New plots for trending injector efficiencies (Melinda)
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSAlignMille2.cxx
index b2b432f..84fe5fc 100644 (file)
-/**************************************************************************\r
- * Copyright(c) 2007-2009, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *\r
- *                                                                        *\r
- * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *\r
- * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *\r
- *                                                                        *\r
- * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *\r
- * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *\r
- * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *\r
- * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *\r
- * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *\r
- * about the suitability of this software for any purpose. It is          *\r
- * provided "as is" without express or implied warranty.                  *\r
- **************************************************************************/\r
-\r
-/* $Id$ */\r
-\r
-//-----------------------------------------------------------------------------\r
-//\r
-//  Interface to AliMillePede2 alignment class for the ALICE ITS detector\r
-// \r
-//  ITS specific alignment class which interface to AliMillepede.   \r
-//  For each track ProcessTrack calculates the local and global derivatives\r
-//  at each hit and fill the corresponding local equations. Provide methods for\r
-//  fixing or constraining detection elements for best results. \r
-// \r
-//  author M. Lunardon (thanks to J. Castillo), ruben.shahoyan@cern.ch\r
-//-----------------------------------------------------------------------------\r
-\r
-#include <TFile.h>\r
-#include <TClonesArray.h>\r
-#include <TMath.h>\r
-#include <TVirtualFitter.h>\r
-#include <TGeoManager.h>\r
-#include <TArrayI.h>\r
-#include <TSystem.h>\r
-#include "AliITSAlignMille2.h"\r
-#include "AliITSgeomTGeo.h"\r
-#include "AliGeomManager.h"\r
-#include "AliMillePede2.h"\r
-#include "AliTrackPointArray.h"\r
-#include "AliAlignObjParams.h"\r
-#include "AliLog.h"\r
-#include "AliTrackFitterRieman.h"\r
-#include "AliITSAlignMille2Constraint.h"\r
-#include "AliITSAlignMille2ConstrArray.h"\r
-#include "AliITSresponseSDD.h"\r
-\r
-ClassImp(AliITSAlignMille2)\r
-\r
-const Char_t* AliITSAlignMille2::kRecKeys[] = {\r
-  "GEOMETRY_FILE",\r
-  "SUPERMODULE_FILE",\r
-  "CONSTRAINTS_REFERENCE_FILE",\r
-  "PREALIGNMENT_FILE",\r
-  "PRECALIBSDD_FILE",\r
-  "INITCALBSDD_FILE",\r
-  "SET_GLOBAL_DELTAS",\r
-  "CONSTRAINT_LOCAL",\r
-  "MODULE_VOLUID",\r
-  "MODULE_INDEX",\r
-  "SET_PSEUDO_PARENTS",\r
-  "SET_TRACK_FIT_METHOD",\r
-  "SET_MINPNT_TRA",\r
-  "SET_NSTDDEV",\r
-  "SET_RESCUT_INIT",\r
-  "SET_RESCUT_OTHER",\r
-  "SET_LOCALSIGMAFACTOR",\r
-  "SET_STARTFAC",\r
-  "SET_B_FIELD",\r
-  "SET_SPARSE_MATRIX",\r
-  "REQUIRE_POINT",\r
-  "CONSTRAINT_ORPHANS",\r
-  "CONSTRAINT_SUBUNITS",\r
-  "APPLY_CONSTRAINT"\r
-};\r
-\r
-\r
-//========================================================================================================\r
-\r
-AliITSAlignMille2* AliITSAlignMille2::fgInstance = 0;  \r
-Int_t              AliITSAlignMille2::fgInstanceID = 0;\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-AliITSAlignMille2::AliITSAlignMille2(const Char_t *configFilename  ) \r
-: TObject(),\r
-  fMillepede(0),\r
-  fStartFac(16.), \r
-  fResCutInitial(100.), \r
-  fResCut(100.),\r
-  fNGlobal(0),\r
-  fNLocal(4),\r
-  fNStdDev(3),\r
-  fIsMilleInit(kFALSE),\r
-  fAllowPseudoParents(kFALSE),\r
-  //\r
-  fCurrentModule(0),\r
-  fTrack(0),\r
-  fTrackBuff(0),\r
-  fCluster(),\r
-  fGlobalDerivatives(0), \r
-  //\r
-  fMinNPtsPerTrack(3),\r
-  fInitTrackParamsMeth(1),\r
-  fTotBadLocEqPoints(0),\r
-  fRieman(0),\r
-  //\r
-  fConstraints(0),\r
-  //\r
-  fUseGlobalDelta(kFALSE),\r
-  fRequirePoints(kFALSE),\r
-  fTempExcludedModule(-1),\r
-  //\r
-  fGeometryFileName("geometry.root"),\r
-  fPreAlignmentFileName(""),\r
-  fConstrRefFileName(""),\r
-  fGeoManager(0),\r
-  fIsConfigured(kFALSE),\r
-  fPreAlignQF(0),\r
-//\r
-  fCorrectSDD(0),\r
-  fInitialRecSDD(0),\r
-  fPrealignment(0),\r
-  fConstrRef(0),\r
-  fMilleModule(2),\r
-  fSuperModule(2),\r
-  fNModules(0),\r
-  fNSuperModules(0),\r
-  fUsePreAlignment(kFALSE),\r
-  fBOn(kFALSE),\r
-  fBField(0.0),\r
-  fBug(0),\r
-  fMilleVersion(2)\r
-{\r
-  /// main constructor that takes input from configuration file\r
-  for (int i=3;i--;) fSigmaFactor[i] = 1.0;\r
-  //\r
-  // new RS\r
-  for (Int_t i=0; i<6; i++) {\r
-    fNReqLayUp[i]=0;\r
-    fNReqLayDown[i]=0;\r
-    fNReqLay[i]=0;\r
-  }\r
-  for (Int_t i=0; i<3; i++) {\r
-    fNReqDetUp[i]=0;\r
-    fNReqDetDown[i]=0;\r
-    fNReqDet[i]=0;\r
-  }\r
-  //\r
-  Int_t lc=LoadConfig(configFilename);\r
-  if (lc) {\r
-    AliError(Form("Error %d loading configuration from %s",lc,configFilename));\r
-    exit(1);\r
-  }\r
-  //\r
-  fMillepede = new AliMillePede2();  \r
-  fgInstance = this;\r
-  fgInstanceID++;\r
-  //\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-AliITSAlignMille2::~AliITSAlignMille2()\r
-{\r
-  /// Destructor\r
-  if (fMillepede)         delete fMillepede;            fMillepede = 0;\r
-  if (fGlobalDerivatives) delete[] fGlobalDerivatives;  fGlobalDerivatives = 0;\r
-  if (fRieman)            delete fRieman;               fRieman = 0;\r
-  if (fPrealignment)      delete fPrealignment;         fPrealignment = 0;\r
-  if (fConstrRef)         delete fConstrRef;            fConstrRef = 0;\r
-  if (fCorrectSDD)        delete fCorrectSDD;           fCorrectSDD = 0;\r
-  if (fInitialRecSDD)     delete fInitialRecSDD;        fInitialRecSDD = 0;\r
-  fTrackBuff.Delete();\r
-  fConstraints.Delete();\r
-  fMilleModule.Delete();\r
-  fSuperModule.Delete();\r
-  if (--fgInstanceID==0) fgInstance = 0;\r
-}\r
-\r
-///////////////////////////////////////////////////////////////////////\r
-\r
-\r
-TObjArray* AliITSAlignMille2::GetConfigRecord(FILE* stream, TString& recTitle, TString& recOpt, Bool_t rew)\r
-{\r
-  // read new record from config file\r
-  TString record;\r
-  static TObjArray* recElems = 0;\r
-  if (recElems) {delete recElems; recElems = 0;}\r
-  //\r
-  TString keyws = recTitle;\r
-  if (!keyws.IsNull()) {\r
-    keyws.ToUpper();\r
-    //    keyws += " ";\r
-  }\r
-  while (record.Gets(stream)) {\r
-    int cmt=record.Index("#"); \r
-    if (cmt>=0) record.Remove(cmt);  // skip comment\r
-    record.ReplaceAll("\t"," ");\r
-    record.ReplaceAll("\r"," ");\r
-    record.Remove(TString::kBoth,' '); \r
-    if (record.IsNull()) continue;      // nothing to decode \r
-    if (!keyws.IsNull() && !record.BeginsWith(keyws.Data())) continue; // specific record was requested\r
-    //\r
-    recElems = record.Tokenize(" ");\r
-    recTitle = recElems->At(0)->GetName();\r
-    recTitle.ToUpper();\r
-    recOpt = recElems->GetLast()>0 ? recElems->At(1)->GetName() : "";\r
-    break;\r
-  }\r
-  if (rew || !recElems) rewind(stream);\r
-  return recElems;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::CheckConfigRecords(FILE* stream)\r
-{  \r
-  TString record,recTitle;\r
-  int lineCnt = 0;\r
-  rewind(stream);\r
-  while (record.Gets(stream)) {\r
-    int cmt=record.Index("#"); \r
-    lineCnt++;\r
-    if (cmt>=0) record.Remove(cmt);  // skip comment\r
-    record.ReplaceAll("\t"," ");\r
-    record.ReplaceAll("\r"," ");\r
-    record.Remove(TString::kBoth,' ');\r
-    if (record.IsNull()) continue;   // nothing to decode  \r
-    // extract keyword\r
-    int spc = record.Index(" ");\r
-    if (spc>0) recTitle = record(0,spc);\r
-    else     recTitle = record;\r
-    recTitle.ToUpper();\r
-    Bool_t strOK = kFALSE;\r
-    for (int ik=kNKeyWords;ik--;) if (recTitle == kRecKeys[ik]) {strOK = kTRUE; break;}\r
-    if (strOK) continue;\r
-    //\r
-    AliError(Form("Unknown keyword %s at line %d",\r
-                 recTitle.Data(),lineCnt));\r
-    return -1;\r
-    //\r
-  }\r
-  //\r
-  rewind(stream);\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::LoadConfig(const Char_t *cfile)\r
-{  \r
-  // return 0 if success\r
-  //        1 if error in module index or voluid\r
-  //\r
-  FILE *pfc=fopen(cfile,"r");\r
-  if (!pfc) return -1;\r
-  //\r
-  TString record,recTitle,recOpt,recExt;\r
-  Int_t nrecElems,irec;\r
-  TObjArray *recArr=0;\r
-  //\r
-  fNModules = 0;\r
-  Bool_t stopped = kFALSE;\r
-  //\r
-  if (CheckConfigRecords(pfc)<0) return -1;\r
-  //\r
-  while(1) { \r
-    //\r
-    // ============= 1: we read some obligatory records in predefined order ================\r
-    //  \r
-    recTitle = kRecKeys[kGeomFile];\r
-    if ( !GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) || \r
-        (fGeometryFileName=recOpt).IsNull()     || \r
-        gSystem->AccessPathName(recOpt.Data())  ||\r
-        InitGeometry() )\r
-      { AliError("Failed to find/load Geometry"); stopped = kTRUE; break;}\r
-    //\r
-    recTitle = kRecKeys[kSuperModileFile];\r
-    if ( !GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) || \r
-        recOpt.IsNull()                         || \r
-        gSystem->AccessPathName(recOpt.Data())  ||\r
-        LoadSuperModuleFile(recOpt.Data()))\r
-      { AliError("Failed to find/load SuperModules"); stopped = kTRUE; break;}\r
-    //\r
-    recTitle = kRecKeys[kConstrRefFile];      // LOCAL_CONSTRAINTS are defined wrt these deltas\r
-    if ( GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) ) {\r
-      if (recOpt.IsNull() || recOpt=="IDEAL") SetConstraintWrtRef( "IDEAL" );\r
-      else if (gSystem->AccessPathName(recOpt.Data()) || SetConstraintWrtRef(recOpt.Data()) )\r
-       { AliError("Failed to load reference deltas for local constraints"); stopped = kTRUE; break;}\r
-    }\r
-    //  \r
-    recTitle = kRecKeys[kPrealignFile];\r
-    if ( GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) )\r
-      if ( (fPreAlignmentFileName=recOpt).IsNull() || \r
-          gSystem->AccessPathName(recOpt.Data())   ||\r
-          ApplyToGeometry()) \r
-       { AliError(Form("Failed to load Prealignment file %s",recOpt.Data())); stopped = kTRUE; break;}\r
-    //\r
-    recTitle = kRecKeys[kPreCalSDDFile];\r
-    if ( GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) ) {\r
-      if ( recOpt.IsNull() || gSystem->AccessPathName(recOpt.Data()) ) {stopped = kTRUE; break;}\r
-      AliInfo(Form("Using %s for SDD precalibration",recOpt.Data()));\r
-      TFile* precfi = TFile::Open(recOpt.Data());\r
-      if (!precfi->IsOpen()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-      fCorrectSDD = (AliITSresponseSDD*)precfi->Get("AliITSresponseSDD");\r
-      precfi->Close();\r
-      delete precfi;\r
-      if (!fCorrectSDD) {AliError("Precalibration SDD object is not found"); stopped = kTRUE; break;}\r
-    }\r
-    //\r
-    recTitle = kRecKeys[ kInitCalSDDFile ];\r
-    if ( GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) ) {\r
-      if ( recOpt.IsNull() || gSystem->AccessPathName(recOpt.Data()) ) {stopped = kTRUE; break;}\r
-      AliInfo(Form("Using %s as SDD calibration used in TrackPoints",recOpt.Data()));\r
-      TFile* precf = TFile::Open(recOpt.Data());\r
-      if (!precf->IsOpen()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-      fInitialRecSDD = (AliITSresponseSDD*)precf->Get("AliITSresponseSDD");\r
-      precf->Close();\r
-      delete precf;\r
-      if (!fInitialRecSDD) {AliError("Initial Calibration SDD object is not found"); stopped = kTRUE; break;}\r
-    }\r
-    //\r
-    recTitle = kRecKeys[ kGlobalDeltas ];\r
-    if ( GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) ) SetUseGlobalDelta(kTRUE);\r
-    //\r
-    // =========== 2: see if there are local gaussian constraints defined =====================\r
-    //            Note that they should be loaded before the modules declaration\r
-    //\r
-    recTitle = kRecKeys[ kConstrLocal ];\r
-    while( (recArr=GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,0)) ) {\r
-      nrecElems = recArr->GetLast()+1;\r
-      if (recOpt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;} // wrong name\r
-      if (GetConstraint(recOpt.Data())) {\r
-       AliError(Form("Existing constraint %s repeated",recOpt.Data()));\r
-       stopped = kTRUE; break;\r
-      }\r
-      recExt = recArr->At(2)->GetName();\r
-      if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-      double val = recExt.Atof();      \r
-      recExt = recArr->At(3)->GetName();\r
-      if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-      double err = recExt.Atof();      \r
-      int nwgh = nrecElems - 4;\r
-      double *wgh = new double[nwgh];\r
-      for (nwgh=0,irec=4;irec<nrecElems;irec++) {\r
-       recExt = recArr->At(irec)->GetName();\r
-       if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       wgh[nwgh++] = recExt.Atof();\r
-      }\r
-      if (stopped) {delete[] wgh; break;}\r
-      //\r
-      ConstrainLocal(recOpt.Data(),wgh,nwgh,val,err);\r
-      delete[] wgh;\r
-      //\r
-    } // end while for loop over local constraints\r
-    if (stopped) break;\r
-    //\r
-    // =========== 3: now read modules to align ===================================\r
-    //\r
-    rewind(pfc);\r
-    while( (recArr=GetConfigRecord(pfc,recTitle="",recOpt,0)) ) {\r
-      if (!(recTitle==kRecKeys[ kModVolID ] || recTitle==kRecKeys[ kModIndex ])) continue;\r
-      // Expected format: MODULE id tolX tolY tolZ tolPsi tolTh tolPhi [[sigX sigY sigZ]  extra params]\r
-      // where tol* is the tolerance (sigma) for given DOF. 0 means fixed\r
-      // sig* is the scaling parameters for the errors of the clusters of this module\r
-      // extra params are defined for specific modules, e.g. t0 and vdrift corrections of SDD\r
-      //\r
-      nrecElems = recArr->GetLast()+1;\r
-      if (nrecElems<2 || !recOpt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-      int idx = recOpt.Atoi(); \r
-      UShort_t voluid =  (idx<=kMaxITSSensID) ? GetModuleVolumeID(idx) : idx;\r
-      AliITSAlignMille2Module* mod = 0;\r
-      //\r
-      if (voluid>=kMinITSSupeModuleID) { // custom supermodule\r
-       for (int j=0; j<fNSuperModules; j++) {\r
-         if (voluid==GetSuperModule(j)->GetVolumeID()) {\r
-           mod = new AliITSAlignMille2Module(*GetSuperModule(j));\r
-           // the matrix might be updated in case some prealignment was applied, check \r
-           TGeoHMatrix* mup = AliGeomManager::GetMatrix(mod->GetName());\r
-           if (mup) *(mod->GetMatrix()) = *mup;\r
-           fMilleModule.AddAtAndExpand(mod,fNModules);\r
-           break;\r
-         }     \r
-       }\r
-      }\r
-      else if (idx<=kMaxITSSensVID) {\r
-       mod = new AliITSAlignMille2Module(voluid);\r
-       fMilleModule.AddAtAndExpand(mod,fNModules);\r
-      }\r
-      if (!mod) {stopped = kTRUE; break;}  // bad volid\r
-      //\r
-      // geometry variation settings\r
-      for (int i=0;i<AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom;i++) {\r
-       irec = i+2;\r
-       if (irec >= nrecElems) break;\r
-       recExt = recArr->At(irec)->GetName();\r
-       if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       mod->SetFreeDOF(i, recExt.Atof() );     \r
-      }\r
-      if (stopped) break;\r
-      //\r
-      // scaling factors for cluster errors\r
-      // first set default ones\r
-      for (int i=0;i<3;i++) mod->SetSigmaFactor(i, fSigmaFactor[i]);   \r
-      for (int i=0;i<3;i++) {\r
-       irec = i+8;\r
-       if (irec >= nrecElems) break;\r
-       recExt = recArr->At(irec)->GetName();\r
-       if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       mod->SetSigmaFactor(i, recExt.Atof() ); \r
-      }     \r
-      if (stopped) break;\r
-      //\r
-      mod->SetGeomParamsGlobal(fUseGlobalDelta);\r
-      // now comes special detectors treatment\r
-      if (mod->IsSDD()) {\r
-       double vl = 0;\r
-       if (nrecElems>11) {\r
-         recExt = recArr->At(11)->GetName();\r
-         if (recExt.IsFloat()) vl = recExt.Atof();\r
-         else {stopped = kTRUE; break;}\r
-         irec = 11;\r
-       }\r
-       mod->SetFreeDOF(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0,vl);\r
-       //\r
-       vl = 0;\r
-       if (nrecElems>12) {\r
-         recExt = recArr->At(12)->GetName();\r
-         if (recExt.IsFloat()) vl = recExt.Atof();\r
-         else {stopped = kTRUE; break;}\r
-         irec = 12;\r
-       }\r
-       mod->SetFreeDOF(AliITSAlignMille2Module::kDOFDV,vl);\r
-      }\r
-      //\r
-      mod->SetUniqueID(fNModules);\r
-      mod->EvaluateDOF();\r
-      fNModules++;\r
-      //\r
-      // now check if there are local constraints on this module\r
-      for (++irec;irec<nrecElems;irec++) {\r
-       recExt = recArr->At(irec)->GetName();\r
-       if (recExt.IsFloat()) {stopped=kTRUE;break;}\r
-       AliITSAlignMille2ConstrArray* cstr = (AliITSAlignMille2ConstrArray*)GetConstraint(recExt.Data());\r
-       if (!cstr) {\r
-         AliInfo(Form("No Local constraint %s was declared",recExt.Data())); \r
-         stopped=kTRUE; \r
-         break;\r
-       }\r
-       cstr->AddModule(mod);\r
-      }\r
-      if (stopped) break;\r
-    } // end while for loop over modules\r
-    if (stopped) break;\r
-    //\r
-    if (fNModules==0) {AliError("Failed to find any MODULE"); stopped = kTRUE; break;}  \r
-    BuildHierarchy();  // preprocess loaded modules\r
-    //\r
-    // =========== 4: the rest may come in arbitrary order =======================================\r
-    rewind(pfc);\r
-    while ( (recArr=GetConfigRecord(pfc,recTitle="",recOpt,0))!=0 ) {\r
-      //\r
-      nrecElems = recArr->GetLast()+1;\r
-      //\r
-      // some simple flags -----------------------------------------------------------------------\r
-      //\r
-      if      (recTitle == kRecKeys[ kPseudoParents ])  SetAllowPseudoParents(kTRUE);\r
-      //\r
-      // some optional parameters ----------------------------------------------------------------\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kTrackFitMethod ]) {\r
-       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsDigit() ) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       SetInitTrackParamsMeth(recOpt.Atoi());\r
-      }\r
-      //\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kMinPntTrack ]) {\r
-       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsDigit() ) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       fMinNPtsPerTrack = recOpt.Atoi();\r
-      }\r
-      //\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kNStDev ]) {\r
-       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsFloat() ) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       fNStdDev = (Int_t)recOpt.Atof();\r
-      }\r
-      //\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kResCutInit  ]) {\r
-       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsFloat() ) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       fResCutInitial = recOpt.Atof();\r
-      }\r
-      //\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kResCutOther ]) {\r
-       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsFloat() ) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       fResCut = recOpt.Atof();\r
-      }\r
-      //\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kLocalSigFactor ]) { //-------------------------\r
-       for (irec=0;irec<3;irec++) if (nrecElems>irec+1) {\r
-           fSigmaFactor[irec] = ((TObjString*)recArr->At(irec+1))->GetString().Atof();\r
-           if (fSigmaFactor[irec]<=0.) stopped = kTRUE;\r
-         }\r
-       if (stopped) break; \r
-      }\r
-      //\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kStartFactor ]) {        //-------------------------\r
-       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsFloat() ) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       fStartFac = recOpt.Atof();\r
-      }\r
-      //\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kBField ]) {         //-------------------------\r
-       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsFloat() ) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       fBField = recOpt.Atof();\r
-       if (fBField>0) {\r
-         fBOn = kTRUE;\r
-         fNLocal = 5; // helices\r
-         fRieman = new AliTrackFitterRieman();\r
-       }  \r
-       else {\r
-         fBField = 0.0;\r
-         fBOn = kFALSE;\r
-         fNLocal = 4;\r
-       }\r
-      }\r
-      //\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kSparseMatrix ]) {   // matrix solver type\r
-       //\r
-       AliMillePede2::SetGlobalMatSparse(kTRUE);\r
-       if (recOpt.IsNull()) continue;\r
-       // solver type and settings\r
-       if      (recOpt == "MINRES") AliMillePede2::SetIterSolverType( AliMinResSolve::kSolMinRes );\r
-       else if (recOpt == "FGMRES") AliMillePede2::SetIterSolverType( AliMinResSolve::kSolFGMRes );\r
-       else {stopped = kTRUE; break;}\r
-       //\r
-       if (nrecElems>=3) { // preconditioner type\r
-         recExt = recArr->At(2)->GetName();\r
-         if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-         AliMillePede2::SetMinResPrecondType( recExt.Atoi() );\r
-       }\r
-       //\r
-       if (nrecElems>=4) { // tolerance\r
-         recExt = recArr->At(3)->GetName();\r
-         if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-         AliMillePede2::SetMinResTol( recExt.Atof() );\r
-       }\r
-       //\r
-       if (nrecElems>=5) { // maxIter\r
-         recExt = recArr->At(4)->GetName();\r
-         if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-         AliMillePede2::SetMinResMaxIter( recExt.Atoi() );\r
-       }       \r
-      }\r
-      //\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kRequirePoint ]) {       //-------------------------\r
-       // syntax:   REQUIRE_POINT where ndet updw nreqpts\r
-       //    where = LAYER or DETECTOR\r
-       //    ndet = detector number: 1-6 for LAYER and 1-3 for DETECTOR (SPD=1, SDD=2, SSD=3)\r
-       //    updw = 1 for Y>0, -1 for Y<0, 0 if not specified\r
-       //    nreqpts = minimum number of points of that type\r
-       if (nrecElems>=5) {\r
-         recOpt.ToUpper();\r
-         int lr = ((TObjString*)recArr->At(2))->GetString().Atoi() - 1;\r
-         int hb = ((TObjString*)recArr->At(3))->GetString().Atoi();\r
-         int np = ((TObjString*)recArr->At(4))->GetString().Atoi();\r
-         fRequirePoints = kTRUE;\r
-         if (recOpt == "LAYER") {\r
-           if (lr<0 || lr>5) {stopped = kTRUE; break;}\r
-           if (hb>0) fNReqLayUp[lr] = np;\r
-           else if (hb<0) fNReqLayDown[lr] = np;\r
-           else fNReqLay[lr] = np;\r
-         }\r
-         else if (recOpt == "DETECTOR") {\r
-           if (lr<0 || lr>2) {stopped = kTRUE; break;}\r
-           if (hb>0) fNReqDetUp[lr] = np;\r
-           else if (hb<0) fNReqDetDown[lr] = np;\r
-           else fNReqDet[lr] = np;\r
-         }\r
-         else {stopped = kTRUE; break;}\r
-       }\r
-       else {stopped = kTRUE; break;}\r
-      }\r
-      //\r
-      // global constraints on the subunits/orphans \r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kConstrOrphans ]) {    //------------------------\r
-       // expect CONSTRAINT_ORPHANS MEAN/MEDIAN Value parID0 ... parID1 ...\r
-       if (nrecElems<4) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       recExt = recArr->At(2)->GetName();\r
-       if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       double val = recExt.Atof();\r
-       UInt_t pattern = 0;\r
-       for (irec=3;irec<nrecElems;irec++) { // read params to constraint\r
-         recExt = recArr->At(irec)->GetName();\r
-         if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-         pattern |= 0x1 << recExt.Atoi();\r
-       }\r
-       if (stopped) break;\r
-       if      (recOpt == "MEAN")   ConstrainOrphansMean(val,pattern);\r
-       else if (recOpt == "MEDIAN") ConstrainOrphansMedian(val,pattern);\r
-       else {stopped = kTRUE; break;}\r
-      }\r
-      //\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kConstrSubunits ]) {    //------------------------\r
-       // expect ONSTRAINT_SUBUNITS MEAN/MEDIAN Value parID0 ... parID1 ... VolID1 ... VolIDn - VolIDm\r
-       if (nrecElems<5) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       recExt = recArr->At(2)->GetName();\r
-       if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       double val = recExt.Atof();\r
-       UInt_t pattern = 0;\r
-       for (irec=3;irec<nrecElems;irec++) { // read params to constraint\r
-         recExt = recArr->At(irec)->GetName();\r
-         if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-         int parid = recExt.Atoi();\r
-         if (parid<kMaxITSSensID) pattern |= 0x1 << recExt.Atoi();\r
-         else break;           // list of params is over \r
-       }\r
-       if (stopped) break;\r
-       //\r
-       Bool_t meanC;\r
-       if      (recOpt == "MEAN")   meanC = kTRUE;\r
-       else if (recOpt == "MEDIAN") meanC = kFALSE;\r
-       else    {stopped = kTRUE; break;}\r
-       //\r
-       int curID = -1;\r
-       int rangeStart = -1;\r
-       for (;irec<nrecElems;irec++) { // read modules to apply this constraint\r
-         recExt = recArr->At(irec)->GetName();\r
-         if (recExt == "-") {rangeStart = curID; continue;}  // range is requested\r
-         else if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-         else curID = recExt.Atoi();\r
-         //\r
-         if (curID<=kMaxITSSensID) curID = GetModuleVolumeID(curID);\r
-         // this was a range start or single \r
-         int start;\r
-         if (rangeStart>=0) {start = rangeStart+1; rangeStart=-1;} // continue the range\r
-         else start = curID;  // create constraint either for single module (or 1st in the range)\r
-         for (int id=start;id<=curID;id++) {\r
-           int id0 = IsVIDDefined(id);\r
-           if (id0<0) {AliDebug(3,Form("Undefined module %d requested in the SubUnits constraint, skipping",id)); continue;}\r
-           if (meanC) ConstrainModuleSubUnitsMean(id0,val,pattern);\r
-           else       ConstrainModuleSubUnitsMedian(id0,val,pattern);\r
-         }\r
-       }\r
-       if (rangeStart>=0) stopped = kTRUE; // unfinished range\r
-       if (stopped) break;\r
-      } \r
-      // \r
-      // association of modules with local constraints\r
-      else if (recTitle == kRecKeys[ kApplyConstr ]) {            //------------------------\r
-       // expect APPLY_CONSTRAINT NAME [NAME1...] [VolID1 ... VolIDn - VolIDm]\r
-       if (nrecElems<3) {stopped = kTRUE; break;}\r
-       int nmID0=-1,nmID1=-1;\r
-       for (irec=1;irec<nrecElems;irec++) { // find the range of constraint names\r
-         recExt = recArr->At(irec)->GetName();\r
-         if (recExt.IsFloat()) break;\r
-         // check if such a constraint was declared\r
-         if (!GetConstraint(recExt.Data())) {\r
-           AliInfo(Form("No Local constraint %s was declared",recExt.Data())); \r
-           stopped=kTRUE; \r
-           break;\r
-         }\r
-         if (nmID0<0) nmID0 = irec;\r
-         nmID1 = irec;\r
-       }\r
-       if (stopped) break;\r
-       //\r
-       if (irec>=nrecElems) {stopped = kTRUE; break;} // no modules provided\r
-       //\r
-       // now read the list of modules to constrain\r
-       int curID = -1;\r
-       int rangeStart = -1;\r
-       for (;irec<nrecElems;irec++) { // read modules to apply this constraint\r
-         recExt = recArr->At(irec)->GetName();\r
-         if (recExt == "-") {rangeStart = curID; continue;}  // range is requested\r
-         else if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}\r
-         else curID = recExt.Atoi();\r
-         //\r
-         if (curID<=kMaxITSSensID) curID = GetModuleVolumeID(curID);\r
-         //\r
-         // this was a range start or single \r
-         int start;\r
-         if (rangeStart>=0) {start = rangeStart+1; rangeStart=-1;} // continue the range\r
-         else start = curID;  // create constraint either for single module (or 1st in the range)\r
-         for (int id=start;id<=curID;id++) {\r
-           AliITSAlignMille2Module *md = GetMilleModuleByVID(id);\r
-           if (!md) {AliDebug(3,Form("Undefined module %d requested in the Local constraint, skipping",id)); continue;}\r
-           for (int nmid=nmID0;nmid<=nmID1;nmid++) \r
-             ((AliITSAlignMille2ConstrArray*)GetConstraint(recArr->At(nmid)->GetName()))->AddModule(md);\r
-         }\r
-       }\r
-       if (rangeStart>=0) stopped = kTRUE; // unfinished range\r
-       if (stopped) break;\r
-      }\r
-      //\r
-      else continue; // already processed record\r
-      //\r
-    } // end of while loop 4 over the various params \r
-    //\r
-    break;\r
-  } // end of while(1) loop \r
-  //\r
-  fclose(pfc);\r
-  if (stopped) {\r
-    AliError(Form("Failed on record %s %s ...\n",recTitle.Data(),recOpt.Data()));\r
-    return -1;\r
-  }\r
-  //\r
-  fIsConfigured = kTRUE;\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::BuildHierarchy()\r
-{\r
-  // build the hieararhy of the modules to align\r
-  //\r
-  if (!GetUseGlobalDelta() && PseudoParentsAllowed()) {\r
-    AliInfo("PseudoParents mode is allowed only when the deltas are global\n"\r
-           "Since Deltas are local, switching to NoPseudoParents");\r
-    SetAllowPseudoParents(kFALSE);\r
-  }\r
-  // set parent/child relationship for modules to align\r
-  AliInfo("Setting parent/child relationships\n");\r
-  //\r
-  // 1) child -> parent reference\r
-  for (int ipar=0;ipar<fNModules;ipar++) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* parent = GetMilleModule(ipar);\r
-    if (parent->IsSensor()) continue; // sensor cannot be a parent\r
-    //\r
-    for (int icld=0;icld<fNModules;icld++) {\r
-      if (icld==ipar) continue;\r
-      AliITSAlignMille2Module* child = GetMilleModule(icld);\r
-      if (!child->BelongsTo(parent)) continue;\r
-      // child cannot have more sensors than the parent\r
-      if (child->GetNSensitiveVolumes() > parent->GetNSensitiveVolumes()) continue;\r
-      //\r
