commented define _ClusterTopology_ - to be used only for the special productions
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITS.cxx
index 04368ce..ae9d9b5 100644 (file)
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
 
-/*
-$Log$
-Revision 1.75  2002/10/22 14:45:25  alibrary
-Introducing Riostream.h
-
-Revision 1.74  2002/10/14 14:57:00  hristov
-Merging the VirtualMC branch to the main development branch (HEAD)
-
-Revision 1.67.4.3  2002/10/14 13:14:07  hristov
-Updating VirtualMC to v3-09-02
-
-Revision 1.73  2002/09/09 17:14:25  nilsen
-Update of documentation to reflect changes in AliITSdigitS?D classes.
-
-Revision 1.72  2002/06/10 17:28:55  nilsen
-Added new FillModules routine and cleaned up the old one.
-
-Revision 1.71  2002/05/13 14:27:56  hristov
-TreeC created once per event (M.Masera)
-
-Revision 1.70  2002/05/10 22:28:30  nilsen
-Changes by Massimo Masera to allow the TTree of clusters to be written to a
-file otherthan the one with digits in it.
-
-Revision 1.69  2002/05/05 21:06:55  nilsen
-Added GetSimulationMoel, and fixed up SetDefaultSimulation to do the
-proper initilization when a simulation has already been defined.
-
-Revision 1.68  2002/05/02 18:51:53  nilsen
-AliITS.h
-   Method MakeBranchR has now a second argument, with a default value:
-       Option_t *opt=" ". Opt="Fast" is to create a separate branch
-       for fast points in TreeR
-   New method MakeBranchRF: it a separate branch in TreeR for Fast Points
-
-AliITS.cxx
-1) TTree->Write() replaced with TTree->AutoSave for TreeS, TreeD and
-   TreeR
-2) Changes in MakeBranchR to allow the creation of a special branch
-   for fast points
-
-Revision 1.67  2002/03/15 17:22:51  nilsen
-Intoduced SDigits2Digits and SDigitsToDigits functions.
-
-Revision 1.66  2001/11/28 01:35:45  nilsen
-Using standard constructors instead of default constructors for Clusterfinder,
-Response, and FastSimulator.
-
-Revision 1.65  2001/11/27 16:27:28  nilsen
-Adding AliITSDigitizer class to do merging and digitization . Based on the
-TTask method. AliITSDigitizer class added to the Makefile and ITSLinkDef.h
-file. The following files required minor changes. AliITS, added functions
-SetHitsAddressBranch, MakeBranchInTreeD and modified MakeBranchD.
-AliITSsimulationSDD.cxx needed a Tree indepenent way of returning back to
-the original Root Directory in function Compress1D. Now it uses gDirectory.
-
-Revision 1.64  2001/11/19 16:17:02  nilsen
-Applyed fixes to bugs found by Rene Brun. With many thanks. Some additonal
-bugs found by Rene require more work to fix. Will be fixed soon.
-
-Revision 1.63  2001/10/24 21:16:34  nilsen
-Removed some dead code and improved comments/documntation.
-
-Revision 1.62  2001/10/21 19:23:21  nilsen
-Added function to allow to limit which detectors to digitize and reconstruct.
-The default is All. This change makes no changes to any root file.
-
-Revision 1.61  2001/10/11 15:26:07  mariana
-Correct HitsToFastRecPoints
-
-Revision 1.60  2001/10/04 22:38:10  nilsen
-Changes made to support PreDigits (SDigits) plus other helpful changes.
-
-Revision 1.59  2001/08/30 09:56:18  hristov
-The operator[] is replaced by At() or AddAt() in case of TObjArray.
-
-Revision 1.58  2001/07/26 15:05:29  hristov
-Use global gRandom generator (M.Ivanov)
-
-Revision 1.57  2001/07/24 14:26:11  mariana
-Introduce the function Digits2Reco() and write the defaults for simulation and reconstruction
-
-Revision 1.56  2001/07/05 12:49:49  mariana
-Temporary patches required by root.v3.01.05
-
-Revision 1.55  2001/06/14 14:59:00  barbera
-Tracking V1 decoupled from AliITS
-
-Revision 1.54  2001/05/31 20:37:56  barbera
-Bari/Salerno model set as defaault SPD simulation
-
-Revision 1.53  2001/05/31 18:52:24 barbera 
-Bari model becomes the default
-
-Revision 1.53  2001/05/30 07:52:24  hristov
-TPC and CONTAINERS included in the search path
-
-Revision 1.52  2001/05/30 06:04:58  hristov
-Changes made to be consitant with changes in TPC tracking classes (B.Nilsen)
-
-Revision 1.51  2001/05/16 14:57:15  alibrary
-New files for folders and Stack
-
-Revision 1.50  2001/05/11 09:15:21  barbera
-Corrected to make fast point creation working with PPR geometry
-
-Revision 1.49  2001/05/11 07:37:49  hristov
-Legacy lines commented
-
-Revision 1.48  2001/05/10 18:14:25  barbera
-A typo corrected
-
-Revision 1.47  2001/05/10 17:55:59  barbera
-Modified to create rec points also for PPR geometries
-
-Revision 1.46  2001/05/10 00:05:28  nilsen
-Allowed for HitsToDigits function to work with versions 5, 7, 8, and 9. This
-should probably be cleaned up to only check to make sure that fITSgeom has
-been properly defined.
-
-Revision 1.45  2001/05/01 22:35:48  nilsen
-Remove/commented a number of cout<< statements. and made change needed by
-SSD code.
-
-Revision 1.44  2001/04/26 22:44:01  nilsen
-Removed dependence on layer 5/6 in AliITS::HitsToDigits. This will be
-done properly in AliITSv???.cxx via SetDefaults.
-
-Revision 1.43  2001/04/26 13:22:52  barbera
-TMatrix and TVector elimininated to speed up the code
-
-Revision 1.42  2001/04/25 21:55:12  barbera
-Updated version to be compatible with actual verion of STEER and TPC
-
-Revision 1.41  2001/04/21 15:16:51  barbera
-Updated with the new SSD reconstruction code
-
-Revision 1.40  2001/03/17 15:07:06  mariana
-Update SDD response parameters
-
-Revision 1.39  2001/03/12 17:45:32  hristov
-Changes needed on Sun with CC 5.0
-
-Revision 1.38  2001/03/07 14:04:51  barbera
-Some vector dimensions increased to cope with full events
-
-Revision 1.37  2001/03/07 12:36:35  barbera
-A change added in the tracking part to manage delta rays
-
-Revision 1.36  2001/03/02 19:44:11  barbera
- modified to taking into account new version tracking v1
-
-Revision 1.35  2001/02/28 18:16:46  mariana
-Make the code compatible with the new AliRun
-
-Revision 1.34  2001/02/11 15:51:39  mariana
-Set protection in MakeBranch
-
-Revision 1.33  2001/02/10 22:26:39  mariana
-Move the initialization of the containers for raw clusters in MakeTreeC()
-
-Revision 1.32  2001/02/08 23:55:31  nilsen
-Removed fMajor/MinorVersion variables in favor of variables in derived classes.
-Set arrays char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"} as const.
-
-Revision 1.31  2001/02/02 23:57:28  nilsen
-Added include file that are no londer included in AliITSgeom.h
-
-Revision 1.30  2001/01/30 09:23:13  hristov
-Streamers removed (R.Brun)
-
-Revision 1.29  2001/01/26 20:01:09  hristov
-Major upgrade of AliRoot code
-
-Revision 1.28  2000/12/18 14:02:00  barbera
-new version of the ITS tracking to take into account the new TPC track parametrization
-
-Revision 1.27  2000/12/08 13:49:27  barbera
-Hidden declaration in a for loop removed to be compliant with HP-UX compiler
-
-Revision 1.26  2000/11/27 13:12:13  barbera
-New version containing the files for tracking
-
-Revision 1.25  2000/11/12 22:38:05  barbera
-Added header file for the SPD Bari model
-
-Revision 1.24  2000/10/09 22:18:12  barbera
-Bug fixes from MAriana to le AliITStest.C run correctly
-
-Revision 1.23  2000/10/05 20:47:42  nilsen
-fixed dependencies of include files. Tryed but failed to get a root automaticly
-generates streamer function to work. Modified SetDefaults.
-
-Revision 1.9.2.15  2000/10/04 16:56:40  nilsen
-Needed to include stdlib.h
-
-=======
-Revision 1.22  2000/10/04 19:45:52  barbera
-Corrected by F. Carminati for v3.04
-
-Revision 1.21  2000/10/02 21:28:08  fca
-Removal of useless dependecies via forward declarations
-
-Revision 1.20  2000/10/02 16:31:39  barbera
-General code clean-up
-
-Revision 1.9.2.14  2000/10/02 15:43:51  barbera
-General code clean-up (e.g., printf -> cout)
-
-Revision 1.19  2000/09/22 12:13:25  nilsen
-Patches and updates for fixes to this and other routines.
+/* $Id$ */
 
-Revision 1.18  2000/07/12 05:32:20  fca
-Correcting several syntax problem with static members
-
-Revision 1.17  2000/07/10 16:07:18  fca
-Release version of ITS code
-
-Revision 1.9.2.3  2000/02/02 13:42:09  barbera
-fixed AliITS.cxx for new AliRun structure. Added ITS hits list to list of hits which will have their track numbers updated
-
-Revision 1.9.2.2  2000/01/23 03:03:13  nilsen
-//fixed FillModule. Removed fi(fabs(xl)<dx....
-
-Revision 1.9.2.1  2000/01/12 19:03:32  nilsen
-This is the version of the files after the merging done in December 1999.
-See the ReadMe110100.txt file for details
-
-Revision 1.9  1999/11/14 14:33:25  fca
-Correct problems with distructors and pointers, thanks to I.Hrivnacova
-
-Revision 1.8  1999/09/29 09:24:19  fca
-Introduction of the Copyright and cvs Log
-
-*/
 
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-//
-//      An overview of the basic philosophy of the ITS code development
-// and analysis is show in the figure below.
-//Begin_Html
-/*
+//                                                                           //
+//      An overview of the basic philosophy of the ITS code development      //
+// and analysis is show in the figure below.                                 //
+//Begin_Html                                                                 //
+/*                                               
 <img src="picts/ITS/ITS_Analysis_schema.gif">
 </pre>
 <br clear=left>
@@ -297,98 +64,88 @@ the AliITS class.
 // futher information.
 //
 ///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-#include <Riostream.h>
+
 #include <stdlib.h>
-#include <TMath.h>
-#include <TRandom.h>
-#include <TBranch.h>
-#include <TVector.h>
 #include <TClonesArray.h>
-#include <TROOT.h>
-#include <TObjectTable.h>
 #include <TFile.h>
-#include <TTree.h>
+#include <TParticle.h>
 #include <TString.h>
-
-#include "AliHeader.h"
-
+#include <TTree.h>
+#include <TVirtualMC.h>
+#include <TArrayI.h>
+#include "AliDetector.h"
 #include "AliITS.h"
-#include "AliITSDetType.h"
-#include "AliITSresponseSPD.h"
-#include "AliITSresponseSDD.h"
-#include "AliITSresponseSSD.h"
-#include "AliITSsegmentationSPD.h"
-#include "AliITSsegmentationSDD.h"
-#include "AliITSsegmentationSSD.h"
-#include "AliITSsimulationSPD.h"
-#include "AliITSsimulationSDD.h"
-#include "AliITSsimulationSSD.h"
-#include "AliITSClusterFinderSPD.h"
-#include "AliITSClusterFinderSDD.h"
-#include "AliITSClusterFinderSSD.h"
+#include "AliITSDetTypeSim.h"
+#include "AliITSDDLRawData.h"
+#include "AliITSLoader.h"
 #include "AliITShit.h"
-#include "AliITSgeom.h"
-#include "AliITSpList.h"
-#include "AliITSdigit.h"
 #include "AliITSmodule.h"
+#include "AliITSpListItem.h"
+#include "AliITSsimulation.h"
+#include "AliITSsimulationFastPoints.h"
+#include "AliMC.h"
+#include "AliITSDigitizer.h"
 #include "AliITSRecPoint.h"
-#include "AliITSRawCluster.h"
+#include "AliITSsegmentationSPD.h"
+#include "AliITSsegmentationSDD.h"
+#include "AliITSsimulationSDD.h"
+#include "AliITSCalibrationSDD.h"
+#include "AliITSCalibrationSSD.h"
+#include "AliITSsegmentationSSD.h"
+#include "AliITSRawStreamSPD.h"
+#include "AliITSRawStreamSSD.h"
+#include "AliITSRawStreamSDD.h"
+#include "AliRawReader.h"
+#include "AliRun.h"
+#include "AliLog.h"
+#include "AliITSInitGeometry.h"
+#include "AliITSFOSignalsSPD.h"
 
