TPC/AliTPCtrackerMI.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16
  17 //-------------------------------------------------------
  18 //          Implementation of the TPC tracker
  19 //
  20 //   Origin: Marian Ivanov   Marian.Ivanov@cern.ch
  21 //
  22 //  AliTPC parallel tracker -
  23 //  How to use?  -
  24 //  run AliTPCFindClusters.C macro - clusters neccessary for tracker are founded
  25 //  run AliTPCFindTracksMI.C macro - to find tracks
  26 //  tracks are written to AliTPCtracks.root file
  27 //  for comparison also seeds are written to the same file - to special branch
  28 //-------------------------------------------------------
  29
  30
  31 /* $Id$ */
  32
  33 #include "Riostream.h"
  34 #include <TClonesArray.h>
  35 #include <TFile.h>
  36 #include <TObjArray.h>
  37 #include <TTree.h>
  38
  39 #include "AliComplexCluster.h"
  40 #include "AliESD.h"
  41 #include "AliESDkink.h"
  42 #include "AliHelix.h"
  43 #include "AliRunLoader.h"
  44 #include "AliTPCClustersRow.h"
  45 #include "AliTPCParam.h"
  46 #include "AliTPCReconstructor.h"
  47 #include "AliTPCclusterMI.h"
  48 #include "AliTPCpolyTrack.h"
  49 #include "AliTPCreco.h"
  50 #include "AliTPCseed.h"
  51 #include "AliTPCtrackerMI.h"
  52 #include "TStopwatch.h"
  53 #include "AliTPCReconstructor.h"
  54 #include "AliESDkink.h"
  55 #include "AliPID.h"
  56 #include "TTreeStream.h"
  57 #include "AliAlignObj.h"
  58 #include "AliTrackPointArray.h"
  59
  60 //
  61
  62 ClassImp(AliTPCtrackerMI)
  63
  64
  65 class AliTPCFastMath {
  66 public:
  67   AliTPCFastMath();
  68   static Double_t FastAsin(Double_t x);
  69  private:
  70   static Double_t fgFastAsin[20000];  //lookup table for fast asin computation
  71 };
  72
  73 Double_t AliTPCFastMath::fgFastAsin[20000];
  74 AliTPCFastMath gAliTPCFastMath; // needed to fill the LUT
  75
  76 AliTPCFastMath::AliTPCFastMath(){
  77   //
  78   // initialized lookup table;
  79   for (Int_t i=0;i<10000;i++){
  80     fgFastAsin[2*i] = TMath::ASin(i/10000.);
  81     fgFastAsin[2*i+1] = (TMath::ASin((i+1)/10000.)-fgFastAsin[2*i]);
  82   }
  83 }
  84
  85 Double_t AliTPCFastMath::FastAsin(Double_t x){
  86   //
  87   // return asin using lookup table
  88   if (x>0){
  89     Int_t index = int(x*10000);
  90     return fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1];
  91   }
  92   x*=-1;
  93   Int_t index = int(x*10000);
  94   return -(fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1]);
  95 }
  96
  97
  98
  99
 100 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateTrack(AliTPCseed * track, Int_t accept){
 101   //
 102   //update track information using current cluster - track->fCurrentCluster
 103
 104
 105   AliTPCclusterMI* c =track->fCurrentCluster;
 106   if (accept>0) track->fCurrentClusterIndex1 |=0x8000;  //sign not accepted clusters
 107
 108   UInt_t i = track->fCurrentClusterIndex1;
 109
 110   Int_t sec=(i&0xff000000)>>24;
 111   //Int_t row = (i&0x00ff0000)>>16;
 112   track->fRow=(i&0x00ff0000)>>16;
 113   track->fSector = sec;
 114   //  Int_t index = i&0xFFFF;
 115   if (sec>=fParam->GetNInnerSector()) track->fRow += fParam->GetNRowLow();
 116   track->SetClusterIndex2(track->fRow, i);
 117   //track->fFirstPoint = row;
 118   //if ( track->fLastPoint<row) track->fLastPoint =row;
 119   //  if (track->fRow<0 || track->fRow>160) {
 120   //  printf("problem\n");
 121   //}
 122   if (track->fFirstPoint>track->fRow)
 123     track->fFirstPoint = track->fRow;
 124   if (track->fLastPoint<track->fRow)
 125     track->fLastPoint  = track->fRow;
 126
 127
 128   track->fClusterPointer[track->fRow] = c;
 129   //
 130
 131   Float_t angle2 = track->GetSnp()*track->GetSnp();
 132   angle2 = TMath::Sqrt(angle2/(1-angle2));
 133   //
 134   //SET NEW Track Point
 135   //
 136   //  if (debug)
 137   {
 138     AliTPCTrackerPoint   &point =*(track->GetTrackPoint(track->fRow));
 139     //
 140     point.SetSigmaY(c->GetSigmaY2()/track->fCurrentSigmaY2);
 141     point.SetSigmaZ(c->GetSigmaZ2()/track->fCurrentSigmaZ2);
 142     point.SetErrY(sqrt(track->fErrorY2));
 143     point.SetErrZ(sqrt(track->fErrorZ2));
 144     //
 145     point.SetX(track->GetX());
 146     point.SetY(track->GetY());
 147     point.SetZ(track->GetZ());
 148     point.SetAngleY(angle2);
 149     point.SetAngleZ(track->GetTgl());
 150     if (point.fIsShared){
 151       track->fErrorY2 *= 4;
 152       track->fErrorZ2 *= 4;
 153     }
 154   }
 155
 156   Double_t chi2 = track->GetPredictedChi2(track->fCurrentCluster);
 157   //
 158   track->fErrorY2 *= 1.3;
 159   track->fErrorY2 += 0.01;
 160   track->fErrorZ2 *= 1.3;
 161   track->fErrorZ2 += 0.005;
 162     //}
 163   if (accept>0) return 0;
 164   if (track->GetNumberOfClusters()%20==0){
 165     //    if (track->fHelixIn){
 166     //  TClonesArray & larr = *(track->fHelixIn);
 167     //  Int_t ihelix = larr.GetEntriesFast();
 168     //  new(larr[ihelix]) AliHelix(*track) ;
 169     //}
 170   }
 171   track->fNoCluster =0;
 172   return track->Update(c,chi2,i);
 173 }
 174
 175
 176
 177 Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluster, Float_t factor,
 178                                       Float_t cory, Float_t corz)
 179 {
 180   //
 181   // decide according desired precision to accept given
 182   // cluster for tracking
 183   Double_t sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
 184   Double_t sz2=ErrZ2(seed,cluster)*corz;
 185   //sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
 186   //sz2=ErrZ2(seed,cluster)*cory;
 187
 188   Double_t sdistancey2 = sy2+seed->GetSigmaY2();
 189   Double_t sdistancez2 = sz2+seed->GetSigmaZ2();
 190
 191   Double_t rdistancey2 = (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())*
 192     (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())/sdistancey2;
 193   Double_t rdistancez2 = (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())*
 194     (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())/sdistancez2;
 195
 196   Double_t rdistance2  = rdistancey2+rdistancez2;
 197   //Int_t  accept =0;
 198
 199   if (rdistance2>16) return 3;
 200
 201
 202   if ((rdistancey2>9.*factor || rdistancez2>9.*factor) && cluster->GetType()==0)
 203     return 2;  //suspisiouce - will be changed
 204
 205   if ((rdistancey2>6.25*factor || rdistancez2>6.25*factor) && cluster->GetType()>0)
 206     // strict cut on overlaped cluster
 207     return  2;  //suspisiouce - will be changed
 208
 209   if ( (rdistancey2>1.*factor || rdistancez2>6.25*factor )
 210        && cluster->GetType()<0){
 211     seed->fNFoundable--;
 212     return 2;
 213   }
 214   return 0;
 215 }
 216
 217
 218
 219
 220 //_____________________________________________________________________________
 221 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCParam *par):
 222 AliTracker(), fkNIS(par->GetNInnerSector()/2), fkNOS(par->GetNOuterSector()/2)
 223 {
 224   //---------------------------------------------------------------------
 225   // The main TPC tracker constructor
 226   //---------------------------------------------------------------------
 227   fInnerSec=new AliTPCSector[fkNIS];
 228   fOuterSec=new AliTPCSector[fkNOS];
 229
 230   Int_t i;
 231   for (i=0; i<fkNIS; i++) fInnerSec[i].Setup(par,0);
 232   for (i=0; i<fkNOS; i++) fOuterSec[i].Setup(par,1);
 233
 234   fN=0;  fSectors=0;
 235
 236   fSeeds=0;
 237   fNtracks = 0;
 238   fParam = par;
 239   Int_t nrowlow = par->GetNRowLow();
 240   Int_t nrowup = par->GetNRowUp();
 241
 242
 243   for (Int_t i=0;i<nrowlow;i++){
 244     fXRow[i]     = par->GetPadRowRadiiLow(i);
 245     fPadLength[i]= par->GetPadPitchLength(0,i);
 246     fYMax[i]     = fXRow[i]*TMath::Tan(0.5*par->GetInnerAngle());
 247   }
 248
 249
 250   for (Int_t i=0;i<nrowup;i++){
 251     fXRow[i+nrowlow]      = par->GetPadRowRadiiUp(i);
 252     fPadLength[i+nrowlow] = par->GetPadPitchLength(60,i);
 253     fYMax[i+nrowlow]      = fXRow[i+nrowlow]*TMath::Tan(0.5*par->GetOuterAngle());
 254   }
 255   fSeeds=0;
 256   //
 257   fInput    = 0;
 258   fOutput   = 0;
 259   fSeedTree = 0;
 260   fTreeDebug =0;
 261   fNewIO     =0;
 262   fDebug     =0;
 263   fEvent     =0;
 264   fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("TPCdebug.root");
 265 }
 266 //________________________________________________________________________
 267 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCtrackerMI &t):
 268   AliTracker(t),
 269   fkNIS(t.fkNIS),
 270   fkNOS(t.fkNOS)
 271 {
 272   //------------------------------------
 273   // dummy copy constructor
 274   //------------------------------------------------------------------
 275 }
 276 AliTPCtrackerMI & AliTPCtrackerMI::operator=(const AliTPCtrackerMI& /*r*/){
 277   //------------------------------
 278   // dummy
 279   //--------------------------------------------------------------
 280   return *this;
 281 }
 282 //_____________________________________________________________________________
 283 AliTPCtrackerMI::~AliTPCtrackerMI() {
 284   //------------------------------------------------------------------
 285   // TPC tracker destructor
 286   //------------------------------------------------------------------
 287   delete[] fInnerSec;
 288   delete[] fOuterSec;
 289   if (fSeeds) {
 290     fSeeds->Delete();
 291     delete fSeeds;
 292   }
 293   if (fDebugStreamer) delete fDebugStreamer;
 294 }
 295
 296 void AliTPCtrackerMI::SetIO()
 297 {
 298   //
 299   fNewIO   =  kTRUE;
 300   fInput   =  AliRunLoader::GetTreeR("TPC", kFALSE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 301
 302   fOutput  =  AliRunLoader::GetTreeT("TPC", kTRUE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
 303   if (fOutput){
 304     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 305     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 306     delete iotrack;
 307   }
 308 }
 309
 310
 311 void AliTPCtrackerMI::SetIO(TTree * input, TTree * output, AliESD * event)
 312 {
 313
 314   // set input
 315   fNewIO = kFALSE;
 316   fInput    = 0;
 317   fOutput   = 0;
 318   fSeedTree = 0;
 319   fTreeDebug =0;
 320   fInput = input;
 321   if (input==0){
 322     return;
 323   }
 324   //set output
 325   fOutput = output;
 326   if (output){
 327     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 328     //    iotrack->fHelixIn   = new TClonesArray("AliHelix");
 329     //iotrack->fHelixOut  = new TClonesArray("AliHelix");
 330     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 331     delete iotrack;
 332   }
 333   if (output && (fDebug&2)){
 334     //write the full seed information if specified in debug mode
 335     //
 336     fSeedTree =  new TTree("Seeds","Seeds");
 337     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
 338     //
 339     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
 340     arrtr->ExpandCreateFast(160);
 341     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
 342     //
 343     vseed->fPoints = arrtr;
 344     vseed->fEPoints = arre;
 345     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
 346     fSeedTree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
 347     delete arrtr;
 348     delete arre;
 349     fTreeDebug = new TTree("trackDebug","trackDebug");
 350     TClonesArray * arrd = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint2",0);
 351     fTreeDebug->Branch("debug",&arrd,32000,99);
 352   }
 353
 354
 355   //set ESD event
 356   fEvent  = event;
 357 }
 358
 359 void AliTPCtrackerMI::FillESD(TObjArray* arr)
 360 {
 361   //
 362   //
 363   //fill esds using updated tracks
 364   if (fEvent){
 365     // write tracks to the event
 366     // store index of the track
 367     Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
 368     //FindKinks(arr,fEvent);
 369     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 370       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
 371       if (!pt) continue;
 372       pt->UpdatePoints();
 373       //      pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
 374       if (pt->GetKinkIndex(0)<=0){  //don't propagate daughter tracks
 375         pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
 376       }
 377
 378       if (( pt->GetPoints()[2]- pt->GetPoints()[0])>5 && pt->GetPoints()[3]>0.8){
 379         AliESDtrack iotrack;
 380         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 381         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 382         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 383         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 384         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 385         //iotrack.SetTPCindex(i);
 386         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 387         continue;
 388       }
 389
 390       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>70)&& (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.55) {
 391         AliESDtrack iotrack;
 392         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 393         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 394         //iotrack.SetTPCindex(i);
 395         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 396         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 397         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 398         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 399         continue;
 400       }
 401       //
 402       // short tracks  - maybe decays
 403
 404       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>30) && (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.70) {
 405         Int_t found,foundable,shared;
 406         pt->GetClusterStatistic(0,60,found, foundable,shared,kFALSE);
 407         if ( (found>20) && (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())<0.2)){
 408           AliESDtrack iotrack;
 409           iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 410           //iotrack.SetTPCindex(i);
 411           iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 412           iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 413           iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 414           //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 415           fEvent->AddTrack(&iotrack);
 416           continue;
 417         }
 418       }
 419
 420       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>20) && (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.8) {
 421         Int_t found,foundable,shared;
 422         pt->GetClusterStatistic(0,60,found, foundable,shared,kFALSE);
 423         if (found<20) continue;
 424         if (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())>0.2) continue;
 425         //
 426         AliESDtrack iotrack;
 427         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 428         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 429         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 430         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 431         //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 432         //iotrack.SetTPCindex(i);
 433         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 434         continue;
 435       }
 436       // short tracks  - secondaties
 437       //
 438       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>30) ) {
 439         Int_t found,foundable,shared;
 440         pt->GetClusterStatistic(128,158,found, foundable,shared,kFALSE);
 441         if ( (found>20) && (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())<0.2) &&float(found)/float(foundable)>0.8){
 442           AliESDtrack iotrack;
 443           iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 444           iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 445           iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 446           iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 447           //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 448           //iotrack.SetTPCindex(i);
