TPC/TPCPEDESTALda.cxx

   1 /*
   2 TPC DA for online calibration
   3
   4 Contact: Haavard.Helstrup@cern.ch
   5 Link:
   6 Run Type: PEDESTAL
   7 DA Type: LDC
   8 Number of events needed: 100
   9 Input Files:
  10 Output Files: tpcPedestal.root, to be exported to the DAQ FXS
  11 fileId:   pedestals
  12 Trigger types used: CALIBRATION_EVENT
  13
  14 */
  15
  16 /*
  17
  18 TPCda_pedestal.cxx - calibration algorithm for TPC pedestal runs
  19
  20 10/06/2007  sylvain.chapeland@cern.ch :  first version - clean skeleton based on DAQ DA case1
  21 19/10/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Possibility to write output to ASCII file
  22 24/10/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Including pedestal calibration for time bins
  23 23/11/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Fix in order to avoid streamer problems in case of
  24                                           invalid ROOTSTYS. The famous magic line provided by Rene.
  25 28/11/2007  christian.lippmann@cern.ch :  TPC mapping file is read from DaqDetDB
  26 18/09/2008  christian.lippmann@cern.ch :  Noisy channels are output to ASCII file. Use max noise in ALTRO.
  27 19/09/2008  J.Wiechula@gsi.de:            Added export of the calibration data to the AMORE data base.
  28                                           Added support for configuration files.
  29 31/01/2011  Christian.Lippmann@cern.ch :  Updates for changed setup at P2 with 2 LDCs per sector
  30
  31 contact: marian.ivanov@cern.ch
  32
  33 This process reads RAW data from the files provided as command line arguments
  34 and save results in a file (named from RESULT_FILE define - see below).
  35
  36 */
  37
  38 #define RESULT_FILE  "tpcPedestal.root"
  39 #define FILE_ID "pedestals"
  40 #define MAPPING_FILE "tpcMapping.root"
  41 #define CONFIG_FILE "TPCPEDESTALda.conf"
  42 #define PED_FILE "tpcPedestals.data"
  43 #define NOISE_FILE "tpcNoise.data"
  44 #define PEDMEM_FILE "tpcPedestalMem.data"
  45 #define NOISY_FILE "tpcNoisyChannels.data"
  46 #define VERYNOISY_FILE "tpcVeryNoisyChannels.data"
  47 #define DEAD_FILE "tpcDeadChannels.data"
  48 #define AliDebugLevel() -1
  49
  50 extern "C" {
  51 #include <daqDA.h>
  52 }
  53 #include "event.h"
  54 #include "monitor.h"
  55
  56 #include "stdio.h"
  57 #include "stdlib.h"
  58 #include <fstream>
  59
  60 //
  61 //Root includes
  62 //
  63 #include "TFile.h"
  64 #include "TArrayF.h"
  65 #include "TROOT.h"
  66 #include "TPluginManager.h"
  67 #include "TSystem.h"
  68 #include "TString.h"
  69 #include "TObjString.h"
  70 #include "TDatime.h"
  71 //
  72 //AliRoot includes
  73 //
  74 #include "AliRawReader.h"
  75 #include "AliRawReaderDate.h"
  76 #include "AliTPCmapper.h"
  77 #include "AliTPCROC.h"
  78 #include "AliTPCCalROC.h"
  79 #include "AliTPCCalPad.h"
  80 #include "AliMathBase.h"
  81 #include "TTreeStream.h"
  82 #include "AliLog.h"
  83 #include "AliTPCConfigDA.h"
  84
  85 //
  86 //AMORE
  87 //
  88 #include <AmoreDA.h>
  89
  90 //
  91 // TPC calibration algorithm includes
  92 //
  93 #include "AliTPCCalibPedestal.h"
  94
  95 /*
  96   Main routine, TPC pedestal detector algorithm to be run on TPC LDC
  97   Arguments: list of DATE raw data files
  98 */
  99
 100 int main(int argc, char **argv) {
 101   //
 102   // Main for TPC pedestal detector algorithm
 103   //
 104   /* log start of process */