 ClassImp(AliITS)
 
 //______________________________________________________________________
-AliITS::AliITS() : AliDetector() {
-    // Default initializer for ITS
-    //      The default constructor of the AliITS class. In addition to
-    // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
-    // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
-    // fITSpoints, fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
-    // is also called.
-    // Inputs:
-    //      none.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      Blank ITS class.
-
-    fIshunt     = 0;   // not zeroed in AliDetector.
-
-    // AliITS variables.
-    fEuclidOut  = 0;
-    fITSgeom    = 0;
-    fITSmodules = 0;
-    fOpt        = "All";
+AliITS::AliITS() : AliDetector(),
+fDetTypeSim(0),
+fEuclidOut(0),
+fOpt("All"),
+fIdN(0),
+fIdSens(0),
+fIdName(0),
+fITSmodules(0),
+fTiming(kFALSE),
+fSimuParam(0),
+fModA(0),
+fpSDigits(0)
+{
+  // Default initializer for ITS
+  //      The default constructor of the AliITS class. In addition to
+  // creating the AliITS class it zeros the variables fIshunt (a member
+  // of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros the pointers
+  // fIdSens, and fIdName. The AliDetector default constructor
+  // is also called.
+  
 //    SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
-
-    fIdN        = 0;
-    fIdName     = 0;
-    fIdSens     = 0;
-
-    fNDetTypes  = kNTYPES;
-    fDetTypes   = 0;
-
-    fSDigits    = 0;
-    fNSDigits   = 0;
-
-    fNdtype     = 0;
-    fDtype      = 0;
-
-    fCtype      = 0;
-    fNctype     = 0;
-    fTreeC      = 0;
-
-    fRecPoints  = 0;
-    fNRecPoints = 0;
-
-    SetMarkerColor(kRed);
+//PH    SetMarkerColor(kRed);
+  for (int i=fgkNTYPES;i--;) fkRawID2ClusID[i] = 0;
 }
 //______________________________________________________________________
-AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):AliDetector(name,title){
-    //     The standard Constructor for the ITS class. In addition to 
-    // creating the AliITS class, it allocates memory for the TClonesArrays 
-    // fHits, fSDigits, fDigits, fITSpoints, and the TObjArray of fCtype 
-    // (clusters). It also zeros the variables
-    // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and fIdN, and zeros
+AliITS::AliITS(const Char_t *title):
+  AliDetector("ITS",title),
+  fDetTypeSim(0),
+  fEuclidOut(0),
+  fOpt("All"),
+  fIdN(0),
+  fIdSens(0),
+  fIdName(0),
+  fITSmodules(0),
+  fTiming(kFALSE),
+  fSimuParam(0),
+  fModA(0),
+  fpSDigits(0)
+{
+    //     The standard Constructor for the ITS class. 
+    // It also zeros the variables
+    // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
     // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
     // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
     // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
@@ -396,58 +153,65 @@ AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):AliDetector(name,title){
     // class for a description of these parameters and its constructor
     // functions.
     // Inputs:
-    //      const char *name      Detector name. Should always be "ITS"
-    //      const char *title     Detector title.
+    //   Char_t *title  Simulation title for the ITS
     // Outputs:
-    //      none.
+    //   none.
     // Return:
-    //      An ITS class.
-
-    fIshunt     = 0;  // not zeroed in AliDetector
-    fHits       = new TClonesArray("AliITShit", 1560);//not done in AliDetector
-    gAlice->AddHitList(fHits);  // Not done in AliDetector.
-
-    fEuclidOut  = 0;
-    fITSgeom    = 0;
-    fITSmodules = 0;
+    //   none.
+  
+    fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560); // from AliDetector
+    if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
+    //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
     SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
-
-    fIdN        = 0;
-    fIdName     = 0;
-    fIdSens     = 0;
-
-    fNDetTypes  = kNTYPES;
-    fDetTypes   = new TObjArray(fNDetTypes);
-
-    fSDigits    = new TClonesArray("AliITSpListItem",1000);
-    fNSDigits   = 0;
-
-    fNdtype     = new Int_t[fNDetTypes];
-    fDtype      = new TObjArray(fNDetTypes);
-
-    fCtype      = new TObjArray(fNDetTypes);
-    fNctype     = new Int_t[fNDetTypes];
-    fTreeC      = 0;
-
-    fRecPoints  = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
-    fNRecPoints = 0;
-
-    Int_t i;
-    for(i=0;i<fNDetTypes;i++) {
-       fDetTypes->AddAt(new AliITSDetType(),i); 
-       fNdtype[i] = 0;
-       fNctype[i] = 0;
-    } // end for i
-
-    SetMarkerColor(kRed);
+    fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
+    //PH  SetMarkerColor(kRed);
+    if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
+    fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+    for (int i=fgkNTYPES;i--;) fkRawID2ClusID[i] = 0;
+}
+//______________________________________________________________________
+AliITS::AliITS(const char *name, const char *title):
+  AliDetector(name,title),
+  fDetTypeSim(0),
+  fEuclidOut(0),
+  fOpt("All"),
+  fIdN(0),
+  fIdSens(0),
+  fIdName(0),
+  fITSmodules(0),
+  fTiming(kFALSE),
+  fSimuParam(0),
+  fModA(0),
+  fpSDigits(0)
+{
+  //     The standard Constructor for the ITS class. 
+  // It also zeros the variables
+  // fIshunt (a member of AliDetector class), fEuclidOut, and zeros
+  // the pointers fIdSens and fIdName. To help in displaying hits via the
+  // ROOT macro display.C AliITS also sets the marker color to red. The
+  // variables passes with this constructor, const char *name and *title,
+  // are used by the constructor of AliDetector class. See AliDetector
+  // class for a description of these parameters and its constructor
+  // functions.
+  
+  fHits = new TClonesArray("AliITShit",1560);
+  if(gAlice->GetMCApp()) gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits);
+  //fNhits=0;  //done in AliDetector(name,title)
+
+  SetDetectors(); // default to fOpt="All". This variable not written out.
+    
+  fDetTypeSim   = new AliITSDetTypeSim();
+  //PH  SetMarkerColor(kRed);
+  if(!fLoader) MakeLoader(AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
+  fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+  for (int i=fgkNTYPES;i--;) fkRawID2ClusID[i] = 0;
 }
 //______________________________________________________________________
 AliITS::~AliITS(){
     // Default destructor for ITS.
     //     The default destructor of the AliITS class. In addition to deleting
-    // the AliITS class it deletes the memory pointed to by the fHits, fDigits,
-    // fSDigits, fCtype, fITSmodules, fITSgeom, fRecPoints, fIdSens, fIdName, 
-    // fITSpoints, fDetType and it's contents.
+    // the AliITS class it deletes the memory pointed to by 
+    // fIdSens, fIdName, fDetTypeSim and it's contents.
     // Inputs:
     //      none.
     // Outputs:
@@ -455,85 +219,56 @@ AliITS::~AliITS(){
     // Return:
     //      none.
 
-    delete fHits; fHits=0;
-    delete fSDigits; fSDigits=0;
-//    delete fDigits; fDigits=0;
-    delete fRecPoints; fRecPoints=0;
-    if(fIdName!=0) delete[] fIdName;  // Array of TStrings
-    if(fIdSens!=0) delete[] fIdSens;
-    if(fITSmodules!=0) {
-       this->ClearModules();
-       delete fITSmodules;
+    if (fHits) {
+      fHits->Delete();
+      delete fHits;
+      fHits=0;
+    }
+    if(fITSmodules) {
+        this->ClearModules();
+        delete fITSmodules;
+       fITSmodules = 0;
     }// end if fITSmodules!=0
 
-    if(fDtype) {
-       fDtype->Delete();
-       delete fDtype;
-    } // end if fDtype
-    delete [] fNdtype;
-    if (fCtype) {
-       fCtype->Delete();
-       delete fCtype;
-    } // end if fCtype
-    delete [] fNctype;
-
-    if (fDetTypes) {
-       fDetTypes->Delete();
-       delete fDetTypes;
-    } // end if fDetTypes
-
-    if (fTreeC) delete fTreeC;
-
-    if (fITSgeom) delete fITSgeom;
-}
-//______________________________________________________________________
-AliITS::AliITS(AliITS &source){
-    // Copy constructor. This is a function which is not allowed to be
-    // done to the ITS. It exits with an error.
-    // Inputs:
-    //      AliITS &source  An AliITS class.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-
-    if(this==&source) return;
-    Error("Copy constructor",
-         "You are not allowed to make a copy of the AliITS");
-    exit(1);
+    delete[] fIdName;  // Array of TStrings
+    delete[] fIdSens;
+    Int_t size   = AliITSgeomTGeo::GetNModules();
+    if (fDetTypeSim){
+      delete fDetTypeSim;
+      fDetTypeSim = 0;
+    }
+    if(fSimuParam){
+      delete fSimuParam;
+      fSimuParam=0;
+    }
+    if(fModA){
+      if(size>0){
+       for(Int_t j=0; j<size; j++){
+         fModA[j]->Delete();
+         delete fModA[j];
+       }
+      }
+      delete []fModA;
+    }
+    if(fpSDigits){
+      fpSDigits->Delete();
+      delete fpSDigits;
+    }
 }
-//______________________________________________________________________
-AliITS& AliITS::operator=(AliITS &source){
-    // Assignment operator. This is a function which is not allowed to be
-    // done to the ITS. It exits with an error.
-    // Inputs:
-    //      AliITS &source  An AliITS class.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
 
-    if(this==&source) return *this;
-    Error("operator=","You are not allowed to make a copy of the AliITS");
-    exit(1);
-    return *this; //fake return
-}
 //______________________________________________________________________
-Int_t AliITS::DistancetoPrimitive(Int_t,Int_t){
-    // Distance from mouse to ITS on the screen. Dummy routine
-    //     A dummy routine used by the ROOT macro display.C to allow for the
-    // use of the mouse (pointing device) in the macro. In general this should
-    // never be called. If it is it returns the number 9999 for any value of
-    // x and y.
+AliDigitizer* AliITS::CreateDigitizer(AliDigitizationInput* digInput)const{
+    // Creates the AliITSDigitizer in a standard way for use via AliModule.
+    // This function can not be included in the .h file because of problems
+    // with the order of inclusion (recursive).
     // Inputs:
-    //      Int_t     Dummy screen coordinate.
-    //      Int_t     Dummy screen coordinate.
-    // Outputs:
-    //      none.
+    //    AliDigitizationInput* digInput  The Manger class for Digitization
+    // Output:
+    //    none.
     // Return:
-    //      Int_t     Dummy = 9999 distance to ITS.
+    //    A new AliITSRunDigitizer (cast as a AliDigitizer).
 
