TPC/TPCPEDESTALda.cxx

   1 /*
   2 TPC DA for online calibration
   3
   4 Contact: Haavard.Helstrup@cern.ch
   5 Link:
   6 Run Type: PEDESTAL
   7 DA Type: LDC
   8 Number of events needed: 100
   9 Input Files:
  10 Output Files: tpcPedestal.root, to be exported to the DAQ FXS
  11 fileId:   pedestals
  12 Trigger types used: CALIBRATION_EVENT
  13
  14 */
  15
  16 /*
  17
  18 TPCda_pedestal.cxx - calibration algorithm for TPC pedestal runs
  19
  20 10/06/2007  sylvain.chapeland@cern.ch :  first version - clean skeleton based on DAQ DA case1
  21 19/10/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Possibility to write output to ASCII file
  22 24/10/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Including pedestal calibration for time bins
  23 23/11/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Fix in order to avoid streamer problems in case of
  24                                           invalid ROOTSTYS. The famous magic line provided by Rene.
  25 28/11/2007  christian.lippmann@cern.ch :  TPC mapping file is read from DaqDetDB
  26 18/09/2008  christian.lippmann@cern.ch :  Noisy channels are output to ASCII file. Use max noise in ALTRO.
  27 19/09/2008  J.Wiechula@gsi.de:            Added export of the calibration data to the AMORE data base.
  28                                           Added support for configuration files.
  29 31/01/2011  Christian.Lippmann@cern.ch :  Updates for changed setup at P2 with 2 LDCs per sector
  30
  31 contact: marian.ivanov@cern.ch
  32
  33 This process reads RAW data from the files provided as command line arguments
  34 and save results in a file (named from RESULT_FILE define - see below).
  35
  36 */
  37
  38 #define RESULT_FILE  "tpcPedestal.root"
  39 #define FILE_ID "pedestals"
  40 #define MAPPING_FILE "tpcMapping.root"
  41 #define CONFIG_FILE "TPCPEDESTALda.conf"
  42 #define PED_FILE "tpcPedestals.data"
  43 #define NOISE_FILE "tpcNoise.data"
  44 #define PEDMEM_FILE "tpcPedestalMem.data"
  45 #define NOISY_FILE "tpcNoisyChannels.data"
  46 #define VERYNOISY_FILE "tpcVeryNoisyChannels.data"
  47 #define DEAD_FILE "tpcDeadChannels.data"
  48 #define AliDebugLevel() -1
  49
  50 extern "C" {
  51 #include <daqDA.h>
  52 }
  53 #include "event.h"
  54 #include "monitor.h"
  55
  56 #include "stdio.h"
  57 #include "stdlib.h"
  58 #include <fstream>
  59
  60 //
  61 //Root includes
  62 //
  63 #include "TFile.h"
  64 #include "TArrayF.h"
  65 #include "TROOT.h"
  66 #include "TPluginManager.h"
  67 #include "TSystem.h"
  68 #include "TString.h"
  69 #include "TObjString.h"
  70 #include "TDatime.h"
  71 //
  72 //AliRoot includes
  73 //
  74 #include "AliRawReader.h"
  75 #include "AliRawReaderDate.h"
  76 #include "AliTPCmapper.h"
  77 #include "AliTPCRawStream.h"
  78 #include "AliTPCROC.h"
  79 #include "AliTPCCalROC.h"
  80 #include "AliTPCCalPad.h"
  81 #include "AliMathBase.h"
  82 #include "TTreeStream.h"
  83 #include "AliLog.h"
  84 #include "AliTPCConfigDA.h"
  85
  86 //
  87 //AMORE
  88 //
  89 #include <AmoreDA.h>
  90
  91 //
  92 // TPC calibration algorithm includes
  93 //
  94 #include "AliTPCCalibPedestal.h"
  95
  96 /*
  97   Main routine, TPC pedestal detector algorithm to be run on TPC LDC
  98   Arguments: list of DATE raw data files
  99 */
 100
 101 int main(int argc, char **argv) {
 102   //
 103   // Main for TPC pedestal detector algorithm
 104   //
 105   /* log start of process */
