]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - HLT/BASE/AliHLTSystem.cxx
Changes required to handle software triggers correctly in the global trigger component.
[u/mrichter/AliRoot.git] / HLT / BASE / AliHLTSystem.cxx
index b88ac8d04b44f3f89a4e8c915c44dcdb0f9ce1ad..3a9b5d467e8c03124f3deeb1664efe50d35834b8 100644 (file)
 // $Id$
+//**************************************************************************
+//* This file is property of and copyright by the ALICE HLT Project        * 
+//* ALICE Experiment at CERN, All rights reserved.                         *
+//*                                                                        *
+//* Primary Authors: Matthias Richter <Matthias.Richter@ift.uib.no>        *
+//*                  for The ALICE HLT Project.                            *
+//*                                                                        *
+//* Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
+//* documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
+//* without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
+//* copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
+//* appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
+//* about the suitability of this software for any purpose. It is          *
+//* provided "as is" without express or implied warranty.                  *
+//**************************************************************************
 
-/**************************************************************************
- * Copyright(c) 1998-1999, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
- *                                                                        *
- * Authors: Matthias Richter <Matthias.Richter@ift.uib.no>                *
- *          Timm Steinbeck <timm@kip.uni-heidelberg.de>                   *
- *          Artur Szostak <artursz@iafrica.com>                           *
- *          for The ALICE Off-line Project.                               *
- *                                                                        *
- * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
- * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
- * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
- * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
- * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
- * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
- * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
- **************************************************************************/
-
-///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-//                                                                           //
-// global HLT module management                                              //
-//                                                                           //
-///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+/** @file   AliHLTSystem.cxx
+    @author Matthias Richter
+    @date   
+    @brief  Implementation of HLT module management.
+*/
 
 #if __GNUC__>= 3
 using namespace std;
 #endif
 
-#include <cerrno>
-#include <string>
-#include "AliL3StandardIncludes.h"
+#include <cassert>
+#include "AliHLTStdIncludes.h"
 #include "AliHLTSystem.h"
 #include "AliHLTComponentHandler.h"
 #include "AliHLTComponent.h"
 #include "AliHLTConfiguration.h"
 #include "AliHLTConfigurationHandler.h"
 #include "AliHLTTask.h"
+#include "AliHLTModuleAgent.h"
+#include "AliHLTOfflineInterface.h"
+#include "AliHLTDataSource.h"
+#include "AliHLTOUT.h"
+#include "AliHLTOUTHandler.h"
+#include "AliHLTOUTTask.h"
+#include "AliHLTControlTask.h"
+#include "AliHLTDataBuffer.h"
+#include "AliHLTMisc.h"
+#include <TObjArray.h>
+#include <TObjString.h>
+#include <TStopwatch.h>
+#include <TList.h>
+//#include <TSystem.h>
+#include <TROOT.h>
+//#include <TInterpreter.h>
 
+/** HLT default component libraries */
+const char* AliHLTSystem::fgkHLTDefaultLibs[]= {
+  "libAliHLTUtil.so", 
+  "libAliHLTRCU.so", 
+  "libAliHLTTPC.so", 
+  //  "libAliHLTSample.so",
+  //  "libAliHLTPHOS.so",
+  "libAliHLTMUON.so",
+  "libAliHLTTRD.so",
+  "libAliHLTITS.so",
+  "libAliHLTGlobal.so",
+  "libAliHLTTrigger.so",
+  NULL
+};
+
+/** ROOT macro for the implementation of ROOT specific class methods */
 ClassImp(AliHLTSystem)
 
-AliHLTSystem::AliHLTSystem()
+AliHLTSystem::AliHLTSystem(AliHLTComponentLogSeverity loglevel, const char* name)
+  :
+  fpComponentHandler(AliHLTComponentHandler::CreateHandler()),
+  fpConfigurationHandler(AliHLTConfigurationHandler::CreateHandler()),
+  fTaskList(),
+  fState(0),
+  fChains(),
+  fStopwatches(new TObjArray),
+  fEventCount(-1),
+  fGoodEvents(-1),
+  fpChainHandlers(NULL),
+  fpEsdHandlers(NULL),
+  fpProprietaryHandlers(NULL),
+  fpHLTOUTTask(NULL),
+  fpControlTask(NULL),
+  fName(name)
+  , fECSParams()
 {
-  fpComponentHandler=new AliHLTComponentHandler();
+  // see header file for class documentation
+  // or
+  // refer to README to build package
+  // or
+  // visit http://web.ift.uib.no/~kjeks/doc/alice-hlt
+
+  if (fgNofInstances++>0) {
+    // July 2008: multiple instances are now allowed
+    // AliHLTSystem is used in multiple instances for the kChain HLTOUT handler
+    //HLTWarning("multiple instances of AliHLTSystem, you should not use more than one at a time");
+  }
+
+  SetGlobalLoggingLevel(loglevel);
+  SetFrameworkLog(loglevel);
   if (fpComponentHandler) {
-    AliHLTComponentEnvironment env;
-    memset(&env, 0, sizeof(AliHLTComponentEnvironment));
-    env.fLoggingFunc=AliHLTLogging::Message;
+    AliHLTAnalysisEnvironment env;
+    memset(&env, 0, sizeof(AliHLTAnalysisEnvironment));
+    env.fStructSize=sizeof(AliHLTAnalysisEnvironment);
+    env.fAllocMemoryFunc=AliHLTSystem::AllocMemory;
+    env.fGetEventDoneDataFunc=AliHLTSystem::AllocEventDoneData;
+    env.fLoggingFunc=NULL;
     fpComponentHandler->SetEnvironment(&env);
-
-    // init logging function in AliHLTLogging
-    Init(AliHLTLogging::Message);
+    InitAliLogFunc(fpComponentHandler);
+    if (fgNofInstances==1) {
+    fpComponentHandler->AnnounceVersion();
+    }
   } else {
     HLTFatal("can not create Component Handler");
   }
-  fpConfigurationHandler=new AliHLTConfigurationHandler();
   if (fpConfigurationHandler) {
     AliHLTConfiguration::GlobalInit(fpConfigurationHandler);
   } else {
@@ -61,60 +122,78 @@ AliHLTSystem::AliHLTSystem()
   }
 }
 
-
 AliHLTSystem::~AliHLTSystem()
 {
-    AliHLTConfiguration::GlobalDeinit();
-    if (fpConfigurationHandler) {
-      delete fpConfigurationHandler;
-    }
-    fpConfigurationHandler=NULL;
-
-    if (fpComponentHandler) {
-      delete fpComponentHandler;
-    }
-    fpComponentHandler=NULL;
-}
+  // see header file for class documentation
+  fgNofInstances--;
+  CleanHLTOUT();
+  CleanTaskList();
+  AliHLTConfiguration::GlobalDeinit(fpConfigurationHandler);
+  if (fpConfigurationHandler) {
+    fpConfigurationHandler->Destroy();
+  }
+  fpConfigurationHandler=NULL;
+  
+  if (fpComponentHandler) {
+    fpComponentHandler->Destroy();
+  }
+  fpComponentHandler=NULL;
+  delete fStopwatches;
 
-int AliHLTSystem::AddConfiguration(AliHLTConfiguration* pConf)
-{
-  int iResult=0;
-  return iResult;
+  // note: fpHLTOUTTask and fpControlTask are deleted by
+  // CleanTaskList
 }
 
-int AliHLTSystem::InsertConfiguration(AliHLTConfiguration* pConf, AliHLTConfiguration* pPrec)
-{
-  int iResult=0;
-  return iResult;
-}
+int AliHLTSystem::fgNofInstances=0;
 
