Debug level during tracking (M.Ivanov)
[u/mrichter/AliRoot.git] / TPC / AliTPCtrackerMI.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16
17 //-------------------------------------------------------
18 //          Implementation of the TPC tracker
19 //
20 //   Origin: Marian Ivanov   Marian.Ivanov@cern.ch
21 // 
22 //  AliTPC parallel tracker
23 //-------------------------------------------------------
24
25
26 /* $Id$ */
27
28 #include "Riostream.h"
29 #include <TClonesArray.h>
30 #include <TFile.h>
31 #include <TObjArray.h>
32 #include <TTree.h>
33
34 #include "AliComplexCluster.h"
35 #include "AliESD.h"
36 #include "AliESDkink.h"
37 #include "AliHelix.h"
38 #include "AliRunLoader.h"
39 #include "AliTPCClustersRow.h"
40 #include "AliTPCParam.h"
41 #include "AliTPCReconstructor.h"
42 #include "AliTPCclusterMI.h"
43 #include "AliTPCpolyTrack.h"
44 #include "AliTPCreco.h"
45 #include "AliTPCseed.h" 
46 #include "AliTPCtrackerMI.h"
47 #include "TStopwatch.h"
48 #include "AliTPCReconstructor.h"
49 #include "AliESDkink.h"
50 #include "AliPID.h"
51 #include "TTreeStream.h"
52 #include "AliAlignObj.h"
53 #include "AliTrackPointArray.h"
54
55 //
56
57 ClassImp(AliTPCtrackerMI)
58
59
60 class AliTPCFastMath {
61 public:
62   AliTPCFastMath();  
63   static Double_t FastAsin(Double_t x);   
64  private: 
65   static Double_t fgFastAsin[20000];  //lookup table for fast asin computation
66 };
67
68 Double_t AliTPCFastMath::fgFastAsin[20000];
69 AliTPCFastMath gAliTPCFastMath; // needed to fill the LUT
70
71 AliTPCFastMath::AliTPCFastMath(){
72   //
73   // initialized lookup table;
74   for (Int_t i=0;i<10000;i++){
75     fgFastAsin[2*i] = TMath::ASin(i/10000.);
76     fgFastAsin[2*i+1] = (TMath::ASin((i+1)/10000.)-fgFastAsin[2*i]);
77   }
78 }
79
80 Double_t AliTPCFastMath::FastAsin(Double_t x){
81   //
82   // return asin using lookup table
83   if (x>0){
84     Int_t index = int(x*10000);
85     return fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1];
86   }
87   x*=-1;
88   Int_t index = int(x*10000);
89   return -(fgFastAsin[2*index]+(x*10000.-index)*fgFastAsin[2*index+1]);
90 }
91
92
93
94
95 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateTrack(AliTPCseed * track, Int_t accept){
96   //
97   //update track information using current cluster - track->fCurrentCluster
98
99
100   AliTPCclusterMI* c =track->fCurrentCluster;
101   if (accept>0) track->fCurrentClusterIndex1 |=0x8000;  //sign not accepted clusters
102
103   UInt_t i = track->fCurrentClusterIndex1;
104
105   Int_t sec=(i&0xff000000)>>24; 
106   //Int_t row = (i&0x00ff0000)>>16; 
107   track->fRow=(i&0x00ff0000)>>16;
108   track->fSector = sec;
109   //  Int_t index = i&0xFFFF;
110   if (sec>=fParam->GetNInnerSector()) track->fRow += fParam->GetNRowLow(); 
111   track->SetClusterIndex2(track->fRow, i);  
112   //track->fFirstPoint = row;
113   //if ( track->fLastPoint<row) track->fLastPoint =row;
114   //  if (track->fRow<0 || track->fRow>160) {
115   //  printf("problem\n");
116   //}
117   if (track->fFirstPoint>track->fRow) 
118     track->fFirstPoint = track->fRow;
119   if (track->fLastPoint<track->fRow) 
120     track->fLastPoint  = track->fRow;
121   
122
123   track->fClusterPointer[track->fRow] = c;  
124   //
125
126   Double_t angle2 = track->GetSnp()*track->GetSnp();
127   angle2 = TMath::Sqrt(angle2/(1-angle2)); 
128   //
129   //SET NEW Track Point
130   //
131   //  if (debug)
132   {
133     AliTPCTrackerPoint   &point =*(track->GetTrackPoint(track->fRow));
134     //
135     point.SetSigmaY(c->GetSigmaY2()/track->fCurrentSigmaY2);
136     point.SetSigmaZ(c->GetSigmaZ2()/track->fCurrentSigmaZ2);
137     point.SetErrY(sqrt(track->fErrorY2));
138     point.SetErrZ(sqrt(track->fErrorZ2));
139     //
140     point.SetX(track->GetX());
141     point.SetY(track->GetY());
142     point.SetZ(track->GetZ());
143     point.SetAngleY(angle2);
144     point.SetAngleZ(track->GetTgl());
145     if (point.fIsShared){
146       track->fErrorY2 *= 4;
147       track->fErrorZ2 *= 4;
148     }
149   }  
150
151   Double_t chi2 = track->GetPredictedChi2(track->fCurrentCluster);
152   //
153   track->fErrorY2 *= 1.3;
154   track->fErrorY2 += 0.01;    
155   track->fErrorZ2 *= 1.3;   
156   track->fErrorZ2 += 0.005;      
157     //}
158   if (accept>0) return 0;
159   if (track->GetNumberOfClusters()%20==0){
160     //    if (track->fHelixIn){
161     //  TClonesArray & larr = *(track->fHelixIn);    
162     //  Int_t ihelix = larr.GetEntriesFast();
163     //  new(larr[ihelix]) AliHelix(*track) ;    
164     //}
165   }
166   track->fNoCluster =0;
167   return track->Update(c,chi2,i);
168 }
169
170
171
172 Int_t AliTPCtrackerMI::AcceptCluster(AliTPCseed * seed, AliTPCclusterMI * cluster, Float_t factor, 
173                                       Float_t cory, Float_t corz)
174 {
175   //
176   // decide according desired precision to accept given 
177   // cluster for tracking
178   Double_t sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
179   Double_t sz2=ErrZ2(seed,cluster)*corz;
180   //sy2=ErrY2(seed,cluster)*cory;
181   //sz2=ErrZ2(seed,cluster)*cory;
182   
183   Double_t sdistancey2 = sy2+seed->GetSigmaY2();
184   Double_t sdistancez2 = sz2+seed->GetSigmaZ2();
185   
186   Double_t rdistancey2 = (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())*
187     (seed->fCurrentCluster->GetY()-seed->GetY())/sdistancey2;
188   Double_t rdistancez2 = (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())*
189     (seed->fCurrentCluster->GetZ()-seed->GetZ())/sdistancez2;
190   
191   Double_t rdistance2  = rdistancey2+rdistancez2;
192   //Int_t  accept =0;
193   
194   if (rdistance2>16) return 3;
195   
196   
197   if ((rdistancey2>9.*factor || rdistancez2>9.*factor) && cluster->GetType()==0)  
198     return 2;  //suspisiouce - will be changed
199   
200   if ((rdistancey2>6.25*factor || rdistancez2>6.25*factor) && cluster->GetType()>0)  
201     // strict cut on overlaped cluster
202     return  2;  //suspisiouce - will be changed
203   
204   if ( (rdistancey2>1.*factor || rdistancez2>6.25*factor ) 
205        && cluster->GetType()<0){
206     seed->fNFoundable--;
207     return 2;    
208   }
209   return 0;
210 }
211
212
213
214
215 //_____________________________________________________________________________
216 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCParam *par): 
217 AliTracker(), fkNIS(par->GetNInnerSector()/2), fkNOS(par->GetNOuterSector()/2)
218 {
219   //---------------------------------------------------------------------
220   // The main TPC tracker constructor
221   //---------------------------------------------------------------------
222   fInnerSec=new AliTPCSector[fkNIS];         
223   fOuterSec=new AliTPCSector[fkNOS];
224  
225   Int_t i;
226   for (i=0; i<fkNIS; i++) fInnerSec[i].Setup(par,0);
227   for (i=0; i<fkNOS; i++) fOuterSec[i].Setup(par,1);
228
229   fN=0;  fSectors=0;
230
231   fSeeds=0;
232   fNtracks = 0;
233   fParam = par;  
234   Int_t nrowlow = par->GetNRowLow();
235   Int_t nrowup = par->GetNRowUp();
236
237   
238   for (Int_t i=0;i<nrowlow;i++){
239     fXRow[i]     = par->GetPadRowRadiiLow(i);
240     fPadLength[i]= par->GetPadPitchLength(0,i);
241     fYMax[i]     = fXRow[i]*TMath::Tan(0.5*par->GetInnerAngle());
242   }
243
244   
245   for (Int_t i=0;i<nrowup;i++){
246     fXRow[i+nrowlow]      = par->GetPadRowRadiiUp(i);
247     fPadLength[i+nrowlow] = par->GetPadPitchLength(60,i);
248     fYMax[i+nrowlow]      = fXRow[i+nrowlow]*TMath::Tan(0.5*par->GetOuterAngle());
249   }
250   fSeeds=0;
251   //
252   fInput    = 0;
253   fOutput   = 0;
254   fSeedTree = 0;
255   fTreeDebug =0;
256   fNewIO     =0;
257   fDebug     =0;
258   fEvent     =0;
259   fDebugStreamer = new TTreeSRedirector("TPCdebug.root");
260 }
261 //________________________________________________________________________
262 AliTPCtrackerMI::AliTPCtrackerMI(const AliTPCtrackerMI &t):
263   AliTracker(t),
264   fkNIS(t.fkNIS),
265   fkNOS(t.fkNOS)
266 {
267   //------------------------------------
268   // dummy copy constructor
269   //------------------------------------------------------------------
270 }
271 AliTPCtrackerMI & AliTPCtrackerMI::operator=(const AliTPCtrackerMI& /*r*/){
272   //------------------------------
273   // dummy 
274   //--------------------------------------------------------------
275   return *this;
276 }
277 //_____________________________________________________________________________
278 AliTPCtrackerMI::~AliTPCtrackerMI() {
279   //------------------------------------------------------------------
280   // TPC tracker destructor
281   //------------------------------------------------------------------
282   delete[] fInnerSec;
283   delete[] fOuterSec;
284   if (fSeeds) {
285     fSeeds->Delete(); 
286     delete fSeeds;
287   }
288   if (fDebugStreamer) delete fDebugStreamer;
289 }
290
291 void AliTPCtrackerMI::SetIO()
292 {
293   //
294   fNewIO   =  kTRUE;
295   fInput   =  AliRunLoader::GetTreeR("TPC", kFALSE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
296   
297   fOutput  =  AliRunLoader::GetTreeT("TPC", kTRUE,AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
298   if (fOutput){
299     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
300     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
301     delete iotrack;
302   }
303 }
304
305
306 void AliTPCtrackerMI::SetIO(TTree * input, TTree * output, AliESD * event)
307 {
308
309   // set input
310   fNewIO = kFALSE;
311   fInput    = 0;
312   fOutput   = 0;
313   fSeedTree = 0;
314   fTreeDebug =0;
315   fInput = input;
316   if (input==0){
317     return;
318   }  
319   //set output
320   fOutput = output;
321   if (output){
322     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
323     //    iotrack->fHelixIn   = new TClonesArray("AliHelix");
324     //iotrack->fHelixOut  = new TClonesArray("AliHelix");    
325     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
326     delete iotrack;
327   }
328   if (output && (fDebug&2)){
329     //write the full seed information if specified in debug mode
330     //
331     fSeedTree =  new TTree("Seeds","Seeds");
332     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
333     //
334     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
335     arrtr->ExpandCreateFast(160);
336     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
337     //
338     vseed->fPoints = arrtr;
339     vseed->fEPoints = arre;
340     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
341     fSeedTree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
342     delete arrtr;
343     delete arre;    
344     fTreeDebug = new TTree("trackDebug","trackDebug");
345     TClonesArray * arrd = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint2",0);
346     fTreeDebug->Branch("debug",&arrd,32000,99);
347   }
348
349
350   //set ESD event  
351   fEvent  = event;  
352 }
353
354 void AliTPCtrackerMI::FillESD(TObjArray* arr)
355 {
356   //
357   //
358   //fill esds using updated tracks
359   if (fEvent){
360     // write tracks to the event
361     // store index of the track
362     Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
363     //FindKinks(arr,fEvent);
364     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
365       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
366       if (!pt) continue; 
367       pt->UpdatePoints();
368       //      pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
369       if (pt->GetKinkIndex(0)<=0){  //don't propagate daughter tracks 
370         pt->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
371       }
372  
373       if (( pt->GetPoints()[2]- pt->GetPoints()[0])>5 && pt->GetPoints()[3]>0.8){
374         AliESDtrack iotrack;
375         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
376         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
377         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
378         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
379         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
380         //iotrack.SetTPCindex(i);
381         fEvent->AddTrack(&iotrack);
382         continue;
383       }
384        
385       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>70)&& (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.55) {
386         AliESDtrack iotrack;
387         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);
388         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
389         //iotrack.SetTPCindex(i);
390         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
391         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
392         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
393         fEvent->AddTrack(&iotrack);
394         continue;
395       } 
396       //
397       // short tracks  - maybe decays
398
399       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>30) && (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.70) {
400         Int_t found,foundable,shared;
401         pt->GetClusterStatistic(0,60,found, foundable,shared,kFALSE);
402         if ( (found>20) && (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())<0.2)){
403           AliESDtrack iotrack;
404           iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);    
405           //iotrack.SetTPCindex(i);
406           iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
407           iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
408           iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
409           //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
410           fEvent->AddTrack(&iotrack);
411           continue;
412         }
413       }       
414       
415       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>20) && (Float_t(pt->GetNumberOfClusters())/Float_t(pt->fNFoundable))>0.8) {
416         Int_t found,foundable,shared;
417         pt->GetClusterStatistic(0,60,found, foundable,shared,kFALSE);
418         if (found<20) continue;
419         if (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())>0.2) continue;
420         //
421         AliESDtrack iotrack;
422         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);      
423         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
424         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
425         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
426         //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
427         //iotrack.SetTPCindex(i);
428         fEvent->AddTrack(&iotrack);
429         continue;
430       }   
431       // short tracks  - secondaties
432       //
433       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>30) ) {
434         Int_t found,foundable,shared;
435         pt->GetClusterStatistic(128,158,found, foundable,shared,kFALSE);
436         if ( (found>20) && (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())<0.2) &&float(found)/float(foundable)>0.8){
437           AliESDtrack iotrack;
438           iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);    
439           iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
440           iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
441           iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
442           //iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);       
443           //iotrack.SetTPCindex(i);
444           fEvent->AddTrack(&iotrack);
445           continue;
446         }
447       }       
448       
449       if ( (pt->GetNumberOfClusters()>15)) {
450         Int_t found,foundable,shared;
451         pt->GetClusterStatistic(138,158,found, foundable,shared,kFALSE);
452         if (found<15) continue;
453         if (pt->fNShared/float(pt->GetNumberOfClusters())>0.2) continue;
454         if (float(found)/float(foundable)<0.8) continue;
455         //
456         AliESDtrack iotrack;
457         iotrack.UpdateTrackParams(pt,AliESDtrack::kTPCin);      
458         iotrack.SetTPCPoints(pt->GetPoints());
459         iotrack.SetKinkIndexes(pt->GetKinkIndexes());
460         iotrack.SetV0Indexes(pt->GetV0Indexes());
461         //      iotrack.SetTPCpid(pt->fTPCr);
462         //iotrack.SetTPCindex(i);
463         fEvent->AddTrack(&iotrack);
464         continue;
465       }   
466     }
467   }
468   printf("Number of filled ESDs-\t%d\n",fEvent->GetNumberOfTracks());
469 }
470
471 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks(TTree * tree)
472 {
473   //
474   // write tracks from seed array to selected tree
475   //
476   fOutput  = tree;
477   if (fOutput){
478     AliTPCtrack *iotrack= new AliTPCtrack;
479     fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
480   }
481   WriteTracks();
482 }
483
484 void AliTPCtrackerMI::WriteTracks()
485 {
486   //
487   // write tracks to the given output tree -
488   // output specified with SetIO routine
489   if (!fSeeds)  return;
490   if (!fOutput){
491     SetIO();
492   }
493
494   if (fOutput){
495     AliTPCtrack *iotrack= 0;
496     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
497     //for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
498     //  iotrack= (AliTPCtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i);
499     //  if (iotrack) break;      
500     //}    
501     //TBranch * br = fOutput->Branch("tracks","AliTPCtrack",&iotrack,32000,100);
502     TBranch * br = fOutput->GetBranch("tracks");
503     br->SetAddress(&iotrack);
504     //
505     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
506       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);    
507       if (!pt) continue;    
508       AliTPCtrack * track = new AliTPCtrack(*pt);
509       iotrack = track;
510       pt->fLab2 =i; 
511       //      br->SetAddress(&iotrack);
512       fOutput->Fill();
513       delete track;
514       iotrack =0;
515     }
516     //fOutput->GetDirectory()->cd();
517     //fOutput->Write();
518   }
519   // delete iotrack;
520   //
521   if (fSeedTree){
522     //write the full seed information if specified in debug mode
523       
524     AliTPCseed * vseed = new AliTPCseed;
525     //
526     TClonesArray * arrtr = new TClonesArray("AliTPCTrackPoint",160);
527     arrtr->ExpandCreateFast(160);
528     //TClonesArray * arrcl = new TClonesArray("AliTPCclusterMI",160);
529     //arrcl->ExpandCreateFast(160);
530     TClonesArray * arre = new TClonesArray("AliTPCExactPoint",160);
531     //
532     vseed->fPoints = arrtr;
533     vseed->fEPoints = arre;
534     //    vseed->fClusterPoints = arrcl;
535     //TBranch * brseed = seedtree->Branch("seeds","AliTPCseed",&vseed,32000,99);
536     TBranch * brseed = fSeedTree->GetBranch("seeds");
537     
538     Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
539     
540     for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
541       AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)fSeeds->UncheckedAt(i);    
542       if (!pt) continue;     
543       pt->fPoints = arrtr;
544       //      pt->fClusterPoints = arrcl;
545       pt->fEPoints       = arre;
546       pt->RebuildSeed();
547       vseed = pt;
548       brseed->SetAddress(&vseed);
549       fSeedTree->Fill();
550       pt->fPoints  = 0;
551       pt->fEPoints = 0;
552       //      pt->fClusterPoints = 0;
553     }
554     fSeedTree->Write();
555     if (fTreeDebug) fTreeDebug->Write();
556   }
557
558 }
559   
560
561
562
563 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrY2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
564   //
565   //
566   //seed->SetErrorY2(0.1);
567   //return 0.1;
568   //calculate look-up table at the beginning
569   static Bool_t  ginit = kFALSE;
570   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
571   static Float_t ggg1[10000];
572   static Float_t ggg2[10000];
573   static Float_t ggg3[10000];
574   static Float_t glandau1[10000];
575   static Float_t glandau2[10000];
576   static Float_t glandau3[10000];
577   //
578   static Float_t gcor01[500];
579   static Float_t gcor02[500];
580   static Float_t gcorp[500];
581   //
582
583   //
584   if (ginit==kFALSE){
585     for (Int_t i=1;i<500;i++){
586       Float_t rsigma = float(i)/100.;
