add getter for the array with digits and initialization inside, just for analysis...
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALRecPoint.cxx
index 88ef2a9..351be08 100644 (file)
  **************************************************************************/
 /* $Id$ */
 //_________________________________________________________________________
-//  Base Class for EMCAL Reconstructed Points  
-//  Why should I put meaningless comments
-//  just to satisfy
-//  the code checker                
-//*-- Author: Gines Martinez (SUBATECH)
+//  Reconstructed Points for the EMCAL
+//  A RecPoint is a cluster of digits
+//  
+//  
+//*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)
+//*-- Author: Dmitri Peressounko (RRC KI & SUBATECH)
+//*-- Author: Heather Gray (LBL) merged AliEMCALRecPoint and AliEMCALTowerRecPoint 02/04
 
 // --- ROOT system ---
 #include "TPad.h"
+#include "TGraph.h"
+#include "TPaveText.h"
 #include "TClonesArray.h"
+#include "TMath.h"
+#include "TGeoMatrix.h"
+#include "TGeoManager.h"
+#include "TGeoPhysicalNode.h"
+#include "TRandom.h"
 
 // --- Standard library ---
+#include <Riostream.h>
 
 // --- AliRoot header files ---
-
+//#include "AliGenerator.h"
+class AliGenerator;
+class AliEMCAL;
+#include "AliLog.h"
+#include "AliGeomManager.h"
 #include "AliEMCALGeometry.h"
+#include "AliEMCALHit.h"
 #include "AliEMCALDigit.h"
 #include "AliEMCALRecPoint.h"
-#include "AliEMCALGetter.h"
+#include "AliCaloCalibPedestal.h"
+#include "AliEMCALGeoParams.h"
 
 ClassImp(AliEMCALRecPoint)
 
-
 //____________________________________________________________________________
 AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint()
-  : AliRecPoint()
+  : AliCluster(), fGeomPtr(0),
+    fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
+    fGlobPos(0,0,0),fLocPos(0,0,0), 
+    fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(200),
+    fMulTrack(0), fDigitsList(0), fTracksList(0),
+    fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
+    fEnergyList(0), fAbsIdList(0),
+    fTime(0.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),  //HG check this 
+    fDETracksList(0), fMulParent(0), fMaxParent(0),
+    fParentsList(0), fDEParentsList(0), fSuperModuleNumber(0),
+    fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1), fSharedCluster(kFALSE)
 {
   // ctor
+  fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
+  
+  fLambda[0] = 0;
+  fLambda[1] = 0;
 
-  fMaxTrack = 0 ;
-  fTheta = fPhi = 0. ; 
-  fEMCALArm = 0;
-  fPRESection = fECASection = fHCASection = kFALSE ; 
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const char * opt) : AliRecPoint(opt)
+AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const char *) 
+  : AliCluster(), fGeomPtr(0),
+    fAmp(0), fIndexInList(-1), //to be set when the point is already stored
+    fGlobPos(0,0,0), fLocPos(0,0,0),
+    fMaxDigit(100), fMulDigit(0), fMaxTrack(1000), fMulTrack(0),
+    fDigitsList(new Int_t[fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[fMaxTrack]),
+    fClusterType(-1), fCoreEnergy(0), fDispersion(0),
+    fEnergyList(new Float_t[fMaxDigit]), 
+    fAbsIdList(new Int_t[fMaxDigit]), fTime(-1.), fNExMax(0), fCoreRadius(10),
+    fDETracksList(new Float_t[fMaxTrack]), fMulParent(0), fMaxParent(1000),
+    fParentsList(new Int_t[fMaxParent]), fDEParentsList(new Float_t[fMaxParent]),
+    fSuperModuleNumber(0), fDigitIndMax(-1), fDistToBadTower(-1),fSharedCluster(kFALSE)
 {
   // ctor
+  for (Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++)
+    fDETracksList[i] = 0;
+  for (Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
+    fParentsList[i] = -1;
+    fDEParentsList[i] = 0;
+  }
+
+  fGeomPtr = AliEMCALGeometry::GetInstance();
+  fLambda[0] = 0;
+  fLambda[1] = 0;
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+AliEMCALRecPoint::AliEMCALRecPoint(const AliEMCALRecPoint & rp) 
+  : AliCluster(rp), fGeomPtr(rp.fGeomPtr),
+    fAmp(rp.fAmp), fIndexInList(rp.fIndexInList),
+    fGlobPos(rp.fGlobPos),fLocPos(rp.fLocPos),
+    fMaxDigit(rp.fMaxDigit), fMulDigit(rp.fMulDigit),
+    fMaxTrack(rp.fMaxTrack), fMulTrack(rp.fMaxTrack),
+    fDigitsList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTracksList(new Int_t[rp.fMaxTrack]),
+    fClusterType(rp.fClusterType), fCoreEnergy(rp.fCoreEnergy), 
+    fDispersion(rp.fDispersion),
+    fEnergyList(new Float_t[rp.fMaxDigit]),  
+    fAbsIdList(new Int_t[rp.fMaxDigit]), fTime(rp.fTime), fNExMax(rp.fNExMax),fCoreRadius(rp.fCoreRadius),
+    fDETracksList(new Float_t[rp.fMaxTrack]), fMulParent(rp.fMulParent), 
+    fMaxParent(rp.fMaxParent), fParentsList(new Int_t[rp.fMaxParent]), 
+    fDEParentsList(new Float_t[rp.fMaxParent]),
+    fSuperModuleNumber(rp.fSuperModuleNumber), fDigitIndMax(rp.fDigitIndMax), 
+    fDistToBadTower(rp.fDistToBadTower), fSharedCluster(rp.fSharedCluster)
+{
+  //copy ctor
+  fLambda[0] = rp.fLambda[0];
+  fLambda[1] = rp.fLambda[1];
+
+  for(Int_t i = 0; i < rp.fMulDigit; i++) {
+    fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
+    fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
+  }
+
+  for(Int_t i = 0; i < rp.fMulTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
+
+  for(Int_t i = 0; i < rp.fMulParent; i++) {
+    fParentsList[i] = rp.fParentsList[i];
+    fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
+  }
+
+}
+//____________________________________________________________________________
+AliEMCALRecPoint::~AliEMCALRecPoint()
+{
+  // dtor
+  if ( fEnergyList )
+    delete[] fEnergyList ; 
+  if ( fAbsIdList )
+    delete[] fAbsIdList ; 
+   if ( fDETracksList)
+    delete[] fDETracksList;
+   if ( fParentsList)
+    delete[] fParentsList;
+   if ( fDEParentsList)
+    delete[] fDEParentsList;
+       
+   delete [] fDigitsList ;
+   delete [] fTracksList ;
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+AliEMCALRecPoint& AliEMCALRecPoint::operator= (const AliEMCALRecPoint &rp)
+{
+  // assignment operator
+
+  if(&rp == this) return *this;
+
+  fGeomPtr     = rp.fGeomPtr;
+  fAmp         = rp.fAmp;
+  fIndexInList = rp.fIndexInList;
+  fGlobPos     = rp.fGlobPos;
+  fLocPos      = rp.fLocPos;
+  fMaxDigit    = rp.fMaxDigit;
+  fMulDigit    = rp.fMulDigit;
+  fMaxTrack    = rp.fMaxTrack;
+  fMulTrack    = rp.fMulTrack;
+  
+  if(fDigitsList) delete [] fDigitsList;
+  fDigitsList = new Int_t[rp.fMaxDigit];
+  if(fTracksList) delete [] fTracksList;
+  fTracksList = new Int_t[rp.fMaxTrack];
+  for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) fDigitsList[i] = rp.fDigitsList[i];
+  for(Int_t i = 0; i<fMaxTrack; i++) fTracksList[i] = rp.fTracksList[i];
+  
+  fClusterType = rp.fClusterType;
+  fCoreEnergy  = rp.fCoreEnergy; 
+  fDispersion  = rp.fDispersion;
+  
+  
+  if(fEnergyList) delete [] fEnergyList;
+  fEnergyList = new Float_t[rp.fMaxDigit];
+  if(fAbsIdList) delete [] fAbsIdList;
+  fAbsIdList = new Int_t[rp.fMaxDigit];  
+  for(Int_t i = 0; i<fMaxDigit; i++) {
+    fEnergyList[i] = rp.fEnergyList[i];
+    fAbsIdList[i]  = rp.fAbsIdList[i];
+  }
+  
+  fTime       = rp.fTime;
+  fNExMax     = rp.fNExMax;
+  fCoreRadius = rp.fCoreRadius;
   
