TPC/TPCPEDESTALda.cxx

   1 /*
   2 TPC DA for online calibration
   3
   4 Contact: Haavard.Helstrup@cern.ch
   5 Link:
   6 Run Type: PEDESTAL
   7 DA Type: LDC
   8 Number of events needed: 100
   9 Input Files:
  10 Output Files: tpcPedestal.root, to be exported to the DAQ FXS
  11 fileId:   pedestals
  12 Trigger types used: CALIBRATION_EVENT
  13
  14 */
  15
  16 /*
  17
  18 TPCda_pedestal.cxx - calibration algorithm for TPC pedestal runs
  19
  20 10/06/2007  sylvain.chapeland@cern.ch :  first version - clean skeleton based on DAQ DA case1
  21 19/10/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Possibility to write output to ASCII file
  22 24/10/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Including pedestal calibration for time bins
  23 23/11/2007  christian.lippmann@cern.ch :  Fix in order to avoid streamer problems in case of
  24                                           invalid ROOTSTYS. The famous magic line provided by Rene.
  25 28/11/2007  christian.lippmann@cern.ch :  TPC mapping file is read from DaqDetDB
  26 18/09/2008  christian.lippmann@cern.ch :  Noisy channels are output to ASCII file. Use max noise in ALTRO.
  27 19/09/2008  J.Wiechula@gsi.de:            Added export of the calibration data to the AMORE data base.
  28                                           Added support for configuration files.
  29
  30 contact: marian.ivanov@cern.ch
  31
  32 This process reads RAW data from the files provided as command line arguments
  33 and save results in a file (named from RESULT_FILE define - see below).
  34
  35 */
  36
  37 #define RESULT_FILE  "tpcPedestal.root"
  38 #define FILE_ID "pedestals"
  39 #define MAPPING_FILE "tpcMapping.root"
  40 #define CONFIG_FILE "TPCPEDESTALda.conf"
  41 #define AliDebugLevel() -1
  42
  43 extern "C" {
  44 #include <daqDA.h>
  45 }
  46 #include "event.h"
  47 #include "monitor.h"
  48
  49 #include "stdio.h"
  50 #include "stdlib.h"
  51 #include <fstream>
  52
  53 //
  54 //Root includes
  55 //
  56 #include "TFile.h"
  57 #include "TArrayF.h"
  58 #include "TROOT.h"
  59 #include "TPluginManager.h"
  60 #include "TSystem.h"
  61 #include "TString.h"
  62 #include "TObjString.h"
  63 #include "TDatime.h"
  64 //
  65 //AliRoot includes
  66 //
  67 #include "AliRawReader.h"
  68 #include "AliRawReaderDate.h"
  69 #include "AliTPCmapper.h"
  70 #include "AliTPCRawStream.h"
  71 #include "AliTPCROC.h"
  72 #include "AliTPCCalROC.h"
  73 #include "AliTPCCalPad.h"
  74 #include "AliMathBase.h"
  75 #include "TTreeStream.h"
  76 #include "AliLog.h"
  77 #include "AliTPCConfigDA.h"
  78
  79 //
  80 //AMORE
  81 //
  82 #include <AmoreDA.h>
  83
  84 //
  85 // TPC calibration algorithm includes
  86 //
  87 #include "AliTPCCalibPedestal.h"
  88
  89 /*
  90   Main routine, TPC pedestal detector algorithm to be run on TPC LDC
  91   Arguments: list of DATE raw data files
  92 */
  93
  94 int main(int argc, char **argv) {
  95   //
  96   // Main for TPC pedestal detector algorithm
  97   //
  98   /* log start of process */
  99   printf("TPC DA started - %s\n",__FILE__);
 100
 101   if (argc<2) {
 102     printf("Wrong number of arguments\n");
 103     return -1;
 104   }
 105   AliLog::SetClassDebugLevel("AliTPCRawStream",-5);
 106   AliLog::SetClassDebugLevel("AliRawReaderDate",-5);
 107   AliLog::SetClassDebugLevel("AliTPCAltroMapping",-5);
 108   AliLog::SetModuleDebugLevel("RAW",-5);
 109
 110   /* magic line */
 111   gROOT->GetPluginManager()->AddHandler("TVirtualStreamerInfo",
 112           "*",
 113           "TStreamerInfo",
 114           "RIO",
 115           "TStreamerInfo()");
 116
 117   /* declare monitoring program */
 118   int i, status;
 119   status=monitorDeclareMp( __FILE__ );
 120   if (status!=0) {
 121     printf("monitorDeclareMp() failed : %s\n",monitorDecodeError(status));
 122     return -1;
 123   }
 124
 125   // variables
 126   AliTPCmapper *mapping = 0;   // The TPC mapping
 127   char localfile[255];
