]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - ANALYSIS/AliAnalysisManager.cxx
Fixes for cmake
[u/mrichter/AliRoot.git] / ANALYSIS / AliAnalysisManager.cxx
index 02566ad4a0e393576316bcfb596f6c5fe93a66b3..136f64ee76b0ee3b93b29347f699417494c79385 100644 (file)
 
 #include <TClass.h>
 #include <TFile.h>
+#include <TKey.h>
 #include <TMethodCall.h>
 #include <TChain.h>
 #include <TSystem.h>
 #include <TROOT.h>
+#include <TCanvas.h>
 
+#include "AliAnalysisSelector.h"
+#include "AliAnalysisGrid.h"
 #include "AliAnalysisTask.h"
 #include "AliAnalysisDataContainer.h"
 #include "AliAnalysisDataSlot.h"
+#include "AliVEventHandler.h"
+#include "AliVEventPool.h"
+#include "AliSysInfo.h"
 #include "AliAnalysisManager.h"
 
 ClassImp(AliAnalysisManager)
 
 AliAnalysisManager *AliAnalysisManager::fgAnalysisManager = NULL;
 
-//______________________________________________________________________________
-AliAnalysisManager::AliAnalysisManager() 
-                   :TNamed(),
-                    fTree(NULL),
-                    fCurrentEntry(-1),
-                    fMode(kLocalAnalysis),
-                    fInitOK(kFALSE),
-                    fTasks(NULL),
-                    fTopTasks(NULL),
-                    fZombies(NULL),
-                    fContainers(NULL),
-                    fInputs(NULL),
-                    fOutputs(NULL)
-{
-// Dummy constructor.
-   fgAnalysisManager = this;
-}
-
 //______________________________________________________________________________
 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const char *name, const char *title)
                    :TNamed(name,title),
                     fTree(NULL),
+                    fInputEventHandler(NULL),
+                    fOutputEventHandler(NULL),
+                    fMCtruthEventHandler(NULL),
+                    fEventPool(NULL),
                     fCurrentEntry(-1),
+                    fNSysInfo(0),
                     fMode(kLocalAnalysis),
                     fInitOK(kFALSE),
                     fDebug(0),
+                    fSpecialOutputLocation(""), 
                     fTasks(NULL),
                     fTopTasks(NULL),
                     fZombies(NULL),
                     fContainers(NULL),
                     fInputs(NULL),
-                    fOutputs(NULL)
+                    fOutputs(NULL),
+                    fCommonInput(NULL),
+                    fCommonOutput(NULL),
+                    fSelector(NULL),
+                    fGridHandler(NULL),
+                    fExtraFiles("")
 {
 // Default constructor.
    fgAnalysisManager = this;
@@ -84,22 +84,34 @@ AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const char *name, const char *title)
    fContainers = new TObjArray();
    fInputs     = new TObjArray();
    fOutputs    = new TObjArray();
+   SetEventLoop(kTRUE);
 }
 
 //______________________________________________________________________________
 AliAnalysisManager::AliAnalysisManager(const AliAnalysisManager& other)
                    :TNamed(other),
                     fTree(NULL),
+                    fInputEventHandler(NULL),
+                    fOutputEventHandler(NULL),
+                    fMCtruthEventHandler(NULL),
+                   fEventPool(NULL),
                     fCurrentEntry(-1),
+                    fNSysInfo(0),
                     fMode(other.fMode),
                     fInitOK(other.fInitOK),
                     fDebug(other.fDebug),
+                    fSpecialOutputLocation(""), 
                     fTasks(NULL),
                     fTopTasks(NULL),
                     fZombies(NULL),
                     fContainers(NULL),
                     fInputs(NULL),
-                    fOutputs(NULL)
+                    fOutputs(NULL),
+                    fCommonInput(NULL),
+                    fCommonOutput(NULL),
+                    fSelector(NULL),
+                    fGridHandler(NULL),
+                    fExtraFiles()
 {
 // Copy constructor.
    fTasks      = new TObjArray(*other.fTasks);
@@ -117,8 +129,13 @@ AliAnalysisManager& AliAnalysisManager::operator=(const AliAnalysisManager& othe
 // Assignment
    if (&other != this) {
       TNamed::operator=(other);
+      fInputEventHandler   = other.fInputEventHandler;
+      fOutputEventHandler  = other.fOutputEventHandler;
+      fMCtruthEventHandler = other.fMCtruthEventHandler;
+      fEventPool           = other.fEventPool;
       fTree       = NULL;
       fCurrentEntry = -1;
+      fNSysInfo   = other.fNSysInfo;
       fMode       = other.fMode;
       fInitOK     = other.fInitOK;
       fDebug      = other.fDebug;
@@ -128,6 +145,11 @@ AliAnalysisManager& AliAnalysisManager::operator=(const AliAnalysisManager& othe
       fContainers = new TObjArray(*other.fContainers);
       fInputs     = new TObjArray(*other.fInputs);
       fOutputs    = new TObjArray(*other.fOutputs);
+      fCommonInput = NULL;
+      fCommonOutput = NULL;
+      fSelector   = NULL;
+      fGridHandler = NULL;
+      fExtraFiles = other.fExtraFiles;
       fgAnalysisManager = this;
    }
    return *this;
@@ -143,6 +165,7 @@ AliAnalysisManager::~AliAnalysisManager()
    if (fContainers) {fContainers->Delete(); delete fContainers;}
    if (fInputs) delete fInputs;
    if (fOutputs) delete fOutputs;
+   if (fGridHandler) delete fGridHandler;
    if (fgAnalysisManager==this) fgAnalysisManager = NULL;
 }
 
@@ -150,49 +173,85 @@ AliAnalysisManager::~AliAnalysisManager()
 Int_t AliAnalysisManager::GetEntry(Long64_t entry, Int_t getall)
 {
 // Read one entry of the tree or a whole branch.
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "== AliAnalysisManager::GetEntry()" << endl;
-   }   
+   if (fDebug > 0) printf("== AliAnalysisManager::GetEntry(%lld)\n", entry);
    fCurrentEntry = entry;
    return fTree ? fTree->GetTree()->GetEntry(entry, getall) : 0;
 }
    
