]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - EMCAL/AliEMCALGeometry.cxx
add some missing copy ctors and progress toward code convention compliance
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALGeometry.cxx
index 6f796f29328b60c62bf616932dda55e15147346d..1b05489b89fc262208f51bd738962981c6a825c7 100644 (file)
 // Geometry class  for EMCAL : singleton  
 // EMCAL consists of layers of scintillator and lead
 // Places the the Barrel Geometry of The EMCAL at Midrapidity
-// between 0 and 120 degrees of Phi and
+// between 80 and 180(or 190) degrees of Phi and
 // -0.7 to 0.7 in eta 
 // Number of Modules and Layers may be controlled by 
 // the name of the instance defined               
-// EMCALArch2x has more modules along both phi and eta
-// EMCALArchxa has less Layers in the Radial Direction
 //*-- Author: Sahal Yacoob (LBL / UCT)
 //     and  : Yves Schutz (SUBATECH)
 //     and  : Jennifer Klay (LBL)
-
-// --- ROOT system ---
-
-// --- Standard library ---
-#include <stdlib.h> 
+//     SHASHLYK : Aleksei Pavlinov (WSU)
+//     SuperModules -> module(or tower) -> cell
 
 // --- AliRoot header files ---
+#include <assert.h>
+#include "Riostream.h"
+
 #include <TMath.h>
+#include <TVector3.h>
+             //#include <TArrayD.h>
+#include <TObjArray.h>
+#include <TGeoManager.h>
+#include <TGeoNode.h>
+#include <TGeoMatrix.h>
+#include <TMatrixD.h>
+#include <TObjString.h>
+#include <TClonesArray.h>
 
 // -- ALICE Headers.
-#include "AliConst.h"
+//#include "AliConst.h"
+#include "AliLog.h"
 
 // --- EMCAL headers
 #include "AliEMCALGeometry.h"
+#include "AliEMCALShishKebabTrd1Module.h"
+#include "AliEMCALRecPoint.h"
+#include "AliEMCALDigit.h"
+#include "AliEMCALHistoUtilities.h"
+#include "AliEMCALAlignData.h"
+
+ClassImp(AliEMCALGeometry)
+
+// these initialisations are needed for a singleton
+AliEMCALGeometry  *AliEMCALGeometry::fgGeom      = 0;
+Bool_t             AliEMCALGeometry::fgInit      = kFALSE;
+AliEMCALAlignData *AliEMCALGeometry::fgAlignData = 0;
+
 
-ClassImp(AliEMCALGeometry);
 
-AliEMCALGeometry *AliEMCALGeometry::fgGeom = 0;
-Bool_t            AliEMCALGeometry::fgInit = kFALSE;
+AliEMCALGeometry::AliEMCALGeometry() : AliGeometry() 
+{ 
+  // default ctor only for internal usage (singleton)
+  // must be kept public for root persistency purposes, but should never be called by the outside world    
+  //  CreateListOfTrd1Modules();
+  AliDebug(2, "AliEMCALGeometry : default ctor ");
+}
+//______________________________________________________________________
+AliEMCALGeometry::AliEMCALGeometry(const Text_t* name, const Text_t* title) :
+AliGeometry(name, title) {// ctor only for internal usage (singleton)
+  AliDebug(2, Form("AliEMCALGeometry(%s,%s) ", name,title));
+  Init();
+  CreateListOfTrd1Modules();
+}
+//______________________________________________________________________
+AliEMCALGeometry::AliEMCALGeometry(const Text_t* name, const Text_t* title, AliEMCALAlignData* alignData) :
+  AliGeometry(name, title) {// Align data in action
+  fgAlignData = alignData;
+  Init();
+  CreateListOfTrd1Modules();
+};
+//______________________________________________________________________
+AliEMCALGeometry::AliEMCALGeometry(const AliEMCALGeometry& geom):AliGeometry(geom) {
+  //copy ctor
+  fGeoName = geom.fGeoName;
+
+  fArrayOpts = geom.fArrayOpts;
+
+  fAlFrontThick = geom.fAlFrontThick;
+  fECPbRadThickness = geom.fECPbRadThickness;
+  fECScintThick = geom.fECScintThick;
+  fNECLayers = geom.fNECLayers;
+  fArm1PhiMin = geom.fArm1PhiMin;
+  fArm1PhiMax = geom.fArm1PhiMax;
+  fArm1EtaMin = geom.fArm1EtaMin;
+  fArm1EtaMax = geom.fArm1EtaMax;
+
+  fIPDistance = geom.fIPDistance;
+  fShellThickness = geom.fShellThickness;
+  fZLength = geom.fZLength;
+  fGap2Active = geom.fGap2Active;
+  fNZ = geom.fNZ;
+  fNPhi = geom.fNPhi;
+  fSampling = geom.fSampling;
+
+  fNumberOfSuperModules = geom.fNumberOfSuperModules;
+  fSteelFrontThick = geom.fSteelFrontThick;
+  fFrontSteelStrip = geom.fFrontSteelStrip;
+  fLateralSteelStrip = geom.fLateralSteelStrip;
+  fPassiveScintThick = geom.fPassiveScintThick;
+  fPhiModuleSize = geom.fPhiModuleSize;
+  fEtaModuleSize = geom.fEtaModuleSize;
+  fPhiTileSize = geom.fPhiTileSize;
+  fEtaTileSize = geom.fEtaTileSize;
+  fLongModuleSize = geom.fLongModuleSize;
+  fNPhiSuperModule = geom.fNPhiSuperModule;
+  fNPHIdiv = geom.fNPHIdiv;
+  fNETAdiv = geom.fNETAdiv;
+
+  fNCells = geom.fNCells;
+  fNCellsInSupMod = geom.fNCellsInSupMod;
+  fNCellsInTower = geom.fNCellsInTower;
+  fNTRU = geom.fNTRU;
+  fNTRUEta = geom.fNTRUEta;
+  fNTRUPhi = geom.fNTRUPhi;
+  fTrd1Angle = geom.fTrd1Angle;
+  f2Trd1Dx2 = geom.f2Trd1Dx2;
+  fPhiGapForSM = geom.fPhiGapForSM;
+  fKey110DEG = geom.fKey110DEG;
+  fTrd2AngleY = geom.fTrd2AngleY;
+  f2Trd2Dy2 = geom.f2Trd2Dy2;
+  fEmptySpace = geom.fEmptySpace;
+  fTubsR = geom.fTubsR;
+  fTubsTurnAngle = geom.fTubsTurnAngle;
+  fEtaCentersOfCells = geom.fEtaCentersOfCells;
+  fXCentersOfCells = geom.fXCentersOfCells;
+  fPhiCentersOfCells = geom.fPhiCentersOfCells;
+
+  fShishKebabTrd1Modules = geom.fShishKebabTrd1Modules;
+
+  fNAdditionalOpts = geom.fNAdditionalOpts;
+}
 