 128   unsigned long32 runNb=0;     // run number
 129   // configuration options
 130   Bool_t timeAnalysis = kTRUE;
 131   Bool_t fastDecoding = kFALSE;
 132
 133   if (!mapping){
 134     /* copy locally the mapping file from daq detector config db */
 135     sprintf(localfile,"./%s",MAPPING_FILE);
 136     status = daqDA_DB_getFile(MAPPING_FILE,localfile);
 137     if (status) {
 138       printf("Failed to get mapping file (%s) from DAQdetDB, status=%d\n", MAPPING_FILE, status);
 139       return -1;
 140     }
 141
 142     /* open the mapping file and retrieve mapping object */
 143     TFile *fileMapping = new TFile(MAPPING_FILE, "read");
 144     mapping = (AliTPCmapper*) fileMapping->Get("tpcMapping");
 145     delete fileMapping;
 146   }
 147
 148   if (mapping == 0) {
 149     printf("Failed to get mapping object from %s.  ...\n", MAPPING_FILE);
 150     return -1;
 151   } else {
 152     printf("Got mapping object from %s\n", MAPPING_FILE);
 153   }
 154
 155   //
 156   // DA configuration from configuration file
 157   //
 158   // retrieve configuration file
 159   sprintf(localfile,"./%s",CONFIG_FILE);
 160   status = daqDA_DB_getFile(CONFIG_FILE,localfile);
 161   if (status) {
 162     printf("Failed to get configuration file (%s) from DAQdetDB, status=%d\n", CONFIG_FILE, status);
 163     return -1;
 164   }
 165   AliTPCConfigDA config(CONFIG_FILE);
 166   // check configuration
 167   if ( (Int_t)config.GetValue("NoTimeAnalysis") == 1 ) {
 168     printf("WARNING: Time analysis was switched off in the configuration file!\n");
 169     timeAnalysis=kFALSE;
 170   }
 171   if ( (Int_t)config.GetValue("UseFastDecoder") == 1 ){
 172     printf("Info: The fast decoder will be used for the processing.\n");
 173     fastDecoding=kTRUE;
 174   }
 175
 176   // create calibration object
 177   AliTPCCalibPedestal calibPedestal(config.GetConfigurationMap()); // pedestal and noise calibration
 178   calibPedestal.SetAltroMapping(mapping->GetAltroMapping()); // Use altro mapping we got from daqDetDb
 179
 180   //===========================//
 181   // loop over RAW data files //
 182   //==========================//
 183   int nevents=0;
 184   for ( i=1; i<argc; i++ ) {
 185
 186     /* define data source : this is argument i */
 187     printf("Processing file %s\n", argv[i]);
 188     status=monitorSetDataSource( argv[i] );
 189     if (status!=0) {
 190       printf("monitorSetDataSource() failed. Error=%s. Exiting ...\n", monitorDecodeError(status));
 191       return -1;
 192     }
 193
 194     /* read until EOF */
 195     for ( ; ; ) {
 196       struct eventHeaderStruct *event;
 197
 198       /* check shutdown condition */
 199       if (daqDA_checkShutdown()) {break;}
 200
 201       /* get next event (blocking call until timeout) */
 202       status=monitorGetEventDynamic((void **)&event);
 203       if (status==MON_ERR_EOF) {
 204         printf ("End of File %d (%s) detected\n", i, argv[i]);
 205         break; /* end of monitoring file has been reached */
 206       }
 207
 208       if (status!=0) {
 209         printf("monitorGetEventDynamic() failed : %s\n",monitorDecodeError(status));
 210         break;
 211       }
 212
 213       /* skip start/end of run events */
 214       if ( (event->eventType != physicsEvent) && (event->eventType != calibrationEvent) )
 215         continue;
 216
 217       /* retry if got no event */
 218       if (event==NULL)
 219         continue;
 220
 221       nevents++;
 222       // get the run number
 223       runNb = event->eventRunNb;
 224       //  Pedestal calibration
 225       AliRawReader *rawReader = new AliRawReaderDate((void*)event);
 226       if ( fastDecoding ) calibPedestal.ProcessEventFast(rawReader);
 227       else calibPedestal.ProcessEvent(rawReader);
 228       delete rawReader;
 229
 230       /* free resources */
 231       free(event);
 232     }
 233   }
 234
 235   //
 236   // Analyse pedestals and write them to rootfile
 237   //
 238   calibPedestal.Analyse();