 105   printf("TPC DA started - %s\n",__FILE__);
 106
 107   if (argc<2) {
 108     printf("Wrong number of arguments\n");
 109     return -1;
 110   }
 111
 112   TString daterolename(gSystem->Getenv("DATE_ROLE_NAME"));
 113   if ( daterolename == "" ) {
 114     printf("Error: Variable DATE_ROLE_NAME not defined! Exiting ...\n");
 115     return -1;
 116   }
 117   bool inner;
 118   if      ( daterolename.EndsWith("-0") ) inner = true;
 119   else if ( daterolename.EndsWith("-1") ) inner = false;
 120   else {
 121     printf("Error: Variable DATE_ROLE_NAME neither ends with -0 nor -1 (E.g. ldc-TPC-C12-1)! Exiting ...\n");
 122     return -1;
 123   }
 124
 125   AliLog::SetClassDebugLevel("AliRawReaderDate",-5);
 126   AliLog::SetClassDebugLevel("AliTPCAltroMapping",-5);
 127   AliLog::SetModuleDebugLevel("RAW",-5);
 128
 129   /* magic line */
 130   gROOT->GetPluginManager()->AddHandler("TVirtualStreamerInfo",
 131                                         "*",
 132                                         "TStreamerInfo",
 133                                         "RIO",
 134                                         "TStreamerInfo()");
 135
 136   /* declare monitoring program */
 137   int i, status;
 138   status=monitorDeclareMp( __FILE__ );
 139   if (status!=0) {
 140     printf("monitorDeclareMp() failed : %s\n",monitorDecodeError(status));
 141     return -1;
 142   }
 143
 144   // variables
 145   AliTPCmapper *mapping = 0;   // The TPC mapping
 146   char localfile[255];
 147   unsigned long32 runNb=0;     // run number
 148   // configuration options
 149   Bool_t timeAnalysis = kTRUE;
 150   Bool_t fastDecoding = kFALSE;
 151
 152   if (!mapping){
 153     /* copy locally the mapping file from daq detector config db */
 154     sprintf(localfile,"./%s",MAPPING_FILE);
 155     status = daqDA_DB_getFile(MAPPING_FILE,localfile);
 156     if (status) {
 157       printf("Failed to get mapping file (%s) from DAQdetDB, status=%d\n", MAPPING_FILE, status);
 158       return -1;
 159     }
 160
 161     /* open the mapping file and retrieve mapping object */
 162     TFile *fileMapping = new TFile(MAPPING_FILE, "read");
 163     mapping = (AliTPCmapper*) fileMapping->Get("tpcMapping");
 164     delete fileMapping;
 165   }
 166
 167   if (mapping == 0) {
 168     printf("Failed to get mapping object from %s.  ...\n", MAPPING_FILE);
 169     return -1;
 170   } else {
 171     printf("Got mapping object from %s\n", MAPPING_FILE);
 172   }
 173
 174   //
 175   // DA configuration from configuration file
 176   //
 177   // retrieve configuration file
 178   sprintf(localfile,"./%s",CONFIG_FILE);
 179   status = daqDA_DB_getFile(CONFIG_FILE,localfile);
 180   if (status) {
 181     printf("Failed to get configuration file (%s) from DAQdetDB, status=%d\n", CONFIG_FILE, status);
 182     return -1;
 183   }
 184   AliTPCConfigDA config(CONFIG_FILE);
 185   // check configuration
 186   Bool_t  skipAmore=kFALSE;
 187
 188   if ( (Int_t)config.GetValue("NoTimeAnalysis") == 1 ) {
 189     printf("WARNING: Time analysis was switched off in the configuration file!\n");
 190     timeAnalysis=kFALSE;
 191   }
 192
 193   if ( (Int_t)config.GetValue("UseFastDecoder") == 1 ){
 194     printf("Info: The fast decoder will be used for the processing.\n");
 195     fastDecoding=kTRUE;
 196   }
 197
 198   if ( config.GetConfigurationMap()->GetValue("SkipAmore") ) {
