TRD/AliTRDtracker.cxx

   1 /**************************************************************************
   2  * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
   3  *                                                                        *
   4  * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
   5  * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
   6  *                                                                        *
   7  * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
   8  * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
   9  * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
  10  * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
  11  * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
  12  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  13  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  14  **************************************************************************/
  15
  16 /*
  17 $Log$
  18 Revision 1.12  2001/05/28 17:07:58  hristov
  19 Last minute changes; ExB correction in AliTRDclusterizerV1; taking into account of material in G10 TEC frames and material between TEC planes (C.Blume,S.Sedykh)
  20
  21 Revision 1.8  2000/12/20 13:00:44  cblume
  22 Modifications for the HP-compiler
  23
  24 Revision 1.7  2000/12/08 16:07:02  cblume
  25 Update of the tracking by Sergei
  26
  27 Revision 1.6  2000/11/30 17:38:08  cblume
  28 Changes to get in line with new STEER and EVGEN
  29
  30 Revision 1.5  2000/11/14 14:40:27  cblume
  31 Correction for the Sun compiler (kTRUE and kFALSE)
  32
  33 Revision 1.4  2000/11/10 14:57:52  cblume
  34 Changes in the geometry constants for the DEC compiler
  35
  36 Revision 1.3  2000/10/15 23:40:01  cblume
  37 Remove AliTRDconst
  38
  39 Revision 1.2  2000/10/06 16:49:46  cblume
  40 Made Getters const
  41
  42 Revision 1.1.2.2  2000/10/04 16:34:58  cblume
  43 Replace include files by forward declarations
  44
  45 Revision 1.1.2.1  2000/09/22 14:47:52  cblume
  46 Add the tracking code
  47
  48 */
  49
  50 #include <iostream.h>
  51
  52 #include <TFile.h>
  53 #include <TROOT.h>
  54 #include <TBranch.h>
  55 #include <TTree.h>
  56
  57 #include "AliRun.h"
  58 #include "AliTRD.h"
  59 #include "AliTRDgeometry.h"
  60 #include "AliTRDrecPoint.h"
  61 #include "AliTRDcluster.h"
  62 #include "AliTRDtrack.h"
  63 #include "AliTRDtrackingSector.h"
  64 #include "AliTRDtimeBin.h"
  65
  66 #include "AliTRDtracker.h"
  67
  68 ClassImp(AliTRDtracker)
  69
  70   const  Float_t     AliTRDtracker::fSeedDepth          = 0.5;
  71   const  Float_t     AliTRDtracker::fSeedStep           = 0.05;
  72   const  Float_t     AliTRDtracker::fSeedGap            = 0.25;
  73
  74   const  Float_t     AliTRDtracker::fMaxSeedDeltaZ12    = 40.;
  75   const  Float_t     AliTRDtracker::fMaxSeedDeltaZ      = 25.;
  76   const  Float_t     AliTRDtracker::fMaxSeedC           = 0.0052;
  77   const  Float_t     AliTRDtracker::fMaxSeedTan         = 1.2;
  78   const  Float_t     AliTRDtracker::fMaxSeedVertexZ     = 150.;
  79
  80   const  Double_t    AliTRDtracker::fSeedErrorSY        = 0.2;
  81   const  Double_t    AliTRDtracker::fSeedErrorSY3       = 2.5;
  82   const  Double_t    AliTRDtracker::fSeedErrorSZ        = 0.1;
  83
  84   const  Float_t     AliTRDtracker::fMinClustersInSeed  = 0.7;
  85
  86   const  Float_t     AliTRDtracker::fMinClustersInTrack = 0.5;
  87   const  Float_t     AliTRDtracker::fSkipDepth          = 0.05;
  88   const  Float_t     AliTRDtracker::fLabelFraction      = 0.5;
  89   const  Float_t     AliTRDtracker::fWideRoad           = 20.;
  90
  91   const  Double_t    AliTRDtracker::fMaxChi2            = 24.;
  92
  93 //____________________________________________________________________
  94 AliTRDtracker::AliTRDtracker()
  95 {
  96   //
  97   // Default constructor
  98   //
  99
 100   fEvent     = 0;
 101   fGeom      = NULL;
 102
 103   fNclusters = 0;
 104   fClusters  = NULL;
 105   fNseeds    = 0;
 106   fSeeds     = NULL;
 107   fNtracks   = 0;
 108   fTracks    = NULL;
 109
 110   fSY2corr = 0.025;
 111 }
 112
 113 //____________________________________________________________________
 114 AliTRDtracker::AliTRDtracker(const Text_t* name, const Text_t* title)
 115                   :TNamed(name, title)
 116 {
 117   fEvent     = 0;
 118   fGeom      = NULL;
 119
 120   fNclusters = 0;
 121   fClusters  = new TObjArray(2000);
 122   fNseeds    = 0;
 123   fSeeds     = new TObjArray(20000);
 124   fNtracks   = 0;
 125   fTracks    = new TObjArray(10000);
 126
 127   fSY2corr = 0.025;
 128 }
 129
 130 //___________________________________________________________________
 131 AliTRDtracker::~AliTRDtracker()
 132 {
