Adding possibility to change the tracking window in ctgTheta
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCtrackerMI.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16
17 //-------------------------------------------------------
18 //          Implementation of the TPC tracker
19 //
20 //   Origin: Marian Ivanov   Marian.Ivanov@cern.ch
21 // 
22 //  AliTPC parallel tracker - 
23 //  How to use?  - 
24 //  run AliTPCFindClusters.C macro - clusters neccessary for tracker are founded
25 //  run AliTPCFindTracksMI.C macro - to find tracks
26 //  tracks are written to AliTPCtracks.root file
27 //  for comparison also seeds are written to the same file - to special branch
28 //-------------------------------------------------------
29
30
31 /* $Id$ */
32
33
34
35 #include "Riostream.h"
36 #include <TClonesArray.h>
37 #include <TFile.h>
38 #include <TObjArray.h>
39 #include <TTree.h>
40
41 #include "AliComplexCluster.h"
42 #include "AliESD.h"
43 #include "AliHelix.h"
44 #include "AliRunLoader.h"
45 #include "AliTPCClustersRow.h"
46 #include "AliTPCParam.h"
47 #include "AliTPCclusterMI.h"
48 #include "AliTPCpolyTrack.h"
49 #include "AliTPCreco.h" 
50 #include "AliTPCtrackerMI.h"
51 #include "TStopwatch.h"
52
53 #include "AliTPCReconstructor.h"
54 //
55
56 ClassImp(AliTPCseed)
57 ClassImp(AliTPCtrackerMI)
58
59
60 class AliTPCFastMath {
61 public:
62   AliTPCFastMath();  
63   static Double_t FastAsin(Double_t x);   
64  private: 
65   static Double_t fgFastAsin[20000];  //lookup table for fast asin computation
66 };
67
68 Double_t AliTPCFastMath::fgFastAsin[20000];
69 AliTPCFastMath gAliTPCFastMath; // needed to fill the LUT
70
71 AliTPCFastMath::AliTPCFastMath(){
72   //
73   // initialized lookup table;
74   for (Int_t i=0;i<10000;i++){
75     fgFastAsin[2*i] = TMath::ASin(i/10000.);
76     fgFastAsin[2*i+1] = (TMath::ASin((i+1)/10000.)-fgFastAsin[2*i]);
77   }
78 }
79
80 Double_t AliTPCFastMath::FastAsin(Double_t x){
81   //
82   // return asin using lookup table
83   if (x>0){
84     Int_t index = int(x*10000);
85     return fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1];
86   }
87   x*=-1;
88   Int_t index = int(x*10000);
89   return -(fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1]);
90 }
91
92
93
94
95 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateTrack(AliTPCseed * track, Int_t accept){
96   //
97   //update track information using current cluster - track->fCurrentCluster
98
99
100   AliTPCclusterMI* c =track->fCurrentCluster;
101   if (accept>0) track->fCurrentClusterIndex1 |=0x8000;  //sign not accepted clusters
102
103   UInt_t i = track->fCurrentClusterIndex1;
104
105   Int_t sec=(i&0xff000000)>>24; 
106   //Int_t row = (i&0x00ff0000)>>16; 
107   track->fRow=(i&0x00ff0000)>>16;
108   track->fSector = sec;
109   //  Int_t index = i&0xFFFF;
110   if (sec>=fParam->GetNInnerSector()) track->fRow += fParam->GetNRowLow(); 
111   track->SetClusterIndex2(track->fRow, i);  
112   //track->fFirstPoint = row;
113   //if ( track->fLastPoint<row) track->fLastPoint =row;
114   //  if (track->fRow<0 || track->fRow>160) {
115   //  printf("problem\n");
116   //}
117   if (track->fFirstPoint>track->fRow) 
118     track->fFirstPoint = track->fRow;
119   if (track->fLastPoint<track->fRow) 
120     track->fLastPoint  = track->fRow;
121   
122
123   track->fClusterPointer[track->fRow] = c;  
124   //
125
126   Float_t angle2 = track->GetSnp()*track->GetSnp();
127   angle2 = TMath::Sqrt(angle2/(1-angle2)); 
128   //
129   //SET NEW Track Point
130   //
131   //  if (debug)
132   {
133     AliTPCTrackerPoint   &point =*(track->GetTrackPoint(track->fRow));
134     //
135     point.SetSigmaY(c->GetSigmaY2()/track->fCurrentSigmaY2);
136     point.SetSigmaZ(c->GetSigmaZ2()/track->fCurrentSigmaZ2);
137     point.SetErrY(sqrt(track->fErrorY2));
138     point.SetErrZ(sqrt(track->fErrorZ2));
139     //
140     point.SetX(track->GetX());
141     point.SetY(track->GetY());
142     point.SetZ(track->GetZ());
143     point.SetAngleY(angle2);
144     point.SetAngleZ(track->GetTgl());
145     if (point.fIsShared){
146       track->fErrorY2 *= 4;
147       track->fErrorZ2 *= 4;
148     }
149   }  
150
151   Double_t chi2 = track->GetPredictedChi2(track->fCurrentCluster);
152   //
153   track->fErrorY2 *= 1.3;
154   track->fErrorY2 += 0.01;    
155   track->fErrorZ2 *= 1.3;   
156   track->fErrorZ2 += 0.005;      
157     //}
158   if (accept>0) return 0;
159   if (track->GetNumberOfClusters()%20==0){
160     //    if (track->fHelixIn){
161     //  TClonesArray & larr = *(track->fHelixIn);    
162     //  Int_t ihelix = larr.GetEntriesFast();
163     //  new(larr[ihelix]) AliHelix(*track) ;    
164     //}
165   }
166   track->fNoCluster =0;
167   return track->Update(c,chi2,i);
168 }
169
170
171
172 Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluster, Float_t factor, 
173                                       Float_t cory, Float_t corz)
174 {
175   //
176   // decide according desired precision to accept given 
177   // cluster for tracking
178   Double_t sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
179   Double_t sz2=ErrZ2(seed,cluster)*corz;
180   //sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
181   //sz2=ErrZ2(seed,cluster)*cory;
182   
183   Double_t sdistancey2 = sy2+seed->GetSigmaY2();
184   Double_t sdistancez2 = sz2+seed->GetSigmaZ2();
185   
186   Double_t rdistancey2 = (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())*
187     (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())/sdistancey2;
188   Double_t rdistancez2 = (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())*
189     (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())/sdistancez2;
190   
191   Double_t rdistance2  = rdistancey2+rdistancez2;
192   //Int_t  accept =0;
193   
194   if (rdistance2>16) return 3;
195   
196   
197   if ((rdistancey2>9.*factor || rdistancez2>9.*factor) && cluster->GetType()==0)  
198     return 2;  //suspisiouce - will be changed
199   
200   if ((rdistancey2>6.25*factor || rdistancez2>6.25*factor) && cluster->GetType()>0)  
201     // strict cut on overlaped cluster
202     return  2;  //suspisiouce - will be changed
203   
204   if ( (rdistancey2>1.*factor || rdistancez2>6.25*factor ) 
205        && cluster->GetType()<0){
206     seed->fNFoundable--;
207     return 2;    
208   }
209   return 0;
210 }
211
212
213
214
215 //_____________________________________________________________________________
216 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCParam *par): 
217 AliTracker(), fkNIS(par->GetNInnerSector()/2), fkNOS(par->GetNOuterSector()/2)
218 {
219   //---------------------------------------------------------------------
220   // The main TPC tracker constructor
221   //---------------------------------------------------------------------
222   fInnerSec=new AliTPCSector[fkNIS];         
223   fOuterSec=new AliTPCSector[fkNOS];
224  
225   Int_t i;
226   for (i=0; i<fkNIS; i++) fInnerSec[i].Setup(par,0);
227   for (i=0; i<fkNOS; i++) fOuterSec[i].Setup(par,1);
228
229   fN=0;  fSectors=0;
230
231   fSeeds=0;
232   fNtracks = 0;
233   fParam = par;  
234   Int_t nrowlow = par->GetNRowLow();
235   Int_t nrowup = par->GetNRowUp();
236
237   
238   for (Int_t i=0;i<nrowlow;i++){
239     fXRow[i]     = par->GetPadRowRadiiLow(i);
240     fPadLength[i]= par->GetPadPitchLength(0,i);
241     fYMax[i]     = fXRow[i]*TMath::Tan(0.5*par->GetInnerAngle());
242   }
243
244   
245   for (Int_t i=0;i<nrowup;i++){
246     fXRow[i+nrowlow]      = par->GetPadRowRadiiUp(i);
247     fPadLength[i+nrowlow] = par->GetPadPitchLength(60,i);
248     fYMax[i+nrowlow]      = fXRow[i+nrowlow]*TMath::Tan(0.5*par->GetOuterAngle());
249   }
250   fSeeds=0;
251   //
252   fInput    = 0;
253   fOutput   = 0;
254   fSeedTree = 0;
255   fTreeDebug =0;
256   fNewIO     =0;
257   fDebug     =0;
258   fEvent     =0;
259 }
260 //________________________________________________________________________
261 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCtrackerMI &t):
262   AliTracker(t),
263   fkNIS(t.fkNIS),
264   fkNOS(t.fkNOS)
265 {
266   //------------------------------------
267   // dummy copy constructor
268   //------------------------------------------------------------------
269 }
270 AliTPCtrackerMI & AliTPCtrackerMI::operator=(const AliTPCtrackerMI& /*r*/){
271   //------------------------------
272   // dummy 
273   //--------------------------------------------------------------
274   return *this;
275 }
276 //_____________________________________________________________________________
277 AliTPCtrackerMI::~AliTPCtrackerMI() {
278   //------------------------------------------------------------------
279   // TPC tracker destructor
280   //------------------------------------------------------------------
281   delete[] fInnerSec;
282   delete[] fOuterSec;
283   if (fSeeds) {
284     fSeeds->Delete(); 
285     delete fSeeds;
286   }
287 }
288
289 void AliTPCtrackerMI::SetIO()
290 {
291   //
292   fNewIO   =  kTRUE;
293   fInput   =  AliRunLoader::GetTreeR("TPC", kFALSE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
294   
295   fOutput  =  AliRunLoader::GetTreeT("TPC", kTRUE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
296   if (fOutput){
297     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
298     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
299     delete iotrack;
300   }
301 }
302
303
304 void AliTPCtrackerMI::SetIO(TTree * input, TTree * output, AliESD * event)
305 {
306
307   // set input
308   fNewIO = kFALSE;
309   fInput    = 0;
310   fOutput   = 0;
311   fSeedTree = 0;
312   fTreeDebug =0;
313   fInput = input;
314   if (input==0){
315     return;
316   }  
317   //set output
318   fOutput = output;
319   if (output){
320     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
321     //    iotrack->fHelixIn   = new TClonesArray("AliHelix");
322     //iotrack->fHelixOut  = new TClonesArray("AliHelix");    
323     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
324     delete iotrack;
325   }
326   if (output && (fDebug&2)){
327     //write the full seed information if specified in debug mode
328     //
329     fSeedTree =  new TTree("Seeds","Seeds");
330     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
331     //
332     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
333     arrtr->ExpandCreateFast(160);
334     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
335     //
336     vseed->fPoints = arrtr;
337     vseed->fEPoints = arre;
338     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
339     fSeedTree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
340     delete arrtr;
341     delete arre;    
342     fTreeDebug = new TTree("trackDebug","trackDebug");
343     TClonesArray * arrd = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint2",0);
344     fTreeDebug->Branch("debug",&arrd,32000,99);
345   }
346
347
348   //set ESD event  
349   fEvent  = event;  
350 }
351
352 void AliTPCtrackerMI::FillESD(TObjArray* arr)
353 {
354   //
355   //
356   //fill esds using updated tracks
357   if (fEvent){
358     // write tracks to the event
359     // store index of the track
360     Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
361     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
362       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
363       if (!pt) continue; 
364       pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
365       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>70)&& (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.55) {
366         AliESDtrack iotrack;
367         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);      
368         //iotrack.SetTPCindex(i);
369         fEvent->AddTrack(&iotrack);
370       }        
371     }
372   }
373 }
374
375 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks(TTree * tree)
376 {
377   //
378   // write tracks from seed array to selected tree
379   //
380   fOutput  = tree;
381   if (fOutput){
382     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
383     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
384   }
385   WriteTracks();
386 }
387
388 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks()
389 {
390   //
391   // write tracks to the given output tree -
392   // output specified with SetIO routine
393   if (!fSeeds)  return;
394   if (!fOutput){
395     SetIO();
396   }
397
398   if (fOutput){
399     AliTPCtrack *iotrack= 0;
400     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
401     //for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
402     //  iotrack= (AliTPCtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
403     //  if (iotrack) break;      
404     //}    
405     //TBranch * br = fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
406     TBranch * br = fOutput->GetBranch("tracks");
407     br->SetAddress(&iotrack);
408     //
409     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
410       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);    
411       if (!pt) continue;    
412       AliTPCtrack * track = new AliTPCtrack(*pt);
413       iotrack = track;
414       pt->fLab2 =i; 
415       //      br->SetAddress(&iotrack);
416       fOutput->Fill();
417       delete track;
418       iotrack =0;
419     }
420     //fOutput->GetDirectory()->cd();
421     //fOutput->Write();
422   }
423   // delete iotrack;
424   //
425   if (fSeedTree){
426     //write the full seed information if specified in debug mode
427       
428     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
429     //
430     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
431     arrtr->ExpandCreateFast(160);
432     //TClonesArray * arrcl = new TClonesArray("AliTPCclusterMI",160);
433     //arrcl->ExpandCreateFast(160);
434     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
435     //
436     vseed->fPoints = arrtr;
437     vseed->fEPoints = arre;
438     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
439     //TBranch * brseed = seedtree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
440     TBranch * brseed = fSeedTree->GetBranch("seeds");
441     
442     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
443     
444     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
445       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);    
446       if (!pt) continue;     
447       pt->fPoints = arrtr;
448       //      pt->fClusterPoints = arrcl;
449       pt->fEPoints       = arre;
450       pt->RebuildSeed();
451       vseed = pt;
452       brseed->SetAddress(&vseed);
453       fSeedTree->Fill();
454       pt->fPoints  = 0;
455       pt->fEPoints = 0;
456       //      pt->fClusterPoints = 0;
457     }
458     fSeedTree->Write();
459     if (fTreeDebug) fTreeDebug->Write();
460   }
461
462 }
463   
464
465
466
467 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrY2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
468   //
469   //
470   //seed->SetErrorY2(0.1);
471   //return 0.1;
472   //calculate look-up table at the beginning
473   static Bool_t  ginit = kFALSE;
474   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
475   static Float_t ggg1[10000];
476   static Float_t ggg2[10000];
477   static Float_t ggg3[10000];
478   static Float_t glandau1[10000];
479   static Float_t glandau2[10000];
480   static Float_t glandau3[10000];
481   //
482   static Float_t gcor01[500];
483   static Float_t gcor02[500];
484   static Float_t gcorp[500];
485   //
486
487   //
488   if (ginit==kFALSE){
489     for (Int_t i=1;i<500;i++){
490       Float_t rsigma = float(i)/100.;
491       gcor02[i] = TMath::Max(0.78 +TMath::Exp(7.4*(rsigma-1.2)),0.6);
