TRD/AliTRDchamberTimeBin.cxx

   1 /**************************************************************************
   2 * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3 *                                                                        *
   4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6 *                                                                        *
   7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14 **************************************************************************/
  15
  16 /* $Id: AliTRDchamberTimeBin.cxx 23313 2008-01-11 14:56:43Z cblume $ */
  17
  18 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  19 //                                                                           //
  20 //  Organization of clusters at the level of 1 TRD chamber.                  //
  21 //  The data structure is used for tracking at the stack level.              //
  22 //                                                                           //
  23 //  Functionalities:                                                         //
  24 //   1. cluster organization and sorting                                     //
  25 //   2. fast data navigation                                                 //
  26 //                                                                           //
  27 //  Authors:                                                                 //
  28 //    Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>                                        //
  29 //    Markus Fasel <M.Fasel@gsi.de>                                          //
  30 //                                                                           //
  31 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
  32
  33 #include <TObject.h>
  34 #include <TROOT.h>
  35 #include <TMath.h>
  36 #include <TStopwatch.h>
  37 #include <TTreeStream.h>
  38
  39 #include "AliLog.h"
  40
  41 #include "AliTRDgeometry.h"
  42 #include "AliTRDpadPlane.h"
  43 #include "AliTRDchamberTimeBin.h"
  44 #include "AliTRDrecoParam.h"
  45 #include "AliTRDReconstructor.h"
  46 #include "AliTRDtrackerV1.h"
  47
  48
  49 ClassImp(AliTRDchamberTimeBin)
  50
  51 //_____________________________________________________________________________
  52 AliTRDchamberTimeBin::AliTRDchamberTimeBin(Int_t plane, Int_t stack, Int_t sector, Double_t z0, Double_t zLength)
  53   :TObject()
  54   ,fReconstructor(0x0)
  55   ,fPlane(plane)
  56   ,fStack(stack)
  57   ,fSector(sector)
  58   ,fNRows(kMaxRows)
  59   ,fN(0)
  60   ,fX(0.)
  61   ,fZ0(z0)
  62   ,fZLength(zLength)
  63 {
  64   //
  65   // Default constructor (Only provided to use AliTRDchamberTimeBin with arrays)
  66   //
  67   SetBit(kT0, kFALSE);
  68   SetBit(kOwner, kFALSE);
  69   memset(fPositions, 1, kMaxRows*sizeof(UChar_t));
  70   memset(fClusters, 0, kMaxClustersLayer*sizeof(AliTRDcluster*));
  71   memset(fIndex, 1, kMaxClustersLayer*sizeof(UInt_t));
  72 }
  73
  74
  75 //_____________________________________________________________________________
  76 AliTRDchamberTimeBin::AliTRDchamberTimeBin(const AliTRDchamberTimeBin &layer):
  77   TObject()
  78   ,fReconstructor(layer.fReconstructor)
  79   ,fPlane(layer.fPlane)
  80   ,fStack(layer.fStack)
  81   ,fSector(layer.fSector)
  82   ,fNRows(layer.fNRows)
  83   ,fN(layer.fN)
  84   ,fX(layer.fX)
  85   ,fZ0(layer.fZ0)
  86   ,fZLength(layer.fZLength)
  87 {
  88 // Copy Constructor
  89
  90   SetBit(kT0, layer.IsT0());
  91   SetBit(kOwner, kFALSE);
  92   for(int i=0; i<kMaxRows; i++) fPositions[i] = layer.fPositions[i];
  93   memcpy(&fClusters[0], &layer.fClusters[0], kMaxClustersLayer*sizeof(AliTRDcluster*));
  94   memcpy(&fIndex[0], &layer.fIndex[0], kMaxClustersLayer*sizeof(UInt_t));
  95
  96
  97 //      BuildIndices();
  98 }
  99
 100 //_____________________________________________________________________________
 101 AliTRDchamberTimeBin &AliTRDchamberTimeBin::operator=(const AliTRDchamberTimeBin &layer)
 102 {
 103 // Assignment operator
 104
 105   if (this != &layer) layer.Copy(*this);
 106   return *this;
 107 }
 108
 109 //_____________________________________________________________________________
 110 void AliTRDchamberTimeBin::Clear(const Option_t *)
 111 {
 112   for(AliTRDcluster **cit = &fClusters[0]; (*cit); cit++){
 113     if(IsOwner()) delete (*cit);
 114     (*cit) = NULL;
 115   }
 116   fN = 0;
 117 }
 118
 119 //_____________________________________________________________________________
 120 void AliTRDchamberTimeBin::Copy(TObject &o) const
 121 {
 122 // Copy method. Performs a deep copy of all data from this object to object o.
