compiling error fix - (Marian)
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCseed.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16
17
18
19 //-----------------------------------------------------------------
20 //           Implementation of the TPC seed class
21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
23 //-----------------------------------------------------------------
24 #include "TClonesArray.h"
25 #include "AliTPCseed.h"
26 #include "AliTPCReconstructor.h"
27 #include "AliTPCClusterParam.h"
28 #include "AliTPCCalPad.h"
29 #include "AliTPCCalROC.h"
30 #include "AliTPCcalibDB.h"
31 #include "AliTPCParam.h"
32
33
34
35 ClassImp(AliTPCseed)
36
37
38
39 AliTPCseed::AliTPCseed():
40   AliTPCtrack(),
41   fEsd(0x0),
42   fClusterOwner(kFALSE),
43   fRow(0),
44   fSector(-1),
45   fRelativeSector(-1),
46   fCurrentSigmaY2(1e10),
47   fCurrentSigmaZ2(1e10),
48   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
49   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
50   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
51   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
52   //
53   fErrorY2(1e10),
54   fErrorZ2(1e10),
55   fCurrentCluster(0x0),
56   fCurrentClusterIndex1(-1),
57   fInDead(kFALSE),
58   fIsSeeding(kFALSE),
59   fNoCluster(0),
60   fSort(0),
61   fBSigned(kFALSE),
62   fSeedType(0),
63   fSeed1(-1),
64   fSeed2(-1),
65   fMAngular(0),
66   fCircular(0),
67   fClusterMap(159),
68   fSharedMap(159)
69 {
70   //
71   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
72   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
73   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
74   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
75   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
76     fDEDX[i] = 0.;
77     fSDEDX[i] = 1e10;
78     fNCDEDX[i] = 0;
79   }
80   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
81   //  for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
82   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
83   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
84   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
85
86 }
87
88 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
89   AliTPCtrack(s),
90   fEsd(0x0),
91   fClusterOwner(clusterOwner),
92   fRow(0),
93   fSector(-1),
94   fRelativeSector(-1),
95   fCurrentSigmaY2(-1),
96   fCurrentSigmaZ2(-1),
97   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
98   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
99   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
100   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
101   fErrorY2(1e10),
102   fErrorZ2(1e10),
103   fCurrentCluster(0x0),
104   fCurrentClusterIndex1(-1),
105   fInDead(kFALSE),
106   fIsSeeding(kFALSE),
107   fNoCluster(0),
108   fSort(0),
109   fBSigned(kFALSE),
110   fSeedType(0),
111   fSeed1(-1),
112   fSeed2(-1),
113   fMAngular(0),
114   fCircular(0),
115   fClusterMap(s.fClusterMap),
116   fSharedMap(s.fSharedMap)
117 {
118   //---------------------
119   // dummy copy constructor
120   //-------------------------
121   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
122     fClusterPointer[i]=0;
123     if (fClusterOwner){
124       if (s.fClusterPointer[i])
125         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
126     }else{
127       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
128     }
129     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
130   }
131   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
132   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
133   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
134     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
135     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
136     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
137   }
138   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
139
140 }
141
142
143 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
144   AliTPCtrack(t),
145   fEsd(0x0),
146   fClusterOwner(kFALSE),
147   fRow(0),
148   fSector(-1),
149   fRelativeSector(-1),
150   fCurrentSigmaY2(-1),
151   fCurrentSigmaZ2(-1),
152   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
153   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
154   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
155   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
156   fErrorY2(1e10),
157   fErrorZ2(1e10),
158   fCurrentCluster(0x0),
159   fCurrentClusterIndex1(-1),
160   fInDead(kFALSE),
161   fIsSeeding(kFALSE),
162   fNoCluster(0),
163   fSort(0),
164   fBSigned(kFALSE),
165   fSeedType(0),
166   fSeed1(-1),
167   fSeed2(-1),
168   fMAngular(0),
169   fCircular(0),
170   fClusterMap(159),
171   fSharedMap(159)
172 {
173   //
174   // Constructor from AliTPCtrack
175   //
176   fFirstPoint =0;
177   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
178   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
179     fClusterPointer[i] = 0;
180     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
181     if (index>=-1){ 
182       SetClusterIndex2(i,index);
183     }
184     else{
185       SetClusterIndex2(i,-3); 
186     }    
187   }
188   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