 //______________________________________________________________________________
-void AliAnalysisManager::Init(TTree *tree)
+Bool_t AliAnalysisManager::Init(TTree *tree)
 {
   // The Init() function is called when the selector needs to initialize
   // a new tree or chain. Typically here the branch addresses of the tree
   // will be set. It is normaly not necessary to make changes to the
   // generated code, but the routine can be extended by the user if needed.
   // Init() will be called many times when running with PROOF.
-   if (!tree) return;
-   if (fDebug > 1) {
+   Bool_t init = kFALSE;
+   if (!tree) return kFALSE; // Should not happen - protected in selector caller
+   if (fDebug > 0) {
       printf("->AliAnalysisManager::Init(%s)\n", tree->GetName());
    }
+   // Call InitTree of EventHandler
+   if (fOutputEventHandler) {
+      if (fMode == kProofAnalysis) {
+         init = fOutputEventHandler->Init(0x0, "proof");
+      } else {
+         init = fOutputEventHandler->Init(0x0, "local");
+      }
+      if (!init) {
+         Error("Init", "Output event handler failed to initialize");
+         return kFALSE;
+      }         
+   }
+   
+   if (fInputEventHandler) {
+      if (fMode == kProofAnalysis) {
+         init = fInputEventHandler->Init(tree, "proof");
+      } else {
+         init = fInputEventHandler->Init(tree, "local");
+      }
+      if (!init) {
+         Error("Init", "Input event handler failed to initialize tree"); 
+         return kFALSE;
+      }         
+   } else {
+      // If no input event handler we need to get the tree once
+      // for the chain
+      if(!tree->GetTree()) {
+         Long64_t readEntry = tree->LoadTree(0);
+         if (readEntry == -2) {
+            Error("Init", "Input tree has no entry. Aborting");
+            return kFALSE;
+         }
+      }   
+   }
+
+   if (fMCtruthEventHandler) {
+      if (fMode == kProofAnalysis) {
+         init = fMCtruthEventHandler->Init(0x0, "proof");
+      } else {
+         init = fMCtruthEventHandler->Init(0x0, "local");
+      }
+      if (!init) {
+         Error("Init", "MC event handler failed to initialize"); 
+         return kFALSE;
+      }         
+   }
+
    if (!fInitOK) InitAnalysis();
-   if (!fInitOK) return;
+   if (!fInitOK) return kFALSE;
    fTree = tree;
-   AliAnalysisDataContainer *top = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
+   AliAnalysisDataContainer *top = fCommonInput;
+   if (!top) top = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
    if (!top) {
-      cout<<"Error: No top input container !" <<endl;
-      return;
+      Error("Init","No top input container !");
+      return kFALSE;
    }
    top->SetData(tree);
-   if (fDebug > 1) {
+   if (fDebug > 0) {
       printf("<-AliAnalysisManager::Init(%s)\n", tree->GetName());
    }
-}
-
-//______________________________________________________________________________
-void AliAnalysisManager::Begin(TTree *tree)
-{
-  // The Begin() function is called at the start of the query.
-  // When running with PROOF Begin() is only called on the client.
-  // The tree argument is deprecated (on PROOF 0 is passed).
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "AliAnalysisManager::Begin()" << endl;
-   }   
-   Init(tree);
+   return kTRUE;
 }
 
 //______________________________________________________________________________
@@ -201,22 +260,68 @@ void AliAnalysisManager::SlaveBegin(TTree *tree)
   // The SlaveBegin() function is called after the Begin() function.
   // When running with PROOF SlaveBegin() is called on each slave server.
   // The tree argument is deprecated (on PROOF 0 is passed).
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "->AliAnalysisManager::SlaveBegin()" << endl;
+   if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::SlaveBegin()\n");
+   static Bool_t isCalled = kFALSE;
+   Bool_t init = kFALSE;
+   Bool_t initOK = kTRUE;
+   TString msg;
+   TDirectory *curdir = gDirectory;
+   // Call SlaveBegin only once in case of mixing
+   if (isCalled && fMode==kMixingAnalysis) return;
+   // Call Init of EventHandler
+   if (fOutputEventHandler) {
+      if (fMode == kProofAnalysis) {
+         // Merging AOD's in PROOF via TProofOutputFile
+         if (fDebug > 1) printf("   Initializing AOD output file %s...\n", fOutputEventHandler->GetOutputFileName());
+         init = fOutputEventHandler->Init("proof");
+         if (!init) msg = "Failed to initialize output handler on worker";
+      } else {
+         init = fOutputEventHandler->Init("local");
+         if (!init) msg = "Failed to initialize output handler";
+      }
+      initOK &= init;
+      if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");
+      else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
+   }
+
+   if (fInputEventHandler) {
+      fInputEventHandler->SetInputTree(tree);
+      if (fMode == kProofAnalysis) {
+         init = fInputEventHandler->Init("proof");
+         if (!init) msg = "Failed to initialize input handler on worker";
+      } else {
+         init = fInputEventHandler->Init("local");
+         if (!init) msg = "Failed to initialize input handler";
+      }
+      initOK &= init;
+      if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");      
+      else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
    }
 
+   if (fMCtruthEventHandler) {
+      if (fMode == kProofAnalysis) {
+         init = fMCtruthEventHandler->Init("proof");
+         if (!init) msg = "Failed to initialize MC handler on worker";
+      } else {
+         init = fMCtruthEventHandler->Init("local");
+         if (!init) msg = "Failed to initialize MC handler";
+      }
+      initOK &= init;
+      if (!fSelector) Error("SlaveBegin", "Selector not set");      
+      else if (!init) {fSelector->Abort(msg); fSelector->SetStatus(-1);}
+   }
+   if (curdir) curdir->cd();
+   isCalled = kTRUE;
+   if (!initOK) return;   
    TIter next(fTasks);
    AliAnalysisTask *task;
    // Call CreateOutputObjects for all tasks
    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
-      TDirectory *curdir = gDirectory;
+      curdir = gDirectory;
       task->CreateOutputObjects();
       if (curdir) curdir->cd();
-   }   
-   if (fMode == kLocalAnalysis) Init(tree);   
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "<-AliAnalysisManager::SlaveBegin()" << endl;
    }
+   if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::SlaveBegin()\n");
 }
 
 //______________________________________________________________________________
@@ -227,15 +332,34 @@ Bool_t AliAnalysisManager::Notify()
    // is started when using PROOF. It is normaly not necessary to make changes
    // to the generated code, but the routine can be extended by the
    // user if needed. The return value is currently not used.
-   if (fTree) {
-      TFile *curfile = fTree->GetCurrentFile();
-      if (curfile && fDebug>1) printf("AliAnalysisManager::Notify() file: %s\n", curfile->GetName());
-      TIter next(fTasks);
-      AliAnalysisTask *task;
-      // Call Notify for all tasks
-      while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) 
-         task->Notify();      
+   if (!fTree) return kFALSE;
+
+   TFile *curfile = fTree->GetCurrentFile();
+   if (!curfile) {
+      Error("Notify","No current file");
+      return kFALSE;
+   }   
+   
+   if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Notify() file: %s\n", curfile->GetName());
+   TIter next(fTasks);
+   AliAnalysisTask *task;
+   // Call Notify for all tasks
+   while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) 
+      task->Notify();
+       
+   // Call Notify of the event handlers
+   if (fInputEventHandler) {
+       fInputEventHandler->Notify(curfile->GetName());
    }
+
+   if (fOutputEventHandler) {
+       fOutputEventHandler->Notify(curfile->GetName());
+   }
+
+   if (fMCtruthEventHandler) {
+       fMCtruthEventHandler->Notify(curfile->GetName());
+   }
+   if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Notify()\n");
    return kTRUE;
 }    
 