-int AliHLTSystem::DeleteConfiguration(AliHLTConfiguration* pConf)
+int AliHLTSystem::BuildTaskList(const char* id)
 {
+  // see header file for class documentation
   int iResult=0;
+  if (id) {
+    if (fpConfigurationHandler) {
+      AliHLTConfiguration* pConf=fpConfigurationHandler->FindConfiguration(id);
+      if (pConf) {
+       iResult=BuildTaskList(pConf);
+      } else {
+       HLTError("unknown configuration \"%s\"", id);
+       iResult=-EEXIST;
+      }
+    } else {
+      iResult=-EFAULT;
+    }
+  } else {
+    iResult=-EINVAL;
+  }
   return iResult;
 }
 
 int AliHLTSystem::BuildTaskList(AliHLTConfiguration* pConf)
 {
+  // see header file for class documentation
   int iResult=0;
   if (pConf) {
     AliHLTTask* pTask=NULL;
     if ((pTask=FindTask(pConf->GetName()))!=NULL) {
       if (pTask->GetConf()!=pConf) {
-       HLTError("configuration missmatch, there is already a task with configuration name \"%s\", but it is different. Most likely configuration %p is not registered properly", pConf->GetName(), pConf);
+       HLTError("configuration mismatch, there is already a task with configuration name \"%s\", but it is different. Most likely configuration %p is not registered properly", pConf->GetName(), pConf);
        iResult=-EEXIST;
-       pTask=NULL;
       }
+      // task for this configuration exists, terminate
+      pTask=NULL;
     } else if (pConf->SourcesResolved(1)!=1) {
        HLTError("configuration \"%s\" has unresolved sources, aborting ...", pConf->GetName());
        iResult=-ENOLINK;
     } else {
-      pTask=new AliHLTTask(pConf, NULL);
+      pTask=new AliHLTTask(pConf);
       if (pTask==NULL) {
        iResult=-ENOMEM;
+      } else {
+       pTask->SetLocalLoggingLevel(GetLocalLoggingLevel());
       }
     }
-    if (pTask) {
+    static int iterationLevel=0;
+    if (pTask && iResult>=0) {
       // check for circular dependencies
       if ((iResult=pConf->FollowDependency(pConf->GetName()))>0) {
        HLTError("detected circular dependency for configuration \"%s\"", pTask->GetName());
@@ -133,8 +212,12 @@ int AliHLTSystem::BuildTaskList(AliHLTConfiguration* pConf)
        fTaskList.Add(pTask);
        AliHLTConfiguration* pDep=pConf->GetFirstSource();
        while (pDep!=NULL && iResult>=0) {
+         HLTDebug("iteration %d: checking dependency %s (%p)", iterationLevel, pDep->GetName(), pDep);
          if (FindTask(pDep->GetName())==NULL) {
+           HLTDebug("iteration %d: building task list for configuration %s (%p)", iterationLevel, pDep->GetName(), pDep);
+           iterationLevel++;
            iResult=BuildTaskList(pDep);
+           iterationLevel--;
          }
          pDep=pConf->GetNextSource();
        }
@@ -143,6 +226,7 @@ int AliHLTSystem::BuildTaskList(AliHLTConfiguration* pConf)
 
        // insert the task and set the cross-links
        if (iResult>=0) {
+         HLTDebug("iteration %d: inserting task %s (%p)", iterationLevel, pTask->GetName(), pTask);
          iResult=InsertTask(pTask);
        }
       } else {
@@ -158,21 +242,41 @@ int AliHLTSystem::BuildTaskList(AliHLTConfiguration* pConf)
 
 int AliHLTSystem::CleanTaskList()
 {
+  // see header file for class documentation
   int iResult=0;
+  fpHLTOUTTask=NULL;
+  fpControlTask=NULL;
   TObjLink* lnk=NULL;
-  while ((lnk=fTaskList.FirstLink())!=NULL) {
-    fTaskList.Remove(lnk);
+  while ((lnk=fTaskList.LastLink())!=NULL) {
     delete (lnk->GetObject());
+    fTaskList.Remove(lnk);
   }
+
   return iResult;
 }
 
 int AliHLTSystem::InsertTask(AliHLTTask* pTask)
 {
+  // see header file for class documentation
   int iResult=0;
-  TObjLink *lnk = NULL;
-  if ((iResult=pTask->CheckDependencies())>0)
-    lnk=fTaskList.FirstLink();
+  if (fpControlTask==NULL) {
+    fpControlTask=new AliHLTControlTask;
+    if (!fpControlTask) return -ENOMEM;
+    fTaskList.AddFirst(fpControlTask);
+  }
+  TObjLink *controlLnk=NULL;
+  TObjLink *lnk = fTaskList.FirstLink();
+  assert(!lnk || lnk->GetObject()==fpControlTask || fpControlTask==NULL);
+  if (lnk && lnk->GetObject()==fpControlTask) {
+    if (pTask->GetConf() && pTask->GetConf()->GetFirstSource()==NULL) {
+      pTask->SetDependency(fpControlTask);
+      fpControlTask->SetTarget(pTask);
+    }
+    controlLnk=lnk;
+    lnk=lnk->Next();
+  }
+  if ((iResult=pTask->CheckDependencies())<=0)
+    lnk=NULL;
   while (lnk && iResult>0) {
     AliHLTTask* pCurr = (AliHLTTask*)lnk->GetObject();
     //HLTDebug("checking  \"%s\"", pCurr->GetName());
@@ -193,10 +297,12 @@ int AliHLTSystem::InsertTask(AliHLTTask* pTask)
   if (iResult==0) {
       if (lnk) {
        fTaskList.AddAfter(lnk, pTask);
+      } else if (controlLnk) {
+       fTaskList.AddAfter(controlLnk, pTask);
       } else {
        fTaskList.AddFirst(pTask);
       }
-      HLTDebug("task \"%s\" inserted", pTask->GetName());
+      HLTDebug("task \"%s\" (%p) inserted (size %d)", pTask->GetName(), pTask, sizeof(AliHLTTask));
   } else if (iResult>0) {
     HLTError("can not resolve dependencies for configuration \"%s\" (%d unresolved)", pTask->GetName(), iResult);
     iResult=-ENOLINK;
@@ -206,15 +312,17 @@ int AliHLTSystem::InsertTask(AliHLTTask* pTask)
 
 AliHLTTask* AliHLTSystem::FindTask(const char* id)
 {
+  // see header file for class documentation
   AliHLTTask* pTask=NULL;
   if (id) {
-    pTask=(AliHLTTask*)fTaskList.FindObject(id); 
+    pTask=dynamic_cast<AliHLTTask*>(fTaskList.FindObject(id)); 
   }
   return pTask;
 }
 
 void AliHLTSystem::PrintTaskList()
 {
+  // see header file for class documentation
   HLTLogKeyword("task list");
   TObjLink *lnk = NULL;
   HLTMessage("Task List");
@@ -231,10 +339,1226 @@ void AliHLTSystem::PrintTaskList()
   }
 }
 