-  fMaxTrack = 200 ;
-  fTheta = fPhi = 0. ; 
-  fEMCALArm = 1;
+  if(fDETracksList) delete [] fDETracksList;
+  fDETracksList = new Float_t[rp.fMaxTrack];
+  for(Int_t i = 0; i < fMaxTrack; i++) fDETracksList[i] = rp.fDETracksList[i];
+
+  fMulParent = rp.fMulParent;
+  fMaxParent = rp.fMaxParent;
+  
+  if(fParentsList) delete [] fParentsList;
+  fParentsList = new Int_t[rp.fMaxParent];
+  if(fDEParentsList) delete [] fDEParentsList;
+  fDEParentsList = new Float_t[rp.fMaxParent];
+  for(Int_t i = 0; i < fMaxParent; i++) {
+    fParentsList[i]   = rp.fParentsList[i]; 
+    fDEParentsList[i] = rp.fDEParentsList[i];
+  }
   
+  fSuperModuleNumber = rp.fSuperModuleNumber;
+  fDigitIndMax       = rp.fDigitIndMax;
+
+  fLambda[0] = rp.fLambda[0];
+  fLambda[1] = rp.fLambda[1];
+       
+  fDistToBadTower = rp.fDistToBadTower;
+  fSharedCluster  = rp.fSharedCluster;
+       
+  return *this;
+
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-Int_t AliEMCALRecPoint::DistancetoPrimitive(Int_t px, Int_t py)
+void AliEMCALRecPoint::AddDigit(AliEMCALDigit & digit, const Float_t energy, const Bool_t shared)
+{
+  // Adds a digit to the RecPoint
+  // and accumulates the total amplitude and the multiplicity 
+  
+  if(fEnergyList == 0)
+    fEnergyList =  new Float_t[fMaxDigit]; 
+  if(fAbsIdList == 0) {
+    fAbsIdList  =  new Int_t  [fMaxDigit];
+  }
+
+  if ( fMulDigit >= fMaxDigit ) { // increase the size of the lists 
+    fMaxDigit*=2 ; 
+    Int_t   * tempo   = new Int_t  [fMaxDigit]; 
+    Float_t * tempoE  = new Float_t[fMaxDigit];
+    Int_t   * tempoId = new Int_t  [fMaxDigit]; 
+
+    Int_t index ;     
+    for ( index = 0 ; index < fMulDigit ; index++ ){
+      tempo  [index] = fDigitsList[index] ;
+      tempoE [index] = fEnergyList[index] ; 
+      tempoId[index] = fAbsIdList [index] ; 
+    }
+    
+    delete [] fDigitsList ;
+    delete [] fEnergyList ;
+    delete [] fAbsIdList ;
+
+    fDigitsList = tempo;
+    fEnergyList = tempoE; 
+    fAbsIdList  = tempoId;
+  } // if
+  
+  fDigitsList[fMulDigit]   = digit.GetIndexInList()  ; 
+  fEnergyList[fMulDigit]   = energy ;
+  fAbsIdList [fMulDigit]   = digit.GetId();
+  fMulDigit++ ; 
+  fAmp += energy ; 
+       
+  if(shared) fSharedCluster = kTRUE;
+}
+//____________________________________________________________________________
+Bool_t AliEMCALRecPoint::AreNeighbours(AliEMCALDigit * digit1, AliEMCALDigit * digit2 ) const
 {
-  // Compute distance from point px,py to  a AliEMCALRecPoint considered as a Tmarker
-  // Compute the closest distance of approach from point px,py to this marker.
-  // The distance is computed in pixels units.
+  // Tells if (true) or not (false) two digits are neighbours
+  // A neighbour is defined as being two digits which share a corner
+  // ONLY USED IN CASE OF UNFOLDING 
+       
+  Bool_t areNeighbours = kFALSE ;
+  Int_t nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
+  Int_t nSupMod1=0, nModule1=0, nIphi1=0, nIeta1=0;
+  Int_t relid1[2] , relid2[2] ; // ieta, iphi
+  Int_t rowdiff=0, coldiff=0;
+
+  areNeighbours = kFALSE ;
+
+  fGeomPtr->GetCellIndex(digit1->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
+  fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, relid1[0],relid1[1]);
+
+  fGeomPtr->GetCellIndex(digit2->GetId(), nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1);
+  fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod1,nModule1,nIphi1,nIeta1, relid2[0],relid2[1]);
+  
+  // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2-1
+  // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
+  if(fSharedCluster){
+    if(nSupMod1%2) relid1[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
+    else           relid2[1]+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
+  }
+       
+  rowdiff = TMath::Abs( relid1[0] - relid2[0] ) ;  
+  coldiff = TMath::Abs( relid1[1] - relid2[1] ) ;  
 
-  TVector3 pos(0.,0.,0.) ;
-  GetLocalPosition( pos) ;
-  Float_t x =  pos.X() ;
-  Float_t y =  pos.Z() ;
-  const Int_t kMaxDiff = 10;
-  Int_t pxm  = gPad->XtoAbsPixel(x);
-  Int_t pym  = gPad->YtoAbsPixel(y);
-  Int_t dist = (px-pxm)*(px-pxm) + (py-pym)*(py-pym);
+  if (( coldiff <= 1 )  && ( rowdiff <= 1 ) && (coldiff + rowdiff > 0)) 
+  areNeighbours = kTRUE ;
   
-  if (dist > kMaxDiff) return 9999;
-  return dist;
+  return areNeighbours;
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+Int_t AliEMCALRecPoint::Compare(const TObject * obj) const
+{
+  // Compares two RecPoints according to their position in the EMCAL modules
+
+  Float_t delta = 1 ; //Width of "Sorting row". 
+       
+  Int_t rv = 2 ; 
+
+  AliEMCALRecPoint * clu = (AliEMCALRecPoint *)obj ; 
+
+  TVector3 locpos1; 
+  GetLocalPosition(locpos1);
+  TVector3 locpos2;  
+  clu->GetLocalPosition(locpos2);  
+
+  Int_t rowdif = (Int_t)(TMath::Ceil(locpos1.X()/delta)-TMath::Ceil(locpos2.X()/delta)) ;
+  if (rowdif> 0) 
+    rv = 1 ;
+  else if(rowdif < 0) 
+    rv = -1 ;
+  else if(locpos1.Y()>locpos2.Y()) 
+    rv = -1 ;
+  else 
+    rv = 1 ; 
+
+  return rv ; 
 }
 