@@ -259,14 +383,15 @@ Bool_t AliAnalysisManager::Process(Long64_t entry)
   //  The entry is always the local entry number in the current tree.
   //  Assuming that fChain is the pointer to the TChain being processed,
   //  use fChain->GetTree()->GetEntry(entry).
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "->AliAnalysisManager::Process()" << endl;
-   }
+   if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Process(%lld)\n", entry);
+
+   if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(entry);
+   if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(entry);
+   if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(entry);
+   
    GetEntry(entry);
    ExecAnalysis();
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "<-AliAnalysisManager::Process()" << endl;
-   }
+   if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Process()\n");
    return kTRUE;
 }
 
@@ -275,69 +400,286 @@ void AliAnalysisManager::PackOutput(TList *target)
 {
   // Pack all output data containers in the output list. Called at SlaveTerminate
   // stage in PROOF case for each slave.
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "->AliAnalysisManager::PackOutput()" << endl;
-   }   
+   if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::PackOutput()\n");
    if (!target) {
       Error("PackOutput", "No target. Aborting.");
       return;
    }
+   if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->Terminate();
+   if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->Terminate();
+   if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->Terminate();
 
+   // Call FinishTaskOutput() for each event loop task (not called for 
+   // post-event loop tasks - use Terminate() fo those)
+   TIter nexttask(fTasks);
+   AliAnalysisTask *task;
+   while ((task=(AliAnalysisTask*)nexttask())) {
+      if (!task->IsPostEventLoop()) {
+         if (fDebug > 0) printf("->FinishTaskOutput: task %s\n", task->GetName());
+         task->FinishTaskOutput();
+         if (fDebug > 0) printf("<-FinishTaskOutput: task %s\n", task->GetName());
+      }
+   }      
+   
    if (fMode == kProofAnalysis) {
       TIter next(fOutputs);
       AliAnalysisDataContainer *output;
+      Bool_t isManagedByHandler = kFALSE;
       while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
-         if (fDebug > 1) printf("   Packing container %s...\n", output->GetName());
-         if (output->GetData()) target->Add(output->ExportData());
+         // Do not consider outputs of post event loop tasks
+         isManagedByHandler = kFALSE;
+         if (output->GetProducer()->IsPostEventLoop()) continue;
+         const char *filename = output->GetFileName();
+         if (!(strcmp(filename, "default")) && fOutputEventHandler) {
+            isManagedByHandler = kTRUE;
+            printf("#### Handler output. Extra: %s\n", fExtraFiles.Data());
+            filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
+         }
+         // Check if data was posted to this container. If not, issue an error.
+         if (!output->GetData() && !isManagedByHandler) {
+            Error("PackOutput", "No data for output container %s. Forgot to PostData ?\n", output->GetName());
+            continue;
+         }   
+         if (!output->IsSpecialOutput()) {
+            // Normal outputs
+            if (strlen(filename) && !isManagedByHandler) {
+               // File resident outputs
+               TFile *file = output->GetFile();
+               // Backup current folder
+               TDirectory *opwd = gDirectory;
+               // Create file if not existing and register to container.
+               if (file) file->cd();
+               else      file = new TFile(filename, "RECREATE"); 
+               if (file->IsZombie()) {
+                  Fatal("PackOutput", "Could not recreate file %s\n", filename);
+                  return;
+               }   
+               output->SetFile(file);
+               // Clear file list to release object ownership to user.
+               file->Clear();
+               // Save data to file, then close.
+               if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
+                  // If data is a collection, we set the name of the collection 
+                  // as the one of the container and we save as a single key.
+                  TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
+                  coll->SetName(output->GetName());
+                  coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
+               } else {
+                  if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
+                     TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
+                     // tree->SetDirectory(file);
+                     tree->AutoSave();
+                  } else {
+                     output->GetData()->Write();
+                  }   
+               }      
+               if (fDebug > 1) printf("PackOutput %s: memory merge, file resident output\n", output->GetName());
+               if (fDebug > 2) {
+                  printf("   file %s listing content:\n", filename);
+                  file->ls();
+               }   
+               file->Close();
+               // Restore current directory
+               if (opwd) opwd->cd();
+            } else {
+               // Memory-resident outputs   
+               if (fDebug > 1) printf("PackOutput %s: memory merge memory resident output\n", filename);
+            }   
+            AliAnalysisDataWrapper *wrap = 0;
+            if (isManagedByHandler) {
+               wrap = new AliAnalysisDataWrapper(fOutputEventHandler->GetTree());
+               wrap->SetName(output->GetName());
+            }   
+            else                    wrap =output->ExportData();
+            // Output wrappers must NOT delete data after merging - the user owns them
+            wrap->SetDeleteData(kFALSE);
+            target->Add(wrap);
+         } else {
+         // Special outputs. The file must be opened and connected to the container.
+            TDirectory *opwd = gDirectory;
+            TFile *file = output->GetFile();
+            if (!file) {
+               AliAnalysisTask *producer = output->GetProducer();
+               Error("PackOutput", 
+                     "File %s for special container %s was NOT opened in %s::CreateOutputObjects !!!",
+                     output->GetFileName(), output->GetName(), producer->ClassName());
+               continue;
+            }   
+            TString outFilename = file->GetName();
+            if (fDebug > 1) printf("PackOutput %s: special output\n", output->GetName());
+            if (isManagedByHandler) {
+               // Terminate IO for files managed by the output handler
+               if (file) file->Write();
+               if (file && fDebug > 2) {
+                  printf("   handled file %s listing content:\n", file->GetName());
+                  file->ls();
+               }   
+               fOutputEventHandler->TerminateIO();
+            } else {               
+               file->cd();
+               // Release object ownership to users after writing data to file
+               if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
+                  // If data is a collection, we set the name of the collection 
+                  // as the one of the container and we save as a single key.
+                  TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
+                  coll->SetName(output->GetName());
+                  coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
+               } else {
+                  if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
+                     TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
+                     tree->SetDirectory(file);
+                     tree->AutoSave();
+                  } else {
+                     output->GetData()->Write();
+                  }   
+               }      
+               file->Clear();
+               if (fDebug > 2) {
+                  printf("   file %s listing content:\n", output->GetFileName());
+                  file->ls();
+               }
+               file->Close();
+            }
+            // Restore current directory
+            if (opwd) opwd->cd();
+            // Check if a special output location was provided or the output files have to be merged
+            if (strlen(fSpecialOutputLocation.Data())) {
+               TString remote = fSpecialOutputLocation;
+               remote += "/";
+               Int_t gid = gROOT->ProcessLine("gProofServ->GetGroupId();");
+               if (remote.BeginsWith("alien://")) {
+                  gROOT->ProcessLine("TGrid::Connect(\"alien://pcapiserv01.cern.ch:10000\", gProofServ->GetUser());");
+                  remote += outFilename;
+                  remote.ReplaceAll(".root", Form("_%d.root", gid));
+               } else {   
+                  remote += Form("%s_%d_", gSystem->HostName(), gid);
+                  remote += outFilename;
+               }   
+               if (fDebug > 1) 
+                  Info("PackOutput", "Output file for container %s to be copied \n   at: %s. No merging.",
+                       output->GetName(), remote.Data());
+               TFile::Cp ( outFilename.Data(), remote.Data() );
+               // Copy extra outputs
+               if (fExtraFiles.Length() && isManagedByHandler) {
+                  TObjArray *arr = fExtraFiles.Tokenize(" ");
+                  TObjString *os;
+                  TIter nextfilename(arr);
+                  while ((os=(TObjString*)nextfilename())) {
+                     outFilename = os->GetString();
+                     remote = fSpecialOutputLocation;
+                     remote += "/";
+                     if (remote.BeginsWith("alien://")) {
+                        remote += outFilename;
+                        remote.ReplaceAll(".root", Form("_%d.root", gid));
+                     } else {   
+                        remote += Form("%s_%d_", gSystem->HostName(), gid);
+                        remote += outFilename;
+                     }   
+                     if (fDebug > 1) 
+                        Info("PackOutput", "Extra AOD file %s to be copied \n   at: %s. No merging.",
+                             outFilename.Data(), remote.Data());
+                     TFile::Cp ( outFilename.Data(), remote.Data() );
+                  }   
+                  delete arr;
+               }   
+            } else {
+            // No special location specified-> use TProofOutputFile as merging utility
+            // The file at this output slot must be opened in CreateOutputObjects
+               if (fDebug > 1) printf("   File for container %s to be merged via file merger...\n", output->GetName());
+            }
+         }      
       }
    } 
-   if (fDebug > 1) {
-      printf("<-AliAnalysisManager::PackOutput: output list contains %d containers\n", target->GetSize());
-   }
+   if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::PackOutput: output list contains %d containers\n", target->GetSize());
 }
 
