]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - EMCAL/AliEMCAL.cxx
add getter for the array with digits and initialization inside, just for analysis...
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCAL.cxx
index 6f95bb978aed4e67a3d158a093b45c7a239a62c8..dc49de3ae60d1311837fbdc25eb259e59155ad96 100644 (file)
@@ -14,7 +14,6 @@
  **************************************************************************/
 
 /* $Id$ */
-
 //_________________________________________________________________________
 // Base Class for EMCAL description:
 // This class contains material definitions    
 //*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH) 
 //
 //*-- Additional Contributions: Sahal Yacoob (LBNL/UCT)
+//                            : Alexei Pavlinov (WSU) 
 //
 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
 // --- ROOT system ---
 class TFile;
 #include <TFolder.h> 
-#include <TTree.h>
-#include <TVirtualMC.h> 
+#include <TGeoGlobalMagField.h>
+#include <TGraph.h> 
 #include <TH1F.h> 
-#include <TF1.h> 
 #include <TRandom.h> 
-#include <TGraph.h> 
+#include <TTree.h>
+#include <TVirtualMC.h> 
 
 // --- Standard library ---
 
 // --- AliRoot header files ---
 #include "AliMagF.h"
+#include "AliLog.h"
 #include "AliEMCAL.h"
 #include "AliRun.h"
+#include "AliRunLoader.h"
+#include "AliCDBManager.h"
 #include "AliEMCALLoader.h"
 #include "AliEMCALSDigitizer.h"
 #include "AliEMCALDigitizer.h"
 #include "AliEMCALDigit.h"
-#include "AliAltroBuffer.h"
+#include "AliEMCALRawUtils.h"
+#include "AliCDBManager.h"
+#include "AliCDBEntry.h"
+#include "AliEMCALRawUtils.h"
 #include "AliRawReader.h"
-#include "AliEMCALRawStream.h"
-#include "AliDAQ.h"
+#include "AliEMCALTriggerData.h"
+#include "AliEMCALRecParam.h"
+#include "AliRawEventHeaderBase.h"
 
 ClassImp(AliEMCAL)
-Double_t AliEMCAL::fgCapa        = 1.;        // 1pF 
-Int_t    AliEMCAL::fgOrder       = 2 ;
-Double_t AliEMCAL::fgTimeMax     = 2.56E-5 ;  // each sample is over 100 ns fTimeMax/fTimeBins
-Double_t AliEMCAL::fgTimePeak    = 4.1E-6 ;   // 4 micro seconds
-Double_t AliEMCAL::fgTimeTrigger = 100E-9 ;      // 100ns, just for a reference
-// some digitization constants
-Int_t    AliEMCAL::fgThreshold = 1;
-// 24*48=1152 towers per SM; divided up on 3 DDLs, 
-// each DDL with 12FEC *32towers or 12*32*2 channels (high&low gain) 
-Int_t    AliEMCAL::fgChannelsPerDDL = 768; // 2*(1152/3 or 12*32) 
+
+//for embedding
+AliEMCALRawUtils*        AliEMCAL::fgRawUtils   = 0;   // EMCAL raw utilities class
+
 //____________________________________________________________________________
-AliEMCAL::AliEMCAL():AliDetector()
+AliEMCAL::AliEMCAL()
+  : AliDetector(),
+    fBirkC0(0),
+    fBirkC1(0.),
+    fBirkC2(0.),
+    fGeometry(0), 
+    fCheckRunNumberAndGeoVersion(kTRUE),
+    fTriggerData(0x0)
 {
   // Default ctor 
   fName = "EMCAL" ;
+  InitConstants();
+  
+  // Should call  AliEMCALGeometry::GetInstance(EMCAL->GetTitle(),"") for getting EMCAL geometry
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-AliEMCAL::AliEMCAL(const char* name, const char* title): AliDetector(name,title)
+AliEMCAL::AliEMCAL(const char* name, const char* title, 
+                   const Bool_t checkGeoAndRun)
+  : AliDetector(name,title),
+    fBirkC0(0),
+    fBirkC1(0.),
+    fBirkC2(0.),
+    fGeometry(0), 
+    fCheckRunNumberAndGeoVersion(checkGeoAndRun),
+    fTriggerData(0x0)
 {
   //   ctor : title is used to identify the layout
-
-  fHighCharge        = 8.2 ;          // adjusted for a high gain range of 5.12 GeV (10 bits)
-  fHighGain          = 6.64 ; 
-  fHighLowGainFactor = 16. ;          // adjusted for a low gain range of 82 GeV (10 bits) 
-  fLowGainOffset     = 1 ;            // offset added to the module id to distinguish high and low gain data
+  InitConstants();
+  
 }
 