189     fDEDX[i] = 0.;
190     fSDEDX[i] = 1e10;
191     fNCDEDX[i] = 0;
192   }
193   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
194   
195   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
196   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
197   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
198   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
199
200 }
201
202 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
203                        const Double_t cc[15], Int_t index):      
204   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
205   fEsd(0x0),
206   fClusterOwner(kFALSE),
207   fRow(0),
208   fSector(-1),
209   fRelativeSector(-1),
210   fCurrentSigmaY2(-1),
211   fCurrentSigmaZ2(-1),
212   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
213   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
214   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
215   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
216   fErrorY2(1e10),
217   fErrorZ2(1e10),
218   fCurrentCluster(0x0),
219   fCurrentClusterIndex1(-1),
220   fInDead(kFALSE),
221   fIsSeeding(kFALSE),
222   fNoCluster(0),
223   fSort(0),
224   fBSigned(kFALSE),
225   fSeedType(0),
226   fSeed1(-1),
227   fSeed2(-1),
228   fMAngular(0),
229   fCircular(0),
230   fClusterMap(159),
231   fSharedMap(159)
232 {
233   //
234   // Constructor
235   //
236   fFirstPoint =0;
237   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
238   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
239   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
240   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
241     fDEDX[i] = 0.;
242     fSDEDX[i] = 1e10;
243     fNCDEDX[i] = 0;
244   }
245   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
246 }
247
248 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
249   //
250   // destructor
251   fNoCluster =0;
252   if (fClusterOwner){
253     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
254       delete fClusterPointer[icluster];
255     }
256   }
257
258 }
259 //_________________________________________________
260 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
261 {
262   //
263   // assignment operator 
264   //
265   if(this!=&param){
266     AliTPCtrack::operator=(param);
267     fEsd =param.fEsd; 
268     for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i]; // this is not allocated by AliTPCSeed
269     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
270     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
271     // but deleted in the dtor... strange...
272     fRow            = param.fRow;
273     fSector         = param.fSector;
274     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
275     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
276     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
277     fErrorY2        = param.fErrorY2;
278     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
279     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
280     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1; 
281     fInDead         = param.fInDead;
282     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
283     fNoCluster      = param.fNoCluster;
284     fSort           = param.fSort;
285     fBSigned        = param.fBSigned;
286     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
287       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
288       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
289       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
290     }
291     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
292     
293     fSeedType = param.fSeedType;
294     fSeed1    = param.fSeed1;
295     fSeed2    = param.fSeed2;
296     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
297     fMAngular = param.fMAngular;
298     fCircular = param.fCircular;
299     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
300     fClusterMap = param.fClusterMap;
301     fSharedMap = param.fSharedMap;
302   }
303   return (*this);
304 }
305 //____________________________________________________
306 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
307 {
308   //
309   // 
310   return &fTrackPoints[i];
311 }
312
313
314
315 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
316 {
317   //
318   //
319   // return cluster for n rows bellow first point
320   Int_t nfoundable = 1;
321   Int_t nfound      = 1;
322   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
323     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
324     if (index!=-1) nfoundable++;
325     if (index>0) nfound++;
326   }
327   if (nfoundable<n) return 0;
328   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
329
330 }
331
332
333 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
334 {
335   // get cluster stat.  on given region
336   //
337   found       = 0;
338   foundable   = 0;
339   shared      =0;
340   for (Int_t i=first;i<last; i++){
341     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
342     if (index!=-1) foundable++;
343     if (index&0x8000) continue;
344     if (fClusterPointer[i]) {
345       found++;
346     }
347     else 
348       continue;
349
350     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