-    return 9999;
+     return new AliITSDigitizer(digInput);
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITS::Init(){
@@ -550,10 +285,9 @@ void AliITS::Init(){
     // Return:
     //      none.
     Int_t i;
-
-    SetDefaults();
     // Array of TStrings
-    for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = gMC->VolId(fIdName[i]);
+    if(TVirtualMC::GetMC()) for(i=0;i<fIdN;i++) fIdSens[i] = TVirtualMC::GetMC()->VolId(fIdName[i]);
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITS::SetDefaults(){
@@ -564,61 +298,15 @@ void AliITS::SetDefaults(){
     //      none.
     // Return:
     //      none.
+    AliInfoClass("AliITS::Setting Defaults");
+    if(!fDetTypeSim) { 
+     Error("SetDefaults()","fDetTypeSim is 0!"); 
+     return;
+    }
+
+    fDetTypeSim->SetDefaults();
+    if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 
-    if(fDebug) printf("%s: SetDefaults\n",ClassName());
-
-    AliITSDetType *iDetType;
-
-    //SPD
-    iDetType=DetType(0); 
-    if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
-       AliITSsegmentationSPD *seg0=new AliITSsegmentationSPD(fITSgeom);
-       SetSegmentationModel(0,seg0); 
-    } // end if
-    if (!iDetType->GetResponseModel()) {
-       SetResponseModel(0,new AliITSresponseSPD()); 
-    } // end if
-    // set digit and raw cluster classes to be used
-
-    const char *kData0=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
-    if (strstr(kData0,"real")) {
-       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSPD");
-    } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSPD","AliITSRawClusterSPD");
-
-    // SDD
-    iDetType=DetType(1); 
-    if (!iDetType->GetResponseModel()) {
-       SetResponseModel(1,new AliITSresponseSDD("simulated")); 
-    } // end if
-    AliITSresponse *resp1=iDetType->GetResponseModel();
-    if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
-       AliITSsegmentationSDD *seg1=new AliITSsegmentationSDD(fITSgeom,resp1);
-       SetSegmentationModel(1,seg1); 
-    } // end if
-    const char *kData1=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
-    const char *kopt=iDetType->GetResponseModel()->ZeroSuppOption();
-    if((!strstr(kopt,"2D"))&&(!strstr(kopt,"1D")) || strstr(kData1,"real") ){
-       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSDD");
-    } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSDD","AliITSRawClusterSDD");
-
-    // SSD
-    iDetType=DetType(2); 
-    if (!iDetType->GetSegmentationModel()) {
-       AliITSsegmentationSSD *seg2=new AliITSsegmentationSSD(fITSgeom);
-       SetSegmentationModel(2,seg2); 
-    } // end if
-    if (!iDetType->GetResponseModel()) {
-       SetResponseModel(2,new AliITSresponseSSD("simulated"));
-    } // end if
-    const char *kData2=(iDetType->GetResponseModel())->DataType();
-    if (strstr(kData2,"real")) {
-       iDetType->ClassNames("AliITSdigit","AliITSRawClusterSSD");
-    } else iDetType->ClassNames("AliITSdigitSSD","AliITSRawClusterSSD");
-
-    if (kNTYPES>3) {
-       Warning("SetDefaults",
-               "Only the three basic detector types are initialized!");
-    }  // end if
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITS::SetDefaultSimulation(){
@@ -629,111 +317,19 @@ void AliITS::SetDefaultSimulation(){
     //      none.
     // Return:
     //      none.
+    if(!fDetTypeSim) { 
+     Error("SetDefaultSimulation()","fDetTypeSim is 0!"); 
+     return;
+    }
 
-    AliITSDetType *iDetType;
-    AliITSsimulation *sim;
-    iDetType=DetType(0);
-    sim = iDetType->GetSimulationModel();
-    if (!sim) {
-       AliITSsegmentation *seg0=
-           (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
-       AliITSresponse *res0 = (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel();
-       AliITSsimulationSPD *sim0=new AliITSsimulationSPD(seg0,res0);
-       SetSimulationModel(0,sim0);
-    }else{ // simulation exists, make sure it is set up properly.
-       ((AliITSsimulationSPD*)sim)->Init(
-           (AliITSsegmentationSPD*) iDetType->GetSegmentationModel(),
-           (AliITSresponseSPD*) iDetType->GetResponseModel());
-//     if(sim->GetResponseModel()==0) sim->SetResponseModel(
-//         (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel());
-//     if(sim->GetSegmentationModel()==0) sim->SetSegmentationModel(
-//         (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel());
-    } // end if
-    iDetType=DetType(1);
-    sim = iDetType->GetSimulationModel();
-    if (!sim) {
-       AliITSsegmentation *seg1=
-           (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
-       AliITSresponse *res1 = (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel();
-       AliITSsimulationSDD *sim1=new AliITSsimulationSDD(seg1,res1);
-       SetSimulationModel(1,sim1);
-    }else{ // simulation exists, make sure it is set up properly.
-       ((AliITSsimulationSDD*)sim)->Init(
-           (AliITSsegmentationSDD*) iDetType->GetSegmentationModel(),
-           (AliITSresponseSDD*) iDetType->GetResponseModel());
-//     if(sim->GetResponseModel()==0) sim->SetResponseModel(
-//         (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel());
-//     if(sim->GetSegmentationModel()==0) sim->SetSegmentationModel(
-//         (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel());
-    } //end if
-    iDetType=DetType(2);
-    sim = iDetType->GetSimulationModel();
-    if (!sim) {
-       AliITSsegmentation *seg2=
-           (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
-       AliITSresponse *res2 = (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel();
-       AliITSsimulationSSD *sim2=new AliITSsimulationSSD(seg2,res2);
-       SetSimulationModel(2,sim2);
-    }else{ // simulation exists, make sure it is set up properly.
-       ((AliITSsimulationSSD*)sim)->Init(
-           (AliITSsegmentationSSD*) iDetType->GetSegmentationModel(),
-           (AliITSresponseSSD*) iDetType->GetResponseModel());
-//     if(sim->GetResponseModel()==0) sim->SetResponseModel(
-//         (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel());
-//     if(sim->GetSegmentationModel()==0) sim->SetSegmentationModel(
-//         (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel());
-    } // end if
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::SetDefaultClusterFinders(){
-    // Sets the default cluster finders. Used in finding RecPoints.
-    // Inputs:
-    //      none.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
+    fDetTypeSim->SetDefaultSimulation();
+    if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 
-    MakeTreeC();
-    AliITSDetType *iDetType;
-
-    // SPD
-    iDetType=DetType(0);
-    if (!iDetType->GetReconstructionModel()) {
-       AliITSsegmentation *seg0 =
-           (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
-       TClonesArray *dig0=DigitsAddress(0);
-       TClonesArray *recp0=ClustersAddress(0);
-       AliITSClusterFinderSPD *rec0 = new AliITSClusterFinderSPD(seg0,dig0,
-                                                                 recp0);
-       SetReconstructionModel(0,rec0);
-    } // end if
-
-    // SDD
-    iDetType=DetType(1);
-    if (!iDetType->GetReconstructionModel()) {
-       AliITSsegmentation *seg1 =
-           (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
-       AliITSresponse *res1 = (AliITSresponse*)iDetType->GetResponseModel();
-       TClonesArray *dig1=DigitsAddress(1);
-       TClonesArray *recp1=ClustersAddress(1);
-       AliITSClusterFinderSDD *rec1 =
-           new AliITSClusterFinderSDD(seg1,res1,dig1,recp1);
-      SetReconstructionModel(1,rec1);
-    } // end if
-
-    // SSD
-    iDetType=DetType(2);
-    if (!iDetType->GetReconstructionModel()) {
-       AliITSsegmentation *seg2=
-           (AliITSsegmentation*)iDetType->GetSegmentationModel();
-       TClonesArray *dig2=DigitsAddress(2);
-       AliITSClusterFinderSSD *rec2= new AliITSClusterFinderSSD(seg2,dig2);
-       SetReconstructionModel(2,rec2);
-    } // end if
 }
+
+
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::MakeBranch(Option_t* option, const char *file){
+void AliITS::MakeBranch(Option_t* option){
     // Creates Tree branches for the ITS.
     // Inputs:
     //      Option_t *option    String of Tree types S,D, and/or R.
@@ -745,123 +341,119 @@ void AliITS::MakeBranch(Option_t* option, const char *file){
     //      none.
     // Return:
     //      none.
-    Bool_t cS = (strstr(option,"S")!=0);
-    Bool_t cD = (strstr(option,"D")!=0);
-    Bool_t cR = (strstr(option,"R")!=0);
-    Bool_t cRF = (strstr(option,"RF")!=0);
-    if(cRF)cR = kFALSE;
-
-    AliDetector::MakeBranch(option,file);
-
-    if(cS) MakeBranchS(file);
-    if(cD) MakeBranchD(file);
-    if(cR) MakeBranchR(file);
-    if(cRF) MakeBranchRF(file);
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::SetTreeAddress(){
-    // Set branch address for the Trees.
-    // Inputs:
-    //      none.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-    TTree *treeS = gAlice->TreeS();
-    TTree *treeD = gAlice->TreeD();
-    TTree *treeR = gAlice->TreeR();
+  if(!fDetTypeSim) {
+    Error("MakeBranch","fDetTypeSim is 0!");
+    return;
+  }
 
-    AliDetector::SetTreeAddress();
+  Bool_t cH = (strstr(option,"H")!=0);
+  Bool_t cS = (strstr(option,"S")!=0);
+  Bool_t cD = (strstr(option,"D")!=0);
+  
+  if(cH && (fHits == 0x0)) fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
+  AliDetector::MakeBranch(option);
+  
+  if(cS) MakeBranchS(0);
+  if(cD) MakeBranchD(0);
 
-    SetTreeAddressS(treeS);
-    SetTreeAddressD(treeD);
-    SetTreeAddressR(treeR);
-}
-//______________________________________________________________________
-AliITSDetType* AliITS::DetType(Int_t id){
-    // Return pointer to id detector type.
-    // Inputs:
-    //      Int_t id   detector id number.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      returned, a pointer to a AliITSDetType.
 
-    return ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id));
 }
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::SetResponseModel(Int_t id, AliITSresponse *response){
-    // Set the response model for the id detector type.
-    // Inputs:
-    //      Int_t id        detector id number.
-    //      AliITSresponse* a pointer containing an instance of AliITSresponse
-    //                      to be stored/owned b y AliITSDetType.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-
-    ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id))->ResponseModel(response);
+//___________________________________________________________________
+void AliITS::MakeBranchS(const char* fl){
+
+  // Creates Tree Branch for the ITS summable digits.
+  // Inputs:
+  //      cont char *fl  File name where SDigits branch is to be written
+  //                     to. If blank it write the SDigits to the same
+  //                     file in which the Hits were found.
+
+  
+  if(!fDetTypeSim){
+    Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
+  }
+  Int_t buffersize = 4000;
+  char branchname[31];
+
+  // only one branch for SDigits.
+  snprintf(branchname,30,"%s",GetName());
+
+  if(fLoader->TreeS()){
+    TClonesArray* sdig = (TClonesArray*)fDetTypeSim->GetSDigits();
+    MakeBranchInTree(fLoader->TreeS(),branchname,&sdig,buffersize,fl);
+  } 
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::SetSegmentationModel(Int_t id, AliITSsegmentation *seg){
-    // Set the segmentation model for the id detector type.
-    // Inputs:
-    //      Int_t id            detector id number.
-    //      AliITSsegmentation* a pointer containing an instance of 
-    //                          AliITSsegmentation to be stored/owned b y 
-    //                          AliITSDetType.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-
-    ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id))->SegmentationModel(seg);
+void AliITS::MakeBranchD(const char* file){
+
+  //Make branch for digits
+  if(!fDetTypeSim) {
+    Warning("MakeBranchD","fDetTypeSim is 0!");
+    return;
+  }
+  fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+  if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
+  MakeBranchInTreeD(fLoader->TreeD(),file);
 }
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::SetSimulationModel(Int_t id, AliITSsimulation *sim){
-    // Set the simulation model for the id detector type.
-    // Inputs:
-    //      Int_t id        detector id number.
-    //      AliITSresponse* a pointer containing an instance of AliITSresponse
-    //                      to be stored/owned b y AliITSDetType.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
 
-   ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id))->SimulationModel(sim);
+//___________________________________________________________________
+void AliITS:: MakeBranchInTreeD(TTree* treeD, const char* file){
+  // Creates Tree branches for the ITS.
+
+  if(!fDetTypeSim){
+    Error("MakeBranchS","fDetTypeSim is 0!");
+  }
+  fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+  if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
+
+  const Char_t *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
+  const Char_t* digclass;
+  Int_t buffersize = 4000;
+  Char_t branchname[31];
+  
+  if(!fDetTypeSim->GetDigits()){
+    fDetTypeSim->SetDigits(new TObjArray(fgkNTYPES));
+  }
+  for(Int_t i=0;i<fgkNTYPES;i++){
+    digclass = fDetTypeSim->GetDigitClassName(i);
+    TString classn = digclass;
+    if(!((fDetTypeSim->GetDigits())->At(i))){
+      (fDetTypeSim->GetDigits())->AddAt(new TClonesArray(classn.Data(),1000),i);
+    }
+    else ResetDigits(i);  
+    if(fgkNTYPES==3) snprintf(branchname,30,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
+    else sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
+    TObjArray* dig = DigitsAddress(i);
+    if(GetDigits() && treeD) AliDetector::MakeBranchInTree(treeD,branchname, &dig,buffersize,file);
+  }
 
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::SetReconstructionModel(Int_t id, AliITSClusterFinder *reconst){
-    // Set the cluster finder model for the id detector type.
+void AliITS::SetTreeAddress(){
+    // Set branch address for the Trees.
     // Inputs:
-    //      Int_t id             detector id number.
-    //      AliITSClusterFinder* a pointer containing an instance of 
-    //                           AliITSClusterFinder to be stored/owned b y 
-    //                           AliITSDetType.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
     //      none.
-
-    ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id))->ReconstructionModel(reconst);
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::SetClasses(Int_t id, const char *digit, const char *cluster){
-    // Set the digit and cluster classes name to be used for the id detector
-    // type.
-    // Inputs:
-    //      Int_t id            detector id number.
-    //      const char *digit   Digit class name for detector id.
-    //      const char *cluster Cluster class name for detector id.
     // Outputs:
     //      none.
     // Return:
     //      none.
-
-    ((AliITSDetType*) fDetTypes->At(id))->ClassNames(digit,cluster);
+    
+  if(!fDetTypeSim) {
+    Error("SetTreeAddress","fDetTypeSim is 0!");
+    return;
+  }
+
+  fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+  if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
+
+  TTree *treeS = fLoader->TreeS();
+  TTree *treeD = fLoader->TreeD();
+  if (fLoader->TreeH() && (fHits == 0x0)) {
+      fHits = new TClonesArray("AliITShit", 1560);
+  }
+  AliDetector::SetTreeAddress();
+
+  fDetTypeSim->SetTreeAddressS(treeS, (Char_t*)GetName());
+  fDetTypeSim->SetTreeAddressD(treeD, (Char_t*)GetName());
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
@@ -879,160 +471,54 @@ void AliITS::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits){
     //      none.
     // Return:
     //      none.
-
-    TClonesArray &lhits = *fHits;
-    new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
+  TClonesArray &lhits = *fHits;
+  new(lhits[fNhits++]) AliITShit(fIshunt,track,vol,hits);
 }
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
-    // Initialize the modules array.
-    // Inputs:
-    //      Int_t size  Size of array of the number of modules to be
-    //                  created. If size <=0 then the number of modules
-    //                  is gotten from AliITSgeom class kept in fITSgeom.
-    // Outputs:
-    //      Int_t &nmodules The number of modules existing.
-    // Return:
-    //      none.
 
