TPC/macros/testTPC/agent.sh

   1 #!/usr/local/bin/bash
   2 #aguments
   3 #1 working directory
   4
   5
   6 # Example usage:
   7 # $ALICE_ROOT/TPC/macros/testTPC/agent.sh /afs/cern.ch/user/m/miranov/public/test2008/reckr191xx
   8
   9 # Or submit as many agents you want on batch machines:
  10 # bsub -q 1nd $ALICE_ROOT/TPC/macros/testTPC/agent.sh /afs/cern.ch/user/m/miranov/public/test2008/reckr191xx
  11
  12 #
  13 #  AGENT to run some action:
  14 #  3 components to be present
  15 #
  16
  17 #  0. CREATE ACTION LIST ( see $ALICE_ROOT/TPC/macros/testTPC/AlienToolkit.cxx)
  18 #
  19
  20 #  1. WORKING DIRECTORY SETUP (in prev. example /afs/cern.ch/user/m/miranov/public/test2008/reckr191xx)
  21 #    1.a  action.list
  22 #    1.b  empty out directory
  23 #    1.c  macros directory -with  <action>.C  - e.g rec.C  FindKrClustersRaw.C
  24
  25
  26 # 2. ENVIRONMENT SETUP:
  27 #
  28 # 2.a  Copy the script  to setup aliroot root to the  ~/.bagentsetup
  29 # 2.b  Export envirnment variables needed OCDB_PATH, AGENTINPUTTYPE, AGENTSE in the .bagentsetup script
  30 # 2.c  Get a valid token: alien-token-init
  31 # 2.d  Copy certificates to default place -  ~/.agentauth/
  32 #      cp /tmp/*$UID* ~/.agentauth/
  33
  34
  35
  36 #
  37 #setup environment
  38 #
  39 #ALIEN -get token
  40 echo xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  41 echo xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  42 echo xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  43 echo ENVIRONMENT
  44 echo ALIEN       - $ALIEN
  45 echo GSHELL_ROOT - $GSHELL_ROOT
  46 echo HOME        - $HOME
  47 echo ALIROOT   =`which aliroot`
  48 echo    ROOT   =`which root`
  49 echo xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  50 echo xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  51 echo xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  52 cp ~/.agentauth/*   /tmp/
  53 source /tmp/gclient_env_$UID
  54 export  PATH=.:${GSHELL_ROOT}/bin:${PATH}.
  55
  56 #aliensh -c ps
  57 #ALIROOT
  58 # test if ~/.bagentsetup exists
  59 if [ ! -f ~/.bagentsetup ]; then
  60   echo "ERROR: '~/.bagentsetup' init script not found\!"
  61   exit 1
  62 fi
  63
  64 source ~/.bagentsetup
  65 echo xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  66 echo ENVIRONMENT
  67 echo ALIROOT   =`which aliroot`
  68 echo    ROOT   =`which root`
  69 echo xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx
  70
  71
  72 #chek env
  73 if [ "x$AGENTINPUTTYPE" == "x" ]; then
  74   echo "WARNING: environment variable 'AGENTINPUTTYPE' falling back to default (castor)\!\!"
  75   export     AGENTINPUTTYPE=2
  76 fi
  77 if [ "x$OCDB_PATH" == "x" ]; then
  78   echo "WARNING: environment variable 'OCDB_PATH' falling back to default (local:///afs/cern.ch/alice/tpctest/OCDB)\!\!"
  79   export     OCDB_PATH=local:///afs/cern.ch/alice/tpctest/OCDB
  80 fi
  81 if [ "x$AGENTSE" == "x" ]; then
  82   echo "WARNUNG: environment variable 'AGENTSE' falling back to default (ALICE::CERN::SE)\!\!"
  83   export     AGENTSE=ALICE::CERN::SE
  84 fi
  85
  86 #
  87 #
  88 echo OPERATING SYSTEM
  89 uname -a
  90 #export workdir
  91 export jobhome=`pwd`
  92
  93 #cd to workdir and check for 'macros' and 'out' dir
  94 cd $1
  95 if [ ! -d macros ]; then
  96   echo "ERROR: no 'macros' dir in '$1'. Does it exist?"
  97   exit 1
  98 fi
  99 if [ ! -d out ]; then
 100   echo "ERROR: no 'out' dir in '$1'. Does it exist?"
 101   exit 1
 102 fi
 103
 104 # check if we are able to write to this dir, the alien SE, can readback from the alien SE and delete stuff
 105 touch agend_alien_tst$HOSTNAME.txt || exit 1
 106 date >> agend_alien_tst$HOSTNAME.txt
 107 #copy to alien
 108 alien_cp -dn agend_alien_tst$HOSTNAME.txt alien:${alien_HOME}agend_alien_tst$HOSTNAME.txt@$AGENTSE
 109
 110 #see if it is there
 111 res=`alien_ls ${alien_HOME}agend_alien_tst$HOSTNAME.txt | grep agend_alien_tst`
 112 if [ "x$res" == "x" ]; then
 113   echo "ERROR: could not write on storage element '$AGENTSE'"
 114   exit 1
 115 fi
 116
 117 #copy back
 118 alien_cp -n alien:${alien_HOME}agend_alien_tst$HOSTNAME.txt agend_alien_tst_back.txt
 119 res=`diff agend_alien_tst$HOSTNAME.txt agend_alien_tst_back.txt`
 120 if [ "x$res" != "x" ]; then
 121   echo "ERROR: problems reading from storage element '$AGENTSE'"
 122   exit 1
 123 fi
 124
 125 #try to delete from alien
 126 res=`alien_rm -d ${alien_HOME}agend_alien_tst$HOSTNAME.txt`
 127 if [ "x$res" != "x" ]; then
 128   echo "ERROR: cannot delete from storage element '$AGENTSE'"
 129   exit 1
 130 fi
 131
 132 #try to delete local files
 133 res=`rm agend_alien_tst*`
 134 if [ "x$res" != "x" ]; then
 135   echo "ERROR: cannot delete local files"
 136   exit 1
 137 fi
 138
 139 echo Current Dir
 140 pwd
 141
 142 aliroot -b -q $ALICE_ROOT/TPC/macros/testTPC/AliTPCjobs.cxx+
 143
 144 #alien_cp -d job.list alien:${alien_HOME}job.list@$AGENTSE
 145