-int AliHLTSystem::Run() 
+int AliHLTSystem::Run(Int_t iNofEvents, int bStop, AliHLTUInt64_t trgMask,
+                     AliHLTUInt32_t timestamp, AliHLTUInt32_t eventtype)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  int iCount=0;
+  SetStatusFlags(kRunning);
+  if (fEventCount>=0 || (iResult=InitTasks())>=0) {
+    if (fEventCount>=0 || (iResult=StartTasks())>=0) {
+      if (fEventCount==0) {
+       InitBenchmarking(fStopwatches);
+      } else {
+       // Matthias Oct 11 2008 this is a bug
+       // By resuming the stopwatches at this point, all continued counting, but the
+       // starting and stopping is controlled by the AliHLTStopwatchGuard
+       //ResumeBenchmarking(fStopwatches);    
+      }
+      for (int i=fEventCount; i<fEventCount+iNofEvents && iResult>=0; i++) {
+       if (fpHLTOUTTask) {
+         if (iNofEvents>1 && i==fEventCount) {
+           HLTWarning("can not add more than one event to the HLTOUT, skipping all but last block");
+         }
+         // reset and prepare for new data
+         fpHLTOUTTask->Reset();
+       }
+       if (eventtype == 0) {
+         eventtype = gkAliEventTypeData;
+       }
+       if ((iResult=ProcessTasks(i, trgMask, timestamp, eventtype))>=0) {
+         fGoodEvents++;
+         iCount++;
+       } else {
+         // TODO: define different running modes to either ignore errors in
+         // event processing or not
+         // currently ignored 
+         iResult=0;
+       }
+       AliHLTDataBuffer::SetGlobalEventCount(iCount);
+      }
+      fEventCount+=iNofEvents;
+      if (bStop) StopTasks();
+      else PauseBenchmarking(fStopwatches);
+    }
+    if (bStop) DeinitTasks();
+  }
+  if (iResult>=0) {
+    iResult=iCount;
+  } else  if (iResult==-126 /*ENOKEY*/) {
+    iResult=0; // do not propagate the error
+  }
+  ClearStatusFlags(kRunning);
+  AliHLTDataBuffer::PrintStatistics();
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::InitTasks()
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
+
+  if (lnk==NULL) {
+    HLTInfo("Task list is empty, skipping HLT");
+    return -126 /*ENOKEY*/;
+  }
+  while (lnk && iResult>=0) {
+    TObject* obj=lnk->GetObject();
+    if (obj) {
+      AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
+      iResult=pTask->Init(NULL, fpComponentHandler);
+//       ProcInfo_t ProcInfo;
+//       gSystem->GetProcInfo(&ProcInfo);
+//       HLTInfo("task %s initialized (%d), current memory usage %d %d", pTask->GetName(), iResult, ProcInfo.fMemResident, ProcInfo.fMemVirtual);
+    } else {
+    }
+    lnk = lnk->Next();
+  }
+  if (iResult<0) {
+    HLTError("can not initialize task list, error %d", iResult);
+  }
+
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::InitBenchmarking(TObjArray* pStopwatches)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  if (pStopwatches==NULL) return 0;
+
+  for (int i=0; i<(int)AliHLTComponent::kSWTypeCount; i++) {
+    TStopwatch* pStopwatch= new TStopwatch;
+    if (pStopwatch) {
+      pStopwatch->Reset();
+      pStopwatches->AddAt(pStopwatch, i);
+    } else {
+      iResult=-ENOMEM;
+      break;
+    }
+  }
+
+  TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
+  while (lnk && iResult>=0) {
+    TObject* obj=lnk->GetObject();
+    if (obj) {
+      AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
+      AliHLTComponent* pComp=NULL;
+      if (iResult>=0 && (pComp=pTask->GetComponent())!=NULL) {
+       switch (pComp->GetComponentType()) {
+       case AliHLTComponent::kProcessor:
+         pComp->SetStopwatches(pStopwatches);
+         break;
+       case AliHLTComponent::kSource:
+         {
+           // this switch determines whether the time consumption of the
+           // AliHLTComponent base methods should be counted to the input
+           // stopwatch or base stopwatch.
+           //int inputBase=(int)AliHLTComponent::kSWBase;
+           int inputBase=(int)AliHLTComponent::kSWInput;
+           pComp->SetStopwatch(pStopwatches->At(inputBase), AliHLTComponent::kSWBase);
+           pComp->SetStopwatch(pStopwatches->At((int)AliHLTComponent::kSWInput), AliHLTComponent::kSWDA);
+         }
+         break;
+       case AliHLTComponent::kSink:
+         {
+           // this switch determines whether the time consumption of the
+           // AliHLTComponent base methods should be counted to the output
+           // stopwatch or base stopwatch.
+           //int outputBase=(int)AliHLTComponent::kSWBase;
+           int outputBase=(int)AliHLTComponent::kSWOutput;
+           pComp->SetStopwatch(pStopwatches->At(outputBase), AliHLTComponent::kSWBase);
+           pComp->SetStopwatch(pStopwatches->At((int)AliHLTComponent::kSWOutput), AliHLTComponent::kSWDA);
+         }
+         break;
+       default:
+         HLTWarning("unknown component type %d", (int)pComp->GetComponentType());
+       }
+      }
+    } else {
+    }
+    lnk = lnk->Next();
+  }
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::PauseBenchmarking(TObjArray* pStopwatches) const
+{
+  // see header file for class documentation
+  if (pStopwatches==NULL) return 0;
+
+  for (int i=0; i<(int)AliHLTComponent::kSWTypeCount; i++) {
+    if (!pStopwatches->At(i)) continue;
+    TStopwatch* pSw=dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(i));
+    if (pSw) pSw->Stop();
+  }
+  return 0;
+}
+
+int AliHLTSystem::ResumeBenchmarking(TObjArray* pStopwatches) const
+{
+  // see header file for class documentation
+  if (pStopwatches==NULL) return 0;
+
+  for (int i=0; i<(int)AliHLTComponent::kSWTypeCount; i++) {
+    if (!pStopwatches->At(i)) continue;
+    TStopwatch* pSw=dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(i));
+    if (pSw) pSw->Continue();
+  }
+  return 0;
+}
+
+int AliHLTSystem::PrintBenchmarking(TObjArray* pStopwatches, int bClean) const
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iInitialized=1;
+  if (pStopwatches==NULL) return 0;
+
+  for (int i=0; i<(int)AliHLTComponent::kSWTypeCount; i++) {
+    if (!dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(i))) {
+      iInitialized=0;
+      break;
+    }
+  }
+
+  if (iInitialized!=0) {
+    HLTImportant("HLT statistics:\n"
+           "    base:              R:%.3fs C:%.3fs\n"
+           "    input:             R:%.3fs C:%.3fs\n"
+           "    output:            R:%.3fs C:%.3fs\n"
+           "    event processing : R:%.3fs C:%.3fs"
+           , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWBase))->RealTime()
+           , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWBase))->CpuTime()
+           , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWInput))->RealTime()
+           , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWInput))->CpuTime()
+           , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWOutput))->RealTime()
+           , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWOutput))->CpuTime()
+           , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWDA))->RealTime()
+           , dynamic_cast<TStopwatch*>(pStopwatches->At(AliHLTComponent::kSWDA))->CpuTime()
+           );
+  }
+
+  if (bClean) {
+    for (int i=0; i<(int)AliHLTComponent::kSWTypeCount; i++) {
+      TObject* pObj=pStopwatches->RemoveAt(i);
+      if (pObj) delete pObj;
+    }
+  }
+  return 0;
+}
+
+int AliHLTSystem::StartTasks()
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
+  while (lnk && iResult>=0) {