587       gcor02[i] = TMath::Max(0.78 +TMath::Exp(7.4*(rsigma-1.2)),0.6);
588       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(3.36*(rsigma-1.2)),0.6);
589       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
590     }
591
592     //
593     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
594       //
595       //
596       // inner sector
597       Float_t amp = float(i);
598       Float_t padlength =0.75;
599       gnoise1 = 0.0004/padlength;
600       Float_t nel     = 0.268*amp;
601       Float_t nprim   = 0.155*amp;
602       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
603       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
604       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
605       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;      
606       //
607       // outer short
608       padlength =1.;
609       gnoise2   = 0.0004/padlength;
610       nel       = 0.3*amp;
611       nprim     = 0.133*amp;
612       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
613       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
614       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
615       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
616       //
617       //
618       // outer long
619       padlength =1.5;
620       gnoise3   = 0.0004/padlength;
621       nel       = 0.3*amp;
622       nprim     = 0.133*amp;
623       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
624       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
625       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
626       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
627       //
628     }
629     ginit = kTRUE;
630   }
631   //
632   //
633   //
634   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));  
635   if (amp>9999) {
636     seed->SetErrorY2(1.);
637     return 1.;
638   }
639   Float_t snoise2;
640   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
641   Int_t ctype = cl->GetType();  
642   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
643   Double_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
644   angle2 = angle2/(1-angle2); 
645   //
646   //cluster "quality"
647   Int_t rsigmay = int(100.*cl->GetSigmaY2()/(seed->fCurrentSigmaY2));
648   Float_t res;
649   //
650   if (fSectors==fInnerSec){
651     snoise2 = gnoise1;
652     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;     
653     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmay];
654     if ((ctype>0)){
655       res+=0.002;
656       res*= gcorp[rsigmay];
657     }
658   }
659   else {
660     if (padlength<1.1){
661       snoise2 = gnoise2;
662       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2; 
663       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];      
664       if ((ctype>0)){
665         res+=0.002;
666         res*= gcorp[rsigmay];
667       }
668     }
669     else{
670       snoise2 = gnoise3;      
671       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2; 
672       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmay];
673       if ((ctype>0)){
674         res+=0.002;
675         res*= gcorp[rsigmay];
676       }
677     }
678   }  
679
680   if (ctype<0){
681     res+=0.005;
682     res*=2.4;  // overestimate error 2 times
683   }
684   res+= snoise2;
685  
686   if (res<2*snoise2)
687     res = 2*snoise2;
688   
689   seed->SetErrorY2(res);
690   return res;
691
692
693 }
694
695
696
697 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
698   //
699   //
700   //seed->SetErrorY2(0.1);
701   //return 0.1;
702   //calculate look-up table at the beginning
703   static Bool_t  ginit = kFALSE;
704   static Float_t gnoise1,gnoise2,gnoise3;
705   static Float_t ggg1[10000];
706   static Float_t ggg2[10000];
707   static Float_t ggg3[10000];
708   static Float_t glandau1[10000];
709   static Float_t glandau2[10000];
710   static Float_t glandau3[10000];
711   //
712   static Float_t gcor01[1000];
713   static Float_t gcor02[1000];
714   static Float_t gcorp[1000];
715   //
716
717   //
718   if (ginit==kFALSE){
719     for (Int_t i=1;i<1000;i++){
720       Float_t rsigma = float(i)/100.;
721       gcor02[i] = TMath::Max(0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigma-1.2)),0.6);
722       gcor01[i] = TMath::Max(0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigma-1.2)),0.6);
723       gcorp[i]  = TMath::Max(TMath::Power((rsigma+0.5),1.5),1.2);
724     }
725
726     //
727     for (Int_t i=3;i<10000;i++){
728       //
729       //
730       // inner sector
731       Float_t amp = float(i);
732       Float_t padlength =0.75;
733       gnoise1 = 0.0004/padlength;
734       Float_t nel     = 0.268*amp;
735       Float_t nprim   = 0.155*amp;
736       ggg1[i]          = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
737       glandau1[i]      = (2.+0.12*nprim)*0.5* (2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
738       if (glandau1[i]>1) glandau1[i]=1;
739       glandau1[i]*=padlength*padlength/12.;      
740       //
741       // outer short
742       padlength =1.;
743       gnoise2   = 0.0004/padlength;
744       nel       = 0.3*amp;
745       nprim     = 0.133*amp;
746       ggg2[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
747       glandau2[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
748       if (glandau2[i]>1) glandau2[i]=1;
749       glandau2[i]*=padlength*padlength/12.;
750       //
751       //
752       // outer long
753       padlength =1.5;
754       gnoise3   = 0.0004/padlength;
755       nel       = 0.3*amp;
756       nprim     = 0.133*amp;
757       ggg3[i]      = fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*(2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
758       glandau3[i]  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
759       if (glandau3[i]>1) glandau3[i]=1;
760       glandau3[i]*=padlength*padlength/12.;
761       //
762     }
763     ginit = kTRUE;
764   }
765   //
766   //
767   //
768   Int_t amp = int(TMath::Abs(cl->GetQ()));  
769   if (amp>9999) {
770     seed->SetErrorY2(1.);
771     return 1.;
772   }
773   Float_t snoise2;
774   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
775   Int_t ctype = cl->GetType();  
776   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->fRow);
777   //
778   Double_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
779   //  if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
780   angle2 = seed->GetTgl()*seed->GetTgl()*(1+angle2/(1-angle2)); 
781   //
782   //cluster "quality"
783   Int_t rsigmaz = int(100.*cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2));
784   Float_t res;
785   //
786   if (fSectors==fInnerSec){
787     snoise2 = gnoise1;
788     res     = ggg1[amp]*z+glandau1[amp]*angle2;     
789     if (ctype==0) res *= gcor01[rsigmaz];
790     if ((ctype>0)){
791       res+=0.002;
792       res*= gcorp[rsigmaz];
793     }
794   }
795   else {
796     if (padlength<1.1){
797       snoise2 = gnoise2;
798       res     = ggg2[amp]*z+glandau2[amp]*angle2; 
799       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];      
800       if ((ctype>0)){
801         res+=0.002;
802         res*= gcorp[rsigmaz];
803       }
804     }
805     else{
806       snoise2 = gnoise3;      
807       res     = ggg3[amp]*z+glandau3[amp]*angle2; 
808       if (ctype==0) res *= gcor02[rsigmaz];
809       if ((ctype>0)){
810         res+=0.002;
811         res*= gcorp[rsigmaz];
812       }
813     }
814   }  
815
816   if (ctype<0){
817     res+=0.002;
818     res*=1.3;
819   }
820   if ((ctype<0) &&amp<70){
821     res+=0.002;
822     res*=1.3;  
823   }
824   res += snoise2;
825   if (res<2*snoise2)
826      res = 2*snoise2;
827   if (res>3) res =3;
828   seed->SetErrorZ2(res);
829   return res;
830 }
831
832
833
834 /*
835 Double_t AliTPCtrackerMI::ErrZ2(AliTPCseed* seed, AliTPCclusterMI * cl){
836   //
837   //
838   //seed->SetErrorZ2(0.1);
839   //return 0.1;
840
841   Float_t snoise2;
842   Float_t z = TMath::Abs(fParam->GetZLength()-TMath::Abs(seed->GetZ()));
843   //
844   Float_t rsigmaz = cl->GetSigmaZ2()/(seed->fCurrentSigmaZ2);
845   Int_t ctype = cl->GetType();
846   Float_t amp = TMath::Abs(cl->GetQ());
847   
848   Float_t nel;
849   Float_t nprim;
850   //
851   Float_t landau=2 ;    //landau fluctuation part
852   Float_t gg=2;         // gg fluctuation part
853   Float_t padlength= GetPadPitchLength(seed->GetX());
854  
855   if (fSectors==fInnerSec){
856     snoise2 = 0.0004/padlength;
857     nel     = 0.268*amp;
858     nprim   = 0.155*amp;
859     gg      = (2+0.001*nel/(padlength*padlength))/nel;
860     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
861     if (landau>1) landau=1;
862   }
863   else {
864     snoise2 = 0.0004/padlength;
865     nel     = 0.3*amp;
866     nprim   = 0.133*amp;
867     gg      = (2+0.0008*nel/(padlength*padlength))/nel;
868     landau  = (2.+0.12*nprim)*0.5*(2.+nprim*nprim*0.001/(padlength*padlength))/nprim;
869     if (landau>1) landau=1;
870   }
871   Float_t sdiff = gg*fParam->GetDiffT()*fParam->GetDiffT()*z;
872
873   //
874   Float_t angle2 = seed->GetSnp()*seed->GetSnp();
875   angle2 = TMath::Sqrt((1-angle2));
876   if (angle2<0.6) angle2 = 0.6;
877   //angle2 = 1;
878
879   Float_t angle = seed->GetTgl()/angle2;
880   Float_t angular = landau*angle*angle*padlength*padlength/12.;
881   Float_t res = sdiff + angular;
882
883   
884   if ((ctype==0) && (fSectors ==fOuterSec))
885     res *= 0.81 +TMath::Exp(6.8*(rsigmaz-1.2));
886
887   if ((ctype==0) && (fSectors ==fInnerSec))
888     res *= 0.72 +TMath::Exp(2.04*(rsigmaz-1.2));
889   
890   if ((ctype>0)){
891     res+=0.005;
892     res*= TMath::Power(rsigmaz+0.5,1.5);  //0.31+0.147*ctype;
893   }
894   if (ctype<0){
895     res+=0.002;
896     res*=1.3;
897   }
898   if ((ctype<0) &&amp<70){
899     res+=0.002;
900     res*=1.3;  
901   }
902   res += snoise2;
903   if (res<2*snoise2)
904      res = 2*snoise2;
905
906   seed->SetErrorZ2(res);
907   return res;
908 }
909 */
910
911
912
913
914 void AliTPCtrackerMI::RotateToLocal(AliTPCseed *seed)
915 {
916   //rotate to track "local coordinata
917   Float_t x = seed->GetX();
918   Float_t y = seed->GetY();
919   Float_t ymax = x*TMath::Tan(0.5*fSectors->GetAlpha());
920   
921   if (y > ymax) {
922     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector+1) % fN;
923     if (!seed->Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
924       return;
925   } else if (y <-ymax) {
926     seed->fRelativeSector= (seed->fRelativeSector-1+fN) % fN;
927     if (!seed->Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
928       return;
929   }   
930
931 }
932
933
934
935 //_____________________________________________________________________________
936 Double_t AliTPCtrackerMI::F1old(Double_t x1,Double_t y1,
937                    Double_t x2,Double_t y2,
938                    Double_t x3,Double_t y3) 
939 {
940   //-----------------------------------------------------------------
941   // Initial approximation of the track curvature
942   //-----------------------------------------------------------------
943   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
944   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
945                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
946   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
947                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
948
949   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
950   if ( xr*xr+yr*yr<=0.00000000000001) return 100;
951   return -xr*yr/sqrt(xr*xr+yr*yr); 
952 }
953
954
955
956 //_____________________________________________________________________________
957 Double_t AliTPCtrackerMI::F1(Double_t x1,Double_t y1,
958                    Double_t x2,Double_t y2,
959                    Double_t x3,Double_t y3) 
960 {
961   //-----------------------------------------------------------------
962   // Initial approximation of the track curvature
963   //-----------------------------------------------------------------
964   x3 -=x1;
965   x2 -=x1;
966   y3 -=y1;
967   y2 -=y1;
968   //  
969   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
970   if (det==0) {
971     return 100;
972   }
973   //
974   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
975   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u;
976   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
977   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
978   if (det<0) c2*=-1;
979   return c2;
980 }
981
982
983 Double_t AliTPCtrackerMI::F2(Double_t x1,Double_t y1,
984                    Double_t x2,Double_t y2,
985                    Double_t x3,Double_t y3) 
986 {
987   //-----------------------------------------------------------------
988   // Initial approximation of the track curvature
989   //-----------------------------------------------------------------
990   x3 -=x1;
991   x2 -=x1;
992   y3 -=y1;
993   y2 -=y1;
994   //  
995   Double_t det = x3*y2-x2*y3;
996   if (det==0) {
997     return 100;
998   }
999   //
1000   Double_t u = 0.5* (x2*(x2-x3)+y2*(y2-y3))/det;
1001   Double_t x0 = x3*0.5-y3*u; 
1002   Double_t y0 = y3*0.5+x3*u;
1003   Double_t c2 = 1/TMath::Sqrt(x0*x0+y0*y0);
1004   if (det<0) c2*=-1;
1005   x0+=x1;
1006   x0*=c2;  
1007   return x0;
1008 }
1009
1010
1011
1012 //_____________________________________________________________________________
1013 Double_t AliTPCtrackerMI::F2old(Double_t x1,Double_t y1,
1014                    Double_t x2,Double_t y2,
1015                    Double_t x3,Double_t y3) 
1016 {
1017   //-----------------------------------------------------------------
1018   // Initial approximation of the track curvature times center of curvature
1019   //-----------------------------------------------------------------
1020   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
1021   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
1022                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
1023   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
1024                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
1025
1026   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
1027   
1028   return -a/(d*y1-b)*xr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
1029 }
1030
1031 //_____________________________________________________________________________
1032 Double_t AliTPCtrackerMI::F3(Double_t x1,Double_t y1, 
1033                    Double_t x2,Double_t y2,
1034                    Double_t z1,Double_t z2) 
1035 {
1036   //-----------------------------------------------------------------
1037   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1038   //-----------------------------------------------------------------
1039   return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1040 }
1041
1042
1043 Double_t AliTPCtrackerMI::F3n(Double_t x1,Double_t y1, 
1044                    Double_t x2,Double_t y2,
1045                    Double_t z1,Double_t z2, Double_t c) 
1046 {
1047   //-----------------------------------------------------------------
1048   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
1049   //-----------------------------------------------------------------
1050
1051   //  Double_t angle1;
1052   
1053   //angle1    =  (z1-z2)*c/(TMath::ASin(c*x1-ni)-TMath::ASin(c*x2-ni));
1054   //
1055   Double_t d  =  TMath::Sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
1056   if (TMath::Abs(d*c*0.5)>1) return 0;
1057   //  Double_t   angle2    =  TMath::ASin(d*c*0.5);
1058   //  Double_t   angle2    =  AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1059   Double_t   angle2    = (d*c*0.5>0.1)? TMath::ASin(d*c*0.5): AliTPCFastMath::FastAsin(d*c*0.5);
1060
1061   angle2  = (z1-z2)*c/(angle2*2.);
1062   return angle2;
1063 }
1064
1065 Bool_t   AliTPCtrackerMI::GetProlongation(Double_t x1, Double_t x2, Double_t x[5], Double_t &y, Double_t &z)
1066 {//-----------------------------------------------------------------
1067   // This function find proloncation of a track to a reference plane x=x2.
1068   //-----------------------------------------------------------------
1069   
1070   Double_t dx=x2-x1;
1071
1072   if (TMath::Abs(x[4]*x1 - x[2]) >= 0.999) {   
1073     return kFALSE;
1074   }
1075
1076   Double_t c1=x[4]*x1 - x[2], r1=sqrt(1.- c1*c1);
1077   Double_t c2=x[4]*x2 - x[2], r2=sqrt(1.- c2*c2);  
1078   y = x[0];
1079   z = x[1];
1080   
1081   Double_t dy = dx*(c1+c2)/(r1+r2);
1082   Double_t dz = 0;
1083   //
1084   Double_t delta = x[4]*dx*(c1+c2)/(c1*r2 + c2*r1);
1085   
1086   if (TMath::Abs(delta)>0.01){
1087     dz = x[3]*TMath::ASin(delta)/x[4];
1088   }else{
1089     dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1090   }
1091   
1092   //dz = x[3]*AliTPCFastMath::FastAsin(delta)/x[4];
1093
1094   y+=dy;
1095   z+=dz;
1096   
1097   return kTRUE;  
1098 }
1099
1100 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters (TTree *tree)
1101 {
1102   //
1103   //
1104   fInput = tree;
1105   return LoadClusters();
1106 }
1107
1108 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadClusters()
1109 {
1110   //
1111   // load clusters to the memory
1112   AliTPCClustersRow *clrow= new AliTPCClustersRow;
1113   clrow->SetClass("AliTPCclusterMI");
1114   clrow->SetArray(0);
1115   clrow->GetArray()->ExpandCreateFast(10000);
1116   //
1117   //  TTree * tree = fClustersArray.GetTree();
1118
1119   TTree * tree = fInput;
1120   TBranch * br = tree->GetBranch("Segment");
1121   br->SetAddress(&clrow);
1122   //
1123   Int_t j=Int_t(tree->GetEntries());
1124   for (Int_t i=0; i<j; i++) {
1125     br->GetEntry(i);
1126     //  
1127     Int_t sec,row;
1128     fParam->AdjustSectorRow(clrow->GetID(),sec,row);
1129     //
1130     AliTPCRow * tpcrow=0;
1131     Int_t left=0;
1132     if (sec<fkNIS*2){
1133       tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);    
1134       left = sec/fkNIS;
1135     }
1136     else{
1137       tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1138       left = (sec-fkNIS*2)/fkNOS;
1139     }
1140     if (left ==0){
1141       tpcrow->fN1 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1142       tpcrow->fClusters1 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN1];
1143       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN1;i++) 
1144         tpcrow->fClusters1[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1145     }
1146     if (left ==1){
1147       tpcrow->fN2 = clrow->GetArray()->GetEntriesFast();
1148       tpcrow->fClusters2 = new AliTPCclusterMI[tpcrow->fN2];
1149       for (Int_t i=0;i<tpcrow->fN2;i++) 
1150         tpcrow->fClusters2[i] = *(AliTPCclusterMI*)(clrow->GetArray()->At(i));
1151     }
1152   }
1153   //
1154   delete clrow;
1155   LoadOuterSectors();
1156   LoadInnerSectors();
1157   return 0;
1158 }
1159
1160
1161 void AliTPCtrackerMI::UnloadClusters()
1162 {
1163   //
1164   // unload clusters from the memory
1165   //
1166   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1167   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1168     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1169       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);
1170       //      if (tpcrow){
1171       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1; 
1172       //        if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2; 
1173       //}
1174       tpcrow->ResetClusters();
1175     }
1176   //
1177   nrows = fInnerSec->GetNRows();
1178   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1179     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1180       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1181       //if (tpcrow){
1182       //        if (tpcrow->fClusters1) delete []tpcrow->fClusters1; 
1183       //if (tpcrow->fClusters2) delete []tpcrow->fClusters2; 
1184       //}
1185       tpcrow->ResetClusters();
1186     }
1187
1188   return ;
1189 }
1190
1191
1192 //_____________________________________________________________________________
1193 Int_t AliTPCtrackerMI::LoadOuterSectors() {
1194   //-----------------------------------------------------------------
1195   // This function fills outer TPC sectors with clusters.
