Restoring -Werror in case of gcc 3.x.x
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCtrackerMI.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16
17 //-------------------------------------------------------
18 //          Implementation of the TPC tracker
19 //
20 //   Origin: Marian Ivanov   Marian.Ivanov@cern.ch
21 // 
22 //  AliTPC parallel tracker
23 //-------------------------------------------------------
24
25
26 /* $Id$ */
27
28 #include "Riostream.h"
29 #include <TClonesArray.h>
30 #include <TFile.h>
31 #include <TObjArray.h>
32 #include <TTree.h>
33
34 #include "AliComplexCluster.h"
35 #include "AliESD.h"
36 #include "AliESDkink.h"
37 #include "AliHelix.h"
38 #include "AliRunLoader.h"
39 #include "AliTPCClustersRow.h"
40 #include "AliTPCParam.h"
41 #include "AliTPCReconstructor.h"
42 #include "AliTPCclusterMI.h"
43 #include "AliTPCpolyTrack.h"
44 #include "AliTPCreco.h"
45 #include "AliTPCseed.h" 
46 #include "AliTPCtrackerMI.h"
47 #include "TStopwatch.h"
48 #include "AliTPCReconstructor.h"
49 #include "AliESDkink.h"
50 #include "AliPID.h"
51 #include "TTreeStream.h"
52 #include "AliAlignObj.h"
53 #include "AliTrackPointArray.h"
54
55 //
56
57 ClassImp(AliTPCtrackerMI)
58
59
60 class AliTPCFastMath {
61 public:
62   AliTPCFastMath();  
63   static Double_t FastAsin(Double_t x);   
64  private: 
65   static Double_t fgFastAsin[20000];  //lookup table for fast asin computation
66 };
67
68 Double_t AliTPCFastMath::fgFastAsin[20000];
69 AliTPCFastMath gAliTPCFastMath; // needed to fill the LUT
70
71 AliTPCFastMath::AliTPCFastMath(){
72   //
73   // initialized lookup table;
74   for (Int_t i=0;i<10000;i++){
75     fgFastAsin[2*i] = TMath::ASin(i/10000.);
76     fgFastAsin[2*i+1] = (TMath::ASin((i+1)/10000.)-fgFastAsin[2*i]);
77   }
78 }
79
80 Double_t AliTPCFastMath::FastAsin(Double_t x){
81   //
82   // return asin using lookup table
83   if (x>0){
84     Int_t index = int(x*10000);
85     return fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1];
86   }
87   x*=-1;
88   Int_t index = int(x*10000);
89   return -(fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1]);
90 }
91
92
93
94
95 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateTrack(AliTPCseed * track, Int_t accept){
96   //
97   //update track information using current cluster - track->fCurrentCluster
98
99
100   AliTPCclusterMI* c =track->fCurrentCluster;
101   if (accept>0) track->fCurrentClusterIndex1 |=0x8000;  //sign not accepted clusters
102
103   UInt_t i = track->fCurrentClusterIndex1;
104
105   Int_t sec=(i&0xff000000)>>24; 
106   //Int_t row = (i&0x00ff0000)>>16; 
107   track->fRow=(i&0x00ff0000)>>16;
108   track->fSector = sec;
109   //  Int_t index = i&0xFFFF;
110   if (sec>=fParam->GetNInnerSector()) track->fRow += fParam->GetNRowLow(); 
111   track->SetClusterIndex2(track->fRow, i);  
112   //track->fFirstPoint = row;
113   //if ( track->fLastPoint<row) track->fLastPoint =row;
114   //  if (track->fRow<0 || track->fRow>160) {
115   //  printf("problem\n");
116   //}
117   if (track->fFirstPoint>track->fRow) 
118     track->fFirstPoint = track->fRow;
119   if (track->fLastPoint<track->fRow) 
120     track->fLastPoint  = track->fRow;
121   
122
123   track->fClusterPointer[track->fRow] = c;  
124   //
125
126   Double_t angle2 = track->GetSnp()*track->GetSnp();
127   angle2 = TMath::Sqrt(angle2/(1-angle2)); 
128   //
129   //SET NEW Track Point
130   //
131   //  if (debug)
132   {
133     AliTPCTrackerPoint   &point =*(track->GetTrackPoint(track->fRow));
134     //
135     point.SetSigmaY(c->GetSigmaY2()/track->fCurrentSigmaY2);
136     point.SetSigmaZ(c->GetSigmaZ2()/track->fCurrentSigmaZ2);
137     point.SetErrY(sqrt(track->fErrorY2));
138     point.SetErrZ(sqrt(track->fErrorZ2));
139     //
140     point.SetX(track->GetX());
141     point.SetY(track->GetY());
142     point.SetZ(track->GetZ());
143     point.SetAngleY(angle2);
144     point.SetAngleZ(track->GetTgl());
145     if (point.fIsShared){
146       track->fErrorY2 *= 4;
147       track->fErrorZ2 *= 4;
148     }
149   }  
150
151   Double_t chi2 = track->GetPredictedChi2(track->fCurrentCluster);
152   //
153   track->fErrorY2 *= 1.3;
154   track->fErrorY2 += 0.01;    
155   track->fErrorZ2 *= 1.3;   
156   track->fErrorZ2 += 0.005;      
157     //}
158   if (accept>0) return 0;
159   if (track->GetNumberOfClusters()%20==0){
160     //    if (track->fHelixIn){
161     //  TClonesArray & larr = *(track->fHelixIn);    
162     //  Int_t ihelix = larr.GetEntriesFast();
163     //  new(larr[ihelix]) AliHelix(*track) ;    
164     //}
165   }
166   track->fNoCluster =0;
167   return track->Update(c,chi2,i);
168 }
169
170
171
172 Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluster, Float_t factor, 
173                                       Float_t cory, Float_t corz)
174 {
175   //
176   // decide according desired precision to accept given 
177   // cluster for tracking
178   Double_t sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
179   Double_t sz2=ErrZ2(seed,cluster)*corz;
180   //sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
181   //sz2=ErrZ2(seed,cluster)*cory;
182   
183   Double_t sdistancey2 = sy2+seed->GetSigmaY2();
184   Double_t sdistancez2 = sz2+seed->GetSigmaZ2();
185   
186   Double_t rdistancey2 = (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())*
187     (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())/sdistancey2;
188   Double_t rdistancez2 = (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())*
189     (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())/sdistancez2;
190   
191   Double_t rdistance2  = rdistancey2+rdistancez2;
192   //Int_t  accept =0;
193   
194   if (rdistance2>16) return 3;
195   
196   
197   if ((rdistancey2>9.*factor || rdistancez2>9.*factor) && cluster->GetType()==0)  
198     return 2;  //suspisiouce - will be changed
199   
200   if ((rdistancey2>6.25*factor || rdistancez2>6.25*factor) && cluster->GetType()>0)  
201     // strict cut on overlaped cluster
202     return  2;  //suspisiouce - will be changed
203   
204   if ( (rdistancey2>1.*factor || rdistancez2>6.25*factor ) 
205        && cluster->GetType()<0){
206     seed->fNFoundable--;
207     return 2;    
208   }
209   return 0;
210 }
211
212
213
214
215 //_____________________________________________________________________________
216 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCParam *par): 
217 AliTracker(), fkNIS(par->GetNInnerSector()/2), fkNOS(par->GetNOuterSector()/2)
218 {
219   //---------------------------------------------------------------------
220   // The main TPC tracker constructor
221   //---------------------------------------------------------------------
222   fInnerSec=new AliTPCSector[fkNIS];         
223   fOuterSec=new AliTPCSector[fkNOS];
224  
225   Int_t i;
226   for (i=0; i<fkNIS; i++) fInnerSec[i].Setup(par,0);
227   for (i=0; i<fkNOS; i++) fOuterSec[i].Setup(par,1);
228
229   fN=0;  fSectors=0;
230
231   fSeeds=0;
232   fNtracks = 0;
233   fParam = par;  
234   Int_t nrowlow = par->GetNRowLow();
235   Int_t nrowup = par->GetNRowUp();
236
237   
238   for (Int_t i=0;i<nrowlow;i++){
239     fXRow[i]     = par->GetPadRowRadiiLow(i);
240     fPadLength[i]= par->GetPadPitchLength(0,i);
241     fYMax[i]     = fXRow[i]*TMath::Tan(0.5*par->GetInnerAngle());
242   }
243
244   
245   for (Int_t i=0;i<nrowup;i++){
246     fXRow[i+nrowlow]      = par->GetPadRowRadiiUp(i);
247     fPadLength[i+nrowlow] = par->GetPadPitchLength(60,i);
248     fYMax[i+nrowlow]      = fXRow[i+nrowlow]*TMath::Tan(0.5*par->GetOuterAngle());
249   }
250   fSeeds=0;
251   //
252   fInput    = 0;
253   fOutput   = 0;
254   fSeedTree = 0;
255   fTreeDebug =0;
256   fNewIO     =0;
257   fDebug     =0;
258   fEvent     =0;
259   fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("TPCdebug.root");
260 }
261 //________________________________________________________________________
262 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCtrackerMI &t):
263   AliTracker(t),
264   fkNIS(t.fkNIS),
265   fkNOS(t.fkNOS)
266 {
267   //------------------------------------
268   // dummy copy constructor
269   //------------------------------------------------------------------
270 }
271 AliTPCtrackerMI & AliTPCtrackerMI::operator=(const AliTPCtrackerMI& /*r*/){
272   //------------------------------
273   // dummy 
274   //--------------------------------------------------------------
275   return *this;
276 }
277 //_____________________________________________________________________________
278 AliTPCtrackerMI::~AliTPCtrackerMI() {
279   //------------------------------------------------------------------
280   // TPC tracker destructor
281   //------------------------------------------------------------------
282   delete[] fInnerSec;
283   delete[] fOuterSec;
284   if (fSeeds) {
285     fSeeds->Delete(); 
286     delete fSeeds;
287   }
288   if (fDebugStreamer) delete fDebugStreamer;
289 }
290
291 void AliTPCtrackerMI::SetIO()
292 {
293   //
294   fNewIO   =  kTRUE;
295   fInput   =  AliRunLoader::GetTreeR("TPC", kFALSE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
296   
297   fOutput  =  AliRunLoader::GetTreeT("TPC", kTRUE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
298   if (fOutput){
299     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
300     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
301     delete iotrack;
302   }
303 }
304
305
306 void AliTPCtrackerMI::SetIO(TTree * input, TTree * output, AliESD * event)
307 {
308
309   // set input
310   fNewIO = kFALSE;
311   fInput    = 0;
312   fOutput   = 0;
313   fSeedTree = 0;
314   fTreeDebug =0;
315   fInput = input;
316   if (input==0){
317     return;
318   }  
319   //set output
320   fOutput = output;
321   if (output){
322     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
323     //    iotrack->fHelixIn   = new TClonesArray("AliHelix");
324     //iotrack->fHelixOut  = new TClonesArray("AliHelix");    
325     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
326     delete iotrack;
327   }
328   if (output && (fDebug&2)){
329     //write the full seed information if specified in debug mode
330     //
331     fSeedTree =  new TTree("Seeds","Seeds");
332     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
333     //
334     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
335     arrtr->ExpandCreateFast(160);
336     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
337     //
338     vseed->fPoints = arrtr;
339     vseed->fEPoints = arre;
340     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
341     fSeedTree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
342     delete arrtr;
343     delete arre;    
344     fTreeDebug = new TTree("trackDebug","trackDebug");
345     TClonesArray * arrd = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint2",0);
346     fTreeDebug->Branch("debug",&arrd,32000,99);
347   }
348
349
350   //set ESD event  
351   fEvent  = event;  
352 }
353
354 void AliTPCtrackerMI::FillESD(TObjArray* arr)
355 {
356   //
357   //
358   //fill esds using updated tracks
359   if (fEvent){
360     // write tracks to the event
361     // store index of the track
362     Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
363     //FindKinks(arr,fEvent);
364     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
365       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
366       if (!pt) continue; 
367       pt->UpdatePoints();
368       //      pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
369       if (pt->GetKinkIndex(0)<=0){  //don't propagate daughter tracks 
370         pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
371       }
372  
373       if (( pt->GetPoints()[2]- pt->GetPoints()[0])>5 && pt->GetPoints()[3]>0.8){
374         AliESDtrack iotrack;
375         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
376         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
377         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
378         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
379         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
380         //iotrack.SetTPCindex(i);
381         fEvent->AddTrack(&iotrack);
382         continue;
383       }
384        
385       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>70)&& (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.55) {
386         AliESDtrack iotrack;
387         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
388         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
389         //iotrack.SetTPCindex(i);
390         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
391         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
392         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
393         fEvent->AddTrack(&iotrack);
394         continue;
395       } 
396       //
397       // short tracks  - maybe decays
398
399       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>30) && (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.70) {
400         Int_t found,foundable,shared;
401         pt->GetClusterStatistic(0,60,found, foundable,shared,kFALSE);
402         if ( (found>20) && (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())<0.2)){
403           AliESDtrack iotrack;
404           iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);    
405           //iotrack.SetTPCindex(i);
406           iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
407           iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
408           iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
409           //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
410           fEvent->AddTrack(&iotrack);
411           continue;
412         }
413       }       
414       
415       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>20) && (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.8) {
416         Int_t found,foundable,shared;
417         pt->GetClusterStatistic(0,60,found, foundable,shared,kFALSE);
418         if (found<20) continue;
419         if (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())>0.2) continue;
420         //
421         AliESDtrack iotrack;
422         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);      
423         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
424         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
425         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
426         //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
427         //iotrack.SetTPCindex(i);
428         fEvent->AddTrack(&iotrack);
429         continue;
430       }   
431       // short tracks  - secondaties
432       //
433       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>30) ) {
434         Int_t found,foundable,shared;
435         pt->GetClusterStatistic(128,158,found, foundable,shared,kFALSE);
436         if ( (found>20) && (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())<0.2) &&float(found)/float(foundable)>0.8){
437           AliESDtrack iotrack;
438           iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);    
439           iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
440           iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
441           iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
442           //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);       
443           //iotrack.SetTPCindex(i);
444           fEvent->AddTrack(&iotrack);
445           continue;
446         }
447       }       
448       
449       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>15)) {
450         Int_t found,foundable,shared;
451         pt->GetClusterStatistic(138,158,found, foundable,shared,kFALSE);
452         if (found<15) continue;
453         if (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())>0.2) continue;
454         if (float(found)/float(foundable)<0.8) continue;
455         //
456         AliESDtrack iotrack;
457         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);      
458         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
459         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
460         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
461         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
462         //iotrack.SetTPCindex(i);
463         fEvent->AddTrack(&iotrack);
464         continue;
465       }   
466     }
467   }
468   printf("Number of filled ESDs-\t%d\n",fEvent->GetNumberOfTracks());
469 }
470
471 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks(TTree * tree)
472 {
473   //
474   // write tracks from seed array to selected tree
475   //
476   fOutput  = tree;
477   if (fOutput){
478     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
479     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
480   }
481   WriteTracks();
482 }
483
484 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks()
485 {
486   //
487   // write tracks to the given output tree -
488   // output specified with SetIO routine
489   if (!fSeeds)  return;
490   if (!fOutput){
491     SetIO();
492   }
493
494   if (fOutput){
495     AliTPCtrack *iotrack= 0;
496     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
497     //for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
498     //  iotrack= (AliTPCtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
499     //  if (iotrack) break;      
500     //}    
501     //TBranch * br = fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
502     TBranch * br = fOutput->GetBranch("tracks");
503     br->SetAddress(&iotrack);
504     //
505     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
506       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);    
507       if (!pt) continue;    
508       AliTPCtrack * track = new AliTPCtrack(*pt);
509       iotrack = track;
510       pt->fLab2 =i; 
511       //      br->SetAddress(&iotrack);
512       fOutput->Fill();
513       delete track;
514       iotrack =0;
515     }
516     //fOutput->GetDirectory()->cd();
517     //fOutput->Write();
518   }
519   // delete iotrack;
520   //
521   if (fSeedTree){
522     //write the full seed information if specified in debug mode
523       
524     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
525     //
