]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - EMCAL/AliEMCALRecoUtils.cxx
change default max distance R to 0.1
[u/mrichter/AliRoot.git] / EMCAL / AliEMCALRecoUtils.cxx
index db11d254bdad07242237f3705929eadc7b2e724a..705746eb818c95c5ce9ef6cd5cecac91c198ac87 100644 (file)
@@ -13,7 +13,7 @@
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
 
-/* $Id: AliEMCALRecoUtils.cxx 33808 2009-07-15 09:48:08Z gconesab $ */
+/* $Id: AliEMCALRecoUtils.cxx | Sun Dec 8 06:56:48 2013 +0100 | Constantin Loizides  $ */
 
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 //
@@ -42,7 +42,6 @@
 // STEER includes
 #include "AliVCluster.h"
 #include "AliVCaloCells.h"
-#include "AliVEvent.h"
 #include "AliLog.h"
 #include "AliPID.h"
 #include "AliESDEvent.h"
 // EMCAL includes
 #include "AliEMCALRecoUtils.h"
 #include "AliEMCALGeometry.h"
-#include "AliEMCALTrack.h"
-#include "AliEMCALCalibTimeDepCorrection.h" // Run dependent
+#include "AliTrackerBase.h"
 #include "AliEMCALPIDUtils.h"
 
 ClassImp(AliEMCALRecoUtils)
   
-//______________________________________________
+//_____________________________________
 AliEMCALRecoUtils::AliEMCALRecoUtils():
-  fParticleType(kPhoton),                 fPosAlgo(kUnchanged),                   fW0(4.), 
-  fNonLinearityFunction(kNoCorrection),   fNonLinearThreshold(30),
+  fParticleType(0),                       fPosAlgo(0),                            fW0(0), 
+  fNonLinearityFunction(0),               fNonLinearThreshold(0),
   fSmearClusterEnergy(kFALSE),            fRandom(),
   fCellsRecalibrated(kFALSE),             fRecalibration(kFALSE),                 fEMCALRecalibrationFactors(),
-  fTimeRecalibration(kFALSE),             fEMCALTimeRecalibrationFactors(),
-  fUseRunCorrectionFactors(kFALSE),       fRunCorrectionFactorsSet(kFALSE),
+  fTimeRecalibration(kFALSE),             fEMCALTimeRecalibrationFactors(),       fUseRunCorrectionFactors(kFALSE),       
   fRemoveBadChannels(kFALSE),             fRecalDistToBadChannels(kFALSE),        fEMCALBadChannelMap(),
   fNCellsFromEMCALBorder(0),              fNoEMCALBorderAtEta0(kTRUE),
-  fRejectExoticCluster(kFALSE),           fPIDUtils(),                            fAODFilterMask(32),
+  fRejectExoticCluster(kFALSE),           fRejectExoticCells(kFALSE), 
+  fExoticCellFraction(0),                 fExoticCellDiffTime(0),                 fExoticCellMinAmplitude(0),
+  fPIDUtils(),                            fAODFilterMask(0),
+  fAODHybridTracks(0),                    fAODTPCOnlyTracks(0),
   fMatchedTrackIndex(0x0),                fMatchedClusterIndex(0x0), 
-  fResidualEta(0x0), fResidualPhi(0x0),   fCutEtaPhiSum(kTRUE),                   fCutEtaPhiSeparate(kFALSE), 
-  fCutR(0.1),                             fCutEta(0.025),                         fCutPhi(0.05), 
-  fMass(0.139),                           fStep(10),
-  fTrackCutsType(kLooseCut),              fCutMinTrackPt(0),                      fCutMinNClusterTPC(-1), 
-  fCutMinNClusterITS(-1),                 fCutMaxChi2PerClusterTPC(1e10),         fCutMaxChi2PerClusterITS(1e10),
+  fResidualEta(0x0), fResidualPhi(0x0),   fCutEtaPhiSum(kFALSE),                  fCutEtaPhiSeparate(kFALSE), 
+  fCutR(0),                               fCutEta(0),                             fCutPhi(0),
+  fClusterWindow(0),                      fMass(0),                           
+  fStepSurface(0),                        fStepCluster(0),
+  fITSTrackSA(kFALSE),                    fEMCalSurfaceDistance(440.),
+  fTrackCutsType(0),                      fCutMinTrackPt(0),                      fCutMinNClusterTPC(0), 
+  fCutMinNClusterITS(0),                  fCutMaxChi2PerClusterTPC(0),            fCutMaxChi2PerClusterITS(0),
   fCutRequireTPCRefit(kFALSE),            fCutRequireITSRefit(kFALSE),            fCutAcceptKinkDaughters(kFALSE),
-  fCutMaxDCAToVertexXY(1e10),             fCutMaxDCAToVertexZ(1e10),              fCutDCAToVertex2D(kFALSE)
+  fCutMaxDCAToVertexXY(0),                fCutMaxDCAToVertexZ(0),                 fCutDCAToVertex2D(kFALSE),
+  fCutRequireITSStandAlone(kFALSE),       fCutRequireITSpureSA(kFALSE) 
 {
 //
   // Constructor.
@@ -88,34 +91,8 @@ AliEMCALRecoUtils::AliEMCALRecoUtils():
   // during Reco algorithm execution
   //
   
-  //Misalignment matrices
-  for(Int_t i = 0; i < 15 ; i++) {
-      fMisalTransShift[i] = 0.; 
-      fMisalRotShift[i]   = 0.; 
-  }
-  
-  //Non linearity
-  for(Int_t i = 0; i < 7  ; i++) fNonLinearityParams[i] = 0.; 
-
-  //For kBeamTestCorrected case, but default is no correction
-  fNonLinearityParams[0] =  0.99078;
-  fNonLinearityParams[1] =  0.161499;
-  fNonLinearityParams[2] =  0.655166; 
-  fNonLinearityParams[3] =  0.134101;
-  fNonLinearityParams[4] =  163.282;
-  fNonLinearityParams[5] =  23.6904;
-  fNonLinearityParams[6] =  0.978;
-  
-  //For kPi0GammaGamma case
-  //fNonLinearityParams[0] = 0.1457/0.1349766/1.038;
-  //fNonLinearityParams[1] = -0.02024/0.1349766/1.038;
-  //fNonLinearityParams[2] = 1.046;
-
-  //Cluster energy smearing
-  fSmearClusterEnergy   = kFALSE;
-  fSmearClusterParam[0] = 0.07; // * sqrt E term
-  fSmearClusterParam[1] = 0.00; // * E term
-  fSmearClusterParam[2] = 0.00; // constant
+  // Init parameters
+  InitParameters();
   
   //Track matching
   fMatchedTrackIndex     = new TArrayI();
@@ -124,7 +101,6 @@ AliEMCALRecoUtils::AliEMCALRecoUtils():
   fResidualEta           = new TArrayF();
   fPIDUtils              = new AliEMCALPIDUtils();
 
-  InitTrackCuts();
 }
 
 //______________________________________________________________________
@@ -136,32 +112,38 @@ AliEMCALRecoUtils::AliEMCALRecoUtils(const AliEMCALRecoUtils & reco)
   fCellsRecalibrated(reco.fCellsRecalibrated),
   fRecalibration(reco.fRecalibration),                       fEMCALRecalibrationFactors(reco.fEMCALRecalibrationFactors),
   fTimeRecalibration(reco.fTimeRecalibration),               fEMCALTimeRecalibrationFactors(reco.fEMCALTimeRecalibrationFactors),
-  fUseRunCorrectionFactors(reco.fUseRunCorrectionFactors),   fRunCorrectionFactorsSet(reco.fRunCorrectionFactorsSet),
+  fUseRunCorrectionFactors(reco.fUseRunCorrectionFactors),   
   fRemoveBadChannels(reco.fRemoveBadChannels),               fRecalDistToBadChannels(reco.fRecalDistToBadChannels),
   fEMCALBadChannelMap(reco.fEMCALBadChannelMap),
   fNCellsFromEMCALBorder(reco.fNCellsFromEMCALBorder),       fNoEMCALBorderAtEta0(reco.fNoEMCALBorderAtEta0),
-  fRejectExoticCluster(reco.fRejectExoticCluster),           fPIDUtils(reco.fPIDUtils), 
-  fAODFilterMask(reco.fAODFilterMask),
+  fRejectExoticCluster(reco.fRejectExoticCluster),           fRejectExoticCells(reco.fRejectExoticCells), 
+  fExoticCellFraction(reco.fExoticCellFraction),             fExoticCellDiffTime(reco.fExoticCellDiffTime),               
+  fExoticCellMinAmplitude(reco.fExoticCellMinAmplitude),
+  fPIDUtils(reco.fPIDUtils),                                 fAODFilterMask(reco.fAODFilterMask),
+  fAODHybridTracks(reco.fAODHybridTracks),                   fAODTPCOnlyTracks(reco.fAODTPCOnlyTracks),
   fMatchedTrackIndex(  reco.fMatchedTrackIndex?  new TArrayI(*reco.fMatchedTrackIndex):0x0),
   fMatchedClusterIndex(reco.fMatchedClusterIndex?new TArrayI(*reco.fMatchedClusterIndex):0x0),
   fResidualEta(        reco.fResidualEta?        new TArrayF(*reco.fResidualEta):0x0),
   fResidualPhi(        reco.fResidualPhi?        new TArrayF(*reco.fResidualPhi):0x0),
   fCutEtaPhiSum(reco.fCutEtaPhiSum),                         fCutEtaPhiSeparate(reco.fCutEtaPhiSeparate), 
   fCutR(reco.fCutR),        fCutEta(reco.fCutEta),           fCutPhi(reco.fCutPhi),
-  fMass(reco.fMass),        fStep(reco.fStep),
+  fClusterWindow(reco.fClusterWindow),
+  fMass(reco.fMass),        fStepSurface(reco.fStepSurface), fStepCluster(reco.fStepCluster),
+  fITSTrackSA(reco.fITSTrackSA),                             fEMCalSurfaceDistance(440.),
   fTrackCutsType(reco.fTrackCutsType),                       fCutMinTrackPt(reco.fCutMinTrackPt), 
   fCutMinNClusterTPC(reco.fCutMinNClusterTPC),               fCutMinNClusterITS(reco.fCutMinNClusterITS), 
   fCutMaxChi2PerClusterTPC(reco.fCutMaxChi2PerClusterTPC),   fCutMaxChi2PerClusterITS(reco.fCutMaxChi2PerClusterITS),
   fCutRequireTPCRefit(reco.fCutRequireTPCRefit),             fCutRequireITSRefit(reco.fCutRequireITSRefit),
   fCutAcceptKinkDaughters(reco.fCutAcceptKinkDaughters),     fCutMaxDCAToVertexXY(reco.fCutMaxDCAToVertexXY),    
-  fCutMaxDCAToVertexZ(reco.fCutMaxDCAToVertexZ),             fCutDCAToVertex2D(reco.fCutDCAToVertex2D)
+  fCutMaxDCAToVertexZ(reco.fCutMaxDCAToVertexZ),             fCutDCAToVertex2D(reco.fCutDCAToVertex2D),
+  fCutRequireITSStandAlone(reco.fCutRequireITSStandAlone),   fCutRequireITSpureSA(reco.fCutRequireITSpureSA) 
 {
   //Copy ctor
   
-  for(Int_t i = 0; i < 15 ; i++) { fMisalRotShift[i]      = reco.fMisalRotShift[i]      ; 
-                                   fMisalTransShift[i]    = reco.fMisalTransShift[i]    ; } 
-  for(Int_t i = 0; i < 7  ; i++) { fNonLinearityParams[i] = reco.fNonLinearityParams[i] ; }
-  for(Int_t i = 0; i < 3  ; i++) { fSmearClusterParam[i]  = reco.fSmearClusterParam[i]  ; }
+  for (Int_t i = 0; i < 15 ; i++) { fMisalRotShift[i]      = reco.fMisalRotShift[i]      ; 
+                                   fMisalTransShift[i]    = reco.fMisalTransShift[i]    ; }
+  for (Int_t i = 0; i < 7  ; i++) { fNonLinearityParams[i] = reco.fNonLinearityParams[i] ; }
+  for (Int_t i = 0; i < 3  ; i++) { fSmearClusterParam[i]  = reco.fSmearClusterParam[i]  ; }
 
 }
 
@@ -171,13 +153,13 @@ AliEMCALRecoUtils & AliEMCALRecoUtils::operator = (const AliEMCALRecoUtils & rec
 {
   //Assignment operator
   
-  if(this == &reco)return *this;
+  if (this == &reco)return *this;
   ((TNamed *)this)->operator=(reco);
 
-  for(Int_t i = 0; i < 15 ; i++) { fMisalTransShift[i]    = reco.fMisalTransShift[i]    ; 
+  for (Int_t i = 0; i < 15 ; i++) { fMisalTransShift[i]    = reco.fMisalTransShift[i]    ; 
                                    fMisalRotShift[i]      = reco.fMisalRotShift[i]      ; }
-  for(Int_t i = 0; i < 7  ; i++) { fNonLinearityParams[i] = reco.fNonLinearityParams[i] ; }
-  for(Int_t i = 0; i < 3  ; i++) { fSmearClusterParam[i]  = reco.fSmearClusterParam[i]  ; }   
+  for (Int_t i = 0; i < 7  ; i++) { fNonLinearityParams[i] = reco.fNonLinearityParams[i] ; }
+  for (Int_t i = 0; i < 3  ; i++) { fSmearClusterParam[i]  = reco.fSmearClusterParam[i]  ; }   
   
   fParticleType              = reco.fParticleType;
   fPosAlgo                   = reco.fPosAlgo; 
@@ -195,7 +177,6 @@ AliEMCALRecoUtils & AliEMCALRecoUtils::operator = (const AliEMCALRecoUtils & rec
   fEMCALTimeRecalibrationFactors = reco.fEMCALTimeRecalibrationFactors;
 
   fUseRunCorrectionFactors   = reco.fUseRunCorrectionFactors;
-  fRunCorrectionFactorsSet   = reco.fRunCorrectionFactorsSet;
   
   fRemoveBadChannels         = reco.fRemoveBadChannels;
   fRecalDistToBadChannels    = reco.fRecalDistToBadChannels;
@@ -203,21 +184,31 @@ AliEMCALRecoUtils & AliEMCALRecoUtils::operator = (const AliEMCALRecoUtils & rec
   
   fNCellsFromEMCALBorder     = reco.fNCellsFromEMCALBorder;
   fNoEMCALBorderAtEta0       = reco.fNoEMCALBorderAtEta0;
+  
   fRejectExoticCluster       = reco.fRejectExoticCluster;           
-
+  fRejectExoticCells         = reco.fRejectExoticCells; 
+  fExoticCellFraction        = reco.fExoticCellFraction;
+  fExoticCellDiffTime        = reco.fExoticCellDiffTime;              
+  fExoticCellMinAmplitude    = reco.fExoticCellMinAmplitude;
+  
   fPIDUtils                  = reco.fPIDUtils;
 
   fAODFilterMask             = reco.fAODFilterMask;
+  fAODHybridTracks           = reco.fAODHybridTracks;
+  fAODTPCOnlyTracks          = reco.fAODTPCOnlyTracks;
   
   fCutEtaPhiSum              = reco.fCutEtaPhiSum;
   fCutEtaPhiSeparate         = reco.fCutEtaPhiSeparate;
   fCutR                      = reco.fCutR;
   fCutEta                    = reco.fCutEta;
   fCutPhi                    = reco.fCutPhi;
+  fClusterWindow             = reco.fClusterWindow;
   fMass                      = reco.fMass;
-  fStep                      = reco.fStep;
-  fRejectExoticCluster       = reco.fRejectExoticCluster;
-
+  fStepSurface               = reco.fStepSurface;
+  fStepCluster               = reco.fStepCluster;
+  fITSTrackSA                = reco.fITSTrackSA;
+  fEMCalSurfaceDistance      = reco.fEMCalSurfaceDistance;
+  
   fTrackCutsType             = reco.fTrackCutsType;
   fCutMinTrackPt             = reco.fCutMinTrackPt;
   fCutMinNClusterTPC         = reco.fCutMinNClusterTPC;
@@ -230,77 +221,77 @@ AliEMCALRecoUtils & AliEMCALRecoUtils::operator = (const AliEMCALRecoUtils & rec
   fCutMaxDCAToVertexXY       = reco.fCutMaxDCAToVertexXY;
   fCutMaxDCAToVertexZ        = reco.fCutMaxDCAToVertexZ;
   fCutDCAToVertex2D          = reco.fCutDCAToVertex2D;
-  
-  if(reco.fResidualEta){
+  fCutRequireITSStandAlone   = reco.fCutRequireITSStandAlone; 
+  fCutRequireITSpureSA       = reco.fCutRequireITSpureSA; 
+  if (reco.fResidualEta) {
     // assign or copy construct
-    if(fResidualEta)
+    if (fResidualEta) 
       *fResidualEta = *reco.fResidualEta;
+    } else {
+      fResidualEta = new TArrayF(*reco.fResidualEta);
     }
-    else fResidualEta = new TArrayF(*reco.fResidualEta);
-  }
-  else{
-    if(fResidualEta)delete fResidualEta;
+  } else {
+    if (fResidualEta) delete fResidualEta;
     fResidualEta = 0;
   }
   
-  if(reco.fResidualPhi){
+  if (reco.fResidualPhi) {
     // assign or copy construct
-    if(fResidualPhi)
+    if (fResidualPhi) 
       *fResidualPhi = *reco.fResidualPhi;
+    } else {
+      fResidualPhi = new TArrayF(*reco.fResidualPhi);
     }
-    else fResidualPhi = new TArrayF(*reco.fResidualPhi);
-  }
-  else{
-    if(fResidualPhi)delete fResidualPhi;
+  } else {
+    if (fResidualPhi) delete fResidualPhi;
     fResidualPhi = 0;
   }
   
-  if(reco.fMatchedTrackIndex){
+  if (reco.fMatchedTrackIndex) {
     // assign or copy construct
-    if(fMatchedTrackIndex)
+    if (fMatchedTrackIndex) 
       *fMatchedTrackIndex = *reco.fMatchedTrackIndex;
+    } else  { 
+      fMatchedTrackIndex = new TArrayI(*reco.fMatchedTrackIndex);
     }
-    else fMatchedTrackIndex = new TArrayI(*reco.fMatchedTrackIndex);
-  }
-  else{
-    if(fMatchedTrackIndex)delete fMatchedTrackIndex;
+  } else {
+    if (fMatchedTrackIndex) delete fMatchedTrackIndex;
     fMatchedTrackIndex = 0;
   }  
   
-  if(reco.fMatchedClusterIndex){
+  if (reco.fMatchedClusterIndex) {
     // assign or copy construct
-    if(fMatchedClusterIndex)
+    if (fMatchedClusterIndex) 
       *fMatchedClusterIndex = *reco.fMatchedClusterIndex;
+    } else {
+      fMatchedClusterIndex = new TArrayI(*reco.fMatchedClusterIndex);
     }
-    else fMatchedClusterIndex = new TArrayI(*reco.fMatchedClusterIndex);
-  }
-  else{
-    if(fMatchedClusterIndex)delete fMatchedClusterIndex;
+  } else {
+    if (fMatchedClusterIndex) delete fMatchedClusterIndex;
     fMatchedClusterIndex = 0;
   }
    
   return *this;
 }
 
-
-//__________________________________________________
+//_____________________________________
 AliEMCALRecoUtils::~AliEMCALRecoUtils()
 {
   //Destructor.
-       
-  if(fEMCALRecalibrationFactors) { 
+  
+  if (fEMCALRecalibrationFactors) { 
     fEMCALRecalibrationFactors->Clear();
-    delete  fEMCALRecalibrationFactors;
-  }    
+    delete fEMCALRecalibrationFactors;
+  }  
   
