TPC/TPCPEDESTALda.cxx

   1 /*
   2 TPC DA for online calibration
   3
   4 Contact: Haavard.Helstrup@cern.ch
   5 Link:
   6 Run Type: PEDESTAL
   7 DA Type: LDC
   8 Number of events needed: 100
   9 Input Files:
  10 Output Files: tpcPedestal.root, to be exported to the DAQ FXS
  11 fileId:   pedestals
  12 Trigger types used: CALIBRATION_EVENT
  13
  14 */
  15
  16 /*
  17
  18 TPCda_pedestal.cxx - calibration algorithm for TPC pedestal runs
  19
  20 10/06/2007  sylvain.chapeland@cern.ch :  first version - clean skeleton based on DAQ DA case1
  21 19/10/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Possibility to write output to ASCII file
  22 24/10/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Including pedestal calibration for time bins
  23 23/11/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Fix in order to avoid streamer problems in case of
  24                                           invalid ROOTSTYS. The famous magic line provided by Rene.
  25 28/11/2007  christian.lippmann@cern.ch :  TPC mapping file is read from DaqDetDB
  26 18/09/2008  christian.lippmann@cern.ch :  Noisy channels are output to ASCII file. Use max noise in ALTRO.
  27 19/09/2008  J.Wiechula@gsi.de:            Added export of the calibration data to the AMORE data base.
  28                                           Added support for configuration files.
  29 31/01/2011  Christian.Lippmann@cern.ch :  Updates for changed setup at P2 with 2 LDCs per sector
  30 26/09/2014  Christian.Lippmann@cern.ch :  Updates for changed setup at P2 1 CRORC per LDC
  31 26/09/2014  Jens.Wiechula@cern.ch      :  comment out obsolete AliTPCRawStream
  32
  33 contact: marian.ivanov@cern.ch
  34
  35 This process reads RAW data from the files provided as command line arguments
  36 and save results in a file (named from RESULT_FILE define - see below).
  37
  38 */
  39
  40 #define RESULT_FILE  "tpcPedestal.root"
  41 #define FILE_ID "pedestals"
  42 #define MAPPING_FILE "tpcMapping.root"
  43 #define CONFIG_FILE "TPCPEDESTALda.conf"
  44 #define PED_FILE "tpcPedestals.data"
  45 #define NOISE_FILE "tpcNoise.data"
  46 #define PEDMEM_FILE "tpcPedestalMem.data"
  47 #define NOISY_FILE "tpcNoisyChannels.data"
  48 #define VERYNOISY_FILE "tpcVeryNoisyChannels.data"
  49 #define DEAD_FILE "tpcDeadChannels.data"
  50 #define AliDebugLevel() -1
  51
  52 extern "C" {
  53 #include <daqDA.h>
  54 }
  55 #include "event.h"
  56 #include "monitor.h"
  57
  58 #include "stdio.h"
  59 #include "stdlib.h"
  60 #include <fstream>
  61
  62 //
  63 //Root includes
  64 //
  65 #include "TFile.h"
  66 #include "TArrayF.h"
  67 #include "TROOT.h"
  68 #include "TPluginManager.h"
  69 #include "TSystem.h"
  70 #include "TString.h"
  71 #include "TObjString.h"
  72 #include "TDatime.h"
  73 //
  74 //AliRoot includes
  75 //
  76 #include "AliRawReader.h"
  77 #include "AliRawReaderDate.h"
  78 #include "AliTPCmapper.h"
  79 //#include "AliTPCRawStreamV3.h"
  80 #include "AliTPCROC.h"
  81 #include "AliTPCCalROC.h"
  82 #include "AliTPCCalPad.h"
  83 #include "AliMathBase.h"
  84 #include "TTreeStream.h"
  85 #include "AliLog.h"
  86 #include "AliTPCConfigDA.h"
  87
  88 //
  89 //AMORE
  90 //
  91 #include <AmoreDA.h>
  92
  93 //
  94 // TPC calibration algorithm includes
  95 //
  96 #include "AliTPCCalibPedestal.h"
  97
  98 /*
  99   Main routine, TPC pedestal detector algorithm to be run on TPC LDC
 100   Arguments: list of DATE raw data files
 101 */
 102
 103 int main(int argc, char **argv) {