1196   //-----------------------------------------------------------------
1197   Int_t nrows = fOuterSec->GetNRows();
1198   UInt_t index=0;
1199   for (Int_t sec = 0;sec<fkNOS;sec++)
1200     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1201       AliTPCRow*  tpcrow = &(fOuterSec[sec%fkNOS][row]);  
1202       Int_t sec2 = sec+2*fkNIS;
1203       //left
1204       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1205       while (ncl--) {
1206         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1207         index=(((sec2<<8)+row)<<16)+ncl;
1208         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1209       }
1210       //right
1211       ncl = tpcrow->fN2;
1212       while (ncl--) {
1213         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1214         index=((((sec2+fkNOS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1215         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1216       }
1217       //
1218       // write indexes for fast acces
1219       //
1220       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1221         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1222       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1223         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1224         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1225       }
1226       Int_t last = 0;
1227       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1228         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1229           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1230         else
1231           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1232       }
1233     }  
1234   fN=fkNOS;
1235   fSectors=fOuterSec;
1236   return 0;
1237 }
1238
1239
1240 //_____________________________________________________________________________
1241 Int_t  AliTPCtrackerMI::LoadInnerSectors() {
1242   //-----------------------------------------------------------------
1243   // This function fills inner TPC sectors with clusters.
1244   //-----------------------------------------------------------------
1245   Int_t nrows = fInnerSec->GetNRows();
1246   UInt_t index=0;
1247   for (Int_t sec = 0;sec<fkNIS;sec++)
1248     for (Int_t row = 0;row<nrows;row++){
1249       AliTPCRow*  tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1250       //
1251       //left
1252       Int_t ncl = tpcrow->fN1;
1253       while (ncl--) {
1254         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters1[ncl]);
1255         index=(((sec<<8)+row)<<16)+ncl;
1256         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1257       }
1258       //right
1259       ncl = tpcrow->fN2;
1260       while (ncl--) {
1261         AliTPCclusterMI *c= &(tpcrow->fClusters2[ncl]);
1262         index=((((sec+fkNIS)<<8)+row)<<16)+ncl;
1263         tpcrow->InsertCluster(c,index);
1264       }
1265       //
1266       // write indexes for fast acces
1267       //
1268       for (Int_t i=0;i<510;i++)
1269         tpcrow->fFastCluster[i]=-1;
1270       for (Int_t i=0;i<tpcrow->GetN();i++){
1271         Int_t zi = Int_t((*tpcrow)[i]->GetZ()+255.);
1272         tpcrow->fFastCluster[zi]=i;  // write index
1273       }
1274       Int_t last = 0;
1275       for (Int_t i=0;i<510;i++){
1276         if (tpcrow->fFastCluster[i]<0)
1277           tpcrow->fFastCluster[i] = last;
1278         else
1279           last = tpcrow->fFastCluster[i];
1280       }
1281
1282     }  
1283    
1284   fN=fkNIS;
1285   fSectors=fInnerSec;
1286   return 0;
1287 }
1288
1289
1290
1291 //_________________________________________________________________________
1292 AliTPCclusterMI *AliTPCtrackerMI::GetClusterMI(Int_t index) const {
1293   //--------------------------------------------------------------------
1294   //       Return pointer to a given cluster
1295   //--------------------------------------------------------------------
1296   Int_t sec=(index&0xff000000)>>24; 
1297   Int_t row=(index&0x00ff0000)>>16; 
1298   Int_t ncl=(index&0x00007fff)>>00;
1299
1300   const AliTPCRow * tpcrow=0;
1301   AliTPCclusterMI * clrow =0;
1302
1303   if (sec<fkNIS*2){
1304     tpcrow = &(fInnerSec[sec%fkNIS][row]);
1305     if (tpcrow==0) return 0;
1306
1307     if (sec<fkNIS) {
1308       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1309       clrow = tpcrow->fClusters1;
1310     }
1311     else {
1312       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1313       clrow = tpcrow->fClusters2;
1314     }
1315   }
1316   else {
1317     tpcrow = &(fOuterSec[(sec-fkNIS*2)%fkNOS][row]);
1318     if (tpcrow==0) return 0;
1319
1320     if (sec-2*fkNIS<fkNOS) {
1321       if (tpcrow->fN1<=ncl) return 0;
1322       clrow = tpcrow->fClusters1;
1323     }
1324     else {
1325       if (tpcrow->fN2<=ncl) return 0;
1326       clrow = tpcrow->fClusters2;
1327     }
1328   }
1329
1330   return &(clrow[ncl]);      
1331   
1332 }
1333
1334
1335
1336 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNext(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1337   //-----------------------------------------------------------------
1338   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1339   //-----------------------------------------------------------------
1340   //
1341   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1342   AliTPCclusterMI *cl=0;
1343   Int_t tpcindex= t.GetClusterIndex2(nr);
1344   //
1345   // update current shape info every 5 pad-row
1346   //  if ( (nr%5==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1347     GetShape(&t,nr);    
1348     //}
1349   //  
1350   if (fIteration>0 && tpcindex>=-1){  //if we have already clusters 
1351     //        
1352     if (tpcindex==-1) return 0; //track in dead zone
1353     if (tpcindex>0){     //
1354       cl = t.fClusterPointer[nr];
1355       if ( (cl==0) ) cl = GetClusterMI(tpcindex);
1356       t.fCurrentClusterIndex1 = tpcindex; 
1357     }
1358     if (cl){      
1359       Int_t relativesector = ((tpcindex&0xff000000)>>24)%18;  // if previously accepted cluster in different sector
1360       Float_t angle = relativesector*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift();
1361       //
1362       if (angle<-TMath::Pi()) angle += 2*TMath::Pi();
1363       if (angle>=TMath::Pi()) angle -= 2*TMath::Pi();
1364       
1365       if (TMath::Abs(angle-t.GetAlpha())>0.001){
1366         Double_t rotation = angle-t.GetAlpha();
1367         t.fRelativeSector= relativesector;
1368         if (!t.Rotate(rotation)) return 0;      
1369       }
1370       if (!t.PropagateTo(x)) return 0;
1371       //
1372       t.fCurrentCluster = cl; 
1373       t.fRow = nr;
1374       Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1375       if ((tpcindex&0x8000)==0) accept =0;
1376       if (accept<3) { 
1377         //if founded cluster is acceptible
1378         if (cl->IsUsed(11)) {  // id cluster is shared inrease uncertainty
1379           t.fErrorY2 += 0.03;
1380           t.fErrorZ2 += 0.03; 
1381           t.fErrorY2 *= 3;
1382           t.fErrorZ2 *= 3; 
1383         }
1384         t.fNFoundable++;
1385         UpdateTrack(&t,accept);
1386         return 1;
1387       }    
1388     }
1389   }
1390   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker()) return 0;  // cut on angle
1391   if (fIteration>1){
1392     // not look for new cluster during refitting    
1393     t.fNFoundable++; 
1394     return 0;
1395   }
1396   //
1397   UInt_t index=0;
1398   //  if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95 || TMath::Abs(x*t.GetC()-t.GetEta())>0.95) return 0;// patch 28 fev 06
1399   Double_t  y=t.GetYat(x);
1400   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1401     if (y > ymax) {
1402       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1403       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
1404         return 0;
1405     } else if (y <-ymax) {
1406       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1407       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
1408         return 0;
1409     }
1410     //return 1;
1411   }
1412   //
1413   if (!t.PropagateTo(x)) {
1414     if (fIteration==0) t.fRemoval = 10;
1415     return 0;
1416   }
1417   y=t.GetY(); 
1418   Double_t z=t.GetZ();
1419   //
1420   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1421   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1422   Double_t  roady  =1.;
1423   Double_t  roadz = 1.;
1424   //
1425   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1426     t.fInDead = kTRUE;
1427     t.SetClusterIndex2(nr,-1); 
1428     return 0;
1429   } 
1430   else
1431     {
1432       if (TMath::Abs(z)<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10) && TMath::Abs(z)<fParam->GetZLength() && (TMath::Abs(t.GetSnp())<AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker())) 
1433         t.fNFoundable++;
1434       else
1435         return 0;
1436     }   
1437   //calculate 
1438   if (krow) {
1439     //    cl = krow.FindNearest2(y+10.,z,roady,roadz,index);    
1440     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);    
1441     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);       
1442   }  
1443   if (cl) {
1444     t.fCurrentCluster = cl; 
1445     t.fRow = nr;
1446     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(10)) return 0; 
1447     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1448     if (fIteration==2&&cl->IsUsed(11)) {
1449       t.fErrorY2 += 0.03;
1450       t.fErrorZ2 += 0.03; 
1451       t.fErrorY2 *= 3;
1452       t.fErrorZ2 *= 3; 
1453     }
1454     /*    
1455     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1456       //
1457       //     
1458
1459       t.fNShared++;
1460       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1461         t.fRemoval =10;
1462         return 0;
1463       }
1464     }
1465     */
1466     if (accept<3) UpdateTrack(&t,accept);
1467
1468   } else {  
1469     if ( fIteration==0 && t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) t.fRemoval=10;
1470     
1471   }
1472   return 1;
1473 }
1474
1475 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextFast(AliTPCseed& t, Int_t nr) {
1476   //-----------------------------------------------------------------
1477   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1478   //-----------------------------------------------------------------
1479   //
1480   Double_t  x= GetXrow(nr), ymax=GetMaxY(nr);
1481   Double_t y,z; 
1482   if (!t.GetProlongation(x,y,z)) {
1483     t.fRemoval = 10;
1484     return 0;
1485   }
1486   //
1487   //
1488   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1489     
1490     if (y > ymax) {
1491       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1492       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
1493         return 0;
1494     } else if (y <-ymax) {
1495       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1496       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
1497         return 0;
1498     }
1499     if (!t.PropagateTo(x)) {
1500       return 0;
1501     } 
1502     t.GetProlongation(x,y,z);
1503   }
1504   //
1505   // update current shape info every 3 pad-row
1506   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2 || (t.fCurrentSigmaY2<0.0001) ){
1507     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1508     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1509     GetShape(&t,nr);
1510   }
1511   //  
1512   AliTPCclusterMI *cl=0;
1513   UInt_t index=0;
1514   
1515   
1516   //Int_t nr2 = nr;
1517   const AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1518   if ( (t.GetSigmaY2()<0) || t.GetSigmaZ2()<0) return 0;
1519   Double_t  roady  =1.;
1520   Double_t  roadz = 1.;
1521   //
1522   Int_t row = nr;
1523   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1524     t.fInDead = kTRUE;
1525     t.SetClusterIndex2(row,-1); 
1526     return 0;
1527   } 
1528   else
1529     {
1530       if (TMath::Abs(z)>(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*x+10)) t.SetClusterIndex2(row,-1);
1531     }   
1532   //calculate 
1533   
1534   if ((cl==0)&&(krow)) {
1535     //    cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,index);    
1536     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,index);    
1537
1538     if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(index);       
1539   }  
1540
1541   if (cl) {
1542     t.fCurrentCluster = cl; 
1543     //    Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);        
1544     //if (accept<3){
1545       t.SetClusterIndex2(row,index);
1546       t.fClusterPointer[row] = cl;
1547       //}
1548   }
1549   return 1;
1550 }
1551
1552
1553
1554 //_________________________________________________________________________
1555 Bool_t AliTPCtrackerMI::GetTrackPoint(Int_t index, AliTrackPoint &p ) const
1556 {
1557   // Get track space point by index
1558   // return false in case the cluster doesn't exist
1559   AliTPCclusterMI *cl = GetClusterMI(index);
1560   if (!cl) return kFALSE;
1561   Int_t sector = (index&0xff000000)>>24;
1562   Int_t row = (index&0x00ff0000)>>16;
1563   Float_t xyz[3];
1564   xyz[0] = fParam->GetPadRowRadii(sector,row);
1565   xyz[1] = cl->GetY();
1566   xyz[2] = cl->GetZ();
1567   Float_t sin,cos;
1568   fParam->AdjustCosSin(sector,cos,sin);
1569   Float_t x = cos*xyz[0]-sin*xyz[1];
1570   Float_t y = cos*xyz[1]+sin*xyz[0];
1571   Float_t cov[6];
1572   Float_t sigmaY2 = 0.027*cl->GetSigmaY2();
1573   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) sigmaY2 *= 2.07;
1574   Float_t sigmaZ2 = 0.066*cl->GetSigmaZ2();
1575   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) sigmaZ2 *= 1.77;
1576   cov[0] = sin*sin*sigmaY2;
1577   cov[1] = -sin*cos*sigmaY2;
1578   cov[2] = 0.;
1579   cov[3] = cos*cos*sigmaY2;
1580   cov[4] = 0.;
1581   cov[5] = sigmaZ2;
1582   p.SetXYZ(x,y,xyz[2],cov);
1583   AliAlignObj::ELayerID iLayer;
1584   Int_t idet;
1585   if (sector < fParam->GetNInnerSector()) {
1586     iLayer = AliAlignObj::kTPC1;
1587     idet = sector;
1588   }
1589   else {
1590     iLayer = AliAlignObj::kTPC2;
1591     idet = sector - fParam->GetNInnerSector();
1592   }
1593   UShort_t volid = AliAlignObj::LayerToVolUID(iLayer,idet);
1594   p.SetVolumeID(volid);
1595   return kTRUE;
1596 }
1597
1598
1599
1600 Int_t AliTPCtrackerMI::UpdateClusters(AliTPCseed& t,  Int_t nr) {
1601   //-----------------------------------------------------------------
1602   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1603   //-----------------------------------------------------------------
1604   t.fCurrentCluster  = 0;
1605   t.fCurrentClusterIndex1 = 0;   
1606    
1607   Double_t xt=t.GetX();
1608   Int_t     row = GetRowNumber(xt)-1; 
1609   Double_t  ymax= GetMaxY(nr);
1610
1611   if (row < nr) return 1; // don't prolongate if not information until now -
1612 //   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.9 && t.GetNumberOfClusters()>40. && fIteration!=2) {
1613 //     t.fRemoval =10;
1614 //     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1615 //   } 
1616 //   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95) {
1617 //     t.fRemoval =10;
1618 //     return 0;  // not prolongate strongly inclined tracks
1619 //   }// patch 28 fev 06
1620
1621   Double_t x= GetXrow(nr);
1622   Double_t y,z;
1623   //t.PropagateTo(x+0.02);
1624   //t.PropagateTo(x+0.01);
1625   if (!t.PropagateTo(x)){
1626     return 0;
1627   }
1628   //
1629   y=t.GetY();
1630   z=t.GetZ();
1631
1632   if (TMath::Abs(y)>ymax){
1633     if (y > ymax) {
1634       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector+1) % fN;
1635       if (!t.Rotate(fSectors->GetAlpha())) 
1636         return 0;
1637     } else if (y <-ymax) {
1638       t.fRelativeSector= (t.fRelativeSector-1+fN) % fN;
1639       if (!t.Rotate(-fSectors->GetAlpha())) 
1640         return 0;
1641     }
1642     //    if (!t.PropagateTo(x)){
1643     //  return 0;
1644     //}
1645     return 1;
1646     //y = t.GetY();    
1647   }
1648   //
1649   if (TMath::Abs(t.GetSnp())>AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker()) return 0;
1650   AliTPCRow &krow=GetRow(t.fRelativeSector,nr);
1651
1652   if (TMath::Abs(TMath::Abs(y)-ymax)<krow.fDeadZone){
1653     t.fInDead = kTRUE;
1654     t.SetClusterIndex2(nr,-1); 
1655     return 0;
1656   } 
1657   else
1658     {
1659       if (TMath::Abs(t.GetZ())<(AliTPCReconstructor::GetCtgRange()*t.GetX()+10) && (TMath::Abs(t.GetSnp())<AliTPCReconstructor::GetMaxSnpTracker())) t.fNFoundable++;
1660       else
1661         return 0;      
1662     }
1663
1664   // update current
1665   if ( (nr%6==0) || t.GetNumberOfClusters()<2){
1666     //    t.fCurrentSigmaY = GetSigmaY(&t);
1667     //t.fCurrentSigmaZ = GetSigmaZ(&t);
1668     GetShape(&t,nr);
1669   }
1670     
1671   AliTPCclusterMI *cl=0;
1672   Int_t index=0;
1673   //
1674   Double_t roady = 1.;
1675   Double_t roadz = 1.;
1676   //
1677
1678   if (!cl){
1679     index = t.GetClusterIndex2(nr);    
1680     if ( (index>0) && (index&0x8000)==0){
1681       cl = t.fClusterPointer[nr];
1682       if ( (cl==0) && (index>0)) cl = GetClusterMI(index);
1683       t.fCurrentClusterIndex1 = index;
1684       if (cl) {
1685         t.fCurrentCluster  = cl;
1686         return 1;
1687       }
1688     }
1689   }
1690
1691   //  if (index<0) return 0;
1692   UInt_t uindex = TMath::Abs(index);
1693
1694   if (krow) {    
1695     //cl = krow.FindNearest2(y+10,z,roady,roadz,uindex);      
1696     cl = krow.FindNearest2(y,z,roady,roadz,uindex);      
1697   }
1698
1699   if (cl) t.fCurrentClusterIndex1 = krow.GetIndex(uindex);   
1700   t.fCurrentCluster  = cl;
1701
1702   return 1;
1703 }
1704
1705
1706 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowToNextCluster(AliTPCseed & t, Int_t nr) {
1707   //-----------------------------------------------------------------
1708   // This function tries to find a track prolongation to next pad row
1709   //-----------------------------------------------------------------
1710
1711   //update error according neighborhoud
1712
1713   if (t.fCurrentCluster) {
1714     t.fRow = nr; 
1715     Int_t accept = AcceptCluster(&t,t.fCurrentCluster,1.);
1716     
1717     if (t.fCurrentCluster->IsUsed(10)){
1718       //
1719       //
1720       //  t.fErrorZ2*=2;
1721       //  t.fErrorY2*=2;
1722       t.fNShared++;
1723       if (t.fNShared>0.7*t.GetNumberOfClusters()) {
1724         t.fRemoval =10;
1725         return 0;
1726       }
1727     }   
1728     if (fIteration>0) accept = 0;
1729     if (accept<3)  UpdateTrack(&t,accept);  
1730  
1731   } else {
1732     if (fIteration==0){
1733       if ( ( (t.GetSigmaY2()+t.GetSigmaZ2())>0.16)&& t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;      
1734       if (  t.GetChi2()/t.GetNumberOfClusters()>6 &&t.GetNumberOfClusters()>18) t.fRemoval=10;      
1735
1736       if (( (t.fNFoundable*0.5 > t.GetNumberOfClusters()) || t.fNoCluster>15)) t.fRemoval=10;
1737     }
1738   }
1739   return 1;
1740 }
1741
1742
1743
1744 //_____________________________________________________________________________
1745 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1746   //-----------------------------------------------------------------
1747   // This function tries to find a track prolongation.
