
882
883         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
884         if (i>64){
885           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
886         }
887         else{ 
888           ampc = point->GetCPoint().GetMax(); 
889         }
890         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
891         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
892
893         Float_t w      =  1.;
894         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
895         if (i<64) {
896           ampc /= 0.63;
897         } else
898           if (i>128){
899             ampc /=1.51;
900           }             
901         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight                 
902           continue;
903         }
904         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
905         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
906         amp[i]        = ampc/angular[i];
907         weight[i]     = w;
908         anc++;
909     }
910
911   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
912   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){      
913     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
914   }
915   
916   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
917   meanlog =10000.;
918   for (Int_t of =0; of<3; of++){    
919     Float_t sumamp=0;
920     Float_t sumamp2=0;
921     Float_t sumw=0;    
922    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
923       {
924         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
925         Float_t ampl      = amp[i];
926         ///angular[i];
927         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
928         //
929         sumw    += weight[i]; 
930         sumamp  += weight[i]*ampl;
931         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
932         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
933         nc[of]++;
934       }
935    if (sumw<1){ 
936      SetdEdx(0);  
937    }
938    else {
939      norm[of] /= sumw;
940      mean[of]  = sumamp/sumw;
941      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
942      if (sigma[of]>0.1) 
943        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
944      else
945        sigma[of] = 1000;      
946      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
947    }
948   }
949     
950   Float_t dedx =0;
951   fSdEdx =0;
952   fMAngular =0;
953   //
954   Int_t norm2 = 0;
955   Int_t norm3 = 0;
956   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
957   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
958
959   for (Int_t i =0;i<3;i++){
960     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
961       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
962       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
963       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
964       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
965       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
966     }
967     fDEDX[i]  = mean[i];             
968     fSDEDX[i] = sigma[i];            
969     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
970   }
971
972   if (norm3>0){
973     dedx   /=norm2;
974     fSdEdx /=norm3;
975     fMAngular/=norm2;
976   }
977   else{
978     SetdEdx(0);
979     return;
980   }
981   //  Float_t dedx1 =dedx;
982   
983   dedx =0;
984   Float_t norm4 = 0;
985   for (Int_t i =0;i<3;i++){
986     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
987       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
988       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
989       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
990     }
991     fDEDX[i]  = mean[i];                
992   }
993   if (norm4>0) dedx /= norm4;
994   
995
996   
997   SetdEdx(dedx);
998     
999   //mi deDX
1000
1001 }
1002 */