 106   printf("TPC DA started - %s\n",__FILE__);
 107
 108   if (argc<2) {
 109     printf("Wrong number of arguments\n");
 110     return -1;
 111   }
 112
 113   TString daterolename(gSystem->Getenv("DATE_ROLE_NAME"));
 114   if ( daterolename == "" ) {
 115     printf("Error: Variable DATE_ROLE_NAME not defined! Exiting ...\n");
 116     return -1;
 117   }
 118   bool inner;
 119   if      ( daterolename.EndsWith("-0") ) inner = true;
 120   else if ( daterolename.EndsWith("-1") ) inner = false;
 121   else {
 122     printf("Error: Variable DATE_ROLE_NAME neither ends with -0 nor -1 (E.g. ldc-TPC-C12-1)! Exiting ...\n");
 123     return -1;
 124   }
 125
 126   AliLog::SetClassDebugLevel("AliTPCRawStream",-5);
 127   AliLog::SetClassDebugLevel("AliRawReaderDate",-5);
 128   AliLog::SetClassDebugLevel("AliTPCAltroMapping",-5);
 129   AliLog::SetModuleDebugLevel("RAW",-5);
 130
 131   /* magic line */
 132   gROOT->GetPluginManager()->AddHandler("TVirtualStreamerInfo",
 133                                         "*",
 134                                         "TStreamerInfo",
 135                                         "RIO",
 136                                         "TStreamerInfo()");
 137
 138   /* declare monitoring program */
 139   int i, status;
 140   status=monitorDeclareMp( __FILE__ );
 141   if (status!=0) {
 142     printf("monitorDeclareMp() failed : %s\n",monitorDecodeError(status));
 143     return -1;
 144   }
 145
 146   // variables
 147   AliTPCmapper *mapping = 0;   // The TPC mapping
 148   char localfile[255];
 149   unsigned long32 runNb=0;     // run number
 150   // configuration options
 151   Bool_t timeAnalysis = kTRUE;
 152   Bool_t fastDecoding = kFALSE;
 153
 154   if (!mapping){
 155     /* copy locally the mapping file from daq detector config db */
 156     sprintf(localfile,"./%s",MAPPING_FILE);
 157     status = daqDA_DB_getFile(MAPPING_FILE,localfile);
 158     if (status) {
 159       printf("Failed to get mapping file (%s) from DAQdetDB, status=%d\n", MAPPING_FILE, status);
 160       return -1;
 161     }
 162
 163     /* open the mapping file and retrieve mapping object */
 164     TFile *fileMapping = new TFile(MAPPING_FILE, "read");
 165     mapping = (AliTPCmapper*) fileMapping->Get("tpcMapping");
 166     delete fileMapping;
 167   }
 168
 169   if (mapping == 0) {
 170     printf("Failed to get mapping object from %s.  ...\n", MAPPING_FILE);
 171     return -1;
 172   } else {
 173     printf("Got mapping object from %s\n", MAPPING_FILE);
 174   }
 175
 176   //
 177   // DA configuration from configuration file
 178   //
 179   // retrieve configuration file
 180   sprintf(localfile,"./%s",CONFIG_FILE);
 181   status = daqDA_DB_getFile(CONFIG_FILE,localfile);
 182   if (status) {
 183     printf("Failed to get configuration file (%s) from DAQdetDB, status=%d\n", CONFIG_FILE, status);
 184     return -1;
 185   }
 186   AliTPCConfigDA config(CONFIG_FILE);
 187   // check configuration
 188   Bool_t  skipAmore=kFALSE;
 189
 190   if ( (Int_t)config.GetValue("NoTimeAnalysis") == 1 ) {
 191     printf("WARNING: Time analysis was switched off in the configuration file!\n");
 192     timeAnalysis=kFALSE;
 193   }
 194
 195   if ( (Int_t)config.GetValue("UseFastDecoder") == 1 ){
 196     printf("Info: The fast decoder will be used for the processing.\n");
 197     fastDecoding=kTRUE;
 198   }
 199
 200   if ( config.GetConfigurationMap()->GetValue("SkipAmore") ) {