1748   //-----------------------------------------------------------------
1749   Double_t xt=t.GetX();
1750   //
1751   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1752   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();  
1753   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();  
1754   //
1755   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1756     
1757   Int_t first = GetRowNumber(xt)-1;
1758   for (Int_t nr= first; nr>=rf; nr-=step) {
1759     // update kink info
1760     if (t.GetKinkIndexes()[0]>0){
1761       for (Int_t i=0;i<3;i++){
1762         Int_t index = t.GetKinkIndexes()[i];
1763         if (index==0) break;
1764         if (index<0) continue;
1765         //
1766         AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
1767         if (!kink){
1768           printf("PROBLEM\n");
1769         }
1770         else{
1771           Int_t kinkrow = kink->GetTPCRow0()+2+Int_t(0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
1772           if (kinkrow==nr){
1773             AliExternalTrackParam paramd(t);
1774             kink->SetDaughter(paramd);
1775             kink->SetStatus(2,5);
1776             kink->Update();
1777           }
1778         }
1779       }
1780     }
1781
1782     if (nr==80) t.UpdateReference();
1783     if (nr<fInnerSec->GetNRows()) 
1784       fSectors = fInnerSec;
1785     else
1786       fSectors = fOuterSec;
1787     if (FollowToNext(t,nr)==0) 
1788       if (!t.IsActive()) 
1789         return 0;
1790     
1791   }   
1792   return 1;
1793 }
1794
1795
1796 //_____________________________________________________________________________
1797 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowProlongationFast(AliTPCseed& t, Int_t rf, Int_t step) {
1798   //-----------------------------------------------------------------
1799   // This function tries to find a track prolongation.
1800   //-----------------------------------------------------------------
1801   Double_t xt=t.GetX();
1802   //
1803   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1804   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();  
1805   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();  
1806   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1807     
1808   for (Int_t nr=GetRowNumber(xt)-1; nr>=rf; nr-=step) {
1809     
1810     if (FollowToNextFast(t,nr)==0) 
1811       if (!t.IsActive()) return 0;
1812     
1813   }   
1814   return 1;
1815 }
1816
1817
1818
1819
1820
1821 Int_t AliTPCtrackerMI::FollowBackProlongation(AliTPCseed& t, Int_t rf) {
1822   //-----------------------------------------------------------------
1823   // This function tries to find a track prolongation.
1824   //-----------------------------------------------------------------
1825   //
1826   Double_t xt=t.GetX();  
1827   Double_t alpha=t.GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
1828   if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();  
1829   if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();  
1830   t.fRelativeSector = Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha()+0.0001)%fN;
1831     
1832   Int_t first = t.fFirstPoint;
1833   if (first<GetRowNumber(xt)+1) first = GetRowNumber(xt)+1;
1834   //
1835   if (first<0) first=0;
1836   for (Int_t nr=first; nr<=rf; nr++) {
1837     //    if ( (TMath::Abs(t.GetSnp())>0.95)) break;//patch 28 fev 06
1838     if (t.GetKinkIndexes()[0]<0){
1839       for (Int_t i=0;i<3;i++){
1840         Int_t index = t.GetKinkIndexes()[i];
1841         if (index==0) break;
1842         if (index>0) continue;
1843         index = TMath::Abs(index);
1844         AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
1845         if (!kink){
1846           printf("PROBLEM\n");
1847         }
1848         else{
1849           Int_t kinkrow = kink->GetTPCRow0()-2-Int_t(0.5/(0.05+kink->GetAngle(2)));
1850           if (kinkrow==nr){
1851             AliExternalTrackParam paramm(t);
1852             kink->SetMother(paramm);
1853             kink->SetStatus(2,1);
1854             kink->Update();
1855           }
1856         }
1857       }      
1858     }
1859     //
1860     if (nr<fInnerSec->GetNRows()) 
1861       fSectors = fInnerSec;
1862     else
1863       fSectors = fOuterSec;
1864     FollowToNext(t,nr);                                                             
1865   }   
1866   return 1;
1867 }
1868
1869
1870
1871
1872    
1873 Float_t AliTPCtrackerMI::OverlapFactor(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2, Int_t &sum1, Int_t & sum2)
1874 {
1875   //
1876   //
1877   sum1=0;
1878   sum2=0;
1879   Int_t sum=0;
1880   //
1881   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1882   dz2*=dz2;  
1883
1884   Float_t dy2 =TMath::Abs((s1->GetY() - s2->GetY()));
1885   dy2*=dy2;
1886   Float_t distance = TMath::Sqrt(dz2+dy2);
1887   if (distance>4.) return 0; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1888  
1889   //  Int_t offset =0;
1890   Int_t firstpoint = TMath::Min(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1891   Int_t lastpoint = TMath::Max(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1892   if (lastpoint>160) 
1893     lastpoint =160;
1894   if (firstpoint<0) 
1895     firstpoint = 0;
1896   if (firstpoint>lastpoint) {
1897     firstpoint =lastpoint;
1898     //    lastpoint  =160;
1899   }
1900     
1901   
1902   for (Int_t i=firstpoint-1;i<lastpoint+1;i++){
1903     if (s1->GetClusterIndex2(i)>0) sum1++;
1904     if (s2->GetClusterIndex2(i)>0) sum2++;
1905     if (s1->GetClusterIndex2(i)==s2->GetClusterIndex2(i) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1906       sum++;
1907     }
1908   }
1909   if (sum<5) return 0;
1910
1911   Float_t summin = TMath::Min(sum1+1,sum2+1);
1912   Float_t ratio = (sum+1)/Float_t(summin);
1913   return ratio;
1914 }
1915
1916 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(AliTPCseed * s1, AliTPCseed * s2)
1917 {
1918   //
1919   //
1920   if (TMath::Abs(s1->GetC()-s2->GetC())>0.004) return;
1921   if (TMath::Abs(s1->GetTgl()-s2->GetTgl())>0.6) return;
1922
1923   Float_t dz2 =(s1->GetZ() - s2->GetZ());
1924   dz2*=dz2;
1925   Float_t dy2 =(s1->GetY() - s2->GetY());
1926   dy2*=dy2;
1927   Float_t distance = dz2+dy2;
1928   if (distance>325.) return ; // if there are far away  - not overlap - to reduce combinatorics
1929   
1930   //
1931   Int_t sumshared=0;
1932   //
1933   Int_t firstpoint = TMath::Max(s1->fFirstPoint,s2->fFirstPoint);
1934   Int_t lastpoint = TMath::Min(s1->fLastPoint,s2->fLastPoint);
1935   //
1936   if (firstpoint>=lastpoint-5) return;;
1937
1938   for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1939     //    if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1940     if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1941       sumshared++;
1942     }
1943   }
1944   if (sumshared>4){
1945     // sign clusters
1946     //
1947     for (Int_t i=firstpoint;i<lastpoint;i++){
1948       //      if ( (s1->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF)==(s2->GetClusterIndex2(i)&0xFFFF8FFF) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1949       if ( (s1->GetClusterIndex2(i))==(s2->GetClusterIndex2(i)) && s1->GetClusterIndex2(i)>0) {
1950         AliTPCTrackerPoint *p1  = s1->GetTrackPoint(i);
1951         AliTPCTrackerPoint *p2  = s2->GetTrackPoint(i);; 
1952         if (s1->IsActive()&&s2->IsActive()){
1953           p1->fIsShared = kTRUE;
1954           p2->fIsShared = kTRUE;
1955         }       
1956       }
1957     }
1958   }
1959   //  
1960   if (sumshared>10){
1961     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1962       if (s1->fOverlapLabels[3*i]==0){
1963         s1->fOverlapLabels[3*i] = s2->GetLabel();
1964         s1->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1965         s1->fOverlapLabels[3*i+2] = s2->GetUniqueID();
1966         break;
1967       } 
1968     }
1969     for (Int_t i=0;i<4;i++){
1970       if (s2->fOverlapLabels[3*i]==0){
1971         s2->fOverlapLabels[3*i] = s1->GetLabel();
1972         s2->fOverlapLabels[3*i+1] = sumshared;
1973         s2->fOverlapLabels[3*i+2] = s1->GetUniqueID();
1974         break;
1975       } 
1976     }    
1977   }
1978   
1979 }
1980
1981 void  AliTPCtrackerMI::SignShared(TObjArray * arr)
1982 {
1983   //
1984   //sort trackss according sectors
1985   //  
1986   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
1987     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
1988     if (!pt) continue;
1989     //if (pt) RotateToLocal(pt);
1990     pt->fSort = 0;
1991   }
1992   arr->UnSort();
1993   arr->Sort();  // sorting according z
1994   arr->Expand(arr->GetEntries());
1995   //
1996   //
1997   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
1998   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
1999     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2000     if (!pt) continue;
2001     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2002       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2003     }
2004   }
2005   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2006     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2007     if (!pt) continue;
2008     if (pt->fRemoval>10) continue;
2009     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2010       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2011       //      if (pt2){
2012       if (pt2->fRemoval<=10) {
2013         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2014         SignShared(pt,pt2);
2015       }
2016     }  
2017   }
2018 }
2019
2020 void  AliTPCtrackerMI::RemoveDouble(TObjArray * arr, Float_t factor1, Float_t factor2,  Int_t removalindex)
2021 {
2022   //
2023   //sort trackss according sectors
2024   //
2025   if (fDebug&1) {
2026     Info("RemoveDouble","Number of tracks before double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2027   }
2028   //
2029   for (Int_t i=0; i<arr->GetEntriesFast(); i++) {
2030     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2031     if (!pt) continue;
2032     pt->fSort = 0;
2033   }
2034   arr->UnSort();
2035   arr->Sort();  // sorting according z
2036   arr->Expand(arr->GetEntries());
2037   //
2038   //reset overlap labels
2039   //
2040   Int_t nseed=arr->GetEntriesFast();
2041   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2042     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2043     if (!pt) continue;
2044     pt->SetUniqueID(i);
2045     for (Int_t j=0;j<=12;j++){
2046       pt->fOverlapLabels[j] =0;
2047     }
2048   }
2049   //
2050   //sign shared tracks
2051   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2052     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2053     if (!pt) continue;
2054     if (pt->fRemoval>10) continue;
2055     Float_t deltac = pt->GetC()*0.1;
2056     for (Int_t j=i+1; j<nseed; j++){
2057       AliTPCseed *pt2=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(j);
2058       //      if (pt2){
2059       if (pt2->fRemoval<=10) {
2060         if ( TMath::Abs(pt->fRelativeSector-pt2->fRelativeSector)>0) break;
2061         if (TMath::Abs(pt->GetC()  -pt2->GetC())>deltac) continue;
2062         if (TMath::Abs(pt->GetTgl()-pt2->GetTgl())>0.05) continue;
2063         //
2064         SignShared(pt,pt2);
2065       }
2066     }
2067   }
2068   //
2069   // remove highly shared tracks
2070   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2071     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2072     if (!pt) continue;
2073     if (pt->fRemoval>10) continue;
2074     //
2075     Int_t sumshared =0;
2076     for (Int_t j=0;j<4;j++){
2077       sumshared = pt->fOverlapLabels[j*3+1];      
2078     }
2079     Float_t factor = factor1;
2080     if (pt->fRemoval>0) factor = factor2;
2081     if (sumshared/pt->GetNumberOfClusters()>factor){
2082       for (Int_t j=0;j<4;j++){
2083         if (pt->fOverlapLabels[3*j]==0) continue;
2084         if (pt->fOverlapLabels[3*j+1]<5) continue; 
2085         if (pt->fRemoval==removalindex) continue;      
2086         AliTPCseed * pt2 = (AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(pt->fOverlapLabels[3*j+2]);
2087         if (!pt2) continue;
2088         if (pt2->GetSigma2C()<pt->GetSigma2C()){
2089           //      pt->fRemoval = removalindex;
2090           delete arr->RemoveAt(i);        
2091           break;
2092         }
2093       }      
2094     }
2095   }
2096   arr->Compress();
2097   if (fDebug&1) {
2098     Info("RemoveDouble","Number of tracks after double removal- %d\n",arr->GetEntries());
2099   }
2100 }
2101
2102
2103
2104
2105
2106
2107 void AliTPCtrackerMI::SortTracks(TObjArray * arr, Int_t mode) const
2108 {
2109   //
2110   //sort tracks in array according mode criteria
2111   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();    
2112   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2113     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2114     if (!pt) {
2115       continue;
2116     }
2117     pt->fSort = mode;
2118   }
2119   arr->UnSort();
2120   arr->Sort();
2121 }
2122
2123 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t removalindex)
2124 {
2125
2126   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2127   //
2128   //
2129   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();  
2130   Int_t good =0;
2131
2132   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2133     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2134     if (!pt) {
2135       delete arr->RemoveAt(i);
2136     }
2137     else{
2138       pt->fSort =1;
2139       pt->fBSigned = kFALSE;
2140     }
2141   }
2142   arr->Compress();
2143   nseed = arr->GetEntriesFast();
2144   arr->UnSort();
2145   arr->Sort();
2146   //
2147   //unsign used
2148   UnsignClusters();
2149   //
2150   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2151     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2152     if (!pt) {
2153       continue;
2154     }    
2155     Int_t found,foundable,shared;
2156     if (pt->IsActive()) 
2157       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kFALSE);
2158     else
2159       pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared,kTRUE); 
2160     //
2161     Double_t factor = factor2;
2162     if (pt->fBConstrain) factor = factor1;
2163
2164     if ((Float_t(shared)/Float_t(found))>factor){
2165       pt->Desactivate(removalindex);
2166       continue;
2167     }
2168
2169     good++;
2170     for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2171       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2172       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2173       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];        
2174       if (!c) continue;
2175       //      if (!c->IsUsed(10)) c->Use(10);
2176       //if (pt->IsActive()) 
2177       c->Use(10);  
2178       //else
2179       //        c->Use(5);
2180     }
2181     
2182   }
2183   fNtracks = good;
2184   if (fDebug>0){
2185     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2186   }
2187 }
2188
2189
2190 void AliTPCtrackerMI::RemoveUsed2(TObjArray * arr, Float_t factor1,  Float_t factor2, Int_t minimal)
2191 {
2192
2193   //Loop over all tracks and remove "overlaps"
2194   //
2195   //
2196   UnsignClusters();
2197   //
2198   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();  
2199   Float_t * quality = new Float_t[nseed];
2200   Int_t   * indexes = new Int_t[nseed];
2201   Int_t good =0;
2202   //
2203   //
2204   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2205     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2206     if (!pt){
2207       quality[i]=-1;
2208       continue;
2209     }
2210     pt->UpdatePoints();    //select first last max dens points
2211     Float_t * points = pt->GetPoints();
2212     if (points[3]<0.8) quality[i] =-1;
2213     //
2214     quality[i] = (points[2]-points[0])+pt->GetNumberOfClusters();
2215   }
2216   TMath::Sort(nseed,quality,indexes);
2217   //
2218   //
2219   for (Int_t itrack=0; itrack<nseed; itrack++) {
2220     Int_t trackindex = indexes[itrack];
2221     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(trackindex);    
2222     if (quality[trackindex]<0){
2223       if (pt) {
2224         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2225       }
2226       else{
2227         arr->RemoveAt(trackindex);
2228       }
2229       continue;
2230     }
2231     //
2232     Int_t first = Int_t(pt->GetPoints()[0]);
2233     Int_t last  = Int_t(pt->GetPoints()[2]);
2234     Double_t factor = (pt->fBConstrain) ? factor1: factor2;
2235     //
2236     Int_t found,foundable,shared;
2237     pt->GetClusterStatistic(first,last, found, foundable,shared,kFALSE);
2238     Float_t sharedfactor = Float_t(shared+1)/Float_t(found+1);
2239     Bool_t itsgold =kFALSE;
2240     if (pt->fEsd){
2241       UInt_t dummy[12];
2242       if (pt->fEsd->GetITSclusters(dummy)>4) itsgold= kTRUE;
2243     }
2244     if (!itsgold){
2245       //
2246       if (Float_t(shared+1)/Float_t(found+1)>factor){
2247         if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue;  //don't remove tracks  - part of the kinks
2248         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2249         continue;
2250       }      
2251       if (pt->GetNumberOfClusters()<50&&(found-0.5*shared)<minimal){  //remove short tracks
2252         if (pt->GetKinkIndexes()[0]!=0) continue;  //don't remove tracks  - part of the kinks
2253         delete arr->RemoveAt(trackindex);
2254         continue;
2255       }
2256     }
2257
2258     good++;
2259     if (sharedfactor>0.4) continue;
2260     if (pt->GetKinkIndexes()[0]>0) continue;
2261     for (Int_t i=first; i<last; i++) {
2262       Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2263       // if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2264       if (index<0 || index&0x8000 ) continue;
2265       AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];        
2266       if (!c) continue;
2267       c->Use(10);  
2268     }    
2269   }
2270   fNtracks = good;
2271   if (fDebug>0){
2272     Info("RemoveUsed","\n*****\nNumber of good tracks after shared removal\t%d\n",fNtracks);
2273   }
2274   delete []quality;
2275   delete []indexes;
2276 }
2277
2278 void AliTPCtrackerMI::UnsignClusters() 
2279 {
2280   //
2281   // loop over all clusters and unsign them
2282   //
2283   
2284   for (Int_t sec=0;sec<fkNIS;sec++){
2285     for (Int_t row=0;row<fInnerSec->GetNRows();row++){
2286       AliTPCclusterMI *cl = fInnerSec[sec][row].fClusters1;
2287       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN1;icl++)
2288         //      if (cl[icl].IsUsed(10))         
2289         cl[icl].Use(-1);
2290       cl = fInnerSec[sec][row].fClusters2;
2291       for (Int_t icl =0;icl< fInnerSec[sec][row].fN2;icl++)
2292         //if (cl[icl].IsUsed(10))       
2293           cl[icl].Use(-1);      
2294     }
2295   }
2296   
2297   for (Int_t sec=0;sec<fkNOS;sec++){
2298     for (Int_t row=0;row<fOuterSec->GetNRows();row++){
2299       AliTPCclusterMI *cl = fOuterSec[sec][row].fClusters1;
2300       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN1;icl++)
2301         //if (cl[icl].IsUsed(10))       
2302           cl[icl].Use(-1);
2303       cl = fOuterSec[sec][row].fClusters2;
2304       for (Int_t icl =0;icl< fOuterSec[sec][row].fN2;icl++)
2305         //if (cl[icl].IsUsed(10))       
2306         cl[icl].Use(-1);      
2307     }
2308   }
2309   
2310 }
2311
2312
2313
2314 void AliTPCtrackerMI::SignClusters(TObjArray * arr, Float_t fnumber, Float_t fdensity)
2315 {
2316   //
2317   //sign clusters to be "used"
2318   //
2319   // snumber and sdensity sign number of sigmas - bellow mean value to be accepted
2320   // loop over "primaries"
2321   
2322   Float_t sumdens=0;
2323   Float_t sumdens2=0;
2324   Float_t sumn   =0;
2325   Float_t sumn2  =0;
2326   Float_t sumchi =0;
2327   Float_t sumchi2 =0;
2328
2329   Float_t sum    =0;
2330
2331   TStopwatch timer;
2332   timer.Start();
2333
2334   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();
2335   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2336     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2337     if (!pt) {
2338       continue;
2339     }    
2340     if (!(pt->IsActive())) continue;
2341     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2342     if ( (dens>0.7) && (pt->GetNumberOfClusters()>70)){
2343       sumdens += dens;
2344       sumdens2+= dens*dens;
2345       sumn    += pt->GetNumberOfClusters();
2346       sumn2   += pt->GetNumberOfClusters()*pt->GetNumberOfClusters();
2347       Float_t chi2 = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2348       if (chi2>5) chi2=5;
2349       sumchi  +=chi2;
2350       sumchi2 +=chi2*chi2;
2351       sum++;
2352     }
2353   }
2354
2355   Float_t mdensity = 0.9;
2356   Float_t meann    = 130;
2357   Float_t meanchi  = 1;
2358   Float_t sdensity = 0.1;
2359   Float_t smeann    = 10;
2360   Float_t smeanchi  =0.4;
2361   
2362
2363   if (sum>20){
2364     mdensity = sumdens/sum;
2365     meann    = sumn/sum;
2366     meanchi  = sumchi/sum;
2367     //
2368     sdensity = sumdens2/sum-mdensity*mdensity;
2369     sdensity = TMath::Sqrt(sdensity);
2370     //
2371     smeann   = sumn2/sum-meann*meann;
2372     smeann   = TMath::Sqrt(smeann);
2373     //
2374     smeanchi = sumchi2/sum - meanchi*meanchi;
2375     smeanchi = TMath::Sqrt(smeanchi);
2376   }
2377
2378
2379   //REMOVE  SHORT DELTAS or tracks going out of sensitive volume of TPC
2380   //
2381   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2382     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2383     if (!pt) {
2384       continue;
2385     }
2386     if (pt->fBSigned) continue;
2387     if (pt->fBConstrain) continue;    
2388     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2389     /*
2390     Int_t found,foundable,shared;    
2391     pt->GetClusterStatistic(0,160,found, foundable,shared);
2392     if (shared/float(found)>0.3) {
2393       if (shared/float(found)>0.9 ){
2394         //delete arr->RemoveAt(i);
2395       }
2396       continue;
2397     }
2398     */
2399     Bool_t isok =kFALSE;
2400     if ( (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.5) &&pt->GetNumberOfClusters()>60)
2401       isok = kTRUE;
2402     if ((TMath::Abs(1/pt->GetC())<100.) && (pt->fNShared/pt->GetNumberOfClusters()<0.7))
2403       isok =kTRUE;
2404     if  (TMath::Abs(pt->GetZ()/pt->GetX())>1.1)
2405       isok =kTRUE;
2406     if ( (TMath::Abs(pt->GetSnp()>0.7) && pt->GetD(0,0)>60.))