 123
 124   AliTRDchamberTimeBin &layer = (AliTRDchamberTimeBin &)o;
 125   layer.fReconstructor = fReconstructor;
 126   layer.fPlane       = fPlane;
 127   layer.fStack       = fStack;
 128   layer.fSector      = fSector;
 129   layer.fNRows       = fNRows;
 130   layer.fN           = fN;
 131   layer.fX           = fX;
 132   layer.fZ0          = fZ0;
 133   layer.fZLength     = fZLength;
 134   layer.SetT0(IsT0());
 135   layer.SetBit(kOwner, kFALSE);
 136
 137   for(int i=0; i<kMaxRows; i++) layer.fPositions[i] = fPositions[i];
 138   memcpy(&layer.fClusters[0], &fClusters[0], kMaxClustersLayer*sizeof(AliTRDcluster*));
 139   memcpy(&layer.fIndex[0], &fIndex[0], kMaxClustersLayer*sizeof(UInt_t));
 140
 141   TObject::Copy(layer); // copies everything into layer
 142
 143 //      layer.BuildIndices();
 144 }
 145
 146 //_____________________________________________________________________________
 147 AliTRDchamberTimeBin::~AliTRDchamberTimeBin()
 148 {
 149 // Destructor
 150   if(IsOwner()){
 151     for(AliTRDcluster **cit = &fClusters[0]; (*cit); cit++) delete (*cit);
 152   }
 153 }
 154
 155 //_____________________________________________________________________________
 156 void  AliTRDchamberTimeBin::SetOwner(Bool_t copy)
 157 {
 158 // Sets the ownership of the clusters to this
 159 // If option "copy" is kTRUE [default] the clusters
 160 // are also copied otherwise only the ownership bit
 161 // is flipped.
 162
 163   SetBit(kOwner, kTRUE);
 164   if(!copy) return;
 165   for(AliTRDcluster **cit = &fClusters[0]; (*cit); ++cit){
 166     (*cit) = new AliTRDcluster(*(*cit));
 167   }
 168 }
 169
 170 //_____________________________________________________________________________
 171 void AliTRDchamberTimeBin::SetRange(Float_t z0, Float_t zLength)
 172 {
 173 // Sets the range in z-direction
 174 //
 175 // Parameters:
 176 //   z0      : starting position of layer in the z direction
 177 //   zLength : length of layer in the z direction
 178
 179   fZ0 = (z0 <= z0 + zLength) ? z0 : z0 + zLength;
 180   fZLength = TMath::Abs(zLength);
 181 }
 182
 183 //_____________________________________________________________________________
 184 void AliTRDchamberTimeBin::InsertCluster(AliTRDcluster *c, UInt_t index)
 185 {
 186   //
 187   // Insert cluster in cluster array.
 188   // Clusters are sorted according to Y coordinate.
