test/cosmic/rec.sh

   1 #!/bin/sh
   2 #############################################################################
   3 # rec.sh. Front-end script to run reconstruction from the grid chunks
   4 # Usage:
   5 #    ./rec.sh <run_number>
   6 #############################################################################
   7 #
   8 # modification history
   9 # version 1.0  2008/03/04 02:12  Marco Meoni
  10 #
  11 # version 1.1  2008/03/28 00:33  Marco Meoni. Used aliensh instead of alien client
  12
  13 # SET THE FOLLOWING PARAMETERS IF NEEDED:
  14 # ---------------------------------------
  15 YEAR=08
  16 DIALOG=${DIALOG=dialog}
  17 GSHELL_ROOT=$ALIEN_ROOT/api
  18 PATH=$PATH:$GSHELL_ROOT/bin
  19 # ---------------------------------------
  20
  21 RUNNUM=$1
  22
  23 [ -z $RUNNUM ] && { echo "Please provide a run number..."; exit 1; }
  24
  25 [ ! -e "$HOME/.globus/usercert.pem" ] && { echo "FAILED: There is no certificate in $HOME/.globus"; exit 1; }
  26
  27 [ -e "/tmp/gclient_env_$UID" ] && { source /tmp/gclient_env_$UID; }
  28 alien-token-init
  29
  30 [ ! "$?" -eq "0" ] && { echo "FAILED: Token creation failed"; exit 1; }
  31
  32 VERSION=1.0
  33 TITLE="Standalone reconstruction of Grid rawdata chunks. v$VERSION"
  34
  35 # Retrieve the list of chunks from AliEn.......
  36 BASEDIR="/alice/data/20"$YEAR
  37 PATTERN="/raw/"$YEAR"0000"$RUNNUM"*0.root"
  38 aliensh -c "gbbox find $BASEDIR $PATTERN" | head --lines=-1 > collection.tmp
  39
  40 [ $(stat -c%s collection.tmp) -eq 0 ] && { echo "No chunks found for the given run"; exit 1; }
  41 list=`cat collection.tmp | awk '{printf("%s %s %s ",$1,"  .","0");}'`   # improve: put basename
  42 totChunks=`cat collection.tmp | wc -l`; totChunks=`echo \($totChunks / 3\) | bc`
  43 rm -f collection.tmp
  44
  45 tempfile=`tempfile 2>/dev/null` || tempfile=/tmp/test$$
  46 trap "rm -f $tempfile" 0 1 2 5 15
  47 $DIALOG --clear --no-cancel --title "$TITLE" \
  48         --ok-label OK --checklist "$totChunks chunks available. Select chunks for reconstruction" 18 74 10 \
  49         $list 2> $tempfile
  50
  51 CHUNKS=`cat $tempfile`" ."
  52 echo "Selected chunks:"
  53 echo $CHUNKS
  54 echo
  55
  56 echo $CHUNKS | while read -d " " filename; do
  57      filename=${filename//\"/}
  58      CHUNK=`echo $filename | cut -d "/" -f 8 | cut -d "." -f 1,2 | cut -c 12-14,16-`
  59
  60      echo "Running AliRoot reconstruction for chunk $filename. Outputs will be stored in "$RUNNUM"/"$CHUNK"."
  61      rm -rf   $RUNNUM"/"$CHUNK
  62      mkdir -p $RUNNUM"/"$CHUNK
  63      cd       $RUNNUM"/"$CHUNK
  64      aliroot -b -q ../../rec.C\(\"alien://$filename\"\) 2>&1 | tee rec.log
  65      cd ../..
  66 done