 449           fEvent->AddTrack(&iotrack);
 450           continue;
 451         }
 452       }
 453
 454       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>15)) {
 455         Int_t found,foundable,shared;
 456         pt->GetClusterStatistic(138,158,found, foundable,shared,kFALSE);
 457         if (found<15) continue;
 458         if (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())>0.2) continue;
 459         if (float(found)/float(foundable)<0.8) continue;
 460         //
 461         AliESDtrack iotrack;
 462         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
 463         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
 464         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
 465         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
 466         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
 467         //iotrack.SetTPCindex(i);
 468         fEvent->AddTrack(&iotrack);
 469         continue;
 470       }
 471     }
 472   }
 473   printf("Number of filled ESDs-\t%d\n",fEvent->GetNumberOfTracks());
 474 }
 475
 476 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks(TTree * tree)
 477 {
 478   //
 479   // write tracks from seed array to selected tree
 480   //
 481   fOutput  = tree;
 482   if (fOutput){
 483     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
 484     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 485   }
 486   WriteTracks();
 487 }
 488
 489 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks()
 490 {
 491   //
 492   // write tracks to the given output tree -
 493   // output specified with SetIO routine
 494   if (!fSeeds)  return;
 495   if (!fOutput){
 496     SetIO();
 497   }
 498
 499   if (fOutput){
 500     AliTPCtrack *iotrack= 0;
 501     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
 502     //for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 503     //  iotrack= (AliTPCtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 504     //  if (iotrack) break;
 505     //}
 506     //TBranch * br = fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
 507     TBranch * br = fOutput->GetBranch("tracks");
 508     br->SetAddress(&iotrack);
 509     //
 510     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 511       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 512       if (!pt) continue;
 513       AliTPCtrack * track = new AliTPCtrack(*pt);
 514       iotrack = track;
 515       pt->fLab2 =i;
 516       //      br->SetAddress(&iotrack);
 517       fOutput->Fill();
 518       delete track;
 519       iotrack =0;
 520     }
 521     //fOutput->GetDirectory()->cd();
 522     //fOutput->Write();
 523   }
 524   // delete iotrack;
 525   //
 526   if (fSeedTree){
 527     //write the full seed information if specified in debug mode
 528
 529     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
 530     //
 531     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
 532     arrtr->ExpandCreateFast(160);
 533     //TClonesArray * arrcl = new TClonesArray("AliTPCclusterMI",160);
 534     //arrcl->ExpandCreateFast(160);
 535     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
 536     //
 537     vseed->fPoints = arrtr;
 538     vseed->fEPoints = arre;
 539     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
 540     //TBranch * brseed = seedtree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
 541     TBranch * brseed = fSeedTree->GetBranch("seeds");
 542
 543     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
 544
 545     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 546       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);
 547       if (!pt) continue;
 548       pt->fPoints = arrtr;
 549       //      pt->fClusterPoints = arrcl;
 550       pt->fEPoints       = arre;
 551       pt->RebuildSeed();
 552       vseed = pt;
 553       brseed->SetAddress(&vseed);
 554       fSeedTree->Fill();
 555       pt->fPoints  = 0;
 556       pt->fEPoints = 0;
 557       //      pt->fClusterPoints = 0;
 558     }
 559     fSeedTree->Write();
 560     if (fTreeDebug) fTreeDebug->Write();
 561   }
 562
 563 }
 564
 565
 566
 567
 568 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrY2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 569   //
 570   //
 571   //seed->SetErrorY2(0.1);
 572   //return 0.1;
 573   //calculate look-up table at the beginning
 574   static Bool_t  ginit = kFALSE;
 575   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
 576   static Float_t ggg1[10000];
 577   static Float_t ggg2[10000];
 578   static Float_t ggg3[10000];
 579   static Float_t glandau1[10000];
 580   static Float_t glandau2[10000];
 581   static Float_t glandau3[10000];
 582   //
 583   static Float_t gcor01[500];
 584   static Float_t gcor02[500];
 585   static Float_t gcorp[500];
 586   //
 587
 588   //
 589   if (ginit==kFALSE){
 590     for (Int_t i=1;i<500;i++){
 591       Float_t rsigma = float(i)/100.;
 592       gcor02[i] = TMath::Max(0.78 +TMath::Exp(7.4*(rsigma-1.2)),0.6);
 593       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(3.36*(rsigma-1.2)),0.6);
 594       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
 595     }
 596
 597     //
 598     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
 599       //
 600       //
 601       // inner sector
 602       Float_t amp = float(i);
 603       Float_t padlength =0.75;
 604       gnoise1 = 0.0004/padlength;
 605       Float_t nel     = 0.268*amp;
 606       Float_t nprim   = 0.155*amp;
 607       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 608       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 609       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
 610       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;
 611       //
 612       // outer short
 613       padlength =1.;
 614       gnoise2   = 0.0004/padlength;
 615       nel       = 0.3*amp;
 616       nprim     = 0.133*amp;
 617       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 618       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 619       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
 620       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
 621       //
 622       //
 623       // outer long
 624       padlength =1.5;
 625       gnoise3   = 0.0004/padlength;
 626       nel       = 0.3*amp;
 627       nprim     = 0.133*amp;
 628       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 629       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 630       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
 631       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
 632       //
 633     }
 634     ginit = kTRUE;
 635   }
 636   //
 637   //
 638   //
 639   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));
 640   if (amp>9999) {
 641     seed->SetErrorY2(1.);
 642     return 1.;
 643   }
 644   Float_t snoise2;
 645   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 646   Int_t ctype = cl->GetType();
 647   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
 648   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 649   angle2 = angle2/(1-angle2);
 650   //
 651   //cluster "quality"
 652   Int_t rsigmay = int(100.*cl->GetSigmaY2()/(seed->fCurrentSigmaY2));
 653   Float_t res;
 654   //
 655   if (fSectors==fInnerSec){
 656     snoise2 = gnoise1;
 657     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;
 658     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmay];
 659     if ((ctype>0)){
 660       res+=0.002;
 661       res*= gcorp[rsigmay];
 662     }
 663   }
 664   else {
 665     if (padlength<1.1){
 666       snoise2 = gnoise2;
 667       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2;
 668       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
 669       if ((ctype>0)){
 670         res+=0.002;
 671         res*= gcorp[rsigmay];
 672       }
 673     }
 674     else{
 675       snoise2 = gnoise3;
 676       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2;
 677       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
 678       if ((ctype>0)){
 679         res+=0.002;
 680         res*= gcorp[rsigmay];
 681       }
 682     }
 683   }
 684
 685   if (ctype<0){
 686     res+=0.005;
 687     res*=2.4;  // overestimate error 2 times
 688   }
 689   res+= snoise2;
 690
 691   if (res<2*snoise2)
 692     res = 2*snoise2;
 693
 694   seed->SetErrorY2(res);
 695   return res;
 696
 697
 698 }
 699
 700
 701
 702 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 703   //
 704   //
 705   //seed->SetErrorY2(0.1);
 706   //return 0.1;
 707   //calculate look-up table at the beginning
 708   static Bool_t  ginit = kFALSE;
 709   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
 710   static Float_t ggg1[10000];
 711   static Float_t ggg2[10000];
 712   static Float_t ggg3[10000];
 713   static Float_t glandau1[10000];
 714   static Float_t glandau2[10000];
 715   static Float_t glandau3[10000];
 716   //
 717   static Float_t gcor01[1000];
 718   static Float_t gcor02[1000];
 719   static Float_t gcorp[1000];
 720   //
 721
 722   //
 723   if (ginit==kFALSE){
 724     for (Int_t i=1;i<1000;i++){
 725       Float_t rsigma = float(i)/100.;
 726       gcor02[i] = TMath::Max(0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigma-1.2)),0.6);
 727       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigma-1.2)),0.6);
 728       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
 729     }
 730
 731     //
 732     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
 733       //
 734       //
 735       // inner sector
 736       Float_t amp = float(i);
 737       Float_t padlength =0.75;
 738       gnoise1 = 0.0004/padlength;
 739       Float_t nel     = 0.268*amp;
 740       Float_t nprim   = 0.155*amp;
 741       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 742       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 743       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
 744       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;
 745       //
 746       // outer short
 747       padlength =1.;
 748       gnoise2   = 0.0004/padlength;
 749       nel       = 0.3*amp;
 750       nprim     = 0.133*amp;
 751       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 752       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 753       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
 754       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
 755       //
 756       //
 757       // outer long
 758       padlength =1.5;
 759       gnoise3   = 0.0004/padlength;
 760       nel       = 0.3*amp;
 761       nprim     = 0.133*amp;
 762       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 763       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 764       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
 765       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
 766       //
 767     }
 768     ginit = kTRUE;
 769   }
 770   //
 771   //
 772   //
 773   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));
 774   if (amp>9999) {
 775     seed->SetErrorY2(1.);
 776     return 1.;
 777   }
 778   Float_t snoise2;
 779   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 780   Int_t ctype = cl->GetType();
 781   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
 782   //
 783   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 784   //  if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
 785   angle2 = seed->GetTgl()*seed->GetTgl()*(1+angle2/(1-angle2));
 786   //
 787   //cluster "quality"
 788   Int_t rsigmaz = int(100.*cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2));
 789   Float_t res;
 790   //
 791   if (fSectors==fInnerSec){
 792     snoise2 = gnoise1;
 793     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;
 794     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmaz];
 795     if ((ctype>0)){
 796       res+=0.002;
 797       res*= gcorp[rsigmaz];
 798     }
 799   }
 800   else {
 801     if (padlength<1.1){
 802       snoise2 = gnoise2;
 803       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2;
 804       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
 805       if ((ctype>0)){
 806         res+=0.002;
 807         res*= gcorp[rsigmaz];
 808       }
 809     }
 810     else{
 811       snoise2 = gnoise3;
 812       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2;
 813       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
 814       if ((ctype>0)){
 815         res+=0.002;
 816         res*= gcorp[rsigmaz];
 817       }
 818     }
 819   }
 820
 821   if (ctype<0){
 822     res+=0.002;
 823     res*=1.3;
 824   }
 825   if ((ctype<0) &&amp<70){
 826     res+=0.002;
 827     res*=1.3;
 828   }
 829   res += snoise2;
 830   if (res<2*snoise2)
 831      res = 2*snoise2;
 832   if (res>3) res =3;
 833   seed->SetErrorZ2(res);
 834   return res;
 835 }
 836
 837
 838
 839 /*
 840 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
 841   //
 842   //
 843   //seed->SetErrorZ2(0.1);
 844   //return 0.1;
 845
 846   Float_t snoise2;
 847   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
 848   //
 849   Float_t rsigmaz = cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2);
 850   Int_t ctype = cl->GetType();
 851   Float_t amp = TMath::Abs(cl->GetQ());
 852
 853   Float_t nel;
 854   Float_t nprim;
 855   //
 856   Float_t landau=2 ;    //landau fluctuation part
 857   Float_t gg=2;         // gg fluctuation part
 858   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetX());
 859
 860   if (fSectors==fInnerSec){
 861     snoise2 = 0.0004/padlength;
 862     nel     = 0.268*amp;
 863     nprim   = 0.155*amp;
 864     gg      = (2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
 865     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 866     if (landau>1) landau=1;
 867   }
 868   else {
 869     snoise2 = 0.0004/padlength;
 870     nel     = 0.3*amp;
 871     nprim   = 0.133*amp;
 872     gg      = (2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
 873     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
 874     if (landau>1) landau=1;
 875   }
 876   Float_t sdiff = gg*fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*z;
 877
 878   //
 879   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
 880   angle2 = TMath::Sqrt((1-angle2));
 881   if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
 882   //angle2 = 1;
 883
 884   Float_t angle = seed->GetTgl()/angle2;
 885   Float_t angular = landau*angle*angle*padlength*padlength/12.;
 886   Float_t res = sdiff + angular;
 887
 888
 889   if ((ctype==0) && (fSectors ==fOuterSec))
 890     res *= 0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigmaz-1.2));
 891
 892   if ((ctype==0) && (fSectors ==fInnerSec))
 893     res *= 0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigmaz-1.2));
 894
 895   if ((ctype>0)){
 896     res+=0.005;
 897     res*= TMath::Power(rsigmaz+0.5,1.5);  //0.31+0.147*ctype;
 898   }
 899   if (ctype<0){
 900     res+=0.002;
 901     res*=1.3;
 902   }
 903   if ((ctype<0) &&amp<70){
 904     res+=0.002;
 905     res*=1.3;
 906   }
 907   res += snoise2;
 908   if (res<2*snoise2)
 909      res = 2*snoise2;
 910
 911   seed->SetErrorZ2(res);
 912   return res;
 913 }
 914 */
 915
 916
 917
 918
 919 void AliTPCtrackerMI::RotateToLocal(AliTPCseed *seed)
 920 {
 921   //rotate to track "local coordinata
 922   Float_t x = seed->GetX();
 923   Float_t y = seed->GetY();
 924   Float_t ymax = x*TMath::Tan(0.5*fSectors->GetAlpha());
 925
 926   if (y > ymax) {
 927     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector+1) % fN;
 928     if (!seed->Rotate(fSectors->GetAlpha()))
 929       return;
 930   } else if (y <-ymax) {
 931     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector-1+fN) % fN;