-      AliITSAlignMille2Module* parOld = child->GetParent();\r
-      // is this parent candidate closer than the old parent ? \r
-      if (parOld && parOld->GetNSensitiveVolumes()<parent->GetNSensitiveVolumes()) continue; // parOld is closer\r
-      child->SetParent(parent);\r
-    }\r
-    //\r
-  }\r
-  //\r
-  // add parent -> children reference\r
-  for (int icld=0;icld<fNModules;icld++) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* child = GetMilleModule(icld);\r
-    AliITSAlignMille2Module* parent = child->GetParent();\r
-    if (parent) parent->AddChild(child);\r
-  }  \r
-  //\r
-  // reorder the modules in such a way that parents come first\r
-  for (int icld=0;icld<fNModules;icld++) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* child  = GetMilleModule(icld);\r
-    AliITSAlignMille2Module* parent; \r
-    while ( (parent=child->GetParent()) &&  (parent->GetUniqueID()>child->GetUniqueID()) ) {\r
-      // swap\r
-      fMilleModule[icld] = parent;\r
-      fMilleModule[parent->GetUniqueID()] = child;\r
-      child->SetUniqueID(parent->GetUniqueID());\r
-      parent->SetUniqueID(icld);\r
-      child = parent;\r
-    }\r
-    //\r
-  }  \r
-  //\r
-  // Go over the child->parent chain and mark modules with explicitly provided sensors.\r
-  // If the sensors of the unit are explicitly declared, all undeclared sensors are \r
-  // suppresed in this unit.\r
-  for (int icld=fNModules;icld--;) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* child = GetMilleModule(icld);\r
-    AliITSAlignMille2Module* parent = child->GetParent();\r
-    if (!parent) continue;\r
-    //\r
-    // check if this parent was already processed\r
-    if (!parent->AreSensorsProvided()) {\r
-      parent->DelSensitiveVolumes();\r
-      parent->SetSensorsProvided(kTRUE);\r
-    }\r
-    // reattach sensors to parent\r
-    for (int isc=child->GetNSensitiveVolumes();isc--;) {\r
-      UShort_t senVID = child->GetSensVolVolumeID(isc);\r
-      if (!parent->IsIn(senVID)) parent->AddSensitiveVolume(senVID);\r
-    }\r
-  }\r
-  //\r
-}\r
-\r
-// pepo\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::SetCurrentModule(Int_t id)\r
-{\r
-  // set the current supermodule\r
-  // new meaning\r
-  if (fMilleVersion>=2) {\r
-    fCurrentModule = GetMilleModule(id);\r
-    return;\r
-  }\r
-  // old meaning\r
-  if (fMilleVersion<=1) {\r
-    Int_t index=id;\r
-    /// set as current the SuperModule that contains the 'index' sens.vol.\r
-    if (index<0 || index>2197) {\r
-      AliInfo("index does not correspond to a sensitive volume!");\r
-      return;\r
-    }\r
-    UShort_t voluid=AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(index);\r
-    Int_t k=IsContained(voluid);\r
-    if (k>=0){\r
-      fCluster.SetVolumeID(voluid);\r
-      fCluster.SetXYZ(0,0,0);\r
-      InitModuleParams();\r
-    }\r
-    else\r
-      AliInfo(Form("module %d not defined\n",index));    \r
-  }\r
-}\r
-// endpepo\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::SetRequiredPoint(Char_t* where, Int_t ndet, Int_t updw, Int_t nreqpts) \r
-{\r
-  // set minimum number of points in specific detector or layer\r
-  // where = LAYER or DETECTOR\r
-  // ndet = detector number: 1-6 for LAYER and 1-3 for DETECTOR (SPD=1, SDD=2, SSD=3)\r
-  // updw = 1 for Y>0, -1 for Y<0, 0 if not specified\r
-  // nreqpts = minimum number of points of that type\r
-  ndet--;\r
-  if (strstr(where,"LAYER")) {\r
-    if (ndet<0 || ndet>5) return;\r
-    if (updw>0) fNReqLayUp[ndet]=nreqpts;\r
-    else if (updw<0) fNReqLayDown[ndet]=nreqpts;\r
-    else fNReqLay[ndet]=nreqpts;\r
-    fRequirePoints=kTRUE;\r
-  }\r
-  else if (strstr(where,"DETECTOR")) {\r
-    if (ndet<0 || ndet>2) return;\r
-    if (updw>0) fNReqDetUp[ndet]=nreqpts;\r
-    else if (updw<0) fNReqDetDown[ndet]=nreqpts;\r
-    else fNReqDet[ndet]=nreqpts;       \r
-    fRequirePoints=kTRUE;\r
-  }\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::GetModuleIndex(const Char_t *symname) \r
-{\r
-  /// index from symname\r
-  if (!symname) return -1;\r
-  for (Int_t i=0;i<=kMaxITSSensID; i++) {\r
-    if (!strcmp(symname,AliITSgeomTGeo::GetSymName(i))) return i;\r
-  }\r
-  return -1;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::GetModuleIndex(UShort_t voluid) \r
-{\r
-  /// index from volume ID\r
-  AliGeomManager::ELayerID lay = AliGeomManager::VolUIDToLayer(voluid);\r
-  if (lay<1|| lay>6) return -1;\r
-  Int_t idx=Int_t(voluid)-2048*lay;\r
-  if (idx>=AliGeomManager::LayerSize(lay)) return -1;\r
-  for (Int_t ilay=1; ilay<lay; ilay++) \r
-    idx += AliGeomManager::LayerSize(ilay);\r
-  return idx;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-UShort_t AliITSAlignMille2::GetModuleVolumeID(const Char_t *symname) \r
-{\r
-  /// volume ID from symname\r
-  /// works for sensitive volumes only\r
-  if (!symname) return 0;\r
-\r
-  for (UShort_t voluid=2000; voluid<13300; voluid++) {\r
-    Int_t modId;\r
-    AliGeomManager::ELayerID layerId = AliGeomManager::VolUIDToLayer(voluid,modId);\r
-    if (layerId>0 && layerId<7 && modId>=0 && modId<AliGeomManager::LayerSize(layerId)) {\r
-      if (!strcmp(symname,AliGeomManager::SymName(layerId,modId))) return voluid;\r
-    }\r
-  }\r
-\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-UShort_t AliITSAlignMille2::GetModuleVolumeID(Int_t index) \r
-{\r
-  /// volume ID from index\r
-  if (index<0) return 0;\r
-  if (index<2198)\r
-    return GetModuleVolumeID(AliITSgeomTGeo::GetSymName(index));\r
-  else {\r
-    for (int i=0; i<fNSuperModules; i++) {\r
-      if (GetSuperModule(i)->GetIndex()==index) return GetSuperModule(i)->GetVolumeID();\r
-    }\r
-  }\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::InitGeometry() \r
-{\r
-  /// initialize geometry\r
-  AliInfo("Loading initial geometry");\r
-  AliGeomManager::LoadGeometry(fGeometryFileName.Data());\r
-  fGeoManager = AliGeomManager::GetGeometry();\r
-  if (!fGeoManager) {\r
-    AliInfo("Couldn't initialize geometry");\r
-    return -1;\r
-  }\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::SetConstraintWrtRef(const char* reffname) \r
-{\r
-  // Load the global deltas from this file. The local gaussian constraints on some modules \r
-  // will be defined with respect to the deltas from this reference file, converted to local\r
-  // delta format. Note: conversion to local format requires reloading the geometry!\r
-  //\r
-  AliInfo(Form("Loading reference deltas for local constraints from %s",reffname));\r
-  if (!fGeoManager) return -1; \r
-  fConstrRefFileName = reffname;\r
-  if (fConstrRefFileName == "IDEAL") { // the reference is the ideal geometry, just create dummy reference array\r
-    fConstrRef = new TClonesArray("AliAlignObjParams",1);\r
-    return 0;\r
-  }\r
-  TFile *pref = TFile::Open(fConstrRefFileName.Data());\r
-  if (!pref->IsOpen()) return -2;   \r
-  fConstrRef = (TClonesArray*)pref->Get("ITSAlignObjs");\r
-  pref->Close();\r
-  delete pref;\r
-  if (!fConstrRef) {\r
-    AliError(Form("Did not find reference prealignment deltas in %s",reffname));\r
-    return -1;\r
-  }\r
-  //\r
-  // we need ideal geometry to convert global deltas to local ones\r
-  if (fUsePreAlignment) {\r
-    AliError("The call of SetConstraintWrtRef must be done before application of the prealignment");\r
-    return -1;\r
-  }\r
-  //\r
-  AliInfo("Converting global reference deltas to local ones");\r
-  Int_t nprea = fConstrRef->GetEntriesFast();\r
-  for (int ix=0; ix<nprea; ix++) {\r
-    AliAlignObjParams *preo=(AliAlignObjParams*) fConstrRef->At(ix);\r
-    if (!preo->ApplyToGeometry()) return -1;\r
-  }\r
-  //\r
-  // now convert the global reference deltas to local ones\r
-  for (int i=fConstrRef->GetEntriesFast();i--;) {\r
-    AliAlignObjParams *preo = (AliAlignObjParams*)fConstrRef->At(i);\r
-    TGeoHMatrix * mupd = AliGeomManager::GetMatrix(preo->GetSymName());\r
-    if (!mupd) {  // this is not alignable entry, need to look in the supermodules\r
-      for (int im=fNSuperModules;im--;) {\r
-       AliITSAlignMille2Module* mod = GetSuperModule(im);\r
-       if ( strcmp(mod->GetName(), preo->GetSymName()) ) continue;\r
-       mupd = mod->GetMatrix();\r
-       break;\r
-      }\r
-      if (!mupd) {\r
-       AliError(Form("Failed to find the volume for reference %s",preo->GetSymName()));\r
-       return -1;\r
-      }\r
-    } \r
-    TGeoHMatrix preMat;\r
-    preo->GetMatrix(preMat);                     //  Delta_Glob\r
-    TGeoHMatrix tmpMat    = *mupd;               //  Delta_Glob * Delta_Glob_Par * M\r
-    preMat.MultiplyLeft( &tmpMat.Inverse() );    //  M^-1 * Delta_Glob_Par^-1 = (Delta_Glob_Par * M)^-1\r
-    tmpMat.MultiplyLeft( &preMat );              //  (Delta_Glob_Par * M)^-1 * Delta_Glob * Delta_Glob_Par * M = Delta_loc\r
-    preo->SetMatrix(tmpMat);     // local corrections \r
-  }\r
-  //\r
-  // we need to reload the geometry spoiled by this reference deltas...\r
-  delete fGeoManager;\r
-  AliInfo("Reloading initial geometry");\r
-  AliGeomManager::LoadGeometry(fGeometryFileName.Data());\r
-  fGeoManager = AliGeomManager::GetGeometry();\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::Init()\r
-{\r
-  // perform global initialization\r
-  //\r
-  if (fIsMilleInit) {\r
-    AliInfo("Millepede has been already initialized!");\r
-    return;\r
-  }\r
-  // range constraints in such a way that the childs are constrained before their parents\r
-  // orphan constraints come last\r
-  for (int ic=0;ic<GetNConstraints();ic++) {\r
-    for (int ic1=ic+1;ic1<GetNConstraints();ic1++) {\r
-      AliITSAlignMille2Constraint *cst0 = GetConstraint(ic);\r
-      AliITSAlignMille2Constraint *cst1 = GetConstraint(ic1);\r
-      if (cst0->GetModuleID()<cst1->GetModuleID()) {\r
-       // swap\r
-       fConstraints[ic] = cst1;\r
-       fConstraints[ic1] = cst0;\r
-      }\r
-    }\r
-  }\r
-  //\r
-  if (!GetUseGlobalDelta()) {\r
-    AliInfo("ATTENTION: The parameters are defined in the local frame, no check for degeneracy will be done");\r
-    for (int imd=fNModules;imd--;) {\r
-      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);\r
-      int npar = mod->GetNParTot();\r
-      // the parameter may have max 1 free instance, otherwise the equations are underdefined\r
-      for (int ipar=0;ipar<npar;ipar++) {\r
-       if (!mod->IsFreeDOF(ipar)) continue;\r
-       mod->SetParOffset(ipar,fNGlobal++);\r
-      }\r
-    }\r
-  }\r
-  else {\r
-    // init millepede, decide which parameters are to be fitted explicitly\r
-    for (int imd=fNModules;imd--;) {\r
-      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);\r
-      int npar = mod->GetNParTot();\r
-      // the parameter may have max 1 free instance, otherwise the equations are underdefined\r
-      for (int ipar=0;ipar<npar;ipar++) {\r
-       if (!mod->IsFreeDOF(ipar)) continue;  // fixed\r
-       //\r
-       int nFreeInstances = 0;\r
-       //\r
-       AliITSAlignMille2Module* parent = mod;\r
-       Bool_t cstMeanMed=kFALSE,cstGauss=kFALSE;\r
-       //\r
-       Bool_t addToFit = kFALSE;       \r
-       // the parameter may be ommitted from explicit fit (if PseudoParentsAllowed is true) if\r
-       // 1) it is not explicitly constrained or its does not participate in Gaussian constraint\r
-       // 2) the same applies to all of its parents\r
-       // 3) it has at least 1 unconstrained direct child\r
-       while(parent) {\r
-         if (!parent->IsFreeDOF(ipar)) {parent = parent->GetParent(); continue;}\r
-         nFreeInstances++;\r
-         if (IsParModConstrained(parent,ipar, cstMeanMed, cstGauss)) nFreeInstances--;\r
-         if (cstGauss) addToFit = kTRUE;\r
-         parent = parent->GetParent();\r
-       }\r
-       if (nFreeInstances>1) {\r
-         AliError(Form("Parameter#%d of module %s\nhas %d free instances in the "\r
-                       "unconstrained parents\nSystem is undefined",ipar,mod->GetName(),nFreeInstances));\r
-         exit(1);\r
-       }\r
-       //\r
-       // i) Are PseudoParents allowed?\r
-       if (!PseudoParentsAllowed()) addToFit = kTRUE;\r
-       // ii) check if this module has no child with such a free parameter. Since the order of this check \r
-       // goes from child to parent, by this moment such a parameter must have been already added\r
-       else if (!IsParModFamilyVaried(mod,ipar))  addToFit = kTRUE;  // no varied children at all\r
-       else if (!IsParFamilyFree(mod,ipar,1))     addToFit = kTRUE;  // no unconstrained direct children\r
-       // otherwise the value of this parameter can be extracted from simple contraint and the values of \r
-       // the relevant parameters of its children the fit is done. Hence it is not included\r
-       if (!addToFit) continue;\r
-       //\r
-       // shall add this parameter to explicit fit\r
-       //      printf("Adding %s %d -> %d\n",mod->GetName(), ipar, fNGlobal);\r
-       mod->SetParOffset(ipar,fNGlobal++);\r
-      }\r
-    }\r
-  }\r
-  //\r
-  AliInfo(Form("Initializing Millepede with %d gpar, %d lpar and %d stddev ...",fNGlobal, fNLocal, fNStdDev));\r
-  fGlobalDerivatives = new Double_t[fNGlobal];\r
-  memset(fGlobalDerivatives,0,fNGlobal*sizeof(Double_t));\r
-  //\r
-  fMillepede->InitMille(fNGlobal,fNLocal,fNStdDev,fResCut,fResCutInitial);\r
-  fIsMilleInit = kTRUE;\r
-  //\r
-  ResetLocalEquation();    \r
-  AliInfo("Parameters initialized to zero");\r
-  //\r
-  /// Fix non free parameters\r
-  for (Int_t i=0; i<fNModules; i++) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(i);\r
-    for (Int_t j=0; j<mod->GetNParTot(); j++) {\r
-      if (mod->GetParOffset(j)<0) continue; // not varied\r
-      FixParameter(mod->GetParOffset(j),mod->GetParConstraint(j));\r
-      fMillepede->SetParamGrID(i, mod->GetParOffset(j));\r
-    }\r
-  }\r
-  //\r
-  // Set iterations\r
-  if (fStartFac>1) fMillepede->SetIterations(fStartFac);    \r
-  //\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::AddConstraint(Double_t *par, Double_t value, Double_t sigma) \r
-{\r
-  /// Constrain equation defined by par to value\r
-  if (!fIsMilleInit) Init();\r
-  fMillepede->SetGlobalConstraint(par, value, sigma);\r
-  AliInfo("Adding constraint");\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::InitGlobalParameters(Double_t *par) \r
-{\r
-  /// Initialize global parameters with par array\r
-  if (!fIsMilleInit) Init();\r
-  fMillepede->SetGlobalParameters(par);\r
-  AliInfo("Init Global Parameters");\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________ \r
-void AliITSAlignMille2::FixParameter(Int_t iPar, Double_t value) \r
-{\r
-  /// Parameter iPar is encourage to vary in [-value;value]. \r
-  /// If value == 0, parameter is fixed\r
-  if (!fIsMilleInit) {\r
-    AliInfo("Millepede has not been initialized!");\r
-    return;\r
-  }\r
-  fMillepede->SetParSigma(iPar, value);\r
-  if (value==0) AliInfo(Form("Parameter %i Fixed", iPar));\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ResetLocalEquation()\r
-{\r
-  /// Reset the derivative vectors\r
-  for(int i=fNLocal;i--;)  fLocalDerivatives[i] = 0.0;\r
-  memset(fGlobalDerivatives, 0, fNGlobal*sizeof(double) );\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::ApplyToGeometry() \r
-{\r
-  // apply starting realignment to ideal geometry\r
-  AliInfo(Form("Using %s for prealignment",fPreAlignmentFileName.Data()));\r
-  if (!fGeoManager) return -1; \r
-  TFile *pref = TFile::Open(fPreAlignmentFileName.Data());\r
-  if (!pref->IsOpen()) return -2;\r
-  fPrealignment = (TClonesArray*)pref->Get("ITSAlignObjs");\r
-  if (!fPrealignment) return -3;  \r
-  Int_t nprea = fPrealignment->GetEntriesFast();\r
-  AliInfo(Form("Array of input misalignments with %d entries",nprea));\r
-  //\r
-  for (int ix=0; ix<nprea; ix++) {\r
-    AliAlignObjParams *preo=(AliAlignObjParams*) fPrealignment->At(ix);\r
-    Int_t index=AliITSAlignMille2Module::GetIndexFromVolumeID(preo->GetVolUID());\r
-    if (index>=0) {\r
-      if (index>=fPreAlignQF.GetSize()) fPreAlignQF.Set(index+10);\r
-      fPreAlignQF[index] = (int) preo->GetUniqueID()+1;\r
-    }\r
-    //TString nms = preo->GetSymName();\r
-    //if (!nms.Contains("Ladder")) continue; //RRR\r
-    //printf("Applying#%4d %s\n",ix,preo->GetSymName());\r
-    if (!preo->ApplyToGeometry()) return -4;\r
-  }\r
-  //\r
-  pref->Close();\r
-  delete pref;\r
-  //\r
-  fUsePreAlignment = kTRUE;\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::GetPreAlignmentQualityFactor(Int_t index) const\r
-{\r
-  // quality factors from prealignment\r
-  if (!fUsePreAlignment || index<0 || index>=fPreAlignQF.GetSize()) return -1;\r
-  return fPreAlignQF[index]-1;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-AliTrackPointArray *AliITSAlignMille2::PrepareTrack(const AliTrackPointArray *atp) \r
-{\r
-  /// create a new AliTrackPointArray keeping only defined modules\r
-  /// move points according to a given prealignment, if any\r
-  /// sort alitrackpoints w.r.t. global Y direction, if selected\r
-  const double kTiny = 1E-12;\r
-  //\r
-  AliTrackPointArray *atps=NULL;\r
-  Int_t idx[20];\r
-  Int_t npts=atp->GetNPoints();\r
-\r
-  /// checks if AliTrackPoints belong to defined modules\r
-  Int_t ngoodpts=0;\r
-  Int_t intidx[20];\r
-  \r
-  for (int j=0; j<npts; j++) {\r
-    intidx[j] = IsVIDContained(atp->GetVolumeID()[j]);\r
-    if (intidx[j]>=0) ngoodpts++;\r
-  }\r
-  AliDebug(3,Form("Number of points in defined modules: %d out of %d",ngoodpts,npts));\r
-\r
-  // reject track if not enough points are left\r
-  if (ngoodpts<fMinNPtsPerTrack) {\r
-    AliInfo("Track with not enough points!");\r
-    return NULL;\r
-  }\r
-  // >> RS\r
-  AliTrackPoint p;\r
-  // check points in specific places\r
-  if (fRequirePoints) {\r
-    Int_t nlayup[6],nlaydown[6],nlay[6];\r
-    Int_t ndetup[3],ndetdown[3],ndet[3];\r
-    for (Int_t j=0; j<6; j++) {nlayup[j]=0; nlaydown[j]=0; nlay[j]=0;}\r
-    for (Int_t j=0; j<3; j++) {ndetup[j]=0; ndetdown[j]=0; ndet[j]=0;}\r
-    \r
-    for (int i=0; i<npts; i++) {\r
-      // skip not defined points\r
-      if (intidx[i]<0) continue;\r
-      Float_t xx=atp->GetX()[i];\r
-      Float_t yy=atp->GetY()[i];\r
-      Float_t r=TMath::Sqrt(xx*xx + yy*yy);\r
-      int lay=-1;\r
-      if (r<5) lay=0;\r
-      else if (r>5 && r<10) lay=1;\r
-      else if (r>10 && r<18) lay=2;\r
-      else if (r>18 && r<30) lay=3;\r
-      else if (r>30 && r<40) lay=4;\r
-      else if (r>40) lay=5;\r
-      if (lay<0) continue;\r
-      int det=lay/2;\r
-      //printf("Point %d - x=%f  y=%f  R=%f  lay=%d  det=%d\n",i,xx,yy,r,lay,det);\r
-\r
-      if (yy>=0.0) { // UP point\r
-       nlayup[lay]++;\r
-       nlay[lay]++;\r
-       ndetup[det]++;\r
-       ndet[det]++;\r
-      }\r
-      else {\r
-       nlaydown[lay]++;\r
-       nlay[lay]++;\r
-       ndetdown[det]++;\r
-       ndet[det]++;\r
-      }\r
-    }\r
-    \r
-    // checks minimum values\r
-    Bool_t isok=kTRUE;\r
-    for (Int_t j=0; j<6; j++) {\r
-      if (nlayup[j]<fNReqLayUp[j]) isok=kFALSE; \r
-      if (nlaydown[j]<fNReqLayDown[j]) isok=kFALSE; \r
-      if (nlay[j]<fNReqLay[j]) isok=kFALSE; \r
-    }\r
-    for (Int_t j=0; j<3; j++) {\r
-      if (ndetup[j]<fNReqDetUp[j]) isok=kFALSE; \r
-      if (ndetdown[j]<fNReqDetDown[j]) isok=kFALSE; \r
-      if (ndet[j]<fNReqDet[j]) isok=kFALSE; \r
-    }\r
-    if (!isok) {\r
-      AliDebug(2,Form("Track does not meet all location point requirements!"));\r
-      return NULL;\r
-    }\r
-  }\r
-  // build a new track with (sorted) (prealigned) good points\r
-  // pepo 200709\r
-//   atps = (AliTrackPointArray*)fTrackBuff[ngoodpts-fMinNPtsPerTrack];\r
-//   if (!atps) {\r
-//     atps = new AliTrackPointArray(ngoodpts);\r
-//     fTrackBuff.AddAtAndExpand(atps,ngoodpts-fMinNPtsPerTrack);\r
-//   }  \r
-  atps = new AliTrackPointArray(ngoodpts);\r
-  // endpepo200709\r
-  //\r
-  //\r
-  for (int i=0; i<npts; i++) idx[i]=i;\r
-  // sort track if required\r
-  TMath::Sort(npts,atp->GetY(),idx); // sort descending...\r
-  //\r
-  Int_t npto=0;\r
-  for (int i=0; i<npts; i++) {\r
-    // skip not defined points\r
-    if (intidx[idx[i]]<0) continue;\r
-    atp->GetPoint(p,idx[i]);\r
-\r
-    // prealign point if required\r
-    // get IDEAL matrix\r
-    AliITSAlignMille2Module *mod = GetMilleModule(intidx[idx[i]]);\r
-    TGeoHMatrix *svOrigMatrix = mod->GetSensitiveVolumeOrigGlobalMatrix(p.GetVolumeID());\r
-    // get back real local coordinates: use OriginalGlobalMatrix because AliTrackPoints were written\r
-    // with idel geometry  \r
-    Double_t pg[3],pl[3];\r
-    pg[0]=p.GetX();\r
-    pg[1]=p.GetY();\r
-    pg[2]=p.GetZ();\r
-    //    printf("Global coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",pg[0],pg[1],pg[2]);\r
-    AliDebug(3,Form("Global coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",pg[0],pg[1],pg[2]));\r
-    svOrigMatrix->MasterToLocal(pg,pl);\r
-\r
-    AliDebug(3,Form("Local coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",pl[0],pl[1],pl[2]));\r
-    //\r
-    // this is a temporary code to extract the drift speed used for given point\r
-    if (p.GetDriftTime()>0) { // RRR\r
-      // calculate the drift speed\r
-      int sid = AliITSAlignMille2Module::GetIndexFromVolumeID(p.GetVolumeID());// - kSDDoffsID;\r
-      fDriftTime0[npto] = fInitialRecSDD ? fInitialRecSDD->GetTimeZero(sid) : 0.;\r
-      /*\r
-      AliGeomManager::ELayerID lay = AliGeomManager::VolUIDToLayer(p.GetVolumeID());\r
-      if      (lay==3) fDriftTime0[npto] = pg[2]<0 ? 169.5 : 140.1;\r
-      else if (lay==4) fDriftTime0[npto] = pg[2]<0 ? 158.3 : 139.0;\r
-      else {\r
-       AliError(Form("Strange layer %d for moduleID %d",lay,p.GetVolumeID()));\r
-       exit(1);\r
-      }\r
-      */\r
-      double tdif = p.GetDriftTime() - fDriftTime0[npto];\r
-      if (tdif<=0) tdif = 1;\r
-      double vdrift = (3.5085-TMath::Abs(pl[0]))/tdif;\r
-      if (vdrift<0) vdrift = 0;\r
-      //\r
-      // TEMPORARY CORRECTION (if provided) -------------->>>\r
-      if (fCorrectSDD) {\r
-       float t0Upd = fCorrectSDD->GetTimeZero(sid);\r
-       vdrift += fCorrectSDD->GetDeltaVDrift(sid);\r
-       tdif    = p.GetDriftTime() - t0Upd;\r
-       // correct Xlocal\r
-       pl[0] = TMath::Sign(3.5085 - vdrift*tdif,pl[0]);\r
-       fDriftTime0[npto] =  t0Upd;\r
-      }\r
-      // TEMPORARY CORRECTION (if provided) --------------<<<\r
-      fDriftSpeed[npto] = TMath::Sign(vdrift,pl[0]);\r
-      //\r
-      /*\r
-      printf("%d  %+6.2f %+6.2f %+6.2f  %+5.2f %+5.2f %+5.2f  %+6.1f  %+6.1f %+f %+f\n",\r
-            p.GetVolumeID(),pg[0],pg[1],pg[2],pl[0],pl[1],pl[2],p.GetDriftTime(), fDriftTime0[npto], fDriftSpeed[npto],tdif);\r
-      */\r
-    }\r
-\r
-    // update covariance matrix\r
-    TGeoHMatrix hcov;\r
-    Double_t hcovel[9];\r
-    hcovel[0]=double(p.GetCov()[0]);\r
-    hcovel[1]=double(p.GetCov()[1]);\r
-    hcovel[2]=double(p.GetCov()[2]);\r
-    hcovel[3]=double(p.GetCov()[1]);\r
-    hcovel[4]=double(p.GetCov()[3]);\r
-    hcovel[5]=double(p.GetCov()[4]);\r
-    hcovel[6]=double(p.GetCov()[2]);\r
-    hcovel[7]=double(p.GetCov()[4]);\r
-    hcovel[8]=double(p.GetCov()[5]);\r
-    hcov.SetRotation(hcovel);\r
-    // now rotate in local system\r
-    //    printf("\nErrMatGlob: before\n"); hcov.Print(""); //RRR\r
-    hcov.Multiply(svOrigMatrix);\r
-    hcov.MultiplyLeft(&svOrigMatrix->Inverse());\r
-    // now hcov is LOCAL COVARIANCE MATRIX\r
-    // apply sigma scaling\r
-    //    printf("\nErrMatLoc: before\n"); hcov.Print(""); //RRR\r
-    Double_t *hcovscl = hcov.GetRotationMatrix(); \r
-    //    for (int ir=3;ir--;) for (int ic=3;ic--;) hcovscl[ir*3+ic] *= mod->GetSigmaFactor(ir)*mod->GetSigmaFactor(ic); //RRR\r
-    // RS TEMPORARY: nullify non-diagonal elements and sigY\r
-    hcovscl[5] = 0;\r
-    for (int ir=3;ir--;) for (int ic=3;ic--;) {\r
-       if (ir==ic) {\r
-         if (TMath::Abs(hcovscl[ir*3+ic])<kTiny) hcovscl[ir*3+ic] = 0.;\r
-         else hcovscl[ir*3+ic] *= mod->GetSigmaFactor(ir)*mod->GetSigmaFactor(ic); //RRR\r
-       }\r
-       else hcovscl[ir*3+ic]  = 0;\r
-      }\r
-    //\r
-    //    printf("\nErrMatLoc: after\n"); hcov.Print(""); //RRR\r
-    //\r
-    if (fBug==1) {\r
-      // correzione bug LAYER 5  SSD temporanea..\r
-      int ssdidx=AliITSAlignMille2Module::GetIndexFromVolumeID(p.GetVolumeID());\r
-      if (ssdidx>=500 && ssdidx<1248) {\r
-       int ladder=(ssdidx-500)%22;\r
-       if (ladder==18) p.SetVolumeID(AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(ssdidx+1));\r
-       if (ladder==19) p.SetVolumeID(AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(ssdidx-1));\r
-      }\r
-    }\r
-    /// get (evenctually prealigned) matrix of sens. vol.\r
-    TGeoHMatrix *svMatrix = mod->GetSensitiveVolumeMatrix(p.GetVolumeID());\r
-    // modify global coordinates according with pre-aligment\r
-    svMatrix->LocalToMaster(pl,pg);\r
-    // now rotate in local system\r
-    hcov.Multiply(&svMatrix->Inverse());\r
-    hcov.MultiplyLeft(svMatrix);\r
-    // hcov is back in GLOBAL RF\r
-    // cure once more\r
-    for (int ir=3;ir--;) for (int ic=3;ic--;) if (TMath::Abs(hcovscl[ir*3+ic])<kTiny) hcovscl[ir*3+ic] = 0.;\r
-    //    printf("\nErrMatGlob: after\n"); hcov.Print(""); //RRR\r
-    //\r
-    Float_t pcov[6];\r
-    pcov[0]=hcovscl[0];\r
-    pcov[1]=hcovscl[1];\r
-    pcov[2]=hcovscl[2];\r
-    pcov[3]=hcovscl[4];\r
-    pcov[4]=hcovscl[5];\r
-    pcov[5]=hcovscl[8];\r
-\r
-    p.SetXYZ(pg[0],pg[1],pg[2],pcov);\r
-    //    printf("New Gl coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",pg[0],pg[1],pg[2]);\r
-    AliDebug(3,Form("New global coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",pg[0],pg[1],pg[2]));\r
-    atps->AddPoint(npto,&p);\r
-    AliDebug(2,Form("Adding point[%d] = ( %f , %f , %f )     volid = %d",npto,atps->GetX()[npto],\r
-                   atps->GetY()[npto],atps->GetZ()[npto],atps->GetVolumeID()[npto] ));\r
-    //    printf("Adding %d %d %f\n",npto, p.GetVolumeID(), p.GetY()); \r
-    npto++;\r
-  }\r
-\r
-  return atps;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-AliTrackPointArray *AliITSAlignMille2::SortTrack(const AliTrackPointArray *atp) \r
-{\r
-  /// sort alitrackpoints w.r.t. global Y direction\r
-  AliTrackPointArray *atps=NULL;\r
-  Int_t idx[20];\r
-  Int_t npts=atp->GetNPoints();\r
-  AliTrackPoint p;\r
-  atps=new AliTrackPointArray(npts);\r
-\r
-  TMath::Sort(npts,atp->GetY(),idx);\r
-\r
-  for (int i=0; i<npts; i++) {\r
-    atp->GetPoint(p,idx[i]);\r
-    atps->AddPoint(i,&p);\r
-    AliDebug(2,Form("Point[%d] = ( %f , %f , %f )     volid = %d",i,atps->GetX()[i],atps->GetY()[i],atps->GetZ()[i],atps->GetVolumeID()[i] ));\r
-  }\r
-  return atps;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::GetCurrentLayer() const \r
-{\r
-  // get current layer id\r
-  if (!fGeoManager) {\r
-    AliInfo("ITS geometry not initialized!");\r
-    return -1;\r
-  }\r
-  return (Int_t)AliGeomManager::VolUIDToLayer(fCluster.GetVolumeID());\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::InitModuleParams() \r
-{\r
-  /// initialize geometry parameters for a given detector\r
-  /// for current cluster (fCluster)\r
-  /// fGlobalInitParam[] is set as:\r
-  ///    [tx,ty,tz,psi,theta,phi]\r
-  ///    (old was [tx,ty,tz,theta,psi,phi] ROOT's angles...)\r
-  /// *** At the moment: using Raffalele's angles definition ***\r
-  ///\r
-  /// return 0 if success\r
-  /// If module is found but has no parameters to vary, return 1\r
-\r
-  if (!fGeoManager) {\r
-    AliInfo("ITS geometry not initialized!");\r
-    return -1;\r
-  }\r
-\r
-  // now 'voluid' is the volumeID of a SENSITIVE VOLUME (coming from a cluster)\r
-\r
-  // set the internal index (index in module list)\r
-  UShort_t voluid=fCluster.GetVolumeID();\r
-  //\r
-  // IT IS VERY IMPORTANT: start from the end of the list, where the childs are located !!!\r
-  Int_t k=fNModules-1;\r
-  fCurrentModule = 0;\r
-  // VERY IMPORTANT: if the sensors were explicitly provided, don't look in the supermodules  \r
-  while (k>=0 && ! (fCurrentModule=GetMilleModule(k))->IsIn(voluid)) k--;\r
-  if (k<0) return -3;\r
-  //\r
-  /*\r
-  // Check if the module has free params. If not, go over the parents\r
-  AliITSAlignMille2Module* mdtmp = fCurrentModule;\r
-  while (mdtmp && mdtmp->GetNParFree()==0) mdtmp = mdtmp->GetParent();\r
-  if (!mdtmp) return 1; // nothing to vary here\r
-  fCurrentModule = mdtmp;\r
-  */\r
-  //\r
-  fModuleInitParam[0] = 0.0;\r
-  fModuleInitParam[1] = 0.0;\r
-  fModuleInitParam[2] = 0.0;\r
-  fModuleInitParam[3] = 0.0; // psi   (X)\r
-  fModuleInitParam[4] = 0.0; // theta (Y)\r
-  fModuleInitParam[5] = 0.0; // phi   (Z)\r
-  fModuleInitParam[6] = 0.0;\r
-  fModuleInitParam[7] = 0.0;\r
-  /// get (evenctually prealigned) matrix of sens. vol.\r
-  TGeoHMatrix *svMatrix = fCurrentModule->GetSensitiveVolumeMatrix(voluid);\r
-  \r
-  fMeasGlo[0] = fCluster.GetX();\r
-  fMeasGlo[1] = fCluster.GetY();\r
-  fMeasGlo[2] = fCluster.GetZ(); \r
-  svMatrix->MasterToLocal(fMeasGlo,fMeasLoc);  \r
-  AliDebug(2,Form("Local coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",fMeasLoc[0] ,fMeasLoc[1] ,fMeasLoc[2] ));\r
-  \r
-  // set stdev from cluster\r
-  TGeoHMatrix hcov;\r
-  Double_t hcovel[9];\r
-  hcovel[0]=double(fCluster.GetCov()[0]);\r
-  hcovel[1]=double(fCluster.GetCov()[1]);\r
-  hcovel[2]=double(fCluster.GetCov()[2]);\r
-  hcovel[3]=double(fCluster.GetCov()[1]);\r
-  hcovel[4]=double(fCluster.GetCov()[3]);\r
-  hcovel[5]=double(fCluster.GetCov()[4]);\r
-  hcovel[6]=double(fCluster.GetCov()[2]);\r
-  hcovel[7]=double(fCluster.GetCov()[4]);\r
-  hcovel[8]=double(fCluster.GetCov()[5]);\r
-  hcov.SetRotation(hcovel);\r
-  // now rotate in local system\r
-  hcov.Multiply(svMatrix);\r
-  hcov.MultiplyLeft(&svMatrix->Inverse());\r
-  //\r
-  // set local sigmas\r
-  fSigmaLoc[0] = TMath::Sqrt(TMath::Abs(hcov.GetRotationMatrix()[0]));\r
-  fSigmaLoc[1] = TMath::Sqrt(TMath::Abs(hcov.GetRotationMatrix()[4])); // RS\r
-  fSigmaLoc[2] = TMath::Sqrt(TMath::Abs(hcov.GetRotationMatrix()[8]));\r
-\r
-  // set minimum value for SigmaLoc to 10 micron \r
-  if (fSigmaLoc[0]<0.0010) fSigmaLoc[0]=0.0010;\r
-  if (fSigmaLoc[2]<0.0010) fSigmaLoc[2]=0.0010;\r
-  //\r
-  /* RRR the rescaling is moved to PrepareTrack\r
-  // multiply local sigmas by global and module specific factor \r
