define roads dynamically when attaching clusters based on
[u/mrichter/AliRoot.git] / TRD / AliTRDseedV1.cxx
1 /**************************************************************************
2 * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
3 *                                                                        *
4 * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
5 * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
6 *                                                                        *
7 * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
8 * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
9 * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
10 * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
11 * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
12 * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
13 * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
14 **************************************************************************/
15
16 /* $Id$ */
17
18 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
19 ////
20 //  The TRD offline tracklet
21 //
22 // The running horse of the TRD reconstruction. The following tasks are preformed:
23 //   1. Clusters attachment to tracks based on prior information stored at tracklet level (see AttachClusters)
24 //   2. Clusters position recalculation based on track information (see GetClusterXY and Fit)
25 //   3. Cluster error parametrization recalculation (see Fit)
26 //   4. Linear track approximation (Fit)
27 //   5. Optimal position (including z estimate for pad row cross tracklets) and covariance matrix of the track fit inside one TRD chamber (Fit)
28 //   6. Tilt pad correction and systematic effects (GetCovAt)
29 //   7. dEdx calculation (CookdEdx)
30 //   8. PID probabilities estimation (CookPID)
31 //
32 //  Authors:                                                              //
33 //    Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>                                     //
34 //    Markus Fasel <M.Fasel@gsi.de>                                       //
35 //                                                                        //
36 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
37
38 #include "TMath.h"
39 #include "TLinearFitter.h"
40 #include "TClonesArray.h" // tmp
41 #include <TTreeStream.h>
42
43 #include "AliLog.h"
44 #include "AliMathBase.h"
45 #include "AliCDBManager.h"
46 #include "AliTracker.h"
47
48 #include "AliTRDpadPlane.h"
49 #include "AliTRDcluster.h"
50 #include "AliTRDseedV1.h"
51 #include "AliTRDtrackV1.h"
52 #include "AliTRDcalibDB.h"
53 #include "AliTRDchamberTimeBin.h"
54 #include "AliTRDtrackingChamber.h"
55 #include "AliTRDtrackerV1.h"
56 #include "AliTRDReconstructor.h"
57 #include "AliTRDrecoParam.h"
58 #include "AliTRDCommonParam.h"
59
60 #include "Cal/AliTRDCalPID.h"
61 #include "Cal/AliTRDCalROC.h"
62 #include "Cal/AliTRDCalDet.h"
63
64 ClassImp(AliTRDseedV1)
65
66 //____________________________________________________________________
67 AliTRDseedV1::AliTRDseedV1(Int_t det) 
68   :AliTRDtrackletBase()
69   ,fReconstructor(0x0)
70   ,fClusterIter(0x0)
71   ,fExB(0.)
72   ,fVD(0.)
73   ,fT0(0.)
74   ,fS2PRF(0.)
75   ,fDiffL(0.)
76   ,fDiffT(0.)
77   ,fClusterIdx(0)
78   ,fN(0)
79   ,fDet(det)
80   ,fPt(0.)
81   ,fdX(0.)
82   ,fX0(0.)
83   ,fX(0.)
84   ,fY(0.)
85   ,fZ(0.)
86   ,fS2Y(0.)
87   ,fS2Z(0.)
88   ,fC(0.)
89   ,fChi2(0.)
90 {
91   //
92   // Constructor
93   //
94   for(Int_t ic=kNclusters; ic--;) fIndexes[ic] = -1;
95   memset(fClusters, 0, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
96   memset(fPad, 0, 3*sizeof(Float_t));
97   fYref[0] = 0.; fYref[1] = 0.; 
98   fZref[0] = 0.; fZref[1] = 0.; 
99   fYfit[0] = 0.; fYfit[1] = 0.; 
100   fZfit[0] = 0.; fZfit[1] = 0.; 
101   memset(fdEdx, 0, kNslices*sizeof(Float_t)); 
102   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++) fProb[ispec]  = -1.;
103   fLabels[0]=-1; fLabels[1]=-1; // most freq MC labels
104   fLabels[2]=0;  // number of different labels for tracklet
105   memset(fRefCov, 0, 7*sizeof(Double_t));
106   // covariance matrix [diagonal]
107   // default sy = 200um and sz = 2.3 cm 
108   fCov[0] = 4.e-4; fCov[1] = 0.; fCov[2] = 5.3; 
109   SetStandAlone(kFALSE);
110 }
111
112 //____________________________________________________________________
113 AliTRDseedV1::AliTRDseedV1(const AliTRDseedV1 &ref)
114   :AliTRDtrackletBase((AliTRDtrackletBase&)ref)
115   ,fReconstructor(0x0)
116   ,fClusterIter(0x0)
117   ,fExB(0.)
118   ,fVD(0.)
119   ,fT0(0.)
120   ,fS2PRF(0.)
121   ,fDiffL(0.)
122   ,fDiffT(0.)
123   ,fClusterIdx(0)
124   ,fN(0)
125   ,fDet(-1)
126   ,fPt(0.)
127   ,fdX(0.)
128   ,fX0(0.)
129   ,fX(0.)
130   ,fY(0.)
131   ,fZ(0.)
132   ,fS2Y(0.)
133   ,fS2Z(0.)
134   ,fC(0.)
135   ,fChi2(0.)
136 {
137   //
138   // Copy Constructor performing a deep copy
139   //
140   if(this != &ref){
141     ref.Copy(*this);
142   }
143   SetBit(kOwner, kFALSE);
144   SetStandAlone(ref.IsStandAlone());
145 }
146
147
148 //____________________________________________________________________
149 AliTRDseedV1& AliTRDseedV1::operator=(const AliTRDseedV1 &ref)
150 {
151   //
152   // Assignment Operator using the copy function
153   //
154
155   if(this != &ref){
156     ref.Copy(*this);
157   }
158   SetBit(kOwner, kFALSE);
159
160   return *this;
161 }
162
163 //____________________________________________________________________
164 AliTRDseedV1::~AliTRDseedV1()
165 {
166   //
167   // Destructor. The RecoParam object belongs to the underlying tracker.
168   //
169
170   //printf("I-AliTRDseedV1::~AliTRDseedV1() : Owner[%s]\n", IsOwner()?"YES":"NO");
171
172   if(IsOwner()) {
173     for(int itb=0; itb<kNclusters; itb++){
174       if(!fClusters[itb]) continue; 
175       //AliInfo(Form("deleting c %p @ %d", fClusters[itb], itb));
176       delete fClusters[itb];
177       fClusters[itb] = 0x0;
178     }
179   }
180 }
181
182 //____________________________________________________________________
183 void AliTRDseedV1::Copy(TObject &ref) const
184 {
185   //
186   // Copy function
187   //
188
189   //AliInfo("");
190   AliTRDseedV1 &target = (AliTRDseedV1 &)ref; 
191
192   target.fReconstructor = fReconstructor;
193   target.fClusterIter   = 0x0;
194   target.fExB           = fExB;
195   target.fVD            = fVD;
196   target.fT0            = fT0;
197   target.fS2PRF         = fS2PRF;
198   target.fDiffL         = fDiffL;
199   target.fDiffT         = fDiffT;
200   target.fClusterIdx    = 0;
201   target.fN             = fN;
202   target.fDet           = fDet;
203   target.fPt            = fPt;
204   target.fdX            = fdX;
205   target.fX0            = fX0;
206   target.fX             = fX;
207   target.fY             = fY;
208   target.fZ             = fZ;
209   target.fS2Y           = fS2Y;
210   target.fS2Z           = fS2Z;
211   target.fC             = fC;
212   target.fChi2          = fChi2;
213   
214   memcpy(target.fIndexes, fIndexes, kNclusters*sizeof(Int_t));
215   memcpy(target.fClusters, fClusters, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
216   memcpy(target.fPad, fPad, 3*sizeof(Float_t));
217   target.fYref[0] = fYref[0]; target.fYref[1] = fYref[1]; 
218   target.fZref[0] = fZref[0]; target.fZref[1] = fZref[1]; 
219   target.fYfit[0] = fYfit[0]; target.fYfit[1] = fYfit[1]; 
220   target.fZfit[0] = fZfit[0]; target.fZfit[1] = fZfit[1]; 
221   memcpy(target.fdEdx, fdEdx, kNslices*sizeof(Float_t)); 
222   memcpy(target.fProb, fProb, AliPID::kSPECIES*sizeof(Float_t)); 
223   memcpy(target.fLabels, fLabels, 3*sizeof(Int_t)); 
224   memcpy(target.fRefCov, fRefCov, 7*sizeof(Double_t)); 
225   memcpy(target.fCov, fCov, 3*sizeof(Double_t)); 
226   
227   TObject::Copy(ref);
228 }
229
230
231 //____________________________________________________________
232 Bool_t AliTRDseedV1::Init(AliTRDtrackV1 *track)
233 {
234 // Initialize this tracklet using the track information
235 //
236 // Parameters:
237 //   track - the TRD track used to initialize the tracklet
238 // 
239 // Detailed description
240 // The function sets the starting point and direction of the
241 // tracklet according to the information from the TRD track.