2407       isok =kTRUE;
2408     
2409     if (isok)     
2410       for (Int_t i=0; i<160; i++) {     
2411         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2412         if (index<0) continue;
2413         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2414         if (!c) continue;
2415         //if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();  
2416         c->Use(10);  
2417       }
2418   }
2419   
2420   
2421   //
2422   Double_t maxchi  = meanchi+2.*smeanchi;
2423
2424   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2425     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2426     if (!pt) {
2427       continue;
2428     }    
2429     //if (!(pt->IsActive())) continue;
2430     if (pt->fBSigned) continue;
2431     Double_t chi     = pt->GetChi2()/pt->GetNumberOfClusters();
2432     if (chi>maxchi) continue;
2433
2434     Float_t bfactor=1;
2435     Float_t dens = pt->GetNumberOfClusters()/Float_t(pt->fNFoundable);
2436    
2437     //sign only tracks with enoug big density at the beginning
2438     
2439     if ((pt->GetDensityFirst(40)<0.75) && pt->GetNumberOfClusters()<meann) continue; 
2440     
2441     
2442     Double_t mindens = TMath::Max(double(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor),0.65);
2443     Double_t minn    = TMath::Max(Int_t(meann-fnumber*smeann*bfactor),50);
2444    
2445     //    if (pt->fBConstrain) mindens = TMath::Max(mdensity-sdensity*fdensity*bfactor,0.65);
2446     if ( (pt->fRemoval==10) && (pt->GetSnp()>0.8)&&(dens>mindens))
2447       minn=0;
2448
2449     if ((dens>mindens && pt->GetNumberOfClusters()>minn) && chi<maxchi ){
2450       //Int_t noc=pt->GetNumberOfClusters();
2451       pt->fBSigned = kTRUE;
2452       for (Int_t i=0; i<160; i++) {
2453
2454         Int_t index=pt->GetClusterIndex2(i);
2455         if (index<0) continue;
2456         AliTPCclusterMI *c= pt->fClusterPointer[i];
2457         if (!c) continue;
2458         //      if (!(c->IsUsed(10))) c->Use();  
2459         c->Use(10);  
2460       }
2461     }
2462   }
2463   //  gLastCheck = nseed;
2464   //  arr->Compress();
2465   if (fDebug>0){
2466     timer.Print();
2467   }
2468 }
2469
2470
2471 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(TObjArray * arr, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1, Float_t th2) const
2472 {
2473   // stop not active tracks
2474   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2475   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows 
2476   Int_t nseed = arr->GetEntriesFast();  
2477   //
2478   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
2479     AliTPCseed *pt=(AliTPCseed*)arr->UncheckedAt(i);    
2480     if (!pt) {
2481       continue;
2482     }
2483     if (!(pt->IsActive())) continue;
2484     StopNotActive(pt,row0,th0, th1,th2);
2485   }
2486 }
2487
2488
2489
2490 void  AliTPCtrackerMI::StopNotActive(AliTPCseed * seed, Int_t row0, Float_t th0, Float_t th1,
2491  Float_t th2) const
2492 {
2493   // stop not active tracks
2494   // take th1 as threshold for number of founded to number of foundable on last 10 active rows
2495   // take th2 as threshold for number of founded to number of foundable on last 20 active rows 
2496   Int_t sumgood1  = 0;
2497   Int_t sumgood2  = 0;
2498   Int_t foundable = 0;
2499   Int_t maxindex = seed->fLastPoint;  //last foundable row
2500   if (seed->fNFoundable*th0 > seed->GetNumberOfClusters()) {
2501     seed->Desactivate(10) ;
2502     return;
2503   }
2504
2505   for (Int_t i=row0; i<maxindex; i++){
2506     Int_t index = seed->GetClusterIndex2(i);
2507     if (index!=-1) foundable++;
2508     //if (!c) continue;
2509     if (foundable<=30) sumgood1++;
2510     if (foundable<=50) {
2511       sumgood2++;
2512     }
2513     else{ 
2514       break;
2515     }        
2516   }
2517   if (foundable>=30.){ 
2518      if (sumgood1<(th1*30.)) seed->Desactivate(10);
2519   }
2520   if (foundable>=50)
2521     if (sumgood2<(th2*50.)) seed->Desactivate(10);
2522 }
2523
2524
2525 Int_t AliTPCtrackerMI::RefitInward(AliESD *event)
2526 {
2527   //
2528   // back propagation of ESD tracks
2529   //
2530   //return 0;
2531   fEvent = event;
2532   ReadSeeds(event,2);
2533   fIteration=2;
2534   //PrepareForProlongation(fSeeds,1);
2535   PropagateForward2(fSeeds);
2536
2537   Int_t ntracks=0;
2538   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2539   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2540     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2541     if (!seed) continue;
2542     if (seed->GetKinkIndex(0)>0)  UpdateKinkQualityD(seed);  // update quality informations for kinks
2543
2544     seed->PropagateTo(fParam->GetInnerRadiusLow());
2545     seed->UpdatePoints();
2546     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2547     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2548     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2549     //
2550     if (AliTPCReconstructor::StreamLevel()>0 && seed!=0&&esd!=0) {
2551       TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
2552       cstream<<"Crefit"<<
2553         "Esd.="<<esd<<
2554         "Track.="<<seed<<
2555         "\n"; 
2556     }
2557     if (seed->GetNumberOfClusters()>15){
2558       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCrefit); 
2559       esd->SetTPCPoints(seed->GetPoints());
2560       esd->SetTPCPointsF(seed->fNFoundable);
2561       Int_t ndedx   = seed->fNCDEDX[0]+seed->fNCDEDX[1]+seed->fNCDEDX[2]+seed->fNCDEDX[3];
2562       Float_t sdedx = (seed->fSDEDX[0]+seed->fSDEDX[1]+seed->fSDEDX[2]+seed->fSDEDX[3])*0.25;
2563       Float_t dedx  = seed->GetdEdx();
2564       esd->SetTPCsignal(dedx, sdedx, ndedx);
2565       ntracks++;
2566     }
2567     else{
2568       //printf("problem\n");
2569     }
2570   }
2571   //FindKinks(fSeeds,event);
2572   Info("RefitInward","Number of refitted tracks %d",ntracks);
2573   fEvent =0;
2574   //WriteTracks();
2575   return 0;
2576 }
2577
2578
2579 Int_t AliTPCtrackerMI::PropagateBack(AliESD *event)
2580 {
2581   //
2582   // back propagation of ESD tracks
2583   //
2584
2585   fEvent = event;
2586   fIteration = 1;
2587   ReadSeeds(event,1);
2588   PropagateBack(fSeeds); 
2589   RemoveUsed2(fSeeds,0.4,0.4,20);
2590   //
2591   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2592   Int_t ntracks=0;
2593   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2594     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*) fSeeds->UncheckedAt(i);
2595     if (!seed) continue;
2596     if (seed->GetKinkIndex(0)<0)  UpdateKinkQualityM(seed);  // update quality informations for kinks
2597     seed->UpdatePoints();
2598     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2599     seed->CookdEdx(0.02,0.6);
2600     CookLabel(seed,0.1); //For comparison only
2601     if (seed->GetNumberOfClusters()>15){
2602       esd->UpdateTrackParams(seed,AliESDtrack::kTPCout);
2603       esd->SetTPCPoints(seed->GetPoints());
2604       esd->SetTPCPointsF(seed->fNFoundable);
2605       Int_t ndedx   = seed->fNCDEDX[0]+seed->fNCDEDX[1]+seed->fNCDEDX[2]+seed->fNCDEDX[3];
2606       Float_t sdedx = (seed->fSDEDX[0]+seed->fSDEDX[1]+seed->fSDEDX[2]+seed->fSDEDX[3])*0.25;
2607       Float_t dedx  = seed->GetdEdx();
2608       esd->SetTPCsignal(dedx, sdedx, ndedx);
2609       ntracks++;
2610       Int_t eventnumber = event->GetEventNumber();// patch 28 fev 06
2611       (*fDebugStreamer)<<"Cback"<<
2612         "Tr0.="<<seed<<
2613         "EventNr="<<eventnumber<<
2614         "\n"; // patch 28 fev 06   
2615     }
2616   }
2617   //FindKinks(fSeeds,event);
2618   Info("PropagateBack","Number of back propagated tracks %d",ntracks);
2619   fEvent =0;
2620   //WriteTracks();
2621   return 0;
2622 }
2623
2624
2625 void AliTPCtrackerMI::DeleteSeeds()
2626 {
2627   //
2628   //delete Seeds
2629   Int_t nseed = fSeeds->GetEntriesFast();
2630   for (Int_t i=0;i<nseed;i++){
2631     AliTPCseed * seed = (AliTPCseed*)fSeeds->At(i);
2632     if (seed) delete fSeeds->RemoveAt(i);
2633   }
2634   delete fSeeds;
2635   fSeeds =0;
2636 }
2637
2638 void AliTPCtrackerMI::ReadSeeds(AliESD *event, Int_t direction)
2639 {
2640   //
2641   //read seeds from the event
2642   
2643   Int_t nentr=event->GetNumberOfTracks();
2644   if (fDebug>0){
2645     Info("ReadSeeds", "Number of ESD tracks: %d\n", nentr);
2646   }
2647   if (fSeeds) 
2648     DeleteSeeds();
2649   if (!fSeeds){   
2650     fSeeds = new TObjArray(nentr);
2651   }
2652   UnsignClusters();
2653   //  Int_t ntrk=0;  
2654   for (Int_t i=0; i<nentr; i++) {
2655     AliESDtrack *esd=event->GetTrack(i);
2656     ULong_t status=esd->GetStatus();
2657     if (!(status&AliESDtrack::kTPCin)) continue;
2658     AliTPCtrack t(*esd);
2659     t.SetNumberOfClusters(0);
2660     //    AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t,t.GetAlpha());
2661     AliTPCseed *seed = new AliTPCseed(t/*,t.GetAlpha()*/);
2662     for (Int_t ikink=0;ikink<3;ikink++) {
2663       Int_t index = esd->GetKinkIndex(ikink);
2664       seed->GetKinkIndexes()[ikink] = index;
2665       if (index==0) continue;
2666       index = TMath::Abs(index);
2667       AliESDkink * kink = fEvent->GetKink(index-1);
2668       if (kink&&esd->GetKinkIndex(ikink)<0){
2669         if ((status & AliESDtrack::kTRDrefit) != 0) kink->SetStatus(1,2);
2670         if ((status & AliESDtrack::kITSout) != 0)   kink->SetStatus(1,0);
2671       }
2672       if (kink&&esd->GetKinkIndex(ikink)>0){
2673         if ((status & AliESDtrack::kTRDrefit) != 0) kink->SetStatus(1,6);
2674         if ((status & AliESDtrack::kITSout) != 0)   kink->SetStatus(1,4);
2675       }
2676
2677     }
2678     if (((status&AliESDtrack::kITSout)==0)&&(direction==1)) seed->ResetCovariance(); 
2679     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) == 0 ) seed->ResetCovariance();
2680     if ( direction ==2 && ((status & AliESDtrack::kTPCout) == 0) ) {
2681       fSeeds->AddAt(0,i);
2682       delete seed;
2683       continue;    
2684     }
2685     if ( direction ==2 &&(status & AliESDtrack::kTRDrefit) > 0 )  {
2686       Double_t par0[5],par1[5],alpha,x;
2687       esd->GetInnerExternalParameters(alpha,x,par0);
2688       esd->GetExternalParameters(x,par1);
2689       Double_t delta1 = TMath::Abs(par0[4]-par1[4])/(0.000000001+TMath::Abs(par0[4]+par1[4]));
2690       Double_t delta2 = TMath::Abs(par0[3]-par1[3]);
2691       Double_t trdchi2=0;
2692       if (esd->GetTRDncls()>0) trdchi2 = esd->GetTRDchi2()/esd->GetTRDncls();
2693       //reset covariance if suspicious 
2694       if ( (delta1>0.1) || (delta2>0.006) ||trdchi2>7.)
2695         seed->ResetCovariance();
2696     }
2697
2698     //
2699     //
2700     // rotate to the local coordinate system
2701     //   
2702     fSectors=fInnerSec; fN=fkNIS;    
2703     Double_t alpha=seed->GetAlpha() - fSectors->GetAlphaShift();
2704     if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
2705     if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
2706     Int_t ns=Int_t(alpha/fSectors->GetAlpha())%fN;
2707     alpha =ns*fSectors->GetAlpha() + fSectors->GetAlphaShift();
2708     if (alpha<-TMath::Pi()) alpha += 2*TMath::Pi();
2709     if (alpha>=TMath::Pi()) alpha -= 2*TMath::Pi();
2710     alpha-=seed->GetAlpha();  
2711     if (!seed->Rotate(alpha)) {
2712       delete seed;
2713       continue;
2714     }
2715     seed->fEsd = esd;
2716     // sign clusters
2717     if (esd->GetKinkIndex(0)<=0){
2718       for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
2719         Int_t index = seed->GetClusterIndex2(irow);    
2720         if (index>0){ 
2721           //
2722           AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(index);
2723           seed->fClusterPointer[irow] = cl;
2724           if (cl){
2725             if ((index & 0x8000)==0){
2726               cl->Use(10);  // accepted cluster   
2727             }else{
2728               cl->Use(6);   // close cluster not accepted
2729             }   
2730           }else{
2731             Info("ReadSeeds","Not found cluster");
2732           }
2733         }
2734       }
2735     }
2736     fSeeds->AddAt(seed,i);
2737   }
2738 }
2739
2740
2741
2742 //_____________________________________________________________________________
2743 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds3(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
2744                                  Float_t deltay, Int_t ddsec) {
2745   //-----------------------------------------------------------------
2746   // This function creates track seeds.