 932     if (!seed->Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
 933       return;
 934   }
 935
 936 }
 937
 938
 939
 940 //_____________________________________________________________________________
 941 Double_t AliTPCtrackerMI::F1old(Double_t x1,Double_t y1,
 942                    Double_t x2,Double_t y2,
 943                    Double_t x3,Double_t y3)
 944 {
 945   //-----------------------------------------------------------------
 946   // Initial approximation of the track curvature
 947   //-----------------------------------------------------------------
 948   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
 949   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
 950                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
 951   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
 952                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
 953
 954   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
 955   if ( xr*xr+yr*yr<=0.00000000000001) return 100;
 956   return -xr*yr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
 957 }
 958
 959
 960
 961 //_____________________________________________________________________________
 962 Double_t AliTPCtrackerMI::F1(Double_t x1,Double_t y1,
 963                    Double_t x2,Double_t y2,
 964                    Double_t x3,Double_t y3)
 965 {
 966   //-----------------------------------------------------------------
 967   // Initial approximation of the track curvature
 968   //-----------------------------------------------------------------
 969   x3 -=x1;
 970   x2 -=x1;
 971   y3 -=y1;
 972   y2 -=y1;
 973   //
 974   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
 975   if (det==0) {
 976     return 100;
 977   }
 978   //
 979   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
 980   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u;
 981   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
 982   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
 983   if (det<0) c2*=-1;
 984   return c2;
 985 }
 986
 987
 988 Double_t AliTPCtrackerMI::F2(Double_t x1,Double_t y1,
 989                    Double_t x2,Double_t y2,
 990                    Double_t x3,Double_t y3)
 991 {
 992   //-----------------------------------------------------------------
 993   // Initial approximation of the track curvature
 994   //-----------------------------------------------------------------
 995   x3 -=x1;
 996   x2 -=x1;
 997   y3 -=y1;
 998   y2 -=y1;
 999   //
1000   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
1001   if (det==0) {
1002     return 100;
1003   }
1004   //
1005   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
1006   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u;
1007   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
1008   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
1009   if (det<0) c2*=-1;
1010   x0+=x1;
1011   x0*=c2;
1012   return x0;
1013 }
1014
1015
1016
1017 //_____________________________________________________________________________
1018 Double_t AliTPCtrackerMI::F2old(Double_t x1,Double_t y1,
1019                    Double_t x2,Double_t y2,
1020                    Double_t x3,Double_t y3)
1021 {
1022   //-----------------------------------------------------------------
1023   // Initial approximation of the track curvature times center of curvature
1024   //-----------------------------------------------------------------
1025   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
1026   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
1027                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
1028   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
1029                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
1030
1031   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
1032
1033   return -a/(d*y1-b)*xr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
1034 }
1035
1036 //_____________________________________________________________________________
1037 Double_t AliTPCtrackerMI::F3(Double_t x1,Double_t y1,
1038                    Double_t x2,Double_t y2,
1039                    Double_t z1,Double_t z2)
1040 {
1041   //-----------------------------------------------------------------
1042   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1043   //-----------------------------------------------------------------
1044   return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1045 }
1046
1047
1048 Double_t AliTPCtrackerMI::F3n(Double_t x1,Double_t y1,
1049                    Double_t x2,Double_t y2,
1050                    Double_t z1,Double_t z2, Double_t c)
1051 {
1052   //-----------------------------------------------------------------
1053   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1054   //-----------------------------------------------------------------
1055
1056   //  Double_t angle1;
1057
1058   //angle1    =  (z1-z2)*c/(TMath::ASin(c*x1-ni)-TMath::ASin(c*x2-ni));
1059   //
1060   Double_t d  =  TMath::Sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1061   if (TMath::Abs(d*c*0.5)>1) return 0;
1062   //  Double_t   angle2    =  TMath::ASin(d*c*0.5);
1063   //  Double_t   angle2    =  AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1064   Double_t   angle2    = (d*c*0.5>0.1)? TMath::ASin(d*c*0.5): AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1065
1066   angle2  = (z1-z2)*c/(angle2*2.);
1067   return angle2;
1068 }
1069
1070 Bool_t   AliTPCtrackerMI::GetProlongation(Double_t x1, Double_t x2, Double_t x[5], Double_t &y, Double_t &z)
1071 {//-----------------------------------------------------------------
1072   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=x2.
1073   //-----------------------------------------------------------------
1074
1075   Double_t dx=x2-x1;
1076
1077   if (TMath::Abs(x[4]*x1 - x[2]) >= 0.999) {
1078     return kFALSE;
1079   }
1080
1081   Double_t c1=x[4]*x1 - x[2], r1=sqrt(1.- c1*c1);
1082   Double_t c2=x[4]*x2 - x[2], r2=sqrt(1.- c2*c2);
1083   y = x[0];
1084   z = x[1];
1085
1086   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
1087   Double_t dz = 0;
1088   //
1089   Double_t delta = x[4]*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
1090
1091   if (TMath::Abs(delta)>0.01){
1092     dz = x[3]*TMath::ASin(delta)/x[4];
1093   }else{
1094     dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1095   }
1096
1097   //dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1098
1099   y+=dy;
1100   z+=dz;
1101
1102   return kTRUE;
1103 }
1104
1105 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters (TTree *tree)
1106 {
1107   //
1108   //
1109   fInput = tree;
1110   return LoadClusters();
1111 }
1112
1113 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters()
1114 {
1115   //
1116   // load clusters to the memory
1117   AliTPCClustersRow *clrow= new AliTPCClustersRow;
1118   clrow->SetClass("AliTPCclusterMI");
1119   clrow->SetArray(0);
1120   clrow->GetArray()->ExpandCreateFast(10000);
1121   //
1122   //  TTree * tree = fClustersArray.GetTree();
1123
1124   TTree * tree = fInput;
1125   TBranch * br = tree->GetBranch("Segment");
1126   br->SetAddress(&clrow);
1127   //
1128   Int_t j=Int_t(tree->GetEntries());
1129   for (Int_t i=0; i<j; i++) {
1130     br->GetEntry(i);
1131     //
1132     Int_t sec,row;
1133     fParam->AdjustSectorRow(clrow->GetID(),sec,row);
1134     //
1135     AliTPCRow * tpcrow=0;
1136     Int_t left=0;
1137     if (sec<fkNIS*2){
1138       tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1139       left = sec/fkNIS;
1140     }
1141     else{
1142       tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1143       left = (sec-fkNIS*2)/fkNOS;
1144     }
1145     if (left ==0){
1146       tpcrow->fN1 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1147       tpcrow->fClusters1 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN1];
1148       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN1;i++)
1149         tpcrow->fClusters1[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1150     }
1151     if (left ==1){
1152       tpcrow->fN2 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1153       tpcrow->fClusters2 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN2];
1154       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN2;i++)
1155         tpcrow->fClusters2[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1156     }
1157   }
1158   //
1159   delete clrow;
1160   LoadOuterSectors();
1161   LoadInnerSectors();
1162   return 0;
1163 }
1164
1165
1166 void AliTPCtrackerMI::UnloadClusters()
1167 {
1168   //
1169   // unload clusters from the memory
1170   //
1171   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1172   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1173     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1174       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
1175       //      if (tpcrow){
1176       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1;
1177       //        if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2;
1178       //}
1179       tpcrow->ResetClusters();
1180     }
1181   //
1182   nrows = fInnerSec->GetNRows();
1183   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1184     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1185       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1186       //if (tpcrow){
1187       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1;
1188       //if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2;
1189       //}
1190       tpcrow->ResetClusters();
1191     }
1192
1193   return ;
1194 }
1195
1196
1197 //_____________________________________________________________________________
1198 Int_t AliTPCtrackerMI::LoadOuterSectors() {
1199   //-----------------------------------------------------------------
1200   // This function fills outer TPC sectors with clusters.
1201   //-----------------------------------------------------------------
1202   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1203   UInt_t index=0;
1204   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1205     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1206       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
1207       Int_t sec2 = sec+2*fkNIS;
1208       //left
1209       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1210       while (ncl--) {
1211         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1212         index=(((sec2<<8)+row)<<16)+ncl;
1213         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1214       }
1215       //right
1216       ncl = tpcrow->fN2;
1217       while (ncl--) {
1218         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1219         index=((((sec2+fkNOS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1220         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1221       }
1222       //
1223       // write indexes for fast acces
1224       //
1225       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1226         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1227       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1228         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1229         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1230       }
1231       Int_t last = 0;
1232       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1233         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1234           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1235         else
1236           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1237       }
1238     }
1239   fN=fkNOS;
1240   fSectors=fOuterSec;
1241   return 0;
1242 }
1243
1244
1245 //_____________________________________________________________________________
1246 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadInnerSectors() {
1247   //-----------------------------------------------------------------
1248   // This function fills inner TPC sectors with clusters.
1249   //-----------------------------------------------------------------
1250   Int_t nrows = fInnerSec->GetNRows();
1251   UInt_t index=0;
1252   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1253     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1254       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1255       //
1256       //left
1257       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1258       while (ncl--) {
1259         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1260         index=(((sec<<8)+row)<<16)+ncl;
1261         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1262       }
1263       //right
1264       ncl = tpcrow->fN2;
1265       while (ncl--) {
1266         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1267         index=((((sec+fkNIS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1268         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1269       }
1270       //
1271       // write indexes for fast acces
1272       //
1273       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1274         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1275       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1276         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1277         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1278       }
1279       Int_t last = 0;
1280       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1281         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1282           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1283         else
1284           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1285       }
1286
1287     }
1288
1289   fN=fkNIS;
1290   fSectors=fInnerSec;
1291   return 0;
1292 }
1293
1294
1295
1296 //_________________________________________________________________________
1297 AliTPCclusterMI *AliTPCtrackerMI::GetClusterMI(Int_t index) const {
1298   //--------------------------------------------------------------------
1299   //       Return pointer to a given cluster
1300   //--------------------------------------------------------------------
1301   Int_t sec=(index&0xff000000)>>24;
1302   Int_t row=(index&0x00ff0000)>>16;
1303   Int_t ncl=(index&0x00007fff)>>00;
1304
1305   const AliTPCRow * tpcrow=0;
1306   AliTPCclusterMI * clrow =0;
1307
1308   if (sec<fkNIS*2){
1309     tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1310     if (tpcrow==0) return 0;
1311
1312     if (sec<fkNIS) {
1313       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1314       clrow = tpcrow->fClusters1;
1315     }
1316     else {
1317       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1318       clrow = tpcrow->fClusters2;
1319     }
1320   }
1321   else {
1322     tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1323     if (tpcrow==0) return 0;
1324
1325     if (sec-2*fkNIS<fkNOS) {
1326       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1327       clrow = tpcrow->fClusters1;
1328     }
1329     else {
1330       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1331       clrow = tpcrow->fClusters2;
1332     }
1333   }
1334
1335   return &(clrow[ncl]);
1336
1337 }
1338
1339
1340
1341 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNext(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1342   //-----------------------------------------------------------------
1343   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1344   //-----------------------------------------------------------------
1345   //
1346   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1347   AliTPCclusterMI *cl=0;
1348   Int_t tpcindex= t.GetClusterIndex2(nr);
1349   //
1350   // update current shape info every 5 pad-row
1351   //  if ( (nr%5==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1352     GetShape(&t,nr);
1353     //}
1354   //