-  for (int i=3;i--;) fSigmaLoc[i] *= fSigmaFactor[i]*fCurrentModule->GetSigmaFactor(i);\r
-  //\r
-  */\r
-  AliDebug(2,Form("Setting StDev from CovMat : fSigmaLocX=%g  fSigmaLocY=%g fSigmaLocZ=%g \n",fSigmaLoc[0] ,fSigmaLoc[1] ,fSigmaLoc[2] ));\r
-   \r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::Print(Option_t*) const \r
-{\r
-  // print current status \r
-  printf("*** AliMillepede for ITS ***\n");\r
-  printf("    Number of defined super modules: %d\n",fNModules);\r
-  printf("    Obtained parameters refer to %s Deltas\n",fUseGlobalDelta ? "GLOBAL":"LOCAL");\r
-  //\r
-  if (fGeoManager)\r
-    printf("    geometry loaded from %s\n",fGeometryFileName.Data());\r
-  else\r
-    printf("    geometry not loaded\n");\r
-  //  \r
-  if (fUsePreAlignment) \r
-    printf("    using prealignment from %s \n",fPreAlignmentFileName.Data());\r
-  else\r
-    printf("    prealignment not used\n");    \r
-  //\r
-  //\r
-  if (fBOn) \r
-    printf("    B Field set to %f T - using Riemann's helices\n",fBField);\r
-  else\r
-    printf("    B Field OFF - using straight lines \n");\r
-  //\r
-  if (fRequirePoints) printf("    Required points in tracks:\n");\r
-  for (Int_t i=0; i<6; i++) {\r
-    if (fNReqLayUp[i]>0) printf("        Layer %d : %d points with Y>0\n",i+1,fNReqLayUp[i]);\r
-    if (fNReqLayDown[i]>0) printf("        Layer %d : %d points with Y<0\n",i+1,fNReqLayDown[i]);\r
-    if (fNReqLay[i]>0) printf("        Layer %d : %d points \n",i+1,fNReqLay[i]);\r
-  }\r
-  for (Int_t i=0; i<3; i++) {\r
-    if (fNReqDetUp[i]>0) printf("        Detector %d : %d points with Y>0\n",i+1,fNReqDetUp[i]);\r
-    if (fNReqDetDown[i]>0) printf("        Detector %d : %d points with Y<0\n",i+1,fNReqDetDown[i]);\r
-    if (fNReqDet[i]>0) printf("        Detector %d : %d points \n",i+1,fNReqDet[i]);\r
-  }\r
-  //  \r
-  printf("\n    Millepede configuration parameters:\n");\r
-  printf("        init value for chi2 cut       : %.4f\n",fStartFac);\r
-  printf("        first iteration cut value     : %.4f\n",fResCutInitial);\r
-  printf("        other iterations cut value    : %.4f\n",fResCut);\r
-  printf("        number of stddev for chi2 cut : %d\n",fNStdDev);\r
-  printf("        def.scaling for local sigmas  : %.4f %.4f %.4f\n",fSigmaFactor[0],fSigmaFactor[1],fSigmaFactor[2]);\r
-\r
-  printf("List of defined modules:\n");\r
-  printf("  intidx\tindex\tvoluid\tname\n");\r
-  for (int i=0; i<fNModules; i++) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* md = GetMilleModule(i); \r
-    printf("  %d\t%d\t%d\t%s\n",i,md->GetIndex(),md->GetVolumeID(),md->GetName());\r
-  }\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-AliITSAlignMille2Module  *AliITSAlignMille2::GetMilleModuleByVID(UShort_t voluid) const\r
-{\r
-  // return pointer to a defined supermodule\r
-  // return NULL if error\r
-  Int_t i=IsVIDDefined(voluid);\r
-  if (i<0) return NULL;\r
-  return GetMilleModule(i);\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-AliITSAlignMille2Module  *AliITSAlignMille2::GetMilleModuleBySymName(const Char_t* symname) const\r
-{\r
-  // return pointer to a defined supermodule\r
-  // return NULL if error\r
-  UShort_t vid = AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromSymname(symname);\r
-  if (vid>0) return GetMilleModuleByVID(vid);\r
-  else {    // this is not alignable module, need to look within defined supermodules\r
-    int i = IsSymDefined(symname);\r
-    if (i>=0) return  GetMilleModule(i);\r
-  }\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-AliITSAlignMille2Module  *AliITSAlignMille2::GetMilleModuleIfContained(const Char_t* symname) const\r
-{\r
-  // return pointer to a defined/contained supermodule\r
-  // return NULL otherwise\r
-  int i = IsSymContained(symname);\r
-  return i<0 ? 0 : GetMilleModule(i);\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-AliAlignObjParams* AliITSAlignMille2::GetPrealignedObject(const Char_t* symname) const\r
-{\r
-  // get delta from prealignment for given volume\r
-  if (!fPrealignment) return 0;\r
-  for (int ipre=fPrealignment->GetEntriesFast();ipre--;) { // was the corresponding object prealigned?\r
-    AliAlignObjParams* preob = (AliAlignObjParams*)fPrealignment->At(ipre);\r
-    if (!strcmp(preob->GetSymName(),symname)) return preob;\r
-  }\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-AliAlignObjParams* AliITSAlignMille2::GetConstrRefObject(const Char_t* symname) const\r
-{\r
-  // get delta with respect to which the constraint is declared\r
-  if (!fConstrRef) return 0;\r
-  for (int ipre=fConstrRef->GetEntriesFast();ipre--;) { // was the corresponding object prealigned?\r
-    AliAlignObjParams* preob = (AliAlignObjParams*)fConstrRef->At(ipre);\r
-    if (!strcmp(preob->GetSymName(),symname)) return preob;\r
-  }\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Bool_t AliITSAlignMille2::InitRiemanFit() \r
-{\r
-  // Initialize Riemann Fitter for current track\r
-  // return kFALSE if error\r
-\r
-  if (!fBOn) return kFALSE;\r
-\r
-  Int_t npts=0;\r
-  AliTrackPoint ap;\r
-  npts = fTrack->GetNPoints();\r
-  AliDebug(3,Form("Fitting track with %d points",npts));\r
-\r
-  fRieman->Reset();\r
-  fRieman->SetTrackPointArray(fTrack);\r
-\r
-  TArrayI ai(npts);\r
-  for (Int_t ipt=0; ipt<npts; ipt++) ai[ipt]=fTrack->GetVolumeID()[ipt];\r
-  \r
-  // fit track with 5 params in his own tracking-rotated reference system\r
-  // xc = -p[1]/p[0];\r
-  // yc = 1/p[0];\r
-  // R  = sqrt( x0*x0 + y0*y0 - y0*p[2]);\r
-  if (!fRieman->Fit(&ai,NULL,(AliGeomManager::ELayerID)1,(AliGeomManager::ELayerID)6)) {\r
-    return kFALSE;\r
-  }\r
-\r
-  for (int i=0; i<5; i++)\r
-    fLocalInitParam[i] = fRieman->GetParam()[i];\r
-  \r
-  return kTRUE;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void trackFit2D(Int_t &, Double_t *, double &chi2, double *par, int flag)\r
-{\r
-  // local function for minuit\r
-  const double kTiny = 1.e-14;\r
-  chi2 = 0;\r
-  static AliTrackPoint pnt;\r
-  static Bool_t fullErr2D;\r
-  //\r
-  if (flag==1) fullErr2D = kFALSE;//kTRUE;\r
-  enum {kAX,kAZ,kBX,kBZ};\r
-  enum {kXX=0,kXY=1,kXZ=2,kYX=kXY,kYY=3,kYZ=4,kZX=kXZ,kZY=kYZ,kZZ=5};\r
-  //\r
-  AliITSAlignMille2* alig = AliITSAlignMille2::GetInstance();\r
-  AliTrackPointArray* track = alig->GetCurrentTrack();\r
-  //\r
-  int npts = track->GetNPoints();\r
-  for (int ip=0;ip<npts;ip++) {\r
-    track->GetPoint(pnt,ip);\r
-    const float *cov = pnt.GetCov();\r
-    double y  = pnt.GetY();\r
-    double dx = pnt.GetX() - (par[kAX]+y*par[kBX]);\r
-    double dz = pnt.GetZ() - (par[kAZ]+y*par[kBZ]);\r
-    double xxe = cov[kXX];\r
-    double zze = cov[kZZ];\r
-    double xze = cov[kXZ];\r
-    //\r
-    if (fullErr2D) {\r
-      xxe += par[kBX]*par[kBX]*cov[kYY]-2.*par[kBX]*cov[kXY];\r
-      zze += par[kBZ]*par[kBZ]*cov[kYY]-2.*par[kBZ]*cov[kZY];\r
-      xze += par[kBX]*par[kBZ]*cov[kYY]-cov[kYZ]*par[kBZ]-cov[kXY]*par[kBX];\r
-    }\r
-    //\r
-    double det = xxe*zze - xze*xze;\r
-    if (det<kTiny) {\r
-      printf("Negative diag. error (det=%+e) |sxx:%+e szz:%+e sxz:%+e| bx:%+e bz:%+e|\n"\r
-            "Discarding correlation term\n",det,xxe,zze,xze,par[kBX],par[kBZ]);\r
-      xxe = cov[kXX];\r
-      zze = cov[kZZ];\r
-      xze = cov[kXZ];\r
-      fullErr2D = kFALSE;\r
-    }\r
-    double xxeI = zze/det;\r
-    double zzeI = xxe/det;\r
-    double xzeI =-xze/det;\r
-    //\r
-    chi2 += dx*dx*xxeI + dz*dz*zzeI + 2.*dx*dz*xzeI;\r
-    // \r
-    //    printf("%d | %+e %+e %+e %+e %+e -> %+e\n",ip,dx,dz,xxeI,zzeI,xzeI,  chi2);\r
-  }\r
-  //\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::InitTrackParams(int meth) \r
-{\r
-  /// initialize local parameters with different methods\r
-  /// for current track (fTrack)\r
-  Int_t npts=0;\r
-  AliTrackPoint ap;\r
-  double sX=0,sXY=0,sZ=0,sZY=0,sY=0,sYY=0,det=0;\r
-  // simple linear interpolation\r
-  // get local starting parameters (to be substituted by ESD track parms)\r
-  // local parms (fLocalInitParam[]) are:\r
-  //      [0] = global x coord. of straight line intersection at y=0 plane\r
-  //      [1] = global z coord. of straight line intersection at y=0 plane\r
-  //      [2] = px/py  \r
-  //      [3] = pz/py\r
-  // test #1: linear fit in x(y) and z(y)\r
-  npts = fTrack->GetNPoints();\r
-  AliDebug(3,Form("*** initializing track with %d points ***",npts));\r
-  for (int i=npts;i--;) {\r
-    sY  += fTrack->GetY()[i];\r
-    sYY += fTrack->GetY()[i]*fTrack->GetY()[i];\r
-    sX  += fTrack->GetX()[i];\r
-    sXY += fTrack->GetX()[i]*fTrack->GetY()[i];\r
-    sZ  += fTrack->GetZ()[i];\r
-    sZY += fTrack->GetZ()[i]*fTrack->GetY()[i];\r
-  }\r
-  det = sYY*npts-sY*sY;\r
-  if (det==0) det = 1E-20;\r
-  fLocalInitParam[0] = (sX*sYY-sY*sXY)/det;\r
-  fLocalInitParam[2] = (sXY*npts-sY*sX)/det;\r
-  //\r
-  fLocalInitParam[1] = (sZ*sYY-sY*sZY)/det;\r
-  fLocalInitParam[3] = (sZY*npts-sY*sZ)/det;\r
-  // pepo200709\r
-  fLocalInitParam[4] = 0.0;\r
-  // endpepo200709\r
-\r
-  AliDebug(2,Form("X = p0gx + ugx*Y : p0gx = %f    ugx = %f\n",fLocalInitParam[0],fLocalInitParam[2]));\r
-  //\r
-  if (meth==1) return;\r
-  //\r
-  // perform full fit accounting for cov.matrix\r
-  static TVirtualFitter *minuit = 0;\r
-  static Double_t step[5]   = {1E-3,1E-3,1E-4,1E-4,1E-5};\r
-  static Double_t arglist[10];\r
-  //\r
-  if (!minuit) {\r
-    minuit = TVirtualFitter::Fitter(0,4);\r
-    minuit->SetFCN(trackFit2D);\r
-    arglist[0] = 1;\r
-    minuit->ExecuteCommand("SET ERR",arglist, 1);\r
-    //\r
-    arglist[0] = -1;\r
-    minuit->ExecuteCommand("SET PRINT",arglist,1);\r
-    //\r
-  }\r
-  //\r
-  minuit->SetParameter(0, "ax",   fLocalInitParam[0], step[0], 0,0);\r
-  minuit->SetParameter(1, "az",   fLocalInitParam[1], step[1], 0,0);\r
-  minuit->SetParameter(2, "bx",   fLocalInitParam[2], step[2], 0,0);\r
-  minuit->SetParameter(3, "bz",   fLocalInitParam[3], step[3], 0,0);\r
-  //\r
-  arglist[0] = 1000; // number of function calls \r
-  arglist[1] = 0.001; // tolerance \r
-  minuit->ExecuteCommand("MIGRAD",arglist,2);\r
-  //\r
-  for (int i=0;i<4;i++) fLocalInitParam[i] = minuit->GetParameter(i);\r
-  for (int i=0;i<4;i++) for (int j=0;j<4;j++) fLocalInitParEr[i][j] = minuit->GetCovarianceMatrixElement(i,j);\r
-  //\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::IsSymDefined(const Char_t* symname) const\r
-{\r
-  // checks if supermodule with this symname is defined and return the internal index\r
-  // return -1 if not.\r
-  for (int k=fNModules;k--;) if (!strcmp(symname,GetMilleModule(k)->GetName())) return k;\r
-  return -1; \r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::IsSymContained(const Char_t* symname) const\r
-{\r
-  // checks if module with this symname is defined and return the internal index\r
-  // return -1 if not.\r
-  UShort_t vid = AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromSymname(symname);\r
-  if (vid>0) return IsVIDContained(vid);\r
-  // only sensors have real vid, but maybe we have a supermodule with fake vid? \r
-  // IMPORTANT: always start from the end to start from the sensors\r
-  return IsSymDefined(symname);\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::IsVIDDefined(UShort_t voluid) const\r
-{\r
-  // checks if supermodule 'voluid' is defined and return the internal index\r
-  // return -1 if not.\r
-  for (int k=fNModules;k--;) if (voluid==GetMilleModule(k)->GetVolumeID()) return k;\r
-  return -1; \r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::IsVIDContained(UShort_t voluid) const\r
-{\r
-  // checks if the sensitive module 'voluid' is contained inside a supermodule \r
-  // and return the internal index of the last identified supermodule\r
-  // return -1 if error\r
-  // IMPORTANT: always start from the end to start from the sensors\r
-  if (AliITSAlignMille2Module::GetIndexFromVolumeID(voluid)<0) return -1;\r
-  for (int k=fNModules;k--;) if (GetMilleModule(k)->IsIn(voluid)) return k;\r
-  return -1; \r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::CheckCurrentTrack() \r
-{\r
-  /// checks if AliTrackPoints belongs to defined modules\r
-  /// return number of good poins\r
-  /// return 0 if not enough points\r
-\r
-  Int_t npts = fTrack->GetNPoints();\r
-  Int_t ngoodpts=0;\r
-  // debug points\r
-  for (int j=0; j<npts; j++) if (IsVIDContained(fTrack->GetVolumeID()[j])>=0) ngoodpts++;\r
-  //\r
-  if (ngoodpts<fMinNPtsPerTrack) return 0;\r
-\r
-  return ngoodpts;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::ProcessTrack(const AliTrackPointArray *track) \r
-{\r
-  /// Process track; Loop over hits and set local equations\r
-  /// here 'track' is a AliTrackPointArray\r
-  /// return 0 if success;\r
-  \r
-  if (!fIsMilleInit) Init();\r
-  //\r
-  Int_t npts = track->GetNPoints();\r
-  AliDebug(2,Form("*** Input track with %d points ***",npts));\r
-\r
-  // preprocessing of the input track: keep only points in defined volumes,\r
-  // move points if prealignment is set, sort by Yglo if required\r
-  \r
-  fTrack=PrepareTrack(track);\r
-  if (!fTrack) return -1;\r
-\r
-  npts = fTrack->GetNPoints();\r
-  if (npts>kMaxPoints) {\r
-    AliError(Form("Compiled with kMaxPoints=%d, current track has %d points",kMaxPoints,npts));\r
-  }\r
-  AliDebug(2,Form("*** Processing prepared track with %d points ***",npts));\r
-  \r
-  if (!fBOn) { // straight lines  \r
-    // set local starting parameters (to be substituted by ESD track parms)\r
-    // local parms (fLocalInitParam[]) are:\r
-    //      [0] = global x coord. of straight line intersection at y=0 plane\r
-    //      [1] = global z coord. of straight line intersection at y=0 plane\r
-    //      [2] = px/py  \r
-    //      [3] = pz/py\r
-    InitTrackParams(fInitTrackParamsMeth);  \r
-  } \r
-  else {\r
-    // local parms (fLocalInitParam[]) are the Riemann Fitter params\r
-    if (!InitRiemanFit()) {\r
-      AliInfo("Riemann fit failed! skipping this track...");\r
-      fTrack=NULL;\r
-      return -5;\r
-    }\r
-  }\r
-  \r
-  Int_t nloceq=0;\r
-  Int_t ngloeq=0;\r
-  static Mille2Data md[kMaxPoints];\r
-  //\r
-  for (Int_t ipt=0; ipt<npts; ipt++) {\r
-    fTrack->GetPoint(fCluster,ipt);\r
-    fCluster.SetUniqueID(ipt);\r
-    AliDebug(2,Form("\n--- processing point %d --- \n",ipt));    \r
-\r
-    // set geometry parameters for the the current module\r
-    if (InitModuleParams()) continue;\r
-    AliDebug(2,Form("    VolID=%d  Index=%d  InternalIdx=%d  symname=%s\n", \r
-                   track->GetVolumeID()[ipt], fCurrentModule->GetIndex(),\r
-                   fCurrentModule->GetUniqueID(), AliGeomManager::SymName(track->GetVolumeID()[ipt]) ));\r
-    AliDebug(2,Form("    Preprocessed Point = ( %f , %f , %f ) \n",fCluster.GetX(),fCluster.GetY(),fCluster.GetZ()));\r
-    int res = AddLocalEquation(md[nloceq]);\r
-    if (res<0) {fTotBadLocEqPoints++; nloceq = 0; break;}\r
-    else if (res==0) nloceq++;\r
-    else {nloceq++; ngloeq++;}\r
-  } // end loop over points\r
-  //\r
-  fTrack=NULL;\r
-  // not enough good points?\r
-  if (nloceq<fMinNPtsPerTrack || ngloeq<1) return -1;\r
-  //\r
-  // finally send local equations to millepede\r
-  SetLocalEquations(md,nloceq);\r
-  fMillepede->SaveRecordData(); // RRR\r
-  //\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::CalcIntersectionPoint(Double_t *lpar, Double_t *gpar) \r
-{\r
-  /// calculate track intersection point in local coordinates\r
-  /// according with a given set of parameters (local(4) and global(6))\r
-  /// and fill fPintLoc/Glo\r
-  ///    local are:   pgx0, pgz0, ugx, ugz   OR   riemann fitters pars\r
-  ///    global are:  tx,ty,tz,psi,theta,phi (Raff's delta angles in deg.)\r
-  /// return 0 if success\r
-  \r
-  AliDebug(3,Form("lpar = %g %g %g %g %g\ngpar= %g %g %g %g %g %g\n",lpar[0],lpar[1],lpar[2],lpar[3],lpar[4],gpar[0],gpar[1],gpar[2],gpar[3],gpar[4],gpar[5]));\r
-  AliDebug(3,Form("deltalpar = %g %g %g %g %g\n",lpar[0]-fLocalInitParam[0],lpar[1]-fLocalInitParam[1],lpar[2]-fLocalInitParam[2],lpar[3]-fLocalInitParam[3],lpar[4]-fLocalInitParam[4]));\r
-\r
-  \r
-  // prepare the TGeoHMatrix\r
-  TGeoHMatrix *tempHMat = fCurrentModule->GetSensitiveVolumeModifiedMatrix(fCluster.GetVolumeID(),gpar,\r
-                                                                          !fUseGlobalDelta);\r
-  if (!tempHMat) return -1;\r
-  \r
-  Double_t v0g[3]; // vector with straight line direction in global coord.\r
-  Double_t p0g[3]; // point of the straight line (glo)\r
-  \r
-  if (fBOn) { // B FIELD!\r
-    AliTrackPoint prf; \r
-    for (int ip=0; ip<5; ip++)\r
-      fRieman->SetParam(ip,lpar[ip]);\r
-\r
-    if (!fRieman->GetPCA(fCluster,prf))  {\r
-      AliInfo(Form("error in GetPCA for point %d",fCluster.GetVolumeID()));\r
-      return -3;\r
-    }\r
-    // now determine straight line passing tangent to fit curve at prf\r
-    // ugx = dX/dY_glo = DeltaX/DeltaY_glo\r
-    // mo' P1=(X,Y,Z)_glo_prf\r
-    //       => (x,y,Z)_trk_prf ruotando di alpha...\r
-    Double_t alpha=fRieman->GetAlpha();\r
-    Double_t x1g = prf.GetX();\r
-    Double_t y1g = prf.GetY();\r
-    Double_t z1g = prf.GetZ();\r
-    Double_t x1t =  x1g*TMath::Cos(alpha) + y1g*TMath::Sin(alpha);\r
-    Double_t y1t = -x1g*TMath::Sin(alpha) + y1g*TMath::Cos(alpha);\r
-    Double_t z1t =  z1g;    \r
-\r
-    Double_t x2t = x1t+1.0;\r
-    Double_t y2t = y1t+fRieman->GetDYat(x1t);\r
-    Double_t z2t = z1t+fRieman->GetDZat(x1t);\r
-    Double_t x2g =  x2t*TMath::Cos(alpha) - y2t*TMath::Sin(alpha);\r
-    Double_t y2g =  x2t*TMath::Sin(alpha) + y2t*TMath::Cos(alpha);\r
-    Double_t z2g =  z2t;  \r
-\r
-    AliDebug(3,Form("Riemann frame:  fAlpha = %f  =  %f  ",alpha,alpha*180./TMath::Pi()));\r
-    AliDebug(3,Form("   prf_glo=( %f , %f , %f )  prf_rf=( %f , %f , %f )\n", x1g,y1g,z1g, x1t,y1t,z1t));\r
-    AliDebug(3,Form("   mov_glo=( %f , %f , %f )      rf=( %f , %f , %f )\n",x2g,y2g,z2g, x2t,y2t,z2t));\r
-        \r
-    if (TMath::Abs(y2g-y1g)<1e-15) {\r
-      AliInfo("DeltaY=0! Cannot proceed...");\r
-      return -1;\r
-    }\r
-    // ugx,1,ugz\r
-    v0g[0] = (x2g-x1g)/(y2g-y1g);\r
-    v0g[1]=1.0;\r
-    v0g[2] = (z2g-z1g)/(y2g-y1g);\r
-    \r
-    // point: just keep prf\r
-    p0g[0]=x1g;\r
-    p0g[1]=y1g;\r
-    p0g[2]=z1g;\r
-  }  \r
-  else { // staight line\r
-    // vector of initial straight line direction in glob. coord\r
-    v0g[0]=lpar[2];\r
-    v0g[1]=1.0;\r
-    v0g[2]=lpar[3];\r
-    \r
-    // intercept in yg=0 plane in glob coord\r
-    p0g[0]=lpar[0];\r
-    p0g[1]=0.0;\r
-    p0g[2]=lpar[1];\r
-  }\r
-  AliDebug(3,Form("Line vector: ( %f , %f , %f )  point:( %f , %f , %f )\n",v0g[0],v0g[1],v0g[2],p0g[0],p0g[1],p0g[2]));\r
-  \r
-  // same in local coord.\r
-  Double_t p0l[3],v0l[3];\r
-  tempHMat->MasterToLocalVect(v0g,v0l);\r
-  tempHMat->MasterToLocal(p0g,p0l);\r
-  \r
-  if (TMath::Abs(v0l[1])<1e-15) {\r
-    AliInfo("Track Y direction in local frame is zero! Cannot proceed...");\r
-    return -1;\r
-  }\r
-  \r
-  // local intersection point\r
-  fPintLoc[0] = p0l[0] - (v0l[0]/v0l[1])*p0l[1];\r
-  fPintLoc[1] = 0;\r
-  fPintLoc[2] = p0l[2] - (v0l[2]/v0l[1])*p0l[1];\r
-  \r
-  // global intersection point\r
-  tempHMat->LocalToMaster(fPintLoc,fPintGlo);\r
-  AliDebug(3,Form("Intesect. point: L( %f , %f , %f )  G( %f , %f , %f )\n",fPintLoc[0],fPintLoc[1],fPintLoc[2],fPintGlo[0],fPintGlo[1],fPintGlo[2]));\r
-  \r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::CalcDerivatives(Int_t paridx, Bool_t islpar) \r
-{\r
-  /// calculate numerically (ROOT's style) the derivatives for\r
-  /// local X intersection  and local Z intersection\r
-  /// parlist: local  (islpar=kTRUE)  pgx0, pgz0, ugx0, ugz0  OR riemann's params\r
-  ///          global (islpar=kFALSE) tx, ty, tz, psi, theta, phi (Raf's angles in deg)\r
-  /// return 0 if success\r
-  \r
-  // copy initial parameters\r
-  Double_t lpar[kNLocal];\r
-  Double_t gpar[kNParCh];\r
-  Double_t *derivative;\r
-  for (Int_t i=0; i<kNLocal; i++) lpar[i]=fLocalInitParam[i];\r
-  for (Int_t i=0; i<kNParCh; i++) gpar[i]=fModuleInitParam[i];\r
-\r
-  // trial with fixed dpar...\r
-  Double_t dpar = 0.;\r
-\r
-  if (islpar) { // track parameters\r
-    //dpar=fLocalInitParam[paridx]*0.001;\r
-    // set minimum dpar\r
-    derivative = fDerivativeLoc[paridx];\r
-    if (!fBOn) {\r
-      if (paridx<3) dpar=1.0e-4; // translations\r
-      else dpar=1.0e-6; // direction\r
-    }\r
-    else { // B Field\r
-      // pepo: proviamo con 1/1000, poi evenctually 1/100...\r
-      Double_t dfrac=0.01;\r
-      switch(paridx) {\r
-      case 0:\r
-       // RMS cosmics: 1e-4\r
-       dpar = TMath::Max(1.0e-6,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac)); \r
-       break;\r
-      case 1: \r
-       // RMS cosmics: 0.2\r
-       dpar = TMath::Max(0.002,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac)); \r
-       break;\r
-      case 2: \r
-       // RMS cosmics: 9\r
-       dpar = TMath::Max(0.09,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac)); \r
-       break;\r
-      case 3: \r
-       // RMS cosmics: 7\r
-       dpar = TMath::Max(0.07,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac)); \r
-       break;\r
-      case 4: \r
-       // RMS cosmics: 0.3\r
-       dpar = TMath::Max(0.003,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac)); \r
-       break;\r
-      }\r
-    }\r
-  }\r
-  else { // alignment global parameters\r
-    derivative = fDerivativeGlo[paridx];\r
-    //dpar=fModuleInitParam[paridx]*0.001;\r
-    if (paridx<3) dpar=1.0e-4; // translations\r
-    else dpar=1.0e-2; // angles    \r
-  }\r
-\r
-  AliDebug(3,Form("+++ using dpar=%g",dpar));\r
-  \r
-  // calculate derivative ROOT's like:\r
-  //  using f(x+h),f(x-h),f(x+h/2),f(x-h2)...\r
-  Double_t pintl1[3]; // f(x-h)\r
-  Double_t pintl2[3]; // f(x-h/2)\r
-  Double_t pintl3[3]; // f(x+h/2)\r
-  Double_t pintl4[3]; // f(x+h)\r
-    \r
-  // first values\r
-  if (islpar) lpar[paridx] -= dpar;\r
-  else gpar[paridx] -= dpar;\r
-  if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;\r
-  for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl1[i]=fPintLoc[i];\r
-\r
-  // second values\r
-  if (islpar) lpar[paridx] += dpar/2;\r
-  else gpar[paridx] += dpar/2;\r
-  if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;\r
-  for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl2[i]=fPintLoc[i];\r
-\r
-  // third values\r
-  if (islpar) lpar[paridx] += dpar;\r
-  else gpar[paridx] += dpar;\r
-  if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;\r
-  for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl3[i]=fPintLoc[i];\r
-\r
-  // fourth values\r
-  if (islpar) lpar[paridx] += dpar/2;\r
-  else gpar[paridx] += dpar/2;\r
-  if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;\r
-  for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl4[i]=fPintLoc[i];\r
-\r
-  Double_t h2 = 1./(2.*dpar);\r
-  Double_t d0 = pintl4[0]-pintl1[0];\r
-  Double_t d2 = 2.*(pintl3[0]-pintl2[0]);\r
-  derivative[0] = h2*(4*d2 - d0)/3.;\r
-  if (TMath::Abs(derivative[0]) < 1.0e-9) derivative[0] = 0.0;\r
-\r
-  d0 = pintl4[2]-pintl1[2];\r
-  d2 = 2.*(pintl3[2]-pintl2[2]);\r
-  derivative[2] = h2*(4*d2 - d0)/3.;\r
-  if (TMath::Abs(derivative[2]) < 1.0e-9) derivative[2]=0.0;\r
-\r
-  AliDebug(3,Form("\n+++ derivatives +++ \n"));\r
-  AliDebug(3,Form("+++ dXLoc/dpar = %g +++\n",derivative[0]));\r
-  AliDebug(3,Form("+++ dZLoc/dpar = %g +++\n\n",derivative[2]));\r
-  \r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::AddLocalEquation(Mille2Data &m) \r
-{\r
-  /// Define local equation for current cluster in X and Z coor.\r
-  /// and store them to memory\r
-  /// return -1 in case of failure to build some equation\r
-  ///         0 if no free global parameters were found but local eq is built\r
-  ///         1 if both local and global eqs are built\r
-  //\r
-  // store first intersection point\r
-  if (CalcIntersectionPoint(fLocalInitParam, fModuleInitParam)) return -1;  \r
-  for (Int_t i=0; i<3; i++) fPintLoc0[i]=fPintLoc[i];\r
-  AliDebug(2,Form("Intesect. point: L( %f , %f , %f )",fPintLoc[0],fPintLoc[1],fPintLoc[2]));\r
-  \r
-  // calculate local derivatives numerically\r
-  Bool_t zeroX = kTRUE;\r
-  Bool_t zeroZ = kTRUE;\r
-  //\r
-  for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++) {\r
-    if (CalcDerivatives(i,kTRUE)) return -1;\r
-    m.fDerLocX[i] = fDerivativeLoc[i][0];\r
-    m.fDerLocZ[i] = fDerivativeLoc[i][2];\r
-    if (zeroX) zeroX = fDerivativeLoc[i][0]==0;\r
-    if (zeroZ) zeroZ = fDerivativeLoc[i][2]==0;\r
-  }\r
-  //  for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++) AliDebug(2,Form("Local parameter %d - dXdpar = %g  - dZdpar = %g\n",i,dXdL[i],dZdL[i]));\r
-  //\r
-  if (zeroX) {AliInfo("Skipping: zero local X derivatives!"); return -1;}\r
-  if (zeroZ) {AliInfo("Skipping: zero local Z derivatives!"); return -1;}\r
-  //\r
-  int ifill = 0;\r
-  //\r
-  AliITSAlignMille2Module* endModule = fCurrentModule;\r
-  //\r
-  zeroX = zeroZ = kTRUE;\r
-  Bool_t dfDone[kNParCh];\r
-  for (int i=kNParCh;i--;) dfDone[i] = kFALSE;\r
-  m.fNModFilled = 0;\r
-  // \r
-  // special block for SDD derivatives\r
-  Double_t jacobian[kNParChGeom];\r
-  Int_t nmodTested = 0;\r
-  //\r
-  do {\r
-    if (fCurrentModule->GetNParFree()==0) continue;\r
-    nmodTested++;\r
-    for (Int_t i=0; i<kNParChGeom; i++) {   // common for all sensors: derivatives over geom params \r
-      //\r
-      if (!fUseGlobalDelta) dfDone[i] = kFALSE; // for global deltas the derivatives at diff. levels are different\r
-      if (fCurrentModule->GetParOffset(i)<0) continue; // this parameter is not explicitly fitted\r
-      if (!dfDone[i]) { \r
-       if (CalcDerivatives(i,kFALSE)) return -1; \r
-       else {\r
-         dfDone[i] = kTRUE;\r
-         if (zeroX) zeroX = fDerivativeGlo[i][0]==0;\r
-         if (zeroZ) zeroZ = fDerivativeGlo[i][2]==0;\r
-       }\r
-      }\r
-      //\r
-      m.fDerGloX[ifill] = fDerivativeGlo[i][0];\r
-      m.fDerGloZ[ifill] = fDerivativeGlo[i][2];\r
-      m.fParMilleID[ifill++] = fCurrentModule->GetParOffset(i);\r
-    }\r
-    //\r
-    // specific for special sensors\r
-    if ( fCurrentModule->IsSDD() && \r
-        (fCurrentModule->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)>=0 ||\r
-         fCurrentModule->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFDV)>=0) ) {\r
-      //\r
-      // assume for sensor local xloc = xloc0 + V0*dT0+dV*(T-T0)\r
-      // where V0 and T are the nominal drift velocity, time and time0\r
-      // and the dT0 and dV are the corrections:\r
-      // dX/dT0 = dX/dxloc * dxloc/dT0 = dX/dxloc * V0\r
-      // dX/dV  = dX/dxloc * dxloc/dV =  dX/dxloc * (T-T0)\r
-      // IMPORTANT: the geom derivatives are over the SENSOR LOCAL parameters\r
-      //\r
-      if (!dfDone[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0] || !dfDone[AliITSAlignMille2Module::kDOFDV]) {\r
-       //\r
-       double dXdxlocsens=0., dZdxlocsens=0.;\r
-       //\r
-       // if the current module is the sensor itself and we work with local params, then \r
-       // we can directly take dX/dxloc_sens dZ/dxloc_sens\r
-       if (!fUseGlobalDelta && fCurrentModule->GetVolumeID()==fCluster.GetVolumeID()) {\r
-         if (dfDone[AliITSAlignMille2Module::kDOFTX]) {\r
-           CalcDerivatives(AliITSAlignMille2Module::kDOFTX,kFALSE); \r
-           dfDone[AliITSAlignMille2Module::kDOFTX] = kTRUE;\r
-         }\r
-         dXdxlocsens = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFTX][0];\r
-         dZdxlocsens = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFTX][2];\r
-       }\r
-       //\r
-       else { // need to perform some transformations\r
-         // fetch the jacobian of the transformation from the sensors local frame to the frame\r
-         // where the parameters are defined:\r
-         // Global: dX/dxloc_sens = dX/dxgl*dxgl/dxloc_sens + ...dX/dphigl*dphigl/dxloc_sens\r
-         if (fUseGlobalDelta) fCurrentModule->CalcDerivGloLoc(fCluster.GetVolumeID(),\r
-                                                              AliITSAlignMille2Module::kDOFTX, jacobian);\r
-         // Local:  dX/dxloc_sens = dX/dxcurr*dxcurr/dxloc_sens +..+dX/dphicurr * dphicurr/dxloc_sens \r
-         else                 fCurrentModule->CalcDerivCurLoc(fCluster.GetVolumeID(),\r
-                                                              AliITSAlignMille2Module::kDOFTX, jacobian);\r
-         //\r
-         for (int j=0;j<kNParChGeom;j++) {\r
-           // need global derivative even if the j-th param is locked\r
-           if (!dfDone[j]) {CalcDerivatives(j,kFALSE); dfDone[j] = kTRUE;}\r
-           dXdxlocsens += fDerivativeGlo[j][0] * jacobian[j];\r
-           dZdxlocsens += fDerivativeGlo[j][2] * jacobian[j];\r
-         }\r
-       }\r
-       //\r
-       if (zeroX) zeroX = dXdxlocsens == 0;\r
-       if (zeroZ) zeroZ = dZdxlocsens == 0;\r
-       //\r
-       double vdrift = GetVDriftSDD();\r
-       double tdrift = GetTDriftSDD();\r
-       //\r
-       fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][0] = dXdxlocsens*vdrift;\r
-       fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][2] = dZdxlocsens*vdrift;\r
-       dfDone[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0] = kTRUE;\r
-       //\r
-       fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFDV][0] = -dXdxlocsens*TMath::Sign(tdrift,vdrift);\r
-       fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFDV][2] = -dZdxlocsens*TMath::Sign(tdrift,vdrift);\r
-       dfDone[AliITSAlignMille2Module::kDOFDV] = kTRUE;\r
-       //\r
-      }\r
-      //\r
-      if (fCurrentModule->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)>=0) {\r
-       m.fDerGloX[ifill] = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][0];\r
-       m.fDerGloZ[ifill] = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][2];\r
-       m.fParMilleID[ifill++] = fCurrentModule->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0);      \r
-      }\r
-      //\r
-      if (fCurrentModule->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFDV)>=0) {\r
-       m.fDerGloX[ifill] = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFDV][0];\r
-       m.fDerGloZ[ifill] = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFDV][2];\r
