]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - EMCAL/AliEMCALQADataMakerRec.cxx
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[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALQADataMakerRec.cxx
index a481b9243141796e8f1b96039d4df8280ae7b6cf..cb2b0948eed5bfb6eeca61a1c99cbeb901c60eee 100644 (file)
@@ -18,11 +18,14 @@ Based on the QA code for PHOS written by Yves Schutz July 2007
 Authors:  J.Klay (Cal Poly) May 2008
           S. Salur LBL April 2008
  
-Created one histogram for QA shifter;
+Created one histogram for QA shifter;-- Yaxian Mao: 11/2009
 The idea:average counts for all the towers should be flat 
 Change all existing histograms as experts
- --By Yaxian Mao 
 
+Change histograms for DQM shifter: --  Yaxian Mao 04/2010
+Calcuate the amplitude ratio from current run and the LED reference, for QAChecker use
+Also calculate the ratio of amplitude from LED Monitor system (current/Reference), to check LED system  
 */
 
 // --- ROOT system ---
@@ -31,12 +34,15 @@ Change all existing histograms as experts
 #include <TH1F.h> 
 #include <TH1I.h> 
 #include <TH2F.h> 
+#include <TLine.h>
+#include <TText.h>
 #include <TProfile.h> 
-
+#include <TStyle.h>
 // --- Standard library ---
 
 
 // --- AliRoot header files ---
+#include "AliDAQ.h"
 #include "AliESDCaloCluster.h"
 #include "AliESDCaloCells.h"
 #include "AliESDEvent.h"
@@ -51,33 +57,101 @@ Change all existing histograms as experts
 #include "AliRawReader.h"
 #include "AliCaloRawStreamV3.h"
 #include "AliEMCALGeoParams.h"
+#include "AliRawEventHeaderBase.h"
+#include "AliQAManager.h"
+#include "AliCDBEntry.h"
+
+#include "AliCaloBunchInfo.h"
+#include "AliCaloFitResults.h"
+#include "AliCaloRawAnalyzerFastFit.h"
+#include "AliCaloRawAnalyzerNN.h"
+#include "AliCaloRawAnalyzerLMS.h"
+#include "AliCaloRawAnalyzerPeakFinder.h"
+#include "AliCaloRawAnalyzerCrude.h"
+
+using namespace std;
 
 ClassImp(AliEMCALQADataMakerRec)
            
 //____________________________________________________________________________ 
-  AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec() : 
-    AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
-    fSuperModules(4), // FIXME!!! number of SuperModules; 4 for 2009; update default to 12 for later runs..
-    fFirstPedestalSample(0),
-    fLastPedestalSample(15),
-    fMinSignalHG(0),
-    fMaxSignalHG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax)
-   {
+AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(fitAlgorithm fitAlgo) : 
+  AliQADataMakerRec(AliQAv1::GetDetName(AliQAv1::kEMCAL), "EMCAL Quality Assurance Data Maker"),
+  fFittingAlgorithm(0),
+  fRawAnalyzer(0),
+  fRawAnalyzerTRU(0),
+  fSuperModules(4), // FIXME!!! number of SuperModules; 4 for 2009; update default to 12 for later runs..
+  fFirstPedestalSample(0),
+  fLastPedestalSample(3),
+  fFirstPedestalSampleTRU(0),
+  fLastPedestalSampleTRU(3),
+  fMinSignalLG(0),
+  fMaxSignalLG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
+  fMinSignalHG(0),
+  fMaxSignalHG(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
+  fMinSignalTRU(0),
+  fMaxSignalTRU(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
+  fMinSignalLGLEDMon(0),
+  fMaxSignalLGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
+  fMinSignalHGLEDMon(0),
+  fMaxSignalHGLEDMon(AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax),
+  fCalibRefHistoPro(NULL),
+  fCalibRefHistoH2F(NULL),
+  fLEDMonRefHistoPro(NULL),
+  fHighEmcHistoH2F(NULL)
+//  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
+//  fLineCol(NULL),
+//  fLineRow(NULL)
+
+{
   // ctor
+  SetFittingAlgorithm(fitAlgo);
+  fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
+  fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE); 
+  fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
+//  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
+//    fTextSM[sm] = NULL ;
+//  }
 }
 
 //____________________________________________________________________________ 
 AliEMCALQADataMakerRec::AliEMCALQADataMakerRec(const AliEMCALQADataMakerRec& qadm) :
   AliQADataMakerRec(), 
+  fFittingAlgorithm(0),
+  fRawAnalyzer(0),
+  fRawAnalyzerTRU(0),
   fSuperModules(qadm.GetSuperModules()), 
   fFirstPedestalSample(qadm.GetFirstPedestalSample()), 
   fLastPedestalSample(qadm.GetLastPedestalSample()),  
+  fFirstPedestalSampleTRU(qadm.GetFirstPedestalSampleTRU()), 
+  fLastPedestalSampleTRU(qadm.GetLastPedestalSampleTRU()),  
+  fMinSignalLG(qadm.GetMinSignalLG()),
+  fMaxSignalLG(qadm.GetMaxSignalLG()),
   fMinSignalHG(qadm.GetMinSignalHG()),
-  fMaxSignalHG(qadm.GetMaxSignalHG())
+  fMaxSignalHG(qadm.GetMaxSignalHG()),
+  fMinSignalTRU(qadm.GetMinSignalTRU()),
+  fMaxSignalTRU(qadm.GetMaxSignalTRU()),
+  fMinSignalLGLEDMon(qadm.GetMinSignalLGLEDMon()),
+  fMaxSignalLGLEDMon(qadm.GetMaxSignalLGLEDMon()),
+  fMinSignalHGLEDMon(qadm.GetMinSignalHGLEDMon()),
+  fMaxSignalHGLEDMon(qadm.GetMaxSignalHGLEDMon()),
+  fCalibRefHistoPro(NULL),
+  fCalibRefHistoH2F(NULL),
+  fLEDMonRefHistoPro(NULL),
+  fHighEmcHistoH2F(NULL)
+//  fTextSM(new TText*[fSuperModules]) ,
+//  fLineCol(NULL),
+//  fLineRow(NULL)
 {
   //copy ctor 
   SetName((const char*)qadm.GetName()) ; 
   SetTitle((const char*)qadm.GetTitle()); 
+  SetFittingAlgorithm(qadm.GetFittingAlgorithm());
+  fRawAnalyzerTRU = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
+  fRawAnalyzerTRU->SetFixTau(kTRUE); 
+  fRawAnalyzerTRU->SetTau(2.5); // default for TRU shaper
+//  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
+//    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
+//  }  
 }
 