 189   //
 190
 191   //if (fTimeBinIndex < 0) {
 192     //AliWarning("Attempt to insert cluster into non-sensitive time bin!\n");
 193     //return;
 194   //}
 195
 196   if (fN == (Int_t) kMaxClustersLayer) {
 197     //AliWarning("Too many clusters !\n");
 198     return;
 199   }
 200
 201   if (fN == 0) {
 202     fIndex[0]       = index;
 203     fClusters[fN++] = c;
 204     return;
 205   }
 206
 207   Int_t i = Find(c->GetY());
 208   memmove(fClusters+i+1,fClusters+i,(fN-i)*sizeof(AliTRDcluster*));
 209   memmove(fIndex   +i+1,fIndex   +i,(fN-i)*sizeof(UInt_t));
 210   fIndex[i]    = index;
 211   fClusters[i] = c;
 212   fN++;
 213 }
 214
 215 //___________________________________________________
 216 void AliTRDchamberTimeBin::Bootstrap(const AliTRDReconstructor *rec, Int_t det)
 217 {
 218 // Reinitialize all data members from the clusters array
 219 // It has to be used after reading from disk
 220
 221   fReconstructor = rec;
 222   fPlane  = AliTRDgeometry::GetLayer(det);
 223   fStack  = AliTRDgeometry::GetStack(det);
 224   fSector = AliTRDgeometry::GetSector(det);
 225   AliTRDgeometry g;
 226   fNRows  = g.GetPadPlane(fPlane, fStack)->GetNrows();
 227   fN = 0;
 228   for(AliTRDcluster **cit = &fClusters[0]; (*cit); cit++) fN++;
 229   BuildIndices();
 230 }
 231
 232 //_____________________________________________________________________________
 233 void AliTRDchamberTimeBin::BuildIndices(Int_t iter)
 234 {
 235 // Rearrangement of the clusters belonging to the propagation layer for the stack.
 236 //
 237 // Detailed description
 238 //
 239 // The array indices of all clusters in one PropagationLayer are stored in
 240 // array. The array is divided into several bins.
 241 // The clusters are sorted in increasing order of their y coordinate.
 242 //
 243 // Sorting algorithm: TreeSearch
 244 //
 245
 246   if(!fN) return;
 247
 248   // Select clusters that belong to the Stack
 249   Int_t nClStack = 0;                                   // Internal counter
 250   for(Int_t i = 0; i < fN; i++){
 251     if(fClusters[i]->IsUsed()){
 252       fClusters[i] = 0x0;
 253       fIndex[i] = 0xffff;
 254     } else nClStack++;
 255   }
 256   if(nClStack > kMaxClustersLayer) AliWarning(Form("Number of clusters in stack %d exceed buffer size %d. Truncating.", nClStack, kMaxClustersLayer));
 257
 258   // Nothing in this time bin. Reset indexes
 259   if(!nClStack){
 260     fN = 0;
 261     memset(&fPositions[0], 0xff, sizeof(UChar_t) * kMaxRows);
 262     memset(&fClusters[0], 0x0, sizeof(AliTRDcluster*) * kMaxClustersLayer);
 263     memset(&fIndex[0], 0xffff, sizeof(UInt_t) * kMaxClustersLayer);
 264     return;
 265   }
 266
 267   // Make a copy
 268   AliTRDcluster *helpCL[kMaxClustersLayer];
 269   UInt_t helpInd[kMaxClustersLayer];
 270   nClStack = 0;
 271   // Defining iterators
 272   AliTRDcluster **fcliter = &fClusters[0], **hcliter = &helpCL[0]; UInt_t *finditer = &fIndex[0], *hinditer = &helpInd[0];
 273   AliTRDcluster *tmpcl = 0x0;
 274   for(Int_t i = 0; i < TMath::Min(fN, kMaxClustersLayer); i++){
 275     if(!(tmpcl = *(fcliter++))){
 276         finditer++;
 277         continue;
 278     }
 279     *(hcliter++)  = tmpcl;
 280     *(hinditer++) = *finditer;
 281     tmpcl = 0x0;
 282     *(finditer++) = 0xffff;