 201     skipAmore=((TObjString*)config.GetConfigurationMap()->GetValue("SkipAmore"))->GetString().Atoi();
 202     printf("TPCPEDESTALda: Skip Amore set in config\n");
 203   }
 204
 205
 206   // create calibration object
 207   AliTPCCalibPedestal calibPedestal(config.GetConfigurationMap()); // pedestal and noise calibration
 208   calibPedestal.SetAltroMapping(mapping->GetAltroMapping()); // Use altro mapping we got from daqDetDb
 209   calibPedestal.SetTimeAnalysis(timeAnalysis);               // pedestal(t) calibration
 210
 211   //===========================//
 212   // loop over RAW data files //
 213   //==========================//
 214   int nevents=0;
 215   for ( i=1; i<argc; i++ ) {
 216
 217     /* define data source : this is argument i */
 218     printf("Processing file %s\n", argv[i]);
 219     status=monitorSetDataSource( argv[i] );
 220     if (status!=0) {
 221       printf("monitorSetDataSource() failed. Error=%s. Exiting ...\n", monitorDecodeError(status));
 222       return -1;
 223     }
 224
 225     /* read until EOF */
 226     for ( ; ; ) {
 227       struct eventHeaderStruct *event;
 228
 229       /* check shutdown condition */
 230       if (daqDA_checkShutdown()) {break;}
 231
 232       /* get next event (blocking call until timeout) */
 233       status=monitorGetEventDynamic((void **)&event);
 234       if (status==MON_ERR_EOF) {
 235         printf ("End of File %d (%s) detected\n", i, argv[i]);
 236         break; /* end of monitoring file has been reached */
 237       }
 238
 239       if (status!=0) {
 240         printf("monitorGetEventDynamic() failed : %s\n",monitorDecodeError(status));
 241         break;
 242       }
 243
 244       /* retry if got no event */
 245       if (event==NULL)
 246         continue;
 247
 248       /* skip start/end of run events */
 249       if ( (event->eventType != physicsEvent) && (event->eventType != calibrationEvent) )
 250         continue;
 251
 252       nevents++;
 253       // get the run number
 254       runNb = event->eventRunNb;
 255       //  Pedestal calibration
 256       calibPedestal.ProcessEvent(event);
 257
 258       /* free resources */
 259       free(event);
 260     }
 261   }
 262
 263   //
 264   // Analyse pedestals and write them to rootfile
 265   //
 266   calibPedestal.Analyse();
 267   calibPedestal.AnalyseTime(nevents);
 268   printf ("%d physics/calibration events processed.\n",nevents);
 269
 270   TFile *fileTPC = new TFile(RESULT_FILE, "recreate");
 271   calibPedestal.Write("tpcCalibPedestal");
 272   delete fileTPC;
 273   printf("Wrote %s.\n",RESULT_FILE);
 274
 275   /* store the result file on FES */
 276   status=daqDA_FES_storeFile(RESULT_FILE,FILE_ID);
 277   if (status) {
 278     status = -2;
 279   }
 280   //
 281   //Send objects to the AMORE DB
 282   //
 283   if (!skipAmore){
 284     printf ("AMORE part\n");
 285     const char *amoreDANameorig=gSystem->Getenv("AMORE_DA_NAME");
 286     //cheet a little -- temporary solution (hopefully)
 287     //
 288     //currently amoreDA uses the environment variable AMORE_DA_NAME to create the mysql
 289     //table in which the calib objects are stored. This table is dropped each time AmoreDA
 290     //is initialised. This of course makes a problem if we would like to store different
 291     //calibration entries in the AMORE DB. Therefore in each DA which writes to the AMORE DB
 292     //the AMORE_DA_NAME env variable is overwritten.