-       m.fParMilleID[ifill++] = fCurrentModule->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFDV);      \r
-      }\r
-    }\r
-    //\r
-    m.fModuleID[m.fNModFilled++] = fCurrentModule->GetUniqueID();\r
-  } while( (fCurrentModule=fCurrentModule->GetParent()) );\r
-  //\r
-  if (nmodTested>0 && zeroX) {AliInfo("Skipping: zero global X derivatives!");return -1;}\r
-  if (nmodTested>0 && zeroZ) {AliInfo("Skipping: zero global Z derivatives!");return -1;}\r
-  //\r
-  // ok, can copy to m\r
-  AliDebug(2,Form("Adding local equation X with fMeas=%.6f  and fSigma=%.6f",(fMeasLoc[0]-fPintLoc0[0]), fSigmaLoc[0]));\r
-  m.fMeasX = fMeasLoc[0]-fPintLoc0[0];\r
-  m.fSigmaX = fSigmaLoc[0];\r
-  //\r
-  AliDebug(2,Form("Adding local equation Z with fMeas=%.6f  and fSigma=%.6f",(fMeasLoc[2]-fPintLoc0[2]), fSigmaLoc[2]));\r
-  m.fMeasZ = fMeasLoc[2]-fPintLoc0[2];\r
-  m.fSigmaZ = fSigmaLoc[2];\r
-  //\r
-  m.fNGlobFilled = ifill;\r
-  fCurrentModule = endModule;\r
-  //\r
-  return Int_t(!zeroX && !zeroZ);\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::SetLocalEquations(const Mille2Data *marr, Int_t neq) \r
-{\r
-  /// Set local equations with data stored in m\r
-  /// return 0 if success\r
-  //\r
-  for (Int_t j=0; j<neq; j++) {\r
-    //\r
-    const Mille2Data &m = marr[j];\r
-    //\r
-    // set equation for Xloc coordinate\r
-    AliDebug(2,Form("setting local equation X with fMeas=%.6f  and fSigma=%.6f",m.fMeasX, m.fSigmaX));\r
-    for (int i=fNLocal; i--;) SetLocalDerivative( i, m.fDerLocX[i] );\r
-    for (int i=m.fNGlobFilled;i--;) SetGlobalDerivative( m.fParMilleID[i] , m.fDerGloX[i] );\r
-    fMillepede->SetLocalEquation(fGlobalDerivatives, fLocalDerivatives, m.fMeasX, m.fSigmaX);  \r
-    //\r
-    // set equation for Zloc coordinate\r
-    AliDebug(2,Form("setting local equation Z with fMeas=%.6f  and fSigma=%.6f",m.fMeasZ, m.fSigmaZ));\r
-    for (int i=fNLocal; i--;) SetLocalDerivative( i, m.fDerLocZ[i] );\r
-    for (int i=m.fNGlobFilled;i--;) SetGlobalDerivative( m.fParMilleID[i] , m.fDerGloZ[i] );\r
-    fMillepede->SetLocalEquation(fGlobalDerivatives, fLocalDerivatives, m.fMeasZ, m.fSigmaZ);  \r
-    //\r
-    for (int i=m.fNModFilled;i--;) GetMilleModule(m.fModuleID[i])->IncNProcessedPoints();\r
-    //\r
-  }\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::GlobalFit()\r
-{\r
-  /// Call global fit; Global parameters are stored in parameters\r
-  if (!fIsMilleInit) Init();\r
-  //\r
-  ApplyPreConstraints();\r
-  int res = fMillepede->GlobalFit();\r
-  AliInfo(Form("%s fitting global parameters!",res ? "Done":"Failed"));\r
-  if (res) {\r
-    // fetch the parameters\r
-    for (int imd=fNModules;imd--;) {\r
-      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);\r
-      int nprocp = 0;\r
-      for (int ip=mod->GetNParTot();ip--;) {\r
-       int idp = mod->GetParOffset(ip);\r
-       if (idp<0) continue;    // was not in the explicit fit\r
-       mod->SetParVal(ip,fMillepede->GetFinalParam(idp));\r
-       mod->SetParErr(ip,fMillepede->GetFinalError(idp));\r
-       int np = fMillepede->GetProcessedPoints(idp);\r
-       if (TMath::Abs(np)>TMath::Abs(nprocp)) nprocp = np;\r
-      }\r
-      if (!mod->GetNProcessedPoints()) mod->SetNProcessedPoints(nprocp);\r
-    }\r
-\r
-  }\r
-  ApplyPostConstraints();\r
-  return res;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::PrintGlobalParameters() \r
-{\r
-  /// Print global parameters\r
-  if (!fIsMilleInit) {\r
-    AliInfo("Millepede has not been initialized!");\r
-    return;\r
-  }\r
-  fMillepede->PrintGlobalParameters();\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Int_t AliITSAlignMille2::LoadSuperModuleFile(const Char_t *sfile)\r
-{ \r
-  // load definitions of supermodules from a root file\r
-  // return 0 if success\r
-\r
-  TFile *smf=TFile::Open(sfile);\r
-  if (!smf->IsOpen()) {\r
-    AliInfo(Form("Cannot open supermodule file %s",sfile));\r
-    return -1;\r
-  }\r
-\r
-  TClonesArray *sma=(TClonesArray*)smf->Get("ITSMilleSuperModules");\r
-  if (!sma) {\r
-    AliInfo(Form("Cannot find ITSMilleSuperModules array in file"));\r
-    return -2;  \r
-  }  \r
-  Int_t nsma=sma->GetEntriesFast();\r
-  AliInfo(Form("Array of SuperModules with %d entries\n",nsma));\r
-  //\r
-  // pepo200709\r
-  Char_t st[2048];\r
-  char symname[250];\r
-  // end pepo200709\r
-\r
-  UShort_t volid;\r
-  TGeoHMatrix m;\r
-  //\r
-  for (Int_t i=0; i<nsma; i++) {\r
-    AliAlignObjParams *a = (AliAlignObjParams*)sma->UncheckedAt(i);\r
-    volid=a->GetVolUID();\r
-    strcpy(st,a->GetSymName());\r
-    a->GetMatrix(m);\r
-    //\r
-    sscanf(st,"%s",symname);\r
-    //\r
-    // decode module list\r
-    char *stp=strstr(st,"ModuleList:");\r
-    if (!stp) return -3;\r
-    stp += 11;\r
-    int idx[2200];\r
-    char spp[200]; int jp=0;\r
-    char cl[20];\r
-    strcpy(st,stp);\r
-    int l=strlen(st);\r
-    int j=0;\r
-    int n=0;\r
-    //\r
-    while (j<=l) {\r
-      if (st[j]==9 || st[j]==32 || st[j]==10 || st[j]==0) {\r
-       spp[jp]=0;\r
-       jp=0;\r
-       if (strlen(spp)) {\r
-         int k=strcspn(spp,"-");\r
-         if (k<int(strlen(spp))) { // c'e' il -\r
-           strcpy(cl,&(spp[k+1]));\r
-           spp[k]=0;\r
-           int ifrom=atoi(spp); int ito=atoi(cl);\r
-           for (int b=ifrom; b<=ito; b++) {\r
-             idx[n]=b;\r
-             n++;\r
-           }\r
-         }\r
-         else { // numerillo singolo\r
-           idx[n]=atoi(spp);\r
-           n++;\r
-         }\r
-       }\r
-      }\r
-      else {\r
-       spp[jp]=st[j];\r
-       jp++;\r
-      }\r
-      j++;\r
-    }\r
-    UShort_t volidsv[2198];\r
-    for (j=0;j<n;j++) {\r
-      volidsv[j]=AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(idx[j]);\r
-      if (!volidsv[j]) {\r
-       AliInfo(Form("Index %d not valid (range 0->%d)",idx[j],kMaxITSSensID));\r
-       return -5;\r
-      }\r
-    }\r
-    Int_t smindex=int(2198+volid-14336); // virtual index\r
-    //\r
-    fSuperModule.AddAtAndExpand(new AliITSAlignMille2Module(smindex,volid,symname,&m,n,volidsv),fNSuperModules);\r
-    //\r
-    fNSuperModules++;\r
-  }\r
-  //\r
-  smf->Close();\r
-  //\r
-  return 0;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ConstrainModuleSubUnitsMean(Int_t idm, Double_t val, UInt_t pattern)\r
-{\r
-  // require that sum of modifications for the childs of this module is = val, i.e.\r
-  // the internal corrections moves the module as a whole by fixed value (0 by default).\r
-  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain\r
-  //\r
-  if (fIsMilleInit) {\r
-    AliInfo("Millepede has been already initialized: no constrain may be added!");\r
-    return;\r
-  }\r
-  if (!GetMilleModule(idm)->GetNChildren()) return;\r
-  TString nm = "cstrSUMean";\r
-  nm += GetNConstraints();\r
-  AliITSAlignMille2Constraint *cstr = new AliITSAlignMille2Constraint(nm.Data(),AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean,\r
-                                                                     idm,val,pattern);\r
-  cstr->SetConstraintID(GetNConstraints());\r
-  fConstraints.Add(cstr);\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ConstrainModuleSubUnitsMedian(Int_t idm, Double_t val, UInt_t pattern)\r
-{\r
-  // require that median of the modifications for the childs of this module is = val, i.e.\r
-  // the internal corrections moves the module as a whole by fixed value (0 by default) \r
-  // module the outliers.\r
-  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain\r
-  // The difference between the mean and the median will be transfered to the parent\r
-  if (fIsMilleInit) {\r
-    AliInfo("Millepede has been already initialized: no constrain may be added!");\r
-    return;\r
-  }\r
-  if (!GetMilleModule(idm)->GetNChildren()) return;\r
-  TString nm = "cstrSUMed";\r
-  nm += GetNConstraints();\r
-  AliITSAlignMille2Constraint *cstr = new AliITSAlignMille2Constraint(nm.Data(),AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMedian,\r
-                                                                     idm,val,pattern);\r
-  cstr->SetConstraintID(GetNConstraints());\r
-  fConstraints.Add(cstr);\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ConstrainOrphansMean(Double_t val, UInt_t pattern)\r
-{\r
-  // require that median of the modifications for the supermodules which have no parents is = val, i.e.\r
-  // the corrections moves the whole setup by fixed value (0 by default) modulo the outliers.\r
-  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain\r
-  //\r
-  if (fIsMilleInit) {\r
-    AliInfo("Millepede has been already initialized: no constrain may be added!");\r
-    return;\r
-  }\r
-  TString nm = "cstrOMean";\r
-  nm += GetNConstraints();\r
-  AliITSAlignMille2Constraint *cstr = new AliITSAlignMille2Constraint(nm.Data(),AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean,\r
-                                                                     -1,val,pattern);\r
-  cstr->SetConstraintID(GetNConstraints());\r
-  fConstraints.Add(cstr);\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ConstrainOrphansMedian(Double_t val, UInt_t pattern)\r
-{\r
-  // require that median of the modifications for the supermodules which have no parents is = val, i.e.\r
-  // the corrections moves the whole setup by fixed value (0 by default) modulo the outliers.\r
-  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain\r
-  //\r
-  if (fIsMilleInit) {\r
-    AliInfo("Millepede has been already initialized: no constrain may be added!");\r
-    return;\r
-  }\r
-  TString nm = "cstrOMed";\r
-  nm += GetNConstraints();\r
-  AliITSAlignMille2Constraint *cstr = new AliITSAlignMille2Constraint(nm.Data(),AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMedian,\r
-                                                                     -1,val,pattern);\r
-  cstr->SetConstraintID(GetNConstraints());\r
-  fConstraints.Add(cstr);\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ConstrainLocal(const Char_t* name,Double_t *parcf,Int_t npar,Double_t val,Double_t err)\r
-{\r
-  // apply constraint on parameters in the local frame\r
-  if (fIsMilleInit) {\r
-    AliInfo("Millepede has been already initialized: no constrain may be added!");\r
-    return;\r
-  }\r
-  AliITSAlignMille2ConstrArray *cstr = new AliITSAlignMille2ConstrArray(name,parcf,npar,val,err);\r
-  cstr->SetConstraintID(GetNConstraints());\r
-  fConstraints.Add(cstr);\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ApplyGaussianConstraint(const AliITSAlignMille2ConstrArray* cstr)\r
-{\r
-  // apply the constraint on the local corrections of a list of modules\r
-  int nmod = cstr->GetNModules();\r
-  double jacobian[AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom][AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom];\r
-  //\r
-  for (int imd=nmod;imd--;) {\r
-    int modID = cstr->GetModuleID(imd);\r
-    AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(modID);\r
-    ResetLocalEquation();\r
-    int nadded = 0;\r
-    double value = cstr->GetValue();\r
-    double sigma = cstr->GetError();\r
-    //\r
-    // in case the reference (survey) deltas were imposed for Gaussian constraints\r
-    // already accumulated corrections: they must be subtracted from the constraint value.\r
-    if (IsConstraintWrtRef()) {\r
-      //\r
-      Double_t precal[AliITSAlignMille2Module::kMaxParTot];\r
-      Double_t refcal[AliITSAlignMille2Module::kMaxParTot];\r
-      for (int ip=AliITSAlignMille2Module::kMaxParTot;ip--;) {precal[ip]=0; refcal[ip] = 0.;}\r
-      //\r
-      // check if there was a reference delta provided for this module\r
-      AliAlignObjParams* parref = GetConstrRefObject(mod->GetName());\r
-      if (parref) parref->GetPars(refcal, refcal+3);    // found reference delta\r
-      //\r
-      // extract already applied local corrections for this module\r
-      if (fPrealignment) {\r
-       //\r
-       AliAlignObjParams *preo = GetPrealignedObject(mod->GetName());\r
-       if (preo) {\r
-         TGeoHMatrix preMat,tmpMat = *mod->GetMatrix(); //  Delta_Glob * Delta_Glob_Par * M\r
-         preo->GetMatrix(preMat);                       //  Delta_Glob\r
-         preMat.MultiplyLeft( &tmpMat.Inverse() );      //  M^-1 * Delta_Glob_Par^-1 = (Delta_Glob_Par * M)^-1\r
-         tmpMat.MultiplyLeft( &preMat );                //  (Delta_Glob_Par * M)^-1 * Delta_Glob * Delta_Glob_Par * M = Delta_loc\r
-         AliAlignObjParams algob;\r
-         algob.SetMatrix(tmpMat);\r
-         algob.GetPars(precal,precal+3); // local corrections for geometry\r
-       }\r
-      }\r
-      //\r
-      // subtract the contribution to constraint from precalibration \r
-      for (int ipar=cstr->GetNCoeffs();ipar--;) value += (refcal[ipar]-precal[ipar])*cstr->GetCoeff(ipar);\r
-      //\r
-    } \r
-    //    \r
-    if (fUseGlobalDelta) mod->CalcDerivLocGlo(&jacobian[0][0]);\r
-    //\r
-    for (int ipar=cstr->GetNCoeffs();ipar--;) {\r
-      double coef = cstr->GetCoeff(ipar);\r
-      if (coef==0) continue;\r
-      //\r
-      if (!fUseGlobalDelta || ipar>= AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom) { // \r
-       // we are working with local params or if the given param is not related to geometry, \r
-       // apply the constraint directly\r
-       int parPos = mod->GetParOffset(ipar);\r
-       if (parPos<0) continue; // not in the fit\r
-       fGlobalDerivatives[parPos] += coef;\r
-       nadded++;\r
-      }\r
-      else { // we are working with global params, while the constraint is on local ones -> jacobian\r
-       for (int jpar=AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom;jpar--;) {\r
-         int parPos = mod->GetParOffset(jpar);\r
-         if (parPos<0) continue;\r
-         fGlobalDerivatives[parPos] += coef*jacobian[ipar][jpar];\r
-         nadded++;\r
-       }\r
-      }      \r
-    }\r
-    if (nadded) AddConstraint(fGlobalDerivatives, value, sigma);\r
-  }\r
-  //\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ApplyPreConstraints()\r
-{\r
-  // apply constriants which cannot be imposed after the fit\r
-  int nconstr = GetNConstraints();\r
-  for (int i=0;i<nconstr;i++) {\r
-    AliITSAlignMille2Constraint* cstr = GetConstraint(i);\r
-    //\r
-    if (cstr->GetType() == AliITSAlignMille2ConstrArray::kTypeGaussian) {\r
-      ApplyGaussianConstraint( (AliITSAlignMille2ConstrArray*)cstr);\r
-      continue;\r
-    } \r
-    //\r
-    if (cstr->GetType() == AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMedian) continue; // post type constraint\r
-    //\r
-    if (!fUseGlobalDelta) continue; // mean/med constraints must be applied to global deltas\r
-    // apply constraint on the mean's before the fit\r
-    int imd = cstr->GetModuleID();\r
-    if (imd>=0) {\r
-      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);\r
-      UInt_t pattern = 0;\r
-      for (int ipar=mod->GetNParTot();ipar--;) {\r
-       if (!cstr->IncludesParam(ipar)) continue;\r
-       if (mod->GetParOffset(ipar)<0) continue; // parameter is not in the explicit fit -> post constraint\r
-       pattern |= 0x1<<ipar;\r
-       cstr->SetApplied(ipar);\r
-      }\r
-      ConstrainModuleSubUnits(imd,cstr->GetValue(),pattern);\r
-      //\r
-    }\r
-    else if (!PseudoParentsAllowed()) {\r
-      ConstrainOrphans(cstr->GetValue(),(UInt_t)cstr->GetPattern());\r
-      cstr->SetApplied(-1);\r
-    }\r
-  }\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ApplyPostConstraints()\r
-{\r
-  // apply constraints which can be imposed after the fit\r
-  int nconstr = GetNConstraints();\r
-  Bool_t convGlo      = kFALSE;\r
-  // check if there is something to do\r
-  int ntodo = 0;\r
-  for (int i=0;i<nconstr;i++) {\r
-    AliITSAlignMille2Constraint* cstr = GetConstraint(i);\r
-    if (cstr->GetType() == AliITSAlignMille2ConstrArray::kTypeGaussian) continue;\r
-    if (cstr->GetRemainingPattern() == 0) continue;\r
-    ntodo++;\r
-  }\r
-  if (!ntodo) return;\r
-  //\r
-  if (!fUseGlobalDelta) { // need to convert to global params\r
-    ConvertParamsToGlobal();\r
-    convGlo = kTRUE;\r
-  }\r
-  //\r
-  for (int i=0;i<nconstr;i++) {\r
-    AliITSAlignMille2Constraint* cstr = GetConstraint(i);\r
-    if (cstr->GetType() == AliITSAlignMille2ConstrArray::kTypeGaussian) continue;\r
-    //\r
-    int imd = cstr->GetModuleID();\r
-    //\r
-    if (imd>=0) {\r
-      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);\r
-      UInt_t pattern = 0;\r
-      for (int ipar=mod->GetNParTot();ipar--;) {\r
-       if (cstr->IsApplied(ipar))      continue;\r
-       if (!cstr->IncludesParam(ipar)) continue;\r
-       if (!mod->IsFreeDOF(ipar))      continue; // parameter is fixed, will not apply constraint\r
-       pattern |= 0x1<<ipar;\r
-       cstr->SetApplied(ipar);\r
-      }\r
-      if (pattern) PostConstrainModuleSubUnits(cstr->GetType(),cstr->GetModuleID(),cstr->GetValue(),pattern);\r
-      //\r
-    }\r
-    else if (PseudoParentsAllowed()) {\r
-      UInt_t pattern = (UInt_t)cstr->GetRemainingPattern();\r
-      PostConstrainOrphans(cstr->GetType(),cstr->GetValue(),pattern);\r
-      cstr->SetApplied(-1);\r
-    }\r
-  }\r
-  // if there was a conversion, rewind it\r
-  if (convGlo) ConvertParamsToLocal();\r
-  // \r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ConstrainModuleSubUnits(Int_t idm, Double_t val, UInt_t pattern)\r
-{\r
-  // require that sum of modifications for the childs of this module is = val, i.e.\r
-  // the internal corrections moves the module as a whole by fixed value (0 by default).\r
-  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain\r
-  //\r
-  //\r
-  AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(idm);\r
-  //\r
-  for (int ip=0;ip<kNParCh;ip++) {\r
-    if ( !((pattern>>ip)&0x1) /*|| !parent->IsFreeDOF(ip)*/) continue;\r
-    ResetLocalEquation();\r
-    int nadd = 0;\r
-    for (int ich=mod->GetNChildren();ich--;) {\r
-      int idpar = ((AliITSAlignMille2Module*)mod->GetChild(ich))->GetParOffset(ip);\r
-      if (idpar<0) continue;\r
-      fGlobalDerivatives[idpar] = 1.0;\r
-      nadd++;\r
-    }\r
-    //\r
-    if (nadd>0) {\r
-      AddConstraint(fGlobalDerivatives,val);\r
-      AliInfo(Form("Constrained param %d for %d submodules of module #%d: %s",ip,nadd,idm,mod->GetName()));\r
-    }\r
-  }\r
-  //\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ConstrainOrphans(Double_t val, UInt_t pattern)\r
-{\r
-  // require that median of the modifications for the supermodules which have no parents is = val, i.e.\r
-  // the corrections moves the whole setup by fixed value (0 by default) modulo the outliers.\r
-  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain\r
-  //\r
-  for (int ip=0;ip<kNParCh;ip++) {\r
-    //\r
-    if ( !((pattern>>ip)&0x1) ) continue;\r
-    ResetLocalEquation();\r
-    int nadd = 0;\r
-    for (int imd=fNModules;imd--;) {\r
-      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);\r
-      if (mod->GetParent()) continue; // this is not an orphan\r
-      int idpar = mod->GetParOffset(ip);\r
-      if (idpar<0) continue;\r
-      fGlobalDerivatives[idpar] = 1.0;\r
-      nadd++;\r
-    }\r
-    if (nadd>0) {\r
-      AddConstraint(fGlobalDerivatives,val);\r
-      AliInfo(Form("Constrained param %d for %d orphan modules",ip,nadd));\r
-    }\r
-  }\r
-  //\r
-  //\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::PostConstrainModuleSubUnits(Int_t type,Int_t idm, Double_t val, UInt_t pattern)\r
-{\r
-  // require that median or mean of the modifications for the childs of this module is = val, i.e.\r
-  // the internal corrections moves the module as a whole by fixed value (0 by default) \r
-  // module the outliers.\r
-  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain\r
-  // The difference between the mean and the median will be transfered to the parent\r
-  //\r
-  AliITSAlignMille2Module* parent = GetMilleModule(idm);\r
-  int nc = parent->GetNChildren();\r
-  //\r
-  double *tmpArr = new double[nc]; \r
-  //\r
-  for (int ip=0;ip<kNParCh;ip++) {\r
-    int npc = 0;\r
-    if ( !((pattern>>ip)&0x1) || !parent->IsFreeDOF(ip)) continue;\r
-    // compute the mean and median of the deltas\r
-    int nfree = 0;\r
-    for (int ich=nc;ich--;) {\r
-      AliITSAlignMille2Module* child = parent->GetChild(ich);\r
-      //      if (!child->IsFreeDOF(ip)) continue; \r
-      tmpArr[nfree++] = child->GetParVal(ip);\r
-    }\r
-    double median=0,mean=0;\r
-    for (int ic0=0;ic0<nfree;ic0++) {// order the deltas \r
-      mean += tmpArr[ic0];\r
-      for (int ic1=ic0+1;ic1<nfree;ic1++) \r
-       if (tmpArr[ic0]>tmpArr[ic1]) {double tv=tmpArr[ic0]; tmpArr[ic0]=tmpArr[ic1]; tmpArr[ic1]=tv;}\r
-    }\r
-    //\r
-    int kmed = nfree/2;\r
-    median = (tmpArr[kmed]+tmpArr[nfree-kmed-1])/2.;\r
-    if (nfree>0) mean /= nfree;\r
-    //\r
-    double shift = val - (type==AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean ? mean : median);\r
-    //\r
-    for (int ich=nc;ich--;) {\r
-      AliITSAlignMille2Module* child = parent->GetChild(ich);\r
-      //    if (!child->IsFreeDOF(ip)) continue; \r
-      child->SetParVal(ip, child->GetParVal(ip) + shift);\r
-      npc++;\r
-    }\r
-    //\r
-    parent->SetParVal(ip, parent->GetParVal(ip) - shift);\r
-    AliInfo(Form("%s constraint: added %f shift to param[%d] of %d children of module %d: %s",\r
-                type==AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean ? "MEAN" : "MEDIAN",shift,\r
-                ip,npc,idm,parent->GetName()));\r
-  }\r
-  delete[] tmpArr;  \r
-  //\r
-  //\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::PostConstrainOrphans(Int_t type,Double_t val, UInt_t pattern)\r
-{\r
-  // require that median or mean of modifications for the supermodules which have no parents is = val, i.e.\r
-  // the corrections moves the whole setup by fixed value (0 by default).\r
-  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain\r
-  //\r
-  int nc = fNModules;\r
-  //\r
-  int norph = 0;\r
-  for (int ich=nc;ich--;) if (!GetMilleModule(ich)->GetParent()) norph ++;\r
-  if (!norph) return;\r
-  double *tmpArr = new double[norph]; \r
-  //\r
-  for (int ip=0;ip<kNParCh;ip++) {\r
-    int npc = 0;\r
-    if ( !((pattern>>ip)&0x1)) continue;\r
-    // compute the mean and median of the deltas\r
-    int nfree = 0;\r
-    for (int ich=nc;ich--;) {\r
-      AliITSAlignMille2Module* child = GetMilleModule(ich);\r
-      //      if (child->GetParent() || !child->IsFreeDOF(ip)) continue; \r
-      if (child->GetParent()) continue; \r
-      tmpArr[nfree++] = child->GetParVal(ip);\r
-    }\r
-    double median=0,mean=0;\r
-    for (int ic0=0;ic0<nfree;ic0++) {// order the deltas \r
-      mean += tmpArr[ic0];\r
-      for (int ic1=ic0+1;ic1<nfree;ic1++) \r
-       if (tmpArr[ic0]>tmpArr[ic1]) {double tv=tmpArr[ic0]; tmpArr[ic0]=tmpArr[ic1]; tmpArr[ic1]=tv;}\r
-    }\r
-    //\r
-    int kmed = nfree/2;\r
-    median = (tmpArr[kmed]+tmpArr[nfree-kmed-1])/2.;\r
-    if (nfree>0) mean /= nfree;\r
-    //\r
-    double shift = val - (type==AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean ? mean : median);\r
-    //\r
-    for (int ich=nc;ich--;) {\r
-      AliITSAlignMille2Module* child = GetMilleModule(ich);\r
-      //      if (child->GetParent() || !child->IsFreeDOF(ip)) continue; \r
-      if (child->GetParent()) continue; \r
-      child->SetParVal(ip, child->GetParVal(ip) + shift);\r
-      npc++;\r
-    }\r
-    //\r
-    AliInfo(Form("%s constraint: added %f shift to param[%d] of %d orphan modules",\r
-                type==AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean ? "MEAN" : "MEDIAN",shift,\r
-                ip,npc));\r
-  }\r
-  delete[] tmpArr;  \r
-  //\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Bool_t AliITSAlignMille2::IsParModConstrained(const AliITSAlignMille2Module* mod,Int_t par, Bool_t &meanmed, Bool_t &gaussian) const\r
-{\r
-  // check if par of the module participates in some constraint, and set the flag for their types\r
-  meanmed = gaussian = kFALSE;\r
-  //\r
-  if ( mod->IsParConstrained(par) ) gaussian = kTRUE;     // direct constraint on this param\r
-  //\r
-  for (int icstr=GetNConstraints();icstr--;) {\r
-    AliITSAlignMille2Constraint* cstr = GetConstraint(icstr);\r
-    //\r
-    if (!cstr->IncludesModPar(mod,par)) continue;\r
-    if (cstr->GetType()==AliITSAlignMille2ConstrArray::kTypeGaussian) gaussian = kTRUE;\r
-    else meanmed = kTRUE;\r
-    //\r
-    if (meanmed && gaussian) break; // no sense to check further\r
-  }\r
-  //\r
-  return meanmed||gaussian;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Bool_t AliITSAlignMille2::IsParModFamilyVaried(const AliITSAlignMille2Module* mod,Int_t par,Int_t depth) const\r
-{\r
-  // check if parameter par is varied for this module or its children up to the level depth\r
-  if (depth<0) return kFALSE;\r
-  if (mod->GetParOffset(par)>=0) return kTRUE;\r
-  for (int icld=mod->GetNChildren();icld--;) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* child = mod->GetChild(icld);\r
-    if (IsParModFamilyVaried(child, par, depth-1)) return kTRUE;\r
-  }\r
-  return kFALSE;\r
-  //\r
-}\r
-\r
-/*\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Bool_t AliITSAlignMille2::IsParFamilyFree(AliITSAlignMille2Module* mod,Int_t par,Int_t depth) const\r
-{\r
-  // check if parameter par is varied and is not subjected to gaussian constraint for the children up to the level depth\r
-  if (depth<0) return kTRUE;\r
-  for (int icld=mod->GetNChildren();icld--;) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* child = mod->GetChild(icld);\r
-    //if (child->GetParOffset(par)<0) continue;                  // fixed\r
-    Bool_t cstMM=kFALSE,cstGS=kFALSE;\r
-    // does this child have gaussian constraint ?\r
-    if (!IsParModConstrained(child,par,cstMM,cstGS) || !cstGS ) return kTRUE;\r
-    // check its children\r
-    if (!IsParFamilyFree(child,par,depth-1)) return kTRUE;\r
-  }\r
-  return kFALSE;\r
-  //\r
-}\r
-*/\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Bool_t AliITSAlignMille2::IsParFamilyFree(const AliITSAlignMille2Module* mod,Int_t par,Int_t depth) const\r
-{\r
-  // check if parameter par is varied and is not subjected to gaussian constraint for the children up to the level depth\r
-  if (depth<0) return kFALSE;\r
-  for (int icld=mod->GetNChildren();icld--;) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* child = mod->GetChild(icld);\r
-    //if (child->GetParOffset(par)<0) continue;                  // fixed\r
-    Bool_t cstMM=kFALSE,cstGS=kFALSE;\r
-    // does this child have gaussian constraint ?\r
-    if (!IsParModConstrained(child,par,cstMM,cstGS) || !cstGS ) return kTRUE;\r
-    // check its children\r
-    if (IsParFamilyFree(child,par,depth-1)) return kTRUE;\r
-  }\r
-  return kFALSE;\r
-  //\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Double_t AliITSAlignMille2::GetTDriftSDD() const \r
-{\r
-  // obtain drift time corrected for t0\r
-  double t = fCluster.GetDriftTime();\r
-  return t - fDriftTime0[ fCluster.GetUniqueID() ];\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Double_t AliITSAlignMille2::GetVDriftSDD() const \r
-{\r
-  // obtain corrected drift speed\r
-  return fDriftSpeed[ fCluster.GetUniqueID() ];\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-Bool_t AliITSAlignMille2::FixedOrphans() const\r
-{\r
-  // are there fixed modules with no parent (normally in such a case \r
-  // the constraints on the orphans should not be applied\r
-  if (!IsConfigured()) {\r
-    AliInfo("Still not configured");\r
-    return kFALSE;\r
-  }\r
-  for (int i=0;i<fNModules;i++) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* md = GetMilleModule(i);\r
-    if (md->GetParent()==0 && md->GetNParFree()==0) return kTRUE;\r
-  }\r
-  return kFALSE;\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ConvertParamsToGlobal()\r
-{\r
-  // convert params in local frame to global one\r
-  double pars[AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom];\r
-  for (int imd=fNModules;imd--;) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);\r
-    if (mod->GeomParamsGlobal()) continue;\r
-    mod->GetGeomParamsGlo(pars);\r
-    mod->SetParVals(pars,AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom);\r
-    mod->SetGeomParamsGlobal(kTRUE);\r
-  }\r
-}\r
-\r
-//________________________________________________________________________________________________________\r
-void AliITSAlignMille2::ConvertParamsToLocal()\r
-{\r
-  // convert params in global frame to local one\r
-  double pars[AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom];\r
-  for (int imd=fNModules;imd--;) {\r
-    AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);\r
-    if (!mod->GeomParamsGlobal()) continue;\r
-    mod->GetGeomParamsLoc(pars);\r
-    mod->SetParVals(pars,AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom);\r
-    mod->SetGeomParamsGlobal(kFALSE);\r
-  }\r
-}\r
-\r
+/**************************************************************************
+ * Copyright(c) 2007-2009, ALICE Experiment at CERN, All rights reserved. *
+ *                                                                        *
+ * Author: The ALICE Off-line Project.                                    *
+ * Contributors are mentioned in the code where appropriate.              *
+ *                                                                        *
+ * Permission to use, copy, modify and distribute this software and its   *
+ * documentation strictly for non-commercial purposes is hereby granted   *
+ * without fee, provided that the above copyright notice appears in all   *
+ * copies and that both the copyright notice and this permission notice   *
+ * appear in the supporting documentation. The authors make no claims     *
+ * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
+ * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
+ **************************************************************************/
+
+/* $Id$ */
+
+//-----------------------------------------------------------------------------
+//
+//  Interface to AliMillePede2 alignment class for the ALICE ITS detector
+// 
+//  ITS specific alignment class which interface to AliMillepede.   