 133   delete fClusters;
 134   delete fTracks;
 135   delete fSeeds;
 136   delete fGeom;
 137 }
 138
 139 //___________________________________________________________________
 140 void AliTRDtracker::Clusters2Tracks(TH1F *hs, TH1F *hd)
 141 {
 142   Int_t i;
 143
 144   Int_t inner, outer;
 145   Int_t fTotalNofTimeBins = fGeom->GetTimeMax() * AliTRDgeometry::Nplan();
 146   Int_t nSteps = (Int_t) (fSeedDepth / fSeedStep);
 147   Int_t gap = (Int_t) (fTotalNofTimeBins * fSeedGap);
 148   Int_t step = (Int_t) (fTotalNofTimeBins * fSeedStep);
 149
 150
 151   //  nSteps = 1;
 152
 153   if (!fClusters) return;
 154
 155   AliTRDtrackingSector fTrSec[AliTRDgeometry::kNsect];
 156   SetUpSectors(fTrSec);
 157
 158   // make a first turn looking for seed ends in the same (n,n)
 159   // and in the adjacent sectors (n,n+1)
 160
 161   for(i=0; i<nSteps; i++) {
 162     printf("step %d out of %d \n", i+1, nSteps);
 163     outer=fTotalNofTimeBins-1-i*step; inner=outer-gap;
 164     MakeSeeds(inner,outer, fTrSec, 1, hs, hd);
 165     FindTracks(fTrSec, hs, hd);
 166   }
 167
 168   // make a second turn looking for seed ends in next-to-adjacent
 169   // sectors (n,n+2)
 170
 171   for(i=0; i<nSteps; i++) {
 172     printf("step %d out of %d \n", i+1, nSteps);
 173     outer=fTotalNofTimeBins-1-i*step; inner=outer-gap;
 174     MakeSeeds(inner, outer, fTrSec, 2, hs, hd);
 175     FindTracks(fTrSec,hs,hd);
 176   }
 177
 178 }
 179
 180 //_____________________________________________________________________
 181 Double_t AliTRDtracker::ExpectedSigmaY2(Double_t r, Double_t tgl, Double_t pt)
 182 {
 183   // Parametrised "expected" error of the cluster reconstruction in Y
 184
 185   Double_t s = 0.08 * 0.08;
 186   return s;
 187 }
 188
 189 //_____________________________________________________________________
 190 Double_t AliTRDtracker::ExpectedSigmaZ2(Double_t r, Double_t tgl)
 191 {
 192   // Parametrised "expected" error of the cluster reconstruction in Z
 193
 194   Double_t s = 6 * 6 /12.;
 195   return s;
 196 }
 197
 198 //_____________________________________________________________________
 199 Double_t f1trd(Double_t x1,Double_t y1,
 200                Double_t x2,Double_t y2,
 201                Double_t x3,Double_t y3)
 202 {
 203   // Initial approximation of the track curvature
 204   // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
 205
 206   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
 207   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
 208                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
 209   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
 210                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
 211
 212   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
 213
 214   return -xr*yr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
 215 }
 216
 217 //_____________________________________________________________________
 218 Double_t f2trd(Double_t x1,Double_t y1,
 219                Double_t x2,Double_t y2,
 220                Double_t x3,Double_t y3)
 221 {
 222   // Initial approximation of the track curvature times center of curvature
 223   // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
 224
 225   Double_t d=(x2-x1)*(y3-y2)-(x3-x2)*(y2-y1);
 226   Double_t a=0.5*((y3-y2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1)-
 227                   (y2-y1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2));
 228   Double_t b=0.5*((x2-x1)*(y3*y3-y2*y2+x3*x3-x2*x2)-
 229                   (x3-x2)*(y2*y2-y1*y1+x2*x2-x1*x1));
 230
 231   Double_t xr=TMath::Abs(d/(d*x1-a)), yr=d/(d*y1-b);
 232
 233   return -a/(d*y1-b)*xr/sqrt(xr*xr+yr*yr);
 234 }
 235
 236 //_____________________________________________________________________
 237 Double_t f3trd(Double_t x1,Double_t y1,
 238                Double_t x2,Double_t y2,
 239                Double_t z1,Double_t z2)
 240 {
 241   // Initial approximation of the tangent of the track dip angle
 242   // Origin: Iouri Belikov, CERN, Jouri.Belikov@cern.ch
 243
 244   return (z1 - z2)/sqrt((x1-x2)*(x1-x2)+(y1-y2)*(y1-y2));
 245 }
 246
 247
 248 //___________________________________________________________________
 249
 250 Int_t AliTRDtracker::FindProlongation(AliTRDtrack& t, AliTRDtrackingSector *sec,
 251                             Int_t s, Int_t rf, Int_t matched_index,
 252                                       TH1F *hs, TH1F *hd)
 253 {
 254   // Starting from current position on track=t this function tries
 255   // to extrapolate the track up to timeBin=rf and to confirm prolongation
 256   // if a close cluster is found. *sec is a pointer to allocated
 257   // array of sectors, in which the initial sector has index=s.