 //______________________________________________________________________________
 void AliAnalysisManager::ImportWrappers(TList *source)
 {
 // Import data in output containers from wrappers coming in source.
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "->AliAnalysisManager::ImportWrappers()" << endl;
-   }   
+   if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::ImportWrappers()\n");
    TIter next(fOutputs);
    AliAnalysisDataContainer *cont;
    AliAnalysisDataWrapper   *wrap;
    Int_t icont = 0;
+   Bool_t inGrid = (fMode == kGridAnalysis)?kTRUE:kFALSE;
    while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
-      wrap = (AliAnalysisDataWrapper*)source->FindObject(cont->GetName());
-      if (!wrap && fDebug>1) {
-         printf("(WW) ImportWrappers: container %s not found in analysis output !\n", cont->GetName());
+      wrap = 0;
+      if (cont->GetProducer()->IsPostEventLoop() && !inGrid) continue;
+      const char *filename = cont->GetFileName();
+      Bool_t isManagedByHandler = kFALSE;
+      if (!(strcmp(filename, "default")) && fOutputEventHandler) {
+         isManagedByHandler = kTRUE;
+         filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
+      }
+      if (cont->IsSpecialOutput() || inGrid) {
+         if (strlen(fSpecialOutputLocation.Data())) continue;
+         // Copy merged file from PROOF scratch space. 
+         // In case of grid the files are already in the current directory.
+         if (!inGrid) {
+            if (isManagedByHandler && fExtraFiles.Length()) {
+               // Copy extra registered dAOD files.
+               TObjArray *arr = fExtraFiles.Tokenize(" ");
+               TObjString *os;
+               TIter nextfilename(arr);
+               while ((os=(TObjString*)nextfilename())) GetFileFromWrapper(os->GetString(), source);
+               delete arr;
+            }
+            if (!GetFileFromWrapper(filename, source)) continue;
+         }   
+         // Normally we should connect data from the copied file to the
+         // corresponding output container, but it is not obvious how to do this
+         // automatically if several objects in file...
+         TFile *f = TFile::Open(filename, "READ");
+         if (!f) {
+            Error("ImportWrappers", "Cannot open file %s in read-only mode", filename);
+            continue;
+         }   
+         TObject *obj = 0;
+         // Try to fetch first a list object having the container name.
+         obj = f->Get(cont->GetName());
+         if (!obj) {
+         // Fetch first object from file having the container type.
+            TIter nextkey(f->GetListOfKeys());
+            TKey *key;
+            while ((key=(TKey*)nextkey())) {
+               obj = f->Get(key->GetName());
+               if (obj && obj->IsA()->InheritsFrom(cont->GetType())) break;
+            }                     
+         }
+         if (!obj) {
+            Error("ImportWrappers", "Could not find object for container %s in file %s", cont->GetName(), filename);
+            continue;
+         }  
+         wrap = new AliAnalysisDataWrapper(obj);
+         wrap->SetDeleteData(kFALSE);
+      }   
+      if (!wrap) wrap = (AliAnalysisDataWrapper*)source->FindObject(cont->GetName());
+      if (!wrap) {
+         Error("ImportWrappers","Container %s not found in analysis output !", cont->GetName());
          continue;
       }
       icont++;
-      if (fDebug > 1) printf("   Importing data for container %s\n", wrap->GetName());
-      if (cont->GetFileName()) printf("    -> %s\n", cont->GetFileName());
+      if (fDebug > 1) {
+         printf("   Importing data for container %s", cont->GetName());
+         if (strlen(filename)) printf("    -> file %s\n", filename);
+         else printf("\n");
+      }   
       cont->ImportData(wrap);
    }         
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "<-AliAnalysisManager::ImportWrappers(): "<< icont << " containers imported" << endl;
-   }   
+   if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::ImportWrappers(): %d containers imported\n", icont);
 }
 
 //______________________________________________________________________________
 void AliAnalysisManager::UnpackOutput(TList *source)
 {
-  // Called by AliAnalysisSelector::Terminate. Output containers should
-  // be in source in the same order as in fOutputs.
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "->AliAnalysisManager::UnpackOutput()" << endl;
-   }   
+  // Called by AliAnalysisSelector::Terminate only on the client.
+   if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::UnpackOutput()\n");
    if (!source) {
       Error("UnpackOutput", "No target. Aborting.");
       return;
    }
-   if (fDebug > 1) {
-      printf("   Source list contains %d containers\n", source->GetSize());
-   }   
+   if (fDebug > 1) printf("   Source list contains %d containers\n", source->GetSize());
 
    if (fMode == kProofAnalysis) ImportWrappers(source);
 