492       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(3.36*(rsigma-1.2)),0.6);
493       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
494     }
495
496     //
497     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
498       //
499       //
500       // inner sector
501       Float_t amp = float(i);
502       Float_t padlength =0.75;
503       gnoise1 = 0.0004/padlength;
504       Float_t nel     = 0.268*amp;
505       Float_t nprim   = 0.155*amp;
506       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
507       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
508       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
509       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;      
510       //
511       // outer short
512       padlength =1.;
513       gnoise2   = 0.0004/padlength;
514       nel       = 0.3*amp;
515       nprim     = 0.133*amp;
516       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
517       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
518       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
519       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
520       //
521       //
522       // outer long
523       padlength =1.5;
524       gnoise3   = 0.0004/padlength;
525       nel       = 0.3*amp;
526       nprim     = 0.133*amp;
527       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
528       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
529       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
530       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
531       //
532     }
533     ginit = kTRUE;
534   }
535   //
536   //
537   //
538   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));  
539   if (amp>9999) {
540     seed->SetErrorY2(1.);
541     return 1.;
542   }
543   Float_t snoise2;
544   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
545   Int_t ctype = cl->GetType();  
546   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
547   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
548   angle2 = angle2/(1-angle2); 
549   //
550   //cluster "quality"
551   Int_t rsigmay = int(100.*cl->GetSigmaY2()/(seed->fCurrentSigmaY2));
552   Float_t res;
553   //
554   if (fSectors==fInnerSec){
555     snoise2 = gnoise1;
556     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;     
557     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmay];
558     if ((ctype>0)){
559       res+=0.002;
560       res*= gcorp[rsigmay];
561     }
562   }
563   else {
564     if (padlength<1.1){
565       snoise2 = gnoise2;
566       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2; 
567       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];      
568       if ((ctype>0)){
569         res+=0.002;
570         res*= gcorp[rsigmay];
571       }
572     }
573     else{
574       snoise2 = gnoise3;      
575       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2; 
576       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
577       if ((ctype>0)){
578         res+=0.002;
579         res*= gcorp[rsigmay];
580       }
581     }
582   }  
583
584   if (ctype<0){
585     res+=0.005;
586     res*=2.4;  // overestimate error 2 times
587   }
588   res+= snoise2;
589  
590   if (res<2*snoise2)
591     res = 2*snoise2;
592   
593   seed->SetErrorY2(res);
594   return res;
595
596
597 }
598
599
600
601 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
602   //
603   //
604   //seed->SetErrorY2(0.1);
605   //return 0.1;
606   //calculate look-up table at the beginning
607   static Bool_t  ginit = kFALSE;
608   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
609   static Float_t ggg1[10000];
610   static Float_t ggg2[10000];
611   static Float_t ggg3[10000];
612   static Float_t glandau1[10000];
613   static Float_t glandau2[10000];
614   static Float_t glandau3[10000];
615   //
616   static Float_t gcor01[1000];
617   static Float_t gcor02[1000];
618   static Float_t gcorp[1000];
619   //
620
621   //
622   if (ginit==kFALSE){
623     for (Int_t i=1;i<1000;i++){
624       Float_t rsigma = float(i)/100.;
625       gcor02[i] = TMath::Max(0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigma-1.2)),0.6);
626       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigma-1.2)),0.6);
627       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
628     }
629
630     //
631     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
632       //
633       //
634       // inner sector
635       Float_t amp = float(i);
636       Float_t padlength =0.75;
637       gnoise1 = 0.0004/padlength;
638       Float_t nel     = 0.268*amp;
639       Float_t nprim   = 0.155*amp;
640       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
641       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
642       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
643       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;      
644       //
645       // outer short
646       padlength =1.;
647       gnoise2   = 0.0004/padlength;
648       nel       = 0.3*amp;
649       nprim     = 0.133*amp;
650       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
651       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
652       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
653       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
654       //
655       //
656       // outer long
657       padlength =1.5;
658       gnoise3   = 0.0004/padlength;
659       nel       = 0.3*amp;
660       nprim     = 0.133*amp;
661       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
662       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
663       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
664       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
665       //
666     }
667     ginit = kTRUE;
668   }
669   //
670   //
671   //
672   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));  
673   if (amp>9999) {
674     seed->SetErrorY2(1.);
675     return 1.;
676   }
677   Float_t snoise2;
678   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
679   Int_t ctype = cl->GetType();  
680   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
681   //
682   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
683   //  if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
684   angle2 = seed->GetTgl()*seed->GetTgl()*(1+angle2/(1-angle2)); 
685   //
686   //cluster "quality"
687   Int_t rsigmaz = int(100.*cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2));
688   Float_t res;
689   //
690   if (fSectors==fInnerSec){
691     snoise2 = gnoise1;
692     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;     
693     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmaz];
694     if ((ctype>0)){
695       res+=0.002;
696       res*= gcorp[rsigmaz];
697     }
698   }
699   else {
700     if (padlength<1.1){
701       snoise2 = gnoise2;
702       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2; 
703       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];      
704       if ((ctype>0)){
705         res+=0.002;
706         res*= gcorp[rsigmaz];
707       }
708     }
709     else{
710       snoise2 = gnoise3;      
711       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2; 
712       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
713       if ((ctype>0)){
714         res+=0.002;
715         res*= gcorp[rsigmaz];
716       }
717     }
718   }  
719
720   if (ctype<0){
721     res+=0.002;
722     res*=1.3;
723   }
724   if ((ctype<0) &&amp<70){
725     res+=0.002;
726     res*=1.3;  
727   }
728   res += snoise2;
729   if (res<2*snoise2)
730      res = 2*snoise2;
731   if (res>3) res =3;
732   seed->SetErrorZ2(res);
733   return res;
734 }
735
736
737
738 /*
739 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
740   //
741   //
742   //seed->SetErrorZ2(0.1);
743   //return 0.1;
744
745   Float_t snoise2;
746   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
747   //
748   Float_t rsigmaz = cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2);
749   Int_t ctype = cl->GetType();
750   Float_t amp = TMath::Abs(cl->GetQ());
751   
752   Float_t nel;
753   Float_t nprim;
754   //
755   Float_t landau=2 ;    //landau fluctuation part
756   Float_t gg=2;         // gg fluctuation part
757   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetX());
758  
759   if (fSectors==fInnerSec){
760     snoise2 = 0.0004/padlength;
761     nel     = 0.268*amp;
762     nprim   = 0.155*amp;
763     gg      = (2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
764     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
765     if (landau>1) landau=1;
766   }
767   else {
768     snoise2 = 0.0004/padlength;
769     nel     = 0.3*amp;
770     nprim   = 0.133*amp;
771     gg      = (2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
772     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
773     if (landau>1) landau=1;
774   }
775   Float_t sdiff = gg*fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*z;
776
777   //
778   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
779   angle2 = TMath::Sqrt((1-angle2));
780   if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
781   //angle2 = 1;
782
783   Float_t angle = seed->GetTgl()/angle2;
784   Float_t angular = landau*angle*angle*padlength*padlength/12.;
785   Float_t res = sdiff + angular;
786
787   
788   if ((ctype==0) && (fSectors ==fOuterSec))
789     res *= 0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigmaz-1.2));
790
791   if ((ctype==0) && (fSectors ==fInnerSec))
792     res *= 0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigmaz-1.2));
793   
794   if ((ctype>0)){
795     res+=0.005;
796     res*= TMath::Power(rsigmaz+0.5,1.5);  //0.31+0.147*ctype;
797   }
798   if (ctype<0){
799     res+=0.002;
800     res*=1.3;
801   }
802   if ((ctype<0) &&amp<70){
803     res+=0.002;
804     res*=1.3;  
805   }
806   res += snoise2;
807   if (res<2*snoise2)
808      res = 2*snoise2;
809
810   seed->SetErrorZ2(res);
811   return res;
812 }
813 */
814
815
816
817 void AliTPCseed::Reset(Bool_t all)
818 {
819   //
820   //
821   SetNumberOfClusters(0);
822   fNFoundable = 0;
823   SetChi2(0);
824   ResetCovariance();
825   /*
826   if (fTrackPoints){
827     for (Int_t i=0;i<8;i++){
828       delete [] fTrackPoints[i];
829     }
830     delete fTrackPoints;
831     fTrackPoints =0;
832   }
833   */
834
835   if (all){   
836     for (Int_t i=0;i<200;i++) SetClusterIndex2(i,-3);
837     for (Int_t i=0;i<160;i++) fClusterPointer[i]=0;
838   }
839
840 }
841
842
843 void AliTPCseed::Modify(Double_t factor)
844 {
845
846   //------------------------------------------------------------------
847   //This function makes a track forget its history :)  
848   //------------------------------------------------------------------
849   if (factor<=0) {
850     ResetCovariance();
851     return;
852   }
853   fC00*=factor;
854   fC10*=0;  fC11*=factor;
855   fC20*=0;  fC21*=0;  fC22*=factor;
856   fC30*=0;  fC31*=0;  fC32*=0;  fC33*=factor;
857   fC40*=0;  fC41*=0;  fC42*=0;  fC43*=0;  fC44*=factor;
858   SetNumberOfClusters(0);
859   fNFoundable =0;
860   SetChi2(0);
861   fRemoval = 0;
862   fCurrentSigmaY2 = 0.000005;
863   fCurrentSigmaZ2 = 0.000005;
864   fNoCluster     = 0;
865   //fFirstPoint = 160;
866   //fLastPoint  = 0;
867 }
868
869
870
871
872 Int_t  AliTPCseed::GetProlongation(Double_t xk, Double_t &y, Double_t & z) const
873 {
874   //-----------------------------------------------------------------
875   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=xk.
876   // doesn't change internal state of the track
877   //-----------------------------------------------------------------
878   
879   Double_t x1=fX, x2=x1+(xk-x1), dx=x2-x1;
880
881   if (TMath::Abs(fP4*xk - fP2) >= 0.999) {   
882     return 0;
883   }
884
885   //  Double_t y1=fP0, z1=fP1;
886   Double_t c1=fP4*x1 - fP2, r1=sqrt(1.- c1*c1);
887   Double_t c2=fP4*x2 - fP2, r2=sqrt(1.- c2*c2);
888   
889   y = fP0;
890   z = fP1;
891   //y += dx*(c1+c2)/(r1+r2);
892   //z += dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1)*fP3;
893   
894   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
895   Double_t dz = 0;
896   //
897   Double_t delta = fP4*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
898   /*
899   if (TMath::Abs(delta)>0.0001){
900     dz = fP3*TMath::ASin(delta)/fP4;
901   }else{
902     dz = dx*fP3*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
903   }
904   */
905   dz =  fP3*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/fP4;
906   //
907   y+=dy;
908   z+=dz;
909   
910
911   return 1;  
912 }
913
914
915 //_____________________________________________________________________________
916 Double_t AliTPCseed::GetPredictedChi2(const AliTPCclusterMI *c) const 
917 {
918   //-----------------------------------------------------------------
919   // This function calculates a predicted chi2 increment.
920   //-----------------------------------------------------------------
921   //Double_t r00=c->GetSigmaY2(), r01=0., r11=c->GetSigmaZ2();
922   Double_t r00=fErrorY2, r01=0., r11=fErrorZ2;
923   r00+=fC00; r01+=fC10; r11+=fC11;
924
925   Double_t det=r00*r11 - r01*r01;
926   if (TMath::Abs(det) < 1.e-10) {
927     Int_t n=GetNumberOfClusters();
928     if (n>4) cerr<<n<<" AliKalmanTrack warning: Singular matrix !\n";
929     return 1e10;
930   }
931   Double_t tmp=r00; r00=r11; r11=tmp; r01=-r01;
932   
933   Double_t dy=c->GetY() - fP0, dz=c->GetZ() - fP1;
934   
935   return (dy*r00*dy + 2*r01*dy*dz + dz*r11*dz)/det;
936 }
937
938
939 //_________________________________________________________________________________________
940
941
942 Int_t AliTPCseed::Compare(const TObject *o) const {
943   //-----------------------------------------------------------------
944   // This function compares tracks according to the sector - for given sector according z
945   //-----------------------------------------------------------------
946   AliTPCseed *t=(AliTPCseed*)o;
947
948   if (fSort == 0){
949     if (t->fRelativeSector>fRelativeSector) return -1;
950     if (t->fRelativeSector<fRelativeSector) return 1;
951     Double_t z2 = t->GetZ();
952     Double_t z1 = GetZ();
953     if (z2>z1) return 1;
954     if (z2<z1) return -1;
955     return 0;
956   }
957   else {
958     Float_t f2 =1;
959     f2 = 1-20*TMath::Sqrt(t->fC44)/(TMath::Abs(t->GetC())+0.0066);
960     if (t->fBConstrain) f2=1.2;
961
962     Float_t f1 =1;
963     f1 = 1-20*TMath::Sqrt(fC44)/(TMath::Abs(GetC())+0.0066);
964
965     if (fBConstrain)   f1=1.2;
966  
967     if (t->GetNumberOfClusters()*f2 <GetNumberOfClusters()*f1) return -1;
968     else return +1;
969   }
970 }
971
972 void AliTPCtrackerMI::RotateToLocal(AliTPCseed *seed)
973 {
974   //rotate to track "local coordinata
975   Float_t x = seed->GetX();
976   Float_t y = seed->GetY();
977   Float_t ymax = x*TMath::Tan(0.5*fSectors->GetAlpha());
978   
979   if (y > ymax) {
980     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector+1) % fN;
981     if (!seed->Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
982       return;
983   } else if (y <-ymax) {
984     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector-1+fN) % fN;
985     if (!seed->Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
986       return;
987   }   
988
989 }
990
991
992
993
994 //_____________________________________________________________________________
995 Int_t AliTPCseed::Update(const AliTPCclusterMI *c, Double_t chisq, UInt_t /*index*/) {
996   //-----------------------------------------------------------------
997   // This function associates a cluster with this track.