 199     skipAmore=((TObjString*)config.GetConfigurationMap()->GetValue("SkipAmore"))->GetString().Atoi();
 200     printf("TPCPEDESTALda: Skip Amore set in config\n");
 201   }
 202
 203
 204   // create calibration object
 205   AliTPCCalibPedestal calibPedestal(config.GetConfigurationMap()); // pedestal and noise calibration
 206   calibPedestal.SetAltroMapping(mapping->GetAltroMapping()); // Use altro mapping we got from daqDetDb
 207   calibPedestal.SetTimeAnalysis(timeAnalysis);               // pedestal(t) calibration
 208
 209   //===========================//
 210   // loop over RAW data files //
 211   //==========================//
 212   int nevents=0;
 213   for ( i=1; i<argc; i++ ) {
 214
 215     /* define data source : this is argument i */
 216     printf("Processing file %s\n", argv[i]);
 217     status=monitorSetDataSource( argv[i] );
 218     if (status!=0) {
 219       printf("monitorSetDataSource() failed. Error=%s. Exiting ...\n", monitorDecodeError(status));
 220       return -1;
 221     }
 222
 223     /* read until EOF */
 224     for ( ; ; ) {
 225       struct eventHeaderStruct *event;
 226
 227       /* check shutdown condition */
 228       if (daqDA_checkShutdown()) {break;}
 229
 230       /* get next event (blocking call until timeout) */
 231       status=monitorGetEventDynamic((void **)&event);
 232       if (status==MON_ERR_EOF) {
 233         printf ("End of File %d (%s) detected\n", i, argv[i]);
 234         break; /* end of monitoring file has been reached */
 235       }
 236
 237       if (status!=0) {
 238         printf("monitorGetEventDynamic() failed : %s\n",monitorDecodeError(status));
 239         break;
 240       }
 241
 242       /* retry if got no event */
 243       if (event==NULL)
 244         continue;
 245
 246       /* skip start/end of run events */
 247       if ( (event->eventType != physicsEvent) && (event->eventType != calibrationEvent) )
 248         continue;
 249
 250       nevents++;
 251       // get the run number
 252       runNb = event->eventRunNb;
 253       //  Pedestal calibration
 254       calibPedestal.ProcessEvent(event);
 255
 256       /* free resources */
 257       free(event);
 258     }
 259   }
 260
 261   //
 262   // Analyse pedestals and write them to rootfile
 263   //
 264   calibPedestal.Analyse();
 265   calibPedestal.AnalyseTime(nevents);
 266   printf ("%d physics/calibration events processed.\n",nevents);
 267
 268   TFile *fileTPC = new TFile(RESULT_FILE, "recreate");
 269   calibPedestal.Write("tpcCalibPedestal");
 270   delete fileTPC;
 271   printf("Wrote %s.\n",RESULT_FILE);
 272
 273   /* store the result file on FES */
 274   status=daqDA_FES_storeFile(RESULT_FILE,FILE_ID);
 275   if (status) {
 276     status = -2;
 277   }
 278   //
 279   //Send objects to the AMORE DB
 280   //
 281   if (!skipAmore){
 282     printf ("AMORE part\n");
 283     const char *amoreDANameorig=gSystem->Getenv("AMORE_DA_NAME");
 284     //cheet a little -- temporary solution (hopefully)
 285     //
 286     //currently amoreDA uses the environment variable AMORE_DA_NAME to create the mysql
 287     //table in which the calib objects are stored. This table is dropped each time AmoreDA
 288     //is initialised. This of course makes a problem if we would like to store different
 289     //calibration entries in the AMORE DB. Therefore in each DA which writes to the AMORE DB
 290     //the AMORE_DA_NAME env variable is overwritten.
