TRD/AliTRDarrayADC.cxx

   1 /*************************************************************************
   2 * Copyright(c) 1998-2008, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3 *                                                                        *
   4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6 *                                                                        *
   7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id: AliTRDarrayADC.cxx 25392 2008-04-23 19:40:29Z cblume $ */
  17
  18 ////////////////////////////////////////////////////////
  19 //                                                    //
  20 // Container class for ADC values                     //
  21 //                                                    //
  22 // Author:                                            //
  23 // Hermes Leon Vargas  (hleon@ikf.uni-frankfurt.de)   //
  24 //                                                    //
  25 ////////////////////////////////////////////////////////
  26
  27 #include "AliTRDarrayADC.h"
  28 #include "Cal/AliTRDCalPadStatus.h"
  29 #include "AliTRDfeeParam.h"
  30 #include "AliTRDSignalIndex.h"
  31 ClassImp(AliTRDarrayADC)
  32
  33 Short_t *AliTRDarrayADC::fgLutPadNumbering = 0x0;
  34
  35 //____________________________________________________________________________________
  36 AliTRDarrayADC::AliTRDarrayADC()
  37                :TObject()
  38                ,fNdet(0)
  39                ,fNrow(0)
  40                ,fNcol(0)
  41                ,fNumberOfChannels(0)
  42                ,fNtime(0)
  43                ,fNAdim(0)
  44                ,fADC(0)
  45 {
  46   //
  47   // AliTRDarrayADC default constructor
  48   //
  49
  50   CreateLut();
  51
  52 }
  53
  54 //____________________________________________________________________________________
  55 AliTRDarrayADC::AliTRDarrayADC(Int_t nrow, Int_t ncol, Int_t ntime)
  56                :TObject()
  57                ,fNdet(0)
  58                ,fNrow(0)
  59                ,fNcol(0)
  60                ,fNumberOfChannels(0)
  61                ,fNtime(0)
  62                ,fNAdim(0)
  63                ,fADC(0)
  64 {
  65   //
  66   // AliTRDarrayADC constructor
  67   //
  68
  69   CreateLut();
  70   Allocate(nrow,ncol,ntime);
  71
  72 }
  73
  74 //____________________________________________________________________________________
  75 AliTRDarrayADC::AliTRDarrayADC(const AliTRDarrayADC &b)
  76                :TObject()
  77                ,fNdet(b.fNdet)
  78                ,fNrow(b.fNrow)
  79                ,fNcol(b.fNcol)
  80                ,fNumberOfChannels(b.fNumberOfChannels)
  81                ,fNtime(b.fNtime)
  82                ,fNAdim(b.fNAdim)
  83                ,fADC(0)
  84 {
  85   //
  86   // AliTRDarrayADC copy constructor
  87   //
  88
  89   fADC =  new Short_t[fNAdim];
  90   memcpy(fADC,b.fADC, fNAdim*sizeof(Short_t));
  91
  92 }
  93
  94 //____________________________________________________________________________________
  95 AliTRDarrayADC::~AliTRDarrayADC()
  96 {
  97   //
  98   // AliTRDarrayADC destructor
  99   //
 100
 101   if(fADC)
 102     {
 103       delete [] fADC;
 104       fADC=0;
 105     }
 106
 107 }
 108
 109 //____________________________________________________________________________________
 110 AliTRDarrayADC &AliTRDarrayADC::operator=(const AliTRDarrayADC &b)
 111 {
 112   //
 113   // Assignment operator
 114   //
 115
 116   if(this==&b)