998   //-----------------------------------------------------------------
999   Double_t r00=fErrorY2, r01=0., r11=fErrorZ2;
1000
1001   r00+=fC00; r01+=fC10; r11+=fC11;
1002   Double_t det=r00*r11 - r01*r01;
1003   Double_t tmp=r00; r00=r11/det; r11=tmp/det; r01=-r01/det;
1004
1005   Double_t k00=fC00*r00+fC10*r01, k01=fC00*r01+fC10*r11;
1006   Double_t k10=fC10*r00+fC11*r01, k11=fC10*r01+fC11*r11;
1007   Double_t k20=fC20*r00+fC21*r01, k21=fC20*r01+fC21*r11;
1008   Double_t k30=fC30*r00+fC31*r01, k31=fC30*r01+fC31*r11;
1009   Double_t k40=fC40*r00+fC41*r01, k41=fC40*r01+fC41*r11;
1010
1011   Double_t dy=c->GetY() - fP0, dz=c->GetZ() - fP1;
1012   Double_t cur=fP4 + k40*dy + k41*dz, eta=fP2 + k20*dy + k21*dz;
1013   if (TMath::Abs(cur*fX-eta) >= 0.9) {
1014     return 0;
1015   }
1016
1017   fP0 += k00*dy + k01*dz;
1018   fP1 += k10*dy + k11*dz;
1019   fP2  = eta;
1020   fP3 += k30*dy + k31*dz;
1021   fP4  = cur;
1022
1023   Double_t c01=fC10, c02=fC20, c03=fC30, c04=fC40;
1024   Double_t c12=fC21, c13=fC31, c14=fC41;
1025
1026   fC00-=k00*fC00+k01*fC10; fC10-=k00*c01+k01*fC11;
1027   fC20-=k00*c02+k01*c12;   fC30-=k00*c03+k01*c13;
1028   fC40-=k00*c04+k01*c14; 
1029
1030   fC11-=k10*c01+k11*fC11;
1031   fC21-=k10*c02+k11*c12;   fC31-=k10*c03+k11*c13;
1032   fC41-=k10*c04+k11*c14; 
1033
1034   fC22-=k20*c02+k21*c12;   fC32-=k20*c03+k21*c13;
1035   fC42-=k20*c04+k21*c14; 
1036
1037   fC33-=k30*c03+k31*c13;
1038   fC43-=k40*c03+k41*c13; 
1039
1040   fC44-=k40*c04+k41*c14; 
1041
1042   Int_t n=GetNumberOfClusters();
1043   //  fIndex[n]=index;
1044   SetNumberOfClusters(n+1);
1045   SetChi2(GetChi2()+chisq);
1046
1047   return 1;
1048 }
1049
1050
1051
1052 //_____________________________________________________________________________
1053 Double_t AliTPCtrackerMI::F1old(Double_t x1,Double_t y1,
1054                    Double_t x2,Double_t y2,
1055                    Double_t x3,Double_t y3) 
1056 {
1057   //-----------------------------------------------------------------
1058   // Initial approximation of the track curvature
1059   //-----------------------------------------------------------------
1060   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
1061   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
1062                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
1063   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
1064                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
1065
1066   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
1067   if ( xr*xr+yr*yr<=0.00000000000001) return 100;
1068   return -xr*yr/sqrt(xr*xr+yr*yr); 
1069 }
1070
1071
1072
1073 //_____________________________________________________________________________
1074 Double_t AliTPCtrackerMI::F1(Double_t x1,Double_t y1,
1075                    Double_t x2,Double_t y2,
1076                    Double_t x3,Double_t y3) 
1077 {
1078   //-----------------------------------------------------------------
1079   // Initial approximation of the track curvature
1080   //-----------------------------------------------------------------
1081   x3 -=x1;
1082   x2 -=x1;
1083   y3 -=y1;
1084   y2 -=y1;
1085   //  
1086   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
1087   if (det==0) {
1088     return 100;
1089   }
1090   //
1091   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
1092   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u;
1093   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
1094   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
1095   if (det<0) c2*=-1;
1096   return c2;
1097 }
1098
1099
1100 Double_t AliTPCtrackerMI::F2(Double_t x1,Double_t y1,
1101                    Double_t x2,Double_t y2,
1102                    Double_t x3,Double_t y3) 
1103 {
1104   //-----------------------------------------------------------------
1105   // Initial approximation of the track curvature
1106   //-----------------------------------------------------------------
1107   x3 -=x1;
1108   x2 -=x1;
1109   y3 -=y1;
1110   y2 -=y1;
1111   //  
1112   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
1113   if (det==0) {
1114     return 100;
1115   }
1116   //
1117   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
1118   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u; 
1119   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
1120   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
1121   if (det<0) c2*=-1;
1122   x0+=x1;
1123   x0*=c2;  
1124   return x0;
1125 }
1126
1127
1128
1129 //_____________________________________________________________________________
1130 Double_t AliTPCtrackerMI::F2old(Double_t x1,Double_t y1,
1131                    Double_t x2,Double_t y2,
1132                    Double_t x3,Double_t y3) 
1133 {
1134   //-----------------------------------------------------------------
1135   // Initial approximation of the track curvature times center of curvature
1136   //-----------------------------------------------------------------
1137   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
1138   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
1139                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
1140   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
1141                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
1142
1143   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
1144   
1145   return -a/(d*y1-b)*xr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
1146 }
1147
1148 //_____________________________________________________________________________
1149 Double_t AliTPCtrackerMI::F3(Double_t x1,Double_t y1, 
1150                    Double_t x2,Double_t y2,
1151                    Double_t z1,Double_t z2) 
1152 {
1153   //-----------------------------------------------------------------
1154   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1155   //-----------------------------------------------------------------
1156   return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1157 }
1158
1159
1160 Double_t AliTPCtrackerMI::F3n(Double_t x1,Double_t y1, 
1161                    Double_t x2,Double_t y2,
1162                    Double_t z1,Double_t z2, Double_t c) 
1163 {
1164   //-----------------------------------------------------------------
1165   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1166   //-----------------------------------------------------------------
1167
1168   //  Double_t angle1;
1169   
1170   //angle1    =  (z1-z2)*c/(TMath::ASin(c*x1-ni)-TMath::ASin(c*x2-ni));
1171   //
1172   Double_t d  =  TMath::Sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1173   if (TMath::Abs(d*c*0.5)>1) return 0;
1174   //  Double_t   angle2    =  TMath::ASin(d*c*0.5);
1175   //  Double_t   angle2    =  AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1176   Double_t   angle2    = (d*c*0.5>0.1)? TMath::ASin(d*c*0.5): AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1177
1178   angle2  = (z1-z2)*c/(angle2*2.);
1179   return angle2;
1180 }
1181
1182 Bool_t   AliTPCtrackerMI::GetProlongation(Double_t x1, Double_t x2, Double_t x[5], Double_t &y, Double_t &z)
1183 {//-----------------------------------------------------------------
1184   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=x2.
1185   //-----------------------------------------------------------------
1186   
1187   Double_t dx=x2-x1;
1188
1189   if (TMath::Abs(x[4]*x1 - x[2]) >= 0.999) {   
1190     return kFALSE;
1191   }
1192
1193   Double_t c1=x[4]*x1 - x[2], r1=sqrt(1.- c1*c1);
1194   Double_t c2=x[4]*x2 - x[2], r2=sqrt(1.- c2*c2);  
1195   y = x[0];
1196   z = x[1];
1197   
1198   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
1199   Double_t dz = 0;
1200   //
1201   Double_t delta = x[4]*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
1202   
1203   if (TMath::Abs(delta)>0.01){
1204     dz = x[3]*TMath::ASin(delta)/x[4];
1205   }else{
1206     dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1207   }
1208   
1209   //dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1210
1211   y+=dy;
1212   z+=dz;
1213   
1214   return kTRUE;  
1215 }
1216
1217 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters (TTree *tree)
1218 {
1219   //
1220   //
1221   fInput = tree;
1222   return LoadClusters();
1223 }
1224
1225 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters()
1226 {
1227   //
1228   // load clusters to the memory
1229   AliTPCClustersRow *clrow= new AliTPCClustersRow;
1230   clrow->SetClass("AliTPCclusterMI");
1231   clrow->SetArray(0);
1232   clrow->GetArray()->ExpandCreateFast(10000);
1233   //
1234   //  TTree * tree = fClustersArray.GetTree();
1235
1236   TTree * tree = fInput;
1237   TBranch * br = tree->GetBranch("Segment");
1238   br->SetAddress(&clrow);
1239   //
1240   Int_t j=Int_t(tree->GetEntries());
1241   for (Int_t i=0; i<j; i++) {
1242     br->GetEntry(i);
1243     //  
1244     Int_t sec,row;
1245     fParam->AdjustSectorRow(clrow->GetID(),sec,row);
1246     //
1247     AliTPCRow * tpcrow=0;
1248     Int_t left=0;
1249     if (sec<fkNIS*2){
1250       tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);    
1251       left = sec/fkNIS;
1252     }
1253     else{
1254       tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1255       left = (sec-fkNIS*2)/fkNOS;
1256     }
1257     if (left ==0){
1258       tpcrow->fN1 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1259       tpcrow->fClusters1 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN1];
1260       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN1;i++) 
1261         tpcrow->fClusters1[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1262     }
1263     if (left ==1){
1264       tpcrow->fN2 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1265       tpcrow->fClusters2 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN2];
1266       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN2;i++) 
1267         tpcrow->fClusters2[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1268     }
1269   }
1270   //
1271   delete clrow;
1272   LoadOuterSectors();
1273   LoadInnerSectors();
1274   return 0;
1275 }
1276
1277
1278 void AliTPCtrackerMI::UnloadClusters()
1279 {
1280   //
1281   // unload clusters from the memory
1282   //
1283   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1284   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1285     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1286       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
1287       //      if (tpcrow){
1288       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1; 
1289       //        if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2; 
1290       //}
1291       tpcrow->ResetClusters();
1292     }
1293   //
1294   nrows = fInnerSec->GetNRows();
1295   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1296     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1297       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1298       //if (tpcrow){
1299       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1; 
1300       //if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2; 
1301       //}
1302       tpcrow->ResetClusters();
1303     }
1304
1305   return ;
1306 }
1307
1308
1309 //_____________________________________________________________________________
1310 Int_t AliTPCtrackerMI::LoadOuterSectors() {
1311   //-----------------------------------------------------------------
1312   // This function fills outer TPC sectors with clusters.
1313   //-----------------------------------------------------------------
1314   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1315   UInt_t index=0;
1316   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1317     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1318       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);  
1319       Int_t sec2 = sec+2*fkNIS;
1320       //left
1321       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1322       while (ncl--) {
1323         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1324         index=(((sec2<<8)+row)<<16)+ncl;
1325         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1326       }
1327       //right
1328       ncl = tpcrow->fN2;
1329       while (ncl--) {
1330         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1331         index=((((sec2+fkNOS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1332         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1333       }
1334       //
1335       // write indexes for fast acces
1336       //
1337       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1338         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1339       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1340         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1341         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1342       }
1343       Int_t last = 0;
1344       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1345         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1346           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1347         else
1348           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1349       }
1350     }  
1351   fN=fkNOS;
1352   fSectors=fOuterSec;
1353   return 0;
1354 }
1355
1356
1357 //_____________________________________________________________________________
1358 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadInnerSectors() {
1359   //-----------------------------------------------------------------
1360   // This function fills inner TPC sectors with clusters.