 258
 259
 260   //  TH1F *hsame = hs;
 261   //  TH1F *hdiff = hd;
 262
 263   //  Bool_t good_match;
 264
 265   const Int_t TIME_BINS_TO_SKIP=Int_t(fSkipDepth*sec->GetNtimeBins());
 266   Int_t try_again=TIME_BINS_TO_SKIP;
 267
 268   Double_t alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();
 269
 270   Int_t ns=Int_t(2*TMath::Pi()/alpha+0.5);
 271
 272   Double_t x0, rho;
 273
 274   for (Int_t nr=sec->GetTimeBinNumber(t.GetX())-1; nr>=rf; nr--) {
 275
 276     Double_t x=sec->GetX(nr);
 277     Double_t ymax=x*TMath::Tan(0.5*alpha);
 278
 279     rho = 0.00295; x0 = 11.09;  // TEC
 280     if(sec->TECframe(nr,t.GetY(),t.GetZ())) {
 281       rho = 1.7; x0 = 33.0;     // G10 frame
 282     }
 283     if(TMath::Abs(x - t.GetX()) > 3) {
 284       rho = 0.0559; x0 = 55.6;  // radiator
 285     }
 286     if (!t.PropagateTo(x,x0,rho,0.139)) {
 287       cerr<<"Can't propagate to x = "<<x<<endl;
 288       return 0;
 289     }
 290
 291     AliTRDtimeBin& time_bin=sec[s][nr];
 292     Double_t sy2=ExpectedSigmaY2(t.GetX(),t.GetTgl(),t.GetPt());
 293     Double_t sz2=ExpectedSigmaZ2(t.GetX(),t.GetTgl());
 294     Double_t road=25.*sqrt(t.GetSigmaY2() + sy2), y=t.GetY(), z=t.GetZ();
 295
 296     if (road>fWideRoad) {
 297       if (t.GetNclusters() > 4) {
 298         cerr<<t.GetNclusters()<<" FindProlongation: Road is too wide !\n";
 299       }
 300       return 0;
 301     }
 302
 303     AliTRDcluster *cl=0;
 304     UInt_t index=0;
 305     //    Int_t ncl = 0;
 306
 307     Double_t max_chi2=fMaxChi2;
 308
 309     if (time_bin) {
 310
 311       for (Int_t i=time_bin.Find(y-road); i<time_bin; i++) {
 312         AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(time_bin[i]);
 313
 314         //      good_match = kFALSE;
 315         //      if((c->GetTrackIndex(0) == matched_index) ||
 316         //   (c->GetTrackIndex(1) == matched_index) ||
 317         //   (c->GetTrackIndex(2) == matched_index)) good_match = kTRUE;
 318         //        if(hsame) hsame->Fill(TMath::Abs(c->GetY()-y)/road);
 319         //        if(hdiff) hdiff->Fill(road);
 320
 321         if (c->GetY() > y+road) break;
 322         if (c->IsUsed() > 0) continue;
 323
 324         //      if(good_match) hsame->Fill(TMath::Abs(c->GetZ()-z));
 325         //      else hdiff->Fill(TMath::Abs(c->GetZ()-z));
 326
 327         //      if(!good_match) continue;
 328
 329         if((c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z) > 3 * 12 * sz2) continue;
 330
 331         Double_t chi2=t.GetPredictedChi2(c);
 332
 333         //      if((c->GetTrackIndex(0) == matched_index) ||
 334         //         (c->GetTrackIndex(1) == matched_index) ||
 335         //         (c->GetTrackIndex(2) == matched_index))
 336         //        hdiff->Fill(chi2);
 337
 338         //      ncl++;
 339
 340         if (chi2 > max_chi2) continue;
 341         max_chi2=chi2;
 342         cl=c;
 343         index=time_bin.GetIndex(i);
 344       }
 345
 346       if(!cl) {
 347
 348         for (Int_t i=time_bin.Find(y-road); i<time_bin; i++) {
 349           AliTRDcluster* c=(AliTRDcluster*)(time_bin[i]);
 350
 351           if (c->GetY() > y+road) break;
 352           if (c->IsUsed() > 0) continue;
 353           if((c->GetZ()-z)*(c->GetZ()-z) > 3.25 * 12 * sz2) continue;
 354
 355           Double_t chi2=t.GetPredictedChi2(c);
 356
 357           //      ncl++;
 358
 359           if (chi2 > max_chi2) continue;
 360           max_chi2=chi2;
 361           cl=c;
 362           index=time_bin.GetIndex(i);
 363         }
 364       }
 365
 366     }
 367
 368     if (cl) {