526     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
527     arrtr->ExpandCreateFast(160);
528     //TClonesArray * arrcl = new TClonesArray("AliTPCclusterMI",160);
529     //arrcl->ExpandCreateFast(160);
530     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
531     //
532     vseed->fPoints = arrtr;
533     vseed->fEPoints = arre;
534     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
535     //TBranch * brseed = seedtree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
536     TBranch * brseed = fSeedTree->GetBranch("seeds");
537     
538     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
539     
540     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
541       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);    
542       if (!pt) continue;     
543       pt->fPoints = arrtr;
544       //      pt->fClusterPoints = arrcl;
545       pt->fEPoints       = arre;
546       pt->RebuildSeed();
547       vseed = pt;
548       brseed->SetAddress(&vseed);
549       fSeedTree->Fill();
550       pt->fPoints  = 0;
551       pt->fEPoints = 0;
552       //      pt->fClusterPoints = 0;
553     }
554     fSeedTree->Write();
555     if (fTreeDebug) fTreeDebug->Write();
556   }
557
558 }
559   
560
561
562
563 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrY2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
564   //
565   //
566   //seed->SetErrorY2(0.1);
567   //return 0.1;
568   //calculate look-up table at the beginning
569   static Bool_t  ginit = kFALSE;
570   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
571   static Float_t ggg1[10000];
572   static Float_t ggg2[10000];
573   static Float_t ggg3[10000];
574   static Float_t glandau1[10000];
575   static Float_t glandau2[10000];
576   static Float_t glandau3[10000];
577   //
578   static Float_t gcor01[500];
579   static Float_t gcor02[500];
580   static Float_t gcorp[500];
581   //
582
583   //
584   if (ginit==kFALSE){
585     for (Int_t i=1;i<500;i++){
586       Float_t rsigma = float(i)/100.;
587       gcor02[i] = TMath::Max(0.78 +TMath::Exp(7.4*(rsigma-1.2)),0.6);
588       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(3.36*(rsigma-1.2)),0.6);
589       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
590     }
591
592     //
593     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
594       //
595       //
596       // inner sector
597       Float_t amp = float(i);
598       Float_t padlength =0.75;
599       gnoise1 = 0.0004/padlength;
600       Float_t nel     = 0.268*amp;
601       Float_t nprim   = 0.155*amp;
602       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
603       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
604       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
605       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;      
606       //
607       // outer short
608       padlength =1.;
609       gnoise2   = 0.0004/padlength;
610       nel       = 0.3*amp;
611       nprim     = 0.133*amp;
612       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
613       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
614       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
615       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
616       //
617       //
618       // outer long
619       padlength =1.5;
620       gnoise3   = 0.0004/padlength;
621       nel       = 0.3*amp;
622       nprim     = 0.133*amp;
623       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
624       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
625       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
626       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
627       //
628     }
629     ginit = kTRUE;
630   }
631   //
632   //
633   //
634   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));  
635   if (amp>9999) {
636     seed->SetErrorY2(1.);
637     return 1.;
638   }
639   Float_t snoise2;
640   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
641   Int_t ctype = cl->GetType();  
642   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
643   Double_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
644   angle2 = angle2/(1-angle2); 
645   //
646   //cluster "quality"
647   Int_t rsigmay = int(100.*cl->GetSigmaY2()/(seed->fCurrentSigmaY2));
648   Float_t res;
649   //
650   if (fSectors==fInnerSec){
651     snoise2 = gnoise1;
652     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;     
653     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmay];
654     if ((ctype>0)){
655       res+=0.002;
656       res*= gcorp[rsigmay];
657     }
658   }
659   else {
660     if (padlength<1.1){
661       snoise2 = gnoise2;
662       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2; 
663       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];      
664       if ((ctype>0)){
665         res+=0.002;
666         res*= gcorp[rsigmay];
667       }
668     }
669     else{
670       snoise2 = gnoise3;      
671       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2; 
672       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
673       if ((ctype>0)){
674         res+=0.002;
675         res*= gcorp[rsigmay];
676       }
677     }
678   }  
679
680   if (ctype<0){
681     res+=0.005;
682     res*=2.4;  // overestimate error 2 times
683   }
684   res+= snoise2;
685  
686   if (res<2*snoise2)
687     res = 2*snoise2;
688   
689   seed->SetErrorY2(res);
690   return res;
691
692
693 }
694
695
696
697 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
698   //
699   //
700   //seed->SetErrorY2(0.1);
701   //return 0.1;
702   //calculate look-up table at the beginning
703   static Bool_t  ginit = kFALSE;
704   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
705   static Float_t ggg1[10000];
706   static Float_t ggg2[10000];
707   static Float_t ggg3[10000];
708   static Float_t glandau1[10000];
709   static Float_t glandau2[10000];
710   static Float_t glandau3[10000];
711   //
712   static Float_t gcor01[1000];
713   static Float_t gcor02[1000];
714   static Float_t gcorp[1000];
715   //
716
717   //
718   if (ginit==kFALSE){
719     for (Int_t i=1;i<1000;i++){
720       Float_t rsigma = float(i)/100.;
721       gcor02[i] = TMath::Max(0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigma-1.2)),0.6);
722       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigma-1.2)),0.6);
723       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
724     }
725
726     //
727     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
728       //
729       //
730       // inner sector
731       Float_t amp = float(i);
732       Float_t padlength =0.75;
733       gnoise1 = 0.0004/padlength;
734       Float_t nel     = 0.268*amp;
735       Float_t nprim   = 0.155*amp;
736       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
737       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
738       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
739       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;      
740       //
741       // outer short
742       padlength =1.;
743       gnoise2   = 0.0004/padlength;
744       nel       = 0.3*amp;
745       nprim     = 0.133*amp;
746       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
747       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
748       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
749       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
750       //
751       //
752       // outer long
753       padlength =1.5;
754       gnoise3   = 0.0004/padlength;
755       nel       = 0.3*amp;
756       nprim     = 0.133*amp;
757       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
758       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
759       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
760       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
761       //
762     }
763     ginit = kTRUE;
764   }
765   //
766   //
767   //
768   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));  
769   if (amp>9999) {
770     seed->SetErrorY2(1.);
771     return 1.;
772   }
773   Float_t snoise2;
774   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
775   Int_t ctype = cl->GetType();  
776   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
777   //
778   Double_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
779   //  if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
780   angle2 = seed->GetTgl()*seed->GetTgl()*(1+angle2/(1-angle2)); 
781   //
782   //cluster "quality"
783   Int_t rsigmaz = int(100.*cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2));
784   Float_t res;
785   //
786   if (fSectors==fInnerSec){
787     snoise2 = gnoise1;
788     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;     
789     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmaz];
790     if ((ctype>0)){
791       res+=0.002;
792       res*= gcorp[rsigmaz];
793     }
794   }
795   else {
796     if (padlength<1.1){
797       snoise2 = gnoise2;
798       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2; 
799       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];      
800       if ((ctype>0)){
801         res+=0.002;
802         res*= gcorp[rsigmaz];
803       }
804     }
805     else{
806       snoise2 = gnoise3;      
807       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2; 
808       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
809       if ((ctype>0)){
810         res+=0.002;
811         res*= gcorp[rsigmaz];
812       }
813     }
814   }  
815
816   if (ctype<0){
817     res+=0.002;
818     res*=1.3;
819   }
820   if ((ctype<0) &&amp<70){
821     res+=0.002;
822     res*=1.3;  
823   }
824   res += snoise2;
825   if (res<2*snoise2)
826      res = 2*snoise2;
827   if (res>3) res =3;
828   seed->SetErrorZ2(res);
829   return res;
830 }
831
832
833
834 /*
835 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
836   //
837   //
838   //seed->SetErrorZ2(0.1);
839   //return 0.1;
840
841   Float_t snoise2;
842   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
843   //
844   Float_t rsigmaz = cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2);
845   Int_t ctype = cl->GetType();
846   Float_t amp = TMath::Abs(cl->GetQ());
847   
848   Float_t nel;
849   Float_t nprim;
850   //
851   Float_t landau=2 ;    //landau fluctuation part
852   Float_t gg=2;         // gg fluctuation part
853   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetX());
854  
855   if (fSectors==fInnerSec){
856     snoise2 = 0.0004/padlength;
857     nel     = 0.268*amp;
858     nprim   = 0.155*amp;
859     gg      = (2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
860     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
861     if (landau>1) landau=1;
862   }
863   else {
864     snoise2 = 0.0004/padlength;
865     nel     = 0.3*amp;
866     nprim   = 0.133*amp;
867     gg      = (2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
868     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
869     if (landau>1) landau=1;
870   }
871   Float_t sdiff = gg*fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*z;
872
873   //
874   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
875   angle2 = TMath::Sqrt((1-angle2));
876   if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
877   //angle2 = 1;
878
879   Float_t angle = seed->GetTgl()/angle2;
880   Float_t angular = landau*angle*angle*padlength*padlength/12.;
881   Float_t res = sdiff + angular;
882
883   
884   if ((ctype==0) && (fSectors ==fOuterSec))
885     res *= 0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigmaz-1.2));
886
887   if ((ctype==0) && (fSectors ==fInnerSec))
888     res *= 0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigmaz-1.2));
889   
890   if ((ctype>0)){
891     res+=0.005;
892     res*= TMath::Power(rsigmaz+0.5,1.5);  //0.31+0.147*ctype;
893   }
894   if (ctype<0){
895     res+=0.002;
896     res*=1.3;
897   }
898   if ((ctype<0) &&amp<70){
899     res+=0.002;
900     res*=1.3;  
901   }
902   res += snoise2;
903   if (res<2*snoise2)
904      res = 2*snoise2;
905
906   seed->SetErrorZ2(res);
907   return res;
908 }
909 */
910
911
912
913
914 void AliTPCtrackerMI::RotateToLocal(AliTPCseed *seed)
915 {
916   //rotate to track "local coordinata
917   Float_t x = seed->GetX();
918   Float_t y = seed->GetY();
919   Float_t ymax = x*TMath::Tan(0.5*fSectors->GetAlpha());
920   
921   if (y > ymax) {
922     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector+1) % fN;
923     if (!seed->Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
924       return;
925   } else if (y <-ymax) {
926     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector-1+fN) % fN;
927     if (!seed->Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
928       return;
929   }   
930
931 }
932
933
934
935 //_____________________________________________________________________________
936 Double_t AliTPCtrackerMI::F1old(Double_t x1,Double_t y1,
937                    Double_t x2,Double_t y2,
938                    Double_t x3,Double_t y3) 
939 {
940   //-----------------------------------------------------------------
941   // Initial approximation of the track curvature
942   //-----------------------------------------------------------------
943   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
944   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
945                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
946   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
947                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
948
949   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
950   if ( xr*xr+yr*yr<=0.00000000000001) return 100;
951   return -xr*yr/sqrt(xr*xr+yr*yr); 
952 }
953
954
955
956 //_____________________________________________________________________________
957 Double_t AliTPCtrackerMI::F1(Double_t x1,Double_t y1,
958                    Double_t x2,Double_t y2,
959                    Double_t x3,Double_t y3) 
960 {
961   //-----------------------------------------------------------------
962   // Initial approximation of the track curvature
963   //-----------------------------------------------------------------
964   x3 -=x1;
965   x2 -=x1;
966   y3 -=y1;
967   y2 -=y1;
968   //  
969   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
970   if (det==0) {
971     return 100;
972   }
973   //
974   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
975   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u;
976   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
977   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
978   if (det<0) c2*=-1;
979   return c2;
980 }
981
982
983 Double_t AliTPCtrackerMI::F2(Double_t x1,Double_t y1,
984                    Double_t x2,Double_t y2,
985                    Double_t x3,Double_t y3) 
986 {
987   //-----------------------------------------------------------------
988   // Initial approximation of the track curvature
989   //-----------------------------------------------------------------
990   x3 -=x1;
991   x2 -=x1;
992   y3 -=y1;
993   y2 -=y1;
994   //  
995   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
996   if (det==0) {
997     return 100;
998   }
999   //
1000   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
1001   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u; 
1002   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
1003   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
1004   if (det<0) c2*=-1;
1005   x0+=x1;
1006   x0*=c2;  
1007   return x0;
1008 }
1009
1010
1011
1012 //_____________________________________________________________________________
1013 Double_t AliTPCtrackerMI::F2old(Double_t x1,Double_t y1,
1014                    Double_t x2,Double_t y2,
1015                    Double_t x3,Double_t y3) 
1016 {
1017   //-----------------------------------------------------------------
1018   // Initial approximation of the track curvature times center of curvature
1019   //-----------------------------------------------------------------
1020   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
1021   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
1022                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
1023   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
1024                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
1025
1026   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
1027   
1028   return -a/(d*y1-b)*xr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
1029 }
1030
1031 //_____________________________________________________________________________
1032 Double_t AliTPCtrackerMI::F3(Double_t x1,Double_t y1, 
1033                    Double_t x2,Double_t y2,
1034                    Double_t z1,Double_t z2) 
1035 {
1036   //-----------------------------------------------------------------
1037   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1038   //-----------------------------------------------------------------
1039   return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1040 }
1041
1042
1043 Double_t AliTPCtrackerMI::F3n(Double_t x1,Double_t y1, 
1044                    Double_t x2,Double_t y2,
1045                    Double_t z1,Double_t z2, Double_t c) 
1046 {
1047   //-----------------------------------------------------------------
1048   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1049   //-----------------------------------------------------------------
1050
1051   //  Double_t angle1;
1052   
1053   //angle1    =  (z1-z2)*c/(TMath::ASin(c*x1-ni)-TMath::ASin(c*x2-ni));
1054   //
1055   Double_t d  =  TMath::Sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1056   if (TMath::Abs(d*c*0.5)>1) return 0;
1057   //  Double_t   angle2    =  TMath::ASin(d*c*0.5);
1058   //  Double_t   angle2    =  AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1059   Double_t   angle2    = (d*c*0.5>0.1)? TMath::ASin(d*c*0.5): AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1060
1061   angle2  = (z1-z2)*c/(angle2*2.);
1062   return angle2;
1063 }
1064
1065 Bool_t   AliTPCtrackerMI::GetProlongation(Double_t x1, Double_t x2, Double_t x[5], Double_t &y, Double_t &z)
1066 {//-----------------------------------------------------------------
1067   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=x2.