 //____________________________________________________________________________
 AliEMCAL::~AliEMCAL()
 {
   //dtor
+  delete fgRawUtils;
+  delete fTriggerData;
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-void AliEMCAL::Copy(AliEMCAL & emcal) const
+void AliEMCAL::InitConstants()
 {
-  //copy
-
-  TObject::Copy(emcal) ; 
-  emcal.fHighCharge        = fHighCharge ;
-  emcal.fHighGain          = fHighGain ; 
-  emcal.fHighLowGainFactor = fHighLowGainFactor ;  
-  emcal.fLowGainOffset     = fLowGainOffset;   
+  //initialize EMCAL values
+  fBirkC0 = 1;
+  fBirkC1 = 0.013/1.032;
+  fBirkC2 = 9.6e-6/(1.032 * 1.032);
 }
 
+//Not needed, modify $ALICE_ROOT/data/galice.cuts instead.
+//Load the modified one in the configuration file with SetTransPar
+// //____________________________________________________________________________
+// void AliEMCAL::DefineMediumParameters()
+// {
+//   //
+//   // EMCAL cuts (Geant3) 
+//   // 
+//   Int_t * idtmed = fIdtmed->GetArray() - 1599 ; 
+// // --- Set decent energy thresholds for gamma and electron tracking
+
+//   // Tracking threshold for photons and electrons in Lead 
+//   Float_t cutgam=10.e-5; // 100 kev;
+//   Float_t cutele=10.e-5; // 100 kev;
+//   TString ntmp(GetTitle()); 
+//   ntmp.ToUpper();
+//   if(ntmp.Contains("10KEV")) {
+//     cutele = cutgam = 1.e-5;
+//   } else if(ntmp.Contains("50KEV")) {
+//     cutele = cutgam = 5.e-5;
+//   } else if(ntmp.Contains("100KEV")) {
+//     cutele = cutgam = 1.e-4;
+//   } else if(ntmp.Contains("200KEV")) {
+//     cutele = cutgam = 2.e-4;
+//   } else if(ntmp.Contains("500KEV")) {
+//     cutele = cutgam = 5.e-4;
+//   }
+
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1600],"CUTGAM", cutgam);
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1600],"CUTELE", cutele); // 1MEV -> 0.1MEV; 15-aug-05
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1600],"BCUTE",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1600],"BCUTM",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
+//   // --- Generate explicitly delta rays in Lead ---
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1600], "LOSS", 3) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1600], "DRAY", 1) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1600], "DCUTE", cutele) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1600], "DCUTM", cutele) ;
+
+// // --- in aluminium parts ---
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1602],"CUTGAM", cutgam) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1602],"CUTELE", cutele) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1602],"BCUTE",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1602],"BCUTM",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1602], "LOSS",3.) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1602], "DRAY",1.) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1602], "DCUTE", cutele) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1602], "DCUTM", cutele) ;
+
+// // --- and finally thresholds for photons and electrons in the scintillator ---
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1601],"CUTGAM", cutgam) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1601],"CUTELE", cutele) ;// 1MEV -> 0.1MEV; 15-aug-05
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1601],"BCUTE",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1601],"BCUTM",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1601], "LOSS",3) ; // generate delta rays 
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1601], "DRAY",1) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1601], "DCUTE", cutele) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1601], "DCUTM", cutele) ;
+
+//   // S steel - 
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1603],"CUTGAM", cutgam);
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1603],"CUTELE", cutele);
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1603],"BCUTE",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1603],"BCUTM",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
+//   // --- Generate explicitly delta rays 
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1603], "LOSS",3);
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1603], "DRAY",1);
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1603], "DCUTE", cutele) ;
+//   gMC->Gstpar(idtmed[1603], "DCUTM", cutele) ;
+
+//   AliEMCALGeometry* geom = GetGeometry();
+//   if(geom->GetILOSS()>=0) {
+//     for(int i=1600; i<=1603; i++) gMC->Gstpar(idtmed[i], "LOSS", geom->GetILOSS()) ; 
+//   } 
+//   if(geom->GetIHADR()>=0) {
+//     for(int i=1600; i<=1603; i++) gMC->Gstpar(idtmed[i], "HADR", geom->GetIHADR()) ; 
+//   }
+// }
+
 //____________________________________________________________________________
-AliDigitizer* AliEMCAL::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager) const
+AliDigitizer* AliEMCAL::CreateDigitizer(AliDigitizationInput* digInput) const
 {
   //create and return the digitizer
-  return new AliEMCALDigitizer(manager);
+  return new AliEMCALDigitizer(digInput);
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -110,7 +202,6 @@ void AliEMCAL::CreateMaterials()
 {
   // Definitions of materials to build EMCAL and associated tracking media.
   // media number in idtmed are 1599 to 1698.
-
   // --- Air ---               
   Float_t aAir[4]={12.0107,14.0067,15.9994,39.948};
   Float_t zAir[4]={6.,7.,8.,18.};
@@ -140,12 +231,24 @@ void AliEMCAL::CreateMaterials()
   Float_t wsteel[4] = { .715,.18,.1,.005 };
   AliMixture(4, "STAINLESS STEEL$", asteel, zsteel, 7.88, 4, wsteel);
 
