TPC/AliTPCseed.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17
  18
  19 //-----------------------------------------------------------------
  20 //           Implementation of the TPC seed class
  21 //        This class is used by the AliTPCtrackerMI class
  22 //      Origin: Marian Ivanov, CERN, Marian.Ivanov@cern.ch
  23 //-----------------------------------------------------------------
  24 #include "TClonesArray.h"
  25 #include "AliTPCseed.h"
  26 #include "AliTPCReconstructor.h"
  27 #include "AliTPCClusterParam.h"
  28 #include "AliTPCCalPad.h"
  29 #include "AliTPCCalROC.h"
  30 #include "AliTPCcalibDB.h"
  31
  32
  33
  34 ClassImp(AliTPCseed)
  35
  36
  37
  38 AliTPCseed::AliTPCseed():
  39   AliTPCtrack(),
  40   fEsd(0x0),
  41   fClusterOwner(kFALSE),
  42   fRow(0),
  43   fSector(-1),
  44   fRelativeSector(-1),
  45   fCurrentSigmaY2(1e10),
  46   fCurrentSigmaZ2(1e10),
  47   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
  48   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
  49   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
  50   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
  51   //
  52   fErrorY2(1e10),
  53   fErrorZ2(1e10),
  54   fCurrentCluster(0x0),
  55   fCurrentClusterIndex1(-1),
  56   fInDead(kFALSE),
  57   fIsSeeding(kFALSE),
  58   fNoCluster(0),
  59   fSort(0),
  60   fBSigned(kFALSE),
  61   fSeedType(0),
  62   fSeed1(-1),
  63   fSeed2(-1),
  64   fMAngular(0),
  65   fCircular(0),
  66   fClusterMap(159),
  67   fSharedMap(159)
  68 {
  69   //
  70   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
  71   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
  72   for (Int_t i=0;i<3;i++)   fKinkIndexes[i]=0;
  73   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=0.2;
  74   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
  75     fDEDX[i] = 0.;
  76     fSDEDX[i] = 1e10;
  77     fNCDEDX[i] = 0;
  78   }
  79   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
  80   //  for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
  81   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
  82   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
  83   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
  84
  85 }
  86
  87 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCseed &s, Bool_t clusterOwner):
  88   AliTPCtrack(s),
  89   fEsd(0x0),
  90   fClusterOwner(clusterOwner),
  91   fRow(0),
  92   fSector(-1),
  93   fRelativeSector(-1),
  94   fCurrentSigmaY2(-1),
  95   fCurrentSigmaZ2(-1),
  96   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
  97   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
  98   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
  99   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 100   fErrorY2(1e10),
 101   fErrorZ2(1e10),
 102   fCurrentCluster(0x0),
 103   fCurrentClusterIndex1(-1),
 104   fInDead(kFALSE),
 105   fIsSeeding(kFALSE),
 106   fNoCluster(0),
 107   fSort(0),
 108   fBSigned(kFALSE),
 109   fSeedType(0),
 110   fSeed1(-1),
 111   fSeed2(-1),
 112   fMAngular(0),
 113   fCircular(0),
 114   fClusterMap(s.fClusterMap),
 115   fSharedMap(s.fSharedMap)
 116 {
 117   //---------------------
 118   // dummy copy constructor
 119   //-------------------------
 120   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 121     fClusterPointer[i]=0;
 122     if (fClusterOwner){
 123       if (s.fClusterPointer[i])
 124         fClusterPointer[i] = new AliTPCclusterMI(*(s.fClusterPointer[i]));
 125     }else{
 126       fClusterPointer[i] = s.fClusterPointer[i];
 127     }
 128     fTrackPoints[i] = s.fTrackPoints[i];
 129   }
 130   for (Int_t i=0;i<160;i++) fIndex[i] = s.fIndex[i];
 131   for (Int_t i=0;i<AliPID::kSPECIES;i++)   fTPCr[i]=s.fTPCr[i];
 132   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 133     fDEDX[i] = s.fDEDX[i];
 134     fSDEDX[i] = s.fSDEDX[i];
 135     fNCDEDX[i] = s.fNCDEDX[i];
 136   }
 137   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = s.fOverlapLabels[i];
 138
 139 }
 140
 141
 142 AliTPCseed::AliTPCseed(const AliTPCtrack &t):
 143   AliTPCtrack(t),
 144   fEsd(0x0),
 145   fClusterOwner(kFALSE),
 146   fRow(0),
 147   fSector(-1),
 148   fRelativeSector(-1),
 149   fCurrentSigmaY2(-1),
 150   fCurrentSigmaZ2(-1),
 151   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 152   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 153   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
 154   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 155   fErrorY2(1e10),
 156   fErrorZ2(1e10),
 157   fCurrentCluster(0x0),
 158   fCurrentClusterIndex1(-1),
 159   fInDead(kFALSE),
 160   fIsSeeding(kFALSE),
 161   fNoCluster(0),
 162   fSort(0),
 163   fBSigned(kFALSE),
 164   fSeedType(0),