 283     nClStack++;
 284   }
 285
 286   // do clusters arrangement
 287   fX = 0.;
 288   fN =  nClStack;
 289   nClStack = 0;
 290   // Reset Positions array
 291   memset(fPositions, 0, sizeof(UChar_t)*kMaxRows);
 292   AliTRDcluster **cliter = &helpCL[0]; // Declare iterator running over the whole array
 293   for(Int_t i = 0; i < fN; i++){
 294     // boundary check
 295     AliTRDcluster *cl = *(cliter++);
 296     UChar_t rowIndex = cl->GetPadRow();
 297     // Insert Leaf
 298     Int_t pos = FindYPosition(cl->GetY(), rowIndex, i);
 299     if(pos == -1){              // zbin is empty;
 300       Int_t upper = (rowIndex == fNRows - 1) ? nClStack : fPositions[rowIndex + 1];
 301       memmove(fClusters + upper + 1, fClusters + upper, (sizeof(AliTRDcluster *))*(nClStack-upper));
 302       memmove(fIndex + upper + 1, fIndex + upper, (sizeof(UInt_t))*(nClStack-upper));
 303       fClusters[upper] = cl;
 304       fIndex[upper] = helpInd[i];
 305       // Move All pointer one position back
 306       for(UChar_t j = rowIndex + 1; j < fNRows; j++) fPositions[j]++;
 307       nClStack++;
 308     } else {            // zbin not empty
 309       memmove(fClusters + pos + 2, fClusters + pos+1, (sizeof(AliTRDcluster *))*(nClStack-(pos+1)));
 310       memmove(fIndex + pos + 2, fIndex + pos+1, (sizeof(UInt_t))*(nClStack-(pos+1)));
 311       fClusters[pos + 1] = cl;  //fIndex[i];
 312       fIndex[pos + 1] = helpInd[i];
 313       // Move All pointer one position back
 314       for(UChar_t j = rowIndex + 1; j < fNRows; j++) fPositions[j]++;
 315       nClStack++;
 316     }
 317
 318     // calculate mean x
 319     fX += cl->GetX();
 320
 321     // Debug Streaming
 322     if(fReconstructor->GetStreamLevel(AliTRDReconstructor::kTracker) >= 3){
 323       TTreeSRedirector &cstream = *AliTRDtrackerV1::DebugStreamer();
 324       cstream << "BuildIndices"
 325       << "Plane="    << fPlane
 326       << "Stack="    << fStack
 327       << "Sector="   << fSector
 328       << "Iter="     << iter
 329       << "C.="       << cl
 330       << "rowIndex=" << rowIndex
 331       << "\n";
 332     }
 333   }
 334
 335 //      AliInfo("Positions");
 336 //      for(int ir=0; ir<fNRows; ir++) printf("pos[%d] %d\n", ir, fPositions[ir]);
 337
 338   fX /= fN;
 339 }
 340
 341 //_____________________________________________________________________________
 342 Int_t AliTRDchamberTimeBin::Find(Float_t y) const
 343 {
 344   //
 345   // Returns index of the cluster nearest in Y
 346   //
 347
 348   if (fN <= 0) return 0;
 349
 350   if (y <= fClusters[0]->GetY()) return 0;
 351
 352   if (y >  fClusters[fN-1]->GetY()) return fN;
 353
 354
 355   Int_t b = 0;
 356   Int_t e = fN - 1;
 357   Int_t m = (b + e) / 2;
 358
 359   for ( ; b < e; m = (b + e) / 2) {
 360     if (y > fClusters[m]->GetY()) b = m + 1;
 361     else e = m;
 362   }
 363
 364   return m;
 365 }
 366
 367 //_____________________________________________________________________________
 368 Int_t AliTRDchamberTimeBin::FindYPosition(Double_t y, UChar_t z, Int_t nClusters) const
 369 {
 370 //
 371 // Tree search Algorithm to find the nearest left cluster for a given
 372 // y-position in a certain z-bin (in fact AVL-tree).
 373 // Making use of the fact that clusters are sorted in y-direction.