1068   //-----------------------------------------------------------------
1069   
1070   Double_t dx=x2-x1;
1071
1072   if (TMath::Abs(x[4]*x1 - x[2]) >= 0.999) {   
1073     return kFALSE;
1074   }
1075
1076   Double_t c1=x[4]*x1 - x[2], r1=sqrt(1.- c1*c1);
1077   Double_t c2=x[4]*x2 - x[2], r2=sqrt(1.- c2*c2);  
1078   y = x[0];
1079   z = x[1];
1080   
1081   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
1082   Double_t dz = 0;
1083   //
1084   Double_t delta = x[4]*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
1085   
1086   if (TMath::Abs(delta)>0.01){
1087     dz = x[3]*TMath::ASin(delta)/x[4];
1088   }else{
1089     dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1090   }
1091   
1092   //dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1093
1094   y+=dy;
1095   z+=dz;
1096   
1097   return kTRUE;  
1098 }
1099
1100 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters (TTree *tree)
1101 {
1102   //
1103   //
1104   fInput = tree;
1105   return LoadClusters();
1106 }
1107
1108 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters()
1109 {
1110   //
1111   // load clusters to the memory
1112   AliTPCClustersRow *clrow= new AliTPCClustersRow;
1113   clrow->SetClass("AliTPCclusterMI");
1114   clrow->SetArray(0);
1115   clrow->GetArray()->ExpandCreateFast(10000);
1116   //
1117   //  TTree * tree = fClustersArray.GetTree();
1118
1119   TTree * tree = fInput;
1120   TBranch * br = tree->GetBranch("Segment");
1121   br->SetAddress(&clrow);
1122   //
1123   Int_t j=Int_t(tree->GetEntries());
1124   for (Int_t i=0; i<j; i++) {
1125     br->GetEntry(i);
1126     //  
1127     Int_t sec,row;
1128     fParam->AdjustSectorRow(clrow->GetID(),sec,row);
1129     for (Int_t icl=0; icl<clrow->GetArray()->GetEntriesFast(); icl++){
1130       Transform((AliCluster*)(clrow->GetArray()->At(icl)));
1131     }
1132     //
1133     AliTPCRow * tpcrow=0;
1134     Int_t left=0;
1135     if (sec<fkNIS*2){
1136       tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);    
1137       left = sec/fkNIS;
1138     }
1139     else{
1140       tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1141       left = (sec-fkNIS*2)/fkNOS;
1142     }
1143     if (left ==0){
1144       tpcrow->fN1 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1145       tpcrow->fClusters1 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN1];
1146       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN1;i++) 
1147         tpcrow->fClusters1[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1148     }
1149     if (left ==1){
1150       tpcrow->fN2 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1151       tpcrow->fClusters2 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN2];
1152       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN2;i++) 
1153         tpcrow->fClusters2[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1154     }
1155   }
1156   //
1157   delete clrow;
1158   LoadOuterSectors();
1159   LoadInnerSectors();
1160   return 0;
1161 }
1162
1163
1164 void AliTPCtrackerMI::UnloadClusters()
1165 {
1166   //
1167   // unload clusters from the memory
1168   //
1169   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1170   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1171     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1172       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
1173       //      if (tpcrow){
1174       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1; 
1175       //        if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2; 
1176       //}
1177       tpcrow->ResetClusters();
1178     }
1179   //
1180   nrows = fInnerSec->GetNRows();
1181   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1182     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1183       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1184       //if (tpcrow){
1185       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1; 
1186       //if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2; 
1187       //}
1188       tpcrow->ResetClusters();
1189     }
1190
1191   return ;
1192 }
1193
1194 void   AliTPCtrackerMI::Transform(AliCluster * cluster){
1195   //
1196   // 
1197   //
1198   //if (!fParam->IsGeoRead()) fParam->ReadGeoMatrices();
1199   TGeoHMatrix  *mat = fParam->GetClusterMatrix(cluster->GetDetector());
1200   Double_t pos[3]= {cluster->GetX(),cluster->GetY(),cluster->GetZ()};
1201   Double_t posC[3];
1202   mat->LocalToMaster(pos,posC);
1203   cluster->SetX(posC[0]);
1204   cluster->SetY(posC[1]);
1205   cluster->SetZ(posC[2]);
1206 }
1207
1208 //_____________________________________________________________________________
1209 Int_t AliTPCtrackerMI::LoadOuterSectors() {
1210   //-----------------------------------------------------------------
1211   // This function fills outer TPC sectors with clusters.
1212   //-----------------------------------------------------------------
1213   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1214   UInt_t index=0;
1215   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1216     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1217       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);  
1218       Int_t sec2 = sec+2*fkNIS;
1219       //left
1220       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1221       while (ncl--) {
1222         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1223         index=(((sec2<<8)+row)<<16)+ncl;
1224         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1225       }
1226       //right
1227       ncl = tpcrow->fN2;
1228       while (ncl--) {
1229         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1230         index=((((sec2+fkNOS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1231         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1232       }
1233       //
1234       // write indexes for fast acces
1235       //
1236       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1237         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1238       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1239         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1240         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1241       }
1242       Int_t last = 0;
1243       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1244         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1245           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1246         else
1247           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1248       }
1249     }  
1250   fN=fkNOS;
1251   fSectors=fOuterSec;
1252   return 0;
1253 }
1254
1255
1256 //_____________________________________________________________________________
1257 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadInnerSectors() {
1258   //-----------------------------------------------------------------
1259   // This function fills inner TPC sectors with clusters.
1260   //-----------------------------------------------------------------
1261   Int_t nrows = fInnerSec->GetNRows();
1262   UInt_t index=0;
1263   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1264     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1265       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1266       //
1267       //left
1268       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1269       while (ncl--) {
1270         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1271         index=(((sec<<8)+row)<<16)+ncl;
1272         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1273       }
1274       //right
1275       ncl = tpcrow->fN2;
1276       while (ncl--) {
1277         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1278         index=((((sec+fkNIS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1279         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1280       }
1281       //
1282       // write indexes for fast acces
1283       //
1284       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1285         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1286       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1287         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1288         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1289       }
1290       Int_t last = 0;
1291       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1292         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1293           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1294         else
1295           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1296       }
1297
1298     }  
1299    
1300   fN=fkNIS;
1301   fSectors=fInnerSec;
1302   return 0;
1303 }
1304
1305
1306
1307 //_________________________________________________________________________
1308 AliTPCclusterMI *AliTPCtrackerMI::GetClusterMI(Int_t index) const {
1309   //--------------------------------------------------------------------
1310   //       Return pointer to a given cluster
1311   //--------------------------------------------------------------------
1312   Int_t sec=(index&0xff000000)>>24; 
1313   Int_t row=(index&0x00ff0000)>>16; 
1314   Int_t ncl=(index&0x00007fff)>>00;
1315
1316   const AliTPCRow * tpcrow=0;
1317   AliTPCclusterMI * clrow =0;
1318
1319   if (sec<0 || sec>=fkNIS*4) {
1320     AliWarning(Form("Wrong sector %d",sec));
1321     return 0x0;
1322   }
1323
1324   if (sec<fkNIS*2){
1325     tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1326     if (tpcrow==0) return 0;
1327
1328     if (sec<fkNIS) {
1329       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1330       clrow = tpcrow->fClusters1;
1331     }
1332     else {
1333       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1334       clrow = tpcrow->fClusters2;
1335     }
1336   }
1337   else {
1338     tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1339     if (tpcrow==0) return 0;
1340
1341     if (sec-2*fkNIS<fkNOS) {
1342       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1343       clrow = tpcrow->fClusters1;
1344     }
1345     else {
1346       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1347       clrow = tpcrow->fClusters2;
1348     }
1349   }
1350
1351   return &(clrow[ncl]);      
1352   
1353 }
1354
1355
1356
1357 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNext(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1358   //-----------------------------------------------------------------
1359   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1360   //-----------------------------------------------------------------
1361   //
1362   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1363   AliTPCclusterMI *cl=0;
1364   Int_t tpcindex= t.GetClusterIndex2(nr);
1365   //
1366   // update current shape info every 5 pad-row
1367   //  if ( (nr%5==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1368     GetShape(&t,nr);    
1369     //}
1370   //  
1371   if (fIteration>0 && tpcindex>=-1){  //if we have already clusters 
1372     //        
1373     if (tpcindex==-1) return 0; //track in dead zone
1374     if (tpcindex>0){     //
1375       cl = t.fClusterPointer[nr];
1376       if ( (cl==0) ) cl = GetClusterMI(tpcindex);
1377       t.fCurrentClusterIndex1 = tpcindex; 
1378     }
1379     if (cl){      
1380       Int_t relativesector = ((tpcindex&0xff000000)>>24)%18;  // if previously accepted cluster in different sector
1381       Float_t angle = relativesector*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift();
1382       //
1383       if (angle<-TMath::Pi()) angle += 2*TMath::Pi();
1384       if (angle>=TMath::Pi()) angle -= 2*TMath::Pi();
1385       
1386       if (TMath::Abs(angle-t.GetAlpha())>0.001){
1387         Double_t rotation = angle-t.GetAlpha();
1388         t.fRelativeSector= relativesector;
1389         if (!t.Rotate(rotation)) return 0;      
1390       }
1391       if (!t.PropagateTo(x)) return 0;
1392       //
1393       t.fCurrentCluster = cl; 
1394       t.fRow = nr;
1395       Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1396       if ((tpcindex&0x8000)==0) accept =0;
1397       if (accept<3) { 
1398         //if founded cluster is acceptible
1399         if (cl->IsUsed(11)) {  // id cluster is shared inrease uncertainty
1400           t.fErrorY2 += 0.03;
1401           t.fErrorZ2 += 0.03; 
1402           t.fErrorY2 *= 3;
1403           t.fErrorZ2 *= 3; 
1404         }
1405         t.fNFoundable++;
1406         UpdateTrack(&t,accept);
1407         return 1;
1408       }    
1409     }
1410   }
1411   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker()) return 0;  // cut on angle
1412   if (fIteration>1){
1413     // not look for new cluster during refitting    
1414     t.fNFoundable++; 
1415     return 0;
1416   }
1417   //
1418   UInt_t index=0;
1419   //  if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95 || TMath::Abs(x*t.GetC()-t.GetEta())>0.95) return 0;// patch 28 fev 06
1420   Double_t  y=t.GetYat(x);
1421   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1422     if (y > ymax) {
1423       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1424       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
1425         return 0;
1426     } else if (y <-ymax) {
1427       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1428       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
1429         return 0;
1430     }
1431     //return 1;
1432   }
1433   //
1434   if (!t.PropagateTo(x)) {
1435     if (fIteration==0) t.fRemoval = 10;
1436     return 0;
1437   }
1438   y=t.GetY(); 
1439   Double_t z=t.GetZ();
1440   //
1441   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1442   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1443   Double_t  roady  =1.;
1444   Double_t  roadz = 1.;
1445   //
