gAlice now only read by AliRunDigitizer. Therefore it is just deleted in AliTRDmerge.C
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRDdigitizer.cxx
1 /**************************************************************************
2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3  *                                                                        *
4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6  *                                                                        *
7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14  **************************************************************************/
15
16 /*
17 $Log$
18 Revision 1.37  2002/04/29 11:50:47  cblume
19 Change initialization of gAlice in the merging case
20
21 Revision 1.36  2002/04/12 12:13:23  cblume
22 Add Jiris changes
23
24 Revision 1.35  2002/03/28 14:59:07  cblume
25 Coding conventions
26
27 Revision 1.34  2002/03/25 20:00:44  cblume
28 Introduce parameter class and regions of interest for merging
29
30 Revision 1.33  2002/02/12 17:32:03  cblume
31 Rearrange the deleting of the list of sdigitsmanager
32
33 Revision 1.32  2002/02/12 16:07:21  cblume
34 Add new constructor
35
36 Revision 1.31  2002/02/11 14:27:11  cblume
37 New pad plane design, new TRF+PRF, tail cancelation, cross talk
38
39 Revision 1.30  2001/11/19 08:44:08  cblume
40 Fix bugs reported by Rene
41
42 Revision 1.29  2001/11/14 19:44:25  hristov
43 Numeric const casted (Alpha)
44
45 Revision 1.28  2001/11/14 16:35:58  cblume
46 Inherits now from AliDetector
47
48 Revision 1.27  2001/11/14 10:50:45  cblume
49 Changes in digits IO. Add merging of summable digits
50
51 Revision 1.26  2001/11/06 17:19:41  cblume
52 Add detailed geometry and simple simulator
53
54 Revision 1.25  2001/06/27 09:54:44  cblume
55 Moved fField initialization to InitDetector()
56
57 Revision 1.24  2001/05/21 16:45:47  hristov
58 Last minute changes (C.Blume)
59
60 Revision 1.23  2001/05/07 08:04:48  cblume
61 New TRF and PRF. Speedup of the code. Digits from amplification region included
62
63 Revision 1.22  2001/03/30 14:40:14  cblume
64 Update of the digitization parameter
65
66 Revision 1.21  2001/03/13 09:30:35  cblume
67 Update of digitization. Moved digit branch definition to AliTRD
68
69 Revision 1.20  2001/02/25 20:19:00  hristov
70 Minor correction: loop variable declared only once for HP, Sun
71
72 Revision 1.19  2001/02/14 18:22:26  cblume
73 Change in the geometry of the padplane
74
75 Revision 1.18  2001/01/26 19:56:57  hristov
76 Major upgrade of AliRoot code
77
78 Revision 1.17  2000/12/08 12:53:27  cblume
79 Change in Copy() function for HP-compiler
80
81 Revision 1.16  2000/12/07 12:20:46  cblume
82 Go back to array compression. Use sampled PRF to speed up digitization
83
84 Revision 1.15  2000/11/23 14:34:08  cblume
85 Fixed bug in expansion routine of arrays (initialize buffers properly)
86
87 Revision 1.14  2000/11/20 08:54:44  cblume
88 Switch off compression as default
89
90 Revision 1.13  2000/11/10 14:57:52  cblume
91 Changes in the geometry constants for the DEC compiler
92
93 Revision 1.12  2000/11/01 14:53:20  cblume
94 Merge with TRD-develop
95
96 Revision 1.1.4.9  2000/10/26 17:00:22  cblume
97 Fixed bug in CheckDetector()
98
99 Revision 1.1.4.8  2000/10/23 13:41:35  cblume
100 Added protection against Log(0) in the gas gain calulation
101
102 Revision 1.1.4.7  2000/10/17 02:27:34  cblume
103 Get rid of global constants
104
105 Revision 1.1.4.6  2000/10/16 01:16:53  cblume
106 Changed timebin 0 to be the one closest to the readout
107
108 Revision 1.1.4.5  2000/10/15 23:34:29  cblume
109 Faster version of the digitizer
110
111 Revision 1.1.4.4  2000/10/06 16:49:46  cblume
112 Made Getters const
113
114 Revision 1.1.4.3  2000/10/04 16:34:58  cblume
115 Replace include files by forward declarations
116
117 Revision 1.1.4.2  2000/09/22 14:41:10  cblume
118 Bug fix in PRF. Included time response. New structure
119
120 Revision 1.10  2000/10/05 07:27:53  cblume
121 Changes in the header-files by FCA
122
123 Revision 1.9  2000/10/02 21:28:19  fca
124 Removal of useless dependecies via forward declarations
125
126 Revision 1.8  2000/06/09 11:10:07  cblume
127 Compiler warnings and coding conventions, next round
128
129 Revision 1.7  2000/06/08 18:32:58  cblume
130 Make code compliant to coding conventions
131
132 Revision 1.6  2000/06/07 16:27:32  cblume
133 Try to remove compiler warnings on Sun and HP
134
135 Revision 1.5  2000/05/09 16:38:57  cblume
136 Removed PadResponse(). Merge problem
137
138 Revision 1.4  2000/05/08 15:53:45  cblume
139 Resolved merge conflict
140
141 Revision 1.3  2000/04/28 14:49:27  cblume
142 Only one declaration of iDict in MakeDigits()
143
144 Revision 1.1.4.1  2000/05/08 14:42:04  cblume
145 Introduced AliTRDdigitsManager
146
147 Revision 1.1  2000/02/28 19:00:13  cblume
148 Add new TRD classes
149
150 */
151
152 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
153 //                                                                           //
154 //  Creates and handles digits from TRD hits                                 //
155 //  Author: C. Blume (C.Blume@gsi.de)                                        //
156 //                                                                           //
157 //  The following effects are included:                                      //
158 //      - Diffusion                                                          //
159 //      - ExB effects                                                        //
160 //      - Gas gain including fluctuations                                    //
161 //      - Pad-response (simple Gaussian approximation)                       //
162 //      - Time-response                                                      //
163 //      - Electronics noise                                                  //
164 //      - Electronics gain                                                   //
165 //      - Digitization                                                       //
166 //      - ADC threshold                                                      //
167 //  The corresponding parameter can be adjusted via the various              //
168 //  Set-functions. If these parameters are not explicitly set, default       //
169 //  values are used (see Init-function).                                     //