-  if(fEMCALTimeRecalibrationFactors) { 
-               fEMCALTimeRecalibrationFactors->Clear();
-               delete  fEMCALTimeRecalibrationFactors;
-       }       
+  if (fEMCALTimeRecalibrationFactors) { 
+    fEMCALTimeRecalibrationFactors->Clear();
+    delete fEMCALTimeRecalibrationFactors;
+  }  
   
-  if(fEMCALBadChannelMap) { 
+  if (fEMCALBadChannelMap) { 
     fEMCALBadChannelMap->Clear();
-    delete  fEMCALBadChannelMap;
+    delete fEMCALBadChannelMap;
   }
  
   delete fMatchedTrackIndex   ; 
@@ -312,179 +303,340 @@ AliEMCALRecoUtils::~AliEMCALRecoUtils()
   InitTrackCuts();
 }
 
-//_______________________________________________________________
-Bool_t AliEMCALRecoUtils::CheckCellFiducialRegion(AliEMCALGeometry* geom, AliVCluster* cluster, AliVCaloCells* cells) 
+//_______________________________________________________________________________
+Bool_t AliEMCALRecoUtils::AcceptCalibrateCell(Int_t absID, Int_t bc,
+                                              Float_t  & amp,    Double_t & time, 
+                                              AliVCaloCells* cells) 
+{
+  // Reject cell if criteria not passed and calibrate it
+  
+  AliEMCALGeometry* geom = AliEMCALGeometry::GetInstance();
+  
+  if (absID < 0 || absID >= 24*48*geom->GetNumberOfSuperModules()) 
+    return kFALSE;
+  
+  Int_t imod = -1, iphi =-1, ieta=-1,iTower = -1, iIphi = -1, iIeta = -1; 
+  
+  if (!geom->GetCellIndex(absID,imod,iTower,iIphi,iIeta)) {
+    // cell absID does not exist
+    amp=0; time = 1.e9;
+    return kFALSE; 
+  }
+  
+  geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(imod,iTower,iIphi, iIeta,iphi,ieta);  
+
+  // Do not include bad channels found in analysis,
+  if (IsBadChannelsRemovalSwitchedOn() && GetEMCALChannelStatus(imod, ieta, iphi)) {
+    return kFALSE;
+  }
+  
+  //Recalibrate energy
+  amp  = cells->GetCellAmplitude(absID);
+  if (!fCellsRecalibrated && IsRecalibrationOn())
+    amp *= GetEMCALChannelRecalibrationFactor(imod,ieta,iphi);
+  
+  // Recalibrate time
+  time = cells->GetCellTime(absID);
+  
+  RecalibrateCellTime(absID,bc,time);
+  
+  return kTRUE;
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+Bool_t AliEMCALRecoUtils::CheckCellFiducialRegion(const AliEMCALGeometry* geom, 
+                                                  const AliVCluster* cluster, 
+                                                  AliVCaloCells* cells) 
 {
-       // Given the list of AbsId of the cluster, get the maximum cell and 
-       // check if there are fNCellsFromBorder from the calorimeter border
-       
-  if(!cluster){
+  // Given the list of AbsId of the cluster, get the maximum cell and 
+  // check if there are fNCellsFromBorder from the calorimeter border
+  
+  if (!cluster)
+  {
     AliInfo("Cluster pointer null!");
     return kFALSE;
   }
   
   //If the distance to the border is 0 or negative just exit accept all clusters
-       if(cells->GetType()==AliVCaloCells::kEMCALCell && fNCellsFromEMCALBorder <= 0 ) return kTRUE;
+  if (cells->GetType()==AliVCaloCells::kEMCALCell && fNCellsFromEMCALBorder <= 0 ) 
+    return kTRUE;
   
-  Int_t absIdMax       = -1, iSM =-1, ieta = -1, iphi = -1;
+  Int_t absIdMax  = -1, iSM =-1, ieta = -1, iphi = -1;
   Bool_t shared = kFALSE;
   GetMaxEnergyCell(geom, cells, cluster, absIdMax,  iSM, ieta, iphi, shared);
-
+  
   AliDebug(2,Form("Cluster Max AbsId %d, Cell Energy %2.2f, Cluster Energy %2.2f, Ncells from border %d, EMCAL eta=0 %d\n", 
-           absIdMax, cells->GetCellAmplitude(absIdMax), cluster->E(), fNCellsFromEMCALBorder, fNoEMCALBorderAtEta0));
-       
-       if(absIdMax==-1) return kFALSE;
-       
-       //Check if the cell is close to the borders:
-       Bool_t okrow = kFALSE;
-       Bool_t okcol = kFALSE;
-  
-  if(iSM < 0 || iphi < 0 || ieta < 0 ) {
+                  absIdMax, cells->GetCellAmplitude(absIdMax), cluster->E(), fNCellsFromEMCALBorder, fNoEMCALBorderAtEta0));
+  
+  if (absIdMax==-1) return kFALSE;
+  
+  //Check if the cell is close to the borders:
+  Bool_t okrow = kFALSE;
+  Bool_t okcol = kFALSE;
+  
+  if (iSM < 0 || iphi < 0 || ieta < 0 ) {
     AliFatal(Form("Negative value for super module: %d, or cell ieta: %d, or cell iphi: %d, check EMCAL geometry name\n",
                   iSM,ieta,iphi));
   }
   
   //Check rows/phi
-  if(iSM < 10){
-    if(iphi >= fNCellsFromEMCALBorder && iphi < 24-fNCellsFromEMCALBorder) okrow =kTRUE; 
-  }
-  else{
-    if(iphi >= fNCellsFromEMCALBorder && iphi < 12-fNCellsFromEMCALBorder) okrow =kTRUE; 
-  }
+  Int_t iPhiLast = 24;
+   if( geom->GetSMType(iSM) == AliEMCALGeometry::kEMCAL_Half ) iPhiLast /= 2;
+   else if (  geom->GetSMType(iSM) == AliEMCALGeometry::kEMCAL_3rd ) iPhiLast /= 3;// 1/3 sm case
   
+  if(iphi >= fNCellsFromEMCALBorder && iphi < iPhiLast - fNCellsFromEMCALBorder) okrow = kTRUE; 
+
   //Check columns/eta
-  if(!fNoEMCALBorderAtEta0){
-    if(ieta  > fNCellsFromEMCALBorder && ieta < 48-fNCellsFromEMCALBorder) okcol =kTRUE; 
-  }
-  else{
-    if(iSM%2==0){
-      if(ieta >= fNCellsFromEMCALBorder)     okcol = kTRUE;    
-    }
-    else {
-      if(ieta <  48-fNCellsFromEMCALBorder)  okcol = kTRUE;    
+  Int_t iEtaLast = 48;
+  if(!fNoEMCALBorderAtEta0 || geom->IsDCALSM(iSM)) {// conside inner border
+     if(  geom->GetSMType(iSM) == AliEMCALGeometry::kDCAL_Standard )  iEtaLast = iEtaLast*2/3;        
+     if(ieta  > fNCellsFromEMCALBorder && ieta < iEtaLast-fNCellsFromEMCALBorder) okcol = kTRUE;  
+  } else {
+    if (iSM%2==0) {
+     if (ieta >= fNCellsFromEMCALBorder)     okcol = kTRUE;  
+    else {
+     if(ieta <  iEtaLast-fNCellsFromEMCALBorder)  okcol = kTRUE; 
     }
   }//eta 0 not checked
-    
+  
   AliDebug(2,Form("EMCAL Cluster in %d cells fiducial volume: ieta %d, iphi %d, SM %d:  column? %d, row? %d\nq",
-           fNCellsFromEMCALBorder, ieta, iphi, iSM, okcol, okrow));
-       
-       if (okcol && okrow) {
+                  fNCellsFromEMCALBorder, ieta, iphi, iSM, okcol, okrow));
+  
+  if (okcol && okrow) {
     //printf("Accept\n");
     return kTRUE;
-  }
-       else  {
+  } else  {
     //printf("Reject\n");
     AliDebug(2,Form("Reject cluster in border, max cell : ieta %d, iphi %d, SM %d\n",ieta, iphi, iSM));
     return kFALSE;
   }
-       
-}      
-
-
-//_________________________________________________________________________________________________________
-Bool_t AliEMCALRecoUtils::ClusterContainsBadChannel(AliEMCALGeometry* geom, UShort_t* cellList, const Int_t nCells){
-       // Check that in the cluster cells, there is no bad channel of those stored 
-       // in fEMCALBadChannelMap or fPHOSBadChannelMap
-       
-       if(!fRemoveBadChannels)  return kFALSE;
-       if(!fEMCALBadChannelMap) return kFALSE;
-       
-       Int_t icol = -1;
-       Int_t irow = -1;
-       Int_t imod = -1;
-       for(Int_t iCell = 0; iCell<nCells; iCell++){
-               
-               //Get the column and row
+}  
+
+//_______________________________________________________________________________
+Bool_t AliEMCALRecoUtils::ClusterContainsBadChannel(const AliEMCALGeometry* geom, 
+                                                    const UShort_t* cellList, 
+                                                    Int_t nCells)
+{
+  // Check that in the cluster cells, there is no bad channel of those stored 
+  // in fEMCALBadChannelMap or fPHOSBadChannelMap
+  
+  if (!fRemoveBadChannels)  return kFALSE;
+  if (!fEMCALBadChannelMap) return kFALSE;
+  
+  Int_t icol = -1;
+  Int_t irow = -1;
+  Int_t imod = -1;
+  for (Int_t iCell = 0; iCell<nCells; iCell++) {
+    //Get the column and row
     Int_t iTower = -1, iIphi = -1, iIeta = -1; 
     geom->GetCellIndex(cellList[iCell],imod,iTower,iIphi,iIeta); 
-    if(fEMCALBadChannelMap->GetEntries() <= imod) continue;
-    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(imod,iTower,iIphi, iIeta,irow,icol);                     
-    if(GetEMCALChannelStatus(imod, icol, irow)){
+    if (fEMCALBadChannelMap->GetEntries() <= imod) continue;
+    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(imod,iTower,iIphi, iIeta,irow,icol);      
+    if (GetEMCALChannelStatus(imod, icol, irow)) {
       AliDebug(2,Form("Cluster with bad channel: SM %d, col %d, row %d\n",imod, icol, irow));
       return kTRUE;
     }
-               
-       }// cell cluster loop
-       
-       return kFALSE;
-       
+  }// cell cluster loop
+
+  return kFALSE;
 }
 
-//_________________________________________________
-Bool_t AliEMCALRecoUtils::IsExoticCluster(AliVCluster *cluster) const {
-  // Check if the cluster has high energy  but small number of cells
-  // The criteria comes from Gustavo's study
-  //
+
+//___________________________________________________________________________
+Float_t AliEMCALRecoUtils::GetECross(Int_t absID, Double_t tcell,
+                                     AliVCaloCells* cells, Int_t bc)
+{
+  //Calculate the energy in the cross around the energy given cell
+  
+  AliEMCALGeometry * geom = AliEMCALGeometry::GetInstance();
+  
+  Int_t imod = -1, iphi =-1, ieta=-1,iTower = -1, iIphi = -1, iIeta = -1; 
+  geom->GetCellIndex(absID,imod,iTower,iIphi,iIeta); 
+  geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(imod,iTower,iIphi, iIeta,iphi,ieta);  
+  
+  //Get close cells index, energy and time, not in corners
+  
+  Int_t absID1 = -1;
+  Int_t absID2 = -1;
+  
+  if ( iphi < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows-1) absID1 = geom-> GetAbsCellIdFromCellIndexes(imod, iphi+1, ieta);
+  if ( iphi > 0 )                                absID2 = geom-> GetAbsCellIdFromCellIndexes(imod, iphi-1, ieta);
+  
+  // In case of cell in eta = 0 border, depending on SM shift the cross cell index
+  
+  Int_t absID3 = -1;
+  Int_t absID4 = -1;
+  
+  if ( ieta == AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols-1 && !(imod%2) ) {
+    absID3 = geom-> GetAbsCellIdFromCellIndexes(imod+1, iphi, 0);
+    absID4 = geom-> GetAbsCellIdFromCellIndexes(imod,   iphi, ieta-1); 
+  } else if ( ieta == 0 && imod%2 ) {
+    absID3 = geom-> GetAbsCellIdFromCellIndexes(imod,   iphi, ieta+1);
+    absID4 = geom-> GetAbsCellIdFromCellIndexes(imod-1, iphi, AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols-1); 
+  } else {
+    if ( ieta < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols-1 ) 
+      absID3 = geom-> GetAbsCellIdFromCellIndexes(imod, iphi, ieta+1);
+    if ( ieta > 0 )                                 
+      absID4 = geom-> GetAbsCellIdFromCellIndexes(imod, iphi, ieta-1); 
+  }
+  
+  //printf("IMOD %d, AbsId %d, a %d, b %d, c %d e %d \n",imod,absID,absID1,absID2,absID3,absID4);
+  
+  Float_t  ecell1  = 0, ecell2  = 0, ecell3  = 0, ecell4  = 0;
+  Double_t tcell1  = 0, tcell2  = 0, tcell3  = 0, tcell4  = 0;
+
+  AcceptCalibrateCell(absID1,bc, ecell1,tcell1,cells); 
+  AcceptCalibrateCell(absID2,bc, ecell2,tcell2,cells); 
+  AcceptCalibrateCell(absID3,bc, ecell3,tcell3,cells); 
+  AcceptCalibrateCell(absID4,bc, ecell4,tcell4,cells); 
+  
+  if (TMath::Abs(tcell-tcell1)*1.e9 > fExoticCellDiffTime) ecell1 = 0 ;
+  if (TMath::Abs(tcell-tcell2)*1.e9 > fExoticCellDiffTime) ecell2 = 0 ;
+  if (TMath::Abs(tcell-tcell3)*1.e9 > fExoticCellDiffTime) ecell3 = 0 ;
+  if (TMath::Abs(tcell-tcell4)*1.e9 > fExoticCellDiffTime) ecell4 = 0 ;
+  
+  return ecell1+ecell2+ecell3+ecell4;
+}
+
+//_____________________________________________________________________________________________
+Bool_t AliEMCALRecoUtils::IsExoticCell(Int_t absID, AliVCaloCells* cells, Int_t bc)
+{
+  // Look to cell neighbourhood and reject if it seems exotic
+  // Do before recalibrating the cells
+
+  if (!fRejectExoticCells) return kFALSE;
+  
+  Float_t  ecell  = 0;
+  Double_t tcell  = 0;
+  Bool_t   accept = AcceptCalibrateCell(absID, bc, ecell ,tcell ,cells); 
+  
+  if (!accept) return kTRUE; // reject this cell
+  
+  if (ecell < fExoticCellMinAmplitude) return kFALSE; // do not reject low energy cells
+
+  Float_t eCross = GetECross(absID,tcell,cells,bc);
+  
+  if (1-eCross/ecell > fExoticCellFraction) {
+    AliDebug(2,Form("AliEMCALRecoUtils::IsExoticCell() - EXOTIC CELL id %d, eCell %f, eCross %f, 1-eCross/eCell %f\n",
+                    absID,ecell,eCross,1-eCross/ecell));
+    return kTRUE;
+  }
+
+  return kFALSE;
+}
+
+//___________________________________________________________________
+Bool_t AliEMCALRecoUtils::IsExoticCluster(const AliVCluster *cluster, 
+                                          AliVCaloCells *cells, 
+                                          Int_t bc) 
+{
+  // Check if the cluster highest energy tower is exotic
   
-  if(!cluster){
+  if (!cluster) {
     AliInfo("Cluster pointer null!");
     return kFALSE;
   }
   
-  Int_t nc = cluster->GetNCells() ;
+  if (!fRejectExoticCluster) return kFALSE;
   
-  if      ( nc > 8 )                   return kFALSE ; // Good cluster, needed for 3x3 clusterizer  
-  else if ( nc < 1 + cluster->E()/3. ) return kTRUE  ; // Bad cluster
-  else                                 return kFALSE ; // Good cluster
+  // Get highest energy tower
+  AliEMCALGeometry* geom = AliEMCALGeometry::GetInstance();
+  Int_t iSupMod = -1, absId = -1, ieta = -1, iphi = -1;
+  Bool_t shared = kFALSE;
+  GetMaxEnergyCell(geom, cells, cluster, absId, iSupMod, ieta, iphi, shared);
   
+  return IsExoticCell(absId,cells,bc);
 }
 
-//__________________________________________________
-Float_t AliEMCALRecoUtils::SmearClusterEnergy(AliVCluster* cluster) {
-
+//_______________________________________________________________________
+Float_t AliEMCALRecoUtils::SmearClusterEnergy(const AliVCluster* cluster) 
+{
   //In case of MC analysis, smear energy to match resolution/calibration in real data
   
-  if(!cluster){
+  if (!cluster) {
     AliInfo("Cluster pointer null!");
     return 0;
   }
   
   Float_t energy    = cluster->E() ;
   Float_t rdmEnergy = energy ;
-  if(fSmearClusterEnergy){
+  if (fSmearClusterEnergy) {
     rdmEnergy = fRandom.Gaus(energy,fSmearClusterParam[0] * TMath::Sqrt(energy) +
                                     fSmearClusterParam[1] * energy +
                                     fSmearClusterParam[2] );
     AliDebug(2, Form("Energy: original %f, smeared %f\n", energy, rdmEnergy));
   }
   
-  return rdmEnergy ;
-
+  return rdmEnergy;
 }
 
-//__________________________________________________
-Float_t AliEMCALRecoUtils::CorrectClusterEnergyLinearity(AliVCluster* cluster){
-// Correct cluster energy from non linearity functions
+//____________________________________________________________________________
+Float_t AliEMCALRecoUtils::CorrectClusterEnergyLinearity(AliVCluster* cluster)
+{
+  // Correct cluster energy from non linearity functions
   
-  if(!cluster){
+  if (!cluster) {
     AliInfo("Cluster pointer null!");
     return 0;
   }
   
   Float_t energy = cluster->E();
+
+  if (energy < 0.05) {
+    // Clusters with less than 50 MeV or negative are not possible
+    AliInfo(Form("Too Low Cluster energy!, E = %f < 0.05 GeV",energy));
+    return 0;
+  }
   
-  switch (fNonLinearityFunction) {
-      
+  switch (fNonLinearityFunction) 
+  {
     case kPi0MC:
     {
       //Non-Linearity correction (from MC with function ([0]*exp(-[1]/E))+(([2]/([3]*2.*TMath::Pi())*exp(-(E-[4])^2/(2.*[3]^2)))))
-      //Double_t fNonLinearityParams[0] = 1.014;
-      //Double_t fNonLinearityParams[1] = -0.03329;
-      //Double_t fNonLinearityParams[2] = -0.3853;
-      //Double_t fNonLinearityParams[3] = 0.5423;
-      //Double_t fNonLinearityParams[4] = -0.4335;
+      //fNonLinearityParams[0] = 1.014;
+      //fNonLinearityParams[1] =-0.03329;
+      //fNonLinearityParams[2] =-0.3853;
+      //fNonLinearityParams[3] = 0.5423;
+      //fNonLinearityParams[4] =-0.4335;
        energy *= (fNonLinearityParams[0]*exp(-fNonLinearityParams[1]/energy))+
                   ((fNonLinearityParams[2]/(fNonLinearityParams[3]*2.*TMath::Pi())*
                     exp(-(energy-fNonLinearityParams[4])*(energy-fNonLinearityParams[4])/(2.*fNonLinearityParams[3]*fNonLinearityParams[3]))));
       break;
     }
      