1446   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1447     t.fInDead = kTRUE;
1448     t.SetClusterIndex2(nr,-1); 
1449     return 0;
1450   } 
1451   else
1452     {
1453       if (TMath::Abs(z)<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10) && TMath::Abs(z)<fParam->GetZLength() && (TMath::Abs(t.GetSnp())<AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker())) 
1454         t.fNFoundable++;
1455       else
1456         return 0;
1457     }   
1458   //calculate 
1459   if (krow) {
1460     //    cl = krow.FindNearest2(y+10.,z,roady,roadz,index);    
1461     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);    
1462     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);       
1463   }  
1464   if (cl) {
1465     t.fCurrentCluster = cl; 
1466     t.fRow = nr;
1467     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(10)) return 0; 
1468     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1469     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(11)) {
1470       t.fErrorY2 += 0.03;
1471       t.fErrorZ2 += 0.03; 
1472       t.fErrorY2 *= 3;
1473       t.fErrorZ2 *= 3; 
1474     }
1475     /*    
1476     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1477       //
1478       //     
1479
1480       t.fNShared++;
1481       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1482         t.fRemoval =10;
1483         return 0;
1484       }
1485     }
1486     */
1487     if (accept<3) UpdateTrack(&t,accept);
1488
1489   } else {  
1490     if ( fIteration==0 && t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) t.fRemoval=10;
1491     
1492   }
1493   return 1;
1494 }
1495
1496 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextFast(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1497   //-----------------------------------------------------------------
1498   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1499   //-----------------------------------------------------------------
1500   //
1501   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1502   Double_t y,z; 
1503   if (!t.GetProlongation(x,y,z)) {
1504     t.fRemoval = 10;
1505     return 0;
1506   }
1507   //
1508   //
1509   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1510     
1511     if (y > ymax) {
1512       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1513       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
1514         return 0;
1515     } else if (y <-ymax) {
1516       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1517       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
1518         return 0;
1519     }
1520     if (!t.PropagateTo(x)) {
1521       return 0;
1522     } 
1523     t.GetProlongation(x,y,z);
1524   }
1525   //
1526   // update current shape info every 3 pad-row
1527   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1528     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1529     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1530     GetShape(&t,nr);
1531   }
1532   //  
1533   AliTPCclusterMI *cl=0;
1534   UInt_t index=0;
1535   
1536   
1537   //Int_t nr2 = nr;
1538   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1539   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1540   Double_t  roady  =1.;
1541   Double_t  roadz = 1.;
1542   //
1543   Int_t row = nr;
1544   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1545     t.fInDead = kTRUE;
1546     t.SetClusterIndex2(row,-1); 
1547     return 0;
1548   } 
1549   else
1550     {
1551       if (TMath::Abs(z)>(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10)) t.SetClusterIndex2(row,-1);
1552     }   
1553   //calculate 
1554   
1555   if ((cl==0)&&(krow)) {
1556     //    cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,index);    
1557     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);    
1558
1559     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);       
1560   }  
1561
1562   if (cl) {
1563     t.fCurrentCluster = cl; 
1564     //    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);        
1565     //if (accept<3){
1566       t.SetClusterIndex2(row,index);
1567       t.fClusterPointer[row] = cl;
1568       //}
1569   }
1570   return 1;
1571 }
1572
1573
1574
1575 //_________________________________________________________________________
1576 Bool_t AliTPCtrackerMI::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint &p ) const
1577 {
1578   // Get track space point by index
1579   // return false in case the cluster doesn't exist
1580   AliTPCclusterMI *cl = GetClusterMI(index);
1581   if (!cl) return kFALSE;
1582   Int_t sector = (index&0xff000000)>>24;
1583   //  Int_t row = (index&0x00ff0000)>>16;
1584   Float_t xyz[3];
1585   //  xyz[0] = fParam->GetPadRowRadii(sector,row);
1586   xyz[0] = cl->GetX();
1587   xyz[1] = cl->GetY();
1588   xyz[2] = cl->GetZ();
1589   Float_t sin,cos;
1590   fParam->AdjustCosSin(sector,cos,sin);
1591   Float_t x = cos*xyz[0]-sin*xyz[1];
1592   Float_t y = cos*xyz[1]+sin*xyz[0];
1593   Float_t cov[6];
1594   Float_t sigmaY2 = 0.027*cl->GetSigmaY2();
1595   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) sigmaY2 *= 2.07;
1596   Float_t sigmaZ2 = 0.066*cl->GetSigmaZ2();
1597   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) sigmaZ2 *= 1.77;
1598   cov[0] = sin*sin*sigmaY2;
1599   cov[1] = -sin*cos*sigmaY2;
1600   cov[2] = 0.;
1601   cov[3] = cos*cos*sigmaY2;
1602   cov[4] = 0.;
1603   cov[5] = sigmaZ2;
1604   p.SetXYZ(x,y,xyz[2],cov);
1605   AliAlignObj::ELayerID iLayer;
1606   Int_t idet;
1607   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) {
1608     iLayer = AliAlignObj::kTPC1;
1609     idet = sector;
1610   }
1611   else {
1612     iLayer = AliAlignObj::kTPC2;
1613     idet = sector - fParam->GetNInnerSector();
1614   }
1615   UShort_t volid = AliAlignObj::LayerToVolUID(iLayer,idet);
1616   p.SetVolumeID(volid);
1617   return kTRUE;
1618 }
1619
1620
1621
1622 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateClusters(AliTPCseed& t,  Int_t nr) {
1623   //-----------------------------------------------------------------
1624   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1625   //-----------------------------------------------------------------
1626   t.fCurrentCluster  = 0;
1627   t.fCurrentClusterIndex1 = 0;   
1628    
1629   Double_t xt=t.GetX();
1630   Int_t     row = GetRowNumber(xt)-1; 
1631   Double_t  ymax= GetMaxY(nr);
1632
1633   if (row < nr) return 1; // don't prolongate if not information until now -
1634 //   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.9 && t.GetNumberOfClusters()>40. && fIteration!=2) {
1635 //     t.fRemoval =10;
1636 //     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1637 //   } 
1638 //   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95) {
1639 //     t.fRemoval =10;
1640 //     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1641 //   }// patch 28 fev 06
1642
1643   Double_t x= GetXrow(nr);
1644   Double_t y,z;
1645   //t.PropagateTo(x+0.02);
1646   //t.PropagateTo(x+0.01);
1647   if (!t.PropagateTo(x)){
1648     return 0;
1649   }
1650   //
1651   y=t.GetY();
1652   z=t.GetZ();
1653
1654   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1655     if (y > ymax) {
1656       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1657       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
1658         return 0;
1659     } else if (y <-ymax) {
1660       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1661       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
1662         return 0;
1663     }
1664     //    if (!t.PropagateTo(x)){
1665     //  return 0;
1666     //}
1667     return 1;
1668     //y = t.GetY();    
1669   }
1670   //
1671   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker()) return 0;
1672   AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1673
1674   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1675     t.fInDead = kTRUE;
1676     t.SetClusterIndex2(nr,-1); 
1677     return 0;
1678   } 
1679   else
1680     {
1681       if (TMath::Abs(t.GetZ())<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*t.GetX()+10) && (TMath::Abs(t.GetSnp())<AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker())) t.fNFoundable++;
1682       else
1683         return 0;      
1684     }
1685
1686   // update current
1687   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2){
1688     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1689     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1690     GetShape(&t,nr);
1691   }
1692     
1693   AliTPCclusterMI *cl=0;
1694   Int_t index=0;
1695   //
1696   Double_t roady = 1.;
1697   Double_t roadz = 1.;
1698   //
1699
1700   if (!cl){
1701     index = t.GetClusterIndex2(nr);    
1702     if ( (index>0) && (index&0x8000)==0){
1703       cl = t.fClusterPointer[nr];
1704       if ( (cl==0) && (index>0)) cl = GetClusterMI(index);
1705       t.fCurrentClusterIndex1 = index;
1706       if (cl) {
1707         t.fCurrentCluster  = cl;
1708         return 1;
1709       }
1710     }
1711   }
1712
1713   //  if (index<0) return 0;
1714   UInt_t uindex = TMath::Abs(index);
1715
1716   if (krow) {    
1717     //cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,uindex);      
1718     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,uindex);      
1719   }
1720
1721   if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(uindex);   
1722   t.fCurrentCluster  = cl;
1723
1724   return 1;
1725 }
1726
1727
1728 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextCluster(AliTPCseed & t, Int_t nr) {
1729   //-----------------------------------------------------------------
1730   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1731   //-----------------------------------------------------------------
1732
1733   //update error according neighborhoud
1734
1735   if (t.fCurrentCluster) {
1736     t.fRow = nr; 
1737     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1738     
1739     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1740       //
1741       //
1742       //  t.fErrorZ2*=2;
1743       //  t.fErrorY2*=2;
1744       t.fNShared++;
1745       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1746         t.fRemoval =10;
1747         return 0;
1748       }
1749     }   
1750     if (fIteration>0) accept = 0;
1751     if (accept<3)  UpdateTrack(&t,accept);  
1752  
1753   } else {
1754     if (fIteration==0){
1755       if ( ( (t.GetSigmaY2()+t.GetSigmaZ2())>0.16)&& t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;      
1756       if (  t.GetChi2()/t.GetNumberOfClusters()>6 &&t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;      
1757
1758       if (( (t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) || t.fNoCluster>15)) t.fRemoval=10;
1759     }
1760   }
1761   return 1;
1762 }
1763
1764
1765
1766 //_____________________________________________________________________________
1767 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1768   //-----------------------------------------------------------------
1769   // This function tries to find a track prolongation.
1770   //-----------------------------------------------------------------
1771   Double_t xt=t.GetX();
1772   //
1773   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1774   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();  
1775   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();  
1776   //
1777   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1778     
1779   Int_t first = GetRowNumber(xt)-1;
1780   for (Int_t nr= first; nr>=rf; nr-=step) {
1781     // update kink info
1782     if (t.GetKinkIndexes()[0]>0){
1783       for (Int_t i=0;i<3;i++){
1784         Int_t index = t.GetKinkIndexes()[i];
1785         if (index==0) break;
1786         if (index<0) continue;
1787         //
1788         AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
1789         if (!kink){
1790           printf("PROBLEM\n");
1791         }
1792         else{
1793           Int_t kinkrow = kink->GetTPCRow0()+2+Int_t(0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
1794           if (kinkrow==nr){
1795             AliExternalTrackParam paramd(t);
1796             kink->SetDaughter(paramd);
1797             kink->SetStatus(2,5);
1798             kink->Update();
1799           }
1800         }
1801       }
1802     }
1803
1804     if (nr==80) t.UpdateReference();
1805     if (nr<fInnerSec->GetNRows()) 
1806       fSectors = fInnerSec;
1807     else
1808       fSectors = fOuterSec;
1809     if (FollowToNext(t,nr)==0) 
1810       if (!t.IsActive()) 
1811         return 0;
1812     
1813   }   
1814   return 1;
1815 }
1816
1817
1818 //_____________________________________________________________________________
1819 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongationFast(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1820   //-----------------------------------------------------------------
1821   // This function tries to find a track prolongation.
1822   //-----------------------------------------------------------------
1823   Double_t xt=t.GetX();
1824   //
1825   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1826   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();  
1827   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();  
1828   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1829     
1830   for (Int_t nr=GetRowNumber(xt)-1; nr>=rf; nr-=step) {
1831     
1832     if (FollowToNextFast(t,nr)==0) 
1833       if (!t.IsActive()) return 0;
1834     
1835   }   
1836   return 1;
1837 }
1838
1839
1840
1841
1842
1843 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowBackProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf) {
1844   //-----------------------------------------------------------------
1845   // This function tries to find a track prolongation.