 //___________________________________________________________________________
@@ -87,185 +342,954 @@ Int_t AliEMCALRecPoint::DistancetoPrimitive(Int_t px, Int_t py)
    AppendPad(option);
  }
 
-//______________________________________________________________________________
-void AliEMCALRecPoint::ExecuteEvent(Int_t event, Int_t px, Int_t py)
+//____________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecPoint::EvalAll(Float_t logWeight,TClonesArray * digits, const Bool_t justClusters) 
 {
-  // Execute action corresponding to one event
-  // This member function is called when a AliEMCALRecPoint is clicked with the locator
-  //
-  // If Left button is clicked on AliEMCALRecPoint, the digits are switched on    
-  // and switched off when the mouse button is released.
+  // Evaluates cluster parameters
+       
+  // First calculate the index of digit with maximum amplitude and get 
+  // the supermodule number where it sits.
+    
+  fDigitIndMax       = GetMaximalEnergyIndex();
+  fSuperModuleNumber = fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(GetAbsIdMaxDigit());
+  
+  //Evaluate global and local position
+  EvalGlobalPosition(logWeight, digits) ;
+  EvalLocalPosition(logWeight, digits) ;
+       
+  //Evaluate shower parameters
+  EvalElipsAxis(logWeight, digits) ;
+  EvalDispersion(logWeight, digits) ;
+
+  //EvalCoreEnergy(logWeight, digits);
+  EvalTime(digits) ;
+  EvalPrimaries(digits) ;
+  EvalParents(digits);
+       
+  //Called last because it sets the global position of the cluster?
+  //Do not call it when recalculating clusters out of standard reconstruction
+  if(!justClusters){ 
+    EvalLocal2TrackingCSTransform();
+  }
+
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+void  AliEMCALRecPoint::EvalDispersion(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
+{
+  // Calculates the dispersion of the shower at the origin of the RecPoint
+  // in cell units - Nov 16,2006
+
+  Double_t d = 0., wtot = 0., w = 0.;
+  Int_t iDigit=0, nstat=0;
+  AliEMCALDigit * digit=0;
+       
+  // Calculates the dispersion in cell units 
+  Double_t etai, phii, etaMean=0.0, phiMean=0.0; 
+  int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
+  int iphi=0, ieta=0;
+  // Calculate mean values
+  for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
+    digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
+
+    if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
+      fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
+      fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
+       
+      // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
+      // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM nSupMod%2=0
+      if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
+               
+      etai=(Double_t)ieta;
+      phii=(Double_t)iphi;
+      w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
+
+      if(w>0.0) {
+        phiMean += phii*w;
+        etaMean += etai*w;
+        wtot    += w;
+      }
+    }
+  }
+  if (wtot>0) {
+    phiMean /= wtot ;
+    etaMean /= wtot ;
+  } else AliError(Form("Wrong weight %f\n", wtot));
+
+  // Calculate dispersion
+  for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
+    digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
+
+    if (fAmp>0 && fEnergyList[iDigit]>0) {
+      fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
+      fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
+               
+      // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
+      // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
+      if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
+      
+      etai=(Double_t)ieta;
+      phii=(Double_t)iphi;
+      w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
+
+      if(w>0.0) {
+        nstat++;
+        d += w*((etai-etaMean)*(etai-etaMean)+(phii-phiMean)*(phii-phiMean));
+      }
+    }
+  }
+  
+  if ( wtot > 0 && nstat>1) d /= wtot ;
+  else                      d = 0. ; 
 
-  //  static Int_t pxold, pyold;
+  fDispersion = TMath::Sqrt(d) ;
+  //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDispersion() : Dispersion %f \n",fDispersion);
+}
 
-  static TGraph *  digitgraph = 0 ;
-  static TPaveText* clustertext = 0 ;
+//____________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels(AliCaloCalibPedestal* caloped)
+{
+  //For each EMC rec. point set the distance to the nearest bad channel.
+  //AliInfo(Form("%d bad channel(s) found.\n", caloped->GetDeadTowerCount()));
+  //It is done in cell units and not in global or local position as before (Sept 2010)
+  
+  if(!caloped->GetDeadTowerCount()) return;
+  
+  //Get channels map of the supermodule where the cluster is.
+  TH2D* hMap  = caloped->GetDeadMap(fSuperModuleNumber);
+  
+  Int_t dRrow, dReta;  
+  Float_t  minDist = 10000.;
+  Float_t  dist    = 0.;
+  Int_t nSupMod, nModule;
+  Int_t nIphi, nIeta;
+  Int_t iphi, ieta;
+  fDigitIndMax  = GetMaximalEnergyIndex();
+  fGeomPtr->GetCellIndex(fAbsIdList[fDigitIndMax], nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
+  fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
   
-  if (!gPad->IsEditable()) return;
+  //Loop on tower status map 
+  for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
+    for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
+      //Check if tower is bad.
+      if(hMap->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
+      //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
+      
+      dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
+      dReta=TMath::Abs(icol-ieta);
+      dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
+      if(dist < minDist) minDist = dist;
+      
+    }
+  }
   
-  switch (event) {
+  //In case the cluster is shared by 2 SuperModules, need to check the map of the second Super Module
+  if (fSharedCluster) {
+    TH2D* hMap2 = 0;
+    Int_t nSupMod2 = -1;
+    
+    //The only possible combinations are (0,1), (2,3) ... (10,11)
+    if(fSuperModuleNumber%2) nSupMod2 = fSuperModuleNumber-1;
+    else                     nSupMod2 = fSuperModuleNumber+1;
+    hMap2  = caloped->GetDeadMap(nSupMod2);
     
+    //Loop on tower status map of second super module
+    for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
+      for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
+       //Check if tower is bad.
+       if(hMap2->GetBinContent(icol,irow)==AliCaloCalibPedestal::kAlive) continue;
+       //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannels() - Bad channel in SM %d, col %d, row %d\n",iSM,icol, irow);
+        dRrow=TMath::Abs(irow-iphi);
+       
+        if(fSuperModuleNumber%2) {
+         dReta=TMath::Abs(icol-(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+ieta));
+       }
+       else {
+        dReta=TMath::Abs(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+icol-ieta);
+       }                    
+        
+       dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dReta*dReta);
+        if(dist < minDist) minDist = dist;        
+
+      }
+    }
     
-  case kButton1Down:{
-    AliEMCALDigit * digit ;
-    AliEMCALGeometry * emcalgeom =  (AliEMCALGetter::Instance())->EMCALGeometry() ;
+  }// shared cluster in 2 SuperModules
+  
+  fDistToBadTower = minDist;
+  //printf("AliEMCALRecPoint::EvalDistanceToBadChannel() - Distance to Bad is %f cm, shared cluster? %d \n",fDistToBadTower,fSharedCluster);
+}
 
-    Int_t iDigit;
-    Int_t relid[4] ;
+
+//____________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
+{
+  // Calculates the center of gravity in the local EMCAL-module coordinates 
+  //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
+  
+  AliEMCALDigit * digit=0;
+  Int_t i=0, nstat=0;
+  
+  Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
+  //Int_t      idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
   