 369
 370       t.Update(cl,max_chi2,index);
 371
 372       try_again=TIME_BINS_TO_SKIP;
 373     } else {
 374       if (try_again==0) break;
 375       if (y > ymax) {
 376         //      cerr<<"y > ymax: "<<y<<" > "<<ymax<<endl;
 377          s = (s+1) % ns;
 378          if (!t.Rotate(alpha)) {
 379            cerr<<"Failed to rotate, alpha = "<<alpha<<endl;
 380            return 0;
 381          }
 382       } else if (y <-ymax) {
 383         //      cerr<<"y < -ymax: "<<y<<" < "<<-ymax<<endl;
 384          s = (s-1+ns) % ns;
 385          if (!t.Rotate(-alpha)) {
 386            cerr<<"Failed to rotate, alpha = "<<alpha<<endl;
 387            return 0;
 388          }
 389       }
 390       if(!sec->TECframe(nr,y,z)) try_again--;
 391     }
 392   }
 393
 394   return 1;
 395 }
 396
 397
 398
 399 //_____________________________________________________________________________
 400 void AliTRDtracker::GetEvent(const Char_t *hitfile, const Char_t *clusterfile)
 401 {
 402   // Opens a ROOT-file with TRD-clusters and reads the cluster-tree in
 403
 404   ReadClusters(fClusters, clusterfile);
 405
 406   // get geometry from the file with hits
 407
 408   TFile *fInputFile = (TFile*) gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(hitfile);
 409   if (!fInputFile) {
 410     printf("AliTRDtracker::Open -- ");
 411     printf("Open the ALIROOT-file %s.\n",hitfile);
 412     fInputFile = new TFile(hitfile,"UPDATE");
 413   }
 414   else {
 415     printf("AliTRDtracker::Open -- ");
 416     printf("%s is already open.\n",hitfile);
 417   }
 418
 419   // Get AliRun object from file or create it if not on file
 420
 421   gAlice = (AliRun*) fInputFile->Get("gAlice");
 422   if (gAlice) {
 423     printf("AliTRDtracker::GetEvent -- ");
 424     printf("AliRun object found on file.\n");
 425   }
 426   else {
 427     printf("AliTRDtracker::GetEvent -- ");
 428     printf("Could not find AliRun object.\n");
 429   }
 430
 431   /*
 432   // Import the Trees for the event nEvent in the file
 433   Int_t nparticles = gAlice->GetEvent(fEvent);
 434   cerr<<"nparticles = "<<nparticles<<endl;
 435
 436   if (nparticles <= 0) {
 437     printf("AliTRDtracker::GetEvent -- ");
 438     printf("No entries in the trees for event %d.\n",fEvent);
 439   }
 440   */
 441
 442   AliTRD *TRD = (AliTRD*) gAlice->GetDetector("TRD");
 443   fGeom = TRD->GetGeometry();
 444
 445 }
 446
 447
 448 //_____________________________________________________________________________
 449 void AliTRDtracker::SetUpSectors(AliTRDtrackingSector *sec)
 450 {
 451   // Fills clusters into TRD tracking_sectors
 452   // Note that the numbering scheme for the TRD tracking_sectors
 453   // differs from that of TRD sectors
 454
 455   for (Int_t i=0; i<AliTRDgeometry::Nsect(); i++) sec[i].SetUp();
 456
 457   //  Sort clusters into AliTRDtimeBin's within AliTRDtrackSector's
 458
 459   cerr<<"SetUpSectors: sorting clusters"<<endl;
 460
 461   Int_t ncl=fClusters->GetEntriesFast();
 462   UInt_t index;
 463   while (ncl--) {
 464     printf("\r %d left  ",ncl);
 465     AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(ncl);
 466     Int_t detector=c->GetDetector(), local_time_bin=c->GetLocalTimeBin();
 467     Int_t sector=fGeom->GetSector(detector);
 468
 469     Int_t tracking_sector = AliTRDgeometry::kNsect - sector - 1;
 470
 471     Int_t tb=sec[sector].GetTimeBin(detector,local_time_bin);
 472     index=ncl;
 473     sec[tracking_sector][tb].InsertCluster(c,index);
 474
 475   }
 476   printf("\r\n");
 477 }
 478
 479
 480 //_____________________________________________________________________________