1361   //-----------------------------------------------------------------
1362   Int_t nrows = fInnerSec->GetNRows();
1363   UInt_t index=0;
1364   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1365     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1366       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1367       //
1368       //left
1369       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1370       while (ncl--) {
1371         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1372         index=(((sec<<8)+row)<<16)+ncl;
1373         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1374       }
1375       //right
1376       ncl = tpcrow->fN2;
1377       while (ncl--) {
1378         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1379         index=((((sec+fkNIS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1380         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1381       }
1382       //
1383       // write indexes for fast acces
1384       //
1385       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1386         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1387       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1388         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1389         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1390       }
1391       Int_t last = 0;
1392       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1393         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1394           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1395         else
1396           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1397       }
1398
1399     }  
1400    
1401   fN=fkNIS;
1402   fSectors=fInnerSec;
1403   return 0;
1404 }
1405
1406
1407
1408 //_________________________________________________________________________
1409 AliTPCclusterMI *AliTPCtrackerMI::GetClusterMI(Int_t index) const {
1410   //--------------------------------------------------------------------
1411   //       Return pointer to a given cluster
1412   //--------------------------------------------------------------------
1413   Int_t sec=(index&0xff000000)>>24; 
1414   Int_t row=(index&0x00ff0000)>>16; 
1415   Int_t ncl=(index&0x00007fff)>>00;
1416
1417   const AliTPCRow * tpcrow=0;
1418   AliTPCclusterMI * clrow =0;
1419
1420   if (sec<fkNIS*2){
1421     tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1422     if (tpcrow==0) return 0;
1423
1424     if (sec<fkNIS) {
1425       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1426       clrow = tpcrow->fClusters1;
1427     }
1428     else {
1429       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1430       clrow = tpcrow->fClusters2;
1431     }
1432   }
1433   else {
1434     tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1435     if (tpcrow==0) return 0;
1436
1437     if (sec-2*fkNIS<fkNOS) {
1438       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1439       clrow = tpcrow->fClusters1;
1440     }
1441     else {
1442       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1443       clrow = tpcrow->fClusters2;
1444     }
1445   }
1446
1447   return &(clrow[ncl]);      
1448   
1449 }
1450
1451
1452
1453 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNext(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1454   //-----------------------------------------------------------------
1455   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1456   //-----------------------------------------------------------------
1457   //
1458   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1459   AliTPCclusterMI *cl=0;
1460   Int_t tpcindex= t.GetClusterIndex2(nr);
1461   //
1462   // update current shape info every 5 pad-row
1463   //  if ( (nr%5==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1464     GetShape(&t,nr);    
1465     //}
1466   //  
1467   if (fIteration>0 && tpcindex>=-1){  //if we have already clusters 
1468     //        
1469     if (tpcindex==-1) return 0; //track in dead zone
1470     if (tpcindex>0){     //
1471       cl = t.fClusterPointer[nr];
1472       if ( (cl==0) ) cl = GetClusterMI(tpcindex);
1473       t.fCurrentClusterIndex1 = tpcindex; 
1474     }
1475     if (cl){      
1476       Int_t relativesector = ((tpcindex&0xff000000)>>24)%18;  // if previously accepted cluster in different sector
1477       Float_t angle = relativesector*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift();
1478       //
1479       if (angle<-TMath::Pi()) angle += 2*TMath::Pi();
1480       if (angle>=TMath::Pi()) angle -= 2*TMath::Pi();
1481       
1482       if (TMath::Abs(angle-t.GetAlpha())>0.001){
1483         Double_t rotation = angle-t.GetAlpha();
1484         t.fRelativeSector= relativesector;
1485         t.Rotate(rotation);     
1486       }
1487       t.PropagateTo(x);
1488       //
1489       t.fCurrentCluster = cl; 
1490       t.fRow = nr;
1491       Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1492       if ((tpcindex&0x8000)==0) accept =0;
1493       if (accept<3) { 
1494         //if founded cluster is acceptible
1495         if (cl->IsUsed(11)) {  // id cluster is shared inrease uncertainty
1496           t.fErrorY2 += 0.03;
1497           t.fErrorZ2 += 0.03; 
1498           t.fErrorY2 *= 3;
1499           t.fErrorZ2 *= 3; 
1500         }
1501         t.fNFoundable++;
1502         UpdateTrack(&t,accept);
1503         return 1;
1504       }    
1505     }
1506   }
1507   if (fIteration>1) return 0;  // not look for new cluster during refitting
1508   //
1509   UInt_t index=0;
1510   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95 || TMath::Abs(x*t.GetC()-t.GetEta())>0.95) return 0;
1511   Double_t  y=t.GetYat(x);
1512   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1513     if (y > ymax) {
1514       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1515       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
1516         return 0;
1517     } else if (y <-ymax) {
1518       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1519       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
1520         return 0;
1521     }
1522     //return 1;
1523   }
1524   //
1525   if (!t.PropagateTo(x)) {
1526     if (fIteration==0) t.fRemoval = 10;
1527     return 0;
1528   }
1529   y=t.GetY(); 
1530   Double_t z=t.GetZ();
1531   //
1532   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1533   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1534   Double_t  roady  =1.;
1535   Double_t  roadz = 1.;
1536   //
1537   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1538     t.fInDead = kTRUE;
1539     t.SetClusterIndex2(nr,-1); 
1540     return 0;
1541   } 
1542   else
1543     {
1544       if (TMath::Abs(z)<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10)) t.fNFoundable++;
1545       else
1546         return 0;
1547     }   
1548   //calculate 
1549   if (krow) {
1550     //    cl = krow.FindNearest2(y+10.,z,roady,roadz,index);    
1551     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);    
1552     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);       
1553   }  
1554   if (cl) {
1555     t.fCurrentCluster = cl; 
1556     t.fRow = nr;
1557     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(10)) return 0; 
1558     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1559     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(11)) {
1560       t.fErrorY2 += 0.03;
1561       t.fErrorZ2 += 0.03; 
1562       t.fErrorY2 *= 3;
1563       t.fErrorZ2 *= 3; 
1564     }
1565     /*    
1566     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1567       //
1568       //     
1569
1570       t.fNShared++;
1571       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1572         t.fRemoval =10;
1573         return 0;
1574       }
1575     }
1576     */
1577     if (accept<3) UpdateTrack(&t,accept);
1578
1579   } else {  
1580     if ( fIteration==0 && t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) t.fRemoval=10;
1581     
1582   }
1583   return 1;
1584 }
1585
1586 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextFast(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1587   //-----------------------------------------------------------------
1588   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1589   //-----------------------------------------------------------------
1590   //
1591   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1592   Double_t y,z; 
1593   if (!t.GetProlongation(x,y,z)) {
1594     t.fRemoval = 10;
1595     return 0;
1596   }
1597   //
1598   //
1599   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1600     
1601     if (y > ymax) {
1602       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1603       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
1604         return 0;
1605     } else if (y <-ymax) {
1606       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1607       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
1608         return 0;
1609     }
1610     if (!t.PropagateTo(x)) {
1611       return 0;
1612     } 
1613     t.GetProlongation(x,y,z);
1614   }
1615   //
1616   // update current shape info every 3 pad-row
1617   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1618     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1619     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1620     GetShape(&t,nr);
1621   }
1622   //  
1623   AliTPCclusterMI *cl=0;
1624   UInt_t index=0;
1625   
1626   
1627   //Int_t nr2 = nr;
1628   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1629   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1630   Double_t  roady  =1.;
1631   Double_t  roadz = 1.;
1632   //
1633   Int_t row = nr;
1634   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1635     t.fInDead = kTRUE;
1636     t.SetClusterIndex2(row,-1); 
1637     return 0;
1638   } 
1639   else
1640     {
1641       if (TMath::Abs(z)>(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10)) t.SetClusterIndex2(row,-1);
1642     }   
1643   //calculate 
1644   
1645   if ((cl==0)&&(krow)) {
1646     //    cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,index);    
1647     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);    
1648
1649     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);       
1650   }  
1651
1652   if (cl) {
1653     t.fCurrentCluster = cl; 
1654     //    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);        
1655     //if (accept<3){
1656       t.SetClusterIndex2(row,index);
1657       t.fClusterPointer[row] = cl;
1658       //}
1659   }
1660   return 1;
1661 }
1662
1663
1664
1665 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateClusters(AliTPCseed& t,  Int_t nr) {
1666   //-----------------------------------------------------------------
1667   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1668   //-----------------------------------------------------------------
1669   t.fCurrentCluster  = 0;
1670   t.fCurrentClusterIndex1 = 0;   
1671    
1672   Double_t xt=t.GetX();
1673   Int_t     row = GetRowNumber(xt)-1; 
1674   Double_t  ymax= GetMaxY(nr);
1675
1676   if (row < nr) return 1; // don't prolongate if not information until now -
1677   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.9 && t.GetNumberOfClusters()>40. && fIteration!=2) {
1678     t.fRemoval =10;
1679     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1680   } 
1681   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95) {
1682     t.fRemoval =10;
1683     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1684   }
1685
1686   Double_t x= GetXrow(nr);
1687   Double_t y,z;
1688   //t.PropagateTo(x+0.02);
1689   //t.PropagateTo(x+0.01);
1690   if (!t.PropagateTo(x)){
1691     return 0;
1692   }
1693   //
1694   y=t.GetY();
1695   z=t.GetZ();
1696
1697   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1698     if (y > ymax) {
1699       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1700       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
1701         return 0;
1702     } else if (y <-ymax) {
1703       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1704       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
1705         return 0;
1706     }
1707     //    if (!t.PropagateTo(x)){
1708     //  return 0;
1709     //}
1710     return 1;
1711     //y = t.GetY();    
1712   }
1713   //
1714
1715   AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1716
1717   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1718     t.fInDead = kTRUE;
1719     t.SetClusterIndex2(nr,-1); 
1720     return 0;
1721   } 
1722   else
1723     {
1724       if (TMath::Abs(t.GetZ())<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*t.GetX()+10)) t.fNFoundable++;
1725       else
1726         return 0;      
1727     }
1728
1729   // update current
1730   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2){
1731     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1732     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1733     GetShape(&t,nr);
1734   }
1735     
1736   AliTPCclusterMI *cl=0;
1737   UInt_t index=0;
1738   //
1739   Double_t roady = 1.;
1740   Double_t roadz = 1.;
1741   //
1742
1743   if (!cl){
1744     index = t.GetClusterIndex2(nr);    
1745     if ( (index>0) && (index&0x8000)==0){
1746       cl = t.fClusterPointer[nr];
1747       if ( (cl==0) && (index>0)) cl = GetClusterMI(index);
1748       t.fCurrentClusterIndex1 = index;
1749       if (cl) {
1750         t.fCurrentCluster  = cl;
1751         return 1;
1752       }
1753     }
1754   }
1755
1756   if (krow) {    
1757     //cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,index);      
1758     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);      
1759   }
1760
1761   if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);   
1762   t.fCurrentCluster  = cl;
1763
1764   return 1;
1765 }
1766
1767
1768 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextCluster(AliTPCseed & t, Int_t nr) {
1769   //-----------------------------------------------------------------
1770   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1771   //-----------------------------------------------------------------
1772
1773   //update error according neighborhoud
1774
1775   if (t.fCurrentCluster) {
1776     t.fRow = nr; 
1777     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1778     
1779     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1780       //
1781       //
1782       //  t.fErrorZ2*=2;
1783       //  t.fErrorY2*=2;
1784       t.fNShared++;
1785       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1786         t.fRemoval =10;
1787         return 0;
1788       }
1789     }   
1790     if (fIteration>0) accept = 0;
1791     if (accept<3)  UpdateTrack(&t,accept);  
1792  
1793   } else {
1794     if (fIteration==0){
1795       if ( ( (t.GetSigmaY2()+t.GetSigmaZ2())>0.16)&& t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;      
1796       if (  t.GetChi2()/t.GetNumberOfClusters()>6 &&t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;      
1797
1798       if (( (t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) || t.fNoCluster>15)) t.fRemoval=10;
1799     }
1800   }
1801   return 1;
1802 }
1803
1804
1805
1806 //_____________________________________________________________________________
1807 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1808   //-----------------------------------------------------------------
1809   // This function tries to find a track prolongation.
1810   //-----------------------------------------------------------------
1811   Double_t xt=t.GetX();
1812   //
1813   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1814   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();  
1815   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();  
1816   //
1817   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1818     
1819   Int_t first = GetRowNumber(xt)-1;
1820   for (Int_t nr= first; nr>=rf; nr-=step) {    
1821     if (nr<fInnerSec->GetNRows()) 
1822       fSectors = fInnerSec;
1823     else
1824       fSectors = fOuterSec;
1825     if (FollowToNext(t,nr)==0) 
1826       if (!t.IsActive()) 
1827         return 0;
1828     
1829   }   
1830   return 1;
1831 }
1832
1833
1834 //_____________________________________________________________________________
1835 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongationFast(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1836   //-----------------------------------------------------------------
1837   // This function tries to find a track prolongation.
1838   //-----------------------------------------------------------------
1839   Double_t xt=t.GetX();
1840   //
1841   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1842   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();  
1843   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();  
1844   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1845     
1846   for (Int_t nr=GetRowNumber(xt)-1; nr>=rf; nr-=step) {
1847     
1848     if (FollowToNextFast(t,nr)==0) 
1849       if (!t.IsActive()) return 0;
1850     
1851   }   
1852   return 1;
1853 }
1854
1855
1856
1857
1858
1859 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowBackProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf) {
1860   //-----------------------------------------------------------------
1861   // This function tries to find a track prolongation.