351       shared++;
352       continue;
353     }
354     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
355     //
356     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
357       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
358         shared++;
359         continue;
360       }
361     }
362     if ( fClusterPointer[i+1]){
363       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
364         shared++;
365         continue;
366       }
367     }
368     
369   }
370   //if (shared>found){
371     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
372   //}
373 }
374
375
376
377
378
379 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
380 {
381   //
382   //
383   SetNumberOfClusters(0);
384   fNFoundable = 0;
385   SetChi2(0);
386   ResetCovariance(10.);
387   /*
388   if (fTrackPoints){
389     for (Int_t i=0;i<8;i++){
390       delete [] fTrackPoints[i];
391     }
392     delete fTrackPoints;
393     fTrackPoints =0;
394   }
395   */
396
397   if (all){   
398     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
399     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
400   }
401
402 }
403
404
405 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
406 {
407
408   //------------------------------------------------------------------
409   //This function makes a track forget its history :)  
410   //------------------------------------------------------------------
411   if (factor<=0) {
412     ResetCovariance(10.);
413     return;
414   }
415   ResetCovariance(factor);
416
417   SetNumberOfClusters(0);
418   fNFoundable =0;
419   SetChi2(0);
420   fRemoval = 0;
421   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
422   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
423   fNoCluster     = 0;
424   //fFirstPoint = 160;
425   //fLastPoint  = 0;
426 }
427
428
429
430
431 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
432 {
433   //-----------------------------------------------------------------
434   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
435   // doesn't change internal state of the track
436   //-----------------------------------------------------------------
437   
438   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
439
440   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {   
441     return 0;
442   }
443
444   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
445   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt(1.- c1*c1);
446   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt(1.- c2*c2);
447   
448   y = GetY();
449   z = GetZ();
450   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
451   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
452   
453   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
454   Double_t dz = 0;
455   //
456   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
457   /*
458   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
459     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
460   }else{
461     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
462   }
463   */
464   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
465   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
466   //
467   y+=dy;
468   z+=dz;
469   
470
471   return 1;  
472 }
473
474
475 //_____________________________________________________________________________
476 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const 
477 {
478   //-----------------------------------------------------------------
479   // This function calculates a predicted chi2 increment.
480   //-----------------------------------------------------------------
481   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
482   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
483   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
484 }
485
486 //_________________________________________________________________________________________
487
488
489 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
490   //-----------------------------------------------------------------
491   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
492   //-----------------------------------------------------------------
493   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
494
495   if (fSort == 0){
496     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
497     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
498     Double_t z2 = t->GetZ();
499     Double_t z1 = GetZ();
500     if (z2>z1) return 1;
501     if (z2<z1) return -1;
502     return 0;
503   }
504   else {
505     Float_t f2 =1;
506     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
507     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
508
509     Float_t f1 =1;
510     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
511
512     if (fBConstrain)   f1=1.2;
513  
514     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
515     else return +1;
516   }
517 }
518
519
520
521
522 //_____________________________________________________________________________
523 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t index)
524 {
525   //-----------------------------------------------------------------
526   // This function associates a cluster with this track.