-    if(fITSmodules){ 
-       fITSmodules->Delete();
-       delete fITSmodules;
-    } // end fir fITSmoudles
-
-    Int_t nl,indexMAX,index;
-
-    if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
-       if(fITSgeom==0) {
-           Error("InitModules","fITSgeom not defined");
-           return;
-       } // end if fITSgeom==0
-       nl = fITSgeom->GetNlayers();
-       indexMAX = fITSgeom->GetModuleIndex(nl,fITSgeom->GetNladders(nl),
-                                           fITSgeom->GetNdetectors(nl))+1;
-       nmodules = indexMAX;
-       fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
-       for(index=0;index<indexMAX;index++){
-           fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
-       } // end for index
-    }else{
-       fITSmodules = new TObjArray(size);
-       for(index=0;index<size;index++) {
-           fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
-       } // end for index
-
-        nmodules = size;
-    } // end i size<=0
-}
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::FillModules(Int_t evnt,Int_t bgrev,Int_t nmodules,
-                        Option_t *option,Text_t *filename){
-    // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from
-    // background if option=Add.
-    // Inputs:
-    //      Int_t evnt       Event to be processed.
-    //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
-    //      Int_t nmodules   Not used.
-    //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
-    //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
-    //                       background hits are considered.
-    //      Test_t *filename File name containing the background hits..
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-    static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
-//    static TClonesArray *fHits2;        //List of hits for one track only
-    static Bool_t first=kTRUE;
-    static TFile *file;
-    const char *addBgr = strstr(option,"Add");
-
-    if (addBgr ) {
-       if(first) {
-           file=new TFile(filename);
-//         fHits2     = new TClonesArray("AliITShit",1000  );
-       } // end if first
-       first=kFALSE;
-       file->cd();
-       file->ls();
-       // Get Hits Tree header from file
-//     if(fHits2) fHits2->Clear();
-       if(trH1) delete trH1;
-       trH1=0;
-
-       char treeName[20];
-       sprintf(treeName,"TreeH%d",bgrev);
-       trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
-       if (!trH1) {
-           Error("FillModules","cannot find Hits Tree for event:%d",bgrev);
-       } // end if !trH1
-       // Set branch addresses
-/*
-       TBranch *branch;
-       char branchname[20];
-       sprintf(branchname,"%s",GetName());
-       if (trH1 && fHits2) {
-           branch = trH1->GetBranch(branchname);
-           if (branch) branch->SetAddress(&fHits2);
-       } // end if trH1 && fHits
-*/
-    } // end if addBgr
-
-    FillModules(gAlice->TreeH(),0); // fill from this file's tree.
-/*
-    TClonesArray *itsHits = this->Hits();
-    Int_t lay,lad,det,index;
-    AliITShit *itsHit=0;
-    AliITSmodule *mod=0;
-    TTree *iTH = gAlice->TreeH();
-    Int_t ntracks =(Int_t) iTH->GetEntries();
-    Int_t t,h;
-    for(t=0; t<ntracks; t++){
-       gAlice->ResetHits();
-       iTH->GetEvent(t);
-       Int_t nhits = itsHits->GetEntriesFast();
-        if (!nhits) continue;
-       for(h=0; h<nhits; h++){
-           itsHit = (AliITShit *)itsHits->UncheckedAt(h);
-           itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
-           // temporarily index=det-1 !!!
-           if(fITSgeom) index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
-           else index=det-1;
-           //
-           mod = this->GetModule(index);
-           mod->AddHit(itsHit,t,h);
-       } // end loop over hits 
-    } // end loop over tracks
-*/
-    // open the file with background
+void AliITS::FillModules(Int_t /* evnt */,Int_t bgrev,Int_t /* nmodules */,
+                         Option_t *option, const char *filename){
+  // fill the modules with the sorted by module hits; add hits from
+  // background if option=Add.
+
+  static TTree *trH1;                 //Tree with background hits
+  static Bool_t first=kTRUE;
+  static TFile *file;
+  const char *addBgr = strstr(option,"Add");
+  
+  if (addBgr ) {
+    if(first) {
+      file=new TFile(filename);
+    } // end if first
+    first=kFALSE;
+    file->cd();
+    file->ls();
+    // Get Hits Tree header from file
+    if(trH1) delete trH1;
+    trH1=0;
     
-    if (addBgr ) {
-       FillModules(trH1,10000000); // Default mask 10M.
-/*
-       Int_t track,i;
-       ntracks =(Int_t)trH1->GetEntries();     
-       // Loop over tracks
-       for (track=0; track<ntracks; track++) {
-           if (fHits2)       fHits2->Clear();
-           trH1->GetEvent(track);
-           //   Loop over hits
-           for(i=0;i<fHits2->GetEntriesFast();++i) {
-               itsHit=(AliITShit*) (*fHits2)[i];
-               itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
-               // temporarily index=det-1 !!!
-               if(fITSgeom) index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
-               else index=det-1;
-               //
-               mod = this->GetModule(index);
-               mod->AddHit(itsHit,track,i);
-           }  // end loop over hits
-       } // end loop over tracks
-*/
-       TTree *fAli=gAlice->TreeK();
-       TFile *fileAli=0;
-       if (fAli) fileAli =fAli->GetCurrentFile();
-       fileAli->cd();
-    } // end if add
+    char treeName[21];
+    snprintf(treeName,20,"TreeH%d",bgrev);
+    trH1 = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
+    if (!trH1) {
+      Error("FillModules","cannot find Hits Tree for event:%d",bgrev);
+    } // end if !trH1
+    // Set branch addresses
+  } // end if addBgr
+  
+  FillModules(fLoader->TreeH(),0); // fill from this file's tree.
+    
+  if (addBgr ) {
+    FillModules(trH1,10000000); // Default mask 10M.
+    TTree *fAli=fLoader->GetRunLoader()->TreeK();
+    TFile *fileAli=0;
+    if (fAli) {
+      fileAli =fAli->GetCurrentFile();
+      fileAli->cd();
+    }
+  } // end if add
+  
+  
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITS::FillModules(TTree *treeH, Int_t mask) {
@@ -1048,267 +534,165 @@ void AliITS::FillModules(TTree *treeH, Int_t mask) {
     // Return:
     //      none.
 
+    if (treeH == 0x0)
+     {
+       AliError("Tree H  is NULL");
+       return;
+     }
     Int_t lay,lad,det,index;
     AliITShit *itsHit=0;
     AliITSmodule *mod=0;
-    char branchname[20];
-    sprintf(branchname,"%s",GetName());
+    char branchname[21];
+    snprintf(branchname,20,"%s",GetName());
     TBranch *branch = treeH->GetBranch(branchname);
     if (!branch) {
-       Error("FillModules","%s branch in TreeH not found",branchname);
-       return;
+        Error("FillModules","%s branch in TreeH not found",branchname);
+        return;
     } // end if !branch
     branch->SetAddress(&fHits);
     Int_t nTracks =(Int_t) treeH->GetEntries();
     Int_t iPrimTrack,h;
     for(iPrimTrack=0; iPrimTrack<nTracks; iPrimTrack++){
-       ResetHits();
-       Int_t nBytes = treeH->GetEvent(iPrimTrack);
-       if (nBytes <= 0) continue;
-       Int_t nHits = fHits->GetEntriesFast();
-       for(h=0; h<nHits; h++){
-           itsHit = (AliITShit *)fHits->UncheckedAt(h);
-           itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
-           if (fITSgeom) {
-               index = fITSgeom->GetModuleIndex(lay,lad,det);
-           } else {
-               index=det-1; // This should not be used.
-           } // end if [You must have fITSgeom for this to work!]
-           mod = GetModule(index);
-           itsHit->SetTrack(itsHit->GetTrack()+mask); // Set track mask.
-           mod->AddHit(itsHit,iPrimTrack,h);
-       } // end loop over hits 
+        ResetHits();
+        Int_t nBytes = treeH->GetEvent(iPrimTrack);
+        if (nBytes <= 0) continue;
+        Int_t nHits = fHits->GetEntriesFast();
+        for(h=0; h<nHits; h++){
+            itsHit = (AliITShit *)fHits->UncheckedAt(h);
+            itsHit->GetDetectorID(lay,lad,det);
+            if (GetITSgeom()) {
+                index = GetITSgeom()->GetModuleIndex(lay,lad,det);
+            } else {
+                index=det-1; // This should not be used.
+            } // end if [You must have fITSgeom for this to work!]
+            mod = GetModule(index);
+            itsHit->SetTrack(itsHit->GetTrack()+mask); // Set track mask.
+            mod->AddHit(itsHit,iPrimTrack,h);
+        } // end loop over hits 
     } // end loop over tracks
 }
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::ClearModules(){
-    // Clear the modules TObjArray.
-    // Inputs:
-    //      none.
-    // Outputs:
-    //      none.
 
-    if(fITSmodules) fITSmodules->Delete();
-}
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::MakeBranchS(const char *fl){
-    // Creates Tree Branch for the ITS summable digits.
-    // Inputs:
-    //      cont char *fl  File name where SDigits branch is to be written
-    //                     to. If blank it write the SDigits to the same
-    //                     file in which the Hits were found.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-    Int_t buffersize = 4000;
-    char branchname[30];
-
-    // only one branch for SDigits.
-    sprintf(branchname,"%s",GetName());
-    if(fSDigits && gAlice->TreeS()){
-       MakeBranchInTree(gAlice->TreeS(),branchname,&fSDigits,buffersize,fl);
-    } // end if
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::SetTreeAddressS(TTree *treeS){
-    // Set branch address for the ITS summable digits Trees.
+Bool_t AliITS::InitModules(Int_t size,Int_t &nmodules){
+    // Initialize the modules array.
     // Inputs:
-    //      TTree *treeS   Tree containing the SDigits.
+    //      Int_t size  Size of array of the number of modules to be
+    //                  created. If size <=0 then the number of modules
+    //                  is gotten from AliITSgeom class kept in fITSgeom.
     // Outputs:
-    //      none.
+    //      Int_t &nmodules The number of modules existing.
     // Return:
     //      none.
-    char branchname[30];
 
-    if(!treeS) return;
-    TBranch *branch;
-    sprintf(branchname,"%s",GetName());
-    branch = treeS->GetBranch(branchname);
-    if (branch) branch->SetAddress(&fSDigits);
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::MakeBranchInTreeD(TTree *treeD,const char *file){
-    // Creates Tree branches for the ITS.
-    // Inputs:
-    //      TTree     *treeD Pointer to the Digits Tree.
-    //      cont char *file  File name where Digits branch is to be written
-    //                       to. If blank it write the SDigits to the same
-    //                       file in which the Hits were found.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-    Int_t buffersize = 4000;
-    char branchname[30];
-
-    sprintf(branchname,"%s",GetName());
-    // one branch for digits per type of detector
-    const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
-    char digclass[40];
-    char clclass[40];
-    Int_t i;
-    for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
-       DetType(i)->GetClassNames(digclass,clclass);
-       // digits
-       if(!(fDtype->At(i))) fDtype->AddAt(new TClonesArray(digclass,1000),i);
-       else ResetDigits(i);
-    } // end for i
-    for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
-       if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
-       else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);      
-       if (fDtype && treeD) {
-           MakeBranchInTree(treeD, 
-                            branchname, &((*fDtype)[i]),buffersize,file);
-       } // end if
-    } // end for i
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::SetTreeAddressD(TTree *treeD){
-    // Set branch address for the Trees.
-    // Inputs:
-    //      TTree *treeD   Tree containing the Digits.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-    char branchname[30];
-    const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
-    TBranch *branch;
-    char digclass[40];
-    char clclass[40];
-    Int_t i;
+    if(fITSmodules){ 
+        fITSmodules->Delete();
+        delete fITSmodules;
+    } // end fir fITSmoudles
 