 165   fSeed1(-1),
 166   fSeed2(-1),
 167   fMAngular(0),
 168   fCircular(0),
 169   fClusterMap(159),
 170   fSharedMap(159)
 171 {
 172   //
 173   // Constructor from AliTPCtrack
 174   //
 175   fFirstPoint =0;
 176   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 177   for (Int_t i=0;i<160;i++) {
 178     fClusterPointer[i] = 0;
 179     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
 180     if (index>=-1){
 181       SetClusterIndex2(i,index);
 182     }
 183     else{
 184       SetClusterIndex2(i,-3);
 185     }
 186   }
 187   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 188     fDEDX[i] = 0.;
 189     fSDEDX[i] = 1e10;
 190     fNCDEDX[i] = 0;
 191   }
 192   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 193
 194   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterMap[i]=kFALSE;
 195   //for (Int_t i=0;i<160;i++) fSharedMap[i]=kFALSE;
 196   fClusterMap.ResetAllBits(kFALSE);
 197   fSharedMap.ResetAllBits(kFALSE);
 198
 199 }
 200
 201 AliTPCseed::AliTPCseed(Double_t xr, Double_t alpha, const Double_t xx[5],
 202                        const Double_t cc[15], Int_t index):
 203   AliTPCtrack(xr, alpha, xx, cc, index),
 204   fEsd(0x0),
 205   fClusterOwner(kFALSE),
 206   fRow(0),
 207   fSector(-1),
 208   fRelativeSector(-1),
 209   fCurrentSigmaY2(-1),
 210   fCurrentSigmaZ2(-1),
 211   fCMeanSigmaY2p30(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 212   fCMeanSigmaZ2p30(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 213   fCMeanSigmaY2p30R(-1.),   //! current mean sigma Y2 - mean2%
 214   fCMeanSigmaZ2p30R(-1.),   //! current mean sigma Z2 - mean2%
 215   fErrorY2(1e10),
 216   fErrorZ2(1e10),
 217   fCurrentCluster(0x0),
 218   fCurrentClusterIndex1(-1),
 219   fInDead(kFALSE),
 220   fIsSeeding(kFALSE),
 221   fNoCluster(0),
 222   fSort(0),
 223   fBSigned(kFALSE),
 224   fSeedType(0),
 225   fSeed1(-1),
 226   fSeed2(-1),
 227   fMAngular(0),
 228   fCircular(0),
 229   fClusterMap(159),
 230   fSharedMap(159)
 231 {
 232   //
 233   // Constructor
 234   //
 235   fFirstPoint =0;
 236   for (Int_t i=0;i<160;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 237   for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 238   for (Int_t i=0;i<5;i++)   fTPCr[i]=0.2;
 239   for (Int_t i=0;i<4;i++) {
 240     fDEDX[i] = 0.;
 241     fSDEDX[i] = 1e10;
 242     fNCDEDX[i] = 0;
 243   }
 244   for (Int_t i=0;i<12;i++) fOverlapLabels[i] = -1;
 245 }
 246
 247 AliTPCseed::~AliTPCseed(){
 248   //
 249   // destructor
 250   fNoCluster =0;
 251   if (fClusterOwner){
 252     for (Int_t icluster=0; icluster<160; icluster++){
 253       delete fClusterPointer[icluster];
 254     }
 255   }
 256
 257 }
 258 //_________________________________________________
 259 AliTPCseed & AliTPCseed::operator=(const AliTPCseed &param)
 260 {
 261   //
 262   // assignment operator
 263   //
 264   if(this!=&param){
 265     AliTPCtrack::operator=(param);
 266     fEsd =param.fEsd;
 267     for(Int_t i = 0;i<160;++i)fClusterPointer[i] = param.fClusterPointer[i]; // this is not allocated by AliTPCSeed
 268     fClusterOwner = param.fClusterOwner;
 269     // leave out fPoint, they are also not copied in the copy ctor...
 270     // but deleted in the dtor... strange...
 271     fRow            = param.fRow;
 272     fSector         = param.fSector;
 273     fRelativeSector = param.fRelativeSector;
 274     fCurrentSigmaY2 = param.fCurrentSigmaY2;
 275     fCurrentSigmaZ2 = param.fCurrentSigmaZ2;
 276     fErrorY2        = param.fErrorY2;
 277     fErrorZ2        = param.fErrorZ2;
 278     fCurrentCluster = param.fCurrentCluster; // this is not allocated by AliTPCSeed
 279     fCurrentClusterIndex1 = param.fCurrentClusterIndex1;
 280     fInDead         = param.fInDead;
 281     fIsSeeding      = param.fIsSeeding;
 282     fNoCluster      = param.fNoCluster;
 283     fSort           = param.fSort;
 284     fBSigned        = param.fBSigned;
 285     for(Int_t i = 0;i<4;++i){
 286       fDEDX[i]   = param.fDEDX[i];
 287       fSDEDX[i]  = param.fSDEDX[i];
 288       fNCDEDX[i] = param.fNCDEDX[i];
 289     }
 290     for(Int_t i = 0;i<AliPID::kSPECIES;++i)fTPCr[i] = param.fTPCr[i];
 291
 292     fSeedType = param.fSeedType;
 293     fSeed1    = param.fSeed1;
 294     fSeed2    = param.fSeed2;
 295     for(Int_t i = 0;i<12;++i)fOverlapLabels[i] = param.fOverlapLabels[i];
 296     fMAngular = param.fMAngular;
 297     fCircular = param.fCircular;
 298     for(int i = 0;i<160;++i)fTrackPoints[i] =  param.fTrackPoints[i];
 299     fClusterMap = param.fClusterMap;
 300     fSharedMap = param.fSharedMap;
 301   }
 302   return (*this);
 303 }
 304 //____________________________________________________
 305 AliTPCTrackerPoint * AliTPCseed::GetTrackPoint(Int_t i)
 306 {
 307   //
 308   //