527   //-----------------------------------------------------------------
528   Int_t n=GetNumberOfClusters();
529   Int_t idx=GetClusterIndex(n);    // save the current cluster index
530
531   AliCluster cl(*c);  cl.SetSigmaY2(fErrorY2); cl.SetSigmaZ2(fErrorZ2);
532   if (!AliTPCtrack::Update(&cl,chisq,index)) return kFALSE;
533   
534   if (fCMeanSigmaY2p30<0){
535     fCMeanSigmaY2p30= c->GetSigmaY2();   //! current mean sigma Y2 - mean30%
536     fCMeanSigmaZ2p30= c->GetSigmaZ2();   //! current mean sigma Z2 - mean30%    
537     fCMeanSigmaY2p30R = 1;   //! current mean sigma Y2 - mean5%
538     fCMeanSigmaZ2p30R = 1;   //! current mean sigma Z2 - mean5%
539   }
540   //
541   fCMeanSigmaY2p30= 0.70*fCMeanSigmaY2p30 +0.30*c->GetSigmaY2();   
542   fCMeanSigmaZ2p30= 0.70*fCMeanSigmaZ2p30 +0.30*c->GetSigmaZ2();  
543   if (fCurrentSigmaY2>0){
544     fCMeanSigmaY2p30R = 0.7*fCMeanSigmaY2p30R  +0.3*c->GetSigmaY2()/fCurrentSigmaY2;  
545     fCMeanSigmaZ2p30R = 0.7*fCMeanSigmaZ2p30R  +0.3*c->GetSigmaZ2()/fCurrentSigmaZ2;   
546   }
547
548
549   SetClusterIndex(n,idx);          // restore the current cluster index
550   return kTRUE;
551 }
552
553
554
555 //_____________________________________________________________________________
556 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
557   //-----------------------------------------------------------------
558   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
559   //-----------------------------------------------------------------
560
561   Float_t amp[200];
562   Float_t angular[200];
563   Float_t weight[200];
564   Int_t index[200];
565   //Int_t nc = 0;
566   Float_t meanlog = 100.;
567   
568   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
569   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
570   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
571   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
572   //
573   //
574   fNShared =0;
575
576   Float_t gainGG = 1;
577   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
578     gainGG= 20000./AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain();  //relative gas gain
579   }
580
581
582   for (Int_t of =0; of<4; of++){    
583     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
584       {
585         Int_t index = fIndex[i];
586         if (index<0||index&0x8000) continue;
587
588         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
589         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
590         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
591         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
592         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
593
594         if (point==0) continue;
595         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
596         if (cl==0) continue;    
597         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
598         if (cl->IsUsed(11)) {
599           fNShared++;
600           continue;
601         }
602         Int_t   type   = cl->GetType();
603         //if (point->fIsShared){
604         //  fNShared++;
605         //  continue;
606         //}
607         //if (pointm) 
608         //  if (pointm->fIsShared) continue;
609         //if (pointp) 
610         //  if (pointp->fIsShared) continue;
611
612         if (type<0) continue;
613         //if (type>10) continue;       
614         //if (point->GetErrY()==0) continue;
615         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
616
617         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
618         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
619         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue; 
620
621
622         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
623         if (cl->GetMax()<5) continue;
624         Float_t angley = point->GetAngleY();
625         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
626
627         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
628         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
629         /*
630         Float_t ns = 1.;
631         if (pointm){
632           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
633           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
634           ns+=1.;
635         }
636         if (pointp){
637           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
638           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
639           ns+=1.;
640         }
641         rsigmay/=ns;
642         rsigmaz/=ns;
643         */
644
645         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
646
647         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
648         if (i>64){
649           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
650           ampc = 1.*cl->GetMax();
651           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();          
652           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
653           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
654           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
655           //Float_t dz = 
656           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
657           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
658           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
659           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
660           //ampc               *=zfactor; 
661         }
662         else{ 
663           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax(); 
664           ampc = 1.0*cl->GetMax(); 
665           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ(); 
666           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
667           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
668           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
669           //Float_t dz = 
670           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