 //______________________________________________________________________
 AliEMCALGeometry::~AliEMCALGeometry(void){
@@ -54,66 +154,427 @@ AliEMCALGeometry::~AliEMCALGeometry(void){
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliEMCALGeometry::Init(void){
-    // Initializes the EMCAL parameters
-
-    fgInit = kFALSE; // Assume failer untill proven otherwise.
-
-    TString name(GetName()) ; 
-                
-    if( name != "EMCALArch1a" &&
-       name != "EMCALArch1b" && 
-       name != "EMCALArch2a" && 
-       name != "EMCALArch2b"  ){
-      Fatal("Init", "%s is not a known geometry (choose among EMCALArch1a, EMCALArch1b, EMCALArch2a and EMCALArch2b)",  name.Data()) ;  
-    } // end if
-    //
-    if ( name == "EMCALArch1a"  ||
-        name == "EMCALArch1b" ) {
-      fNZ         = 96;
-      fNPhi       = 144;
-    } // end if
-    if ( name == "EMCALArch2a"  ||
-        name == "EMCALArch2b" ) {
-       fNZ         = 112;
-       fNPhi       = 168;
-    } // end if
-    if ( name == "EMCALArch1a"  ||
-        name == "EMCALArch2a" ) {
-      fNLayers    = 21;
-    } // end if
-    if ( name == "EMCALArch1b"  ||
-        name == "EMCALArch2b" ) {
-       fNLayers    = 25;
-    } // end if
-
-    // geometry
-    fAlFrontThick   = 3.18; // cm, Thickness of front Al layer
-    fGap2Active     = 1.0;  // cm, Gap between Al and 1st Scintillator
-    fPbRadThickness = 0.5; // cm, Thickness of the Pb radiators.
-    fPreShowerSintThick = 0.6; // cm, Thickness of the sintilator for the
-                               // preshower part of the calorimeter
-    fFullShowerSintThick = 0.5; // cm, Thickness of the sintilator for the
-                                // full shower part of the calorimeter
-    fArm1PhiMin     =  60.0; // degrees, Starting EMCAL Phi position
-    fArm1PhiMax     = 180.0; // degrees, Ending EMCAL Phi position
-    fArm1EtaMin     = -0.7; // pseudorapidity, Starting EMCAL Eta position
-    fArm1EtaMax     = +0.7; // pseudorapidity, Ending EMCAL Eta position
-    fIPDistance     = 454.0; // cm, Radial distance to inner surface of EMCAL
-    fShellThickness = fAlFrontThick + fGap2Active + 2.*(GetPreSintThick() + GetPbRadThick()) + 
-       (fNLayers-3)*(GetFullSintThick()+ GetPbRadThick()) + GetFullSintThick() ;
-    //below; cm, Z length of the EMCAL.
-    fZLength        = 2.*ZFromEtaR(fIPDistance+fShellThickness,fArm1EtaMax);
-    fEnvelop[0]     = fIPDistance; // mother volume inner radius
-    fEnvelop[1]     = fIPDistance + fShellThickness; // mother volume outer r.
-    fEnvelop[2]     = 1.00001*fZLength; // add some padding for mother volume. 
-    fgInit = kTRUE; 
+  // Initializes the EMCAL parameters
+  // naming convention : GUV_WX_N_ gives the composition of a tower
+  // WX inform about the composition of the EM calorimeter section: 
+  //   thickness in mm of Pb radiator (W) and of scintillator (X), and number of scintillator layers (N)
+  // New geometry: EMCAL_55_25
+  // 24-aug-04 for shish-kebab
+  // SHISH_25 or SHISH_62
+  // 11-oct-05   - correction for pre final design
+  // Feb 06,2006 - decrease the weight of EMCAL
+
+  fAdditionalOpts[0] = "nl=";    // number of sampling layers (fNECLayers)
+  fAdditionalOpts[1] = "pbTh=";  // cm, Thickness of the Pb   (fECPbRadThick)
+  fAdditionalOpts[2] = "scTh=";  // cm, Thickness of the Sc    (fECScintThick)
+  fAdditionalOpts[3] = "latSS=";  // cm, Thickness of lateral steel strip (fLateralSteelStrip)
+
+  fNAdditionalOpts = sizeof(fAdditionalOpts) / sizeof(char*);
+
+  fgInit = kFALSE; // Assume failed until proven otherwise.
+  fGeoName   = GetName();
+  fGeoName.ToUpper();
+  fKey110DEG = 0;
+  if(fGeoName.Contains("110DEG")) fKey110DEG = 1; // for GetAbsCellId
+  fShishKebabTrd1Modules = 0;
+  fTrd2AngleY = f2Trd2Dy2 = fEmptySpace = fTubsR = fTubsTurnAngle = 0;
+
+  fNZ             = 114;       // granularity along Z (eta) 
+  fNPhi           = 168;       // granularity in phi (azimuth)
+  fArm1PhiMin     = 60.0;      // degrees, Starting EMCAL Phi position
+  fArm1PhiMax     = 180.0;     // degrees, Ending EMCAL Phi position
+  fArm1EtaMin     = -0.7;      // pseudorapidity, Starting EMCAL Eta position
+  fArm1EtaMax     = +0.7;      // pseudorapidity, Ending EMCAL Eta position
+  fIPDistance     = 454.0;      // cm, Radial distance to inner surface of EMCAL
+  fPhiGapForSM    = 0.;         // cm, only for final TRD1 geometry
+  for(int i=0; i<12; i++) fMatrixOfSM[i] = 0;
+
+  // geometry
+  if(fGeoName.Contains("SHISH")){ // Only shahslyk now
+    // 7-sep-05; integration issue
+    fArm1PhiMin     = 80.0;    // 60  -> 80
+    fArm1PhiMax     = 180.0;   // 180 -> 190
+
+    fNumberOfSuperModules = 10; // 12 = 6 * 2 (6 in phi, 2 in Z);
+    fSteelFrontThick = 2.54;    //  9-sep-04
+    fIPDistance      = 460.0;
+    fFrontSteelStrip = fPassiveScintThick = 0.0; // 13-may-05
+    fLateralSteelStrip = 0.025; // before MAY 2005 
+    fPhiModuleSize   = fEtaModuleSize   = 11.4;
+    fPhiTileSize = fEtaTileSize      = 5.52; // (11.4-5.52*2)/2. = 0.18 cm (wall thickness)
+    fNPhi            = 14;
+    fNZ              = 30;
+    fAlFrontThick    = fGap2Active = 0;
+    fNPHIdiv = fNETAdiv = 2;
+
+    fNECLayers       = 62;
+    fECScintThick    = fECPbRadThickness = 0.2;
+    fSampling        = 1.;  // 30-aug-04 - should be calculated
+    if(fGeoName.Contains("TWIST")) { // all about EMCAL module
+      fNZ             = 27;  // 16-sep-04
+    } else if(fGeoName.Contains("TRD")) {
+      fIPDistance      = 428.0;  //  11-may-05
+      fSteelFrontThick = 0.0;    // 3.17 -> 0.0; 28-mar-05 : no stell plate
+      fNPhi            = 12;
+      fSampling       = 12.327;
+      fPhiModuleSize = fEtaModuleSize = 12.26;
+      fNZ            = 26;     // 11-oct-04
+      fTrd1Angle     = 1.3;    // in degree
+// 18-nov-04; 1./0.08112=12.327
+// http://pdsfweb01.nersc.gov/~pavlinov/ALICE/SHISHKEBAB/RES/linearityAndResolutionForTRD1.html
+      if(fGeoName.Contains("TRD1")) {       // 30-jan-05
+       // for final design
+        fPhiGapForSM    = 2.;         // cm, only for final TRD1 geometry
+        if(fGeoName.Contains("MAY05") || fGeoName.Contains("WSUC") || fGeoName.Contains("FINAL")){
+          fNumberOfSuperModules = 12; // 20-may-05
+          if(fGeoName.Contains("WSUC")) fNumberOfSuperModules = 1; // 27-may-05
+          fNECLayers     = 77;       // (13-may-05 from V.Petrov)
+          fPhiModuleSize = 12.5;     // 20-may-05 - rectangular shape
+          fEtaModuleSize = 11.9;
+          fECScintThick  = fECPbRadThickness = 0.16;// (13-may-05 from V.Petrov)
+          fFrontSteelStrip   = 0.025;// 0.025cm = 0.25mm  (13-may-05 from V.Petrov)
+          fLateralSteelStrip = 0.01; // 0.01cm  = 0.1mm   (13-may-05 from V.Petrov) - was 0.025
+          fPassiveScintThick = 0.8;  // 0.8cm   = 8mm     (13-may-05 from V.Petrov)
+          fNZ                = 24;
+          fTrd1Angle         = 1.5;  // 1.3 or 1.5
+