2747   // SEEDING WITH VERTEX CONSTRAIN 
2748   //-----------------------------------------------------------------
2749   // cuts[0]   - fP4 cut
2750   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
2751   // cuts[2]   - zvertex cut
2752   // cuts[3]   - fP3 cut
2753   Int_t nin0  = 0;
2754   Int_t nin1  = 0;
2755   Int_t nin2  = 0;
2756   Int_t nin   = 0;
2757   Int_t nout1 = 0;
2758   Int_t nout2 = 0;
2759
2760   Double_t x[5], c[15];
2761   //  Int_t di = i1-i2;
2762   //
2763   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
2764   Double_t alpha=fSectors->GetAlpha(), shift=fSectors->GetAlphaShift();
2765   Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
2766   //
2767   //  Double_t x1 =fOuterSec->GetX(i1);
2768   //Double_t xx2=fOuterSec->GetX(i2);
2769   
2770   Double_t x1 =GetXrow(i1);
2771   Double_t xx2=GetXrow(i2);
2772
2773   Double_t x3=GetX(), y3=GetY(), z3=GetZ();
2774
2775   Int_t imiddle = (i2+i1)/2;    //middle pad row index
2776   Double_t xm = GetXrow(imiddle); // radius of middle pad-row
2777   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,imiddle); //middle pad -row
2778   //
2779   Int_t ns =sec;   
2780
2781   const AliTPCRow& kr1=GetRow(ns,i1);
2782   Double_t ymax  = GetMaxY(i1)-kr1.fDeadZone-1.5;  
2783   Double_t ymaxm = GetMaxY(imiddle)-kr1.fDeadZone-1.5;  
2784
2785   //
2786   // change cut on curvature if it can't reach this layer
2787   // maximal curvature set to reach it
2788   Double_t dvertexmax  = TMath::Sqrt((x1-x3)*(x1-x3)+(ymax+5-y3)*(ymax+5-y3));
2789   if (dvertexmax*0.5*cuts[0]>0.85){
2790     cuts[0] = 0.85/(dvertexmax*0.5+1.);
2791   }
2792   Double_t r2min = 1/(cuts[0]*cuts[0]);  //minimal square of radius given by cut
2793
2794   //  Int_t ddsec = 1;
2795   if (deltay>0) ddsec = 0; 
2796   // loop over clusters  
2797   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
2798     //
2799     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
2800     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();    
2801     //if (TMath::Abs(y1)>ymax) continue;
2802
2803     if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
2804
2805     // find possible directions    
2806     Float_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3); 
2807     Float_t extraz = z1 - anglez*(x1-xx2);  // extrapolated z      
2808     //
2809     //
2810     //find   rotation angles relative to line given by vertex and point 1
2811     Double_t dvertex2 = (x1-x3)*(x1-x3)+(y1-y3)*(y1-y3);
2812     Double_t dvertex  = TMath::Sqrt(dvertex2);
2813     Double_t angle13  = TMath::ATan((y1-y3)/(x1-x3));
2814     Double_t cs13     = cos(-angle13), sn13 = sin(-angle13);            
2815     
2816     //
2817     // loop over 2 sectors
2818     Int_t dsec1=-ddsec;
2819     Int_t dsec2= ddsec;
2820     if (y1<0)  dsec2= 0;
2821     if (y1>0)  dsec1= 0;
2822     
2823     Double_t dddz1=0;  // direction of delta inclination in z axis
2824     Double_t dddz2=0;
2825     if ( (z1-z3)>0)
2826       dddz1 =1;    
2827     else
2828       dddz2 =1;
2829     //
2830     for (Int_t dsec = dsec1; dsec<=dsec2;dsec++){
2831       Int_t sec2 = sec + dsec;
2832       // 
2833       //      AliTPCRow&  kr2  = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][i2];
2834       //AliTPCRow&  kr2m = fOuterSec[(sec2+fkNOS)%fkNOS][imiddle];
2835       AliTPCRow&  kr2  = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,i2);
2836       AliTPCRow&  kr2m = GetRow((sec2+fkNOS)%fkNOS,imiddle);
2837       Int_t  index1 = TMath::Max(kr2.Find(extraz-0.6-dddz1*TMath::Abs(z1)*0.05)-1,0);
2838       Int_t  index2 = TMath::Min(kr2.Find(extraz+0.6+dddz2*TMath::Abs(z1)*0.05)+1,kr2);
2839
2840       // rotation angles to p1-p3
2841       Double_t cs13r     = cos(-angle13+dsec*alpha)/dvertex, sn13r = sin(-angle13+dsec*alpha)/dvertex;            
2842       Double_t x2,   y2,   z2; 
2843       //
2844       //      Double_t dymax = maxangle*TMath::Abs(x1-xx2);
2845
2846       //
2847       Double_t dxx0 =  (xx2-x3)*cs13r;
2848       Double_t dyy0 =  (xx2-x3)*sn13r;
2849       for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
2850         const AliTPCclusterMI *kcl = kr2[js];
2851         if (kcl->IsUsed(10)) continue;  
2852         //
2853         //calcutate parameters
2854         //      
2855         Double_t yy0 =  dyy0 +(kcl->GetY()-y3)*cs13r;
2856         // stright track
2857         if (TMath::Abs(yy0)<0.000001) continue;
2858         Double_t xx0 =  dxx0 -(kcl->GetY()-y3)*sn13r;
2859         Double_t y0  =  0.5*(xx0*xx0+yy0*yy0-xx0)/yy0;
2860         Double_t r02 = (0.25+y0*y0)*dvertex2;   
2861         //curvature (radius) cut
2862         if (r02<r2min) continue;                
2863        
2864         nin0++; 
2865         //
2866         Double_t c0  = 1/TMath::Sqrt(r02);
2867         if (yy0>0) c0*=-1.;     
2868                
2869        
2870         //Double_t dfi0   = 2.*TMath::ASin(dvertex*c0*0.5);
2871         //Double_t dfi1   = 2.*TMath::ASin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);
2872         Double_t dfi0   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(dvertex*c0*0.5);
2873         Double_t dfi1   = 2.*AliTPCFastMath::FastAsin(TMath::Sqrt(yy0*yy0+(1-xx0)*(1-xx0))*dvertex*c0*0.5);  
2874         //
2875         //
2876         Double_t z0  =  kcl->GetZ();  
2877         Double_t zzzz2    = z1-(z1-z3)*dfi1/dfi0;
2878         if (TMath::Abs(zzzz2-z0)>0.5) continue;       
2879         nin1++;              
2880         //      
2881         Double_t dip    = (z1-z0)*c0/dfi1;        
2882         Double_t x0 = (0.5*cs13+y0*sn13)*dvertex*c0;
2883         //
2884         y2 = kcl->GetY(); 
2885         if (dsec==0){
2886           x2 = xx2; 
2887           z2 = kcl->GetZ();       
2888         }
2889         else
2890           {
2891             // rotation 
2892             z2 = kcl->GetZ();  
2893             x2= xx2*cs-y2*sn*dsec;
2894             y2=+xx2*sn*dsec+y2*cs;
2895           }
2896         
2897         x[0] = y1;
2898         x[1] = z1;
2899         x[2] = x0;
2900         x[3] = dip;
2901         x[4] = c0;
2902         //
2903         //
2904         // do we have cluster at the middle ?
2905         Double_t ym,zm;
2906         GetProlongation(x1,xm,x,ym,zm);
2907         UInt_t dummy; 
2908         AliTPCclusterMI * cm=0;
2909         if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){      
2910           cm = krm.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2911           if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {        
2912             continue;
2913           }
2914         }
2915         else{     
2916           // rotate y1 to system 0
2917           // get state vector in rotated system 
2918           Double_t yr1  = (-0.5*sn13+y0*cs13)*dvertex*c0;
2919           Double_t xr2  =  x0*cs+yr1*sn*dsec;
2920           Double_t xr[5]={kcl->GetY(),kcl->GetZ(), xr2, dip, c0};
2921           //
2922           GetProlongation(xx2,xm,xr,ym,zm);
2923           if (TMath::Abs(ym)-ymaxm<0){
2924             cm = kr2m.FindNearest2(ym,zm,1.0,0.6,dummy);
2925             if ((!cm) || (cm->IsUsed(10))) {      
2926               continue;
2927             }
2928           }
2929         }
2930        
2931
2932         Double_t dym = 0;
2933         Double_t dzm = 0;
2934         if (cm){
2935           dym = ym - cm->GetY();
2936           dzm = zm - cm->GetZ();
2937         }
2938         nin2++;
2939
2940
2941         //
2942         //
2943         Double_t sy1=kr1[is]->GetSigmaY2()*2., sz1=kr1[is]->GetSigmaZ2()*2.;
2944         Double_t sy2=kcl->GetSigmaY2()*2.,     sz2=kcl->GetSigmaZ2()*2.;
2945         //Double_t sy3=400*3./12., sy=0.1, sz=0.1;
2946         Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
2947         //Double_t sy3=25000*x[4]*x[4]*60+0.5, sy=0.1, sz=0.1;
2948
2949         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
2950         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
2951         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
2952         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
2953         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
2954         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
2955         
2956         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
2957         Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
2958         Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
2959         Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
2960         
2961         c[0]=sy1;
2962         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
2963         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
2964         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
2965                        c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
2966         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
2967         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
2968         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
2969         
2970         //      if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
2971         
2972         UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
2973         AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, ns*alpha+shift);
2974         
2975         track->fIsSeeding = kTRUE;
2976         track->fSeed1 = i1;
2977         track->fSeed2 = i2;
2978         track->fSeedType=3;
2979
2980        
2981         //if (dsec==0) {
2982           FollowProlongation(*track, (i1+i2)/2,1);
2983           Int_t foundable,found,shared;
2984           track->GetClusterStatistic((i1+i2)/2,i1, found, foundable, shared, kTRUE);
2985           if ((found<0.55*foundable)  || shared>0.5*found || (track->GetSigmaY2()+track->GetSigmaZ2())>0.5){
2986             seed->Reset();
2987             seed->~AliTPCseed();
2988             continue;
2989           }
2990           //}
2991         
2992         nin++;
2993         FollowProlongation(*track, i2,1);
2994         
2995         
2996         //Int_t rc = 1;
2997         track->fBConstrain =1;
2998         //      track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
2999         track->fLastPoint = i1;  // first cluster in track position
3000         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3001         
3002         if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 || 
3003             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 || 
3004             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters() ) {
3005           seed->Reset();
3006           seed->~AliTPCseed();
3007           continue;
3008         }
3009         nout1++;
3010         // Z VERTEX CONDITION
3011         Double_t zv;
3012         zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3013           ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3014         if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]) {
3015           FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-20,0));
3016           zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3017             ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3018           if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2]){
3019             FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-40,0));
3020             zv = track->GetZ()+track->GetTgl()/track->GetC()*
3021               ( asin(-track->GetEta()) - asin(track->GetX()*track->GetC()-track->GetEta()));
3022             if (TMath::Abs(zv-z3)>cuts[2] &&(track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.7)){
3023               // make seed without constrain
3024               AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,1.);
3025               FollowProlongation(*track2, i2,1);
3026               track2->fBConstrain = kFALSE;
3027               track2->fSeedType = 1;
3028               arr->AddLast(track2); 
3029               seed->Reset();
3030               seed->~AliTPCseed();
3031               continue;         
3032             }
3033             else{
3034               seed->Reset();
3035               seed->~AliTPCseed();
3036               continue;
3037             
3038             }
3039           }
3040         }
3041         
3042         track->fSeedType =0;
3043         arr->AddLast(track); 
3044         seed = new AliTPCseed;  
3045         nout2++;
3046         // don't consider other combinations
3047         if (track->GetNumberOfClusters() > track->fNFoundable*0.8)
3048           break;
3049       }
3050     }
3051   }
3052   if (fDebug>3){
3053     Info("MakeSeeds3","\nSeeding statistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2);
3054   }
3055   delete seed;
3056 }
3057
3058
3059 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds5(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2,  Float_t cuts[4],
3060                                  Float_t deltay) {
3061   
3062
3063
3064   //-----------------------------------------------------------------
3065   // This function creates track seeds.
3066   //-----------------------------------------------------------------
3067   // cuts[0]   - fP4 cut
3068   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3069   // cuts[2]   - zvertex cut
3070   // cuts[3]   - fP3 cut
3071
3072
3073   Int_t nin0  = 0;
3074   Int_t nin1  = 0;
3075   Int_t nin2  = 0;
3076   Int_t nin   = 0;
3077   Int_t nout1 = 0;
3078   Int_t nout2 = 0;
3079   Int_t nout3 =0;
3080   Double_t x[5], c[15];
3081   //
3082   // make temporary seed
3083   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3084   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3085   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3086   //
3087   //
3088
3089   // first 3 padrows
3090   Double_t x1 = GetXrow(i1-1);
3091   const    AliTPCRow& kr1=GetRow(sec,i1-1);
3092   Double_t y1max  = GetMaxY(i1-1)-kr1.fDeadZone-1.5;  
3093   //
3094   Double_t x1p = GetXrow(i1);
3095   const    AliTPCRow& kr1p=GetRow(sec,i1);
3096   //
3097   Double_t x1m = GetXrow(i1-2);
3098   const    AliTPCRow& kr1m=GetRow(sec,i1-2);
3099
3100   //
3101   //last 3 padrow for seeding
3102   AliTPCRow&  kr3  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-7);
3103   Double_t    x3   =  GetXrow(i1-7);
3104   //  Double_t    y3max= GetMaxY(i1-7)-kr3.fDeadZone-1.5;  
3105   //
3106   AliTPCRow&  kr3p  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-6);
3107   Double_t    x3p   = GetXrow(i1-6);
3108   //
3109   AliTPCRow&  kr3m  = GetRow((sec+fkNOS)%fkNOS,i1-8);
3110   Double_t    x3m   = GetXrow(i1-8);
3111
3112   //
3113   //
3114   // middle padrow
3115   Int_t im = i1-4;                           //middle pad row index
3116   Double_t xm         = GetXrow(im);         // radius of middle pad-row
3117   const AliTPCRow& krm=GetRow(sec,im);   //middle pad -row
3118   //  Double_t ymmax = GetMaxY(im)-kr1.fDeadZone-1.5;  
3119   //
3120   //
3121   Double_t deltax  = x1-x3;
3122   Double_t dymax   = deltax*cuts[1];
3123   Double_t dzmax   = deltax*cuts[3];
3124   //
3125   // loop over clusters  
3126   for (Int_t is=0; is < kr1; is++) {
3127     //
3128     if (kr1[is]->IsUsed(10)) continue;
3129     Double_t y1=kr1[is]->GetY(), z1=kr1[is]->GetZ();    
3130     //
3131     if (deltay>0 && TMath::Abs(y1max-TMath::Abs(y1))> deltay ) continue;  // seed only at the edge    
3132     // 
3133     Int_t  index1 = TMath::Max(kr3.Find(z1-dzmax)-1,0);
3134     Int_t  index2 = TMath::Min(kr3.Find(z1+dzmax)+1,kr3);
3135     //    
3136     Double_t y3,   z3;
3137     //
3138     //
3139     UInt_t index;
3140     for (Int_t js=index1; js < index2; js++) {
3141       const AliTPCclusterMI *kcl = kr3[js];
3142       if (kcl->IsUsed(10)) continue;
3143       y3 = kcl->GetY(); 
3144       // apply angular cuts
3145       if (TMath::Abs(y1-y3)>dymax) continue;
3146       x3 = x3; 
3147       z3 = kcl->GetZ(); 
3148       if (TMath::Abs(z1-z3)>dzmax) continue;
3149       //
3150       Double_t angley = (y1-y3)/(x1-x3);
3151       Double_t anglez = (z1-z3)/(x1-x3);
3152       //
3153       Double_t erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3154       Double_t errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.5+0.5;
3155       //
3156       Double_t yyym = angley*(xm-x1)+y1;
3157       Double_t zzzm = anglez*(xm-x1)+z1;
3158
3159       const AliTPCclusterMI *kcm = krm.FindNearest2(yyym,zzzm,erry,errz,index);
3160       if (!kcm) continue;
3161       if (kcm->IsUsed(10)) continue;
3162       
3163       erry = TMath::Abs(angley)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3164       errz = TMath::Abs(anglez)*(x1-x1m)*0.4+0.5;
3165       //
3166       //
3167       //
3168       Int_t used  =0;
3169       Int_t found =0;
3170       //
3171       // look around first
3172       const AliTPCclusterMI *kc1m = kr1m.FindNearest2(angley*(x1m-x1)+y1,
3173                                                       anglez*(x1m-x1)+z1,
3174                                                       erry,errz,index);
3175       //
3176       if (kc1m){
3177         found++;
3178         if (kc1m->IsUsed(10)) used++;
3179       }
3180       const AliTPCclusterMI *kc1p = kr1p.FindNearest2(angley*(x1p-x1)+y1,
3181                                                       anglez*(x1p-x1)+z1,
3182                                                       erry,errz,index);
3183       //
3184       if (kc1p){
3185         found++;
3186         if (kc1p->IsUsed(10)) used++;
3187       }
3188       if (used>1)  continue;
3189       if (found<1) continue; 
3190
3191       //
3192       // look around last
3193       const AliTPCclusterMI *kc3m = kr3m.FindNearest2(angley*(x3m-x3)+y3,
3194                                                       anglez*(x3m-x3)+z3,
3195                                                       erry,errz,index);
3196       //
3197       if (kc3m){
3198         found++;
3199         if (kc3m->IsUsed(10)) used++;
3200       }
3201       else 
3202         continue;
3203       const AliTPCclusterMI *kc3p = kr3p.FindNearest2(angley*(x3p-x3)+y3,
3204                                                       anglez*(x3p-x3)+z3,
3205                                                       erry,errz,index);
3206       //
3207       if (kc3p){
3208         found++;
3209         if (kc3p->IsUsed(10)) used++;
3210       }
3211       else 
3212         continue;
3213       if (used>1)  continue;
3214       if (found<3) continue;       
3215       //
3216       Double_t x2,y2,z2;
3217       x2 = xm;
3218       y2 = kcm->GetY();
3219       z2 = kcm->GetZ();
3220       //
3221                         
3222       x[0]=y1;
3223       x[1]=z1;
3224       x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3225       //if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;
3226       nin0++;
3227       //
3228       x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3229       nin1++;
3230       //
3231       x[3]=F3n(x1,y1,x2,y2,z1,z2,x[4]);
3232       //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3233       nin2++;
3234       //
3235       //
3236       Double_t sy1=0.1,  sz1=0.1;
3237       Double_t sy2=0.1,  sz2=0.1;
3238       Double_t sy3=0.1,  sy=0.1, sz=0.1;
3239       
3240       Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3241       Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3242       Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3243       Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3244       Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3245       Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3246       
3247       Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[3])/sy;