 //__________________________________________________________________
@@ -86,6 +160,11 @@ AliEMCALQADataMakerRec& AliEMCALQADataMakerRec::operator = (const AliEMCALQAData
   // Equal operator.
   this->~AliEMCALQADataMakerRec();
   new(this) AliEMCALQADataMakerRec(qadm);
+//  fLineCol = NULL;
+//  fLineRow = NULL;
+//  for (Int_t sm = 0 ; sm < fSuperModules ; sm++){
+//    fTextSM[sm] = qadm.fTextSM[sm] ;
+//  }    
   return *this;
 }
  
@@ -101,6 +180,59 @@ void AliEMCALQADataMakerRec::EndOfDetectorCycle(AliQAv1::TASKINDEX_t task, TObjA
   AliQAChecker::Instance()->Run(AliQAv1::kEMCAL, task, list) ;  
 }
 
+//____________________________________________________________________________ 
+void AliEMCALQADataMakerRec::GetCalibRefFromOCDB()
+{
+  //Get the reference histogram from OCDB
+  TString sName1("hHighEmcalRawMaxMinusMin") ;
+  TString sName2("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin") ;
+  sName1.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ; 
+  sName2.Prepend(Form("%s_", AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib))) ; 
+  
+  TString refStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
+  if (!refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabLocalOCDB()) && !refStorage.Contains(AliQAv1::GetLabAliEnOCDB())) {
+    AliFatal(Form("%s is not a valid location for reference data", refStorage.Data())) ; 
+  } else {
+    AliQAManager* manQA = AliQAManager::QAManager(AliQAv1::kRAWS) ;    
+    AliQAv1::SetQARefDataDirName(AliRecoParam::kCalib) ;
+    if ( ! manQA->GetLock() ) { 
+      manQA->SetDefaultStorage(AliQAv1::GetQARefStorage()) ; 
+      manQA->SetSpecificStorage("*", AliQAv1::GetQARefStorage()) ;
+      manQA->SetRun(AliCDBManager::Instance()->GetRun()) ; 
+      manQA->SetLock() ; 
+    }
+    char * detOCDBDir = Form("%s/%s/%s", GetName(), AliQAv1::GetRefOCDBDirName(), AliQAv1::GetRefDataDirName()) ; 
+    AliCDBEntry * entry = manQA->Get(detOCDBDir, manQA->GetRun()) ;
+    if (entry) {
+      TList * listDetQAD =static_cast<TList *>(entry->GetObject()) ;
+      if ( strcmp(listDetQAD->ClassName(), "TList") != 0 ) {
+        AliError(Form("Expected a Tlist and found a %s for detector %s", listDetQAD->ClassName(), GetName())) ; 
+        listDetQAD = NULL ; 
+      }
+      TObjArray * dirOCDB= NULL ; 
+      if ( listDetQAD )
+        dirOCDB = static_cast<TObjArray *>(listDetQAD->FindObject(Form("%s/%s", AliQAv1::GetTaskName(AliQAv1::kRAWS).Data(), AliRecoParam::GetEventSpecieName(AliRecoParam::kCalib)))) ;       
+      if (dirOCDB){
+        fCalibRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName1.Data())) ; 
+        fLEDMonRefHistoPro = dynamic_cast<TProfile *>(dirOCDB->FindObject(sName2.Data())) ; 
+      }
+    }
+  }
+  if(fCalibRefHistoPro && fLEDMonRefHistoPro){
+    
+    //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
+    Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
+    Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
+    Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
+    
+    if(!fCalibRefHistoH2F)
+      fCalibRefHistoH2F =  new TH2F("hCalibRefHisto", "hCalibRefHisto", nbinsZ, -0.5, nbinsZ - 0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi -0.5);
+    ConvertProfile2H(fCalibRefHistoPro,fCalibRefHistoH2F) ; 
+  } else {
+    AliFatal(Form("No reference object with name %s or %s found", sName1.Data(), sName2.Data())) ; 
+  }
+}
 //____________________________________________________________________________ 
 void AliEMCALQADataMakerRec::InitESDs()
 {
@@ -144,7 +276,7 @@ void AliEMCALQADataMakerRec::InitDigits()
 //____________________________________________________________________________ 
 void AliEMCALQADataMakerRec::InitRecPoints()
 {
-  // create Reconstructed Points histograms in RecPoints subdir
+  // create Reconstructed PoInt_ts histograms in RecPoints subdir
   const Bool_t expert   = kTRUE ; 
   const Bool_t image    = kTRUE ; 
   
@@ -170,24 +302,30 @@ void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
    const Bool_t saveCorr = kTRUE ; 
    const Bool_t image    = kTRUE ; 
 
-  int nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
-  int nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
-
-  // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
+  Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
+  Int_t nTot = fSuperModules * nTowersPerSM; // max number of towers in all SuperModules
+  
+  
+       //Defining histograms binning, each 2D histogram covers all SMs
+       Int_t nSMSectors = fSuperModules / 2; // 2 SMs per sector
+       Int_t nbinsZ = 2*AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
+       Int_t nbinsPhi = nSMSectors * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
+   
+   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
   TProfile * h0 = new TProfile("hLowEmcalSupermodules", "Low Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",
                               fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
-  Add2RawsList(h0, kNsmodLG, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(h0, kNsmodLG, expert, !image, !saveCorr) ;
   TProfile * h1 = new TProfile("hHighEmcalSupermodules", "High Gain EMC: # of towers vs SuperMod;SM Id;# of towers",  
                               fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ; 
-  Add2RawsList(h1, kNsmodHG, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(h1, kNsmodHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 
   // where did max sample occur? (bins are towers)
   TProfile * h2 = new TProfile("hLowEmcalRawtime", "Low Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]", 
                               nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
-  Add2RawsList(h2, kTimeLG, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(h2, kTimeLG, expert, !image, !saveCorr) ;
   TProfile * h3 = new TProfile("hHighEmcalRawtime", "High Gain EMC: Time at Max vs towerId;Tower Id;Time [ticks]", 
                               nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
-  Add2RawsList(h3, kTimeHG, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(h3, kTimeHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 
   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are towers)
   TProfile * h4 = new TProfile("hLowEmcalRawMaxMinusMin", "Low Gain EMC: Max - Min vs towerId;Tower Id;Max-Min [ADC counts]", 
@@ -200,120 +338,149 @@ void AliEMCALQADataMakerRec::InitRaws()
   // total counter: channels per event
   TH1I * h6 = new TH1I("hLowNtot", "Low Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200, 0, nTot) ;
   h6->Sumw2() ;
-  Add2RawsList(h6, kNtotLG, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(h6, kNtotLG, expert, !image, !saveCorr) ;
   TH1I * h7 = new TH1I("hHighNtot", "High Gain EMC: Total Number of found towers;# of Towers;Counts", 200,0, nTot) ;
   h7->Sumw2() ;
-  Add2RawsList(h7, kNtotHG, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(h7, kNtotHG, expert, !image, !saveCorr) ;
 