@@ -345,37 +687,24 @@ void AliAnalysisManager::UnpackOutput(TList *source)
    AliAnalysisDataContainer *output;
    while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next())) {
       if (!output->GetData()) continue;
-      // Check if the output need to be written to a file.
-      const char *filename = output->GetFileName();
-      if (!filename || !strlen(filename)) continue;
-      TFile *file = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
-      if (file) file->cd();
-      else      file = new TFile(filename, "RECREATE");
-      if (file->IsZombie()) continue;
-      // Reparent data to this file
-      TMethodCall callEnv;
-      if (output->GetData()->IsA())
-         callEnv.InitWithPrototype(output->GetData()->IsA(), "SetDirectory", "TDirectory*");
-      if (callEnv.IsValid()) {
-         callEnv.SetParam((Long_t) file);
-         callEnv.Execute(output->GetData());
-      }
-      output->GetData()->Write();
-      // Check if there are client tasks that run in single-shot mode.
-      if (!output->HasConsumers()) continue;
-      output->SetEventByEvent(kFALSE);
-      TObjArray *list = output->GetConsumers();
-      Int_t ncons = list->GetEntriesFast();
-      for (Int_t i=0; i<ncons; i++) {
-         AliAnalysisTask *task = (AliAnalysisTask*)list->At(i);
-         task->CheckNotify(kTRUE);
-         // If task is active, execute it
-         if (task->IsActive()) task->ExecuteTask();         
-      }
+      // Check if there are client tasks that run post event loop
+      if (output->HasConsumers()) {
+         // Disable event loop semaphore
+         output->SetPostEventLoop(kTRUE);
+         TObjArray *list = output->GetConsumers();
+         Int_t ncons = list->GetEntriesFast();
+         for (Int_t i=0; i<ncons; i++) {
+            AliAnalysisTask *task = (AliAnalysisTask*)list->At(i);
+            task->CheckNotify(kTRUE);
+            // If task is active, execute it
+            if (task->IsPostEventLoop() && task->IsActive()) {
+               if (fDebug > 0) printf("== Executing post event loop task %s\n", task->GetName());
+               task->ExecuteTask();
+            }   
+         }
+      }   
    }
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "<-AliAnalysisManager::UnpackOutput()" << endl;
-   }   
+   if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::UnpackOutput()\n");
 }
 
 //______________________________________________________________________________
@@ -384,22 +713,108 @@ void AliAnalysisManager::Terminate()
   // The Terminate() function is the last function to be called during
   // a query. It always runs on the client, it can be used to present
   // the results graphically.
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "->AliAnalysisManager::Terminate()" << endl;
-   }   
+   if (fDebug > 0) printf("->AliAnalysisManager::Terminate()\n");
    AliAnalysisTask *task;
    TIter next(fTasks);
    // Call Terminate() for tasks
    while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->Terminate();
-   if (fDebug > 1) {
-      cout << "<-AliAnalysisManager::Terminate()" << endl;
+   //
+   TIter next1(fOutputs);
+   AliAnalysisDataContainer *output;
+   while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next1())) {
+      // Special outputs or grid files have the files already closed and written.
+      if (fMode == kGridAnalysis) continue;
+      if (output->IsSpecialOutput()&&(fMode == kProofAnalysis)) continue;
+      const char *filename = output->GetFileName();
+      if (!(strcmp(filename, "default"))) {
+         if (fOutputEventHandler) filename = fOutputEventHandler->GetOutputFileName();
+         TFile *aodfile = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
+         if (aodfile) {
+            if (fDebug > 1) printf("Writing output handler file: %s\n", filename);
+            aodfile->Write();
+            continue;
+         }   
+      }      
+      if (!strlen(filename)) continue;
+      if (!output->GetData()) continue;
+      TFile *file = output->GetFile();
+      TDirectory *opwd = gDirectory;
+      file = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
+      if (!file) file = new TFile(filename, "RECREATE");
+      if (file->IsZombie()) continue;
+      output->SetFile(file);
+      file->cd();
+      if (fDebug > 1) printf("   writing output data %s to file %s\n", output->GetData()->GetName(), file->GetName());
+      if (output->GetData()->InheritsFrom(TCollection::Class())) {
+      // If data is a collection, we set the name of the collection 
+      // as the one of the container and we save as a single key.
+         TCollection *coll = (TCollection*)output->GetData();
+         coll->SetName(output->GetName());
+         coll->Write(output->GetName(), TObject::kSingleKey);
+      } else {
+         if (output->GetData()->InheritsFrom(TTree::Class())) {
+            TTree *tree = (TTree*)output->GetData();
+            tree->SetDirectory(file);
+            tree->AutoSave();
+         } else {
+            output->GetData()->Write();
+         }   
+      }      
+      if (opwd) opwd->cd();
    }   
+   next1.Reset();
+   while ((output=(AliAnalysisDataContainer*)next1())) {
+      // Close all files at output
+      TDirectory *opwd = gDirectory;
+      if (output->GetFile()) {
+         output->GetFile()->Close();
+         // Copy merged outputs in alien if requested
+         if (fSpecialOutputLocation.Length() && 
+             fSpecialOutputLocation.BeginsWith("alien://")) {
+            Info("Terminate", "Copy file %s to %s", output->GetFile()->GetName(),fSpecialOutputLocation.Data()); 
+            TFile::Cp(output->GetFile()->GetName(), 
+                      Form("%s/%s", fSpecialOutputLocation.Data(), output->GetFile()->GetName()));
+         }             
+      }   
+      if (opwd) opwd->cd();
+   }   
+
+   if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->TerminateIO();
+   if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->TerminateIO();
+   if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->TerminateIO();
+
+   Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
+   if (getsysInfo) {
+      TDirectory *cdir = gDirectory;
+      TFile f("syswatch.root", "RECREATE");
+      if (!f.IsZombie()) {
+         TTree *tree = AliSysInfo::MakeTree("syswatch.log");
+         tree->SetMarkerStyle(kCircle);
+         tree->SetMarkerColor(kBlue);
+         tree->SetMarkerSize(0.5);
+         if (!gROOT->IsBatch()) {
+            tree->SetAlias("event", "id0");
+            tree->SetAlias("memUSED", "mi.fMemUsed");
+            new TCanvas("SysInfo","SysInfo",10,10,800,600);
+            tree->Draw("memUSED:event","","", 1234567890, 0);
+         }   
+         tree->Write();
+         f.Close();
+         delete tree;
+      }
+      if (cdir) cdir->cd();
+   }      
+   if (fDebug > 0) printf("<-AliAnalysisManager::Terminate()\n");
 }
 