1862   //-----------------------------------------------------------------
1863   //  Double_t xt=t.GetX();  
1864   //
1865   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1866   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();  
1867   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();  
1868   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1869     
1870   Int_t first = t.fFirstPoint;
1871   //
1872   if (first<0) first=0;
1873   for (Int_t nr=first; nr<=rf; nr++) {
1874     //if ( (t.GetSnp()<0.9))
1875     if (nr<fInnerSec->GetNRows()) 
1876       fSectors = fInnerSec;
1877     else
1878       fSectors = fOuterSec;
1879     FollowToNext(t,nr);                                                             
1880   }   
1881   return 1;
1882 }
1883
1884
1885
1886
1887    
1888 Float_t AliTPCtrackerMI::OverlapFactor(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2, Int_t &sum1, Int_t & sum2)
1889 {
1890   //
1891   //
1892   sum1=0;
1893   sum2=0;
1894   Int_t sum=0;
1895   //
1896   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1897   dz2*=dz2;  
1898
1899   Float_t dy2 =TMath::Abs((s1->GetY() - s2->GetY()));
1900   dy2*=dy2;
1901   Float_t distance = TMath::Sqrt(dz2+dy2);
1902   if (distance>4.) return 0; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1903  
1904   //  Int_t offset =0;
1905   Int_t firstpoint = TMath::Min(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1906   Int_t lastpoint = TMath::Max(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1907   if (lastpoint>160) 
1908     lastpoint =160;
1909   if (firstpoint<0) 
1910     firstpoint = 0;
1911   if (firstpoint>lastpoint) {
1912     firstpoint =lastpoint;
1913     //    lastpoint  =160;
1914   }
1915     
1916   
1917   for (Int_t i=firstpoint-1;i<lastpoint+1;i++){
1918     if (s1->GetClusterIndex2(i)>0) sum1++;
1919     if (s2->GetClusterIndex2(i)>0) sum2++;
1920     if (s1->GetClusterIndex2(i)==s2->GetClusterIndex2(i) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1921       sum++;
1922     }
1923   }
1924   if (sum<5) return 0;
1925
1926   Float_t summin = TMath::Min(sum1+1,sum2+1);
1927   Float_t ratio = (sum+1)/Float_t(summin);
1928   return ratio;
1929 }
1930
1931 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2)
1932 {
1933   //
1934   //
1935   if (TMath::Abs(s1->GetC()-s2->GetC())>0.004) return;
1936   if (TMath::Abs(s1->GetTgl()-s2->GetTgl())>0.6) return;
1937
1938   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1939   dz2*=dz2;
1940   Float_t dy2 =(s1->GetY() - s2->GetY());
1941   dy2*=dy2;
1942   Float_t distance = dz2+dy2;
1943   if (distance>325.) return ; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1944   
1945   //
1946   Int_t sumshared=0;
1947   //
1948   Int_t firstpoint = TMath::Max(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1949   Int_t lastpoint = TMath::Min(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1950   //
1951   if (firstpoint>=lastpoint-5) return;;
1952
1953   for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1954     //    if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1955     if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1956       sumshared++;
1957     }
1958   }
1959   if (sumshared>4){
1960     // sign clusters
1961     //
1962     for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1963       //      if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1964       if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1965         AliTPCTrackerPoint *p1  = s1->GetTrackPoint(i);
1966         AliTPCTrackerPoint *p2  = s2->GetTrackPoint(i);; 
1967         if (s1->IsActive()&&s2->IsActive()){
1968           p1->fIsShared = kTRUE;
1969           p2->fIsShared = kTRUE;
1970         }       
1971       }
1972     }
1973   }
1974   //  
1975   if (sumshared>10){
1976     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1977       if (s1->fOverlapLabels[3*i]==0){
1978         s1->fOverlapLabels[3*i] = s2->GetLabel();
1979         s1->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1980         s1->fOverlapLabels[3*i+2] = s2->GetUniqueID();
1981         break;
1982       } 
1983     }
1984     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1985       if (s2->fOverlapLabels[3*i]==0){
1986         s2->fOverlapLabels[3*i] = s1->GetLabel();
1987         s2->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1988         s2->fOverlapLabels[3*i+2] = s1->GetUniqueID();
1989         break;
1990       } 
1991     }    
1992   }
1993   
1994 }
1995
1996 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(TObjArray * arr)
1997 {
1998   //
1999   //sort trackss according sectors
2000   //  
2001   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
2002     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2003     if (!pt) continue;
2004     //if (pt) RotateToLocal(pt);
2005     pt->fSort = 0;
2006   }
2007   arr->UnSort();
2008   arr->Sort();  // sorting according z
2009   arr->Expand(arr->GetEntries());
2010   //
2011   //
2012   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
2013   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2014     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2015     if (!pt) continue;
2016     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2017       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2018     }
2019   }
2020   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2021     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2022     if (!pt) continue;
2023     if (pt->fRemoval>10) continue;
2024     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2025       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2026       //      if (pt2){
2027       if (pt2->fRemoval<=10) {
2028         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2029         SignShared(pt,pt2);
2030       }
2031     }  
2032   }
2033 }
2034
2035 void  AliTPCtrackerMI::RemoveDouble(TObjArray * arr, Float_t factor1, Float_t factor2,  Int_t removalindex)
2036 {
2037   //
2038   //sort trackss according sectors
2039   //
2040   if (fDebug&1) {
2041     Info("RemoveDouble","Number of tracks before double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2042   }
2043   //
2044   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
2045     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2046     if (!pt) continue;
2047     pt->fSort = 0;
2048   }
2049   arr->UnSort();
2050   arr->Sort();  // sorting according z
2051   arr->Expand(arr->GetEntries());
2052   //
2053   //reset overlap labels
2054   //
2055   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
2056   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2057     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2058     if (!pt) continue;
2059     pt->SetUniqueID(i);
2060     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2061       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2062     }
2063   }
2064   //
2065   //sign shared tracks
2066   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2067     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2068     if (!pt) continue;
2069     if (pt->fRemoval>10) continue;
2070     Float_t deltac = pt->GetC()*0.1;
2071     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2072       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2073       //      if (pt2){
2074       if (pt2->fRemoval<=10) {
2075         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2076         if (TMath::Abs(pt->GetC()  -pt2->GetC())>deltac) continue;
2077         if (TMath::Abs(pt->GetTgl()-pt2->GetTgl())>0.05) continue;
2078         //
2079         SignShared(pt,pt2);
2080       }
2081     }
2082   }
2083   //
2084   // remove highly shared tracks
2085   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2086     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2087     if (!pt) continue;
2088     if (pt->fRemoval>10) continue;
2089     //
2090     Int_t sumshared =0;
2091     for (Int_t j=0;j<4;j++){
2092       sumshared = pt->fOverlapLabels[j*3+1];      
2093     }
2094     Float_t factor = factor1;
2095     if (pt->fRemoval>0) factor = factor2;
2096     if (sumshared/pt->GetNumberOfClusters()>factor){
2097       for (Int_t j=0;j<4;j++){
2098         if (pt->fOverlapLabels[3*j]==0) continue;
2099         if (pt->fOverlapLabels[3*j+1]<5) continue; 
2100         if (pt->fRemoval==removalindex) continue;      
2101         AliTPCseed * pt2 = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(pt->fOverlapLabels[3*j+2]);
2102         if (!pt2) continue;
2103         if (pt2->GetSigma2C()<pt->GetSigma2C()){
2104           //      pt->fRemoval = removalindex;
2105           delete arr->RemoveAt(i);        
2106           break;
2107         }
2108       }      
2109     }
2110   }
2111   arr->Compress();
2112   if (fDebug&1) {
2113     Info("RemoveDouble","Number of tracks after double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2114   }
2115 }
2116
2117
2118
2119
2120
2121
2122 void AliTPCtrackerMI::SortTracks(TObjArray * arr, Int_t mode) const
2123 {
2124   //
2125   //sort tracks in array according mode criteria
2126   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();    
2127   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2128     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2129     if (!pt) {
2130       continue;
2131     }
2132     pt->fSort = mode;
2133   }
2134   arr->UnSort();
2135   arr->Sort();
2136 }
2137
2138 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t removalindex)
2139 {
2140
2141   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2142   //
2143   //
2144   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();  
2145   Int_t good =0;
2146
2147   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2148     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2149     if (!pt) {
2150       delete arr->RemoveAt(i);
2151     }
2152     else{
2153       pt->fSort =1;
2154       pt->fBSigned = kFALSE;
2155     }
2156   }
2157   arr->Compress();
2158   nseed = arr->GetEntriesFast();
2159   arr->UnSort();
2160   arr->Sort();
2161   //
2162   //unsign used
2163   UnsignClusters();
2164   //
2165   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2166     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2167     if (!pt) {
2168       continue;
2169     }    
2170     Int_t found,foundable,shared;
2171     if (pt->IsActive()) 
2172       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kFALSE);
2173     else
2174       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kTRUE); 
2175     //
2176     Double_t factor = factor2;
2177     if (pt->fBConstrain) factor = factor1;
2178
2179     if ((Float_t(shared)/Float_t(found))>factor){
2180       pt->Desactivate(removalindex);
2181       continue;
2182     }
2183
2184     good++;
2185     for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2186       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2187       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2188       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];        
2189       if (!c) continue;
2190       //      if (!c->IsUsed(10)) c->Use(10);
2191       //if (pt->IsActive()) 
2192       c->Use(10);  
2193       //else
2194       //        c->Use(5);
2195     }
2196     
2197   }
2198   fNtracks = good;
2199   if (fDebug>0){
2200     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2201   }
2202 }
2203
2204 void AliTPCtrackerMI::UnsignClusters() 
2205 {
2206   //
2207   // loop over all clusters and unsign them
2208   //
2209   
2210   for (Int_t sec=0;sec<fkNIS;sec++){
2211     for (Int_t row=0;row<fInnerSec->GetNRows();row++){
2212       AliTPCclusterMI *cl = fInnerSec[sec][row].fClusters1;
2213       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN1;icl++)
2214         //      if (cl[icl].IsUsed(10))         
2215         cl[icl].Use(-1);
2216       cl = fInnerSec[sec][row].fClusters2;
2217       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN2;icl++)
2218         //if (cl[icl].IsUsed(10))       
2219           cl[icl].Use(-1);      
2220     }
2221   }
2222   
2223   for (Int_t sec=0;sec<fkNOS;sec++){
2224     for (Int_t row=0;row<fOuterSec->GetNRows();row++){
2225       AliTPCclusterMI *cl = fOuterSec[sec][row].fClusters1;
2226       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN1;icl++)
2227         //if (cl[icl].IsUsed(10))       
2228           cl[icl].Use(-1);
2229       cl = fOuterSec[sec][row].fClusters2;
2230       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN2;icl++)
2231         //if (cl[icl].IsUsed(10))       
2232         cl[icl].Use(-1);      
2233     }
2234   }
2235   
2236 }
2237
2238
2239
2240 void AliTPCtrackerMI::SignClusters(TObjArray * arr, Float_t fnumber, Float_t fdensity)
2241 {
2242   //
2243   //sign clusters to be "used"
2244   //
2245   // snumber and sdensity sign number of sigmas - bellow mean value to be accepted
2246   // loop over "primaries"
2247   
2248   Float_t sumdens=0;
2249   Float_t sumdens2=0;
2250   Float_t sumn   =0;
2251   Float_t sumn2  =0;
2252   Float_t sumchi =0;
2253   Float_t sumchi2 =0;
2254
2255   Float_t sum    =0;
2256
2257   TStopwatch timer;
2258   timer.Start();
2259
2260   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2261   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2262     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2263     if (!pt) {
2264       continue;
2265     }    
2266     if (!(pt->IsActive())) continue;
2267     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2268     if ( (dens>0.7) && (pt->GetNumberOfClusters()>70)){
2269       sumdens += dens;
2270       sumdens2+= dens*dens;
2271       sumn    += pt->GetNumberOfClusters();
2272       sumn2   += pt->GetNumberOfClusters()*pt->GetNumberOfClusters();
2273       Float_t chi2 = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2274       if (chi2>5) chi2=5;
2275       sumchi  +=chi2;
2276       sumchi2 +=chi2*chi2;
2277       sum++;
2278     }
2279   }
2280
2281   Float_t mdensity = 0.9;
2282   Float_t meann    = 130;
2283   Float_t meanchi  = 1;
2284   Float_t sdensity = 0.1;
2285   Float_t smeann    = 10;
2286   Float_t smeanchi  =0.4;
2287   
2288
2289   if (sum>20){
2290     mdensity = sumdens/sum;
2291     meann    = sumn/sum;
2292     meanchi  = sumchi/sum;
2293     //
2294     sdensity = sumdens2/sum-mdensity*mdensity;
2295     sdensity = TMath::Sqrt(sdensity);
2296     //
2297     smeann   = sumn2/sum-meann*meann;
2298     smeann   = TMath::Sqrt(smeann);
2299     //
2300     smeanchi = sumchi2/sum - meanchi*meanchi;
2301     smeanchi = TMath::Sqrt(smeanchi);
2302   }
2303
2304
2305   //REMOVE  SHORT DELTAS or tracks going out of sensitive volume of TPC
2306   //
2307   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2308     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2309     if (!pt) {
2310       continue;
2311     }
2312     if (pt->fBSigned) continue;
2313     if (pt->fBConstrain) continue;    
2314     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2315     /*
2316     Int_t found,foundable,shared;    
2317     pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared);
2318     if (shared/float(found)>0.3) {
2319       if (shared/float(found)>0.9 ){
2320         //delete arr->RemoveAt(i);
2321       }
2322       continue;
2323     }
2324     */
2325     Bool_t isok =kFALSE;
2326     if ( (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.5) &&pt->GetNumberOfClusters()>60)
2327       isok = kTRUE;
2328     if ((TMath::Abs(1/pt->GetC())<100.) && (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.7))
2329       isok =kTRUE;
2330     if  (TMath::Abs(pt->GetZ()/pt->GetX())>1.1)
2331       isok =kTRUE;
2332     if ( (TMath::Abs(pt->GetSnp()>0.7) && pt->GetD(0,0)>60.))