 481 void AliTRDtracker::MakeSeeds(Int_t inner, Int_t outer,
 482                               AliTRDtrackingSector* fTrSec, Int_t turn,
 483                               TH1F *hs, TH1F *hd)
 484 {
 485   // Creates track seeds using clusters in timeBins=i1,i2
 486
 487   Int_t i2 = inner, i1 = outer;
 488   Int_t ti[3], to[3];
 489   Int_t nprim = 85600/2;
 490
 491
 492   TH1F *hsame = hs;
 493   TH1F *hdiff = hd;
 494   Bool_t match = false;
 495   Int_t matched_index;
 496
 497   // find seeds
 498
 499   Double_t x[5], c[15];
 500   Int_t max_sec=AliTRDgeometry::kNsect;
 501
 502   Double_t alpha=AliTRDgeometry::GetAlpha();
 503   Double_t shift=AliTRDgeometry::GetAlpha()/2.;
 504   Double_t cs=cos(alpha), sn=sin(alpha);
 505   Double_t cs2=cos(2.*alpha), sn2=sin(2.*alpha);
 506
 507   Double_t x1 =fTrSec[0].GetX(i1);
 508   Double_t xx2=fTrSec[0].GetX(i2);
 509
 510
 511   printf("\n");
 512
 513   if((turn != 1)&&(turn != 2)) {
 514     printf("*** Error in MakeSeeds: unexpected turn = %d  \n", turn);
 515     return;
 516   }
 517
 518
 519   for (Int_t ns=0; ns<max_sec; ns++) {
 520
 521     printf("\n MakeSeeds: sector %d \n", ns);
 522
 523     Int_t nl2=fTrSec[(ns-2+max_sec)%max_sec][i2];
 524     Int_t nl=fTrSec[(ns-1+max_sec)%max_sec][i2];
 525     Int_t nm=fTrSec[ns][i2];
 526     Int_t nu=fTrSec[(ns+1)%max_sec][i2];
 527     Int_t nu2=fTrSec[(ns+2)%max_sec][i2];
 528
 529     AliTRDtimeBin& r1=fTrSec[ns][i1];
 530
 531     for (Int_t is=0; is < r1; is++) {
 532       Double_t y1=r1[is]->GetY(), z1=r1[is]->GetZ();
 533       for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) to[ii] = r1[is]->GetTrackIndex(ii);
 534
 535       for (Int_t js=0; js < nl2+nl+nm+nu+nu2; js++) {
 536
 537         const AliTRDcluster *cl;
 538         Double_t x2,   y2,   z2;
 539         Double_t x3=0., y3=0.;
 540
 541         if (js<nl2) {
 542           if(turn != 2) continue;
 543           AliTRDtimeBin& r2=fTrSec[(ns-2+max_sec)%max_sec][i2];
 544           cl=r2[js];
 545           y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
 546           for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) ti[ii] = cl->GetTrackIndex(ii);
 547
 548           x2= xx2*cs2+y2*sn2;
 549           y2=-xx2*sn2+y2*cs2;
 550         }
 551         else if (js<nl2+nl) {
 552           if(turn != 1) continue;
 553           AliTRDtimeBin& r2=fTrSec[(ns-1+max_sec)%max_sec][i2];
 554           cl=r2[js-nl2];
 555           y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
 556           for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) ti[ii] = cl->GetTrackIndex(ii);
 557
 558           x2= xx2*cs+y2*sn;
 559           y2=-xx2*sn+y2*cs;
 560
 561         }
 562         else if (js<nl2+nl+nm) {
 563           if(turn != 1) continue;
 564           AliTRDtimeBin& r2=fTrSec[ns][i2];
 565           cl=r2[js-nl2-nl];
 566           x2=xx2; y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
 567           for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) ti[ii] = cl->GetTrackIndex(ii);
 568         }
 569         else if (js<nl2+nl+nm+nu) {
 570           if(turn != 1) continue;
 571           AliTRDtimeBin& r2=fTrSec[(ns+1)%max_sec][i2];
 572           cl=r2[js-nl2-nl-nm];
 573           y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
 574           for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) ti[ii] = cl->GetTrackIndex(ii);
 575
 576           x2=xx2*cs-y2*sn;
 577           y2=xx2*sn+y2*cs;
 578
 579         }
 580         else {
 581           if(turn != 2) continue;