242 // 
243 // Caution
244 // The TRD track has to be propagated to the beginning of the
245 // chamber where the tracklet will be constructed
246 //
247
248   Double_t y, z; 
249   if(!track->GetProlongation(fX0, y, z)) return kFALSE;
250   Update(track);
251   return kTRUE;
252 }
253
254
255 //_____________________________________________________________________________
256 void AliTRDseedV1::Reset()
257 {
258   //
259   // Reset seed
260   //
261   fExB=0.;fVD=0.;fT0=0.;fS2PRF=0.;
262   fDiffL=0.;fDiffT=0.;
263   fClusterIdx=0;
264   fN=0;
265   fDet=-1;
266   fPt=0.;
267   fdX=0.;fX0=0.; fX=0.; fY=0.; fZ=0.;
268   fS2Y=0.; fS2Z=0.;
269   fC=0.; fChi2 = 0.;
270
271   for(Int_t ic=kNclusters; ic--;) fIndexes[ic] = -1;
272   memset(fClusters, 0, kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
273   memset(fPad, 0, 3*sizeof(Float_t));
274   fYref[0] = 0.; fYref[1] = 0.; 
275   fZref[0] = 0.; fZref[1] = 0.; 
276   fYfit[0] = 0.; fYfit[1] = 0.; 
277   fZfit[0] = 0.; fZfit[1] = 0.; 
278   memset(fdEdx, 0, kNslices*sizeof(Float_t)); 
279   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++) fProb[ispec]  = -1.;
280   fLabels[0]=-1; fLabels[1]=-1; // most freq MC labels
281   fLabels[2]=0;  // number of different labels for tracklet
282   memset(fRefCov, 0, 7*sizeof(Double_t));
283   // covariance matrix [diagonal]
284   // default sy = 200um and sz = 2.3 cm 
285   fCov[0] = 4.e-4; fCov[1] = 0.; fCov[2] = 5.3; 
286 }
287
288 //____________________________________________________________________
289 void AliTRDseedV1::Update(const AliTRDtrackV1 *trk)
290
291   // update tracklet reference position from the TRD track
292
293   Double_t fSnp = trk->GetSnp();
294   Double_t fTgl = trk->GetTgl();
295   fPt = trk->Pt();
296   Double_t norm =1./TMath::Sqrt(1. - fSnp*fSnp); 
297   fYref[1] = fSnp*norm;
298   fZref[1] = fTgl*norm;
299   SetCovRef(trk->GetCovariance());
300
301   Double_t dx = trk->GetX() - fX0;
302   fYref[0] = trk->GetY() - dx*fYref[1];
303   fZref[0] = trk->GetZ() - dx*fZref[1];
304 }
305
306 //_____________________________________________________________________________
307 void AliTRDseedV1::UpdateUsed()
308 {
309   //
310   // Calculate number of used clusers in the tracklet
311   //
312
313   Int_t nused = 0, nshared = 0;
314   for (Int_t i = kNclusters; i--; ) {
315     if (!fClusters[i]) continue;
316     if(fClusters[i]->IsUsed()){ 
317       nused++;
318     } else if(fClusters[i]->IsShared()){
319       if(IsStandAlone()) nused++;
320       else nshared++;
321     }
322   }
323   SetNUsed(nused);
324   SetNShared(nshared);
325 }
326
327 //_____________________________________________________________________________
328 void AliTRDseedV1::UseClusters()
329 {
330   //
331   // Use clusters
332   //
333   // In stand alone mode:
334   // Clusters which are marked as used or shared from another track are
335   // removed from the tracklet
336   //
337   // In barrel mode:
338   // - Clusters which are used by another track become shared
339   // - Clusters which are attached to a kink track become shared
340   //
341   AliTRDcluster **c = &fClusters[0];
342   for (Int_t ic=kNclusters; ic--; c++) {
343     if(!(*c)) continue;
344     if(IsStandAlone()){
345       if((*c)->IsShared() || (*c)->IsUsed()){ 
346         if((*c)->IsShared()) SetNShared(GetNShared()-1);
347         else SetNUsed(GetNUsed()-1);
348         (*c) = 0x0;
349         fIndexes[ic] = -1;
350         SetN(GetN()-1);
351         continue;
352       }
353     } else {
354       if((*c)->IsUsed() || IsKink()){
355         (*c)->SetShared();
356         continue;
357       }
358     }
359     (*c)->Use();
360   }
361 }
362
363
364
365 //____________________________________________________________________
366 void AliTRDseedV1::CookdEdx(Int_t nslices)
367 {
368 // Calculates average dE/dx for all slices and store them in the internal array fdEdx. 
369 //
370 // Parameters:
371 //  nslices : number of slices for which dE/dx should be calculated
372 // Output:
373 //  store results in the internal array fdEdx. This can be accessed with the method
374 //  AliTRDseedV1::GetdEdx()
375 //
376 // Detailed description
377 // Calculates average dE/dx for all slices. Depending on the PID methode 
378 // the number of slices can be 3 (LQ) or 8(NN). 
379 // The calculation of dQ/dl are done using the tracklet fit results (see AliTRDseedV1::GetdQdl(Int_t))
380 //
381 // The following effects are included in the calculation:
382 // 1. calibration values for t0 and vdrift (using x coordinate to calculate slice)
383 // 2. cluster sharing (optional see AliTRDrecoParam::SetClusterSharing())
384 // 3. cluster size
385 //
386
387   Int_t nclusters[kNslices]; 
388   memset(nclusters, 0, kNslices*sizeof(Int_t));
389   memset(fdEdx, 0, kNslices*sizeof(Float_t));
390
391   const Double_t kDriftLength = (.5 * AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick());
392
393   AliTRDcluster *c = 0x0;
394   for(int ic=0; ic<AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); ic++){
395     if(!(c = fClusters[ic]) && !(c = fClusters[ic+kNtb])) continue;
396     Float_t dx = TMath::Abs(fX0 - c->GetX());
397     
398     // Filter clusters for dE/dx calculation
399     
400     // 1.consider calibration effects for slice determination
401     Int_t slice;
402     if(dx<kDriftLength){ // TODO should be replaced by c->IsInChamber() 
403       slice = Int_t(dx * nslices / kDriftLength);
404     } else slice = c->GetX() < fX0 ? nslices-1 : 0;
405
406
407     // 2. take sharing into account
408     Float_t w = /*c->IsShared() ? .5 :*/ 1.;
409     
410     // 3. take into account large clusters TODO
411     //w *= c->GetNPads() > 3 ? .8 : 1.;
412     
413     //CHECK !!!
414     fdEdx[slice]   += w * GetdQdl(ic); //fdQdl[ic];
415     nclusters[slice]++;
416   } // End of loop over clusters
417
418   //if(fReconstructor->GetPIDMethod() == AliTRDReconstructor::kLQPID){
419   if(nslices == AliTRDpidUtil::kLQslices){
420   // calculate mean charge per slice (only LQ PID)
421     for(int is=0; is<nslices; is++){ 
422       if(nclusters[is]) fdEdx[is] /= nclusters[is];
423     }
424   }
425 }
426
427 //_____________________________________________________________________________
428 void AliTRDseedV1::CookLabels()
429 {
430   //
431   // Cook 2 labels for seed
432   //
433
434   Int_t labels[200];
435   Int_t out[200];
436   Int_t nlab = 0;
437   for (Int_t i = 0; i < kNclusters; i++) {
438     if (!fClusters[i]) continue;
439     for (Int_t ilab = 0; ilab < 3; ilab++) {
440       if (fClusters[i]->GetLabel(ilab) >= 0) {
441         labels[nlab] = fClusters[i]->GetLabel(ilab);
442         nlab++;
443       }
444     }
445   }
446
447   fLabels[2] = AliMathBase::Freq(nlab,labels,out,kTRUE);
448   fLabels[0] = out[0];
449   if ((fLabels[2]  > 1) && (out[3] > 1)) fLabels[1] = out[2];
450 }
451
452
453 //____________________________________________________________________
454 Float_t AliTRDseedV1::GetdQdl(Int_t ic, Float_t *dl) const
455 {
456 // Using the linear approximation of the track inside one TRD chamber (TRD tracklet) 
457 // the charge per unit length can be written as:
458 // BEGIN_LATEX
459 // #frac{dq}{dl} = #frac{q_{c}}{dx * #sqrt{1 + #(){#frac{dy}{dx}}^{2}_{fit} + #(){#frac{dy}{dx}}^{2}_{ref}}}
460 // END_LATEX
461 // where qc is the total charge collected in the current time bin and dx is the length 
462 // of the time bin. 
463 // The following correction are applied :
464 //   - charge : pad row cross corrections
465 //              [diffusion and TRF assymetry] TODO
466 //   - dx     : anisochronity, track inclination - see Fit and AliTRDcluster::GetXloc() 
467 //              and AliTRDcluster::GetYloc() for the effects taken into account
468 // 
469 // Author : Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
470 //
471   Float_t dq = 0.;
472   if(fClusters[ic]){ 
473     if(!fClusters[ic]->IsInChamber()) return 0.;
474     dq += TMath::Abs(fClusters[ic]->GetQ());
475   }
476   if(fClusters[ic+kNtb]) dq += TMath::Abs(fClusters[ic+kNtb]->GetQ());
477   if(dq<1.e-3) return 0.;
478   
479
480   Double_t dx = fdX;
481   if(ic-1>=0 && ic+1<kNtb){
482     Float_t x2(0.), x1(0.);
483     // try to estimate upper radial position
484     if(fClusters[ic-1]) x2 = fClusters[ic-1]->GetX(); 
485     else if(fClusters[ic-1+kNtb]) x2 = fClusters[ic-1+kNtb]->GetX(); 
486     else if(fClusters[ic]) x2 = fClusters[ic]->GetX()+fdX;
487     else x2 = fClusters[ic+kNtb]->GetX()+fdX;
488     // try to estimate lower radial position
489     if(fClusters[ic+1]) x1 = fClusters[ic+1]->GetX();
490     else if(fClusters[ic+1+kNtb]) x1 = fClusters[ic+1+kNtb]->GetX();
491     else if(fClusters[ic]) x1 = fClusters[ic]->GetX()-fdX;
492     else x1 = fClusters[ic+kNtb]->GetX()-fdX;
493
494     dx = .5*(x2 - x1);
495   }
496   dx *= TMath::Sqrt(1. + fYfit[1]*fYfit[1] + fZref[1]*fZref[1]);
497
498   if(dl) (*dl) = dx;
499   return dq/dx;
500 }
501
502 //____________________________________________________________
503 Float_t AliTRDseedV1::GetMomentum(Float_t *err) const
504
505 // Returns momentum of the track after update with the current tracklet as:
506 // BEGIN_LATEX
507 // p=#frac{1}{1/p_{t}} #sqrt{1+tgl^{2}}
508 // END_LATEX
509 // and optionally the momentum error (if err is not null). 