+    TObject* obj=lnk->GetObject();
+    if (obj) {
+      AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
+      iResult=pTask->StartRun();
+//       ProcInfo_t ProcInfo;
+//       gSystem->GetProcInfo(&ProcInfo);
+//       HLTInfo("task %s started (%d), current memory usage %d %d", pTask->GetName(), iResult, ProcInfo.fMemResident, ProcInfo.fMemVirtual);
+    } else {
+    }
+    lnk = lnk->Next();
+  }
+  if (iResult<0) {
+    HLTError("can not start task list, error %d", iResult);
+  } else {
+    SetStatusFlags(kStarted);
+    fEventCount=0;
+    fGoodEvents=0;
+    if ((iResult=SendControlEvent(kAliHLTDataTypeSOR))<0) {
+      HLTError("can not send SOR event: error %d", iResult);
+    }
+  }
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::ProcessTasks(Int_t eventNo, AliHLTUInt64_t trgMask,
+         AliHLTUInt32_t timestamp, AliHLTUInt32_t eventtype)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  HLTDebug("processing event no %d", eventNo);
+  TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
+  while (lnk && iResult>=0) {
+    TObject* obj=lnk->GetObject();
+    if (obj) {
+      AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
+      iResult=pTask->ProcessTask(eventNo, eventtype, trgMask, timestamp);
+//       ProcInfo_t ProcInfo;
+//       gSystem->GetProcInfo(&ProcInfo);
+//       HLTInfo("task %s processed (%d), current memory usage %d %d", pTask->GetName(), iResult, ProcInfo.fMemResident, ProcInfo.fMemVirtual);
+    } else {
+    }
+    lnk = lnk->Next();
+  }
+
+  if (iResult>=0) {
+    HLTImportant("Event %d successfully finished (%d)", eventNo, iResult);
+    iResult=0;
+  } else {
+    HLTError("Processing of event %d failed (%d)", eventNo, iResult);
+  }
+
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::StopTasks()
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  if ((iResult=SendControlEvent(kAliHLTDataTypeEOR))<0) {
+    HLTError("can not send EOR event");
+  }
+
+  // cleanup blocks from the last event. This is a bit awkward. All output
+  // blocks from the chains need to be stored in the HLTOUT task. Though,
+  // we do not know, whether HLTOUT is going to be processed or not.
+  if (fpHLTOUTTask)
+    fpHLTOUTTask->Reset();
+
+  TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
+  while (lnk) {
+    TObject* obj=lnk->GetObject();
+    if (obj) {
+      AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
+      int locResult=pTask->EndRun();
+      if (iResult>=0 && locResult<0) iResult=locResult;
+//       ProcInfo_t ProcInfo;
+//       gSystem->GetProcInfo(&ProcInfo);
+//       HLTInfo("task %s stopped (%d), current memory usage %d %d", pTask->GetName(), iResult, ProcInfo.fMemResident, ProcInfo.fMemVirtual);
+    } else {
+    }
+    lnk = lnk->Next();
+  }
+  PrintBenchmarking(fStopwatches, 1 /*clean*/);
+  ClearStatusFlags(kStarted);
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::SendControlEvent(AliHLTComponentDataType dt)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+
+  AliHLTComponentBlockDataList controlBlocks;
+  AliHLTComponentBlockData bd;
+
+  // run decriptor block of type kAliHLTDataTypeSOR/kAliHLTDataTypeEOR 
+  AliHLTComponent::FillBlockData(bd);
+  AliHLTRunDesc runDesc;
+  memset(&runDesc, 0, sizeof(AliHLTRunDesc));
+  runDesc.fStructSize=sizeof(AliHLTRunDesc);
+  runDesc.fRunNo=AliHLTMisc::Instance().GetCDBRunNo();
+  bd.fPtr=&runDesc;
+  bd.fSize=sizeof(AliHLTRunDesc);
+  bd.fDataType=dt;
+  bd.fSpecification=kAliHLTVoidDataSpec;
+  controlBlocks.push_back(bd);
+
+  // ECS parameter of type kAliHLTDataTypeECSParam
+  if (fECSParams.IsNull())
+    fECSParams="CTP_TRIGGER_CLASS=00:DUMMY-TRIGGER-ALL:00-01-02-03-04-05-06-07-08-09-10-11-12-13-14-15-16-17";
+  AliHLTComponent::FillBlockData(bd);
+  bd.fPtr=(void*)fECSParams.Data();
+  bd.fSize=fECSParams.Length()+1;
+  bd.fDataType=kAliHLTDataTypeECSParam;
+  bd.fSpecification=kAliHLTVoidDataSpec;
+  controlBlocks.push_back(bd);  
+
+  AliHLTControlTask::AliHLTControlEventGuard g(fpControlTask, controlBlocks);
+  HLTDebug("sending event %s, run descriptor %p", AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), &runDesc);
+  TObjLink *lnk=fTaskList.FirstLink();
+  while (lnk && iResult>=0) {
+    TObject* obj=lnk->GetObject();
+    if (obj) {
+      AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
+      AliHLTUInt32_t eventType=gkAliEventTypeUnknown;
+      if (dt==kAliHLTDataTypeSOR) eventType=gkAliEventTypeStartOfRun;
+      else if (dt==kAliHLTDataTypeEOR) eventType=gkAliEventTypeEndOfRun;
+      else HLTWarning("unknown control event %s", AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str());
+      iResult=pTask->ProcessTask(-1, eventType, 0, 0);
+    } else {
+    }
+    lnk = lnk->Next();
+  }
+
+  // control events are not supposed to go into the HLTOUT
+  if (fpHLTOUTTask)
+    fpHLTOUTTask->Reset();
+
+  HLTDebug("event %s done (%d)", AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), iResult);
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::DeinitTasks()
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  TObjLink *lnk=fTaskList.LastLink();
+  while (lnk) {
+    TObject* obj=lnk->GetObject();
+    if (obj) {
+      AliHLTTask* pTask=(AliHLTTask*)obj;
+      int localRes=pTask->Deinit();
+      if (iResult>=0) iResult=localRes;
+//       ProcInfo_t ProcInfo;
+//       gSystem->GetProcInfo(&ProcInfo);
+//       HLTInfo("task %s cleaned (%d), current memory usage %d %d", pTask->GetName(), iResult, ProcInfo.fMemResident, ProcInfo.fMemVirtual);
+    } else {
+    }
+    lnk = lnk->Prev();
+  }
+  fEventCount=-1;
+  fGoodEvents=-1;
+
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::CleanHLTOUT()
+{
+  // see header file for class documentation
+  if (fpChainHandlers) {
+    AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector* pHandlers=reinterpret_cast<AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector*>(fpChainHandlers);
+    fpChainHandlers=NULL;
+    if (pHandlers) {
+      AliHLTOUT::InvalidateBlocks(*pHandlers);
+      AliHLTOUT::RemoveEmptyDuplicateHandlers(*pHandlers);
+    }
+    assert(pHandlers->size()==0);
+    delete pHandlers;
+  }
+
+  if (fpEsdHandlers) {
+    AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector* pHandlers=reinterpret_cast<AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector*>(fpEsdHandlers);
+    fpEsdHandlers=NULL;
+    if (pHandlers) {
+      AliHLTOUT::InvalidateBlocks(*pHandlers);
+      AliHLTOUT::RemoveEmptyDuplicateHandlers(*pHandlers);
+    }
+    assert(pHandlers->size()==0);
+    delete pHandlers;
+  }
+
+  if (fpProprietaryHandlers) {
+    AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector* pHandlers=reinterpret_cast<AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector*>(fpProprietaryHandlers);
+    fpProprietaryHandlers=NULL;
+    if (pHandlers) {
+      AliHLTOUT::InvalidateBlocks(*pHandlers);
+      AliHLTOUT::RemoveEmptyDuplicateHandlers(*pHandlers);
+    }
+    assert(pHandlers->size()==0);
+    delete pHandlers;
+  }
+  return 0;
+}
+
+void* AliHLTSystem::AllocMemory( void* /*param*/, unsigned long size )
+{
+  // see header file for class documentation
+  void* p=NULL;
+  try {
+    p=(void*)new char[size];
+  }
+  catch (...) {
+    AliHLTLogging log;
+    log.LoggingVarargs(kHLTLogError, "AliHLTSystem" , "AllocMemory" , __FILE__ , __LINE__ , "exeption during memory allocation" );
+  }