1355   if (fIteration>0 && tpcindex>=-1){  //if we have already clusters
1356     //
1357     if (tpcindex==-1) return 0; //track in dead zone
1358     if (tpcindex>0){     //
1359       cl = t.fClusterPointer[nr];
1360       if ( (cl==0) ) cl = GetClusterMI(tpcindex);
1361       t.fCurrentClusterIndex1 = tpcindex;
1362     }
1363     if (cl){
1364       Int_t relativesector = ((tpcindex&0xff000000)>>24)%18;  // if previously accepted cluster in different sector
1365       Float_t angle = relativesector*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift();
1366       //
1367       if (angle<-TMath::Pi()) angle += 2*TMath::Pi();
1368       if (angle>=TMath::Pi()) angle -= 2*TMath::Pi();
1369
1370       if (TMath::Abs(angle-t.GetAlpha())>0.001){
1371         Double_t rotation = angle-t.GetAlpha();
1372         t.fRelativeSector= relativesector;
1373         t.Rotate(rotation);
1374       }
1375       t.PropagateTo(x);
1376       //
1377       t.fCurrentCluster = cl;
1378       t.fRow = nr;
1379       Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1380       if ((tpcindex&0x8000)==0) accept =0;
1381       if (accept<3) {
1382         //if founded cluster is acceptible
1383         if (cl->IsUsed(11)) {  // id cluster is shared inrease uncertainty
1384           t.fErrorY2 += 0.03;
1385           t.fErrorZ2 += 0.03;
1386           t.fErrorY2 *= 3;
1387           t.fErrorZ2 *= 3;
1388         }
1389         t.fNFoundable++;
1390         UpdateTrack(&t,accept);
1391         return 1;
1392       }
1393     }
1394   }
1395   if (fIteration>1) {t.fNFoundable++; return 0;}  // not look for new cluster during refitting
1396   //
1397   UInt_t index=0;
1398   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95 || TMath::Abs(x*t.GetC()-t.GetEta())>0.95) return 0;
1399   Double_t  y=t.GetYat(x);
1400   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1401     if (y > ymax) {
1402       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1403       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1404         return 0;
1405     } else if (y <-ymax) {
1406       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1407       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1408         return 0;
1409     }
1410     //return 1;
1411   }
1412   //
1413   if (!t.PropagateTo(x)) {
1414     if (fIteration==0) t.fRemoval = 10;
1415     return 0;
1416   }
1417   y=t.GetY();
1418   Double_t z=t.GetZ();
1419   //
1420   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1421   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1422   Double_t  roady  =1.;
1423   Double_t  roadz = 1.;
1424   //
1425   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1426     t.fInDead = kTRUE;
1427     t.SetClusterIndex2(nr,-1);
1428     return 0;
1429   }
1430   else
1431     {
1432       if (TMath::Abs(z)<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10) && TMath::Abs(z)<fParam->GetZLength() ) t.fNFoundable++;
1433       else
1434         return 0;
1435     }
1436   //calculate
1437   if (krow) {
1438     //    cl = krow.FindNearest2(y+10.,z,roady,roadz,index);
1439     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);
1440     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);
1441   }
1442   if (cl) {
1443     t.fCurrentCluster = cl;
1444     t.fRow = nr;
1445     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(10)) return 0;
1446     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1447     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(11)) {
1448       t.fErrorY2 += 0.03;
1449       t.fErrorZ2 += 0.03;
1450       t.fErrorY2 *= 3;
1451       t.fErrorZ2 *= 3;
1452     }
1453     /*
1454     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1455       //
1456       //
1457
1458       t.fNShared++;
1459       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1460         t.fRemoval =10;
1461         return 0;
1462       }
1463     }
1464     */
1465     if (accept<3) UpdateTrack(&t,accept);
1466
1467   } else {
1468     if ( fIteration==0 && t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) t.fRemoval=10;
1469
1470   }
1471   return 1;
1472 }
1473
1474 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextFast(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1475   //-----------------------------------------------------------------
1476   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1477   //-----------------------------------------------------------------
1478   //
1479   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1480   Double_t y,z;
1481   if (!t.GetProlongation(x,y,z)) {
1482     t.fRemoval = 10;
1483     return 0;
1484   }
1485   //
1486   //
1487   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1488
1489     if (y > ymax) {
1490       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1491       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1492         return 0;
1493     } else if (y <-ymax) {
1494       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1495       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1496         return 0;
1497     }
1498     if (!t.PropagateTo(x)) {
1499       return 0;
1500     }
1501     t.GetProlongation(x,y,z);
1502   }
1503   //
1504   // update current shape info every 3 pad-row
1505   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1506     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1507     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1508     GetShape(&t,nr);
1509   }
1510   //
1511   AliTPCclusterMI *cl=0;
1512   UInt_t index=0;
1513
1514
1515   //Int_t nr2 = nr;
1516   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1517   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1518   Double_t  roady  =1.;
1519   Double_t  roadz = 1.;
1520   //
1521   Int_t row = nr;
1522   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1523     t.fInDead = kTRUE;
1524     t.SetClusterIndex2(row,-1);
1525     return 0;
1526   }
1527   else
1528     {
1529       if (TMath::Abs(z)>(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10)) t.SetClusterIndex2(row,-1);
1530     }
1531   //calculate
1532
1533   if ((cl==0)&&(krow)) {
1534     //    cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,index);
1535     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);
1536
1537     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);
1538   }
1539
1540   if (cl) {
1541     t.fCurrentCluster = cl;
1542     //    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1543     //if (accept<3){
1544       t.SetClusterIndex2(row,index);
1545       t.fClusterPointer[row] = cl;
1546       //}
1547   }
1548   return 1;
1549 }
1550
1551
1552
1553 //_________________________________________________________________________
1554 Bool_t AliTPCtrackerMI::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint &p ) const
1555 {
1556   // Get track space point by index
1557   // return false in case the cluster doesn't exist
1558   AliTPCclusterMI *cl = GetClusterMI(index);
1559   if (!cl) return kFALSE;
1560   Int_t sector = (index&0xff000000)>>24;
1561   Int_t row = (index&0x00ff0000)>>16;
1562   Float_t xyz[3];
1563   xyz[0] = fParam->GetPadRowRadii(sector,row);
1564   xyz[1] = cl->GetY();
1565   xyz[2] = cl->GetZ();
1566   Float_t sin,cos;
1567   fParam->AdjustCosSin(sector,cos,sin);
1568   Float_t x = cos*xyz[0]-sin*xyz[1];
1569   Float_t y = cos*xyz[1]+sin*xyz[0];
1570   Float_t cov[6];
1571   Float_t sigmaY2 = 0.027*cl->GetSigmaY2();
1572   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) sigmaY2 *= 2.07;
1573   Float_t sigmaZ2 = 0.066*cl->GetSigmaZ2();
1574   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) sigmaZ2 *= 1.77;
1575   cov[0] = sin*sin*sigmaY2;
1576   cov[1] = -sin*cos*sigmaY2;
1577   cov[2] = 0.;
1578   cov[3] = cos*cos*sigmaY2;
1579   cov[4] = 0.;
1580   cov[5] = sigmaZ2;
1581   p.SetXYZ(x,y,xyz[2],cov);
1582   AliAlignObj::ELayerID iLayer;
1583   Int_t idet;
1584   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) {
1585     iLayer = AliAlignObj::kTPC1;
1586     idet = sector;
1587   }
1588   else {
1589     iLayer = AliAlignObj::kTPC2;
1590     idet = sector - fParam->GetNInnerSector();
1591   }
1592   UShort_t volid = AliAlignObj::LayerToVolUID(iLayer,idet);
1593   p.SetVolumeID(volid);
1594   return kTRUE;
1595 }
1596
1597
1598
1599 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateClusters(AliTPCseed& t,  Int_t nr) {
1600   //-----------------------------------------------------------------
1601   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1602   //-----------------------------------------------------------------
1603   t.fCurrentCluster  = 0;
1604   t.fCurrentClusterIndex1 = 0;
1605
1606   Double_t xt=t.GetX();
1607   Int_t     row = GetRowNumber(xt)-1;
1608   Double_t  ymax= GetMaxY(nr);
1609
1610   if (row < nr) return 1; // don't prolongate if not information until now -
1611   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.9 && t.GetNumberOfClusters()>40. && fIteration!=2) {
1612     t.fRemoval =10;
1613     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1614   }
1615   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95) {
1616     t.fRemoval =10;
1617     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1618   }
1619
1620   Double_t x= GetXrow(nr);
1621   Double_t y,z;
1622   //t.PropagateTo(x+0.02);
1623   //t.PropagateTo(x+0.01);
1624   if (!t.PropagateTo(x)){
1625     return 0;
1626   }
1627   //
1628   y=t.GetY();
1629   z=t.GetZ();
1630
1631   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1632     if (y > ymax) {
1633       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1634       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha()))
1635         return 0;
1636     } else if (y <-ymax) {
1637       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1638       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha()))
1639         return 0;
1640     }
1641     //    if (!t.PropagateTo(x)){
1642     //  return 0;
1643     //}
1644     return 1;
1645     //y = t.GetY();
1646   }
1647   //
1648
1649   AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1650
1651   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1652     t.fInDead = kTRUE;
1653     t.SetClusterIndex2(nr,-1);
1654     return 0;
1655   }
1656   else
1657     {
1658       if (TMath::Abs(t.GetZ())<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*t.GetX()+10)) t.fNFoundable++;
1659       else
1660         return 0;
1661     }
1662
1663   // update current
1664   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2){
1665     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1666     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1667     GetShape(&t,nr);
1668   }
1669
1670   AliTPCclusterMI *cl=0;
1671   Int_t index=0;
1672   //
1673   Double_t roady = 1.;
1674   Double_t roadz = 1.;
1675   //
1676
1677   if (!cl){
1678     index = t.GetClusterIndex2(nr);
1679     if ( (index>0) && (index&0x8000)==0){
1680       cl = t.fClusterPointer[nr];
1681       if ( (cl==0) && (index>0)) cl = GetClusterMI(index);
1682       t.fCurrentClusterIndex1 = index;
1683       if (cl) {
1684         t.fCurrentCluster  = cl;
1685         return 1;
1686       }
1687     }
1688   }
1689
1690   //  if (index<0) return 0;
1691   UInt_t uindex = TMath::Abs(index);
1692
1693   if (krow) {
1694     //cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,uindex);
1695     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,uindex);
1696   }
1697
1698   if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(uindex);
1699   t.fCurrentCluster  = cl;
1700
1701   return 1;
1702 }
1703
1704
1705 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextCluster(AliTPCseed & t, Int_t nr) {
1706   //-----------------------------------------------------------------
1707   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1708   //-----------------------------------------------------------------
1709
1710   //update error according neighborhoud
1711
1712   if (t.fCurrentCluster) {
1713     t.fRow = nr;
1714     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1715
1716     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1717       //
1718       //
1719       //  t.fErrorZ2*=2;
1720       //  t.fErrorY2*=2;
1721       t.fNShared++;
1722       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1723         t.fRemoval =10;
1724         return 0;
1725       }
1726     }
1727     if (fIteration>0) accept = 0;
1728     if (accept<3)  UpdateTrack(&t,accept);
1729
1730   } else {
1731     if (fIteration==0){
1732       if ( ( (t.GetSigmaY2()+t.GetSigmaZ2())>0.16)&& t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;
1733       if (  t.GetChi2()/t.GetNumberOfClusters()>6 &&t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;
1734
1735       if (( (t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) || t.fNoCluster>15)) t.fRemoval=10;
1736     }
1737   }
1738   return 1;
1739 }
1740
1741
1742
1743 //_____________________________________________________________________________
1744 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1745   //-----------------------------------------------------------------
1746   // This function tries to find a track prolongation.
1747   //-----------------------------------------------------------------
1748   Double_t xt=t.GetX();
1749   //
1750   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1751   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1752   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1753   //
1754   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1755
1756   Int_t first = GetRowNumber(xt)-1;
1757   for (Int_t nr= first; nr>=rf; nr-=step) {
1758     // update kink info
1759     if (t.GetKinkIndexes()[0]>0){
1760       for (Int_t i=0;i<3;i++){
1761         Int_t index = t.GetKinkIndexes()[i];
1762         if (index==0) break;
1763         if (index<0) continue;
1764         //
1765         AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
1766         if (!kink){
1767           printf("PROBLEM\n");
1768         }
1769         else{
1770           Int_t kinkrow = kink->GetTPCRow0()+2+Int_t(0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
1771           if (kinkrow==nr){
1772             AliExternalTrackParam paramd(t);
1773             kink->SetDaughter(paramd);
1774             kink->SetStatus(2,5);
1775             kink->Update();
1776           }
1777         }
1778       }
1779     }
1780
1781     if (nr==80) t.UpdateReference();
1782     if (nr<fInnerSec->GetNRows())
1783       fSectors = fInnerSec;
1784     else
1785       fSectors = fOuterSec;
1786     if (FollowToNext(t,nr)==0)
1787       if (!t.IsActive())
1788         return 0;
1789
1790   }
1791   return 1;
1792 }
1793
1794
1795 //_____________________________________________________________________________
1796 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongationFast(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1797   //-----------------------------------------------------------------
1798   // This function tries to find a track prolongation.
1799   //-----------------------------------------------------------------
1800   Double_t xt=t.GetX();
1801   //
1802   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1803   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1804   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1805   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1806
1807   for (Int_t nr=GetRowNumber(xt)-1; nr>=rf; nr-=step) {
1808
1809     if (FollowToNextFast(t,nr)==0)
1810       if (!t.IsActive()) return 0;
1811
1812   }
1813   return 1;
1814 }
1815
1816
1817
1818
1819
1820 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowBackProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf) {
1821   //-----------------------------------------------------------------
1822   // This function tries to find a track prolongation.