   // pedestal (bins are towers)
   TProfile * h8 = new TProfile("hLowEmcalRawPed", "Low Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]", 
                               nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
-  Add2RawsList(h8, kPedLG, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(h8, kPedLG, expert, !image, !saveCorr) ;
   TProfile * h9 = new TProfile("hHighEmcalRawPed", "High Gain EMC: Pedestal vs towerId;Tower Id;Pedestal [ADC counts]",
                               nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
-  Add2RawsList(h9, kPedHG, expert, image, !saveCorr) ;
-
-  // pedestal rms (standard dev = sqrt of variance estimator for pedestal) (bins are towers)
-  TProfile * h10 = new TProfile("hLowEmcalRawPedRMS", "Low Gain EMC: Pedestal RMS vs towerId;Tower Id;Width [ADC counts]", 
-                               nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
-  Add2RawsList(h10, kPedRMSLG, expert, image, !saveCorr) ;
-  TProfile * h11 = new TProfile("hHighEmcalRawPedRMS", "High Gain EMC: Pedestal RMS vs towerId;Tower Id;Width [ADC counts]",
-                               nTot, -0.5, nTot-0.5) ;
-  Add2RawsList(h11, kPedRMSHG, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(h9, kPedHG, expert, !image, !saveCorr) ;
        
- //number of events per tower, for shifter fast check          
-  TH1I * h12 = new TH1I("hTowerHG", "High Gains on the Tower;Tower", nTot,0, nTot) ;
-  h12->Sumw2() ;
-  Add2RawsList(h12, kTowerHG, !expert, image, !saveCorr) ;
-  TH1I * h13 = new TH1I("hTowerLG", "Low Gains on the Tower;Tower", nTot,0, nTot) ;
-  h13->Sumw2() ;
-  Add2RawsList(h13, kTowerLG, !expert, image, !saveCorr) ;             
-
+  //temp 2D amplitude histogram for the current run
+  fHighEmcHistoH2F = new TH2F("h2DHighEC2", "High Gain EMC:Max - Min [ADC counts]", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
+   fHighEmcHistoH2F->SetDirectory(0) ; // this histo must be memory resident
+  //add ratio histograms: to comapre the current run with the reference data 
+  TH2F * h15 = new TH2F("h2DRatioAmp", "High Gain Ratio to Reference:Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}", nbinsZ, -0.5 , nbinsZ-0.5, 
+                        nbinsPhi, -0.5, nbinsPhi-0.5);
+  //settings for display in amore
+  h15->SetTitle("Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run}"); 
+  h15->SetMaximum(2.0);
+  h15->SetMinimum(0.1);
+  h15->SetOption("COLZ");
+  gStyle->SetOptStat(0);
+  Int_t color[] = {4,3,2} ;
+  gStyle->SetPalette(3,color);
+  h15->GetZaxis()->SetNdivisions(3);
+  h15->UseCurrentStyle();
+  h15->SetDirectory(0);
+  Add2RawsList(h15, k2DRatioAmp, !expert, image, !saveCorr) ;
+
+       TH1F * h16 = new TH1F("hRatioDist", "Amplitude_{current run}/Amplitude_{reference run} ratio distribution", nTot, 0., 2.);
+  h16->SetMinimum(0.1); 
+  h16->SetMaximum(100.);
+  gStyle->SetOptStat(0);
+  h16->UseCurrentStyle();
+  h16->SetDirectory(0);
+  Add2RawsList(h16, kRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
   // now repeat the same for TRU and LEDMon data
-  int nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
+  Int_t nTot2x2 = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // max number of TRU channels for all SuperModules
 
   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
   TProfile * hT0 = new TProfile("hTRUEmcalSupermodules", "TRU EMC: # of TRU channels vs SuperMod;SM Id;# of TRU channels",
                                fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
-  Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hT0, kNsmodTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 
   // where did max sample occur? (bins are TRU channels)
   TProfile * hT1 = new TProfile("hTRUEmcalRawtime", "TRU EMC: Time at Max vs 2x2Id;2x2 Id;Time [ticks]", 
                                nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
-  Add2RawsList(hT1, kTimeTRU, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hT1, kTimeTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 
   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are TRU channels)
   TProfile * hT2 = new TProfile("hTRUEmcalRawMaxMinusMin", "TRU EMC: Max - Min vs 2x2Id;2x2 Id;Max-Min [ADC counts]", 
                                nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
-  Add2RawsList(hT2, kSigTRU, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hT2, kSigTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 
   // total counter: channels per event
   TH1I * hT3 = new TH1I("hTRUNtot", "TRU EMC: Total Number of found TRU channels;# of TRU Channels;Counts", 200, 0, nTot2x2) ;
   hT3->Sumw2() ;
-  Add2RawsList(hT3, kNtotTRU, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hT3, kNtotTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 
   // pedestal (bins are TRU channels)
   TProfile * hT4 = new TProfile("hTRUEmcalRawPed", "TRU EMC: Pedestal vs 2x2Id;2x2 Id;Pedestal [ADC counts]", 
                                nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
-  Add2RawsList(hT4, kPedTRU, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hT4, kPedTRU, expert, !image, !saveCorr) ;
 
-  // pedestal rms (standard dev = sqrt of variance estimator for pedestal) (bins are TRU channels)
-  TProfile * hT5 = new TProfile("hTRUEmcalRawPedRMS", "TRU EMC: Pedestal RMS vs 2x2Id;2x2 Id;Width [ADC counts]", 
-                               nTot2x2, -0.5, nTot2x2-0.5) ;
-  Add2RawsList(hT5, kPedRMSTRU, expert, image, !saveCorr) ;
+  // L0 trigger hits: # of hits (bins are TRU channels)
+  TH1I * hT5 = new TH1I("hTRUEmcalL0hits", "L0 trigger hits: Total number of 2x2 L0 generated", nTot2x2, -0.5, nTot2x2);
+  hT5->Sumw2();
+  Add2RawsList(hT5, kNL0TRU, expert, !image, !saveCorr);
+
+  // L0 trigger hits: average time (bins are TRU channels)
+  TProfile * hT6 = new TProfile("hTRUEmcalL0hitsAvgTime", "L0 trigger hits: average time bin", nTot2x2, -0.5, nTot2x2); 
+  Add2RawsList(hT6, kTimeL0TRU, expert, !image, !saveCorr);
 