+  // Oct 26,2010 : Multipurpose Copy Paper UNV-21200), weiht 75 g/m**2. 
+  // *Cellulose C6H10O5
+  //    Component C  A=12.01   Z=6.    W=6./21.
+  //    Component H  A=1.      Z=1.    W=10./21.
+  //    Component O  A=16.     Z=8.    W=5./21.
+  Float_t apaper[3] = { 12.01, 1.0, 16.0};
+  Float_t zpaper[3] = {  6.0,  1.0,  8.0};
+  Float_t wpaper[3] = {6./21., 10./21., 5./21.};
+  AliMixture(5, "BondPaper$", apaper, zpaper, 0.75, 3, wpaper);
   // DEFINITION OF THE TRACKING MEDIA
+  // Look to the $ALICE_ROOT/data/galice.cuts for particular values
+  // of cuts.
+  // Don't forget to add a new tracking medium with non-default cuts
 
   // for EMCAL: idtmed[1599->1698] equivalent to fIdtmed[0->100]
-  Int_t * idtmed = fIdtmed->GetArray() - 1599 ; 
-  Int_t   isxfld = gAlice->Field()->Integ() ;
-  Float_t sxmgmx = gAlice->Field()->Max() ;
+  Int_t   isxfld = ((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->Integ() ;
+  Float_t sxmgmx = ((AliMagF*)TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField())->Max() ;
 
   // Air                                                                         -> idtmed[1599]
  AliMedium(0, "Air$", 0, 0,
@@ -157,8 +260,9 @@ void AliEMCAL::CreateMaterials()
             isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.1, 0.1, 0, 0) ;
 
  // The scintillator of the CPV made of Polystyrene scintillator                   -> idtmed[1601]
+  float deemax = 0.1; // maximum fractional energy loss in one step (0 < DEEMAX < deemax )
   AliMedium(2, "Scintillator$", 2, 1,
-            isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.001, 0.1, 0.001, 0.001, 0, 0) ;
+            isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.001, deemax, 0.001, 0.001, 0, 0) ;
 
   // Various Aluminium parts made of Al                                            -> idtmed[1602]
   AliMedium(3, "Al$", 3, 0,
@@ -166,67 +270,13 @@ void AliEMCAL::CreateMaterials()
 
   // 25-aug-04 by PAI : see  PMD/AliPMDv0.cxx for STEEL definition                 -> idtmed[1603]
   AliMedium(4, "S steel$", 4, 0, 
-             isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.1, 0.1, 0.001, 0.001, 0, 0) ;
+             isxfld, sxmgmx, 10.0, 0.01, 0.1, 0.001, 0.001, 0, 0) ;
 
-// --- Set decent energy thresholds for gamma and electron tracking
-
-  // Tracking threshold for photons and electrons in Lead 
-  Float_t cutgam=10.e-5; // 100 kev;
-  Float_t cutele=10.e-5; // 100 kev;
-  TString ntmp(GetTitle()); 
-  ntmp.ToUpper();
-  if(ntmp.Contains("10KEV")) {
-    cutele = cutgam = 1.e-5;
-  } else if(ntmp.Contains("50KEV")) {
-    cutele = cutgam = 5.e-5;
-  } else if(ntmp.Contains("100KEV")) {
-    cutele = cutgam = 1.e-4;
-  } else if(ntmp.Contains("200KEV")) {
-    cutele = cutgam = 2.e-4;
-  } else if(ntmp.Contains("500KEV")) {
-    cutele = cutgam = 5.e-4;
-  }
+  // Oct 26,2010; Nov 24,2010                                                      -> idtmed[1604]
+  deemax = 0.01;
+  AliMedium(5, "Paper$", 5, 0, 
+             isxfld, sxmgmx, 10.0, deemax, 0.1, 0.001, 0.001, 0, 0) ;
 
-  gMC->Gstpar(idtmed[1600],"CUTGAM", cutgam);
-  gMC->Gstpar(idtmed[1600],"CUTELE", cutele); // 1MEV -> 0.1MEV; 15-aug-05
-  gMC->Gstpar(idtmed[1600],"BCUTE",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
-  gMC->Gstpar(idtmed[1600],"BCUTM",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
-  // --- Generate explicitly delta rays in Lead ---
-  gMC->Gstpar(idtmed[1600], "LOSS",3.) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1600], "DRAY",1.) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1600], "DCUTE", cutele) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1600], "DCUTM", cutele) ;
-
-// --- in aluminium parts ---
-  gMC->Gstpar(idtmed[1602],"CUTGAM", cutgam) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1602],"CUTELE", cutele) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1602],"BCUTE",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
-  gMC->Gstpar(idtmed[1602],"BCUTM",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
-  gMC->Gstpar(idtmed[1602], "LOSS",3.) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1602], "DRAY",1.) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1602], "DCUTE", cutele) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1602], "DCUTM", cutele) ;
-
-// --- and finally thresholds for photons and electrons in the scintillator ---
-  gMC->Gstpar(idtmed[1601],"CUTGAM", cutgam) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1601],"CUTELE", cutele) ;// 1MEV -> 0.1MEV; 15-aug-05
-  gMC->Gstpar(idtmed[1601],"BCUTE",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
-  gMC->Gstpar(idtmed[1601],"BCUTM",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
-  gMC->Gstpar(idtmed[1601], "LOSS",3.) ; // generate delta rays 
-  gMC->Gstpar(idtmed[1601], "DRAY",1.) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1601], "DCUTE", cutele) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1601], "DCUTM", cutele) ;
-
-  // S steel - 
-  gMC->Gstpar(idtmed[1603],"CUTGAM", cutgam);
-  gMC->Gstpar(idtmed[1603],"CUTELE", cutele);
-  gMC->Gstpar(idtmed[1603],"BCUTE",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
-  gMC->Gstpar(idtmed[1603],"BCUTM",  cutgam);  // BCUTE and BCUTM start from GUTGUM
-  // --- Generate explicitly delta rays 
-  gMC->Gstpar(idtmed[1603], "LOSS",3.);
-  gMC->Gstpar(idtmed[1603], "DRAY",1.);
-  gMC->Gstpar(idtmed[1603], "DCUTE", cutele) ;
-  gMC->Gstpar(idtmed[1603], "DCUTM", cutele) ;
 