3248       Double_t f31=(F3(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[3])/sz;
3249       Double_t f32=(F3(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[3])/sy;
3250       Double_t f34=(F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[3])/sz;
3251       
3252       c[0]=sy1;
3253       c[1]=0.;       c[2]=sz1; 
3254       c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3255       c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3256       c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3257       c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3258       c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3259       c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3260       
3261       //        if (!BuildSeed(kr1[is],kcl,0,x1,x2,x3,x,c)) continue;
3262       
3263       UInt_t index=kr1.GetIndex(is);
3264       AliTPCseed *track=new(seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3265       
3266       track->fIsSeeding = kTRUE;
3267
3268       nin++;      
3269       FollowProlongation(*track, i1-7,1);
3270       if (track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.75 || 
3271           track->fNShared>0.6*track->GetNumberOfClusters() || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.6){
3272         seed->Reset();
3273         seed->~AliTPCseed();
3274         continue;
3275       }
3276       nout1++;
3277       nout2++;  
3278       //Int_t rc = 1;
3279       FollowProlongation(*track, i2,1);
3280       track->fBConstrain =0;
3281       track->fLastPoint = i1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3282       track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3283       
3284       if (track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 || 
3285           track->GetNumberOfClusters()<track->fNFoundable*0.7 || 
3286           track->fNShared>2. || track->GetChi2()/track->GetNumberOfClusters()>6 || ( track->GetSigmaY2()+ track->GetSigmaZ2())>0.5 ) {
3287         seed->Reset();
3288         seed->~AliTPCseed();
3289         continue;
3290       }
3291    
3292       {
3293         FollowProlongation(*track, TMath::Max(i2-10,0),1);
3294         AliTPCseed * track2 = MakeSeed(track,0.2,0.5,0.9);
3295         FollowProlongation(*track2, i2,1);
3296         track2->fBConstrain = kFALSE;
3297         track2->fSeedType = 4;
3298         arr->AddLast(track2); 
3299         seed->Reset();
3300         seed->~AliTPCseed();
3301       }
3302       
3303    
3304       //arr->AddLast(track); 
3305       //seed = new AliTPCseed;  
3306       nout3++;
3307     }
3308   }
3309   
3310   if (fDebug>3){
3311     Info("MakeSeeds5","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin,nout1,nout2,nout3);
3312   }
3313   delete seed;
3314 }
3315
3316
3317 //_____________________________________________________________________________
3318 void AliTPCtrackerMI::MakeSeeds2(TObjArray * arr, Int_t sec, Int_t i1, Int_t i2, Float_t */*cuts[4]*/,
3319                                  Float_t deltay, Bool_t /*bconstrain*/) {
3320   //-----------------------------------------------------------------
3321   // This function creates track seeds - without vertex constraint
3322   //-----------------------------------------------------------------
3323   // cuts[0]   - fP4 cut        - not applied
3324   // cuts[1]   - tan(phi)  cut
3325   // cuts[2]   - zvertex cut    - not applied 
3326   // cuts[3]   - fP3 cut
3327   Int_t nin0=0;
3328   Int_t nin1=0;
3329   Int_t nin2=0;
3330   Int_t nin3=0;
3331   //  Int_t nin4=0;
3332   //Int_t nin5=0;
3333
3334   
3335
3336   Double_t alpha=fOuterSec->GetAlpha(), shift=fOuterSec->GetAlphaShift();
3337   //  Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
3338   Int_t row0 = (i1+i2)/2;
3339   Int_t drow = (i1-i2)/2;
3340   const AliTPCRow& kr0=fSectors[sec][row0];
3341   AliTPCRow * kr=0;
3342
3343   AliTPCpolyTrack polytrack;
3344   Int_t nclusters=fSectors[sec][row0];
3345   AliTPCseed * seed = new AliTPCseed;
3346
3347   Int_t sumused=0;
3348   Int_t cused=0;
3349   Int_t cnused=0;
3350   for (Int_t is=0; is < nclusters; is++) {  //LOOP over clusters
3351     Int_t nfound =0;
3352     Int_t nfoundable =0;
3353     for (Int_t iter =1; iter<2; iter++){   //iterations
3354       const AliTPCRow& krm=fSectors[sec][row0-iter];
3355       const AliTPCRow& krp=fSectors[sec][row0+iter];      
3356       const AliTPCclusterMI * cl= kr0[is];
3357       
3358       if (cl->IsUsed(10)) {
3359         cused++;
3360       }
3361       else{
3362         cnused++;
3363       }
3364       Double_t x = kr0.GetX();
3365       // Initialization of the polytrack
3366       nfound =0;
3367       nfoundable =0;
3368       polytrack.Reset();
3369       //
3370       Double_t y0= cl->GetY();
3371       Double_t z0= cl->GetZ();
3372       Float_t erry = 0;
3373       Float_t errz = 0;
3374       
3375       Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row0)-kr0.fDeadZone-1.5;
3376       if (deltay>0 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))> deltay ) continue;  // seed only at the edge
3377       
3378       erry = (0.5)*cl->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;      
3379       errz = (0.5)*cl->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl->GetQ())*6;      
3380       polytrack.AddPoint(x,y0,z0,erry, errz);
3381
3382       sumused=0;
3383       if (cl->IsUsed(10)) sumused++;
3384
3385
3386       Float_t roady = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaY2()+0.2)+1.)*iter;
3387       Float_t roadz = (5*TMath::Sqrt(cl->GetSigmaZ2()+0.2)+1.)*iter;
3388       //
3389       x = krm.GetX();
3390       AliTPCclusterMI * cl1 = krm.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3391       if (cl1 && TMath::Abs(ymax-TMath::Abs(y0))) {
3392         erry = (0.5)*cl1->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;          
3393         errz = (0.5)*cl1->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl1->GetQ())*3;
3394         if (cl1->IsUsed(10))  sumused++;
3395         polytrack.AddPoint(x,cl1->GetY(),cl1->GetZ(),erry,errz);
3396       }
3397       //
3398       x = krp.GetX();
3399       AliTPCclusterMI * cl2 = krp.FindNearest(y0,z0,roady,roadz);
3400       if (cl2) {
3401         erry = (0.5)*cl2->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;          
3402         errz = (0.5)*cl2->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cl2->GetQ())*3;
3403         if (cl2->IsUsed(10)) sumused++;  
3404         polytrack.AddPoint(x,cl2->GetY(),cl2->GetZ(),erry,errz);
3405       }
3406       //
3407       if (sumused>0) continue;
3408       nin0++;
3409       polytrack.UpdateParameters();
3410       // follow polytrack
3411       roadz = 1.2;
3412       roady = 1.2;
3413       //
3414       Double_t yn,zn;
3415       nfoundable = polytrack.GetN();
3416       nfound     = nfoundable; 
3417       //
3418       for (Int_t ddrow = iter+1; ddrow<drow;ddrow++){
3419         Float_t maxdist = 0.8*(1.+3./(ddrow));
3420         for (Int_t delta = -1;delta<=1;delta+=2){
3421           Int_t row = row0+ddrow*delta;
3422           kr = &(fSectors[sec][row]);
3423           Double_t xn = kr->GetX();
3424           Double_t ymax = fSectors->GetMaxY(row)-kr->fDeadZone-1.5;
3425           polytrack.GetFitPoint(xn,yn,zn);
3426           if (TMath::Abs(yn)>ymax) continue;
3427           nfoundable++;
3428           AliTPCclusterMI * cln = kr->FindNearest(yn,zn,roady,roadz);
3429           if (cln) {
3430             Float_t dist =  TMath::Sqrt(  (yn-cln->GetY())*(yn-cln->GetY())+(zn-cln->GetZ())*(zn-cln->GetZ()));
3431             if (dist<maxdist){
3432               /*
3433               erry = (dist+0.3)*cln->GetSigmaY2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));         
3434               errz = (dist+0.3)*cln->GetSigmaZ2()/TMath::Sqrt(cln->GetQ())*(1.+1./(ddrow));
3435               if (cln->IsUsed(10)) {
3436                 //      printf("used\n");
3437                 sumused++;
3438                 erry*=2;
3439                 errz*=2;
3440               }
3441               */
3442               erry=0.1;
3443               errz=0.1;
3444               polytrack.AddPoint(xn,cln->GetY(),cln->GetZ(),erry, errz);
3445               nfound++;
3446             }
3447           }
3448         }
3449         if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound) || (nfound<0.6*nfoundable))  break;     
3450         polytrack.UpdateParameters();
3451       }           
3452     }
3453     if ( (sumused>3) || (sumused>0.5*nfound))  {
3454       //printf("sumused   %d\n",sumused);
3455       continue;
3456     }
3457     nin1++;
3458     Double_t dy,dz;
3459     polytrack.GetFitDerivation(kr0.GetX(),dy,dz);
3460     AliTPCpolyTrack track2;
3461     
3462     polytrack.Refit(track2,0.5+TMath::Abs(dy)*0.3,0.4+TMath::Abs(dz)*0.3);
3463     if (track2.GetN()<0.5*nfoundable) continue;
3464     nin2++;
3465
3466     if ((nfound>0.6*nfoundable) &&( nfoundable>0.4*(i1-i2))) {
3467       //
3468       // test seed with and without constrain
3469       for (Int_t constrain=0; constrain<=0;constrain++){
3470         // add polytrack candidate
3471
3472         Double_t x[5], c[15];
3473         Double_t x1,x2,x3,y1,y2,y3,z1,z2,z3;
3474         track2.GetBoundaries(x3,x1);    
3475         x2 = (x1+x3)/2.;
3476         track2.GetFitPoint(x1,y1,z1);
3477         track2.GetFitPoint(x2,y2,z2);
3478         track2.GetFitPoint(x3,y3,z3);
3479         //
3480         //is track pointing to the vertex ?
3481         Double_t x0,y0,z0;
3482         x0=0;
3483         polytrack.GetFitPoint(x0,y0,z0);
3484
3485         if (constrain) {
3486           x2 = x3;
3487           y2 = y3;
3488           z2 = z3;
3489           
3490           x3 = 0;
3491           y3 = 0;
3492           z3 = 0;
3493         }
3494         x[0]=y1;
3495         x[1]=z1;
3496         x[4]=F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3497                 
3498         //      if (TMath::Abs(x[4]) >= cuts[0]) continue;  //
3499         x[2]=F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
3500         
3501         //if (TMath::Abs(x[4]*x1-x[2]) >= cuts[1]) continue;
3502         //x[3]=F3(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
3503         x[3]=F3n(x1,y1,x3,y3,z1,z3,x[4]);
3504         //if (TMath::Abs(x[3]) > cuts[3]) continue;
3505
3506         
3507         Double_t sy =0.1, sz =0.1;
3508         Double_t sy1=0.02, sz1=0.02;
3509         Double_t sy2=0.02, sz2=0.02;
3510         Double_t sy3=0.02;
3511
3512         if (constrain){
3513           sy3=25000*x[4]*x[4]+0.1, sy=0.1, sz=0.1;
3514         }
3515         
3516         Double_t f40=(F1(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[4])/sy;
3517         Double_t f42=(F1(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[4])/sy;
3518         Double_t f43=(F1(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[4])/sy;
3519         Double_t f20=(F2(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
3520         Double_t f22=(F2(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
3521         Double_t f23=(F2(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
3522
3523         Double_t f30=(F3(x1,y1+sy,x3,y3,z1,z3)-x[3])/sy;
3524         Double_t f31=(F3(x1,y1,x3,y3,z1+sz,z3)-x[3])/sz;
3525         Double_t f32=(F3(x1,y1,x3,y3+sy,z1,z3)-x[3])/sy;
3526         Double_t f34=(F3(x1,y1,x3,y3,z1,z3+sz)-x[3])/sz;
3527
3528         
3529         c[0]=sy1;
3530         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3531         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3532         c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3533         c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3534         c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3535         c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3536         c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3537         
3538         //Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x1);
3539         Int_t row1 = GetRowNumber(x1);
3540
3541         UInt_t index=0;
3542         //kr0.GetIndex(is);
3543         AliTPCseed *track=new (seed) AliTPCseed(index, x, c, x1, sec*alpha+shift);
3544         track->fIsSeeding = kTRUE;
3545         Int_t rc=FollowProlongation(*track, i2);        
3546         if (constrain) track->fBConstrain =1;
3547         else
3548           track->fBConstrain =0;
3549         track->fLastPoint = row1+fInnerSec->GetNRows();  // first cluster in track position
3550         track->fFirstPoint = track->fLastPoint;
3551
3552         if (rc==0 || track->GetNumberOfClusters()<(i1-i2)*0.5 || 
3553             track->GetNumberOfClusters() < track->fNFoundable*0.6 || 
3554             track->fNShared>0.4*track->GetNumberOfClusters()) {
3555           //delete track;
3556           seed->Reset();
3557           seed->~AliTPCseed();
3558         }
3559         else {
3560           arr->AddLast(track);
3561           seed = new AliTPCseed;
3562         }
3563         nin3++;
3564       }
3565     }  // if accepted seed
3566   }
3567   if (fDebug>3){
3568     Info("MakeSeeds2","\nSeeding statiistic:\t%d\t%d\t%d\t%d",nin0,nin1,nin2,nin3);
3569   }
3570   delete seed;
3571 }
3572
3573
3574 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::MakeSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3575 {
3576   //
3577   //
3578   //reseed using track points
3579   Int_t p0 = int(r0*track->GetNumberOfClusters());     // point 0 
3580   Int_t p1 = int(r1*track->GetNumberOfClusters());
3581   Int_t p2 = int(r2*track->GetNumberOfClusters());   // last point
3582   Int_t pp2=0;
3583   Double_t  x0[3],x1[3],x2[3];
3584   for (Int_t i=0;i<3;i++){
3585     x0[i]=-1;
3586     x1[i]=-1;
3587     x2[i]=-1;
3588   }
3589
3590   // find track position at given ratio of the length
3591   Int_t  sec0=0, sec1=0, sec2=0;
3592   Int_t index=-1;
3593   Int_t clindex;
3594   for (Int_t i=0;i<160;i++){
3595     if (track->fClusterPointer[i]){
3596       index++;
3597       AliTPCTrackerPoint   *trpoint =track->GetTrackPoint(i);
3598       if ( (index<p0) || x0[0]<0 ){
3599         if (trpoint->GetX()>1){
3600           clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3601           if (clindex>0){       
3602             x0[0] = trpoint->GetX();
3603             x0[1] = trpoint->GetY();
3604             x0[2] = trpoint->GetZ();
3605             sec0  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3606           }
3607         }
3608       }
3609
3610       if ( (index<p1) &&(trpoint->GetX()>1)){
3611         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3612         if (clindex>0){
3613           x1[0] = trpoint->GetX();
3614           x1[1] = trpoint->GetY();
3615           x1[2] = trpoint->GetZ();
3616           sec1  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3617         }
3618       }
3619       if ( (index<p2) &&(trpoint->GetX()>1)){
3620         clindex = track->GetClusterIndex2(i);
3621         if (clindex>0){
3622           x2[0] = trpoint->GetX();
3623           x2[1] = trpoint->GetY();
3624           x2[2] = trpoint->GetZ(); 
3625           sec2  = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3626           pp2 = i;
3627         }
3628       }
3629     }
3630   }
3631   
3632   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3633   //
3634   alpha = (sec1-sec2)*fSectors->GetAlpha();
3635   cs = TMath::Cos(alpha);
3636   sn = TMath::Sin(alpha); 
3637   xx2= x1[0]*cs-x1[1]*sn;
3638   yy2= x1[0]*sn+x1[1]*cs;
3639   x1[0] = xx2;
3640   x1[1] = yy2;
3641   //
3642   alpha = (sec0-sec2)*fSectors->GetAlpha();
3643   cs = TMath::Cos(alpha);
3644   sn = TMath::Sin(alpha); 
3645   xx2= x0[0]*cs-x0[1]*sn;
3646   yy2= x0[0]*sn+x0[1]*cs;
3647   x0[0] = xx2;
3648   x0[1] = yy2;
3649   //
3650   //
3651   //
3652   Double_t x[5],c[15];
3653   //
3654   x[0]=x2[1];
3655   x[1]=x2[2];
3656   x[4]=F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]);
3657   //  if (x[4]>1) return 0;
3658   x[2]=F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]);
3659   x[3]=F3n(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2],x0[2],x[4]);
3660   //if (TMath::Abs(x[3]) > 2.2)  return 0;
3661   //if (TMath::Abs(x[2]) > 1.99) return 0;
3662   //  
3663   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3664   //
3665   Double_t sy1=0.02+track->GetSigmaY2(), sz1=0.02+track->GetSigmaZ2();
3666   Double_t sy2=0.01+track->GetSigmaY2(), sz2=0.01+track->GetSigmaZ2();
3667   Double_t sy3=0.01+track->GetSigmaY2();
3668   //
3669   Double_t f40=(F1(x2[0],x2[1]+sy,x1[0],x1[1],x0[0],x0[1])-x[4])/sy;
3670   Double_t f42=(F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1]+sy,x0[0],x0[1])-x[4])/sy;
3671   Double_t f43=(F1(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]+sy)-x[4])/sy;
3672   Double_t f20=(F2(x2[0],x2[1]+sy,x1[0],x1[1],x0[0],x0[1])-x[2])/sy;
3673   Double_t f22=(F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1]+sy,x0[0],x0[1])-x[2])/sy;
3674   Double_t f23=(F2(x2[0],x2[1],x1[0],x1[1],x0[0],x0[1]+sy)-x[2])/sy;
3675   //
3676   Double_t f30=(F3(x2[0],x2[1]+sy,x0[0],x0[1],x2[2],x0[2])-x[3])/sy;
3677   Double_t f31=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2]+sz,x0[2])-x[3])/sz;
3678   Double_t f32=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1]+sy,x2[2],x0[2])-x[3])/sy;
3679   Double_t f34=(F3(x2[0],x2[1],x0[0],x0[1],x2[2],x0[2]+sz)-x[3])/sz;
3680   
3681   
3682   c[0]=sy1;
3683   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3684   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3685   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3686   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3687   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3688   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3689   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3690   
3691   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(x2[0]);
3692   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, x2[0], sec2*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3693   //  Double_t y0,z0,y1,z1, y2,z2;
3694   //seed->GetProlongation(x0[0],y0,z0);
3695   // seed->GetProlongation(x1[0],y1,z1);
3696   //seed->GetProlongation(x2[0],y2,z2);
3697   //  seed =0;
3698   seed->fLastPoint  = pp2;
3699   seed->fFirstPoint = pp2;
3700   
3701
3702   return seed;
3703 }
3704
3705
3706 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::ReSeed(AliTPCseed *track, Float_t r0, Float_t r1, Float_t r2)
3707 {
3708   //
3709   //
3710   //reseed using founded clusters 
3711   //
3712   // Find the number of clusters
3713   Int_t nclusters = 0;
3714   for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){
3715     if (track->GetClusterIndex(irow)>0) nclusters++;
3716   }
3717   //
3718   Int_t ipos[3];
3719   ipos[0] = TMath::Max(int(r0*nclusters),0);             // point 0 cluster
3720   ipos[1] = TMath::Min(int(r1*nclusters),nclusters-1);   // 
3721   ipos[2] = TMath::Min(int(r2*nclusters),nclusters-1);   // last point
3722   //
3723   //
3724   Double_t  xyz[3][3];
3725   Int_t     row[3],sec[3]={0,0,0};
3726   //
3727   // find track row position at given ratio of the length
3728   Int_t index=-1;
3729   for (Int_t irow=0;irow<160;irow++){    
3730     if (track->GetClusterIndex2(irow)<0) continue;
3731     index++;
3732     for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3733       if (index<=ipos[ipoint]) row[ipoint] = irow;
3734     }        
3735   }
3736   //
3737   //Get cluster and sector position
3738   for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3739     Int_t clindex = track->GetClusterIndex2(row[ipoint]);