-    const Int_t kMulDigit=AliEMCALRecPoint::GetDigitsMultiplicity() ;
-    Float_t * xi = new Float_t [kMulDigit] ; 
-    Float_t * zi = new Float_t [kMulDigit] ;
+  Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.;
+  
+  //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
+  for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
+    digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
     
-    for(iDigit = 0; iDigit < kMulDigit; iDigit++) {
-      Fatal("AliEMCALRecPoint::ExecuteEvent", " -> Something wrong with the code"); 
-      digit = 0 ; //dynamic_cast<AliEMCALDigit *>((fDigitsList)[iDigit]);
-      emcalgeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
-      emcalgeom->PosInAlice(relid, xi[iDigit], zi[iDigit]) ;
+    if(!digit) {
+      AliError("No Digit!!");
+      continue;
     }
     
-    if (!digitgraph) {
-      digitgraph = new TGraph(fMulDigit,xi,zi);
-      digitgraph-> SetMarkerStyle(5) ; 
-      digitgraph-> SetMarkerSize(1.) ;
-      digitgraph-> SetMarkerColor(1) ;
-      digitgraph-> Draw("P") ;
-    }
-    if (!clustertext) {
-      
-      TVector3 pos(0.,0.,0.) ;
-      GetLocalPosition(pos) ;
-      clustertext = new TPaveText(pos.X()-10,pos.Z()+10,pos.X()+50,pos.Z()+35,"") ;
-      Text_t  line1[40] ;
-      Text_t  line2[40] ;
-      sprintf(line1,"Energy=%1.2f GeV",GetEnergy()) ;
-      sprintf(line2,"%d Digits",GetDigitsMultiplicity()) ;
-      clustertext ->AddText(line1) ;
-      clustertext ->AddText(line2) ;
-      clustertext ->Draw("");
-    }
-    gPad->Update() ; 
-    Print() ;
-    delete[] xi ; 
-    delete[] zi ; 
-   }
-  
-break;
-  
-  case kButton1Up:
-    if (digitgraph) {
-      delete digitgraph  ;
-      digitgraph = 0 ;
+    fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
+    
+    //Temporal patch, due to mapping problem, need to swap "y" in one of the 2 SM, although no effect in position calculation. GCB 05/2010
+    if(fSharedCluster && fSuperModuleNumber != fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId())) xyzi[1]*=-1;
+    
+    //printf("EvalLocalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local x,y,z %f %f %f \n", 
+    //         digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
+    
+    if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
+    else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
+    
+    if(w>0.0) {
+      wtot += w ;
+      nstat++;
+      for(i=0; i<3; i++ ) {
+       clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
+       clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
+      }
     }
-    if (clustertext) {
-      delete clustertext ;
-      clustertext = 0 ;
+  }
+  //  cout << " wtot " << wtot << endl;
+  if ( wtot > 0 ) { 
+    //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
+    for(i=0; i<3; i++ ) {
+      clXYZ[i] /= wtot;
+      if(nstat>1) {
+       clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);  
+       clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
+       if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
+         clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
+       } else      clRmsXYZ[i] = 0;
+      } else        clRmsXYZ[i] = 0;
+    }    
+  } else {
+    for(i=0; i<3; i++ ) {
+      clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
     }
+  }
+  
+  //   // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
+  //   // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
+  //   // Rndm generates a number in ]0,1]
+  //   if (fMulDigit==1) { 
+  //     clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm()); 
+  //     clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm()); 
+  //   }
+  
+  //Set position in local vector
+  fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
+  fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
+  fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
+  
+  if (gDebug==2)
+    printf("EvalLocalPosition Cluster: Local (x,y,z) = (%f,%f,%f) \n", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ; 
+  
+}
+
+
+//____________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecPoint::EvalGlobalPosition(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
+{
+  // Calculates the center of gravity in the global ALICE coordinates 
+  //  Info("Print", " logWeight %f : cluster energy %f ", logWeight, fAmp); // for testing
+  
+  AliEMCALDigit * digit=0;
+  Int_t i=0, nstat=0;
+       
+  Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
+  //Int_t      idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
+       
+  Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, lxyzi[3], xyzi[3], wtot=0., w=0.;
+
+  //printf(" dist : %f  e : %f \n", dist, fAmp);
+  for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
+    digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
+
+    if(!digit) {
+      AliError("No Digit!!");
+      continue;
+    }    
     
-    break;
+    //Get the local coordinates of the cell
+    fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, lxyzi[0], lxyzi[1], lxyzi[2]);
     
+    //Now get the global coordinate
+    fGeomPtr->GetGlobal(lxyzi,xyzi, fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()));
+    //TVector3 pos(xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
+    //printf("EvalGlobalPosition Cell:  Id %i, SM %i : dist %f Local (x,y,z) = (%f %f %f), eta %f, phi%f \n", 
+    //    digit->GetId(), fGeomPtr->GetSuperModuleNumber(digit->GetId()),dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2],pos.Eta(),pos.Phi()*TMath::RadToDeg());
+         
+    if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
+    else  w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
+
+    if(w>0.0) {
+      wtot += w ;
+      nstat++;
+      for(i=0; i<3; i++ ) {
+        clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
+        clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
+      }
+    }
+  }
+  //  cout << " wtot " << wtot << endl;
+  if ( wtot > 0 ) { 
+    //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
+    for(i=0; i<3; i++ ) {
+      clXYZ[i] /= wtot;
+      if(nstat>1) {
+        clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);  
+        clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
+       if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
+          clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
+        } else      clRmsXYZ[i] = 0;
+      } else        clRmsXYZ[i] = 0;
+    }    
+  } else {
+    for(i=0; i<3; i++ ) {
+      clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
+    }
   }
+
+//  // Cluster of one single digit, smear the position to avoid discrete position
+//  // smear x and z with +- 3 cm to uniform (avoid discrete effects). Tower size is approx 6 cm.
+//  // Rndm generates a number in ]0,1]
+//  if (fMulDigit==1) { 
+//    clXYZ[0] += fGeomPtr->GetPhiTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm()); 
+//    clXYZ[2] += fGeomPtr->GetEtaTileSize()*(0.5 - gRandom->Rndm());  
+//  }
+       
+  //Set position in global vector
+  fGlobPos.SetX(clXYZ[0]);
+  fGlobPos.SetY(clXYZ[1]);
+  fGlobPos.SetZ(clXYZ[2]);
+               
+  if (gDebug==2)
+       printf("EvalGlobalPosition Cluster: (x ,y ,z) = (%f,%f,%f), eta %f,phi %f\n", 
+                  fGlobPos.X(), fGlobPos.Y(), fGlobPos.Z(),fGlobPos.Eta(),fGlobPos.Phi()*TMath::RadToDeg()) ; 
 }
+
 //____________________________________________________________________________
-void AliEMCALRecPoint::EvalAll(Float_t logWeight,TClonesArray * digits) 
+void AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFit(Double_t deff, Double_t logWeight, 
+Double_t phiSlope, TClonesArray * digits)
 {
-  //evaluates (if necessary) all RecPoint data members 
+  // Evaluates local position of clusters in SM
+  
+  Double_t ycorr=0;
+  AliEMCALDigit *digit=0;
+  Int_t i=0, nstat=0;
+  Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, clRmsXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.; 
 