+          if(fGeoName.Contains("FINAL")) { // 9-sep-05
+            fNumberOfSuperModules = 10;
+            if(fGeoName.Contains("110DEG")) {
+              fNumberOfSuperModules = 12;// last two modules have size 10 degree in phi (180<phi<190)
+              fArm1PhiMax = 200.0; // for XEN1 and turn angle of super modules
+           }
+            fPhiModuleSize = 12.26 - fPhiGapForSM / Float_t(fNPhi); // first assumption
+            fEtaModuleSize = fPhiModuleSize;
+            if(fGeoName.Contains("HUGE")) fNECLayers *= 3; // 28-oct-05 for analysing leakage    
+          }
+       }
+      } else if(fGeoName.Contains("TRD2")) {       // 30-jan-05
+        fSteelFrontThick = 0.0;         // 11-mar-05
+        fIPDistance+= fSteelFrontThick; // 1-feb-05 - compensate absence of steel plate
+        fTrd1Angle  = 1.64;             // 1.3->1.64
+        fTrd2AngleY = fTrd1Angle;       //  symmetric case now
+        fEmptySpace    = 0.2; // 2 mm
+        fTubsR         = fIPDistance; // 31-jan-05 - as for Fred case
+
+        fPhiModuleSize  = fTubsR*2.*TMath::Tan(fTrd2AngleY*TMath::DegToRad()/2.);
+        fPhiModuleSize -= fEmptySpace/2.; // 11-mar-05  
+        fEtaModuleSize  = fPhiModuleSize; // 20-may-05 
+        fTubsTurnAngle  = 3.;
+      }
+      fNPHIdiv = fNETAdiv  = 2;   // 13-oct-04 - division again
+      if(fGeoName.Contains("3X3")) {   // 23-nov-04
+        fNPHIdiv = fNETAdiv  = 3;
+      } else if(fGeoName.Contains("4X4")) {
+        fNPHIdiv = fNETAdiv  = 4;
+      }
+    }
+    if(fGeoName.Contains("25")){
+      fNECLayers     = 25;
+      fECScintThick  = fECPbRadThickness = 0.5;
+    }
+    if(fGeoName.Contains("WSUC")){ // 18-may-05 - about common structure
+      fShellThickness = 30.; // should be change 
+      fNPhi = fNZ = 4; 
+    }
+
+    CheckAdditionalOptions();
+    DefineSamplingFraction();
+
+    fPhiTileSize = fPhiModuleSize/2. - fLateralSteelStrip; // 13-may-05 
+    fEtaTileSize = fEtaModuleSize/2. - fLateralSteelStrip; // 13-may-05 
+
+    // constant for transition absid <--> indexes
+    fNCellsInTower  = fNPHIdiv*fNETAdiv;
+    fNCellsInSupMod = fNCellsInTower*fNPhi*fNZ;
+    fNCells         = fNCellsInSupMod*fNumberOfSuperModules;
+    if(fGeoName.Contains("110DEG")) fNCells -= fNCellsInSupMod;
+
+    fLongModuleSize = fNECLayers*(fECScintThick + fECPbRadThickness);
+    if(fGeoName.Contains("MAY05")) fLongModuleSize += (fFrontSteelStrip + fPassiveScintThick);
+
+    // 30-sep-04
+    if(fGeoName.Contains("TRD")) {
+      f2Trd1Dx2 = fEtaModuleSize + 2.*fLongModuleSize*TMath::Tan(fTrd1Angle*TMath::DegToRad()/2.);
+      if(fGeoName.Contains("TRD2")) {  // 27-jan-05
+        f2Trd2Dy2 = fPhiModuleSize + 2.*fLongModuleSize*TMath::Tan(fTrd2AngleY*TMath::DegToRad()/2.);
+      }
+    }
+  } else Fatal("Init", "%s is an undefined geometry!", fGeoName.Data()) ; 
+
+  fNPhiSuperModule = fNumberOfSuperModules/2;
+  if(fNPhiSuperModule<1) fNPhiSuperModule = 1;
+  //There is always one more scintillator than radiator layer because of the first block of aluminium
+  fShellThickness = fAlFrontThick + fGap2Active + fNECLayers*GetECScintThick()+(fNECLayers-1)*GetECPbRadThick();
+  if(fGeoName.Contains("SHISH")) {
+    fShellThickness = fSteelFrontThick + fLongModuleSize;
+    if(fGeoName.Contains("TWIST")) { // 13-sep-04
+      fShellThickness  = TMath::Sqrt(fLongModuleSize*fLongModuleSize + fPhiModuleSize*fEtaModuleSize);
+      fShellThickness += fSteelFrontThick;
+    } else if(fGeoName.Contains("TRD")) { // 1-oct-04
+      fShellThickness  = TMath::Sqrt(fLongModuleSize*fLongModuleSize + f2Trd1Dx2*f2Trd1Dx2);
+      fShellThickness += fSteelFrontThick;
+      // Local coordinates
+      fParSM[0] = GetShellThickness()/2.;        
+      fParSM[1] = GetPhiModuleSize() * GetNPhi()/2.;
+      fParSM[2] = 350./2.;
+    }
+  }
+
+  fZLength        = 2.*ZFromEtaR(fIPDistance+fShellThickness,fArm1EtaMax); // Z coverage
+  fEnvelop[0]     = fIPDistance; // mother volume inner radius
+  fEnvelop[1]     = fIPDistance + fShellThickness; // mother volume outer r.
+  fEnvelop[2]     = 1.00001*fZLength; // add some padding for mother volume. 
+  
+  if(fgAlignData != NULL) {
+    // Number of modules is read from Alignment DB if exists
+    fNumberOfSuperModules = fgAlignData->GetNSuperModules();
+  }
+  fgInit = kTRUE; 
+  
+  if (AliDebugLevel()>=2) {
+    printf("Init: geometry of EMCAL named %s is as follows:\n", fGeoName.Data());
+    printf( "               ECAL      : %d x (%f cm Pb, %f cm Sc) \n", 
+    GetNECLayers(), GetECPbRadThick(), GetECScintThick() ) ; 
+    printf("                fSampling %5.2f \n",  fSampling );
+    if(fGeoName.Contains("SHISH")){
+      printf(" fIPDistance       %6.3f cm \n", fIPDistance);
+      if(fSteelFrontThick>0.) 
+      printf(" fSteelFrontThick  %6.3f cm \n", fSteelFrontThick);
+      printf(" fNPhi %i   |  fNZ %i \n", fNPhi, fNZ);
+      printf(" fNCellsInTower %i : fNCellsInSupMod %i : fNCells %i\n",fNCellsInTower, fNCellsInSupMod, fNCells);
+      if(fGeoName.Contains("MAY05")){
+       printf(" fFrontSteelStrip         %6.4f cm (thickness of front steel strip)\n", 
+        fFrontSteelStrip);
+       printf(" fLateralSteelStrip       %6.4f cm (thickness of lateral steel strip)\n", 
+        fLateralSteelStrip);
+       printf(" fPassiveScintThick  %6.4f cm (thickness of front passive Sc tile)\n",
+        fPassiveScintThick);
+      }
+      printf(" X:Y module size     %6.3f , %6.3f cm \n", fPhiModuleSize, fEtaModuleSize);
+      printf(" X:Y   tile size     %6.3f , %6.3f cm \n", fPhiTileSize, fEtaTileSize);
+      printf(" #of sampling layers %i(fNECLayers) \n", fNECLayers);
+      printf(" fLongModuleSize     %6.3f cm \n", fLongModuleSize);
+      printf(" #supermodule in phi direction %i \n", fNPhiSuperModule );
+    }
+    if(fGeoName.Contains("TRD")) {
+      printf(" fTrd1Angle %7.4f\n", fTrd1Angle);
+      printf(" f2Trd1Dx2  %7.4f\n",  f2Trd1Dx2);
+      if(fGeoName.Contains("TRD2")) {
+        printf(" fTrd2AngleY     %7.4f\n", fTrd2AngleY);
+        printf(" f2Trd2Dy2       %7.4f\n", f2Trd2Dy2);
+        printf(" fTubsR          %7.2f cm\n", fTubsR);
+        printf(" fTubsTurnAngle  %7.4f\n", fTubsTurnAngle);
+        printf(" fEmptySpace     %7.4f cm\n", fEmptySpace);
+      } else if(fGeoName.Contains("TRD1") && fGeoName.Contains("FINAL")){
+        printf("SM dimensions(TRD1) : dx %7.2f dy %7.2f dz %7.2f (SMOD, BOX)\n", 
+        fParSM[0],fParSM[1],fParSM[2]);
+        printf(" fPhiGapForSM  %7.4f cm \n",  fPhiGapForSM);
+        if(fGeoName.Contains("110DEG"))printf(" Last two modules have size 10 degree in  phi (180<phi<190)\n");
+      }
+    }
+    printf("Granularity: %d in eta and %d in phi\n", GetNZ(), GetNPhi()) ;
+    printf("Layout: phi = (%7.1f, %7.1f), eta = (%5.2f, %5.2f), IP = %7.2f\n",  
+          GetArm1PhiMin(), GetArm1PhiMax(),GetArm1EtaMin(), GetArm1EtaMax(), GetIPDistance() );
+  }
+  //TRU parameters. These parameters values are not the final ones.