 104   //
 105   // Main for TPC pedestal detector algorithm
 106   //
 107   /* log start of process */
 108   printf("TPC DA started - %s\n",__FILE__);
 109
 110   if (argc<2) {
 111     printf("Wrong number of arguments\n");
 112     return -1;
 113   }
 114
 115   /*
 116   TString daterolename(gSystem->Getenv("DATE_ROLE_NAME"));
 117   if ( daterolename == "" ) {
 118     printf("Error: Variable DATE_ROLE_NAME not defined! Exiting ...\n");
 119     return -1;
 120   }
 121   bool inner;
 122   if      ( daterolename.EndsWith("-0") ) inner = true;
 123   else if ( daterolename.EndsWith("-1") ) inner = false;
 124   else {
 125     printf("Error: Variable DATE_ROLE_NAME neither ends with -0 nor -1 (E.g. ldc-TPC-C12-1)! Exiting ...\n");
 126     return -1;
 127   }
 128   */
 129
 130   //AliLog::SetClassDebugLevel("AliTPCRawStreamV3",-5);
 131   AliLog::SetClassDebugLevel("AliRawReaderDate",-5);
 132   AliLog::SetClassDebugLevel("AliTPCAltroMapping",-5);
 133   AliLog::SetModuleDebugLevel("RAW",-5);
 134
 135   /* magic line */
 136   gROOT->GetPluginManager()->AddHandler("TVirtualStreamerInfo",
 137                                         "*",
 138                                         "TStreamerInfo",
 139                                         "RIO",
 140                                         "TStreamerInfo()");
 141
 142   /* declare monitoring program */
 143   int i, status;
 144   status=monitorDeclareMp( __FILE__ );
 145   if (status!=0) {
 146     printf("monitorDeclareMp() failed : %s\n",monitorDecodeError(status));
 147     return -1;
 148   }
 149
 150   // variables
 151   AliTPCmapper *mapping = 0;   // The TPC mapping
 152   char localfile[255];
 153   unsigned long32 runNb=0;     // run number
 154   // configuration options
 155   Bool_t timeAnalysis = kTRUE;
 156   Bool_t fastDecoding = kFALSE;
 157
 158   if (!mapping){
 159     /* copy locally the mapping file from daq detector config db */
 160     sprintf(localfile,"./%s",MAPPING_FILE);
 161     status = daqDA_DB_getFile(MAPPING_FILE,localfile);
 162     if (status) {
 163       printf("Failed to get mapping file (%s) from DAQdetDB, status=%d\n", MAPPING_FILE, status);
 164       return -1;
 165     }
 166
 167     /* open the mapping file and retrieve mapping object */
 168     TFile *fileMapping = new TFile(MAPPING_FILE, "read");
 169     mapping = (AliTPCmapper*) fileMapping->Get("tpcMapping");
 170     delete fileMapping;
 171   }
 172
 173   if (mapping == 0) {
 174     printf("Failed to get mapping object from %s.  ...\n", MAPPING_FILE);
 175     return -1;
 176   } else {
 177     printf("Got mapping object from %s\n", MAPPING_FILE);
 178   }
 179
 180   //
 181   // DA configuration from configuration file
 182   //
 183   // retrieve configuration file
 184   sprintf(localfile,"./%s",CONFIG_FILE);
 185   status = daqDA_DB_getFile(CONFIG_FILE,localfile);
 186   if (status) {
 187     printf("Failed to get configuration file (%s) from DAQdetDB, status=%d\n", CONFIG_FILE, status);
 188     return -1;
 189   }
 190   AliTPCConfigDA config(CONFIG_FILE);
 191   // check configuration
 192   Bool_t  skipAmore=kFALSE;
 193
 194   if ( (Int_t)config.GetValue("NoTimeAnalysis") == 1 ) {
 195     printf("WARNING: Time analysis was switched off in the configuration file!\n");
 196     timeAnalysis=kFALSE;
 197   }
 198
 199   if ( (Int_t)config.GetValue("UseFastDecoder") == 1 ){
 200     printf("Info: The fast decoder will be used for the processing.\n");
 201     fastDecoding=kTRUE;
 202   }
 203