-  EvalPrimaries(digits) ;
+  Double_t dist  = TmaxInCm(Double_t(fAmp));
+  //Int_t      idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
+       
+  for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
+    digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(fDigitsList[iDigit])) ;
+    if(digit){
+      dist = deff;
+      //fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
+      fGeomPtr->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), dist, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
+      
+      if(logWeight > 0.0)  w = TMath::Max( 0., logWeight + TMath::Log( fEnergyList[iDigit] / fAmp ));
+      else                 w = fEnergyList[iDigit]; // just energy
+      
+      if(w>0.0) {
+        wtot += w ;
+        nstat++;
+        for(i=0; i<3; i++ ) {
+          clXYZ[i]    += (w*xyzi[i]);
+          clRmsXYZ[i] += (w*xyzi[i]*xyzi[i]);
+        }
+      }
+    }else AliError("Digit null");
+  }//loop
+  //  cout << " wtot " << wtot << endl;
+  if ( wtot > 0 ) { 
+    //    xRMS   = TMath::Sqrt(x2m - xMean*xMean);
+    for(i=0; i<3; i++ ) {
+      clXYZ[i] /= wtot;
+      if(nstat>1) {
+        clRmsXYZ[i] /= (wtot*wtot);  
+        clRmsXYZ[i]  =  clRmsXYZ[i] - clXYZ[i]*clXYZ[i];
+       if(clRmsXYZ[i] > 0.0) {
+          clRmsXYZ[i] =  TMath::Sqrt(clRmsXYZ[i]);
+        } else      clRmsXYZ[i] = 0;
+      } else        clRmsXYZ[i] = 0;
+    }    
+  } else {
+    for(i=0; i<3; i++ ) {
+      clXYZ[i] = clRmsXYZ[i] = -1.;
+    }
+  }
+  // clRmsXYZ[i] ??
+  if(phiSlope != 0.0 && logWeight > 0.0 && wtot) { 
+    // Correction in phi direction (y - coords here); Aug 16;
+    // May be put to global level or seperate method
+    ycorr = clXYZ[1] * (1. + phiSlope);
+    //printf(" y %f : ycorr %f : slope %f \n", clXYZ[1], ycorr, phiSlope); 
+    clXYZ[1] = ycorr;
+  }
+       
+  fLocPos.SetX(clXYZ[0]);
+  fLocPos.SetY(clXYZ[1]);
+  fLocPos.SetZ(clXYZ[2]);
+    
+//  if (gDebug==2)
+//    printf("EvalLocalPosition: eta,phi,r = %f,%f,%f", fLocPos.X(), fLocPos.Y(), fLocPos.Z()) ; 
 }
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliEMCALRecPoint::EvalEMCALArm(AliEMCALDigit * digit) 
+//_____________________________________________________________________________
+Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2(TClonesArray * digits, TArrayD &ed)
+{
+  // Evaluated local position of rec.point using digits 
+  // and parametrisation of w0 and deff
+  //printf(" <I> AliEMCALRecPoint::EvalLocalPosition2() \n"); 
+  return AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(digits, ed, fLocPos);
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
+{
+  // Used when digits should be recalibrated
+  Double_t deff=0, w0=0, esum=0;
+  Int_t iDigit=0;
+  //  AliEMCALDigit *digit;
+
+  if(ed.GetSize() && (digits->GetEntries()!=ed.GetSize())) return kFALSE;
+
+  // Calculate sum energy of digits
+  esum = 0.0;
+  for(iDigit=0; iDigit<ed.GetSize(); iDigit++) esum += ed[iDigit];
+
+  GetDeffW0(esum, deff, w0);
+  
+  return EvalLocalPositionFromDigits(esum, deff, w0, digits, ed, locPos); 
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Bool_t AliEMCALRecPoint::EvalLocalPositionFromDigits(const Double_t esum, const Double_t deff, const Double_t w0, TClonesArray *digits, TArrayD &ed, TVector3 &locPos)
 {
-  // Returns the EMCAL module in which the RecPoint is found
+  //Evaluate position of digits in supermodule.
+  AliEMCALDigit *digit=0;
 
+  Int_t i=0, nstat=0;
+  Double_t clXYZ[3]={0.,0.,0.}, xyzi[3], wtot=0., w=0.; 
+  //Int_t      idMax = GetAbsIdMaxDigit();// idMax is not used at all in RelPosCellInSModule, why use it?
+       
+  // Get pointer to EMCAL geometry
+  // (can't use fGeomPtr in static method)
+  AliEMCALGeometry* geo = AliEMCALGeometry::GetInstance(); 
 
-  if( fEMCALArm == 0){
-  Int_t relid[4] ; 
+  for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
+    digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At(iDigit));
+    if(digit){
+      //geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), idMax, deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
+      geo->RelPosCellInSModule(digit->GetId(), deff, xyzi[0], xyzi[1], xyzi[2]);
+      
+      if(w0 > 0.0)  w = TMath::Max( 0., w0 + TMath::Log(ed[iDigit] / esum));
+      else          w = ed[iDigit]; // just energy
+      
+      if(w>0.0) {
+        wtot += w ;
+        nstat++;
+        for(i=0; i<3; i++ ) {
+          clXYZ[i] += (w*xyzi[i]);
+        }
+      }
+    }else AliError("Digit null");
+  }//loop
+  //  cout << " wtot " << wtot << endl;
+  if (wtot > 0) { 
+    for(i=0; i<3; i++ ) {
+      clXYZ[i] /= wtot;
+    }
+    locPos.SetX(clXYZ[0]);
+    locPos.SetY(clXYZ[1]);
+    locPos.SetZ(clXYZ[2]);
+    return kTRUE;
+  } else {
+    return kFALSE;
+  }
+
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecPoint::GetDeffW0(const Double_t esum , Double_t &deff,  Double_t &w0)
+{
+  //
+  // Aug 31, 2001 
+  // Applied for simulation data with threshold 3 adc
+  // Calculate efective distance (deff) and weigh parameter (w0) 
+  // for coordinate calculation; 0.5 GeV < esum <100 GeV.
+  // Look to:  http://rhic.physics.wayne.edu/~pavlinov/ALICE/SHISHKEBAB/RES/CALIB/GEOMCORR/deffandW0VaEgamma_2.gif
+  //
+  Double_t e=0.0;
+  const  Double_t kdp0=9.25147, kdp1=1.16700; // Hard coded now
+  const  Double_t kwp0=4.83713, kwp1=-2.77970e-01, kwp2 = 4.41116;
+
+  // No extrapolation here
+  e = esum<0.5?0.5:esum;
+  e = e>100.?100.:e;
+
+  deff = kdp0 + kdp1*TMath::Log(e);
+  w0   = kwp0 / (1. + TMath::Exp(kwp1*(e+kwp2)));
+  //printf("<I> AliEMCALRecPoint::GetDeffW0 esum %5.2f : deff %5.2f : w0 %5.2f \n", esum, deff, w0); 
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecPoint::EvalCoreEnergy(Float_t logWeight, TClonesArray * digits)
+{
+  // This function calculates energy in the core, 
+  // i.e. within a radius rad = fCoreEnergy around the center. Beyond this radius
+  // in accordance with shower profile the energy deposition 
+  // should be less than 2%
+  // Unfinished - Nov 15,2006
+  // Distance is calculate in (phi,eta) units
+
+  AliEMCALDigit * digit = 0 ;
+
+  Int_t iDigit=0;
+
+  if (!fLocPos.Mag()) {
+    EvalLocalPosition(logWeight, digits);
+  }
+  
+  Double_t phiPoint = fLocPos.Phi(), etaPoint = fLocPos.Eta();
+  Double_t eta, phi, distance;
+  for(iDigit=0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {
+    digit = (AliEMCALDigit *) ( digits->At(fDigitsList[iDigit]) ) ;
+    
+    eta = phi = 0.0;
+    fGeomPtr->EtaPhiFromIndex(digit->GetId(),eta, phi) ;
+    phi = phi * TMath::DegToRad();
+  
+    distance = TMath::Sqrt((eta-etaPoint)*(eta-etaPoint)+(phi-phiPoint)*(phi-phiPoint));
+    if(distance < fCoreRadius)
+      fCoreEnergy += fEnergyList[iDigit] ;
+  }
   