   // and also LED Mon..
   // LEDMon has both high and low gain channels, just as regular FEE/towers
-  int nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
+  Int_t nTotLEDMon = fSuperModules * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // max number of LEDMon channels for all SuperModules
 
   // counter info: number of channels per event (bins are SM index)
   TProfile * hL0 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalSupermodules", "LowLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",
                               fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ;
-  Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hL0, kNsmodLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
   TProfile * hL1 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalSupermodules", "HighLEDMon Gain EMC: # of strips vs SuperMod;SM Id;# of strips",  
                               fSuperModules, -0.5, fSuperModules-0.5) ; 
-  Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hL1, kNsmodHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 
   // where did max sample occur? (bins are strips)
   TProfile * hL2 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawtime", "LowLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]", 
                               nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
-  Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hL2, kTimeLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
   TProfile * hL3 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawtime", "HighLEDMon Gain EMC: Time at Max vs stripId;Strip Id;Time [ticks]", 
                               nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
-  Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hL3, kTimeHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 
   // how much above pedestal was the max sample?  (bins are strips)
   TProfile * hL4 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "LowLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]", 
                               nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
-  Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hL4, kSigLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
   TProfile * hL5 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawMaxMinusMin", "HighLEDMon Gain EMC: Max - Min vs stripId;Strip Id;Max-Min [ADC counts]",
                               nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
-  Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
-
-  // total counter: channels per event
+  Add2RawsList(hL5, kSigHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
+  
+    // total counter: channels per event
   TH1I * hL6 = new TH1I("hLowLEDMonNtot", "LowLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200, 0, nTotLEDMon) ;
   hL6->Sumw2() ;
-  Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hL6, kNtotLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
   TH1I * hL7 = new TH1I("hHighLEDMonNtot", "HighLEDMon Gain EMC: Total Number of found strips;# of Strips;Counts", 200,0, nTotLEDMon) ;
   hL7->Sumw2() ;
-  Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hL7, kNtotHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
 
   // pedestal (bins are strips)
   TProfile * hL8 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawPed", "LowLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]", 
                               nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
-  Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hL8, kPedLGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
   TProfile * hL9 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPed", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal vs stripId;Strip Id;Pedestal [ADC counts]",
                               nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
-  Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
-
-  // pedestal rms (standard dev = sqrt of variance estimator for pedestal) (bins are strips)
-  TProfile * hL10 = new TProfile("hLowLEDMonEmcalRawPedRMS", "LowLEDMon Gain EMC: Pedestal RMS vs stripId;Strip Id;Width [ADC counts]", 
-                               nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
-  Add2RawsList(hL10, kPedRMSLGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
-  TProfile * hL11 = new TProfile("hHighLEDMonEmcalRawPedRMS", "HighLEDMon Gain EMC: Pedestal RMS vs stripId;Strip Id;Width [ADC counts]",
-                               nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
-  Add2RawsList(hL11, kPedRMSHGLEDMon, expert, image, !saveCorr) ;
+  Add2RawsList(hL9, kPedHGLEDMon, expert, !image, !saveCorr) ;
+  
+  //add two histograms for shifter from the LED monitor system: comapre LED monitor with the reference run
+  //to be used for decision whether we need to change reference data
+  TH1F * hL10 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatio", "LEDMon amplitude, Ratio to reference run", nTotLEDMon, -0.5, nTotLEDMon-0.5) ;
+  //settings for display in amore
+  hL10->SetTitle("Amplitude_{LEDMon current}/Amplitude_{LEDMon reference}"); 
+  hL10->SetMaximum(2.0);
+  hL10->SetMinimum(0.1); 
+  gStyle->SetOptStat(0);
+  hL10->UseCurrentStyle();
+  hL10->SetDirectory(0);
+//  hL10->SetOption("E");
+  Add2RawsList(hL10, kLEDMonRatio, !expert, image, !saveCorr) ;
+
+  TH1F * hL11 = new TH1F("hMaxMinusMinLEDMonRatioDist", "LEDMon amplitude, Ratio distribution", nTot, 0, 2);
+  hL11->SetMinimum(0.1) ;
+  hL11->SetMaximum(100.);
+  gStyle->SetOptStat(0);
+  hL11->UseCurrentStyle();
+  hL11->SetDirectory(0);
+  Add2RawsList(hL11, kLEDMonRatioDist, !expert, image, !saveCorr) ;
   
+  GetCalibRefFromOCDB() ;   
 }
 
 //____________________________________________________________________________
@@ -345,223 +512,292 @@ void AliEMCALQADataMakerRec::MakeESDs(AliESDEvent * esd)
 void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRaws(AliRawReader* rawReader)
 {
   //Fill prepared histograms with Raw digit properties
+  GetRawsData(kSigHG)->Reset("ICE"); 
+  GetRawsData(kSigHG)->ResetStats();  
+  GetRawsData(kSigLGLEDMon)->Reset("ICE");
+  GetRawsData(kSigLGLEDMon)->ResetStats();
+  
+  // make sure EMCal was readout during the event
+  Int_t emcID = AliDAQ::DetectorID("EMCAL"); // bit 18..
+  const UInt_t *detPattern = rawReader->GetDetectorPattern(); 
+  UInt_t emcInReadout = ( ((1 << emcID) & detPattern[0]) >> emcID);
+  if (! emcInReadout) return; // no poInt_t in looking at this event, if no EMCal data
 
-  //Raw histogram filling not yet implemented
-  //
-  //Need to figure out how to get the info we want without having to
-  //actually run Raw2Digits twice.
-  //I suspect what we actually want is a raw digits method, not a true
-  //emcal raw data method, but this doesn't seem to be allowed in
-  //AliQADataMakerRec.h
-
-  // For now, to avoid redoing the expensive signal fits we just
-  // look at max vs min of the signal spextra, a la online usage in
-  // AliCaloCalibPedestal
-
+  // setup
   rawReader->Reset() ;
   AliCaloRawStreamV3 in(rawReader,"EMCAL"); 
-  rawReader->Select("EMCAL", 0, 43) ; //select EMCAL DDL's 
+  rawReader->Select("EMCAL", 0, AliEMCALGeoParams::fgkLastAltroDDL) ; //select EMCAL DDL's 
 
-  // setup
-  int nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
-  int nRows = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
-  int nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
-  int n2x2PerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
-
-  int sampleMin = 0; 
-  int sampleMax = AliEMCALGeoParams::fgkSampleMax; // 0x3ff = 1023 = 10-bit range
+  AliRecoParam::EventSpecie_t saveSpecie = fEventSpecie ;
 
