prod/cosmic/rawqa.sh

   1 #!/bin/sh
   2 #############################################################################
   3 # rawqa.sh. Front-end script to run reconstruction from the grid chunks
   4 # Usage:
   5 #    ./rawqa.sh <run_number>
   6 #############################################################################
   7 #
   8 # modification history
   9 # version 1.0  July 2008 adapated from rec.C by M. Meoni
  10 # author Yves Schutz CERN
  11 #
  12
  13 # SET THE FOLLOWING PARAMETERS IF NEEDED:
  14 # ---------------------------------------
  15 export YEAR=09
  16 # ---------------------------------------
  17 kill -9 `ps | grep aliroot | awk '{print $1}'`
  18
  19 export RUNNUM=$1
  20
  21 [ -z $RUNNUM ] && { echo "Please provide a run number..."; exit 1; }
  22
  23 [ ! -e "$HOME/.globus/usercert.pem" ] && { echo "FAILED: There is no certificate in $HOME/.globus"; exit 1; }
  24
  25 #[ -e "/tmp/gclient_env_$UID" ] && { source /tmp/gclient_env_$UID; }
  26 #echo 12==========================  $LD_LIBRARY_PATH
  27 alien-token-init
  28 source /tmp/gclient_env_$UID;
  29
  30 [ ! "$?" -eq "0" ] && { echo "FAILED: Token creation failed"; exit 1; }
  31
  32 VERSION=1.0
  33 TITLE="Standalone QA checking of Grid rawdata chunks. v$VERSION"
  34
  35 # Retrieve the list of chunks from AliEn.......
  36 export BASEDIR="/alice/data/20"$YEAR/LHC${YEAR}*
  37 PATTERN="$RUNNUM/raw/${YEAR}*${RUNNUM}*.root"
  38 #aliensh -c "gbbox find $BASEDIR $PATTERN" | head --lines=-1 > collection.tmp
  39 aliensh -c "gbbox find $BASEDIR $PATTERN" > collection.tmp
  40
  41 [ `ls -al collection.tmp | awk '{print $5}'` -eq 0 ] && { echo "No chunks found for the given run"; exit 1; }
  42 rm -r collection.tmp2
  43 #
  44 for ifile in `cat collection.tmp | grep root` ; do printf $ifile" "\|" "0" " >> collection.tmp2 ; done
  45 list=`cat collection.tmp2`
  46 [ -e collection.tmp2 ] && { rm -f collection.tmp2 ; }
  47 totChunks=`cat collection.tmp | wc -l`
  48 rm -f collection.tmp
  49
  50 tempfile=`tempfile 2>/dev/null` || tempfile=/tmp/test$$
  51 trap "rm -f $tempfile" 0 1 2 5 15
  52 dialog --clear --no-cancel --title "$TITLE" \
  53         --ok-label OK --checklist "$totChunks chunks available for run $RUNNUM (only the first 500 are shown). Select chunks for reconstruction" 18 80 10 \
  54         $list 2> $tempfile
  55
  56 CHUNKS=`cat $tempfile`
  57 echo "Selected chunks:"
  58 echo $CHUNKS
  59 echo
  60
  61 #dialog --clear --no-cancel \
  62 #        --ok-label OK --radiolist "Program to run:" 15 20 5 "aliroot -b" \| on alieve \| off 2> $tempfile
  63 PROGRAM=aliroot #`cat $tempfile`
  64
  65 #
  66 for filename in $CHUNKS; do
  67      CHUNK=`basename $filename | cut -d "." -f 1,2`
  68      BEG=`expr index "$CHUNK" .`
  69      BEG=`expr $BEG - 4`
  70      SUBCHUNK=${CHUNK:$BEG}
  71      echo "Running QA for chunk $filename. Outputs will be stored in "$RUNNUM"/"$CHUNK".   $SUBCHUNK"
  72      [ -e $RUNNUM"/"$CHUNK ] && { rm -rf   $RUNNUM"/"$CHUNK ; }
  73      mkdir -p $RUNNUM"/"$CHUNK
  74      rm $RUNNUM"/"*.QA.$RUNNUM.$SUBCHUNK.root
  75      rm $RUNNUM"/"QA.$SUBCHUNK.root
  76      cd       $RUNNUM"/"$CHUNK
  77 $PROGRAM -b<<EOF
  78 .L $ALICE_ROOT/prod/cosmic/rawqa.C+
  79 rawqa($filename, $RUNNUM)
  80 EOF
  81
  82 $PROGRAM -b -q <<EOF
  83 AliQAManager * qam = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kRECMODE) ;
  84  qam.Merge(atoi(gSystem->Getenv("RUNNUM"))) ;
  85 EOF
  86      rm *QA.$RUNNUM.root
  87      cd ..
  88 done
  89 ls */Merged.QA.Data.root > merged.list
  90 outfile="Merged.QA.Data."$RUNNUM".root"
  91 $PROGRAM -b -q <<EOF
  92 .L $ALICE_ROOT/test/cosmic/MergeQAMerged.C
  93 MergeQAMerged("$outfile", "merged.list") ;
  94 EOF
  95 rm -f merged.list
  96 #$PROGRAM -b -q $ALICE_ROOT/test/cosmic/qasummary.C
  97 #$PROGRAM -b  $ALICE_ROOT/test/QA/menuQA.C
  98 cd ..