510 // The estimated variance of the momentum is given by:
511 // BEGIN_LATEX
512 // #sigma_{p}^{2} = (#frac{dp}{dp_{t}})^{2} #sigma_{p_{t}}^{2}+(#frac{dp}{dtgl})^{2} #sigma_{tgl}^{2}+2#frac{dp}{dp_{t}}#frac{dp}{dtgl} cov(tgl,1/p_{t})
513 // END_LATEX
514 // which can be simplified to
515 // BEGIN_LATEX
516 // #sigma_{p}^{2} = p^{2}p_{t}^{4}tgl^{2}#sigma_{tgl}^{2}-2p^{2}p_{t}^{3}tgl cov(tgl,1/p_{t})+p^{2}p_{t}^{2}#sigma_{1/p_{t}}^{2}
517 // END_LATEX
518 //
519
520   Double_t p = fPt*TMath::Sqrt(1.+fZref[1]*fZref[1]);
521   Double_t p2 = p*p;
522   Double_t tgl2 = fZref[1]*fZref[1];
523   Double_t pt2 = fPt*fPt;
524   if(err){
525     Double_t s2 = 
526       p2*tgl2*pt2*pt2*fRefCov[4]
527      -2.*p2*fZref[1]*fPt*pt2*fRefCov[5]
528      +p2*pt2*fRefCov[6];
529     (*err) = TMath::Sqrt(s2);
530   }
531   return p;
532 }
533
534
535 //____________________________________________________________________
536 Float_t* AliTRDseedV1::GetProbability(Bool_t force)
537 {       
538   if(!force) return &fProb[0];
539   if(!CookPID()) return 0x0;
540   return &fProb[0];
541 }
542
543 //____________________________________________________________
544 Bool_t AliTRDseedV1::CookPID()
545 {
546 // Fill probability array for tracklet from the DB.
547 //
548 // Parameters
549 //
550 // Output
551 //   returns pointer to the probability array and 0x0 if missing DB access 
552 //
553 // Detailed description
554
555   
556   // retrive calibration db
557   AliTRDcalibDB *calibration = AliTRDcalibDB::Instance();
558   if (!calibration) {
559     AliError("No access to calibration data");
560     return kFALSE;
561   }
562
563   if (!fReconstructor) {
564     AliError("Reconstructor not set.");
565     return kFALSE;
566   }
567
568   // Retrieve the CDB container class with the parametric detector response
569   const AliTRDCalPID *pd = calibration->GetPIDObject(fReconstructor->GetPIDMethod());
570   if (!pd) {
571     AliError("No access to AliTRDCalPID object");
572     return kFALSE;
573   }
574   //AliInfo(Form("Method[%d] : %s", fReconstructor->GetRecoParam() ->GetPIDMethod(), pd->IsA()->GetName()));
575
576   // calculate tracklet length TO DO
577   Float_t length = (AliTRDgeometry::AmThick() + AliTRDgeometry::DrThick());
578   /// TMath::Sqrt((1.0 - fSnp[iPlane]*fSnp[iPlane]) / (1.0 + fTgl[iPlane]*fTgl[iPlane]));
579   
580   //calculate dE/dx
581   CookdEdx(fReconstructor->GetNdEdxSlices());
582   
583   // Sets the a priori probabilities
584   for(int ispec=0; ispec<AliPID::kSPECIES; ispec++) {
585     fProb[ispec] = pd->GetProbability(ispec, GetMomentum(), &fdEdx[0], length, GetPlane());     
586   }
587
588   return kTRUE;
589 }
590
591 //____________________________________________________________________
592 Float_t AliTRDseedV1::GetQuality(Bool_t kZcorr) const
593 {
594   //
595   // Returns a quality measurement of the current seed
596   //
597
598   Float_t zcorr = kZcorr ? GetTilt() * (fZfit[0] - fZref[0]) : 0.;
599   return 
600       .5 * TMath::Abs(18.0 - GetN())
601     + 10.* TMath::Abs(fYfit[1] - fYref[1])
602     + 5. * TMath::Abs(fYfit[0] - fYref[0] + zcorr)
603     + 2. * TMath::Abs(fZfit[0] - fZref[0]) / GetPadLength();
604 }
605
606 //____________________________________________________________________
607 void AliTRDseedV1::GetCovAt(Double_t x, Double_t *cov) const
608 {
609 // Computes covariance in the y-z plane at radial point x (in tracking coordinates) 
610 // and returns the results in the preallocated array cov[3] as :
611 //   cov[0] = Var(y)
612 //   cov[1] = Cov(yz)
613 //   cov[2] = Var(z)
614 //
615 // Details
616 //
617 // For the linear transformation
618 // BEGIN_LATEX
619 // Y = T_{x} X^{T}
620 // END_LATEX
621 //   The error propagation has the general form
622 // BEGIN_LATEX
623 // C_{Y} = T_{x} C_{X} T_{x}^{T} 
624 // END_LATEX
625 //  We apply this formula 2 times. First to calculate the covariance of the tracklet 
626 // at point x we consider: 
627 // BEGIN_LATEX
628 // T_{x} = (1 x); X=(y0 dy/dx); C_{X}=#(){#splitline{Var(y0) Cov(y0, dy/dx)}{Cov(y0, dy/dx) Var(dy/dx)}} 
629 // END_LATEX
630 // and secondly to take into account the tilt angle
631 // BEGIN_LATEX
632 // T_{#alpha} = #(){#splitline{cos(#alpha) __ sin(#alpha)}{-sin(#alpha) __ cos(#alpha)}}; X=(y z); C_{X}=#(){#splitline{Var(y)    0}{0   Var(z)}} 
633 // END_LATEX
634 //
635 // using simple trigonometrics one can write for this last case
636 // BEGIN_LATEX
637 // C_{Y}=#frac{1}{1+tg^{2}#alpha} #(){#splitline{(#sigma_{y}^{2}+tg^{2}#alpha#sigma_{z}^{2}) __ tg#alpha(#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})}{tg#alpha(#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2}) __ (#sigma_{z}^{2}+tg^{2}#alpha#sigma_{y}^{2})}} 
638 // END_LATEX
639 // which can be aproximated for small alphas (2 deg) with
640 // BEGIN_LATEX
641 // C_{Y}=#(){#splitline{#sigma_{y}^{2} __ (#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})tg#alpha}{((#sigma_{z}^{2}-#sigma_{y}^{2})tg#alpha __ #sigma_{z}^{2}}} 
642 // END_LATEX
643 //
644 // before applying the tilt rotation we also apply systematic uncertainties to the tracklet 
645 // position which can be tunned from outside via the AliTRDrecoParam::SetSysCovMatrix(). They might 
646 // account for extra misalignment/miscalibration uncertainties. 
647 //
648 // Author :
649 // Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de> 
650 // Date : Jan 8th 2009
651 //
652
653
654   Double_t xr     = fX0-x; 
655   Double_t sy2    = fCov[0] +2.*xr*fCov[1] + xr*xr*fCov[2];
656   Double_t sz2    = fS2Z;
657   //GetPadLength()*GetPadLength()/12.;
658
659   // insert systematic uncertainties
660   if(fReconstructor){
661     Double_t sys[15]; memset(sys, 0, 15*sizeof(Double_t));
662     fReconstructor->GetRecoParam()->GetSysCovMatrix(sys);
663     sy2 += sys[0];
664     sz2 += sys[1];
665   }
666   // rotate covariance matrix
667   Double_t t2 = GetTilt()*GetTilt();
668   Double_t correction = 1./(1. + t2);
669   cov[0] = (sy2+t2*sz2)*correction;
670   cov[1] = GetTilt()*(sz2 - sy2)*correction;
671   cov[2] = (t2*sy2+sz2)*correction;
672
673   //printf("C(%6.1f %+6.3f %6.1f)  [%s]\n", 1.e4*TMath::Sqrt(cov[0]), cov[1], 1.e4*TMath::Sqrt(cov[2]), IsRowCross()?" RC ":"-");
674 }
675
676 //____________________________________________________________
677 Double_t AliTRDseedV1::GetCovSqrt(Double_t *c, Double_t *d)
678 {
679 // Helper function to calculate the square root of the covariance matrix. 
680 // The input matrix is stored in the vector c and the result in the vector d. 
681 // Both arrays have to be initialized by the user with at least 3 elements. Return negative in case of failure.