170 //  As an example on how to use this class to produce digits from hits       //
171 //  have a look at the macro hits2digits.C                                   //
172 //  The production of summable digits is demonstrated in hits2sdigits.C      //
173 //  and the subsequent conversion of the s-digits into normal digits is      //
174 //  explained in sdigits2digits.C.                                           //
175 //                                                                           //
176 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
177
178 #include <stdlib.h>
179
180 #include <TMath.h>
181 #include <TVector.h>
182 #include <TRandom.h>
183 #include <TROOT.h>
184 #include <TTree.h>
185 #include <TFile.h>
186 #include <TF1.h>
187 #include <TList.h>
188 #include <TTask.h>
189
190 #include "AliRun.h"
191 #include "AliMagF.h"
192 #include "AliRunDigitizer.h"
193
194 #include "AliTRD.h"
195 #include "AliTRDhit.h"
196 #include "AliTRDdigitizer.h"
197 #include "AliTRDdataArrayI.h"
198 #include "AliTRDdataArrayF.h"
199 #include "AliTRDsegmentArray.h"
200 #include "AliTRDdigitsManager.h"
201 #include "AliTRDgeometry.h"
202 #include "AliTRDparameter.h"
203
204 ClassImp(AliTRDdigitizer)
205
206 //_____________________________________________________________________________
207 AliTRDdigitizer::AliTRDdigitizer()
208 {
209   //
210   // AliTRDdigitizer default constructor
211   //
212
213   fInputFile          = 0;
214   fDigitsManager      = 0;
215   fSDigitsManagerList = 0;
216   fSDigitsManager     = 0;
217   fTRD                = 0;
218   fGeo                = 0;
219   fPar                = 0;
220   fMasks              = 0;
221   fEvent              = 0;
222   fCompress           = kTRUE;
223   fDebug              = 0;
224   fSDigits            = kFALSE;
225   fSDigitsScale       = 0.0;
226   fMergeSignalOnly    = kFALSE;
227
228 }
229
230 //_____________________________________________________________________________
231 AliTRDdigitizer::AliTRDdigitizer(const Text_t *name, const Text_t *title)
232                 :AliDigitizer(name,title)
233 {
234   //
235   // AliTRDdigitizer constructor
236   //
237
238   fInputFile          = 0;
239   fDigitsManager      = 0;
240   fSDigitsManagerList = 0;
241   fSDigitsManager     = 0;
242   fTRD                = 0;
243   fGeo                = 0;
244   fPar                = 0;
245   fMasks              = 0;
246   fEvent              = 0;
247   fCompress           = kTRUE;
248   fDebug              = 0;
249   fSDigits            = kFALSE;
250   fMergeSignalOnly    = kFALSE;
251
252   // For the summable digits
253   fSDigitsScale       = 100.;
254
255 }
256
257 //_____________________________________________________________________________
258 AliTRDdigitizer::AliTRDdigitizer(AliRunDigitizer *manager
259                                 , const Text_t *name, const Text_t *title)
260                 :AliDigitizer(manager,name,title)
261 {
262   //
263   // AliTRDdigitizer constructor
264   //
265
266   fInputFile          = 0;
267   fDigitsManager      = 0;
268   fSDigitsManagerList = 0;
269   fSDigitsManager     = 0;
270   fTRD                = 0;
271   fGeo                = 0;
272   fPar                = 0;
273   fMasks              = 0;
274   fEvent              = 0;
275   fCompress           = kTRUE;
276   fDebug              = 0;
277   fSDigits            = kFALSE;
278   fMergeSignalOnly    = kFALSE;
279
280   // For the summable digits
281   fSDigitsScale       = 100.;
282
283 }
284
285 //_____________________________________________________________________________
286 AliTRDdigitizer::AliTRDdigitizer(AliRunDigitizer *manager)
287                 :AliDigitizer(manager,"AliTRDdigitizer","TRD digitizer")
288 {
289   //
290   // AliTRDdigitizer constructor
291   //
292
293   fInputFile          = 0;
294   fDigitsManager      = 0;
295   fSDigitsManagerList = 0;
296   fSDigitsManager     = 0;
297   fTRD                = 0;
298   fGeo                = 0;
299   fPar                = 0;
300   fMasks              = 0;
301   fEvent              = 0;
302   fCompress           = kTRUE;
303   fDebug              = 0;
304   fSDigits            = kFALSE;
305   fMergeSignalOnly    = kFALSE;
306
307   // For the summable digits
308   fSDigitsScale       = 100.;
309
310 }
311
312 //_____________________________________________________________________________
313 AliTRDdigitizer::AliTRDdigitizer(const AliTRDdigitizer &d)
314 {
315   //
316   // AliTRDdigitizer copy constructor
317   //
318
319   ((AliTRDdigitizer &) d).Copy(*this);
320
321 }
322
323 //_____________________________________________________________________________
324 AliTRDdigitizer::~AliTRDdigitizer()
325 {
326   //
327   // AliTRDdigitizer destructor
328   //
329
330   if (fInputFile) {
331     fInputFile->Close();
332     delete fInputFile;
333     fInputFile = 0;
334   }
335
336   if (fDigitsManager) {
337     delete fDigitsManager;
338     fDigitsManager = 0;
339   }
340
341   if (fSDigitsManager) {
342     delete fSDigitsManager;
343     fSDigitsManager = 0;
344   }
345
346   if (fSDigitsManagerList) {
347     delete fSDigitsManagerList;
348     fSDigitsManagerList = 0;
349   }
350
351   if (fMasks) {
352     delete [] fMasks;
353     fMasks = 0;
354   }
355
356 }
357
358 //_____________________________________________________________________________
359 AliTRDdigitizer &AliTRDdigitizer::operator=(const AliTRDdigitizer &d)
360 {
361   //
362   // Assignment operator
363   //
364
365   if (this != &d) ((AliTRDdigitizer &) d).Copy(*this);
366   return *this;
367
368 }
369
370 //_____________________________________________________________________________
371 void AliTRDdigitizer::Copy(TObject &d)
372 {
373   //
374   // Copy function
375   //
376
377   ((AliTRDdigitizer &) d).fInputFile          = 0;
378   ((AliTRDdigitizer &) d).fSDigitsManagerList = 0;
379   ((AliTRDdigitizer &) d).fSDigitsManager     = 0;
380   ((AliTRDdigitizer &) d).fDigitsManager      = 0;
381   ((AliTRDdigitizer &) d).fTRD                = 0;
382   ((AliTRDdigitizer &) d).fGeo                = 0;
383   ((AliTRDdigitizer &) d).fMasks              = 0;
384   ((AliTRDdigitizer &) d).fEvent              = 0;
385   ((AliTRDdigitizer &) d).fPar                = 0;
386   ((AliTRDdigitizer &) d).fCompress           = fCompress;