+//  For each track ProcessTrack calculates the local and global derivatives
+//  at each hit and fill the corresponding local equations. Provide methods for
+//  fixing or constraning detection elements for best results. 
+// 
+//  author M. Lunardon (thanks to J. Castillo), ruben.shahoyan@cern.ch
+//-----------------------------------------------------------------------------
+
+#include <TFile.h>
+#include <TGrid.h>
+#include <TClonesArray.h>
+#include <TMath.h>
+#include <TVirtualFitter.h>
+#include <TGeoManager.h>
+#include <TSystem.h>
+#include <TRandom.h>
+#include <TCollection.h>
+#include <TGeoPhysicalNode.h>
+#include <TMap.h>
+#include <TObjString.h>
+#include <TString.h>
+#include "AliITSAlignMille2.h"
+#include "AliITSgeomTGeo.h"
+#include "AliGeomManager.h"
+#include "AliMillePede2.h"
+#include "AliTrackPointArray.h"
+#include "AliAlignObjParams.h"
+#include "AliLog.h"
+#include "AliTrackFitterRieman.h"
+#include "AliITSAlignMille2Constraint.h"
+#include "AliITSAlignMille2ConstrArray.h"
+#include "AliITSresponseSDD.h"
+#include "AliITSTPArrayFit.h"
+#include "AliCDBManager.h"
+#include "AliCDBStorage.h"
+#include "AliCDBEntry.h"
+#include "AliITSsegmentationSDD.h"
+#include "AliITSDriftSpeedArraySDD.h"
+#include "AliITSCorrectSDDPoints.h"
+#include "AliESDVertex.h"
+
+ClassImp(AliITSAlignMille2)
+
+const Char_t* AliITSAlignMille2::fgkRecKeys[] = {
+  "OCDB_PATH",
+  "OCDB_SPECIFIC",
+  "GEOMETRY_FILE",
+  "SUPERMODULE_FILE",
+  "CONSTRAINTS_REFERENCE_FILE",
+  "PREALIGNMENT_FILE",
+  "PRECALIBSDD_FILE",
+  "PREVDRIFTSDD_FILE",
+  "PRECORRMAPSDD_FILE",
+  "INITCORRMAPSDD_FILE",
+  "INITCALBSDD_FILE",
+  "INITVDRIFTSDD_FILE",
+  "INITDELTA_FILE",
+  "INITGEOM_FILE",
+  "SET_GLOBAL_DELTAS",
+  "CONSTRAINT_LOCAL",
+  "MODULE_VOLUID",
+  "MODULE_INDEX",
+  "SET_PSEUDO_PARENTS",
+  "SET_TRACK_FIT_METHOD",
+  "SET_MINPNT_TRA",
+  "SET_NSTDDEV",
+  "SET_RESCUT_INIT",
+  "SET_RESCUT_OTHER",
+  "SET_LOCALSIGMAFACTOR",
+  "SET_STARTFAC",
+  "SET_FINALFAC",
+  "SET_B_FIELD",
+  "SET_SPARSE_MATRIX",
+  "REQUIRE_POINT",
+  "CONSTRAINT_ORPHANS",
+  "CONSTRAINT_SUBUNITS",
+  "APPLY_CONSTRAINT",
+  "SET_EXTRA_CLUSTERS_MODE",
+  "SET_USE_TPAFITTER",
+  "SET_USE_LOCAL_YERROR",
+  "SET_MIN_POINTS_PER_MODULE",
+  "SET_USE_SDDVDCORRMULT",
+  "SET_WEIGHT_PT",
+  "SET_USE_DIAMOND",
+  "CORRECT_DIAMOND",
+  "SET_USE_VERTEX",
+  "SET_SAME_SDDT0"
+};
+
+const Char_t AliITSAlignMille2::fgkXYZ[] = "XYZ";
+
+//========================================================================================================
+
+AliITSAlignMille2* AliITSAlignMille2::fgInstance = 0;  
+Int_t              AliITSAlignMille2::fgInstanceID = 0;
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+AliITSAlignMille2::AliITSAlignMille2(const Char_t *configFilename,TList *userInfo ) 
+: TObject(),
+  fMillepede(0),
+  fStartFac(16.), 
+  fFinalFac(1.), 
+  fResCutInitial(100.), 
+  fResCut(100.),
+  fNGlobal(0),
+  fNLocal(4),
+  fNStdDev(3),
+  fIsMilleInit(kFALSE),
+  fAllowPseudoParents(kFALSE),
+  //
+  fTPAFitter(0),
+  fCurrentModule(0),
+  fTrack(0),
+  fTrackBuff(0),
+  fCluster(),
+  fCurrentSensID(-1),
+  fClusLoc(12*3),
+  fClusGlo(12*3),
+  fClusSigLoc(12*3),
+  fGlobalDerivatives(0),
+  fMeasLoc(0),
+  fMeasGlo(0),
+  fSigmaLoc(0),
+  fConstrPT(-1),
+  fConstrPTErr(-1),
+  fConstrCharge(0),
+  fRunID(0),
+  //
+  fMinNPtsPerTrack(3),
+  fIniTrackParamsMeth(1),
+  fTotBadLocEqPoints(0),
+  fRieman(0),
+  //
+  fConstraints(0),
+  fCacheMatrixOrig(kMaxITSSensID+1),
+  fCacheMatrixCurr(kMaxITSSensID+1),
+  //
+  fUseGlobalDelta(kFALSE),
+  fTempExcludedModule(-1),
+  fUserProvided(0),
+  //
+  fIniUserInfo(userInfo),
+  fIniGeomPath(""),
+  fIniDeltaPath(""),
+  fIniSDDRespPath(""),
+  fPreCalSDDRespPath(""),
+  fIniSDDVDriftPath(""),
+  fPreSDDVDriftPath(""),
+  fIniSDDCorrMapPath(""),
+  fPreSDDCorrMapPath(""),
+  fConvertPreDeltas(kFALSE),
+  fGeometryPath(""),
+  fPreDeltaPath(""),
+  fConstrRefPath(""),
+  fDiamondPath(""),
+  fGeoManager(0),
+  fIsConfigured(kFALSE),
+  fPreAlignQF(0),
+//
+  fIniRespSDD(0),
+  fPreRespSDD(0),
+  fIniVDriftSDD(0),
+  fPreVDriftSDD(0),
+  fIniCorrMapSDD(0),
+  fPreCorrMapSDD(0),
+  fSegmentationSDD(0),
+  fPrealignment(0),
+  fConstrRef(0),
+  fMilleModule(2),
+  fSuperModule(2),
+  fNModules(0),
+  fNSuperModules(0),
+  fUsePreAlignment(kFALSE),
+  fUseLocalYErr(kFALSE),
+  fBOn(kFALSE),
+  fBField(0.0),
+  fDataType(kCosmics),
+  fMinPntPerSens(0),
+  fBug(0),
+  fMilleVersion(2),
+  fExtraClustersMode(0),
+  fTrackWeight(1),
+  fWeightPt(0.),
+  fIsSDDVDriftMult(kFALSE),
+  fDiamond(),
+  fDiamondI(),
+  fUseDiamond(kFALSE),
+  fUseVertex(kFALSE),
+  fVertexSet(kFALSE),
+  fDiamondPointID(-1),
+  fDiamondModID(-1),
+  fCheckDiamondPoint(kDiamondCheckIfPrompt),
+  fFixCurvIfConstraned(kTRUE),
+  fCurvFitWasConstrained(kFALSE),
+  fConvAlgMatOld(100)
+{
+  /// main constructor that takes input from configuration file
+  for (int i=3;i--;) fSigmaFactor[i] = 1.0;
+  //
+  // new RS
+  for (int i=0;i<3;i++) {
+    fCorrDiamond[i] = 0;
+  }
+  for (int itp=0;itp<kNDataType;itp++) {
+    fRequirePoints[itp] = kFALSE;
+    for (Int_t i=0; i<6; i++) {
+      fNReqLayUp[itp][i]=0;
+      fNReqLayDown[itp][i]=0;
+      fNReqLay[itp][i]=0;
+    }
+    for (Int_t i=0; i<3; i++) {
+      fNReqDetUp[itp][i]=0;
+      fNReqDetDown[itp][i]=0;
+      fNReqDet[itp][i]=0;
+    }
+  }
+  //
+  //  if (ProcessUserInfo(userInfo)) exit(1);
+  //
+  fDiamond.SetVolumeID(kVtxSensVID);
+  fDiamondI.SetVolumeID(kVtxSensVID);
+  float xyzd[3] = {0,0,0};
+  float covd[6] = {1,0,0,1,0,1e4}; 
+  fDiamond.SetXYZ(xyzd,covd); // dummy diamond
+  covd[5] = 1e-4;
+  fDiamondI.SetXYZ(xyzd,covd);
+  //
+  Int_t lc=LoadConfig(configFilename);
+  if (lc) {
+    AliError(Form("Error %d loading configuration from %s",lc,configFilename));
+    exit(1);
+  }
+  //
+  fMillepede = new AliMillePede2();  
+  fgInstance = this;
+  fgInstanceID++;
+  ResetCovIScale();
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+AliITSAlignMille2::~AliITSAlignMille2()
+{
+  /// Destructor
+  delete fMillepede;
+  delete[] fGlobalDerivatives;
+  delete fRieman;
+  delete fPrealignment;
+  delete fConstrRef;
+  delete fPreRespSDD;
+  delete fIniRespSDD;
+  delete fSegmentationSDD;
+  delete fIniVDriftSDD;
+  delete fPreVDriftSDD;
+  delete fIniCorrMapSDD;
+  delete fPreCorrMapSDD;
+  delete fTPAFitter;
+  fCacheMatrixOrig.Delete();
+  fCacheMatrixCurr.Delete();
+  fTrackBuff.Delete();
+  fConstraints.Delete();
+  fMilleModule.Delete();
+  fSuperModule.Delete();
+  if (--fgInstanceID==0) fgInstance = 0;
+}
+
+///////////////////////////////////////////////////////////////////////
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+TObjArray* AliITSAlignMille2::GetConfigRecord(FILE* stream, TString& recTitle, TString& recOpt, Bool_t rew)
+{
+  // read new record from config file
+  TString record;
+  static TObjArray* recElems = 0;
+  if (recElems) {delete recElems; recElems = 0;}
+  recOpt = "";
+  //
+  TString keyws = recTitle;
+  if (!keyws.IsNull()) {
+    keyws.ToUpper();
+    //    keyws += " ";
+  }
+  while (record.Gets(stream)) {
+    int cmt=record.Index("#"); 
+    if (cmt>=0) record.Remove(cmt);  // skip comment
+    record.ReplaceAll("\t"," ");
+    record.ReplaceAll("\r"," ");
+    record.Remove(TString::kBoth,' '); 
+    if (record.IsNull()) continue;      // nothing to decode 
+    if (!keyws.IsNull() && !record.BeginsWith(keyws.Data())) continue; // specific record was requested
+    //
+    recElems = record.Tokenize(" ");
+    recTitle = recElems->At(0)->GetName();
+    recTitle.ToUpper();
+    recOpt = recElems->GetLast()>0 ? recElems->At(1)->GetName() : "";
+    break;
+  }
+  if (rew || !recElems) rewind(stream);
+  return recElems;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::CheckConfigRecords(FILE* stream)
+{  
+  TString record,recTitle;
+  int lineCnt = 0;
+  rewind(stream);
+  while (record.Gets(stream)) {
+    int cmt=record.Index("#"); 
+    lineCnt++;
+    if (cmt>=0) record.Remove(cmt);  // skip comment
+    record.ReplaceAll("\t"," ");
+    record.ReplaceAll("\r"," ");
+    record.Remove(TString::kBoth,' ');
+    if (record.IsNull()) continue;   // nothing to decode  
+    // extract keyword
+    int spc = record.Index(" ");
+    if (spc>0) recTitle = record(0,spc);
+    else     recTitle = record;
+    recTitle.ToUpper();
+    Bool_t strOK = kFALSE;
+    for (int ik=kNKeyWords;ik--;) if (recTitle == fgkRecKeys[ik]) {strOK = kTRUE; break;}
+    if (strOK) continue;
+    //
+    AliError(Form("Unknown keyword %s at line %d",
+                 recTitle.Data(),lineCnt));
+    return -1;
+    //
+  }
+  //
+  rewind(stream);
+  return 0;
+}
+
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::LoadConfig(const Char_t *cfile)
+{  
+  // return 0 if success
+  //        1 if error in module index or voluid
+  //
+  AliInfo(Form("Loading MillePede2 configuration from %s",cfile));
+  AliCDBManager::Instance()->SetCacheFlag(kFALSE);
+  FILE *pfc=fopen(cfile,"r");
+  if (!pfc) return -1;
+  //
+  TString record,recTitle,recOpt,recExt;
+  Int_t nrecElems,irec;
+  TObjArray *recArr=0;
+  //
+  fNModules = 0;
+  Bool_t stopped = kFALSE;
+  //
+  if (CheckConfigRecords(pfc)<0) return -1;
+  //
+  while(1) { 
+    //
+    // ============= 1: we read some important records in predefined order ================
+    //  
+    recTitle = fgkRecKeys[kOCDBDefaultPath];
+    if ( GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) && !recOpt.IsNull() ) {
+      AliInfo(Form("Configuration sets OCDB default storage to %s",recOpt.Data()));
+      AliCDBManager::Instance()->SetDefaultStorage( gSystem->ExpandPathName(recOpt.Data()) );
+      TObjString* objStr = (TObjString*)AliCDBManager::Instance()->GetStorageMap()->GetValue("default");
+      if (!objStr) {stopped = kTRUE; break;}
+      objStr->SetUniqueID(1); // mark as user set
+    }
+    //
+    if (fIniUserInfo && ProcessUserInfo(fIniUserInfo)) { AliError("Failed to process intial User Info"); stopped = kTRUE; break;}
+    //  
+    recTitle = fgkRecKeys[kGeomFile];
+    if ( GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) ) fGeometryPath = gSystem->ExpandPathName(recOpt.Data()); 
+    if ( LoadGeometry(fGeometryPath) ) { AliError("Failed to find/load target ideal Geometry"); stopped = kTRUE; break;}
+    //
+    // Do we use new TrackPointArray fitter ?
+    recTitle = fgkRecKeys[kTPAFitter];
+    if ( GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) ) fTPAFitter = new AliITSTPArrayFit(kNLocal);
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[kSuperModileFile];
+    if ( !GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) || 
+        recOpt.IsNull()                         || 
+        gSystem->ExpandPathName(recOpt)         ||
+        gSystem->AccessPathName(recOpt.Data())  ||
+        LoadSuperModuleFile(recOpt.Data()))
+      { AliError("Failed to find/load SuperModules"); stopped = kTRUE; break;}
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[kConstrRefFile];      // LOCAL_CONSTRAINTS are defined wrt these deltas
+    if ( (recArr = GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1)) ) {
+      if (recOpt.IsNull() || recOpt=="IDEAL") SetConstraintWrtRef( "IDEAL" );
+      else {
+       for (int i=2;i<=recArr->GetLast();i++) {recOpt += " "; recOpt += recArr->At(i)->GetName();} // in case of OCDB string
+       if ( SetConstraintWrtRef(recOpt.Data()) )
+         { AliError("Failed to load reference deltas for local constraints"); stopped = kTRUE; break;}
+      }
+    }
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[kInitGeomFile];
+    if ( (recArr = GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1))  && !recOpt.IsNull() ) {
+      for (int i=2;i<=recArr->GetLast();i++) {recOpt += " "; recOpt += recArr->At(i)->GetName();} // in case of OCDB string
+      fIniGeomPath = recOpt;
+      gSystem->ExpandPathName(fIniGeomPath);
+      fUserProvided |= kSameInitGeomBit;
+      AliInfo(Form("Configuration sets Production Geometry to %s",fIniGeomPath.Data()));
+    }
+    if (fIniGeomPath.IsNull()) fIniGeomPath = fGeometryPath;
+    //  
+    recTitle = fgkRecKeys[kInitDeltaFile];
+    if ( (recArr = GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1))  && !recOpt.IsNull() ) {
+      for (int i=2;i<=recArr->GetLast();i++) {recOpt += " "; recOpt += recArr->At(i)->GetName();} // in case of OCDB string
+      fIniDeltaPath = recOpt;
+      gSystem->ExpandPathName(fIniDeltaPath);
+      fUserProvided |= kSameInitDeltasBit;
+      AliInfo(Form("Configuration sets Production Deltas to %s",fIniDeltaPath.Data()));
+    }
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[kPreDeltaFile];
+    if ( (recArr = GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1)) ) {
+      if (!recOpt.IsNull()) {
+       for (int i=2;i<=recArr->GetLast();i++) {recOpt += " "; recOpt += recArr->At(i)->GetName();} // in case of OCDB string
+       fPreDeltaPath = recOpt;
+       gSystem->ExpandPathName(fPreDeltaPath);
+      }
+      else if (!fIniDeltaPath.IsNull()) {
+       AliInfo("PreAlignment Deltas keyword is present but empty, will set to Init Deltas of the first tree");
+       fPreDeltaPath = fIniDeltaPath;  
+       if (fIniGeomPath != fGeometryPath) fConvertPreDeltas = kTRUE; // production and target geometries are different, request conversion
+      }
+      AliInfo(Form("Configuration sets PreAlignment Deltas to %s",fPreDeltaPath.Data()));
+    }
+    //
+    // if initial deltas were provided, load them, apply to geometry and store are "original" matrices
+    if (CacheMatricesOrig()) {stopped = kTRUE; break;}
+    //  
+    // then load prealignment deltas
+    if (!fPreDeltaPath.IsNull()) {
+      if (fConvertPreDeltas) ConvertDeltas();   // Prealignment deltas are the same as production ones, but need conversion to new geometry
+      else if (LoadDeltas(fPreDeltaPath,fPrealignment)) {stopped = kTRUE; break;} // read deltas from the file
+    }
+    if (fPrealignment && ApplyToGeometry()) {stopped = kTRUE; break;}
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[ kInitCalSDDFile ];
+    if ( (recArr = GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1)) && !recOpt.IsNull()) {
+      for (int i=2;i<=recArr->GetLast();i++) {recOpt += " "; recOpt += recArr->At(i)->GetName();} // in case of OCDB string
+      fIniSDDRespPath = recOpt;
+      gSystem->ExpandPathName(fIniSDDRespPath);
+      fUserProvided |= kSameInitSDDRespBit;
+      AliInfo(Form("Configuration sets Production SDD Response to %s",fIniSDDRespPath.Data()));
+    }
+    if (LoadSDDResponse(fIniSDDRespPath, fIniRespSDD) ) {stopped = kTRUE; break;}
+    //
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[ kInitCorrMapSDDFile ];
+    if ( (recArr = GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1)) && !recOpt.IsNull()) {
+      for (int i=2;i<=recArr->GetLast();i++) {recOpt += " "; recOpt += recArr->At(i)->GetName();} // in case of OCDB string
+      fIniSDDCorrMapPath = recOpt;
+      gSystem->ExpandPathName(fIniSDDCorrMapPath);
+      fUserProvided |= kSameInitSDDCorrMapBit;
+      AliInfo(Form("Configuration sets Production SDD Correction Map to %s",fIniSDDCorrMapPath.Data()));
+    }
+    if (LoadSDDCorrMap(fIniSDDCorrMapPath, fIniCorrMapSDD) ) {stopped = kTRUE; break;}
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[kPreCalSDDFile];
+    if ( (recArr = GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1)) ) {
+      if (!recOpt.IsNull()) {
+       for (int i=2;i<=recArr->GetLast();i++) {recOpt += " "; recOpt += recArr->At(i)->GetName();} // in case of OCDB string
+       fPreCalSDDRespPath = recOpt;
+       gSystem->ExpandPathName(fPreCalSDDRespPath);
+      }
+      else if (!fIniSDDRespPath.IsNull()) {
+       AliInfo("PreCalibration SDD response keyword is present but empty, will set to Init SDD repsonse");
+       fPreCalSDDRespPath = fIniSDDRespPath;   
+      }
+      AliInfo(Form("Configuration sets PreCalibration SDD Response to %s",fPreCalSDDRespPath.Data()));
+    }
+    //
+    if (LoadSDDResponse(fPreCalSDDRespPath, fPreRespSDD) ) {stopped = kTRUE; break;}
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[kPreCorrMapSDDFile];
+    if ( (recArr = GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1)) ) {
+      if (!recOpt.IsNull()) {
+       for (int i=2;i<=recArr->GetLast();i++) {recOpt += " "; recOpt += recArr->At(i)->GetName();} // in case of OCDB string
+       fPreSDDCorrMapPath = recOpt;
+       gSystem->ExpandPathName(fPreSDDCorrMapPath);
+      }
+      else if (!fIniSDDCorrMapPath.IsNull()) {
+       AliInfo("PreCalibration SDD Correction Map keyword is present but empty, will set to Init SDD Correction Map");
+       fPreSDDCorrMapPath = fIniSDDCorrMapPath;
+      }
+      AliInfo(Form("Configuration sets PreCalibration SDD Correction Map to %s",fPreSDDCorrMapPath.Data()));
+    }
+    //
+    if (LoadSDDCorrMap(fPreSDDCorrMapPath, fPreCorrMapSDD) ) {stopped = kTRUE; break;}
+    //    //
+    recTitle = fgkRecKeys[ kInitVDriftSDDFile ];
+    if ( (recArr = GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1)) && !recOpt.IsNull()) {
+      for (int i=2;i<=recArr->GetLast();i++) {recOpt += " "; recOpt += recArr->At(i)->GetName();} // in case of OCDB string
+      fIniSDDVDriftPath = recOpt;
+      gSystem->ExpandPathName(fIniSDDVDriftPath);
+      fUserProvided |= kSameInitSDDVDriftBit;
+      AliInfo(Form("Configuration sets Production SDD VDrift to %s",fIniSDDVDriftPath.Data()));
+    }
+    if (LoadSDDVDrift(fIniSDDVDriftPath, fIniVDriftSDD) ) {stopped = kTRUE; break;}
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[ kPreVDriftSDDFile ];
+    if ( (recArr = GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1)) && !recOpt.IsNull()) {
+      for (int i=2;i<=recArr->GetLast();i++) {recOpt += " "; recOpt += recArr->At(i)->GetName();} // in case of OCDB string
+      fPreSDDVDriftPath = recOpt;
+      gSystem->ExpandPathName(fPreSDDVDriftPath);
+      AliInfo(Form("Configuration sets PreCalibration SDD VDrift to %s",fPreSDDVDriftPath.Data()));
+      if (LoadSDDVDrift(fPreSDDVDriftPath, fPreVDriftSDD) ) {stopped = kTRUE; break;}
+    }
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[ kGlobalDeltas ];
+    if ( GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) ) SetUseGlobalDelta(kTRUE);
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[ kUseDiamond ];
+    if ( GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) ) {
+      if (!GetUseGlobalDelta()) {
+       AliError("Diamond constraint is supported only for Global Frame mode");
+       stopped = kTRUE; 
+       break;
+      }
+      fUseDiamond = kTRUE;
+      if (!recOpt.IsNull()) {
+       fDiamondPath = recOpt;
+       gSystem->ExpandPathName(fDiamondPath);
+       fUserProvided |= kSameDiamondBit;
+       AliInfo(Form("Configuration sets Diamond constraint to %s",fDiamondPath.Data()));
+      }
+    }
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[ kUseVertex ];
+    if ( GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,1) ) {
+      if (!GetUseGlobalDelta()) {
+       AliError("Vertex constraint is supported only for Global Frame mode");
+       stopped = kTRUE; 
+       break;
+      }
+      fUseVertex = kTRUE;
+      if (fUseDiamond) {
+       AliError("Cannot use Vertex and Diamond constraints at the same time");
+       stopped = kTRUE; 
+       break;
+      }
+      AliInfo("Will use Vertex constraint when available");
+    }
+    // =========== 2: see if there are local gaussian constraints defined =====================
+    //            Note that they should be loaded before the modules declaration
+    //
+    recTitle = fgkRecKeys[ kConstrLocal ];
+    while( (recArr=GetConfigRecord(pfc,recTitle,recOpt,0)) ) {
+      nrecElems = recArr->GetLast()+1;
+      if (recOpt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;} // wrong name
+      if (GetConstraint(recOpt.Data())) {
+       AliError(Form("Existing constraint %s repeated",recOpt.Data()));
+       stopped = kTRUE; break;
+      }
+      recExt = recArr->At(2)->GetName();
+      if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}
+      double val = recExt.Atof();      
+      recExt = recArr->At(3)->GetName();
+      if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}
+      double err = recExt.Atof();      
+      int nwgh = nrecElems - 4;
+      double *wgh = new double[nwgh];
+      for (nwgh=0,irec=4;irec<nrecElems;irec++) {
+       recExt = recArr->At(irec)->GetName();
+       if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}
+       wgh[nwgh++] = recExt.Atof();
+      }
+      if (stopped) {delete[] wgh; break;}
+      //
+      ConstrainLocal(recOpt.Data(),wgh,nwgh,val,err);
+      delete[] wgh;
+      //
+    } // end while for loop over local constraints
+    if (stopped) break;
+    //
+    // =========== 3: now read modules to align ===================================
+    //
+    rewind(pfc);
+    // create fixed modules
+    for (int j=0; j<fNSuperModules; j++) {
+      AliITSAlignMille2Module* proto = GetSuperModule(j);
+      if (!proto->IsAlignable()) continue;
+      AliITSAlignMille2Module* mod = new AliITSAlignMille2Module(*proto);
+      // the matrix might be updated in case some prealignment was applied, check 
+      TGeoHMatrix* mup = AliGeomManager::GetMatrix(mod->GetName());
+      if (mup) *(mod->GetMatrix()) = *mup;
+      fMilleModule.AddAtAndExpand(mod,fNModules);
+      mod->SetGeomParamsGlobal(fUseGlobalDelta);
+      mod->SetUniqueID(fNModules++);
+      mod->SetNotInConf(kTRUE);
+    }
+    CreateVertexModule();
+    //
+    while( (recArr=GetConfigRecord(pfc,recTitle="",recOpt,0)) ) {
+      if (!(recTitle==fgkRecKeys[ kModVolID ] || recTitle==fgkRecKeys[ kModIndex ])) continue;
+      // Expected format: MODULE id tolX tolY tolZ tolPsi tolTh tolPhi [[sigX sigY sigZ]  extra params]
+      // where tol* is the tolerance (sigma) for given DOF. 0 means fixed
+      // sig* is the scaling parameters for the errors of the clusters of this module
+      // extra params are defined for specific modules, e.g. t0 and vdrift corrections of SDD
+      //
+      nrecElems = recArr->GetLast()+1;
+      if (nrecElems<2 || !recOpt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}
+      int idx = recOpt.Atoi(); 
+      UShort_t voluid =  (idx<=kMaxITSSensID) ? GetModuleVolumeID(idx) : idx;
+      AliITSAlignMille2Module* mod = 0;
+      //
+      if (voluid>=kMinITSSupeModuleID) { // custom supermodule
+       mod = GetMilleModuleByVID(voluid);
+       if (!mod) { // need to create
+         for (int j=0; j<fNSuperModules; j++) {
+           if (voluid==GetSuperModule(j)->GetVolumeID()) {
+             mod = new AliITSAlignMille2Module(*GetSuperModule(j));
+             // the matrix might be updated in case some prealignment was applied, check 
+             TGeoHMatrix* mup = AliGeomManager::GetMatrix(mod->GetName());
+             if (mup) *(mod->GetMatrix()) = *mup;
+             fMilleModule.AddAtAndExpand(mod,fNModules);
+             mod->SetGeomParamsGlobal(fUseGlobalDelta);
+             mod->SetUniqueID(fNModules++);
+             break;
+           }   
+         }
+       }
+       mod->SetNotInConf(kFALSE);
+      }
+      else if (idx<=kMaxITSSensVID) {
+       mod = new AliITSAlignMille2Module(voluid);
+       fMilleModule.AddAtAndExpand(mod,fNModules);
+       mod->SetGeomParamsGlobal(fUseGlobalDelta);
+       mod->SetUniqueID(fNModules++);
+      }
+      if (!mod) {stopped = kTRUE; break;}  // bad volid
+      //
+      // geometry variation settings
+      for (int i=0;i<AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom;i++) {
+       irec = i+2;
+       if (irec >= nrecElems) break;
+       recExt = recArr->At(irec)->GetName();
+       if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}
+       mod->SetFreeDOF(i, recExt.Atof() );     
+      }
+      if (stopped) break;
+      //
+      // scaling factors for cluster errors
+      // first set default ones
+      for (int i=0;i<3;i++) mod->SetSigmaFactor(i, fSigmaFactor[i]);   
+      for (int i=0;i<3;i++) {
+       irec = i+8;
+       if (irec >= nrecElems) break;
+       recExt = recArr->At(irec)->GetName();
+       if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}
+       mod->SetSigmaFactor(i, recExt.Atof() ); 
+      }     
+      if (stopped) break;
+      //
+      // now comes special detectors treatment
+      if (mod->IsSDD()) {
+       double vl = 0;
+       if (nrecElems>11) {
+         recExt = recArr->At(11)->GetName();
+         if (recExt.IsFloat()) vl = recExt.Atof();
+         else {stopped = kTRUE; break;}
+         irec = 11;
+       }
+       mod->SetFreeDOF(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0,vl);
+       //
+       Bool_t cstLR = kFALSE;
+       for (int lr=0;lr<2;lr++) { // left right side vdrift corrections
+         vl = 0;
+         if (nrecElems>12+lr) {
+           recExt = recArr->At(12+lr)->GetName();
+           if (recExt.IsFloat()) vl = recExt.Atof();
+           else {stopped = kTRUE; break;}
+           irec = 12+lr;
+         }
+         mod->SetFreeDOF(lr==0 ? AliITSAlignMille2Module::kDOFDVL : AliITSAlignMille2Module::kDOFDVR,vl);
+         if (lr==1 && vl>=10) cstLR = kTRUE;  // the right side should be constrained to left one 
+       }
+       if (cstLR) mod->SetVDriftLRSame();
+      }
+      //
+      mod->EvaluateDOF();
+      //
+      // now check if there are local constraints on this module
+      for (++irec;irec<nrecElems;irec++) {
+       recExt = recArr->At(irec)->GetName();
+       if (recExt.IsFloat()) {stopped=kTRUE;break;}
+       AliITSAlignMille2ConstrArray* cstr = (AliITSAlignMille2ConstrArray*)GetConstraint(recExt.Data());
+       if (!cstr) {
+         AliInfo(Form("No Local constraint %s was declared",recExt.Data())); 
+         stopped=kTRUE; 
+         break;
+       }
+       cstr->AddModule(mod);
+      }
+      if (stopped) break;
+    } // end while for loop over modules
+    if (stopped) break;
+    //
+    if (fNModules==0) {AliError("Failed to find any MODULE"); stopped = kTRUE; break;}  
+    BuildHierarchy();  // preprocess loaded modules
+    //
+    // =========== 4: the rest may come in arbitrary order =======================================
+    rewind(pfc);
+    while ( (recArr=GetConfigRecord(pfc,recTitle="",recOpt,0))!=0 ) {
+      //
+      nrecElems = recArr->GetLast()+1;
+      //
+      // some simple flags -----------------------------------------------------------------------
+      //
+      if      (recTitle == fgkRecKeys[ kPseudoParents ])  SetAllowPseudoParents(kTRUE);
+      //
+      // some optional parameters ----------------------------------------------------------------
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kTrackFitMethod ]) {
+       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsDigit() ) {stopped = kTRUE; break;}
+       SetInitTrackParamsMeth(recOpt.Atoi());
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kMinPntTrack ]) {
+       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsDigit() ) {stopped = kTRUE; break;}
+       fMinNPtsPerTrack = recOpt.Atoi();
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kNStDev ]) {
+       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsFloat() ) {stopped = kTRUE; break;}
+       fNStdDev = (Int_t)recOpt.Atof();
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kResCutInit  ]) {
+       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsFloat() ) {stopped = kTRUE; break;}
+       fResCutInitial = recOpt.Atof();
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kResCutOther ]) {
+       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsFloat() ) {stopped = kTRUE; break;}
+       fResCut = recOpt.Atof();
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kLocalSigFactor ]) { //-------------------------
+       for (irec=0;irec<3;irec++) if (nrecElems>irec+1) {
+           fSigmaFactor[irec] = ((TObjString*)recArr->At(irec+1))->GetString().Atof();
+           if (fSigmaFactor[irec]<=0.) stopped = kTRUE;
+         }
+       if (stopped) break; 
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kStartFactor ]) {        //-------------------------
+       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsFloat() ) {stopped = kTRUE; break;}
+       fStartFac = recOpt.Atof();
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kFinalFactor ]) {        //-------------------------
+       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsFloat() ) {stopped = kTRUE; break;}
+       fFinalFac = recOpt.Atof();
+      }
+      //
+      // pepo2708909
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kExtraClustersMode ]) {        //-------------------------
+       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsDigit() ) {stopped = kTRUE; break;}
+       fExtraClustersMode = recOpt.Atoi();
+      }
+      // endpepo270809
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kBField ]) {         //-------------------------
+       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsFloat() ) {stopped = kTRUE; break;}
+       SetBField( recOpt.Atof() );
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kSDDVDCorrMult ]) {         //-------------------------
+       SetSDDVDCorrMult( recOpt.IsNull() || (recOpt.IsFloat() && (recOpt.Atof())>-0.5) ); 
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kWeightPt ]) {         //-------------------------
+       double wgh = 1;
+       if (!recOpt.IsNull()) {
+         if (!recOpt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}
+         else wgh = recOpt.Atof();
+       }
+       SetWeightPt(wgh);
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kSparseMatrix ]) {   // matrix solver type
+       //
+       AliMillePede2::SetGlobalMatSparse(kTRUE);
+       if (recOpt.IsNull()) continue;
+       // solver type and settings
+       if      (recOpt == "MINRES") AliMillePede2::SetIterSolverType( AliMinResSolve::kSolMinRes );
+       else if (recOpt == "FGMRES") AliMillePede2::SetIterSolverType( AliMinResSolve::kSolFGMRes );
+       else {stopped = kTRUE; break;}
+       //
+       if (nrecElems>=3) { // preconditioner type
+         recExt = recArr->At(2)->GetName();
+         if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}
+         AliMillePede2::SetMinResPrecondType( recExt.Atoi() );
+       }
+       //
+       if (nrecElems>=4) { // tolerance
+         recExt = recArr->At(3)->GetName();
+         if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}
+         AliMillePede2::SetMinResTol( recExt.Atof() );
+       }
+       //
+       if (nrecElems>=5) { // maxIter
+         recExt = recArr->At(4)->GetName();
+         if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}
+         AliMillePede2::SetMinResMaxIter( recExt.Atoi() );
+       }       
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kRequirePoint ]) {       //-------------------------
+       // syntax:   REQUIRE_POINT where ndet updw nreqpts
+       //    where = LAYER or DETECTOR
+       //    ndet = detector number: 1-6 for LAYER and 1-3 for DETECTOR (SPD=1, SDD=2, SSD=3)
+       //    updw = 1 for Y>0, -1 for Y<0, 0 if not specified
+       //    nreqpts = minimum number of points of that type
+       if (nrecElems>=5) {
+         recOpt.ToUpper();
+         int lr = ((TObjString*)recArr->At(2))->GetString().Atoi() - 1;
+         int hb = ((TObjString*)recArr->At(3))->GetString().Atoi();
+         int np = ((TObjString*)recArr->At(4))->GetString().Atoi();
+         //
+         int rtp = -1; // use for run type
+         if (nrecElems>5) {
+           TString tpstr = ((TObjString*)recArr->At(5))->GetString();
+           if ( tpstr.Contains("cosmics",TString::kIgnoreCase) ) rtp = kCosmics;
+           else if ( tpstr.Contains("collision",TString::kIgnoreCase) ) rtp = kCollision;
+           else {stopped = kTRUE; break;}
+         }
+         //
+         int tpmn= rtp<0 ? 0 : rtp;
+         int tpmx= rtp<0 ? kNDataType-1 : rtp;
+         for (int itp=tpmn;itp<=tpmx;itp++) {
+           fRequirePoints[itp]=kTRUE;
+           if (recOpt == "LAYER") {
+             if (lr<0 || lr>5) {stopped = kTRUE; break;}
+             if (hb>0) fNReqLayUp[itp][lr]=np;
+             else if (hb<0) fNReqLayDown[itp][lr]=np;
+             else fNReqLay[itp][lr]=np;
+           }
+           else if (recOpt == "DETECTOR") {
+             if (lr<0 || lr>2) {stopped = kTRUE; break;}
+             if (hb>0) fNReqDetUp[itp][lr]=np;
+             else if (hb<0) fNReqDetDown[itp][lr]=np;
+             else fNReqDet[itp][lr]=np;
+           }
+           else {stopped = kTRUE; break;}
+         }
+         if (stopped) break;
+       }
+       else {stopped = kTRUE; break;}
+      }
+      //
+      // global constraints on the subunits/orphans 
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kConstrOrphans ]) {    //------------------------
+       // expect CONSTRAINT_ORPHANS MEAN/MEDIAN Value parID0 ... parID1 ...