+  fNTRU    = 3 ;
+  fNTRUEta = 3 ;
+  fNTRUPhi = 1 ;
+}
+
+//______________________________________________________________________
+
+void AliEMCALGeometry::CheckAdditionalOptions()
+{
+  // Feb 06,2006
+  //Additional options that
+  //can be used to select
+  //the specific geometry of 
+  //EMCAL to run
+
+  fArrayOpts = new TObjArray;
+  Int_t nopt = AliEMCALHistoUtilities::ParseString(fGeoName, *fArrayOpts);
+  if(nopt==1) { // no aditional option(s)
+    fArrayOpts->Delete();
+    delete fArrayOpts;
+    fArrayOpts = 0; 
+    return;
+  }             
+  for(Int_t i=1; i<nopt; i++){
+    TObjString *o = (TObjString*)fArrayOpts->At(i); 
+
+    TString addOpt = o->String();
+    Int_t indj=-1;
+    for(Int_t j=0; j<fNAdditionalOpts; j++) {
+      TString opt = fAdditionalOpts[j];
+      if(addOpt.Contains(opt,TString::kIgnoreCase)) {
+         indj = j;
+        break;
+      }
+    }
+    if(indj<0) {
+      AliDebug(2,Form("<E> option |%s| unavailable : ** look to the file AliEMCALGeometry.h **\n", 
+                     addOpt.Data()));
+      assert(0);
+    } else {
+      AliDebug(2,Form("<I> option |%s| is valid : number %i : |%s|\n", 
+                     addOpt.Data(), indj, fAdditionalOpts[indj]));
+      if       (addOpt.Contains("NL=",TString::kIgnoreCase))   {// number of sampling layers
+        sscanf(addOpt.Data(),"NL=%i", &fNECLayers);
+        AliDebug(2,Form(" fNECLayers %i (new) \n", fNECLayers));
+      } else if(addOpt.Contains("PBTH=",TString::kIgnoreCase)) {//Thickness of the Pb(fECPbRadThicknes)
+        sscanf(addOpt.Data(),"PBTH=%f", &fECPbRadThickness);
+      } else if(addOpt.Contains("SCTH=",TString::kIgnoreCase)) {//Thickness of the Sc(fECScintThick)
+        sscanf(addOpt.Data(),"SCTH=%f", &fECScintThick);
+      } else if(addOpt.Contains("LATSS=",TString::kIgnoreCase)) {// Thickness of lateral steel strip (fLateralSteelStrip)
+        sscanf(addOpt.Data(),"LATSS=%f", &fLateralSteelStrip);
+        AliDebug(2,Form(" fLateralSteelStrip %f (new) \n", fLateralSteelStrip));
+      }
+    }
+  }
+}
+
+void AliEMCALGeometry::DefineSamplingFraction()
+{
+  // Jun 05,2006
+  // Look http://rhic.physics.wayne.edu/~pavlinov/ALICE/SHISHKEBAB/RES/linearityAndResolutionForTRD1.html
+  // Keep for compatibilty
+  //
+  if(fNECLayers == 69) {        // 10% layer reduction
+    fSampling = 12.55;
+  } else if(fNECLayers == 61) { // 20% layer reduction
+    fSampling = 12.80;
+  } else if(fNECLayers == 77) {
+    if       (fECScintThick>0.175 && fECScintThick<0.177) { // 10% Pb thicknes reduction
+      fSampling = 10.5; // fECScintThick = 0.176, fECPbRadThickness=0.144;
+    } else if(fECScintThick>0.191 && fECScintThick<0.193) { // 20% Pb thicknes reduction
+      fSampling = 8.93; // fECScintThick = 0.192, fECPbRadThickness=0.128;
+    }
+  }
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+void AliEMCALGeometry::FillTRU(const TClonesArray * digits, TClonesArray * ampmatrix, TClonesArray * timeRmatrix) {
+
+
+//  Orders digits ampitudes list in fNTRU TRUs (384 cells) per supermodule. 
+//  Each TRU is a TMatrixD, and they are kept in TClonesArrays. The number of 
+//  TRU in phi is fNTRUPhi, and the number of TRU in eta is fNTRUEta.
+//  Last 2 modules are half size in Phi, I considered that the number of TRU
+//  is maintained for the last modules but decision not taken. If different, 
+//  then this must be changed. 
+
+  //Check data members
+
+  if(fNTRUEta*fNTRUPhi != fNTRU)
+    Error("FillTRU"," Wrong number of TRUS per Eta or Phi");
+
+  //Initilize and declare variables
+  //List of TRU matrices initialized to 0.
+  Int_t nCellsPhi  = fNPhi*2/fNTRUPhi;
+  Int_t nCellsPhi2 = fNPhi/fNTRUPhi; //HalfSize modules
+  Int_t nCellsEta  = fNZ*2/fNTRUEta;
+  Int_t id      = -1; 
+  Float_t amp   = -1;
+  Float_t timeR = -1;
+  Int_t iSupMod = -1;
+  Int_t nTower  = -1;
+  Int_t nIphi   = -1;
+  Int_t nIeta   = -1;
+  Int_t iphi    = -1;
+  Int_t ieta    = -1;
+
+  //List of TRU matrices initialized to 0.
+  for(Int_t k = 0; k < fNTRU*fNumberOfSuperModules; k++){
+    TMatrixD  * amptrus   = new TMatrixD(nCellsPhi,nCellsEta) ;
+    TMatrixD  * timeRtrus = new TMatrixD(nCellsPhi,nCellsEta) ;
+    for(Int_t i = 0; i < nCellsPhi; i++){
+      for(Int_t j = 0; j < nCellsEta; j++){
+       (*amptrus)(i,j) = 0.0;
+       (*timeRtrus)(i,j) = 0.0;
+      }
+    }
+    new((*ampmatrix)[k])   TMatrixD(*amptrus) ;
+    new((*timeRmatrix)[k]) TMatrixD(*timeRtrus) ; 
+  }
+  
+  AliEMCALDigit * dig ;
+  
+  //Digits loop to fill TRU matrices with amplitudes.
+  for(Int_t idig = 0 ; idig < digits->GetEntriesFast() ; idig++){
+    
+    dig = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(idig)) ;
+    amp    = dig->GetAmp() ;   // Energy of the digit (arbitrary units)
+    id     = dig->GetId() ;    // Id label of the cell
+    timeR  = dig->GetTimeR() ; // Earliest time of the digit
+   
+    //Get eta and phi cell position in supermodule
+    Bool_t bCell = GetCellIndex(id, iSupMod, nTower, nIphi, nIeta) ;
+    if(!bCell)
+      Error("FillTRU","Wrong cell id number") ;
+    
+    GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,nTower,nIphi, nIeta,iphi,ieta);
+
+    //Check to which TRU in the supermodule belongs the cell. 
+    //Supermodules are divided in a TRU matrix of dimension 
+    //(fNTRUPhi,fNTRUEta).
+    //Each TRU is a cell matrix of dimension (nCellsPhi,nCellsEta)
+
+    //First calculate the row and column in the supermodule 
+    //of the TRU to which the cell belongs.
+    Int_t col   = ieta/nCellsEta; 
+    Int_t row   = iphi/nCellsPhi; 
+    if(iSupMod > 9)
+      row   = iphi/nCellsPhi2; 
+    //Calculate label number of the TRU
+    Int_t itru  = row + col*fNTRUPhi + iSupMod*fNTRU ;  
+    //Fill TRU matrix with cell values
+    TMatrixD * amptrus   = dynamic_cast<TMatrixD *>(ampmatrix->At(itru)) ;
+    TMatrixD * timeRtrus = dynamic_cast<TMatrixD *>(timeRmatrix->At(itru)) ;
+
+    //Calculate row and column of the cell inside the TRU with number itru
+    Int_t irow = iphi - row *  nCellsPhi;
+    if(iSupMod > 9)
+      irow = iphi - row *  nCellsPhi2;
+    Int_t icol = ieta - col *  nCellsEta;
+    
+    (*amptrus)(irow,icol) = amp ;
+    (*timeRtrus)(irow,icol) = timeR ;
+
+  }
+}
+
+//______________________________________________________________________
+void AliEMCALGeometry::GetCellPhiEtaIndexInSModuleFromTRUIndex(const Int_t itru, const Int_t iphitru, const Int_t ietatru, Int_t &iphiSM, Int_t &ietaSM) const 
+{
+  
+  // This method transforms the (eta,phi) index of cells in a 
+  // TRU matrix into Super Module (eta,phi) index.
+  
+  // Calculate in which row and column where the TRU are 
+  // ordered in the SM
+
+  Int_t col = itru/ fNTRUPhi ;
+  Int_t row = itru - col*fNTRUPhi ;
+   
+  //Calculate the (eta,phi) index in SM
+  Int_t nCellsPhi = fNPhi*2/fNTRUPhi;
+  Int_t nCellsEta = fNZ*2/fNTRUEta;
+  
+  iphiSM = nCellsPhi*row + iphitru  ;
+  ietaSM = nCellsEta*col + ietatru  ; 
 }
 