 117     {
 118       return *this;
 119     }
 120   if(fADC)
 121     {
 122       delete [] fADC;
 123     }
 124   fNdet=b.fNdet;
 125   fNrow=b.fNrow;
 126   fNcol=b.fNcol;
 127   fNumberOfChannels = b.fNumberOfChannels;
 128   fNtime=b.fNtime;
 129   fNAdim=b.fNAdim;
 130   fADC = new Short_t[fNAdim];
 131   memcpy(fADC,b.fADC, fNAdim*sizeof(Short_t));
 132
 133   return *this;
 134
 135 }
 136
 137 //____________________________________________________________________________________
 138 void AliTRDarrayADC::Allocate(Int_t nrow, Int_t ncol, Int_t ntime)
 139 {
 140   //
 141   // Allocate memory for an AliTRDarrayADC array with dimensions
 142   // Row*NumberOfNecessaryMCMs*ADCchannelsInMCM*Time
 143   //
 144
 145   fNrow=nrow;
 146   fNcol=ncol;
 147   fNtime=ntime;
 148   Int_t adcchannelspermcm = AliTRDfeeParam::GetNadcMcm();
 149   Int_t padspermcm = AliTRDfeeParam::GetNcolMcm();
 150   Int_t numberofmcms = fNcol/padspermcm;
 151   fNumberOfChannels = numberofmcms*adcchannelspermcm;
 152   fNAdim=nrow*fNumberOfChannels*ntime;
 153
 154   if(fADC)
 155     {
 156       delete [] fADC;
 157     }
 158
 159   fADC = new Short_t[fNAdim];
 160   memset(fADC,0,sizeof(Short_t)*fNAdim);
 161
 162 }
 163
 164 //____________________________________________________________________________________
 165 Short_t AliTRDarrayADC::GetDataBits(Int_t row, Int_t col, Int_t time) const
 166 {
 167   //
 168   // Get the ADC value for a given position: row, col, time
 169   // Taking bit masking into account
 170   //
 171   // Adapted from code of the class AliTRDdataArrayDigits
 172   //
 173
 174   Short_t tempval = GetData(row,col,time);
 175   // Be aware of manipulations introduced by pad masking in the RawReader
 176   // Only output the manipulated Value
 177   CLRBIT(tempval, 10);
 178   CLRBIT(tempval, 11);
 179   CLRBIT(tempval, 12);
 180   return tempval;
 181
 182 }
 183
 184 //____________________________________________________________________________________
 185 UChar_t AliTRDarrayADC::GetPadStatus(Int_t row, Int_t col, Int_t time) const
 186 {
 187   //
 188   // Returns the pad status stored in the pad signal
 189   //
 190   // Output is a UChar_t value
 191   // Status Codes:
 192   //               Noisy Masking:           2
 193   //               Bridged Left Masking     8
 194   //               Bridged Right Masking    8
 195   //               Not Connected Masking Digits
 196   //
 197   // Adapted from code of the class AliTRDdataArrayDigits
 198   //
 199
 200   UChar_t padstatus = 0;
 201   Short_t signal = GetData(row,col,time);
 202   if(signal > 0 && TESTBIT(signal, 10)){
 203     if(TESTBIT(signal, 11))
 204       if(TESTBIT(signal, 12))
 205         padstatus = AliTRDCalPadStatus::kPadBridgedRight;
 206       else
 207         padstatus = AliTRDCalPadStatus::kNotConnected;
 208     else
 209       if(TESTBIT(signal, 12))
 210         padstatus = AliTRDCalPadStatus::kPadBridgedLeft;
 211       else
 212         padstatus = AliTRDCalPadStatus::kMasked;
 213   }
 214
 215   return padstatus;
 216
 217 }
 218
 219 //____________________________________________________________________________________
 220 void AliTRDarrayADC::SetPadStatus(Int_t row, Int_t col, Int_t time, UChar_t status)
 221 {
 222   //
 223   // Setting the pad status into the signal using the Bits 10 to 14
 224   // (currently used: 10 to 12)
 225   //
 226   // Input codes (Unsigned char):
 227   //               Noisy Masking:           2