682 // 
683 // For calculating the square root of the symmetric matrix c
684 // the following relation is used:
685 // BEGIN_LATEX
686 // C^{1/2} = VD^{1/2}V^{-1}
687 // END_LATEX
688 // with V being the matrix with the n eigenvectors as columns. 
689 // In case C is symmetric the followings are true:
690 //   - matrix D is diagonal with the diagonal given by the eigenvalues of C
691 //   - V = V^{-1}
692 //
693 // Author A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
694 // Date   Mar 19 2009
695
696   Double_t L[2], // eigenvalues
697            V[3]; // eigenvectors
698   // the secular equation and its solution :
699   // (c[0]-L)(c[2]-L)-c[1]^2 = 0
700   // L^2 - L*Tr(c)+DET(c) = 0
701   // L12 = [Tr(c) +- sqrt(Tr(c)^2-4*DET(c))]/2
702   Double_t Tr = c[0]+c[2],           // trace
703           DET = c[0]*c[2]-c[1]*c[1]; // determinant
704   if(TMath::Abs(DET)<1.e-20) return -1.;
705   Double_t DD = TMath::Sqrt(Tr*Tr - 4*DET);
706   L[0] = .5*(Tr + DD);
707   L[1] = .5*(Tr - DD);
708   if(L[0]<0. || L[1]<0.) return -1.;
709
710   // the sym V matrix
711   // | v00   v10|
712   // | v10   v11|
713   Double_t tmp = (L[0]-c[0])/c[1];
714   V[0] = TMath::Sqrt(1./(tmp*tmp+1));
715   V[1] = tmp*V[0];
716   V[2] = V[1]*c[1]/(L[1]-c[2]);
717   // the VD^{1/2}V is: 
718   L[0] = TMath::Sqrt(L[0]); L[1] = TMath::Sqrt(L[1]);
719   d[0] = V[0]*V[0]*L[0]+V[1]*V[1]*L[1];
720   d[1] = V[0]*V[1]*L[0]+V[1]*V[2]*L[1];
721   d[2] = V[1]*V[1]*L[0]+V[2]*V[2]*L[1];
722
723   return 1.;
724 }
725
726 //____________________________________________________________
727 Double_t AliTRDseedV1::GetCovInv(Double_t *c, Double_t *d)
728 {
729 // Helper function to calculate the inverse of the covariance matrix.
730 // The input matrix is stored in the vector c and the result in the vector d. 
731 // Both arrays have to be initialized by the user with at least 3 elements
732 // The return value is the determinant or 0 in case of singularity.
733 //
734 // Author A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
735 // Date   Mar 19 2009
736
737   Double_t Det = c[0]*c[2] - c[1]*c[1];
738   if(TMath::Abs(Det)<1.e-20) return 0.;
739   Double_t InvDet = 1./Det;
740   d[0] = c[2]*InvDet;
741   d[1] =-c[1]*InvDet;
742   d[2] = c[0]*InvDet;
743   return Det;
744 }
745
746 //____________________________________________________________________
747 UShort_t AliTRDseedV1::GetVolumeId() const
748 {
749   Int_t ic=0;
750   while(ic<kNclusters && !fClusters[ic]) ic++;
751   return fClusters[ic] ? fClusters[ic]->GetVolumeId() : 0;
752 }
753
754
755 //____________________________________________________________________
756 void AliTRDseedV1::Calibrate()
757 {
758 // Retrieve calibration and position parameters from OCDB. 
759 // The following information are used
760 //  - detector index
761 //  - column and row position of first attached cluster. If no clusters are attached 
762 // to the tracklet a random central chamber position (c=70, r=7) will be used.
763 //
764 // The following information is cached in the tracklet
765 //   t0 (trigger delay)
766 //   drift velocity
767 //   PRF width
768 //   omega*tau = tg(a_L)
769 //   diffusion coefficients (longitudinal and transversal)
770 //
771 // Author :
772 // Alex Bercuci <A.Bercuci@gsi.de> 
773 // Date : Jan 8th 2009
774 //
775
776   AliCDBManager *cdb = AliCDBManager::Instance();
777   if(cdb->GetRun() < 0){
778     AliError("OCDB manager not properly initialized");
779     return;
780   }
781
782   AliTRDcalibDB *calib = AliTRDcalibDB::Instance();
783   AliTRDCalROC  *vdROC = calib->GetVdriftROC(fDet),
784                 *t0ROC = calib->GetT0ROC(fDet);;
785   const AliTRDCalDet *vdDet = calib->GetVdriftDet();
786   const AliTRDCalDet *t0Det = calib->GetT0Det();
787
788   Int_t col = 70, row = 7;
789   AliTRDcluster **c = &fClusters[0];
790   if(GetN()){ 
791     Int_t ic = 0;
792     while (ic<kNclusters && !(*c)){ic++; c++;} 
793     if(*c){
794       col = (*c)->GetPadCol();
795       row = (*c)->GetPadRow();
796     }
797   }
798
799   fT0    = t0Det->GetValue(fDet) + t0ROC->GetValue(col,row);
800   fVD    = vdDet->GetValue(fDet) * vdROC->GetValue(col, row);
801   fS2PRF = calib->GetPRFWidth(fDet, col, row); fS2PRF *= fS2PRF;
802   fExB   = AliTRDCommonParam::Instance()->GetOmegaTau(fVD);
803   AliTRDCommonParam::Instance()->GetDiffCoeff(fDiffL,
804   fDiffT, fVD);
805   SetBit(kCalib, kTRUE);
806 }
807
808 //____________________________________________________________________
809 void AliTRDseedV1::SetOwner()
810 {
811   //AliInfo(Form("own [%s] fOwner[%s]", own?"YES":"NO", fOwner?"YES":"NO"));
812   
813   if(TestBit(kOwner)) return;
814   for(int ic=0; ic<kNclusters; ic++){
815     if(!fClusters[ic]) continue;
816     fClusters[ic] = new AliTRDcluster(*fClusters[ic]);
817   }
818   SetBit(kOwner);
819 }
820
821 //____________________________________________________________
822 void AliTRDseedV1::SetPadPlane(AliTRDpadPlane *p)
823 {
824 // Shortcut method to initialize pad geometry.
825   if(!p) return;
826   SetTilt(TMath::Tan(TMath::DegToRad()*p->GetTiltingAngle()));
827   SetPadLength(p->GetLengthIPad());
828   SetPadWidth(p->GetWidthIPad());
829 }
830
831
832 //____________________________________________________________________
833 Bool_t  AliTRDseedV1::AttachClusters(AliTRDtrackingChamber *chamber, Bool_t tilt)
834 {
835 //
836 // Projective algorithm to attach clusters to seeding tracklets. The following steps are performed :
837 // 1. Collapse x coordinate for the full detector plane
838 // 2. truncated mean on y (r-phi) direction
839 // 3. purge clusters
840 // 4. truncated mean on z direction
841 // 5. purge clusters
842 //
843 // Parameters
844 //  - chamber : pointer to tracking chamber container used to search the tracklet
845 //  - tilt    : switch for tilt correction during road building [default true]
846 // Output
847 //  - true    : if tracklet found successfully. Failure can happend because of the following:
848 //      -
849 // Detailed description
850 //      
851 // We start up by defining the track direction in the xy plane and roads. The roads are calculated based
852 // on tracking information (variance in the r-phi direction) and estimated variance of the standard 
853 // clusters (see AliTRDcluster::SetSigmaY2()) corrected for tilt (see GetCovAt()). From this the road is
854 // BEGIN_LATEX
855 // r_{y} = 3*#sqrt{12*(#sigma^{2}_{Kalman}(y) + #frac{#sigma^{2}_{cl}(y) + tg^{2}(#alpha_{L})#sigma^{2}_{cl}(z)}{1+tg^{2}(#alpha_{L})})}
856 // r_{z} = 1.5*L_{pad}
857 // END_LATEX
858 // 
859 // Author Alexandru Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
860
861   Bool_t kPRINT = kFALSE;
862   if(!fReconstructor->GetRecoParam() ){
863     AliError("Seed can not be used without a valid RecoParam.");
864     return kFALSE;
865   }
866   // Initialize reco params for this tracklet
867   // 1. first time bin in the drift region
868   Int_t t0 = 14;
869   Int_t kClmin = Int_t(fReconstructor->GetRecoParam() ->GetFindableClusters()*AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins());
870
871   Double_t s2yTrk= fRefCov[0], 
872            s2yCl = 0., 
873            s2zCl = GetPadLength()*GetPadLength()/12., 
874            syRef = TMath::Sqrt(s2yTrk),
875            t2    = GetTilt()*GetTilt();
876   //define roads
877   Double_t kroady = 1., //fReconstructor->GetRecoParam() ->GetRoad1y();
878            kroadz = GetPadLength() * 1.5 + 1.;
879   // define probing cluster (the perfect cluster) and default calibration
880   Short_t sig[] = {0, 0, 10, 30, 10, 0,0};
881   AliTRDcluster cp(fDet, 6, 75, 0, sig, 0);
882   Calibrate();
883
884   if(kPRINT) printf("AttachClusters() sy[%f] road[%f]\n", syRef, kroady);