 //______________________________________________________________________
 AliEMCALGeometry *  AliEMCALGeometry::GetInstance(){ 
   // Returns the pointer of the unique instance
   
-  return static_cast<AliEMCALGeometry *>( fgGeom ) ; 
+  AliEMCALGeometry * rv = static_cast<AliEMCALGeometry *>( fgGeom );
+  return rv; 
 }
 
 //______________________________________________________________________
@@ -124,7 +585,7 @@ AliEMCALGeometry* AliEMCALGeometry::GetInstance(const Text_t* name,
     AliEMCALGeometry * rv = 0; 
     if ( fgGeom == 0 ) {
        if ( strcmp(name,"") == 0 ) rv = 0;
-       else {    
+       else {
            fgGeom = new AliEMCALGeometry(name, title);
            if ( fgInit ) rv = (AliEMCALGeometry * ) fgGeom;
            else {
@@ -134,282 +595,393 @@ AliEMCALGeometry* AliEMCALGeometry::GetInstance(const Text_t* name,
            } // end if fgInit
        } // end if strcmp(name,"")
     }else{
-       if ( strcmp(fgGeom->GetName(), name) != 0 ) {
-         TString message("\n") ; 
-         message += "current geometry is " ;  
-         message += fgGeom->GetName() ;
-         message += "\n                      you cannot call     " ; 
-         message += name ;  
-         ::Info("GetGeometry", message.Data() ) ; 
+       if ( strcmp(fgGeom->GetName(), name) != 0) {
+         printf("\ncurrent geometry is %s : ", fgGeom->GetName());
+         printf(" you cannot call %s ", name);  
        }else{
          rv = (AliEMCALGeometry *) fgGeom; 
-       } // end if
+       } // end 
     }  // end if fgGeom
     return rv; 
 }
 
-//______________________________________________________________________
-Int_t AliEMCALGeometry::TowerIndex(Int_t ieta,Int_t iphi,Int_t ipre) const {
-    // Returns the tower index number from the based on the Z and Phi
-    // index numbers. There are 2 times the number of towers to separate
-    // out the full towers from the pre-showers.
-    // Inputs:
-    //   Int_t ieta    // index allong z axis [1-fNZ]
-    //   Int_t iphi  // index allong phi axis [1-fNPhi]
-    //   Int_t ipre  // 0 = Full tower, 1 = Pre-shower tower only. [0,1]
-    // Outputs:
-    //   none.
-    // Returned
-    // Int_t the absoulute tower index. [1-2*fNZ*fNPhi]
-    Int_t index;
-
-    if((ieta<=0 || ieta>GetNEta()) || (iphi<=0 || iphi>GetNPhi()) ||
-       (ipre<0 || ipre>1) ){
-      TString message ("\n") ; 
-      message += "inputs out of range ieta= " ; 
-      message += ieta ; 
-      message += " [1-" ; 
-      message += GetNEta() ;
-      message += "] iphi= " ; 
-      message += iphi ; 
-      message += " [1-" ; 
-      message += GetNPhi() ; 
-      message += "] ipre= " ;
-      message += ipre ; 
-      message += "[0,1]. returning -1" ; 
-      Warning("TowerIndex", message.Data() ) ; 
-      return -1;
-    } // end if
-    index = iphi + GetNPhi()*(ieta-1) + ipre*(GetNPhi()*GetNEta());
-    return index;
+Bool_t AliEMCALGeometry::IsInEMCAL(Double_t x, Double_t y, Double_t z) const {
+  // Checks whether point is inside the EMCal volume, used in AliEMCALv*.cxx
+  //
+  // Code uses cylindrical approximation made of inner radius (for speed)
+  //
+  // Points behind EMCAl, i.e. R > outer radius, but eta, phi in acceptance 
+  // are considered to inside
+
+  Double_t r=sqrt(x*x+y*y);
+
+  if ( r > fEnvelop[0] ) {
+     Double_t theta;
+     theta  =    TMath::ATan2(r,z);
+     Double_t eta;
+     if(theta == 0) 
+       eta = 9999;
+     else 
+       eta    =   -TMath::Log(TMath::Tan(theta/2.));
+     if (eta < fArm1EtaMin || eta > fArm1EtaMax)
+       return 0;
+     Double_t phi = TMath::ATan2(y,x) * 180./TMath::Pi();
+     if (phi > fArm1PhiMin && phi < fArm1PhiMax)
+       return 1;
+  }
+  return 0;
+}
+// ==
+
+//
+// == Shish-kebab cases ==
+//
+Int_t AliEMCALGeometry::GetAbsCellId(Int_t nSupMod, Int_t nTower, Int_t nIphi, Int_t nIeta) const
+{ 
+  // 27-aug-04; 
+  // corr. 21-sep-04; 
+  //       13-oct-05; 110 degree case
+  // May 31, 2006; ALICE numbering scheme:
+  // 0 <= nSupMod < fNumberOfSuperModules
+  // 0 <= nTower  < fNPHI * fNZ ( fNPHI * fNZ/2 for fKey110DEG=1)
+  // 0 <= nIphi   < fNPHIdiv
+  // 0 <= nIeta   < fNETAdiv
+  // 0 <= absid   < fNCells
+  static Int_t id=0; // have to change from 0 to fNCells-1
+  if(fKey110DEG == 1 && nSupMod >= 10) { // 110 degree case; last two supermodules
+    id  = fNCellsInSupMod*10 + (fNCellsInSupMod/2)*(nSupMod-10);
+  } else {
+    id  = fNCellsInSupMod*nSupMod;
+  }
+  id += fNCellsInTower *nTower;
+  id += fNPHIdiv *nIphi;
+  id += nIeta;
+  if(id<0 || id >= fNCells) {
+//     printf(" wrong numerations !!\n");
+//     printf("    id      %6i(will be force to -1)\n", id);
+//     printf("    fNCells %6i\n", fNCells);
+//     printf("    nSupMod %6i\n", nSupMod);
+//     printf("    nTower  %6i\n", nTower);
+//     printf("    nIphi   %6i\n", nIphi);
+//     printf("    nIeta   %6i\n", nIeta);
+    id = -TMath::Abs(id); // if negative something wrong
+  }
+  return id;
 }
 
