test/cosmic/rawqa.sh

   1 #!/bin/sh
   2 #############################################################################
   3 # rawqa.sh. Front-end script to run reconstruction from the grid chunks
   4 # Usage:
   5 #    ./rawqa.sh <run_number>
   6 #############################################################################
   7 #
   8 # modification history
   9 # version 1.0  July 2008 adapated from rec.C by M. Meoni
  10 # author Yves Schutz CERN
  11 #
  12
  13 # SET THE FOLLOWING PARAMETERS IF NEEDED:
  14 # ---------------------------------------
  15 export YEAR=08
  16 # ---------------------------------------
  17
  18 export RUNNUM=$1
  19
  20 [ -z $RUNNUM ] && { echo "Please provide a run number..."; exit 1; }
  21
  22 [ ! -e "$HOME/.globus/usercert.pem" ] && { echo "FAILED: There is no certificate in $HOME/.globus"; exit 1; }
  23
  24 [ -e "/tmp/gclient_env_$UID" ] && { source /tmp/gclient_env_$UID; }
  25 echo 12==========================  $LD_LIBRARY_PATH
  26 alien-token-init
  27
  28 [ ! "$?" -eq "0" ] && { echo "FAILED: Token creation failed"; exit 1; }
  29
  30 VERSION=1.0
  31 TITLE="Standalone QA checking of Grid rawdata chunks. v$VERSION"
  32
  33 # Retrieve the list of chunks from AliEn.......
  34 export BASEDIR="/alice/data/20"$YEAR
  35 PATTERN="/raw/"$YEAR"0000"$RUNNUM"*0.root"
  36 #aliensh -c "gbbox find $BASEDIR $PATTERN" | head --lines=-1 > collection.tmp
  37 aliensh -c "gbbox find $BASEDIR $PATTERN" > collection.tmp
  38
  39 [ `ls -al collection.tmp | awk '{print $5}'` -eq 0 ] && { echo "No chunks found for the given run"; exit 1; }
  40 rm -r collection.tmp2
  41 #
  42 for ifile in `cat collection.tmp | grep root` ; do printf $ifile" "\|" "0" " >> collection.tmp2 ; done
  43 list=`cat collection.tmp2`
  44 [ -e collection.tmp2 ] && { rm -f collection.tmp2 ; }
  45 totChunks=`cat collection.tmp | wc -l`
  46 rm -f collection.tmp
  47
  48 tempfile=`tempfile 2>/dev/null` || tempfile=/tmp/test$$
  49 trap "rm -f $tempfile" 0 1 2 5 15
  50 dialog --clear --no-cancel --title "$TITLE" \
  51         --ok-label OK --checklist "$totChunks chunks available for run $RUNNUM (only the first 500 are shown). Select chunks for reconstruction" 18 80 10 \
  52         $list 2> $tempfile
  53
  54 CHUNKS=`cat $tempfile`
  55 echo "Selected chunks:"
  56 echo $CHUNKS
  57 echo
  58
  59 #dialog --clear --no-cancel \
  60 #        --ok-label OK --radiolist "Program to run:" 15 20 5 "aliroot -b" \| on alieve \| off 2> $tempfile
  61 PROGRAM=aliroot #`cat $tempfile`
  62
  63 #
  64 for filename in $CHUNKS; do
  65      filename=${filename//\"/}
  66      CHUNK=`basename $filename | cut -d "." -f 1,2`
  67      BEG=`expr index "$CHUNK" .`
  68      BEG=`expr $BEG - 4`
  69      SUBCHUNK=${CHUNK:$BEG}
  70      echo "Running QA for chunk $filename. Outputs will be stored in "$RUNNUM"/"$CHUNK".   $SUBCHUNK"
  71      [ -e $RUNNUM"/"$CHUNK ] && { rm -rf   $RUNNUM"/"$CHUNK ; }
  72      mkdir -p $RUNNUM"/"$CHUNK
  73      rm $RUNNUM"/"*.QA.$RUNNUM.$SUBCHUNK.root
  74      rm $RUNNUM"/"QA.$SUBCHUNK.root
  75      cd       $RUNNUM"/"$CHUNK
  76      $PROGRAM -q $ALICE_ROOT/test/cosmic/rawqa.C\(\"$filename\"\) 2>&1 | tee rawqa.log
  77      ls *.QA.$RUNNUM.0.root > $tempfile
  78      cd ../
  79      QAFILES=`cat $tempfile`
  80      for qafile in $QAFILES; do
  81         in=$CHUNK/$qafile
  82         ou=${qafile/.0./.$SUBCHUNK.}
  83         ln -si $in $ou
  84      done
  85      ln -si $CHUNK/QA.root QA.$SUBCHUNK.root
  86      cd ..
  87 done
  88 cd $RUNNUM
  89 $PROGRAM -b <<EOF
  90  AliQADataMakerSteer qas ;
  91  qas.Merge(atoi(gSystem->Getenv("RUNNUM"))) ;
  92 EOF
  93 rm -f tempo.txt
  94
  95 $PROGRAM -b -q $ALICE_ROOT/test/cosmic/qasummary.C
  96 $PROGRAM -b  $ALICE_ROOT/test/QA/menuQA.C
  97 cd ..