 309   return &fTrackPoints[i];
 310 }
 311
 312
 313
 314 Double_t AliTPCseed::GetDensityFirst(Int_t n)
 315 {
 316   //
 317   //
 318   // return cluster for n rows bellow first point
 319   Int_t nfoundable = 1;
 320   Int_t nfound      = 1;
 321   for (Int_t i=fLastPoint-1;i>0&&nfoundable<n; i--){
 322     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 323     if (index!=-1) nfoundable++;
 324     if (index>0) nfound++;
 325   }
 326   if (nfoundable<n) return 0;
 327   return Double_t(nfound)/Double_t(nfoundable);
 328
 329 }
 330
 331
 332 void AliTPCseed::GetClusterStatistic(Int_t first, Int_t last, Int_t &found, Int_t &foundable, Int_t &shared, Bool_t plus2)
 333 {
 334   // get cluster stat.  on given region
 335   //
 336   found       = 0;
 337   foundable   = 0;
 338   shared      =0;
 339   for (Int_t i=first;i<last; i++){
 340     Int_t index = GetClusterIndex2(i);
 341     if (index!=-1) foundable++;
 342     if (index&0x8000) continue;
 343     if (fClusterPointer[i]) {
 344       found++;
 345     }
 346     else
 347       continue;
 348
 349     if (fClusterPointer[i]->IsUsed(10)) {
 350       shared++;
 351       continue;
 352     }
 353     if (!plus2) continue; //take also neighborhoud
 354     //
 355     if ( (i>0) && fClusterPointer[i-1]){
 356       if (fClusterPointer[i-1]->IsUsed(10)) {
 357         shared++;
 358         continue;
 359       }
 360     }
 361     if ( fClusterPointer[i+1]){
 362       if (fClusterPointer[i+1]->IsUsed(10)) {
 363         shared++;
 364         continue;
 365       }
 366     }
 367
 368   }
 369   //if (shared>found){
 370     //Error("AliTPCseed::GetClusterStatistic","problem\n");
 371   //}
 372 }
 373
 374
 375
 376
 377
 378 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
 379 {
 380   //
 381   //
 382   SetNumberOfClusters(0);
 383   fNFoundable = 0;
 384   SetChi2(0);
 385   ResetCovariance(10.);
 386   /*
 387   if (fTrackPoints){
 388     for (Int_t i=0;i<8;i++){
 389       delete [] fTrackPoints[i];
 390     }
 391     delete fTrackPoints;
 392     fTrackPoints =0;
 393   }
 394   */
 395
 396   if (all){
 397     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
 398     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
 399   }
 400
 401 }
 402
 403
 404 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
 405 {
 406
 407   //------------------------------------------------------------------
 408   //This function makes a track forget its history :)
 409   //------------------------------------------------------------------
 410   if (factor<=0) {
 411     ResetCovariance(10.);
 412     return;
 413   }
 414   ResetCovariance(factor);
 415
 416   SetNumberOfClusters(0);
 417   fNFoundable =0;
 418   SetChi2(0);
 419   fRemoval = 0;
 420   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
 421   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
 422   fNoCluster     = 0;
 423   //fFirstPoint = 160;
 424   //fLastPoint  = 0;
 425 }
 426
 427
 428
 429
 430 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
 431 {
 432   //-----------------------------------------------------------------
 433   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
 434   // doesn't change internal state of the track
 435   //-----------------------------------------------------------------
 436
 437   Double_t x1=GetX(), x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
 438
 439   if (TMath::Abs(GetSnp()+GetC()*dx) >= AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) {
 440     return 0;
 441   }
 442
 443   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
 444   Double_t c1=GetSnp(), r1=sqrt(1.- c1*c1);
 445   Double_t c2=c1 + GetC()*dx, r2=sqrt(1.- c2*c2);
 446
 447   y = GetY();
 448   z = GetZ();
 449   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 450   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
 451
 452   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
 453   Double_t dz = 0;
 454   //
 455   Double_t delta = GetC()*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 456   /*
 457   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
 458     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
 459   }else{
 460     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
 461   }
 462   */
 463   //  dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
 464   dz =  GetTgl()*TMath::ASin(delta)/GetC();
 465   //
 466   y+=dy;
 467   z+=dz;
 468
 469
 470   return 1;
 471 }
 472
 473
 474 //_____________________________________________________________________________
 475 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliCluster *c) const
 476 {
 477   //-----------------------------------------------------------------
 478   // This function calculates a predicted chi2 increment.