1823   //-----------------------------------------------------------------
1824   //
1825   Double_t xt=t.GetX();
1826   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1827   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
1828   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
1829   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1830
1831   Int_t first = t.fFirstPoint;
1832   if (first<GetRowNumber(xt)+1) first = GetRowNumber(xt)+1;
1833   //
1834   if (first<0) first=0;
1835   for (Int_t nr=first; nr<=rf; nr++) {
1836     if ( (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95)) break;
1837     if (t.GetKinkIndexes()[0]<0){
1838       for (Int_t i=0;i<3;i++){
1839         Int_t index = t.GetKinkIndexes()[i];
1840         if (index==0) break;
1841         if (index>0) continue;
1842         index = TMath::Abs(index);
1843         AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
1844         if (!kink){
1845           printf("PROBLEM\n");
1846         }
1847         else{
1848           Int_t kinkrow = kink->GetTPCRow0()-2-Int_t(0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
1849           if (kinkrow==nr){
1850             AliExternalTrackParam paramm(t);
1851             kink->SetMother(paramm);
1852             kink->SetStatus(2,1);
1853             kink->Update();
1854           }
1855         }
1856       }
1857     }
1858     //
1859     if (nr<fInnerSec->GetNRows())
1860       fSectors = fInnerSec;
1861     else
1862       fSectors = fOuterSec;
1863     FollowToNext(t,nr);
1864   }
1865   return 1;
1866 }
1867
1868
1869
1870
1871
1872 Float_t AliTPCtrackerMI::OverlapFactor(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2, Int_t &sum1, Int_t & sum2)
1873 {
1874   //
1875   //
1876   sum1=0;
1877   sum2=0;
1878   Int_t sum=0;
1879   //
1880   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1881   dz2*=dz2;
1882
1883   Float_t dy2 =TMath::Abs((s1->GetY() - s2->GetY()));
1884   dy2*=dy2;
1885   Float_t distance = TMath::Sqrt(dz2+dy2);
1886   if (distance>4.) return 0; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1887
1888   //  Int_t offset =0;
1889   Int_t firstpoint = TMath::Min(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1890   Int_t lastpoint = TMath::Max(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1891   if (lastpoint>160)
1892     lastpoint =160;
1893   if (firstpoint<0)
1894     firstpoint = 0;
1895   if (firstpoint>lastpoint) {
1896     firstpoint =lastpoint;
1897     //    lastpoint  =160;
1898   }
1899
1900
1901   for (Int_t i=firstpoint-1;i<lastpoint+1;i++){
1902     if (s1->GetClusterIndex2(i)>0) sum1++;
1903     if (s2->GetClusterIndex2(i)>0) sum2++;
1904     if (s1->GetClusterIndex2(i)==s2->GetClusterIndex2(i) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1905       sum++;
1906     }
1907   }
1908   if (sum<5) return 0;
1909
1910   Float_t summin = TMath::Min(sum1+1,sum2+1);
1911   Float_t ratio = (sum+1)/Float_t(summin);
1912   return ratio;
1913 }
1914
1915 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2)
1916 {
1917   //
1918   //
1919   if (TMath::Abs(s1->GetC()-s2->GetC())>0.004) return;
1920   if (TMath::Abs(s1->GetTgl()-s2->GetTgl())>0.6) return;
1921
1922   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1923   dz2*=dz2;
1924   Float_t dy2 =(s1->GetY() - s2->GetY());
1925   dy2*=dy2;
1926   Float_t distance = dz2+dy2;
1927   if (distance>325.) return ; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1928
1929   //
1930   Int_t sumshared=0;
1931   //
1932   Int_t firstpoint = TMath::Max(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1933   Int_t lastpoint = TMath::Min(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1934   //
1935   if (firstpoint>=lastpoint-5) return;;
1936
1937   for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1938     //    if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1939     if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1940       sumshared++;
1941     }
1942   }
1943   if (sumshared>4){
1944     // sign clusters
1945     //
1946     for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1947       //      if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1948       if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1949         AliTPCTrackerPoint *p1  = s1->GetTrackPoint(i);
1950         AliTPCTrackerPoint *p2  = s2->GetTrackPoint(i);;
1951         if (s1->IsActive()&&s2->IsActive()){
1952           p1->fIsShared = kTRUE;
1953           p2->fIsShared = kTRUE;
1954         }
1955       }
1956     }
1957   }
1958   //
1959   if (sumshared>10){
1960     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1961       if (s1->fOverlapLabels[3*i]==0){
1962         s1->fOverlapLabels[3*i] = s2->GetLabel();
1963         s1->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1964         s1->fOverlapLabels[3*i+2] = s2->GetUniqueID();
1965         break;
1966       }
1967     }
1968     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1969       if (s2->fOverlapLabels[3*i]==0){
1970         s2->fOverlapLabels[3*i] = s1->GetLabel();
1971         s2->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1972         s2->fOverlapLabels[3*i+2] = s1->GetUniqueID();
1973         break;
1974       }
1975     }
1976   }
1977
1978 }
1979
1980 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(TObjArray * arr)
1981 {
1982   //
1983   //sort trackss according sectors
1984   //
1985   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
1986     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
1987     if (!pt) continue;
1988     //if (pt) RotateToLocal(pt);
1989     pt->fSort = 0;
1990   }
1991   arr->UnSort();
1992   arr->Sort();  // sorting according z
1993   arr->Expand(arr->GetEntries());
1994   //
1995   //
1996   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
1997   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
1998     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
1999     if (!pt) continue;
2000     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2001       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2002     }
2003   }
2004   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2005     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2006     if (!pt) continue;
2007     if (pt->fRemoval>10) continue;
2008     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2009       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2010       //      if (pt2){
2011       if (pt2->fRemoval<=10) {
2012         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2013         SignShared(pt,pt2);
2014       }
2015     }
2016   }
2017 }
2018
2019 void  AliTPCtrackerMI::RemoveDouble(TObjArray * arr, Float_t factor1, Float_t factor2,  Int_t removalindex)
2020 {
2021   //
2022   //sort trackss according sectors
2023   //
2024   if (fDebug&1) {
2025     Info("RemoveDouble","Number of tracks before double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2026   }
2027   //
2028   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
2029     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2030     if (!pt) continue;
2031     pt->fSort = 0;
2032   }
2033   arr->UnSort();
2034   arr->Sort();  // sorting according z
2035   arr->Expand(arr->GetEntries());
2036   //
2037   //reset overlap labels
2038   //
2039   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
2040   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2041     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2042     if (!pt) continue;
2043     pt->SetUniqueID(i);
2044     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2045       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2046     }
2047   }
2048   //
2049   //sign shared tracks
2050   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2051     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2052     if (!pt) continue;
2053     if (pt->fRemoval>10) continue;
2054     Float_t deltac = pt->GetC()*0.1;
2055     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2056       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2057       //      if (pt2){
2058       if (pt2->fRemoval<=10) {
2059         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2060         if (TMath::Abs(pt->GetC()  -pt2->GetC())>deltac) continue;
2061         if (TMath::Abs(pt->GetTgl()-pt2->GetTgl())>0.05) continue;
2062         //
2063         SignShared(pt,pt2);
2064       }
2065     }
2066   }
2067   //
2068   // remove highly shared tracks
2069   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2070     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2071     if (!pt) continue;
2072     if (pt->fRemoval>10) continue;
2073     //
2074     Int_t sumshared =0;
2075     for (Int_t j=0;j<4;j++){
2076       sumshared = pt->fOverlapLabels[j*3+1];
2077     }
2078     Float_t factor = factor1;
2079     if (pt->fRemoval>0) factor = factor2;
2080     if (sumshared/pt->GetNumberOfClusters()>factor){
2081       for (Int_t j=0;j<4;j++){
2082         if (pt->fOverlapLabels[3*j]==0) continue;
2083         if (pt->fOverlapLabels[3*j+1]<5) continue;
2084         if (pt->fRemoval==removalindex) continue;
2085         AliTPCseed * pt2 = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(pt->fOverlapLabels[3*j+2]);
2086         if (!pt2) continue;
2087         if (pt2->GetSigma2C()<pt->GetSigma2C()){
2088           //      pt->fRemoval = removalindex;
2089           delete arr->RemoveAt(i);
2090           break;
2091         }
2092       }
2093     }
2094   }
2095   arr->Compress();
2096   if (fDebug&1) {
2097     Info("RemoveDouble","Number of tracks after double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2098   }
2099 }
2100
2101
2102
2103
2104
2105
2106 void AliTPCtrackerMI::SortTracks(TObjArray * arr, Int_t mode) const
2107 {
2108   //
2109   //sort tracks in array according mode criteria
2110   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2111   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2112     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2113     if (!pt) {
2114       continue;
2115     }
2116     pt->fSort = mode;
2117   }
2118   arr->UnSort();
2119   arr->Sort();
2120 }
2121
2122 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t removalindex)
2123 {
2124
2125   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2126   //
2127   //
2128   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2129   Int_t good =0;
2130
2131   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2132     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2133     if (!pt) {
2134       delete arr->RemoveAt(i);
2135     }
2136     else{
2137       pt->fSort =1;
2138       pt->fBSigned = kFALSE;
2139     }
2140   }
2141   arr->Compress();
2142   nseed = arr->GetEntriesFast();
2143   arr->UnSort();
2144   arr->Sort();
2145   //
2146   //unsign used
2147   UnsignClusters();
2148   //
2149   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2150     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2151     if (!pt) {
2152       continue;
2153     }
2154     Int_t found,foundable,shared;
2155     if (pt->IsActive())
2156       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kFALSE);
2157     else
2158       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kTRUE);
2159     //
2160     Double_t factor = factor2;
2161     if (pt->fBConstrain) factor = factor1;
2162
2163     if ((Float_t(shared)/Float_t(found))>factor){
2164       pt->Desactivate(removalindex);
2165       continue;
2166     }
2167
2168     good++;
2169     for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2170       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2171       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2172       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2173       if (!c) continue;
2174       //      if (!c->IsUsed(10)) c->Use(10);
2175       //if (pt->IsActive())
2176       c->Use(10);
2177       //else
2178       //        c->Use(5);
2179     }
2180
2181   }
2182   fNtracks = good;
2183   if (fDebug>0){
2184     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2185   }
2186 }
2187
2188
2189 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed2(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t minimal)
2190 {
2191
2192   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2193   //
2194   //
2195   UnsignClusters();
2196   //
2197   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2198   Float_t * quality = new Float_t[nseed];
2199   Int_t   * indexes = new Int_t[nseed];
2200   Int_t good =0;
2201   //
2202   //
2203   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2204     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2205     if (!pt){
2206       quality[i]=-1;
2207       continue;
2208     }
2209     pt->UpdatePoints();    //select first last max dens points
2210     Float_t * points = pt->GetPoints();
2211     if (points[3]<0.8) quality[i] =-1;
2212     //
2213     quality[i] = (points[2]-points[0])+pt->GetNumberOfClusters();
2214   }
2215   TMath::Sort(nseed,quality,indexes);
2216   //
2217   //
2218   for (Int_t itrack=0; itrack<nseed; itrack++) {
2219     Int_t trackindex = indexes[itrack];
2220     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(trackindex);
2221     if (quality[trackindex]<0){
2222       if (pt) {
2223         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2224       }
2225       else{
2226         arr->RemoveAt(trackindex);
2227       }
2228       continue;
2229     }
2230     //
2231     Int_t first = Int_t(pt->GetPoints()[0]);
2232     Int_t last  = Int_t(pt->GetPoints()[2]);
2233     Double_t factor = (pt->fBConstrain) ? factor1: factor2;
2234     //
2235     Int_t found,foundable,shared;
2236     pt->GetClusterStatistic(first,last, found, foundable,shared,kFALSE);
2237     Float_t sharedfactor = Float_t(shared+1)/Float_t(found+1);
2238     Bool_t itsgold =kFALSE;
2239     if (pt->fEsd){
2240       UInt_t dummy[12];
2241       if (pt->fEsd->GetITSclusters(dummy)>4) itsgold= kTRUE;
2242     }
2243     if (!itsgold){
2244       //
2245       if (Float_t(shared+1)/Float_t(found+1)>factor){
2246         if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue;  //don't remove tracks  - part of the kinks
2247         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2248         continue;
2249       }
2250       if (pt->GetNumberOfClusters()<50&&(found-0.5*shared)<minimal){  //remove short tracks
2251         if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue;  //don't remove tracks  - part of the kinks
2252         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2253         continue;
2254       }
2255     }
2256
2257     good++;
2258     if (sharedfactor>0.4) continue;
2259     if (pt->GetKinkIndexes()[0]>0) continue;
2260     for (Int_t i=first; i<last; i++) {
2261       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2262       // if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2263       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2264       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2265       if (!c) continue;
2266       c->Use(10);
2267     }
2268   }
2269   fNtracks = good;
2270   if (fDebug>0){
2271     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2272   }
2273   delete []quality;
2274   delete []indexes;
2275 }
2276
2277 void AliTPCtrackerMI::UnsignClusters()
2278 {
2279   //
2280   // loop over all clusters and unsign them
2281   //
2282
2283   for (Int_t sec=0;sec<fkNIS;sec++){
2284     for (Int_t row=0;row<fInnerSec->GetNRows();row++){
2285       AliTPCclusterMI *cl = fInnerSec[sec][row].fClusters1;
2286       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN1;icl++)
2287         //      if (cl[icl].IsUsed(10))
2288         cl[icl].Use(-1);
2289       cl = fInnerSec[sec][row].fClusters2;
2290       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN2;icl++)
2291         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2292           cl[icl].Use(-1);
2293     }
2294   }
2295
2296   for (Int_t sec=0;sec<fkNOS;sec++){
2297     for (Int_t row=0;row<fOuterSec->GetNRows();row++){
2298       AliTPCclusterMI *cl = fOuterSec[sec][row].fClusters1;
2299       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN1;icl++)
2300         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2301           cl[icl].Use(-1);
2302       cl = fOuterSec[sec][row].fClusters2;
2303       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN2;icl++)
2304         //if (cl[icl].IsUsed(10))
2305         cl[icl].Use(-1);
2306     }
2307   }
2308
2309 }
2310
2311
2312
2313 void AliTPCtrackerMI::SignClusters(TObjArray * arr, Float_t fnumber, Float_t fdensity)
2314 {
2315   //
2316   //sign clusters to be "used"
2317   //
2318   // snumber and sdensity sign number of sigmas - bellow mean value to be accepted
2319   // loop over "primaries"
2320
2321   Float_t sumdens=0;
2322   Float_t sumdens2=0;
2323   Float_t sumn   =0;
2324   Float_t sumn2  =0;
2325   Float_t sumchi =0;
2326   Float_t sumchi2 =0;
2327
2328   Float_t sum    =0;
2329
2330   TStopwatch timer;
2331   timer.Start();
2332
2333   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2334   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2335     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2336     if (!pt) {
2337       continue;
2338     }
2339     if (!(pt->IsActive())) continue;
2340     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2341     if ( (dens>0.7) && (pt->GetNumberOfClusters()>70)){
2342       sumdens += dens;
2343       sumdens2+= dens*dens;
2344       sumn    += pt->GetNumberOfClusters();
2345       sumn2   += pt->GetNumberOfClusters()*pt->GetNumberOfClusters();
2346       Float_t chi2 = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2347       if (chi2>5) chi2=5;
2348       sumchi  +=chi2;
2349       sumchi2 +=chi2*chi2;
2350       sum++;
2351     }
2352   }
2353
2354   Float_t mdensity = 0.9;
2355   Float_t meann    = 130;
2356   Float_t meanchi  = 1;
2357   Float_t sdensity = 0.1;
2358   Float_t smeann    = 10;
2359   Float_t smeanchi  =0.4;
2360
2361
2362   if (sum>20){
2363     mdensity = sumdens/sum;
2364     meann    = sumn/sum;
2365     meanchi  = sumchi/sum;
2366     //
2367     sdensity = sumdens2/sum-mdensity*mdensity;
2368     sdensity = TMath::Sqrt(sdensity);
2369     //
2370     smeann   = sumn2/sum-meann*meann;
2371     smeann   = TMath::Sqrt(smeann);
2372     //
2373     smeanchi = sumchi2/sum - meanchi*meanchi;
2374     smeanchi = TMath::Sqrt(smeanchi);
2375   }
2376
2377
2378   //REMOVE  SHORT DELTAS or tracks going out of sensitive volume of TPC
2379   //
2380   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2381     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2382     if (!pt) {
2383       continue;
2384     }
2385     if (pt->fBSigned) continue;
2386     if (pt->fBConstrain) continue;
2387     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2388     /*
2389     Int_t found,foundable,shared;
2390     pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared);
2391     if (shared/float(found)>0.3) {
2392       if (shared/float(found)>0.9 ){
2393         //delete arr->RemoveAt(i);
2394       }
2395       continue;
2396     }
2397     */
2398     Bool_t isok =kFALSE;
2399     if ( (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.5) &&pt->GetNumberOfClusters()>60)
2400       isok = kTRUE;
2401     if ((TMath::Abs(1/pt->GetC())<100.) && (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.7))
2402       isok =kTRUE;
2403     if  (TMath::Abs(pt->GetZ()/pt->GetX())>1.1)
2404       isok =kTRUE;
2405     if ( (TMath::Abs(pt->GetSnp()>0.7) && pt->GetD(0,0)>60.))