 374 //
 375 // Parameters:
 376 //   y : y position of the reference point in tracking coordinates
 377 //   z : z reference bin.
 378 //   nClusters :
 379 //
 380 // Output :
 381 // Index of the nearest left cluster in the StackLayer indexing (-1 if no clusters are found)
 382 //
 383
 384   Int_t start = fPositions[z];          // starting Position of the bin
 385   Int_t upper = (Int_t)((z != fNRows - 1) ? fPositions[z+1] : nClusters); // ending Position of the bin
 386   Int_t end = upper - 1; // ending Position of the bin
 387   if(end < start) return -1; // Bin is empty
 388   Int_t middle = static_cast<Int_t>((start + end)/2);
 389   // 1st Part: climb down the tree: get the next cluster BEFORE ypos
 390   while(start + 1 < end){
 391     if(y >= fClusters[middle]->GetY()) start = middle;
 392     else end = middle;
 393     middle = static_cast<Int_t>((start + end)/2);
 394   }
 395   if(y > fClusters[end]->GetY()) return end;
 396   return start;
 397 }
 398
 399 //_____________________________________________________________________________
 400 Int_t AliTRDchamberTimeBin::FindNearestYCluster(Double_t y, UChar_t z) const
 401 {
 402 //
 403 // Tree search Algorithm to find the nearest cluster for a given
 404 // y-position in a certain z-bin (in fact AVL-tree).
 405 // Making use of the fact that clusters are sorted in y-direction.
 406 //
 407 // Parameters:
 408 //   y : y position of the reference point in tracking coordinates
 409 //   z : z reference bin.
 410 //
 411 // Output
 412 // Index of the nearest cluster in the StackLayer indexing (-1 if no clusters are found)
 413 //
 414
 415   Int_t position = FindYPosition(y, z, fN);
 416   if(position == -1) return position; // bin empty
 417   // FindYPosition always returns the left Neighbor. We don't know if the left or the right Neighbor is nearest
 418   // to the Reference y-position, so test both
 419   Int_t upper = (Int_t)((z < fNRows-1) ? fPositions[z+1] : fN); // ending Position of the bin
 420   if((position + 1) < (upper)){
 421     if(TMath::Abs(y - fClusters[position + 1]->GetY()) < TMath::Abs(y - fClusters[position]->GetY())) return position + 1;
 422     else return position;
 423   }
 424   return position;
 425 }
 426
 427 //_____________________________________________________________________________
 428 Int_t AliTRDchamberTimeBin::SearchNearestCluster(Double_t y, Double_t z, Double_t maxroady, Double_t maxroadz) const
 429 {
 430 //
 431 // Finds the nearest cluster from a given point in a defined range.
 432 // Distance is determined in a 2D space by the 2-Norm.
 433 //
 434 // Parameters :
 435 //   y : y position of the reference point in tracking coordinates
 436 //   z : z reference bin.
 437 //   maxroady : maximum searching distance in y direction
 438 //   maxroadz : maximum searching distance in z direction
 439 //
 440 // Output
 441 // Index of the nearest cluster in the StackLayer indexing (-1 if no cluster is found).
 442 // Cluster can be accessed with the operator[] or GetCluster(Int_t index)
 443 //
 444 // Detail description
 445 //
 446 // The following steps are perfomed:
 447 // 1. Get the expected z bins inside maxroadz.
 448 // 2. For each z bin find nearest y cluster.