+  return p;
+}
+
+int AliHLTSystem::AllocEventDoneData( void* /*param*/, AliHLTEventID_t /*eventID*/, unsigned long size, AliHLTComponentEventDoneData** edd )
 {
+  // see header file for class documentation
+  unsigned long blocksize=sizeof(AliHLTComponentEventDoneData)+size;
+  void* block=AllocMemory(NULL, blocksize);
+  if (!block) return -ENOMEM;
+  memset(block, 0, blocksize);
+  *edd=reinterpret_cast<AliHLTComponentEventDoneData*>(block);
+  (*edd)->fStructSize=sizeof(AliHLTComponentEventDoneData);
+  (*edd)->fDataSize=size;
+  (*edd)->fData=reinterpret_cast<AliHLTUInt8_t*>(block)+sizeof(AliHLTComponentEventDoneData);
+  
+  return 0;
+}
+
+int AliHLTSystem::Reconstruct(int nofEvents, AliRunLoader* runLoader, 
+                             AliRawReader* rawReader)
+{
+  // see header file for class documentation
   int iResult=0;
-  HLTError("function not yet implemented");
-  iResult=-ENOSYS;
+  if (runLoader || rawReader || nofEvents==0) {
+    if (nofEvents>0) {HLTInfo("Run Loader %p, Raw Reader %p , %d event(s)", runLoader, rawReader, nofEvents);}
+    if (CheckStatus(kReady)) {
+      if (nofEvents==0) {
+       // special case to close the reconstruction
+       if (!CheckStatus(kError)) {
+       StopTasks();
+       DeinitTasks();
+       CleanHLTOUT();
+       }
+      } else {
+      if ((iResult=AliHLTOfflineInterface::SetParamsToComponents(runLoader, rawReader))>=0) {
+       AliHLTUInt64_t trgMask=0x1;
+       AliHLTUInt32_t timestamp=0;
+       AliHLTUInt32_t eventtype=0;
+       if (runLoader==NULL) {
+         // this is a quick workaround for the case of simulation
+         // the trigger framework is still under development, secondly, AliHLTSimulation
+         // does not yet add the emulated ECS parameters, so no CTP trigger is known in the HLT
+         // AliHLTTask will initialize one dummy CTP trigger class with bit 0, that's why the
+         // default trigger mask is 0x1
+         trgMask=AliHLTMisc::Instance().GetTriggerMask(rawReader);
+
+         // get the timestamp and type of the event from the raw reader
+         // this is currently only meaningfull for reconstruction (runloader==NULL)
+         timestamp=AliHLTMisc::Instance().GetTimeStamp(rawReader);
+         eventtype=AliHLTMisc::Instance().GetEventType(rawReader);
+       }
+       // the system always remains started after event processing, a specific
+       // call with nofEvents==0 is needed to execute the stop sequence
+       if ((iResult=Run(nofEvents, 0, trgMask, timestamp, eventtype))<0) SetStatusFlags(kError);
+      }
+      }
+    } else {
+      HLTError("wrong state %#x, required flags %#x", GetStatusFlags(), kReady);
+    }
+  } else {
+    HLTError("missing RunLoader (%p)/RawReader (%p) instance", runLoader, rawReader);
+    iResult=-EINVAL;
+  }
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::FillESD(int eventNo, AliRunLoader* runLoader, AliESDEvent* esd)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  if (runLoader || esd) {
+    HLTInfo("Event %d: Run Loader %p, ESD %p", eventNo, runLoader, esd);
+    iResult=AliHLTOfflineInterface::FillComponentESDs(eventNo, runLoader, esd);
+  } else {
+    HLTError("missing run loader/ESD instance(s)");
+    iResult=-EINVAL;
+  }
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::ProcessHLTOUT(AliHLTOUT* pHLTOUT, AliESDEvent* esd)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  if (!pHLTOUT) return -EINVAL;
+  HLTDebug("processing %d HLT data blocks", pHLTOUT->GetNofDataBlocks());
+
+  // add the current HLTOUT task to the collection
+  if (fpHLTOUTTask) {
+    AliHLTOUT* pTask=dynamic_cast<AliHLTOUT*>(fpHLTOUTTask);
+    if (pTask && (iResult=pTask->Init())>=0) {
+      if (pTask->GetNofDataBlocks()>0) {
+       pHLTOUT->AddSubCollection(pTask);
+      }
+    } else {
+      HLTWarning("can not initialize HLTOUT sub collection %s for reconstruction chain (%d), data blocks are lost", pTask?fpHLTOUTTask->GetName():"nil", iResult);
+      iResult=0;
+    }
+  }
+
+  
+  //
+  // process all kChain handlers first
+  //
+  if ((iResult=ProcessHLTOUTkChain(pHLTOUT))<0) {
+    HLTWarning("Processing of kChain-type data blocks failed with error code %d", iResult);
+    iResult=0;
+  } 
+
+  if (!fpEsdHandlers)
+    fpEsdHandlers=new AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector;
+  if (!fpProprietaryHandlers)
+    fpProprietaryHandlers=new AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector;
+
+  AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector* pEsdHandlers=reinterpret_cast<AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector*>(fpEsdHandlers);
+  AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector* pProprietaryHandlers=reinterpret_cast<AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector*>(fpProprietaryHandlers);
+  if (!pEsdHandlers || !pProprietaryHandlers) return -ENOMEM;
+
+  // invalidate all blocks
+  AliHLTOUT::InvalidateBlocks(*pEsdHandlers);
+  AliHLTOUT::InvalidateBlocks(*pProprietaryHandlers);
+
+  AliHLTComponentDataTypeList esdBlocks;
+
+  for (iResult=pHLTOUT->SelectFirstDataBlock();
+       iResult>=0;
+       iResult=pHLTOUT->SelectNextDataBlock()) {
+    AliHLTComponentDataType dt=kAliHLTVoidDataType;
+    AliHLTUInt32_t spec=kAliHLTVoidDataSpec;
+    pHLTOUT->GetDataBlockDescription(dt, spec);
+    AliHLTOUTHandler* pHandler=pHLTOUT->GetHandler();
+    AliHLTModuleAgent::AliHLTOUTHandlerType handlerType=pHLTOUT->GetDataBlockHandlerType();
+
+    // default handling for ESD data blocks does not require an explicite handler
+    if (!pHandler && (dt==kAliHLTDataTypeESDObject || dt==kAliHLTDataTypeESDTree)) {
+      handlerType=AliHLTModuleAgent::kEsd;
+    }
+    const char* pMsg="invalid";
+    switch (handlerType) {
+    case AliHLTModuleAgent::kEsd:
+      {
+       if (pHandler) {
+         // schedule for later processing
+         pHLTOUT->InsertHandler(*pEsdHandlers, pHLTOUT->GetDataBlockHandlerDesc());
+       } else {
+         AliHLTComponentDataTypeList::iterator element=esdBlocks.begin();
+         for (; element!=esdBlocks.end(); element++) {
+           if (*element==dt) {
+             HLTWarning("multiple ESDs of identical data type %s, please add appropriate handler to merge ESDs", AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str());
+             break;
+           }
+         }
+         if (element==esdBlocks.end()) esdBlocks.push_back(dt);
+
+         // write directly
+         const AliHLTUInt8_t* pBuffer=NULL;
+         AliHLTUInt32_t size=0;
+         if (pHLTOUT->GetDataBuffer(pBuffer, size)>=0) {
+           pHLTOUT->WriteESD(pBuffer, size, dt, esd);
+           pHLTOUT->ReleaseDataBuffer(pBuffer);
+         }
+         pHLTOUT->MarkDataBlockProcessed();
+       }
+      }
+      break;
+    case AliHLTModuleAgent::kRawReader:
+      // handled in the AliRawReaderHLT
+      break;
+    case AliHLTModuleAgent::kRawStream:
+      HLTWarning("HLTOUT handler type 'kRawStream' not yet implemented: agent %s, data type %s, specification %#x",
+                pHLTOUT->GetAgent()?pHLTOUT->GetAgent()->GetModuleId():"<invalid>",
+                AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), spec);
+      break;
+    case AliHLTModuleAgent::kChain:
+      HLTWarning("HLTOUT handler type 'kChain' has already been processed: agent %s, data type %s, specification %#x\n"
+                "New block of this type added by the chain? Skipping data block ...",