2333       isok =kTRUE;
2334     
2335     if (isok)     
2336       for (Int_t i=0; i<160; i++) {     
2337         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2338         if (index<0) continue;
2339         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2340         if (!c) continue;
2341         //if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();  
2342         c->Use(10);  
2343       }
2344   }
2345   
2346   
2347   //
2348   Double_t maxchi  = meanchi+2.*smeanchi;
2349
2350   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2351     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2352     if (!pt) {
2353       continue;
2354     }    
2355     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2356     if (pt->fBSigned) continue;
2357     Double_t chi     = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2358     if (chi>maxchi) continue;
2359
2360     Float_t bfactor=1;
2361     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2362    
2363     //sign only tracks with enoug big density at the beginning
2364     
2365     if ((pt->GetDensityFirst(40)<0.75) && pt->GetNumberOfClusters()<meann) continue; 
2366     
2367     
2368     Double_t mindens = TMath::Max(double(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor),0.65);
2369     Double_t minn    = TMath::Max(Int_t(meann-fnumber*smeann*bfactor),50);
2370    
2371     //    if (pt->fBConstrain) mindens = TMath::Max(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor,0.65);
2372     if ( (pt->fRemoval==10) && (pt->GetSnp()>0.8)&&(dens>mindens))
2373       minn=0;
2374
2375     if ((dens>mindens && pt->GetNumberOfClusters()>minn) && chi<maxchi ){
2376       //Int_t noc=pt->GetNumberOfClusters();
2377       pt->fBSigned = kTRUE;
2378       for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2379
2380         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2381         if (index<0) continue;
2382         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2383         if (!c) continue;
2384         //      if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();  
2385         c->Use(10);  
2386       }
2387     }
2388   }
2389   //  gLastCheck = nseed;
2390   //  arr->Compress();
2391   if (fDebug>0){
2392     timer.Print();
2393   }
2394 }
2395
2396
2397 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(TObjArray * arr, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1, Float_t th2) const
2398 {
2399   // stop not active tracks
2400   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2401   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows 
2402   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();  
2403   //
2404   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2405     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2406     if (!pt) {
2407       continue;
2408     }
2409     if (!(pt->IsActive())) continue;
2410     StopNotActive(pt,row0,th0, th1,th2);
2411   }
2412 }
2413
2414
2415
2416 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(AliTPCseed * seed, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1,
2417  Float_t th2) const
2418 {
2419   // stop not active tracks
2420   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2421   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows 
2422   Int_t sumgood1  = 0;
2423   Int_t sumgood2  = 0;
2424   Int_t foundable = 0;
2425   Int_t maxindex = seed->fLastPoint;  //last foundable row
2426   if (seed->fNFoundable*th0 > seed->GetNumberOfClusters()) {
2427     seed->Desactivate(10) ;
2428     return;
2429   }
2430
2431   for (Int_t i=row0; i<maxindex; i++){
2432     Int_t index = seed->GetClusterIndex2(i);
2433     if (index!=-1) foundable++;
2434     //if (!c) continue;
2435     if (foundable<=30) sumgood1++;
2436     if (foundable<=50) {
2437       sumgood2++;
2438     }
2439     else{ 
2440       break;
2441     }        
2442   }
2443   if (foundable>=30.){ 
2444      if (sumgood1<(th1*30.)) seed->Desactivate(10);
2445   }
2446   if (foundable>=50)
2447     if (sumgood2<(th2*50.)) seed->Desactivate(10);
2448 }
2449
2450
2451 Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESD *event)
2452 {
2453   //
2454   // back propagation of ESD tracks
2455   //
2456   //return 0;
2457   fEvent = event;
2458   ReadSeeds(event,2);
2459   fIteration=2;
2460   //PrepareForProlongation(fSeeds,1);
2461   PropagateForward2(fSeeds);
2462   Int_t ntracks=0;
2463   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2464   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2465     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2466     if (!seed) continue;
2467     seed->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
2468     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2469     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2470     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2471     if (seed->GetNumberOfClusters()>60){
2472       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCrefit); 
2473       ntracks++;
2474     }
2475     else{
2476       //printf("problem\n");
2477     }
2478   }
2479   Info("RefitInward","Number of refitted tracks %d",ntracks);
2480   fEvent =0;
2481   //WriteTracks();
2482   return 0;
2483 }
2484
2485
2486 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliESD *event)
2487 {
2488   //
2489   // back propagation of ESD tracks
2490   //
2491
2492   fEvent = event;
2493   fIteration = 1;
2494   ReadSeeds(event,0);
2495   PropagateBack(fSeeds);
2496   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2497   Int_t ntracks=0;
2498   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2499     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2500     if (!seed) continue;
2501     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2502     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2503     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2504     if (seed->GetNumberOfClusters()>60){
2505       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCout);
2506       ntracks++;
2507     }
2508   }
2509   Info("PropagateBack","Number of back propagated tracks %d",ntracks);
2510   fEvent =0;
2511   //WriteTracks();
2512   return 0;
2513 }
2514
2515
2516 void AliTPCtrackerMI::DeleteSeeds()
2517 {
2518   //
2519   //delete Seeds
2520   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2521   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2522     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*)fSeeds->At(i);
2523     if (seed) delete fSeeds->RemoveAt(i);
2524   }
2525   delete fSeeds;
2526   fSeeds =0;
2527 }
2528
2529 void AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(AliESD *event, Int_t direction)
2530 {
2531   //
2532   //read seeds from the event
2533   
2534   Int_t nentr=event->GetNumberOfTracks();
2535   if (fDebug>0){
2536     Info("ReadSeeds", "Number of ESD tracks: %d\n", nentr);
2537   }
2538   if (fSeeds) 
2539     DeleteSeeds();
2540   if (!fSeeds){   
2541     fSeeds = new TObjArray(nentr);
2542   }
2543   UnsignClusters();
2544   //  Int_t ntrk=0;  
2545   for (Int_t i=0; i<nentr; i++) {
2546     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2547     ULong_t status=esd->GetStatus();    
2548     AliTPCtrack t(*esd);
2549     AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t,t.GetAlpha());
2550     if ((status==AliESDtrack::kTPCin)&&(direction==1)) seed->ResetCovariance(); 
2551     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) == 0 ) seed->ResetCovariance();
2552     if ( direction ==2 && ((status & AliESDtrack::kTPCout) == 0) ) {
2553       fSeeds->AddAt(0,i);
2554       delete seed;
2555       continue;    
2556     }
2557     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) > 0 )  {
2558       Double_t par0[5],par1[5],x;
2559       esd->GetInnerExternalParameters(x,par0);
2560       esd->GetExternalParameters(x,par1);
2561       Double_t delta1 = TMath::Abs(par0[4]-par1[4])/(0.000000001+TMath::Abs(par0[4]+par1[4]));
2562       Double_t delta2 = TMath::Abs(par0[3]-par1[3]);
2563       //reset covariance if suspicious 
2564       if ( (delta1>0.1) || (delta2>0.006))
2565         seed->ResetCovariance();
2566     }
2567
2568     //
2569     //
2570     // rotate to the local coordinate system
2571    
2572     fSectors=fInnerSec; fN=fkNIS;
2573     
2574     Double_t alpha=seed->GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
2575     if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
2576     if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
2577     Int_t ns=Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha())%fN;
2578     alpha =ns*fSectors->GetAlpha() + fSectors->GetAlphaShift();
2579     if (alpha<-TMath::Pi()) alpha += 2*TMath::Pi();
2580     if (alpha>=TMath::Pi()) alpha -= 2*TMath::Pi();
2581     alpha-=seed->GetAlpha();  
2582     if (!seed->Rotate(alpha)) {
2583       delete seed;
2584       continue;
2585     }
2586     seed->fEsd = esd;
2587     //
2588     //seed->PropagateTo(fSectors->GetX(0));
2589     //
2590     //    Int_t index = esd->GetTPCindex();
2591     //AliTPCseed * seed2= (AliTPCseed*)fSeeds->At(index);
2592     //if (direction==2){
2593     //  AliTPCseed * seed2  = ReSeed(seed,0.,0.5,1.);
2594     //  if (seed2) {
2595     //  delete seed;
2596     //  seed = seed2;
2597     //  }
2598     //}
2599     //
2600     // sign clusters
2601     for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
2602       Int_t index = seed->GetClusterIndex2(irow);    
2603       if (index>0){ 
2604         //
2605         AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(index);
2606         seed->fClusterPointer[irow] = cl;
2607         if (cl){
2608           if ((index & 0x8000)==0){
2609             cl->Use(10);  // accepted cluster     
2610           }else{
2611             cl->Use(6);   // close cluster not accepted
2612           }     
2613         }else{
2614            Info("ReadSeeds","Not found cluster");
2615         }
2616       }
2617     }
2618     fSeeds->AddAt(seed,i);
2619   }
2620 }
2621
2622
2623
2624 //_____________________________________________________________________________
2625 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds3(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
2626                                  Float_t deltay, Int_t ddsec) {
2627   //-----------------------------------------------------------------
2628   // This function creates track seeds.
2629   // SEEDING WITH VERTEX CONSTRAIN 
2630   //-----------------------------------------------------------------
2631   // cuts[0]   - fP4 cut
2632   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
2633   // cuts[2]   - zvertex cut
2634   // cuts[3]   - fP3 cut
2635   Int_t nin0  = 0;
2636   Int_t nin1  = 0;
2637   Int_t nin2  = 0;
2638   Int_t nin   = 0;
2639   Int_t nout1 = 0;
2640   Int_t nout2 = 0;
2641
2642   Double_t x[5], c[15];
2643   //  Int_t di = i1-i2;
2644   //
2645   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
2646   Double_t alpha=fSectors->GetAlpha(), shift=fSectors->GetAlphaShift();
2647   Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
2648   //
2649   //  Double_t x1 =fOuterSec->GetX(i1);
2650   //Double_t xx2=fOuterSec->GetX(i2);
2651   
2652   Double_t x1 =GetXrow(i1);
2653   Double_t xx2=GetXrow(i2);
2654
2655   Double_t x3=GetX(), y3=GetY(), z3=GetZ();
2656
2657   Int_t imiddle = (i2+i1)/2;    //middle pad row index
2658   Double_t xm = GetXrow(imiddle); // radius of middle pad-row
2659   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,imiddle); //middle pad -row
2660   //
2661   Int_t ns =sec;   
2662
2663   const AliTPCRow& kr1=GetRow(ns,i1);
2664   Double_t ymax  = GetMaxY(i1)-kr1.fDeadZone-1.5;  
2665   Double_t ymaxm = GetMaxY(imiddle)-kr1.fDeadZone-1.5;  
2666
2667   //
2668   // change cut on curvature if it can't reach this layer
2669   // maximal curvature set to reach it
2670   Double_t dvertexmax  = TMath::Sqrt((x1-x3)*(x1-x3)+(ymax+5-y3)*(ymax+5-y3));
2671   if (dvertexmax*0.5*cuts[0]>0.85){
2672     cuts[0] = 0.85/(dvertexmax*0.5+1.);
2673   }
2674   Double_t r2min = 1/(cuts[0]*cuts[0]);  //minimal square of radius given by cut
2675
2676   //  Int_t ddsec = 1;
2677   if (deltay>0) ddsec = 0; 
2678   // loop over clusters  
2679   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
2680     //
2681     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
2682     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();    
2683     //if (TMath::Abs(y1)>ymax) continue;
2684
2685     if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
2686
2687     // find possible directions    
2688     Float_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3); 
2689     Float_t extraz = z1 - anglez*(x1-xx2);  // extrapolated z      
2690     //
2691     //
2692     //find   rotation angles relative to line given by vertex and point 1
2693     Double_t dvertex2 = (x1-x3)*(x1-x3)+(y1-y3)*(y1-y3);
2694     Double_t dvertex  = TMath::Sqrt(dvertex2);
2695     Double_t angle13  = TMath::ATan((y1-y3)/(x1-x3));
2696     Double_t cs13     = cos(-angle13), sn13 = sin(-angle13);            
2697     
2698     //
2699     // loop over 2 sectors
2700     Int_t dsec1=-ddsec;
2701     Int_t dsec2= ddsec;
2702     if (y1<0)  dsec2= 0;
2703     if (y1>0)  dsec1= 0;
2704     
2705     Double_t dddz1=0;  // direction of delta inclination in z axis
2706     Double_t dddz2=0;
2707     if ( (z1-z3)>0)
2708       dddz1 =1;    
2709     else
2710       dddz2 =1;
2711     //
2712     for (Int_t dsec = dsec1; dsec<=dsec2;dsec++){
2713       Int_t sec2 = sec + dsec;
2714       // 
2715       //      AliTPCRow&  kr2  = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][i2];
2716       //AliTPCRow&  kr2m = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][imiddle];
2717       AliTPCRow&  kr2  = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,i2);
2718       AliTPCRow&  kr2m = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,imiddle);
2719       Int_t  index1 = TMath::Max(kr2.Find(extraz-0.6-dddz1*TMath::Abs(z1)*0.05)-1,0);
2720       Int_t  index2 = TMath::Min(kr2.Find(extraz+0.6+dddz2*TMath::Abs(z1)*0.05)+1,kr2);
2721
2722       // rotation angles to p1-p3
2723       Double_t cs13r     = cos(-angle13+dsec*alpha)/dvertex, sn13r = sin(-angle13+dsec*alpha)/dvertex;            
2724       Double_t x2,   y2,   z2; 
2725       //
2726       //      Double_t dymax = maxangle*TMath::Abs(x1-xx2);
2727
2728       //
2729       Double_t dxx0 =  (xx2-x3)*cs13r;
2730       Double_t dyy0 =  (xx2-x3)*sn13r;
2731       for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
2732         const AliTPCclusterMI *kcl = kr2[js];
2733         if (kcl->IsUsed(10)) continue;  
2734         //
2735         //calcutate parameters
2736         //      
2737         Double_t yy0 =  dyy0 +(kcl->GetY()-y3)*cs13r;
2738         // stright track
2739         if (TMath::Abs(yy0)<0.000001) continue;
2740         Double_t xx0 =  dxx0 -(kcl->GetY()-y3)*sn13r;
2741         Double_t y0  =  0.5*(xx0*xx0+yy0*yy0-xx0)/yy0;
2742         Double_t r02 = (0.25+y0*y0)*dvertex2;   
2743         //curvature (radius) cut
2744         if (r02<r2min) continue;                
2745        
2746         nin0++; 
2747         //
2748         Double_t c0  = 1/TMath::Sqrt(r02);
2749         if (yy0>0) c0*=-1.;     
2750                
2751        
2752         //Double_t dfi0   = 2.*TMath::ASin(dvertex*c0*0.5);
2753         //Double_t dfi1   = 2.*TMath::ASin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);
2754         Double_t dfi0   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(dvertex*c0*0.5);
2755         Double_t dfi1   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);  
2756         //
2757         //
2758         Double_t z0  =  kcl->GetZ();  
2759         Double_t zzzz2    = z1-(z1-z3)*dfi1/dfi0;
2760         if (TMath::Abs(zzzz2-z0)>0.5) continue;       
2761         nin1++;              
2762         //      
2763         Double_t dip    = (z1-z0)*c0/dfi1;        
2764         Double_t x0 = (0.5*cs13+y0*sn13)*dvertex*c0;
2765         //
2766         y2 = kcl->GetY(); 
2767         if (dsec==0){
2768           x2 = xx2; 
2769           z2 = kcl->GetZ();       
2770         }
2771         else
2772           {
2773             // rotation 
2774             z2 = kcl->GetZ();  
2775             x2= xx2*cs-y2*sn*dsec;
2776             y2=+xx2*sn*dsec+y2*cs;
2777           }
2778         
2779         x[0] = y1;
2780         x[1] = z1;
2781         x[2] = x0;
2782         x[3] = dip;
2783         x[4] = c0;
2784         //
2785         //
2786         // do we have cluster at the middle ?