 204   if ( config.GetConfigurationMap()->GetValue("SkipAmore") ) {
 205     skipAmore=((TObjString*)config.GetConfigurationMap()->GetValue("SkipAmore"))->GetString().Atoi();
 206     printf("TPCPEDESTALda: Skip Amore set in config\n");
 207   }
 208
 209
 210   // create calibration object
 211   AliTPCCalibPedestal calibPedestal(config.GetConfigurationMap()); // pedestal and noise calibration
 212   calibPedestal.SetAltroMapping(mapping->GetAltroMapping()); // Use altro mapping we got from daqDetDb
 213   calibPedestal.SetTimeAnalysis(timeAnalysis);               // pedestal(t) calibration
 214
 215   //===========================//
 216   // loop over RAW data files //
 217   //==========================//
 218   int nevents=0;
 219   for ( i=1; i<argc; i++ ) {
 220
 221     /* define data source : this is argument i */
 222     printf("Processing file %s\n", argv[i]);
 223     status=monitorSetDataSource( argv[i] );
 224     if (status!=0) {
 225       printf("monitorSetDataSource() failed. Error=%s. Exiting ...\n", monitorDecodeError(status));
 226       return -1;
 227     }
 228
 229     /* read until EOF */
 230     for ( ; ; ) {
 231       struct eventHeaderStruct *event;
 232
 233       /* check shutdown condition */
 234       if (daqDA_checkShutdown()) {break;}
 235
 236       /* get next event (blocking call until timeout) */
 237       status=monitorGetEventDynamic((void **)&event);
 238       if (status==MON_ERR_EOF) {
 239         printf ("End of File %d (%s) detected\n", i, argv[i]);
 240         break; /* end of monitoring file has been reached */
 241       }
 242
 243       if (status!=0) {
 244         printf("monitorGetEventDynamic() failed : %s\n",monitorDecodeError(status));
 245         break;
 246       }
 247
 248       /* retry if got no event */
 249       if (event==NULL)
 250         continue;
 251
 252       /* skip start/end of run events */
 253       if ( (event->eventType != physicsEvent) && (event->eventType != calibrationEvent) )
 254         continue;
 255
 256       nevents++;
 257       // get the run number
 258       runNb = event->eventRunNb;
 259       //  Pedestal calibration
 260       calibPedestal.ProcessEvent(event);
 261
 262       /* free resources */
 263       free(event);
 264     }
 265   }
 266
 267   //
 268   // Analyse pedestals and write them to rootfile
 269   //
 270   calibPedestal.Analyse();
 271   calibPedestal.AnalyseTime(nevents);
 272   printf ("%d physics/calibration events processed.\n",nevents);
 273
 274   TFile *fileTPC = new TFile(RESULT_FILE, "recreate");
 275   calibPedestal.Write("tpcCalibPedestal");
 276   delete fileTPC;
 277   printf("Wrote %s.\n",RESULT_FILE);
 278
 279   /* store the result file on FES */
 280   status=daqDA_FES_storeFile(RESULT_FILE,FILE_ID);
 281   if (status) {
 282     status = -2;
 283   }
 284   //
 285   //Send objects to the AMORE DB
 286   //
 287   if (!skipAmore){
 288     printf ("AMORE part\n");
 289     const char *amoreDANameorig=gSystem->Getenv("AMORE_DA_NAME");
 290     //cheet a little -- temporary solution (hopefully)
 291     //
 292     //currently amoreDA uses the environment variable AMORE_DA_NAME to create the mysql
 293     //table in which the calib objects are stored. This table is dropped each time AmoreDA
 294     //is initialised. This of course makes a problem if we would like to store different
 295     //calibration entries in the AMORE DB. Therefore in each DA which writes to the AMORE DB
 296     //the AMORE_DA_NAME env variable is overwritten.