 //______________________________________________________________________________
 void AliAnalysisManager::AddTask(AliAnalysisTask *task)
 {
 // Adds a user task to the global list of tasks.
+   if (fTasks->FindObject(task)) {
+      Warning("AddTask", "Task %s: the same object already added to the analysis manager. Not adding.", task->GetName());
+      return;
+   }   
    task->SetActive(kFALSE);
    fTasks->Add(task);
 }  
@@ -420,6 +835,10 @@ AliAnalysisDataContainer *AliAnalysisManager::CreateContainer(const char *name,
 //   kExchangeContainer  = 0, used to exchange date between tasks
 //   kInputContainer   = 1, used to store input data
 //   kOutputContainer  = 2, used for posting results
+   if (fContainers->FindObject(name)) {
+      Error("CreateContainer","A container named %s already defined !\n",name);
+      return NULL;
+   }   
    AliAnalysisDataContainer *cont = new AliAnalysisDataContainer(name, datatype);
    fContainers->Add(cont);
    switch (type) {
@@ -427,9 +846,11 @@ AliAnalysisDataContainer *AliAnalysisManager::CreateContainer(const char *name,
          fInputs->Add(cont);
          break;
       case kOutputContainer:
-         if (fOutputs->FindObject(name)) printf("CreateContainer: warning: a container named %s existing !\n",name);
          fOutputs->Add(cont);
-         if (filename && strlen(filename)) cont->SetFileName(filename);
+         if (filename && strlen(filename)) {
+            cont->SetFileName(filename);
+            cont->SetDataOwned(kFALSE);  // data owned by the file
+         }   
          break;
       case kExchangeContainer:
          break;   
@@ -442,9 +863,13 @@ Bool_t AliAnalysisManager::ConnectInput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
 {
 // Connect input of an existing task to a data container.
+   if (!task) {
+      Error("ConnectInput", "Task pointer is NULL");
+      return kFALSE;
+   }   
    if (!fTasks->FindObject(task)) {
       AddTask(task);
-      Warning("ConnectInput", "Task %s not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
+      Info("ConnectInput", "Task %s was not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
    } 
    Bool_t connected = task->ConnectInput(islot, cont);
    return connected;
@@ -455,6 +880,10 @@ Bool_t AliAnalysisManager::ConnectOutput(AliAnalysisTask *task, Int_t islot,
                                         AliAnalysisDataContainer *cont)
 {
 // Connect output of an existing task to a data container.
+   if (!task) {
+      Error("ConnectOutput", "Task pointer is NULL");
+      return kFALSE;
+   }   
    if (!fTasks->FindObject(task)) {
       AddTask(task);
       Warning("ConnectOutput", "Task %s not registered. Now owned by analysis manager", task->GetName());
@@ -549,6 +978,30 @@ Bool_t AliAnalysisManager::InitAnalysis()
          return kFALSE;
       }   
    }
+   // Check that all containers feeding post-event loop tasks are in the outputs list
+   TIter nextcont(fContainers); // loop over all containers
+   while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)nextcont())) {
+      if (!cont->IsPostEventLoop() && !fOutputs->FindObject(cont)) {
+         if (cont->HasConsumers()) {
+         // Check if one of the consumers is post event loop
+            TIter nextconsumer(cont->GetConsumers());
+            while ((task=(AliAnalysisTask*)nextconsumer())) {
+               if (task->IsPostEventLoop()) {
+                  fOutputs->Add(cont);
+                  break;
+               }
+            }
+         }
+      }
+   }   
+   // Check if all special output containers have a file name provided
+   TIter nextout(fOutputs);
+   while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)nextout())) {
+      if (cont->IsSpecialOutput() && !strlen(cont->GetFileName())) {
+         Error("InitAnalysis", "Wrong container %s : a file name MUST be provided for special outputs", cont->GetName());
+         return kFALSE;
+      }
+   }      
    fInitOK = kTRUE;
    return kTRUE;
 }   
@@ -557,6 +1010,13 @@ Bool_t AliAnalysisManager::InitAnalysis()
 void AliAnalysisManager::PrintStatus(Option_t *option) const
 {
 // Print task hierarchy.
+   if (!fInitOK) {
+      Info("PrintStatus", "Analysis manager %s not initialized : call InitAnalysis() first", GetName());
+      return;
+   }   
+   Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
+   if (getsysInfo)
+      Info("PrintStatus", "System information will be collected each %lld events", fNSysInfo);
    TIter next(fTopTasks);
    AliAnalysisTask *task;
    while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
@@ -571,64 +1031,87 @@ void AliAnalysisManager::ResetAnalysis()
 }
 
 //______________________________________________________________________________
-void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, TTree *tree)
+void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, TTree *tree, Long64_t nentries, Long64_t firstentry)
 {
-// Start analysis for this manager. Analysis task can be: LOCAL, PROOF or GRID.
+// Start analysis for this manager. Analysis task can be: LOCAL, PROOF, GRID or
+// MIX. Process nentries starting from firstentry
    if (!fInitOK) {
       Error("StartAnalysis","Analysis manager was not initialized !");
       return;
    }
-   if (fDebug>1) {
-      cout << "StartAnalysis: " << GetName() << endl;   
-   }   
+   if (fDebug > 0) printf("StartAnalysis %s\n",GetName());
    TString anaType = type;
    anaType.ToLower();
    fMode = kLocalAnalysis;
-   if (tree) {
-      if (anaType.Contains("proof"))     fMode = kProofAnalysis;
-      else if (anaType.Contains("grid")) fMode = kGridAnalysis;
-   }
+   Bool_t runlocalinit = kTRUE;
+   if (anaType.Contains("file")) runlocalinit = kFALSE;
+   if (anaType.Contains("proof"))     fMode = kProofAnalysis;
+   else if (anaType.Contains("grid")) fMode = kGridAnalysis;
+   else if (anaType.Contains("mix"))  fMode = kMixingAnalysis;
+
    if (fMode == kGridAnalysis) {
-      Warning("StartAnalysis", "GRID analysis mode not implemented. Running local.");
-      fMode = kLocalAnalysis;
+      if (!fGridHandler) {
+         Error("StartAnalysis", "Cannot start grid analysis without a grid handler.");
+         Info("===", "Add an AliAnalysisAlien object as plugin for this manager and configure it.");
+         return;
+      }
+      // Write analysis manager in the analysis file
+      cout << "===== RUNNING GRID ANALYSIS: " << GetName() << endl;
+      // run local task configuration
+      TIter nextTask(fTasks);
+      AliAnalysisTask *task;
+      while ((task=(AliAnalysisTask*)nextTask())) {
+         task->LocalInit();
+      }
+      if (!fGridHandler->StartAnalysis(nentries, firstentry)) {
+         Info("StartAnalysis", "Grid analysis was stopped and cannot be terminated");
+         return;
+      }   
+
+      // Terminate grid analysis
+      if (fSelector && fSelector->GetStatus() == -1) return;
+      if (fGridHandler->GetRunMode() == AliAnalysisGrid::kOffline) return;
+      cout << "===== MERGING OUTPUTS REGISTERED BY YOUR ANALYSIS JOB: " << GetName() << endl;
+      if (!fGridHandler->MergeOutputs()) {
+         // Return if outputs could not be merged or if it alien handler
+         // was configured for offline mode or local testing.
+         return;
+      }
+      ImportWrappers(NULL);
+      Terminate();
+      return;
    }
-   char line[128];
+   char line[256];
    SetEventLoop(kFALSE);
-   // Disable by default all branches and set event loop mode
-   if (tree) {
-//      tree->SetBranchStatus("*",0);
-      SetEventLoop(kTRUE);
-   }   
-   AliAnalysisDataContainer *cont = 0;
-   TIter nextc(fInputs);
-   // Force top containers have the same event loop type as the analysis
-   while ((cont=(AliAnalysisDataContainer*)nextc())) cont->SetEventByEvent(IsEventLoop());
-   AliAnalysisDataContainer *cont_top = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->First();
+   // Enable event loop mode if a tree was provided
+   if (tree || fMode==kMixingAnalysis) SetEventLoop(kTRUE);
 
-   TChain *chain = dynamic_cast<TChain*>(tree);
+   TChain *chain = 0;
+   TString ttype = "TTree";
+   if (tree && tree->IsA() == TChain::Class()) {
+      chain = (TChain*)tree;
+      if (!chain || !chain->GetListOfFiles()->First()) {
+         Error("StartAnalysis", "Cannot process null or empty chain...");
+         return;
+      }   
+      ttype = "TChain";
+   }   
 