 239   calibPedestal.AnalyseTime(nevents);
 240   printf ("%d physics/calibration events processed.\n",nevents);
 241
 242   TFile *fileTPC = new TFile(RESULT_FILE, "recreate");
 243   calibPedestal.Write("tpcCalibPedestal");
 244   delete fileTPC;
 245   printf("Wrote %s.\n",RESULT_FILE);
 246
 247   /* store the result file on FES */
 248   status=daqDA_FES_storeFile(RESULT_FILE,FILE_ID);
 249   if (status) {
 250     status = -2;
 251   }
 252   //
 253   //Send objects to the AMORE DB
 254   //
 255   printf ("AMORE part\n");
 256   const char *amoreDANameorig=gSystem->Getenv("AMORE_DA_NAME");
 257   //cheet a little -- temporary solution (hopefully)
 258   //
 259   //currently amoreDA uses the environment variable AMORE_DA_NAME to create the mysql
 260   //table in which the calib objects are stored. This table is dropped each time AmoreDA
 261   //is initialised. This of course makes a problem if we would like to store different
 262   //calibration entries in the AMORE DB. Therefore in each DA which writes to the AMORE DB
 263   //the AMORE_DA_NAME env variable is overwritten.
 264   const char *role=gSystem->Getenv("DATE_ROLE_NAME");
 265   gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",Form("%s-%s",role,FILE_ID));
 266   //
 267   // end cheet
 268   if ( role ){
 269     TDatime time;
 270     TObjString info(Form("Run: %u; Date: %s",runNb,time.AsString()));
 271
 272     amore::da::AmoreDA amoreDA(amore::da::AmoreDA::kSender);
 273     Int_t status=0;
 274     status+=amoreDA.Send("Pedestals",calibPedestal.GetCalPadPedestal());
 275     status+=amoreDA.Send("Noise",calibPedestal.GetCalPadRMS());
 276     status+=amoreDA.Send("Info",&info);
 277     if ( status )
 278       printf("Waring: Failed to write one of the calib objects to the AMORE database\n");
 279     // reset env var
 280     if (amoreDANameorig) gSystem->Setenv("AMORE_DA_NAME",amoreDANameorig);
 281   } else {
 282     printf ("Warning: environment variable 'AMORE_DA_NAME' not set. Cannot write to the AMORE database\n");
 283   }
 284
 285
 286   if ( !timeAnalysis ){
 287     printf("Skipping ASCII file preparation for local ALTRO configuration, as requested\n");
 288     return status;
 289   }
 290
 291   //
 292   // Now prepare ASCII files for local ALTRO configuration through DDL.
 293   //
 294   ofstream pedfile;
 295   ofstream noisefile;
 296   ofstream pedmemfile;
 297   ofstream noisychannelfile;
 298
 299   char filename[255];
 300   sprintf(filename,"tpcPedestals.data");
 301   pedfile.open(filename);
 302   sprintf(filename,"tpcNoise.data");
 303   noisefile.open(filename);
 304   sprintf(filename,"tpcPedestalMem.data");
 305   pedmemfile.open(filename);
 306   sprintf(filename,"tpcNoisyChannels.data");
 307   noisychannelfile.open(filename);
 308
 309   TArrayF **timePed = calibPedestal.GetTimePedestals();  // pedestal values for each time bin
 310
 311   Int_t ctr_channel = 0;
 312   Int_t ctr_altro   = 0;
 313   Int_t ctr_pattern = 0;
 314   Int_t ctr_noisy   = 0;
 315
 316   pedfile          << 10 << std::endl; // Mark file to contain PEDESTALS per channel
 317   noisefile        << 11 << std::endl; // Mark file to contain NOISE per altro
 318   pedmemfile       << 12 << std::endl; // Mark file to contain PEDESTALs per time bin
 319   noisychannelfile << 14 << std::endl; // Mark file to contain NOISY CHANNELS
 320
 321   for ( Int_t roc = 0; roc < 72; roc++ ) {
 322     if ( !calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc) ) continue;
 323     Int_t side   = mapping->GetSideFromRoc(roc);
 324     Int_t sector = mapping->GetSectorFromRoc(roc);
 325     //printf("Analysing ROC %d (side %d, sector %d) ...\n", roc, side, sector);
 326     Int_t nru = mapping->IsIROC(roc) ? 2 : 4;
 327     for ( int rcu = 0; rcu < nru; rcu++ ) {
 328       Int_t patch = mapping->IsIROC(roc) ? rcu : rcu+2;
 329       for ( int branch = 0; branch < 2; branch++ ) {
 330         for ( int fec = 0; fec < mapping->GetNfec(patch, branch); fec++ ) {