+       if (nrecElems<4) {stopped = kTRUE; break;}
+       recExt = recArr->At(2)->GetName();
+       if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}
+       double val = recExt.Atof();
+       UInt_t pattern = 0;
+       for (irec=3;irec<nrecElems;irec++) { // read params to constraint
+         recExt = recArr->At(irec)->GetName();
+         if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}
+         pattern |= 0x1 << recExt.Atoi();
+       }
+       if (stopped) break;
+       if      (recOpt == "MEAN")   ConstrainOrphansMean(val,pattern);
+       else if (recOpt == "MEDIAN") ConstrainOrphansMedian(val,pattern);
+       else {stopped = kTRUE; break;}
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kConstrSubunits ]) {    //------------------------
+       // expect CONSTRAINT_SUBUNITS MEAN/MEDIAN Value parID0 ... parID1 ... VolID1 ... VolIDn - VolIDm
+       if (nrecElems<5) {stopped = kTRUE; break;}
+       recExt = recArr->At(2)->GetName();
+       if (!recExt.IsFloat()) {stopped = kTRUE; break;}
+       double val = recExt.Atof();
+       UInt_t pattern = 0;
+       for (irec=3;irec<nrecElems;irec++) { // read params to constraint
+         recExt = recArr->At(irec)->GetName();
+         if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}
+         int parid = recExt.Atoi();
+         if (parid<kMaxITSSensID) pattern |= 0x1 << recExt.Atoi();
+         else break;           // list of params is over 
+       }
+       if (stopped) break;
+       //
+       Bool_t meanC;
+       if      (recOpt == "MEAN")   meanC = kTRUE;
+       else if (recOpt == "MEDIAN") meanC = kFALSE;
+       else    {stopped = kTRUE; break;}
+       //
+       int curID = -1;
+       int rangeStart = -1;
+       for (;irec<nrecElems;irec++) { // read modules to apply this constraint
+         recExt = recArr->At(irec)->GetName();
+         if (recExt == "-") {rangeStart = curID; continue;}  // range is requested
+         else if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}
+         else curID = recExt.Atoi();
+         //
+         if (curID<=kMaxITSSensID) curID = GetModuleVolumeID(curID);
+         // this was a range start or single 
+         int start;
+         if (rangeStart>=0) {start = rangeStart+1; rangeStart=-1;} // continue the range
+         else start = curID;  // create constraint either for single module (or 1st in the range)
+         for (int id=start;id<=curID;id++) {
+           int id0 = IsVIDDefined(id);
+           if (id0<0) {AliDebug(3,Form("Undefined module %d requested in the SubUnits constraint, skipping",id)); continue;}
+           if (meanC) ConstrainModuleSubUnitsMean(id0,val,pattern);
+           else       ConstrainModuleSubUnitsMedian(id0,val,pattern);
+         }
+       }
+       if (rangeStart>=0) stopped = kTRUE; // unfinished range
+       if (stopped) break;
+      } 
+      // 
+      // association of modules with local constraints
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kApplyConstr ]) {            //------------------------
+       // expect APPLY_CONSTRAINT NAME [NAME1...] [VolID1 ... VolIDn - VolIDm]
+       if (nrecElems<3) {stopped = kTRUE; break;}
+       int nmID0=-1,nmID1=-1;
+       for (irec=1;irec<nrecElems;irec++) { // find the range of constraint names
+         recExt = recArr->At(irec)->GetName();
+         if (recExt.IsFloat()) break;
+         // check if such a constraint was declared
+         if (!GetConstraint(recExt.Data())) {
+           AliInfo(Form("No Local constraint %s was declared",recExt.Data())); 
+           stopped=kTRUE; 
+           break;
+         }
+         if (nmID0<0) nmID0 = irec;
+         nmID1 = irec;
+       }
+       if (stopped) break;
+       //
+       if (irec>=nrecElems) {stopped = kTRUE; break;} // no modules provided
+       //
+       // now read the list of modules to constrain
+       int curID = -1;
+       int rangeStart = -1;
+       for (;irec<nrecElems;irec++) { // read modules to apply this constraint
+         recExt = recArr->At(irec)->GetName();
+         if (recExt == "-") {rangeStart = curID; continue;}  // range is requested
+         else if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}
+         else curID = recExt.Atoi();
+         //
+         if (curID<=kMaxITSSensID) curID = GetModuleVolumeID(curID);
+         //
+         // this was a range start or single 
+         int start;
+         if (rangeStart>=0) {start = rangeStart+1; rangeStart=-1;} // continue the range
+         else start = curID;  // create constraint either for single module (or 1st in the range)
+         for (int id=start;id<=curID;id++) {
+           AliITSAlignMille2Module *md = GetMilleModuleByVID(id);
+           if (!md) {AliDebug(3,Form("Undefined module %d requested in the Local constraint, skipping",id)); continue;}
+           for (int nmid=nmID0;nmid<=nmID1;nmid++) 
+             ((AliITSAlignMille2ConstrArray*)GetConstraint(recArr->At(nmid)->GetName()))->AddModule(md);
+         }
+       }
+       if (rangeStart>=0) stopped = kTRUE; // unfinished range
+       if (stopped) break;
+      }
+      //
+      // request of the same T0 for group of SDD modules
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kSameSDDT0 ]) {            //------------------------
+       // expect SET_SAME_SDDT0 [SensID1 ... SensIDn - SensIDm]
+       if (nrecElems<3) {stopped = kTRUE; break;}
+       //
+       // now read the list of modules to constrain
+       int curID = -1;
+       int rangeStart = -1;
+       AliITSAlignMille2ConstrArray *cstrT0 = new AliITSAlignMille2ConstrArray("SDDT0",0,0,0,0);
+       int naddM = 0;
+       cstrT0->SetPattern(BIT(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0));
+       for (irec=1;irec<nrecElems;irec++) { // read modules to apply this constraint
+         recExt = recArr->At(irec)->GetName();
+         if (recExt == "-") {rangeStart = curID; continue;}  // range is requested
+         else if (!recExt.IsDigit()) {stopped = kTRUE; break;}
+         else curID = recExt.Atoi();
+         //
+         if (curID<kSDDoffsID || curID>=kSDDoffsID+kNSDDmod) {stopped = kTRUE; break;}
+         //
+         // this was a range start or single 
+         int start;
+         if (rangeStart>=0) {start = rangeStart+1; rangeStart=-1;} // continue the range
+         else start = curID;  // create constraint either for single module (or 1st in the range)
+         for (int id=start;id<=curID;id++) {
+           int vid = AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(id);
+           if (vid<=1) {AliDebug(3,Form("Undefined module index %d requested in the SAME_SDDT0 constraint, skipping",id)); continue;}
+           AliITSAlignMille2Module *md = GetMilleModuleByVID(vid);
+           if (!md) {AliDebug(3,Form("Undefined module %d requested in the Local constraint, skipping",id)); continue;}
+           cstrT0->AddModule(md,kFALSE);
+           naddM++;
+         }       
+       }
+       if (rangeStart>=0) stopped = kTRUE; // unfinished range
+       if (stopped) break;
+       if (naddM<2) delete cstrT0;
+       else {
+         cstrT0->SetConstraintID(GetNConstraints());
+         fConstraints.Add(cstrT0);
+       }
+      }
+      //
+      // Do we use new local Y errors?
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kUseLocalYErr ]) {
+       // expect SET_TPAFITTER 
+       fUseLocalYErr = kTRUE;
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kMinPointsSens ]) {         //-------------------------
+       if (recOpt.IsNull() || !recOpt.IsDigit() ) {stopped = kTRUE; break;}
+       SetMinPointsPerSensor( recOpt.Atoi() );
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kOCDBSpecificPath ]) {         //-------------------------
+       if (recOpt.IsNull() || nrecElems<3 ) {stopped = kTRUE; break;}
+       AliCDBManager::Instance()->SetSpecificStorage(recOpt.Data(), gSystem->ExpandPathName(recArr->At(2)->GetName()));
+       AliInfo(Form("Configuration sets OCDB specific storage %s to %s",recOpt.Data(),recArr->At(2)->GetName()));
+       TObjString *pths = (TObjString*)AliCDBManager::Instance()->GetStorageMap()->GetValue(recOpt.Data());
+       if (!pths) { stopped = kTRUE; break; }
+       pths->SetUniqueID(1); // mark as set by user
+      }
+      //
+      else if (recTitle == fgkRecKeys[ kCorrectDiamond ] && fUseDiamond) {         //-------------------------
+       if (nrecElems<4) {stopped = kTRUE; break;}
+       for (int i=0;i<3;i++) fCorrDiamond[i] = ((TObjString*)recArr->At(i+1))->GetString().Atof();
+       AliInfo(Form("Correction %+.4f %+.4f %+.4f will be applied to diamond",fCorrDiamond[0],fCorrDiamond[1],fCorrDiamond[2]));
+      }
+      //
+      else continue; // already processed record
+      //
+    } // end of while loop 4 over the various params 
+    //
+    break;
+  } // end of while(1) loop 
+  //
+  fclose(pfc);
+  if (!fDiamondPath.IsNull() && IsDiamondUsed() && LoadDiamond(fDiamondPath) ) stopped = kTRUE;
+  if (stopped) {
+    AliError(Form("Failed on record %s %s ...\n",recTitle.Data(),recOpt.Data()));
+    return -1;
+  }
+  //
+  if (CacheMatricesCurr()) return -1;
+  SetUseLocalYErrors(fUseLocalYErr); // YErr used only with TPAFitter 
+  fSegmentationSDD = new AliITSsegmentationSDD();
+  //
+  fIsConfigured = kTRUE;
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::BuildHierarchy()
+{
+  // build the hieararhy of the modules to align
+  //
+  if (!GetUseGlobalDelta() && PseudoParentsAllowed()) {
+    AliInfo("PseudoParents mode is allowed only when the deltas are global\n"
+           "Since Deltas are local, switching to NoPseudoParents");
+    SetAllowPseudoParents(kFALSE);
+  }
+  // set parent/child relationship for modules to align
+  AliInfo("Setting parent/child relationships\n");
+  //
+  // 1) child -> parent reference
+  for (int ipar=0;ipar<fNModules;ipar++) {
+    AliITSAlignMille2Module* parent = GetMilleModule(ipar);
+    if (parent->IsSensor()) continue; // sensor cannot be a parent
+    //
+    for (int icld=0;icld<fNModules;icld++) {
+      if (icld==ipar) continue;
+      AliITSAlignMille2Module* child = GetMilleModule(icld);
+      if (!child->BelongsTo(parent)) continue;
+      // child cannot have more sensors than the parent
+      if (child->GetNSensitiveVolumes() > parent->GetNSensitiveVolumes()) continue;
+      //
+      AliITSAlignMille2Module* parOld = child->GetParent();
+      // is this parent candidate closer than the old parent ? 
+      if (parOld && parOld->GetNSensitiveVolumes()<parent->GetNSensitiveVolumes()) continue; // parOld is closer
+      child->SetParent(parent);
+    }
+    //
+  }
+  //
+  // add parent -> children reference
+  for (int icld=0;icld<fNModules;icld++) {
+    AliITSAlignMille2Module* child = GetMilleModule(icld);
+    AliITSAlignMille2Module* parent = child->GetParent();
+    if (parent) parent->AddChild(child);
+  }  
+  //
+  // reorder the modules in such a way that parents come first
+  for (int icld=0;icld<fNModules;icld++) {
+    AliITSAlignMille2Module* child  = GetMilleModule(icld);
+    AliITSAlignMille2Module* parent; 
+    while ( (parent=child->GetParent()) &&  (parent->GetUniqueID()>child->GetUniqueID()) ) {
+      // swap
+      fMilleModule[icld] = parent;
+      fMilleModule[parent->GetUniqueID()] = child;
+      child->SetUniqueID(parent->GetUniqueID());
+      parent->SetUniqueID(icld);
+      child = parent;
+    }
+    //
+  }  
+  //
+  // Go over the child->parent chain and mark modules with explicitly provided sensors.
+  // If the sensors of the unit are explicitly declared, all undeclared sensors are 
+  // suppresed in this unit.
+  for (int icld=fNModules;icld--;) {
+    AliITSAlignMille2Module* child = GetMilleModule(icld);
+    AliITSAlignMille2Module* parent = child->GetParent();
+    if (!parent) continue;
+    //
+    // check if this parent was already processed
+    if (!parent->AreSensorsProvided()) {
+      parent->DelSensitiveVolumes();
+      parent->SetSensorsProvided(kTRUE);
+    }
+    // reattach sensors to parent
+    for (int isc=child->GetNSensitiveVolumes();isc--;) {
+      UShort_t senVID = child->GetSensVolVolumeID(isc);
+      if (!parent->IsIn(senVID)) parent->AddSensitiveVolume(senVID);
+    }
+  }
+  //
+}
+
+// pepo
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::SetCurrentModule(Int_t id)
+{
+  // set the current supermodule
+  // new meaning
+  if (fMilleVersion>=2) {
+    fCurrentModule = GetMilleModule(id);
+    return;
+  }
+  // old meaning
+  if (fMilleVersion<=1) {
+    Int_t index=id;
+    /// set as current the SuperModule that contains the 'index' sens.vol.
+    if (index<0 || index>2197) {
+      AliInfo("index does not correspond to a sensitive volume!");
+      return;
+    }
+    UShort_t voluid=AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(index);
+    Int_t k=IsContained(voluid);
+    if (k>=0){
+      fCurrentSensID = index;
+      fCluster.SetVolumeID(voluid);
+      fCluster.SetXYZ(0,0,0);
+      InitModuleParams();
+    }
+    else
+      AliInfo(Form("module %d not defined\n",index));    
+  }
+}
+// endpepo
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::SetRequiredPoint(Char_t* where, Int_t ndet, Int_t updw, Int_t nreqpts,Int_t runtype) 
+{
+  // set minimum number of points in specific detector or layer
+  // where = LAYER or DETECTOR
+  // ndet = detector number: 1-6 for LAYER and 1-3 for DETECTOR (SPD=1, SDD=2, SSD=3)
+  // updw = 1 for Y>0, -1 for Y<0, 0 if not specified
+  // nreqpts = minimum number of points of that type
+  ndet--;
+  int tpmn= runtype<0 ? 0 : runtype;
+  int tpmx= runtype<0 ? kNDataType-1 : runtype;
+  //
+  for (int itp=tpmn;itp<=tpmx;itp++) {
+    fRequirePoints[itp]=kTRUE;
+    if (strstr(where,"LAYER")) {
+      if (ndet<0 || ndet>5) return;
+      if (updw>0) fNReqLayUp[itp][ndet]=nreqpts;
+      else if (updw<0) fNReqLayDown[itp][ndet]=nreqpts;
+      else fNReqLay[itp][ndet]=nreqpts;
+    }
+    else if (strstr(where,"DETECTOR")) {
+      if (ndet<0 || ndet>2) return;
+      if (updw>0) fNReqDetUp[itp][ndet]=nreqpts;
+      else if (updw<0) fNReqDetDown[itp][ndet]=nreqpts;
+      else fNReqDet[itp][ndet]=nreqpts;        
+    }
+  }
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::GetModuleIndex(const Char_t *symname) 
+{
+  /// index from symname
+  if (!symname) return -1;
+  for (Int_t i=0;i<=kMaxITSSensID; i++) {
+    if (!strcmp(symname,AliITSgeomTGeo::GetSymName(i))) return i;
+  }
+  return -1;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::GetModuleIndex(UShort_t voluid) 
+{
+  /// index from volume ID
+  AliGeomManager::ELayerID lay = AliGeomManager::VolUIDToLayer(voluid);
+  if (lay<1|| lay>6) return -1;
+  Int_t idx=Int_t(voluid)-2048*lay;
+  if (idx>=AliGeomManager::LayerSize(lay)) return -1;
+  for (Int_t ilay=1; ilay<lay; ilay++) 
+    idx += AliGeomManager::LayerSize(ilay);
+  return idx;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+UShort_t AliITSAlignMille2::GetModuleVolumeID(const Char_t *symname) 
+{
+  /// volume ID from symname
+  /// works for sensitive volumes only
+  if (!symname) return 0;
+
+  for (UShort_t voluid=2000; voluid<13300; voluid++) {
+    Int_t modId;
+    AliGeomManager::ELayerID layerId = AliGeomManager::VolUIDToLayer(voluid,modId);
+    if (layerId>0 && layerId<7 && modId>=0 && modId<AliGeomManager::LayerSize(layerId)) {
+      if (!strcmp(symname,AliGeomManager::SymName(layerId,modId))) return voluid;
+    }
+  }
+
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+UShort_t AliITSAlignMille2::GetModuleVolumeID(Int_t index) 
+{
+  /// volume ID from index
+  if (index<0) return 0;
+  if (index<2198)
+    return GetModuleVolumeID(AliITSgeomTGeo::GetSymName(index));
+  else {
+    for (int i=0; i<fNSuperModules; i++) {
+      if (GetSuperModule(i)->GetIndex()==index) return GetSuperModule(i)->GetVolumeID();
+    }
+  }
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::LoadGeometry(TString& path) 
+{
+  // initialize ideal geometry
+  AliInfo(Form("Loading ideal geometry %s",path.Data()));
+  if (path.IsNull()) {
+    AliError("Path to geometry is not provided");
+    return -1;
+  }
+  //
+  AliCDBEntry *entry = 0;
+  TGeoManager *gm = 0;
+  while(1) {
+    if (path.BeginsWith("path: ")) { // must load from OCDB
+      entry = GetCDBEntry(path.Data());
+      if (!entry) break;
+      gm = (TGeoManager*) entry->GetObject();
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      //      AliCDBManager::Instance()->UnloadFromCache(path); // don't want cached object, read new copy
+      //      delete cdbId;
+      //      delete entry;
+      break;
+    }
+    //
+    if (gSystem->AccessPathName(path.Data())) break;
+    TFile* precf = TFile::Open(path.Data());
+    if (precf->FindKey("ALICE")) gm = (TGeoManager*)precf->Get("ALICE");
+    else if (precf->FindKey("AliCDBEntry") && (entry=(AliCDBEntry*)precf->Get("AliCDBEntry"))) {
+      gm = (TGeoManager*) entry->GetObject();
+      if (gm && gm->InheritsFrom(TGeoManager::Class())) entry->SetObject(NULL);
+      else gm = 0;
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      delete entry;
+    }
+    precf->Close();
+    delete precf;
+    break;
+  } 
+  //
+  if (!gm) {AliError(Form("Failed to load geometry from %s",path.Data())); return -1;}
+  AliGeomManager::SetGeometry(gm);
+  fGeoManager = AliGeomManager::GetGeometry();
+  if (!fGeoManager) {
+    AliInfo("Couldn't initialize geometry");
+    return -1;
+  }
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::SetConstraintWrtRef(const char* reffname) 
+{
+  // Load the global deltas from this file. The local gaussian constraints on some modules 
+  // will be defined with respect to the deltas from this reference file, converted to local
+  // delta format. Note: conversion to local format requires reloading the geometry!
+  //
+  AliInfo(Form("Loading reference deltas for local constraints from %s",reffname));
+  if (!fGeoManager) return -1; 
+  fConstrRefPath = reffname;
+  if (fConstrRefPath == "IDEAL") { // the reference is the ideal geometry, just create dummy reference array
+    fConstrRef = new TClonesArray("AliAlignObjParams",1);
+    return 0;
+  }
+  if (LoadDeltas(fConstrRefPath,fConstrRef)) return -1;
+  //
+  // we need ideal geometry to convert global deltas to local ones
+  if (fUsePreAlignment) {
+    AliError("The call of SetConstraintWrtRef must be done before application of the prealignment");
+    return -1;
+  }
+  //
+  AliInfo("Converting global reference deltas to local ones");
+  Int_t nprea = fConstrRef->GetEntriesFast();
+  for (int ix=0; ix<nprea; ix++) {
+    AliAlignObjParams *preo=(AliAlignObjParams*) fConstrRef->At(ix);
+    if (!preo->ApplyToGeometry()) return -1;
+  }
+  //
+  // now convert the global reference deltas to local ones
+  for (int i=fConstrRef->GetEntriesFast();i--;) {
+    AliAlignObjParams *preo = (AliAlignObjParams*)fConstrRef->At(i);
+    TGeoHMatrix * mupd = AliGeomManager::GetMatrix(preo->GetSymName());
+    if (!mupd) {  // this is not alignable entry, need to look in the supermodules
+      for (int im=fNSuperModules;im--;) {
+       AliITSAlignMille2Module* mod = GetSuperModule(im);
+       if ( strcmp(mod->GetName(), preo->GetSymName()) ) continue;
+       mupd = mod->GetMatrix();
+       break;
+      }
+      if (!mupd) {
+       AliError(Form("Failed to find the volume for reference %s",preo->GetSymName()));
+       return -1;
+      }
+    } 
+    TGeoHMatrix preMat;
+    preo->GetMatrix(preMat);                     //  Delta_Glob
+    TGeoHMatrix tmpMat    = *mupd;               //  Delta_Glob * Delta_Glob_Par * M
+    preMat.MultiplyLeft( &tmpMat.Inverse() );    //  M^-1 * Delta_Glob_Par^-1 = (Delta_Glob_Par * M)^-1
+    tmpMat.MultiplyLeft( &preMat );              //  (Delta_Glob_Par * M)^-1 * Delta_Glob * Delta_Glob_Par * M = Delta_loc
+    preo->SetMatrix(tmpMat);     // local corrections 
+  }
+  //
+  // we need to reload the geometry spoiled by this reference deltas...
+  delete fGeoManager;
+  AliInfo("Reloading target ideal geometry");
+  return LoadGeometry(fGeometryPath);
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::Init()
+{
+  // perform global initialization
+  //
+  if (fIsMilleInit) {
+    AliInfo("Millepede has been already initialized!");
+    return;
+  }
+  // range constraints in such a way that the childs are constrained before their parents
+  // orphan constraints come last
+  for (int ic=0;ic<GetNConstraints();ic++) {
+    for (int ic1=ic+1;ic1<GetNConstraints();ic1++) {
+      AliITSAlignMille2Constraint *cst0 = GetConstraint(ic);
+      AliITSAlignMille2Constraint *cst1 = GetConstraint(ic1);
+      if (cst0->GetModuleID()<cst1->GetModuleID()) {
+       // swap
+       fConstraints[ic] = cst1;
+       fConstraints[ic1] = cst0;
+      }
+    }
+  }
+  //
+  if (!GetUseGlobalDelta()) {
+    AliInfo("ATTENTION: The parameters are defined in the local frame, no check for degeneracy will be done");
+    for (int imd=fNModules;imd--;) {
+      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);
+      int npar = mod->GetNParTot();
+      // the parameter may have max 1 free instance, otherwise the equations are underdefined
+      for (int ipar=0;ipar<npar;ipar++) {
+       if (!mod->IsFreeDOF(ipar)) continue;
+       mod->SetParOffset(ipar,fNGlobal++);
+      }
+    }
+  }
+  else {
+    // init millepede, decide which parameters are to be fitted explicitly
+    for (int imd=fNModules;imd--;) {
+      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);
+      if (mod->IsNotInConf()) continue; // dummy module
+      int npar = mod->GetNParTot();
+      // the parameter may have max 1 free instance, otherwise the equations are underdefined
+      for (int ipar=0;ipar<npar;ipar++) {
+       if (!mod->IsFreeDOF(ipar)) continue;  // fixed
+       //
+       int nFreeInstances = 0;
+       //
+       AliITSAlignMille2Module* parent = mod;
+       Bool_t cstMeanMed=kFALSE,cstGauss=kFALSE;
+       //
+       Bool_t addToFit = kFALSE;       
+       // the parameter may be ommitted from explicit fit (if PseudoParentsAllowed is true) if
+       // 1) it is not explicitly constrained or its does not participate in Gaussian constraint
+       // 2) the same applies to all of its parents
+       // 3) it has at least 1 unconstrained direct child
+       while(parent) {
+         if (parent->IsNotInConf()) {parent = parent->GetParent(); continue;}
+         if (!parent->IsFreeDOF(ipar)) {parent = parent->GetParent(); continue;}
+         nFreeInstances++;
+         if (IsParModConstrained(parent,ipar, cstMeanMed, cstGauss)) nFreeInstances--;
+         if (cstGauss) addToFit = kTRUE;
+         parent = parent->GetParent();
+       }
+       if (nFreeInstances>1) {
+         AliError(Form("Parameter#%d of module %s\nhas %d free instances in the "
+                       "unconstrained parents\nSystem is undefined",ipar,mod->GetName(),nFreeInstances));
+         exit(1);
+       }
+       //
+       // i) Are PseudoParents allowed?