+    case kPi0MCv2:
+    {
+      //Non-Linearity correction (from MC with function [0]/((x+[1])^[2]))+1;
+      //fNonLinearityParams[0] = 3.11111e-02;
+      //fNonLinearityParams[1] =-5.71666e-02; 
+      //fNonLinearityParams[2] = 5.67995e-01;      
+      
+      energy *= fNonLinearityParams[0]/TMath::Power(energy+fNonLinearityParams[1],fNonLinearityParams[2])+1;
+      break;
+    }
+    
+    case kPi0MCv3:
+    {
+      //Same as beam test corrected, change parameters
+      //fNonLinearityParams[0] =  9.81039e-01
+      //fNonLinearityParams[1] =  1.13508e-01;
+      //fNonLinearityParams[2] =  1.00173e+00; 
+      //fNonLinearityParams[3] =  9.67998e-02;
+      //fNonLinearityParams[4] =  2.19381e+02;
+      //fNonLinearityParams[5] =  6.31604e+01;
+      //fNonLinearityParams[6] =  1;
+      energy *= fNonLinearityParams[6]/(fNonLinearityParams[0]*(1./(1.+fNonLinearityParams[1]*exp(-energy/fNonLinearityParams[2]))*1./(1.+fNonLinearityParams[3]*exp((energy-fNonLinearityParams[4])/fNonLinearityParams[5]))));
+      
+      break;
+    }
+      
+      
     case kPi0GammaGamma:
     {
       //Non-Linearity correction (from Olga Data with function p0+p1*exp(-p2*E))
-      //Double_t fNonLinearityParams[0] = 1.04;
-      //Double_t fNonLinearityParams[1] = -0.1445;
-      //Double_t fNonLinearityParams[2] = 1.046;
+      //fNonLinearityParams[0] = 1.04;
+      //fNonLinearityParams[1] = -0.1445;
+      //fNonLinearityParams[2] = 1.046;
       energy /= (fNonLinearityParams[0]+fNonLinearityParams[1]*exp(-fNonLinearityParams[2]*energy)); //Olga function
       break;
     }
@@ -527,80 +679,115 @@ Float_t AliEMCALRecoUtils::CorrectClusterEnergyLinearity(AliVCluster* cluster){
 
       break;
     }
+     
+    case kBeamTestCorrectedv2:
+    {
+      //From beam test, corrected for material between beam and EMCAL
+      //fNonLinearityParams[0] =  0.983504;
+      //fNonLinearityParams[1] =  0.210106;
+      //fNonLinearityParams[2] =  0.897274;
+      //fNonLinearityParams[3] =  0.0829064;
+      //fNonLinearityParams[4] =  152.299;
+      //fNonLinearityParams[5] =  31.5028;
+      //fNonLinearityParams[6] =  0.968;
+      energy *= fNonLinearityParams[6]/(fNonLinearityParams[0]*(1./(1.+fNonLinearityParams[1]*exp(-energy/fNonLinearityParams[2]))*1./(1.+fNonLinearityParams[3]*exp((energy-fNonLinearityParams[4])/fNonLinearityParams[5]))));
+      
+      break;
+    }
       
     case kNoCorrection:
       AliDebug(2,"No correction on the energy\n");
       break;
       
   }
-  
-  return energy;
 
+  return energy;
 }
+
 //__________________________________________________
 void AliEMCALRecoUtils::InitNonLinearityParam()
 {
-       //Initialising Non Linearity Parameters
-       
-       if(fNonLinearityFunction == kPi0MC)
-               {
-                       fNonLinearityParams[0] = 1.014;
-      fNonLinearityParams[1] = -0.03329;
-      fNonLinearityParams[2] = -0.3853;
-      fNonLinearityParams[3] = 0.5423;
-      fNonLinearityParams[4] = -0.4335;
-               }
-
-       if(fNonLinearityFunction == kPi0GammaGamma)
-               {
-                       fNonLinearityParams[0] = 1.04;
-                       fNonLinearityParams[1] = -0.1445;
-                       fNonLinearityParams[2] = 1.046;
-               }       
-
-       if(fNonLinearityFunction == kPi0GammaConversion)
-               {
-      fNonLinearityParams[0] = 0.139393;
-      fNonLinearityParams[1] = 0.0566186;
-      fNonLinearityParams[2] = 0.982133;
-               }       
-
-       if(fNonLinearityFunction == kBeamTest)
-               {
-                       if(fNonLinearThreshold == 30)
-                       {
-                               fNonLinearityParams[0] = 1.007; 
-                               fNonLinearityParams[1] = 0.894; 
-                               fNonLinearityParams[2] = 0.246; 
-                       }
-                       if(fNonLinearThreshold == 45)
-                       {
-                               fNonLinearityParams[0] = 1.003; 
-                               fNonLinearityParams[1] = 0.719; 
-                               fNonLinearityParams[2] = 0.334; 
-                       }
-                       if(fNonLinearThreshold == 75)
-                       {
-                               fNonLinearityParams[0] = 1.002; 
-                               fNonLinearityParams[1] = 0.797; 
-                               fNonLinearityParams[2] = 0.358; 
-                       }
-               }
-
-       if(fNonLinearityFunction == kBeamTestCorrected)
-               {
-                       fNonLinearityParams[0] =  0.99078;
-                       fNonLinearityParams[1] =  0.161499;
-                       fNonLinearityParams[2] =  0.655166; 
-                       fNonLinearityParams[3] =  0.134101;
-                       fNonLinearityParams[4] =  163.282;
-                       fNonLinearityParams[5] =  23.6904;
-                       fNonLinearityParams[6] =  0.978;
-               }
+  //Initialising Non Linearity Parameters
+  
+  if (fNonLinearityFunction == kPi0MC) {
+    fNonLinearityParams[0] = 1.014;
+    fNonLinearityParams[1] = -0.03329;
+    fNonLinearityParams[2] = -0.3853;
+    fNonLinearityParams[3] = 0.5423;
+    fNonLinearityParams[4] = -0.4335;
+  }
+  
+  if (fNonLinearityFunction == kPi0MCv2) {
+    fNonLinearityParams[0] = 3.11111e-02;
+    fNonLinearityParams[1] =-5.71666e-02; 
+    fNonLinearityParams[2] = 5.67995e-01;      
+  }
+  
+  if (fNonLinearityFunction == kPi0MCv3) {
+    fNonLinearityParams[0] =  9.81039e-01;
+    fNonLinearityParams[1] =  1.13508e-01;
+    fNonLinearityParams[2] =  1.00173e+00; 
+    fNonLinearityParams[3] =  9.67998e-02;
+    fNonLinearityParams[4] =  2.19381e+02;
+    fNonLinearityParams[5] =  6.31604e+01;
+    fNonLinearityParams[6] =  1;
+  }
+  
+  if (fNonLinearityFunction == kPi0GammaGamma) {
+    fNonLinearityParams[0] = 1.04;
+    fNonLinearityParams[1] = -0.1445;
+    fNonLinearityParams[2] = 1.046;
+  }  
+
+  if (fNonLinearityFunction == kPi0GammaConversion) {
+    fNonLinearityParams[0] = 0.139393;
+    fNonLinearityParams[1] = 0.0566186;
+    fNonLinearityParams[2] = 0.982133;
+  }  
+
+  if (fNonLinearityFunction == kBeamTest) {
+    if (fNonLinearThreshold == 30) {
+      fNonLinearityParams[0] = 1.007; 
+      fNonLinearityParams[1] = 0.894; 
+      fNonLinearityParams[2] = 0.246; 
+    }
+    if (fNonLinearThreshold == 45) {
+      fNonLinearityParams[0] = 1.003; 
+      fNonLinearityParams[1] = 0.719; 
+      fNonLinearityParams[2] = 0.334; 
+    }
+    if (fNonLinearThreshold == 75) {
+      fNonLinearityParams[0] = 1.002; 
+      fNonLinearityParams[1] = 0.797; 
+      fNonLinearityParams[2] = 0.358; 
+    }
+  }
+
+  if (fNonLinearityFunction == kBeamTestCorrected) {
+    fNonLinearityParams[0] =  0.99078;
+    fNonLinearityParams[1] =  0.161499;
+    fNonLinearityParams[2] =  0.655166; 
+    fNonLinearityParams[3] =  0.134101;
+    fNonLinearityParams[4] =  163.282;
+    fNonLinearityParams[5] =  23.6904;
+    fNonLinearityParams[6] =  0.978;
+  }
+  
+  if (fNonLinearityFunction == kBeamTestCorrectedv2) {
+    fNonLinearityParams[0] =  0.983504;
+    fNonLinearityParams[1] =  0.210106;
+    fNonLinearityParams[2] =  0.897274;
+    fNonLinearityParams[3] =  0.0829064;
+    fNonLinearityParams[4] =  152.299;
+    fNonLinearityParams[5] =  31.5028;
+    fNonLinearityParams[6] =  0.968;
+  }
 }
 
-//__________________________________________________
-Float_t  AliEMCALRecoUtils::GetDepth(const Float_t energy, const Int_t iParticle, const Int_t iSM) const 
+//_________________________________________________________
+Float_t  AliEMCALRecoUtils::GetDepth(Float_t energy, 
+                                     Int_t iParticle, 
+                                     Int_t iSM) const 
 {
   //Calculate shower depth for a given cluster energy and particle type
 
@@ -608,49 +795,69 @@ Float_t  AliEMCALRecoUtils::GetDepth(const Float_t energy, const Int_t iParticle
   Float_t x0    = 1.31;
   Float_t ecr   = 8;
   Float_t depth = 0;
+  Float_t arg   = energy*1000/ ecr; //Multiply energy by 1000 to transform to MeV
   
   switch ( iParticle )
   {
     case kPhoton:
-      depth = x0 * (TMath::Log(energy*1000/ ecr) + 0.5); //Multiply energy by 1000 to transform to MeV
+      if (arg < 1) 
+       depth = 0;
+      else
+       depth = x0 * (TMath::Log(arg) + 0.5); 
       break;
       
     case kElectron:
-      depth = x0 * (TMath::Log(energy*1000/ ecr) - 0.5); //Multiply energy by 1000 to transform to MeV
+      if (arg < 1) 
+       depth = 0;
+      else
+       depth = x0 * (TMath::Log(arg) - 0.5); 
       break;
       
     case kHadron:
       // hadron 
       // boxes anc. here
-      if(gGeoManager){
+      if (gGeoManager) {
         gGeoManager->cd("ALIC_1/XEN1_1");
         TGeoNode        *geoXEn1    = gGeoManager->GetCurrentNode();
         TGeoNodeMatrix  *geoSM      = dynamic_cast<TGeoNodeMatrix *>(geoXEn1->GetDaughter(iSM));
-        if(geoSM){
+        if (geoSM) {
           TGeoVolume      *geoSMVol   = geoSM->GetVolume(); 
           TGeoShape       *geoSMShape = geoSMVol->GetShape();
           TGeoBBox        *geoBox     = dynamic_cast<TGeoBBox *>(geoSMShape);
-          if(geoBox) depth = 0.5 * geoBox->GetDX()*2 ;
+          if (geoBox) depth = 0.5 * geoBox->GetDX()*2 ;
           else AliFatal("Null GEANT box");
-        }else AliFatal("NULL  GEANT node matrix");
+        }
+        else AliFatal("NULL  GEANT node matrix");
       }
-      else{//electron
-        depth = x0 * (TMath::Log(energy*1000 / ecr)  - 0.5); //Multiply energy by 1000 to transform to MeV
+      else
+      {//electron
+       if (arg < 1) 
+         depth = 0;
+       else
+         depth = x0 * (TMath::Log(arg) - 0.5); 
       }
         
       break;
       
     default://photon
-      depth = x0 * (TMath::Log(energy*1000 / ecr) + 0.5); //Multiply energy by 1000 to transform to MeV
+      if (arg < 1) 
+       depth = 0;
+      else
+       depth = x0 * (TMath::Log(arg) + 0.5);
   }  
   
   return depth;
-  
 }
 
-//__________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::GetMaxEnergyCell(AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu, 
-                                         Int_t & absId,  Int_t& iSupMod, Int_t& ieta, Int_t& iphi, Bool_t &shared)
+//____________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::GetMaxEnergyCell(const AliEMCALGeometry *geom, 
+                                         AliVCaloCells* cells, 
+                                         const AliVCluster* clu, 
+                                         Int_t  & absId,  
+                                         Int_t  & iSupMod, 
+                                         Int_t  & ieta, 
+                                         Int_t  & iphi, 
+                                         Bool_t & shared)
 {
   //For a given CaloCluster gets the absId of the cell 
   //with maximum energy deposit.
@@ -666,7 +873,7 @@ void AliEMCALRecoUtils::GetMaxEnergyCell(AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells*
   Int_t iIeta   = -1;
   Int_t iSupMod0= -1;
 
-  if(!clu){
+  if (!clu) {
     AliInfo("Cluster pointer null!");
     absId=-1; iSupMod0=-1, ieta = -1; iphi = -1; shared = -1;
     return;
@@ -676,20 +883,21 @@ void AliEMCALRecoUtils::GetMaxEnergyCell(AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells*
     cellAbsId = clu->GetCellAbsId(iDig);
     fraction  = clu->GetCellAmplitudeFraction(iDig);
     //printf("a Cell %d, id, %d, amp %f, fraction %f\n",iDig,cellAbsId,cells->GetCellAmplitude(cellAbsId),fraction);
-    if(fraction < 1e-4) fraction = 1.; // in case unfolding is off
+    if (fraction < 1e-4) fraction = 1.; // in case unfolding is off
     geom->GetCellIndex(cellAbsId,iSupMod,iTower,iIphi,iIeta); 
     geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,iTower,iIphi, iIeta,iphi,ieta);
-    if(iDig==0) iSupMod0=iSupMod;
-    else if(iSupMod0!=iSupMod) {
+    if (iDig==0) {
+      iSupMod0=iSupMod;
+    } else if (iSupMod0!=iSupMod)  {
       shared = kTRUE;
       //printf("AliEMCALRecoUtils::GetMaxEnergyCell() - SHARED CLUSTER\n");
     }
-    if(IsRecalibrationOn()) {
+    if (!fCellsRecalibrated && IsRecalibrationOn()) {
       recalFactor = GetEMCALChannelRecalibrationFactor(iSupMod,ieta,iphi);
     }
     eCell  = cells->GetCellAmplitude(cellAbsId)*fraction*recalFactor;
     //printf("b Cell %d, id, %d, amp %f, fraction %f\n",iDig,cellAbsId,eCell,fraction);
-    if(eCell > eMax)  { 
+    if (eCell > eMax) { 
       eMax  = eCell; 
       absId = cellAbsId;
       //printf("\t new max: cell %d, e %f, ecell %f\n",maxId, eMax,eCell);
@@ -703,118 +911,211 @@ void AliEMCALRecoUtils::GetMaxEnergyCell(AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells*
                                          iIphi, iIeta,iphi,ieta); 
   //printf("Max id %d, iSM %d, col %d, row %d\n",absId,iSupMod,ieta,iphi);
   //printf("Max end---\n");
-  
 }
 
-//________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::InitEMCALRecalibrationFactors(){
-       //Init EMCAL recalibration factors
-       AliDebug(2,"AliCalorimeterUtils::InitEMCALRecalibrationFactors()");
-       //In order to avoid rewriting the same histograms
-       Bool_t oldStatus = TH1::AddDirectoryStatus();
-       TH1::AddDirectory(kFALSE);
-  
-       fEMCALRecalibrationFactors = new TObjArray(10);
-       for (int i = 0; i < 10; i++) fEMCALRecalibrationFactors->Add(new TH2F(Form("EMCALRecalFactors_SM%d",i),Form("EMCALRecalFactors_SM%d",i),  48, 0, 48, 24, 0, 24));
-       //Init the histograms with 1
-       for (Int_t sm = 0; sm < 10; sm++) {
-               for (Int_t i = 0; i < 48; i++) {
-                       for (Int_t j = 0; j < 24; j++) {
-                               SetEMCALChannelRecalibrationFactor(sm,i,j,1.);
-                       }
-               }
-       }
-       fEMCALRecalibrationFactors->SetOwner(kTRUE);
-       fEMCALRecalibrationFactors->Compress();
-       
-       //In order to avoid rewriting the same histograms
-       TH1::AddDirectory(oldStatus);           
+//______________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::InitParameters()
+{
+  // Initialize data members with default values
+  
+  fParticleType = kPhoton;
+  fPosAlgo      = kUnchanged;
+  fW0           = 4.5;
+  
+  fNonLinearityFunction = kNoCorrection;
+  fNonLinearThreshold   = 30;
+  
+  fExoticCellFraction     = 0.97;
+  fExoticCellDiffTime     = 1e6;
+  fExoticCellMinAmplitude = 0.5;
+  
+  fAODFilterMask    = 128;
+  fAODHybridTracks  = kFALSE;
+  fAODTPCOnlyTracks = kTRUE;
+  
+  fCutEtaPhiSum      = kTRUE;
+  fCutEtaPhiSeparate = kFALSE;
+  
+  fCutR   = 0.05; 
+  fCutEta = 0.025; 
+  fCutPhi = 0.05;
+  
+  fClusterWindow = 100;
+  fMass          = 0.139;
+  
+  fStepSurface   = 20.;                      
+  fStepCluster   = 5.;
+  fTrackCutsType = kLooseCut;
+  
+  fCutMinTrackPt     = 0;
+  fCutMinNClusterTPC = -1;
+  fCutMinNClusterITS = -1;
+  
+  fCutMaxChi2PerClusterTPC  = 1e10;
+  fCutMaxChi2PerClusterITS  = 1e10;
+  
+  fCutRequireTPCRefit     = kFALSE;
+  fCutRequireITSRefit     = kFALSE;
+  fCutAcceptKinkDaughters = kFALSE;
+  
+  fCutMaxDCAToVertexXY = 1e10;             
+  fCutMaxDCAToVertexZ  = 1e10;              
+  fCutDCAToVertex2D    = kFALSE;
+  
+  fCutRequireITSStandAlone = kFALSE; //MARCEL
+  fCutRequireITSpureSA     = kFALSE; //Marcel
+  
+  //Misalignment matrices
+  for (Int_t i = 0; i < 15 ; i++) 
+  {
+    fMisalTransShift[i] = 0.; 
+    fMisalRotShift[i]   = 0.; 
+  }
+  
+  //Non linearity
+  for (Int_t i = 0; i < 7  ; i++) fNonLinearityParams[i] = 0.; 
+  
+  //For kBeamTestCorrectedv2 case, but default is no correction
+  fNonLinearityParams[0] =  0.983504;
+  fNonLinearityParams[1] =  0.210106;
+  fNonLinearityParams[2] =  0.897274;
+  fNonLinearityParams[3] =  0.0829064;
+  fNonLinearityParams[4] =  152.299;
+  fNonLinearityParams[5] =  31.5028;
+  fNonLinearityParams[6] =  0.968;
+  
+  //Cluster energy smearing
+  fSmearClusterEnergy   = kFALSE;
+  fSmearClusterParam[0] = 0.07; // * sqrt E term
+  fSmearClusterParam[1] = 0.00; // * E term
+  fSmearClusterParam[2] = 0.00; // constant
 }
 