+                pHLTOUT->GetAgent()?pHLTOUT->GetAgent()->GetModuleId():"<invalid>",
+                AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), spec);
+      break;
+    case AliHLTModuleAgent::kProprietary:
+      HLTDebug("processing proprietary data: agent %s, data type %s, specification %#x",
+                pHLTOUT->GetAgent()?pHLTOUT->GetAgent()->GetModuleId():"<invalid>",
+                AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), spec);
+      if (pHandler) {
+       AliHLTOUT::AliHLTOUTLockGuard g(pHLTOUT);
+       int res=pHandler->ProcessData(pHLTOUT);
+       if (res<0) {
+         HLTWarning("processing proprietary data failed (%d): agent %s, data type %s, specification %#x",
+                    res, pHLTOUT->GetAgent()?pHLTOUT->GetAgent()->GetModuleId():"<invalid>",
+                    AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), spec);
+       }
+      }
+      break;
+    case AliHLTModuleAgent::kUnknownOutput:
+      pMsg="unknown";
+      // fall trough intended
+    default:
+      HLTWarning("%s handler type: agent %s, data type %s, specification %#x, ... skipping data block",
+                pMsg, pHLTOUT->GetAgent()?pHLTOUT->GetAgent()->GetModuleId():"<invalid>",
+                AliHLTComponent::DataType2Text(dt).c_str(), spec);
+    }
+  }
+  // TODO: the return value of SelectFirst/NextDataBlock must be
+  // changed in order to avoid this check
+  if (iResult==-ENOENT) iResult=0;
+
+  AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector::iterator handler;
+
+  // process and write all esd data blocks
+  for (handler=pEsdHandlers->begin(); handler!=pEsdHandlers->end() && iResult>=0; handler++) {
+    AliHLTOUT::AliHLTOUTSelectionGuard g(pHLTOUT, &(*handler));            
+    AliHLTOUTHandler* pHandler=*handler;
+    const AliHLTUInt8_t* pBuffer=NULL;
+    AliHLTUInt32_t size=0;
+    pHandler->ProcessData(pHLTOUT);
+    if ((size=pHandler->GetProcessedData(pBuffer))>0) {
+      AliHLTModuleAgent::AliHLTOUTHandlerDesc desc=*handler;
+      AliHLTComponentDataType dt=desc;
+      pHLTOUT->WriteESD(pBuffer, size, dt, esd);
+      pHandler->ReleaseProcessedData(pBuffer, size);
+    }
+    pHLTOUT->MarkDataBlocksProcessed(&(*handler));
+  }
+
+  // process all kProprietary data blocks
+  for (handler=pProprietaryHandlers->begin(); handler!=pProprietaryHandlers->end() && iResult>=0; handler++) {
+    AliHLTOUT::AliHLTOUTSelectionGuard g(pHLTOUT, &(*handler));            
+    AliHLTOUTHandler* pHandler=*handler;
+    const AliHLTUInt8_t* pBuffer=NULL;
+    AliHLTUInt32_t size=0;
+    pHandler->ProcessData(pHLTOUT);
+    if ((size=pHandler->GetProcessedData(pBuffer))>0) {
+      HLTWarning("data produced by kProprietary handler ignored");
+      pHandler->ReleaseProcessedData(pBuffer, size);
+    }
+    pHLTOUT->MarkDataBlocksProcessed(&(*handler));
+  }
+
+  // remove all empty handlers form the list (handlers which did not get a block this time)
+  AliHLTOUT::RemoveEmptyDuplicateHandlers(*pEsdHandlers);
+  AliHLTOUT::RemoveEmptyDuplicateHandlers(*pProprietaryHandlers);
+
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::ProcessHLTOUTkChain(AliHLTOUT* pHLTOUT)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  if (!pHLTOUT) return -EINVAL;
+
+  if (!fpChainHandlers)
+    fpChainHandlers=new AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector;
+
+  AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector* pChainHandlers=reinterpret_cast<AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector*>(fpChainHandlers);
+  if (!pChainHandlers) return -ENOMEM;
+
+  // invalidate all blocks
+  AliHLTOUT::InvalidateBlocks(*pChainHandlers);
+
+  // fill the list
+  pHLTOUT->FillHandlerList(*pChainHandlers, AliHLTModuleAgent::kChain);
+
+  // process all defined chain handlers
+  AliHLTOUT::AliHLTOUTHandlerListEntryVector::iterator chainHandler;
+  for (chainHandler=pChainHandlers->begin(); chainHandler!=pChainHandlers->end() && iResult>=0; chainHandler++) {
+    if (chainHandler->IsEmpty()) continue;
+    AliHLTOUT::AliHLTOUTSelectionGuard g(pHLTOUT, &(*chainHandler));       
+    AliHLTOUTHandler* pHandler=*chainHandler;
+    const AliHLTUInt8_t* pBuffer=NULL;
+    AliHLTUInt32_t size=0;
+    pHandler->ProcessData(pHLTOUT);
+    if ((size=pHandler->GetProcessedData(pBuffer))>0) {
+      AliHLTModuleAgent::AliHLTOUTHandlerDesc desc=*chainHandler;
+      //AliHLTComponentDataType dt=desc;
+
+      pHandler->ReleaseProcessedData(pBuffer, size);
+    }
+    pHLTOUT->MarkDataBlocksProcessed(&(*chainHandler));
+  }
+
+  // remove all empty handlers form the list (handlers which did not get a block this time)
+  AliHLTOUT::RemoveEmptyDuplicateHandlers(*pChainHandlers);
+
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::LoadComponentLibraries(const char* libraries)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  if (libraries) {
+    if (fpComponentHandler) {
+      TString libs(libraries);
+      TObjArray* pTokens=libs.Tokenize(" ");
+      if (pTokens) {
+       int iEntries=pTokens->GetEntriesFast();
+       for (int i=0; i<iEntries && iResult>=0; i++) {
+         iResult=fpComponentHandler->LoadLibrary((((TObjString*)pTokens->At(i))->GetString()).Data());
+       }
+       delete pTokens;
+      }
+      if (iResult>=0) {
+       SetStatusFlags(kLibrariesLoaded);
+      } else {
+       // lets see if we need this, probably not
+       //fpComponentHandler->UnloadLibraries();
+       ClearStatusFlags(kLibrariesLoaded);
+      }
+    } else {
+      iResult=-EFAULT;
+      HLTFatal("no component handler available");
+    }
+  } else {
+    iResult=-EINVAL;
+  }
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::Configure(AliRunLoader* runloader)
+{
+  // see header file for class documentation
+  return Configure(NULL, runloader);
+}
+
+int AliHLTSystem::Configure(AliRawReader* rawReader, AliRunLoader* runloader)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  if (CheckStatus(kRunning)) {
+    HLTError("HLT system in running state, can not configure");
+    return -EBUSY;
+  }
+  ClearStatusFlags(kTaskListCreated);
+  if (CheckFilter(kHLTLogDebug))
+    AliHLTModuleAgent::PrintStatus();
+  if (CheckStatus(kConfigurationLoaded)==0) {
+    iResult=LoadConfigurations(rawReader, runloader);
+  } else {
+    if (fChains.Length()==0) {
+      HLTError("custom configuration(s) specified, but no configuration to run in local reconstruction, use \'chains=<chain,...>\' option");
+      iResult=-ENOENT;
+    }
+  }
+  if (iResult>=0) {
+    SetStatusFlags(kConfigurationLoaded);
+    if (CheckFilter(kHLTLogDebug))
+      fpConfigurationHandler->PrintConfigurations();
+    iResult=BuildTaskListsFromReconstructionChains(rawReader, runloader);
+    if (iResult>=0) {
+      SetStatusFlags(kTaskListCreated);
+    }
+  }
+  if (iResult<0) SetStatusFlags(kError);
+  
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::ScanOptions(const char* options)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  if (options) {
+    //AliHLTComponentHandler::TLibraryMode libMode=AliHLTComponentHandler::kDynamic;
+    TString libs("");
+    TString excludelibs("");
+    TString alloptions(options);
+    TObjArray* pTokens=alloptions.Tokenize(" ");
+    if (pTokens) {
+      int iEntries=pTokens->GetEntriesFast();
+      for (int i=0; i<iEntries; i++) {
+       TString token=(((TObjString*)pTokens->At(i))->GetString());