 479   //-----------------------------------------------------------------
 480   Double_t p[2]={c->GetY(), c->GetZ()};
 481   Double_t cov[3]={fErrorY2, 0., fErrorZ2};
 482   return AliExternalTrackParam::GetPredictedChi2(p,cov);
 483 }
 484
 485 //_________________________________________________________________________________________
 486
 487
 488 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
 489   //-----------------------------------------------------------------
 490   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
 491   //-----------------------------------------------------------------
 492   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
 493
 494   if (fSort == 0){
 495     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
 496     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
 497     Double_t z2 = t->GetZ();
 498     Double_t z1 = GetZ();
 499     if (z2>z1) return 1;
 500     if (z2<z1) return -1;
 501     return 0;
 502   }
 503   else {
 504     Float_t f2 =1;
 505     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->GetSigma1Pt2())/(t->OneOverPt()+0.0066);
 506     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
 507
 508     Float_t f1 =1;
 509     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(GetSigma1Pt2())/(OneOverPt()+0.0066);
 510
 511     if (fBConstrain)   f1=1.2;
 512
 513     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
 514     else return +1;
 515   }
 516 }
 517
 518
 519
 520
 521 //_____________________________________________________________________________
 522 Bool_t AliTPCseed::Update(const AliCluster *c, Double_t chisq, Int_t index)
 523 {
 524   //-----------------------------------------------------------------
 525   // This function associates a cluster with this track.
 526   //-----------------------------------------------------------------
 527   Int_t n=GetNumberOfClusters();
 528   Int_t idx=GetClusterIndex(n);    // save the current cluster index
 529
 530   AliCluster cl(*c);  cl.SetSigmaY2(fErrorY2); cl.SetSigmaZ2(fErrorZ2);
 531   if (!AliTPCtrack::Update(&cl,chisq,index)) return kFALSE;
 532
 533   if (fCMeanSigmaY2p30<0){
 534     fCMeanSigmaY2p30= c->GetSigmaY2();   //! current mean sigma Y2 - mean30%
 535     fCMeanSigmaZ2p30= c->GetSigmaZ2();   //! current mean sigma Z2 - mean30%
 536     fCMeanSigmaY2p30R = 1;   //! current mean sigma Y2 - mean5%
 537     fCMeanSigmaZ2p30R = 1;   //! current mean sigma Z2 - mean5%
 538   }
 539   //
 540   fCMeanSigmaY2p30= 0.70*fCMeanSigmaY2p30 +0.30*c->GetSigmaY2();
 541   fCMeanSigmaZ2p30= 0.70*fCMeanSigmaZ2p30 +0.30*c->GetSigmaZ2();
 542   if (fCurrentSigmaY2>0){
 543     fCMeanSigmaY2p30R = 0.7*fCMeanSigmaY2p30R  +0.3*c->GetSigmaY2()/fCurrentSigmaY2;
 544     fCMeanSigmaZ2p30R = 0.7*fCMeanSigmaZ2p30R  +0.3*c->GetSigmaZ2()/fCurrentSigmaZ2;
 545   }
 546
 547
 548   SetClusterIndex(n,idx);          // restore the current cluster index
 549   return kTRUE;
 550 }
 551
 552
 553
 554 //_____________________________________________________________________________
 555 Float_t AliTPCseed::CookdEdx(Double_t low, Double_t up,Int_t i1, Int_t i2, Bool_t onlyused) {
 556   //-----------------------------------------------------------------
 557   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 558   //-----------------------------------------------------------------
 559
 560   Float_t amp[200];
 561   Float_t angular[200];
 562   Float_t weight[200];
 563   Int_t index[200];
 564   //Int_t nc = 0;
 565   Float_t meanlog = 100.;
 566
 567   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 568   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 569   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 570   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 571   //
 572   //
 573   fNShared =0;
 574
 575   for (Int_t of =0; of<4; of++){
 576     for (Int_t i=of+i1;i<i2;i+=4)
 577       {
 578         Int_t index = fIndex[i];
 579         if (index<0||index&0x8000) continue;
 580
 581         //AliTPCTrackPoint * point = (AliTPCTrackPoint *) arr.At(i);
 582         AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
 583         //AliTPCTrackerPoint * pointm = GetTrackPoint(i-1);
 584         //AliTPCTrackerPoint * pointp = 0;
 585         //if (i<159) pointp = GetTrackPoint(i+1);
 586
 587         if (point==0) continue;
 588         AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
 589         if (cl==0) continue;
 590         if (onlyused && (!cl->IsUsed(10))) continue;
 591         if (cl->IsUsed(11)) {
 592           fNShared++;
 593           continue;
 594         }
 595         Int_t   type   = cl->GetType();
 596         //if (point->fIsShared){
 597         //  fNShared++;
 598         //  continue;
 599         //}
 600         //if (pointm)
 601         //  if (pointm->fIsShared) continue;
 602         //if (pointp)
 603         //  if (pointp->fIsShared) continue;