1846   //-----------------------------------------------------------------
1847   //
1848   Double_t xt=t.GetX();  
1849   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1850   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();  
1851   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();  
1852   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1853     
1854   Int_t first = t.fFirstPoint;
1855   if (first<GetRowNumber(xt)+1) first = GetRowNumber(xt)+1;
1856   //
1857   if (first<0) first=0;
1858   for (Int_t nr=first; nr<=rf; nr++) {
1859     //    if ( (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95)) break;//patch 28 fev 06
1860     if (t.GetKinkIndexes()[0]<0){
1861       for (Int_t i=0;i<3;i++){
1862         Int_t index = t.GetKinkIndexes()[i];
1863         if (index==0) break;
1864         if (index>0) continue;
1865         index = TMath::Abs(index);
1866         AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
1867         if (!kink){
1868           printf("PROBLEM\n");
1869         }
1870         else{
1871           Int_t kinkrow = kink->GetTPCRow0()-2-Int_t(0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
1872           if (kinkrow==nr){
1873             AliExternalTrackParam paramm(t);
1874             kink->SetMother(paramm);
1875             kink->SetStatus(2,1);
1876             kink->Update();
1877           }
1878         }
1879       }      
1880     }
1881     //
1882     if (nr<fInnerSec->GetNRows()) 
1883       fSectors = fInnerSec;
1884     else
1885       fSectors = fOuterSec;
1886     FollowToNext(t,nr);                                                             
1887   }   
1888   return 1;
1889 }
1890
1891
1892
1893
1894    
1895 Float_t AliTPCtrackerMI::OverlapFactor(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2, Int_t &sum1, Int_t & sum2)
1896 {
1897   //
1898   //
1899   sum1=0;
1900   sum2=0;
1901   Int_t sum=0;
1902   //
1903   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1904   dz2*=dz2;  
1905
1906   Float_t dy2 =TMath::Abs((s1->GetY() - s2->GetY()));
1907   dy2*=dy2;
1908   Float_t distance = TMath::Sqrt(dz2+dy2);
1909   if (distance>4.) return 0; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1910  
1911   //  Int_t offset =0;
1912   Int_t firstpoint = TMath::Min(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1913   Int_t lastpoint = TMath::Max(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1914   if (lastpoint>160) 
1915     lastpoint =160;
1916   if (firstpoint<0) 
1917     firstpoint = 0;
1918   if (firstpoint>lastpoint) {
1919     firstpoint =lastpoint;
1920     //    lastpoint  =160;
1921   }
1922     
1923   
1924   for (Int_t i=firstpoint-1;i<lastpoint+1;i++){
1925     if (s1->GetClusterIndex2(i)>0) sum1++;
1926     if (s2->GetClusterIndex2(i)>0) sum2++;
1927     if (s1->GetClusterIndex2(i)==s2->GetClusterIndex2(i) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1928       sum++;
1929     }
1930   }
1931   if (sum<5) return 0;
1932
1933   Float_t summin = TMath::Min(sum1+1,sum2+1);
1934   Float_t ratio = (sum+1)/Float_t(summin);
1935   return ratio;
1936 }
1937
1938 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2)
1939 {
1940   //
1941   //
1942   if (TMath::Abs(s1->GetC()-s2->GetC())>0.004) return;
1943   if (TMath::Abs(s1->GetTgl()-s2->GetTgl())>0.6) return;
1944
1945   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1946   dz2*=dz2;
1947   Float_t dy2 =(s1->GetY() - s2->GetY());
1948   dy2*=dy2;
1949   Float_t distance = dz2+dy2;
1950   if (distance>325.) return ; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1951   
1952   //
1953   Int_t sumshared=0;
1954   //
1955   Int_t firstpoint = TMath::Max(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1956   Int_t lastpoint = TMath::Min(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1957   //
1958   if (firstpoint>=lastpoint-5) return;;
1959
1960   for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1961     //    if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1962     if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1963       sumshared++;
1964     }
1965   }
1966   if (sumshared>4){
1967     // sign clusters
1968     //
1969     for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1970       //      if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1971       if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1972         AliTPCTrackerPoint *p1  = s1->GetTrackPoint(i);
1973         AliTPCTrackerPoint *p2  = s2->GetTrackPoint(i);; 
1974         if (s1->IsActive()&&s2->IsActive()){
1975           p1->fIsShared = kTRUE;
1976           p2->fIsShared = kTRUE;
1977         }       
1978       }
1979     }
1980   }
1981   //  
1982   if (sumshared>10){
1983     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1984       if (s1->fOverlapLabels[3*i]==0){
1985         s1->fOverlapLabels[3*i] = s2->GetLabel();
1986         s1->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1987         s1->fOverlapLabels[3*i+2] = s2->GetUniqueID();
1988         break;
1989       } 
1990     }
1991     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1992       if (s2->fOverlapLabels[3*i]==0){
1993         s2->fOverlapLabels[3*i] = s1->GetLabel();
1994         s2->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1995         s2->fOverlapLabels[3*i+2] = s1->GetUniqueID();
1996         break;
1997       } 
1998     }    
1999   }
2000   
2001 }
2002
2003 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(TObjArray * arr)
2004 {
2005   //
2006   //sort trackss according sectors
2007   //  
2008   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
2009     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2010     if (!pt) continue;
2011     //if (pt) RotateToLocal(pt);
2012     pt->fSort = 0;
2013   }
2014   arr->UnSort();
2015   arr->Sort();  // sorting according z
2016   arr->Expand(arr->GetEntries());
2017   //
2018   //
2019   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
2020   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2021     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2022     if (!pt) continue;
2023     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2024       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2025     }
2026   }
2027   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2028     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2029     if (!pt) continue;
2030     if (pt->fRemoval>10) continue;
2031     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2032       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2033       //      if (pt2){
2034       if (pt2->fRemoval<=10) {
2035         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2036         SignShared(pt,pt2);
2037       }
2038     }  
2039   }
2040 }
2041
2042 void  AliTPCtrackerMI::RemoveDouble(TObjArray * arr, Float_t factor1, Float_t factor2,  Int_t removalindex)
2043 {
2044   //
2045   //sort trackss according sectors
2046   //
2047   if (fDebug&1) {
2048     Info("RemoveDouble","Number of tracks before double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2049   }
2050   //
2051   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
2052     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2053     if (!pt) continue;
2054     pt->fSort = 0;
2055   }
2056   arr->UnSort();
2057   arr->Sort();  // sorting according z
2058   arr->Expand(arr->GetEntries());
2059   //
2060   //reset overlap labels
2061   //
2062   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
2063   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2064     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2065     if (!pt) continue;
2066     pt->SetUniqueID(i);
2067     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2068       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2069     }
2070   }
2071   //
2072   //sign shared tracks
2073   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2074     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2075     if (!pt) continue;
2076     if (pt->fRemoval>10) continue;
2077     Float_t deltac = pt->GetC()*0.1;
2078     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2079       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2080       //      if (pt2){
2081       if (pt2->fRemoval<=10) {
2082         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2083         if (TMath::Abs(pt->GetC()  -pt2->GetC())>deltac) continue;
2084         if (TMath::Abs(pt->GetTgl()-pt2->GetTgl())>0.05) continue;
2085         //
2086         SignShared(pt,pt2);
2087       }
2088     }
2089   }
2090   //
2091   // remove highly shared tracks
2092   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2093     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2094     if (!pt) continue;
2095     if (pt->fRemoval>10) continue;
2096     //
2097     Int_t sumshared =0;
2098     for (Int_t j=0;j<4;j++){
2099       sumshared = pt->fOverlapLabels[j*3+1];      
2100     }
2101     Float_t factor = factor1;
2102     if (pt->fRemoval>0) factor = factor2;
2103     if (sumshared/pt->GetNumberOfClusters()>factor){
2104       for (Int_t j=0;j<4;j++){
2105         if (pt->fOverlapLabels[3*j]==0) continue;
2106         if (pt->fOverlapLabels[3*j+1]<5) continue; 
2107         if (pt->fRemoval==removalindex) continue;      
2108         AliTPCseed * pt2 = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(pt->fOverlapLabels[3*j+2]);
2109         if (!pt2) continue;
2110         if (pt2->GetSigma2C()<pt->GetSigma2C()){
2111           //      pt->fRemoval = removalindex;
2112           delete arr->RemoveAt(i);        
2113           break;
2114         }
2115       }      
2116     }
2117   }
2118   arr->Compress();
2119   if (fDebug&1) {
2120     Info("RemoveDouble","Number of tracks after double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2121   }
2122 }
2123
2124
2125
2126
2127
2128
2129 void AliTPCtrackerMI::SortTracks(TObjArray * arr, Int_t mode) const
2130 {
2131   //
2132   //sort tracks in array according mode criteria
2133   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();    
2134   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2135     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2136     if (!pt) {
2137       continue;
2138     }
2139     pt->fSort = mode;
2140   }
2141   arr->UnSort();
2142   arr->Sort();
2143 }
2144
2145 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t removalindex)
2146 {
2147
2148   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2149   //
2150   //
2151   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();  
2152   Int_t good =0;
2153
2154   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2155     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2156     if (!pt) {
2157       delete arr->RemoveAt(i);
2158     }
2159     else{
2160       pt->fSort =1;
2161       pt->fBSigned = kFALSE;
2162     }
2163   }
2164   arr->Compress();
2165   nseed = arr->GetEntriesFast();
2166   arr->UnSort();
2167   arr->Sort();
2168   //
2169   //unsign used
2170   UnsignClusters();
2171   //
2172   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2173     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2174     if (!pt) {
2175       continue;
2176     }    
2177     Int_t found,foundable,shared;
2178     if (pt->IsActive()) 
2179       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kFALSE);
2180     else
2181       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kTRUE); 
2182     //
2183     Double_t factor = factor2;
2184     if (pt->fBConstrain) factor = factor1;
2185
2186     if ((Float_t(shared)/Float_t(found))>factor){
2187       pt->Desactivate(removalindex);
2188       continue;
2189     }
2190
2191     good++;
2192     for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2193       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2194       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2195       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];        
2196       if (!c) continue;
2197       //      if (!c->IsUsed(10)) c->Use(10);
2198       //if (pt->IsActive()) 
2199       c->Use(10);  
2200       //else
2201       //        c->Use(5);
2202     }
2203     
2204   }
2205   fNtracks = good;
2206   if (fDebug>0){
2207     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2208   }
2209 }
2210
2211
2212 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed2(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t minimal)
2213 {
2214
2215   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2216   //
2217   //
2218   UnsignClusters();
2219   //
2220   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();  
2221   Float_t * quality = new Float_t[nseed];
2222   Int_t   * indexes = new Int_t[nseed];
2223   Int_t good =0;
2224   //
2225   //
2226   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2227     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2228     if (!pt){
2229       quality[i]=-1;
2230       continue;
2231     }
2232     pt->UpdatePoints();    //select first last max dens points
2233     Float_t * points = pt->GetPoints();
2234     if (points[3]<0.8) quality[i] =-1;
2235     //
2236     quality[i] = (points[2]-points[0])+pt->GetNumberOfClusters();
2237   }
2238   TMath::Sort(nseed,quality,indexes);
2239   //
2240   //
2241   for (Int_t itrack=0; itrack<nseed; itrack++) {
2242     Int_t trackindex = indexes[itrack];
2243     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(trackindex);    
2244     if (quality[trackindex]<0){
2245       if (pt) {
2246         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2247       }
2248       else{
2249         arr->RemoveAt(trackindex);
2250       }
2251       continue;
2252     }
2253     //
2254     Int_t first = Int_t(pt->GetPoints()[0]);
2255     Int_t last  = Int_t(pt->GetPoints()[2]);
2256     Double_t factor = (pt->fBConstrain) ? factor1: factor2;
2257     //
2258     Int_t found,foundable,shared;
2259     pt->GetClusterStatistic(first,last, found, foundable,shared,kFALSE);
2260     Float_t sharedfactor = Float_t(shared+1)/Float_t(found+1);
2261     Bool_t itsgold =kFALSE;
2262     if (pt->fEsd){
2263       Int_t dummy[12];
2264       if (pt->fEsd->GetITSclusters(dummy)>4) itsgold= kTRUE;
2265     }
2266     if (!itsgold){
2267       //
2268       if (Float_t(shared+1)/Float_t(found+1)>factor){
2269         if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue;  //don't remove tracks  - part of the kinks
2270         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2271         continue;
2272       }      
2273       if (pt->GetNumberOfClusters()<50&&(found-0.5*shared)<minimal){  //remove short tracks
2274         if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue;  //don't remove tracks  - part of the kinks
2275         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2276         continue;
2277       }
2278     }
2279
2280     good++;
2281     if (sharedfactor>0.4) continue;
2282     if (pt->GetKinkIndexes()[0]>0) continue;
2283     for (Int_t i=first; i<last; i++) {
2284       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2285       // if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2286       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2287       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];        
2288       if (!c) continue;
2289       c->Use(10);  
2290     }    
2291   }
2292   fNtracks = good;
2293   if (fDebug>0){
2294     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2295   }
2296   delete []quality;
2297   delete []indexes;
2298 }
2299
2300 void AliTPCtrackerMI::UnsignClusters() 
2301 {
2302   //
2303   // loop over all clusters and unsign them
2304   //
2305   
2306   for (Int_t sec=0;sec<fkNIS;sec++){
2307     for (Int_t row=0;row<fInnerSec->GetNRows();row++){
2308       AliTPCclusterMI *cl = fInnerSec[sec][row].fClusters1;
2309       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN1;icl++)
2310         //      if (cl[icl].IsUsed(10))         
2311         cl[icl].Use(-1);
2312       cl = fInnerSec[sec][row].fClusters2;
2313       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN2;icl++)
2314         //if (cl[icl].IsUsed(10))       
2315           cl[icl].Use(-1);      
2316     }
2317   }
2318   
2319   for (Int_t sec=0;sec<fkNOS;sec++){
2320     for (Int_t row=0;row<fOuterSec->GetNRows();row++){
2321       AliTPCclusterMI *cl = fOuterSec[sec][row].fClusters1;
2322       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN1;icl++)
2323         //if (cl[icl].IsUsed(10))       
2324           cl[icl].Use(-1);
2325       cl = fOuterSec[sec][row].fClusters2;
2326       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN2;icl++)
2327         //if (cl[icl].IsUsed(10))       
2328         cl[icl].Use(-1);      
2329     }
2330   }
2331   
2332 }
2333
2334
2335
2336 void AliTPCtrackerMI::SignClusters(TObjArray * arr, Float_t fnumber, Float_t fdensity)
2337 {
2338   //
2339   //sign clusters to be "used"
2340   //
2341   // snumber and sdensity sign number of sigmas - bellow mean value to be accepted
2342   // loop over "primaries"
2343   
2344   Float_t sumdens=0;
2345   Float_t sumdens2=0;
2346   Float_t sumn   =0;
2347   Float_t sumn2  =0;
2348   Float_t sumchi =0;
2349   Float_t sumchi2 =0;
2350
2351   Float_t sum    =0;
2352
2353   TStopwatch timer;
2354   timer.Start();
2355
2356   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2357   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2358     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2359     if (!pt) {
2360       continue;
2361     }    
2362     if (!(pt->IsActive())) continue;
2363     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2364     if ( (dens>0.7) && (pt->GetNumberOfClusters()>70)){
2365       sumdens += dens;
2366       sumdens2+= dens*dens;
2367       sumn    += pt->GetNumberOfClusters();
2368       sumn2   += pt->GetNumberOfClusters()*pt->GetNumberOfClusters();
2369       Float_t chi2 = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2370       if (chi2>5) chi2=5;
2371       sumchi  +=chi2;
2372       sumchi2 +=chi2*chi2;
2373       sum++;
2374     }
2375   }
2376
2377   Float_t mdensity = 0.9;
2378   Float_t meann    = 130;
2379   Float_t meanchi  = 1;
2380   Float_t sdensity = 0.1;
2381   Float_t smeann    = 10;
2382   Float_t smeanchi  =0.4;
2383   
2384
2385   if (sum>20){
2386     mdensity = sumdens/sum;
2387     meann    = sumn/sum;
2388     meanchi  = sumchi/sum;
2389     //
2390     sdensity = sumdens2/sum-mdensity*mdensity;
2391     sdensity = TMath::Sqrt(sdensity);
2392     //
2393     smeann   = sumn2/sum-meann*meann;
2394     smeann   = TMath::Sqrt(smeann);
2395     //
2396     smeanchi = sumchi2/sum - meanchi*meanchi;
2397     smeanchi = TMath::Sqrt(smeanchi);
2398   }
2399
2400
2401   //REMOVE  SHORT DELTAS or tracks going out of sensitive volume of TPC
2402   //
2403   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2404     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2405     if (!pt) {
2406       continue;
2407     }
2408     if (pt->fBSigned) continue;
2409     if (pt->fBConstrain) continue;    
2410     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2411     /*
2412     Int_t found,foundable,shared;    
2413     pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared);
2414     if (shared/float(found)>0.3) {
2415       if (shared/float(found)>0.9 ){
2416         //delete arr->RemoveAt(i);
2417       }
2418       continue;
2419     }
2420     */
2421     Bool_t isok =kFALSE;
2422     if ( (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.5) &&pt->GetNumberOfClusters()>60)
2423       isok = kTRUE;
2424     if ((TMath::Abs(1/pt->GetC())<100.) && (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.7))
2425       isok =kTRUE;
2426     if  (TMath::Abs(pt->GetZ()/pt->GetX())>1.1)
2427       isok =kTRUE;
2428     if ( (TMath::Abs(pt->GetSnp()>0.7) && pt->GetD(0,0)>60.))