-//________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::InitEMCALTimeRecalibrationFactors(){
-       //Init EMCAL recalibration factors
-       AliDebug(2,"AliCalorimeterUtils::InitEMCALRecalibrationFactors()");
-       //In order to avoid rewriting the same histograms
-       Bool_t oldStatus = TH1::AddDirectoryStatus();
-       TH1::AddDirectory(kFALSE);
+//_____________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::InitEMCALRecalibrationFactors()
+{
+  //Init EMCAL recalibration factors
+  AliDebug(2,"AliCalorimeterUtils::InitEMCALRecalibrationFactors()");
+  //In order to avoid rewriting the same histograms
+  Bool_t oldStatus = TH1::AddDirectoryStatus();
+  TH1::AddDirectory(kFALSE);
+  
+  fEMCALRecalibrationFactors = new TObjArray(12);
+  for (int i = 0; i < 12; i++) 
+    fEMCALRecalibrationFactors->Add(new TH2F(Form("EMCALRecalFactors_SM%d",i),
+                                             Form("EMCALRecalFactors_SM%d",i),  48, 0, 48, 24, 0, 24));
+  //Init the histograms with 1
+  for (Int_t sm = 0; sm < 12; sm++) 
+  {
+    for (Int_t i = 0; i < 48; i++) 
+    {
+      for (Int_t j = 0; j < 24; j++) 
+      {
+        SetEMCALChannelRecalibrationFactor(sm,i,j,1.);
+      }
+    }
+  }
   
-       fEMCALTimeRecalibrationFactors = new TObjArray(4);
-       for (int i = 0; i < 4; i++) 
+  fEMCALRecalibrationFactors->SetOwner(kTRUE);
+  fEMCALRecalibrationFactors->Compress();
+  
+  //In order to avoid rewriting the same histograms
+  TH1::AddDirectory(oldStatus);    
+}
+
+//_________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::InitEMCALTimeRecalibrationFactors()
+{
+  //Init EMCAL recalibration factors
+  AliDebug(2,"AliCalorimeterUtils::InitEMCALRecalibrationFactors()");
+  //In order to avoid rewriting the same histograms
+  Bool_t oldStatus = TH1::AddDirectoryStatus();
+  TH1::AddDirectory(kFALSE);
+  
+  fEMCALTimeRecalibrationFactors = new TObjArray(4);
+  for (int i = 0; i < 4; i++) 
     fEMCALTimeRecalibrationFactors->Add(new TH1F(Form("hAllTimeAvBC%d",i),
                                                  Form("hAllTimeAvBC%d",i),  
-                                                 48*24*10,0.,48*24*10)          );
-       //Init the histograms with 1
-       for (Int_t bc = 0; bc < 4; bc++) {
-                       for (Int_t i = 0; i < 48*24*10; i++) 
-        SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(bc,i,0.);
+                                                 48*24*12,0.,48*24*12)          );
+  //Init the histograms with 1
+  for (Int_t bc = 0; bc < 4; bc++) 
+  {
+    for (Int_t i = 0; i < 48*24*12; i++) 
+      SetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(bc,i,0.);
   }
-
-       fEMCALTimeRecalibrationFactors->SetOwner(kTRUE);
-       fEMCALTimeRecalibrationFactors->Compress();
-       
-       //In order to avoid rewriting the same histograms
-       TH1::AddDirectory(oldStatus);           
+  
+  fEMCALTimeRecalibrationFactors->SetOwner(kTRUE);
+  fEMCALTimeRecalibrationFactors->Compress();
+  
+  //In order to avoid rewriting the same histograms
+  TH1::AddDirectory(oldStatus);    
 }
 
-//________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::InitEMCALBadChannelStatusMap(){
-       //Init EMCAL bad channels map
-       AliDebug(2,"AliEMCALRecoUtils::InitEMCALBadChannelStatusMap()");
-       //In order to avoid rewriting the same histograms
-       Bool_t oldStatus = TH1::AddDirectoryStatus();
-       TH1::AddDirectory(kFALSE);
-       
-       fEMCALBadChannelMap = new TObjArray(10);
-       //TH2F * hTemp = new  TH2I("EMCALBadChannelMap","EMCAL SuperModule bad channel map", 48, 0, 48, 24, 0, 24);
-       for (int i = 0; i < 10; i++) {
-               fEMCALBadChannelMap->Add(new TH2I(Form("EMCALBadChannelMap_Mod%d",i),Form("EMCALBadChannelMap_Mod%d",i), 48, 0, 48, 24, 0, 24));
-       }
-               
-       fEMCALBadChannelMap->SetOwner(kTRUE);
-       fEMCALBadChannelMap->Compress();
-       
-       //In order to avoid rewriting the same histograms
-       TH1::AddDirectory(oldStatus);           
+//____________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::InitEMCALBadChannelStatusMap()
+{
+  //Init EMCAL bad channels map
+  AliDebug(2,"AliEMCALRecoUtils::InitEMCALBadChannelStatusMap()");
+  //In order to avoid rewriting the same histograms
+  Bool_t oldStatus = TH1::AddDirectoryStatus();
+  TH1::AddDirectory(kFALSE);
+  
+  fEMCALBadChannelMap = new TObjArray(12);
+  //TH2F * hTemp = new  TH2I("EMCALBadChannelMap","EMCAL SuperModule bad channel map", 48, 0, 48, 24, 0, 24);
+  for (int i = 0; i < 12; i++) 
+  {
+    fEMCALBadChannelMap->Add(new TH2I(Form("EMCALBadChannelMap_Mod%d",i),Form("EMCALBadChannelMap_Mod%d",i), 48, 0, 48, 24, 0, 24));
+  }
+  
+  fEMCALBadChannelMap->SetOwner(kTRUE);
+  fEMCALBadChannelMap->Compress();
+  
+  //In order to avoid rewriting the same histograms
+  TH1::AddDirectory(oldStatus);    
 }
 
-//________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::RecalibrateClusterEnergy(AliEMCALGeometry* geom, AliVCluster * cluster, AliVCaloCells * cells, const Int_t bc){
-       // Recalibrate the cluster energy and Time, considering the recalibration map 
+//____________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::RecalibrateClusterEnergy(const AliEMCALGeometry* geom, 
+                                                 AliVCluster * cluster, 
+                                                 AliVCaloCells * cells, 
+                                                 Int_t bc)
+{
+  // Recalibrate the cluster energy and Time, considering the recalibration map 
   // and the energy of the cells and time that compose the cluster.
   // bc= bunch crossing number returned by esdevent->GetBunchCrossNumber();
-       
-  if(!cluster){
+  
+  if (!cluster) {
     AliInfo("Cluster pointer null!");
     return;
   }  
   
-       //Get the cluster number of cells and list of absId, check what kind of cluster do we have.
-       UShort_t * index    = cluster->GetCellsAbsId() ;
-       Double_t * fraction = cluster->GetCellsAmplitudeFraction() ;
-       Int_t ncells = cluster->GetNCells();
-       
-       //Initialize some used variables
-       Float_t energy = 0;
-       Int_t   absId  =-1;
+  //Get the cluster number of cells and list of absId, check what kind of cluster do we have.
+  UShort_t * index    = cluster->GetCellsAbsId() ;
+  Double_t * fraction = cluster->GetCellsAmplitudeFraction() ;
+  Int_t ncells = cluster->GetNCells();
+  
+  //Initialize some used variables
+  Float_t energy = 0;
+  Int_t   absId  =-1;
   Int_t   icol   =-1, irow =-1, imod=1;
-       Float_t factor = 1, frac = 0;
+  Float_t factor = 1, frac = 0;
   Int_t   absIdMax = -1;
   Float_t emax     = 0;
   
-       //Loop on the cells, get the cell amplitude and recalibration factor, multiply and and to the new energy
-       for(Int_t icell = 0; icell < ncells; icell++){
-               absId = index[icell];
-               frac =  fraction[icell];
-               if(frac < 1e-5) frac = 1; //in case of EMCAL, this is set as 0 since unfolding is off
+  //Loop on the cells, get the cell amplitude and recalibration factor, multiply and and to the new energy
+  for (Int_t icell = 0; icell < ncells; icell++)
+  {
+    absId = index[icell];
+    frac =  fraction[icell];
+    if (frac < 1e-5) frac = 1; //in case of EMCAL, this is set as 0 since unfolding is off
     
-    if(!fCellsRecalibrated && IsRecalibrationOn()){
-      
+    if (!fCellsRecalibrated && IsRecalibrationOn()) {
       // Energy  
       Int_t iTower = -1, iIphi = -1, iIeta = -1; 
       geom->GetCellIndex(absId,imod,iTower,iIphi,iIeta); 
-      if(fEMCALRecalibrationFactors->GetEntries() <= imod) continue;
-      geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(imod,iTower,iIphi, iIeta,irow,icol);                   
+      if (fEMCALRecalibrationFactors->GetEntries() <= imod) 
+       continue;
+      geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(imod,iTower,iIphi, iIeta,irow,icol);      
       factor = GetEMCALChannelRecalibrationFactor(imod,icol,irow);
       
       AliDebug(2,Form("AliEMCALRecoUtils::RecalibrateClusterEnergy - recalibrate cell: module %d, col %d, row %d, cell fraction %f,recalibration factor %f, cell energy %f\n",
@@ -822,152 +1123,105 @@ void AliEMCALRecoUtils::RecalibrateClusterEnergy(AliEMCALGeometry* geom, AliVClu
       
     } 
     
-               energy += cells->GetCellAmplitude(absId)*factor*frac;
+    energy += cells->GetCellAmplitude(absId)*factor*frac;
     
-    if(emax < cells->GetCellAmplitude(absId)*factor*frac){
+    if (emax < cells->GetCellAmplitude(absId)*factor*frac) {
       emax     = cells->GetCellAmplitude(absId)*factor*frac;
       absIdMax = absId;
     }
+  }
+  
+  AliDebug(2,Form("AliEMCALRecoUtils::RecalibrateClusterEnergy - Energy before %f, after %f \n",cluster->E(),energy));
 
-       }
-       
   cluster->SetE(energy);
 
-  AliDebug(2,Form("AliEMCALRecoUtils::RecalibrateClusterEnergy - Energy before %f, after %f\n",cluster->E(),energy));
+  // Recalculate time of cluster
+  Double_t timeorg = cluster->GetTOF();
 
-       // Recalculate time of cluster only for ESDs
-  if(!strcmp("AliESDCaloCluster",Form("%s",cluster->ClassName()))){
-    
-    // Time
-    Double_t weightedTime = 0;
-    Double_t weight       = 0;
-    Double_t weightTot    = 0;
-    Double_t maxcellTime  = 0;
-    for(Int_t icell = 0; icell < ncells; icell++){
-      absId = index[icell];
-      frac =  fraction[icell];
-      if(frac < 1e-5) frac = 1; //in case of EMCAL, this is set as 0 since unfolding is off
-
-      Double_t celltime = cells->GetCellTime(absId);
-      RecalibrateCellTime(absId, bc, celltime);
-      if(absId == absIdMax) maxcellTime = celltime;
-
-      if(!fCellsRecalibrated){
-      
-        Int_t iTower = -1, iIphi = -1, iIeta = -1; 
-        geom->GetCellIndex(absId,imod,iTower,iIphi,iIeta); 
-        if(fEMCALRecalibrationFactors->GetEntries() <= imod) continue;
-        geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(imod,iTower,iIphi, iIeta,irow,icol);                 
-        factor = GetEMCALChannelRecalibrationFactor(imod,icol,irow);
-        
-        AliDebug(2,Form("AliEMCALRecoUtils::RecalibrateClusterEnergy - recalibrate cell: module %d, col %d, row %d, cell fraction %f,recalibration factor %f, cell energy %f\n",
-                        imod,icol,irow,frac,factor,cells->GetCellTime(absId)));
-        
-      } 
-      
-      weight        = GetCellWeight(cells->GetCellAmplitude(absId)*factor*frac , energy );
-      weightTot    += weight;
-      weightedTime += celltime * weight;
-      
-    }
-    
-    if(weightTot > 0)
-      cluster->SetTOF(weightedTime/weightTot);
-    else 
-      cluster->SetTOF(maxcellTime);
-    
-  }
+  Double_t time = cells->GetCellTime(absIdMax);
+  if (!fCellsRecalibrated && IsTimeRecalibrationOn())
+    RecalibrateCellTime(absIdMax,bc,time);
+
+  cluster->SetTOF(time);
+
+  AliDebug(2,Form("AliEMCALRecoUtils::RecalibrateClusterEnergy - Time before %f, after %f \n",timeorg,cluster->GetTOF()));
 }
 
-//________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::RecalibrateCells(AliEMCALGeometry* geom, AliVCaloCells * cells, Int_t bc){
-       // Recalibrate the cells time and energy, considering the recalibration map and the energy 
+//_____________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::RecalibrateCells(AliVCaloCells * cells,
+                                         Int_t bc)
+{
+  // Recalibrate the cells time and energy, considering the recalibration map and the energy 
   // of the cells that compose the cluster.
   // bc= bunch crossing number returned by esdevent->GetBunchCrossNumber();
 
-  if(!IsRecalibrationOn() && !IsTimeRecalibrationOn()) return;
+  if (!IsRecalibrationOn() && !IsTimeRecalibrationOn() && !IsBadChannelsRemovalSwitchedOn()) 
+    return;
   
-  if(!cells){
+  if (!cells) {
     AliInfo("Cells pointer null!");
     return;
   }  
   
-  fCellsRecalibrated = kTRUE;
-  
-  Int_t absId  =-1;
-  Int_t icol   =-1, irow  =-1, imod  = 1;
-  Int_t iTower =-1, iIeta =-1, iIphi =-1;
-
-  Int_t nEMcell = cells->GetNumberOfCells() ;
-  
-  for (Int_t iCell = 0; iCell < nEMcell; iCell++) { 
+  Short_t  absId  =-1;
+  Bool_t   accept = kFALSE;
+  Float_t  ecell  = 0;
+  Double_t tcell  = 0;
+  Double_t ecellin = 0;
+  Double_t tcellin = 0;
+  Int_t  mclabel = -1;
+  Double_t efrac = 0;
+  
+  Int_t nEMcell  = cells->GetNumberOfCells() ;  
+  for (Int_t iCell = 0; iCell < nEMcell; iCell++) 
+  { 
+    cells->GetCell( iCell, absId, ecellin, tcellin, mclabel, efrac );
     
-    absId = cells->GetCellNumber(iCell);
-    
-    // Energy
-    Float_t factor = 1;
-    if(IsRecalibrationOn()){
-      geom->GetCellIndex(absId,imod,iTower,iIphi,iIeta); 
-      if(fEMCALRecalibrationFactors->GetEntries() <= imod) continue;
-      geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(imod,iTower,iIphi, iIeta,irow,icol);   
-      factor = GetEMCALChannelRecalibrationFactor(imod,icol,irow);
-               }
-    
-    Float_t cellE      = cells->GetAmplitude(iCell) * factor ;
-    
-    //Time
-    Double_t celltime = cells->GetCellTime(absId);
-    RecalibrateCellTime(absId, bc, celltime);
+    accept = AcceptCalibrateCell(absId, bc, ecell ,tcell ,cells); 
+    if (!accept) {
+      ecell = 0;
+      tcell = -1;
+    }
     
     //Set new values
-    cells->SetCell(iCell,cells->GetCellNumber(iCell),cellE, celltime);
-    
+    cells->SetCell(iCell,absId,ecell, tcell, mclabel, efrac);
   }
-  
+
+  fCellsRecalibrated = kTRUE;
 }
 
-//________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::RecalibrateCellTime(const Int_t absId, const Int_t bc, Double_t & celltime){
-       // Recalibrate time of cell with absID  considering the recalibration map 
+//_______________________________________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::RecalibrateCellTime(Int_t absId, Int_t bc, Double_t & celltime) const
+{
+  // Recalibrate time of cell with absID  considering the recalibration map 
   // bc= bunch crossing number returned by esdevent->GetBunchCrossNumber();
-    
-  if(!fCellsRecalibrated && IsTimeRecalibrationOn()){
-//    printf("cell time org %g, ",celltime);
-
-    Double_t timeBCoffset = 0.;
-    if( bc%4 ==0 || bc%4==1) timeBCoffset = 100.*1.e-9; //in ns        
-    
-    Double_t celloffset = GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(bc%4,absId)*1.e-9; 
-    
-//    printf("absId %d, time %f bc %d-%d: bc0 %f, bc1 %f, bc2 %f, bc3 %f \n", absId, celltime*1.e9,bc, bc%4, 
-//           GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(0,absId),GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(1,absId),
-//           GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(2,absId),GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(3,absId));
-    
-    celltime -= timeBCoffset ;
-    celltime -= celloffset   ;  
-//    printf("new %g\n",celltime);
-  }
   
+  if (!fCellsRecalibrated && IsTimeRecalibrationOn() && bc >= 0) {
+    celltime -= GetEMCALChannelTimeRecalibrationFactor(bc%4,absId)*1.e-9;    ;  
+  }
 }
   
-//__________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPosition(AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu)
+//______________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPosition(const AliEMCALGeometry *geom, 
+                                                   AliVCaloCells* cells, 
+                                                   AliVCluster* clu)
 {
   //For a given CaloCluster recalculates the position for a given set of misalignment shifts and puts it again in the CaloCluster.
   