 582           AliTRDtimeBin& r2=fTrSec[(ns+2)%max_sec][i2];
 583           cl=r2[js-nl2-nl-nm-nu];
 584           y2=cl->GetY(); z2=cl->GetZ();
 585           for(Int_t ii=0; ii<3; ii++) ti[ii] = cl->GetTrackIndex(ii);
 586
 587           x2=xx2*cs2-y2*sn2;
 588           y2=xx2*sn2+y2*cs2;
 589         }
 590
 591
 592         match = false;
 593         matched_index = -1;
 594         for (Int_t ii=0; ii<3; ii++) {
 595           // cerr<<"ti["<<ii<<"] = "<<ti[ii]<<"; to["<<ii<<"] = "<<to[ii]<<endl;
 596           if(ti[ii] < 0) continue;
 597           if(ti[ii] >= nprim) continue;
 598           for (Int_t kk=0; kk<3; kk++) {
 599             if(to[kk] < 0) continue;
 600             if(to[kk] >= nprim) continue;
 601             if(ti[ii] == to[kk]) {
 602               //cerr<<"ti["<<ii<<"] = "<<ti[ii]<<" = "<<to[kk]<<" = to["<<kk<<"]"<<endl;
 603               matched_index = ti[ii];
 604               match = true;
 605             }
 606           }
 607         }
 608
 609         if(TMath::Abs(z1-z2) > fMaxSeedDeltaZ12) continue;
 610
 611         Double_t zz=z1 - z1/x1*(x1-x2);
 612
 613         if (TMath::Abs(zz-z2)>fMaxSeedDeltaZ) continue;
 614
 615         Double_t d=(x2-x1)*(0.-y2)-(0.-x2)*(y2-y1);
 616         if (d==0.) {cerr<<"TRD MakeSeeds: Straight seed !\n"; continue;}
 617
 618         x[0]=y1;
 619         x[1]=z1;
 620         x[2]=f1trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
 621
 622         if (TMath::Abs(x[2]) > fMaxSeedC) continue;
 623
 624         x[3]=f2trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3);
 625
 626         if (TMath::Abs(x[2]*x1-x[3]) >= 0.99999) continue;
 627
 628         x[4]=f3trd(x1,y1,x2,y2,z1,z2);
 629
 630         if (TMath::Abs(x[4]) > fMaxSeedTan) continue;
 631
 632         Double_t a=asin(x[3]);
 633         Double_t zv=z1 - x[4]/x[2]*(a+asin(x[2]*x1-x[3]));
 634
 635         if (TMath::Abs(zv)>fMaxSeedVertexZ) continue;
 636
 637         Double_t sy1=r1[is]->GetSigmaY2(), sz1=r1[is]->GetSigmaZ2();
 638         Double_t sy2=cl->GetSigmaY2(),     sz2=cl->GetSigmaZ2();
 639         Double_t sy3=fSeedErrorSY3, sy=fSeedErrorSY, sz=fSeedErrorSZ;
 640
 641         Double_t f20=(f1trd(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[2])/sy;
 642         Double_t f22=(f1trd(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[2])/sy;
 643         Double_t f24=(f1trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[2])/sy;
 644         Double_t f30=(f2trd(x1,y1+sy,x2,y2,x3,y3)-x[3])/sy;
 645         Double_t f32=(f2trd(x1,y1,x2,y2+sy,x3,y3)-x[3])/sy;
 646         Double_t f34=(f2trd(x1,y1,x2,y2,x3,y3+sy)-x[3])/sy;
 647         Double_t f40=(f3trd(x1,y1+sy,x2,y2,z1,z2)-x[4])/sy;
 648         Double_t f41=(f3trd(x1,y1,x2,y2,z1+sz,z2)-x[4])/sz;
 649         Double_t f42=(f3trd(x1,y1,x2,y2+sy,z1,z2)-x[4])/sy;
 650         Double_t f43=(f3trd(x1,y1,x2,y2,z1,z2+sz)-x[4])/sz;
 651
 652         c[0]=sy1;
 653         c[1]=0.;       c[2]=sz1;
 654         c[3]=f20*sy1;  c[4]=0.;       c[5]=f20*sy1*f20+f22*sy2*f22+f24*sy3*f24;
 655         c[6]=f30*sy1;  c[7]=0.;       c[8]=f30*sy1*f20+f32*sy2*f22+f34*sy3*f24;
 656                                       c[9]=f30*sy1*f30+f32*sy2*f32+f34*sy3*f34;
 657         c[10]=f40*sy1; c[11]=f41*sz1; c[12]=f40*sy1*f20+f42*sy2*f22;
 658         c[13]=f40*sy1*f30+f42*sy2*f32;
 659         c[14]=f40*sy1*f40+f41*sz1*f41+f42*sy2*f42+f43*sz2*f43;
 660
 661         UInt_t index=r1.GetIndex(is);
 662
 663         AliTRDtrack *track=new AliTRDtrack(r1[is],index,x,c,x1,ns*alpha+shift);
 664
 665         Int_t rc=FindProlongation(*track,fTrSec,ns,i2,matched_index,hsame,hdiff);