 293
 294     //find processed sector
 295     Char_t sideName='A';
 296     Int_t sector = -1;
 297     for ( Int_t roc = 0; roc < 72; roc++ ) {
 298       if ( !calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc) ) continue;
 299       if (mapping->GetSideFromRoc(roc)==1) sideName='C';
 300       sector = mapping->GetSectorFromRoc(roc);
 301     }
 302   //   gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",Form("TPC-%c%02d-%s",sideName,sector,FILE_ID));
 303     gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",Form("%s-%s",gSystem->Getenv("DATE_ROLE_NAME"),FILE_ID));
 304
 305     //
 306     // end cheet
 307     if (sector>-1){
 308       TDatime time;
 309       TObjString info(Form("Run: %u; Date: %s",runNb,time.AsSQLString()));
 310
 311       amore::da::AmoreDA amoreDA(amore::da::AmoreDA::kSender);
 312       Int_t statusDA=0;
 313       statusDA+=amoreDA.Send("Pedestals",calibPedestal.GetCalPadPedestal());
 314       statusDA+=amoreDA.Send("Noise",calibPedestal.GetCalPadRMS());
 315       statusDA+=amoreDA.Send("Info",&info);
 316       if ( statusDA )
 317         printf("Warning: Failed to write one of the calib objects to the AMORE database\n");
 318     }  else {
 319       printf("Warning: No data found!\n");
 320     }
 321     // reset env var
 322     if (amoreDANameorig) gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",amoreDANameorig);
 323   }
 324
 325   //
 326   // Now prepare ASCII files for local ALTRO configuration through DDL.
 327   //
 328   ofstream pedfile;
 329   ofstream noisefile;
 330   ofstream pedmemfile;
 331   ofstream noisychannelfile;
 332   ofstream verynoisychannelfile;
 333   ofstream deadchannelfile;
 334
 335   pedfile.open(PED_FILE);
 336   noisefile.open(NOISE_FILE);
 337   pedmemfile.open(PEDMEM_FILE);
 338   noisychannelfile.open(NOISY_FILE);
 339   verynoisychannelfile.open(VERYNOISY_FILE);
 340   deadchannelfile.open(DEAD_FILE);
 341
 342   TArrayF **timePed = calibPedestal.GetTimePedestals();  // pedestal values for each time bin
 343
 344   Int_t ctr_channel = 0;
 345   Int_t ctr_altro   = 0;
 346   Int_t ctr_pattern = 0;
 347   Int_t ctr_noisy   = 0;
 348   Int_t ctr_vnoisy  = 0;
 349   Int_t ctr_dead    = 0;
 350
 351   pedfile              << 10 << std::endl; // Mark file to contain PEDESTALS per channel
 352   noisefile            << 11 << std::endl; // Mark file to contain NOISE per altro
 353   pedmemfile           << 12 << std::endl; // Mark file to contain PEDESTALs per time bin
 354   noisychannelfile     << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 355   verynoisychannelfile << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 356   deadchannelfile      << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY or DEAD CHANNELS
 357
 358   // inner==true : calROC from ldc-0 contains: rcus 0,1 for IROC and rcu 2 for OROC
 359   // inner==false: calROC from ldc-1 contains: nothing  for IROC and rcus 3,4,5 for OROC
 360   for ( Int_t roc = 0; roc < 72; roc++ ) {
 361     if ( !calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc) ) continue;
 362     bool isIROC  = mapping->IsIROC(roc);
 363     Int_t side   = mapping->GetSideFromRoc(roc);
 364     Int_t sector = mapping->GetSectorFromRoc(roc);
 365     Int_t minrcu, maxrcu;
 366     if      ( isIROC ) { minrcu=0; maxrcu=1; }
 367     else if ( inner  ) { minrcu=2; maxrcu=2; }
 368     else               { minrcu=3; maxrcu=5; }
 369     for ( int rcu = minrcu; rcu <= maxrcu; rcu++ ) {
 370       //Int_t patch = mapping->IsIROC(roc) ? rcu : rcu+2;
 371       for ( int branch = 0; branch < 2; branch++ ) {
 372         for ( int fec = 0; fec < mapping->GetNfec(rcu, branch); fec++ ) {
 373           for ( int altro = 0; altro < 8; altro++ ) {
 374             Float_t rms = 0.;
 375             Float_t maxrms = 0.;
 376             Float_t ctr_altrochannel = 0.;
 377             for ( int channel = 0; channel < 16; channel++ ) {
 378               Int_t hwadd     = mapping->CodeHWAddress(branch, fec, altro, channel);