-    if(!treeD) return;
-    for (i=0; i<kNTYPES; i++) {
-       DetType(i)->GetClassNames(digclass,clclass);
-       // digits
-       if(!(fDtype->At(i))) fDtype->AddAt(new TClonesArray(digclass,1000),i);
-       else ResetDigits(i);
-       if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sDigits%s",GetName(),det[i]);
-       else  sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
-       if (fDtype) {
-           branch = treeD->GetBranch(branchname);
-           if (branch) branch->SetAddress(&((*fDtype)[i]));
-       } // end if fDtype
-    } // end for i
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::Hits2SDigits(){
-    // Standard Hits to summable Digits function.
-    // Inputs:
-    //      none.
-    // Outputs:
-    //      none.
+    if(!fDetTypeSim) {
+      Error("InitModules","fDetTypeSim is null!");
+      return kFALSE;
+    }
+    if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
 
-//    return; // Using Hits in place of the larger sDigits.
-    AliHeader *header=gAlice->GetHeader(); // Get event number from this file.
-    // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
-    // Event number from file, no background hit merging , use size from
-    // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
-    HitsToSDigits(header->GetEvent(),0,-1," ",fOpt," ");
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::Hits2PreDigits(){
-    // Standard Hits to summable Digits function.
-    // Inputs:
-    //      none.
-    // Outputs:
-    //      none.
+    Int_t nl,indexMAX,index;
 
-    AliHeader *header=gAlice->GetHeader(); // Get event number from this file.
-    // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
-    // Event number from file, no background hit merging , use size from
-    // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
-    HitsToPreDigits(header->GetEvent(),0,-1," ",fOpt," ");
+    if(size<=0){ // default to using data stored in AliITSgeom
+        if(fDetTypeSim->GetITSgeom()==0) {
+            Error("InitModules","fITSgeom not defined");
+            return kFALSE;
+        } // end if fITSgeom==0
+        nl = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetNlayers();
+        indexMAX = fDetTypeSim->GetITSgeom()->GetIndexMax();
+        nmodules = indexMAX;
+        fITSmodules = new TObjArray(indexMAX);
+        for(index=0;index<indexMAX;index++){
+            fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
+        } // end for index
+    }else{
+        fITSmodules = new TObjArray(size);
+        for(index=0;index<size;index++) {
+            fITSmodules->AddAt( new AliITSmodule(index),index);
+        } // end for index
+
+        nmodules = size;
+    } // end i size<=0
+    return kTRUE;
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::SDigitsToDigits(Option_t *opt){
-    // Standard Summable digits to Digits function.
+void AliITS::Hits2SDigits(){
+    // Standard Hits to summable Digits function.
     // Inputs:
     //      none.
     // Outputs:
     //      none.
-    char name[20] = {0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0};
-
-    if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
-    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
-
-    const char *all = strstr(opt,"All");
-    const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
-                         strstr(opt,"SSD")};
-    if( !det[0] && !det[1] && !det[2] ) all = "All";
-    else all = 0;
-    static Bool_t setDef=kTRUE;
-    if (setDef) SetDefaultSimulation();
-    setDef=kFALSE;
-
-    AliITSsimulation *sim      = 0;
-    AliITSDetType    *iDetType = 0;
-    TTree            *trees    = gAlice->TreeS();
-    if( !(trees && this->GetSDigits()) ){
-       Error("SDigits2Digits","Error: No trees or SDigits. Returning.");
-       return;
-    } // end if
-    sprintf( name, "%s", this->GetName() );
-    TBranch *brchSDigits = trees->GetBranch( name );
-    
-    Int_t id,module;
-    for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
-       id       = geom->GetModuleType(module);
-        if (!all && !det[id]) continue;
-       iDetType = DetType(id);
-       sim      = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
-       if (!sim) {
-           Error("SDigit2Digits",
-                 "The simulation class was not instanciated!");
-           exit(1);
-       } // end if !sim
-       sim->InitSimulationModule(module,gAlice->GetEvNumber());
-//
-       // add summable digits to module
-       this->GetSDigits()->Clear();
-       brchSDigits->GetEvent(module);
-       sim->AddSDigitsToModule(GetSDigits(),0);
-//
-        // Digitise current module sum(SDigits)->Digits
-        sim->FinishSDigitiseModule();
-
-        // fills all branches - wasted disk space
-        gAlice->TreeD()->Fill();
-        this->ResetDigits();
-    } // end for module
-
-    gAlice->TreeD()->GetEntries();
-
-    gAlice->TreeD()->AutoSave();
-    // reset tree
-    gAlice->TreeD()->Reset();
+  
+
+   if(!fDetTypeSim) {
+     Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is null!");
+     return; 
+  } 
+     
+  SetDefaults();
+  fLoader->LoadHits("read");
+  fLoader->LoadSDigits("recreate");
+  AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader(); 
+  fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+  if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
+
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
+        // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
+        // Event number from file, no background hit merging , use size from
+        // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
+    rl->GetEvent(iEvent);
+    if (!fLoader->TreeS()) fLoader->MakeTree("S");
+    MakeBranch("S");
+    SetTreeAddress();
+    HitsToPreDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
+  } // end for iEvent
     
+  fLoader->UnloadHits();
+  fLoader->UnloadSDigits();
+  
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITS::Hits2Digits(){
-    // Standard Hits to Digits function.
-    // Inputs:
-    //      none.
-    // Outputs:
-    //      none.
 
-    AliHeader *header=gAlice->GetHeader(); // Get event number from this file.
-    // Do the Hits to Digits operation. Use Standard input values.
-    // Event number from file, no background hit merging , use size from
-    // AliITSgeom class, option="All", input from this file only.
-    HitsToDigits(header->GetEvent(),0,-1," ",fOpt," ");
+  //Conversion from hits to digits
+  if(!fDetTypeSim) {
+    Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
+    return;
+  }
+   
+  fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+  if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
+  SetDefaults();
+
+  fLoader->LoadHits("read");
+  fLoader->LoadDigits("recreate");
+  AliRunLoader* rl = fLoader->GetRunLoader(); 
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < rl->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
+    rl->GetEvent(iEvent);
+    if (!fLoader->TreeD()) fLoader->MakeTree("D");
+    MakeBranch("D");
+    SetTreeAddress();   
+    HitsToDigits(iEvent,0,-1," ",fOpt," ");
+  } 
+  
+  fLoader->UnloadHits();
+  fLoader->UnloadDigits();
+  
 }
+
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::HitsToSDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
-                         Option_t *option, Option_t *opt,Text_t *filename){
-    // keep galice.root for signal and name differently the file for 
+void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
+                          Option_t *option,Option_t *opt,
+                          const char *filename){
+    //   Keep galice.root for signal and name differently the file for 
     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
     // the condition below will disappear when the geom class will be
     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
-    // 7 is the SDD beam test version. Dummy routine. Hits are ITS's Summable
-    // Digits.
+    // 7 is the SDD beam test version.
     // Inputs:
     //      Int_t evnt       Event to be processed.
     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
@@ -1321,13 +705,83 @@ void AliITS::HitsToSDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
     //      none.
     // Return:
     //      none.
-//    return; // using Hits instead of the larger sdigits.
 
-    HitsToPreDigits(evNumber,bgrev,size,option,opt,filename);
+  if(!fDetTypeSim) {
+    Error("HitsToDigits","fDetTypeSim is null!");
+    return;
+  }
+  fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+  if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
+  if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
+  AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
+
+  const char *all = strstr(opt,"All");
+  const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
+                       strstr(opt,"SSD")};
+  static Bool_t setDef=kTRUE;
+  if (setDef) SetDefaultSimulation();
+  setDef=kFALSE;
+  
+  Int_t nmodules;
+  InitModules(size,nmodules);
+  FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
+  // Reset Fast-OR signals for this event
+  fDetTypeSim->ResetFOSignals();
+
+  AliITSsimulation *sim      = 0;
+  AliITSmodule     *mod      = 0;
+  Int_t id;
+  for(Int_t module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
+    id       = geom->GetModuleType(module);
+    if (!all && !det[id]) continue;
+    sim      = (AliITSsimulation*)fDetTypeSim->GetSimulationModel(id);
+    if (!sim) {
+      Error("HitsToDigits","The simulation class was not "
+           "instanciated for module %d type %s!",module,
+           geom->GetModuleTypeName(module));
+      exit(1);
+    } // end if !sim
+    mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
+    sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
+    // fills all branches - wasted disk space
+    fLoader->TreeD()->Fill(); 
+    ResetDigits();
+  } // end for module
+  
+  ClearModules();
+  // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
+  if (all || det[0]) { // SPD present
+    WriteFOSignals();
+  }
+  
+  fLoader->TreeD()->GetEntries();
+  fLoader->TreeD()->AutoSave();
+  // reset tree
+  fLoader->TreeD()->Reset();
+}
+//_____________________________________________________________________
+void AliITS::Hits2PreDigits(){ 
+  // Turn hits into SDigits
+
+  if(!fDetTypeSim) {
+    Error("Hits2SDigits","fDetTypeSim is 0!");
+    return;
+  }
+   
+  fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+  if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
+  SetDefaults();
+  
+  HitsToPreDigits(fLoader->GetRunLoader()->GetEventNumber(),
+                 0,-1," ",fOpt," ");
 }
+
 //______________________________________________________________________
 void AliITS::HitsToPreDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
-                         Option_t *option, Option_t *opt,Text_t *filename){
+                             Option_t *option,Option_t *opt,
+                             const char *filename){
     //   Keep galice.root for signal and name differently the file for 
     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
     // the condition below will disappear when the geom class will be
@@ -1346,122 +800,231 @@ void AliITS::HitsToPreDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
     // Return:
     //      none.
 
-    if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
-    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
-
-    const char *all = strstr(opt,"All");
-    const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
-                         strstr(opt,"SSD")};
-    static Bool_t setDef=kTRUE;
-    if (setDef) SetDefaultSimulation();
-    setDef=kFALSE;
-
-    Int_t nmodules;
-    InitModules(size,nmodules);
-    FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
-
-    AliITSsimulation *sim      = 0;
-    AliITSDetType    *iDetType = 0;
-    AliITSmodule     *mod      = 0;
-    Int_t id,module;
-    for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
-       id       = geom->GetModuleType(module);
-        if (!all && !det[id]) continue;
-       iDetType = DetType(id);
-       sim      = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
-       if (!sim) {
-           Error("HitsToSDigits",
-                 "The simulation class was not instanciated!");
-           exit(1);
-       } // end if !sim
-       mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
-       sim->SDigitiseModule(mod,module,evNumber);
-       // fills all branches - wasted disk space
-       gAlice->TreeS()->Fill(); 
-       ResetSDigits();
-    } // end for module
-
-    ClearModules();
-
-    gAlice->TreeS()->GetEntries();
-    gAlice->TreeS()->AutoSave();
-    // reset tree
-    gAlice->TreeS()->Reset();
+  if(!fDetTypeSim) {
+    Error("HitsToPreDigits","fDetTypeSim is null!");
+    return;
+  }
+  fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+  if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
+
+  if(!GetITSgeom()){
+    Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
+    return; // need transformations to do digitization.
+  }
+  AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
+
+  const char *all = strstr(opt,"All");
+  const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
+                       strstr(opt,"SSD")};
+  static Bool_t setDef=kTRUE;
+  if (setDef) SetDefaultSimulation();
+  setDef=kFALSE;
+  
+  Int_t nmodules;
+  InitModules(size,nmodules);
+  FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
+  
+
+  AliITSsimulation *sim      = 0;
+  AliITSmodule     *mod      = 0;
+  Int_t id,module;
+  for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
+    id       = geom->GetModuleType(module);
+    if (!all && !det[id]) continue;
+    sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
+    if (!sim) {
+      Error("HitsToPreDigits","The simulation class was not "
+           "instanciated for module %d type %s!",module,
+           geom->GetModuleTypeName(module));
+      exit(1);
+    } // end if !sim
+    mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
+    sim->SDigitiseModule(mod,module,evNumber);
+    // fills all branches - wasted disk space
+    fLoader->TreeS()->Fill(); 
+    fDetTypeSim->ResetSDigits();
+  } // end for module
+
+  ClearModules();
+
+  
+  fLoader->TreeS()->GetEntries();
+  fLoader->TreeS()->AutoSave();
+  fLoader->WriteSDigits("OVERWRITE");
+  // reset tree
+  fLoader->TreeS()->Reset();
 }
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::HitsToDigits(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
-                         Option_t *option, Option_t *opt,Text_t *filename){
-    //   Keep galice.root for signal and name differently the file for 
+
+//_____________________________________________________________________
+void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
+                                  Option_t *opt0,Option_t *opt1,
+                                 const char *flnm){
+    // keep galice.root for signal and name differently the file for 
     // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
     // the condition below will disappear when the geom class will be
     // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
-    // 7 is the SDD beam test version.
     // Inputs:
     //      Int_t evnt       Event to be processed.
     //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
-    //      Int_t nmodules   Not used.
-    //      Option_t *option String indicating if merging hits or not. To
+    //      Int_t size       Size used by InitModules. See InitModules.
+    //      Option_t *opt0   Option passed to FillModules. See FillModules.
+    //      Option_t *opt1   String indicating if merging hits or not. To
     //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
     //                       background hits are considered.
-    //      Test_t *filename File name containing the background hits..
+    //      Test_t *flnm     File name containing the background hits..
     // Outputs:
     //      none.
     // Return:
     //      none.
 