2787         Double_t ym,zm;
2788         GetProlongation(x1,xm,x,ym,zm);
2789         UInt_t dummy; 
2790         AliTPCclusterMI * cm=0;
2791         if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){      
2792           cm = krm.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2793           if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {        
2794             continue;
2795           }
2796         }
2797         else{     
2798           // rotate y1 to system 0
2799           // get state vector in rotated system 
2800           Double_t yr1  = (-0.5*sn13+y0*cs13)*dvertex*c0;
2801           Double_t xr2  =  x0*cs+yr1*sn*dsec;
2802           Double_t xr[5]={kcl->GetY(),kcl->GetZ(), xr2, dip, c0};
2803           //
2804           GetProlongation(xx2,xm,xr,ym,zm);
2805           if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){
2806             cm = kr2m.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2807             if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {      
2808               continue;
2809             }
2810           }
2811         }
2812        
2813
2814         Double_t dym = 0;
2815         Double_t dzm = 0;
2816         if (cm){
2817           dym = ym - cm->GetY();
2818           dzm = zm - cm->GetZ();
2819         }
2820         nin2++;
2821
2822
2823         //
2824         //
2825         Double_t sy1=kr1[is]->GetSigmaY2()*2., sz1=kr1[is]->GetSigmaZ2()*2.;
2826         Double_t sy2=kcl->GetSigmaY2()*2.,     sz2=kcl->GetSigmaZ2()*2.;
2827         //Double_t sy3=400*3./12., sy=0.1, sz=0.1;
2828         Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
2829         //Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]*60+0.5, sy=0.1, sz=0.1;
2830
2831         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
2832         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
2833         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
2834         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
2835         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
2836         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
2837         
2838         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
2839         Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
2840         Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
2841         Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
2842         
2843         c[0]=sy1;
2844         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
2845         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
2846         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
2847                        c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
2848         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
2849         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
2850         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
2851         
2852         //      if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
2853         
2854         UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
2855         AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, ns*alpha+shift);
2856         
2857         track->fIsSeeding = kTRUE;
2858         track->fSeed1 = i1;
2859         track->fSeed2 = i2;
2860         track->fSeedType=3;
2861
2862        
2863         //if (dsec==0) {
2864           FollowProlongation(*track, (i1+i2)/2,1);
2865           Int_t foundable,found,shared;
2866           track->GetClusterStatistic((i1+i2)/2,i1, found, foundable, shared, kTRUE);
2867           if ((found<0.55*foundable)  || shared>0.5*found || (track->GetSigmaY2()+track->GetSigmaZ2())>0.5){
2868             seed->Reset();
2869             seed->~AliTPCseed();
2870             continue;
2871           }
2872           //}
2873         
2874         nin++;
2875         FollowProlongation(*track, i2,1);
2876         
2877         
2878         //Int_t rc = 1;
2879         track->fBConstrain =1;
2880         //      track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
2881         track->fLastPoint = i1;  // first cluster in track position
2882         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
2883         
2884         if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 || 
2885             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 || 
2886             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters() ) {
2887           seed->Reset();
2888           seed->~AliTPCseed();
2889           continue;
2890         }
2891         nout1++;
2892         // Z VERTEX CONDITION
2893         Double_t zv;
2894         zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
2895           ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
2896         if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]) {
2897           FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-20,0));
2898           zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
2899             ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
2900           if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]){
2901             FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-40,0));
2902             zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
2903               ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
2904             if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2] &&(track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.7)){
2905               // make seed without constrain
2906               AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,1.);
2907               FollowProlongation(*track2, i2,1);
2908               track2->fBConstrain = kFALSE;
2909               track2->fSeedType = 1;
2910               arr->AddLast(track2); 
2911               seed->Reset();
2912               seed->~AliTPCseed();
2913               continue;         
2914             }
2915             else{
2916               seed->Reset();
2917               seed->~AliTPCseed();
2918               continue;
2919             
2920             }
2921           }
2922         }
2923         
2924         track->fSeedType =0;
2925         arr->AddLast(track); 
2926         seed = new AliTPCseed;  
2927         nout2++;
2928         // don't consider other combinations
2929         if (track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.8)
2930           break;
2931       }
2932     }
2933   }
2934   if (fDebug>3){
2935     Info("MakeSeeds3","\nSeeding statistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2);
2936   }
2937   delete seed;
2938 }
2939
2940
2941 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds5(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
2942                                  Float_t deltay) {
2943   
2944
2945
2946   //-----------------------------------------------------------------
2947   // This function creates track seeds.
2948   //-----------------------------------------------------------------
2949   // cuts[0]   - fP4 cut
2950   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
2951   // cuts[2]   - zvertex cut
2952   // cuts[3]   - fP3 cut
2953
2954
2955   Int_t nin0  = 0;
2956   Int_t nin1  = 0;
2957   Int_t nin2  = 0;
2958   Int_t nin   = 0;
2959   Int_t nout1 = 0;
2960   Int_t nout2 = 0;
2961   Int_t nout3 =0;
2962   Double_t x[5], c[15];
2963   //
2964   // make temporary seed
2965   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
2966   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
2967   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
2968   //
2969   //
2970
2971   // first 3 padrows
2972   Double_t x1 = GetXrow(i1-1);
2973   const    AliTPCRow& kr1=GetRow(sec,i1-1);
2974   Double_t y1max  = GetMaxY(i1-1)-kr1.fDeadZone-1.5;  
2975   //
2976   Double_t x1p = GetXrow(i1);
2977   const    AliTPCRow& kr1p=GetRow(sec,i1);
2978   //
2979   Double_t x1m = GetXrow(i1-2);
2980   const    AliTPCRow& kr1m=GetRow(sec,i1-2);
2981
2982   //
2983   //last 3 padrow for seeding
2984   AliTPCRow&  kr3  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-7);
2985   Double_t    x3   =  GetXrow(i1-7);
2986   //  Double_t    y3max= GetMaxY(i1-7)-kr3.fDeadZone-1.5;  
2987   //
2988   AliTPCRow&  kr3p  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-6);
2989   Double_t    x3p   = GetXrow(i1-6);
2990   //
2991   AliTPCRow&  kr3m  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-8);
2992   Double_t    x3m   = GetXrow(i1-8);
2993
2994   //
2995   //
2996   // middle padrow
2997   Int_t im = i1-4;                           //middle pad row index
2998   Double_t xm         = GetXrow(im);         // radius of middle pad-row
2999   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,im);   //middle pad -row
3000   //  Double_t ymmax = GetMaxY(im)-kr1.fDeadZone-1.5;  
3001   //
3002   //
3003   Double_t deltax  = x1-x3;
3004   Double_t dymax   = deltax*cuts[1];
3005   Double_t dzmax   = deltax*cuts[3];
3006   //
3007   // loop over clusters  
3008   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
3009     //
3010     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
3011     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();    
3012     //
3013     if (deltay>0 && TMath::Abs(y1max-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge    
3014     // 
3015     Int_t  index1 = TMath::Max(kr3.Find(z1-dzmax)-1,0);
3016     Int_t  index2 = TMath::Min(kr3.Find(z1+dzmax)+1,kr3);
3017     //    
3018     Double_t y3,   z3;
3019     //
3020     //
3021     UInt_t index;
3022     for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
3023       const AliTPCclusterMI *kcl = kr3[js];
3024       if (kcl->IsUsed(10)) continue;
3025       y3 = kcl->GetY(); 
3026       // apply angular cuts
3027       if (TMath::Abs(y1-y3)>dymax) continue;
3028       x3 = x3; 
3029       z3 = kcl->GetZ(); 
3030       if (TMath::Abs(z1-z3)>dzmax) continue;
3031       //
3032       Double_t angley = (y1-y3)/(x1-x3);
3033       Double_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3);
3034       //
3035       Double_t erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3036       Double_t errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3037       //
3038       Double_t yyym = angley*(xm-x1)+y1;
3039       Double_t zzzm = anglez*(xm-x1)+z1;
3040
3041       const AliTPCclusterMI *kcm = krm.FindNearest2(yyym,zzzm,erry,errz,index);
3042       if (!kcm) continue;
3043       if (kcm->IsUsed(10)) continue;
3044       
3045       erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3046       errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3047       //
3048       //
3049       //
3050       Int_t used  =0;
3051       Int_t found =0;
3052       //
3053       // look around first
3054       const AliTPCclusterMI *kc1m = kr1m.FindNearest2(angley*(x1m-x1)+y1,
3055                                                       anglez*(x1m-x1)+z1,
3056                                                       erry,errz,index);
3057       //
3058       if (kc1m){
3059         found++;
3060         if (kc1m->IsUsed(10)) used++;
3061       }
3062       const AliTPCclusterMI *kc1p = kr1p.FindNearest2(angley*(x1p-x1)+y1,
3063                                                       anglez*(x1p-x1)+z1,
3064                                                       erry,errz,index);
3065       //
3066       if (kc1p){
3067         found++;
3068         if (kc1p->IsUsed(10)) used++;
3069       }
3070       if (used>1)  continue;
3071       if (found<1) continue; 
3072
3073       //
3074       // look around last
3075       const AliTPCclusterMI *kc3m = kr3m.FindNearest2(angley*(x3m-x3)+y3,
3076                                                       anglez*(x3m-x3)+z3,
3077                                                       erry,errz,index);
3078       //
3079       if (kc3m){
3080         found++;
3081         if (kc3m->IsUsed(10)) used++;
3082       }
3083       else 
3084         continue;
3085       const AliTPCclusterMI *kc3p = kr3p.FindNearest2(angley*(x3p-x3)+y3,
3086                                                       anglez*(x3p-x3)+z3,
3087                                                       erry,errz,index);
3088       //
3089       if (kc3p){
3090         found++;
3091         if (kc3p->IsUsed(10)) used++;
3092       }
3093       else 
3094         continue;
3095       if (used>1)  continue;
3096       if (found<3) continue;       
3097       //
3098       Double_t x2,y2,z2;
3099       x2 = xm;
3100       y2 = kcm->GetY();
3101       z2 = kcm->GetZ();
3102       //
3103                         
3104       x[0]=y1;
3105       x[1]=z1;
3106       x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3107       //if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;
3108       nin0++;
3109       //
3110       x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3111       nin1++;
3112       //
3113       x[3]=F3n(x1,y1,x2,y2,z1,z2,x[4]);
3114       //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3115       nin2++;
3116       //
3117       //
3118       Double_t sy1=0.1,  sz1=0.1;
3119       Double_t sy2=0.1,  sz2=0.1;
3120       Double_t sy3=0.1,  sy=0.1, sz=0.1;
3121       
3122       Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3123       Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3124       Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3125       Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3126       Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3127       Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3128       
3129       Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
3130       Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
3131       Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
3132       Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
3133       
3134       c[0]=sy1;
3135       c[1]=0.;       c[2]=sz1; 
3136       c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3137       c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3138       c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3139       c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3140       c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3141       c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3142       
3143       //        if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
3144       
3145       UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
3146       AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3147       
3148       track->fIsSeeding = kTRUE;
3149
3150       nin++;      
3151       FollowProlongation(*track, i1-7,1);
3152       if (track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.75 || 
3153           track->fNShared>0.6*track->GetNumberOfClusters() || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.6){
3154         seed->Reset();
3155         seed->~AliTPCseed();
3156         continue;
3157       }
3158       nout1++;
3159       nout2++;  
3160       //Int_t rc = 1;
3161       FollowProlongation(*track, i2,1);
3162       track->fBConstrain =0;
3163       track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3164       track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3165       
3166       if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 || 
3167           track->GetNumberOfClusters()<track->fNFoundable*0.7 || 
3168           track->fNShared>2. || track->GetChi2()/track->GetNumberOfClusters()>6 || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.5 ) {
3169         seed->Reset();
3170         seed->~AliTPCseed();
3171         continue;
3172       }
3173    
3174       {
3175         FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-10,0),1);
3176         AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,0.9);
3177         FollowProlongation(*track2, i2,1);
3178         track2->fBConstrain = kFALSE;
3179         track2->fSeedType = 4;
3180         arr->AddLast(track2); 
3181         seed->Reset();
3182         seed->~AliTPCseed();
3183       }
3184       
3185    
3186       //arr->AddLast(track); 
3187       //seed = new AliTPCseed;  
3188       nout3++;
3189     }
3190   }
3191   
3192   if (fDebug>3){
3193     Info("MakeSeeds5","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2,nout3);
3194   }
3195   delete seed;
3196 }
3197
3198
3199 //_____________________________________________________________________________
3200 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds2(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2, Float_t */*cuts[4]*/,
3201                                  Float_t deltay, Bool_t /*bconstrain*/) {
3202   //-----------------------------------------------------------------
3203   // This function creates track seeds - without vertex constraint
3204   //-----------------------------------------------------------------
3205   // cuts[0]   - fP4 cut        - not applied
3206   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3207   // cuts[2]   - zvertex cut    - not applied 
3208   // cuts[3]   - fP3 cut
3209   Int_t nin0=0;
3210   Int_t nin1=0;
3211   Int_t nin2=0;
3212   Int_t nin3=0;
3213   //  Int_t nin4=0;
3214   //Int_t nin5=0;
3215
3216   
3217
3218   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3219   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3220   Int_t row0 = (i1+i2)/2;
3221   Int_t drow = (i1-i2)/2;
3222   const AliTPCRow& kr0=fSectors[sec][row0];
3223   AliTPCRow * kr=0;
3224
3225   AliTPCpolyTrack polytrack;
3226   Int_t nclusters=fSectors[sec][row0];
3227   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3228
3229   Int_t sumused=0;
3230   Int_t cused=0;
3231   Int_t cnused=0;
3232   for (Int_t is=0; is < nclusters; is++) {  //LOOP over clusters
3233     Int_t nfound =0;
3234     Int_t nfoundable =0;
3235     for (Int_t iter =1; iter<2; iter++){   //iterations
3236       const AliTPCRow& krm=fSectors[sec][row0-iter];
3237       const AliTPCRow& krp=fSectors[sec][row0+iter];      
3238       const AliTPCclusterMI * cl= kr0[is];
3239       
3240       if (cl->IsUsed(10)) {
3241         cused++;
3242       }
3243       else{
3244         cnused++;
3245       }
3246       Double_t x = kr0.GetX();
3247       // Initialization of the polytrack
3248       nfound =0;
3249       nfoundable =0;
3250       polytrack.Reset();
3251       //
3252       Double_t y0= cl->GetY();
3253       Double_t z0= cl->GetZ();
3254       Float_t erry = 0;
3255       Float_t errz = 0;
3256       
3257       Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row0)-kr0.fDeadZone-1.5;
3258       if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
3259       
3260       erry = (0.5)*cl->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;      
3261       errz = (0.5)*cl->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;      
3262       polytrack.AddPoint(x,y0,z0,erry, errz);
3263
3264       sumused=0;
3265       if (cl->IsUsed(10)) sumused++;
3266
3267
3268       Float_t roady = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()+0.2)+1.)*iter;
3269       Float_t roadz = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaZ2()+0.2)+1.)*iter;
3270       //
3271       x = krm.GetX();
3272       AliTPCclusterMI * cl1 = krm.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3273       if (cl1 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))) {
3274         erry = (0.5)*cl1->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;          
3275         errz = (0.5)*cl1->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;
3276         if (cl1->IsUsed(10))  sumused++;
3277         polytrack.AddPoint(x,cl1->GetY(),cl1->GetZ(),erry,errz);
3278       }
3279       //
3280       x = krp.GetX();
3281       AliTPCclusterMI * cl2 = krp.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3282       if (cl2) {
3283         erry = (0.5)*cl2->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;          
3284         errz = (0.5)*cl2->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;
3285         if (cl2->IsUsed(10)) sumused++;  
3286         polytrack.AddPoint(x,cl2->GetY(),cl2->GetZ(),erry,errz);
3287       }
3288       //
3289       if (sumused>0) continue;
3290       nin0++;
3291       polytrack.UpdateParameters();
3292       // follow polytrack
3293       roadz = 1.2;
3294       roady = 1.2;
3295       //
3296       Double_t yn,zn;
3297       nfoundable = polytrack.GetN();
3298       nfound     = nfoundable; 
3299       //
3300       for (Int_t ddrow = iter+1; ddrow<drow;ddrow++){
3301         Float_t maxdist = 0.8*(1.+3./(ddrow));
3302         for (Int_t delta = -1;delta<=1;delta+=2){
3303           Int_t row = row0+ddrow*delta;
3304           kr = &(fSectors[sec][row]);
3305           Double_t xn = kr->GetX();
3306           Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row)-kr->fDeadZone-1.5;
3307           polytrack.GetFitPoint(xn,yn,zn);
3308           if (TMath::Abs(yn)>ymax) continue;
3309           nfoundable++;
3310           AliTPCclusterMI * cln = kr->FindNearest(yn,zn,roady,roadz);
3311           if (cln) {
3312             Float_t dist =  TMath::Sqrt(  (yn-cln->GetY())*(yn-cln->GetY())+(zn-cln->GetZ())*(zn-cln->GetZ()));
3313             if (dist<maxdist){
3314               /*
3315               erry = (dist+0.3)*cln->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));         
3316               errz = (dist+0.3)*cln->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));
3317               if (cln->IsUsed(10)) {
3318                 //      printf("used\n");
3319                 sumused++;
3320                 erry*=2;
3321                 errz*=2;
3322               }
3323               */
3324               erry=0.1;
3325               errz=0.1;
3326               polytrack.AddPoint(xn,cln->GetY(),cln->GetZ(),erry, errz);
3327               nfound++;
3328             }
3329           }
3330         }
3331         if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound) || (nfound<0.6*nfoundable))  break;     
3332         polytrack.UpdateParameters();
3333       }           
3334     }
3335     if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound))  {
3336       //printf("sumused   %d\n",sumused);
3337       continue;
3338     }
3339     nin1++;
3340     Double_t dy,dz;
3341     polytrack.GetFitDerivation(kr0.GetX(),dy,dz);
3342     AliTPCpolyTrack track2;
3343     
3344     polytrack.Refit(track2,0.5+TMath::Abs(dy)*0.3,0.4+TMath::Abs(dz)*0.3);
3345     if (track2.GetN()<0.5*nfoundable) continue;
3346     nin2++;
3347
3348     if ((nfound>0.6*nfoundable) &&( nfoundable>0.4*(i1-i2))) {
3349       //
3350       // test seed with and without constrain
3351       for (Int_t constrain=0; constrain<=0;constrain++){
3352         // add polytrack candidate
3353
3354         Double_t x[5], c[15];
3355         Double_t x1,x2,x3,y1,y2,y3,z1,z2,z3;
3356         track2.GetBoundaries(x3,x1);    
3357         x2 = (x1+x3)/2.;
3358         track2.GetFitPoint(x1,y1,z1);
3359         track2.GetFitPoint(x2,y2,z2);
3360         track2.GetFitPoint(x3,y3,z3);
3361         //
3362         //is track pointing to the vertex ?