 297
 298     //find processed sector
 299     Char_t sideName='A';
 300     Int_t sector = -1;
 301     for ( Int_t roc = 0; roc < 72; roc++ ) {
 302       if ( !calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc) ) continue;
 303       if (mapping->GetSideFromRoc(roc)==1) sideName='C';
 304       sector = mapping->GetSectorFromRoc(roc);
 305     }
 306   //   gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",Form("TPC-%c%02d-%s",sideName,sector,FILE_ID));
 307     gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",Form("%s-%s",gSystem->Getenv("DATE_ROLE_NAME"),FILE_ID));
 308
 309     //
 310     // end cheet
 311     if (sector>-1){
 312       TDatime time;
 313       TObjString info(Form("Run: %u; Date: %s",runNb,time.AsSQLString()));
 314
 315       amore::da::AmoreDA amoreDA(amore::da::AmoreDA::kSender);
 316       Int_t statusDA=0;
 317       statusDA+=amoreDA.Send("Pedestals",calibPedestal.GetCalPadPedestal());
 318       statusDA+=amoreDA.Send("Noise",calibPedestal.GetCalPadRMS());
 319       statusDA+=amoreDA.Send("Info",&info);
 320       if ( statusDA )
 321         printf("Warning: Failed to write one of the calib objects to the AMORE database\n");
 322     }  else {
 323       printf("Warning: No data found!\n");
 324     }
 325     // reset env var
 326     if (amoreDANameorig) gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",amoreDANameorig);
 327   }
 328
 329   //
 330   // Now prepare ASCII files for local ALTRO configuration through DDL.
 331   //
 332   ofstream pedfile;
 333   ofstream noisefile;
 334   ofstream pedmemfile;
 335   ofstream noisychannelfile;
 336   ofstream verynoisychannelfile;
 337   ofstream deadchannelfile;
 338
 339   pedfile.open(PED_FILE);
 340   noisefile.open(NOISE_FILE);
 341   pedmemfile.open(PEDMEM_FILE);
 342   noisychannelfile.open(NOISY_FILE);
 343   verynoisychannelfile.open(VERYNOISY_FILE);
 344   deadchannelfile.open(DEAD_FILE);
 345
 346   TArrayF **timePed = calibPedestal.GetTimePedestals();  // pedestal values for each time bin
 347
 348   Int_t ctr_channel = 0;
 349   Int_t ctr_altro   = 0;
 350   Int_t ctr_pattern = 0;
 351   Int_t ctr_noisy   = 0;
 352   Int_t ctr_vnoisy  = 0;
 353   Int_t ctr_dead    = 0;
 354
 355   pedfile              << 10 << std::endl; // Mark file to contain PEDESTALS per channel
 356   noisefile            << 11 << std::endl; // Mark file to contain NOISE per altro
 357   pedmemfile           << 12 << std::endl; // Mark file to contain PEDESTALs per time bin
 358   noisychannelfile     << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 359   verynoisychannelfile << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 360   deadchannelfile      << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 361
 362   // inner==true : calROC from ldc-0 contains: rcus 0,1 for IROC and rcu 2 for OROC
 363   // inner==false: calROC from ldc-1 contains: nothing  for IROC and rcus 3,4,5 for OROC
 364   for ( Int_t roc = 0; roc < 72; roc++ ) {
 365     if ( !calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc) ) continue;
 366     bool isIROC  = mapping->IsIROC(roc);
 367     Int_t side   = mapping->GetSideFromRoc(roc);
 368     Int_t sector = mapping->GetSectorFromRoc(roc);
 369     Int_t minrcu, maxrcu;
 370     if      ( isIROC ) { minrcu=0; maxrcu=1; }
 371     //else if ( inner  ) { minrcu=2; maxrcu=2; }
 372     //else               { minrcu=3; maxrcu=5; }
 373     else               { minrcu=2; maxrcu=5; }
 374     for ( int rcu = minrcu; rcu <= maxrcu; rcu++ ) {
 375       //Int_t patch = mapping->IsIROC(roc) ? rcu : rcu+2;
 376       for ( int branch = 0; branch < 2; branch++ ) {
 377         for ( int fec = 0; fec < mapping->GetNfec(rcu, branch); fec++ ) {
 378           for ( int altro = 0; altro < 8; altro++ ) {
 379             Float_t rms = 0.;
 380             Float_t maxrms = 0.;
 381             Float_t ctr_altrochannel = 0.;
 382             for ( int channel = 0; channel < 16; channel++ ) {
 383               Int_t hwadd     = mapping->CodeHWAddress(branch, fec, altro, channel);