-//______________________________________________________________________
-void AliEMCALGeometry::TowerIndexes(Int_t index,Int_t &ieta,Int_t &iphi,
-                                   Int_t &ipre) const {
-    // given the tower index number it returns the based on the Z and Phi
-    // index numbers and if it is for the full tower or the pre-tower number.
-    // There are 2 times the number of towers to separate
-    // out the full towsers from the pre-towsers.
-    // Inputs:
-    //   Int_t index // Tower index number [1-2*fNZ*fNPhi]
-    // Outputs:
-    //   Int_t ieta    // index allong z axis [1-fNZ]
-    //   Int_t iphi  // index allong phi axis [1-fNPhi]
-    //   Int_t ipre  // 0 = Full tower, 1 = Pre-shower tower only. [0,1]
-    // Returned
-    //   none.
-    Int_t itowers;
-
-    itowers = GetNEta()*GetNPhi();
-    if(index<1 || index>2*itowers){
-      TString message("\n") ; 
-      message += "index= " ; 
-      message += index ; 
-      message += " is out of range [1-" ;
-      message += 2*itowers ; 
-      message += "], returning -1 for all." ;
-      Warning("TowerIndex", message.Data() ) ; 
-      ieta = -1; iphi = -1; ipre = -1;
-      return ;
-    } // end if
-    ipre = 0;
-    if(index>itowers){ // pre shower indexs
-       ipre = 1;
-       index = index - itowers;
-    } // end if
-    ieta = 1+ (Int_t)((index-1)/GetNPhi());
-    iphi = index - GetNPhi()*(ieta-1);
-    return;
+Bool_t  AliEMCALGeometry::CheckAbsCellId(Int_t absId) const
+{ 
+  // May 31, 2006; only trd1 now
+  if(absId<0 || absId >= fNCells) return kFALSE;
+  else                            return kTRUE;
 }
 
-//______________________________________________________________________
-void AliEMCALGeometry::EtaPhiFromIndex(Int_t index,Float_t &eta,Float_t &phi) const {
-    // given the tower index number it returns the based on the eta and phi
-    // of the tower.
-    // Inputs:
-    //   Int_t index // Tower index number [1-2*fNZ*fNPhi]
-    // Outputs:
-    //   Float_t eta  // eta of center of tower in pseudorapidity
-    //   Float_t phi  // phi of center of tower in degrees
-    // Returned
-    //   none.
-    Int_t ieta,iphi,ipre;
-    Double_t deta,dphi,phid;
-
-    TowerIndexes(index,ieta,iphi,ipre);
-    deta = (GetArm1EtaMax()-GetArm1EtaMin())/((Float_t)GetNEta());
-    eta  = GetArm1EtaMin() + (((Float_t)ieta)-0.5)*deta;
-    dphi = (GetArm1PhiMax() - GetArm1PhiMin())/((Float_t)GetNPhi());  // in degrees.
-    phid = GetArm1PhiMin() + dphi*((Float_t)iphi -0.5);//iphi range [1-fNphi].
-    phi  = phid;
+Bool_t AliEMCALGeometry::GetCellIndex(Int_t absId,Int_t &nSupMod,Int_t &nTower,Int_t &nIphi,Int_t &nIeta) const
+{ 
+  // 21-sep-04; 19-oct-05;
+  // May 31, 2006; ALICE numbering scheme:
+  static Int_t tmp=0, sm10=0;
+  if(!CheckAbsCellId(absId)) return kFALSE;
+
+  sm10 = fNCellsInSupMod*10;
+  if(fKey110DEG == 1 && absId >= sm10) { // 110 degree case; last two supermodules  
+    nSupMod = (absId-sm10) / (fNCellsInSupMod/2) + 10;
+    tmp     = (absId-sm10) % (fNCellsInSupMod/2);
+  } else {
+    nSupMod = absId / fNCellsInSupMod;
+    tmp     = absId % fNCellsInSupMod;
+  }
+
+  nTower  = tmp / fNCellsInTower;
+  tmp     = tmp % fNCellsInTower;
+  nIphi   = tmp / fNPHIdiv;
+  nIeta   = tmp % fNPHIdiv;
+
+  return kTRUE;
 }
 
-//______________________________________________________________________
-Int_t AliEMCALGeometry::TowerIndexFromEtaPhi(Float_t eta,Float_t phi) const {
-    // returns the tower index number based on the eta and phi of the tower.
-    // Inputs:
-    //   Float_t eta  // eta of center of tower in pseudorapidity
-    //   Float_t phi  // phi of center of tower in degrees
-    // Outputs:
-    //   none.
-    // Returned
-    //   Int_t index // Tower index number [1-fNZ*fNPhi]
-    Int_t ieta,iphi;
-
-    ieta = 1 + (Int_t)(((Float_t)GetNEta())*(eta-GetArm1EtaMin())/
-                 (GetArm1EtaMax() - GetArm1EtaMin()));
-    if(ieta<=0 || ieta>GetNEta()){
-      TString message("\n") ; 
-      message += "ieta = " ; 
-      message += ieta ; 
-      message += " eta=" ; 
-      message += eta ; 
-      message += " is outside of EMCAL. etamin=" ;
-      message += GetArm1EtaMin() ;
-      message += " to etamax=" ; 
-      message += GetArm1EtaMax();
-      message += " returning -1";
-      Warning("TowerIndexFromEtaPhi", message.Data() ) ; 
-      return -1;
-    } // end if
-    iphi = 1 + (Int_t)(((Float_t)GetNPhi())*(phi-GetArm1PhiMin())/
-                 ((Float_t)(GetArm1PhiMax() - GetArm1PhiMin())));
-    if(iphi<=0 || iphi>GetNPhi()){
-      TString message("\n") ; 
-      message += "iphi=" ; 
-      message += iphi ;  
-      message += "phi= " ; 
-      message += phi ; 
-      message += " is outside of EMCAL." ;
-      message += " Phimin=" ; 
-      message += GetArm1PhiMin() ; 
-      message += " PhiMax=" ; 
-      message += GetArm1PhiMax() ;
-      message += " returning -1" ;
-      Warning("TowerIndexFromEtaPhi", message.Data() ) ; 
-      return -1;
-    } // end if
-    return TowerIndex(ieta,iphi,0);
+void AliEMCALGeometry::GetModulePhiEtaIndexInSModule(Int_t nSupMod, Int_t nTower,  int &iphim, int &ietam) const
+{ 
+  // added nSupMod; have to check  - 19-oct-05 !
+  // Alice numbering scheme        - Jun 01,2006 
+  static Int_t nphi;
+
+  if(fKey110DEG == 1 && nSupMod>=10) nphi = fNPhi/2;
+  else                               nphi = fNPhi;
+
+  ietam = nTower/nphi; // have to change from 0 to fNZ-1
+  iphim = nTower%nphi; // have to change from 0 to fNPhi-1
 }
 
-//______________________________________________________________________
-Int_t AliEMCALGeometry::PreTowerIndexFromEtaPhi(Float_t eta,Float_t phi) const {
-    // returns the pretower index number based on the eta and phi of the tower.
-    // Inputs:
-    //   Float_t eta  // eta of center of tower in pseudorapidity
-    //   Float_t phi  // phi of center of tower in degrees
-    // Outputs:
-    //   none.
-    // Returned
-    //   Int_t index // PreTower index number [fNZ*fNPhi-2*fNZ*fNPhi]
-
-    return GetNEta()*GetNPhi()+TowerIndexFromEtaPhi(eta,phi);
+void AliEMCALGeometry::GetCellPhiEtaIndexInSModule(Int_t nSupMod, Int_t nTower, Int_t nIphi, Int_t nIeta, 
+int &iphi, int &ieta) const
+{ 
+  // added nSupMod; Nov 25, 05
+  // Alice numbering scheme        - Jun 01,2006 
+  static Int_t iphim, ietam;
+
+  GetModulePhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower, iphim, ietam); 
+  // have to change from 0 to (fNZ*fNETAdiv-1)
+  ieta  = ietam*fNETAdiv + (1-nIeta); // x(module) = -z(SM) 
+  // iphi - have to change from 0 to (fNPhi*fNPHIdiv-1)
+  iphi  = iphim*fNPHIdiv + nIphi;     // y(module) =  y(SM) 
 }
 