-    if(!GetITSgeom()) return; // need transformations to do digitization.
-    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
-
-    const char *all = strstr(opt,"All");
-    const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
-                         strstr(opt,"SSD")};
-    static Bool_t setDef=kTRUE;
-    if (setDef) SetDefaultSimulation();
-    setDef=kFALSE;
-
-    Int_t nmodules;
-    InitModules(size,nmodules);
-    FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,option,filename);
-
-    AliITSsimulation *sim      = 0;
-    AliITSDetType    *iDetType = 0;
-    AliITSmodule     *mod      = 0;
-    Int_t id,module;
-    for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
-       id       = geom->GetModuleType(module);
-        if (!all && !det[id]) continue;
-       iDetType = DetType(id);
-       sim      = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
-       if (!sim) {
-           Error("HitsToDigits",
-                 "The simulation class was not instanciated!");
-           exit(1);
-       } // end if !sim
-       mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
-       sim->DigitiseModule(mod,module,evNumber);
-       // fills all branches - wasted disk space
-       gAlice->TreeD()->Fill(); 
-       ResetDigits();
-    } // end for module
-
-    ClearModules();
-
-    gAlice->TreeD()->GetEntries();
-    gAlice->TreeD()->AutoSave();
-    // reset tree
-    gAlice->TreeD()->Reset();
+
+
+  if(!GetITSgeom()){
+    Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
+    return; // need transformations to do digitization.
+  }
+  AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
+
+  AliITSLoader *pITSloader = (AliITSLoader*)fLoader;
+
+  const char *all = strstr(opt1,"All");
+  const char *det[3] ={strstr(opt1,"SPD"),strstr(opt1,"SDD"),
+                      strstr(opt1,"SSD")};
+  Int_t nmodules;
+  InitModules(size,nmodules);
+  FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,opt0,flnm);
+
+  AliITSsimulation *sim      = 0;
+  AliITSmodule     *mod      = 0;
+  Int_t id,module;
+
+  TTree *lTR = pITSloader->TreeR();
+  if(!lTR) {
+    pITSloader->MakeTree("R");
+    lTR = pITSloader->TreeR();
+  }
+  
+  TClonesArray* ptarray = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
+  TBranch* branch = (TBranch*)lTR->Branch("ITSRecPointsF",&ptarray);
+  branch->SetAddress(&ptarray);
+  //m.b. : this change is nothing but a nice way to make sure
+  //the CPU goes up !    
+  for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
+    id       = geom->GetModuleType(module);
+    if (!all && !det[id]) continue;
+    sim      = (AliITSsimulation*)GetSimulationModel(id);
+    if (!sim) {
+      Error("HitsToFastPoints","The simulation class was not "
+           "instantiated for module %d type %s!",module,
+           geom->GetModuleTypeName(module));
+      exit(1);
+    } // end if !sim
+    mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
+    sim->CreateFastRecPoints(mod,module,gRandom,ptarray);
+    lTR->Fill();
+    ptarray->Clear();
+  } // end for module
+
+  ClearModules();
+  fLoader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
+  delete ptarray;
+}
+//_____________________________________________________________________
+Int_t AliITS::Hits2Clusters(TTree *hTree, TTree *cTree) {
+  //------------------------------------------------------------
+  // This function creates ITS clusters
+  //------------------------------------------------------------
+  if(!GetITSgeom()){
+    Error("HitsToPreDigits","fGeom is null!");
+    return 1; // need transformations to do digitization.
+  }
+  AliITSgeom *geom=GetITSgeom();
+  Int_t mmax=geom->GetIndexMax();
+
+  InitModules(-1,mmax);
+  FillModules(hTree,0);
+
+  TClonesArray *points = new TClonesArray("AliITSRecPoint",1000);
+  TBranch *branch=cTree->GetBranch("ITSRecPoints");
+  if (!branch) cTree->Branch("ITSRecPoints",&points);
+  else branch->SetAddress(&points);
+
+  AliITSsimulationFastPoints sim;
+  Int_t ncl=0;
+  for (Int_t m=0; m<mmax; m++) {
+    AliITSmodule *mod=GetModule(m);      
+    sim.CreateFastRecPoints(mod,m,gRandom,points);      
+    ncl+=points->GetEntriesFast();
+    cTree->Fill();
+    points->Clear();
+  }
+
+  AliDebug(1,Form("Number of found fast clusters : %d",ncl));
+
+  //cTree->Write();
+
+  delete points;
+  return 0;
 }
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::ResetSDigits(){
-    // Reset the Summable Digits array.
-    // Inputs:
-    //      none.
-    // Outputs:
-    //      none.
 
-    if (fSDigits) fSDigits->Clear();
-    fNSDigits = 0;
+//_____________________________________________________________________
+void AliITS::CheckLabels(Int_t lab[3]) const {
+  //------------------------------------------------------------
+  // Tries to find mother's labels
+  //------------------------------------------------------------
+
+  if(lab[0]<0 && lab[1]<0 && lab[2]<0) return; // In case of no labels just exit
+
+  Int_t ntracks = gAlice->GetMCApp()->GetNtrack();
+  for (Int_t i=0;i<3;i++){
+    Int_t label = lab[i];
+    if (label>=0 && label<ntracks) {
+      TParticle *part=(TParticle*)gAlice->GetMCApp()->Particle(label);
+      if (part->P() < 0.005) {
+       Int_t m=part->GetFirstMother();
+       if (m<0) {      
+         continue;
+       }
+       if (part->GetStatusCode()>0) {
+         continue;
+       }
+       lab[i]=m;       
+      }
+    }    
+  }
+  
 }
+
+//______________________________________________________________________
+void AliITS::SDigitsToDigits(Option_t *opt){
+  // Standard Summable digits to Digits function.
+  // Inputs:
+  //      none.
+  // Outputs:
+  //      none.
+  if (!fDetTypeSim) {
+    AliError("fDetTypeSim is 0!");
+    return;
+  }
+  const char *all = strstr(opt,"All");
+  const char *det[3] ={strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
+                      strstr(opt,"SSD")};
+
+  // Reset Fast-OR signals for this event
+  fDetTypeSim->ResetFOSignals();
+
+  fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+  SetDefaults();
+  if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
+  fDetTypeSim->SDigitsToDigits(opt,(Char_t*)GetName());
+
+  // Add Fast-OR signals to event (only one object per event)
+  if (all || det[0]) { // SPD present
+   WriteFOSignals();
+  }
+}
+
 //______________________________________________________________________
 void AliITS::ResetDigits(){
     // Reset number of digits and the digits array for the ITS detector.
@@ -1469,25 +1032,30 @@ void AliITS::ResetDigits(){
     //      none.
     // Outputs:
     //      none.
+    if(!fDetTypeSim) {
+      Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
+      return;
+    }
+   
+    fDetTypeSim->ResetDigits();
 
-    if (!fDtype) return;
 
-    Int_t i;
-    for (i=0;i<kNTYPES;i++ ) {
-       if (fDtype->At(i))    ((TClonesArray*)fDtype->At(i))->Clear();
-       if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
-    } // end for i
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::ResetDigits(Int_t i){
+void AliITS::ResetDigits(Int_t branch){
     // Reset number of digits and the digits array for this branch.
     // Inputs:
     //      none.
     // Outputs:
     //      none.
 
-    if (fDtype->At(i))    ((TClonesArray*)fDtype->At(i))->Clear();
-    if (fNdtype)  fNdtype[i]=0;
+    if(!fDetTypeSim) {
+      Error("ResetDigits","fDetTypeSim is 0!");
+      return;
+    }
+   
+    fDetTypeSim->ResetDigits(branch);
+
 }
 //______________________________________________________________________
 void AliITS::AddSumDigit(AliITSpListItem &sdig){
@@ -1499,26 +1067,15 @@ void AliITS::AddSumDigit(AliITSpListItem &sdig){
     // Return:
     //      none.
 
-    TClonesArray &lsdig = *fSDigits;
-    new(lsdig[fNSDigits++]) AliITSpListItem(sdig);
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::AddRealDigit(Int_t id, Int_t *digits){
-    //   Add a real digit - as coming from data.
-    // Inputs:
-    //      Int_t id        Detector type number.
-    //      Int_t *digits   Integer array containing the digits info. See 
-    //                      AliITSdigit.h
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-
-    TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)fDtype->At(id));
-    new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigit(digits);
+    if(!fDetTypeSim) {
+      Error("AddSumDigit","fDetTypeSim is 0!");
+      return;
+    }
+    fDetTypeSim->AddSumDigit(sdig);
+    
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::AddSimDigit(Int_t id, AliITSdigit *d){
+void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch, AliITSdigit *d){
     //    Add a simulated digit.
     // Inputs:
     //      Int_t id        Detector type number.
@@ -1529,418 +1086,334 @@ void AliITS::AddSimDigit(Int_t id, AliITSdigit *d){
     // Return:
     //      none.
 
-    TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)fDtype->At(id));
-
-    switch(id){
-    case 0:
-       new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(*((AliITSdigitSPD*)d));
-       break;
-    case 1:
-       new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(*((AliITSdigitSDD*)d));
-       break;
-    case 2:
-       new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(*((AliITSdigitSSD*)d));
-       break;
-    } // end switch id
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::AddSimDigit(Int_t id,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,
-                        Int_t *hits,Float_t *charges){
-    //   Add a simulated digit to the list.
-    // Inputs:
-    //      Int_t id        Detector type number.
-    //      Float_t phys    Physics indicator. See AliITSdigits.h
-    //      Int_t *digits   Integer array containing the digits info. See 
-    //                      AliITSdigit.h
-    //      Int_t *tracks   Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()] 
-    //                      containing the track numbers that contributed to
-    //                      this digit.
-    //      Int_t *hits     Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
-    //                      containing the hit numbers, from AliITSmodule, that
-    //                      contributed to this digit.
-    //      Float_t *charge Floating point array of the signals contributed
-    //                      to this digit by each track.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-
-    TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)fDtype->At(id));
-    switch(id){
-    case 0:
-       new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSPD(digits,tracks,hits);
-       break;
-    case 1:
-       new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSDD(phys,digits,tracks,
-                                                  hits,charges);
-       break;
-    case 2:
-       new(ldigits[fNdtype[id]++]) AliITSdigitSSD(digits,tracks,hits);
-       break;
-    } // end switch id
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::MakeTreeC(Option_t *option){
-    //   Create a separate tree to store the clusters.
-    // Inputs:
-    //      Option_t *option  string which must contain "C" otherwise
-    //                        no Cluster Tree is created.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-  TDirectory *cwd = gDirectory;
-  TFile *fileRecPoints = gAlice->GetTreeRFile();
-  if(fileRecPoints)fileRecPoints->cd();
-    const char *optC = strstr(option,"C");
-    char hname[30];
-    Int_t cureve = gAlice->GetEvNumber();
-    sprintf(hname,"TreeC%d",cureve);
-    if(fTreeC){
-      const char *curname = fTreeC->GetName();
-      char *exists = strstr(hname,curname);
-      if(!exists){
-        delete fTreeC; 
-        fTreeC=0;
-      }
-    }
-    if (optC && !fTreeC) fTreeC = new TTree(hname,"Clusters in ITS");
-    else return;
-
-    Int_t buffersize = 4000;
-    char branchname[30];
-    const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
-    char digclass[40];
-    char clclass[40];
-
-    // one branch for Clusters per type of detector
-    Int_t i;   
-    for (i=0; i<kNTYPES ;i++) {
-        AliITSDetType *iDetType=DetType(i); 
-        iDetType->GetClassNames(digclass,clclass);
-       // clusters
-        if(!ClustersAddress(i)){
-          fCtype->AddAt(new TClonesArray(clclass,1000),i);
-        }
-        if (kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
-       else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
-       if (fCtype   && fTreeC) {
-           TreeC()->Branch(branchname,&((*fCtype)[i]), buffersize);
-       } // end if fCtype && fTreeC
-    } // end for i
-    cwd->cd();
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::GetTreeC(Int_t event){
-    //    Get the clusters tree for this event and set the branch address.
-    // Inputs:
-    //      Int_t event    Event number for the cluster tree.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-    char treeName[20];
-    char branchname[30];
-    const char *det[3] = {"SPD","SDD","SSD"};
-
-    ResetClusters();
-    if (fTreeC) {
-       delete fTreeC;
-    } // end if fTreeC
-
-    sprintf(treeName,"TreeC%d",event);
-    TFile *fileRecPoints = gAlice->GetTreeRFile();
-    if(!fileRecPoints){
-      fTreeC = (TTree*)gDirectory->Get(treeName);
-    }
-    else {
-      fTreeC = (TTree*)fileRecPoints->Get(treeName);
+    if(!fDetTypeSim) {
+      Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
+      return;
     }
+    fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,d);
 