671
672           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
673           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
674           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
675           //ampc               *=zfactor; 
676
677         }
678         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
679         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
680         Float_t w      =  1.;
681         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5); 
682         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
683         if (i<64) {
684           ampc /= 0.6;
685           //ampc /= (1+0.0008*z);
686         } else
687           if (i>128){
688             ampc /=1.5;
689             //ampc /= (1+0.0008*z);
690           }else{
691             //ampc /= (1+0.0008*z);
692           }
693         
694         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
695           // w*= 2.;
696           
697           continue;
698         }
699         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
700         amp[nc[of]]       /=gainGG;
701         amp[nc[of]]        = ampc;
702         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
703         weight[nc[of]]     = w;
704         nc[of]++;
705       }
706     
707     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
708     Float_t sumamp=0;
709     Float_t sumamp2=0;
710     Float_t sumw=0;
711     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
712     meanlog = 50;
713     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
714       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
715       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
716       //
717       sumw    += weight[index[i]]; 
718       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
719       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
720       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
721     }
722     if (sumw<1){ 
723       SetdEdx(0);  
724     }
725     else {
726       norm[of] /= sumw;
727       mean[of]  = sumamp/sumw;
728       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
729       if (sigma[of]>0.1) 
730         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
731       else
732         sigma[of] = 1000;
733       
734     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
735     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
736     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
737     }
738   }
739
740   Float_t dedx =0;
741   fSdEdx =0;
742   fMAngular =0;
743   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
744   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
745
746   
747   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/ 
748   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
749
750   Int_t norm2 = 0;
751   Int_t norm3 = 0;
752   for (Int_t i =0;i<4;i++){
753     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
754       dedx      += mean[i] *nc[i];
755       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
756       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
757       norm2     += nc[i];
758       norm3     += nc[i]-2;
759     }
760     fDEDX[i]  = mean[i];             
761     fSDEDX[i] = sigma[i];            
762     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
763   }
764
765   if (norm3>0){
766     dedx   /=norm2;
767     fSdEdx /=norm3;
768     fMAngular/=norm2;
769   }
770   else{
771     SetdEdx(0);
772     return 0;
773   }
774   //  Float_t dedx1 =dedx;
775   /*
776   dedx =0;
777   for (Int_t i =0;i<4;i++){
778     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
779       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
780       dedx      += mean[i] *nc[i];
781     }
782     fDEDX[i]  = mean[i];                
783   }
784   dedx /= norm2;
785   */
786
787   
788   SetdEdx(dedx);
789   return dedx;
790 }
791 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
792   //
793   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
794   //
795   Double_t bg2=bg*bg;
796   Double_t bethe;
797   if (bg<3.5e1) 
798     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
799   else // Density effect ( approximately :) 
800     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
801   return bethe/11.091;
802 }
803
804 void AliTPCseed::CookPID()
805 {
806   //
807   // cook PID information according dEdx
808   //
809   Double_t fRange = 10.;
810   Double_t fRes   = 0.1;
811   Double_t fMIP   = 47.;
812   //
813   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
814   Double_t sumr =0;
815   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
816     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
817     Double_t mom=GetP();
818     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
819     Double_t bethe=Bethe(mom/mass); 
820     Double_t sigma=fRes*bethe;
821     if (sigma>0.001){
822       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
823         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
824         sumr+=fTPCr[j];
825         continue;
826       }
827       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
828       sumr+=fTPCr[j];
829     }
830     else{
831       fTPCr[j]=1.;
832       sumr+=fTPCr[j];
833     }
834   }
835   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
836     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
837   }
838 }
839
840 /*
841 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
842   //-----------------------------------------------------------------
843   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
844   //-----------------------------------------------------------------
845
846   Float_t amp[200];
847   Float_t angular[200];
848   Float_t weight[200];
849   Int_t index[200];
850   Bool_t inlimit[200];
851   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
852   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