-//______________________________________________________________________
-Bool_t AliEMCALGeometry::AbsToRelNumbering(Int_t AbsId, Int_t *relid) const {
-    // Converts the absolute numbering into the following array/
-    //  relid[0] = EMCAL Arm number 1:1 
-    //  relid[1] = 0  Not in Pre Shower layers
-    //           = -1 In Pre Shower
-    //  relid[2] = Row number inside EMCAL
-    //  relid[3] = Column number inside EMCAL
-    // Input:
-    //   Int_t AbsId // Tower index number [1-2*fNZ*fNPhi]
-    // Outputs:
-    //   Int_t *relid // array of 5. Discribed above.
-    Bool_t rv  = kTRUE ;
-    Int_t ieta=0,iphi=0,ipre=0,index=AbsId;
-
-    TowerIndexes(index,ieta,iphi,ipre);
-    relid[0] = 1;
-    relid[1] = 0;
-    if(ipre==1) 
-      relid[1] = -1;
-    relid[2] = ieta;
-    relid[3] = iphi;
-
-    return rv;
+Int_t  AliEMCALGeometry::GetSuperModuleNumber(Int_t absId)  const
+{
+  //return the number of the 
+  //supermodule given the absolute
+  //ALICE numbering
+
+  static Int_t nSupMod, nTower, nIphi, nIeta;
+  GetCellIndex(absId, nSupMod, nTower, nIphi, nIeta);
+  return nSupMod;
+} 
+
+// Methods for AliEMCALRecPoint - Feb 19, 2006
+Bool_t AliEMCALGeometry::RelPosCellInSModule(Int_t absId, Double_t &xr, Double_t &yr, Double_t &zr) const
+{
+  // Look to see what the relative
+  // position inside a given cell is
+  // for a recpoint.
+  // Alice numbering scheme - Jun 08, 2006
+
+  static Int_t nSupMod, nTower, nIphi, nIeta, iphi, ieta;
+  static Int_t phiIndexShift=6;
+  if(!CheckAbsCellId(absId)) return kFALSE;
+
+  GetCellIndex(absId, nSupMod, nTower, nIphi, nIeta);
+  GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nTower,nIphi,nIeta, iphi, ieta); 
+  xr = fXCentersOfCells.At(ieta);
+  zr = fEtaCentersOfCells.At(ieta);
+
+  if(nSupMod<10) {
+    yr = fPhiCentersOfCells.At(iphi);
+  } else {
+    yr = fPhiCentersOfCells.At(iphi + phiIndexShift);
+    //    cout<<" absId "<<absId<<" nSupMod "<<nSupMod << " iphi "<<iphi<<" ieta "<<ieta;
+    //    cout<< " xr " << xr << " yr " << yr << " zr " << zr <<endl;
+  }
+
+  return kTRUE;
 }
 
-//______________________________________________________________________
-void AliEMCALGeometry::PosInAlice(const Int_t *relid,Float_t &theta,
-                                    Float_t &phi) const {
-    // Converts the relative numbering into the local EMCAL-module (x, z)
-    // coordinates
-    Int_t ieta   = relid[2]; // offset along x axis
-    Int_t iphi = relid[3]; // offset along z axis
-    Int_t ipre = relid[1]; // indicates -1 preshower, or 0 full tower.
-    Int_t index;
-    Float_t eta;
-
-    if(ipre==-1) ipre = 1;
-    index = TowerIndex(ieta,iphi,ipre);
-    EtaPhiFromIndex(index,eta,phi);
-    theta = 180.*(2.0*TMath::ATan(TMath::Exp(-eta)))/TMath::Pi();
+Bool_t AliEMCALGeometry::RelPosCellInSModule(Int_t absId, Double_t loc[3]) const
+{
+  // Alice numbering scheme - Jun 03, 2006
+  loc[0] = loc[1] = loc[2]=0.0;
+  if(RelPosCellInSModule(absId, loc[0],loc[1],loc[2])) {
+    return kTRUE;
+  }
+  return kFALSE;
+}
 
-    return;
+Bool_t AliEMCALGeometry::RelPosCellInSModule(Int_t absId, TVector3 &vloc) const
+{
+  static Double_t loc[3];
+  if(RelPosCellInSModule(absId,loc)) {
+    vloc.SetXYZ(loc[0], loc[1], loc[2]);
+    return kTRUE;
+  } else {
+    vloc.SetXYZ(0,0,0);
+    return kFALSE;
+  }
+  // Alice numbering scheme - Jun 03, 2006
 }
 
-//______________________________________________________________________
-void AliEMCALGeometry::XYZFromIndex(const Int_t *relid,Float_t &x,Float_t &y, Float_t &z) const {
-    // given the tower relative number it returns the X, Y and Z
-    // of the tower.
-    
-    // Outputs:
-    //   Float_t x  // x of center of tower in cm
-    //   Float_t y  // y of center of tower in cm
-    //   Float_t z  // z of centre of tower in cm
-    // Returned
-    //   none.
-    
-    Float_t eta,theta, phi,cyl_radius,kDeg2Rad;
-    
-    Int_t ieta   = relid[2]; // offset along x axis
-    Int_t iphi = relid[3]; // offset along z axis
-    Int_t ipre = relid[1]; // indicates -1 preshower, or 0 full tower.
-    Int_t index;
-    
+void AliEMCALGeometry::CreateListOfTrd1Modules()
+{
+  //Generate the list of Trd1 modules
+  //which will make up the EMCAL
+  //geometry
+
+  AliDebug(2,Form(" AliEMCALGeometry::CreateListOfTrd1Modules() started "));
+
+  AliEMCALShishKebabTrd1Module *mod=0, *mTmp=0; // current module
+  if(fShishKebabTrd1Modules == 0) {
+    fShishKebabTrd1Modules = new TList;
+    for(int iz=0; iz< GetNZ(); iz++) { 
+      if(iz==0) { 
+        mod  = new AliEMCALShishKebabTrd1Module(TMath::Pi()/2.,this);
+      } else {
+        mTmp  = new AliEMCALShishKebabTrd1Module(*mod);
+        mod   = mTmp;
+      }
+      fShishKebabTrd1Modules->Add(mod);
+    }
+  } else {
+    AliDebug(2,Form(" Already exits : "));
+  }
+  AliDebug(2,Form(" fShishKebabTrd1Modules has %i modules \n", 
+                 fShishKebabTrd1Modules->GetSize()));
+  // Feb 20,2006;
+  // Jun 01, 2006 - ALICE numbering scheme
+  // define grid for cells in eta(z) and x directions in local coordinates system of SM
+  //  fEtaCentersOfCells = new TArrayD(fNZ *fNETAdiv);
+  //  fXCentersOfCells = new TArrayD(fNZ *fNETAdiv);
+  fEtaCentersOfCells.Set(fNZ *fNETAdiv);
+  fXCentersOfCells.Set(fNZ *fNETAdiv);
+  AliDebug(2,Form(" Cells grid in eta directions : size %i\n", fEtaCentersOfCells.GetSize()));
+  Int_t iphi=0, ieta=0, nTower=0;
+  Double_t xr, zr;
+  for(Int_t it=0; it<fNZ; it++) { // array index
+    AliEMCALShishKebabTrd1Module *trd1 = GetShishKebabModule(it);
+    nTower = fNPhi*it;
+    for(Int_t ic=0; ic<fNETAdiv; ic++) { // array index
+      trd1->GetCenterOfCellInLocalCoordinateofSM(ic, xr, zr);
+      GetCellPhiEtaIndexInSModule(0, nTower, 0, ic, iphi, ieta); // don't depend from phi - ieta in action
+      fXCentersOfCells.AddAt(float(xr) - fParSM[0],ieta);
+      fEtaCentersOfCells.AddAt(float(zr) - fParSM[2],ieta);
+    }
+  }
+  for(Int_t i=0; i<fEtaCentersOfCells.GetSize(); i++) {
+    AliDebug(2,Form(" ind %2.2i : z %8.3f : x %8.3f", i+1, 
+                    fEtaCentersOfCells.At(i),fXCentersOfCells.At(i)));
+  }
+
+ // define grid for cells in phi(y) direction in local coordinates system of SM
+  //  fPhiCentersOfCells = new TArrayD(fNPhi*fNPHIdiv);
+  fPhiCentersOfCells.Set(fNPhi*fNPHIdiv);
+  AliDebug(2,Form(" Cells grid in phi directions : size %i\n", fPhiCentersOfCells.GetSize()));
+  Int_t ind=0;
+  for(Int_t it=0; it<fNPhi; it++) { // array index
+    Float_t ytLeftCenterModule = -fParSM[1] + fPhiModuleSize*(2*it+1)/2;         // module
+    for(Int_t ic=0; ic<fNPHIdiv; ic++) { // array index
+      Float_t ytLeftCenterCell = ytLeftCenterModule + fPhiTileSize *(2*ic-1)/2.; // tower(cell) 
+      fPhiCentersOfCells.AddAt(ytLeftCenterCell,ind);
+      AliDebug(2,Form(" ind %2.2i : y %8.3f ", ind, fPhiCentersOfCells.At(ind))); 
+      ind++;
+    }
+  }
+}
 