885
886   // working variables
887   const Int_t kNrows = 16;
888   AliTRDcluster *clst[kNrows][kNclusters];
889   Double_t cond[4], dx, dy, yt, zt,
890     yres[kNrows][kNclusters];
891   Int_t idxs[kNrows][kNclusters], ncl[kNrows], ncls = 0;
892   memset(ncl, 0, kNrows*sizeof(Int_t));
893   memset(clst, 0, kNrows*kNclusters*sizeof(AliTRDcluster*));
894
895   // Do cluster projection
896   AliTRDcluster *c = 0x0;
897   AliTRDchamberTimeBin *layer = 0x0;
898   Bool_t kBUFFER = kFALSE;
899   for (Int_t it = 0; it < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); it++) {
900     if(!(layer = chamber->GetTB(it))) continue;
901     if(!Int_t(*layer)) continue;
902     // get track projection at layers position
903     dx   = fX0 - layer->GetX();
904     yt = fYref[0] - fYref[1] * dx;
905     zt = fZref[0] - fZref[1] * dx;
906     // get standard cluster error corrected for tilt
907     cp.SetLocalTimeBin(it);
908     cp.SetSigmaY2(0.02, fDiffT, fExB, dx, -1./*zt*/, fYref[1]);
909     s2yCl = (cp.GetSigmaY2() + t2*s2zCl)/(1.+t2);
910     // get estimated road
911     kroady = 3.*TMath::Sqrt(12.*(s2yTrk + s2yCl));
912
913     if(kPRINT) printf("  %2d dx[%f] yt[%f] zt[%f] sT[um]=%6.2f sy[um]=%6.2f syTilt[um]=%6.2f yRoad[mm]=%f\n", it, dx, yt, zt, 1.e4*TMath::Sqrt(s2yTrk), 1.e4*TMath::Sqrt(cp.GetSigmaY2()), 1.e4*TMath::Sqrt(s2yCl), 1.e1*kroady);
914
915     // select clusters
916     cond[0] = yt; cond[2] = kroady;
917     cond[1] = zt; cond[3] = kroadz;
918     Int_t n=0, idx[6];
919     layer->GetClusters(cond, idx, n, 6);
920     for(Int_t ic = n; ic--;){
921       c  = (*layer)[idx[ic]];
922       dy = yt - c->GetY();
923       dy += tilt ? GetTilt() * (c->GetZ() - zt) : 0.;
924       // select clusters on a 3 sigmaKalman level
925 /*      if(tilt && TMath::Abs(dy) > 3.*syRef){ 
926         printf("too large !!!\n");
927         continue;
928       }*/
929       Int_t r = c->GetPadRow();
930       if(kPRINT) printf("\t\t%d dy[%f] yc[%f] r[%d]\n", ic, TMath::Abs(dy), c->GetY(), r);
931       clst[r][ncl[r]] = c;
932       idxs[r][ncl[r]] = idx[ic];
933       yres[r][ncl[r]] = dy;
934       ncl[r]++; ncls++;
935
936       if(ncl[r] >= kNclusters) {
937         AliWarning(Form("Cluster candidates reached limit %d. Some may be lost.", kNclusters));
938         kBUFFER = kTRUE;
939         break;
940       }
941     }
942     if(kBUFFER) break;
943   }
944   if(kPRINT) printf("Found %d clusters\n", ncls);
945   if(ncls<kClmin) return kFALSE;
946  
947   // analyze each row individualy
948   Double_t mean, syDis;
949   Int_t nrow[] = {0, 0, 0}, nr = 0, lr=-1;
950   for(Int_t ir=kNrows; ir--;){
951     if(!(ncl[ir])) continue;
952     if(lr>0 && lr-ir != 1){
953       if(kPRINT) printf("W - gap in rows attached !!\n"); 
954     }
955     if(kPRINT) printf("\tir[%d] lr[%d] n[%d]\n", ir, lr, ncl[ir]);
956     // Evaluate truncated mean on the y direction
957     if(ncl[ir] > 3) AliMathBase::EvaluateUni(ncl[ir], yres[ir], mean, syDis, Int_t(ncl[ir]*.8));
958     else {
959       mean = 0.; syDis = 0.;
960       continue;
961     } 
962
963     // TODO check mean and sigma agains cluster resolution !!
964     if(kPRINT) printf("\tr[%2d] m[%f %5.3fsigma] s[%f]\n", ir, mean, TMath::Abs(mean/syDis), syDis);
965     // select clusters on a 3 sigmaDistr level
966     Bool_t kFOUND = kFALSE;
967     for(Int_t ic = ncl[ir]; ic--;){
968       if(yres[ir][ic] - mean > 3. * syDis){ 
969         clst[ir][ic] = 0x0; continue;
970       }
971       nrow[nr]++; kFOUND = kTRUE;
972     }
973     // exit loop
974     if(kFOUND) nr++; 
975     lr = ir; if(nr>=3) break;
976   }
977   if(kPRINT) printf("lr[%d] nr[%d] nrow[0]=%d nrow[1]=%d nrow[2]=%d\n", lr, nr, nrow[0], nrow[1], nrow[2]);
978
979   // classify cluster rows
980   Int_t row = -1;
981   switch(nr){
982   case 1:
983     row = lr;
984     break;
985   case 2:
986     SetBit(kRowCross, kTRUE); // mark pad row crossing
987     if(nrow[0] > nrow[1]){ row = lr+1; lr = -1;}
988     else{ 
989       row = lr; lr = 1;
990       nrow[2] = nrow[1];
991       nrow[1] = nrow[0];
992       nrow[0] = nrow[2];
993     }
994     break;
995   case 3:
996     SetBit(kRowCross, kTRUE); // mark pad row crossing
997     break;
998   }
999   if(kPRINT) printf("\trow[%d] n[%d]\n\n", row, nrow[0]);
1000   if(row<0) return kFALSE;
1001
1002   // Select and store clusters 
1003   // We should consider here :
1004   //  1. How far is the chamber boundary
1005   //  2. How big is the mean
1006   Int_t n = 0;
1007   for (Int_t ir = 0; ir < nr; ir++) {
1008     Int_t jr = row + ir*lr; 
1009     if(kPRINT) printf("\tattach %d clusters for row %d\n", ncl[jr], jr);
1010     for (Int_t ic = 0; ic < ncl[jr]; ic++) {
1011       if(!(c = clst[jr][ic])) continue;
1012       Int_t it = c->GetPadTime();
1013       // TODO proper indexing of clusters !!
1014       fIndexes[it+kNtb*ir]  = chamber->GetTB(it)->GetGlobalIndex(idxs[jr][ic]);
1015       fClusters[it+kNtb*ir] = c;
1016   
1017       //printf("\tid[%2d] it[%d] idx[%d]\n", ic, it, fIndexes[it]);
1018   
1019       n++;
1020     }
1021   }  
1022
1023   // number of minimum numbers of clusters expected for the tracklet
1024   if (n < kClmin){
1025     //AliWarning(Form("Not enough clusters to fit the tracklet %d [%d].", n, kClmin));
1026     return kFALSE;
1027   }
1028   SetN(n);
1029
1030   // Load calibration parameters for this tracklet  
1031   Calibrate();
1032
1033   // calculate dx for time bins in the drift region (calibration aware)
1034   Float_t x[2] = {0.,0.}; Int_t tb[2]={0,0};
1035   for (Int_t it = t0, irp=0; irp<2 && it < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); it++) {
1036     if(!fClusters[it]) continue;
1037     x[irp]  = fClusters[it]->GetX();
1038     tb[irp] = fClusters[it]->GetLocalTimeBin();
1039     irp++;
1040   }  
1041   Int_t dtb = tb[1] - tb[0];
1042   fdX = dtb ? (x[0] - x[1]) / dtb : 0.15;
1043   return kTRUE;
1044 }
1045
1046 //____________________________________________________________
1047 void AliTRDseedV1::Bootstrap(const AliTRDReconstructor *rec)
1048 {
1049 //   Fill in all derived information. It has to be called after recovery from file or HLT.
1050 //   The primitive data are
1051 //   - list of clusters
1052 //   - detector (as the detector will be removed from clusters)
1053 //   - position of anode wire (fX0) - temporary
1054 //   - track reference position and direction
1055 //   - momentum of the track
1056 //   - time bin length [cm]
1057 // 
1058 //   A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de> Oct 30th 2008
1059 //
1060   fReconstructor = rec;
1061   AliTRDgeometry g;
1062   AliTRDpadPlane *pp = g.GetPadPlane(fDet);
1063   fPad[0] = pp->GetLengthIPad();
1064   fPad[1] = pp->GetWidthIPad();
1065   fPad[3] = TMath::Tan(TMath::DegToRad()*pp->GetTiltingAngle());
1066   //fSnp = fYref[1]/TMath::Sqrt(1+fYref[1]*fYref[1]);
1067   //fTgl = fZref[1];
1068   Int_t n = 0, nshare = 0, nused = 0;
1069   AliTRDcluster **cit = &fClusters[0];
1070   for(Int_t ic = kNclusters; ic--; cit++){
1071     if(!(*cit)) return;
1072     n++;
1073     if((*cit)->IsShared()) nshare++;
1074     if((*cit)->IsUsed()) nused++;
1075   }
1076   SetN(n); SetNUsed(nused); SetNShared(nshare);
1077   Fit();
1078   CookLabels();
1079   GetProbability();
1080 }
1081
1082
1083 //____________________________________________________________________
1084 Bool_t AliTRDseedV1::Fit(Bool_t tilt, Bool_t zcorr)
1085 {
1086 //
1087 // Linear fit of the clusters attached to the tracklet
1088 //
1089 // Parameters :
1090 //   - tilt : switch for tilt pad correction of cluster y position based on 
1091 //            the z, dzdx info from outside [default false].