3363         Double_t x0,y0,z0;
3364         x0=0;
3365         polytrack.GetFitPoint(x0,y0,z0);
3366
3367         if (constrain) {
3368           x2 = x3;
3369           y2 = y3;
3370           z2 = z3;
3371           
3372           x3 = 0;
3373           y3 = 0;
3374           z3 = 0;
3375         }
3376         x[0]=y1;
3377         x[1]=z1;
3378         x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3379                 
3380         //      if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;  //
3381         x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3382         
3383         //if (TMath::Abs(x[4]*x1-x[2]) >= cuts[1]) continue;
3384         //x[3]=F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
3385         x[3]=F3n(x1,y1,x3,y3,z1,z3,x[4]);
3386         //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3387
3388         
3389         Double_t sy =0.1, sz =0.1;
3390         Double_t sy1=0.02, sz1=0.02;
3391         Double_t sy2=0.02, sz2=0.02;
3392         Double_t sy3=0.02;
3393
3394         if (constrain){
3395           sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
3396         }
3397         
3398         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3399         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3400         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3401         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3402         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3403         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3404
3405         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x3,y3,z1,z3)-x[3])/sy;
3406         Double_t f31=(F3(x1,y1,x3,y3,z1+sz,z3)-x[3])/sz;
3407         Double_t f32=(F3(x1,y1,x3,y3+sy,z1,z3)-x[3])/sy;
3408         Double_t f34=(F3(x1,y1,x3,y3,z1,z3+sz)-x[3])/sz;
3409
3410         
3411         c[0]=sy1;
3412         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3413         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3414         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3415         c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3416         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3417         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3418         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3419         
3420         //Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x1);
3421         Int_t row1 = GetRowNumber(x1);
3422
3423         UInt_t index=0;
3424         //kr0.GetIndex(is);
3425         AliTPCseed *track=new (seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3426         track->fIsSeeding = kTRUE;
3427         Int_t rc=FollowProlongation(*track, i2);        
3428         if (constrain) track->fBConstrain =1;
3429         else
3430           track->fBConstrain =0;
3431         track->fLastPoint = row1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3432         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3433
3434         if (rc==0 || track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 || 
3435             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 || 
3436             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters()) {
3437           //delete track;
3438           seed->Reset();
3439           seed->~AliTPCseed();
3440         }
3441         else {
3442           arr->AddLast(track);
3443           seed = new AliTPCseed;
3444         }
3445         nin3++;
3446       }
3447     }  // if accepted seed
3448   }
3449   if (fDebug>3){
3450     Info("MakeSeeds2","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin3);
3451   }
3452   delete seed;
3453 }
3454
3455
3456 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::MakeSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3457 {
3458   //
3459   //
3460   //reseed using track points
3461   Int_t p0 = int(r0*track->GetNumberOfClusters());     // point 0 
3462   Int_t p1 = int(r1*track->GetNumberOfClusters());
3463   Int_t p2 = int(r2*track->GetNumberOfClusters());   // last point
3464   Int_t pp2=0;
3465   Double_t  x0[3],x1[3],x2[3];
3466   x0[0]=-1;
3467   x0[0]=-1;
3468   x0[0]=-1;
3469
3470   // find track position at given ratio of the length
3471   Int_t  sec0, sec1, sec2;
3472   sec0=0;
3473   sec1=0;
3474   sec2=0;
3475   Int_t index=-1;
3476   Int_t clindex;
3477   for (Int_t i=0;i<160;i++){
3478     if (track->fClusterPointer[i]){
3479       index++;
3480       AliTPCTrackerPoint   *trpoint =track->GetTrackPoint(i);
3481       if ( (index<p0) || x0[0]<0 ){
3482         if (trpoint->GetX()>1){
3483           clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3484           if (clindex>0){       
3485             x0[0] = trpoint->GetX();
3486             x0[1] = trpoint->GetY();
3487             x0[2] = trpoint->GetZ();
3488             sec0  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3489           }
3490         }
3491       }
3492
3493       if ( (index<p1) &&(trpoint->GetX()>1)){
3494         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3495         if (clindex>0){
3496           x1[0] = trpoint->GetX();
3497           x1[1] = trpoint->GetY();
3498           x1[2] = trpoint->GetZ();
3499           sec1  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3500         }
3501       }
3502       if ( (index<p2) &&(trpoint->GetX()>1)){
3503         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3504         if (clindex>0){
3505           x2[0] = trpoint->GetX();
3506           x2[1] = trpoint->GetY();
3507           x2[2] = trpoint->GetZ(); 
3508           sec2  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3509           pp2 = i;
3510         }
3511       }
3512     }
3513   }
3514   
3515   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3516   //
3517   alpha = (sec1-sec2)*fSectors->GetAlpha();
3518   cs = TMath::Cos(alpha);
3519   sn = TMath::Sin(alpha); 
3520   xx2= x1[0]*cs-x1[1]*sn;
3521   yy2= x1[0]*sn+x1[1]*cs;
3522   x1[0] = xx2;
3523   x1[1] = yy2;
3524   //
3525   alpha = (sec0-sec2)*fSectors->GetAlpha();
3526   cs = TMath::Cos(alpha);
3527   sn = TMath::Sin(alpha); 
3528   xx2= x0[0]*cs-x0[1]*sn;
3529   yy2= x0[0]*sn+x0[1]*cs;
3530   x0[0] = xx2;
3531   x0[1] = yy2;
3532   //
3533   //
3534   //
3535   Double_t x[5],c[15];
3536   //
3537   x[0]=x2[1];
3538   x[1]=x2[2];
3539   x[4]=F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]);
3540   //  if (x[4]>1) return 0;
3541   x[2]=F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]);
3542   x[3]=F3n(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2],x0[2],x[4]);
3543   //if (TMath::Abs(x[3]) > 2.2)  return 0;
3544   //if (TMath::Abs(x[2]) > 1.99) return 0;
3545   //  
3546   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3547   //
3548   Double_t sy1=0.02+track->GetSigmaY2(), sz1=0.02+track->GetSigmaZ2();
3549   Double_t sy2=0.01+track->GetSigmaY2(), sz2=0.01+track->GetSigmaZ2();
3550   Double_t sy3=0.01+track->GetSigmaY2();
3551   //
3552   Double_t f40=(F1(x2[0],x2[1]+sy,x1[0],x1[1],x0[0],x0[1])-x[4])/sy;
3553   Double_t f42=(F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1]+sy,x0[0],x0[1])-x[4])/sy;
3554   Double_t f43=(F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]+sy)-x[4])/sy;
3555   Double_t f20=(F2(x2[0],x2[1]+sy,x1[0],x1[1],x0[0],x0[1])-x[2])/sy;
3556   Double_t f22=(F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1]+sy,x0[0],x0[1])-x[2])/sy;
3557   Double_t f23=(F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]+sy)-x[2])/sy;
3558   //
3559   Double_t f30=(F3(x2[0],x2[1]+sy,x0[0],x0[1],x2[2],x0[2])-x[3])/sy;
3560   Double_t f31=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2]+sz,x0[2])-x[3])/sz;
3561   Double_t f32=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1]+sy,x2[2],x0[2])-x[3])/sy;
3562   Double_t f34=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2],x0[2]+sz)-x[3])/sz;
3563   
3564   
3565   c[0]=sy1;
3566   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3567   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3568   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3569   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3570   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3571   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3572   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3573   
3574   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x2[0]);
3575   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, x2[0], sec2*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3576   //  Double_t y0,z0,y1,z1, y2,z2;
3577   //seed->GetProlongation(x0[0],y0,z0);
3578   // seed->GetProlongation(x1[0],y1,z1);
3579   //seed->GetProlongation(x2[0],y2,z2);
3580   //  seed =0;
3581   seed->fLastPoint  = pp2;
3582   seed->fFirstPoint = pp2;
3583   
3584
3585   return seed;
3586 }
3587
3588
3589 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::ReSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3590 {
3591   //
3592   //
3593   //reseed using founded clusters 
3594   //
3595   // Find the number of clusters
3596   Int_t nclusters = 0;
3597   for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
3598     if (track->GetClusterIndex(irow)>0) nclusters++;
3599   }
3600   //
3601   Int_t ipos[3];
3602   ipos[0] = TMath::Max(int(r0*nclusters),0);             // point 0 cluster
3603   ipos[1] = TMath::Min(int(r1*nclusters),nclusters-1);   // 
3604   ipos[2] = TMath::Min(int(r2*nclusters),nclusters-1);   // last point
3605   //
3606   //
3607   Double_t  xyz[3][3];
3608   Int_t     row[3],sec[3]={0,0,0};
3609   //
3610   // find track row position at given ratio of the length
3611   Int_t index=-1;
3612   for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){    
3613     if (track->GetClusterIndex2(irow)<0) continue;
3614     index++;
3615     for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3616       if (index<=ipos[ipoint]) row[ipoint] = irow;
3617     }        
3618   }
3619   //
3620   //Get cluster and sector position
3621   for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3622     Int_t clindex = track->GetClusterIndex2(row[ipoint]);
3623     AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3624     if (cl==0) {
3625       //Error("Bug\n");
3626       //      AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3627       return 0;
3628     }
3629     sec[ipoint]     = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3630     xyz[ipoint][0]  = GetXrow(row[ipoint]);
3631     xyz[ipoint][1]  = cl->GetY();
3632     xyz[ipoint][2]  = cl->GetZ();
3633   }
3634   //
3635   //
3636   // Calculate seed state vector and covariance matrix
3637
3638   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3639   //
3640   alpha = (sec[1]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3641   cs = TMath::Cos(alpha);
3642   sn = TMath::Sin(alpha); 
3643   xx2= xyz[1][0]*cs-xyz[1][1]*sn;
3644   yy2= xyz[1][0]*sn+xyz[1][1]*cs;
3645   xyz[1][0] = xx2;
3646   xyz[1][1] = yy2;
3647   //
3648   alpha = (sec[0]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3649   cs = TMath::Cos(alpha);