 331           for ( int altro = 0; altro < 8; altro++ ) {
 332             Float_t rms = 0.;
 333             Float_t maxrms = 0.;
 334             Float_t ctr_altrochannel = 0.;
 335             for ( int channel = 0; channel < 16; channel++ ) {
 336               Int_t hwadd     = mapping->CodeHWAddress(branch, fec, altro, channel);
 337               Int_t row       = mapping->GetPadRow(patch, hwadd);        // row in a ROC
 338               Int_t globalrow = mapping->GetGlobalPadRow(patch, hwadd);  // row in full sector
 339               Int_t pad       = mapping->GetPad(patch, hwadd);
 340               Float_t ped     = calibPedestal.GetCalRocPedestal(roc)->GetValue(row,pad);
 341               // fixed pedestal
 342               pedfile << ctr_channel++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << patch << "\t"
 343                   << hwadd << "\t" << ped << std::endl;
 344               // pedestal(t)
 345               if ( timePed && fabs(timePed[globalrow][pad].GetSum()) > 1e-10 ) {
 346                 pedmemfile << ctr_pattern++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << patch
 347                     << "\t" << hwadd;
 348                 for ( Int_t timebin = 0; timebin < 1024; timebin++ )
 349                   pedmemfile << "\t" << timePed[globalrow][pad].At(timebin);
 350                 pedmemfile << std::endl;
 351               }
 352               // rms=noise
 353               Float_t rms2 = calibPedestal.GetCalRocRMS(roc)->GetValue(row,pad);
 354               if ( fabs(ped) < 1.e-10 ) {                        // dead channel
 355                 noisychannelfile << ctr_noisy++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 356                     << patch << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 357               } else if ( (ped > 1.e-10) && (rms2 > 1.e-10) ) {  // not dead
 358               // Find noisy channels
 359                 if ( ((roc<36)             && (rms2 > 2.0))  ||  // IROC
 360                        ((roc>35) && (row<65) && (rms2 > 2.0))  ||  // OROC, small pads
 361                        ((roc>35) && (row>64) && (rms2 > 3.0)) ) {  // OROC, large pads (50% more signal)
 362                   noisychannelfile << ctr_noisy++ << "\t" << side << "\t" << sector << "\t"
 363                       << patch << "\t" << hwadd << "\t" << rms2 << std::endl;
 364                        } else {
 365                        // Not noisy. Get average and maximum noise in this ALTRO
 366                          rms += rms2;
 367                          ctr_altrochannel += 1.;
 368                          if (rms2 > maxrms) maxrms = rms2;
 369                        } // end if noisy
 370               } // end if some signal
 371             } // end channel for loop
 372             Int_t hwadd = mapping->CodeHWAddress(branch, fec, altro, 0);   // ALTRO address
 373       // Noise data (rms) averaged over all channels in this ALTRO.
 374             if ( ctr_altrochannel > 1.e-10 ) {
 375         /*
 376         // average noise of this ALTRO (excluding high-noise channels)
 377               noisefile << ctr_altro << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << patch << "\t"
 378               << hwadd << "\t" << rms/ctr_altrochannel << std::endl;
 379         */
 380         // maximum noise of this ALTRO (excluding high-noise channels)
 381               noisefile << ctr_altro << "\t" << side << "\t" << sector << "\t" << patch << "\t"
 382                   << hwadd << "\t" << maxrms << std::endl;
 383               ctr_altro++;
 384             }
 385           } // end altro for loop
 386         } // end fec for loop
 387       } // end branch for loop
 388     } // end rcu for loop
 389   } // end roc loop
 390
 391   pedfile.close();
 392   noisefile.close();
 393   pedmemfile.close();
 394   noisychannelfile.close();
 395   printf("Wrote ASCII files. Found %d noisy channels.\n", ctr_noisy);
 396
 397   return status;
 398
 399 }