 604
 605         if (type<0) continue;
 606         //if (type>10) continue;
 607         //if (point->GetErrY()==0) continue;
 608         //if (point->GetErrZ()==0) continue;
 609
 610         //Float_t ddy = (point->GetY()-cl->GetY())/point->GetErrY();
 611         //Float_t ddz = (point->GetZ()-cl->GetZ())/point->GetErrZ();
 612         //if ((ddy*ddy+ddz*ddz)>10) continue;
 613
 614
 615         //      if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 616         if (cl->GetMax()<5) continue;
 617         Float_t angley = point->GetAngleY();
 618         Float_t anglez = point->GetAngleZ();
 619
 620         Float_t rsigmay2 =  point->GetSigmaY();
 621         Float_t rsigmaz2 =  point->GetSigmaZ();
 622         /*
 623         Float_t ns = 1.;
 624         if (pointm){
 625           rsigmay +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaY();
 626           rsigmaz +=  pointm->GetTPoint().GetSigmaZ();
 627           ns+=1.;
 628         }
 629         if (pointp){
 630           rsigmay +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaY();
 631           rsigmaz +=  pointp->GetTPoint().GetSigmaZ();
 632           ns+=1.;
 633         }
 634         rsigmay/=ns;
 635         rsigmaz/=ns;
 636         */
 637
 638         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay2*rsigmaz2);
 639
 640         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 641         if (i>64){
 642           //      ampc = 1.*point->GetCPoint().GetMax();
 643           ampc = 1.*cl->GetMax();
 644           //ampc = 1.*point->GetCPoint().GetQ();
 645           //      AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 646           //      Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.6)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.6)+0.5);
 647           // Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 648           //Float_t dz =
 649           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 650           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 651           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 652           //      Float_t zfactor = (AliTPCReconstructor::GetCtgRange()-0.0004*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 653           //ampc               *=zfactor;
 654         }
 655         else{
 656           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetMax();
 657           ampc = 1.0*cl->GetMax();
 658           //ampc = 1.0*point->GetCPoint().GetQ();
 659           //AliTPCClusterPoint & p = point->GetCPoint();
 660           // Float_t dy = TMath::Abs(Int_t( TMath::Abs(p.GetY()/0.4)) - TMath::Abs(p.GetY()/0.4)+0.5);
 661           //Float_t iz =  (250.0-TMath::Abs(p.GetZ())+0.11)/0.566;
 662           //Float_t dz =
 663           //  TMath::Abs( Int_t(iz) - iz + 0.5);
 664
 665           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dy);
 666           //ampc *= 1.15*(1-0.3*dz);
 667           //    Float_t zfactor = (1.02-0.000*TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ()));
 668           //ampc               *=zfactor;
 669
 670         }
 671         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 672         //ampc *= 0.58;     // put mean value to channel 50
 673         Float_t w      =  1.;
 674         //      if (type>0)  w =  1./(type/2.-0.5);
 675         //      Float_t z = TMath::Abs(cl->GetZ());
 676         if (i<64) {
 677           ampc /= 0.6;
 678           //ampc /= (1+0.0008*z);
 679         } else
 680           if (i>128){
 681             ampc /=1.5;
 682             //ampc /= (1+0.0008*z);
 683           }else{
 684             //ampc /= (1+0.0008*z);
 685           }
 686
 687         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 688           // w*= 2.;
 689
 690           continue;
 691         }
 692         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 693         amp[nc[of]]        = ampc;
 694         angular[nc[of]]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 695         weight[nc[of]]     = w;
 696         nc[of]++;
 697       }
 698
 699     TMath::Sort(nc[of],amp,index,kFALSE);
 700     Float_t sumamp=0;
 701     Float_t sumamp2=0;
 702     Float_t sumw=0;
 703     //meanlog = amp[index[Int_t(nc[of]*0.33)]];
 704     meanlog = 50;
 705     for (Int_t i=int(nc[of]*low+0.5);i<int(nc[of]*up+0.5);i++){
 706       Float_t ampl      = amp[index[i]]/angular[index[i]];
 707       ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 708       //
 709       sumw    += weight[index[i]];
 710       sumamp  += weight[index[i]]*ampl;
 711       sumamp2 += weight[index[i]]*ampl*ampl;
 712       norm[of]    += angular[index[i]]*weight[index[i]];
 713     }
 714     if (sumw<1){
 715       SetdEdx(0);
 716     }
 717     else {
 718       norm[of] /= sumw;
 719       mean[of]  = sumamp/sumw;
 720       sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 721       if (sigma[of]>0.1)