2406       isok =kTRUE;
2407
2408     if (isok)
2409       for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2410         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2411         if (index<0) continue;
2412         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2413         if (!c) continue;
2414         //if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();
2415         c->Use(10);
2416       }
2417   }
2418
2419
2420   //
2421   Double_t maxchi  = meanchi+2.*smeanchi;
2422
2423   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2424     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2425     if (!pt) {
2426       continue;
2427     }
2428     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2429     if (pt->fBSigned) continue;
2430     Double_t chi     = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2431     if (chi>maxchi) continue;
2432
2433     Float_t bfactor=1;
2434     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2435
2436     //sign only tracks with enoug big density at the beginning
2437
2438     if ((pt->GetDensityFirst(40)<0.75) && pt->GetNumberOfClusters()<meann) continue;
2439
2440
2441     Double_t mindens = TMath::Max(double(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor),0.65);
2442     Double_t minn    = TMath::Max(Int_t(meann-fnumber*smeann*bfactor),50);
2443
2444     //    if (pt->fBConstrain) mindens = TMath::Max(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor,0.65);
2445     if ( (pt->fRemoval==10) && (pt->GetSnp()>0.8)&&(dens>mindens))
2446       minn=0;
2447
2448     if ((dens>mindens && pt->GetNumberOfClusters()>minn) && chi<maxchi ){
2449       //Int_t noc=pt->GetNumberOfClusters();
2450       pt->fBSigned = kTRUE;
2451       for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2452
2453         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2454         if (index<0) continue;
2455         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2456         if (!c) continue;
2457         //      if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();
2458         c->Use(10);
2459       }
2460     }
2461   }
2462   //  gLastCheck = nseed;
2463   //  arr->Compress();
2464   if (fDebug>0){
2465     timer.Print();
2466   }
2467 }
2468
2469
2470 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(TObjArray * arr, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1, Float_t th2) const
2471 {
2472   // stop not active tracks
2473   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2474   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows
2475   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2476   //
2477   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2478     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);
2479     if (!pt) {
2480       continue;
2481     }
2482     if (!(pt->IsActive())) continue;
2483     StopNotActive(pt,row0,th0, th1,th2);
2484   }
2485 }
2486
2487
2488
2489 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(AliTPCseed * seed, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1,
2490  Float_t th2) const
2491 {
2492   // stop not active tracks
2493   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2494   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows
2495   Int_t sumgood1  = 0;
2496   Int_t sumgood2  = 0;
2497   Int_t foundable = 0;
2498   Int_t maxindex = seed->fLastPoint;  //last foundable row
2499   if (seed->fNFoundable*th0 > seed->GetNumberOfClusters()) {
2500     seed->Desactivate(10) ;
2501     return;
2502   }
2503
2504   for (Int_t i=row0; i<maxindex; i++){
2505     Int_t index = seed->GetClusterIndex2(i);
2506     if (index!=-1) foundable++;
2507     //if (!c) continue;
2508     if (foundable<=30) sumgood1++;
2509     if (foundable<=50) {
2510       sumgood2++;
2511     }
2512     else{
2513       break;
2514     }
2515   }
2516   if (foundable>=30.){
2517      if (sumgood1<(th1*30.)) seed->Desactivate(10);
2518   }
2519   if (foundable>=50)
2520     if (sumgood2<(th2*50.)) seed->Desactivate(10);
2521 }
2522
2523
2524 Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESD *event)
2525 {
2526   //
2527   // back propagation of ESD tracks
2528   //
2529   //return 0;
2530   fEvent = event;
2531   ReadSeeds(event,2);
2532   fIteration=2;
2533   //PrepareForProlongation(fSeeds,1);
2534   PropagateForward2(fSeeds);
2535
2536   Int_t ntracks=0;
2537   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2538   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2539     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2540     if (!seed) continue;
2541     if (seed->GetKinkIndex(0)>0)  UpdateKinkQualityD(seed);  // update quality informations for kinks
2542
2543     seed->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
2544     seed->UpdatePoints();
2545     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2546     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2547     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2548     //
2549     if (0 && seed!=0&&esd!=0) {
2550       TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
2551       cstream<<"Crefit"<<
2552         "Esd.="<<esd<<
2553         "Track.="<<seed<<
2554         "\n";
2555     }
2556     if (seed->GetNumberOfClusters()>15){
2557       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCrefit);
2558       esd->SetTPCPoints(seed->GetPoints());
2559       esd->SetTPCPointsF(seed->fNFoundable);
2560       Int_t ndedx   = seed->fNCDEDX[0]+seed->fNCDEDX[1]+seed->fNCDEDX[2]+seed->fNCDEDX[3];
2561       Float_t sdedx = (seed->fSDEDX[0]+seed->fSDEDX[1]+seed->fSDEDX[2]+seed->fSDEDX[3])*0.25;
2562       Float_t dedx  = seed->GetdEdx();
2563       esd->SetTPCsignal(dedx, sdedx, ndedx);
2564       ntracks++;
2565     }
2566     else{
2567       //printf("problem\n");
2568     }
2569   }
2570   //FindKinks(fSeeds,event);
2571   Info("RefitInward","Number of refitted tracks %d",ntracks);
2572   fEvent =0;
2573   //WriteTracks();
2574   return 0;
2575 }
2576
2577
2578 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliESD *event)
2579 {
2580   //
2581   // back propagation of ESD tracks
2582   //
2583
2584   fEvent = event;
2585   fIteration = 1;
2586   ReadSeeds(event,1);
2587   PropagateBack(fSeeds);
2588   RemoveUsed2(fSeeds,0.4,0.4,20);
2589   //
2590   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2591   Int_t ntracks=0;
2592   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2593     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2594     if (!seed) continue;
2595     if (seed->GetKinkIndex(0)<0)  UpdateKinkQualityM(seed);  // update quality informations for kinks
2596     seed->UpdatePoints();
2597     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2598     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2599     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2600     if (seed->GetNumberOfClusters()>15){
2601       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCout);
2602       esd->SetTPCPoints(seed->GetPoints());
2603       ntracks++;
2604     }
2605   }
2606   //FindKinks(fSeeds,event);
2607   Info("PropagateBack","Number of back propagated tracks %d",ntracks);
2608   fEvent =0;
2609   //WriteTracks();
2610   return 0;
2611 }
2612
2613
2614 void AliTPCtrackerMI::DeleteSeeds()
2615 {
2616   //
2617   //delete Seeds
2618   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2619   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2620     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*)fSeeds->At(i);
2621     if (seed) delete fSeeds->RemoveAt(i);
2622   }
2623   delete fSeeds;
2624   fSeeds =0;
2625 }
2626
2627 void AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(AliESD *event, Int_t direction)
2628 {
2629   //
2630   //read seeds from the event
2631
2632   Int_t nentr=event->GetNumberOfTracks();
2633   if (fDebug>0){
2634     Info("ReadSeeds", "Number of ESD tracks: %d\n", nentr);
2635   }
2636   if (fSeeds)
2637     DeleteSeeds();
2638   if (!fSeeds){
2639     fSeeds = new TObjArray(nentr);
2640   }
2641   UnsignClusters();
2642   //  Int_t ntrk=0;
2643   for (Int_t i=0; i<nentr; i++) {
2644     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2645     ULong_t status=esd->GetStatus();
2646     if (!(status&AliESDtrack::kTPCin)) continue;
2647     AliTPCtrack t(*esd);
2648     t.SetNumberOfClusters(0);
2649     //    AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t,t.GetAlpha());
2650     AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t/*,t.GetAlpha()*/);
2651     for (Int_t ikink=0;ikink<3;ikink++) {
2652       Int_t index = esd->GetKinkIndex(ikink);
2653       seed->GetKinkIndexes()[ikink] = index;
2654       if (index==0) continue;
2655       index = TMath::Abs(index);
2656       AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
2657       if (kink&&esd->GetKinkIndex(ikink)<0){
2658         if ((status & AliESDtrack::kTRDrefit) != 0) kink->SetStatus(1,2);
2659         if ((status & AliESDtrack::kITSout) != 0)   kink->SetStatus(1,0);
2660       }
2661       if (kink&&esd->GetKinkIndex(ikink)>0){
2662         if ((status & AliESDtrack::kTRDrefit) != 0) kink->SetStatus(1,6);
2663         if ((status & AliESDtrack::kITSout) != 0)   kink->SetStatus(1,4);
2664       }
2665
2666     }
2667     if (((status&AliESDtrack::kITSout)==0)&&(direction==1)) seed->ResetCovariance();
2668     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) == 0 ) seed->ResetCovariance();
2669     if ( direction ==2 && ((status & AliESDtrack::kTPCout) == 0) ) {
2670       fSeeds->AddAt(0,i);
2671       delete seed;
2672       continue;
2673     }
2674     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) > 0 )  {
2675       Double_t par0[5],par1[5],alpha,x;
2676       esd->GetInnerExternalParameters(alpha,x,par0);
2677       esd->GetExternalParameters(x,par1);
2678       Double_t delta1 = TMath::Abs(par0[4]-par1[4])/(0.000000001+TMath::Abs(par0[4]+par1[4]));
2679       Double_t delta2 = TMath::Abs(par0[3]-par1[3]);
2680       Double_t trdchi2=0;
2681       if (esd->GetTRDncls()>0) trdchi2 = esd->GetTRDchi2()/esd->GetTRDncls();
2682       //reset covariance if suspicious
2683       if ( (delta1>0.1) || (delta2>0.006) ||trdchi2>7.)
2684         seed->ResetCovariance();
2685     }
2686
2687     //
2688     //
2689     // rotate to the local coordinate system
2690     //
2691     fSectors=fInnerSec; fN=fkNIS;
2692     Double_t alpha=seed->GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
2693     if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
2694     if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
2695     Int_t ns=Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha())%fN;
2696     alpha =ns*fSectors->GetAlpha() + fSectors->GetAlphaShift();
2697     if (alpha<-TMath::Pi()) alpha += 2*TMath::Pi();
2698     if (alpha>=TMath::Pi()) alpha -= 2*TMath::Pi();
2699     alpha-=seed->GetAlpha();
2700     if (!seed->Rotate(alpha)) {
2701       delete seed;
2702       continue;
2703     }
2704     seed->fEsd = esd;
2705     // sign clusters
2706     if (esd->GetKinkIndex(0)<=0){
2707       for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
2708         Int_t index = seed->GetClusterIndex2(irow);
2709         if (index>0){
2710           //
2711           AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(index);
2712           seed->fClusterPointer[irow] = cl;
2713           if (cl){
2714             if ((index & 0x8000)==0){
2715               cl->Use(10);  // accepted cluster
2716             }else{
2717               cl->Use(6);   // close cluster not accepted
2718             }
2719           }else{
2720             Info("ReadSeeds","Not found cluster");
2721           }
2722         }
2723       }
2724     }
2725     fSeeds->AddAt(seed,i);
2726   }
2727 }
2728
2729
2730
2731 //_____________________________________________________________________________
2732 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds3(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
2733                                  Float_t deltay, Int_t ddsec) {
2734   //-----------------------------------------------------------------
2735   // This function creates track seeds.