+       if (token.Contains("loglevel=")) {
+         TString param=token.ReplaceAll("loglevel=", "");
+         if (param.IsDigit()) {
+           SetGlobalLoggingLevel((AliHLTComponentLogSeverity)param.Atoi());
+         } else if (param.BeginsWith("0x") &&
+                    param.Replace(0,2,"",0).IsHex()) {
+           int severity=0;
+           sscanf(param.Data(),"%x", &severity);
+           SetGlobalLoggingLevel((AliHLTComponentLogSeverity)severity);
+         } else {
+           HLTWarning("wrong parameter for option \'loglevel=\', (hex) number expected");
+         }
+       } else if (token.Contains("frameworklog=")) {
+         TString param=token.ReplaceAll("frameworklog=", "");
+         if (param.IsDigit()) {
+           SetFrameworkLog((AliHLTComponentLogSeverity)param.Atoi());
+         } else if (param.BeginsWith("0x") &&
+                    param.Replace(0,2,"",0).IsHex()) {
+           int severity=0;
+           sscanf(param.Data(),"%x", &severity);
+           SetFrameworkLog((AliHLTComponentLogSeverity)severity);
+         } else {
+           HLTWarning("wrong parameter for option \'loglevel=\', (hex) number expected");
+         }
+       } else if (token.Contains("alilog=off")) {
+         SwitchAliLog(0);
+       } else if (token.Contains("config=")) {
+         TString param=token.ReplaceAll("config=", "");
+         Int_t error=0;
+         gROOT->Macro(param.Data(), &error);
+         if (error==0) {
+           SetStatusFlags(kConfigurationLoaded);
+         } else {
+           HLTError("can not execute macro \'%s\'", param.Data());
+           iResult=-EBADF;
+         }
+       } else if (token.Contains("chains=")) {
+         TString param=token.ReplaceAll("chains=", "");
+         fChains=param.ReplaceAll(",", " ");
+         if (fChains.IsNull()) fChains=" "; // disable all chains
+       } else if (token.Contains("libmode=")) {
+         TString param=token.ReplaceAll("libmode=", "");
+         param.ReplaceAll(",", " ");
+         if (fpComponentHandler) {
+           if (param.CompareTo("static")==0) {
+             fpComponentHandler->SetLibraryMode(AliHLTComponentHandler::kStatic);
+           } else if (param.CompareTo("dynamic")==0) {
+             fpComponentHandler->SetLibraryMode(AliHLTComponentHandler::kDynamic);
+           } else {
+             HLTWarning("wrong argument for option \'libmode=\', use \'static\' or \'dynamic\'");
+           }
+         }
+       } else if (token.BeginsWith("ECS=")) {
+         fECSParams=token.ReplaceAll("ECS=", "");
+       } else if (token.BeginsWith("lib") && token.EndsWith(".so")) {
+         libs+=token;
+         libs+=" ";
+       } else if (token.BeginsWith("!lib") && token.EndsWith(".so")) {
+         excludelibs+=token;
+         excludelibs+=" ";
+       } else {
+         HLTWarning("unknown option \'%s\'", token.Data());
+       }
+      }
+      delete pTokens;
+    }
+
+    if (iResult>=0) {
+      if (libs.IsNull()) {
+       const char** deflib=fgkHLTDefaultLibs;
+       for (;*deflib; deflib++) {
+         if (excludelibs.Contains(*deflib)) continue;
+         libs+=*deflib;
+         libs+=" ";
+       }
+      }
+      if ((!CheckStatus(AliHLTSystem::kLibrariesLoaded)) &&
+         (LoadComponentLibraries(libs.Data())<0)) {
+       HLTError("error while loading HLT libraries");
+       iResult=-EFAULT;
+      }
+    }
+  }
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::Reset(int bForce)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  if (!bForce && CheckStatus(kRunning)) {
+    HLTError("HLT system in running state, can not configure");
+    return -EBUSY;
+  }
+  CleanTaskList();
+  ClearStatusFlags(~kUninitialized);
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::LoadConfigurations(AliRawReader* rawReader, AliRunLoader* runloader)
+{
+  // see header file for class documentation
+  if (CheckStatus(kRunning)) {
+    HLTError("HLT system in running state, can not configure");
+    return -EBUSY;
+  }
+  int iResult=0;
+  AliHLTModuleAgent* pAgent=NULL;
+
+  // first check for the required libraries and load those
+  TString extralibs;
+  for (pAgent=AliHLTModuleAgent::GetFirstAgent(); 
+       pAgent && iResult>=0;
+       pAgent=AliHLTModuleAgent::GetNextAgent()) {
+    const char* deplibs=pAgent->GetRequiredComponentLibraries();
+    if (deplibs) {
+      HLTDebug("required libraries \'%s\' for agent %s (%p)", deplibs, pAgent->GetName(), pAgent);
+      extralibs+=" ";
+      extralibs+=deplibs;
+    }
+  }
+  if (iResult>=0) {
+    iResult=LoadComponentLibraries(extralibs.Data());
+  }
+
+  // in order to register the configurations in the correct sequence
+  // all agents need to be ordered with respect to the required
+  // libraries. Ordering relies on the naming convention
+  // libAliHLT<Module>.so
+  TList agents;
+  for (pAgent=AliHLTModuleAgent::GetFirstAgent(); 
+       pAgent && iResult>=0;
+       pAgent=AliHLTModuleAgent::GetNextAgent()) {
+    AliHLTModuleAgent* pPrevDep=NULL;
+    TString dependencies=pAgent->GetRequiredComponentLibraries();
+    TObjArray* pTokens=dependencies.Tokenize(" ");
+    if (pTokens) {
+      for (int n=0; n<pTokens->GetEntriesFast(); n++) {
+       TString module=((TObjString*)pTokens->At(n))->GetString();
+       HLTDebug("  checking %s", module.Data());
+       module.ReplaceAll("libAliHLT", "");
+       module.ReplaceAll(".so", "");
+       
+       for (AliHLTModuleAgent* pCurrent=dynamic_cast<AliHLTModuleAgent*>(pPrevDep==NULL?agents.First():agents.After(pPrevDep));
+            pCurrent!=NULL; pCurrent=dynamic_cast<AliHLTModuleAgent*>(agents.After(pCurrent))) {
+         HLTDebug("    checking %s == %s", module.Data(), pCurrent->GetModuleId());
+
+         if (module.CompareTo(pCurrent->GetModuleId())==0) {
+           pPrevDep=pCurrent;
+           break;
+         }
+       }
+      }
+      delete pTokens;
+    }
+
+    if (pPrevDep) {
+      // insert right after the last dependency
+      agents.AddAfter(pPrevDep, pAgent);
+      HLTDebug("insert %s after %s", pAgent->GetModuleId(), pPrevDep->GetModuleId());
+    } else {
+      // insert at the beginning
+      agents.AddFirst(pAgent);
+      HLTDebug("insert %s at beginning", pAgent->GetModuleId());
+    }
+  }
+
+  // now we load the configurations
+  if (agents.GetEntries()) {
+    TIter next(&agents);
+    while ((pAgent = dynamic_cast<AliHLTModuleAgent*>(next()))) {
+      HLTDebug("load configurations for agent %s (%p)", pAgent->GetName(), pAgent);
+      pAgent->CreateConfigurations(fpConfigurationHandler, rawReader, runloader);
+    }
+  }
+
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::BuildTaskListsFromReconstructionChains(AliRawReader* rawReader, AliRunLoader* runloader)
+{
+  // see header file for class documentation
+  if (CheckStatus(kRunning)) {
+    HLTError("HLT system in running state, can not configure");
+    return -EBUSY;
+  }
+  if (!CheckStatus(kConfigurationLoaded)) {
+    HLTWarning("configurations not yet loaded");
+    return 0;
+  }
+
+  int iResult=0;
+  int bHaveOutput=0;
+
+  // query chains
+  TString chains;
+  if (fChains.Length()>0) {
+    chains=fChains;
+    HLTImportant("custom reconstruction chain: %s", chains.Data());
+  } else {
+    AliHLTModuleAgent* pAgent=AliHLTModuleAgent::GetFirstAgent();
+    while ((pAgent || fChains.Length()>0) && iResult>=0) {