2429       isok =kTRUE;
2430     
2431     if (isok)     
2432       for (Int_t i=0; i<160; i++) {     
2433         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2434         if (index<0) continue;
2435         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2436         if (!c) continue;
2437         //if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();  
2438         c->Use(10);  
2439       }
2440   }
2441   
2442   
2443   //
2444   Double_t maxchi  = meanchi+2.*smeanchi;
2445
2446   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2447     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2448     if (!pt) {
2449       continue;
2450     }    
2451     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2452     if (pt->fBSigned) continue;
2453     Double_t chi     = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2454     if (chi>maxchi) continue;
2455
2456     Float_t bfactor=1;
2457     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2458    
2459     //sign only tracks with enoug big density at the beginning
2460     
2461     if ((pt->GetDensityFirst(40)<0.75) && pt->GetNumberOfClusters()<meann) continue; 
2462     
2463     
2464     Double_t mindens = TMath::Max(double(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor),0.65);
2465     Double_t minn    = TMath::Max(Int_t(meann-fnumber*smeann*bfactor),50);
2466    
2467     //    if (pt->fBConstrain) mindens = TMath::Max(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor,0.65);
2468     if ( (pt->fRemoval==10) && (pt->GetSnp()>0.8)&&(dens>mindens))
2469       minn=0;
2470
2471     if ((dens>mindens && pt->GetNumberOfClusters()>minn) && chi<maxchi ){
2472       //Int_t noc=pt->GetNumberOfClusters();
2473       pt->fBSigned = kTRUE;
2474       for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2475
2476         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2477         if (index<0) continue;
2478         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2479         if (!c) continue;
2480         //      if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();  
2481         c->Use(10);  
2482       }
2483     }
2484   }
2485   //  gLastCheck = nseed;
2486   //  arr->Compress();
2487   if (fDebug>0){
2488     timer.Print();
2489   }
2490 }
2491
2492
2493 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(TObjArray * arr, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1, Float_t th2) const
2494 {
2495   // stop not active tracks
2496   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2497   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows 
2498   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();  
2499   //
2500   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2501     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2502     if (!pt) {
2503       continue;
2504     }
2505     if (!(pt->IsActive())) continue;
2506     StopNotActive(pt,row0,th0, th1,th2);
2507   }
2508 }
2509
2510
2511
2512 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(AliTPCseed * seed, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1,
2513  Float_t th2) const
2514 {
2515   // stop not active tracks
2516   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2517   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows 
2518   Int_t sumgood1  = 0;
2519   Int_t sumgood2  = 0;
2520   Int_t foundable = 0;
2521   Int_t maxindex = seed->fLastPoint;  //last foundable row
2522   if (seed->fNFoundable*th0 > seed->GetNumberOfClusters()) {
2523     seed->Desactivate(10) ;
2524     return;
2525   }
2526
2527   for (Int_t i=row0; i<maxindex; i++){
2528     Int_t index = seed->GetClusterIndex2(i);
2529     if (index!=-1) foundable++;
2530     //if (!c) continue;
2531     if (foundable<=30) sumgood1++;
2532     if (foundable<=50) {
2533       sumgood2++;
2534     }
2535     else{ 
2536       break;
2537     }        
2538   }
2539   if (foundable>=30.){ 
2540      if (sumgood1<(th1*30.)) seed->Desactivate(10);
2541   }
2542   if (foundable>=50)
2543     if (sumgood2<(th2*50.)) seed->Desactivate(10);
2544 }
2545
2546
2547 Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESD *event)
2548 {
2549   //
2550   // back propagation of ESD tracks
2551   //
2552   //return 0;
2553   fEvent = event;
2554   ReadSeeds(event,2);
2555   fIteration=2;
2556   //PrepareForProlongation(fSeeds,1);
2557   PropagateForward2(fSeeds);
2558
2559   Int_t ntracks=0;
2560   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2561   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2562     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2563     if (!seed) continue;
2564     if (seed->GetKinkIndex(0)>0)  UpdateKinkQualityD(seed);  // update quality informations for kinks
2565
2566     seed->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
2567     seed->UpdatePoints();
2568     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2569     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2570     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2571     //
2572     if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>0 && seed!=0&&esd!=0) {
2573       TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
2574       cstream<<"Crefit"<<
2575         "Esd.="<<esd<<
2576         "Track.="<<seed<<
2577         "\n"; 
2578     }
2579     if (seed->GetNumberOfClusters()>15){
2580       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCrefit); 
2581       esd->SetTPCPoints(seed->GetPoints());
2582       esd->SetTPCPointsF(seed->fNFoundable);
2583       Int_t ndedx   = seed->fNCDEDX[0]+seed->fNCDEDX[1]+seed->fNCDEDX[2]+seed->fNCDEDX[3];
2584       Float_t sdedx = (seed->fSDEDX[0]+seed->fSDEDX[1]+seed->fSDEDX[2]+seed->fSDEDX[3])*0.25;
2585       Float_t dedx  = seed->GetdEdx();
2586       esd->SetTPCsignal(dedx, sdedx, ndedx);
2587       ntracks++;
2588     }
2589     else{
2590       //printf("problem\n");
2591     }
2592   }
2593   //FindKinks(fSeeds,event);
2594   Info("RefitInward","Number of refitted tracks %d",ntracks);
2595   fEvent =0;
2596   //WriteTracks();
2597   return 0;
2598 }
2599
2600
2601 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliESD *event)
2602 {
2603   //
2604   // back propagation of ESD tracks
2605   //
2606
2607   fEvent = event;
2608   fIteration = 1;
2609   ReadSeeds(event,1);
2610   PropagateBack(fSeeds); 
2611   RemoveUsed2(fSeeds,0.4,0.4,20);
2612   //
2613   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2614   Int_t ntracks=0;
2615   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2616     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2617     if (!seed) continue;
2618     if (seed->GetKinkIndex(0)<0)  UpdateKinkQualityM(seed);  // update quality informations for kinks
2619     seed->UpdatePoints();
2620     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2621     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2622     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2623     if (seed->GetNumberOfClusters()>15){
2624       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCout);
2625       esd->SetTPCPoints(seed->GetPoints());
2626       esd->SetTPCPointsF(seed->fNFoundable);
2627       Int_t ndedx   = seed->fNCDEDX[0]+seed->fNCDEDX[1]+seed->fNCDEDX[2]+seed->fNCDEDX[3];
2628       Float_t sdedx = (seed->fSDEDX[0]+seed->fSDEDX[1]+seed->fSDEDX[2]+seed->fSDEDX[3])*0.25;
2629       Float_t dedx  = seed->GetdEdx();
2630       esd->SetTPCsignal(dedx, sdedx, ndedx);
2631       ntracks++;
2632       Int_t eventnumber = event->GetEventNumber();// patch 28 fev 06
2633       (*fDebugStreamer)<<"Cback"<<
2634         "Tr0.="<<seed<<
2635         "EventNr="<<eventnumber<<
2636         "\n"; // patch 28 fev 06   
2637     }
2638   }
2639   //FindKinks(fSeeds,event);
2640   Info("PropagateBack","Number of back propagated tracks %d",ntracks);
2641   fEvent =0;
2642   //WriteTracks();
2643   return 0;
2644 }
2645
2646
2647 void AliTPCtrackerMI::DeleteSeeds()
2648 {
2649   //
2650   //delete Seeds
2651   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2652   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2653     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*)fSeeds->At(i);
2654     if (seed) delete fSeeds->RemoveAt(i);
2655   }
2656   delete fSeeds;
2657   fSeeds =0;
2658 }
2659
2660 void AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(AliESD *event, Int_t direction)
2661 {
2662   //
2663   //read seeds from the event
2664   
2665   Int_t nentr=event->GetNumberOfTracks();
2666   if (fDebug>0){
2667     Info("ReadSeeds", "Number of ESD tracks: %d\n", nentr);
2668   }
2669   if (fSeeds) 
2670     DeleteSeeds();
2671   if (!fSeeds){   
2672     fSeeds = new TObjArray(nentr);
2673   }
2674   UnsignClusters();
2675   //  Int_t ntrk=0;  
2676   for (Int_t i=0; i<nentr; i++) {
2677     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2678     ULong_t status=esd->GetStatus();
2679     if (!(status&AliESDtrack::kTPCin)) continue;
2680     AliTPCtrack t(*esd);
2681     t.SetNumberOfClusters(0);
2682     //    AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t,t.GetAlpha());
2683     AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t/*,t.GetAlpha()*/);
2684     for (Int_t ikink=0;ikink<3;ikink++) {
2685       Int_t index = esd->GetKinkIndex(ikink);
2686       seed->GetKinkIndexes()[ikink] = index;
2687       if (index==0) continue;
2688       index = TMath::Abs(index);
2689       AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
2690       if (kink&&esd->GetKinkIndex(ikink)<0){
2691         if ((status & AliESDtrack::kTRDrefit) != 0) kink->SetStatus(1,2);
2692         if ((status & AliESDtrack::kITSout) != 0)   kink->SetStatus(1,0);
2693       }
2694       if (kink&&esd->GetKinkIndex(ikink)>0){
2695         if ((status & AliESDtrack::kTRDrefit) != 0) kink->SetStatus(1,6);
2696         if ((status & AliESDtrack::kITSout) != 0)   kink->SetStatus(1,4);
2697       }
2698
2699     }
2700     if (((status&AliESDtrack::kITSout)==0)&&(direction==1)) seed->ResetCovariance(); 
2701     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) == 0 ) seed->ResetCovariance();
2702     if ( direction ==2 && ((status & AliESDtrack::kTPCout) == 0) ) {
2703       fSeeds->AddAt(0,i);
2704       delete seed;
2705       continue;    
2706     }
2707     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) > 0 )  {
2708       Double_t par0[5],par1[5],alpha,x;
2709       esd->GetInnerExternalParameters(alpha,x,par0);
2710       esd->GetExternalParameters(x,par1);
2711       Double_t delta1 = TMath::Abs(par0[4]-par1[4])/(0.000000001+TMath::Abs(par0[4]+par1[4]));
2712       Double_t delta2 = TMath::Abs(par0[3]-par1[3]);
2713       Double_t trdchi2=0;
2714       if (esd->GetTRDncls()>0) trdchi2 = esd->GetTRDchi2()/esd->GetTRDncls();
2715       //reset covariance if suspicious 
2716       if ( (delta1>0.1) || (delta2>0.006) ||trdchi2>7.)
2717         seed->ResetCovariance();
2718     }
2719
2720     //
2721     //
2722     // rotate to the local coordinate system
2723     //   
2724     fSectors=fInnerSec; fN=fkNIS;    
2725     Double_t alpha=seed->GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
2726     if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
2727     if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
2728     Int_t ns=Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha())%fN;
2729     alpha =ns*fSectors->GetAlpha() + fSectors->GetAlphaShift();
2730     if (alpha<-TMath::Pi()) alpha += 2*TMath::Pi();
2731     if (alpha>=TMath::Pi()) alpha -= 2*TMath::Pi();
2732     alpha-=seed->GetAlpha();  
2733     if (!seed->Rotate(alpha)) {
2734       delete seed;
2735       continue;
2736     }
2737     seed->fEsd = esd;
2738     // sign clusters
2739     if (esd->GetKinkIndex(0)<=0){
2740       for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
2741         Int_t index = seed->GetClusterIndex2(irow);    
2742         if (index>0){ 
2743           //
2744           AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(index);
2745           seed->fClusterPointer[irow] = cl;
2746           if (cl){
2747             if ((index & 0x8000)==0){
2748               cl->Use(10);  // accepted cluster   
2749             }else{
2750               cl->Use(6);   // close cluster not accepted
2751             }   
2752           }else{
2753             Info("ReadSeeds","Not found cluster");
2754           }
2755         }
2756       }
2757     }
2758     fSeeds->AddAt(seed,i);
2759   }
2760 }
2761
2762
2763
2764 //_____________________________________________________________________________
2765 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds3(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
2766                                  Float_t deltay, Int_t ddsec) {
2767   //-----------------------------------------------------------------
2768   // This function creates track seeds.