-   // Initialize locally all tasks
+   // Initialize locally all tasks (happens for all modes)
    TIter next(fTasks);
    AliAnalysisTask *task;
-   while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
-      for (Int_t islot=0; islot<task->GetNinputs(); islot++) {
-         cont = task->GetInputSlot(islot)->GetContainer();
-         if (cont==cont_top) break;
-         cont = 0;
+   if (runlocalinit) {
+      while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
+         task->LocalInit();
       }
-      // All tasks feeding from the top containers must have the same event loop type
-//      if (cont) task->SetExecPerEvent(IsEventLoop());
-//      else task->SetExecPerEvent(task->IsExecPerEvent());         
-      task->LocalInit();
-   }
+   }   
    
    switch (fMode) {
       case kLocalAnalysis:
          if (!tree) {
-            TIter next(fTasks);
-            AliAnalysisTask *task;
+            TIter nextT(fTasks);
             // Call CreateOutputObjects for all tasks
-            while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
+            while ((task=(AliAnalysisTask*)nextT())) {
                TDirectory *curdir = gDirectory;
                task->CreateOutputObjects();
                if (curdir) curdir->cd();
@@ -638,12 +1121,9 @@ void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, TTree *tree)
             return;
          } 
          // Run tree-based analysis via AliAnalysisSelector  
-         gROOT->ProcessLine(".L $ALICE_ROOT/ANALYSIS/AliAnalysisSelector.cxx+");
          cout << "===== RUNNING LOCAL ANALYSIS " << GetName() << " ON TREE " << tree->GetName() << endl;
-         sprintf(line, "AliAnalysisSelector *selector = new AliAnalysisSelector((AliAnalysisManager*)0x%lx);",(ULong_t)this);
-         gROOT->ProcessLine(line);
-         sprintf(line, "((TTree*)0x%lx)->Process(selector);",(ULong_t)tree);
-         gROOT->ProcessLine(line);
+         fSelector = new AliAnalysisSelector(this);
+         tree->Process(fSelector, "", nentries, firstentry);
          break;
       case kProofAnalysis:
          if (!gROOT->GetListOfProofs() || !gROOT->GetListOfProofs()->GetEntries()) {
@@ -655,7 +1135,7 @@ void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, TTree *tree)
          if (chain) {
             chain->SetProof();
             cout << "===== RUNNING PROOF ANALYSIS " << GetName() << " ON CHAIN " << chain->GetName() << endl;
-            chain->Process(gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT/ANALYSIS/AliAnalysisSelector.cxx+"));
+            chain->Process("AliAnalysisSelector", "", nentries, firstentry);
          } else {
             printf("StartAnalysis: no chain\n");
             return;
@@ -663,13 +1143,111 @@ void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, TTree *tree)
          break;
       case kGridAnalysis:
          Warning("StartAnalysis", "GRID analysis mode not implemented. Running local.");
+         break;
+      case kMixingAnalysis:   
+         // Run event mixing analysis
+         if (!fEventPool) {
+            Error("StartAnalysis", "Cannot run event mixing without event pool");
+            return;
+         }
+         cout << "===== RUNNING EVENT MIXING ANALYSIS " << GetName() << endl;
+         fSelector = new AliAnalysisSelector(this);
+         while ((chain=fEventPool->GetNextChain())) {
+            next.Reset();
+            // Call NotifyBinChange for all tasks
+            while ((task=(AliAnalysisTask*)next()))
+               if (!task->IsPostEventLoop()) task->NotifyBinChange();
+            chain->Process(fSelector);
+         }
+         PackOutput(fSelector->GetOutputList());
+         Terminate();
+   }   
+}   
+
+//______________________________________________________________________________
+void AliAnalysisManager::StartAnalysis(const char *type, const char *dataset, Long64_t nentries, Long64_t firstentry)
+{
+// Start analysis for this manager on a given dataset. Analysis task can be: 
+// LOCAL, PROOF or GRID. Process nentries starting from firstentry.
+   if (!fInitOK) {
+      Error("StartAnalysis","Analysis manager was not initialized !");
+      return;
+   }
+   if (fDebug > 0) printf("StartAnalysis %s\n",GetName());
+   TString anaType = type;
+   anaType.ToLower();
+   if (!anaType.Contains("proof")) {
+      Error("StartAnalysis", "Cannot process datasets in %s mode. Try PROOF.", type);
+      return;
+   }   
+   fMode = kProofAnalysis;
+   char line[256];
+   SetEventLoop(kTRUE);
+   // Set the dataset flag
+   TObject::SetBit(kUseDataSet);
+   fTree = 0;
+
+   // Initialize locally all tasks
+   TIter next(fTasks);
+   AliAnalysisTask *task;
+   while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) {
+      task->LocalInit();
+   }
+   
+   if (!gROOT->GetListOfProofs() || !gROOT->GetListOfProofs()->GetEntries()) {
+      printf("StartAnalysis: no PROOF!!!\n");
+      return;
+   }   
+   sprintf(line, "gProof->AddInput((TObject*)0x%lx);", (ULong_t)this);
+   gROOT->ProcessLine(line);
+   sprintf(line, "gProof->GetDataSet(\"%s\");", dataset);
+   if (!gROOT->ProcessLine(line)) {
+      Error("StartAnalysis", "Dataset %s not found", dataset);
+      return;
+   }   
+   sprintf(line, "gProof->Process(\"%s\", \"AliAnalysisSelector\", \"\", %lld, %lld);",
+           dataset, nentries, firstentry);
+   cout << "===== RUNNING PROOF ANALYSIS " << GetName() << " ON DATASET " << dataset << endl;
+   gROOT->ProcessLine(line);
+}   
+
+//______________________________________________________________________________
+TFile *AliAnalysisManager::OpenProofFile(const char *filename, const char *option)
+{
+// Opens a special output file used in PROOF.
+   char line[256];
+   if (fMode!=kProofAnalysis || !fSelector) {
+      Error("OpenProofFile","Cannot open PROOF file %s",filename);
+      return NULL;
+   } 
+   if (fSpecialOutputLocation.Length()) {
+      TFile *f = (TFile*)gROOT->GetListOfFiles()->FindObject(filename);
+      if (!f) f = new TFile(filename, option);
+      return f;
+   }   
+   sprintf(line, "TProofOutputFile *pf = new TProofOutputFile(\"%s\");", filename);
+   if (fDebug > 1) printf("=== %s\n", line);
+   gROOT->ProcessLine(line);
+   sprintf(line, "pf->OpenFile(\"%s\");", option);
+   gROOT->ProcessLine(line);
+   if (fDebug > 1) {
+      gROOT->ProcessLine("pf->Print()");
+      printf(" == proof file name: %s\n", gFile->GetName());
    }   
+   sprintf(line, "((TList*)0x%lx)->Add(pf);",(ULong_t)fSelector->GetOutputList());
+   if (fDebug > 1) printf("=== %s\n", line);
+   gROOT->ProcessLine(line);
+   return gFile;
 }   
 