1092 //   - zcorr : switch for using z information to correct for anisochronity 
1093 //            and a finner error parameterization estimation [default false]  
1094 // Output :
1095 //  True if successful
1096 //
1097 // Detailed description
1098 //
1099 //            Fit in the xy plane
1100 // 
1101 // The fit is performed to estimate the y position of the tracklet and the track 
1102 // angle in the bending plane. The clusters are represented in the chamber coordinate 
1103 // system (with respect to the anode wire - see AliTRDtrackerV1::FollowBackProlongation() 
1104 // on how this is set). The x and y position of the cluster and also their variances 
1105 // are known from clusterizer level (see AliTRDcluster::GetXloc(), AliTRDcluster::GetYloc(), 
1106 // AliTRDcluster::GetSX() and AliTRDcluster::GetSY()). 
1107 // If gaussian approximation is used to calculate y coordinate of the cluster the position 
1108 // is recalculated taking into account the track angle. The general formula to calculate the 
1109 // error of cluster position in the gaussian approximation taking into account diffusion and track
1110 // inclination is given for TRD by:
1111 // BEGIN_LATEX
1112 // #sigma^{2}_{y} = #sigma^{2}_{PRF} + #frac{x#delta_{t}^{2}}{(1+tg(#alpha_{L}))^{2}} + #frac{x^{2}tg^{2}(#phi-#alpha_{L})tg^{2}(#alpha_{L})}{12}
1113 // END_LATEX
1114 //
1115 // Since errors are calculated only in the y directions, radial errors (x direction) are mapped to y
1116 // by projection i.e.
1117 // BEGIN_LATEX
1118 // #sigma_{x|y} = tg(#phi) #sigma_{x}
1119 // END_LATEX
1120 // and also by the lorentz angle correction
1121 //
1122 //            Fit in the xz plane
1123 //
1124 // The "fit" is performed to estimate the radial position (x direction) where pad row cross happens. 
1125 // If no pad row crossing the z position is taken from geometry and radial position is taken from the xy 
1126 // fit (see below).
1127 // 
1128 // There are two methods to estimate the radial position of the pad row cross:
1129 //   1. leading cluster radial position : Here the lower part of the tracklet is considered and the last 
1130 // cluster registered (at radial x0) on this segment is chosen to mark the pad row crossing. The error 
1131 // of the z estimate is given by :
1132 // BEGIN_LATEX
1133 // #sigma_{z} = tg(#theta) #Delta x_{x_{0}}/12
1134 // END_LATEX
1135 // The systematic errors for this estimation are generated by the following sources:
1136 //   - no charge sharing between pad rows is considered (sharp cross)
1137 //   - missing cluster at row cross (noise peak-up, under-threshold signal etc.).
1138 // 
1139 //   2. charge fit over the crossing point : Here the full energy deposit along the tracklet is considered 
1140 // to estimate the position of the crossing by a fit in the qx plane. The errors in the q directions are 
1141 // parameterized as s_q = q^2. The systematic errors for this estimation are generated by the following sources:
1142 //   - no general model for the qx dependence
1143 //   - physical fluctuations of the charge deposit 
1144 //   - gain calibration dependence
1145 //
1146 //            Estimation of the radial position of the tracklet
1147 //
1148 // For pad row cross the radial position is taken from the xz fit (see above). Otherwise it is taken as the 
1149 // interpolation point of the tracklet i.e. the point where the error in y of the fit is minimum. The error
1150 // in the y direction of the tracklet is (see AliTRDseedV1::GetCovAt()):
1151 // BEGIN_LATEX
1152 // #sigma_{y} = #sigma^{2}_{y_{0}} + 2xcov(y_{0}, dy/dx) + #sigma^{2}_{dy/dx}
1153 // END_LATEX
1154 // and thus the radial position is:
1155 // BEGIN_LATEX
1156 // x = - cov(y_{0}, dy/dx)/#sigma^{2}_{dy/dx}
1157 // END_LATEX
1158 //
1159 //            Estimation of tracklet position error 
1160 //
1161 // The error in y direction is the error of the linear fit at the radial position of the tracklet while in the z 
1162 // direction is given by the cluster error or pad row cross error. In case of no pad row cross this is given by:
1163 // BEGIN_LATEX
1164 // #sigma_{y} = #sigma^{2}_{y_{0}} - 2cov^{2}(y_{0}, dy/dx)/#sigma^{2}_{dy/dx} + #sigma^{2}_{dy/dx}
1165 // #sigma_{z} = Pad_{length}/12
1166 // END_LATEX
1167 // For pad row cross the full error is calculated at the radial position of the crossing (see above) and the error 
1168 // in z by the width of the crossing region - being a matter of parameterization. 
1169 // BEGIN_LATEX
1170 // #sigma_{z} = tg(#theta) #Delta x_{x_{0}}/12
1171 // END_LATEX
1172 // In case of no tilt correction (default in the barrel tracking) the tilt is taken into account by the rotation of
1173 // the covariance matrix. See AliTRDseedV1::GetCovAt() for details.
1174 //
1175 // Author 
1176 // A.Bercuci <A.Bercuci@gsi.de>
1177
1178   if(!IsCalibrated()) Calibrate();
1179
1180   const Int_t kClmin = 8;
1181
1182   // get track direction
1183   Double_t y0   = fYref[0];
1184   Double_t dydx = fYref[1]; 
1185   Double_t z0   = fZref[0];
1186   Double_t dzdx = fZref[1];
1187   Double_t yt, zt;
1188
1189   //AliTRDtrackerV1::AliTRDLeastSquare fitterZ;
1190   TLinearFitter  fitterY(1, "pol1");
1191   TLinearFitter  fitterZ(1, "pol1");
1192   
1193   // book cluster information
1194   Double_t qc[kNclusters], xc[kNclusters], yc[kNclusters], zc[kNclusters], sy[kNclusters];
1195
1196   Int_t n = 0;
1197   AliTRDcluster *c=0x0, **jc = &fClusters[0];
1198   for (Int_t ic=0; ic<kNtb; ic++, ++jc) {
1199     xc[ic]  = -1.;
1200     yc[ic]  = 999.;
1201     zc[ic]  = 999.;
1202     sy[ic]  = 0.;
1203     if(!(c = (*jc))) continue;
1204     if(!c->IsInChamber()) continue;
1205
1206     Float_t w = 1.;
1207     if(c->GetNPads()>4) w = .5;
1208     if(c->GetNPads()>5) w = .2;
1209
1210     // cluster charge
1211     qc[n]   = TMath::Abs(c->GetQ());
1212     // pad row of leading 
1213
1214     // Radial cluster position
1215     //Int_t jc = TMath::Max(fN-3, 0);
1216     //xc[fN]   = c->GetXloc(fT0, fVD, &qc[jc], &xc[jc]/*, z0 - c->GetX()*dzdx*/);
1217     xc[n]   = fX0 - c->GetX();
1218
1219     // extrapolated track to cluster position
1220     yt = y0 - xc[n]*dydx; 
1221     zt = z0 - xc[n]*dzdx; 
1222
1223     // Recalculate cluster error based on tracking information
1224     c->SetSigmaY2(fS2PRF, fDiffT, fExB, xc[n], zcorr?zt:-1., dydx);
1225     sy[n]  = TMath::Sqrt(c->GetSigmaY2());
1226
1227     yc[n]   = fReconstructor->UseGAUS() ? 
1228       c->GetYloc(y0, sy[n], GetPadWidth()): c->GetY();
1229     zc[n]   = c->GetZ();
1230     //optional tilt correction
1231     if(tilt) yc[n] -= (GetTilt()*(zc[n] - zt)); 
1232
1233     fitterY.AddPoint(&xc[n], yc[n], TMath::Sqrt(sy[n]));
1234     fitterZ.AddPoint(&xc[n], qc[n], 1.);
1235     n++;
1236   }
1237   // to few clusters
1238   if (n < kClmin) return kFALSE; 
1239
1240   // fit XY
1241   fitterY.Eval();
1242   fYfit[0] = fitterY.GetParameter(0);
1243   fYfit[1] = -fitterY.GetParameter(1);
1244   // store covariance
1245   Double_t *p = fitterY.GetCovarianceMatrix();
1246   fCov[0] = p[0]; // variance of y0
1247   fCov[1] = p[1]; // covariance of y0, dydx
1248   fCov[2] = p[3]; // variance of dydx
1249   // the ref radial position is set at the minimum of 
1250   // the y variance of the tracklet
1251   fX   = -fCov[1]/fCov[2];
1252
1253   // fit XZ
1254   if(IsRowCross()){
1255     // THE LEADING CLUSTER METHOD
1256     Float_t xMin = fX0;
1257     Int_t ic=n=kNclusters-1; jc = &fClusters[ic];
1258     AliTRDcluster *c0 =0x0, **kc = &fClusters[kNtb-1];
1259     for(; ic>kNtb; ic--, --jc, --kc){
1260       if((c0 = (*kc)) && c0->IsInChamber() && (xMin>c0->GetX())) xMin = c0->GetX();
1261       if(!(c = (*jc))) continue;
1262       if(!c->IsInChamber()) continue;
1263       zc[kNclusters-1] = c->GetZ(); 
1264       fX = fX0 - c->GetX();
1265     }
1266     fZfit[0] = .5*(zc[0]+zc[kNclusters-1]); fZfit[1] = 0.;
1267     // Error parameterization
1268     fS2Z     = fdX*fZref[1];
1269     fS2Z    *= fS2Z; fS2Z    *= 0.2887; //  1/sqrt(12)
1270 /*
1271     // THE FIT X-Q PLANE METHOD 
1272     ic=n=kNclusters-1; jc = &fClusters[ic];
1273     for(; ic>kNtb; ic--, --jc){
1274       if(!(c = (*jc))) continue;
1275       if(!c->IsInChamber()) continue;
1276       qc[n]   = TMath::Abs(c->GetQ());
1277       xc[n]   = fX0 - c->GetX();
1278       zc[n]   = c->GetZ();
1279       fitterZ.AddPoint(&xc[n], -qc[n], 1.);
1280       n--;
1281     }
1282     // fit XZ
1283     fitterZ.Eval();
1284     if(fitterZ.GetParameter(1)!=0.){ 
1285       fX = -fitterZ.GetParameter(0)/fitterZ.GetParameter(1);
1286       fX=(fX<0.)?0.:fX;
1287       Float_t dl = .5*AliTRDgeometry::CamHght()+AliTRDgeometry::CdrHght();
1288       fX=(fX> dl)?dl:fX;
1289       fX-=.055; // TODO to be understood
1290     }
1291
1292     fZfit[0] = .5*(zc[0]+zc[kNclusters-1]); fZfit[1] = 0.;
1293     // temporary external error parameterization
1294     fS2Z     = 0.05+0.4*TMath::Abs(fZref[1]); fS2Z *= fS2Z;
1295     // TODO correct formula
1296     //fS2Z     = sigma_x*TMath::Abs(fZref[1]);
1297 */
1298   } else {
1299     fZfit[0] = zc[0]; fZfit[1] = 0.;
1300     fS2Z     = GetPadLength()*GetPadLength()/12.;
1301   }
1302   fS2Y = fCov[0] +2.*fX*fCov[1] + fX*fX*fCov[2];
1303   return kTRUE;
1304 }
1305
1306
1307 /*
1308 //_____________________________________________________________________________
1309 void AliTRDseedV1::FitMI()
1310 {
1311 //
1312 // Fit the seed.