-  if(!clu){
+  if (!clu) {
     AliInfo("Cluster pointer null!");
     return;
   }
     
-  if     (fPosAlgo==kPosTowerGlobal) RecalculateClusterPositionFromTowerGlobal( geom, cells, clu);
-  else if(fPosAlgo==kPosTowerIndex)  RecalculateClusterPositionFromTowerIndex ( geom, cells, clu);
-  else   AliDebug(2,"Algorithm to recalculate position not selected, do nothing.");
-  
+  if      (fPosAlgo==kPosTowerGlobal) RecalculateClusterPositionFromTowerGlobal( geom, cells, clu);
+  else if (fPosAlgo==kPosTowerIndex)  RecalculateClusterPositionFromTowerIndex ( geom, cells, clu);
+  else    AliDebug(2,"Algorithm to recalculate position not selected, do nothing.");
 }  
 
-//__________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPositionFromTowerGlobal(AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu)
+//_____________________________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPositionFromTowerGlobal(const AliEMCALGeometry *geom, 
+                                                                  AliVCaloCells* cells, 
+                                                                  AliVCluster* clu)
 {
   // For a given CaloCluster recalculates the position for a given set of misalignment shifts and puts it again in the CaloCluster.
   // The algorithm is a copy of what is done in AliEMCALRecPoint
@@ -985,23 +1239,23 @@ void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPositionFromTowerGlobal(AliEMCALGeomet
   Bool_t shared = kFALSE;
 
   Float_t  clEnergy = clu->E(); //Energy already recalibrated previously
+  if (clEnergy <= 0)
+    return;
   GetMaxEnergyCell(geom, cells, clu, absId,  iSupModMax, ieta, iphi,shared);
   Double_t depth = GetDepth(clEnergy,fParticleType,iSupModMax) ;
   
   //printf("** Cluster energy %f, ncells %d, depth %f\n",clEnergy,clu->GetNCells(),depth);
   
-  for (Int_t iDig=0; iDig< clu->GetNCells(); iDig++) {
-    
-      absId = clu->GetCellAbsId(iDig);
-      fraction  = clu->GetCellAmplitudeFraction(iDig);
-      if(fraction < 1e-4) fraction = 1.; // in case unfolding is off
+  for (Int_t iDig=0; iDig< clu->GetNCells(); iDig++) 
+  {
+    absId = clu->GetCellAbsId(iDig);
+    fraction  = clu->GetCellAmplitudeFraction(iDig);
+    if (fraction < 1e-4) fraction = 1.; // in case unfolding is off
     
-    if(!fCellsRecalibrated){
-
+    if (!fCellsRecalibrated) {
       geom->GetCellIndex(absId,iSM,iTower,iIphi,iIeta); 
-      geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSM,iTower,iIphi, iIeta,iphi,ieta);                    
-      
-      if(IsRecalibrationOn()) {
+      geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSM,iTower,iIphi, iIeta,iphi,ieta);      
+      if (IsRecalibrationOn()) {
         recalFactor = GetEMCALChannelRecalibrationFactor(iSM,ieta,iphi);
       }
     }
@@ -1016,12 +1270,11 @@ void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPositionFromTowerGlobal(AliEMCALGeomet
     geom->GetGlobal(pLocal,pGlobal,iSupModMax);
     //printf("pLocal (%f,%f,%f)\n",pGlobal[0],pGlobal[1],pGlobal[2]);
 
-    for(int i=0; i<3; i++ ) newPos[i] += (weight*pGlobal[i]);
-    
+    for (int i=0; i<3; i++ ) newPos[i] += (weight*pGlobal[i]);
   }// cell loop
   
-  if(totalWeight>0){
-    for(int i=0; i<3; i++ )    newPos[i] /= totalWeight;
+  if (totalWeight>0) {
+    for (int i=0; i<3; i++ )    newPos[i] /= totalWeight;
   }
     
   //Float_t pos[]={0,0,0};
@@ -1029,28 +1282,26 @@ void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPositionFromTowerGlobal(AliEMCALGeomet
   //printf("OldPos  : %2.3f,%2.3f,%2.3f\n",pos[0],pos[1],pos[2]);
   //printf("NewPos  : %2.3f,%2.3f,%2.3f\n",newPos[0],newPos[1],newPos[2]);
   
-       if(iSupModMax > 1) {//sector 1
-         newPos[0] +=fMisalTransShift[3];//-=3.093; 
-         newPos[1] +=fMisalTransShift[4];//+=6.82;
-         newPos[2] +=fMisalTransShift[5];//+=1.635;
+  if (iSupModMax > 1) { //sector 1
+    newPos[0] +=fMisalTransShift[3];//-=3.093; 
+    newPos[1] +=fMisalTransShift[4];//+=6.82;
+    newPos[2] +=fMisalTransShift[5];//+=1.635;
     //printf("   +    : %2.3f,%2.3f,%2.3f\n",fMisalTransShift[3],fMisalTransShift[4],fMisalTransShift[5]);
-
-       }
-       else {//sector 0
-         newPos[0] +=fMisalTransShift[0];//+=1.134;
-         newPos[1] +=fMisalTransShift[1];//+=8.2;
-         newPos[2] +=fMisalTransShift[2];//+=1.197;
+  } else { //sector 0
+    newPos[0] +=fMisalTransShift[0];//+=1.134;
+    newPos[1] +=fMisalTransShift[1];//+=8.2;
+    newPos[2] +=fMisalTransShift[2];//+=1.197;
     //printf("   +    : %2.3f,%2.3f,%2.3f\n",fMisalTransShift[0],fMisalTransShift[1],fMisalTransShift[2]);
-
-       }
+  }
   //printf("NewPos : %2.3f,%2.3f,%2.3f\n",newPos[0],newPos[1],newPos[2]);
 
   clu->SetPosition(newPos);
-  
 }  
 
-//__________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPositionFromTowerIndex(AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster* clu)
+//____________________________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPositionFromTowerIndex(const AliEMCALGeometry *geom, 
+                                                                 AliVCaloCells* cells, 
+                                                                 AliVCluster* clu)
 {
   // For a given CaloCluster recalculates the position for a given set of misalignment shifts and puts it again in the CaloCluster.
   // The algorithm works with the tower indeces, averages the indeces and from them it calculates the global position
@@ -1062,11 +1313,14 @@ void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPositionFromTowerIndex(AliEMCALGeometr
   Int_t absId   = -1;
   Int_t iTower  = -1;
   Int_t iIphi   = -1, iIeta   = -1;
-       Int_t iSupMod = -1, iSupModMax = -1;
+  Int_t iSupMod = -1, iSupModMax = -1;
   Int_t iphi = -1, ieta =-1;
   Bool_t shared = kFALSE;
 
   Float_t clEnergy = clu->E(); //Energy already recalibrated previously.
+  
+  if (clEnergy <= 0)
+    return;
   GetMaxEnergyCell(geom, cells, clu, absId,  iSupModMax, ieta, iphi,shared);
   Float_t  depth = GetDepth(clEnergy,fParticleType,iSupMod) ;
 
@@ -1074,543 +1328,792 @@ void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPositionFromTowerIndex(AliEMCALGeometr
   Bool_t areInSameSM = kTRUE; //exclude clusters with cells in different SMs for now
   Int_t startingSM = -1;
   
-  for (Int_t iDig=0; iDig< clu->GetNCells(); iDig++) {
+  for (Int_t iDig=0; iDig< clu->GetNCells(); iDig++) 
+  {
     absId = clu->GetCellAbsId(iDig);
     fraction  = clu->GetCellAmplitudeFraction(iDig);
-    if(fraction < 1e-4) fraction = 1.; // in case unfolding is off
+    if (fraction < 1e-4) fraction = 1.; // in case unfolding is off
 
-    if     (iDig==0)  startingSM = iSupMod;
-    else if(iSupMod != startingSM) areInSameSM = kFALSE;
+    if      (iDig==0)  startingSM = iSupMod;
+    else if (iSupMod != startingSM) areInSameSM = kFALSE;
 
     eCell  = cells->GetCellAmplitude(absId);
     
     geom->GetCellIndex(absId,iSupMod,iTower,iIphi,iIeta); 
-    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,iTower,iIphi, iIeta,iphi,ieta);          
+    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,iTower,iIphi, iIeta,iphi,ieta);    
     
-    if(!fCellsRecalibrated){
-      
-      if(IsRecalibrationOn()) {
-                
+    if (!fCellsRecalibrated)
+    {
+      if (IsRecalibrationOn()) {
         recalFactor = GetEMCALChannelRecalibrationFactor(iSupMod,ieta,iphi);
-        
       }
     }
     
     eCell  = cells->GetCellAmplitude(absId)*fraction*recalFactor;
     
     weight = GetCellWeight(eCell,clEnergy);
-    if(weight < 0) weight = 0;
+    if (weight < 0) weight = 0;
     totalWeight += weight;
     weightedCol += ieta*weight;
     weightedRow += iphi*weight;
     
     //printf("Max cell? cell %d, amplitude org %f, fraction %f, recalibration %f, amplitude new %f \n",cellAbsId, cells->GetCellAmplitude(cellAbsId), fraction, recalFactor, eCell) ;
-    
-    }// cell loop
+  }// cell loop
     
   Float_t xyzNew[]={0.,0.,0.};
-  if(areInSameSM == kTRUE) {
+  if (areInSameSM == kTRUE) {
     //printf("In Same SM\n");
     weightedCol = weightedCol/totalWeight;
     weightedRow = weightedRow/totalWeight;
     geom->RecalculateTowerPosition(weightedRow, weightedCol, iSupModMax, depth, fMisalTransShift, fMisalRotShift, xyzNew); 
-  }
-  else {
+  } 
+  else 
+  {
     //printf("In Different SM\n");
     geom->RecalculateTowerPosition(iphi,        ieta,        iSupModMax, depth, fMisalTransShift, fMisalRotShift, xyzNew); 
   }
   
   clu->SetPosition(xyzNew);
-  
 }
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterDistanceToBadChannel(AliEMCALGeometry * geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster * cluster){           
-       
+//___________________________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterDistanceToBadChannel(const AliEMCALGeometry * geom, 
+                                                               AliVCaloCells* cells, 
+                                                               AliVCluster * cluster)
+{           
   //re-evaluate distance to bad channel with updated bad map
   
-  if(!fRecalDistToBadChannels) return;
+  if (!fRecalDistToBadChannels) return;
   
-  if(!cluster){
+  if (!cluster)
+  {
     AliInfo("Cluster pointer null!");
     return;
   }  
   
-       //Get channels map of the supermodule where the cluster is.
-  Int_t absIdMax       = -1, iSupMod =-1, icolM = -1, irowM = -1;
+  //Get channels map of the supermodule where the cluster is.
+  Int_t absIdMax  = -1, iSupMod =-1, icolM = -1, irowM = -1;
   Bool_t shared = kFALSE;
   GetMaxEnergyCell(geom, cells, cluster, absIdMax,  iSupMod, icolM, irowM, shared);
   TH2D* hMap  = (TH2D*)fEMCALBadChannelMap->At(iSupMod);
 
-  Int_t dRrow, dRcol;  
-       Float_t  minDist = 10000.;
-       Float_t  dist    = 0.;
+  Int_t dRrow, dRcol;  
+  Float_t  minDist = 10000.;
+  Float_t  dist    = 0.;
   
   //Loop on tower status map 
-       for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
-               for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
-                       //Check if tower is bad.
-                       if(hMap->GetBinContent(icol,irow)==0) continue;
+  for (Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++)
+  {
+    for (Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++)
+    {
+      //Check if tower is bad.
+      if (hMap->GetBinContent(icol,irow)==0) continue;
       //printf("AliEMCALRecoUtils::RecalculateDistanceToBadChannels() - \n \t Bad channel in SM %d, col %d, row %d, \n \t Cluster max in col %d, row %d\n",
       //       iSupMod,icol, irow, icolM,irowM);
       
       dRrow=TMath::Abs(irowM-irow);
       dRcol=TMath::Abs(icolM-icol);
       dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dRcol*dRcol);
-                       if(dist < minDist){
+      if (dist < minDist)
+      {
         //printf("MIN DISTANCE TO BAD %2.2f\n",dist);
         minDist = dist;
       }
-      
-               }
-       }
+    }
+  }
   
-       //In case the cluster is shared by 2 SuperModules, need to check the map of the second Super Module
-       if (shared) {
-               TH2D* hMap2 = 0;
-               Int_t iSupMod2 = -1;
+  //In case the cluster is shared by 2 SuperModules, need to check the map of the second Super Module
+  if (shared) 
+  {
+    TH2D* hMap2 = 0;
+    Int_t iSupMod2 = -1;
     
-               //The only possible combinations are (0,1), (2,3) ... (8,9)
-               if(iSupMod%2) iSupMod2 = iSupMod-1;
-               else          iSupMod2 = iSupMod+1;
-               hMap2  = (TH2D*)fEMCALBadChannelMap->At(iSupMod2);
+    //The only possible combinations are (0,1), (2,3) ... (8,9)
+    if (iSupMod%2) iSupMod2 = iSupMod-1;
+    else           iSupMod2 = iSupMod+1;
+    hMap2  = (TH2D*)fEMCALBadChannelMap->At(iSupMod2);
     
-               //Loop on tower status map of second super module
-               for(Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++){
-                       for(Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++){
-                               //Check if tower is bad.
-                               if(hMap2->GetBinContent(icol,irow)==0) continue;
-                               //printf("AliEMCALRecoUtils::RecalculateDistanceToBadChannels(shared) - \n \t Bad channel in SM %d, col %d, row %d \n \t Cluster max in SM %d, col %d, row %d\n",
-          //     iSupMod2,icol, irow,iSupMod,icolM,irowM);
-        
+    //Loop on tower status map of second super module
+    for (Int_t irow = 0; irow < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALRows; irow++)
+    {
+      for (Int_t icol = 0; icol < AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols; icol++)
+      {
+        //Check if tower is bad.
+        if (hMap2->GetBinContent(icol,irow)==0) 
+         continue;
+        //printf("AliEMCALRecoUtils::RecalculateDistanceToBadChannels(shared) - \n \t Bad channel in SM %d, col %d, row %d \n \t Cluster max in SM %d, col %d, row %d\n",
+        //     iSupMod2,icol, irow,iSupMod,icolM,irowM);
         dRrow=TMath::Abs(irow-irowM);
         
-        if(iSupMod%2) {
-                                 dRcol=TMath::Abs(icol-(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+icolM));
-                               }
-        else {
+        if (iSupMod%2) {
+          dRcol=TMath::Abs(icol-(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+icolM));
+        } else {
           dRcol=TMath::Abs(AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols+icol-icolM);
-                               }                    
-        
-                               dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dRcol*dRcol);
-        if(dist < minDist) minDist = dist;        
+        }                    
         
-                       }
-               }
-    
-       }// shared cluster in 2 SuperModules
+        dist=TMath::Sqrt(dRrow*dRrow+dRcol*dRcol);
+        if (dist < minDist) minDist = dist;        
+      }
+    }
+  }// shared cluster in 2 SuperModules
   
   AliDebug(2,Form("Max cluster cell (SM,col,row)=(%d %d %d) - Distance to Bad Channel %2.2f",iSupMod, icolM, irowM, minDist));
   cluster->SetDistanceToBadChannel(minDist);
-  
 }
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPID(AliVCluster * cluster){           
-       
+//__________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterPID(AliVCluster * cluster)
+{           
   //re-evaluate identification parameters with bayesian
   
-  if(!cluster){
+  if (!cluster) {
     AliInfo("Cluster pointer null!");
     return;
   }
   
-       if ( cluster->GetM02() != 0)
+  if (cluster->GetM02() != 0)
     fPIDUtils->ComputePID(cluster->E(),cluster->GetM02());
   
-  Float_t pidlist[AliPID::kSPECIESN+1];
-       for(Int_t i = 0; i < AliPID::kSPECIESN+1; i++) pidlist[i] = fPIDUtils->GetPIDFinal(i);
-  
+  Float_t pidlist[AliPID::kSPECIESCN+1];
+  for (Int_t i = 0; i < AliPID::kSPECIESCN+1; i++) pidlist[i] = fPIDUtils->GetPIDFinal(i);
+        
   cluster->SetPID(pidlist);
-       
 }
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterShowerShapeParameters(AliEMCALGeometry * geom, AliVCaloCells* cells, AliVCluster * cluster)
+//___________________________________________________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterShowerShapeParameters(const AliEMCALGeometry * geom, 
+                                                                AliVCaloCells* cells, 
+                                                                AliVCluster * cluster,
+                                                                Float_t & l0,   Float_t & l1,   
+                                                                Float_t & disp, Float_t & dEta, Float_t & dPhi,
+                                                                Float_t & sEta, Float_t & sPhi, Float_t & sEtaPhi)
 {
   // Calculates new center of gravity in the local EMCAL-module coordinates 
   // and tranfers into global ALICE coordinates
   // Calculates Dispersion and main axis
   
-  if(!cluster){
+  if (!cluster) {
     AliInfo("Cluster pointer null!");
     return;
   }
     
-  Int_t nstat  = 0;
-  Float_t wtot = 0. ;
   Double_t eCell       = 0.;
   Float_t  fraction    = 1.;
   Float_t  recalFactor = 1.;
 
-  Int_t iSupMod = -1;
-  Int_t iTower  = -1;
-  Int_t iIphi   = -1;
-  Int_t iIeta   = -1;
-  Int_t iphi    = -1;
-  Int_t ieta    = -1;
-  Double_t etai = -1.;
-  Double_t phii = -1.;
-  
-  Double_t w     = 0.;
-  Double_t d     = 0.;
-  Double_t dxx   = 0.;
-  Double_t dzz   = 0.;
-  Double_t dxz   = 0.;  
-  Double_t xmean = 0.;
-  Double_t zmean = 0.;
+  Int_t    iSupMod = -1;
+  Int_t    iTower  = -1;
+  Int_t    iIphi   = -1;
+  Int_t    iIeta   = -1;
+  Int_t    iphi    = -1;
+  Int_t    ieta    = -1;
+  Double_t etai    = -1.;
+  Double_t phii    = -1.;
+  
+  Int_t    nstat   = 0 ;
+  Float_t  wtot    = 0.;
+  Double_t w       = 0.;
+  Double_t etaMean = 0.;
+  Double_t phiMean = 0.;
+  
+  //Loop on cells, calculate the cluster energy, in case a cut on cell energy is added
+  // and to check if the cluster is between 2 SM in eta
+  Int_t   iSM0   = -1;
+  Bool_t  shared = kFALSE;
+  Float_t energy = 0;
+  
+  for (Int_t iDigit=0; iDigit < cluster->GetNCells(); iDigit++)
+  {
+    //Get from the absid the supermodule, tower and eta/phi numbers
+    geom->GetCellIndex(cluster->GetCellAbsId(iDigit),iSupMod,iTower,iIphi,iIeta);
+    geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,iTower,iIphi,iIeta, iphi,ieta);
     
-  //Loop on cells
-  for(Int_t iDigit=0; iDigit < cluster->GetNCells(); iDigit++) {
+    //Check if there are cells of different SM
+    if      (iDigit == 0   ) iSM0 = iSupMod;
+    else if (iSupMod!= iSM0) shared = kTRUE;
+    
+    //Get the cell energy, if recalibration is on, apply factors
+    fraction  = cluster->GetCellAmplitudeFraction(iDigit);
+    if (fraction < 1e-4) fraction = 1.; // in case unfolding is off
+    
+    if (IsRecalibrationOn()) {
+      recalFactor = GetEMCALChannelRecalibrationFactor(iSupMod,ieta,iphi);
+    }
     
+    eCell  = cells->GetCellAmplitude(cluster->GetCellAbsId(iDigit))*fraction*recalFactor;
+    
+    energy += eCell;
+    
+  }//cell loop
+  
+  //Loop on cells
+  for (Int_t iDigit=0; iDigit < cluster->GetNCells(); iDigit++) 
+  {
     //Get from the absid the supermodule, tower and eta/phi numbers
     geom->GetCellIndex(cluster->GetCellAbsId(iDigit),iSupMod,iTower,iIphi,iIeta); 
     geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,iTower,iIphi,iIeta, iphi,ieta);        
     
     //Get the cell energy, if recalibration is on, apply factors
     fraction  = cluster->GetCellAmplitudeFraction(iDigit);
-    if(fraction < 1e-4) fraction = 1.; // in case unfolding is off
+    if (fraction < 1e-4) fraction = 1.; // in case unfolding is off
     
-    if(!fCellsRecalibrated){
-      
-      if(IsRecalibrationOn()) {
+    if (!fCellsRecalibrated) {
+      if (IsRecalibrationOn()) {
         recalFactor = GetEMCALChannelRecalibrationFactor(iSupMod,ieta,iphi);
       }
-      
     }
     
     eCell  = cells->GetCellAmplitude(cluster->GetCellAbsId(iDigit))*fraction*recalFactor;
     
-    if(cluster->E() > 0 && eCell > 0){
-      
+    // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
+    // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
+    if (shared && iSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
+    
+    if (cluster->E() > 0 && eCell > 0) {
       w  = GetCellWeight(eCell,cluster->E());
       
       etai=(Double_t)ieta;
-      phii=(Double_t)iphi;             
-      if(w > 0.0) {
+      phii=(Double_t)iphi;  
+      
+      if (w > 0.0) {
         wtot += w ;
-        nstat++;                       
+        nstat++;            
         //Shower shape
-        dxx  += w * etai * etai ;
-        xmean+= w * etai ;
-        dzz  += w * phii * phii ;
-        zmean+= w * phii ; 
-        dxz  += w * etai * phii ; 
+        sEta     += w * etai * etai ;
+        etaMean  += w * etai ;
+        sPhi     += w * phii * phii ;
+        phiMean  += w * phii ; 
+        sEtaPhi  += w * etai * phii ; 
       }
-    }
-    else
+    } else
       AliError(Form("Wrong energy %f and/or amplitude %f\n", eCell, cluster->E()));
   }//cell loop
   
-  //Normalize to the weight    
+  //Normalize to the weight  
   if (wtot > 0) {
-    xmean /= wtot ;
-    zmean /= wtot ;
-  }
-  else
+    etaMean /= wtot ;
+    phiMean /= wtot ;
+  } else
     AliError(Form("Wrong weight %f\n", wtot));
   