853   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
854   
855
856   //
857   Float_t meanlog = 100.;
858   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
859
860   Float_t amean     =0;
861   Float_t asigma    =0;
862   Float_t anc       =0;
863   Float_t anorm     =0;
864
865   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
866   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
867   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
868   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
869   //
870   //
871   fNShared =0;
872
873   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){    
874   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
875   for (Int_t i =0; i<160;i++)
876     {
877         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
878         if (point==0) continue;
879         if (point->fIsShared){
880           fNShared++;     
881           continue;
882         }
883         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
884         if (type<0) continue;
885         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
886         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
887         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
888         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
889         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
890         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
891
892         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
893         if (i>64){
894           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
895         }
896         else{ 
897           ampc = point->GetCPoint().GetMax(); 
898         }
899         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
900         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
901
902         Float_t w      =  1.;
903         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
904         if (i<64) {
905           ampc /= 0.63;
906         } else
907           if (i>128){
908             ampc /=1.51;
909           }             
910         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight                 
911           continue;
912         }
913         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
914         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
915         amp[i]        = ampc/angular[i];
916         weight[i]     = w;
917         anc++;
918     }
919
920   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
921   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){      
922     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
923   }
924   
925   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
926   meanlog =10000.;
927   for (Int_t of =0; of<3; of++){    
928     Float_t sumamp=0;
929     Float_t sumamp2=0;
930     Float_t sumw=0;    
931    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
932       {
933         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
934         Float_t ampl      = amp[i];
935         ///angular[i];
936         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
937         //
938         sumw    += weight[i]; 
939         sumamp  += weight[i]*ampl;
940         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
941         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
942         nc[of]++;
943       }
944    if (sumw<1){ 
945      SetdEdx(0);  
946    }
947    else {
948      norm[of] /= sumw;
949      mean[of]  = sumamp/sumw;
950      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
951      if (sigma[of]>0.1) 
952        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
953      else
954        sigma[of] = 1000;      
955      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
956    }
957   }
958     
959   Float_t dedx =0;
960   fSdEdx =0;
961   fMAngular =0;
962   //
963   Int_t norm2 = 0;
964   Int_t norm3 = 0;
965   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
966   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
967
968   for (Int_t i =0;i<3;i++){
969     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
970       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
971       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
972       fMAngular += norm[i] *nc[i];    
973       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
974       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
975     }
976     fDEDX[i]  = mean[i];             
977     fSDEDX[i] = sigma[i];            
978     fNCDEDX[i]= nc[i]; 
979   }
980
981   if (norm3>0){
982     dedx   /=norm2;
983     fSdEdx /=norm3;
984     fMAngular/=norm2;
985   }
986   else{
987     SetdEdx(0);
988     return;
989   }
990   //  Float_t dedx1 =dedx;
991   
992   dedx =0;
993   Float_t norm4 = 0;
994   for (Int_t i =0;i<3;i++){
995     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
996       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
997       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
998       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
999     }
1000     fDEDX[i]  = mean[i];                
1001   }
1002   if (norm4>0) dedx /= norm4;
1003   
1004
1005   
1006   SetdEdx(dedx);
1007     
1008   //mi deDX
1009
1010 }
1011 */
1012 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
1013 //-----------------------------------------------------------------
1014 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
1015 //-----------------------------------------------------------------
1016   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
1017     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt(1.- c1*c1);
1018     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
1019     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
1020     Double_t r2=TMath::Sqrt(1.- c2*c2);
1021     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
1022 }
1023