1313 // Marian Ivanov's version 
1314 //
1315 // linear fit on the y direction with respect to the reference direction. 
1316 // The residuals for each x (x = xc - x0) are deduced from:
1317 // dy = y - yt             (1)
1318 // the tilting correction is written :
1319 // y = yc + h*(zc-zt)      (2)
1320 // yt = y0+dy/dx*x         (3)
1321 // zt = z0+dz/dx*x         (4)
1322 // from (1),(2),(3) and (4)
1323 // dy = yc - y0 - (dy/dx + h*dz/dx)*x + h*(zc-z0)
1324 // the last term introduces the correction on y direction due to tilting pads. There are 2 ways to account for this:
1325 // 1. use tilting correction for calculating the y
1326 // 2. neglect tilting correction here and account for it in the error parametrization of the tracklet.
1327   const Float_t kRatio  = 0.8;
1328   const Int_t   kClmin  = 5;
1329   const Float_t kmaxtan = 2;
1330
1331   if (TMath::Abs(fYref[1]) > kmaxtan){
1332                 //printf("Exit: Abs(fYref[1]) = %3.3f, kmaxtan = %3.3f\n", TMath::Abs(fYref[1]), kmaxtan);
1333                 return;              // Track inclined too much
1334         }
1335
1336   Float_t  sigmaexp  = 0.05 + TMath::Abs(fYref[1] * 0.25); // Expected r.m.s in y direction
1337   Float_t  ycrosscor = GetPadLength() * GetTilt() * 0.5;           // Y correction for crossing 
1338   Int_t fNChange = 0;
1339
1340   Double_t sumw;
1341   Double_t sumwx;
1342   Double_t sumwx2;
1343   Double_t sumwy;
1344   Double_t sumwxy;
1345   Double_t sumwz;
1346   Double_t sumwxz;
1347
1348         // Buffering: Leave it constant fot Performance issues
1349   Int_t    zints[kNtb];            // Histograming of the z coordinate 
1350                                          // Get 1 and second max probable coodinates in z
1351   Int_t    zouts[2*kNtb];       
1352   Float_t  allowedz[kNtb];         // Allowed z for given time bin
1353   Float_t  yres[kNtb];             // Residuals from reference
1354   //Float_t  anglecor = GetTilt() * fZref[1];  // Correction to the angle
1355   
1356   Float_t pos[3*kNtb]; memset(pos, 0, 3*kNtb*sizeof(Float_t));
1357   Float_t *fX = &pos[0], *fY = &pos[kNtb], *fZ = &pos[2*kNtb];
1358   
1359   Int_t fN  = 0; AliTRDcluster *c = 0x0; 
1360   fN2 = 0;
1361   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); i++) {
1362     yres[i] = 10000.0;
1363     if (!(c = fClusters[i])) continue;
1364     if(!c->IsInChamber()) continue;
1365     // Residual y
1366     //yres[i] = fY[i] - fYref[0] - (fYref[1] + anglecor) * fX[i] + GetTilt()*(fZ[i] - fZref[0]);
1367     fX[i] = fX0 - c->GetX();
1368     fY[i] = c->GetY();
1369     fZ[i] = c->GetZ();
1370     yres[i] = fY[i] - GetTilt()*(fZ[i] - (fZref[0] - fX[i]*fZref[1]));
1371     zints[fN] = Int_t(fZ[i]);
1372     fN++;
1373   }
1374
1375   if (fN < kClmin){
1376     //printf("Exit fN < kClmin: fN = %d\n", fN);
1377     return; 
1378   }
1379   Int_t nz = AliTRDtrackerV1::Freq(fN, zints, zouts, kFALSE);
1380   Float_t fZProb   = zouts[0];
1381   if (nz <= 1) zouts[3] = 0;
1382   if (zouts[1] + zouts[3] < kClmin) {
1383     //printf("Exit zouts[1] = %d, zouts[3] = %d\n",zouts[1],zouts[3]);
1384     return;
1385   }
1386   
1387   // Z distance bigger than pad - length
1388   if (TMath::Abs(zouts[0]-zouts[2]) > 12.0) zouts[3] = 0;
1389   
1390   Int_t  breaktime = -1;
1391   Bool_t mbefore   = kFALSE;
1392   Int_t  cumul[kNtb][2];
1393   Int_t  counts[2] = { 0, 0 };
1394   
1395   if (zouts[3] >= 3) {
1396
1397     //
1398     // Find the break time allowing one chage on pad-rows
1399     // with maximal number of accepted clusters
1400     //
1401     fNChange = 1;
1402     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); i++) {
1403       cumul[i][0] = counts[0];
1404       cumul[i][1] = counts[1];
1405       if (TMath::Abs(fZ[i]-zouts[0]) < 2) counts[0]++;
1406       if (TMath::Abs(fZ[i]-zouts[2]) < 2) counts[1]++;
1407     }
1408     Int_t  maxcount = 0;
1409     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins(); i++) {
1410       Int_t after  = cumul[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()][0] - cumul[i][0];
1411       Int_t before = cumul[i][1];
1412       if (after + before > maxcount) { 
1413         maxcount  = after + before; 
1414         breaktime = i;
1415         mbefore   = kFALSE;
1416       }
1417       after  = cumul[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()-1][1] - cumul[i][1];
1418       before = cumul[i][0];
1419       if (after + before > maxcount) { 
1420         maxcount  = after + before; 
1421         breaktime = i;
1422         mbefore   = kTRUE;
1423       }
1424     }
1425     breaktime -= 1;
1426   }
1427
1428   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1429     if (i >  breaktime) allowedz[i] =   mbefore  ? zouts[2] : zouts[0];
1430     if (i <= breaktime) allowedz[i] = (!mbefore) ? zouts[2] : zouts[0];
1431   }  
1432
1433   if (((allowedz[0] > allowedz[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()]) && (fZref[1] < 0)) ||
1434       ((allowedz[0] < allowedz[AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()]) && (fZref[1] > 0))) {
1435     //
1436     // Tracklet z-direction not in correspondance with track z direction 
1437     //
1438     fNChange = 0;
1439     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1440       allowedz[i] = zouts[0];  // Only longest taken
1441     } 
1442   }
1443   
1444   if (fNChange > 0) {
1445     //
1446     // Cross pad -row tracklet  - take the step change into account
1447     //
1448     for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1449       if (!fClusters[i]) continue; 
1450       if(!fClusters[i]->IsInChamber()) continue;
1451       if (TMath::Abs(fZ[i] - allowedz[i]) > 2) continue;
1452       // Residual y
1453       //yres[i] = fY[i] - fYref[0] - (fYref[1] + anglecor) * fX[i] + GetTilt()*(fZ[i] - fZref[0]);   
1454       yres[i] = fY[i] - GetTilt()*(fZ[i] - (fZref[0] - fX[i]*fZref[1]));
1455 //       if (TMath::Abs(fZ[i] - fZProb) > 2) {
1456 //         if (fZ[i] > fZProb) yres[i] += GetTilt() * GetPadLength();
1457 //         if (fZ[i] < fZProb) yres[i] -= GetTilt() * GetPadLength();
1458       }
1459     }
1460   }
1461   
1462   Double_t yres2[kNtb];
1463   Double_t mean;
1464   Double_t sigma;
1465   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1466     if (!fClusters[i]) continue;
1467     if(!fClusters[i]->IsInChamber()) continue;
1468     if (TMath::Abs(fZ[i] - allowedz[i]) > 2) continue;
1469     yres2[fN2] = yres[i];
1470     fN2++;
1471   }
1472   if (fN2 < kClmin) {
1473                 //printf("Exit fN2 < kClmin: fN2 = %d\n", fN2);
1474     fN2 = 0;
1475     return;
1476   }
1477   AliMathBase::EvaluateUni(fN2,yres2,mean,sigma, Int_t(fN2*kRatio-2.));