-  //Calculate dispersion       
-  for(Int_t iDigit=0; iDigit < cluster->GetNCells(); iDigit++) {
-    
+  //Calculate dispersion  
+  for (Int_t iDigit=0; iDigit < cluster->GetNCells(); iDigit++) 
+  {
     //Get from the absid the supermodule, tower and eta/phi numbers
     geom->GetCellIndex(cluster->GetCellAbsId(iDigit),iSupMod,iTower,iIphi,iIeta); 
     geom->GetCellPhiEtaIndexInSModule(iSupMod,iTower,iIphi,iIeta, iphi,ieta);
     
     //Get the cell energy, if recalibration is on, apply factors
     fraction  = cluster->GetCellAmplitudeFraction(iDigit);
-    if(fraction < 1e-4) fraction = 1.; // in case unfolding is off
-    if(IsRecalibrationOn()) {
+    if (fraction < 1e-4) fraction = 1.; // in case unfolding is off
+    if (IsRecalibrationOn()) {
       recalFactor = GetEMCALChannelRecalibrationFactor(iSupMod,ieta,iphi);
     }
     eCell  = cells->GetCellAmplitude(cluster->GetCellAbsId(iDigit))*fraction*recalFactor;
     
-    if(cluster->E() > 0 && eCell > 0){
-      
+    // In case of a shared cluster, index of SM in C side, columns start at 48 and ends at 48*2
+    // C Side impair SM, nSupMod%2=1; A side pair SM, nSupMod%2=0
+    if (shared && iSupMod%2) ieta+=AliEMCALGeoParams::fgkEMCALCols;
+    
+    if (cluster->E() > 0 && eCell > 0) {
       w  = GetCellWeight(eCell,cluster->E());
       
       etai=(Double_t)ieta;
-      phii=(Double_t)iphi;             
-      if(w > 0.0)  d +=  w*((etai-xmean)*(etai-xmean)+(phii-zmean)*(phii-zmean)); 
-    }
-    else
+      phii=(Double_t)iphi;    
+      if (w > 0.0) { 
+        disp +=  w *((etai-etaMean)*(etai-etaMean)+(phii-phiMean)*(phii-phiMean)); 
+        dEta +=  w * (etai-etaMean)*(etai-etaMean) ; 
+        dPhi +=  w * (phii-phiMean)*(phii-phiMean) ; 
+      }
+    } else
       AliError(Form("Wrong energy %f and/or amplitude %f\n", eCell, cluster->E()));
   }// cell loop
   
   //Normalize to the weigth and set shower shape parameters
   if (wtot > 0 && nstat > 1) {
-    d /= wtot ;
-    dxx /= wtot ;
-    dzz /= wtot ;
-    dxz /= wtot ;
-    dxx -= xmean * xmean ;
-    dzz -= zmean * zmean ;
-    dxz -= xmean * zmean ;
-    cluster->SetM02(0.5 * (dxx + dzz) + TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz ));
-    cluster->SetM20(0.5 * (dxx + dzz) - TMath::Sqrt( 0.25 * (dxx - dzz) * (dxx - dzz) + dxz * dxz ));
-  }
-  else{
-    d=0. ;
-    cluster->SetM20(0.) ;
-    cluster->SetM02(0.) ;
-  }    
-  
-  if (d>=0)
-    cluster->SetDispersion(TMath::Sqrt(d)) ;
-  else    
-    cluster->SetDispersion(0) ;
+    disp    /= wtot ;
+    dEta    /= wtot ;
+    dPhi    /= wtot ;
+    sEta    /= wtot ;
+    sPhi    /= wtot ;
+    sEtaPhi /= wtot ;
+    
+    sEta    -= etaMean * etaMean ;
+    sPhi    -= phiMean * phiMean ;
+    sEtaPhi -= etaMean * phiMean ;
+    
+    l0 = (0.5 * (sEta + sPhi) + TMath::Sqrt( 0.25 * (sEta - sPhi) * (sEta - sPhi) + sEtaPhi * sEtaPhi ));
+    l1 = (0.5 * (sEta + sPhi) - TMath::Sqrt( 0.25 * (sEta - sPhi) * (sEta - sPhi) + sEtaPhi * sEtaPhi ));
+  } else {
+    l0   = 0. ;
+    l1   = 0. ;
+    dEta = 0. ; dPhi = 0. ; disp    = 0. ;
+    sEta = 0. ; sPhi = 0. ; sEtaPhi = 0. ;
+  }  
 }
 
+//____________________________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterShowerShapeParameters(const AliEMCALGeometry * geom, 
+                                                                AliVCaloCells* cells, 
+                                                                AliVCluster * cluster)
+{
+  // Calculates new center of gravity in the local EMCAL-module coordinates 
+  // and tranfers into global ALICE coordinates
+  // Calculates Dispersion and main axis and puts them into the cluster
+  
+  Float_t l0   = 0., l1   = 0.;
+  Float_t disp = 0., dEta = 0., dPhi    = 0.; 
+  Float_t sEta = 0., sPhi = 0., sEtaPhi = 0.;
+  
+  AliEMCALRecoUtils::RecalculateClusterShowerShapeParameters(geom,cells,cluster,l0,l1,disp,
+                                                             dEta, dPhi, sEta, sPhi, sEtaPhi);
+  
+  cluster->SetM02(l0);
+  cluster->SetM20(l1);
+  if (disp > 0. ) cluster->SetDispersion(TMath::Sqrt(disp)) ;
+  
+} 
+
 //____________________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::FindMatches(AliVEvent *event,TObjArray * clusterArr,  AliEMCALGeometry *geom)
+void AliEMCALRecoUtils::FindMatches(AliVEvent *event,
+                                    TObjArray * clusterArr,  
+                                    const AliEMCALGeometry *geom)
 {
   //This function should be called before the cluster loop
   //Before call this function, please recalculate the cluster positions
   //Given the input event, loop over all the tracks, select the closest cluster as matched with fCutR
   //Store matched cluster indexes and residuals
   
-  fMatchedTrackIndex->Reset();
+  fMatchedTrackIndex  ->Reset();
   fMatchedClusterIndex->Reset();
   fResidualPhi->Reset();
   fResidualEta->Reset();
   
-  fMatchedTrackIndex->Set(500);
-  fMatchedClusterIndex->Set(500);
-  fResidualPhi->Set(500);
-  fResidualEta->Set(500);
+  fMatchedTrackIndex  ->Set(1000);
+  fMatchedClusterIndex->Set(1000);
+  fResidualPhi->Set(1000);
+  fResidualEta->Set(1000);
   
   AliESDEvent* esdevent = dynamic_cast<AliESDEvent*> (event);
   AliAODEvent* aodevent = dynamic_cast<AliAODEvent*> (event);
   
+  // init the magnetic field if not already on
+  if (!TGeoGlobalMagField::Instance()->GetField()) {
+    if (!event->InitMagneticField())
+    {
+      AliInfo("Mag Field not initialized, null esd/aod evetn pointers");
+    }
+  } // Init mag field
+  
+  if (esdevent) {
+    UInt_t mask1 = esdevent->GetESDRun()->GetDetectorsInDAQ();
+    UInt_t mask2 = esdevent->GetESDRun()->GetDetectorsInReco();
+    Bool_t desc1 = (mask1 >> 3) & 0x1;
+    Bool_t desc2 = (mask2 >> 3) & 0x1;
+    if (desc1==0 || desc2==0) { 
+//       AliError(Form("TPC not in DAQ/RECO: %u (%u)/%u (%u)", 
+//       mask1, esdevent->GetESDRun()->GetDetectorsInReco(),
+//       mask2, esdevent->GetESDRun()->GetDetectorsInDAQ()));
+      fITSTrackSA=kTRUE;
+    }
+  }
+
+  TObjArray *clusterArray = 0x0;
+  if (!clusterArr) {
+    clusterArray = new TObjArray(event->GetNumberOfCaloClusters());
+    for (Int_t icl=0; icl<event->GetNumberOfCaloClusters(); icl++) 
+    {
+      AliVCluster *cluster = (AliVCluster*) event->GetCaloCluster(icl);
+      if (geom && !IsGoodCluster(cluster,geom,(AliVCaloCells*)event->GetEMCALCells())) 
+       continue;
+      clusterArray->AddAt(cluster,icl);
+    }
+  }
+  
   Int_t    matched=0;
   Double_t cv[21];
   for (Int_t i=0; i<21;i++) cv[i]=0;
-  for(Int_t itr=0; itr<event->GetNumberOfTracks(); itr++)
+  for (Int_t itr=0; itr<event->GetNumberOfTracks(); itr++)
   {
     AliExternalTrackParam *trackParam = 0;
     
     //If the input event is ESD, the starting point for extrapolation is TPCOut, if available, or TPCInner 
-    if(esdevent)
-    {
-      AliESDtrack *esdTrack = esdevent->GetTrack(itr);
-      if(!esdTrack || !IsAccepted(esdTrack)) continue;
-      if(esdTrack->Pt()<fCutMinTrackPt) continue;
-      trackParam =  const_cast<AliExternalTrackParam*>(esdTrack->GetInnerParam());
+    AliESDtrack *esdTrack = 0;
+    AliAODTrack *aodTrack = 0;
+    if (esdevent) {
+      esdTrack = esdevent->GetTrack(itr);
+      if (!esdTrack) continue;
+      if (!IsAccepted(esdTrack)) continue;
+      if (esdTrack->Pt()<fCutMinTrackPt) continue;
+      Double_t phi = esdTrack->Phi()*TMath::RadToDeg();
+      if (TMath::Abs(esdTrack->Eta())>0.9 || phi <= 10 || phi >= 250 ) continue;
+      if (!fITSTrackSA)
+       trackParam =  const_cast<AliExternalTrackParam*>(esdTrack->GetInnerParam());  // if TPC Available
+      else
+       trackParam =  new AliExternalTrackParam(*esdTrack); // If ITS Track Standing alone              
     }
     
     //If the input event is AOD, the starting point for extrapolation is at vertex
-    //AOD tracks are selected according to its bit.
-    else if(aodevent)
-    {
-      AliAODTrack *aodTrack = aodevent->GetTrack(itr);
-      if(!aodTrack) continue;
-      if(!aodTrack->TestFilterMask(fAODFilterMask)) continue; //Select AOD tracks that fulfill GetStandardITSTPCTrackCuts2010()
-      if(aodTrack->Pt()<fCutMinTrackPt) continue;
+    //AOD tracks are selected according to its filterbit.
+    else if (aodevent) {
+      aodTrack = aodevent->GetTrack(itr);
+      if (!aodTrack) continue;
+            
+      if (fAODTPCOnlyTracks) { // Match with TPC only tracks, default from May 2013, before filter bit 32
+        //printf("Match with TPC only tracks, accept? %d, test bit 128 <%d> \n", aodTrack->IsTPCOnly(), aodTrack->TestFilterMask(128));
+        if (!aodTrack->IsTPCOnly()) continue ;
+      } else if (fAODHybridTracks) { // Match with hybrid tracks
+        //printf("Match with Hybrid tracks, accept? %d \n", aodTrack->IsHybridGlobalConstrainedGlobal());
+        if (!aodTrack->IsHybridGlobalConstrainedGlobal()) continue ;
+      } else { // Match with tracks on a mask
+        //printf("Match with tracks having filter bit mask %d, accept? %d \n",fAODFilterMask,aodTrack->TestFilterMask(fAODFilterMask));
+        if (!aodTrack->TestFilterMask(fAODFilterMask) ) continue; //Select AOD tracks
+      }
+      
+      if (aodTrack->Pt()<fCutMinTrackPt) continue;
+
+      Double_t phi = aodTrack->Phi()*TMath::RadToDeg();
+      if (TMath::Abs(aodTrack->Eta())>0.9 || phi <= 10 || phi >= 250 ) 
+       continue;
       Double_t pos[3],mom[3];
       aodTrack->GetXYZ(pos);
       aodTrack->GetPxPyPz(mom);
       AliDebug(5,Form("aod track: i=%d | pos=(%5.4f,%5.4f,%5.4f) | mom=(%5.4f,%5.4f,%5.4f) | charge=%d\n",itr,pos[0],pos[1],pos[2],mom[0],mom[1],mom[2],aodTrack->Charge()));
+
       trackParam= new AliExternalTrackParam(pos,mom,cv,aodTrack->Charge());
     }
     
     //Return if the input data is not "AOD" or "ESD"
-    else
-    {
+    else {
       printf("Wrong input data type! Should be \"AOD\" or \"ESD\"\n");
+      if (clusterArray) {
+       clusterArray->Clear();
+       delete clusterArray;
+      }
       return;
     }
     
-    if(!trackParam) continue;
-    
-    Float_t dRMax = fCutR, dEtaMax=fCutEta, dPhiMax=fCutPhi;
+    if (!trackParam) continue;
+
+    //Extrapolate the track to EMCal surface
+    AliExternalTrackParam emcalParam(*trackParam);
+    Float_t eta, phi, pt;
+    if (!ExtrapolateTrackToEMCalSurface(&emcalParam, fEMCalSurfaceDistance, fMass, fStepSurface, eta, phi, pt)) {
+      if (aodevent && trackParam) delete trackParam;
+      if (fITSTrackSA && trackParam) delete trackParam;
+      continue;
+    }
+
+    if (TMath::Abs(eta)>0.75 || (phi) < 70*TMath::DegToRad() || (phi) > 190*TMath::DegToRad()) {
+      if (aodevent && trackParam) delete trackParam;
+      if (fITSTrackSA && trackParam) delete trackParam;
+      continue;
+    }
+
+    //Find matched clusters
     Int_t index = -1;
-    if(!clusterArr){// get clusters from event
-      for(Int_t icl=0; icl<event->GetNumberOfCaloClusters(); icl++)
-      {
-        AliVCluster *cluster = (AliVCluster*) event->GetCaloCluster(icl);
-        if(geom && !IsGoodCluster(cluster,geom,(AliVCaloCells*)event->GetEMCALCells())) continue;
-        AliExternalTrackParam trkPamTmp(*trackParam);//Retrieve the starting point every time before the extrapolation 
-        Float_t tmpEta=-999, tmpPhi=-999;
-        if(!ExtrapolateTrackToCluster(&trkPamTmp, cluster, tmpEta, tmpPhi)) continue;
-        if(fCutEtaPhiSum)
-        {
-          Float_t tmpR=TMath::Sqrt(tmpEta*tmpEta + tmpPhi*tmpPhi);
-          if(tmpR<dRMax)
-          {
-            dRMax=tmpR;
-            dEtaMax=tmpEta;
-            dPhiMax=tmpPhi;
-            index=icl;
-          }
-        }
-        else if(fCutEtaPhiSeparate)
-        {
-          if(TMath::Abs(tmpEta)<TMath::Abs(dEtaMax) && TMath::Abs(tmpPhi)<TMath::Abs(dPhiMax))
-          {
-            dEtaMax = tmpEta;
-            dPhiMax = tmpPhi;
-            index=icl;
-          }
-        }
-        else
-        {
-          printf("Error: please specify your cut criteria\n");
-          printf("To cut on sqrt(dEta^2+dPhi^2), use: SwitchOnCutEtaPhiSum()\n");
-          printf("To cut on dEta and dPhi separately, use: SwitchOnCutEtaPhiSeparate()\n");
-          if(aodevent && trackParam) delete trackParam;
-          return;
-        }
-      }//cluster loop
-    } 
-    else { // external cluster array, not from ESD event
-      for(Int_t icl=0; icl<clusterArr->GetEntriesFast(); icl++)
-      {
-        AliVCluster *cluster = dynamic_cast<AliVCluster*> (clusterArr->At(icl)) ;
-        if(!cluster){ 
-          AliInfo("Cluster not found!!!");
-          continue;
-        }
-        if(!cluster->IsEMCAL()) continue;
-        AliExternalTrackParam trkPamTmp (*trackParam);//Retrieve the starting point every time before the extrapolation
-        Float_t tmpEta=-999, tmpPhi=-999;
-        if(!ExtrapolateTrackToCluster(&trkPamTmp, cluster, tmpEta, tmpPhi)) continue;
-        if(fCutEtaPhiSum)
-        {
-          Float_t tmpR=TMath::Sqrt(tmpEta*tmpEta + tmpPhi*tmpPhi);
-          if(tmpR<dRMax)
-          {
-            dRMax=tmpR;
-            dEtaMax=tmpEta;
-            dPhiMax=tmpPhi;
-            index=icl;
-          }
-        }
-        else if(fCutEtaPhiSeparate)
-        {
-          if(TMath::Abs(tmpEta)<TMath::Abs(dEtaMax) && TMath::Abs(tmpPhi)<TMath::Abs(dPhiMax))
-          {
-            dEtaMax = tmpEta;
-            dPhiMax = tmpPhi;
-            index=icl;
-          }
-        }
-        else
-        {
-          printf("Error: please specify your cut criteria\n");
-          printf("To cut on sqrt(dEta^2+dPhi^2), use: SwitchOnCutEtaPhiSum()\n");
-          printf("To cut on dEta and dPhi separately, use: SwitchOnCutEtaPhiSeparate()\n");
-          if(aodevent && trackParam) delete trackParam;
-          return;
-        }
-      }//cluster loop
-    }// external list of clusters
+    Float_t dEta = -999, dPhi = -999;
+    if (!clusterArr) {
+      index = FindMatchedClusterInClusterArr(&emcalParam, &emcalParam, clusterArray, dEta, dPhi);  
+    } else {
+      index = FindMatchedClusterInClusterArr(&emcalParam, &emcalParam, clusterArr, dEta, dPhi);  
+    }  
     
-    if(index>-1)
-    {
-      fMatchedTrackIndex  ->AddAt(itr,matched);
-      fMatchedClusterIndex->AddAt(index,matched);
-      fResidualEta          ->AddAt(dEtaMax,matched);
-      fResidualPhi          ->AddAt(dPhiMax,matched);
+    if (index>-1) {
+      fMatchedTrackIndex   ->AddAt(itr,matched);
+      fMatchedClusterIndex ->AddAt(index,matched);
+      fResidualEta         ->AddAt(dEta,matched);
+      fResidualPhi         ->AddAt(dPhi,matched);
       matched++;
     }
-    if(aodevent && trackParam) delete trackParam;
+    if (aodevent && trackParam) delete trackParam;
+    if (fITSTrackSA && trackParam) delete trackParam;
   }//track loop
+
+  if (clusterArray) {
+    clusterArray->Clear();
+    delete clusterArray;
+  }
   
   AliDebug(2,Form("Number of matched pairs = %d !\n",matched));
   
-  fMatchedTrackIndex  ->Set(matched);
-  fMatchedClusterIndex->Set(matched);
-  fResidualPhi          ->Set(matched);
-  fResidualEta          ->Set(matched);
+  fMatchedTrackIndex   ->Set(matched);
+  fMatchedClusterIndex ->Set(matched);
+  fResidualPhi         ->Set(matched);
+  fResidualEta         ->Set(matched);
 }
 