+      const char* agentchains=pAgent->GetReconstructionChains(rawReader, runloader);
+      if (agentchains) {
+       if (!chains.IsNull()) chains+=" ";
+       chains+=agentchains;
+       HLTInfo("reconstruction chains for agent %s (%p): %s", pAgent->GetName(), pAgent, agentchains);
+      }
+      pAgent=AliHLTModuleAgent::GetNextAgent();
+    }
+  }
+
+  // build task list for chains
+  TObjArray* pTokens=chains.Tokenize(" ");
+  if (pTokens) {
+    int iEntries=pTokens->GetEntriesFast();
+    for (int i=0; i<iEntries && iResult>=0; i++) {
+      const char* pCID=((TObjString*)pTokens->At(i))->GetString().Data();
+      AliHLTConfiguration* pConf=fpConfigurationHandler->FindConfiguration(pCID);
+      if (pConf) {
+       iResult=BuildTaskList(pConf);
+       if (true) { // condition was deprecated but kept for sake of svn diff
+         // bHaveOutput variable has to be set for both running modes
+         // AliHLTSimulation and AliHLTReconstruction
+         assert(fpComponentHandler!=NULL);
+         TString cid=pConf->GetComponentID();
+         if (runloader!=NULL && cid.CompareTo("HLTOUT")==0) {
+           // remove from the input of a global HLTOUT configuration
+           chains.ReplaceAll(pCID, "");
+         } else if (bHaveOutput==0) {
+           // check whether this configuration produces data output
+           if ((bHaveOutput=fpComponentHandler->HasOutputData(cid.Data()))<0) {
+             bHaveOutput=0;
+             chains.ReplaceAll(pCID, "");
+           }
+         }
+       }
+      } else {
+       HLTWarning("can not find configuration %s", pCID);
+      }
+    }
+    delete pTokens;
+  }
+
+  // build HLTOUT for simulation
+  if (iResult>=0 && runloader) {
+    if (bHaveOutput) {
+      // there are components in the chain which produce data which need to be
+      // piped to an HLTOUT
+
+      // add the SchemaEvolutionComponent which analyzes the ROOT objects in
+      // the output stream
+      if (fpComponentHandler->FindComponentIndex("ROOTSchemaEvolutionComponent")>=0 ||
+         fpComponentHandler->LoadLibrary("libAliHLTUtil.so")>=0) {
+       AliHLTConfiguration schemaevo("_schemaevolution_", "ROOTSchemaEvolutionComponent", 
+                                     chains.Data(), "-file=HLT.StreamerInfo.root");
+       iResult=BuildTaskList("_schemaevolution_");
+      } else {
+       HLTWarning("can not load libAliHLTUtil.so and ROOTSchemaEvolutionComponent");
+      }
+
+      // add the HLTOUT component
+      if (fpComponentHandler->FindComponentIndex("HLTOUT")>=0 ||
+         fpComponentHandler->LoadLibrary("libHLTsim.so")>=0) {
+       AliHLTConfiguration globalout("_globalout_", "HLTOUT", chains.Data(), NULL);
+       iResult=BuildTaskList("_globalout_");
+      } else {
+       HLTError("can not load libHLTsim.so and HLTOUT component");
+       iResult=-EFAULT;
+      }
+    }
+  }
+
+  // build HLTOUT task for reconstruction
+  // Matthias 08.07.2008 the rawReader is never set when running embedded into
+  // AliReconstruction. The system is configured during AliHLTReconstructor::Init
+  // where the RawReader is not available. It is available in the first invocation
+  // of Reconstruct.
+  // 
+  // That means that policy is slightly changed:
+  // - if the run loader is available -> AliSimulation
+  // - no run loader available -> AliReconstruction
+  if (iResult>=0 && !runloader) {
+    if (bHaveOutput) {
+      // there are components in the chain which produce data which need to be
+      // piped to an HLTOUT sub-collection
+      if (!fpHLTOUTTask) {
+       iResult=AddHLTOUTTask(chains.Data());
+      }
+    }
+  }
+
+  if (iResult>=0) SetStatusFlags(kTaskListCreated);
+
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::AddHLTOUTTask(const char* hltoutchains)
+{
+  // see header file for class documentation
+  int iResult=0;
+  if (!hltoutchains || hltoutchains[0]==0) return 0;
+
+  // check chains for output
+  TString chains=hltoutchains;
+  TObjArray* pTokens=chains.Tokenize(" ");
+  if (pTokens) {
+    int iEntries=pTokens->GetEntriesFast();
+    for (int i=0; i<iEntries && iResult>=0; i++) {
+      const char* token=((TObjString*)pTokens->At(i))->GetString().Data();
+      AliHLTConfiguration* pConf=fpConfigurationHandler->FindConfiguration(token);
+      if (pConf) {
+       TString cid=pConf->GetComponentID();
+       if (fpComponentHandler->HasOutputData(cid.Data())) {
+         continue;
+       }
+      } else {
+       HLTWarning("can not find configuration %s", token);
+      }
+      // remove from the list of hltout chains
+      chains.ReplaceAll(token, "");
+    }
+    delete pTokens;
+  }
+
+  // do not create the HLTOUT task if none of the chains have output
+  if (chains.IsNull()) return 0;
+
+  // indicate the task to be available
+  iResult=1;
+
+  if (fpHLTOUTTask) {
+    if (strcmp(chains.Data(), fpHLTOUTTask->GetSourceChains())==0) {
+      HLTWarning("HLTOUT task already added for chains \"%s\" %p", chains.Data(), fpHLTOUTTask);
+    } else {
+      HLTError("HLTOUT task already added for chains \"%s\" %p, ignoring new chains  \"%s\"",
+              fpHLTOUTTask->GetSourceChains(), fpHLTOUTTask, chains.Data());
+    }
+    return iResult;
+  }
+
+  fpHLTOUTTask=new AliHLTOUTTask(chains);
+  if (fpHLTOUTTask) {
+    if (fpHLTOUTTask->GetConf() && fpHLTOUTTask->GetConf()->SourcesResolved()>=0) {
+      iResult=InsertTask(fpHLTOUTTask);
+    } else {
+      HLTError("HLTOUT task (%s) sources not resolved", fpHLTOUTTask->GetName());
+      iResult=-ENOENT;
+    }
+
+    if (iResult<0) {
+      delete fpHLTOUTTask;
+    }
+
+  } else {
+    iResult=-ENOMEM;
+  }
+  return iResult;
+}
+
+int AliHLTSystem::CheckStatus(int flag)
+{
+  // see header file for class documentation
+  if (flag==kUninitialized && flag==fState) return 1;
+  if ((fState&flag)==flag) return 1;
+  return 0;
+}
+
+int AliHLTSystem::GetStatusFlags()
+{
+  // see header file for class documentation
+  return fState;
+}
+
+int AliHLTSystem::SetStatusFlags(int flags)
+{
+  // see header file for class documentation
+  fState|=flags;
+  return fState;
+}
+
+int AliHLTSystem::ClearStatusFlags(int flags)
+{
+  // see header file for class documentation
+  fState&=~flags;
+  return fState;
+}
+
+AliHLTfctVoid AliHLTSystem::FindDynamicSymbol(const char* library, const char* symbol)
+{
+  // see header file for class documentation
+  if (fpComponentHandler==NULL) return NULL;
+  return fpComponentHandler->FindSymbol(library, symbol);
+}
+
+void AliHLTSystem::SetFrameworkLog(AliHLTComponentLogSeverity level) 
+{
+  // see header file for class documentation
+  SetLocalLoggingLevel(level);
+  if (fpComponentHandler) fpComponentHandler->SetLocalLoggingLevel(level);
+  if (fpConfigurationHandler) fpConfigurationHandler->SetLocalLoggingLevel(level);
+}
+
+int AliHLTSystem::LoggingVarargs(AliHLTComponentLogSeverity severity, 
+                                const char* originClass, const char* originFunc,
+                                const char* file, int line, ... ) const
+{
+  // see header file for function documentation
+  int iResult=0;
+
+  va_list args;
+  va_start(args, line);
+
+  if (!fName.IsNull())
+    AliHLTLogging::SetLogString(this, " (%p)", "%s_pfmt_: ", fName.Data());
+  iResult=SendMessage(severity, originClass, originFunc, file, line, AliHLTLogging::BuildLogString(NULL, args, !fName.IsNull() /*append if non empty*/));
+  va_end(args);
+
   return iResult;
 }