-    TBranch *branch;
-
-    if (fTreeC) {
-        Int_t i;
-       char digclass[40];
-       char clclass[40];
-       for (i=0; i<kNTYPES; i++) {
-           AliITSDetType *iDetType=DetType(i); 
-           iDetType->GetClassNames(digclass,clclass);
-           // clusters
-           if(!fCtype->At(i)) fCtype->AddAt(new TClonesArray(clclass,1000),i);
-           if(kNTYPES==3) sprintf(branchname,"%sClusters%s",GetName(),det[i]);
-           else  sprintf(branchname,"%sClusters%d",GetName(),i+1);
-           if (fCtype) {
-               branch = fTreeC->GetBranch(branchname);
-                if (branch) branch->SetAddress(&((*fCtype)[i]));
-           } // end if fCtype
-       } // end for i
-    } else {
-       Error("GetTreeC","cannot find Clusters Tree for event:%d",event);
-    } // end if fTreeC
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::AddCluster(Int_t id, AliITSRawCluster *c){
-    //   Add a cluster to the list.
-    // Inputs:
-    //      Int_t id             Detector type number.
-    //      AliITSRawCluster *c  Cluster class to be added to the tree of
-    //                           clusters.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
+void AliITS::AddSimDigit(Int_t branch,Float_t phys,Int_t *digits,Int_t *tracks,
+                         Int_t *hits,Float_t *charges, Int_t sigexpanded){
+  //   Add a simulated digit to the list.
+  // Inputs:
+  //      Int_t id        Detector type number.
+  //      Float_t phys    Physics indicator. See AliITSdigits.h
+  //      Int_t *digits   Integer array containing the digits info. See 
+  //                      AliITSdigit.h
+  //      Int_t *tracks   Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()] 
+  //                      containing the track numbers that contributed to
+  //                      this digit.
+  //      Int_t *hits     Integer array [AliITSdigitS?D::GetNTracks()]
+  //                      containing the hit numbers, from AliITSmodule, that
+  //                      contributed to this digit.
+  //      Float_t *charge Floating point array of the signals contributed
+  //                      to this digit by each track.
+  // Outputs:
+  //      none.
+  // Return:
+  //      none.
+
+    if(!fDetTypeSim) {
+      Error("AddSimDigit","fDetTypeSim is 0!");
+      return;
+    }
+    fDetTypeSim->AddSimDigit(branch,phys,digits,tracks,hits,charges,sigexpanded);
 
-    TClonesArray &lc = *((TClonesArray*)fCtype->At(id));
-
-    switch(id){
-    case 0:
-       new(lc[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSPD(*((AliITSRawClusterSPD*)c));
-       break;
-    case 1:
-       new(lc[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSDD(*((AliITSRawClusterSDD*)c));
-       break;
-    case 2:
-       new(lc[fNctype[id]++]) AliITSRawClusterSSD(*((AliITSRawClusterSSD*)c));
-       break;
-    } // end switch id
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::ResetClusters(){
-    // Reset number of clusters and the clusters array for ITS.
-    // Inputs:
-    //      none.
-    // Outputs:
-    //      none.
+void AliITS::Digits2Raw(){
+    // convert digits of the current event to raw data
+
+  if(!fDetTypeSim) {
+    Error("Digits2Raw","fDetTypeSim is 0!");
+    return;
+  }
+  fDetTypeSim->SetLoader((AliITSLoader*)fLoader);
+  SetDefaults();
+  if(fSimuParam) fDetTypeSim->SetSimuParam(fSimuParam);
+  fDetTypeSim->GetLoader()->LoadDigits();
+  TTree* digits = fDetTypeSim->GetLoader()->TreeD();
+  if (!digits) {
+      Error("Digits2Raw", "no digits tree");
+      return;
+  }
+  fDetTypeSim->SetTreeAddressD(digits,(Char_t*)GetName());
+  
+   // Get the FO signals for this event
+  AliITSFOSignalsSPD* foSignals = NULL;
+  AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
+  AliITSLoader* itsLoader = (AliITSLoader*) runLoader->GetLoader("ITSLoader");
+  if (!itsLoader) {
+    AliError("ITS loader is NULL.");
+  }
+   else {
+      if(!itsLoader->TreeD()) AliError("   !!! No TreeD available !!!");
+      foSignals = (AliITSFOSignalsSPD*)itsLoader->TreeD()->GetUserInfo()->FindObject("AliITSFOSignalsSPD");
+      if(!foSignals) AliError("FO signals not retrieved");
+     }
+  Bool_t deleteFOsignalsLater = kFALSE;
+  if (!foSignals) {
+    AliError("FO signals not available. No FO bits will be written.");
+    foSignals = new AliITSFOSignalsSPD(); // make a temporary dummy signals object
+    deleteFOsignalsLater = kTRUE;
+  }
+  
+  
+  AliITSDDLModuleMapSDD* ddlsdd=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
+  Char_t rawSDD=fDetTypeSim->GetSimuParam()->GetSDDRawDataFormat();
+  AliITSDDLRawData rawWriter;
+  
+  rawWriter.SetSDDRawFormat(rawSDD);
+  //Verbose level
+  // 0: Silent
+  // 1: cout messages
+  // 2: txt files with digits 
+  //BE CAREFUL, verbose level 2 MUST be used only for debugging and
+  //it is highly suggested to use this mode only for debugging digits files
+  //reasonably small, because otherwise the size of the txt files can reach
+  //quickly several MB wasting time and disk space.
+  rawWriter.SetVerbose(0);
+    
+  //SILICON PIXEL DETECTOR
+  AliDebug(1,"Formatting raw data for SPD");
+  rawWriter.RawDataSPD(digits->GetBranch("ITSDigitsSPD"),foSignals);
+  if(deleteFOsignalsLater) delete foSignals;
+    
+  //SILICON DRIFT DETECTOR
+  AliDebug(1,Form("Formatting raw data for SDD - Format code =%d",rawSDD));
+  rawWriter.RawDataSDD(digits->GetBranch("ITSDigitsSDD"),ddlsdd);
+    
+  //SILICON STRIP DETECTOR
+  AliDebug(1,"Formatting raw data for SSD");
+  rawWriter.RawDataSSD(digits->GetBranch("ITSDigitsSSD"));
 