   //set constants for Birk's Law implentation
   fBirkC0 =  1;
@@ -234,267 +284,139 @@ void AliEMCAL::CreateMaterials()
   fBirkC2 =  9.6e-6/(dP * dP);
 
 }
-      
-//____________________________________________________________________________
-void AliEMCAL::Digits2Raw()
-{
-  // convert digits of the current event to raw data
-  AliEMCALLoader * loader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(fLoader) ; 
-
-  // get the digits
-  loader->LoadDigits("EMCAL");
-  loader->GetEvent();
-  TClonesArray* digits = loader->Digits() ;
-
-  if (!digits) {
-    Error("Digits2Raw", "no digits found !");
-    return;
-  }
-
-  // get the digitizer 
-  loader->LoadDigitizer();
-  AliEMCALDigitizer * digitizer = dynamic_cast<AliEMCALDigitizer *>(loader->Digitizer())  ; 
-  
-
-  AliAltroBuffer* buffer = NULL;
-  Int_t prevDDL = -1;
-  Int_t adcValuesLow[fgkTimeBins];
-  Int_t adcValuesHigh[fgkTimeBins];
-  
-  // loop over digits (assume ordered digits)
-  for (Int_t iDigit = 0; iDigit < digits->GetEntries(); iDigit++) {
-    AliEMCALDigit* digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(iDigit)) ;
-    if (digit->GetAmp() < fgThreshold) 
-      continue;
-    Int_t iDDL = digit->GetId() / fgChannelsPerDDL ;
-    // for each DDL id is numbered from 1 to  fgChannelsperDDL -1 
-    Int_t idDDL = digit->GetId() - iDDL * ( fgChannelsPerDDL - 1 ) ;  
-    // new DDL
-    if (iDDL != prevDDL) {
-      // write real header and close previous file
-      if (buffer) {
-       buffer->Flush();
-       buffer->WriteDataHeader(kFALSE, kFALSE);
-       delete buffer;
-      }
 
-      // open new file and write dummy header
-      TString fileName(AliDAQ::DdlFileName("EMCAL",iDDL));
-      buffer = new AliAltroBuffer(fileName.Data());
-      buffer->WriteDataHeader(kTRUE, kFALSE);  //Dummy;
+//____________________________________________________________________________
+void  AliEMCAL::Init()
+{ 
+  // Init
+  //Not needed, modify $ALICE_ROOT/data/galice.cuts instead.
+  //Load the modified one in the configuration file with SetTransPar
+  //DefineMediumParameters(); 
+}     
 
-      prevDDL = iDDL;
-    }
+//____________________________________________________________________________
+void AliEMCAL::Digits2Raw() {
 
-    // out of time range signal (?)
-    if (digit->GetTimeR() > GetRawFormatTimeMax() ) {
-      buffer->FillBuffer(digit->GetAmp());
-      buffer->FillBuffer(GetRawFormatTimeBins() );  // time bin
-      buffer->FillBuffer(3);          // bunch length
-      buffer->WriteTrailer(3, idDDL, 0, 0);  // trailer
-
-      // calculate the time response function
-    } else {
-      Double_t energy = 0 ;  
-      energy = digit->GetAmp() * digitizer->GetECAchannel() + digitizer->GetECApedestal() ; 
-      
-      Bool_t lowgain = RawSampledResponse(digit->GetTimeR(), energy, adcValuesHigh, adcValuesLow) ; 
-      
-      if (lowgain) 
-       buffer->WriteChannel(iDDL, 0, fLowGainOffset, 
-                            GetRawFormatTimeBins(), adcValuesLow, fgThreshold);
-      else 
-       buffer->WriteChannel(iDDL, 0, 0, 
-                            GetRawFormatTimeBins(), adcValuesHigh, fgThreshold);
-      
-    }
-  }
-  
-  // write real header and close last file
-  if (buffer) {
-    buffer->Flush();
-    buffer->WriteDataHeader(kFALSE, kFALSE);
-    delete buffer;
-  }
+  static AliEMCALRawUtils rawUtils;
+  rawUtils.Digits2Raw();
 