 228   //               Bridged Left Masking     8
 229   //               Bridged Right Masking    8
 230   //               Not Connected Masking    32
 231   //
 232   // Status codes: Any masking:             Bit 10(1)
 233   //               Noisy masking:           Bit 11(0), Bit 12(0)
 234   //               No Connection masking:   Bit 11(1), Bit 12(0)
 235   //               Bridged Left masking:    Bit 11(0), Bit 12(1)
 236   //               Bridged Right masking:   Bit 11(1), Bit 12(1)
 237   //
 238   // Adapted from code of the class AliTRDdataArrayDigits
 239   //
 240
 241   Short_t signal = GetData(row,col,time);
 242
 243   // Only set the Pad Status if the signal is > 0
 244   if(signal > 0)
 245     {
 246       switch(status)
 247         {
 248         case AliTRDCalPadStatus::kMasked:
 249           SETBIT(signal, 10);
 250           CLRBIT(signal, 11);
 251           CLRBIT(signal, 12);
 252           break;
 253         case AliTRDCalPadStatus::kNotConnected:
 254           SETBIT(signal, 10);
 255           SETBIT(signal, 11);
 256           CLRBIT(signal, 12);
 257           break;
 258         case AliTRDCalPadStatus::kPadBridgedLeft:
 259           SETBIT(signal, 10);
 260           CLRBIT(signal, 11);
 261           SETBIT(signal, 12);
 262           break;
 263         case AliTRDCalPadStatus::kPadBridgedRight:
 264           SETBIT(signal, 10);
 265           SETBIT(signal, 11);
 266           SETBIT(signal, 12);
 267         default:
 268           CLRBIT(signal, 10);
 269           CLRBIT(signal, 11);
 270           CLRBIT(signal, 12);
 271         }
 272       SetData(row, col, time, signal);
 273     }
 274
 275 }
 276
 277 //____________________________________________________________________________________
 278 Bool_t AliTRDarrayADC::IsPadCorrupted(Int_t row, Int_t col, Int_t time)
 279 {
 280   //
 281   // Checks if the pad has any masking as corrupted (Bit 10 in signal set)
 282   //
 283   // Adapted from code of the class AliTRDdataArrayDigits
 284   //
 285
 286   Short_t signal = GetData(row,col,time);
 287   return (signal > 0 && TESTBIT(signal, 10)) ? kTRUE : kFALSE;
 288
 289 }
 290
 291 //____________________________________________________________________________________
 292 void AliTRDarrayADC::Compress()
 293 {
 294   //
 295   // Compress the array
 296   //
 297
 298   Int_t counter=0;
 299   Int_t newDim=0;
 300   Int_t j;
 301   Int_t l;
 302   Int_t r=0;
 303   Int_t s=0;
 304   Int_t *longm;
 305   longm = new Int_t[fNAdim];
 306   Int_t *longz;
 307   longz = new Int_t[fNAdim];
 308   Int_t k=0;
 309   memset(longz,0,sizeof(Int_t)*fNAdim);
 310   memset(longm,0,sizeof(Int_t)*fNAdim);
 311
 312   for(Int_t i=0;i<fNAdim; i++)
 313     {
 314       j=0;
 315       if(fADC[i]==-1)
 316         {
 317           for(k=i;k<fNAdim;k++)
 318             {
 319               if((fADC[k]==-1)&&(j<16000))
 320                 {
 321                   j=j+1;
 322                   longm[r]=j;
 323                 }
 324               else
 325                 {
 326                   break;
 327                 }
 328             }
 329           r=r+1;
 330         }
 331       l=16001;
 332       if(fADC[i]==0)
 333         {
 334           for(k=i;k<fNAdim;k++)
 335             {
 336               if((fADC[k]==0)&&(l<32767))
 337                 {
 338                   l=l+1;
 339                   longz[s]=l;
 340                 }
 341               else
 342                 {