2769   // SEEDING WITH VERTEX CONSTRAIN 
2770   //-----------------------------------------------------------------
2771   // cuts[0]   - fP4 cut
2772   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
2773   // cuts[2]   - zvertex cut
2774   // cuts[3]   - fP3 cut
2775   Int_t nin0  = 0;
2776   Int_t nin1  = 0;
2777   Int_t nin2  = 0;
2778   Int_t nin   = 0;
2779   Int_t nout1 = 0;
2780   Int_t nout2 = 0;
2781
2782   Double_t x[5], c[15];
2783   //  Int_t di = i1-i2;
2784   //
2785   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
2786   Double_t alpha=fSectors->GetAlpha(), shift=fSectors->GetAlphaShift();
2787   Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
2788   //
2789   //  Double_t x1 =fOuterSec->GetX(i1);
2790   //Double_t xx2=fOuterSec->GetX(i2);
2791   
2792   Double_t x1 =GetXrow(i1);
2793   Double_t xx2=GetXrow(i2);
2794
2795   Double_t x3=GetX(), y3=GetY(), z3=GetZ();
2796
2797   Int_t imiddle = (i2+i1)/2;    //middle pad row index
2798   Double_t xm = GetXrow(imiddle); // radius of middle pad-row
2799   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,imiddle); //middle pad -row
2800   //
2801   Int_t ns =sec;   
2802
2803   const AliTPCRow& kr1=GetRow(ns,i1);
2804   Double_t ymax  = GetMaxY(i1)-kr1.fDeadZone-1.5;  
2805   Double_t ymaxm = GetMaxY(imiddle)-kr1.fDeadZone-1.5;  
2806
2807   //
2808   // change cut on curvature if it can't reach this layer
2809   // maximal curvature set to reach it
2810   Double_t dvertexmax  = TMath::Sqrt((x1-x3)*(x1-x3)+(ymax+5-y3)*(ymax+5-y3));
2811   if (dvertexmax*0.5*cuts[0]>0.85){
2812     cuts[0] = 0.85/(dvertexmax*0.5+1.);
2813   }
2814   Double_t r2min = 1/(cuts[0]*cuts[0]);  //minimal square of radius given by cut
2815
2816   //  Int_t ddsec = 1;
2817   if (deltay>0) ddsec = 0; 
2818   // loop over clusters  
2819   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
2820     //
2821     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
2822     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();    
2823     //if (TMath::Abs(y1)>ymax) continue;
2824
2825     if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
2826
2827     // find possible directions    
2828     Float_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3); 
2829     Float_t extraz = z1 - anglez*(x1-xx2);  // extrapolated z      
2830     //
2831     //
2832     //find   rotation angles relative to line given by vertex and point 1
2833     Double_t dvertex2 = (x1-x3)*(x1-x3)+(y1-y3)*(y1-y3);
2834     Double_t dvertex  = TMath::Sqrt(dvertex2);
2835     Double_t angle13  = TMath::ATan((y1-y3)/(x1-x3));
2836     Double_t cs13     = cos(-angle13), sn13 = sin(-angle13);            
2837     
2838     //
2839     // loop over 2 sectors
2840     Int_t dsec1=-ddsec;
2841     Int_t dsec2= ddsec;
2842     if (y1<0)  dsec2= 0;
2843     if (y1>0)  dsec1= 0;
2844     
2845     Double_t dddz1=0;  // direction of delta inclination in z axis
2846     Double_t dddz2=0;
2847     if ( (z1-z3)>0)
2848       dddz1 =1;    
2849     else
2850       dddz2 =1;
2851     //
2852     for (Int_t dsec = dsec1; dsec<=dsec2;dsec++){
2853       Int_t sec2 = sec + dsec;
2854       // 
2855       //      AliTPCRow&  kr2  = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][i2];
2856       //AliTPCRow&  kr2m = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][imiddle];
2857       AliTPCRow&  kr2  = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,i2);
2858       AliTPCRow&  kr2m = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,imiddle);
2859       Int_t  index1 = TMath::Max(kr2.Find(extraz-0.6-dddz1*TMath::Abs(z1)*0.05)-1,0);
2860       Int_t  index2 = TMath::Min(kr2.Find(extraz+0.6+dddz2*TMath::Abs(z1)*0.05)+1,kr2);
2861
2862       // rotation angles to p1-p3
2863       Double_t cs13r     = cos(-angle13+dsec*alpha)/dvertex, sn13r = sin(-angle13+dsec*alpha)/dvertex;            
2864       Double_t x2,   y2,   z2; 
2865       //
2866       //      Double_t dymax = maxangle*TMath::Abs(x1-xx2);
2867
2868       //
2869       Double_t dxx0 =  (xx2-x3)*cs13r;
2870       Double_t dyy0 =  (xx2-x3)*sn13r;
2871       for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
2872         const AliTPCclusterMI *kcl = kr2[js];
2873         if (kcl->IsUsed(10)) continue;  
2874         //
2875         //calcutate parameters
2876         //      
2877         Double_t yy0 =  dyy0 +(kcl->GetY()-y3)*cs13r;
2878         // stright track
2879         if (TMath::Abs(yy0)<0.000001) continue;
2880         Double_t xx0 =  dxx0 -(kcl->GetY()-y3)*sn13r;
2881         Double_t y0  =  0.5*(xx0*xx0+yy0*yy0-xx0)/yy0;
2882         Double_t r02 = (0.25+y0*y0)*dvertex2;   
2883         //curvature (radius) cut
2884         if (r02<r2min) continue;                
2885        
2886         nin0++; 
2887         //
2888         Double_t c0  = 1/TMath::Sqrt(r02);
2889         if (yy0>0) c0*=-1.;     
2890                
2891        
2892         //Double_t dfi0   = 2.*TMath::ASin(dvertex*c0*0.5);
2893         //Double_t dfi1   = 2.*TMath::ASin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);
2894         Double_t dfi0   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(dvertex*c0*0.5);
2895         Double_t dfi1   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);  
2896         //
2897         //
2898         Double_t z0  =  kcl->GetZ();  
2899         Double_t zzzz2    = z1-(z1-z3)*dfi1/dfi0;
2900         if (TMath::Abs(zzzz2-z0)>0.5) continue;       
2901         nin1++;              
2902         //      
2903         Double_t dip    = (z1-z0)*c0/dfi1;        
2904         Double_t x0 = (0.5*cs13+y0*sn13)*dvertex*c0;
2905         //
2906         y2 = kcl->GetY(); 
2907         if (dsec==0){
2908           x2 = xx2; 
2909           z2 = kcl->GetZ();       
2910         }
2911         else
2912           {
2913             // rotation 
2914             z2 = kcl->GetZ();  
2915             x2= xx2*cs-y2*sn*dsec;
2916             y2=+xx2*sn*dsec+y2*cs;
2917           }
2918         
2919         x[0] = y1;
2920         x[1] = z1;
2921         x[2] = x0;
2922         x[3] = dip;
2923         x[4] = c0;
2924         //
2925         //
2926         // do we have cluster at the middle ?
2927         Double_t ym,zm;
2928         GetProlongation(x1,xm,x,ym,zm);
2929         UInt_t dummy; 
2930         AliTPCclusterMI * cm=0;
2931         if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){      
2932           cm = krm.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2933           if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {        
2934             continue;
2935           }
2936         }
2937         else{     
2938           // rotate y1 to system 0
2939           // get state vector in rotated system 
2940           Double_t yr1  = (-0.5*sn13+y0*cs13)*dvertex*c0;
2941           Double_t xr2  =  x0*cs+yr1*sn*dsec;
2942           Double_t xr[5]={kcl->GetY(),kcl->GetZ(), xr2, dip, c0};
2943           //
2944           GetProlongation(xx2,xm,xr,ym,zm);
2945           if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){
2946             cm = kr2m.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2947             if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {      
2948               continue;
2949             }
2950           }
2951         }
2952        
2953
2954         Double_t dym = 0;
2955         Double_t dzm = 0;
2956         if (cm){
2957           dym = ym - cm->GetY();
2958           dzm = zm - cm->GetZ();
2959         }
2960         nin2++;
2961
2962
2963         //
2964         //
2965         Double_t sy1=kr1[is]->GetSigmaY2()*2., sz1=kr1[is]->GetSigmaZ2()*2.;
2966         Double_t sy2=kcl->GetSigmaY2()*2.,     sz2=kcl->GetSigmaZ2()*2.;
2967         //Double_t sy3=400*3./12., sy=0.1, sz=0.1;
2968         Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
2969         //Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]*60+0.5, sy=0.1, sz=0.1;
2970
2971         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
2972         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
2973         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
2974         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
2975         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
2976         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
2977         
2978         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
2979         Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
2980         Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
2981         Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
2982         
2983         c[0]=sy1;
2984         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
2985         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
2986         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
2987                        c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
2988         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
2989         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
2990         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
2991         
2992         //      if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
2993         
2994         UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
2995         AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, ns*alpha+shift);
2996         
2997         track->fIsSeeding = kTRUE;
2998         track->fSeed1 = i1;
2999         track->fSeed2 = i2;
3000         track->fSeedType=3;
3001
3002        
3003         //if (dsec==0) {
3004           FollowProlongation(*track, (i1+i2)/2,1);
3005           Int_t foundable,found,shared;
3006           track->GetClusterStatistic((i1+i2)/2,i1, found, foundable, shared, kTRUE);
3007           if ((found<0.55*foundable)  || shared>0.5*found || (track->GetSigmaY2()+track->GetSigmaZ2())>0.5){
3008             seed->Reset();
3009             seed->~AliTPCseed();
3010             continue;
3011           }
3012           //}
3013         
3014         nin++;
3015         FollowProlongation(*track, i2,1);
3016         
3017         
3018         //Int_t rc = 1;
3019         track->fBConstrain =1;
3020         //      track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3021         track->fLastPoint = i1;  // first cluster in track position
3022         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3023         
3024         if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 || 
3025             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 || 
3026             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters() ) {
3027           seed->Reset();
3028           seed->~AliTPCseed();
3029           continue;
3030         }
3031         nout1++;
3032         // Z VERTEX CONDITION
3033         Double_t zv;
3034         zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3035           ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3036         if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]) {
3037           FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-20,0));
3038           zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3039             ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3040           if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]){
3041             FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-40,0));
3042             zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3043               ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3044             if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2] &&(track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.7)){
3045               // make seed without constrain
3046               AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,1.);
3047               FollowProlongation(*track2, i2,1);
3048               track2->fBConstrain = kFALSE;
3049               track2->fSeedType = 1;
3050               arr->AddLast(track2); 
3051               seed->Reset();
3052               seed->~AliTPCseed();
3053               continue;         
3054             }
3055             else{
3056               seed->Reset();
3057               seed->~AliTPCseed();
3058               continue;
3059             
3060             }
3061           }
3062         }
3063         
3064         track->fSeedType =0;
3065         arr->AddLast(track); 
3066         seed = new AliTPCseed;  
3067         nout2++;
3068         // don't consider other combinations
3069         if (track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.8)
3070           break;
3071       }
3072     }
3073   }
3074   if (fDebug>3){
3075     Info("MakeSeeds3","\nSeeding statistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2);
3076   }
3077   delete seed;
3078 }
3079
3080
3081 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds5(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
3082                                  Float_t deltay) {
3083   
3084
3085
3086   //-----------------------------------------------------------------
3087   // This function creates track seeds.