-  // for the pedestal calculation
-  Bool_t selectPedestalSamples = kTRUE;
+  if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) { 
+    SetEventSpecie(AliRecoParam::kCalib) ;
+  }
+  const Int_t nTowersPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; // number of towers in a SuperModule; 24x48
+  const Int_t nRows        = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; // number of rows per SuperModule
+  const Int_t nStripsPerSM = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALLEDRefs; // number of strips per SuperModule
+  const Int_t n2x2PerSM    = AliEMCALGeoParams::fgkEMCALTRUsPerSM * AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU; // number of TRU 2x2's per SuperModule
+  const Int_t n2x2PerTRU   = AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU;
 
   // SM counters; decl. should be safe, assuming we don't get more than expected SuperModules..
-  int nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
-  int nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
-  int nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
-  int nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
-  int nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
-
-  // indices for the reading
-  int iSM = 0;
-  int sample = 0;
-  int time = 0;
-  // counters, on sample level
-  int i = 0; // the sample number in current event.
-  int maxTime = 0;
-  int startBin = 0;
-
-  // calc. quantities
-  double meanPed = 0, squaredMean = 0, rmsPed = 0;
-
+  Int_t nTotalSMLG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
+  Int_t nTotalSMHG[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]       = {0};
+  Int_t nTotalSMTRU[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules]      = {0};
+  Int_t nTotalSMLGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
+  Int_t nTotalSMHGLEDMon[AliEMCALGeoParams::fgkEMCALModules] = {0};
+
+  const Int_t nTRUL0ChannelBits = 10; // used for L0 trigger bits checks
+  Int_t iSM = 0; // SuperModule index 
   // start loop over input stream  
   while (in.NextDDL()) {
-    int iRCU = in.GetDDLNumber() % 2; // RCU0 or RCU1, within SuperModule
-    while (in.NextChannel()) {
+    Int_t iRCU = in.GetDDLNumber() % 2; // RCU0 or RCU1, within SuperModule
+    fRawAnalyzer->SetIsZeroSuppressed( in.GetZeroSupp() ); 
 
-      // counters
-      int max = sampleMin, min = sampleMax; // min and max sample values
-      int nsamples = 0;
-
-      // for the pedestal calculation
-      int sampleSum = 0; // sum of samples
-      int squaredSampleSum = 0; // sum of samples squared
-      int nSum = 0; // number of samples in sum
-      
-      while (in.NextBunch()) {
-       const UShort_t *sig = in.GetSignals();
-       startBin = in.GetStartTimeBin();
-       nsamples += in.GetBunchLength();
-       for (i = 0; i < in.GetBunchLength(); i++) {
-         sample = sig[i];
-         time = startBin--;
-
-         // check if it's a min or max value
-         if (sample < min) min = sample;
-         if (sample > max) {
-           max = sample;
-           maxTime = time;
+    while (in.NextChannel()) {
+      iSM = in.GetModule(); // SuperModule
+      //prInt_tf("iSM %d DDL %d", iSM, in.GetDDLNumber()); 
+      if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading
+
+       Int_t nsamples = 0;
+       vector<AliCaloBunchInfo> bunchlist; 
+       while (in.NextBunch()) {
+         nsamples += in.GetBunchLength();
+         bunchlist.push_back( AliCaloBunchInfo(in.GetStartTimeBin(), in.GetBunchLength(), in.GetSignals() ) );
+       } 
+       
+       if (nsamples > 0) { // this check is needed for when we have zero-supp. on, but not sparse readout
+         Float_t time = 0.; 
+         Float_t amp  = 0.; 
+         // indices for pedestal calc.
+         Int_t firstPedSample = 0;
+         Int_t lastPedSample  = 0;
+         bool isTRUL0IdData   = false;
+
+         if (! in.IsTRUData() ) { // high gain, low gain, LED Mon data - all have the same shaper/sampling 
+           AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzer->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2()); 
+           amp  = fitResults.GetAmp();
+           time = fitResults.GetTof(); 
+           firstPedSample = fFirstPedestalSample;
+           lastPedSample  = fLastPedestalSample;
          }
-
-         // should we add it for the pedestal calculation?
-         if ( (fFirstPedestalSample<=time && time<=fLastPedestalSample) || // sample time in range
-              !selectPedestalSamples ) { // or we don't restrict the sample range.. - then we'll take all 
-           sampleSum += sample;
-           squaredSampleSum += sample*sample;
-           nSum++;
+         else { // TRU data is special, needs its own analyzer
+           AliCaloFitResults fitResults = fRawAnalyzerTRU->Evaluate( bunchlist, in.GetAltroCFG1(), in.GetAltroCFG2()); 
+           amp  = fitResults.GetAmp();
+           time = fitResults.GetTof(); 
+           firstPedSample = fFirstPedestalSampleTRU;
+           lastPedSample  = fLastPedestalSampleTRU;
+           if (in.GetColumn() > n2x2PerTRU) {
+             isTRUL0IdData = true;
+           }
          }
-         
-       } // loop over samples in bunch
-      } // loop over bunches
-    
-      if (nsamples > 0) { // this check is needed for when we have zero-supp. on, but not sparse readout
-
-      // calculate pedesstal estimate: mean of possibly selected samples
-      if (nSum > 0) {
-       meanPed = sampleSum / (1.0 * nSum);
-       squaredMean = squaredSampleSum / (1.0 * nSum);
-       // The variance (rms squared) is equal to the mean of the squares minus the square of the mean..
-       rmsPed = sqrt(squaredMean - meanPed*meanPed); 
-      }
-      else {
-       meanPed = 0;
-       squaredMean = 0;
-       rmsPed  = 0;
-      }
-
-      // it should be enough to check the SuperModule info for each DDL really, but let's keep it here for now
-      iSM = in.GetModule(); //The modules are numbered starting from 0
-
-      if (iSM>=0 && iSM<fSuperModules) { // valid module reading, can go on with filling
-
-       if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
-         int towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
+  
+         // pedestal samples
+         Int_t nPed = 0;
+         vector<Int_t> pedSamples; 
        