1478   if (sigma < sigmaexp * 0.8) {
1479     sigma = sigmaexp;
1480   }
1481   //Float_t fSigmaY = sigma;
1482
1483   // Reset sums
1484   sumw   = 0; 
1485   sumwx  = 0; 
1486   sumwx2 = 0;
1487   sumwy  = 0; 
1488   sumwxy = 0; 
1489   sumwz  = 0;
1490   sumwxz = 0;
1491
1492   fN2    = 0;
1493   Float_t fMeanz = 0;
1494   Float_t fMPads = 0;
1495   fUsable = 0;
1496   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1497     if (!fClusters[i]) continue;
1498     if (!fClusters[i]->IsInChamber()) continue;
1499     if (TMath::Abs(fZ[i] - allowedz[i]) > 2){fClusters[i] = 0x0; continue;}
1500     if (TMath::Abs(yres[i] - mean) > 4.0 * sigma){fClusters[i] = 0x0;  continue;}
1501     SETBIT(fUsable,i);
1502     fN2++;
1503     fMPads += fClusters[i]->GetNPads();
1504     Float_t weight = 1.0;
1505     if (fClusters[i]->GetNPads() > 4) weight = 0.5;
1506     if (fClusters[i]->GetNPads() > 5) weight = 0.2;
1507    
1508         
1509     Double_t x = fX[i];
1510     //printf("x = %7.3f dy = %7.3f fit %7.3f\n", x, yres[i], fY[i]-yres[i]);
1511     
1512     sumw   += weight; 
1513     sumwx  += x * weight; 
1514     sumwx2 += x*x * weight;
1515     sumwy  += weight * yres[i];  
1516     sumwxy += weight * (yres[i]) * x;
1517     sumwz  += weight * fZ[i];    
1518     sumwxz += weight * fZ[i] * x;
1519
1520   }
1521
1522   if (fN2 < kClmin){
1523                 //printf("Exit fN2 < kClmin(2): fN2 = %d\n",fN2);
1524     fN2 = 0;
1525     return;
1526   }
1527   fMeanz = sumwz / sumw;
1528   Float_t correction = 0;
1529   if (fNChange > 0) {
1530     // Tracklet on boundary
1531     if (fMeanz < fZProb) correction =  ycrosscor;
1532     if (fMeanz > fZProb) correction = -ycrosscor;
1533   }
1534
1535   Double_t det = sumw * sumwx2 - sumwx * sumwx;
1536   fYfit[0]    = (sumwx2 * sumwy  - sumwx * sumwxy) / det;
1537   fYfit[1]    = (sumw   * sumwxy - sumwx * sumwy)  / det;
1538   
1539   fS2Y = 0;
1540   for (Int_t i = 0; i < AliTRDtrackerV1::GetNTimeBins()+1; i++) {
1541     if (!TESTBIT(fUsable,i)) continue;
1542     Float_t delta = yres[i] - fYfit[0] - fYfit[1] * fX[i];
1543     fS2Y += delta*delta;
1544   }
1545   fS2Y = TMath::Sqrt(fS2Y / Float_t(fN2-2));
1546         // TEMPORARY UNTIL covariance properly calculated
1547         fS2Y = TMath::Max(fS2Y, Float_t(.1));
1548   
1549   fZfit[0]   = (sumwx2 * sumwz  - sumwx * sumwxz) / det;
1550   fZfit[1]   = (sumw   * sumwxz - sumwx * sumwz)  / det;
1551 //   fYfitR[0] += fYref[0] + correction;
1552 //   fYfitR[1] += fYref[1];
1553 //  fYfit[0]   = fYfitR[0];
1554   fYfit[1]   = -fYfit[1];
1555
1556   UpdateUsed();
1557 }*/
1558
1559 //___________________________________________________________________
1560 void AliTRDseedV1::Print(Option_t *o) const
1561 {
1562   //
1563   // Printing the seedstatus
1564   //
1565
1566   AliInfo(Form("Det[%3d] X0[%7.2f] Pad{L[%5.2f] W[%5.2f] Tilt[%+6.2f]}", fDet, fX0, GetPadLength(), GetPadWidth(), GetTilt()));
1567   AliInfo(Form("N[%2d] Nused[%2d] Nshared[%2d] [%d]", GetN(), GetNUsed(), GetNShared(), fN));
1568   AliInfo(Form("FLAGS : RC[%c] Kink[%c] SA[%c]", IsRowCross()?'y':'n', IsKink()?'y':'n', IsStandAlone()?'y':'n'));
1569
1570   Double_t cov[3], x=GetX();
1571   GetCovAt(x, cov);
1572   AliInfo("    |  x[cm]  |      y[cm]       |      z[cm]      |  dydx |  dzdx |");
1573   AliInfo(Form("Fit | %7.2f | %7.2f+-%7.2f | %7.2f+-%7.2f| %5.2f | ----- |", x, GetY(), TMath::Sqrt(cov[0]), GetZ(), TMath::Sqrt(cov[2]), fYfit[1]));
1574   AliInfo(Form("Ref | %7.2f | %7.2f+-%7.2f | %7.2f+-%7.2f| %5.2f | %5.2f |", x, fYref[0]-fX*fYref[1], TMath::Sqrt(fRefCov[0]), fZref[0]-fX*fYref[1], TMath::Sqrt(fRefCov[2]), fYref[1], fZref[1]))
1575
1576
1577   if(strcmp(o, "a")!=0) return;
1578
1579   AliTRDcluster* const* jc = &fClusters[0];
1580   for(int ic=0; ic<kNclusters; ic++, jc++) {
1581     if(!(*jc)) continue;
1582     (*jc)->Print(o);
1583   }
1584 }
1585
1586
1587 //___________________________________________________________________
1588 Bool_t AliTRDseedV1::IsEqual(const TObject *o) const
1589 {
1590   // Checks if current instance of the class has the same essential members
1591   // as the given one
1592
1593   if(!o) return kFALSE;
1594   const AliTRDseedV1 *inTracklet = dynamic_cast<const AliTRDseedV1*>(o);
1595   if(!inTracklet) return kFALSE;
1596
1597   for (Int_t i = 0; i < 2; i++){
1598     if ( fYref[i] != inTracklet->fYref[i] ) return kFALSE;
1599     if ( fZref[i] != inTracklet->fZref[i] ) return kFALSE;
1600   }
1601   
1602   if ( fS2Y != inTracklet->fS2Y ) return kFALSE;
1603   if ( GetTilt() != inTracklet->GetTilt() ) return kFALSE;
1604   if ( GetPadLength() != inTracklet->GetPadLength() ) return kFALSE;
1605   
1606   for (Int_t i = 0; i < kNclusters; i++){
1607 //     if ( fX[i] != inTracklet->GetX(i) ) return kFALSE;
1608 //     if ( fY[i] != inTracklet->GetY(i) ) return kFALSE;
1609 //     if ( fZ[i] != inTracklet->GetZ(i) ) return kFALSE;
1610     if ( fIndexes[i] != inTracklet->fIndexes[i] ) return kFALSE;
1611   }
1612 //   if ( fUsable != inTracklet->fUsable ) return kFALSE;
1613
1614   for (Int_t i=0; i < 2; i++){
1615     if ( fYfit[i] != inTracklet->fYfit[i] ) return kFALSE;
1616     if ( fZfit[i] != inTracklet->fZfit[i] ) return kFALSE;
1617     if ( fLabels[i] != inTracklet->fLabels[i] ) return kFALSE;
1618   }
1619   
1620 /*  if ( fMeanz != inTracklet->GetMeanz() ) return kFALSE;
1621   if ( fZProb != inTracklet->GetZProb() ) return kFALSE;*/
1622   if ( fN != inTracklet->fN ) return kFALSE;
1623   //if ( fNUsed != inTracklet->fNUsed ) return kFALSE;
1624   //if ( fFreq != inTracklet->GetFreq() ) return kFALSE;
1625   //if ( fNChange != inTracklet->GetNChange() ) return kFALSE;
1626    
1627   if ( fC != inTracklet->fC ) return kFALSE;
1628   //if ( fCC != inTracklet->GetCC() ) return kFALSE;
1629   if ( fChi2 != inTracklet->fChi2 ) return kFALSE;
1630   //  if ( fChi2Z != inTracklet->GetChi2Z() ) return kFALSE;
1631
1632   if ( fDet != inTracklet->fDet ) return kFALSE;
1633   if ( fPt != inTracklet->fPt ) return kFALSE;
1634   if ( fdX != inTracklet->fdX ) return kFALSE;
1635   
1636   for (Int_t iCluster = 0; iCluster < kNclusters; iCluster++){
1637     AliTRDcluster *curCluster = fClusters[iCluster];
1638     AliTRDcluster *inCluster = inTracklet->fClusters[iCluster];
1639     if (curCluster && inCluster){
1640       if (! curCluster->IsEqual(inCluster) ) {
1641         curCluster->Print();
1642         inCluster->Print();
1643         return kFALSE;
1644       }
1645     } else {
1646       // if one cluster exists, and corresponding 
1647       // in other tracklet doesn't - return kFALSE
1648       if(curCluster || inCluster) return kFALSE;
1649     }
1650   }
1651   return kTRUE;
1652 }