+       if (!PseudoParentsAllowed()) addToFit = kTRUE;
+       // ii) check if this module has no child with such a free parameter. Since the order of this check 
+       // goes from child to parent, by this moment such a parameter must have been already added
+       else if (!IsParModFamilyVaried(mod,ipar))  addToFit = kTRUE;  // no varied children at all
+       else if (!IsParFamilyFree(mod,ipar,1))     addToFit = kTRUE;  // no unconstrained direct children
+       // otherwise the value of this parameter can be extracted from simple contraint and the values of 
+       // the relevant parameters of its children the fit is done. Hence it is not included
+       if (!addToFit) continue;
+       //
+       // shall add this parameter to explicit fit
+       //      printf("Adding %s %d -> %d\n",mod->GetName(), ipar, fNGlobal);
+       mod->SetParOffset(ipar,fNGlobal++);
+      }
+    }
+  }
+  //
+  AliInfo(Form("Initializing Millepede with %d gpar, %d lpar and %d stddev ...",fNGlobal, kNLocal, fNStdDev));
+  fGlobalDerivatives = new Double_t[fNGlobal];
+  memset(fGlobalDerivatives,0,fNGlobal*sizeof(Double_t));
+  //
+  fMillepede->InitMille(fNGlobal,kNLocal,fNStdDev,fResCut,fResCutInitial);
+  fMillepede->SetMinPntValid(fMinPntPerSens);
+  fIsMilleInit = kTRUE;
+  //
+  ResetLocalEquation();    
+  AliInfo("Parameters initialized to zero");
+  //
+  /// Fix non free parameters
+  for (Int_t i=0; i<fNModules; i++) {
+    AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(i);
+    for (Int_t j=0; j<mod->GetNParTot(); j++) {
+      if (mod->GetParOffset(j)<0) continue; // not varied
+      FixParameter(mod->GetParOffset(j),mod->GetParConstraint(j));
+      fMillepede->SetParamGrID(i, mod->GetParOffset(j));
+    }
+  }
+  //
+  ResetCovIScale();
+  // Set iterations
+  if (fStartFac>1) fMillepede->SetIterations(fStartFac);    
+  if (fFinalFac>1) fMillepede->SetChi2CutRef(fFinalFac);    
+  fTrackBuff.Expand(24);
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::AddConstraint(Double_t *par, Double_t value, Double_t sigma) 
+{
+  /// Constrain equation defined by par to value
+  if (!fIsMilleInit) Init();
+  fMillepede->SetGlobalConstraint(par, value, sigma);
+  AliInfo("Adding constraint");
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::InitGlobalParameters(Double_t *par) 
+{
+  /// Initialize global parameters with par array
+  if (!fIsMilleInit) Init();
+  fMillepede->SetGlobalParameters(par);
+  AliInfo("Init Global Parameters");
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________ 
+void AliITSAlignMille2::FixParameter(Int_t iPar, Double_t value) 
+{
+  /// Parameter iPar is encourage to vary in [-value;value]. 
+  /// If value == 0, parameter is fixed
+  if (!fIsMilleInit) {
+    AliInfo("Millepede has not been initialized!");
+    return;
+  }
+  fMillepede->SetParSigma(iPar, value);
+  if (IsZero(value)) AliInfo(Form("Parameter %i Fixed", iPar));
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ResetLocalEquation()
+{
+  /// Reset the derivative vectors
+  for(int i=kNLocal;i--;)  fLocalDerivatives[i] = 0.0;
+  memset(fGlobalDerivatives, 0, fNGlobal*sizeof(double) );
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::ApplyToGeometry() 
+{
+  // apply prealignment to ideal geometry
+  Int_t nprea = fPrealignment->GetEntriesFast();
+  AliInfo(Form("Array of prealignment deltas: %d entries",nprea));
+  //
+  for (int ix=0; ix<nprea; ix++) {
+    AliAlignObjParams *preo=(AliAlignObjParams*) fPrealignment->At(ix);
+    Int_t index=AliITSAlignMille2Module::GetIndexFromVolumeID(preo->GetVolUID());
+    if (index>=0) {
+      if (index>=fPreAlignQF.GetSize()) fPreAlignQF.Set(index+10);
+      fPreAlignQF[index] = (int) preo->GetUniqueID()+1;
+    }
+    if (!preo->ApplyToGeometry()) {
+      AliError(Form("Failed on ApplyToGeometry at %s",preo->GetSymName()));
+      return -1;
+    }
+  }
+  //
+  fUsePreAlignment = kTRUE;
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::GetPreAlignmentQualityFactor(Int_t index) const
+{
+  // quality factors from prealignment
+  if (!fUsePreAlignment || index<0 || index>=fPreAlignQF.GetSize()) return -1;
+  return fPreAlignQF[index]-1;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+AliTrackPointArray *AliITSAlignMille2::PrepareTrack(const AliTrackPointArray *atp) 
+{
+  /// create a new AliTrackPointArray keeping only defined modules
+  /// move points according to a given prealignment, if any
+  /// sort alitrackpoints w.r.t. global Y direction, if cosmics
+  const Double_t kRad2L[6] = {5*5,10*10,18*18,30*30,40*40,60*60};
+  const Float_t kSensSigY2[6] = {200e-4*200e-4/12, 200e-4*200e-4/12, 
+                                300e-4*300e-4/12, 300e-4*300e-4/12, 
+                                300e-4*300e-4/12, 300e-4*300e-4/12}; // thickness^2/12
+  //
+  fTrack = NULL;
+  Int_t   idx[20] = {0};
+  Short_t lrID[20] = {0};
+  Int_t npts=atp->GetNPoints();
+  if (npts<fMinNPtsPerTrack) return NULL;
+  TGeoHMatrix hcov;
+  //
+  /// checks if AliTrackPoints belong to defined modules
+  Int_t ngoodpts=0;
+  Int_t intidx[20];
+  for (int j=0; j<npts; j++) {
+    intidx[j] = GetRequestedModID(atp->GetVolumeID()[j]);
+    if (intidx[j]<0) continue;
+    ngoodpts++;
+    Float_t xx=atp->GetX()[j];
+    Float_t yy=atp->GetY()[j];
+    Float_t r=xx*xx + yy*yy;
+    int lay;
+    for (lay=0;lay<6;lay++) if (r<kRad2L[lay]) break;
+    if (lay>5) continue;
+    lrID[j] = lay;
+  }
+  //
+  AliDebug(3,Form("Number of points in defined modules: %d out of %d",ngoodpts,npts));
+
+  // pepo270809
+  Int_t nextra=0;
+  // extra clusters selection mode  
+  if (fExtraClustersMode) {
+    // 1 = keep one cluster, remove randomly the extra
+    // 2 = keep one cluster, remove the internal one
+    // 10 = keep tracks only if at least one extra is present
+    
+    int iextra1[20],iextra2[20],layovl[20];
+    // extra clusters mapping
+    for (Int_t ipt=0; ipt<npts; ipt++) {
+      if (intidx[ipt]<0) continue; // looks only defined modules...
+      float p1x=atp->GetX()[ipt];
+      float p1y=atp->GetY()[ipt];
+      float p1z=atp->GetZ()[ipt];
+      int lay1=int(AliGeomManager::VolUIDToLayer(atp->GetVolumeID()[ipt]));
+      float r1 = p1x*p1x + p1y*p1y;
+      UShort_t volid1=atp->GetVolumeID()[ipt];
+      
+      for (int ik=ipt+1; ik<npts; ik++) {
+       if (intidx[ik]<0) continue;
+       // compare point ipt with next ones
+       int lay2=int(AliGeomManager::VolUIDToLayer(atp->GetVolumeID()[ik]));
+       // check if same layer
+       if (lay2 != lay1) continue;
+       UShort_t volid2=atp->GetVolumeID()[ik];
+       // check if different module
+       if (volid1 == volid2) continue;
+
+       float p2x=atp->GetX()[ik];
+       float p2y=atp->GetY()[ik];
+       float p2z=atp->GetZ()[ik];
+       float r2 = p2x*p2x + p2y*p2y;   
+       float dr= (p1x-p2x)*(p1x-p2x) + (p1y-p2y)*(p1y-p2y) + (p1z-p2z)*(p1z-p2z);
+       
+       // looks for pairs with dr<1 cm, same layer but different module
+       if (dr<1.0) {
+         // extra1 is the one with smaller radius in rphi plane
+         if (r1<r2) {
+           iextra1[nextra]=ipt;
+           iextra2[nextra]=ik;
+         }
+         else {
+           iextra1[nextra]=ik;
+           iextra2[nextra]=ipt;
+         }
+         layovl[nextra]=lay1;    
+         nextra++;
+       }
+      }
+    } // end overlaps mapping
+    
+    // mode=1: keep only one clusters and remove the other randomly
+    if (fExtraClustersMode==1 && nextra) {
+      for (int ie=0; ie<nextra; ie++) {
+       if (gRandom->Rndm()<0.5) 
+         intidx[iextra1[ie]]=-1;
+       else
+         intidx[iextra2[ie]]=-1;         
+      }
+    }
+
+    // mode=2: keep only one clusters and remove the other...
+    if (fExtraClustersMode==2 && nextra) {
+      for (int ie=0; ie<nextra; ie++) {
+       if (layovl[ie]==1) intidx[iextra2[ie]]=-1;
+       else if (layovl[ie]==2) intidx[iextra1[ie]]=-1;
+       else intidx[iextra1[ie]]=-1;      
+      }
+    }
+
+    // mode=10: reject track if no overlaps are present
+    if (fExtraClustersMode==10 && nextra==0) {
+      AliInfo("Track with no extra clusters: rejected!");
+      return NULL;
+    }
+    
+    // recalculate ngoodpts
+    ngoodpts=0;
+    for (int i=0; i<npts; i++) {
+      if (intidx[i]>=0) ngoodpts++;
+    }
+  }
+  // endpepo270809
+
+  // reject track if not enough points are left
+  if (ngoodpts<fMinNPtsPerTrack) {
+    AliDebug(2,"Track with not enough points!");
+    return NULL;
+  }
+  // >> RS
+  AliTrackPoint p;
+  // check points in specific places
+  if (fRequirePoints[fDataType]) {
+    Int_t nlayup[6],nlaydown[6],nlay[6];
+    Int_t ndetup[3],ndetdown[3],ndet[3];
+    for (Int_t j=0; j<6; j++) {nlayup[j]=0; nlaydown[j]=0; nlay[j]=0;}
+    for (Int_t j=0; j<3; j++) {ndetup[j]=0; ndetdown[j]=0; ndet[j]=0;}
+    
+    for (int i=0; i<npts; i++) {
+      // skip not defined points
+      if (intidx[i]<0) continue;
+      //      
+      Float_t yy=atp->GetY()[i];
+      int lay = lrID[i];
+      int det=lay/2;
+      //printf("Point %d - x=%f  y=%f  R=%f  lay=%d  det=%d\n",i,xx,yy,r,lay,det);
+
+      if (yy>=0.0) { // UP point
+       nlayup[lay]++;
+       nlay[lay]++;
+       ndetup[det]++;
+       ndet[det]++;
+      }
+      else {
+       nlaydown[lay]++;
+       nlay[lay]++;
+       ndetdown[det]++;
+       ndet[det]++;
+      }
+    }
+    //
+    // checks minimum values
+    Bool_t isok=kTRUE;
+    for (Int_t j=0; j<6; j++) {
+      if (nlayup[j]<fNReqLayUp[fDataType][j]) isok=kFALSE; 
+      if (nlaydown[j]<fNReqLayDown[fDataType][j]) isok=kFALSE; 
+      if (nlay[j]<fNReqLay[fDataType][j]) isok=kFALSE; 
+    }
+    for (Int_t j=0; j<3; j++) {
+      if (ndetup[j]<fNReqDetUp[fDataType][j]) isok=kFALSE; 
+      if (ndetdown[j]<fNReqDetDown[fDataType][j]) isok=kFALSE; 
+      if (ndet[j]<fNReqDet[fDataType][j]) isok=kFALSE; 
+    }
+    if (!isok) {
+      AliDebug(2,Form("Track does not meet all location point requirements!"));
+      return NULL;
+    }
+  }
+  // build a new track with (sorted) (prealigned) good points
+  // pepo200709
+  //fTrack = (AliTrackPointArray*)fTrackBuff[ngoodpts-fMinNPtsPerTrack];
+  Int_t addVertex = IsTypeCollision()&&((fUseDiamond&&(fCheckDiamondPoint!=kDiamondIgnore))||(fUseVertex&&fVertexSet)) ? 1 : 0;
+  fTrack = (AliTrackPointArray*)fTrackBuff[ngoodpts + addVertex ];
+  if (!fTrack) {
+    fTrack = new AliTrackPointArray(ngoodpts + addVertex);
+    //    fTrackBuff.AddAtAndExpand(fTrack,ngoodpts-fMinNPtsPerTrack);
+    fTrackBuff.AddAtAndExpand(fTrack,ngoodpts + addVertex);
+  }  
+  //  fTrack = new AliTrackPointArray(ngoodpts);
+  // endpepo200709
+  //
+  //
+  for (int i=0; i<npts; i++) idx[i]=i;
+  // sort track if required
+  if (IsTypeCosmics()) TMath::Sort(npts,atp->GetY(),idx); // sort descending...
+  //
+  Int_t npto=0;
+  if (fClusLoc.GetSize()<3*npts)    fClusLoc.Set(3*npts);
+  if (fClusGlo.GetSize()<3*npts)    fClusGlo.Set(3*npts);
+  if (fClusSigLoc.GetSize()<3*npts) fClusSigLoc.Set(3*npts);
+  //
+  for (int i=0; i<npts; i++) {
+    // skip not defined points
+    if (intidx[idx[i]]<0) continue;
+    atp->GetPoint(p,idx[i]);
+    int sid = AliITSAlignMille2Module::GetIndexFromVolumeID(p.GetVolumeID());
+    //
+    // prealign point if required
+    // get matrix used to produce the digits
+    AliITSAlignMille2Module *mod = GetMilleModule(intidx[idx[i]]);
+    TGeoHMatrix *svOrigMatrix = GetSensorOrigMatrixSID(sid); //mod->GetSensitiveVolumeOrigGlobalMatrix(p.GetVolumeID());
+    // get back real local coordinate
+    fMeasLoc  = fClusLoc.GetArray() + npto*3;
+    fMeasGlo  = fClusGlo.GetArray() + npto*3;
+    fSigmaLoc = fClusSigLoc.GetArray() + npto*3;
+    fMeasGlo[0]=p.GetX();
+    fMeasGlo[1]=p.GetY();
+    fMeasGlo[2]=p.GetZ();
+    AliDebug(3,Form("Global coordinates of measured point : X=%+f  Y=%+f  Z=%+f \n",fMeasGlo[0],fMeasGlo[1],fMeasGlo[2]));
+    svOrigMatrix->MasterToLocal(fMeasGlo,fMeasLoc);
+    AliDebug(3,Form("Local coordinates of measured point : X=%+f  Y=%+f  Z=%+f \n",fMeasLoc[0],fMeasLoc[1],fMeasLoc[2]));
+    //
+    if (p.GetDriftTime()>0) ProcessSDDPointInfo(&p,sid, npto);     // for SDD points extract vdrift
+    //
+    // update covariance matrix
+    Double_t hcovel[9];
+    hcovel[0]=double(p.GetCov()[0]);
+    hcovel[1]=double(p.GetCov()[1]);
+    hcovel[2]=double(p.GetCov()[2]);
+    hcovel[3]=double(p.GetCov()[1]);
+    hcovel[4]=double(p.GetCov()[3]);
+    hcovel[5]=double(p.GetCov()[4]);
+    hcovel[6]=double(p.GetCov()[2]);
+    hcovel[7]=double(p.GetCov()[4]);
+    hcovel[8]=double(p.GetCov()[5]);
+    hcov.SetRotation(hcovel);
+    //
+    if (AliLog::GetGlobalDebugLevel()>=2) {
+      AliInfo("Original Global Cov Matrix");
+      printf("%+.4e %+.4e %+.4e\n%+.4e %+.4e\n%+.4e\n",hcovel[0],hcovel[1],hcovel[2],hcovel[4],hcovel[5],hcovel[8]);
+    } 
+    //
+    // now rotate in local system
+    hcov.Multiply(svOrigMatrix);
+    hcov.MultiplyLeft(&svOrigMatrix->Inverse());
+    // now hcov is LOCAL COVARIANCE MATRIX
+    // apply sigma scaling
+    Double_t *hcovscl = hcov.GetRotationMatrix();
+    /*
+    const float *cv = p.GetCov();
+    printf("## %d %d  %+.3e %+.3e %+.3e   %+.3e %+.3e %+.3e   %+.3e %+.3e %+.3e %+.3e %+.3e %+.3e   %+.3e %+.3e %+.3e\n",
+          sid,p.GetClusterType(),
+          fMeasGlo[0],fMeasGlo[1],fMeasGlo[2],
+          fMeasLoc[0],fMeasLoc[1],fMeasLoc[2],
+          cv[0],cv[1],cv[2],cv[3],cv[4],cv[5],
+          hcovscl[0],hcovscl[4],hcovscl[8]);
+
+    */
+    if (AliLog::GetGlobalDebugLevel()>=2) {
+      AliInfo("Original Local Cov Matrix");
+      printf("%+.4e %+.4e %+.4e\n%+.4e %+.4e\n%+.4e\n",hcovscl[0],hcovscl[1],hcovscl[2],hcovscl[4],hcovscl[5],hcovscl[8]);
+    } 
+    hcovscl[4] = fUseLocalYErr ? kSensSigY2[lrID[idx[i]]] : 1E-8; // error due to the sensor thickness
+    //
+    for (int ir=3;ir--;) for (int ic=3;ic--;) {
+       if (ir==ic) {     
+         if ( IsZero(hcovscl[ir*3+ic],1e-8) ) hcovscl[ir*3+ic] = 1E-8;
+         else hcovscl[ir*3+ic] *= mod->GetSigmaFactor(ir)*mod->GetSigmaFactor(ic); //RRR
+         fSigmaLoc[ir] = TMath::Sqrt(hcovscl[ir*3+ic]);
+       }
+       else hcovscl[ir*3+ic]  = 0;
+      }
+    //
+    if (AliLog::GetGlobalDebugLevel()>=2) {
+      AliInfo("Modified Local Cov Matrix");
+      printf("%+.4e %+.4e %+.4e\n%+.4e %+.4e\n%+.4e\n",hcovscl[0],hcovscl[1],hcovscl[2],hcovscl[4],hcovscl[5],hcovscl[8]);
+    } 
+    //
+    if (fBug==1) {
+      // correzione bug LAYER 5  SSD temporanea..
+      int ssdidx=AliITSAlignMille2Module::GetIndexFromVolumeID(p.GetVolumeID());
+      if (ssdidx>=500 && ssdidx<1248) {
+       int ladder=(ssdidx-500)%22;
+       if (ladder==18) p.SetVolumeID(AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(ssdidx+1));
+       if (ladder==19) p.SetVolumeID(AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(ssdidx-1));
+      }
+    }
+    /// get (evenctually prealigned) matrix of sens. vol.
+    TGeoHMatrix *svMatrix = GetSensorCurrMatrixSID(sid);    //mod->GetSensitiveVolumeMatrix(p.GetVolumeID());
+    // modify global coordinates according with pre-aligment
+    svMatrix->LocalToMaster(fMeasLoc,fMeasGlo);
+    // now rotate in local system
+    hcov.Multiply(&svMatrix->Inverse());
+    hcov.MultiplyLeft(svMatrix);         // hcov is back in GLOBAL RF
+    // cure once more
+    for (int ir=3;ir--;) for (int ic=3;ic--;) if (IsZero(hcovscl[ir*3+ic])) hcovscl[ir*3+ic] = 0.;
+    //    printf("\nErrMatGlob: after\n"); hcov.Print(""); //RRR
+    //
+    if (AliLog::GetGlobalDebugLevel()>=2) {
+      AliInfo("Modified Global Cov Matrix");
+      printf("%+.4e %+.4e %+.4e\n%+.4e %+.4e\n%+.4e\n",hcovscl[0],hcovscl[1],hcovscl[2],hcovscl[4],hcovscl[5],hcovscl[8]);
+    } 
+    //
+    Float_t pcov[6];
+    pcov[0]=hcovscl[0];
+    pcov[1]=hcovscl[1];
+    pcov[2]=hcovscl[2];
+    pcov[3]=hcovscl[4];
+    pcov[4]=hcovscl[5];
+    pcov[5]=hcovscl[8];
+    // 
+    // make sure the matrix is positive definite
+    {
+      enum {kXX=0,kXY=1,kXZ=2,kYX=kXY,kYY=3,kYZ=4,kZX=kXZ,kZY=kYZ,kZZ=5};
+      if (pcov[kXX]*pcov[kYY]*0.999<pcov[kXY]*pcov[kXY]) pcov[kXY] = 0.999*TMath::Sign((float)TMath::Sqrt(pcov[kXX]*pcov[kYY]),pcov[kXY]);
+      if (pcov[kXX]*pcov[kZZ]*0.999<pcov[kXZ]*pcov[kXZ]) pcov[kXZ] = 0.999*TMath::Sign((float)TMath::Sqrt(pcov[kXX]*pcov[kZZ]),pcov[kXZ]);
+      if (pcov[kYY]*pcov[kZZ]*0.999<pcov[kYZ]*pcov[kYZ]) pcov[kYZ] = 0.999*TMath::Sign((float)TMath::Sqrt(pcov[kYY]*pcov[kZZ]),pcov[kYZ]);
+    }
+    //
+    p.SetXYZ(fMeasGlo[0],fMeasGlo[1],fMeasGlo[2],pcov);
+    //    printf("New Gl coordinates of measured point : X=%f  Y=%f  Z=%f \n",fMeasGlo[0],fMeasGlo[1],fMeasGlo[2]);
+    AliDebug(3,Form("New global coordinates of measured point : X=%+f  Y=%+f  Z=%+f \n",fMeasGlo[0],fMeasGlo[1],fMeasGlo[2]));
+    fTrack->AddPoint(npto,&p);
+    AliDebug(2,Form("Adding point[%d] = ( %+f , %+f , %+f )     volid = %d",npto,fTrack->GetX()[npto],
+                   fTrack->GetY()[npto],fTrack->GetZ()[npto],fTrack->GetVolumeID()[npto] ));
+    //    printf("Adding %d %d %f\n",npto, p.GetVolumeID(), p.GetY()); 
+    npto++;
+  }
+  //
+  fDiamondPointID = -1;
+  if (addVertex) {
+    fTrack->AddPoint(npto,&fDiamond);
+    fMeasLoc  = fClusLoc.GetArray() + npto*3;
+    fMeasGlo  = fClusGlo.GetArray() + npto*3;
+    fSigmaLoc = fClusSigLoc.GetArray() + npto*3;
+    fMeasLoc[0] = fMeasGlo[0] = fDiamond.GetX();
+    fMeasLoc[1] = fMeasGlo[1] = fDiamond.GetY();
+    fMeasLoc[2] = fMeasGlo[2] = fDiamond.GetZ();
+    fSigmaLoc[0] = TMath::Sqrt(fDiamond.GetCov()[0]);
+    fSigmaLoc[1] = TMath::Sqrt(fDiamond.GetCov()[3]);
+    fSigmaLoc[2] = TMath::Sqrt(fDiamond.GetCov()[5]);
+    fDiamondPointID = npto++;
+  }
+  //
+  return fTrack;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+AliTrackPointArray *AliITSAlignMille2::SortTrack(const AliTrackPointArray *atp) 
+{
+  /// sort alitrackpoints w.r.t. global Y direction
+  AliTrackPointArray *atps=NULL;
+  Int_t idx[20];
+  Int_t npts=atp->GetNPoints();
+  AliTrackPoint p;
+  atps=new AliTrackPointArray(npts);
+
+  TMath::Sort(npts,atp->GetY(),idx);
+
+  for (int i=0; i<npts; i++) {
+    atp->GetPoint(p,idx[i]);
+    atps->AddPoint(i,&p);
+    AliDebug(2,Form("Point[%d] = ( %+f , %+f , %+f )     volid = %d",i,atps->GetX()[i],atps->GetY()[i],atps->GetZ()[i],atps->GetVolumeID()[i] ));
+  }
+  return atps;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::GetCurrentLayer() const 
+{
+  // get current layer id
+  if (!fGeoManager) {
+    AliInfo("ITS geometry not initialized!");
+    return -1;
+  }
+  return (Int_t)AliGeomManager::VolUIDToLayer(fCluster.GetVolumeID());
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::InitModuleParams() 
+{
+  /// initialize geometry parameters for a given detector
+  /// for current cluster (fCluster)
+  /// fGlobalInitParam[] is set as:
+  ///    [tx,ty,tz,psi,theta,phi]
+  ///    (old was [tx,ty,tz,theta,psi,phi] ROOT's angles...)
+  /// *** At the moment: using Raffalele's angles definition ***
+  ///
+  /// return 0 if success
+  /// If module is found but has no parameters to vary, return 1
+
+  if (!fGeoManager) {
+    AliInfo("ITS geometry not initialized!");
+    return -1;
+  }
+
+  // now 'voluid' is the volumeID of a SENSITIVE VOLUME (coming from a cluster)
+
+  // set the internal index (index in module list)
+  UShort_t voluid=fCluster.GetVolumeID();
+  fCurrentSensID = AliITSAlignMille2Module::GetIndexFromVolumeID(voluid);
+  //
+  if (fCurrentSensID==-1) { // this is a special "vertex" module
+    fCurrentModule = GetMilleModuleByVID(voluid);
+    fCurrentSensID = fCurrentModule->GetIndex();
+
+  }
+  else {
+    //
+    // IT IS VERY IMPORTANT: start from the end of the list, where the childs are located !!!
+    Int_t k=fNModules-1;
+    fCurrentModule = 0;
+    // VERY IMPORTANT: if the sensors were explicitly provided, don't look in the supermodules  
+    while (k>=0 && ! (fCurrentModule=GetMilleModule(k))->IsIn(voluid)) k--;
+    if (k<0) return -3;
+  }
+  //
+  for (int i=AliITSAlignMille2Module::kMaxParTot;i--;) fModuleInitParam[i] = 0.0;
+  //
+  int clID = fCluster.GetUniqueID()-1;
+  if (clID<0) { // external cluster
+    fMeasGlo  = &fExtClusterPar[0];
+    fMeasLoc  = &fExtClusterPar[3];
+    fSigmaLoc = &fExtClusterPar[6];
+    fExtClusterPar[0] = fCluster.GetX();
+    fExtClusterPar[1] = fCluster.GetY();
+    fExtClusterPar[2] = fCluster.GetZ();
+    //
+    TGeoHMatrix *svMatrix = fCurrentModule->GetSensitiveVolumeMatrix(voluid);
+    svMatrix->MasterToLocal(fMeasGlo,fMeasLoc);  
+    TGeoHMatrix hcov;
+    Double_t hcovel[9];
+    hcovel[0]=double(fCluster.GetCov()[0]);
+    hcovel[1]=double(fCluster.GetCov()[1]);
+    hcovel[2]=double(fCluster.GetCov()[2]);
+    hcovel[3]=double(fCluster.GetCov()[1]);
+    hcovel[4]=double(fCluster.GetCov()[3]);
+    hcovel[5]=double(fCluster.GetCov()[4]);
+    hcovel[6]=double(fCluster.GetCov()[2]);
+    hcovel[7]=double(fCluster.GetCov()[4]);
+    hcovel[8]=double(fCluster.GetCov()[5]);
+    hcov.SetRotation(hcovel);
+    // now rotate in local system
+    hcov.Multiply(svMatrix);
+    hcov.MultiplyLeft(&svMatrix->Inverse());
+    if (fSigmaLoc[0]<0.0010) fSigmaLoc[0]=0.0010;
+    if (fSigmaLoc[2]<0.0010) fSigmaLoc[2]=0.0010;
+    //
+  }
+  else {
+    int offs = 3*clID;
+    fMeasGlo  = fClusGlo.GetArray()  + offs;
+    fMeasLoc  = fClusLoc.GetArray()  + offs;
+    fSigmaLoc = fClusSigLoc.GetArray() + offs;
+  }
+  //
+  // set minimum value for SigmaLoc to 10 micron 
+  if (fSigmaLoc[0]<0.0010) fSigmaLoc[0]=0.0010;
+  if (fSigmaLoc[2]<0.0010) fSigmaLoc[2]=0.0010;
+  if (fCurrentSensID==kVtxSensID || fUseLocalYErr) if (fSigmaLoc[1]<0.0010) fSigmaLoc[1]=0.0010;
+  //
+  AliDebug(2,Form("Local coordinates of measured point : X=%+f  Y=%+f  Z=%+f \n",fMeasLoc[0] ,fMeasLoc[1] ,fMeasLoc[2] ));
+  AliDebug(2,Form("Setting StDev from CovMat : fSigmaLocX=%g  fSigmaLocY=%g fSigmaLocZ=%g \n",fSigmaLoc[0] ,fSigmaLoc[1] ,fSigmaLoc[2] ));
+  //   
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::Print(Option_t*) const 
+{
+  // print current status 
+  printf("*** AliMillepede for ITS ***\n");
+  printf("    Number of defined super modules: %d\n",fNModules);
+  printf("    Obtained parameters refer to %s Deltas\n",fUseGlobalDelta ? "GLOBAL":"LOCAL");
+  //
+  if (fGeoManager)
+    printf("    geometry loaded from %s\n",fGeometryPath.Data());
+  else
+    printf("    geometry not loaded\n");
+  //  
+  if (fUsePreAlignment) 
+    printf("    using prealignment from %s \n",fPreDeltaPath.Data());
+  else
+    printf("    prealignment not used\n");    
+  //
+  //
+  if (fBOn) 
+    printf("    B Field set to %+f T - using helices\n",fBField);
+  else
+    printf("    B Field OFF - using straight lines \n");
+  //
+  if (fTPAFitter)
+    printf("    Using AliITSTPArrayFit class for track fitting\n");
+  else 
+    printf("    Using StraightLine/Riemann fitter for track fitting\n");
+  //
+  printf("Using local Y error due to the sensor thickness: %s\n",(fUseLocalYErr && fTPAFitter) ? "ON":"OFF");
+  //
+  for (int itp=0;itp<kNDataType;itp++) {
+    if (fRequirePoints[itp]) printf("    Required points in %s tracks:\n",itp==kCosmics? "cosmics" : "collisions");
+    for (Int_t i=0; i<6; i++) {
+      if (fNReqLayUp[itp][i]>0) printf("        Layer %d : %d points with Y>0\n",i+1,fNReqLayUp[itp][i]);
+      if (fNReqLayDown[itp][i]>0) printf("        Layer %d : %d points with Y<0\n",i+1,fNReqLayDown[itp][i]);
+      if (fNReqLay[itp][i]>0) printf("        Layer %d : %d points \n",i+1,fNReqLay[itp][i]);
+    }
+    for (Int_t i=0; i<3; i++) {
+      if (fNReqDetUp[itp][i]>0) printf("        Detector %d : %d points with Y>0\n",i+1,fNReqDetUp[itp][i]);
+      if (fNReqDetDown[itp][i]>0) printf("        Detector %d : %d points with Y<0\n",i+1,fNReqDetDown[itp][i]);
+      if (fNReqDet[itp][i]>0) printf("        Detector %d : %d points \n",i+1,fNReqDet[itp][i]);
+    }
+  }
+  printf("        SDD VDrift correction         : %s",fIsSDDVDriftMult ? "Mult":"Add");
+  printf("        Weight acc. to pT in power    : %f",fWeightPt);
+  //  
+  printf("\n    Millepede configuration parameters:\n");
+  printf("        init factor for chi2 cut      : %.4f\n",fStartFac);
+  printf("        final factor for chi2 cut     : %.4f\n",fFinalFac);
+  printf("        first iteration cut value     : %.4f\n",fResCutInitial);
+  printf("        other iterations cut value    : %.4f\n",fResCut);
+  printf("        number of stddev for chi2 cut : %d\n",fNStdDev);
+  printf("        def.scaling for local sigmas  : %.4f %.4f %.4f\n",fSigmaFactor[0],fSigmaFactor[1],fSigmaFactor[2]);
+  printf("        min.tracks per module         : %d\n",fMinPntPerSens);
+  //
+  printf("List of defined modules:\n");
+  printf("  intidx\tindex\tvoluid\tname\n");
+  for (int i=0; i<fNModules; i++) {
+    AliITSAlignMille2Module* md = GetMilleModule(i); 
+    printf("  %d\t%d\t%d\t%s\n",i,md->GetIndex(),md->GetVolumeID(),md->GetName());
+  }
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+AliITSAlignMille2Module  *AliITSAlignMille2::GetMilleModuleByVID(UShort_t voluid) const
+{
+  // return pointer to a defined supermodule
+  // return NULL if error
+  Int_t i=IsVIDDefined(voluid);
+  if (i<0) return NULL;
+  return GetMilleModule(i);
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+AliITSAlignMille2Module  *AliITSAlignMille2::GetMilleModuleBySymName(const Char_t* symname) const
+{
+  // return pointer to a defined supermodule
+  // return NULL if error
+  UShort_t vid = AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromSymname(symname);
+  if (vid>0) return GetMilleModuleByVID(vid);
+  else {    // this is not alignable module, need to look within defined supermodules
+    int i = IsSymDefined(symname);
+    if (i>=0) return  GetMilleModule(i);
+  }
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+AliITSAlignMille2Module  *AliITSAlignMille2::GetMilleModuleIfContained(const Char_t* symname) const
+{
+  // return pointer to a defined/contained supermodule
+  // return NULL otherwise
+  int i = IsSymContained(symname);
+  return i<0 ? 0 : GetMilleModule(i);
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+AliAlignObjParams* AliITSAlignMille2::GetPrealignedObject(const Char_t* symname) const
+{
+  // get delta from prealignment for given volume
+  if (!fPrealignment) return 0;
+  for (int ipre=fPrealignment->GetEntriesFast();ipre--;) { // was the corresponding object prealigned?