 //______________________________________________________________________________
 void AliAnalysisManager::ExecAnalysis(Option_t *option)
 {
 // Execute analysis.
+   static Long64_t ncalls = 0;
+   Bool_t getsysInfo = ((fNSysInfo>0) && (fMode==kLocalAnalysis))?kTRUE:kFALSE;
+   if (getsysInfo && ncalls==0) AliSysInfo::AddStamp("Start", (Int_t)ncalls);
+   ncalls++;
    if (!fInitOK) {
      Error("ExecAnalysis", "Analysis manager was not initialized !");
       return;
@@ -677,29 +1255,50 @@ void AliAnalysisManager::ExecAnalysis(Option_t *option)
    AliAnalysisTask *task;
    // Check if the top tree is active.
    if (fTree) {
-      if (fDebug>1) {
-         printf("AliAnalysisManager::ExecAnalysis\n");
-      }   
       TIter next(fTasks);
    // De-activate all tasks
       while ((task=(AliAnalysisTask*)next())) task->SetActive(kFALSE);
-      AliAnalysisDataContainer *cont = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
+      AliAnalysisDataContainer *cont = fCommonInput;
+      if (!cont) cont = (AliAnalysisDataContainer*)fInputs->At(0);
       if (!cont) {
              Error("ExecAnalysis","Cannot execute analysis in TSelector mode without at least one top container");
          return;
       }   
       cont->SetData(fTree); // This will notify all consumers
-      TIter next1(cont->GetConsumers());
+      Long64_t entry = fTree->GetTree()->GetReadEntry();
+      
+//
+//    Call BeginEvent() for optional input/output and MC services 
+      if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(entry);
+      if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(entry);
+      if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(entry);
+//
+//    Execute the tasks
+//      TIter next1(cont->GetConsumers());
+      TIter next1(fTopTasks);
       while ((task=(AliAnalysisTask*)next1())) {
-//         task->SetActive(kTRUE);
          if (fDebug >1) {
             cout << "    Executing task " << task->GetName() << endl;
          }   
+        
          task->ExecuteTask(option);
       }
+//
+//    Call FinishEvent() for optional output and MC services 
+      if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->FinishEvent();
+      if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->FinishEvent();
+      if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->FinishEvent();
+      // Gather system information if requested
+      if (getsysInfo && ((ncalls%fNSysInfo)==0)) 
+         AliSysInfo::AddStamp(Form("Event#%lld",ncalls),(Int_t)ncalls);
       return;
    }   
    // The event loop is not controlled by TSelector   
+//
+//  Call BeginEvent() for optional input/output and MC services 
+   if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->BeginEvent(-1);
+   if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->BeginEvent(-1);
+   if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->BeginEvent(-1);
    TIter next2(fTopTasks);
    while ((task=(AliAnalysisTask*)next2())) {
       task->SetActive(kTRUE);
@@ -708,6 +1307,11 @@ void AliAnalysisManager::ExecAnalysis(Option_t *option)
       }   
       task->ExecuteTask(option);
    }   
+//
+// Call FinishEvent() for optional output and MC services 
+   if (fInputEventHandler)   fInputEventHandler  ->FinishEvent();
+   if (fOutputEventHandler)  fOutputEventHandler ->FinishEvent();
+   if (fMCtruthEventHandler) fMCtruthEventHandler->FinishEvent();
 }
 
 //______________________________________________________________________________
@@ -715,3 +1319,86 @@ void AliAnalysisManager::FinishAnalysis()
 {
 // Finish analysis.
 }
+
+//______________________________________________________________________________
+void AliAnalysisManager::SetInputEventHandler(AliVEventHandler*  handler)
+{
+// Set the input event handler and create a container for it.
+   fInputEventHandler   = handler;
+   fCommonInput = CreateContainer("cAUTO_INPUT", TChain::Class(), AliAnalysisManager::kInputContainer);
+   Warning("SetInputEventHandler", " An automatic input container for the input chain was created.\nPlease use: mgr->GetCommonInputContainer() to access it.");
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+void AliAnalysisManager::SetOutputEventHandler(AliVEventHandler*  handler)
+{
+// Set the input event handler and create a container for it.
+   fOutputEventHandler   = handler;
+   fCommonOutput = CreateContainer("cAUTO_OUTPUT", TTree::Class(), AliAnalysisManager::kOutputContainer, "default");
+   fCommonOutput->SetSpecialOutput();
+   Warning("SetOutputEventHandler", " An automatic output container for the output tree was created.\nPlease use: mgr->GetCommonOutputContainer() to access it.");
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+void AliAnalysisManager::RegisterExtraFile(const char *fname)
+{
+// This method is used externally to register output files which are not
+// connected to any output container, so that the manager can properly register,
+// retrieve or merge them when running in distributed mode. The file names are
+// separated by blancs. The method has to be called in MyAnalysisTask::LocalInit().
+   if (fExtraFiles.Length()) fExtraFiles += " ";
+   fExtraFiles += fname;
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+Bool_t AliAnalysisManager::GetFileFromWrapper(const char *filename, TList *source)
+{
+// Copy a file from the location specified ina the wrapper with the same name from the source list.
+   char full_path[512];
+   char ch_url[512];
+   TObject *pof =  source->FindObject(filename);
+   if (!pof || !pof->InheritsFrom("TProofOutputFile")) {
+      Error("GetFileFromWrapper", "TProofOutputFile object not found in output list for file %s", filename);
+      return kFALSE;
+   }
+   gROOT->ProcessLine(Form("sprintf((char*)0x%lx, \"%%s\", ((TProofOutputFile*)0x%lx)->GetOutputFileName();)", full_path, pof));
+   gROOT->ProcessLine(Form("sprintf((char*)0x%lx, \"%%s\", gProof->GetUrl();)", ch_url));
+   TString clientUrl(ch_url);
+   TString full_path_str(full_path);
+   if (clientUrl.Contains("localhost")){
+      TObjArray* array = full_path_str.Tokenize ( "//" );
+      TObjString *strobj = ( TObjString *)array->At(1);
+      TObjArray* arrayPort = strobj->GetString().Tokenize ( ":" );
+      TObjString *strobjPort = ( TObjString *) arrayPort->At(1);
+      full_path_str.ReplaceAll(strobj->GetString().Data(),"localhost:PORT");
+      full_path_str.ReplaceAll(":PORT",Form(":%s",strobjPort->GetString().Data()));
+      if (fDebug > 1) Info("GetFileFromWrapper","Using tunnel from %s to %s",full_path_str.Data(),filename);
+      delete arrayPort;
+      delete array;
+   }
+   if (fDebug > 1) 
+      Info("GetFileFromWrapper","Copying file %s from PROOF scratch space", full_path_str.Data());
+   Bool_t gotit = TFile::Cp(full_path_str.Data(), filename); 
+   if (!gotit)
+      Error("GetFileFromWrapper", "Could not get file %s from proof scratch space", filename);
+   return gotit;
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+void AliAnalysisManager::GetAnalysisTypeString(TString &type) const
+{
+// Fill analysis type in the provided string.
+   switch (fMode) {
+      case kLocalAnalysis:
+         type = "local";
+         return;
+      case kProofAnalysis:
+         type = "proof";
+         return;
+      case kGridAnalysis:
+         type = "grid";
+         return;
+      case kMixingAnalysis:
+         type = "mix";
+   }
+}