1024 void AliTPCseed::SetClusterMapBit(int ibit, Bool_t state)
1025 {
1026   fClusterMap[ibit] = state;
1027 }
1028 Bool_t AliTPCseed::GetClusterMapBit(int ibit)
1029 {
1030   return fClusterMap[ibit];
1031 }
1032 void AliTPCseed::SetSharedMapBit(int ibit, Bool_t state)
1033 {
1034   fSharedMap[ibit] = state;
1035 }
1036 Bool_t AliTPCseed::GetSharedMapBit(int ibit)
1037 {
1038   return fSharedMap[ibit];
1039 }
1040
1041
1042
1043
1044
1045 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxNorm(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, AliTPCCalPad * gainMap, Bool_t posNorm, Bool_t padNorm){
1046  
1047   //
1048   // calculates dedx using the cluster
1049   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
1050   // type   -  1 - max charge  or 0- total charge in cluster 
1051   //           //2- max no corr 3- total+ correction
1052   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
1053   //
1054   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
1055   //
1056   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCClusterParam::Instance();
1057   if (!parcl) parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1058   if (!parcl) return 0;
1059   Float_t amp[160];
1060   Int_t   indexes[160];
1061   Int_t   ncl=0;
1062   //
1063   //
1064   Float_t gainGG = 1;
1065   if (AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()){
1066     gainGG= 20000./AliTPCcalibDB::Instance()->GetParameters()->GetGasGain();  //relative gas gain
1067   }
1068
1069   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
1070   const Float_t kedgey =3.;
1071   //
1072   //
1073   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
1074     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
1075     if (!cluster) continue;
1076     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
1077     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetMax():cluster->GetQ();
1078     if (!gainMap) gainMap =  AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor();
1079     if (gainMap) {      
1080       Float_t factor = 1;      
1081       AliTPCCalROC * roc = gainMap->GetCalROC(cluster->GetDetector());
1082       if (irow < 63) { // IROC
1083         factor = roc->GetValue(irow, TMath::Nint(cluster->GetPad()))*1.55;
1084       } else {         // OROC
1085         factor = roc->GetValue(irow - 63, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
1086       }
1087       if (factor>0.5) charge/=factor;
1088     }
1089     
1090     //do normalization
1091     Float_t corr=1;
1092     Int_t  ipad= 0;
1093     if (irow>62) ipad=1;
1094     if (irow>127) ipad=2;    
1095     if (type<=1){
1096       //        
1097       AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1098       Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
1099       Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ());
1100       
1101       Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
1102       corr  = parcl->Qnorm(ipad,type,dr,ty,tz);
1103     }
1104     amp[ncl]=charge/corr;
1105     amp[ncl]/=gainGG;
1106     if (posNorm){
1107       //
1108       //
1109       //
1110       corr = parcl->QnormPos(ipad,type, cluster->GetPad(),cluster->GetTimeBin(), cluster->GetZ(),
1111                              cluster->GetSigmaY2(),cluster->GetSigmaZ2(),cluster->GetMax(),cluster->GetQ());
1112       amp[ncl]/=corr;
1113     }
1114
1115
1116     amp[ncl] *= 2.0;     // put mean value to channel 50
1117     if (padNorm){
1118       corr=1;
1119       if (type==0 && parcl->fQpadTnorm) corr = (*parcl->fQpadTnorm)[ipad];
1120       if (type==1 && parcl->fQpadTnorm) corr = (*parcl->fQpadMnorm)[ipad];
1121       amp[ncl]/=corr;
1122     }
1123
1124     // if (ipad==0) {
1125 //       amp[ncl] /= 0.65; // this we will take form OCDB
1126 //     } else
1127 //       if (ipad==2){
1128 //      amp[ncl] /=1.57;
1129 //       }else{
1130 //       }      
1131     ncl++;
1132   }
1133
1134   if (type>3) return ncl; 
1135   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1136
1137   if (ncl<10) return 0;
1138   
1139   Float_t suma=0;
1140   Float_t sumn=0;
1141   Int_t icl0=TMath::Nint(ncl*low);
1142   Int_t icl1=TMath::Nint(ncl*up);
1143   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1144     suma+=amp[indexes[icl]];
1145     sumn++;
1146   }
1147   return suma/sumn;
1148
1149 }
1150
1151 Double_t AliTPCseed::BetheMass(Double_t mass){
1152   //
1153   // return bethe-bloch
1154   //
1155   Float_t bg= P()/mass; 
1156   const Double_t kp1=0.76176e-1;
1157   const Double_t kp2=10.632;
1158   const Double_t kp3=0.13279e-4;
1159   const Double_t kp4=1.8631;
1160   const Double_t kp5=1.9479;
1161
1162   Double_t dbg = (Double_t) bg;
1163
1164   Double_t beta = dbg/TMath::Sqrt(1.+dbg*dbg);
1165
1166   Double_t aa = TMath::Power(beta,kp4);
1167   Double_t bb = TMath::Power(1./dbg,kp5);
1168
1169   bb=TMath::Log(kp3+bb);
1170   
1171   return ((Float_t)((kp2-aa-bb)*kp1/aa));
1172 }
1173
1174
1175 Float_t  AliTPCseed::CookShape(Int_t type){
1176   //
1177   //
1178   //
1179  //-----------------------------------------------------------------
1180   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
1181   //-----------------------------------------------------------------
1182   Float_t means=0;
1183   Float_t meanc=0;
1184   for (Int_t i =0; i<160;i++)    {
1185     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
1186     if (point==0) continue;
1187
1188     AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
1189     if (cl==0) continue;        
1190     
1191     Float_t rsigmay =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1192     Float_t rsigmaz =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaZ());
1193     Float_t rsigma =   (rsigmay+rsigmaz)*0.5;
1194     if (type==0) means+=rsigma;
1195     if (type==1) means+=rsigmay;
1196     if (type==2) means+=rsigmaz;
1197     meanc++;
1198   }
1199   Float_t mean = (meanc>0)? means/meanc:0;
1200   return mean;
1201 }