 //________________________________________________________________________________
-Int_t AliEMCALRecoUtils::FindMatchedCluster(AliESDtrack *track, AliVEvent *event, AliEMCALGeometry *geom)
+Int_t AliEMCALRecoUtils::FindMatchedClusterInEvent(const AliESDtrack *track, 
+                                                   const AliVEvent *event, 
+                                                   const AliEMCALGeometry *geom, 
+                                                   Float_t &dEta, Float_t &dPhi)
 {
   //
   // This function returns the index of matched cluster to input track
   // Returns -1 if no match is found
-  
-  
-  Float_t dRMax = fCutR, dEtaMax = fCutEta, dPhiMax = fCutPhi;
   Int_t index = -1;
+  Double_t phiV = track->Phi()*TMath::RadToDeg();
+  if (TMath::Abs(track->Eta())>0.9 || phiV <= 10 || phiV >= 250 ) return index;
+  AliExternalTrackParam *trackParam = 0;
+  if (!fITSTrackSA)
+    trackParam = const_cast<AliExternalTrackParam*>(track->GetInnerParam());  // If TPC
+  else
+    trackParam = new AliExternalTrackParam(*track);
+    
+  if (!trackParam) return index;
+  AliExternalTrackParam emcalParam(*trackParam);
+  Float_t eta, phi, pt;
+
+  if (!ExtrapolateTrackToEMCalSurface(&emcalParam, fEMCalSurfaceDistance, fMass, fStepSurface, eta, phi, pt))  {
+    if (fITSTrackSA) delete trackParam;
+    return index;
+  }
+  if (TMath::Abs(eta)>0.75 || (phi) < 70*TMath::DegToRad() || (phi) > 190*TMath::DegToRad()) {
+    if (fITSTrackSA) delete trackParam;
+    return index;
+  }
   
-  AliExternalTrackParam *trackParam = const_cast<AliExternalTrackParam*>(track->GetInnerParam());
-  
-  if(!trackParam) return index;          
-  for(Int_t icl=0; icl<event->GetNumberOfCaloClusters(); icl++)
+  TObjArray *clusterArr = new TObjArray(event->GetNumberOfCaloClusters());
+
+  for (Int_t icl=0; icl<event->GetNumberOfCaloClusters(); icl++)
   {
     AliVCluster *cluster = (AliVCluster*) event->GetCaloCluster(icl);
-    if(geom && !IsGoodCluster(cluster,geom,(AliVCaloCells*)event->GetEMCALCells())) continue;  
-    AliExternalTrackParam trkPamTmp (*trackParam);//Retrieve the starting point every time before the extrapolation
-    Float_t tmpEta=-999, tmpPhi=-999;
-    if(!ExtrapolateTrackToCluster(&trkPamTmp, cluster, tmpEta, tmpPhi)) continue;
-    if(fCutEtaPhiSum)
-    {
+    if (geom && !IsGoodCluster(cluster,geom,(AliVCaloCells*)event->GetEMCALCells())) continue;
+    clusterArr->AddAt(cluster,icl);
+  }
+
+  index = FindMatchedClusterInClusterArr(&emcalParam, &emcalParam, clusterArr, dEta, dPhi);  
+  clusterArr->Clear();
+  delete clusterArr;
+  if (fITSTrackSA) delete trackParam;
+
+  return index;
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________________
+Int_t  AliEMCALRecoUtils::FindMatchedClusterInClusterArr(const AliExternalTrackParam *emcalParam, 
+                                                         AliExternalTrackParam *trkParam, 
+                                                         const TObjArray * clusterArr, 
+                                                         Float_t &dEta, Float_t &dPhi)
+{
+  // Find matched cluster in array
+  
+  dEta=-999, dPhi=-999;
+  Float_t dRMax = fCutR, dEtaMax=fCutEta, dPhiMax=fCutPhi;
+  Int_t index = -1;
+  Float_t tmpEta=-999, tmpPhi=-999;
+
+  Double_t exPos[3] = {0.,0.,0.};
+  if (!emcalParam->GetXYZ(exPos)) return index;
+
+  Float_t clsPos[3] = {0.,0.,0.};
+  for (Int_t icl=0; icl<clusterArr->GetEntriesFast(); icl++)
+  {
+    AliVCluster *cluster = dynamic_cast<AliVCluster*> (clusterArr->At(icl)) ;
+    if (!cluster || !cluster->IsEMCAL()) continue;
+    cluster->GetPosition(clsPos);
+    Double_t dR = TMath::Sqrt(TMath::Power(exPos[0]-clsPos[0],2)+TMath::Power(exPos[1]-clsPos[1],2)+TMath::Power(exPos[2]-clsPos[2],2));
+    if (dR > fClusterWindow) continue;
+    
+    AliExternalTrackParam trkPamTmp (*trkParam);//Retrieve the starting point every time before the extrapolation
+    if (!ExtrapolateTrackToCluster(&trkPamTmp, cluster, fMass, fStepCluster, tmpEta, tmpPhi)) continue;
+    if (fCutEtaPhiSum) {
       Float_t tmpR=TMath::Sqrt(tmpEta*tmpEta + tmpPhi*tmpPhi);
-      if(tmpR<dRMax)
-           {
-             dRMax=tmpR;
-             dEtaMax=tmpEta;
-             dPhiMax=tmpPhi;
-             index=icl;
-           }
-    }
-    else if(fCutEtaPhiSeparate)
-    {
-      if(TMath::Abs(tmpEta)<TMath::Abs(dEtaMax) && TMath::Abs(tmpPhi)<TMath::Abs(dPhiMax))
-           {
-             dEtaMax = tmpEta;
-             dPhiMax = tmpPhi;
-             index=icl;
-           }
-    }
-    else
-    {
+      if (tmpR<dRMax) {
+        dRMax=tmpR;
+        dEtaMax=tmpEta;
+        dPhiMax=tmpPhi;
+        index=icl;
+      }
+    } else if (fCutEtaPhiSeparate) {
+      if (TMath::Abs(tmpEta)<TMath::Abs(dEtaMax) && TMath::Abs(tmpPhi)<TMath::Abs(dPhiMax)) {
+        dEtaMax = tmpEta;
+        dPhiMax = tmpPhi;
+        index=icl;
+      }
+    } else {
       printf("Error: please specify your cut criteria\n");
       printf("To cut on sqrt(dEta^2+dPhi^2), use: SwitchOnCutEtaPhiSum()\n");
       printf("To cut on dEta and dPhi separately, use: SwitchOnCutEtaPhiSeparate()\n");
-      return -1;
+      return index;
     }
-  }//cluster loop
+  }
+
+  dEta=dEtaMax;
+  dPhi=dPhiMax;
+
   return index;
 }
 
-//________________________________________________________________________________
-Bool_t  AliEMCALRecoUtils::ExtrapolateTrackToCluster(AliExternalTrackParam *trkParam, AliVCluster *cluster, Float_t &tmpEta, Float_t &tmpPhi)
+//------------------------------------------------------------------------------------
+Bool_t AliEMCALRecoUtils::ExtrapolateTrackToEMCalSurface(AliVTrack *track,
+                                                        Double_t emcalR, Double_t mass, Double_t step)
+{ 
+  // Extrapolate track to EMCAL surface
+
+  track->SetTrackPhiEtaPtOnEMCal(-999, -999, -999);
+
+  if (track->Pt()<0.350) //todo: discuss with Marta, everywhere else we use pT=0
+    return kFALSE;
+
+  Double_t phi = track->Phi()*TMath::RadToDeg();
+  if (TMath::Abs(track->Eta())>0.9 || phi <= 10 || phi >= 250) 
+    return kFALSE;
+
+  AliESDtrack *esdt = dynamic_cast<AliESDtrack*>(track);
+  AliAODTrack *aodt = 0;
+  if (!esdt) {
+    aodt = dynamic_cast<AliAODTrack*>(track);
+    if (!aodt)
+      return kFALSE;
+  }
+
+  if (mass<0) {
+    Bool_t onlyTPC = kFALSE;
+    if (mass==-99)
+      onlyTPC=kTRUE;
+    if (esdt)
+      mass = esdt->GetMass(onlyTPC);
+    else 
+      mass = aodt->M();
+  }
+
+  AliExternalTrackParam *trackParam = 0;
+  if (esdt) {
+    const AliExternalTrackParam *in = esdt->GetInnerParam();
+    if (!in)
+      return kFALSE;
+    trackParam = new AliExternalTrackParam(*in);
+  } else {
+    Double_t xyz[3] = {0}, pxpypz[3] = {0}, cv[21] = {0};
+    aodt->PxPyPz(pxpypz);  
+    aodt->XvYvZv(xyz);
+    aodt->GetCovarianceXYZPxPyPz(cv);  
+    trackParam = new AliExternalTrackParam(xyz,pxpypz,cv,aodt->Charge());
+  }
+  if (!trackParam)
+    return kFALSE;
+
+  Float_t etaout=-999, phiout=-999, ptout=-999;
+  Bool_t ret = ExtrapolateTrackToEMCalSurface(trackParam, 
+                                             emcalR,
+                                             mass,
+                                             step,
+                                             etaout, 
+                                             phiout,
+                                             ptout);
+  delete trackParam;
+  if (!ret)
+    return kFALSE;
+  if (TMath::Abs(etaout)>0.75 || (phiout<70*TMath::DegToRad()) || (phiout>190*TMath::DegToRad()))
+    return kFALSE;
+  track->SetTrackPhiEtaPtOnEMCal(phiout, etaout, ptout);
+  return kTRUE;
+}
+
+
+//------------------------------------------------------------------------------------
+Bool_t AliEMCALRecoUtils::ExtrapolateTrackToEMCalSurface(AliExternalTrackParam *trkParam, 
+                                                         Double_t emcalR,
+                                                         Double_t mass, 
+                                                         Double_t step, 
+                                                         Float_t &eta, 
+                                                         Float_t &phi,
+                                                        Float_t &pt)
+{
+  //Extrapolate track to EMCAL surface
+  
+  eta = -999, phi = -999, pt = -999;
+  if (!trkParam) return kFALSE;
+  if (!AliTrackerBase::PropagateTrackToBxByBz(trkParam, emcalR, mass, step, kTRUE, 0.8, -1)) return kFALSE;
+  Double_t trkPos[3] = {0.,0.,0.};
+  if (!trkParam->GetXYZ(trkPos)) return kFALSE;
+  TVector3 trkPosVec(trkPos[0],trkPos[1],trkPos[2]);
+  eta = trkPosVec.Eta();
+  phi = trkPosVec.Phi();
+  pt = trkParam->Pt();
+  if (phi<0)
+    phi += 2*TMath::Pi();
+
+  return kTRUE;
+}
+
+//-----------------------------------------------------------------------------------
+Bool_t AliEMCALRecoUtils::ExtrapolateTrackToPosition(AliExternalTrackParam *trkParam, 
+                                                     const Float_t *clsPos, 
+                                                     Double_t mass, 
+                                                     Double_t step, 
+                                                     Float_t &tmpEta, 
+                                                     Float_t &tmpPhi)
 {
   //
-  //Return the residual by extrapolating a track to a cluster
+  //Return the residual by extrapolating a track param to a global position
   //
-  if(!trkParam || !cluster) return kFALSE;
-  Float_t clsPos[3];
-  Double_t trkPos[3];
-  cluster->GetPosition(clsPos); //Has been recalculated
+  tmpEta = -999;
+  tmpPhi = -999;
+  if (!trkParam) return kFALSE;
+  Double_t trkPos[3] = {0.,0.,0.};
   TVector3 vec(clsPos[0],clsPos[1],clsPos[2]);
   Double_t alpha =  ((int)(vec.Phi()*TMath::RadToDeg()/20)+0.5)*20*TMath::DegToRad();
   vec.RotateZ(-alpha); //Rotate the cluster to the local extrapolation coordinate system
-  if(!AliTrackerBase::PropagateTrackToBxByBz(trkParam, vec.X(), fMass, fStep,kTRUE, 0.8, -1)) return kFALSE;
-  trkParam->GetXYZ(trkPos); //Get the extrapolated global position
+  if (!AliTrackerBase::PropagateTrackToBxByBz(trkParam, vec.X(), mass, step,kTRUE, 0.8, -1)) return kFALSE;
+  if (!trkParam->GetXYZ(trkPos)) return kFALSE; //Get the extrapolated global position
 
   TVector3 clsPosVec(clsPos[0],clsPos[1],clsPos[2]);
   TVector3 trkPosVec(trkPos[0],trkPos[1],trkPos[2]);
 
   // track cluster matching
-  tmpPhi = clsPosVec.DeltaPhi(trkPosVec); // tmpPhi is between -pi and pi
-  tmpEta = clsPosVec.Eta()-trkPosVec.Eta();  // track cluster matching
+  tmpPhi = clsPosVec.DeltaPhi(trkPosVec);    // tmpPhi is between -pi and pi
+  tmpEta = clsPosVec.Eta()-trkPosVec.Eta();
 
   return kTRUE;
 }
 
-//________________________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::GetMatchedResiduals(Int_t clsIndex, Float_t &dEta, Float_t &dPhi)
+//----------------------------------------------------------------------------------
+Bool_t AliEMCALRecoUtils::ExtrapolateTrackToCluster(AliExternalTrackParam *trkParam, 
+                                                    const AliVCluster *cluster, 
+                                                    Double_t mass, 
+                                                    Double_t step, 
+                                                    Float_t &tmpEta, 
+                                                    Float_t &tmpPhi)
+{
+  //
+  //Return the residual by extrapolating a track param to a cluster
+  //
+  tmpEta = -999;
+  tmpPhi = -999;
+  if (!cluster || !trkParam) 
+    return kFALSE;
+
+  Float_t clsPos[3] = {0.,0.,0.};
+  cluster->GetPosition(clsPos);
+
+  return ExtrapolateTrackToPosition(trkParam, clsPos, mass, step, tmpEta, tmpPhi);
+}
+
+//---------------------------------------------------------------------------------
+Bool_t AliEMCALRecoUtils::ExtrapolateTrackToCluster(AliExternalTrackParam *trkParam, 
+                                                    const AliVCluster *cluster, 
+                                                    Float_t &tmpEta, 
+                                                    Float_t &tmpPhi)
+{
+  //
+  //Return the residual by extrapolating a track param to a clusterfStepCluster
+  //
+
+  return ExtrapolateTrackToCluster(trkParam, cluster, fMass, fStepCluster, tmpEta, tmpPhi);
+}
+
+//_______________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::GetMatchedResiduals(Int_t clsIndex, 
+                                            Float_t &dEta, Float_t &dPhi)
 {
   //Given a cluster index as in AliESDEvent::GetCaloCluster(clsIndex)
   //Get the residuals dEta and dPhi for this cluster to the closest track
   //Works with ESDs and AODs
 
-  if( FindMatchedPosForCluster(clsIndex) >= 999 )
-  {
+  if (FindMatchedPosForCluster(clsIndex) >= 999) {
     AliDebug(2,"No matched tracks found!\n");
     dEta=999.;
     dPhi=999.;
@@ -1619,15 +2122,15 @@ void AliEMCALRecoUtils::GetMatchedResiduals(Int_t clsIndex, Float_t &dEta, Float
   dEta = fResidualEta->At(FindMatchedPosForCluster(clsIndex));
   dPhi = fResidualPhi->At(FindMatchedPosForCluster(clsIndex));
 }
-//________________________________________________________________________________
+
+//______________________________________________________________________________________________
 void AliEMCALRecoUtils::GetMatchedClusterResiduals(Int_t trkIndex, Float_t &dEta, Float_t &dPhi)
 {
   //Given a track index as in AliESDEvent::GetTrack(trkIndex)
   //Get the residuals dEta and dPhi for this track to the closest cluster
   //Works with ESDs and AODs
 
-  if( FindMatchedPosForTrack(trkIndex) >= 999 )
-  {
+  if (FindMatchedPosForTrack(trkIndex) >= 999) {
     AliDebug(2,"No matched cluster found!\n");
     dEta=999.;
     dPhi=999.;
@@ -1644,7 +2147,7 @@ Int_t AliEMCALRecoUtils::GetMatchedTrackIndex(Int_t clsIndex)
   //Get the index of matched track to this cluster
   //Works with ESDs and AODs
   
-  if(IsClusterMatched(clsIndex))
+  if (IsClusterMatched(clsIndex))
     return fMatchedTrackIndex->At(FindMatchedPosForCluster(clsIndex));
   else 
     return -1; 
@@ -1657,35 +2160,35 @@ Int_t AliEMCALRecoUtils::GetMatchedClusterIndex(Int_t trkIndex)
   //Get the index of matched cluster to this track
   //Works with ESDs and AODs
   
-  if(IsTrackMatched(trkIndex))
+  if (IsTrackMatched(trkIndex))
     return fMatchedClusterIndex->At(FindMatchedPosForTrack(trkIndex));
   else 
     return -1; 
 }
 
-//__________________________________________________
+//______________________________________________________________
 Bool_t AliEMCALRecoUtils::IsClusterMatched(Int_t clsIndex) const
 {
   //Given a cluster index as in AliESDEvent::GetCaloCluster(clsIndex)
   //Returns if the cluster has a match
-  if(FindMatchedPosForCluster(clsIndex) < 999) 
+  if (FindMatchedPosForCluster(clsIndex) < 999) 
     return kTRUE;
   else
     return kFALSE;
 }
 
-//__________________________________________________
+//____________________________________________________________
 Bool_t AliEMCALRecoUtils::IsTrackMatched(Int_t trkIndex) const 
 {
   //Given a track index as in AliESDEvent::GetTrack(trkIndex)
   //Returns if the track has a match
-  if(FindMatchedPosForTrack(trkIndex) < 999) 
+  if (FindMatchedPosForTrack(trkIndex) < 999) 
     return kTRUE;
   else
     return kFALSE;
 }
 
-//__________________________________________________________
+//______________________________________________________________________
 UInt_t AliEMCALRecoUtils::FindMatchedPosForCluster(Int_t clsIndex) const
 {
   //Given a cluster index as in AliESDEvent::GetCaloCluster(clsIndex)
@@ -1693,23 +2196,22 @@ UInt_t AliEMCALRecoUtils::FindMatchedPosForCluster(Int_t clsIndex) const
   Float_t tmpR = fCutR;
   UInt_t pos = 999;
   
-  for(Int_t i=0; i<fMatchedClusterIndex->GetSize(); i++)
+  for (Int_t i=0; i<fMatchedClusterIndex->GetSize(); i++) 
   {
-    if(fMatchedClusterIndex->At(i)==clsIndex)
-      {
-       Float_t r = TMath::Sqrt(fResidualEta->At(i)*fResidualEta->At(i) + fResidualPhi->At(i)*fResidualPhi->At(i));
-       if(r<tmpR)
-         {
-           pos=i;
-           tmpR=r;
-           AliDebug(3,Form("Matched cluster index: index: %d, dEta: %2.4f, dPhi: %2.4f.\n",fMatchedClusterIndex->At(i),fResidualEta->At(i),fResidualPhi->At(i)));
-         }
+    if (fMatchedClusterIndex->At(i)==clsIndex) {
+      Float_t r = TMath::Sqrt(fResidualEta->At(i)*fResidualEta->At(i) + fResidualPhi->At(i)*fResidualPhi->At(i));
+      if (r<tmpR) {
+        pos=i;
+        tmpR=r;
+        AliDebug(3,Form("Matched cluster index: index: %d, dEta: %2.4f, dPhi: %2.4f.\n",
+                        fMatchedClusterIndex->At(i),fResidualEta->At(i),fResidualPhi->At(i)));
       }
+    }
   }
   return pos;
 }
 
-//__________________________________________________________
+//____________________________________________________________________
 UInt_t AliEMCALRecoUtils::FindMatchedPosForTrack(Int_t trkIndex) const
 {
   //Given a track index as in AliESDEvent::GetTrack(trkIndex)
@@ -1717,33 +2219,35 @@ UInt_t AliEMCALRecoUtils::FindMatchedPosForTrack(Int_t trkIndex) const
   Float_t tmpR = fCutR;
   UInt_t pos = 999;
   