-
-         if ( in.IsLowGain() ) { 
-           //fill the low gain histograms, and counters
-           nTotalSMLG[iSM]++; // one more channel found
-           GetRawsData(kSigLG)->Fill(towerId, max - min);
-           GetRawsData(kTimeLG)->Fill(towerId, maxTime);
-               GetRawsData(kTowerLG)->Fill(towerId);
-           if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
-             GetRawsData(kPedLG)->Fill(towerId, meanPed);
-             GetRawsData(kPedRMSLG)->Fill(towerId, rmsPed);
-           }
-         } // gain==0
-         else if ( in.IsHighGain() ) {         
-           //fill the high gain ones
-           nTotalSMHG[iSM]++; // one more channel found
-           int signal = max - min;
-           // only fill the max-min signal info and maxTime, if the
-           // signal was in the selected range 
-           if ( (signal > fMinSignalHG) && (signal < fMaxSignalHG) ) { 
-             GetRawsData(kSigHG)->Fill(towerId, signal);
-             GetRawsData(kTimeHG)->Fill(towerId, maxTime);
-                 GetRawsData(kTowerHG)->Fill(towerId);
-           } // signal
-           if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
-             GetRawsData(kPedHG)->Fill(towerId, meanPed);
-             GetRawsData(kPedRMSHG)->Fill(towerId, rmsPed);
+         // select earliest bunch 
+         unsigned int bunchIndex = 0;
+         unsigned int startBin = bunchlist.at(0).GetStartBin();
+         if (bunchlist.size() > 0) {
+           for(unsigned int ui=1; ui < bunchlist.size(); ui++ ) {
+             if (startBin > bunchlist.at(ui).GetStartBin() ) {
+               startBin = bunchlist.at(ui).GetStartBin();
+               bunchIndex = ui;
+             }
            }
          }
-       } // low or high gain
-       // TRU
-       else if ( in.IsTRUData() ) {
-         // for TRU data, the mapping class holds the TRU internal 2x2 number (0..95) in the Column var..
-         int iTRU = iRCU; //TRU0 is from RCU0, TRU1 from RCU1
-         if (iRCU>0 && in.GetBranch()>0) iTRU=2; // TRU2 is from branch B on RCU1
-         int TRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + iTRU*AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU 
-           + in.GetColumn();
-
-         //fill the low gain histograms, and counters
-         nTotalSMTRU[iSM]++; // one more channel found
-         GetRawsData(kSigTRU)->Fill(TRU2x2Id, max - min);
-         GetRawsData(kTimeTRU)->Fill(TRU2x2Id, maxTime);
-         if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
-           GetRawsData(kPedTRU)->Fill(TRU2x2Id, meanPed);
-           GetRawsData(kPedRMSTRU)->Fill(TRU2x2Id, rmsPed);
+
+         // check bunch for entries in the pedestal sample range
+         Int_t bunchLength = bunchlist.at(bunchIndex).GetLength(); 
+         const UShort_t *sig = bunchlist.at(bunchIndex).GetData();
+         Int_t timebin = 0;
+
+         if (! isTRUL0IdData) { // regular data, can look at pedestals
+           for (Int_t i = 0; i<bunchLength; i++) {
+             timebin = startBin--;
+             if ( firstPedSample<=timebin && timebin<=lastPedSample ) {
+               pedSamples.push_back( sig[i] );
+               nPed++;
+             }     
+           } // i
          }
-       }
-       // LED Mon
-       else if ( in.IsLEDMonData() ) {
-         // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
-         // and the Strip number in the Column..
-         int gain = in.GetRow(); 
-         int stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
-         
-         if ( gain == 0 ) { 
-           //fill the low gain histograms, and counters
-           nTotalSMLGLEDMon[iSM]++; // one more channel found
-           GetRawsData(kSigLGLEDMon)->Fill(stripId, max - min);
-           GetRawsData(kTimeLGLEDMon)->Fill(stripId, maxTime);
-           if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
-             GetRawsData(kPedLGLEDMon)->Fill(stripId, meanPed);
-             GetRawsData(kPedRMSLGLEDMon)->Fill(stripId, rmsPed);
+         else { // TRU L0 Id Data
+           // which TRU the channel belongs to?
+           Int_t iTRUId = in.GetModule()*3 + (iRCU*in.GetBranch() + iRCU);
+
+           for (Int_t i = 0; i< bunchLength; i++) {
+             for( Int_t j = 0; j < nTRUL0ChannelBits; j++ ){
+               // check if the bit j is 1
+               if( (sig[i] & ( 1 << j )) > 0 ){
+                 Int_t iTRUIdInSM = (in.GetColumn() - n2x2PerTRU)*nTRUL0ChannelBits+j;
+                 if(iTRUIdInSM < n2x2PerTRU) {
+                   Int_t iTRUAbsId = iTRUIdInSM + n2x2PerTRU * iTRUId;
+                   // Fill the histograms
+                   GetRawsData(kNL0TRU)->Fill(iTRUAbsId);
+                   GetRawsData(kTimeL0TRU)->Fill(iTRUAbsId, startBin);
+                 }
+               }
+             }
+             startBin--;
+           } // i      
+         } // TRU L0 Id data                   
+
+         // fill histograms
+         if ( in.IsLowGain() || in.IsHighGain() ) { // regular towers
+           Int_t towerId = iSM*nTowersPerSM + in.GetColumn()*nRows + in.GetRow();
+           if ( in.IsLowGain() ) { 
+             nTotalSMLG[iSM]++; 
+             if ( (amp > fMinSignalLG) && (amp < fMaxSignalLG) ) { 
+               GetRawsData(kSigLG)->Fill(towerId, amp);
+               GetRawsData(kTimeLG)->Fill(towerId, time);
+             }
+             if (nPed > 0) {
+               for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
+                 GetRawsData(kPedLG)->Fill(towerId, pedSamples[i]);
+               }
+             }
+           } // gain==0
+           else if ( in.IsHighGain() ) {               
+             nTotalSMHG[iSM]++; 
+             if ( (amp > fMinSignalHG) && (amp < fMaxSignalHG) ) { 
+               GetRawsData(kSigHG)->Fill(towerId, amp);
+               GetRawsData(kTimeHG)->Fill(towerId, time);
+             } 
+             if (nPed > 0) {
+               for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
+                 GetRawsData(kPedHG)->Fill(towerId, pedSamples[i]);
+               }
+             }
+           } // gain==1
+         } // low or high gain
+         // TRU
+         else if ( in.IsTRUData() && in.GetColumn()<AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU) {
+           // for TRU data, the mapping class holds the TRU Int_ternal 2x2 number (0..95) in the Column var..
+           Int_t iTRU = (iRCU*in.GetBranch() + iRCU); //TRU0 is from RCU0, TRU1 from RCU1, TRU2 is from branch B on RCU1
+           Int_t iTRU2x2Id = iSM*n2x2PerSM + iTRU*AliEMCALGeoParams::fgkEMCAL2x2PerTRU 
+             + in.GetColumn();
+           nTotalSMTRU[iSM]++; 
+           if ( (amp > fMinSignalTRU) && (amp < fMaxSignalTRU) ) { 
+             GetRawsData(kSigTRU)->Fill(iTRU2x2Id, amp);
+             GetRawsData(kTimeTRU)->Fill(iTRU2x2Id, time);
            }
-         } // gain==0
-         else if ( gain == 1 ) {               
-           //fill the high gain ones
-           nTotalSMHGLEDMon[iSM]++; // one more channel found
-           GetRawsData(kSigHGLEDMon)->Fill(stripId, max - min);
-           GetRawsData(kTimeHGLEDMon)->Fill(stripId, maxTime);
-           if (nSum>0) { // only fill pedestal info in case it could be calculated
-             GetRawsData(kPedHGLEDMon)->Fill(stripId, meanPed);
-             GetRawsData(kPedRMSHGLEDMon)->Fill(stripId, rmsPed);
+           if (nPed > 0) {
+             for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
+               GetRawsData(kPedTRU)->Fill(iTRU2x2Id, pedSamples[i]);
+             }
            }
-         } // low or high gain
-       } // LEDMon
-
-      } // SM index OK
+         }
+         // LED Mon
+         else if ( in.IsLEDMonData() ) {
+           // for LED Mon data, the mapping class holds the gain info in the Row variable
+           // and the Strip number in the Column..
+           Int_t gain = in.GetRow(); 
+           Int_t stripId = iSM*nStripsPerSM + in.GetColumn();
+         
+           if ( gain == 0 ) { 
+             nTotalSMLGLEDMon[iSM]++; 
+             if ( (amp > fMinSignalLGLEDMon) && (amp < fMaxSignalLGLEDMon) ) { 
+               GetRawsData(kSigLGLEDMon)->Fill(stripId, amp);
+               GetRawsData(kTimeLGLEDMon)->Fill(stripId, time);
+             }
+             if (nPed > 0) {
+               for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
+                 GetRawsData(kPedLGLEDMon)->Fill(stripId, pedSamples[i]);
+               }
+             }
+           } // gain==0
+           else if ( gain == 1 ) {             
+             nTotalSMHGLEDMon[iSM]++; 
+             if ( (amp > fMinSignalHGLEDMon) && (amp < fMaxSignalHGLEDMon) ) { 
+               GetRawsData(kSigHGLEDMon)->Fill(stripId, amp);
+               GetRawsData(kTimeHGLEDMon)->Fill(stripId, time);
+             }
+             if (nPed > 0) {
+               for (Int_t i=0; i<nPed; i++) {
+                 GetRawsData(kPedHGLEDMon)->Fill(stripId, pedSamples[i]);
+               }
+             }
+           } // low or high gain
+         } // LEDMon
+
+       } // SM index OK
 