387   ((AliTRDdigitizer &) d).fDebug              = fDebug  ;
388   ((AliTRDdigitizer &) d).fSDigits            = fSDigits;
389   ((AliTRDdigitizer &) d).fSDigitsScale       = fSDigitsScale;
390   ((AliTRDdigitizer &) d).fMergeSignalOnly    = fMergeSignalOnly;
391                                       
392 }
393
394 //_____________________________________________________________________________
395 void AliTRDdigitizer::Exec(Option_t* option)
396 {
397   //
398   // Executes the merging
399   //
400
401   Int_t iInput;
402
403   AliTRDdigitsManager *sdigitsManager;
404
405   TString optionString = option;
406   if (optionString.Contains("deb")) {
407     fDebug = 1;
408     if (optionString.Contains("2")) {
409       fDebug = 2;
410     }
411     printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
412     printf("Called with debug option %d\n",fDebug);
413   }
414
415   // The AliRoot file is already connected by the manager
416   if (gAlice) {
417     if (fDebug > 0) {
418       printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
419       printf("AliRun object found on file.\n");
420     }
421   }
422   else {
423     printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
424     printf("Could not find AliRun object.\n");
425     return;
426   }
427                                                                            
428   Int_t nInput = fManager->GetNinputs();
429   fMasks = new Int_t[nInput];
430   for (iInput = 0; iInput < nInput; iInput++) {
431     fMasks[iInput] = fManager->GetMask(iInput);
432   }
433
434   // Initialization
435   InitDetector();
436
437   for (iInput = 0; iInput < nInput; iInput++) {
438
439     if (fDebug > 0) {
440       printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
441       printf("Add input stream %d\n",iInput);
442     }
443
444     // check if the input tree exists
445     if (!fManager->GetInputTreeTRDS(iInput)) {
446       printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
447       printf("Input stream %d does not exist\n",iInput);
448       return;
449     } 
450
451     // Read the s-digits via digits manager
452     sdigitsManager = new AliTRDdigitsManager();
453     sdigitsManager->SetDebug(fDebug);
454     sdigitsManager->SetSDigits(kTRUE);
455     sdigitsManager->ReadDigits(fManager->GetInputTreeTRDS(iInput));
456
457     // Add the s-digits to the input list 
458     AddSDigitsManager(sdigitsManager);
459
460   }
461
462   // Convert the s-digits to normal digits
463   if (fDebug > 0) {
464     printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
465     printf("Do the conversion\n");
466   }
467   SDigits2Digits();
468
469   // Store the digits
470   if (fDebug > 0) {
471     printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
472     printf("Write the digits\n");
473   }
474   fDigitsManager->MakeBranch(fManager->GetTreeDTRD());
475   fDigitsManager->WriteDigits();
476   if (fDebug > 0) {
477     printf("<AliTRDdigitizer::Exec> ");
478     printf("Done\n");
479   }
480
481   DeleteSDigitsManager();
482
483 }
484
485 //_____________________________________________________________________________
486 Bool_t AliTRDdigitizer::Open(const Char_t *file, Int_t nEvent)
487 {
488   //
489   // Opens a ROOT-file with TRD-hits and reads in the hit-tree
490   //
491
492   // Connect the AliRoot file containing Geometry, Kine, and Hits
493   fInputFile = (TFile *) gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(file);
494   if (!fInputFile) {
495     if (fDebug > 0) {
496       printf("<AliTRDdigitizer::Open> ");
497       printf("Open the AliROOT-file %s.\n",file);
498     }
499     fInputFile = new TFile(file,"UPDATE");
500   }
501   else {
502     if (fDebug > 0) {
503       printf("<AliTRDdigitizer::Open> ");
504       printf("%s is already open.\n",file);
505     }
506   }
507
508   gAlice = (AliRun *) fInputFile->Get("gAlice");
509   if (gAlice) {
510     if (fDebug > 0) {
511       printf("<AliTRDdigitizer::Open> ");
512       printf("AliRun object found on file.\n");
513     }
514   }
515   else {
516     printf("<AliTRDdigitizer::Open> ");
517     printf("Could not find AliRun object.\n");
518     return kFALSE;
519   }
520
521   fEvent = nEvent;
522
523   // Import the Trees for the event nEvent in the file
524   Int_t nparticles = gAlice->GetEvent(fEvent);
525   if (nparticles <= 0) {
526     printf("<AliTRDdigitizer::Open> ");
527     printf("No entries in the trees for event %d.\n",fEvent);
528     return kFALSE;
529   }
530
531   if (InitDetector()) {
532     return MakeBranch();
533   }
534   else {
535     return kFALSE;
536   }
537
538 }
539
540 //_____________________________________________________________________________
541 Bool_t AliTRDdigitizer::InitDetector()
542 {
543   //
544   // Sets the pointer to the TRD detector and the geometry
545   //
546
547   // Get the pointer to the detector class and check for version 1
548   fTRD = (AliTRD *) gAlice->GetDetector("TRD");
549   if (!fTRD) {
550     printf("<AliTRDdigitizer::InitDetector> ");
551     printf("No TRD module found\n");
552     exit(1);
553   }
554   if (fTRD->IsVersion() != 1) {
555     printf("<AliTRDdigitizer::InitDetector> ");
556     printf("TRD must be version 1 (slow simulator).\n");
557     exit(1);
558   }
559
560   // Get the geometry
561   fGeo = fTRD->GetGeometry();
562   if (fDebug > 0) {
563     printf("<AliTRDdigitizer::InitDetector> ");
564     printf("Geometry version %d\n",fGeo->IsVersion());
565   }
566
567   // Create a digits manager
568   fDigitsManager = new AliTRDdigitsManager();
569   fDigitsManager->SetSDigits(fSDigits);
570   fDigitsManager->CreateArrays();
571   fDigitsManager->SetEvent(fEvent);
572   fDigitsManager->SetDebug(fDebug);
573
574   // The list for the input s-digits manager to be merged
575   fSDigitsManagerList = new TList();
576
577   return kTRUE;
578
579 }
580
581 //_____________________________________________________________________________
582 Bool_t AliTRDdigitizer::MakeBranch(const Char_t *file) const
583 {
584   // 
585   // Create the branches for the digits array
586   //
587
588   return fDigitsManager->MakeBranch(file);
589
590 }
591
592 //_____________________________________________________________________________
593 Bool_t AliTRDdigitizer::MakeDigits()
594 {
595   //
596   // Creates digits.