-  loader->UnloadDigits();
 }
-
 //____________________________________________________________________________
-void AliEMCAL::Raw2Digits(AliRawReader* reader)
-{
-  // convert raw data of the current event to digits
+void AliEMCAL::Hits2SDigits()  
+{ 
+// create summable digits
+
   GetGeometry();
-  AliEMCALLoader * loader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(fLoader) ; 
+  AliEMCALSDigitizer emcalDigitizer(fLoader->GetRunLoader()->GetFileName().Data()) ;
+  emcalDigitizer.SetEventRange(0, -1) ; // do all the events
+  emcalDigitizer.Digitize() ;
+}
 
-  // get the digits
-  loader->CleanDigits(); // start from scratch
-  loader->LoadDigits("EMCAL");
-  TClonesArray* digits = loader->Digits() ;
-  digits->Clear(); // yes, this is perhaps somewhat paranoid.. [clearing an extra time]
+//______________________________________________________________________
+Bool_t AliEMCAL::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader){
+  
+  // Conversion from raw data to EMCAL sdigits. 
+  // Does the same as AliEMCALReconstructor::ConvertDigits()
+  // Needed to embed real data and simulation
+  // Works on a single-event basis
+  
+  rawReader->Reset() ; 
+  
+  //Get/create the sdigits tree and array
+       AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
+       AliEMCALLoader *emcalLoader = dynamic_cast<AliEMCALLoader*>(rl->GetDetectorLoader("EMCAL")); 
+  
+  if(!emcalLoader){
+    AliFatal("NULL loader");
+    return kFALSE;
+  }
+  
+  emcalLoader->GetEvent();
+  emcalLoader->LoadSDigits("UPDATE");
 
-  if (!digits) {
-    Error("Raw2Digits", "no digits found !");
-    return;
+  TTree * treeS = emcalLoader->TreeS();
+  if ( !treeS ) { 
+    emcalLoader->MakeSDigitsContainer();
+    treeS = emcalLoader->TreeS();
   }
-  if (!reader) {
-    Error("Raw2Digits", "no raw reader found !");
-    return;
+  
+  if(!emcalLoader->SDigits()) {
+    AliFatal("No sdigits array available\n");
+    return kFALSE;
   }
-
-  // and get the digitizer too 
-  loader->LoadDigitizer();
-  AliEMCALDigitizer * digitizer = dynamic_cast<AliEMCALDigitizer *>(loader->Digitizer())  ; 
-
-  // Use AliAltroRawStream to read the ALTRO format.  No need to
-  // reinvent the wheel :-) 
-  AliEMCALRawStream in(reader);
-  // Select EMCAL DDL's;
-  reader->Select("EMCAL");
-
-  // reading is from previously existing AliEMCALGetter.cxx
-  // ReadRaw method
-  Bool_t first = kTRUE ;
-  TF1 * signalF = new TF1("signal", RawResponseFunction, 0, GetRawFormatTimeMax(), 4);
-  signalF->SetParNames("Charge", "Gain", "Amplitude", "TimeZero"); 
   
-  Int_t id = -1;
-  Bool_t lowGainFlag = kFALSE ; 
-
-  Int_t idigit = 0 ; 
-  Int_t amp = 0 ; 
-  Double_t time = 0. ; 
-  Double_t energy = 0. ; 
-
-  TGraph * gLowGain = new TGraph(GetRawFormatTimeBins()) ; 
-  TGraph * gHighGain= new TGraph(GetRawFormatTimeBins()) ;  
-
-  while ( in.Next() ) { // EMCAL entries loop 
-    if ( in.IsNewId() ) {
-      if (!first) {
-       FitRaw(lowGainFlag, gLowGain, gHighGain, signalF, energy, time) ; 
-
-       if (time == 0. && energy == 0.) { 
-         amp = 0 ; 
-       }
-       else {
-         amp = static_cast<Int_t>( (energy - digitizer->GetECApedestal()) / digitizer->GetECAchannel() + 0.5 ) ; 
-       }
-
-       if (amp > 0) {
-         new((*digits)[idigit]) AliEMCALDigit( -1, -1, id, amp, time) ;        
-         idigit++ ; 
-       }
-       Int_t index ; 
-       for (index = 0; index < GetRawFormatTimeBins(); index++) {
-         gLowGain->SetPoint(index, index * GetRawFormatTimeMax() / GetRawFormatTimeBins(), 0) ;  
-         gHighGain->SetPoint(index, index * GetRawFormatTimeMax() / GetRawFormatTimeBins(), 0) ; 
-       } 
-      } // not first  
-      first = kFALSE ; 
-      id = in.GetId() ; 
-      if (in.GetModule() == GetRawFormatLowGainOffset() ) {
-       lowGainFlag = kTRUE ; 
-      }
-      else { 
-       lowGainFlag = kFALSE ; 
-      }
-    } // new Id?
-    if (lowGainFlag) {
-      gLowGain->SetPoint(in.GetTime(), 
-                        in.GetTime()* GetRawFormatTimeMax() / GetRawFormatTimeBins(), 
-                        in.GetSignal()) ;
-    }
-    else { 
-      gHighGain->SetPoint(in.GetTime(), 
-                         in.GetTime() * GetRawFormatTimeMax() / GetRawFormatTimeBins(), 
-                         in.GetSignal() ) ;
-    }
-  } // EMCAL entries loop
-  digits->Sort() ; 
+  TClonesArray * sdigits = emcalLoader->SDigits();
+  sdigits->Clear("C");  
+  
+  //Trigger sdigits
+  if(!fTriggerData)fTriggerData = new AliEMCALTriggerData();
+  fTriggerData->SetMode(1);    
+  TClonesArray *digitsTrg = new TClonesArray("AliEMCALTriggerRawDigit", 32 * 96);    
+  Int_t bufsize = 32000;
+  treeS->Branch("EMTRG", &digitsTrg, bufsize);
+  
+  
+  //Only physics events
+  if (rawReader->GetType()== AliRawEventHeaderBase::kPhysicsEvent) {
 