-  AliEMCALGeometry * emcalgeom = (AliEMCALGetter::Instance())->EMCALGeometry();
+}
+//____________________________________________________________________________
+void  AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis(Float_t logWeight,TClonesArray * digits)
+{
+  // Calculates the axis of the shower ellipsoid in eta and phi
+  // in cell units
+
+  TString gn(fGeomPtr->GetName());
+
+  Double_t wtot = 0.;
+  Double_t x    = 0.;
+  Double_t z    = 0.;
+  Double_t dxx  = 0.;
+  Double_t dzz  = 0.;
+  Double_t dxz  = 0.;
+
+  AliEMCALDigit * digit = 0;
+       
+  Double_t etai =0, phii=0, w=0; 
+  int nSupMod=0, nModule=0, nIphi=0, nIeta=0;
+  int iphi=0, ieta=0;
+  for(Int_t iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
+    digit = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
+    etai = phii = 0.; 
+    // Nov 15,2006 - use cell numbers as coordinates
+    // Copied for shish-kebab geometry, ieta,iphi is cast as double as eta,phi
+    // We can use the eta,phi(or coordinates) of cell
+    nSupMod = nModule = nIphi = nIeta = iphi = ieta = 0;
+
+    fGeomPtr->GetCellIndex(digit->GetId(), nSupMod,nModule,nIphi,nIeta);
+    fGeomPtr->GetCellPhiEtaIndexInSModule(nSupMod,nModule,nIphi,nIeta, iphi,ieta);
+         
+    // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
+    // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
+    if(fSharedCluster && nSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
+    
+    etai=(Double_t)ieta;
+    phii=(Double_t)iphi;
+         
+    w = TMath::Max(0.,logWeight+TMath::Log(fEnergyList[iDigit]/fAmp ) ) ;
+    // fAmp summed amplitude of digits, i.e. energy of recpoint 
+    // Gives smaller value of lambda than log weight  
+    // w = fEnergyList[iDigit] / fAmp; // Nov 16, 2006 - try just energy
+
+    dxx  += w * etai * etai ;
+    x    += w * etai ;
+    dzz  += w * phii * phii ;
+    z    += w * phii ; 
+
+    dxz  += w * etai * phii ; 
+
+    wtot += w ;
+  }
+
+  if ( wtot > 0 ) { 
+    dxx /= wtot ;
+    x   /= wtot ;
+    dxx -= x * x ;
+    dzz /= wtot ;
+    z   /= wtot ;
+    dzz -= z * z ;
+    dxz /= wtot ;
+    dxz -= x * z ;
+
+    fLambda[0] =  0.5 * (dxx + dzz) + TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
+    if(fLambda[0] > 0)
+      fLambda[0] = TMath::Sqrt(fLambda[0]) ;
+    else
+      fLambda[0] = 0;
+    
+    fLambda[1] =  0.5 * (dxx + dzz) - TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz )  ;
 
-  emcalgeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
-  fEMCALArm = relid[0];
+    if(fLambda[1] > 0) //To avoid exception if numerical errors lead to negative lambda.
+      fLambda[1] = TMath::Sqrt(fLambda[1]) ;
+    else
+      fLambda[1]= 0. ;
+  } else { 
+    fLambda[0]= 0. ;
+    fLambda[1]= 0. ;
   }
+
+  //printf("AliEMCALRecPoint::EvalElipsAxis() lambdas  = %f,%f \n", fLambda[0],fLambda[1]) ; 
+
 }
 
 //______________________________________________________________________________
 void  AliEMCALRecPoint::EvalPrimaries(TClonesArray * digits)
 {
-  // Constructs the list of primary particles (tracks) which have contributed to this RecPoint
+  // Constructs the list of primary particles (tracks) which 
+  // have contributed to this RecPoint and calculate deposited energy 
+  // for each track
+    
+  AliEMCALDigit * digit =0;
+  Int_t * primArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
+  memset(primArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
+  Float_t * dEPrimArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
+  memset(dEPrimArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
   
-  AliEMCALDigit * digit ;
-  Int_t * tempo    = new Int_t[fMaxTrack] ;
-
   Int_t index ;  
   for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
     digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ; 
+    if(!digit) {
+      AliError("No Digit!!");
+      continue;
+    }
+    
     Int_t nprimaries = digit->GetNprimary() ;
-    Int_t * newprimaryarray = new Int_t[nprimaries] ;
-    Int_t ii ; 
-    for ( ii = 0 ; ii < nprimaries ; ii++)
-      newprimaryarray[ii] = digit->GetPrimary(ii+1) ; 
-
+    if ( nprimaries == 0 ) continue ;
     Int_t jndex ;
     for ( jndex = 0 ; jndex < nprimaries ; jndex++ ) { // all primaries in digit
       if ( fMulTrack > fMaxTrack ) {
-       fMulTrack = - 1 ;
-       Error("GetNprimaries", "increase fMaxTrack ")  ;
-       break ;
+        fMulTrack = fMaxTrack ;
+        Error("EvalPrimaries", "increase fMaxTrack ")  ;
+        break ;
       }
-      Int_t newprimary = newprimaryarray[jndex] ;
+      Int_t newPrimary = digit->GetPrimary(jndex+1);
+      Float_t dEPrimary = digit->GetDEPrimary(jndex+1);
       Int_t kndex ;
       Bool_t already = kFALSE ;
       for ( kndex = 0 ; kndex < fMulTrack ; kndex++ ) { //check if not already stored
-       if ( newprimary == tempo[kndex] ){
-         already = kTRUE ;
-         break ;
-       }
+        if ( newPrimary == primArray[kndex] ){
+          already = kTRUE ;
+          dEPrimArray[kndex] += dEPrimary; 
+          break ;
+        }
       } // end of check
-      if ( !already) { // store it
-       tempo[fMulTrack] = newprimary ; 
-       fMulTrack++ ;
+      if ( !already && (fMulTrack < fMaxTrack)) { // store it
+        primArray[fMulTrack] = newPrimary ; 
+        dEPrimArray[fMulTrack] = dEPrimary ; 
+        fMulTrack++ ;
       } // store it
     } // all primaries in digit
-    delete newprimaryarray ; 
   } // all digits
+  
+  Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulTrack];
+  TMath::Sort(fMulTrack,dEPrimArray,sortIdx); 
+  for(index = 0; index < fMulTrack; index++) {
+    fTracksList[index] = primArray[sortIdx[index]] ;    
+    fDETracksList[index] = dEPrimArray[sortIdx[index]] ;
+  }
+  delete [] sortIdx;
+  delete [] primArray ;
+  delete [] dEPrimArray ;
+  
+}
 