2736   // SEEDING WITH VERTEX CONSTRAIN
2737   //-----------------------------------------------------------------
2738   // cuts[0]   - fP4 cut
2739   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
2740   // cuts[2]   - zvertex cut
2741   // cuts[3]   - fP3 cut
2742   Int_t nin0  = 0;
2743   Int_t nin1  = 0;
2744   Int_t nin2  = 0;
2745   Int_t nin   = 0;
2746   Int_t nout1 = 0;
2747   Int_t nout2 = 0;
2748
2749   Double_t x[5], c[15];
2750   //  Int_t di = i1-i2;
2751   //
2752   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
2753   Double_t alpha=fSectors->GetAlpha(), shift=fSectors->GetAlphaShift();
2754   Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
2755   //
2756   //  Double_t x1 =fOuterSec->GetX(i1);
2757   //Double_t xx2=fOuterSec->GetX(i2);
2758
2759   Double_t x1 =GetXrow(i1);
2760   Double_t xx2=GetXrow(i2);
2761
2762   Double_t x3=GetX(), y3=GetY(), z3=GetZ();
2763
2764   Int_t imiddle = (i2+i1)/2;    //middle pad row index
2765   Double_t xm = GetXrow(imiddle); // radius of middle pad-row
2766   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,imiddle); //middle pad -row
2767   //
2768   Int_t ns =sec;
2769
2770   const AliTPCRow& kr1=GetRow(ns,i1);
2771   Double_t ymax  = GetMaxY(i1)-kr1.fDeadZone-1.5;
2772   Double_t ymaxm = GetMaxY(imiddle)-kr1.fDeadZone-1.5;
2773
2774   //
2775   // change cut on curvature if it can't reach this layer
2776   // maximal curvature set to reach it
2777   Double_t dvertexmax  = TMath::Sqrt((x1-x3)*(x1-x3)+(ymax+5-y3)*(ymax+5-y3));
2778   if (dvertexmax*0.5*cuts[0]>0.85){
2779     cuts[0] = 0.85/(dvertexmax*0.5+1.);
2780   }
2781   Double_t r2min = 1/(cuts[0]*cuts[0]);  //minimal square of radius given by cut
2782
2783   //  Int_t ddsec = 1;
2784   if (deltay>0) ddsec = 0;
2785   // loop over clusters
2786   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
2787     //
2788     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
2789     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();
2790     //if (TMath::Abs(y1)>ymax) continue;
2791
2792     if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
2793
2794     // find possible directions
2795     Float_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3);
2796     Float_t extraz = z1 - anglez*(x1-xx2);  // extrapolated z
2797     //
2798     //
2799     //find   rotation angles relative to line given by vertex and point 1
2800     Double_t dvertex2 = (x1-x3)*(x1-x3)+(y1-y3)*(y1-y3);
2801     Double_t dvertex  = TMath::Sqrt(dvertex2);
2802     Double_t angle13  = TMath::ATan((y1-y3)/(x1-x3));
2803     Double_t cs13     = cos(-angle13), sn13 = sin(-angle13);
2804
2805     //
2806     // loop over 2 sectors
2807     Int_t dsec1=-ddsec;
2808     Int_t dsec2= ddsec;
2809     if (y1<0)  dsec2= 0;
2810     if (y1>0)  dsec1= 0;
2811
2812     Double_t dddz1=0;  // direction of delta inclination in z axis
2813     Double_t dddz2=0;
2814     if ( (z1-z3)>0)
2815       dddz1 =1;
2816     else
2817       dddz2 =1;
2818     //
2819     for (Int_t dsec = dsec1; dsec<=dsec2;dsec++){
2820       Int_t sec2 = sec + dsec;
2821       //
2822       //      AliTPCRow&  kr2  = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][i2];
2823       //AliTPCRow&  kr2m = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][imiddle];
2824       AliTPCRow&  kr2  = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,i2);
2825       AliTPCRow&  kr2m = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,imiddle);
2826       Int_t  index1 = TMath::Max(kr2.Find(extraz-0.6-dddz1*TMath::Abs(z1)*0.05)-1,0);
2827       Int_t  index2 = TMath::Min(kr2.Find(extraz+0.6+dddz2*TMath::Abs(z1)*0.05)+1,kr2);
2828
2829       // rotation angles to p1-p3
2830       Double_t cs13r     = cos(-angle13+dsec*alpha)/dvertex, sn13r = sin(-angle13+dsec*alpha)/dvertex;
2831       Double_t x2,   y2,   z2;
2832       //
2833       //      Double_t dymax = maxangle*TMath::Abs(x1-xx2);
2834
2835       //
2836       Double_t dxx0 =  (xx2-x3)*cs13r;
2837       Double_t dyy0 =  (xx2-x3)*sn13r;
2838       for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
2839         const AliTPCclusterMI *kcl = kr2[js];
2840         if (kcl->IsUsed(10)) continue;
2841         //
2842         //calcutate parameters
2843         //
2844         Double_t yy0 =  dyy0 +(kcl->GetY()-y3)*cs13r;
2845         // stright track
2846         if (TMath::Abs(yy0)<0.000001) continue;
2847         Double_t xx0 =  dxx0 -(kcl->GetY()-y3)*sn13r;
2848         Double_t y0  =  0.5*(xx0*xx0+yy0*yy0-xx0)/yy0;
2849         Double_t r02 = (0.25+y0*y0)*dvertex2;
2850         //curvature (radius) cut
2851         if (r02<r2min) continue;
2852
2853         nin0++;
2854         //
2855         Double_t c0  = 1/TMath::Sqrt(r02);
2856         if (yy0>0) c0*=-1.;
2857
2858
2859         //Double_t dfi0   = 2.*TMath::ASin(dvertex*c0*0.5);
2860         //Double_t dfi1   = 2.*TMath::ASin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);
2861         Double_t dfi0   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(dvertex*c0*0.5);
2862         Double_t dfi1   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);
2863         //
2864         //
2865         Double_t z0  =  kcl->GetZ();
2866         Double_t zzzz2    = z1-(z1-z3)*dfi1/dfi0;
2867         if (TMath::Abs(zzzz2-z0)>0.5) continue;
2868         nin1++;
2869         //
2870         Double_t dip    = (z1-z0)*c0/dfi1;
2871         Double_t x0 = (0.5*cs13+y0*sn13)*dvertex*c0;
2872         //
2873         y2 = kcl->GetY();
2874         if (dsec==0){
2875           x2 = xx2;
2876           z2 = kcl->GetZ();
2877         }
2878         else
2879           {
2880             // rotation
2881             z2 = kcl->GetZ();
2882             x2= xx2*cs-y2*sn*dsec;
2883             y2=+xx2*sn*dsec+y2*cs;
2884           }
2885
2886         x[0] = y1;
2887         x[1] = z1;
2888         x[2] = x0;
2889         x[3] = dip;
2890         x[4] = c0;
2891         //
2892         //
2893         // do we have cluster at the middle ?
2894         Double_t ym,zm;
2895         GetProlongation(x1,xm,x,ym,zm);
2896         UInt_t dummy;
2897         AliTPCclusterMI * cm=0;
2898         if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){
2899           cm = krm.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2900           if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {
2901             continue;
2902           }
2903         }
2904         else{
2905           // rotate y1 to system 0
2906           // get state vector in rotated system
2907           Double_t yr1  = (-0.5*sn13+y0*cs13)*dvertex*c0;
2908           Double_t xr2  =  x0*cs+yr1*sn*dsec;
2909           Double_t xr[5]={kcl->GetY(),kcl->GetZ(), xr2, dip, c0};
2910           //
2911           GetProlongation(xx2,xm,xr,ym,zm);
2912           if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){
2913             cm = kr2m.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2914             if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {
2915               continue;
2916             }
2917           }
2918         }
2919
2920
2921         Double_t dym = 0;
2922         Double_t dzm = 0;
2923         if (cm){
2924           dym = ym - cm->GetY();
2925           dzm = zm - cm->GetZ();
2926         }
2927         nin2++;
2928
2929
2930         //
2931         //
2932         Double_t sy1=kr1[is]->GetSigmaY2()*2., sz1=kr1[is]->GetSigmaZ2()*2.;
2933         Double_t sy2=kcl->GetSigmaY2()*2.,     sz2=kcl->GetSigmaZ2()*2.;
2934         //Double_t sy3=400*3./12., sy=0.1, sz=0.1;
2935         Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
2936         //Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]*60+0.5, sy=0.1, sz=0.1;
2937
2938         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
2939         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
2940         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
2941         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
2942         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
2943         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
2944
2945         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
2946         Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
2947         Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
2948         Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
2949
2950         c[0]=sy1;
2951         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
2952         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
2953         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
2954                        c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
2955         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
2956         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
2957         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
2958
2959         //      if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
2960
2961         UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
2962         AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, ns*alpha+shift);
2963
2964         track->fIsSeeding = kTRUE;
2965         track->fSeed1 = i1;
2966         track->fSeed2 = i2;
2967         track->fSeedType=3;
2968
2969
2970         //if (dsec==0) {
2971           FollowProlongation(*track, (i1+i2)/2,1);
2972           Int_t foundable,found,shared;
2973           track->GetClusterStatistic((i1+i2)/2,i1, found, foundable, shared, kTRUE);
2974           if ((found<0.55*foundable)  || shared>0.5*found || (track->GetSigmaY2()+track->GetSigmaZ2())>0.5){
2975             seed->Reset();
2976             seed->~AliTPCseed();
2977             continue;
2978           }
2979           //}
2980
2981         nin++;
2982         FollowProlongation(*track, i2,1);
2983
2984
2985         //Int_t rc = 1;
2986         track->fBConstrain =1;
2987         //      track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
2988         track->fLastPoint = i1;  // first cluster in track position
2989         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
2990
2991         if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
2992             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 ||
2993             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters() ) {
2994           seed->Reset();
2995           seed->~AliTPCseed();
2996           continue;
2997         }
2998         nout1++;
2999         // Z VERTEX CONDITION
3000         Double_t zv;
3001         zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3002           ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3003         if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]) {
3004           FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-20,0));
3005           zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3006             ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3007           if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]){
3008             FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-40,0));
3009             zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3010               ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3011             if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2] &&(track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.7)){
3012               // make seed without constrain
3013               AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,1.);
3014               FollowProlongation(*track2, i2,1);
3015               track2->fBConstrain = kFALSE;
3016               track2->fSeedType = 1;
3017               arr->AddLast(track2);
3018               seed->Reset();
3019               seed->~AliTPCseed();
3020               continue;
3021             }
3022             else{
3023               seed->Reset();
3024               seed->~AliTPCseed();
3025               continue;
3026
3027             }
3028           }
3029         }
3030
3031         track->fSeedType =0;
3032         arr->AddLast(track);
3033         seed = new AliTPCseed;
3034         nout2++;
3035         // don't consider other combinations
3036         if (track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.8)
3037           break;
3038       }
3039     }
3040   }
3041   if (fDebug>3){
3042     Info("MakeSeeds3","\nSeeding statistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2);
3043   }
3044   delete seed;
3045 }
3046
3047
3048 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds5(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
3049                                  Float_t deltay) {
3050
3051
3052
3053   //-----------------------------------------------------------------
3054   // This function creates track seeds.
3055   //-----------------------------------------------------------------
3056   // cuts[0]   - fP4 cut
3057   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3058   // cuts[2]   - zvertex cut
3059   // cuts[3]   - fP3 cut
3060
3061
3062   Int_t nin0  = 0;
3063   Int_t nin1  = 0;
3064   Int_t nin2  = 0;
3065   Int_t nin   = 0;
3066   Int_t nout1 = 0;
3067   Int_t nout2 = 0;
3068   Int_t nout3 =0;
3069   Double_t x[5], c[15];
3070   //
3071   // make temporary seed
3072   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3073   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3074   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3075   //
3076   //
3077
3078   // first 3 padrows
3079   Double_t x1 = GetXrow(i1-1);
3080   const    AliTPCRow& kr1=GetRow(sec,i1-1);
3081   Double_t y1max  = GetMaxY(i1-1)-kr1.fDeadZone-1.5;
3082   //
3083   Double_t x1p = GetXrow(i1);
3084   const    AliTPCRow& kr1p=GetRow(sec,i1);
3085   //
3086   Double_t x1m = GetXrow(i1-2);
3087   const    AliTPCRow& kr1m=GetRow(sec,i1-2);
3088
3089   //
3090   //last 3 padrow for seeding
3091   AliTPCRow&  kr3  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-7);
3092   Double_t    x3   =  GetXrow(i1-7);
3093   //  Double_t    y3max= GetMaxY(i1-7)-kr3.fDeadZone-1.5;
3094   //
3095   AliTPCRow&  kr3p  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-6);
3096   Double_t    x3p   = GetXrow(i1-6);
3097   //
3098   AliTPCRow&  kr3m  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-8);
3099   Double_t    x3m   = GetXrow(i1-8);
3100
3101   //
3102   //
3103   // middle padrow
3104   Int_t im = i1-4;                           //middle pad row index
3105   Double_t xm         = GetXrow(im);         // radius of middle pad-row
3106   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,im);   //middle pad -row
3107   //  Double_t ymmax = GetMaxY(im)-kr1.fDeadZone-1.5;
3108   //
3109   //
3110   Double_t deltax  = x1-x3;
3111   Double_t dymax   = deltax*cuts[1];
3112   Double_t dzmax   = deltax*cuts[3];
3113   //
3114   // loop over clusters
3115   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
3116     //
3117     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
3118     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();
3119     //
3120     if (deltay>0 && TMath::Abs(y1max-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
3121     //
3122     Int_t  index1 = TMath::Max(kr3.Find(z1-dzmax)-1,0);
3123     Int_t  index2 = TMath::Min(kr3.Find(z1+dzmax)+1,kr3);
3124     //
3125     Double_t y3,   z3;
3126     //
3127     //
3128     UInt_t index;
3129     for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
3130       const AliTPCclusterMI *kcl = kr3[js];
3131       if (kcl->IsUsed(10)) continue;
3132       y3 = kcl->GetY();
3133       // apply angular cuts
3134       if (TMath::Abs(y1-y3)>dymax) continue;
3135       x3 = x3;
3136       z3 = kcl->GetZ();
3137       if (TMath::Abs(z1-z3)>dzmax) continue;
3138       //
3139       Double_t angley = (y1-y3)/(x1-x3);
3140       Double_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3);
3141       //
3142       Double_t erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3143       Double_t errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3144       //
3145       Double_t yyym = angley*(xm-x1)+y1;
3146       Double_t zzzm = anglez*(xm-x1)+z1;
3147
3148       const AliTPCclusterMI *kcm = krm.FindNearest2(yyym,zzzm,erry,errz,index);
3149       if (!kcm) continue;
3150       if (kcm->IsUsed(10)) continue;
3151
3152       erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3153       errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3154       //
3155       //
3156       //
3157       Int_t used  =0;
3158       Int_t found =0;
3159       //
3160       // look around first
3161       const AliTPCclusterMI *kc1m = kr1m.FindNearest2(angley*(x1m-x1)+y1,
3162                                                       anglez*(x1m-x1)+z1,
3163                                                       erry,errz,index);
3164       //
3165       if (kc1m){
3166         found++;
3167         if (kc1m->IsUsed(10)) used++;
3168       }
3169       const AliTPCclusterMI *kc1p = kr1p.FindNearest2(angley*(x1p-x1)+y1,
3170                                                       anglez*(x1p-x1)+z1,
3171                                                       erry,errz,index);
3172       //
3173       if (kc1p){
3174         found++;