       } // nsamples>0 check, some data found for this channel; not only trailer/header
     }// end while over channel 
    
   }//end while over DDL's, of input stream 
 
+ // TProfile * p = dynamic_cast<TProfile *>(GetRawsData(kSigHG)) ;
+  ConvertProfile2H(dynamic_cast<TProfile *>(GetRawsData(kSigHG)), fHighEmcHistoH2F) ;  
+  Double_t binContent = 0. ;
+  
+  //reset histograms
+  GetRawsData(k2DRatioAmp)->Reset("ICE"); 
+  GetRawsData(kRatioDist)->Reset("ICE"); 
+  GetRawsData(kLEDMonRatio)->Reset("ICE");     
+  GetRawsData(kLEDMonRatioDist)->Reset("ICE");
+  GetRawsData(k2DRatioAmp)->ResetStats(); 
+  GetRawsData(kRatioDist)->ResetStats();
+  GetRawsData(kLEDMonRatio)->ResetStats();
+  GetRawsData(kLEDMonRatioDist)->ResetStats();
+  
+  //calculate the ratio of the amplitude and fill the histograms, only if the events type is Calib
+ if (rawReader->GetType() == AliRawEventHeaderBase::kCalibrationEvent) { 
+      for(Int_t ix = 1; ix <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsX(); ix++) {
+       for(Int_t iy = 1; iy <= fHighEmcHistoH2F->GetNbinsY(); iy++) {
+         if(fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy))binContent = fHighEmcHistoH2F->GetBinContent(ix, iy)/fCalibRefHistoH2F->GetBinContent(ix, iy) ;
+         GetRawsData(k2DRatioAmp)->SetBinContent(ix, iy, binContent);
+         GetRawsData(kRatioDist)->Fill(GetRawsData(k2DRatioAmp)->GetBinContent(ix, iy));
+       }
+     } 
+   
+ }
+  //Now for LED monitor system, to calculate the ratio as well
+  Double_t binError = 0. ;
+  
+  for(int ib = 1; ib <= fLEDMonRefHistoPro->GetNbinsX(); ib++) {
+    
+    if(fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib) != 0) binContent = GetRawsData(kSigLGLEDMon)->GetBinContent(ib) / fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib);
+    else binContent = 0;
+    GetRawsData(kLEDMonRatio)->SetBinContent(ib, binContent);
+    
+    binError = GetRawsData(kSigLGLEDMon)->GetBinError(ib)/fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib) +
+    GetRawsData(kSigLGLEDMon)->GetBinContent(ib)/TMath::Power(fLEDMonRefHistoPro->GetBinContent(ib), 2)*fLEDMonRefHistoPro->GetBinError(ib);
+    GetRawsData(kLEDMonRatio)->SetBinError(ib, binError);
+    GetRawsData(kLEDMonRatioDist)->Fill(GetRawsData(kLEDMonRatio)->GetBinContent(ib));
+    }
+  
+  
+  
+  
   // let's also fill the SM and event counter histograms
-  int nTotalHG = 0;
-  int nTotalLG = 0;
-  int nTotalTRU = 0;
-  int nTotalHGLEDMon = 0;
-  int nTotalLGLEDMon = 0;
+  Int_t nTotalHG = 0;
+  Int_t nTotalLG = 0;
+  Int_t nTotalTRU = 0;
+  Int_t nTotalHGLEDMon = 0;
+  Int_t nTotalLGLEDMon = 0;
   for (iSM=0; iSM<fSuperModules; iSM++) {  
     nTotalLG += nTotalSMLG[iSM]; 
     nTotalHG += nTotalSMHG[iSM]; 
     nTotalTRU += nTotalSMTRU[iSM]; 
-    nTotalLG += nTotalSMLGLEDMon[iSM]; 
-    nTotalHG += nTotalSMHGLEDMon[iSM]; 
+    nTotalLGLEDMon += nTotalSMLGLEDMon[iSM]; 
+    nTotalHGLEDMon += nTotalSMHGLEDMon[iSM]; 
     GetRawsData(kNsmodLG)->Fill(iSM, nTotalSMLG[iSM]); 
     GetRawsData(kNsmodHG)->Fill(iSM, nTotalSMHG[iSM]); 
     GetRawsData(kNsmodTRU)->Fill(iSM, nTotalSMTRU[iSM]); 
     GetRawsData(kNsmodLGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMLGLEDMon[iSM]); 
     GetRawsData(kNsmodHGLEDMon)->Fill(iSM, nTotalSMHGLEDMon[iSM]); 
   }
+  
   GetRawsData(kNtotLG)->Fill(nTotalLG);
   GetRawsData(kNtotHG)->Fill(nTotalHG);
   GetRawsData(kNtotTRU)->Fill(nTotalTRU);
   GetRawsData(kNtotLGLEDMon)->Fill(nTotalLGLEDMon);
   GetRawsData(kNtotHGLEDMon)->Fill(nTotalHGLEDMon);
 
