test/cosmic/rawqa.sh

   1 #!/bin/sh
   2 #############################################################################
   3 # rawqa.sh. Front-end script to run reconstruction from the grid chunks
   4 # Usage:
   5 #    ./rawqa.sh <run_number>
   6 #############################################################################
   7 #
   8 # modification history
   9 # version 1.0  July 2008 adapated from rec.C by M. Meoni
  10 # author Yves Schutz CERN
  11 #
  12
  13
  14 # SET THE FOLLOWING PARAMETERS IF NEEDED:
  15 # ---------------------------------------
  16 export YEAR=08
  17 # ---------------------------------------
  18
  19 export RUNNUM=$1
  20
  21 [ -z $RUNNUM ] && { echo "Please provide a run number..."; exit 1; }
  22
  23 [ ! -e "$HOME/.globus/usercert.pem" ] && { echo "FAILED: There is no certificate in $HOME/.globus"; exit 1; }
  24
  25 [ -e "/tmp/gclient_env_$UID" ] && { source /tmp/gclient_env_$UID; }
  26 alien-token-init
  27
  28 [ ! "$?" -eq "0" ] && { echo "FAILED: Token creation failed"; exit 1; }
  29
  30 VERSION=1.0
  31 TITLE="Standalone QA checking of Grid rawdata chunks. v$VERSION"
  32
  33 # Retrieve the list of chunks from AliEn.......
  34 export BASEDIR="/alice/data/20"$YEAR
  35 PATTERN="/raw/"$YEAR"0000"$RUNNUM"*0.root"
  36 #aliensh -c "gbbox find $BASEDIR $PATTERN" | head --lines=-1 > collection.tmp
  37 aliensh -c "gbbox find $BASEDIR $PATTERN" > collection.tmp
  38
  39 [ `ls -al collection.tmp | awk '{print $5}'` -eq 0 ] && { echo "No chunks found for the given run"; exit 1; }
  40 rm -r collection.tmp2
  41 #
  42 for ifile in `cat collection.tmp | grep root` ; do printf $ifile" "\|" "0" " >> collection.tmp2 ; done
  43 list=`cat collection.tmp2`
  44 [ -e collection.tmp2 ] && { rm -f collection.tmp2 ; }
  45 totChunks=`cat collection.tmp | wc -l`
  46 rm -f collection.tmp
  47
  48 tempfile=`tempfile 2>/dev/null` || tempfile=/tmp/test$$
  49 trap "rm -f $tempfile" 0 1 2 5 15
  50 dialog --clear --no-cancel --title "$TITLE" \
  51         --ok-label OK --checklist "$totChunks chunks available for run $RUNNUM (only the first 500 are shown). Select chunks for reconstruction" 18 80 10 \
  52         $list 2> $tempfile
  53
  54 CHUNKS=`cat $tempfile`
  55 echo "Selected chunks:"
  56 echo $CHUNKS
  57 echo
  58
  59 #dialog --clear --no-cancel \
  60 #        --ok-label OK --radiolist "Program to run:" 15 20 5 "aliroot -b" \| on alieve \| off 2> $tempfile
  61 PROGRAM=aliroot #`cat $tempfile`
  62 #
  63 rm -rf $RUNNUM"/"*QA.$RUNNUM*.root
  64 for filename in $CHUNKS; do
  65      filename=${filename//\"/}
  66      CHUNK=`basename $filename | cut -d "." -f 1,2`
  67      SUBCHUNK=${CHUNK#*.}
  68      echo "Running QA for chunk $filename. Outputs will be stored in "$RUNNUM"/"$CHUNK".   $SUBCHUNK"
  69      rm -rf   $RUNNUM"/"$CHUNK
  70      mkdir -p $RUNNUM"/"$CHUNK
  71      cd       $RUNNUM"/"$CHUNK
  72      $PROGRAM -q $ALICE_ROOT/test/cosmic/rawqa.C\(\"$filename\"\) 2>&1 | tee rawqa.log
  73      ls *.QA.$RUNNUM.0.root > $tempfile
  74      cd ../
  75      QAFILES=`cat $tempfile`
  76      for qafile in $QAFILES; do
  77         in=$CHUNK/$qafile
  78         ou=${qafile/.0./.$SUBCHUNK.}
  79         ln -si $in $ou
  80      done
  81      ln -si $CHUNK/QA.root QA.$SUBCHUNK.root
  82      cd ../
  83 done
  84 cd $RUNNUM
  85 $PROGRAM -b <<EOF
  86  AliQADataMakerSteer qas ;
  87  qas.Merge(atoi(gSystem->Getenv("RUNNUM"))) ;
  88 EOF
  89 rm -f tempo.txt
  90
  91 $PROGRAM -b $ALICE_ROOT/test/cosmic/qasummary.C
  92 cd ..