3175         if (kc1p->IsUsed(10)) used++;
3176       }
3177       if (used>1)  continue;
3178       if (found<1) continue;
3179
3180       //
3181       // look around last
3182       const AliTPCclusterMI *kc3m = kr3m.FindNearest2(angley*(x3m-x3)+y3,
3183                                                       anglez*(x3m-x3)+z3,
3184                                                       erry,errz,index);
3185       //
3186       if (kc3m){
3187         found++;
3188         if (kc3m->IsUsed(10)) used++;
3189       }
3190       else
3191         continue;
3192       const AliTPCclusterMI *kc3p = kr3p.FindNearest2(angley*(x3p-x3)+y3,
3193                                                       anglez*(x3p-x3)+z3,
3194                                                       erry,errz,index);
3195       //
3196       if (kc3p){
3197         found++;
3198         if (kc3p->IsUsed(10)) used++;
3199       }
3200       else
3201         continue;
3202       if (used>1)  continue;
3203       if (found<3) continue;
3204       //
3205       Double_t x2,y2,z2;
3206       x2 = xm;
3207       y2 = kcm->GetY();
3208       z2 = kcm->GetZ();
3209       //
3210
3211       x[0]=y1;
3212       x[1]=z1;
3213       x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3214       //if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;
3215       nin0++;
3216       //
3217       x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3218       nin1++;
3219       //
3220       x[3]=F3n(x1,y1,x2,y2,z1,z2,x[4]);
3221       //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3222       nin2++;
3223       //
3224       //
3225       Double_t sy1=0.1,  sz1=0.1;
3226       Double_t sy2=0.1,  sz2=0.1;
3227       Double_t sy3=0.1,  sy=0.1, sz=0.1;
3228
3229       Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3230       Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3231       Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3232       Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3233       Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3234       Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3235
3236       Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
3237       Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
3238       Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
3239       Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
3240
3241       c[0]=sy1;
3242       c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3243       c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3244       c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3245       c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3246       c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3247       c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3248       c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3249
3250       //        if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
3251
3252       UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
3253       AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3254
3255       track->fIsSeeding = kTRUE;
3256
3257       nin++;
3258       FollowProlongation(*track, i1-7,1);
3259       if (track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.75 ||
3260           track->fNShared>0.6*track->GetNumberOfClusters() || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.6){
3261         seed->Reset();
3262         seed->~AliTPCseed();
3263         continue;
3264       }
3265       nout1++;
3266       nout2++;
3267       //Int_t rc = 1;
3268       FollowProlongation(*track, i2,1);
3269       track->fBConstrain =0;
3270       track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3271       track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3272
3273       if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
3274           track->GetNumberOfClusters()<track->fNFoundable*0.7 ||
3275           track->fNShared>2. || track->GetChi2()/track->GetNumberOfClusters()>6 || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.5 ) {
3276         seed->Reset();
3277         seed->~AliTPCseed();
3278         continue;
3279       }
3280
3281       {
3282         FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-10,0),1);
3283         AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,0.9);
3284         FollowProlongation(*track2, i2,1);
3285         track2->fBConstrain = kFALSE;
3286         track2->fSeedType = 4;
3287         arr->AddLast(track2);
3288         seed->Reset();
3289         seed->~AliTPCseed();
3290       }
3291
3292
3293       //arr->AddLast(track);
3294       //seed = new AliTPCseed;
3295       nout3++;
3296     }
3297   }
3298
3299   if (fDebug>3){
3300     Info("MakeSeeds5","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2,nout3);
3301   }
3302   delete seed;
3303 }
3304
3305
3306 //_____________________________________________________________________________
3307 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds2(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2, Float_t */*cuts[4]*/,
3308                                  Float_t deltay, Bool_t /*bconstrain*/) {
3309   //-----------------------------------------------------------------
3310   // This function creates track seeds - without vertex constraint
3311   //-----------------------------------------------------------------
3312   // cuts[0]   - fP4 cut        - not applied
3313   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3314   // cuts[2]   - zvertex cut    - not applied
3315   // cuts[3]   - fP3 cut
3316   Int_t nin0=0;
3317   Int_t nin1=0;
3318   Int_t nin2=0;
3319   Int_t nin3=0;
3320   //  Int_t nin4=0;
3321   //Int_t nin5=0;
3322
3323
3324
3325   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3326   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3327   Int_t row0 = (i1+i2)/2;
3328   Int_t drow = (i1-i2)/2;
3329   const AliTPCRow& kr0=fSectors[sec][row0];
3330   AliTPCRow * kr=0;
3331
3332   AliTPCpolyTrack polytrack;
3333   Int_t nclusters=fSectors[sec][row0];
3334   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3335
3336   Int_t sumused=0;
3337   Int_t cused=0;
3338   Int_t cnused=0;
3339   for (Int_t is=0; is < nclusters; is++) {  //LOOP over clusters
3340     Int_t nfound =0;
3341     Int_t nfoundable =0;
3342     for (Int_t iter =1; iter<2; iter++){   //iterations
3343       const AliTPCRow& krm=fSectors[sec][row0-iter];
3344       const AliTPCRow& krp=fSectors[sec][row0+iter];
3345       const AliTPCclusterMI * cl= kr0[is];
3346
3347       if (cl->IsUsed(10)) {
3348         cused++;
3349       }
3350       else{
3351         cnused++;
3352       }
3353       Double_t x = kr0.GetX();
3354       // Initialization of the polytrack
3355       nfound =0;
3356       nfoundable =0;
3357       polytrack.Reset();
3358       //
3359       Double_t y0= cl->GetY();
3360       Double_t z0= cl->GetZ();
3361       Float_t erry = 0;
3362       Float_t errz = 0;
3363
3364       Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row0)-kr0.fDeadZone-1.5;
3365       if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
3366
3367       erry = (0.5)*cl->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;
3368       errz = (0.5)*cl->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;
3369       polytrack.AddPoint(x,y0,z0,erry, errz);
3370
3371       sumused=0;
3372       if (cl->IsUsed(10)) sumused++;
3373
3374
3375       Float_t roady = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()+0.2)+1.)*iter;
3376       Float_t roadz = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaZ2()+0.2)+1.)*iter;
3377       //
3378       x = krm.GetX();
3379       AliTPCclusterMI * cl1 = krm.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3380       if (cl1 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))) {
3381         erry = (0.5)*cl1->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;
3382         errz = (0.5)*cl1->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;
3383         if (cl1->IsUsed(10))  sumused++;
3384         polytrack.AddPoint(x,cl1->GetY(),cl1->GetZ(),erry,errz);
3385       }
3386       //
3387       x = krp.GetX();
3388       AliTPCclusterMI * cl2 = krp.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3389       if (cl2) {
3390         erry = (0.5)*cl2->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;
3391         errz = (0.5)*cl2->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;
3392         if (cl2->IsUsed(10)) sumused++;
3393         polytrack.AddPoint(x,cl2->GetY(),cl2->GetZ(),erry,errz);
3394       }
3395       //
3396       if (sumused>0) continue;
3397       nin0++;
3398       polytrack.UpdateParameters();
3399       // follow polytrack
3400       roadz = 1.2;
3401       roady = 1.2;
3402       //
3403       Double_t yn,zn;
3404       nfoundable = polytrack.GetN();
3405       nfound     = nfoundable;
3406       //
3407       for (Int_t ddrow = iter+1; ddrow<drow;ddrow++){
3408         Float_t maxdist = 0.8*(1.+3./(ddrow));
3409         for (Int_t delta = -1;delta<=1;delta+=2){
3410           Int_t row = row0+ddrow*delta;
3411           kr = &(fSectors[sec][row]);
3412           Double_t xn = kr->GetX();
3413           Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row)-kr->fDeadZone-1.5;
3414           polytrack.GetFitPoint(xn,yn,zn);
3415           if (TMath::Abs(yn)>ymax) continue;
3416           nfoundable++;
3417           AliTPCclusterMI * cln = kr->FindNearest(yn,zn,roady,roadz);
3418           if (cln) {
3419             Float_t dist =  TMath::Sqrt(  (yn-cln->GetY())*(yn-cln->GetY())+(zn-cln->GetZ())*(zn-cln->GetZ()));
3420             if (dist<maxdist){
3421               /*
3422               erry = (dist+0.3)*cln->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));
3423               errz = (dist+0.3)*cln->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));
3424               if (cln->IsUsed(10)) {
3425                 //      printf("used\n");
3426                 sumused++;
3427                 erry*=2;
3428                 errz*=2;
3429               }
3430               */
3431               erry=0.1;
3432               errz=0.1;
3433               polytrack.AddPoint(xn,cln->GetY(),cln->GetZ(),erry, errz);
3434               nfound++;
3435             }
3436           }
3437         }
3438         if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound) || (nfound<0.6*nfoundable))  break;
3439         polytrack.UpdateParameters();
3440       }
3441     }
3442     if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound))  {
3443       //printf("sumused   %d\n",sumused);
3444       continue;
3445     }
3446     nin1++;
3447     Double_t dy,dz;
3448     polytrack.GetFitDerivation(kr0.GetX(),dy,dz);
3449     AliTPCpolyTrack track2;
3450
3451     polytrack.Refit(track2,0.5+TMath::Abs(dy)*0.3,0.4+TMath::Abs(dz)*0.3);
3452     if (track2.GetN()<0.5*nfoundable) continue;
3453     nin2++;
3454
3455     if ((nfound>0.6*nfoundable) &&( nfoundable>0.4*(i1-i2))) {
3456       //
3457       // test seed with and without constrain
3458       for (Int_t constrain=0; constrain<=0;constrain++){
3459         // add polytrack candidate
3460
3461         Double_t x[5], c[15];
3462         Double_t x1,x2,x3,y1,y2,y3,z1,z2,z3;
3463         track2.GetBoundaries(x3,x1);
3464         x2 = (x1+x3)/2.;
3465         track2.GetFitPoint(x1,y1,z1);
3466         track2.GetFitPoint(x2,y2,z2);
3467         track2.GetFitPoint(x3,y3,z3);
3468         //
3469         //is track pointing to the vertex ?
3470         Double_t x0,y0,z0;
3471         x0=0;
3472         polytrack.GetFitPoint(x0,y0,z0);
3473
3474         if (constrain) {
3475           x2 = x3;
3476           y2 = y3;
3477           z2 = z3;
3478
3479           x3 = 0;
3480           y3 = 0;
3481           z3 = 0;
3482         }
3483         x[0]=y1;
3484         x[1]=z1;
3485         x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3486
3487         //      if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;  //
3488         x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3489
3490         //if (TMath::Abs(x[4]*x1-x[2]) >= cuts[1]) continue;
3491         //x[3]=F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
3492         x[3]=F3n(x1,y1,x3,y3,z1,z3,x[4]);
3493         //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3494
3495
3496         Double_t sy =0.1, sz =0.1;
3497         Double_t sy1=0.02, sz1=0.02;
3498         Double_t sy2=0.02, sz2=0.02;
3499         Double_t sy3=0.02;
3500
3501         if (constrain){
3502           sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
3503         }
3504
3505         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3506         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3507         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3508         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3509         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3510         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3511
3512         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x3,y3,z1,z3)-x[3])/sy;
3513         Double_t f31=(F3(x1,y1,x3,y3,z1+sz,z3)-x[3])/sz;
3514         Double_t f32=(F3(x1,y1,x3,y3+sy,z1,z3)-x[3])/sy;
3515         Double_t f34=(F3(x1,y1,x3,y3,z1,z3+sz)-x[3])/sz;
3516
3517
3518         c[0]=sy1;
3519         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3520         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3521         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3522         c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3523         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3524         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3525         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3526
3527         //Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x1);
3528         Int_t row1 = GetRowNumber(x1);
3529
3530         UInt_t index=0;
3531         //kr0.GetIndex(is);
3532         AliTPCseed *track=new (seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3533         track->fIsSeeding = kTRUE;
3534         Int_t rc=FollowProlongation(*track, i2);
3535         if (constrain) track->fBConstrain =1;
3536         else
3537           track->fBConstrain =0;
3538         track->fLastPoint = row1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3539         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3540
3541         if (rc==0 || track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 ||
3542             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 ||
3543             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters()) {
3544           //delete track;
3545           seed->Reset();
3546           seed->~AliTPCseed();
3547         }
3548         else {
3549           arr->AddLast(track);
3550           seed = new AliTPCseed;
3551         }
3552         nin3++;
3553       }
3554     }  // if accepted seed
3555   }
3556   if (fDebug>3){
3557     Info("MakeSeeds2","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin3);
3558   }
3559   delete seed;
3560 }
3561
3562
3563 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::MakeSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3564 {
3565   //
3566   //
3567   //reseed using track points
3568   Int_t p0 = int(r0*track->GetNumberOfClusters());     // point 0
3569   Int_t p1 = int(r1*track->GetNumberOfClusters());
3570   Int_t p2 = int(r2*track->GetNumberOfClusters());   // last point
3571   Int_t pp2=0;
3572   Double_t  x0[3],x1[3],x2[3];
3573   for (Int_t i=0;i<3;i++){
3574     x0[i]=-1;
3575     x1[i]=-1;
3576     x2[i]=-1;
3577   }
3578
3579   // find track position at given ratio of the length
3580   Int_t  sec0=0, sec1=0, sec2=0;
3581   Int_t index=-1;
3582   Int_t clindex;
3583   for (Int_t i=0;i<160;i++){
3584     if (track->fClusterPointer[i]){
3585       index++;
3586       AliTPCTrackerPoint   *trpoint =track->GetTrackPoint(i);
3587       if ( (index<p0) || x0[0]<0 ){
3588         if (trpoint->GetX()>1){
3589           clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3590           if (clindex>0){
3591             x0[0] = trpoint->GetX();
3592             x0[1] = trpoint->GetY();
3593             x0[2] = trpoint->GetZ();
3594             sec0  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3595           }
3596         }
3597       }
3598
3599       if ( (index<p1) &&(trpoint->GetX()>1)){
3600         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3601         if (clindex>0){
3602           x1[0] = trpoint->GetX();
3603           x1[1] = trpoint->GetY();
3604           x1[2] = trpoint->GetZ();
3605           sec1  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3606         }
3607       }
3608       if ( (index<p2) &&(trpoint->GetX()>1)){
3609         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3610         if (clindex>0){
3611           x2[0] = trpoint->GetX();
3612           x2[1] = trpoint->GetY();
3613           x2[2] = trpoint->GetZ();
3614           sec2  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3615           pp2 = i;
3616         }
3617       }
3618     }
3619   }
3620
3621   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3622   //