3740     AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3741     if (cl==0) {
3742       //Error("Bug\n");
3743       //      AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3744       return 0;
3745     }
3746     sec[ipoint]     = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3747     xyz[ipoint][0]  = GetXrow(row[ipoint]);
3748     xyz[ipoint][1]  = cl->GetY();
3749     xyz[ipoint][2]  = cl->GetZ();
3750   }
3751   //
3752   //
3753   // Calculate seed state vector and covariance matrix
3754
3755   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3756   //
3757   alpha = (sec[1]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3758   cs = TMath::Cos(alpha);
3759   sn = TMath::Sin(alpha); 
3760   xx2= xyz[1][0]*cs-xyz[1][1]*sn;
3761   yy2= xyz[1][0]*sn+xyz[1][1]*cs;
3762   xyz[1][0] = xx2;
3763   xyz[1][1] = yy2;
3764   //
3765   alpha = (sec[0]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3766   cs = TMath::Cos(alpha);
3767   sn = TMath::Sin(alpha); 
3768   xx2= xyz[0][0]*cs-xyz[0][1]*sn;
3769   yy2= xyz[0][0]*sn+xyz[0][1]*cs;
3770   xyz[0][0] = xx2;
3771   xyz[0][1] = yy2;
3772   //
3773   //
3774   //
3775   Double_t x[5],c[15];
3776   //
3777   x[0]=xyz[2][1];
3778   x[1]=xyz[2][2];
3779   x[4]=F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3780   x[2]=F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3781   x[3]=F3n(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2],x[4]);
3782   //  
3783   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3784   //
3785   Double_t sy1=0.2, sz1=0.2;
3786   Double_t sy2=0.2, sz2=0.2;
3787   Double_t sy3=0.2;
3788   //
3789   Double_t f40=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3790   Double_t f42=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3791   Double_t f43=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[4])/sy;
3792   Double_t f20=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3793   Double_t f22=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3794   Double_t f23=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[2])/sy;
3795   //
3796   Double_t f30=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3797   Double_t f31=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2]+sz,xyz[0][2])-x[3])/sz;
3798   Double_t f32=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy,xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3799   Double_t f34=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2]+sz)-x[3])/sz;
3800   
3801   
3802   c[0]=sy1;
3803   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3804   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3805   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3806   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3807   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3808   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3809   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3810   
3811   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(xyz[2][0]);
3812   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, xyz[2][0], sec[2]*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3813   seed->fLastPoint  = row[2];
3814   seed->fFirstPoint = row[2];  
3815   return seed;
3816 }
3817
3818
3819 AliTPCseed *AliTPCtrackerMI::ReSeed(AliTPCseed *track,Int_t r0, Bool_t forward)
3820 {
3821   //
3822   //
3823   //reseed using founded clusters 
3824   //
3825   Double_t  xyz[3][3];
3826   Int_t     row[3]={0,0,0};
3827   Int_t     sec[3]={0,0,0};
3828   //
3829   // forward direction
3830   if (forward){
3831     for (Int_t irow=r0;irow<160;irow++){
3832       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3833         row[0] = irow;
3834         break;
3835       }
3836     }
3837     for (Int_t irow=160;irow>r0;irow--){
3838       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3839         row[2] = irow;
3840         break;
3841       }
3842     }
3843     for (Int_t irow=row[2]-15;irow>row[0];irow--){
3844       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3845         row[1] = irow;
3846         break;
3847       }
3848     }
3849     //
3850   }
3851   if (!forward){
3852     for (Int_t irow=0;irow<r0;irow++){
3853       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3854         row[0] = irow;
3855         break;
3856       }
3857     }
3858     for (Int_t irow=r0;irow>0;irow--){
3859       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3860         row[2] = irow;
3861         break;
3862       }
3863     }    
3864     for (Int_t irow=row[2]-15;irow>row[0];irow--){
3865       if (track->GetClusterIndex(irow)>0){
3866         row[1] = irow;
3867         break;
3868       }
3869     } 
3870   }
3871   //
3872   if ((row[2]-row[0])<20) return 0;
3873   if (row[1]==0) return 0;
3874   //
3875   //
3876   //Get cluster and sector position
3877   for (Int_t ipoint=0;ipoint<3;ipoint++){
3878     Int_t clindex = track->GetClusterIndex2(row[ipoint]);
3879     AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3880     if (cl==0) {
3881       //Error("Bug\n");
3882       //      AliTPCclusterMI * cl = GetClusterMI(clindex);
3883       return 0;
3884     }
3885     sec[ipoint]     = ((clindex&0xff000000)>>24)%18;
3886     xyz[ipoint][0]  = GetXrow(row[ipoint]);
3887     AliTPCTrackerPoint * point = track->GetTrackPoint(row[ipoint]);    
3888     if (point&&ipoint<2){
3889       //
3890        xyz[ipoint][1]  = point->GetY();
3891        xyz[ipoint][2]  = point->GetZ();
3892     }
3893     else{
3894       xyz[ipoint][1]  = cl->GetY();
3895       xyz[ipoint][2]  = cl->GetZ();
3896     }
3897   }
3898   //
3899   //
3900   //
3901   //
3902   // Calculate seed state vector and covariance matrix
3903
3904   Double_t alpha, cs,sn, xx2,yy2;
3905   //
3906   alpha = (sec[1]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3907   cs = TMath::Cos(alpha);
3908   sn = TMath::Sin(alpha); 
3909   xx2= xyz[1][0]*cs-xyz[1][1]*sn;
3910   yy2= xyz[1][0]*sn+xyz[1][1]*cs;
3911   xyz[1][0] = xx2;
3912   xyz[1][1] = yy2;
3913   //
3914   alpha = (sec[0]-sec[2])*fSectors->GetAlpha();
3915   cs = TMath::Cos(alpha);
3916   sn = TMath::Sin(alpha); 
3917   xx2= xyz[0][0]*cs-xyz[0][1]*sn;
3918   yy2= xyz[0][0]*sn+xyz[0][1]*cs;
3919   xyz[0][0] = xx2;
3920   xyz[0][1] = yy2;
3921   //
3922   //
3923   //
3924   Double_t x[5],c[15];
3925   //
3926   x[0]=xyz[2][1];
3927   x[1]=xyz[2][2];
3928   x[4]=F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3929   x[2]=F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]);
3930   x[3]=F3n(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2],x[4]);
3931   //  
3932   Double_t sy =0.1,  sz =0.1;
3933   //
3934   Double_t sy1=0.2, sz1=0.2;
3935   Double_t sy2=0.2, sz2=0.2;
3936   Double_t sy3=0.2;
3937   //
3938   Double_t f40=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3939   Double_t f42=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[4])/sy;
3940   Double_t f43=(F1(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[4])/sy;
3941   Double_t f20=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3942   Double_t f22=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1])-x[2])/sy;
3943   Double_t f23=(F2(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[1][0],xyz[1][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy)-x[2])/sy;
3944   //
3945   Double_t f30=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1]+sy,xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3946   Double_t f31=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2]+sz,xyz[0][2])-x[3])/sz;
3947   Double_t f32=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1]+sy,xyz[2][2],xyz[0][2])-x[3])/sy;
3948   Double_t f34=(F3(xyz[2][0],xyz[2][1],xyz[0][0],xyz[0][1],xyz[2][2],xyz[0][2]+sz)-x[3])/sz;
3949   
3950   
3951   c[0]=sy1;
3952   c[1]=0.;       c[2]=sz1;
3953   c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f23*sy3*f23;
3954   c[6]=f30*sy1;  c[7]=f31*sz1;  c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22;
3955   c[9]=f30*sy1*f30+f31*sz1*f31+f32*sy2*f32+f34*sz2*f34;
3956   c[10]=f40*sy1; c[11]=0.; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22+f43*sy3*f23;
3957   c[13]=f30*sy1*f40+f32*sy2*f42;
3958   c[14]=f40*sy1*f40+f42*sy2*f42+f43*sy3*f43;
3959   
3960   //  Int_t row1 = fSectors->GetRowNumber(xyz[2][0]);
3961   AliTPCseed *seed=new  AliTPCseed(0, x, c, xyz[2][0], sec[2]*fSectors->GetAlpha()+fSectors->GetAlphaShift());
3962   seed->fLastPoint  = row[2];
3963   seed->fFirstPoint = row[2];  
3964   for (Int_t i=row[0];i<row[2];i++){
3965     seed->fIndex[i] = track->fIndex[i];
3966   }
3967
3968   return seed;
3969 }
3970
3971 void  AliTPCtrackerMI::FindKinks(TObjArray * array, AliESD *esd)
3972 {
3973   //
3974   //  find kinks
3975   //
3976   //
3977
3978   TObjArray *kinks= new TObjArray(10000);
3979   //  TObjArray *v0s= new TObjArray(10000);
3980   Int_t nentries = array->GetEntriesFast();
3981   AliHelix *helixes      = new AliHelix[nentries];
3982   Int_t    *sign         = new Int_t[nentries];
3983   Int_t    *nclusters    = new Int_t[nentries];
3984   Float_t  *alpha        = new Float_t[nentries];
3985   AliESDkink * kink      = new AliESDkink();
3986   Int_t      * usage     = new Int_t[nentries];
3987   Float_t  *zm           = new Float_t[nentries];
3988   Float_t  *z0           = new Float_t[nentries]; 
3989   Float_t  *fim          = new Float_t[nentries];
3990   Float_t  *shared       = new Float_t[nentries];
3991   Bool_t   *circular     = new Bool_t[nentries];
3992   Float_t *dca          = new Float_t[nentries];
3993   //const AliESDVertex * primvertex = esd->GetVertex();
3994   //
3995   //  nentries = array->GetEntriesFast();
3996   //
3997   
3998   //
3999   //
4000   for (Int_t i=0;i<nentries;i++){
4001     sign[i]=0;
4002     usage[i]=0;
4003     AliTPCseed* track = (AliTPCseed*)array->At(i);    
4004     if (!track) continue;
4005     track->fCircular =0;
4006     shared[i] = kFALSE;
4007     track->UpdatePoints();
4008     if (( track->GetPoints()[2]- track->GetPoints()[0])>5 && track->GetPoints()[3]>0.8){
4009     }
4010     nclusters[i]=track->GetNumberOfClusters();
4011     alpha[i] = track->GetAlpha();
4012     new (&helixes[i]) AliHelix(*track);
4013     Double_t xyz[3];
4014     helixes[i].Evaluate(0,xyz);
4015     sign[i] = (track->GetC()>0) ? -1:1;
4016     Double_t x,y,z;
4017     x=160;
4018     if (track->GetProlongation(x,y,z)){
4019       zm[i]  = z;
4020       fim[i] = alpha[i]+TMath::ATan2(y,x);
4021     }
4022     else{
4023       zm[i]  = track->GetZ();
4024       fim[i] = alpha[i];
4025     }   
4026     z0[i]=1000;
4027     circular[i]= kFALSE;
4028     if (track->GetProlongation(0,y,z))  z0[i] = z;
4029     dca[i] = track->GetD(0,0);    
4030   }
4031   //
4032   //
4033   TStopwatch timer;
4034   timer.Start();
4035   Int_t ncandidates =0;
4036   Int_t nall =0;
4037   Int_t ntracks=0; 
4038   Double_t phase[2][2],radius[2];
4039
4040   //
4041   // Find circling track
4042   TTreeSRedirector &cstream = *fDebugStreamer;
4043   //
4044   for (Int_t i0=0;i0<nentries;i0++){
4045     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i0);
4046     if (!track0) continue;    
4047     if (track0->fN<40) continue;
4048     if (TMath::Abs(1./track0->fP4)>200) continue;
4049     for (Int_t i1=i0+1;i1<nentries;i1++){
4050       AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(i1);
4051       if (!track1) continue;
4052       if (track1->fN<40)                  continue;
4053       if ( TMath::Abs(track1->fP3+track0->fP3)>0.1) continue;
4054       if (track0->fBConstrain&&track1->fBConstrain) continue;
4055       if (TMath::Abs(1./track1->fP4)>200) continue;
4056       if (track1->fP4*track0->fP4>0)      continue;
4057       if (track1->fP3*track0->fP3>0)      continue;
4058       if (max(TMath::Abs(1./track0->fP4),TMath::Abs(1./track1->fP4))>190) continue;
4059       if (track0->fBConstrain&&TMath::Abs(track1->fP4)<TMath::Abs(track0->fP4)) continue; //returning - lower momenta
4060       if (track1->fBConstrain&&TMath::Abs(track0->fP4)<TMath::Abs(track1->fP4)) continue; //returning - lower momenta
4061       //
4062       Float_t mindcar = TMath::Min(TMath::Abs(dca[i0]),TMath::Abs(dca[i1]));
4063       if (mindcar<5)   continue;
4064       Float_t mindcaz = TMath::Min(TMath::Abs(z0[i0]-GetZ()),TMath::Abs(z0[i1]-GetZ()));
4065       if (mindcaz<5) continue;
4066       if (mindcar+mindcaz<20) continue;
4067       //
4068       //
4069       Float_t xc0 = helixes[i0].GetHelix(6);
4070       Float_t yc0 = helixes[i0].GetHelix(7);
4071       Float_t r0  = helixes[i0].GetHelix(8);
4072       Float_t xc1 = helixes[i1].GetHelix(6);
4073       Float_t yc1 = helixes[i1].GetHelix(7);
4074       Float_t r1  = helixes[i1].GetHelix(8);
4075         
4076       Float_t rmean = (r0+r1)*0.5;
4077       Float_t delta =TMath::Sqrt((xc1-xc0)*(xc1-xc0)+(yc1-yc0)*(yc1-yc0));
4078       //if (delta>30) continue;
4079       if (delta>rmean*0.25) continue;
4080       if (TMath::Abs(r0-r1)/rmean>0.3) continue; 
4081       //
4082       Int_t npoints = helixes[i0].GetRPHIintersections(helixes[i1], phase, radius,10);
4083       if (npoints==0) continue;
4084       helixes[i0].GetClosestPhases(helixes[i1], phase);
4085       //
4086       Double_t xyz0[3];
4087       Double_t xyz1[3];
4088       Double_t hangles[3];
4089       helixes[i0].Evaluate(phase[0][0],xyz0);
4090       helixes[i1].Evaluate(phase[0][1],xyz1);
4091
4092       helixes[i0].GetAngle(phase[0][0],helixes[i1],phase[0][1],hangles);
4093       Double_t deltah[2],deltabest;
4094       if (hangles[2]<2.8) continue;
4095       /*
4096       cstream<<"C"<<track0->fLab<<track1->fLab<<
4097         track0->fP3<<track1->fP3<<
4098         track0->fP4<<track1->fP4<<
4099         delta<<rmean<<npoints<<
4100         hangles[0]<<hangles[2]<<
4101         xyz0[2]<<xyz1[2]<<radius[0]<<"\n"; 
4102       */
4103       if (npoints>0){
4104         Int_t ibest=0;
4105         helixes[i0].ParabolicDCA(helixes[i1],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],deltah[0],2);
4106         if (npoints==2){
4107           helixes[i0].ParabolicDCA(helixes[i1],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],deltah[1],2);
4108           if (deltah[1]<deltah[0]) ibest=1;
4109         }
4110         deltabest  = TMath::Sqrt(deltah[ibest]);
4111         helixes[i0].Evaluate(phase[ibest][0],xyz0);
4112         helixes[i1].Evaluate(phase[ibest][1],xyz1);
4113         helixes[i0].GetAngle(phase[ibest][0],helixes[i1],phase[ibest][1],hangles);
4114         Double_t radiusbest = TMath::Sqrt(radius[ibest]);
4115         //
4116         if (deltabest>6) continue;
4117         if (mindcar+mindcaz<40 && (hangles[2]<3.12||deltabest>3)) continue;
4118         Bool_t sign =kFALSE;
4119         if (hangles[2]>3.06) sign =kTRUE;
4120         //
4121         if (sign){
4122           circular[i0] = kTRUE;
4123           circular[i1] = kTRUE;
4124           if (TMath::Abs(track0->fP4)<TMath::Abs(track1->fP4)){
4125             track0->fCircular += 1;
4126             track1->fCircular += 2;
4127           }
4128           else{
4129             track1->fCircular += 1;
4130             track0->fCircular += 2;
4131           }
4132         }               
4133         if (sign&&AliTPCReconstructor::StreamLevel()>1){          
4134           //debug stream          
4135           cstream<<"Curling"<<
4136             "lab0="<<track0->fLab<<
4137             "lab1="<<track1->fLab<<   
4138             "Tr0.="<<track0<<
4139             "Tr1.="<<track1<<      
4140             "dca0="<<dca[i0]<<
4141             "dca1="<<dca[i1]<<
4142             "mindcar="<<mindcar<<
4143             "mindcaz="<<mindcaz<<
4144             "delta="<<delta<<
4145             "rmean="<<rmean<<
4146             "npoints="<<npoints<<                      
4147             "hangles0="<<hangles[0]<<
4148             "hangles2="<<hangles[2]<<                    
4149             "xyz0="<<xyz0[2]<<
4150             "xyzz1="<<xyz1[2]<<
4151             "z0="<<z0[i0]<<
4152             "z1="<<z0[i1]<<
4153             "radius="<<radiusbest<<
4154             "deltabest="<<deltabest<< 
4155             "phase0="<<phase[ibest][0]<<
4156             "phase1="<<phase[ibest][1]<<
4157             "\n";                 
4158         }
4159       }
4160     }
4161   }
4162   //
4163   //  Finf kinks loop
4164   // 
4165   //
4166   for (Int_t i =0;i<nentries;i++){
4167     if (sign[i]==0) continue;
4168     AliTPCseed * track0 = (AliTPCseed*)array->At(i);
4169     ntracks++;
4170     //
4171     Double_t cradius0 = 40*40;
4172     Double_t cradius1 = 270*270;
4173     Double_t cdist1=8.;
4174     Double_t cdist2=8.;
4175     Double_t cdist3=0.55; 
4176     for (Int_t j =i+1;j<nentries;j++){
4177       nall++;
4178       if (sign[j]*sign[i]<1) continue;
4179       if ( (nclusters[i]+nclusters[j])>200) continue;
4180       if ( (nclusters[i]+nclusters[j])<80) continue;
4181       if ( TMath::Abs(zm[i]-zm[j])>60.) continue;
4182       if ( TMath::Abs(fim[i]-fim[j])>0.6 && TMath::Abs(fim[i]-fim[j])<5.7 ) continue;
4183       //AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(j);  Double_t phase[2][2],radius[2];    
4184       Int_t npoints = helixes[i].GetRPHIintersections(helixes[j], phase, radius,20);
4185       if (npoints<1) continue;
4186       // cuts on radius      
4187       if (npoints==1){
4188         if (radius[0]<cradius0||radius[0]>cradius1) continue;
4189       }
4190       else{
4191         if ( (radius[0]<cradius0||radius[0]>cradius1) && (radius[1]<cradius0||radius[1]>cradius1) ) continue;
4192       }
4193       //      
4194       Double_t delta1=10000,delta2=10000;
4195       // cuts on the intersection radius
4196       helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
4197       if (radius[0]<20&&delta1<1) continue; //intersection at vertex
4198       if (radius[0]<10&&delta1<3) continue; //intersection at vertex
4199       if (npoints==2){ 
4200         helixes[i].LinearDCA(helixes[j],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);
4201         if (radius[1]<20&&delta2<1) continue;  //intersection at vertex
4202         if (radius[1]<10&&delta2<3) continue;  //intersection at vertex 
4203       }
4204       //
4205       Double_t distance1 = TMath::Min(delta1,delta2);
4206       if (distance1>cdist1) continue;  // cut on DCA linear approximation
4207       //
4208       npoints = helixes[i].GetRPHIintersections(helixes[j], phase, radius,20);
4209       helixes[i].ParabolicDCA(helixes[j],phase[0][0],phase[0][1],radius[0],delta1);
4210       if (radius[0]<20&&delta1<1) continue; //intersection at vertex
4211       if (radius[0]<10&&delta1<3) continue; //intersection at vertex
4212       //
4213       if (npoints==2){ 
4214         helixes[i].ParabolicDCA(helixes[j],phase[1][0],phase[1][1],radius[1],delta2);   
4215         if (radius[1]<20&&delta2<1) continue;  //intersection at vertex
4216         if (radius[1]<10&&delta2<3) continue;  //intersection at vertex 
4217       }            
4218       distance1 = TMath::Min(delta1,delta2);
4219       Float_t rkink =0;
4220       if (delta1<delta2){
4221         rkink = TMath::Sqrt(radius[0]);
4222       }
4223       else{
4224         rkink = TMath::Sqrt(radius[1]);
4225       }
4226       if (distance1>cdist2) continue;
4227       //
4228       //
4229       AliTPCseed * track1 = (AliTPCseed*)array->At(j);
4230       //
4231       //
4232       Int_t row0 = GetRowNumber(rkink); 
4233       if (row0<10)  continue;
4234       if (row0>150) continue;
4235       //
4236       //
4237       Float_t dens00=-1,dens01=-1;
4238       Float_t dens10=-1,dens11=-1;
4239       //
4240       Int_t found,foundable,shared;