 722         sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 723       else
 724         sigma[of] = 1000;
 725
 726     mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 727     //mean  *=(1-0.02*(sigma/(mean*0.17)-1.));
 728     //mean *=(1-0.1*(norm-1.));
 729     }
 730   }
 731
 732   Float_t dedx =0;
 733   fSdEdx =0;
 734   fMAngular =0;
 735   //  mean[0]*= (1-0.05*(sigma[0]/(0.01+mean[1]*0.18)-1));
 736   //  mean[1]*= (1-0.05*(sigma[1]/(0.01+mean[0]*0.18)-1));
 737
 738
 739   //  dedx = (mean[0]* TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+ mean[1]* TMath::Sqrt((1.+nc[1])) )/
 740   //  (  TMath::Sqrt((1.+nc[0]))+TMath::Sqrt((1.+nc[1])));
 741
 742   Int_t norm2 = 0;
 743   Int_t norm3 = 0;
 744   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 745     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 746       dedx      += mean[i] *nc[i];
 747       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2);
 748       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 749       norm2     += nc[i];
 750       norm3     += nc[i]-2;
 751     }
 752     fDEDX[i]  = mean[i];
 753     fSDEDX[i] = sigma[i];
 754     fNCDEDX[i]= nc[i];
 755   }
 756
 757   if (norm3>0){
 758     dedx   /=norm2;
 759     fSdEdx /=norm3;
 760     fMAngular/=norm2;
 761   }
 762   else{
 763     SetdEdx(0);
 764     return 0;
 765   }
 766   //  Float_t dedx1 =dedx;
 767   /*
 768   dedx =0;
 769   for (Int_t i =0;i<4;i++){
 770     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 771       mean[i]   = mean[i]*(1-0.12*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 772       dedx      += mean[i] *nc[i];
 773     }
 774     fDEDX[i]  = mean[i];
 775   }
 776   dedx /= norm2;
 777   */
 778
 779
 780   SetdEdx(dedx);
 781   return dedx;
 782 }
 783 Double_t AliTPCseed::Bethe(Double_t bg){
 784   //
 785   // This is the Bethe-Bloch function normalised to 1 at the minimum
 786   //
 787   Double_t bg2=bg*bg;
 788   Double_t bethe;
 789   if (bg<3.5e1)
 790     bethe=(1.+ bg2)/bg2*(log(5940*bg2) - bg2/(1.+ bg2));
 791   else // Density effect ( approximately :)
 792     bethe=1.15*(1.+ bg2)/bg2*(log(3.5*5940*bg) - bg2/(1.+ bg2));
 793   return bethe/11.091;
 794 }
 795
 796 void AliTPCseed::CookPID()
 797 {
 798   //
 799   // cook PID information according dEdx
 800   //
 801   Double_t fRange = 10.;
 802   Double_t fRes   = 0.1;
 803   Double_t fMIP   = 47.;
 804   //
 805   Int_t ns=AliPID::kSPECIES;
 806   Double_t sumr =0;
 807   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 808     Double_t mass=AliPID::ParticleMass(j);
 809     Double_t mom=GetP();
 810     Double_t dedx=fdEdx/fMIP;
 811     Double_t bethe=Bethe(mom/mass);
 812     Double_t sigma=fRes*bethe;
 813     if (sigma>0.001){
 814       if (TMath::Abs(dedx-bethe) > fRange*sigma) {
 815         fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*fRange*fRange)/sigma;
 816         sumr+=fTPCr[j];
 817         continue;
 818       }
 819       fTPCr[j]=TMath::Exp(-0.5*(dedx-bethe)*(dedx-bethe)/(sigma*sigma))/sigma;
 820       sumr+=fTPCr[j];
 821     }
 822     else{
 823       fTPCr[j]=1.;
 824       sumr+=fTPCr[j];
 825     }
 826   }
 827   for (Int_t j=0; j<ns; j++) {
 828     fTPCr[j]/=sumr;           //normalize
 829   }
 830 }
 831
 832 /*
 833 void AliTPCseed::CookdEdx2(Double_t low, Double_t up) {
 834   //-----------------------------------------------------------------
 835   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
 836   //-----------------------------------------------------------------
 837
 838   Float_t amp[200];
 839   Float_t angular[200];
 840   Float_t weight[200];
 841   Int_t index[200];
 842   Bool_t inlimit[200];
 843   for (Int_t i=0;i<200;i++) inlimit[i]=kFALSE;
 844   for (Int_t i=0;i<200;i++) amp[i]=10000;
 845   for (Int_t i=0;i<200;i++) angular[i]= 1;;
 846
 847
 848   //
 849   Float_t meanlog = 100.;
 850   Int_t indexde[4]={0,64,128,160};
 851
 852   Float_t amean     =0;
 853   Float_t asigma    =0;
 854   Float_t anc       =0;
 855   Float_t anorm     =0;
 856
 857   Float_t mean[4]  = {0,0,0,0};
 858   Float_t sigma[4] = {1000,1000,1000,1000};
 859   Int_t nc[4]      = {0,0,0,0};
 860   Float_t norm[4]    = {1000,1000,1000,1000};
 861   //
 862   //
 863   fNShared =0;
 864
 865   //  for (Int_t of =0; of<3; of++){
 866   //  for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 867   for (Int_t i =0; i<160;i++)
 868     {
 869         AliTPCTrackPoint * point = GetTrackPoint(i);
 870         if (point==0) continue;
 871         if (point->fIsShared){
 872           fNShared++;
 873           continue;
 874         }
 875         Int_t   type   = point->GetCPoint().GetType();
 876         if (type<0) continue;
 877         if (point->GetCPoint().GetMax()<5) continue;
 878         Float_t angley = point->GetTPoint().GetAngleY();
 879         Float_t anglez = point->GetTPoint().GetAngleZ();