+//______________________________________________________________________________
+void  AliEMCALRecPoint::EvalParents(TClonesArray * digits)
+{
+  // Constructs the list of parent particles (tracks) which have contributed to this RecPoint
+
+  AliEMCALDigit * digit=0 ;
+  Int_t * parentArray = new Int_t[fMaxTrack] ;
+  memset(parentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
+  Float_t * dEParentArray = new Float_t[fMaxTrack] ;
+  memset(dEParentArray,-1,sizeof(Int_t)*fMaxTrack);
   
-  fTracksList = new Int_t[fMulTrack] ;
-  for(index = 0; index < fMulTrack; index++)
-   fTracksList[index] = tempo[index] ;
-  delete tempo ;
+  Int_t index ;  
+  for ( index = 0 ; index < GetDigitsMultiplicity() ; index++ ) { // all digits
+    if (fDigitsList[index] >= digits->GetEntries() || fDigitsList[index] < 0)
+      AliError(Form("Trying to get invalid digit %d (idx in WriteRecPoint %d)",fDigitsList[index],index));
+    digit = dynamic_cast<AliEMCALDigit *>(digits->At( fDigitsList[index] )) ; 
+    if(!digit) {
+      AliError("No Digit!!");
+      continue;
+    }
+    
+    Int_t nparents = digit->GetNiparent() ;
+    if ( nparents == 0 ) continue ;
+    
+    Int_t jndex ;
+    for ( jndex = 0 ; jndex < nparents ; jndex++ ) { // all primaries in digit
+      if ( fMulParent > fMaxParent ) {
+        fMulTrack = - 1 ;
+        Error("EvalParents", "increase fMaxParent")  ;
+        break ;
+      }
+      Int_t newParent = digit->GetIparent(jndex+1) ;
+      Float_t newdEParent = digit->GetDEParent(jndex+1) ;
+      Int_t kndex ;
+      Bool_t already = kFALSE ;
+      for ( kndex = 0 ; kndex < fMulParent ; kndex++ ) { //check if not already stored
+        if ( newParent == parentArray[kndex] ){
+          dEParentArray[kndex] += newdEParent;
+          already = kTRUE ;
+          break ;
+        }
+      } // end of check
+      if ( !already && (fMulParent < fMaxParent)) { // store it
+        parentArray[fMulParent] = newParent ; 
+        dEParentArray[fMulParent] = newdEParent ; 
+        fMulParent++ ;
+      } // store it
+    } // all parents in digit
+  } // all digits
+  
+  if (fMulParent>0) {
+    Int_t *sortIdx = new Int_t[fMulParent];
+    TMath::Sort(fMulParent,dEParentArray,sortIdx); 
+    for(index = 0; index < fMulParent; index++) {
+      fParentsList[index] = parentArray[sortIdx[index]] ;      
+      fDEParentsList[index] = dEParentArray[sortIdx[index]] ;
+    }
+    delete [] sortIdx;
+  }
+  
+  delete [] parentArray;
+  delete [] dEParentArray;
+}
 
+//____________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecPoint::GetLocalPosition(TVector3 & lpos) const
+{
+  // returns the position of the cluster in the local reference system
+  // of the sub-detector
+  
+  lpos = fLocPos;
 }
 
 //____________________________________________________________________________
 void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos) const
 {
   // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
+  // These are now the Cartesian X, Y and Z
+  //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
+  // fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, fSuperModuleNumber);
+  gpos = fGlobPos;
+       
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+//void AliEMCALRecPoint::GetGlobalPosition(TVector3 & gpos, TMatrixF & gmat) const
+//{
+//  // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
+//  // These are now the Cartesian X, Y and Z
+//  //  cout<<" geom "<<geom<<endl;
+//
+//  //To be implemented
+//  fGeomPtr->GetGlobalEMCAL(this, gpos, gmat);
+//
+//}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecPoint::EvalLocal2TrackingCSTransform()
+{
+  //Evaluates local to "tracking" c.s. transformation (B.P.).
+  //All evaluations should be completed before calling for this
+  //function.                           
+  //See ALICE PPR Chapter 5 p.18 for "tracking" c.s. definition,
+  //or just ask Jouri Belikov. :) 
+
+  SetVolumeId(AliGeomManager::LayerToVolUID(AliGeomManager::kEMCAL,GetSuperModuleNumber()));
+
+  const TGeoHMatrix* tr2loc = GetTracking2LocalMatrix();
+  if(!tr2loc) AliFatal(Form("No Tracking2LocalMatrix found."));
+
+  Double_t lxyz[3] = {fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z()};
+  Double_t txyz[3] = {0,0,0};
+
+  tr2loc->MasterToLocal(lxyz,txyz);
+  SetX(txyz[0]); SetY(txyz[1]); SetZ(txyz[2]);
+
+  if(AliLog::GetGlobalDebugLevel()>0) {
+    TVector3 gpos; //TMatrixF gmat;
+    //GetGlobalPosition(gpos,gmat); //Not doing anythin special, replace by next line. 
+    fGeomPtr->GetGlobal(fLocPos, gpos, GetSuperModuleNumber());
+    
+    Float_t gxyz[3];
+    GetGlobalXYZ(gxyz);
+    AliInfo(Form("lCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), tCS-->(%.3f,%.3f,%.3f), gCS-->(%.3f,%.3f,%.3f),  gCScalc-\
+->(%.3f,%.3f,%.3f), supermodule %d",
+                 fLocPos.X(),fLocPos.Y(),fLocPos.Z(),
+                 GetX(),GetY(),GetZ(),
+                 gpos.X(),gpos.Y(),gpos.Z(),
+                 gxyz[0],gxyz[1],gxyz[2],GetSuperModuleNumber()));
+  }
+
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+Float_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergy(void) const
+{
+  // Finds the maximum energy in the cluster
   