-  delete signalF ; 
-  delete gLowGain;
-  delete gHighGain ; 
+    if(!fgRawUtils)  fgRawUtils   = new AliEMCALRawUtils;
+    //must be done here because, in constructor, option is not yet known
+    fgRawUtils->SetOption(GetOption());
     
-  return ; 
-}
-
-//____________________________________________________________________________ 
-void AliEMCAL::FitRaw(Bool_t lowGainFlag, TGraph * gLowGain, TGraph * gHighGain, TF1* signalF, Double_t & energy, Double_t & time)
-{
-  // Fits the raw signal time distribution; from AliEMCALGetter 
-
-  const Int_t kNoiseThreshold = 0 ;
-  Double_t timezero1 = 0., timezero2 = 0., timemax = 0. ;
-  Double_t signal = 0., signalmax = 0. ;       
-  energy = time = 0. ; 
-
-  if (lowGainFlag) {
-    timezero1 = timezero2 = signalmax = timemax = 0. ;
-    signalF->FixParameter(0, GetRawFormatLowCharge()) ; 
-    signalF->FixParameter(1, GetRawFormatLowGain()) ; 
-    Int_t index ; 
-    for (index = 0; index < GetRawFormatTimeBins(); index++) {
-      gLowGain->GetPoint(index, time, signal) ; 
-      if (signal > kNoiseThreshold && timezero1 == 0.) 
-       timezero1 = time ;
-      if (signal <= kNoiseThreshold && timezero1 > 0. && timezero2 == 0.)
-       timezero2 = time ; 
-      if (signal > signalmax) {
-       signalmax = signal ; 
-       timemax   = time ; 
-      }
-    }
-    signalmax /= RawResponseFunctionMax(GetRawFormatLowCharge(), 
-                                               GetRawFormatLowGain()) ;
-    if ( timezero1 + GetRawFormatTimePeak() < GetRawFormatTimeMax() * 0.4 ) { // else its noise 
-      signalF->SetParameter(2, signalmax) ; 
-      signalF->SetParameter(3, timezero1) ;                
-      gLowGain->Fit(signalF, "QRON", "", 0., timezero2); //, "QRON") ; 
-      energy = signalF->GetParameter(2) ; 
-      time   = signalF->GetMaximumX() - GetRawFormatTimePeak() - GetRawFormatTimeTrigger() ;
-    }
-  } else {
-    timezero1 = timezero2 = signalmax = timemax = 0. ;
-    signalF->FixParameter(0, GetRawFormatHighCharge()) ; 
-    signalF->FixParameter(1, GetRawFormatHighGain()) ; 
-    Int_t index ; 
-    for (index = 0; index < GetRawFormatTimeBins(); index++) {
-      gHighGain->GetPoint(index, time, signal) ;               
-      if (signal > kNoiseThreshold && timezero1 == 0.) 
-       timezero1 = time ;
-      if (signal <= kNoiseThreshold && timezero1 > 0. && timezero2 == 0.)
-       timezero2 = time ; 
-      if (signal > signalmax) {
-       signalmax = signal ;   
-       timemax   = time ; 
-      }
+    // Set parameters from OCDB to raw utils
+    AliEMCALRecParam* recpar = emcalLoader->ReconstructionParameters(0);
+    // fgRawUtils->SetRawFormatHighLowGainFactor(recpar->GetHighLowGainFactor());
+    // fgRawUtils->SetRawFormatOrder(recpar->GetOrderParameter());
+    // fgRawUtils->SetRawFormatTau(recpar->GetTau());
+    fgRawUtils->SetNoiseThreshold(recpar->GetNoiseThreshold());
+    fgRawUtils->SetNPedSamples(recpar->GetNPedSamples());
+    fgRawUtils->SetRemoveBadChannels(recpar->GetRemoveBadChannels());
+    fgRawUtils->SetFittingAlgorithm(recpar->GetFittingAlgorithm());
+    fgRawUtils->SetFALTROUsage(recpar->UseFALTRO());
+    // fgRawUtils->SetTimeMin(recpar->GetTimeMin());
+    // fgRawUtils->SetTimeMax(recpar->GetTimeMax());
+
+    //Fit
+    fgRawUtils->Raw2Digits(rawReader,sdigits,emcalLoader->PedestalData(),digitsTrg,fTriggerData);
+    
+  }//skip calibration event
+  else{
+    AliDebug(1," Calibration Event, skip!");
+  }
+  
+  //Final arrangements of the array, set all sdigits as embedded
+  sdigits->Sort() ;
+  for (Int_t iSDigit = 0 ; iSDigit < sdigits->GetEntriesFast() ; iSDigit++) { 
+    AliEMCALDigit * sdigit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(sdigits->At(iSDigit)) ;
+    if(sdigit){
+      sdigit->SetIndexInList(iSDigit) ;
+      sdigit->SetType(AliEMCALDigit::kEmbedded);
     }
-    signalmax /= RawResponseFunctionMax(GetRawFormatHighCharge(), 
-                                               GetRawFormatHighGain()) ;;
-    if ( timezero1 + GetRawFormatTimePeak() < GetRawFormatTimeMax() * 0.4 ) { // else its noise  
-      signalF->SetParameter(2, signalmax) ; 
-      signalF->SetParameter(3, timezero1) ;               
-      gHighGain->Fit(signalF, "QRON", "", 0., timezero2) ; 
-      energy = signalF->GetParameter(2) ; 
-      time   = signalF->GetMaximumX() - GetRawFormatTimePeak() - GetRawFormatTimeTrigger() ;
+    else {
+      AliFatal("sdigit is NULL!");
     }
-  }
+  }    
   