 880         Float_t rsigmay =  point->GetCPoint().GetSigmaY();
 881         Float_t rsigmaz =  point->GetCPoint().GetSigmaZ();
 882         Float_t rsigma = TMath::Sqrt(rsigmay*rsigmaz);
 883
 884         Float_t ampc   = 0;     // normalization to the number of electrons
 885         if (i>64){
 886           ampc =  point->GetCPoint().GetMax();
 887         }
 888         else{
 889           ampc = point->GetCPoint().GetMax();
 890         }
 891         ampc *= 2.0;     // put mean value to channel 50
 892         //      ampc *= 0.565;     // put mean value to channel 50
 893
 894         Float_t w      =  1.;
 895         Float_t z = TMath::Abs(point->GetCPoint().GetZ());
 896         if (i<64) {
 897           ampc /= 0.63;
 898         } else
 899           if (i>128){
 900             ampc /=1.51;
 901           }
 902         if (type<0) {  //amp at the border - lower weight
 903           continue;
 904         }
 905         if (rsigma>1.5) ampc/=1.3;  // if big backround
 906         angular[i]    = TMath::Sqrt(1.+angley*angley+anglez*anglez);
 907         amp[i]        = ampc/angular[i];
 908         weight[i]     = w;
 909         anc++;
 910     }
 911
 912   TMath::Sort(159,amp,index,kFALSE);
 913   for (Int_t i=int(anc*low+0.5);i<int(anc*up+0.5);i++){
 914     inlimit[index[i]] = kTRUE;  // take all clusters
 915   }
 916
 917   //  meanlog = amp[index[Int_t(anc*0.3)]];
 918   meanlog =10000.;
 919   for (Int_t of =0; of<3; of++){
 920     Float_t sumamp=0;
 921     Float_t sumamp2=0;
 922     Float_t sumw=0;
 923    for (Int_t i=indexde[of];i<indexde[of+1];i++)
 924       {
 925         if (inlimit[i]==kFALSE) continue;
 926         Float_t ampl      = amp[i];
 927         ///angular[i];
 928         ampl              = meanlog*TMath::Log(1.+ampl/meanlog);
 929         //
 930         sumw    += weight[i];
 931         sumamp  += weight[i]*ampl;
 932         sumamp2 += weight[i]*ampl*ampl;
 933         norm[of]    += angular[i]*weight[i];
 934         nc[of]++;
 935       }
 936    if (sumw<1){
 937      SetdEdx(0);
 938    }
 939    else {
 940      norm[of] /= sumw;
 941      mean[of]  = sumamp/sumw;
 942      sigma[of] = sumamp2/sumw-mean[of]*mean[of];
 943      if (sigma[of]>0.1)
 944        sigma[of] = TMath::Sqrt(sigma[of]);
 945      else
 946        sigma[of] = 1000;
 947      mean[of] = (TMath::Exp(mean[of]/meanlog)-1)*meanlog;
 948    }
 949   }
 950
 951   Float_t dedx =0;
 952   fSdEdx =0;
 953   fMAngular =0;
 954   //
 955   Int_t norm2 = 0;
 956   Int_t norm3 = 0;
 957   Float_t www[3] = {12.,14.,17.};
 958   //Float_t www[3] = {1.,1.,1.};
 959
 960   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 961     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000){
 962       dedx      += mean[i] *nc[i]*www[i]/sigma[i];
 963       fSdEdx    += sigma[i]*(nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 964       fMAngular += norm[i] *nc[i];
 965       norm2     += nc[i]*www[i]/sigma[i];
 966       norm3     += (nc[i]-2)*www[i]/sigma[i];
 967     }
 968     fDEDX[i]  = mean[i];
 969     fSDEDX[i] = sigma[i];
 970     fNCDEDX[i]= nc[i];
 971   }
 972
 973   if (norm3>0){
 974     dedx   /=norm2;
 975     fSdEdx /=norm3;
 976     fMAngular/=norm2;
 977   }
 978   else{
 979     SetdEdx(0);
 980     return;
 981   }
 982   //  Float_t dedx1 =dedx;
 983
 984   dedx =0;
 985   Float_t norm4 = 0;
 986   for (Int_t i =0;i<3;i++){
 987     if (nc[i]>2&&nc[i]<1000&&sigma[i]>3){
 988       //mean[i]   = mean[i]*(1+0.08*(sigma[i]/(fSdEdx)-1.));
 989       dedx      += mean[i] *(nc[i])/(sigma[i]);
 990       norm4     += (nc[i])/(sigma[i]);
 991     }
 992     fDEDX[i]  = mean[i];
 993   }
 994   if (norm4>0) dedx /= norm4;
 995
 996
 997
 998   SetdEdx(dedx);
 999
1000   //mi deDX
1001
1002 }
1003 */
1004 Double_t AliTPCseed::GetYat(Double_t xk) const {
1005 //-----------------------------------------------------------------
1006 // This function calculates the Y-coordinate of a track at the plane x=xk.
1007 //-----------------------------------------------------------------
1008   if (TMath::Abs(GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0.; //patch 01 jan 06
1009     Double_t c1=GetSnp(), r1=TMath::Sqrt(1.- c1*c1);
1010     Double_t c2=c1+GetC()*(xk-GetX());
1011     if (TMath::Abs(c2)>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTrack()) return 0;
1012     Double_t r2=TMath::Sqrt(1.- c2*c2);
1013     return GetY() + (xk-GetX())*(c1+c2)/(r1+r2);
1014 }
1015
1016 void AliTPCseed::SetClusterMapBit(int ibit, Bool_t state)
1017 {
1018   fClusterMap[ibit] = state;
1019 }
1020 Bool_t AliTPCseed::GetClusterMapBit(int ibit)
1021 {
1022   return fClusterMap[ibit];
1023 }
1024 void AliTPCseed::SetSharedMapBit(int ibit, Bool_t state)
1025 {
1026   fSharedMap[ibit] = state;
1027 }
1028 Bool_t AliTPCseed::GetSharedMapBit(int ibit)
1029 {
1030   return fSharedMap[ibit];
1031 }