 384               Int_t row       = mapping->GetPadRow(rcu, hwadd);        // row in a ROC
 385               Int_t globalrow = mapping->GetGlobalPadRow(rcu, hwadd);  // row in full sector
 386               Int_t pad       = mapping->GetPad(rcu, hwadd);
 387               Float_t ped     = calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc)->GetValue(row,pad);
 388               // fixed pedestal
 389               pedfile << ctr_channel++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 390                       << hwadd << "\t" << ped << std::endl;
 391               // pedestal(t)=pedestal memories
 392               if ( timePed && fabs(timePed[globalrow][pad].GetSum()) > 1e-10 ) {
 393                 pedmemfile << ctr_pattern++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu
 394                     << "\t" << hwadd;
 395                 for ( Int_t timebin = 0; timebin < 1024; timebin++ )
 396                   pedmemfile << "\t" << timePed[globalrow][pad].At(timebin);
 397                 pedmemfile << std::endl;
 398               }
 399               // rms=noise
 400               Float_t rms2 = calibPedestal.GetCalRocRMS(roc)->GetValue(row,pad);
 401               if ( fabs(ped) < 1.e-10 ) {                        // dead channel
 402                 deadchannelfile << ctr_dead++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 403                                 << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 404               } else if ( (ped > 1.e-10) && (rms2 > 1.e-10) ) {  // not dead
 405                 // Find noisy channels
 406                 if ( rms2 > 6.0 ) { // VERY noisy
 407                   verynoisychannelfile << ctr_vnoisy++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 408                                        << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 409
 410                 } else if ( ((roc<36)             && (rms2 > 2.0))  ||  // IROC
 411                             ((roc>35) && (row<65) && (rms2 > 2.0))  ||  // OROC, small pads
 412                             ((roc>35) && (row>64) && (rms2 > 3.0)) ) {  // OROC, large pads (50% more signal)
 413                   noisychannelfile << ctr_noisy++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 414                                    << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 415                 } else {
 416                   // Not noisy. Get average and maximum noise in this ALTRO
 417                   rms += rms2;
 418                   ctr_altrochannel += 1.;
 419                   if (rms2 > maxrms) maxrms = rms2;
 420                 } // end if noisy
 421               } // end if some signal
 422             } // end channel for loop
 423             Int_t hwadd = mapping->CodeHWAddress(branch, fec, altro, 0);   // ALTRO address
 424             // Noise data (rms) averaged over all channels in this ALTRO.
 425             if ( ctr_altrochannel > 1.e-10 ) {
 426               /*
 427               // average noise of this ALTRO (excluding high-noise channels)
 428               noisefile << ctr_altro << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 429               << hwadd << "\t" << rms/ctr_altrochannel << std::endl;
 430               */
 431               // maximum noise of this ALTRO (excluding high-noise channels)
 432               noisefile << ctr_altro << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 433                         << hwadd << "\t" << maxrms << std::endl;
 434               ctr_altro++;
 435             }
 436           } // end altro for loop
 437         } // end fec for loop
 438       } // end branch for loop
 439     } // end rcu for loop
 440   } // end roc loop
 441
 442   pedfile.close();
 443   noisefile.close();
 444   pedmemfile.close();
 445   noisychannelfile.close();
 446   verynoisychannelfile.close();
 447   deadchannelfile.close();
 448   printf("Wrote ASCII files. Found %d noisy, %d very noisy and %d dead channels.\n", ctr_noisy, ctr_vnoisy, ctr_dead);
 449
 450   return status;
 451
 452 }