597   //
598
599   ///////////////////////////////////////////////////////////////
600   // Parameter 
601   ///////////////////////////////////////////////////////////////
602
603   // Converts number of electrons to fC
604   const Double_t kEl2fC  = 1.602E-19 * 1.0E15; 
605
606   ///////////////////////////////////////////////////////////////
607
608   // Number of pads included in the pad response
609   const Int_t kNpad  = 3;
610
611   // Number of track dictionary arrays
612   const Int_t kNDict = AliTRDdigitsManager::kNDict;
613
614   // Half the width of the amplification region
615   const Float_t kAmWidth = AliTRDgeometry::AmThick() / 2.;
616
617   Int_t   iRow, iCol, iTime, iPad;
618   Int_t   iDict  = 0;
619   Int_t   nBytes = 0;
620
621   Int_t   totalSizeDigits = 0;
622   Int_t   totalSizeDict0  = 0;
623   Int_t   totalSizeDict1  = 0;
624   Int_t   totalSizeDict2  = 0;
625
626   Int_t   timeTRDbeg = 0;
627   Int_t   timeTRDend = 1;
628
629   Float_t pos[3];
630   Float_t rot[3];
631   Float_t xyz[3];
632   Float_t padSignal[kNpad];
633   Float_t signalOld[kNpad];
634
635   AliTRDdataArrayF *signals = 0;
636   AliTRDdataArrayI *digits  = 0;
637   AliTRDdataArrayI *dictionary[kNDict];
638
639   // Create a default parameter class if none is defined
640   if (!fPar) {
641     fPar = new AliTRDparameter("TRDparameter","Standard TRD parameter");
642     if (fDebug > 0) {
643       printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
644       printf("Create the default parameter object\n");
645     }
646   }
647
648   // Create a container for the amplitudes
649   AliTRDsegmentArray *signalsArray 
650                      = new AliTRDsegmentArray("AliTRDdataArrayF"
651                                              ,AliTRDgeometry::Ndet());
652
653   if (fPar->TRFOn()) {
654     timeTRDbeg = ((Int_t) (-fPar->GetTRFlo() / fPar->GetTimeBinSize())) - 1;
655     timeTRDend = ((Int_t) ( fPar->GetTRFhi() / fPar->GetTimeBinSize())) - 1;
656     if (fDebug > 0) {
657       printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
658       printf("Sample the TRF between -%d and %d\n",timeTRDbeg,timeTRDend);
659     }
660   }
661
662   Float_t elAttachProp = fPar->GetElAttachProp() / 100.; 
663
664   if (!fGeo) {
665     printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
666     printf("No geometry defined\n");
667     return kFALSE;
668   }
669
670   if (fDebug > 0) {
671     printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
672     printf("Start creating digits.\n");
673   }
674
675   // Get the pointer to the hit tree
676   TTree *hitTree = gAlice->TreeH();
677
678   // Get the number of entries in the hit tree
679   // (Number of primary particles creating a hit somewhere)
680   Int_t nTrack = (Int_t) hitTree->GetEntries();
681   if (fDebug > 0) {
682     printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
683     printf("Found %d primary particles\n",nTrack);
684   } 
685
686   Int_t detectorOld = -1;
687   Int_t countHits   =  0; 
688
689   // Loop through all entries in the tree
690   for (Int_t iTrack = 0; iTrack < nTrack; iTrack++) {
691
692     gAlice->ResetHits();
693     nBytes += hitTree->GetEvent(iTrack);
694
695     // Loop through the TRD hits
696     Int_t iHit = 0;
697     AliTRDhit *hit = (AliTRDhit *) fTRD->FirstHit(-1);
698     while (hit) {
699  
700       countHits++;
701       iHit++;
702
703               pos[0]      = hit->X();
704               pos[1]      = hit->Y();
705               pos[2]      = hit->Z();
706       Float_t q           = hit->GetCharge();
707       Int_t   track       = hit->Track();
708       Int_t   detector    = hit->GetDetector();
709       Int_t   plane       = fGeo->GetPlane(detector);
710       Int_t   sector      = fGeo->GetSector(detector);
711       Int_t   chamber     = fGeo->GetChamber(detector);
712       Int_t   nRowMax     = fPar->GetRowMax(plane,chamber,sector);
713       Int_t   nColMax     = fPar->GetColMax(plane);
714       Int_t   nTimeMax    = fPar->GetTimeMax();
715       Int_t   nTimeBefore = fPar->GetTimeBefore();
716       Int_t   nTimeAfter  = fPar->GetTimeAfter();
717       Int_t   nTimeTotal  = fPar->GetTimeTotal();
718       Float_t row0        = fPar->GetRow0(plane,chamber,sector);
719       Float_t col0        = fPar->GetCol0(plane);
720       Float_t time0       = fPar->GetTime0(plane);
721       Float_t rowPadSize  = fPar->GetRowPadSize(plane,chamber,sector);
722       Float_t colPadSize  = fPar->GetColPadSize(plane);
723       Float_t timeBinSize = fPar->GetTimeBinSize();
724       Float_t divideRow   = 1.0 / rowPadSize;
725       Float_t divideCol   = 1.0 / colPadSize;
726       Float_t divideTime  = 1.0 / timeBinSize;
727
728       if (fDebug > 1) {
729         printf("Analyze hit no. %d ",iHit);
730         printf("-----------------------------------------------------------\n");
731         hit->Dump();
732         printf("plane = %d, sector = %d, chamber = %d\n"
733               ,plane,sector,chamber);
734         printf("nRowMax = %d, nColMax = %d, nTimeMax = %d\n" 
735               ,nRowMax,nColMax,nTimeMax);
736         printf("nTimeBefore = %d, nTimeAfter = %d, nTimeTotal = %d\n"
737               ,nTimeBefore,nTimeAfter,nTimeTotal);
738         printf("row0 = %f, col0 = %f, time0 = %f\n"
739               ,row0,col0,time0);
740         printf("rowPadSize = %f, colPadSize = %f, timeBinSize = %f\n"
741                ,rowPadSize,colPadSize,timeBinSize); 
742       }
743        
744       // Don't analyze test hits and switched off detectors
745       if ((CheckDetector(plane,chamber,sector)) &&
746           (((Int_t) q) != 0)) {
747
748         if (detector != detectorOld) {
749
750           if (fDebug > 1) {
751             printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
752             printf("Get new container. New det = %d, Old det = %d\n"
753                   ,detector,detectorOld);
754           }
755           // Compress the old one if enabled
756           if ((fCompress) && (detectorOld > -1)) {
757             if (fDebug > 1) {
758               printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
759               printf("Compress the old container ...");
760             }
761             signals->Compress(1,0);
762             for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
763               dictionary[iDict]->Compress(1,0);
764             }
765             if (fDebug > 1) printf("done\n");
766           }
767           // Get the new container
768           signals = (AliTRDdataArrayF *) signalsArray->At(detector);
769           if (signals->GetNtime() == 0) {
770             // Allocate a new one if not yet existing
771             if (fDebug > 1) {
772               printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
773               printf("Allocate a new container ... ");
774             }
775             signals->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
776           }
777           else {
778             // Expand an existing one
779             if (fCompress) {
780               if (fDebug > 1) {
781                 printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
782                 printf("Expand an existing container ... ");
783               }
784               signals->Expand();
785             }
786           }
787           // The same for the dictionary
788           for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {       
789             dictionary[iDict] = fDigitsManager->GetDictionary(detector,iDict);
790             if (dictionary[iDict]->GetNtime() == 0) {
791               dictionary[iDict]->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
792             }
793             else {
794               if (fCompress) dictionary[iDict]->Expand();
795             }
796           }      
797           if (fDebug > 1) printf("done\n");
798           detectorOld = detector;
799         }
800
801         // Rotate the sectors on top of each other
802         fGeo->Rotate(detector,pos,rot);
803
804         // The driftlength. It is negative if the hit is in the 
805         // amplification region.
806         Float_t driftlength = time0 - rot[0];
807
808         // Take also the drift in the amplification region into account
809         // The drift length is at the moment still the same, regardless of
810         // the position relativ to the wire. This non-isochronity needs still
811         // to be implemented.