 291
 292     //find processed sector
 293     Char_t sideName='A';
 294     Int_t sector = -1;
 295     for ( Int_t roc = 0; roc < 72; roc++ ) {
 296       if ( !calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc) ) continue;
 297       if (mapping->GetSideFromRoc(roc)==1) sideName='C';
 298       sector = mapping->GetSectorFromRoc(roc);
 299     }
 300   //   gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",Form("TPC-%c%02d-%s",sideName,sector,FILE_ID));
 301     gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",Form("%s-%s",gSystem->Getenv("DATE_ROLE_NAME"),FILE_ID));
 302
 303     //
 304     // end cheet
 305     if (sector>-1){
 306       TDatime time;
 307       TObjString info(Form("Run: %u; Date: %s",runNb,time.AsSQLString()));
 308
 309       amore::da::AmoreDA amoreDA(amore::da::AmoreDA::kSender);
 310       Int_t statusDA=0;
 311       statusDA+=amoreDA.Send("Pedestals",calibPedestal.GetCalPadPedestal());
 312       statusDA+=amoreDA.Send("Noise",calibPedestal.GetCalPadRMS());
 313       statusDA+=amoreDA.Send("Info",&info);
 314       if ( statusDA )
 315         printf("Warning: Failed to write one of the calib objects to the AMORE database\n");
 316     }  else {
 317       printf("Warning: No data found!\n");
 318     }
 319     // reset env var
 320     if (amoreDANameorig) gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",amoreDANameorig);
 321   }
 322
 323   //
 324   // Now prepare ASCII files for local ALTRO configuration through DDL.
 325   //
 326   ofstream pedfile;
 327   ofstream noisefile;
 328   ofstream pedmemfile;
 329   ofstream noisychannelfile;
 330   ofstream verynoisychannelfile;
 331   ofstream deadchannelfile;
 332
 333   pedfile.open(PED_FILE);
 334   noisefile.open(NOISE_FILE);
 335   pedmemfile.open(PEDMEM_FILE);
 336   noisychannelfile.open(NOISY_FILE);
 337   verynoisychannelfile.open(VERYNOISY_FILE);
 338   deadchannelfile.open(DEAD_FILE);
 339
 340   TArrayF **timePed = calibPedestal.GetTimePedestals();  // pedestal values for each time bin
 341
 342   Int_t ctr_channel = 0;
 343   Int_t ctr_altro   = 0;
 344   Int_t ctr_pattern = 0;
 345   Int_t ctr_noisy   = 0;
 346   Int_t ctr_vnoisy  = 0;
 347   Int_t ctr_dead    = 0;
 348
 349   pedfile              << 10 << std::endl; // Mark file to contain PEDESTALS per channel
 350   noisefile            << 11 << std::endl; // Mark file to contain NOISE per altro
 351   pedmemfile           << 12 << std::endl; // Mark file to contain PEDESTALs per time bin
 352   noisychannelfile     << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 353   verynoisychannelfile << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 354   deadchannelfile      << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 355
 356   // inner==true : calROC from ldc-0 contains: rcus 0,1 for IROC and rcu 2 for OROC
 357   // inner==false: calROC from ldc-1 contains: nothing  for IROC and rcus 3,4,5 for OROC
 358   for ( Int_t roc = 0; roc < 72; roc++ ) {
 359     if ( !calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc) ) continue;
 360     bool isIROC  = mapping->IsIROC(roc);
 361     Int_t side   = mapping->GetSideFromRoc(roc);
 362     Int_t sector = mapping->GetSectorFromRoc(roc);
 363     Int_t minrcu, maxrcu;
 364     if      ( isIROC ) { minrcu=0; maxrcu=1; }
 365     else if ( inner  ) { minrcu=2; maxrcu=2; }
 366     else               { minrcu=3; maxrcu=5; }
 367     for ( int rcu = minrcu; rcu <= maxrcu; rcu++ ) {
 368       //Int_t patch = mapping->IsIROC(roc) ? rcu : rcu+2;
 369       for ( int branch = 0; branch < 2; branch++ ) {
 370         for ( int fec = 0; fec < mapping->GetNfec(rcu, branch); fec++ ) {
 371           for ( int altro = 0; altro < 8; altro++ ) {
 372             Float_t rms = 0.;
 373             Float_t maxrms = 0.;
 374             Float_t ctr_altrochannel = 0.;
 375             for ( int channel = 0; channel < 16; channel++ ) {
 376               Int_t hwadd     = mapping->CodeHWAddress(branch, fec, altro, channel);