-  AliEMCALGeometry * emcalgeom = AliEMCALGetter::Instance()->EMCALGeometry();  
-  gpos.SetX(fPhi) ;
-  if ( IsInECA() ) 
-    gpos.SetY(emcalgeom->GetIP2ECASection()) ;
-  else if ( IsInPRE() )
-    gpos.SetY(emcalgeom->GetIP2PRESection()) ;
-  else if ( IsInHCA() )
-    gpos.SetY(emcalgeom->GetIP2HCASection()) ;
-  else 
-    Fatal("GetGlobalPosition", "Unexpected tower section") ; 
-  gpos.SetZ(fTheta) ; 
+  Float_t menergy = 0. ;
+
+  Int_t iDigit;
+  for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
+    if(fEnergyList[iDigit] > menergy) 
+      menergy = fEnergyList[iDigit] ;
+  }
+  return menergy ;
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-void AliEMCALRecPoint::GetLocalPosition(TVector3 & lpos) const
+Int_t AliEMCALRecPoint::GetMaximalEnergyIndex(void) const
 {
-  // returns the position of the cluster in the global reference system of ALICE
+  // Finds the maximum energy in the cluster
+  
+  Float_t menergy = 0. ;
+  Int_t mid       = 0  ;
+  Int_t iDigit;
+  
+  for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
+    
+    if(fEnergyList[iDigit] > menergy){ 
+      menergy = fEnergyList[iDigit] ;
+      mid     = iDigit ;
+    }
+  }//loop on cluster digits
+  
+  return mid ;
+}
+
+
+//____________________________________________________________________________
+Int_t AliEMCALRecPoint::GetMultiplicityAtLevel(Float_t H) const
+{
+  // Calculates the multiplicity of digits with energy larger than H*energy 
+  
+  Int_t multipl   = 0 ;
+  Int_t iDigit ;
+  for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) {
+
+    if(fEnergyList[iDigit] > H * fAmp) 
+      multipl++ ;
+  }
+  return multipl ;
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+Int_t  AliEMCALRecPoint::GetNumberOfLocalMax(AliEMCALDigit **  maxAt, Float_t * maxAtEnergy,
+                                              Float_t locMaxCut,TClonesArray * digits) const
+{ 
+  // Calculates the number of local maxima in the cluster using fLocalMaxCut as the minimum
+  // energy difference between two local maxima
+
+  AliEMCALDigit * digit  = 0;
+  AliEMCALDigit * digitN = 0;
+  
+  Int_t iDigitN = 0 ;
+  Int_t iDigit  = 0 ;
+
+  for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++)
+    maxAt[iDigit] = (AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[iDigit])  ;
+  
+  for(iDigit = 0 ; iDigit < fMulDigit; iDigit++) {   
+    if(maxAt[iDigit]) {
+      digit = maxAt[iDigit] ;
+          
+      for(iDigitN = 0; iDigitN < fMulDigit; iDigitN++) {       
+        digitN = (AliEMCALDigit *) digits->At(fDigitsList[iDigitN]) ; 
+       
+       if ( AreNeighbours(digit, digitN) ) {
+         if (fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] ) {    
+           maxAt[iDigitN] = 0 ;
+           // but may be digit too is not local max ?
+           if(fEnergyList[iDigit] < fEnergyList[iDigitN] + locMaxCut) 
+             maxAt[iDigit] = 0 ;
+         }
+         else {
+           maxAt[iDigit] = 0 ;
+           // but may be digitN too is not local max ?
+           if(fEnergyList[iDigit] > fEnergyList[iDigitN] - locMaxCut) 
+             maxAt[iDigitN] = 0 ; 
+         } 
+       } // if Areneighbours
+      } // while digitN
+    } // slot not empty
+  } // while digit
+  
+  iDigitN = 0 ;
+  for(iDigit = 0; iDigit < fMulDigit; iDigit++) { 
+    if(maxAt[iDigit] ){
+      maxAt[iDigitN] = maxAt[iDigit] ;
+      maxAtEnergy[iDigitN] = fEnergyList[iDigit] ;
+      iDigitN++ ; 
+    }
+  }
+  return iDigitN ;
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+Int_t AliEMCALRecPoint::GetPrimaryIndex() const  
+{
+  // Get the primary track index in TreeK which deposits the most energy 
+  // in Digits which forms RecPoint. 
+
+  if (fMulTrack)
+    return fTracksList[0];
+  return -12345;
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecPoint::EvalTime(TClonesArray * digits){
+  // time is set to the time of the digit with the maximum energy
+
+  Float_t maxE  = 0;
+  Int_t   maxAt = 0;
+  for(Int_t idig=0; idig < fMulDigit; idig++){
+    if(fEnergyList[idig] > maxE){
+      maxE  = fEnergyList[idig] ;
+      maxAt = idig;
+    }
+  }
+  fTime = ((AliEMCALDigit*) digits->At(fDigitsList[maxAt]))->GetTime() ;
   
-  lpos.SetX(fLocPos.X()) ;
-  lpos.SetY(fLocPos.Y()) ;
-  lpos.SetZ(fLocPos.Z()) ;
 }
 
 //______________________________________________________________________________
@@ -278,7 +1302,7 @@ void AliEMCALRecPoint::Paint(Option_t *)
   Coord_t x = pos.X()     ;
   Coord_t y = pos.Z()     ;
   Color_t markercolor = 1 ;
-  Size_t  markersize = 1. ;
+  Size_t  markersize  = 1.;
   Style_t markerstyle = 5 ;
   
   if (!gPad->IsBatch()) {
@@ -289,3 +1313,89 @@ void AliEMCALRecPoint::Paint(Option_t *)
   gPad->SetAttMarkerPS(markercolor,markerstyle,markersize) ;
   gPad->PaintPolyMarker(1,&x,&y,"") ;
 }
+
+//_____________________________________________________________________
+Double_t AliEMCALRecPoint::TmaxInCm(const Double_t e , const Int_t key)
+{ 
+  // e energy in GeV)
+  // key  =  0(gamma, default)
+  //     !=  0(electron)
+  const Double_t ca   = 4.82;  // shower max parameter - first guess; ca=TMath::Log(1000./8.07)
+  Double_t tmax = 0.;    // position of electromagnetic shower max in cm
+
+  Double_t x0   = 1.31;  // radiation lenght (cm)
+  //If old geometry in use
+  if(!((fGeomPtr->GetEMCGeometry()->GetGeoName()).Contains("V1"))) x0 = 1.28;
+
+  if(e>0.1) {
+    tmax = TMath::Log(e) + ca;
+    if      (key==0) tmax += 0.5; 
+    else             tmax -= 0.5;
+    tmax *= x0; // convert to cm
+  }
+  return tmax;
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+Float_t AliEMCALRecPoint::EtaToTheta(Float_t arg) const
+{
+  //Converts Theta (Radians) to Eta(Radians)
+  return (2.*TMath::ATan(TMath::Exp(-arg)));
+}
+
+//______________________________________________________________________________
+Float_t AliEMCALRecPoint::ThetaToEta(Float_t arg) const
+{
+  //Converts Eta (Radians) to Theta(Radians)
+  return (-1 * TMath::Log(TMath::Tan(0.5 * arg)));
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecPoint::Print(Option_t *opt) const
+{
+  // Print the list of digits belonging to the cluster
+  if(strlen(opt)==0) return;
+  TString message ; 
+  message  = "AliEMCALRecPoint:\n" ;
+  message +=  " digits # = " ; 
+  AliInfo(message.Data()) ; 
+
+  Int_t iDigit;
+  for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++)
+    printf(" %d ", fDigitsList[iDigit] ) ;  
+  printf("\n");
+
+  AliInfo(" Energies = ") ;
+  for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) 
+    printf(" %f ", fEnergyList[iDigit] ) ;
+  printf("\n");
+
+  AliInfo("\n Abs Ids = ") ;
+  for(iDigit=0; iDigit<fMulDigit; iDigit++) 
+    printf(" %i ", fAbsIdList[iDigit] ) ;
+  printf("\n");
+
+  AliInfo(" Primaries  ") ;
+  for(iDigit = 0;iDigit < fMulTrack; iDigit++)
+    printf(" %d ", fTracksList[iDigit]) ;
+
+  printf("\n Local x %6.2f y %7.2f z %7.1f \n", fLocPos[0], fLocPos[1], fLocPos[2]);
+
+  message  = "       ClusterType     = %d" ;
+  message += "       Multiplicity    = %d" ;
+  message += "       Cluster Energy  = %f" ; 
+  message += "       Core energy     = %f" ; 
+  message += "       Core radius     = %f" ; 
+  message += "       Number of primaries %d" ; 
+  message += "       Stored at position %d" ; 
+  AliInfo(Form(message.Data(), fClusterType, fMulDigit, fAmp, fCoreEnergy, fCoreRadius, fMulTrack, GetIndexInList()) ) ;  
+}
+
+//___________________________________________________________
+Double_t  AliEMCALRecPoint::GetPointEnergy() const
+{
+  //Returns energy ....
+  Double_t e=0.0;
+  for(int ic=0; ic<GetMultiplicity(); ic++) e += double(fEnergyList[ic]);
+  return e;
+}