812         Float_t driftlengthL = TMath::Abs(driftlength + kAmWidth);
813         if (fPar->ExBOn()) driftlengthL /= TMath::Sqrt(fPar->GetLorentzFactor());
814
815         // Loop over all electrons of this hit
816         // TR photons produce hits with negative charge
817         Int_t nEl = ((Int_t) TMath::Abs(q));
818         for (Int_t iEl = 0; iEl < nEl; iEl++) {
819
820           xyz[0] = rot[0];
821           xyz[1] = rot[1];
822           xyz[2] = rot[2];
823
824           // Electron attachment
825           if (fPar->ElAttachOn()) {
826             if (gRandom->Rndm() < (driftlengthL * elAttachProp)) 
827               continue;
828           }
829
830           // Apply the diffusion smearing
831           if (fPar->DiffusionOn()) {
832             if (!(fPar->Diffusion(driftlengthL,xyz))) continue;
833           }
834
835           // Apply E x B effects (depends on drift direction)
836           if (fPar->ExBOn()) { 
837             if (!(fPar->ExB(driftlength+kAmWidth,xyz))) continue;   
838           }
839
840           // The electron position after diffusion and ExB in pad coordinates 
841           // The pad row (z-direction)
842           Float_t rowDist   = xyz[2] - row0;
843           Int_t   rowE      = ((Int_t) (rowDist * divideRow));
844           if ((rowE < 0) || (rowE >= nRowMax)) continue;   
845           Float_t rowOffset = ((((Float_t) rowE) + 0.5) * rowPadSize) - rowDist;
846
847           // The pad column (rphi-direction)
848           Float_t col0tilt  = fPar->Col0Tilted(col0,rowOffset,plane);
849           Float_t colDist   = xyz[1] - col0tilt;
850           Int_t   colE      = ((Int_t) (colDist * divideCol));
851           if ((colE < 0) || (colE >= nColMax)) continue;   
852           Float_t colOffset = ((((Float_t) colE) + 0.5) * colPadSize) - colDist;    
853
854           // The time bin (negative for hits in the amplification region)
855           // In the amplification region the electrons drift from both sides
856           // to the middle (anode wire plane)
857           Float_t timeDist   = time0 - xyz[0];
858           Float_t timeOffset = 0;
859           Int_t   timeE      = 0;
860           if (timeDist > 0) {
861             // The time bin
862             timeE      = ((Int_t) (timeDist * divideTime));
863             // The distance of the position to the middle of the timebin
864             timeOffset = ((((Float_t) timeE) + 0.5) * timeBinSize) - timeDist;
865           }
866           else {
867             // Difference between half of the amplification gap width and
868             // the distance to the anode wire
869             Float_t anodeDist = kAmWidth - TMath::Abs(timeDist + kAmWidth);
870             // The time bin
871             timeE      = -1 * (((Int_t ) (anodeDist * divideTime)) + 1);
872             // The distance of the position to the middle of the timebin
873             timeOffset = ((((Float_t) timeE) + 0.5) * timeBinSize) + anodeDist;
874           }
875  
876           // Apply the gas gain including fluctuations
877           Float_t ggRndm = 0.0;
878           do {
879             ggRndm = gRandom->Rndm();
880           } while (ggRndm <= 0);
881           Int_t signal = (Int_t) (-fPar->GetGasGain() * TMath::Log(ggRndm));
882
883           // Apply the pad response 
884           if (fPar->PRFOn()) {
885             // The distance of the electron to the center of the pad 
886             // in units of pad width
887             Float_t dist = - colOffset * divideCol;
888             if (!(fPar->PadResponse(signal,dist,plane,padSignal))) continue;
889           }
890           else {
891             padSignal[0] = 0.0;
892             padSignal[1] = signal;
893             padSignal[2] = 0.0;
894           }
895
896           // Sample the time response inside the drift region
897           // + additional time bins before and after.
898           // The sampling is done always in the middle of the time bin
899           for (Int_t iTimeBin = TMath::Max(timeE-timeTRDbeg,        -nTimeBefore) 
900                     ;iTimeBin < TMath::Min(timeE+timeTRDend,nTimeMax+nTimeAfter ) 
901                     ;iTimeBin++) {
902
903             // Apply the time response
904             Float_t timeResponse = 1.0;
905             Float_t crossTalk    = 0.0;
906             Float_t time         = (iTimeBin - timeE) * timeBinSize + timeOffset;
907             if (fPar->TRFOn()) {
908               timeResponse = fPar->TimeResponse(time);
909             }
910             if (fPar->CTOn()) {
911               crossTalk    = fPar->CrossTalk(time);
912             }
913
914             signalOld[0] = 0.0;
915             signalOld[1] = 0.0;
916             signalOld[2] = 0.0;
917
918             for (iPad = 0; iPad < kNpad; iPad++) {
919
920               Int_t colPos = colE + iPad - 1;
921               if (colPos <        0) continue;
922               if (colPos >= nColMax) break;
923
924               // Add the signals
925               // Note: The time bin number is shifted by nTimeBefore to avoid negative
926               // time bins. This has to be subtracted later.
927               Int_t iCurrentTimeBin = iTimeBin + nTimeBefore;
928               signalOld[iPad]  = signals->GetDataUnchecked(rowE,colPos,iCurrentTimeBin);
929               if( colPos != colE ) {
930                 signalOld[iPad] += padSignal[iPad] * (timeResponse + crossTalk);
931               } 
932               else {
933                 signalOld[iPad] += padSignal[iPad] * timeResponse;
934               }
935               signals->SetDataUnchecked(rowE,colPos,iCurrentTimeBin,signalOld[iPad]);
936
937               // Store the track index in the dictionary
938               // Note: We store index+1 in order to allow the array to be compressed
939               if (signalOld[iPad] > 0) {
940                 for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
941                   Int_t oldTrack = dictionary[iDict]->GetDataUnchecked(rowE
942                                                                       ,colPos
943                                                                       ,iCurrentTimeBin);
944                   if (oldTrack == track+1) break;
945                   if (oldTrack ==       0) {
946                     dictionary[iDict]->SetDataUnchecked(rowE,colPos,iCurrentTimeBin,track+1);
947                     break;
948                   }
949                 }
950               }
951
952             } // Loop: pads
953
954           } // Loop: time bins
955
956         } // Loop: electrons of a single hit
957
958       } // If: detector and test hit
959
960       hit = (AliTRDhit *) fTRD->NextHit();   
961
962     } // Loop: hits of one primary track
963
964   } // Loop: primary tracks
965
966   if (fDebug > 0) {
967     printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