 449 // 3. Select best candidate
 450 //
 451   Int_t   index   = -1;
 452   // initial minimal distance will be represented as ellipse: semi-major = z-direction
 453   // later 2-Norm will be used
 454 //      Float_t nExcentricity = TMath::Sqrt(maxroadz*maxroadz - maxroad*maxroad)/maxroadz;
 455   Float_t mindist = maxroadz;
 456
 457   // not very nice but unfortunately neccessarry: we have ho check the neighbors in both directions (+ and -) too. How
 458   // much neighbors depends on the Quotient maxroadz/fZLength
 459   UChar_t maxRows = 3;
 460   UChar_t zpos[kMaxRows];
 461   // Float_t mindist = TMath::Sqrt(maxroad*maxroad + maxroadz*maxroadz);
 462 //      UChar_t myZbin = FindTreePosition(z, fZ0 + fZLength/2, fZLength/4, 8, 8, kFALSE);
 463   UChar_t myZbin = fNRows - 1 - (UChar_t)(TMath::Abs(fZ0 - z)/fZLength * fNRows);
 464   if(z < fZ0) myZbin = fNRows - 1;
 465   if(z > fZ0 + fZLength) myZbin = 0;
 466   //printf("\n%f < %f < %f [%d]\n", fZ0, z, fZ0 + fZLength, myZbin);
 467   //for(int ic=0; ic<fN; ic++) printf("%d z = %f row %d\n", ic, fClusters[ic]->GetZ(), fClusters[ic]->GetPadRow());
 468
 469   UChar_t nNeighbors = 0;
 470   for(UChar_t i = 0; i < maxRows; i++){
 471     if((myZbin - 1 + i) < 0) continue;
 472     if((myZbin - 1 + i) > fNRows - 1) break;
 473     zpos[nNeighbors] = myZbin - 1 + i;
 474     nNeighbors++;
 475   }
 476   Float_t ycl = 0, zcl = 0;
 477   for(UChar_t neighbor = 0; neighbor < nNeighbors; neighbor++){ // Always test the neighbors too
 478     Int_t pos = FindNearestYCluster(y, zpos[neighbor]);
 479     if(pos == -1) continue;     // No cluster in bin
 480     AliTRDcluster *c = (AliTRDcluster *) (fClusters[pos]);
 481     if(c->IsUsed()) continue;           // we are only interested in unused clusters
 482     ycl = c->GetY();
 483     // Too far away in y-direction (Prearrangement)
 484     if (TMath::Abs(ycl - y) > maxroady){
 485       //printf("y[%f] ycl[%f] roady[%f]\n", y, ycl, maxroady);
 486       continue;
 487     }
 488     zcl = c->GetZ();
 489     // Too far away in z-Direction
 490     // (Prearrangement since we have not so many bins to test)
 491     if (TMath::Abs(zcl - z) > maxroadz) continue;
 492
 493     Float_t dist;               // distance defined as 2-Norm
 494     // if we havent found a Particle that is in the ellipse around (y,z) with maxroad as semi-minor and
 495     // maxroadz as semi-major, we take the radius of the ellipse concerning the cluster as mindist, later we
 496     // take the 2-Norm when we found a cluster inside the ellipse (The value 10000 is taken because it is surely
 497     // large enough to be usable as an indicator whether we have found a nearer cluster or not)
 498 //              if(mindist > 10000.){
 499 //                      Float_t phi = ((zcl - z) == 0) ? TMath::Pi()/2 : TMath::ATan((ycl - y)/(zcl - z));
 500 //                      mindist = maxroad/TMath::Sqrt(1 - nExcentricity*nExcentricity * (TMath::Cos(phi))*(TMath::Cos(phi)));
 501 //              }
 502     dist = TMath::Max(TMath::Abs(y-ycl),TMath::Abs(z-zcl));     // infinity Norm
 503 //              dist = TMath::Sqrt((ycl - y)*(ycl - y) + (zcl - z)*(zcl - z));
 504     if((Int_t)(dist * 100000) < (Int_t)(mindist * 100000)){
 505     //if((dist = TMath::Sqrt((ycl - y)*(ycl - y) + (zcl - z)*(zcl - z))) < mindist){
 506       mindist = dist;
 507       index   = pos;
 508     }
 509   }
 510   // This is the Array Position in fIndex2D of the Nearest cluster: if a
 511   // cluster is called, then the function has to retrieve the Information
 512   // which is Stored in the Array called, the function
 513   return index;
 514 }
 515
 516 //_____________________________________________________________________________
 517 void AliTRDchamberTimeBin::BuildCond(AliTRDcluster *cl, Double_t *cond, UChar_t Layer, Double_t theta, Double_t phi)
 518 {
 519 // Helper function to calculate the area where to expect a cluster in THIS
 520 // layer.