1032
1033
1034
1035
1036
1037 Float_t  AliTPCseed::CookdEdxNorm(Double_t low, Double_t up, Int_t type, Int_t i1, Int_t i2, AliTPCCalPad * gainMap, Bool_t posNorm){
1038
1039   //
1040   // calculates dedx using the cluster
1041   // low    -  up specify trunc mean range  - default form 0-0.7
1042   // type   -  1 - max charge  or 0- total charge in cluster
1043   //           //2- max no corr 3- total+ correction
1044   // i1-i2  -  the pad-row range used for calculation
1045   //
1046   // normalization parametrization taken from AliTPCClusterParam
1047   //
1048   AliTPCClusterParam * parcl = AliTPCClusterParam::Instance();
1049   if (!parcl) parcl = AliTPCcalibDB::Instance()->GetClusterParam();
1050   if (!parcl) return 0;
1051   Float_t amp[160];
1052   Int_t   indexes[160];
1053   Int_t   ncl=0;
1054   //
1055   //
1056   const Float_t ktany = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*10);
1057   const Float_t kedgey =4.;
1058   //
1059   //
1060   for (Int_t irow=i1; irow<i2; irow++){
1061     AliTPCclusterMI* cluster = GetClusterPointer(irow);
1062     if (!cluster) continue;
1063     if (TMath::Abs(cluster->GetY())>cluster->GetX()*ktany-kedgey) continue; // edge cluster
1064     Float_t charge= (type%2)? cluster->GetMax():cluster->GetQ();
1065     if (!gainMap) gainMap =  AliTPCcalibDB::Instance()->GetDedxGainFactor();
1066     if (gainMap) {
1067       Float_t factor = 1;
1068       AliTPCCalROC * roc = gainMap->GetCalROC(cluster->GetDetector());
1069       if (irow < 63) { // IROC
1070         factor = roc->GetValue(irow, TMath::Nint(cluster->GetPad()))*1.55;
1071       } else {         // OROC
1072         factor = roc->GetValue(irow - 63, TMath::Nint(cluster->GetPad()));
1073       }
1074       if (factor>0.5) charge/=factor;
1075     }
1076
1077     //do normalization
1078     Float_t corr=1;
1079     Int_t  ipad= 0;
1080     if (irow>62) ipad=1;
1081     if (irow>127) ipad=2;
1082     if (type<=1){
1083       //
1084       AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(irow);
1085       Float_t              ty = TMath::Abs(point->GetAngleY());
1086       Float_t              tz = TMath::Abs(point->GetAngleZ());
1087
1088       Float_t dr    = (250.-TMath::Abs(cluster->GetZ()))/250.;
1089       corr  = parcl->Qnorm(ipad,type,dr,ty,tz);
1090     }
1091     amp[ncl]=charge/corr;
1092     if (posNorm){
1093       //
1094       //
1095       //
1096       corr = parcl->QnormPos(ipad,type, cluster->GetPad(),cluster->GetTimeBin(), cluster->GetZ(),
1097                              cluster->GetSigmaY2(),cluster->GetSigmaZ2(),cluster->GetMax(),cluster->GetQ());
1098       amp[ncl]/=corr;
1099     }
1100
1101
1102     amp[ncl] *= 2.0;     // put mean value to channel 50
1103     if (ipad==0) {
1104       amp[ncl] /= 0.65; // this we will take form OCDB
1105     } else
1106       if (ipad==2){
1107         amp[ncl] /=1.57;
1108       }else{
1109       }
1110     ncl++;
1111   }
1112
1113   if (type>3) return ncl;
1114   TMath::Sort(ncl,amp, indexes, kFALSE);
1115
1116   if (ncl<10) return 0;
1117
1118   Float_t suma=0;
1119   Float_t sumn=0;
1120   Int_t icl0=TMath::Nint(ncl*low);
1121   Int_t icl1=TMath::Nint(ncl*up);
1122   for (Int_t icl=icl0; icl<icl1;icl++){
1123     suma+=amp[indexes[icl]];
1124     sumn++;
1125   }
1126   return suma/sumn;
1127
1128 }
1129
1130 Double_t AliTPCseed::BetheMass(Double_t mass){
1131   //
1132   // return bethe-bloch
1133   //
1134   Float_t bg= P()/mass;
1135   const Double_t kp1=0.76176e-1;
1136   const Double_t kp2=10.632;
1137   const Double_t kp3=0.13279e-4;
1138   const Double_t kp4=1.8631;
1139   const Double_t kp5=1.9479;
1140
1141   Double_t dbg = (Double_t) bg;
1142
1143   Double_t beta = dbg/TMath::Sqrt(1.+dbg*dbg);
1144
1145   Double_t aa = TMath::Power(beta,kp4);
1146   Double_t bb = TMath::Power(1./dbg,kp5);
1147
1148   bb=TMath::Log(kp3+bb);
1149
1150   return ((Float_t)((kp2-aa-bb)*kp1/aa));
1151 }
1152
1153
1154 Float_t  AliTPCseed::CookShape(Int_t type){
1155   //
1156   //
1157   //
1158  //-----------------------------------------------------------------
1159   // This funtion calculates dE/dX within the "low" and "up" cuts.
1160   //-----------------------------------------------------------------
1161   Float_t means=0;
1162   Float_t meanc=0;
1163   for (Int_t i =0; i<160;i++)    {
1164     AliTPCTrackerPoint * point = GetTrackPoint(i);
1165     if (point==0) continue;
1166
1167     AliTPCclusterMI * cl = fClusterPointer[i];
1168     if (cl==0) continue;
1169
1170     Float_t rsigmay =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaY());
1171     Float_t rsigmaz =  TMath::Sqrt(point->GetSigmaZ());
1172     Float_t rsigma =   (rsigmay+rsigmaz)*0.5;
1173     if (type==0) means+=rsigma;
1174     if (type==1) means+=rsigmay;
1175     if (type==2) means+=rsigmaz;
1176     meanc++;
1177   }
1178   Float_t mean = (meanc>0)? means/meanc:0;
1179   return mean;
1180 }