+  SetEventSpecie(saveSpecie) ; 
   // just in case the next rawreader consumer forgets to reset; let's do it here again..
   rawReader->Reset() ;
 
@@ -577,7 +813,7 @@ void AliEMCALQADataMakerRec::MakeDigits()
   TIter next(fDigitsArray) ; 
   AliEMCALDigit * digit ; 
   while ( (digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(next())) ) {
-    GetDigitsData(0)->Fill( digit->GetAmp()) ;
+    GetDigitsData(0)->Fill( digit->GetAmplitude()) ;
   }  
   
 }
@@ -612,19 +848,19 @@ void AliEMCALQADataMakerRec::MakeRecPoints(TTree * clustersTree)
     return;
   }
   
-  TObjArray * emcrecpoints = new TObjArray(100) ;
-  emcbranch->SetAddress(&emcrecpoints);
+  TObjArray * emcRecPoints = new TObjArray(100) ;
+  emcbranch->SetAddress(&emcRecPoints);
   emcbranch->GetEntry(0);
   
-  GetRecPointsData(kRecPM)->Fill(emcrecpoints->GetEntriesFast()) ; 
-  TIter next(emcrecpoints) ; 
+  GetRecPointsData(kRecPM)->Fill(emcRecPoints->GetEntriesFast()) ; 
+  TIter next(emcRecPoints) ; 
   AliEMCALRecPoint * rp ; 
   while ( (rp = dynamic_cast<AliEMCALRecPoint *>(next())) ) {
-    GetRecPointsData(kRecPE)->Fill( rp->GetEnergy()) ;
+    GetRecPointsData(kRecPE)->Fill(rp->GetEnergy()) ;
     GetRecPointsData(kRecPDigM)->Fill(rp->GetMultiplicity());
   }
-  emcrecpoints->Delete();
-  delete emcrecpoints;
+  emcRecPoints->Delete();
+  delete emcRecPoints;
   
 }
 
@@ -635,3 +871,93 @@ void AliEMCALQADataMakerRec::StartOfDetectorCycle()
   
 }
 
+//____________________________________________________________________________ 
+void AliEMCALQADataMakerRec::SetFittingAlgorithm(Int_t fitAlgo)              
+{
+  //Set fitting algorithm and initialize it if this same algorithm was not set before.
+  //printf("**** Set Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
+  
+  if(fitAlgo == fFittingAlgorithm && fRawAnalyzer) {
+    //Do nothing, this same algorithm already set before.
+    //printf("**** Algorithm already set before, number %d, %s ****\n",fitAlgo, fRawAnalyzer->GetName());
+    return;
+  }
+  //Initialize the requested algorithm
+  if(fitAlgo != fFittingAlgorithm || !fRawAnalyzer) {
+    //printf("**** Init Algorithm , number %d ****\n",fitAlgo);
+               
+    fFittingAlgorithm = fitAlgo; 
+    if (fRawAnalyzer) delete fRawAnalyzer;  // delete prev. analyzer if existed.
+               
+    if (fitAlgo == kFastFit) {
+      fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerFastFit();
+    }
+    else if (fitAlgo == kNeuralNet) {
+      fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerNN();
+    }
+    else if (fitAlgo == kLMS) {
+      fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerLMS();
+    }
+    else if (fitAlgo == kPeakFinder) {
+      fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerPeakFinder();
+    }
+    else if (fitAlgo == kCrude) {
+      fRawAnalyzer = new AliCaloRawAnalyzerCrude();
+    }
+    else {
+      AliWarning("EMCAL QA invalid fit algorithm choice") ; 
+    }
+
+  }
+  return;
+}
+
+//_____________________________________________________________________________________
+void AliEMCALQADataMakerRec::ConvertProfile2H(TProfile * p, TH2 * histo) 
+{  
+  // set some histogram defaults
+  //histo->Reset() ; 
+  //histo->SetStats(kFALSE); // no statistics box shown
+  Int_t nbinsProf = p->GetNbinsX();
+  
+  // loop through the TProfile p and fill the TH2F histo 
+  Int_t row = 0;
+  Int_t col = 0;
+  Double_t binContent = 0;
+  Int_t towerNum = 0; // global tower Id
+  //  i = 0; // tower Id within SuperModule
+  Int_t iSM = 0; // SuperModule index 
+  Int_t iSMSide = 0; // 0=A, 1=C side
+  Int_t iSMSector = 0; // 2 SM's per sector
+  
+  // indices for 2D plots
+  Int_t col2d = 0;
+  Int_t row2d = 0;
+  
+  for (Int_t ibin = 1; ibin <= nbinsProf; ibin++) {
+    towerNum = (Int_t) p->GetBinCenter(ibin);
+    binContent = p->GetBinContent(ibin);
+    
+    // figure out what the tower indices are: col, row within a SuperModule
+    iSM = towerNum/(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
+    col = (towerNum/AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows) % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols);
+    row = towerNum % (AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows);
+    
+    //DecodeTowerNum(towerNum, &SM, &col, &row);
+    // then we calculate what the global 2D coord are, based on which SM 
+    // we are in
+    iSMSector = iSM / 2;
+    iSMSide = iSM % 2;
+    
+    if (iSMSide == 1) { // C side, shown to the right
+      col2d = col + AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
+    }
+    else { // A side, shown to the left 
+      col2d = col; 
+    }
+    
+    row2d = row + iSMSector * AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows;
+    
+    histo->SetBinContent(col2d+1, row2d+1, binContent);
+  }
+}