 521 //
 522 // Parameters :
 523 //   cl    :
 524 //   cond  :
 525 //   Layer :
 526 //   theta :
 527 //   phi   :
 528 //
 529 // Detail description
 530 //
 531 // Helper function to calculate the area where to expect a cluster in THIS
 532 // layer. by using the information of a former cluster in another layer
 533 // and the angle in theta- and phi-direction between layer 0 and layer 3.
 534 // If the layer is zero, initial conditions are calculated. Otherwise a
 535 // linear interpolation is performed.
 536 //Begin_Html
 537 //<img src="gif/build_cond.gif">
 538 //End_Html
 539 //
 540
 541   if(!fReconstructor){
 542     AliError("Reconstructor not set.");
 543     return;
 544   }
 545
 546   if(Layer == 0){
 547     cond[0] = cl->GetY();                       // center: y-Direction
 548     cond[1] = cl->GetZ();                       // center: z-Direction
 549     cond[2] = fReconstructor->GetRecoParam()->GetMaxPhi()   * (cl->GetX() - GetX()) + 1.0;                      // deviation: y-Direction
 550     cond[3] = fReconstructor->GetRecoParam()->GetMaxTheta() * (cl->GetX() - GetX()) + 1.0;                      // deviation: z-Direction
 551   } else {
 552     cond[0] = cl->GetY() + phi   * (GetX() - cl->GetX());
 553     cond[1] = cl->GetZ() + theta * (GetX() - cl->GetX());
 554     cond[2] = fReconstructor->GetRecoParam()->GetRoad0y() + phi;
 555     cond[3] = fReconstructor->GetRecoParam()->GetRoad0z();
 556   }
 557 }
 558
 559 //_____________________________________________________________________________
 560 void AliTRDchamberTimeBin::GetClusters(Double_t *cond, Int_t *index, Int_t& ncl, Int_t BufferSize)
 561 {
 562 // Finds all clusters situated in this layer inside a rectangle  given by the center an ranges.
 563 //
 564 // Parameters :
 565 //   cond  :
 566 //   index :
 567 //   ncl :
 568 //   BufferSize   :
 569 //
 570 // Output :
 571 //
 572 // Detail description
 573 //
 574 // Function returs an array containing the indices in the stacklayer of
 575 // the clusters found an  the number of found clusters in the stacklayer
 576
 577   ncl = 0;
 578   memset(index, 0, BufferSize*sizeof(Int_t));
 579   if(fN == 0) return;
 580
 581   //Boundary checks
 582   Double_t zvals[2];
 583   if(((cond[1] - cond[3]) >= (fZ0 + fZLength)) || (cond[1] + cond[3]) <= fZ0) return; // We are outside of the chamvber
 584   zvals[0] = ((cond[1] - cond[3]) < fZ0) ? fZ0 : (cond[1] - cond[3]);
 585   zvals[1] = ((cond[1] + cond[3]) < fZ0 + fZLength) ? (cond[1] + cond[3]) : fZ0 + fZLength - 1.E-3;
 586
 587   UChar_t zhi = fNRows - 1 - (UChar_t)(TMath::Abs(fZ0 - zvals[0])/fZLength * fNRows);
 588   UChar_t zlo = fNRows - 1 - (UChar_t)(TMath::Abs(fZ0 - zvals[1])/fZLength * fNRows);
 589
 590 /*      AliInfo(Form("yc[%f] zc[%f] dy[%f] dz[%f]", cond[0], cond[1], cond[2], cond[3]));
 591   PrintClusters();
 592   AliInfo(Form("zlo[%f] zhi[%f]", zvals[0], zvals[1]));
 593   AliInfo(Form("zlo[%d] zhi[%d]", zlo, zhi));*/
 594
 595   //Preordering in Direction z saves a lot of loops (boundary checked)
 596   for(UChar_t z = zlo; z <= zhi; z++){
 597     UInt_t upper = (z < fNRows-1) ? fPositions[z+1] : fN;
 598     //AliInfo(Form("z[%d] y [%d %d]", z, fPositions[z], upper));
 599     for(Int_t y = fPositions[z]; y < (Int_t)upper; y++){
 600       if(ncl == BufferSize){
 601         AliWarning("Buffer size riched. Some clusters may be lost.");
 602         return; //Buffer filled
 603       }
 604
 605       if(fClusters[y]->GetY() > (cond[0] + cond[2])) break;                     // Abbortion conditions!!!