 379               Int_t row       = mapping->GetPadRow(rcu, hwadd);        // row in a ROC
 380               Int_t globalrow = mapping->GetGlobalPadRow(rcu, hwadd);  // row in full sector
 381               Int_t pad       = mapping->GetPad(rcu, hwadd);
 382               Float_t ped     = calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc)->GetValue(row,pad);
 383               // fixed pedestal
 384               pedfile << ctr_channel++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 385                       << hwadd << "\t" << ped << std::endl;
 386               // pedestal(t)=pedestal memories
 387               if ( timePed && fabs(timePed[globalrow][pad].GetSum()) > 1e-10 ) {
 388                 pedmemfile << ctr_pattern++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu
 389                     << "\t" << hwadd;
 390                 for ( Int_t timebin = 0; timebin < 1024; timebin++ )
 391                   pedmemfile << "\t" << timePed[globalrow][pad].At(timebin);
 392                 pedmemfile << std::endl;
 393               }
 394               // rms=noise
 395               Float_t rms2 = calibPedestal.GetCalRocRMS(roc)->GetValue(row,pad);
 396               if ( fabs(ped) < 1.e-10 ) {                        // dead channel
 397                 deadchannelfile << ctr_dead++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 398                                 << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 399               } else if ( (ped > 1.e-10) && (rms2 > 1.e-10) ) {  // not dead
 400                 // Find noisy channels
 401                 if ( rms2 > 6.0 ) { // VERY noisy
 402                   verynoisychannelfile << ctr_vnoisy++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 403                                        << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 404
 405                 } else if ( ((roc<36)             && (rms2 > 2.0))  ||  // IROC
 406                             ((roc>35) && (row<65) && (rms2 > 2.0))  ||  // OROC, small pads
 407                             ((roc>35) && (row>64) && (rms2 > 3.0)) ) {  // OROC, large pads (50% more signal)
 408                   noisychannelfile << ctr_noisy++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 409                                    << rcu << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 410                 } else {
 411                   // Not noisy. Get average and maximum noise in this ALTRO
 412                   rms += rms2;
 413                   ctr_altrochannel += 1.;
 414                   if (rms2 > maxrms) maxrms = rms2;
 415                 } // end if noisy
 416               } // end if some signal
 417             } // end channel for loop
 418             Int_t hwadd = mapping->CodeHWAddress(branch, fec, altro, 0);   // ALTRO address
 419             // Noise data (rms) averaged over all channels in this ALTRO.
 420             if ( ctr_altrochannel > 1.e-10 ) {
 421               /*
 422               // average noise of this ALTRO (excluding high-noise channels)
 423               noisefile << ctr_altro << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 424               << hwadd << "\t" << rms/ctr_altrochannel << std::endl;
 425               */
 426               // maximum noise of this ALTRO (excluding high-noise channels)
 427               noisefile << ctr_altro << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << rcu << "\t"
 428                         << hwadd << "\t" << maxrms << std::endl;
 429               ctr_altro++;
 430             }
 431           } // end altro for loop
 432         } // end fec for loop
 433       } // end branch for loop
 434     } // end rcu for loop
 435   } // end roc loop
 436
 437   pedfile.close();
 438   noisefile.close();
 439   pedmemfile.close();
 440   noisychannelfile.close();
 441   verynoisychannelfile.close();
 442   deadchannelfile.close();
 443   printf("Wrote ASCII files. Found %d noisy, %d very noisy and %d dead channels.\n", ctr_noisy, ctr_vnoisy, ctr_dead);
 444
 445   return status;
 446
 447 }