 666
 667         //      if (match) hsame->Fill((Float_t) track->GetNclusters());
 668         //      else hdiff->Fill((Float_t) track->GetNclusters());
 669         //      delete track;
 670         //      continue;
 671
 672         if ((rc < 0) ||
 673             (track->GetNclusters() < (i1-i2)*fMinClustersInSeed)) delete track;
 674         else {
 675           fSeeds->AddLast(track); fNseeds++;
 676           printf("\r found seed %d  ", fNseeds);
 677         }
 678       }
 679     }
 680   }
 681
 682   fSeeds->Sort();
 683 }
 684
 685 //_____________________________________________________________________________
 686 void AliTRDtracker::ReadClusters(TObjArray *array, const Char_t *filename)
 687 {
 688   //
 689   // Reads AliTRDclusters (option >= 0) or AliTRDrecPoints (option < 0)
 690   // from the file. The names of the cluster tree and branches
 691   // should match the ones used in AliTRDclusterizer::WriteClusters()
 692   //
 693
 694   TDirectory *savedir=gDirectory;
 695
 696   TFile *file = TFile::Open(filename);
 697   if (!file->IsOpen()) {printf("Can't open file %s !\n",filename); return;}
 698
 699   TTree *ClusterTree = (TTree*)file->Get("ClusterTree");
 700
 701   TObjArray *ClusterArray = new TObjArray(400);
 702
 703   ClusterTree->GetBranch("TRDcluster")->SetAddress(&ClusterArray);
 704
 705   Int_t nEntries = (Int_t) ClusterTree->GetEntries();
 706   printf("found %d entries in %s.\n",nEntries,ClusterTree->GetName());
 707
 708   // Loop through all entries in the tree
 709   Int_t nbytes;
 710   AliTRDcluster *c = 0;
 711
 712   for (Int_t iEntry = 0; iEntry < nEntries; iEntry++) {
 713
 714     // Import the tree
 715     nbytes += ClusterTree->GetEvent(iEntry);
 716
 717     // Get the number of points in the detector
 718     Int_t nCluster = ClusterArray->GetEntriesFast();
 719     printf("Read %d clusters from entry %d \n", nCluster, iEntry);
 720
 721     // Loop through all TRD digits
 722     for (Int_t iCluster = 0; iCluster < nCluster; iCluster++) {
 723       c = (AliTRDcluster*)ClusterArray->UncheckedAt(iCluster);
 724       AliTRDcluster *co = new AliTRDcluster(*c);
 725       co->SetSigmaY2(c->GetSigmaY2() * fSY2corr);
 726       array->AddLast(co);
 727       delete ClusterArray->RemoveAt(iCluster);
 728     }
 729   }
 730
 731   file->Close();
 732   delete ClusterArray;
 733   savedir->cd();
 734
 735 }
 736
 737 //___________________________________________________________________
 738 void AliTRDtracker::FindTracks(AliTRDtrackingSector* fTrSec, TH1F *hs, TH1F *hd)
 739 {
 740   //
 741   // Finds tracks in TRD
 742   //
 743
 744   TH1F *hsame = hs;
 745   TH1F *hdiff = hd;
 746
 747   Int_t num_of_time_bins = fTrSec[0].GetNtimeBins();
 748   Int_t nseed=fSeeds->GetEntriesFast();
 749
 750   Int_t nSeedClusters;
 751   for (Int_t i=0; i<nseed; i++) {
 752     cerr<<"FindTracks: seed "<<i+1<<" out of "<<nseed<<endl;
 753
 754     AliTRDtrack& t=*((AliTRDtrack*)fSeeds->UncheckedAt(i));
 755
 756     nSeedClusters = t.GetNclusters();
 757     Double_t alpha=t.GetAlpha();
 758
 759     if (alpha > 2.*TMath::Pi()) alpha -= 2.*TMath::Pi();
 760     if (alpha < 0.            ) alpha += 2.*TMath::Pi();
 761     Int_t ns=Int_t(alpha/AliTRDgeometry::GetAlpha())%AliTRDgeometry::kNsect;
 762
 763     Int_t label = GetTrackLabel(t);
 764
 765     if (FindProlongation(t,fTrSec,ns,0,label,hsame,hdiff)) {
 766       cerr<<"No of clusters in the track = "<<t.GetNclusters()<<endl;
 767       if (t.GetNclusters() >= Int_t(fMinClustersInTrack*num_of_time_bins)) {
 768         Int_t label = GetTrackLabel(t);