968     printf("Finished analyzing %d hits\n",countHits);
969   }
970
971   // The total conversion factor
972   Float_t convert = kEl2fC * fPar->GetPadCoupling() 
973                            * fPar->GetTimeCoupling() 
974                            * fPar->GetChipGain();
975
976   // Loop through all chambers to finalize the digits
977   for (Int_t iDet = 0; iDet < AliTRDgeometry::Ndet(); iDet++) {
978
979     Int_t plane       = fGeo->GetPlane(iDet);
980     Int_t sector      = fGeo->GetSector(iDet);
981     Int_t chamber     = fGeo->GetChamber(iDet);
982     Int_t nRowMax     = fPar->GetRowMax(plane,chamber,sector);
983     Int_t nColMax     = fPar->GetColMax(plane);
984     Int_t nTimeMax    = fPar->GetTimeMax();
985     Int_t nTimeTotal  = fPar->GetTimeTotal();
986
987     Double_t *inADC  = new Double_t[nTimeTotal];
988     Double_t *outADC = new Double_t[nTimeTotal];
989
990     if (fDebug > 0) {
991       printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
992       printf("Digitization for chamber %d\n",iDet);
993     }
994
995     // Add a container for the digits of this detector
996     digits = fDigitsManager->GetDigits(iDet);        
997     // Allocate memory space for the digits buffer
998     digits->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
999
1000     // Get the signal container
1001     signals = (AliTRDdataArrayF *) signalsArray->At(iDet);
1002     if (signals->GetNtime() == 0) {
1003       // Create missing containers
1004       signals->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);      
1005     }
1006     else {
1007       // Expand the container if neccessary
1008       if (fCompress) signals->Expand();
1009     }
1010     // Create the missing dictionary containers
1011     for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {       
1012       dictionary[iDict] = fDigitsManager->GetDictionary(iDet,iDict);
1013       if (dictionary[iDict]->GetNtime() == 0) {
1014         dictionary[iDict]->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
1015       }
1016     }
1017
1018     Int_t nDigits = 0;
1019
1020     // Don't create noise in detectors that are switched off
1021     if (CheckDetector(plane,chamber,sector)) {
1022
1023       // Create the digits for this chamber
1024       for (iRow  = 0; iRow  <  nRowMax;   iRow++ ) {
1025         for (iCol  = 0; iCol  <  nColMax;   iCol++ ) {
1026
1027           // Create summable digits
1028           if (fSDigits) {
1029
1030             for (iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {         
1031               Float_t signalAmp = signals->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
1032               signalAmp *= fSDigitsScale;
1033               signalAmp  = TMath::Min(signalAmp,(Float_t) 1.0e9);
1034               Int_t adc  = (Int_t) signalAmp;
1035               if (adc > 0) nDigits++;
1036               digits->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,adc);
1037             }
1038
1039           }
1040           // Create normal digits
1041           else {
1042
1043             for (iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {         
1044               Float_t signalAmp = signals->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
1045               // Add the noise
1046               signalAmp  = TMath::Max((Double_t) gRandom->Gaus(signalAmp,fPar->GetNoise()),0.0);
1047               // Convert to mV
1048               signalAmp *= convert;
1049               // Convert to ADC counts. Set the overflow-bit fADCoutRange if the 
1050               // signal is larger than fADCinRange
1051               Int_t adc  = 0;
1052               if (signalAmp >= fPar->GetADCinRange()) {
1053                 adc = ((Int_t) fPar->GetADCoutRange());
1054               }
1055               else {
1056                 adc = ((Int_t) (signalAmp * (fPar->GetADCoutRange() 
1057                                            / fPar->GetADCinRange())));
1058               }
1059               inADC[iTime]  = adc;
1060               outADC[iTime] = adc;
1061             }
1062
1063             // Apply the tail cancelation via the digital filter
1064             if (fPar->TCOn()) {
1065               DeConvExp(inADC,outADC,nTimeTotal,fPar->GetTCnexp());
1066             }
1067
1068             for (iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {   
1069               // Store the amplitude of the digit if above threshold
1070               if (outADC[iTime] > fPar->GetADCthreshold()) {
1071                 if (fDebug > 2) {
1072                   printf("  iRow = %d, iCol = %d, iTime = %d, adc = %f\n"
1073                         ,iRow,iCol,iTime,outADC[iTime]);
1074                 }
1075                 nDigits++;
1076                 digits->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,outADC[iTime]);
1077               }
1078             }
1079
1080           }
1081
1082         }
1083       }
1084
1085     }
1086
1087     // Compress the arrays
1088     digits->Compress(1,0);
1089     for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
1090       dictionary[iDict]->Compress(1,0);
1091     }
1092
1093     totalSizeDigits += digits->GetSize();
1094     totalSizeDict0  += dictionary[0]->GetSize();
1095     totalSizeDict1  += dictionary[1]->GetSize();
1096     totalSizeDict2  += dictionary[2]->GetSize();
1097
1098     Float_t nPixel = nRowMax * nColMax * nTimeMax;
1099     if (fDebug > 0) {
1100       printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
1101       printf("Found %d digits in detector %d (%3.0f).\n"
1102             ,nDigits,iDet
1103             ,100.0 * ((Float_t) nDigits) / nPixel);
1104     } 
1105
1106     if (fCompress) signals->Compress(1,0);
1107
1108     delete [] inADC;
1109     delete [] outADC;
1110
1111   }
1112
1113   if (fDebug > 0) {
1114     printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
1115     printf("Total number of analyzed hits = %d\n",countHits);
1116     printf("<AliTRDdigitizer::MakeDigits> ");
1117     printf("Total digits data size = %d, %d, %d, %d\n",totalSizeDigits
1118                                                       ,totalSizeDict0
1119                                                       ,totalSizeDict1
1120                                                       ,totalSizeDict2);        
1121   }
1122
1123   return kTRUE;
1124
1125 }
1126
1127 //_____________________________________________________________________________
1128 void AliTRDdigitizer::AddSDigitsManager(AliTRDdigitsManager *man)
1129 {
1130   //
1131   // Add a digits manager for s-digits to the input list.
1132   //
1133
1134   fSDigitsManagerList->Add(man);
1135
1136 }
1137
1138 //_____________________________________________________________________________
1139 void AliTRDdigitizer::DeleteSDigitsManager()
1140 {
1141   //
1142   // Removes digits manager from the input list.