-  return;
-}
-
-//____________________________________________________________________________
-void AliEMCAL::Hits2SDigits()  
-{ 
-// create summable digits
+  AliDebug(1,Form("Embedded sdigits entries %d \n",sdigits->GetEntriesFast()));
+  
+  //Write array, clean arrays, unload ..
+  
+  Int_t bufferSize = 32000 ;    
+  TBranch * sdigitsBranch = treeS->GetBranch("EMCAL");
+  if (sdigitsBranch)
+    sdigitsBranch->SetAddress(&sdigits);
+  else
+    treeS->Branch("EMCAL",&sdigits,bufferSize);
+  
+  treeS->Fill();
+  emcalLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
+  emcalLoader->UnloadSDigits();
 
-  GetGeometry();
-  AliEMCALSDigitizer emcalDigitizer(fLoader->GetRunLoader()->GetFileName().Data()) ;
-  emcalDigitizer.SetEventRange(0, -1) ; // do all the events
-  emcalDigitizer.ExecuteTask() ;
+  digitsTrg->Delete();
+  delete digitsTrg;
+    
+  return kTRUE;
+  
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -507,70 +429,90 @@ AliLoader* AliEMCAL::MakeLoader(const char* topfoldername)
  return fLoader;
 }
 
-//__________________________________________________________________
-Double_t AliEMCAL::RawResponseFunction(Double_t *x, Double_t *par)
+//____________________________________________________________________________
+
+AliEMCALGeometry* AliEMCAL::GetGeometry() const
 {
-  // Shape of the electronics raw reponse:
-  // It is a semi-gaussian, 2nd order Gamma function of the general form
-  // v(t) = n**n * Q * A**n / C *(t/tp)**n * exp(-n * t/tp) with 
-  // tp : peaking time par[0]
-  // n  : order of the function
-  // C  : integrating capacitor in the preamplifier
-  // A  : open loop gain of the preamplifier
-  // Q  : the total APD charge to be measured Q = C * energy
-  
-  Double_t signal ;
-  Double_t xx = x[0] - ( fgTimeTrigger + par[3] ) ; 
+  //Initializes and returns geometry
   