 377               Int_t row       = mapping->GetPadRow(rcu, hwadd);        // row in a ROC
 378               Int_t globalrow = mapping->GetGlobalPadRow(rcu, hwadd);  // row in full sector
 379               Int_t pad       = mapping->GetPad(rcu, hwadd);
 380               Float_t ped     = calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc)->GetValue(row,pad);
 381               // fixed pedestal
 382               pedfile << ctr_channel++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 383                       << hwadd << "\t" << ped << std::endl;
 384               // pedestal(t)=pedestal memories
 385               if ( timePed && fabs(timePed[globalrow][pad].GetSum()) > 1e-10 ) {
 386                 pedmemfile << ctr_pattern++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu
 387                     << "\t" << hwadd;
 388                 for ( Int_t timebin = 0; timebin < 1024; timebin++ )
 389                   pedmemfile << "\t" << timePed[globalrow][pad].At(timebin);
 390                 pedmemfile << std::endl;
 391               }
 392               // rms=noise
 393               Float_t rms2 = calibPedestal.GetCalRocRMS(roc)->GetValue(row,pad);
 394               if ( fabs(ped) < 1.e-10 ) {                        // dead channel
 395                 deadchannelfile << ctr_dead++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 396                                 << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 397               } else if ( (ped > 1.e-10) && (rms2 > 1.e-10) ) {  // not dead
 398                 // Find noisy channels
 399                 if ( rms2 > 6.0 ) { // VERY noisy
 400                   verynoisychannelfile << ctr_vnoisy++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 401                                        << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 402
 403                 } else if ( ((roc<36)             && (rms2 > 2.0))  ||  // IROC
 404                             ((roc>35) && (row<65) && (rms2 > 2.0))  ||  // OROC, small pads
 405                             ((roc>35) && (row>64) && (rms2 > 3.0)) ) {  // OROC, large pads (50% more signal)
 406                   noisychannelfile << ctr_noisy++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 407                                    << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 408                 } else {
 409                   // Not noisy. Get average and maximum noise in this ALTRO
 410                   rms += rms2;
 411                   ctr_altrochannel += 1.;
 412                   if (rms2 > maxrms) maxrms = rms2;
 413                 } // end if noisy
 414               } // end if some signal
 415             } // end channel for loop
 416             Int_t hwadd = mapping->CodeHWAddress(branch, fec, altro, 0);   // ALTRO address
 417             // Noise data (rms) averaged over all channels in this ALTRO.
 418             if ( ctr_altrochannel > 1.e-10 ) {
 419               /*
 420               // average noise of this ALTRO (excluding high-noise channels)
 421               noisefile << ctr_altro << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 422               << hwadd << "\t" << rms/ctr_altrochannel << std::endl;
 423               */
 424               // maximum noise of this ALTRO (excluding high-noise channels)
 425               noisefile << ctr_altro << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 426                         << hwadd << "\t" << maxrms << std::endl;
 427               ctr_altro++;
 428             }
 429           } // end altro for loop
 430         } // end fec for loop
 431       } // end branch for loop
 432     } // end rcu for loop
 433   } // end roc loop
 434
 435   pedfile.close();
 436   noisefile.close();
 437   pedmemfile.close();
 438   noisychannelfile.close();
 439   verynoisychannelfile.close();
 440   deadchannelfile.close();
 441   printf("Wrote ASCII files. Found %d noisy, %d very noisy and %d dead channels.\n", ctr_noisy, ctr_vnoisy, ctr_dead);
 442
 443   return status;
 444
 445 }