1143   //
1144
1145   fSDigitsManagerList->Delete();
1146
1147 }
1148
1149 //_____________________________________________________________________________
1150 Bool_t AliTRDdigitizer::ConvertSDigits()
1151 {
1152   //
1153   // Converts s-digits to normal digits
1154   //
1155
1156   // Number of track dictionary arrays
1157   const Int_t    kNDict = AliTRDdigitsManager::kNDict;
1158
1159   // Converts number of electrons to fC
1160   const Double_t kEl2fC = 1.602E-19 * 1.0E15; 
1161
1162   Int_t iDict = 0;
1163   Int_t iRow;
1164   Int_t iCol;
1165   Int_t iTime;
1166
1167   if (!fPar) {    
1168     fPar = new AliTRDparameter("TRDparameter","Standard parameter");
1169     if (fDebug > 0) {
1170       printf("<AliTRDdigitizer::ConvertSDigits> ");
1171       printf("Create the default parameter object\n");
1172     }
1173   }
1174
1175   Double_t sDigitsScale = 1.0 / GetSDigitsScale();
1176   Double_t noise        = fPar->GetNoise();
1177   Double_t padCoupling  = fPar->GetPadCoupling();
1178   Double_t timeCoupling = fPar->GetTimeCoupling();
1179   Double_t chipGain     = fPar->GetChipGain();
1180   Double_t convert      = kEl2fC * padCoupling * timeCoupling * chipGain;;
1181   Double_t adcInRange   = fPar->GetADCinRange();
1182   Double_t adcOutRange  = fPar->GetADCoutRange();
1183   Int_t    adcThreshold = fPar->GetADCthreshold();
1184
1185   AliTRDdataArrayI *digitsIn;
1186   AliTRDdataArrayI *digitsOut;
1187   AliTRDdataArrayI *dictionaryIn[kNDict];
1188   AliTRDdataArrayI *dictionaryOut[kNDict];
1189
1190   // Loop through the detectors
1191   for (Int_t iDet = 0; iDet < AliTRDgeometry::Ndet(); iDet++) {
1192
1193     if (fDebug > 0) {
1194       printf("<AliTRDdigitizer::ConvertSDigits> ");
1195       printf("Convert detector %d to digits.\n",iDet);
1196     }
1197
1198     Int_t plane      = fGeo->GetPlane(iDet);
1199     Int_t sector     = fGeo->GetSector(iDet);
1200     Int_t chamber    = fGeo->GetChamber(iDet);
1201     Int_t nRowMax    = fPar->GetRowMax(plane,chamber,sector);
1202     Int_t nColMax    = fPar->GetColMax(plane);
1203     Int_t nTimeTotal = fPar->GetTimeTotal();
1204
1205     Double_t *inADC  = new Double_t[nTimeTotal];
1206     Double_t *outADC = new Double_t[nTimeTotal];
1207
1208     digitsIn  = fSDigitsManager->GetDigits(iDet);
1209     digitsIn->Expand();
1210     digitsOut = fDigitsManager->GetDigits(iDet);
1211     digitsOut->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
1212     for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
1213       dictionaryIn[iDict]  = fSDigitsManager->GetDictionary(iDet,iDict);
1214       dictionaryIn[iDict]->Expand();
1215       dictionaryOut[iDict] = fDigitsManager->GetDictionary(iDet,iDict);
1216       dictionaryOut[iDict]->Allocate(nRowMax,nColMax,nTimeTotal);
1217     }
1218
1219     for (iRow  = 0; iRow  <  nRowMax;   iRow++ ) {
1220       for (iCol  = 0; iCol  <  nColMax;   iCol++ ) {
1221
1222         for (iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {         
1223           Double_t signal = (Double_t) digitsIn->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
1224           signal *= sDigitsScale;
1225           // Add the noise
1226           signal  = TMath::Max((Double_t) gRandom->Gaus(signal,noise),0.0);
1227           // Convert to mV
1228           signal *= convert;
1229           // Convert to ADC counts. Set the overflow-bit adcOutRange if the 
1230           // signal is larger than adcInRange
1231           Int_t adc  = 0;
1232           if (signal >= adcInRange) {
1233             adc = ((Int_t) adcOutRange);
1234           }
1235           else {
1236             adc = ((Int_t) (signal * (adcOutRange / adcInRange)));
1237           }
1238           inADC[iTime]  = adc;
1239           outADC[iTime] = adc;
1240         }
1241
1242         // Apply the tail cancelation via the digital filter
1243         if (fPar->TCOn()) {
1244           DeConvExp(inADC,outADC,nTimeTotal,fPar->GetTCnexp());
1245         }
1246
1247         for (iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {   
1248           // Store the amplitude of the digit if above threshold
1249           if (outADC[iTime] > adcThreshold) {
1250             digitsOut->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,outADC[iTime]);
1251             // Copy the dictionary
1252             for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) { 
1253               Int_t track = dictionaryIn[iDict]->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
1254               dictionaryOut[iDict]->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,track);
1255             }
1256           }
1257         }
1258
1259       }
1260     }
1261
1262     if (fCompress) {
1263       digitsIn->Compress(1,0);
1264       digitsOut->Compress(1,0);
1265       for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
1266         dictionaryIn[iDict]->Compress(1,0);
1267         dictionaryOut[iDict]->Compress(1,0);
1268       }
1269     }
1270
1271     delete [] inADC;
1272     delete [] outADC;
1273
1274   }    
1275
1276   return kTRUE;
1277
1278 }
1279
1280 //_____________________________________________________________________________
1281 Bool_t AliTRDdigitizer::MergeSDigits()
1282 {
1283   //
1284   // Merges the input s-digits:
1285   //   - The amplitude of the different inputs are summed up.
1286   //   - Of the track IDs from the input dictionaries only one is
1287   //     kept for each input. This works for maximal 3 different merged inputs.
1288   //
1289
1290   // Number of track dictionary arrays
1291   const Int_t kNDict = AliTRDdigitsManager::kNDict;
1292
1293   if (!fPar) {
1294     fPar = new AliTRDparameter("TRDparameter","Standard parameter");
1295     if (fDebug > 0) {
1296       printf("<AliTRDdigitizer::MergeSDigits> ");
1297       printf("Create the default parameter object\n");
1298     }
1299   }
1300
1301   Int_t iDict = 0;
1302   Int_t jDict = 0;
1303
1304   AliTRDdataArrayI *digitsA;
1305   AliTRDdataArrayI *digitsB;
1306   AliTRDdataArrayI *dictionaryA[kNDict];
1307   AliTRDdataArrayI *dictionaryB[kNDict];
1308
1309   // Get the first s-digits
1310   fSDigitsManager = (AliTRDdigitsManager *) fSDigitsManagerList->First();
1311   if (!fSDigitsManager) return kFALSE;
1312
1313   // Loop through the other sets of s-digits
1314   AliTRDdigitsManager *mergeSDigitsManager;
1315   mergeSDigitsManager = (AliTRDdigitsManager *) 
1316                         fSDigitsManagerList->After(fSDigitsManager);
1317
1318   if (fDebug > 0) {
1319     if (mergeSDigitsManager) {
1320       printf("<AliTRDdigitizer::MergeSDigits> ");
1321       printf("Merge %d input files.\n",fSDigitsManagerList->GetSize());
1322     }
1323     else {
1324       printf("<AliTRDdigitizer::MergeSDigits> ");
1325       printf("Only one input file.\n");
1326     }
1327   }
1328
1329   Int_t iMerge = 0;
1330   while (mergeSDigitsManager) {
1331
1332     iMerge++;
1333
1334     // Loop through the detectors
1335     for (Int_t iDet = 0; iDet < AliTRDgeometry::Ndet(); iDet++) {
1336
1337       Int_t plane      = fGeo->GetPlane(iDet);
1338       Int_t sector     = fGeo->GetSector(iDet);
1339       Int_t chamber    = fGeo->GetChamber(iDet);
1340       Int_t nRowMax    = fPar->GetRowMax(plane,chamber,sector);
1341       Int_t nColMax    = fPar->GetColMax(plane);
1342       Int_t nTimeTotal = fPar->GetTimeTotal();
1343
1344       // Loop through the pixels of one detector and add the signals
1345       digitsA = fSDigitsManager->GetDigits(iDet);
1346       digitsB = mergeSDigitsManager->GetDigits(iDet);
1347       digitsA->Expand();
1348       digitsB->Expand();
1349       for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
1350         dictionaryA[iDict] = fSDigitsManager->GetDictionary(iDet,iDict);
1351         dictionaryB[iDict] = mergeSDigitsManager->GetDictionary(iDet,iDict);
1352         dictionaryA[iDict]->Expand();
1353         dictionaryB[iDict]->Expand();
1354       }
1355
1356       // Merge only detectors that contain a signal
1357       Bool_t doMerge = kTRUE;
1358       if (fMergeSignalOnly) {
1359         if (digitsA->GetOverThreshold(0) == 0) {
1360           doMerge = kFALSE;
1361         }
1362       }
1363
1364       if (doMerge) {
1365
1366         if (fDebug > 0) {
1367           printf("<AliTRDdigitizer::MergeSDigits> ");
1368           printf("Merge detector %d of input no.%d\n",iDet,iMerge+1);
1369         }
1370
1371         for (Int_t iRow  = 0; iRow  <  nRowMax;   iRow++ ) {
1372           for (Int_t iCol  = 0; iCol  <  nColMax;   iCol++ ) {
1373             for (Int_t iTime = 0; iTime < nTimeTotal; iTime++) {         
1374
1375               // Add the amplitudes of the summable digits 
1376               Int_t ampA = digitsA->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
1377               Int_t ampB = digitsB->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
1378               ampA += ampB;
1379               digitsA->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,ampA);
1380
1381              // Add the mask to the track id if defined.
