test/cosmic/rec.sh

   1 #!/bin/bash
   2 #############################################################################
   3 # rec.sh. Front-end script to run reconstruction from the grid chunks
   4 # Usage:
   5 #    ./rec.sh <run_number>
   6 #############################################################################
   7 #
   8 # modification history
   9 # version 1.0  2008/03/04 02:12  Marco Meoni
  10 #
  11 # version 1.1  2008/03/28 00:33  Marco Meoni. Used aliensh instead of alien client
  12
  13 # SET THE FOLLOWING PARAMETERS IF NEEDED:
  14 # ---------------------------------------
  15 YEAR=08
  16 DIALOG=/usr/bin/dialog
  17 # ---------------------------------------
  18
  19 RUNNUM=$1
  20
  21 [ -z $RUNNUM ] && { echo "Please provide a run number..."; exit 1; }
  22
  23 [ ! -e "$HOME/.globus/usercert.pem" ] && { echo "FAILED: There is no certificate in $HOME/.globus"; exit 1; }
  24
  25 [ -e "/tmp/gclient_env_$UID" ] && { source /tmp/gclient_env_$UID; }
  26 alien-token-init
  27
  28 [ ! "$?" -eq "0" ] && { echo "FAILED: Token creation failed"; exit 1; }
  29
  30 VERSION=1.0
  31 TITLE="Standalone reconstruction of Grid rawdata chunks. v$VERSION"
  32
  33 # Retrieve the list of chunks from AliEn.......
  34 BASEDIR="/alice/data/20"$YEAR
  35 PATTERN="/raw/"$YEAR"0000"$RUNNUM"*0.root"
  36 aliensh -c "gbbox find $BASEDIR $PATTERN" | head --lines=-1 > collection.tmp
  37
  38 [ $(stat -c%s collection.tmp) -eq 0 ] && { echo "No chunks found for the given run"; exit 1; }
  39 rm -f collection.tmp2
  40 for ifile in `cat collection.tmp | head --lines=500` ; do printf $ifile" "\|" "0" " >> collection.tmp2 ; done
  41 list=`cat collection.tmp2`
  42 rm -f collection.tmp2
  43 totChunks=`cat collection.tmp | wc -l`
  44 rm -f collection.tmp
  45
  46 tempfile=`tempfile 2>/dev/null` || tempfile=/tmp/test$$
  47 trap "rm -f $tempfile" 0 1 2 5 15
  48 $DIALOG --clear --no-cancel --title "$TITLE" \
  49         --ok-label OK --checklist "$totChunks chunks available for run $RUNNUM (only the first 500 are shown). Select chunks for reconstruction" 18 80 10 \
  50         $list 2> $tempfile
  51
  52 CHUNKS=`cat $tempfile`
  53 echo "Selected chunks:"
  54 echo $CHUNKS
  55 echo
  56
  57 $DIALOG --clear --no-cancel \
  58         --ok-label OK --radiolist "Program to run:" 15 20 5 "aliroot -b" \| on alieve \| off 2> $tempfile
  59 PROGRAM=`cat $tempfile`
  60
  61 for filename in $CHUNKS; do
  62      filename=${filename//\"/}
  63      CHUNK=`basename $filename | cut -d "." -f 1,2`
  64
  65      echo "Running AliRoot reconstruction for chunk $filename. Outputs will be stored in "$RUNNUM"/"$CHUNK"."
  66      rm -rf   $RUNNUM"/"$CHUNK
  67      mkdir -p $RUNNUM"/"$CHUNK
  68      cd       $RUNNUM"/"$CHUNK
  69      $PROGRAM -q $ALICE_ROOT/test/cosmic/rec.C\(\"alien://$filename\"\) 2>&1 | tee rec.log
  70      cd ../..
  71 done