-    if(ipre==-1) ipre = 1;
-    index = TowerIndex(ieta,iphi,ipre);
-    EtaPhiFromIndex(index,eta,phi);
-    theta = 180.*(2.0*TMath::ATan(TMath::Exp(-eta)))/TMath::Pi();
-    
-    kDeg2Rad = TMath::Pi() / static_cast<Double_t>(180) ; 
-    if ( ipre == -1 ) 
-      cyl_radius = GetIP2PreShower() ;
-    else 
-      cyl_radius = GetIP2Tower() ;
-
-    x =  cyl_radius * TMath::Cos(phi * kDeg2Rad ) ;
-    y =  cyl_radius * TMath::Sin(phi * kDeg2Rad ) ; 
-    z =  cyl_radius / TMath::Tan(theta * kDeg2Rad ) ; 
- return;
-} 
+void  AliEMCALGeometry::GetTransformationForSM()
+{
+  //Uses the geometry manager to
+  //load the transformation matrix
+  //for the supermodules
+
+  static Bool_t transInit=kFALSE;
+  if(transInit) return;
+
+  int i=0;
+  if(gGeoManager == 0) {
+    Info("CreateTransformationForSM() "," Load geometry : TGeoManager::Import()");
+    assert(0);
+  }
+  TGeoNode *tn = gGeoManager->GetTopNode();
+  TGeoNode *node=0, *xen1 = 0;
+  for(i=0; i<tn->GetNdaughters(); i++) {
+    node = tn->GetDaughter(i);
+    TString ns(node->GetName());
+    if(ns.Contains(GetNameOfEMCALEnvelope())) {
+      xen1 = node;
+      break;
+    }
+  }
+  if(!xen1) {
+    Info("CreateTransformationForSM() "," geometry has not EMCAL envelope with name %s", 
+    GetNameOfEMCALEnvelope());
+    assert(0);
+  }
+  printf(" i %i : EMCAL Envelope is %s : #SM %i \n", i, xen1->GetName(), xen1->GetNdaughters());
+  for(i=0; i<xen1->GetNdaughters(); i++) {
+    TGeoNodeMatrix *sm = (TGeoNodeMatrix*)xen1->GetDaughter(i);
+    fMatrixOfSM[i] = sm->GetMatrix();
+    //Compiler doesn't like this syntax...
+    //    printf(" %i : matrix %x \n", i, fMatrixOfSM[i]);
+  }
+  transInit = kTRUE;
+}
 
-//______________________________________________________________________
-/*
-Boot_t AliEMCALGeometry::AreNeighbours(Int_t index1,Int_t index2) const {
-    // Returns kTRUE if the two towers are neighbours or not, including
-    // diagonals. Both indexes are required to be either towers or preshower.
-    // Inputs:
-    //   Int_t index1  // index of tower 1
-    //   Int_t index2  // index of tower 2
-    // Outputs:
-    //   none.
-    // Returned
-    //   Boot_t kTRUE if the towers are neighbours otherwise false.
-    Boot_t anb = kFALSE;
-    Int_t ieta1 = 0, ieta2 = 0, iphi1 = 0, iphi2 = 0, ipre1 = 0, ipre2 = 0;
-
-    TowerIndexes(index1,ieta1,iphi1,ipre1);
-    TowerIndexes(index2,ieta2,iphi2,ipre2);
-    if(ipre1!=ipre2) return anb;
-    if((ieta1>=ieta2-1 && ieta1<=ieta2+1) && (iphi1>=iphi2-1 &&iphi1<=iphi2+1))
-                                                                 anb = kTRUE;
-    return anb;
+void AliEMCALGeometry::GetGlobal(const Double_t *loc, Double_t *glob, int ind) const
+{
+  // Figure out the global numbering
+  // of a given supermodule from the
+  // local numbering
+  // Alice numbering - Jun 03,2006
+  //  if(fMatrixOfSM[0] == 0) GetTransformationForSM();
+
+  if(ind>=0 && ind < GetNumberOfSuperModules()) {
+    fMatrixOfSM[ind]->LocalToMaster(loc, glob);
+  }
+}
+
+void AliEMCALGeometry::GetGlobal(const TVector3 &vloc, TVector3 &vglob, int ind) const
+{
+  //Figure out the global numbering
+  //of a given supermodule from the
+  //local numbering given a 3-vector location
+
+  static Double_t tglob[3], tloc[3];
+  vloc.GetXYZ(tloc);
+  GetGlobal(tloc, tglob, ind);
+  vglob.SetXYZ(tglob[0], tglob[1], tglob[2]);
+}
+
+void AliEMCALGeometry::GetGlobal(Int_t absId , double glob[3]) const
+{ 
+  // Alice numbering scheme - Jun 03, 2006
+  static Int_t nSupMod, nModule, nIphi, nIeta;
+  static double loc[3];
+
+  glob[0]=glob[1]=glob[2]=0.0; // bad case
+  if(RelPosCellInSModule(absId, loc)) {
+    GetCellIndex(absId, nSupMod, nModule, nIphi, nIeta);
+    fMatrixOfSM[nSupMod]->LocalToMaster(loc, glob);
+  }
+}
+
+void AliEMCALGeometry::GetGlobal(Int_t absId , TVector3 &vglob) const
+{ 
+  // Alice numbering scheme - Jun 03, 2006
+  static Double_t glob[3];
+
+  GetGlobal(absId, glob);
+  vglob.SetXYZ(glob[0], glob[1], glob[2]);
+
+}
+
+void AliEMCALGeometry::GetGlobal(const AliRecPoint *rp, TVector3 &vglob) const
+{
+  // Figure out the global numbering
+  // of a given supermodule from the
+  // local numbering for RecPoints
+
+  static TVector3 vloc;
+  static Int_t nSupMod, nModule, nIphi, nIeta;
+
+  AliRecPoint *rpTmp = (AliRecPoint*)rp; // const_cast ??
+  if(!rpTmp) return;
+  AliEMCALRecPoint *rpEmc = (AliEMCALRecPoint*)rpTmp;
+
+  GetCellIndex(rpEmc->GetAbsId(0), nSupMod, nModule, nIphi, nIeta);
+  rpTmp->GetLocalPosition(vloc);
+  GetGlobal(vloc, vglob, nSupMod);
+}
+
+void AliEMCALGeometry::EtaPhiFromIndex(Int_t absId,Float_t &eta,Float_t &phi) const
+{
+  // Jun 03, 2006 - version for TRD1
+  static TVector3 vglob;
+  GetGlobal(absId, vglob);
+  eta = vglob.Eta();
+  phi = vglob.Phi();
+}
+
+AliEMCALShishKebabTrd1Module* AliEMCALGeometry::GetShishKebabModule(Int_t neta=0)
+{
+  //This method was too long to be
+  //included in the header file - the
+  //rule checker complained about it's
+  //length, so we move it here.  It returns the
+  //shishkebabmodule at a given eta index point.
+
+  static AliEMCALShishKebabTrd1Module* trd1=0;
+  if(fShishKebabTrd1Modules && neta>=0 && neta<fShishKebabTrd1Modules->GetSize()) {
+    trd1 = (AliEMCALShishKebabTrd1Module*)fShishKebabTrd1Modules->At(neta);
+  } else trd1 = 0;
+  return trd1;
 }
- */