 769         t.SetLabel(label);
 770         t.CookdEdx();
 771         UseClusters(t);
 772
 773         AliTRDtrack *pt = new AliTRDtrack(t);
 774         fTracks->AddLast(pt); fNtracks++;
 775
 776         cerr<<"found track "<<fNtracks<<endl;
 777       }
 778     }
 779     delete fSeeds->RemoveAt(i);
 780     fNseeds--;
 781   }
 782 }
 783
 784 //__________________________________________________________________
 785 void AliTRDtracker::UseClusters(AliTRDtrack t) {
 786   Int_t ncl=t.GetNclusters();
 787   for (Int_t i=0; i<ncl; i++) {
 788     Int_t index = t.GetClusterIndex(i);
 789     AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(index);
 790     c->Use();
 791   }
 792 }
 793
 794 //__________________________________________________________________
 795 Int_t AliTRDtracker::GetTrackLabel(AliTRDtrack t) {
 796
 797   Int_t label=123456789, index, i, j;
 798   Int_t ncl=t.GetNclusters();
 799   const Int_t range = AliTRDgeometry::kNplan * fGeom->GetTimeMax();
 800   Bool_t label_added;
 801
 802   //  Int_t s[range][2];
 803   Int_t **s = new Int_t* [range];
 804   for (i=0; i<range; i++) {
 805     s[i] = new Int_t[2];
 806   }
 807   for (i=0; i<range; i++) {
 808     s[i][0]=-1;
 809     s[i][1]=0;
 810   }
 811
 812   Int_t t0,t1,t2;
 813   for (i=0; i<ncl; i++) {
 814     index=t.GetClusterIndex(i);
 815     AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(index);
 816     t0=c->GetTrackIndex(0);
 817     t1=c->GetTrackIndex(1);
 818     t2=c->GetTrackIndex(2);
 819   }
 820
 821   for (i=0; i<ncl; i++) {
 822     index=t.GetClusterIndex(i);
 823     AliTRDcluster *c=(AliTRDcluster*)fClusters->UncheckedAt(index);
 824     for (Int_t k=0; k<3; k++) {
 825       label=c->GetTrackIndex(k);
 826       label_added=kFALSE; j=0;
 827       if (label >= 0) {
 828         while ( (!label_added) && ( j < range ) ) {
 829           if (s[j][0]==label || s[j][1]==0) {
 830             s[j][0]=label;
 831             s[j][1]=s[j][1]+1;
 832             label_added=kTRUE;
 833           }
 834           j++;
 835         }
 836       }
 837     }
 838   }
 839
 840   Int_t max=0;
 841   label = -123456789;
 842
 843   for (i=0; i<range; i++) {
 844     if (s[i][1]>max) {
 845       max=s[i][1]; label=s[i][0];
 846     }
 847   }
 848   delete []s;
 849   if(max > ncl*fLabelFraction) return label;
 850   else return -1;
 851 }
 852
 853 //___________________________________________________________________
 854
 855 Int_t AliTRDtracker::WriteTracks(const Char_t *filename) {
 856
 857   TDirectory *savedir=gDirectory;
 858
 859   //TFile *out=TFile::Open(filename,"RECREATE");
 860   TFile *out = (TFile*) gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
 861   if (!out) {
 862     printf("AliTRDtracker::Open -- ");
 863     printf("Open the ALIROOT-file %s.\n",filename);
 864     out = new TFile(filename,"RECREATE");
 865   }
 866   else {
 867     printf("AliTRDtracker::Open -- ");
 868     printf("%s is already open.\n",filename);
 869   }
 870
 871   TTree tracktree("TreeT","Tree with TRD tracks");
 872
 873   AliTRDtrack *iotrack=0;
 874   tracktree.Branch("tracks","AliTRDtrack",&iotrack,32000,0);
 875
 876   Int_t ntracks=fTracks->GetEntriesFast();
 877
 878   for (Int_t i=0; i<ntracks; i++) {
 879     AliTRDtrack *pt=(AliTRDtrack*)fTracks->UncheckedAt(i);
 880     iotrack=pt;
 881     tracktree.Fill();
 882     cerr<<"WriteTracks: put track "<<i<<" in the tree"<<endl;
 883   }
 884
 885   tracktree.Write();
 886   out->Close();
 887
 888   savedir->cd();
 889
 890   cerr<<"WriteTracks: done"<<endl;
 891   return 1;
 892 }
 893