-  for(Int_t i=0; i<fMatchedTrackIndex->GetSize(); i++)
+  for (Int_t i=0; i<fMatchedTrackIndex->GetSize(); i++) 
   {
-    if(fMatchedTrackIndex->At(i)==trkIndex)
-      {
-       Float_t r = TMath::Sqrt(fResidualEta->At(i)*fResidualEta->At(i) + fResidualPhi->At(i)*fResidualPhi->At(i));
-       if(r<tmpR)
-         {
-           pos=i;
-           tmpR=r;
-           AliDebug(3,Form("Matched track index: index: %d, dEta: %2.4f, dPhi: %2.4f.\n",fMatchedTrackIndex->At(i),fResidualEta->At(i),fResidualPhi->At(i)));
-         }
+    if (fMatchedTrackIndex->At(i)==trkIndex) {
+      Float_t r = TMath::Sqrt(fResidualEta->At(i)*fResidualEta->At(i) + fResidualPhi->At(i)*fResidualPhi->At(i));
+      if (r<tmpR) {
+        pos=i;
+        tmpR=r;
+        AliDebug(3,Form("Matched track index: index: %d, dEta: %2.4f, dPhi: %2.4f.\n",
+                        fMatchedTrackIndex->At(i),fResidualEta->At(i),fResidualPhi->At(i)));
       }
+    }
   }
   return pos;
 }
 
-//__________________________________________________________
-Bool_t AliEMCALRecoUtils::IsGoodCluster(AliVCluster *cluster, AliEMCALGeometry *geom, AliVCaloCells* cells)
+//__________________________________________________________________________
+Bool_t AliEMCALRecoUtils::IsGoodCluster(AliVCluster *cluster, 
+                                        const AliEMCALGeometry *geom, 
+                                        AliVCaloCells* cells, Int_t bc)
 {
   // check if the cluster survives some quality cut
   //
   //
   Bool_t isGood=kTRUE;
-  if(!cluster || !cluster->IsEMCAL()) return kFALSE;
-  if(ClusterContainsBadChannel(geom,cluster->GetCellsAbsId(),cluster->GetNCells())) return kFALSE;
-  if(!CheckCellFiducialRegion(geom,cluster,cells)) return kFALSE;
-  if(fRejectExoticCluster && IsExoticCluster(cluster)) return kFALSE;
+
+  if (!cluster || !cluster->IsEMCAL())              return kFALSE;
+  if (ClusterContainsBadChannel(geom,cluster->GetCellsAbsId(),cluster->GetNCells())) return kFALSE;
+  if (!CheckCellFiducialRegion(geom,cluster,cells)) return kFALSE;
+  if (IsExoticCluster(cluster, cells,bc))           return kFALSE;
 
   return isGood;
 }
@@ -1771,13 +2275,11 @@ Bool_t AliEMCALRecoUtils::IsAccepted(AliESDtrack *esdTrack)
 
 
   //DCA cuts
-  if(fTrackCutsType==kGlobalCut)
-    {
-      Float_t maxDCAToVertexXYPtDep = 0.0182 + 0.0350/TMath::Power(esdTrack->Pt(),1.01); //This expression comes from AliESDtrackCuts::GetStandardITSTPCTrackCuts2010()
-      //AliDebug(3,Form("Track pT = %f, DCAtoVertexXY = %f",esdTrack->Pt(),MaxDCAToVertexXYPtDep));
-      SetMaxDCAToVertexXY(maxDCAToVertexXYPtDep); //Set pT dependent DCA cut to vertex in x-y plane
-    }
-
+  if (fTrackCutsType==kGlobalCut) {
+    Float_t maxDCAToVertexXYPtDep = 0.0182 + 0.0350/TMath::Power(esdTrack->Pt(),1.01); //This expression comes from AliESDtrackCuts::GetStandardITSTPCTrackCuts2010()
+    //AliDebug(3,Form("Track pT = %f, DCAtoVertexXY = %f",esdTrack->Pt(),MaxDCAToVertexXYPtDep));
+    SetMaxDCAToVertexXY(maxDCAToVertexXYPtDep); //Set pT dependent DCA cut to vertex in x-y plane
+  }
 
   Float_t b[2];
   Float_t bCov[3];
@@ -1823,16 +2325,30 @@ Bool_t AliEMCALRecoUtils::IsAccepted(AliESDtrack *esdTrack)
   if (!fCutDCAToVertex2D && TMath::Abs(dcaToVertexZ) > fCutMaxDCAToVertexZ)
     cuts[9] = kTRUE;
 
-  if(fTrackCutsType==kGlobalCut)
-    {
-      //Require at least one SPD point + anything else in ITS
-      if( (esdTrack->HasPointOnITSLayer(0) || esdTrack->HasPointOnITSLayer(1)) == kFALSE)
-       cuts[10] = kTRUE;
-    }
+  if (fTrackCutsType==kGlobalCut) {
+    //Require at least one SPD point + anything else in ITS
+    if ( (esdTrack->HasPointOnITSLayer(0) || esdTrack->HasPointOnITSLayer(1)) == kFALSE)
+      cuts[10] = kTRUE;
+  }
 
+  // ITS
+  if (fCutRequireITSStandAlone || fCutRequireITSpureSA) {
+    if ((status & AliESDtrack::kITSin) == 0 || (status & AliESDtrack::kTPCin)) {
+      // TPC tracks
+      cuts[11] = kTRUE; 
+    } else {
+      // ITS standalone tracks
+      if (fCutRequireITSStandAlone && !fCutRequireITSpureSA) {
+       if (status & AliESDtrack::kITSpureSA) cuts[11] = kTRUE;
+      } else if (fCutRequireITSpureSA) {
+       if (!(status & AliESDtrack::kITSpureSA)) cuts[11] = kTRUE;
+      }
+    }
+  }
+  
   Bool_t cut=kFALSE;
   for (Int_t i=0; i<kNCuts; i++)
-    if (cuts[i]) {cut = kTRUE;}
+    if (cuts[i]) { cut = kTRUE ; }
 
     // cut the track
   if (cut) 
@@ -1841,8 +2357,7 @@ Bool_t AliEMCALRecoUtils::IsAccepted(AliESDtrack *esdTrack)
     return kTRUE;
 }
 
-
-//__________________________________________________
+//_____________________________________
 void AliEMCALRecoUtils::InitTrackCuts()
 {
   //Intilize the track cut criteria
@@ -1850,52 +2365,154 @@ void AliEMCALRecoUtils::InitTrackCuts()
   //Also you can customize the cuts using the setters
   
   switch (fTrackCutsType)
-    {
+  {
     case kTPCOnlyCut:
-      {
-       AliInfo(Form("Track cuts for matching: GetStandardTPCOnlyTrackCuts()"));
-       //TPC
-       SetMinNClustersTPC(70);
-       SetMaxChi2PerClusterTPC(4);
-       SetAcceptKinkDaughters(kFALSE);
-       SetRequireTPCRefit(kFALSE);
-
-       //ITS
-       SetRequireITSRefit(kFALSE);
-       SetMaxDCAToVertexZ(3.2);
-       SetMaxDCAToVertexXY(2.4);
-       SetDCAToVertex2D(kTRUE);
-
-       break;
-      }
-    
+    {
+      AliInfo(Form("Track cuts for matching: GetStandardTPCOnlyTrackCuts()"));
+      //TPC
+      SetMinNClustersTPC(70);
+      SetMaxChi2PerClusterTPC(4);
+      SetAcceptKinkDaughters(kFALSE);
+      SetRequireTPCRefit(kFALSE);
+      
+      //ITS
+      SetRequireITSRefit(kFALSE);
+      SetMaxDCAToVertexZ(3.2);
+      SetMaxDCAToVertexXY(2.4);
+      SetDCAToVertex2D(kTRUE);
+      
+      break;
+    }
+      
     case kGlobalCut:
-      {
-       AliInfo(Form("Track cuts for matching: GetStandardITSTPCTrackCuts2010(kTURE)"));
-       //TPC
-       SetMinNClustersTPC(70);
-       SetMaxChi2PerClusterTPC(4);
-       SetAcceptKinkDaughters(kFALSE);
-       SetRequireTPCRefit(kTRUE);
-
-       //ITS
-       SetRequireITSRefit(kTRUE);
-       SetMaxDCAToVertexZ(2);
-       SetMaxDCAToVertexXY();
-       SetDCAToVertex2D(kFALSE);
-
-       break;
-      }
-
+    {
+      AliInfo(Form("Track cuts for matching: GetStandardITSTPCTrackCuts2010(kTURE)"));
+      //TPC
+      SetMinNClustersTPC(70);
+      SetMaxChi2PerClusterTPC(4);
+      SetAcceptKinkDaughters(kFALSE);
+      SetRequireTPCRefit(kTRUE);
+      
+      //ITS
+      SetRequireITSRefit(kTRUE);
+      SetMaxDCAToVertexZ(2);
+      SetMaxDCAToVertexXY();
+      SetDCAToVertex2D(kFALSE);
+      
+      break;
+    }
+      
     case kLooseCut:
-      {
-       AliInfo(Form("Track cuts for matching: Loose cut w/o DCA cut"));
-       SetMinNClustersTPC(50);
-       SetAcceptKinkDaughters(kTRUE);
+    {
+      AliInfo(Form("Track cuts for matching: Loose cut w/o DCA cut"));
+      SetMinNClustersTPC(50);
+      SetAcceptKinkDaughters(kTRUE);
+      
+      break;
+    }
 
-       break;
+    case kITSStandAlone:
+    {
+      AliInfo(Form("Track cuts for matching: ITS Stand Alone tracks cut w/o DCA cut"));
+      SetRequireITSRefit(kTRUE);
+      SetRequireITSStandAlone(kTRUE);
+      SetITSTrackSA(kTRUE);
+      break;
+    }
+    
+  }
+}
+
+
+//________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::SetClusterMatchedToTrack(const AliVEvent *event)
+{
+  // Checks if tracks are matched to EMC clusters and set the matched EMCAL cluster index to ESD track. 
+
+  Int_t nTracks = event->GetNumberOfTracks();
+  for (Int_t iTrack = 0; iTrack < nTracks; ++iTrack) 
+  {
+    AliVTrack* track = dynamic_cast<AliVTrack*>(event->GetTrack(iTrack));
+    if (!track) 
+    {
+      AliWarning(Form("Could not receive track %d", iTrack));
+      continue;
+    }
+    
+    Int_t matchClusIndex = GetMatchedClusterIndex(iTrack);       
+    track->SetEMCALcluster(matchClusIndex); //sets -1 if track not matched within residual
+    /*the following can be done better if AliVTrack::SetStatus will be there. Patch pending with Andreas/Peter*/
+    AliESDtrack* esdtrack = dynamic_cast<AliESDtrack*>(track);
+    if (esdtrack) { 
+      if (matchClusIndex != -1) 
+        esdtrack->SetStatus(AliESDtrack::kEMCALmatch);
+      else
+        esdtrack->ResetStatus(AliESDtrack::kEMCALmatch);
+    } else {
+      AliAODTrack* aodtrack = dynamic_cast<AliAODTrack*>(track);
+      if (matchClusIndex != -1) 
+        aodtrack->SetStatus(AliESDtrack::kEMCALmatch);
+      else
+        aodtrack->ResetStatus(AliESDtrack::kEMCALmatch);
+    }
+  }
+  AliDebug(2,"Track matched to closest cluster");  
+}
+
+//_________________________________________________________________________
+void AliEMCALRecoUtils::SetTracksMatchedToCluster(const AliVEvent *event)
+{
+  // Checks if EMC clusters are matched to ESD track.
+  // Adds track indexes of all the tracks matched to a cluster withing residuals in ESDCalocluster.
+  
+  for (Int_t iClus=0; iClus < event->GetNumberOfCaloClusters(); ++iClus) 
+  {
+    AliVCluster *cluster = event->GetCaloCluster(iClus);
+    if (!cluster->IsEMCAL()) 
+      continue;
+    
+    Int_t nTracks = event->GetNumberOfTracks();
+    TArrayI arrayTrackMatched(nTracks);
+    
+    // Get the closest track matched to the cluster
+    Int_t nMatched = 0;
+    Int_t matchTrackIndex = GetMatchedTrackIndex(iClus);
+    if (matchTrackIndex != -1) 
+    {
+      arrayTrackMatched[nMatched] = matchTrackIndex;
+      nMatched++;
+    }
+    
+    // Get all other tracks matched to the cluster
+    for (Int_t iTrk=0; iTrk<nTracks; ++iTrk) 
+    {
+      AliVTrack* track = dynamic_cast<AliVTrack*>(event->GetTrack(iTrk));
+      if (iTrk == matchTrackIndex) continue;
+      if (track->GetEMCALcluster() == iClus) {
+        arrayTrackMatched[nMatched] = iTrk;
+        ++nMatched;
       }
     }
+    
+    //printf("Tender::SetTracksMatchedToCluster - cluster E %f, N matches %d, first match %d\n",cluster->E(),nMatched,arrayTrackMatched[0]);
+    
+    arrayTrackMatched.Set(nMatched);
+    AliESDCaloCluster *esdcluster = dynamic_cast<AliESDCaloCluster*>(cluster);
+    if (esdcluster) 
+      esdcluster->AddTracksMatched(arrayTrackMatched);
+    else if (nMatched>0) {
+      AliAODCaloCluster *aodcluster = dynamic_cast<AliAODCaloCluster*>(cluster);
+      if (aodcluster)
+        aodcluster->AddTrackMatched(event->GetTrack(arrayTrackMatched.At(0)));
+    }
+    
+    Float_t eta= -999, phi = -999;
+    if (matchTrackIndex != -1) 
+      GetMatchedResiduals(iClus, eta, phi);
+    cluster->SetTrackDistance(phi, eta);
+  }
+  
+  AliDebug(2,"Cluster matched to tracks");  
 }
 
 //___________________________________________________
@@ -1905,70 +2522,35 @@ void AliEMCALRecoUtils::Print(const Option_t *) const
   
   printf("AliEMCALRecoUtils Settings: \n");
   printf("Misalignment shifts\n");
-  for(Int_t i=0; i<5; i++) printf("\t sector %d, traslation (x,y,z)=(%f,%f,%f), rotation (x,y,z)=(%f,%f,%f)\n",i, 
+  for (Int_t i=0; i<5; i++) printf("\t sector %d, traslation (x,y,z)=(%f,%f,%f), rotation (x,y,z)=(%f,%f,%f)\n",i, 
                                   fMisalTransShift[i*3],fMisalTransShift[i*3+1],fMisalTransShift[i*3+2],
                                   fMisalRotShift[i*3],  fMisalRotShift[i*3+1],  fMisalRotShift[i*3+2]   );
   printf("Non linearity function %d, parameters:\n", fNonLinearityFunction);
-  for(Int_t i=0; i<6; i++) printf("param[%d]=%f\n",i, fNonLinearityParams[i]);
+  for (Int_t i=0; i<6; i++) printf("param[%d]=%f\n",i, fNonLinearityParams[i]);
   
   printf("Position Recalculation option %d, Particle Type %d, fW0 %2.2f, Recalibrate Data %d \n",fPosAlgo,fParticleType,fW0, fRecalibration);
 
   printf("Matching criteria: ");
-  if(fCutEtaPhiSum)
-    {
-      printf("sqrt(dEta^2+dPhi^2)<%2.2f\n",fCutR);
-    }
-  else if(fCutEtaPhiSeparate)
-    {
-      printf("dEta<%2.2f, dPhi<%2.2f\n",fCutEta,fCutPhi);
-    }
-  else
-    {
-      printf("Error\n");
-      printf("please specify your cut criteria\n");
-      printf("To cut on sqrt(dEta^2+dPhi^2), use: SwitchOnCutEtaPhiSum()\n");
-      printf("To cut on dEta and dPhi separately, use: SwitchOnCutEtaPhiSeparate()\n");
-    }
+  if (fCutEtaPhiSum) {
+    printf("sqrt(dEta^2+dPhi^2)<%4.3f\n",fCutR);
+  } else if (fCutEtaPhiSeparate) {
+    printf("dEta<%4.3f, dPhi<%4.3f\n",fCutEta,fCutPhi);
+  } else {
+    printf("Error\n");
+    printf("please specify your cut criteria\n");
+    printf("To cut on sqrt(dEta^2+dPhi^2), use: SwitchOnCutEtaPhiSum()\n");
+    printf("To cut on dEta and dPhi separately, use: SwitchOnCutEtaPhiSeparate()\n");
+  }
 
-  printf("Mass hypothesis = %2.3f [GeV/c^2], extrapolation step = %2.2f[cm]\n",fMass,fStep);
+  printf("Mass hypothesis = %2.3f [GeV/c^2], extrapolation step to surface = %2.2f[cm], step to cluster = %2.2f[cm]\n",fMass,fStepSurface, fStepCluster);
+  printf("Cluster selection window: dR < %2.0f\n",fClusterWindow);
 
   printf("Track cuts: \n");
   printf("Minimum track pT: %1.2f\n",fCutMinTrackPt);
-  printf("AOD track selection mask: %d\n",fAODFilterMask);
+  printf("AOD track selection: tpc only %d, or hybrid %d, or mask: %d\n",fAODTPCOnlyTracks,fAODHybridTracks, fAODFilterMask);
   printf("TPCRefit = %d, ITSRefit = %d\n",fCutRequireTPCRefit,fCutRequireITSRefit);
   printf("AcceptKinks = %d\n",fCutAcceptKinkDaughters);
   printf("MinNCulsterTPC = %d, MinNClusterITS = %d\n",fCutMinNClusterTPC,fCutMinNClusterITS);
   printf("MaxChi2TPC = %2.2f, MaxChi2ITS = %2.2f\n",fCutMaxChi2PerClusterTPC,fCutMaxChi2PerClusterITS);
   printf("DCSToVertex2D = %d, MaxDCAToVertexXY = %2.2f, MaxDCAToVertexZ = %2.2f\n",fCutDCAToVertex2D,fCutMaxDCAToVertexXY,fCutMaxDCAToVertexZ);
-
 }
-
-//_____________________________________________________________________
-void AliEMCALRecoUtils::SetRunDependentCorrections(Int_t runnumber){
-  //Get EMCAL time dependent corrections from file and put them in the recalibration histograms
-  //Do it only once and only if it is requested
-  
-  if(!fUseRunCorrectionFactors) return;
-  if(fRunCorrectionFactorsSet)  return;
-  
-  AliInfo(Form("AliEMCALRecoUtils::GetRunDependentCorrections() - Get Correction Factors for Run number %d\n",runnumber));
-  AliEMCALCalibTimeDepCorrection  *corr =  new AliEMCALCalibTimeDepCorrection();
-  corr->ReadRootInfo(Form("CorrectionFiles/Run%d_Correction.root",runnumber));
-  
-  SwitchOnRecalibration();
-  for(Int_t ism = 0; ism < 4; ism++){
-    for(Int_t icol = 0; icol < 48; icol++){
-      for(Int_t irow = 0; irow < 24; irow++){
-        Float_t orgRecalFactor = GetEMCALChannelRecalibrationFactors(ism)->GetBinContent(icol,irow);
-        Float_t newRecalFactor = orgRecalFactor*corr->GetCorrection(ism, icol,irow,0);
-        GetEMCALChannelRecalibrationFactors(ism)->SetBinContent(icol,irow,newRecalFactor);
-        //printf("ism %d, icol %d, irow %d, corrections : org %f, time dep %f, final %f (org*time %f)\n",ism, icol, irow, 
-        //        orgRecalFactor, corr->GetCorrection(ism, icol,irow,0),
-        //       (GetEMCALChannelRecalibrationFactors(ism))->GetBinContent(icol,irow),newRecalFactor);
-      }
-    }
-  }
-   fRunCorrectionFactorsSet = kTRUE;
-}
-