3088   //-----------------------------------------------------------------
3089   // cuts[0]   - fP4 cut
3090   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3091   // cuts[2]   - zvertex cut
3092   // cuts[3]   - fP3 cut
3093
3094
3095   Int_t nin0  = 0;
3096   Int_t nin1  = 0;
3097   Int_t nin2  = 0;
3098   Int_t nin   = 0;
3099   Int_t nout1 = 0;
3100   Int_t nout2 = 0;
3101   Int_t nout3 =0;
3102   Double_t x[5], c[15];
3103   //
3104   // make temporary seed
3105   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3106   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3107   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3108   //
3109   //
3110
3111   // first 3 padrows
3112   Double_t x1 = GetXrow(i1-1);
3113   const    AliTPCRow& kr1=GetRow(sec,i1-1);
3114   Double_t y1max  = GetMaxY(i1-1)-kr1.fDeadZone-1.5;  
3115   //
3116   Double_t x1p = GetXrow(i1);
3117   const    AliTPCRow& kr1p=GetRow(sec,i1);
3118   //
3119   Double_t x1m = GetXrow(i1-2);
3120   const    AliTPCRow& kr1m=GetRow(sec,i1-2);
3121
3122   //
3123   //last 3 padrow for seeding
3124   AliTPCRow&  kr3  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-7);
3125   Double_t    x3   =  GetXrow(i1-7);
3126   //  Double_t    y3max= GetMaxY(i1-7)-kr3.fDeadZone-1.5;  
3127   //
3128   AliTPCRow&  kr3p  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-6);
3129   Double_t    x3p   = GetXrow(i1-6);
3130   //
3131   AliTPCRow&  kr3m  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-8);
3132   Double_t    x3m   = GetXrow(i1-8);
3133
3134   //
3135   //
3136   // middle padrow
3137   Int_t im = i1-4;                           //middle pad row index
3138   Double_t xm         = GetXrow(im);         // radius of middle pad-row
3139   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,im);   //middle pad -row
3140   //  Double_t ymmax = GetMaxY(im)-kr1.fDeadZone-1.5;  
3141   //
3142   //
3143   Double_t deltax  = x1-x3;
3144   Double_t dymax   = deltax*cuts[1];
3145   Double_t dzmax   = deltax*cuts[3];
3146   //
3147   // loop over clusters  
3148   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
3149     //
3150     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
3151     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();    
3152     //
3153     if (deltay>0 && TMath::Abs(y1max-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge    
3154     // 
3155     Int_t  index1 = TMath::Max(kr3.Find(z1-dzmax)-1,0);
3156     Int_t  index2 = TMath::Min(kr3.Find(z1+dzmax)+1,kr3);
3157     //    
3158     Double_t y3,   z3;
3159     //
3160     //
3161     UInt_t index;
3162     for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
3163       const AliTPCclusterMI *kcl = kr3[js];
3164       if (kcl->IsUsed(10)) continue;
3165       y3 = kcl->GetY(); 
3166       // apply angular cuts
3167       if (TMath::Abs(y1-y3)>dymax) continue;
3168       x3 = x3; 
3169       z3 = kcl->GetZ(); 
3170       if (TMath::Abs(z1-z3)>dzmax) continue;
3171       //
3172       Double_t angley = (y1-y3)/(x1-x3);
3173       Double_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3);
3174       //
3175       Double_t erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3176       Double_t errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3177       //
3178       Double_t yyym = angley*(xm-x1)+y1;
3179       Double_t zzzm = anglez*(xm-x1)+z1;
3180
3181       const AliTPCclusterMI *kcm = krm.FindNearest2(yyym,zzzm,erry,errz,index);
3182       if (!kcm) continue;
3183       if (kcm->IsUsed(10)) continue;
3184       
3185       erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3186       errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3187       //
3188       //
3189       //
3190       Int_t used  =0;
3191       Int_t found =0;
3192       //
3193       // look around first
3194       const AliTPCclusterMI *kc1m = kr1m.FindNearest2(angley*(x1m-x1)+y1,
3195                                                       anglez*(x1m-x1)+z1,
3196                                                       erry,errz,index);
3197       //
3198       if (kc1m){
3199         found++;
3200         if (kc1m->IsUsed(10)) used++;
3201       }
3202       const AliTPCclusterMI *kc1p = kr1p.FindNearest2(angley*(x1p-x1)+y1,
3203                                                       anglez*(x1p-x1)+z1,
3204                                                       erry,errz,index);
3205       //
3206       if (kc1p){
3207         found++;
3208         if (kc1p->IsUsed(10)) used++;
3209       }
3210       if (used>1)  continue;
3211       if (found<1) continue; 
3212
3213       //
3214       // look around last
3215       const AliTPCclusterMI *kc3m = kr3m.FindNearest2(angley*(x3m-x3)+y3,
3216                                                       anglez*(x3m-x3)+z3,
3217                                                       erry,errz,index);
3218       //
3219       if (kc3m){
3220         found++;
3221         if (kc3m->IsUsed(10)) used++;
3222       }
3223       else 
3224         continue;
3225       const AliTPCclusterMI *kc3p = kr3p.FindNearest2(angley*(x3p-x3)+y3,
3226                                                       anglez*(x3p-x3)+z3,
3227                                                       erry,errz,index);
3228       //
3229       if (kc3p){
3230         found++;
3231         if (kc3p->IsUsed(10)) used++;
3232       }
3233       else 
3234         continue;
3235       if (used>1)  continue;
3236       if (found<3) continue;       
3237       //
3238       Double_t x2,y2,z2;
3239       x2 = xm;
3240       y2 = kcm->GetY();
3241       z2 = kcm->GetZ();
3242       //
3243                         
3244       x[0]=y1;
3245       x[1]=z1;
3246       x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3247       //if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;
3248       nin0++;
3249       //
3250       x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3251       nin1++;
3252       //
3253       x[3]=F3n(x1,y1,x2,y2,z1,z2,x[4]);
3254       //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3255       nin2++;
3256       //
3257       //
3258       Double_t sy1=0.1,  sz1=0.1;
3259       Double_t sy2=0.1,  sz2=0.1;
3260       Double_t sy3=0.1,  sy=0.1, sz=0.1;
3261       
3262       Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3263       Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3264       Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3265       Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3266       Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3267       Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3268       
3269       Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
3270       Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
3271       Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
3272       Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
3273       
3274       c[0]=sy1;
3275       c[1]=0.;       c[2]=sz1; 
3276       c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3277       c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3278       c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3279       c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3280       c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3281       c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3282       
3283       //        if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
3284       
3285       UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
3286       AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3287       
3288       track->fIsSeeding = kTRUE;
3289
3290       nin++;      
3291       FollowProlongation(*track, i1-7,1);
3292       if (track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.75 || 
3293           track->fNShared>0.6*track->GetNumberOfClusters() || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.6){
3294         seed->Reset();
3295         seed->~AliTPCseed();
3296         continue;
3297       }
3298       nout1++;
3299       nout2++;  
3300       //Int_t rc = 1;
3301       FollowProlongation(*track, i2,1);
3302       track->fBConstrain =0;
3303       track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3304       track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3305       
3306       if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 || 
3307           track->GetNumberOfClusters()<track->fNFoundable*0.7 || 
3308           track->fNShared>2. || track->GetChi2()/track->GetNumberOfClusters()>6 || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.5 ) {
3309         seed->Reset();
3310         seed->~AliTPCseed();
3311         continue;
3312       }
3313    
3314       {
3315         FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-10,0),1);
3316         AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,0.9);
3317         FollowProlongation(*track2, i2,1);
3318         track2->fBConstrain = kFALSE;
3319         track2->fSeedType = 4;
3320         arr->AddLast(track2); 
3321         seed->Reset();
3322         seed->~AliTPCseed();
3323       }
3324       
3325    
3326       //arr->AddLast(track); 
3327       //seed = new AliTPCseed;  
3328       nout3++;
3329     }
3330   }
3331   
3332   if (fDebug>3){
3333     Info("MakeSeeds5","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2,nout3);
3334   }
3335   delete seed;
3336 }
3337
3338
3339 //_____________________________________________________________________________
3340 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds2(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2, Float_t */*cuts[4]*/,
3341                                  Float_t deltay, Bool_t /*bconstrain*/) {
3342   //-----------------------------------------------------------------
3343   // This function creates track seeds - without vertex constraint
3344   //-----------------------------------------------------------------
3345   // cuts[0]   - fP4 cut        - not applied
3346   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3347   // cuts[2]   - zvertex cut    - not applied 
3348   // cuts[3]   - fP3 cut
3349   Int_t nin0=0;
3350   Int_t nin1=0;
3351   Int_t nin2=0;
3352   Int_t nin3=0;
3353   //  Int_t nin4=0;
3354   //Int_t nin5=0;
3355
3356   
3357
3358   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3359   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3360   Int_t row0 = (i1+i2)/2;
3361   Int_t drow = (i1-i2)/2;
3362   const AliTPCRow& kr0=fSectors[sec][row0];
3363   AliTPCRow * kr=0;
3364
3365   AliTPCpolyTrack polytrack;
3366   Int_t nclusters=fSectors[sec][row0];
3367   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3368
3369   Int_t sumused=0;
3370   Int_t cused=0;
3371   Int_t cnused=0;
3372   for (Int_t is=0; is < nclusters; is++) {  //LOOP over clusters
3373     Int_t nfound =0;
3374     Int_t nfoundable =0;
3375     for (Int_t iter =1; iter<2; iter++){   //iterations
3376       const AliTPCRow& krm=fSectors[sec][row0-iter];
3377       const AliTPCRow& krp=fSectors[sec][row0+iter];      
3378       const AliTPCclusterMI * cl= kr0[is];
3379       
3380       if (cl->IsUsed(10)) {
3381         cused++;
3382       }
3383       else{
3384         cnused++;
3385       }
3386       Double_t x = kr0.GetX();
3387       // Initialization of the polytrack
3388       nfound =0;
3389       nfoundable =0;
3390       polytrack.Reset();
3391       //
3392       Double_t y0= cl->GetY();
3393       Double_t z0= cl->GetZ();
3394       Float_t erry = 0;
3395       Float_t errz = 0;
3396       
3397       Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row0)-kr0.fDeadZone-1.5;
3398       if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
3399       
3400       erry = (0.5)*cl->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;      
3401       errz = (0.5)*cl->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;      
3402       polytrack.AddPoint(x,y0,z0,erry, errz);
3403
3404       sumused=0;
3405       if (cl->IsUsed(10)) sumused++;
3406
3407
3408       Float_t roady = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()+0.2)+1.)*iter;
3409       Float_t roadz = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaZ2()+0.2)+1.)*iter;
3410       //
3411       x = krm.GetX();
3412       AliTPCclusterMI * cl1 = krm.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3413       if (cl1 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))) {
3414         erry = (0.5)*cl1->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;          
3415         errz = (0.5)*cl1->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;
3416         if (cl1->IsUsed(10))  sumused++;
3417         polytrack.AddPoint(x,cl1->GetY(),cl1->GetZ(),erry,errz);
3418       }
3419       //
3420       x = krp.GetX();
3421       AliTPCclusterMI * cl2 = krp.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3422       if (cl2) {
3423         erry = (0.5)*cl2->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;          
3424         errz = (0.5)*cl2->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;
3425         if (cl2->IsUsed(10)) sumused++;  
3426         polytrack.AddPoint(x,cl2->GetY(),cl2->GetZ(),erry,errz);
3427       }
3428       //
3429       if (sumused>0) continue;
3430       nin0++;
3431       polytrack.UpdateParameters();
3432       // follow polytrack
3433       roadz = 1.2;
3434       roady = 1.2;
3435       //
3436       Double_t yn,zn;
3437       nfoundable = polytrack.GetN();
3438       nfound     = nfoundable; 
3439       //
3440       for (Int_t ddrow = iter+1; ddrow<drow;ddrow++){
3441         Float_t maxdist = 0.8*(1.+3./(ddrow));
3442         for (Int_t delta = -1;delta<=1;delta+=2){
3443           Int_t row = row0+ddrow*delta;
3444           kr = &(fSectors[sec][row]);
3445           Double_t xn = kr->GetX();
3446           Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row)-kr->fDeadZone-1.5;
3447           polytrack.GetFitPoint(xn,yn,zn);
3448           if (TMath::Abs(yn)>ymax) continue;
3449           nfoundable++;
3450           AliTPCclusterMI * cln = kr->FindNearest(yn,zn,roady,roadz);
3451           if (cln) {
3452             Float_t dist =  TMath::Sqrt(  (yn-cln->GetY())*(yn-cln->GetY())+(zn-cln->GetZ())*(zn-cln->GetZ()));
3453             if (dist<maxdist){
3454               /*
3455               erry = (dist+0.3)*cln->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));         
3456               errz = (dist+0.3)*cln->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));
3457               if (cln->IsUsed(10)) {
3458                 //      printf("used\n");
3459                 sumused++;
3460                 erry*=2;
3461                 errz*=2;
3462               }
3463               */
3464               erry=0.1;
3465               errz=0.1;
3466               polytrack.AddPoint(xn,cln->GetY(),cln->GetZ(),erry, errz);
3467               nfound++;
3468             }
3469           }
3470         }
3471         if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound) || (nfound<0.6*nfoundable))  break;     
3472         polytrack.UpdateParameters();
3473       }           
3474     }
3475     if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound))  {
3476       //printf("sumused   %d\n",sumused);
3477       continue;
3478     }
3479     nin1++;
3480     Double_t dy,dz;
3481     polytrack.GetFitDerivation(kr0.GetX(),dy,dz);
3482     AliTPCpolyTrack track2;
3483     
3484     polytrack.Refit(track2,0.5+TMath::Abs(dy)*0.3,0.4+TMath::Abs(dz)*0.3);
3485     if (track2.GetN()<0.5*nfoundable) continue;
3486     nin2++;
3487
3488     if ((nfound>0.6*nfoundable) &&( nfoundable>0.4*(i1-i2))) {
3489       //
3490       // test seed with and without constrain
3491       for (Int_t constrain=0; constrain<=0;constrain++){
3492         // add polytrack candidate
3493
3494         Double_t x[5], c[15];
3495         Double_t x1,x2,x3,y1,y2,y3,z1,z2,z3;
3496         track2.GetBoundaries(x3,x1);    
3497         x2 = (x1+x3)/2.;
3498         track2.GetFitPoint(x1,y1,z1);
3499         track2.GetFitPoint(x2,y2,z2);
3500         track2.GetFitPoint(x3,y3,z3);
3501         //
3502         //is track pointing to the vertex ?
3503         Double_t x0,y0,z0;
3504         x0=0;
3505         polytrack.GetFitPoint(x0,y0,z0);
3506
3507         if (constrain) {
3508           x2 = x3;
3509           y2 = y3;
3510           z2 = z3;
3511           
3512           x3 = 0;
3513           y3 = 0;
3514           z3 = 0;
3515         }
3516         x[0]=y1;
3517         x[1]=z1;
3518         x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3519                 
3520         //      if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;  //
3521         x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3522         
3523         //if (TMath::Abs(x[4]*x1-x[2]) >= cuts[1]) continue;
3524         //x[3]=F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
3525         x[3]=F3n(x1,y1,x3,y3,z1,z3,x[4]);
3526         //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3527
3528         
3529         Double_t sy =0.1, sz =0.1;
3530         Double_t sy1=0.02, sz1=0.02;
3531         Double_t sy2=0.02, sz2=0.02;
3532         Double_t sy3=0.02;
3533
3534         if (constrain){
3535           sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
3536         }
3537         
3538         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3539         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3540         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3541         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3542         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3543         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3544
3545         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x3,y3,z1,z3)-x[3])/sy;
3546         Double_t f31=(F3(x1,y1,x3,y3,z1+sz,z3)-x[3])/sz;
3547         Double_t f32=(F3(x1,y1,x3,y3+sy,z1,z3)-x[3])/sy;
3548         Double_t f34=(F3(x1,y1,x3,y3,z1,z3+sz)-x[3])/sz;
3549
3550         
3551         c[0]=sy1;
3552         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3553         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3554         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3555         c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3556         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3557         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3558         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3559         
3560         //Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x1);
3561         Int_t row1 = GetRowNumber(x1);
3562
3563         UInt_t index=0;
3564         //kr0.GetIndex(is);
3565         AliTPCseed *track=new (seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3566         track->fIsSeeding = kTRUE;
3567         Int_t rc=FollowProlongation(*track, i2);        
3568         if (constrain) track->fBConstrain =1;
3569         else
3570           track->fBConstrain =0;
3571         track->fLastPoint = row1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3572         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3573
3574         if (rc==0 || track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 || 
3575             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 || 
3576             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters()) {
3577           //delete track;
3578           seed->Reset();
3579           seed->~AliTPCseed();
3580         }
3581         else {
3582           arr->AddLast(track);
3583           seed = new AliTPCseed;
3584         }
3585         nin3++;
3586       }
3587     }  // if accepted seed
3588   }
3589   if (fDebug>3){
3590     Info("MakeSeeds2","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin3);
3591   }
3592   delete seed;
3593 }
3594
3595
3596 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::MakeSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3597 {
3598   //
3599   //
3600   //reseed using track points
3601   Int_t p0 = int(r0*track->GetNumberOfClusters());     // point 0 
3602   Int_t p1 = int(r1*track->GetNumberOfClusters());
3603   Int_t p2 = int(r2*track->GetNumberOfClusters());   // last point
3604   Int_t pp2=0;
3605   Double_t  x0[3],x1[3],x2[3];
3606   for (Int_t i=0;i<3;i++){
3607     x0[i]=-1;
3608     x1[i]=-1;
3609     x2[i]=-1;
3610   }
3611
3612   // find track position at given ratio of the length
3613   Int_t  sec0=0, sec1=0, sec2=0;
3614   Int_t index=-1;
3615   Int_t clindex;
3616   for (Int_t i=0;i<160;i++){
3617     if (track->fClusterPointer[i]){
3618       index++;