 343                   break;
 344                 }
 345             }
 346           s=s+1;
 347         }
 348       if(fADC[i]>0)
 349         {
 350           i=i+1;
 351         }
 352       i=i+j+(l-16001-1);
 353     }
 354
 355   //Calculate the size of the compressed array
 356   for(Int_t i=0; i<fNAdim;i++)
 357     {
 358       if(longm[i]!=0)
 359         {
 360           counter=counter+longm[i]-1;
 361         }
 362       if(longz[i]!=0)
 363         {
 364           counter=counter+(longz[i]-16001)-1;
 365         }
 366     }
 367   newDim = fNAdim-counter;   //Dimension of the compressed array
 368   Short_t* buffer;
 369   buffer = new Short_t[newDim];
 370   Int_t counterTwo=0;
 371
 372   //Fill the buffer of the compressed array
 373   Int_t g=0;
 374   Int_t h=0;
 375   for(Int_t i=0; i<newDim; i++)
 376     {
 377       if(counterTwo<fNAdim)
 378         {
 379           if(fADC[counterTwo]>0)
 380             {
 381               buffer[i]=fADC[counterTwo];
 382             }
 383           if(fADC[counterTwo]==-1)
 384             {
 385               buffer[i]=-(longm[g]);
 386               counterTwo=counterTwo+longm[g]-1;
 387               g++;
 388             }
 389           if(fADC[counterTwo]==0)
 390             {
 391               buffer[i]=-(longz[h]);
 392               counterTwo=counterTwo+(longz[h]-16001)-1;
 393               h++;
 394             }
 395           counterTwo++;
 396         }
 397     }
 398
 399   //Copy the buffer
 400   if(fADC)
 401     {
 402       delete [] fADC;
 403       fADC=0;
 404     }
 405   fADC = new Short_t[newDim];
 406   fNAdim = newDim;
 407   for(Int_t i=0; i<newDim; i++)
 408     {
 409       fADC[i] = buffer[i];
 410     }
 411
 412   //Delete auxiliary arrays
 413   if(buffer)
 414     {
 415       delete [] buffer;
 416       buffer=0;
 417     }
 418   if(longz)
 419     {
 420       delete [] longz;
 421       longz=0;
 422     }
 423   if(longm)
 424     {
 425       delete [] longm;
 426       longm=0;
 427     }
 428
 429 }
 430
 431 //____________________________________________________________________________________
 432 void AliTRDarrayADC::Expand()
 433 {
 434   //
 435   // Expand the array
 436   //
 437
 438   //Check if the array has not been already expanded
 439   Int_t verif=0;
 440   for(Int_t i=0; i<fNAdim; i++)
 441     {
 442       if(fADC[i]<-1)
 443         {
 444           verif++;
 445         }
 446     }
 447
 448   if(verif==0)
 449     {
 450       //       AliDebug(1,"Nothing to expand");
 451       return;
 452     }
 453
 454   Int_t *longz;
 455   longz = new Int_t[fNAdim];
 456   Int_t *longm;
 457   longm = new Int_t[fNAdim];
 458   Int_t dimexp=0;
 459   //Initialize arrays
 460   memset(longz,0,sizeof(Int_t)*fNAdim);
 461   memset(longm,0,sizeof(Int_t)*fNAdim);
 462   Int_t r2=0;
 463   Int_t r3=0;
 464   for(Int_t i=0; i<fNAdim;i++)
 465     {
 466       if((fADC[i]<0)&&(fADC[i]>=-16000))
 467         {
 468           longm[r2]=-fADC[i];
 469           r2++;
 470         }
 471       if(fADC[i]<-16000)
 472         {
 473           longz[r3]=-fADC[i]-16001;
 474           r3++;
 475         }
 476     }
 477   //Calculate the new dimensions of the array
 478   for(Int_t i=0; i<fNAdim;i++)
 479     {
 480       if(longm[i]!=0)
 481         {
 482           dimexp=dimexp+longm[i]-1;
 483         }
 484       if(longz[i]!=0)
 485         {
 486           dimexp=dimexp+longz[i]-1;
 487         }
 488     }
 489   dimexp=dimexp+fNAdim;