 606       if(fClusters[y]->GetY() < (cond[0] - cond[2])) continue;  // Too small
 607       if(((Int_t)((fClusters[y]->GetZ())*1000) < (Int_t)(zvals[0]*1000)) || ((Int_t)((fClusters[y]->GetZ())*1000) > (Int_t)(zvals[1]*1000))){/*printf("exit z\n"); TODO*/ continue;}
 608       index[ncl] = y;
 609       ncl++;
 610     }
 611   }
 612   if(ncl>fN) AliError(Form("Clusters found %d > %d (clusters in layer)", ncl, fN));
 613 }
 614
 615 //_____________________________________________________________________________
 616 AliTRDcluster *AliTRDchamberTimeBin::GetNearestCluster(Double_t *cond)
 617 {
 618 // Function returning a pointer to the nearest cluster (nullpointer if not successfull).
 619 //
 620 // Parameters :
 621 //   cond  :
 622 //
 623 // Output :
 624 //   pointer to the nearest cluster (nullpointer if not successfull).
 625 //
 626 // Detail description
 627 //
 628 // returns a pointer to the nearest cluster (nullpointer if not
 629 // successfull) by the help of the method FindNearestCluster
 630
 631
 632   Double_t maxroad  = fReconstructor->GetRecoParam()->GetRoad2y();
 633   Double_t maxroadz = fReconstructor->GetRecoParam()->GetRoad2z();
 634
 635   Int_t index = SearchNearestCluster(cond[0],cond[1],maxroad,maxroadz);
 636   AliTRDcluster *returnCluster = 0x0;
 637   if(index != -1) returnCluster = (AliTRDcluster *) fClusters[index];
 638   return returnCluster;
 639 }
 640
 641 //_____________________________________________________________________________
 642 void AliTRDchamberTimeBin::Print(Option_t *) const
 643 {
 644 // Prints the position of each cluster in the stacklayer on the stdout
 645 //
 646   if(!fN) return;
 647   AliInfo(Form("Layer[%d] Stack[%d] Sector[%2d] nRows[%2d]", fPlane, fStack, fSector, fNRows));
 648   AliInfo(Form("Z0[%7.3f] Z1[%7.3f]", fZ0, fZ0+fZLength));
 649   AliTRDcluster* const* icl = &fClusters[0];
 650   for(Int_t jcl = 0; jcl < fN; jcl++, icl++){
 651     AliInfo(Form("%2d X[%7.3f] Y[%7.3f] Z[%7.3f] tb[%2d] col[%3d] row[%2d] used[%s]", jcl,  (*icl)->GetX(), (*icl)->GetY(), (*icl)->GetZ(), (*icl)->GetLocalTimeBin(), (*icl)->GetPadCol(), (*icl)->GetPadRow(),
 652     (*icl)->IsUsed() ? "y" : "n"));
 653   }
 654   Int_t irow = 0;
 655   for(UChar_t const* pos = &fPositions[0]; irow<fNRows; pos++, irow++){
 656     if((*pos) != 0xff) AliInfo(Form("r[%2d] pos[%d]", irow, (*pos)));
 657   }
 658 }