-  if (xx < 0 || xx > fgTimeMax) 
-    signal = 0. ;  
-  else { 
-    Double_t fac = par[0] * TMath::Power(fgOrder, fgOrder) * TMath::Power(par[1], fgOrder) / fgCapa ; 
-    signal = fac * par[2] * TMath::Power(xx / fgTimePeak, fgOrder) * TMath::Exp(-fgOrder * (xx / fgTimePeak)) ; 
+  // Pass the transpor model name (Geant3, Geant4, Fluka) and title to the geometry
+  TString mcname   = "";
+  TString mctitle  = "";
+  if(gMC){
+    mcname  = gMC->GetName()  ;
+    mctitle = gMC->GetTitle() ;
   }
-  return signal ;  
-}
-
-//__________________________________________________________________
-Double_t AliEMCAL::RawResponseFunctionMax(Double_t charge, Double_t gain) 
-{
-  //compute the maximum of the raw response function and return
-  return ( charge * TMath::Power(fgOrder, fgOrder) * TMath::Power(gain, fgOrder) 
-     / ( fgCapa * TMath::Exp(fgOrder) ) );  
-
-}
-//__________________________________________________________________
-Bool_t AliEMCAL::RawSampledResponse(
-const Double_t dtime, const Double_t damp, Int_t * adcH, Int_t * adcL) const 
-{
-  // for a start time dtime and an amplitude damp given by digit, 
-  // calculates the raw sampled response AliEMCAL::RawResponseFunction
-
-  const Int_t kRawSignalOverflow = 0x3FF ; 
-  Bool_t lowGain = kFALSE ; 
-
-  TF1 signalF("signal", RawResponseFunction, 0, GetRawFormatTimeMax(), 4);
-
-  for (Int_t iTime = 0; iTime < GetRawFormatTimeBins(); iTime++) {
-    signalF.SetParameter(0, GetRawFormatHighCharge() ) ; 
-    signalF.SetParameter(1, GetRawFormatHighGain() ) ; 
-    signalF.SetParameter(2, damp) ; 
-    signalF.SetParameter(3, dtime) ; 
-    Double_t time = iTime * GetRawFormatTimeMax() / GetRawFormatTimeBins() ;
-    Double_t signal = signalF.Eval(time) ;     
-    if ( static_cast<Int_t>(signal+0.5) > kRawSignalOverflow ){  // larger than 10 bits 
-      signal = kRawSignalOverflow ;
-      lowGain = kTRUE ; 
+  
+  //Check if run number and requested geometry correspond to the same geometry as
+  //in real data taking. To prevent errors in official simulation productions
+  if(!(AliEMCALGeometry::GetInstance()))
+  {
+    // Check the transport model name and option, set sampling fraction depending on it
+    if(!fCheckRunNumberAndGeoVersion){// Set geometry with the name used in the configuration file
+      return AliEMCALGeometry::GetInstance(GetTitle(),"EMCAL",mcname,mctitle) ;
     }
-    adcH[iTime] =  static_cast<Int_t>(signal + 0.5) ;
-
-    signalF.SetParameter(0, GetRawFormatLowCharge() ) ;     
-    signalF.SetParameter(1, GetRawFormatLowGain() ) ; 
-    signal = signalF.Eval(time) ;  
-    if ( static_cast<Int_t>(signal+0.5) > kRawSignalOverflow)  // larger than 10 bits 
-      signal = kRawSignalOverflow ;
-    adcL[iTime] = static_cast<Int_t>(0.5 + signal ) ; 
-
-  }
-  return lowGain ; 
+    else
+    {//Check run number and version and set the corresponding one.
+      //Get run number
+      //AliRunLoader *rl = AliRunLoader::Instance();
+      //Int_t runNumber = rl->GetRunNumber();
+      
+      AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
+      Int_t runNumber = man->GetRun();
+      
+      //Instanciate geometry depending on the run number
+      TString geoName(GetTitle());
+      if(runNumber >= 104064 && runNumber < 140000 ){//2009-2010 runs
+        //First year geometry, 4 SM.
+        
+        if(!geoName.Contains("FIRSTYEARV1"))
+        { 
+          AliInfo(Form("*** ATTENTION *** \n \t Specified geometry name <<%s>> for run %d is not considered! \n \t In use <<EMCAL_FIRSTYEARV1>>, check run number and year \n ",
+                       geoName.Data(),runNumber)); 
+        }
+        else 
+        {
+          AliDebug(1,"Initialized geometry with name <<EMCAL_FIRSTYEARV1>>");
+        }
+
+        return AliEMCALGeometry::GetInstance("EMCAL_FIRSTYEARV1","EMCAL",mcname,mctitle) ;// Set geometry with the name used in the configuration file
+      }
+      else if(runNumber >= 140000 && runNumber <= 170593)
+      {
+        //Almost complete EMCAL geometry, 10 SM. Year 2011 configuration
+        
+        if(!geoName.Contains("COMPLETEV1"))
+        {
+          AliInfo(Form("*** ATTENTION *** \n \t Specified geometry name <<%s>>  for run %d is  not considered! \n \t In use <<EMCAL_COMPLETEV1>>, check run number and year \n ",
+                       geoName.Data(),runNumber));
+        }
+        else 
+        {
+          AliDebug(1,"Initialized geometry with name <<EMCAL_COMPLETEV1>>");
+        }
+        
+        return AliEMCALGeometry::GetInstance("EMCAL_COMPLETEV1","EMCAL",mcname,mctitle) ;// Set geometry with the name used in the configuration file
+      }
+      else{ 
+        //Default geometry
+        //Complete EMCAL geometry, 12 SM. Year 2012 and on
+        
+        if(!geoName.Contains("COMPLETE12SMV1"))
+        {
+          AliInfo(Form("*** ATTENTION *** \n \t Specified geometry name <<%s>>  for run %d is  not considered! \n \t In use <<EMCAL_COMPLETE12SMV1>>, check run number and year \n ",
+                       geoName.Data(),runNumber));
+        }
+        else 
+        {
+          AliDebug(1,"Initialized geometry with name <<EMCAL_COMPLETE12SMV1>>");
+        }
+                
+        return AliEMCALGeometry::GetInstance("EMCAL_COMPLETE12SMV1","EMCAL",mcname,mctitle) ;// Set geometry with the name used in the configuration file
+      }
+    }
+  }// Init geometry for the first time
+  
+  
+  return AliEMCALGeometry::GetInstance();
+    
 }