 490
 491   //Write in the buffer the new array
 492   Short_t* bufferE;
 493   bufferE = new Short_t[dimexp];
 494   Int_t contaexp =0;
 495   Int_t h=0;
 496   Int_t l=0;
 497   for(Int_t i=0; i<dimexp; i++)
 498     {
 499       if(fADC[contaexp]>0)
 500         {
 501           bufferE[i]=fADC[contaexp];
 502         }
 503
 504       if((fADC[contaexp]<0)&&(fADC[contaexp]>=-16000))
 505         {
 506           for(Int_t j=0; j<longm[h];j++)
 507             {
 508               bufferE[i+j]=-1;
 509             }
 510           i=i+longm[h]-1;
 511           h++;
 512         }
 513       if(fADC[contaexp]<-16000)
 514         {
 515           for(Int_t j=0; j<longz[l];j++)
 516             {
 517               bufferE[i+j]=0;
 518             }
 519           i=i+longz[l]-1;
 520           l++;
 521         }
 522       contaexp++;
 523     }
 524   //Copy the buffer
 525   if(fADC)
 526     {
 527       delete [] fADC;
 528       fADC=0;
 529     }
 530
 531   fADC = new Short_t[dimexp];
 532   fNAdim = dimexp;
 533   for(Int_t i=0; i<dimexp; i++)
 534     {
 535       fADC[i] = bufferE[i];
 536     }
 537
 538   //Delete auxiliary arrays
 539   if(bufferE) delete [] bufferE;
 540   if(longm) delete [] longm;
 541   if(longz) delete [] longz;
 542
 543 }
 544 //____________________________________________________________________________________
 545 void AliTRDarrayADC::DeleteNegatives()
 546 {
 547
 548   //
 549   //This method modifies the digits array, changing the negative values (-1)
 550   //Produced during digitization into zero.
 551   //
 552
 553   for(Int_t a=0; a<fNAdim; a++)
 554     {
 555       if(fADC[a]==-1)
 556         {
 557           fADC[a]=0;
 558         }
 559     }
 560 }
 561 //________________________________________________________________________________
 562 void AliTRDarrayADC::Reset()
 563 {
 564   //
 565   // Reset the array, the old contents are deleted
 566   // The array keeps the same dimensions as before
 567   //
 568
 569   memset(fADC,0,sizeof(Short_t)*fNAdim);
 570 }
 571 //________________________________________________________________________________
 572 void AliTRDarrayADC::ConditionalReset(AliTRDSignalIndex* idx)
 573 {
 574   //
 575   // Reset the array, the old contents are deleted
 576   // The array keeps the same dimensions as before
 577   //
 578
 579   if(idx->GetNoOfIndexes()>25)
 580     memset(fADC,0,sizeof(Short_t)*fNAdim);
 581   else
 582     {
 583       Int_t row, col;
 584       while(idx->NextRCIndex(row, col)){
 585         Int_t colnumb = fgLutPadNumbering[col];
 586         memset(&fADC[(row*fNumberOfChannels+colnumb)*fNtime],0,fNtime);
 587       }
 588     }
 589
 590 }
 591
 592 //________________________________________________________________________________
 593 void AliTRDarrayADC::CreateLut()
 594 {
 595   //
 596   // Initializes the Look Up Table to relate
 597   // pad numbering and mcm channel numbering
 598   //
 599
 600   if(fgLutPadNumbering)  return;
 601
 602    fgLutPadNumbering = new Short_t[AliTRDfeeParam::GetNcol()];
 603    memset(fgLutPadNumbering,0,sizeof(Short_t)*AliTRDfeeParam::GetNcol());
 604
 605   for(Int_t mcm=0; mcm<8; mcm++)
 606     {
 607       Int_t lowerlimit=0+mcm*18;
 608       Int_t upperlimit=18+mcm*18;
 609       Int_t shiftposition = 1+3*mcm;
 610       for(Int_t index=lowerlimit;index<upperlimit;index++)
 611         {
 612           fgLutPadNumbering[index]=index+shiftposition;
 613         }
 614     }
 615 }