-    Int_t i;
-    for (i=0;i<kNTYPES;i++ ) ResetClusters(i);
+  fLoader->UnloadDigits();
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::ResetClusters(Int_t i){
-    //    Reset number of clusters and the clusters array for this branch.
-    // Inputs:
-    //      Int_t i        Detector type number.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-
-    if (fCtype->At(i))    ((TClonesArray*)fCtype->At(i))->Clear();
-    if (fNctype)  fNctype[i]=0;
+AliLoader* AliITS::MakeLoader(const char* topfoldername){ 
+    //builds ITSgetter (AliLoader type)
+    //if detector wants to use castomized getter, it must overload this method
+
+    AliDebug(1,Form("Creating AliITSLoader. Top folder is %s.",
+         topfoldername));
+    fLoader = new AliITSLoader(GetName(),topfoldername);
+    return fLoader;
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::MakeBranchR(const char *file, Option_t *opt){
-    // Creates Tree branches for the ITS Reconstructed points.
-    // Inputs:
-    //      cont char *file  File name where RecPoints branch is to be written
-    //                       to. If blank it write the SDigits to the same
-    //                       file in which the Hits were found.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-    Int_t buffsz = 4000;
-    char branchname[30];
-
-    // only one branch for rec points for all detector types
-    Bool_t oFast= (strstr(opt,"Fast")!=0);
-    if(oFast){
-      sprintf(branchname,"%sRecPointsF",GetName());
-    } else {
-      sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
+Bool_t AliITS::Raw2SDigits(AliRawReader* rawReader)
+{
+  //
+  // Converts RAW data to SDigits
+  //
+  // Get TreeS
+  //
+  Int_t last   = -1;
+  Int_t size   = AliITSgeomTGeo::GetNModules();
+  if(!fModA) {
+    fModA = new TClonesArray*[size];
+    for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++) fModA[mod] = new TClonesArray("AliITSpListItem", 10000);
+  }
+  AliLoader* loader =  (AliRunLoader::Instance())->GetLoader("ITSLoader");
+  if (!loader){
+    Error("Open","Can not get ITS loader from Run Loader");
+    return kFALSE;
+  }
+
+  TTree* tree = 0;
+  tree = loader->TreeS();
+  if (!tree){
+    loader->MakeTree("S");
+    tree = loader->TreeS();
+  }
+  //
+  // Array for SDigits
+  // 
+  if(!fpSDigits){
+    fpSDigits = new TClonesArray("AliITSpListItem",10000);
+  }
+  TClonesArray& aSDigits = *fpSDigits;
+  Int_t bufsize = 32000;
+  tree->Branch("ITS", &fpSDigits, bufsize);
+  Int_t npx = 0;
+  //
+  // SPD
+  //
+  AliITSsegmentationSPD* segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
+  if(!segSPD){
+    AliWarning("Set AliITS defaults");
+    SetDefaults();
+    segSPD = (AliITSsegmentationSPD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(0);
+  }
+  npx = segSPD->Npx();
+  Double_t thr, sigma; 
+
+  Int_t countRW = -1; // RS counter for raw -> cluster ID's (used in embedding)
+  const TArrayI* rawID2clusID = fkRawID2ClusID[kSPD];
+  AliITSRawStreamSPD inputSPD(rawReader);
+  while(1){
+    Bool_t next  = inputSPD.Next();
+    if (!next) break;
+
+    countRW++; // RS
+    Int_t module = inputSPD.GetModuleID();
+    Int_t column = inputSPD.GetColumn();
+    Int_t row    = inputSPD.GetRow();
+    Int_t index  = npx * column + row;
+
+    if (module >= size) continue;
+    last = (fModA[module])->GetEntries();
+    TClonesArray& dum = *fModA[module];
+    fDetTypeSim->GetSimuParam()->SPDThresholds(module,thr,sigma);
+    thr += 1.;
+    int label = kMaxLabel;
+    if (rawID2clusID) { // RS If the raw->cluster ID is set (filled by cluster finder) store cluster ID's in SDigits
+      if (rawID2clusID->GetSize()<=countRW) {AliError(Form("The buffer of rawSPD to clusSPD ID's is shorter than current rawSPD ID=%d",countRW));}
+      else label = (*rawID2clusID)[countRW];
     }
-    if (fRecPoints && gAlice->TreeR()) {
-       MakeBranchInTree(gAlice->TreeR(),branchname,&fRecPoints,buffsz,file);
-    } // end if
-}
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::SetTreeAddressR(TTree *treeR){
-    // Set branch address for the Reconstructed points Trees.
-    // Inputs:
-    //      TTree *treeR   Tree containing the RecPoints.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-    char branchname[30];
-
-    if(!treeR) return;
-    TBranch *branch;
-    sprintf(branchname,"%sRecPoints",GetName());
-    branch = treeR->GetBranch(branchname);
-    if (branch) {
-      branch->SetAddress(&fRecPoints);
+    new (dum[last]) AliITSpListItem(label, -1, module, index, thr);
+  }
+  rawReader->Reset();
+
+  //
+  // SDD
+  // 
+  AliITSsegmentationSDD* segSDD = (AliITSsegmentationSDD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(1);
+  npx = segSDD->Npx();
+  Int_t scalef=AliITSsimulationSDD::ScaleFourier(segSDD);
+  Int_t firstSDD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(3,1,1);
+  Int_t firstSSD=AliITSgeomTGeo::GetModuleIndex(5,1,1);
+  //
+  countRW = -1; // RS
+  rawID2clusID = fkRawID2ClusID[kSDD];
+  AliITSRawStream* inputSDD=AliITSRawStreamSDD::CreateRawStreamSDD(rawReader);
+  for(Int_t iMod=firstSDD; iMod<firstSSD; iMod++){
+    AliITSCalibrationSDD* cal = (AliITSCalibrationSDD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(iMod);
+    Bool_t isZeroSupp=cal->GetZeroSupp();
+    if(isZeroSupp){ 
+      for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,cal->GetZSLowThreshold(iSid));
+    }else{
+      for(Int_t iSid=0; iSid<2; iSid++) inputSDD->SetZeroSuppLowThreshold(iMod-firstSDD,iSid,0);
+    }
+  }
+
+  AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap=fDetTypeSim->GetDDLModuleMapSDD();
+  inputSDD->SetDDLModuleMap(ddlmap);
+  while(inputSDD->Next()){
+    countRW++; // RS
+    if(inputSDD->IsCompletedModule()==kFALSE && 
+       inputSDD->IsCompletedDDL()==kFALSE){
+
+      Int_t module = inputSDD->GetModuleID();
+      Int_t anode  = inputSDD->GetCoord1()+segSDD->NpzHalf()*inputSDD->GetChannel();
+      Int_t time   = inputSDD->GetCoord2();
+      Int_t signal10 = inputSDD->GetSignal();
+      Int_t index = AliITSpList::GetIndex(anode,time,scalef*npx);
+
+      if (module >= size) continue;
+      last = fModA[module]->GetEntries();
+      TClonesArray& dum = *fModA[module];
+      int label = kMaxLabel;
+      if (rawID2clusID) { // RS If the raw->cluster ID is set (filled by cluster finder) store cluster ID's in SDigits
+       if (rawID2clusID->GetSize()<=countRW) {AliError(Form("The buffer of rawSDD to clusSDD ID's is shorter than current rawSDD ID=%d",countRW));}
+       else label = (*rawID2clusID)[countRW];
+      }
+      new (dum[last]) AliITSpListItem(label, -1, module, index, Double_t(signal10));
+      ((AliITSpListItem*) dum.At(last))->AddSignalAfterElect(module, index, Double_t(signal10));
     }
-    else {
-      sprintf(branchname,"%sRecPointsF",GetName());
-      branch = treeR->GetBranch(branchname);
-      if (branch) {
-        branch->SetAddress(&fRecPoints);
+  }
+  delete inputSDD;
+  rawReader->Reset();
+    
+  //
+  // SSD
+  // 
+  AliITSsegmentationSSD* segSSD = (AliITSsegmentationSSD*) fDetTypeSim->GetSegmentationModel(2);
+  npx = segSSD->Npx();
+  AliITSRawStreamSSD inputSSD(rawReader);
+  countRW = -1;
+  rawID2clusID = fkRawID2ClusID[kSSD];
+  while(1){
+    Bool_t next  = inputSSD.Next();
+    if (!next) break;
+    countRW++; // RS
+    Int_t module  = inputSSD.GetModuleID();
+    if(module<0)AliError(Form("Invalid SSD  module %d \n",module));
+    if(module<0)continue;
+    Int_t side    = inputSSD.GetSideFlag();
+    Int_t strip   = inputSSD.GetStrip();
+    Int_t signal  = inputSSD.GetSignal();
+    Int_t index  = npx * side + strip;
+
+    if (module >= size) continue;
+       
+    last = fModA[module]->GetEntries();
+    TClonesArray& dum = *fModA[module];
+    int label = kMaxLabel;
+    if (rawID2clusID) { // RS If the raw->cluster ID is set (filled by cluster finder) store cluster ID's in SDigits
+      if (rawID2clusID->GetSize()<=countRW) {AliError(Form("The buffer of rawSSD to clusSSD ID's is shorter than current rawSSD ID=%d",countRW));}
+      else label = (*rawID2clusID)[countRW];
+    }    
+    new (dum[last]) AliITSpListItem(label, -1, module, index, Double_t(signal));
+  }
+  rawReader->Reset();
+  AliITSpListItem* sdig = 0;
+    
+  Int_t firstssd = GetITSgeom()->GetStartDet(kSSD);
+  Double_t adcToEv = 1.;
+  for (Int_t mod = 0; mod < size; mod++)
+    {
+      if(mod>=firstssd) {
+       AliITSCalibrationSSD* calssd = (AliITSCalibrationSSD*)fDetTypeSim->GetCalibrationModel(mod);
+       adcToEv = 1./calssd->GetSSDDEvToADC(1.);
       }
+      Int_t nsdig =  fModA[mod]->GetEntries();
+      for (Int_t ie = 0; ie < nsdig; ie++) {
+       sdig = (AliITSpListItem*) (fModA[mod]->At(ie));
+       Double_t digsig = sdig->GetSignal();
+       if(mod>=firstssd) digsig*=adcToEv; // for SSD: convert back charge from ADC to electron
+       new (aSDigits[ie]) AliITSpListItem(sdig->GetTrack(0), -1, mod, sdig->GetIndex(), digsig);
+       Float_t sig = sdig->GetSignalAfterElect();
+       if(mod>=firstssd) sig*=adcToEv;
+       if (sig > 0.) {
+         sdig = (AliITSpListItem*)aSDigits[ie];
+         sdig->AddSignalAfterElect(mod, sdig->GetIndex(), Double_t(sig));
+       }
+      }
+       
+      tree->Fill();
+      aSDigits.Clear();
+      fModA[mod]->Clear();
     }
+  loader->WriteSDigits("OVERWRITE");    
+  return kTRUE;
 }
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::AddRecPoint(const AliITSRecPoint &r){
-    // Add a reconstructed space point to the list
-    // Inputs:
-    //      const AliITSRecPoint &r RecPoint class to be added to the tree
-    //                              of reconstructed points TreeR.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
 
-    TClonesArray &lrecp = *fRecPoints;
-    new(lrecp[fNRecPoints++]) AliITSRecPoint(r);
-}
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::HitsToFastRecPoints(Int_t evNumber,Int_t bgrev,Int_t size,
-                                Option_t *opt0,Option_t *opt1,Text_t *flnm){
-    // keep galice.root for signal and name differently the file for 
-    // background when add! otherwise the track info for signal will be lost !
-    // the condition below will disappear when the geom class will be
-    // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
-    // Inputs:
-    //      Int_t evnt       Event to be processed.
-    //      Int_t bgrev      Background Hit tree number.
-    //      Int_t size       Size used by InitModules. See InitModules.
-    //      Option_t *opt0   Option passed to FillModules. See FillModules.
-    //      Option_t *opt1   String indicating if merging hits or not. To
-    //                       merge hits set equal to "Add". Otherwise no
-    //                       background hits are considered.
-    //      Test_t *flnm     File name containing the background hits..
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
-
-    if(!GetITSgeom()) return;
-    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
-
-    const char *all = strstr(opt1,"All");
-    const char *det[3] ={strstr(opt1,"SPD"),strstr(opt1,"SDD"),
-                        strstr(opt1,"SSD")};
-    Int_t nmodules;
-    InitModules(size,nmodules);
-    FillModules(evNumber,bgrev,nmodules,opt0,flnm);
-
-    AliITSsimulation *sim      = 0;
-    AliITSDetType    *iDetType = 0;
-    AliITSmodule     *mod      = 0;
-    Int_t id,module;
-
-    //m.b. : this change is nothing but a nice way to make sure
-    //the CPU goes up !
-    for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
-       id       = geom->GetModuleType(module);
-        if (!all && !det[id]) continue;
-       iDetType = DetType(id);
-       sim      = (AliITSsimulation*)iDetType->GetSimulationModel();
-       if (!sim) {
-           Error("HitsToFastPoints",
-                 "The simulation class was not instanciated!");
-           exit(1);
-       } // end if !sim
-       mod      = (AliITSmodule *)fITSmodules->At(module);
-       sim->CreateFastRecPoints(mod,module,gRandom);
-    // gAlice->TreeR()->Fill(); 
-    TBranch *br=gAlice->TreeR()->GetBranch("ITSRecPointsF");
-    br->Fill();
-       ResetRecPoints();
-    } // end for module
-
-    ClearModules();
-
-    gAlice->TreeR()->AutoSave();
-    // reset tree
-    gAlice->TreeR()->Reset();
+void AliITS::UpdateInternalGeometry(){
+  //reads new geometry from TGeo 
+//   AliDebug(1,"Delete ITSgeom and create a new one reading TGeo");
+
+  AliITSVersion_t version = (AliITSVersion_t)IsVersion();
+  AliITSInitGeometry initgeom;
+  AliITSgeom* geom = initgeom.CreateAliITSgeom(version);
+  SetITSgeom(geom);
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::Digits2Reco(){
-    // Find clusters and reconstruct space points.
-    // Inputs:
-    //      none.
-    // Outputs:
-    //      none.
-
-    AliHeader *header=gAlice->GetHeader();
-    // to Digits to RecPoints for event in file, all digits in file, and
-    // all ITS detectors.
-    DigitsToRecPoints(header->GetEvent(),0,fOpt);
+AliTriggerDetector* AliITS::CreateTriggerDetector() const {
+  // create an AliITSTrigger object (and set trigger conditions as input)
+  return new AliITSTrigger(fDetTypeSim->GetTriggerConditions());
 }
 //______________________________________________________________________
-void AliITS::DigitsToRecPoints(Int_t evNumber,Int_t lastentry,Option_t *opt){
-    // cluster finding and reconstruction of space points
-    // the condition below will disappear when the geom class will be
-    // initialized for all versions - for the moment it is only for v5 !
-    // 7 is the SDD beam test version
-    // Inputs:
-    //      Int_t evNumber   Event number to be processed.
-    //      Int_t lastentry  Offset for module when not all of the modules
-    //                       are processed.
-    //      Option_t *opt    String indicating which ITS sub-detectors should
-    //                       be processed. If ="All" then all of the ITS
-    //                       sub detectors are processed.
-    // Outputs:
-    //      none.
-    // Return:
-    //      none.
+void AliITS::WriteFOSignals(){
+// This method write FO signals in Digits tree both in Hits2Digits
+// or SDigits2Digits
 
-    if(!GetITSgeom()) return;
-    AliITSgeom *geom = GetITSgeom();
-    
-    const char *all = strstr(opt,"All");
-    const char *det[3] = {strstr(opt,"SPD"),strstr(opt,"SDD"),
-                         strstr(opt,"SSD")};
-    static Bool_t setRec=kTRUE;
-    if (setRec) SetDefaultClusterFinders();
-    setRec=kFALSE;
-
-    TTree *treeC=TreeC();
-    AliITSClusterFinder *rec     = 0;
-    AliITSDetType      *iDetType = 0;
-    Int_t id,module,first=0;
-    for(module=0;module<geom->GetIndexMax();module++){
-       id       = geom->GetModuleType(module);
-        if (!all && !det[id]) continue;
-       if(det[id]) first = geom->GetStartDet(id);
-       iDetType = DetType(id);
-       rec = (AliITSClusterFinder*)iDetType->GetReconstructionModel();
-        TClonesArray *itsDigits  = this->DigitsAddress(id);
-       if (!rec) {
-           Error("DigitsToRecPoints",
-                 "The reconstruction class was not instanciated!");
-           exit(1);
-       } // end if !rec
-       this->ResetDigits();
-       if (all) gAlice->TreeD()->GetEvent(lastentry+module);
-       else gAlice->TreeD()->GetEvent(lastentry+(module-first));
-       Int_t ndigits = itsDigits->GetEntriesFast();
-       if (ndigits) rec->FindRawClusters(module);
-    gAlice->TreeR()->Fill(); 
-       ResetRecPoints();
-       treeC->Fill();
-       ResetClusters();
-    } // end for module
-
-    gAlice->TreeR()->GetEntries();
-    treeC->GetEntries();
-    gAlice->TreeR()->AutoSave();
-    // reset tree
-    gAlice->TreeR()->Reset();
-
-    treeC->AutoSave();
-    treeC->Reset();
+  fDetTypeSim->ProcessNoiseForFastOr();
+  fDetTypeSim->WriteFOSignals();
 }
-//______________________________________________________________________
-void AliITS::ResetRecPoints(){
-    // Reset number of rec points and the rec points array.
-    // Inputs:
-    //      none.
-    // Outputs:
-    //      none.
 
-    if (fRecPoints) fRecPoints->Clear();
-    fNRecPoints = 0;
-}
+