1382               for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
1383                 Int_t trackB = dictionaryB[iDict]->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
1384                 if ((fMasks) && (trackB > 0)) {
1385                   for (jDict = 0; jDict < kNDict; jDict++) { 
1386                     Int_t trackA = dictionaryA[iDict]->GetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime);
1387                     if (trackA == 0) {
1388                       trackA = trackB + fMasks[iMerge];
1389                       dictionaryA[iDict]->SetDataUnchecked(iRow,iCol,iTime,trackA);
1390                     }
1391                   }
1392                 }
1393               }
1394
1395             }
1396           }
1397         }
1398
1399       }
1400
1401       if (fCompress) {
1402         digitsA->Compress(1,0);
1403         digitsB->Compress(1,0);
1404         for (iDict = 0; iDict < kNDict; iDict++) {
1405           dictionaryA[iDict]->Compress(1,0);
1406           dictionaryB[iDict]->Compress(1,0);
1407         }
1408       }
1409
1410     }    
1411
1412     // The next set of s-digits
1413     mergeSDigitsManager = (AliTRDdigitsManager *) 
1414                           fSDigitsManagerList->After(mergeSDigitsManager);
1415
1416   }
1417
1418   return kTRUE;
1419
1420 }
1421
1422 //_____________________________________________________________________________
1423 Bool_t AliTRDdigitizer::SDigits2Digits()
1424 {
1425   //
1426   // Merges the input s-digits and converts them to normal digits
1427   //
1428
1429   if (!MergeSDigits()) return kFALSE;
1430
1431   return ConvertSDigits();
1432
1433 }
1434
1435 //_____________________________________________________________________________
1436 Bool_t AliTRDdigitizer::CheckDetector(Int_t plane, Int_t chamber, Int_t sector)
1437 {
1438   //
1439   // Checks whether a detector is enabled
1440   //
1441
1442   if ((fTRD->GetSensChamber() >=       0) &&
1443       (fTRD->GetSensChamber() != chamber)) return kFALSE;
1444   if ((fTRD->GetSensPlane()   >=       0) &&
1445       (fTRD->GetSensPlane()   !=   plane)) return kFALSE;
1446   if ( fTRD->GetSensSector()  >=       0) {
1447     Int_t sens1 = fTRD->GetSensSector();
1448     Int_t sens2 = sens1 + fTRD->GetSensSectorRange();
1449     sens2 -= ((Int_t) (sens2 / AliTRDgeometry::Nsect())) 
1450            * AliTRDgeometry::Nsect();
1451     if (sens1 < sens2) {
1452       if ((sector < sens1) || (sector >= sens2)) return kFALSE;
1453     }
1454     else {
1455       if ((sector < sens1) && (sector >= sens2)) return kFALSE;
1456     }
1457   }
1458
1459   return kTRUE;
1460
1461 }
1462
1463 //_____________________________________________________________________________
1464 Bool_t AliTRDdigitizer::WriteDigits() const
1465 {
1466   //
1467   // Writes out the TRD-digits and the dictionaries
1468   //
1469
1470   // Store the digits and the dictionary in the tree
1471   return fDigitsManager->WriteDigits();
1472
1473 }
1474
1475 //_____________________________________________________________________________
1476 void AliTRDdigitizer::DeConvExp(Double_t *source, Double_t *target
1477                               , Int_t n, Int_t nexp) 
1478 {
1479   //
1480   // Does the deconvolution by the digital filter.
1481   //
1482   // Author:        Marcus Gutfleisch, KIP Heidelberg
1483   // Optimized for: New TRF from Venelin Angelov, simulated with CADENCE
1484   //                Pad-ground capacitance = 25 pF
1485   //                Pad-pad cross talk capacitance = 6 pF
1486   //                For 10 MHz digitization, corresponding to 20 time bins
1487   //                in the drift region
1488   //
1489
1490   Double_t rates[2];
1491   Double_t coefficients[2];
1492
1493   /* initialize (coefficient = alpha, rates = lambda) */
1494   
1495   if( nexp == 1 ) {
1496     rates[0] = 0.466998;
1497     /* no rescaling */
1498     coefficients[0] = 1.0;
1499   }
1500   if( nexp == 2 ) {
1501     rates[0] = 0.8988162;
1502     coefficients[0] = 0.11392069;
1503     rates[1] = 0.3745688;
1504     coefficients[1] = 0.8860793;
1505     /* no rescaling */
1506     Float_t sumc = coefficients[0]+coefficients[1];
1507     coefficients[0] /= sumc;
1508     coefficients[1] /= sumc;
1509   }
1510       
1511   Int_t i, k;
1512   Double_t reminder[2];
1513   Double_t correction, result;
1514
1515   /* attention: computation order is important */
1516   correction=0.0;
1517   for ( k = 0; k < nexp; k++ ) reminder[k]=0.0;
1518     
1519   for ( i = 0; i < n; i++ ) {
1520     result = ( source[i] - correction );    /* no rescaling */
1521     target[i] = result;
1522     
1523     for ( k = 0; k < nexp; k++ ) reminder[k] = rates[k] 
1524                              * ( reminder[k] + coefficients[k] * result);
1525       
1526     correction=0.0;
1527     for ( k = 0; k < nexp; k++ ) correction += reminder[k];
1528   }
1529   
1530 }
1531
1532 //_____________________________________________________________________________
1533 void AliTRDdigitizer::InitOutput(TFile *file, Int_t iEvent)
1534 {
1535   //
1536   // Initializes the output branches
1537   //
1538
1539   fEvent = iEvent;
1540   fDigitsManager->MakeTreeAndBranches(file,iEvent);
1541
1542 }