+    AliAlignObjParams* preob = (AliAlignObjParams*)fPrealignment->At(ipre);
+    if (!strcmp(preob->GetSymName(),symname)) return preob;
+  }
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+AliAlignObjParams* AliITSAlignMille2::GetConstrRefObject(const Char_t* symname) const
+{
+  // get delta with respect to which the constraint is declared
+  if (!fConstrRef) return 0;
+  for (int ipre=fConstrRef->GetEntriesFast();ipre--;) { // was the corresponding object prealigned?
+    AliAlignObjParams* preob = (AliAlignObjParams*)fConstrRef->At(ipre);
+    if (!strcmp(preob->GetSymName(),symname)) return preob;
+  }
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Bool_t AliITSAlignMille2::InitRiemanFit() 
+{
+  // Initialize Riemann Fitter for current track
+  // return kFALSE if error
+
+  if (!fBOn) return kFALSE;
+
+  Int_t npts=0;
+  AliTrackPoint ap;
+  npts = fTrack->GetNPoints();
+  AliDebug(3,Form("Fitting track with %d points",npts));
+  if (!fRieman) fRieman = new AliTrackFitterRieman();
+  fRieman->Reset();
+  fRieman->SetTrackPointArray(fTrack);
+
+  TArrayI ai(npts);
+  for (Int_t ipt=0; ipt<npts; ipt++) ai[ipt]=fTrack->GetVolumeID()[ipt];
+  
+  // fit track with 5 params in his own tracking-rotated reference system
+  // xc = -p[1]/p[0];
+  // yc = 1/p[0];
+  // R  = sqrt( x0*x0 + y0*y0 - y0*p[2]);
+  if (!fRieman->Fit(&ai,NULL,(AliGeomManager::ELayerID)1,(AliGeomManager::ELayerID)6)) {
+    return kFALSE;
+  }
+
+  for (int i=0; i<5; i++)
+    fLocalInitParam[i] = fRieman->GetParam()[i];
+  
+  return kTRUE;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void trackFit2D(Int_t &, Double_t *, double &chi2, double *par, int flag)
+{
+  // local function for minuit
+  const double kTiny = 1.e-14;
+  chi2 = 0;
+  static AliTrackPoint pnt;
+  static Bool_t fullErr2D;
+  //
+  if (flag==1) fullErr2D = kFALSE;//kTRUE;
+  //  fullErr2D = kTRUE;
+  enum {kAX,kAZ,kBX,kBZ};
+  enum {kXX=0,kXY=1,kXZ=2,kYX=kXY,kYY=3,kYZ=4,kZX=kXZ,kZY=kYZ,kZZ=5};
+  //
+  AliITSAlignMille2* alig = AliITSAlignMille2::GetInstance();
+  AliTrackPointArray* track = alig->GetCurrentTrack();
+  //
+  int npts = track->GetNPoints();
+  for (int ip=0;ip<npts;ip++) {
+    track->GetPoint(pnt,ip);
+    const float *cov = pnt.GetCov();
+    double y  = pnt.GetY();
+    double dx = pnt.GetX() - (par[kAX]+y*par[kBX]);
+    double dz = pnt.GetZ() - (par[kAZ]+y*par[kBZ]);
+    double xxe = cov[kXX];
+    double zze = cov[kZZ];
+    double xze = cov[kXZ];
+    //
+    if (fullErr2D) {
+      xxe += par[kBX]*par[kBX]*cov[kYY]-2.*par[kBX]*cov[kXY];
+      zze += par[kBZ]*par[kBZ]*cov[kYY]-2.*par[kBZ]*cov[kZY];
+      xze += par[kBX]*par[kBZ]*cov[kYY]-cov[kYZ]*par[kBZ]-cov[kXY]*par[kBX];
+    }
+    //
+    double det = xxe*zze - xze*xze;
+    if (det<kTiny) {
+      printf("Negative diag. error (det=%+e) |sxx:%+e szz:%+e sxz:%+e| bx:%+e bz:%+e|\n"
+            "Discarding correlation term\n",det,xxe,zze,xze,par[kBX],par[kBZ]);
+      xxe = cov[kXX];
+      zze = cov[kZZ];
+      xze = cov[kXZ];
+      fullErr2D = kFALSE;
+    }
+    double xxeI = zze/det;
+    double zzeI = xxe/det;
+    double xzeI =-xze/det;
+    //
+    chi2 += dx*dx*xxeI + dz*dz*zzeI + 2.*dx*dz*xzeI;
+    // 
+    //    printf("%d | %+e %+e %+e %+e %+e -> %+e\n",ip,dx,dz,xxeI,zzeI,xzeI,  chi2);
+  }
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::InitTrackParams(int meth) 
+{
+  /// initialize local parameters with different methods
+  /// for current track (fTrack)
+  Int_t npts=0;
+  AliTrackPoint ap;
+  double sX=0,sXY=0,sZ=0,sZY=0,sY=0,sYY=0,det=0;
+  // simple linear interpolation
+  // get local starting parameters (to be substituted by ESD track parms)
+  // local parms (fLocalInitParam[]) are:
+  //      [0] = global x coord. of straight line intersection at y=0 plane
+  //      [1] = global z coord. of straight line intersection at y=0 plane
+  //      [2] = px/py  
+  //      [3] = pz/py
+  // test #1: linear fit in x(y) and z(y)
+  npts = fTrack->GetNPoints();
+  AliDebug(3,Form("*** initializing track with %d points ***",npts));
+  for (int i=npts;i--;) {
+    sY  += fTrack->GetY()[i];
+    sYY += fTrack->GetY()[i]*fTrack->GetY()[i];
+    sX  += fTrack->GetX()[i];
+    sXY += fTrack->GetX()[i]*fTrack->GetY()[i];
+    sZ  += fTrack->GetZ()[i];
+    sZY += fTrack->GetZ()[i]*fTrack->GetY()[i];
+  }
+  det = sYY*npts-sY*sY;
+  if (IsZero(det)) det = 1E-16;
+  fLocalInitParam[0] = (sX*sYY-sY*sXY)/det;
+  fLocalInitParam[2] = (sXY*npts-sY*sX)/det;
+  //
+  fLocalInitParam[1] = (sZ*sYY-sY*sZY)/det;
+  fLocalInitParam[3] = (sZY*npts-sY*sZ)/det;
+  // pepo200709
+  fLocalInitParam[4] = 0.0;
+  // endpepo200709
+
+  AliDebug(2,Form("X = p0gx + ugx*Y : p0gx = %+f    ugx = %+f\n",fLocalInitParam[0],fLocalInitParam[2]));
+  //
+  if (meth==1) return;
+  //
+  // perform full fit accounting for cov.matrix
+  static TVirtualFitter *minuit = 0;
+  static Double_t step[5]   = {1E-3,1E-3,1E-4,1E-4,1E-5};
+  static Double_t arglist[10];
+  //
+  if (!minuit) {
+    minuit = TVirtualFitter::Fitter(0,4);
+    minuit->SetFCN(trackFit2D);
+    arglist[0] = 1;
+    minuit->ExecuteCommand("SET ERR",arglist, 1);
+    //
+    arglist[0] = -1;
+    minuit->ExecuteCommand("SET PRINT",arglist,1);
+    //
+  }
+  //
+  minuit->SetParameter(0, "ax",   fLocalInitParam[0], step[0], 0,0);
+  minuit->SetParameter(1, "az",   fLocalInitParam[1], step[1], 0,0);
+  minuit->SetParameter(2, "bx",   fLocalInitParam[2], step[2], 0,0);
+  minuit->SetParameter(3, "bz",   fLocalInitParam[3], step[3], 0,0);
+  //
+  arglist[0] = 1000; // number of function calls 
+  arglist[1] = 0.001; // tolerance 
+  minuit->ExecuteCommand("MIGRAD",arglist,2);
+  //
+  for (int i=0;i<4;i++) fLocalInitParam[i] = minuit->GetParameter(i);
+  for (int i=0;i<4;i++) for (int j=0;j<4;j++) fLocalInitParEr[i][j] = minuit->GetCovarianceMatrixElement(i,j);
+  /*
+  double amin,edm,errdef;
+  int nvpar,nparx;
+  minuit->GetStats(amin,edm,errdef,nvpar,nparx);
+  amin /= (2*npts - 4);
+  printf("Mchi2: %+e\n",amin);
+  */
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::IsSymDefined(const Char_t* symname) const
+{
+  // checks if supermodule with this symname is defined and return the internal index
+  // return -1 if not.
+  for (int k=fNModules;k--;) if (!strcmp(symname,GetMilleModule(k)->GetName())) return k;
+  return -1; 
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::IsSymContained(const Char_t* symname) const
+{
+  // checks if module with this symname is defined and return the internal index
+  // return -1 if not.
+  UShort_t vid = AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromSymname(symname);
+  if (vid>0) return IsVIDContained(vid);
+  // only sensors have real vid, but maybe we have a supermodule with fake vid? 
+  // IMPORTANT: always start from the end to start from the sensors
+  return IsSymDefined(symname);
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::IsVIDDefined(UShort_t voluid) const
+{
+  // checks if supermodule 'voluid' is defined and return the internal index
+  // return -1 if not.
+  for (int k=fNModules;k--;) if (voluid==GetMilleModule(k)->GetVolumeID()) return k;
+  return -1; 
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::IsVIDContained(UShort_t voluid) const
+{
+  // checks if the sensitive module 'voluid' is contained inside a supermodule 
+  // and return the internal index of the last identified supermodule
+  // return -1 if error
+  // IMPORTANT: always start from the end to start from the sensors
+  if (AliITSAlignMille2Module::GetIndexFromVolumeID(voluid)<0) return -1;
+  for (int k=fNModules;k--;) if (GetMilleModule(k)->IsIn(voluid)) return k;
+  return -1; 
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::GetRequestedModID(UShort_t voluid) const
+{
+  // checks if the sensitive module 'voluid' is contained inside a supermodule 
+  // and return the internal index of the last identified supermodule
+  // return -1 if error
+  // IMPORTANT: always start from the end to start from the sensors
+  if (AliITSAlignMille2Module::GetIndexFromVolumeID(voluid)<0) return -1;
+  int k;
+  for (k=fNModules;k--;) if (GetMilleModule(k)->IsIn(voluid)) break;
+  if (k<0) return -1;
+  AliITSAlignMille2Module* md = GetMilleModule(k);
+  while (md && md->IsNotInConf()) md = md->GetParent();
+  if (md) return int(md->GetUniqueID());
+  else return -1; 
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::CheckCurrentTrack() 
+{
+  /// checks if AliTrackPoints belongs to defined modules
+  /// return number of good poins
+  /// return 0 if not enough points
+
+  Int_t npts = fTrack->GetNPoints();
+  Int_t ngoodpts=0;
+  // debug points
+  for (int j=0; j<npts; j++) if (IsVIDContained(fTrack->GetVolumeID()[j])>=0) ngoodpts++;
+  //
+  if (ngoodpts<fMinNPtsPerTrack) return 0;
+
+  return ngoodpts;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::ProcessTrack(const AliTrackPointArray *track, Double_t wgh) 
+{
+  /// Process track; Loop over hits and set local equations
+  /// here 'track' is a AliTrackPointArray
+  /// return 0 if success;
+  //
+  if (!fIsMilleInit) Init();
+  //
+  Int_t npts = track->GetNPoints();
+  AliDebug(2,Form("*** Input track with %d points ***",npts));
+
+  // preprocessing of the input track: keep only points in defined volumes,
+  // move points if prealignment is set, sort by Yglo if required
+  fTrackWeight = wgh;
+  fTrack=PrepareTrack(track);
+  if (!fTrack) {
+    RemoveHelixFitConstraint();
+    RemoveVertexConstraint();
+    return -1;
+  }
+  npts = fTrack->GetNPoints();
+  if (npts>kMaxPoints) {
+    AliError(Form("Compiled with kMaxPoints=%d, current track has %d points",kMaxPoints,npts));
+  }
+  AliDebug(2,Form("*** Processing prepared track with %d points ***",npts));
+  //
+  npts = FitTrack();
+  if (npts<0) return npts;
+  //
+  //  printf("Params: "); for (int i=0;i<fNLocal;i++) printf("%+.2e ",fLocalInitParam[i]); printf("\n");//RRR
+  Int_t nloceq=0;
+  Int_t ngloeq=0;
+  static Mille2Data md[kMaxPoints];
+  //
+  for (Int_t ipt=0; ipt<npts; ipt++) {
+    fTrack->GetPoint(fCluster,ipt);
+    fCluster.SetUniqueID(ipt+1);
+    AliDebug(2,Form("\n--- processing point %d --- \n",ipt));    
+
+    // set geometry parameters for the the current module
+    if (InitModuleParams()) continue;
+    AliDebug(2,Form("    VolID=%d  Index=%d  InternalIdx=%d  symname=%s\n", 
+                   track->GetVolumeID()[ipt], fCurrentModule->GetIndex(),
+                   fCurrentModule->GetUniqueID(), AliGeomManager::SymName(track->GetVolumeID()[ipt]) ));
+    AliDebug(2,Form("    Preprocessed Point = ( %+f , %+f , %+f ) \n",fCluster.GetX(),fCluster.GetY(),fCluster.GetZ()));
+    int res = fTPAFitter ? AddLocalEquationTPA(md[nloceq]) : AddLocalEquation(md[nloceq]);
+    if (res<0) {fTotBadLocEqPoints++; nloceq = 0; break;}
+    else if (res==0) nloceq++;
+    else {nloceq++; ngloeq++;}
+  } // end loop over points
+  //
+  fTrack=NULL;
+  // not enough good points?
+  if (nloceq<fMinNPtsPerTrack || ngloeq<1) return -1;
+  //
+  // finally send local equations to millepede
+  SetLocalEquations(md,nloceq);
+  fMillepede->SaveRecordData(); // RRR
+  fCurvFitWasConstrained = kFALSE; // restore default
+  //
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::FitTrack() 
+{
+  // Fit the track with selected constraints
+  //
+  const Double_t kfDiamondTolerance = 0.1;  //diamond tolerance on top of the MS error
+  if (!fTrack) return -1;
+  int npts = fTrack->GetNPoints();
+  //
+  if (fTPAFitter) {  // use dediacted fitter
+    //
+    // if the diamond point is attached, for the moment don't include it in the fit
+    fTPAFitter->AttachPoints(fTrack,0, npts-1); 
+    fTPAFitter->SetBz(fBField);
+    fTPAFitter->SetTypeCosmics(IsTypeCosmics());
+    if (fIniTrackParamsMeth==1) fTPAFitter->SetIgnoreCov();
+    //
+    double chi2;
+    double chi2f = 0;
+    double dca2err;
+    double dca2 = 0.;
+    Bool_t fitIsDone = kFALSE;
+    if (fUseDiamond && fDiamondPointID>0 && fCheckDiamondPoint==kDiamondCheckIfPrompt) { // diamond constraint was added, check if the track looks like prompt
+      fTPAFitter->SetFirstLast(0,fDiamondPointID-1);
+      if (IsCovIScaleTouched()) for (int i=npts;i--;) fTPAFitter->SetCovIScale(i,GetCovIScale(i));
+      //
+      chi2f = fTPAFitter->Fit(fConstrCharge,fConstrPT,fConstrPTErr);
+      if ( chi2f<0 || (chi2f>fNStdDev*fStartFac && fTPAFitter->GetNIterations()>=fTPAFitter->GetMaxIterations()) ) { //RRR
+       AliInfo(Form("Track fit failed on checking if it is prompt! skipping this track... Chi2:%+e",chi2f));
+       fTPAFitter->Reset();
+       //      fTrack = NULL;
+       return -5;
+      }
+      double xyzRes[3];
+      fTPAFitter->GetResiduals(xyzRes,&fDiamondI,kTRUE);
+      dca2 = xyzRes[0]*xyzRes[0] + xyzRes[1]*xyzRes[1];
+      double pT = IsFieldON() ? fTPAFitter->GetPt() : 0.45;
+      if (pT<0.1) pT = 0.1;
+      dca2err = kfDiamondTolerance + 0.02/pT;
+      if (dca2>dca2err*dca2err) { // this is secondary
+       int* clst = (int*) fTrack->GetClusterType();
+       clst[fDiamondPointID] = -1;;
+       fDiamondPointID = -1; 
+       fitIsDone = kTRUE;
+       npts--;
+      }
+      else fTPAFitter->SetFirstLast(0,fDiamondPointID); // fit with diamond
+    }
+    //    fTPAFitter->SetParAxis(1);
+    if (!fitIsDone) {
+      if (IsCovIScaleTouched()) for (int i=npts;i--;) fTPAFitter->SetCovIScale(i,GetCovIScale(i));
+      chi2 = fTPAFitter->Fit(fConstrCharge,fConstrPT,fConstrPTErr);
+    }
+    //
+    RemoveHelixFitConstraint();  // suppress eventual constraints to not affect fit of the next track
+    RemoveVertexConstraint(); // same ...
+    //
+    if ( !fitIsDone && (chi2<0 || (chi2>fNStdDev*fStartFac && fTPAFitter->GetNIterations()>=fTPAFitter->GetMaxIterations())) ) { //RRR
+      AliInfo(Form("Track fit failed! skipping this track... Chi2:%+e",chi2));
+      if (fUseDiamond && fDiamondPointID>0 && fCheckDiamondPoint==kDiamondCheckIfPrompt) AliInfo(Form("VertexFree fit gave Chi2:%+e with residual %+e",chi2f,TMath::Sqrt(dca2)));
+      /*
+       fTrack->Print("");
+       fTPAFitter->FitHelixCrude();
+       fTPAFitter->SetFitDone();
+       fTPAFitter->Print();
+      */
+      fTPAFitter->Reset();
+      //      fTrack = NULL;
+      return -5;
+    }
+    fNLocal = fTPAFitter->IsFieldON() ? 5:4; // Attention: the fitter might have decided to work in line mode
+    npts  = fTPAFitter->GetLast() - fTPAFitter->GetFirst() + 1; // actual number of points
+    /*
+      double *pr = fTPAFitter->GetParams();
+      printf("FtPar: %+.5e  %+.5e  %+.5e  %+.5e | chi2:%.3e\n",pr[2],pr[0],pr[3],pr[1],chi2); // RRR
+    */
+  }
+  else {
+    //
+    if (!fBOn) { // straight lines  
+      // set local starting parameters (to be substituted by ESD track parms)
+      // local parms (fLocalInitParam[]) are:
+      //      [0] = global x coord. of straight line intersection at y=0 plane
+      //      [1] = global z coord. of straight line intersection at y=0 plane
+      //      [2] = px/py  
+      //      [3] = pz/py
+      InitTrackParams(fIniTrackParamsMeth); 
+      /*
+      double *pr = fLocalInitParam;
+      printf("FtPar: %+.5e  %+.5e  %+.5e  %+.5e |\n",pr[0],pr[1],pr[2],pr[3]); // RRR
+      */
+    } 
+    else {
+      // local parms (fLocalInitParam[]) are the Riemann Fitter params
+      if (!InitRiemanFit()) {
+       AliInfo("Riemann fit failed! skipping this track...");
+       fTrack=NULL;
+       return -5;
+      }
+    }
+  }
+  return npts;
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::CalcIntersectionPoint(Double_t *lpar, Double_t *gpar) 
+{
+  /// calculate track intersection point in local coordinates
+  /// according with a given set of parameters (local(4) and global(6))
+  /// and fill fPintLoc/Glo
+  ///    local are:   pgx0, pgz0, ugx, ugz   OR   riemann fitters pars
+  ///    global are:  tx,ty,tz,psi,theta,phi (Raff's delta angles in deg.)
+  /// return 0 if success
+  
+  AliDebug(3,Form("lpar = %g %g %g %g %g\ngpar= %g %g %g %g %g %g\n",lpar[0],lpar[1],lpar[2],lpar[3],lpar[4],gpar[0],gpar[1],gpar[2],gpar[3],gpar[4],gpar[5]));
+  AliDebug(3,Form("deltalpar = %g %g %g %g %g\n",lpar[0]-fLocalInitParam[0],lpar[1]-fLocalInitParam[1],lpar[2]-fLocalInitParam[2],lpar[3]-fLocalInitParam[3],lpar[4]-fLocalInitParam[4]));
+
+  
+  // prepare the TGeoHMatrix
+  TGeoHMatrix *tempHMat = fCurrentModule->GetSensitiveVolumeModifiedMatrix(fCluster.GetVolumeID(),gpar,
+                                                                          !fUseGlobalDelta);
+  if (!tempHMat) return -1;
+  
+  Double_t v0g[3]; // vector with straight line direction in global coord.
+  Double_t p0g[3]; // point of the straight line (glo)
+  
+  if (fBOn) { // B FIELD!
+    AliTrackPoint prf; 
+    for (int ip=0; ip<5; ip++)
+      fRieman->SetParam(ip,lpar[ip]);
+
+    if (!fRieman->GetPCA(fCluster,prf))  {
+      AliInfo(Form("error in GetPCA for point %d",fCluster.GetVolumeID()));
+      return -3;
+    }
+    // now determine straight line passing tangent to fit curve at prf
+    // ugx = dX/dY_glo = DeltaX/DeltaY_glo
+    // mo' P1=(X,Y,Z)_glo_prf
+    //       => (x,y,Z)_trk_prf ruotando di alpha...
+    Double_t alpha=fRieman->GetAlpha();
+    Double_t x1g = prf.GetX();
+    Double_t y1g = prf.GetY();
+    Double_t z1g = prf.GetZ();
+    Double_t x1t =  x1g*TMath::Cos(alpha) + y1g*TMath::Sin(alpha);
+    Double_t y1t = -x1g*TMath::Sin(alpha) + y1g*TMath::Cos(alpha);
+    Double_t z1t =  z1g;    
+
+    Double_t x2t = x1t+1.0;
+    Double_t y2t = y1t+fRieman->GetDYat(x1t);
+    Double_t z2t = z1t+fRieman->GetDZat(x1t);
+    Double_t x2g =  x2t*TMath::Cos(alpha) - y2t*TMath::Sin(alpha);
+    Double_t y2g =  x2t*TMath::Sin(alpha) + y2t*TMath::Cos(alpha);
+    Double_t z2g =  z2t;  
+
+    AliDebug(3,Form("Riemann frame:  fAlpha = %+f  =  %+f  ",alpha,alpha*180./TMath::Pi()));
+    AliDebug(3,Form("   prf_glo=( %+f , %+f , %+f )  prf_rf=( %+f , %+f , %+f )\n", x1g,y1g,z1g, x1t,y1t,z1t));
+    AliDebug(3,Form("   mov_glo=( %+f , %+f , %+f )      rf=( %+f , %+f , %+f )\n",x2g,y2g,z2g, x2t,y2t,z2t));
+        
+    if (TMath::Abs(y2g-y1g)<1e-15) {
+      AliInfo("DeltaY=0! Cannot proceed...");
+      return -1;
+    }
+    // ugx,1,ugz
+    v0g[0] = (x2g-x1g)/(y2g-y1g);
+    v0g[1]=1.0;
+    v0g[2] = (z2g-z1g)/(y2g-y1g);
+    
+    // point: just keep prf
+    p0g[0]=x1g;
+    p0g[1]=y1g;
+    p0g[2]=z1g;
+  }  
+  else { // staight line
+    // vector of initial straight line direction in glob. coord
+    v0g[0]=lpar[2];
+    v0g[1]=1.0;
+    v0g[2]=lpar[3];
+    
+    // intercept in yg=0 plane in glob coord
+    p0g[0]=lpar[0];
+    p0g[1]=0.0;
+    p0g[2]=lpar[1];
+  }
+  AliDebug(3,Form("Line vector: ( %+f , %+f , %+f )  point:( %+f , %+f , %+f )\n",v0g[0],v0g[1],v0g[2],p0g[0],p0g[1],p0g[2]));
+  
+  // same in local coord.
+  Double_t p0l[3],v0l[3];
+  tempHMat->MasterToLocalVect(v0g,v0l);
+  tempHMat->MasterToLocal(p0g,p0l);
+  
+  if (TMath::Abs(v0l[1])<1e-15) {
+    AliInfo("Track Y direction in local frame is zero! Cannot proceed...");
+    return -1;
+  }
+  
+  // local intersection point
+  fPintLoc[0] = p0l[0] - (v0l[0]/v0l[1])*p0l[1];
+  fPintLoc[1] = 0;
+  fPintLoc[2] = p0l[2] - (v0l[2]/v0l[1])*p0l[1];
+  
+  // global intersection point
+  tempHMat->LocalToMaster(fPintLoc,fPintGlo);
+  AliDebug(3,Form("Intesect. point: L( %+f , %+f , %+f )  G( %+f , %+f , %+f )\n",fPintLoc[0],fPintLoc[1],fPintLoc[2],fPintGlo[0],fPintGlo[1],fPintGlo[2]));
+  
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::CalcDerivatives(Int_t paridx, Bool_t islpar) 
+{
+  /// calculate numerically (ROOT's style) the derivatives for
+  /// local X intersection  and local Z intersection
+  /// parlist: local  (islpar=kTRUE)  pgx0, pgz0, ugx0, ugz0  OR riemann's params
+  ///          global (islpar=kFALSE) tx, ty, tz, psi, theta, phi (Raf's angles in deg)
+  /// return 0 if success
+  
+  // copy initial parameters
+  Double_t lpar[kNLocal];
+  Double_t gpar[kNParCh];
+  Double_t *derivative;
+  for (Int_t i=0; i<kNLocal; i++) lpar[i]=fLocalInitParam[i];
+  for (Int_t i=0; i<kNParCh; i++) gpar[i]=fModuleInitParam[i];
+
+  // trial with fixed dpar...
+  Double_t dpar = 0.;
+
+  if (islpar) { // track parameters
+    //dpar=fLocalInitParam[paridx]*0.001;
+    // set minimum dpar
+    derivative = fDerivativeLoc[paridx];
+    if (!fBOn) {
+      if (paridx<3) dpar=1.0e-4; // translations
+      else dpar=1.0e-6; // direction
+    }
+    else { // B Field
+      // pepo: proviamo con 1/1000, poi evenctually 1/100...
+      Double_t dfrac=0.01;
+      switch(paridx) {
+      case 0:
+       // RMS cosmics: 1e-4
+       dpar = TMath::Max(1.0e-6,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac)); 
+       break;
+      case 1: 
+       // RMS cosmics: 0.2
+       dpar = TMath::Max(0.002,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac)); 
+       break;
+      case 2: 
+       // RMS cosmics: 9
+       dpar = TMath::Max(0.09,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac)); 
+       break;
+      case 3: 
+       // RMS cosmics: 7
+       dpar = TMath::Max(0.07,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac)); 
+       break;
+      case 4: 
+       // RMS cosmics: 0.3
+       dpar = TMath::Max(0.003,TMath::Abs(fLocalInitParam[paridx]*dfrac)); 
+       break;
+      }
+    }
+  }
+  else { // alignment global parameters
+    derivative = fDerivativeGlo[paridx];
+    //dpar=fModuleInitParam[paridx]*0.001;
+    if (paridx<3) dpar=1.0e-4; // translations
+    else dpar=1.0e-2; // angles    
+  }
+
+  AliDebug(3,Form("+++ using dpar=%g",dpar));
+  
+  // calculate derivative ROOT's like:
+  //  using f(x+h),f(x-h),f(x+h/2),f(x-h2)...
+  Double_t pintl1[3]; // f(x-h)
+  Double_t pintl2[3]; // f(x-h/2)
+  Double_t pintl3[3]; // f(x+h/2)
+  Double_t pintl4[3]; // f(x+h)
+    
+  // first values
+  if (islpar) lpar[paridx] -= dpar;
+  else gpar[paridx] -= dpar;
+  if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;
+  for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl1[i]=fPintLoc[i];
+
+  // second values
+  if (islpar) lpar[paridx] += dpar/2;
+  else gpar[paridx] += dpar/2;
+  if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;
+  for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl2[i]=fPintLoc[i];
+
+  // third values
+  if (islpar) lpar[paridx] += dpar;
+  else gpar[paridx] += dpar;
+  if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;
+  for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl3[i]=fPintLoc[i];
+
+  // fourth values
+  if (islpar) lpar[paridx] += dpar/2;
+  else gpar[paridx] += dpar/2;
+  if (CalcIntersectionPoint(lpar, gpar)) return -2;
+  for (Int_t i=0; i<3; i++) pintl4[i]=fPintLoc[i];
+
+  Double_t h2 = 1./(2.*dpar);
+  Double_t d0 = pintl4[0]-pintl1[0];
+  Double_t d2 = 2.*(pintl3[0]-pintl2[0]);
+  derivative[0] = h2*(4*d2 - d0)/3.;
+  if (TMath::Abs(derivative[0]) < 1.0e-9) derivative[0] = 0.0;
+
+  d0 = pintl4[2]-pintl1[2];
+  d2 = 2.*(pintl3[2]-pintl2[2]);
+  derivative[2] = h2*(4*d2 - d0)/3.;
+  if (TMath::Abs(derivative[2]) < 1.0e-9) derivative[2]=0.0;
+
+  AliDebug(3,Form("\n+++ derivatives +++ \n"));
+  AliDebug(3,Form("+++ dXLoc/dpar = %g +++\n",derivative[0]));
+  AliDebug(3,Form("+++ dZLoc/dpar = %g +++\n\n",derivative[2]));
+  
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::AddLocalEquation(Mille2Data &m) 
+{
+  /// Define local equation for current cluster in X and Z coor.
+  /// and store them to memory
+  /// return -1 in case of failure to build some equation
+  ///         0 if no free global parameters were found but local eq is built
+  ///         1 if both local and global eqs are built
+  //
+  // store first intersection point
+  if (CalcIntersectionPoint(fLocalInitParam, fModuleInitParam)) return -1;  
+  for (Int_t i=0; i<3; i++) fPintLoc0[i]=fPintLoc[i];
+
+  AliDebug(2,Form("Intersect. point: L( %+f , %+f , %+f )",fPintLoc[0],fPintLoc[1],fPintLoc[2]));
+  
+  // calculate local derivatives numerically
+  Bool_t zeroX = kTRUE;
+  Bool_t zeroZ = kTRUE;
+  //
+  for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++) {
+    if (CalcDerivatives(i,kTRUE)) return -1;
+    m.fDerLoc[i][kX] = fDerivativeLoc[i][0];
+    m.fDerLoc[i][kZ] = fDerivativeLoc[i][2];
+    if (zeroX) zeroX = IsZero(fDerivativeLoc[i][0]);
+    if (zeroZ) zeroZ = IsZero(fDerivativeLoc[i][2]);
+  }
+  //  for (Int_t i=0; i<fNLocal; i++) AliDebug(2,Form("Local parameter %d - dXdpar = %g  - dZdpar = %g\n",i,dXdL[i],dZdL[i]));
+  //
+  if (zeroX) {AliInfo("Skipping: zero local X derivatives!"); return -1;}
+  if (zeroZ) {AliInfo("Skipping: zero local Z derivatives!"); return -1;}
+  //
+  int status = 0;
+  int ifill = 0;
+  //
+  AliITSAlignMille2Module* endModule = fCurrentModule;
+  //
+  zeroX = zeroZ = kTRUE;
+  Bool_t dfDone[kNParCh];
+  for (int i=kNParCh;i--;) dfDone[i] = kFALSE;
+  m.fNModFilled = 0;
+  // 
+  // special block for SDD derivatives
+  Double_t jacobian[kNParChGeom];
+  Int_t nmodTested = 0;
+  //
+  do {
+    if (fCurrentModule->GetNParFree()==0) continue;
+    nmodTested++;
+    for (Int_t i=0; i<kNParChGeom; i++) {   // common for all sensors: derivatives over geom params 
+      //
+      if (!fUseGlobalDelta) dfDone[i] = kFALSE; // for global deltas the derivatives at diff. levels are different
+      if (fCurrentModule->GetParOffset(i)<0) continue; // this parameter is not explicitly fitted
+      if (!dfDone[i]) { 
+       if (CalcDerivatives(i,kFALSE)) return -1; 
+       else {
+         dfDone[i] = kTRUE;
+         if (zeroX) zeroX = IsZero(fDerivativeGlo[i][0]);
+         if (zeroZ) zeroZ = IsZero(fDerivativeGlo[i][2]);
+       }
+      }
+      //
+      m.fDerGlo[ifill][kX] = fDerivativeGlo[i][0];
+      m.fDerGlo[ifill][kZ] = fDerivativeGlo[i][2];
+      m.fParMilleID[ifill++] = fCurrentModule->GetParOffset(i);
+    }
+    //
+    // specific for special sensors
+    Int_t sddLR = -1;
+    if ( fCurrentModule->IsSDD() && 
+        (fCurrentModule->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)>=0  ||
+         //      fCurrentModule->GetParOffset(sddLR = fMeasLoc[kX]>0 ?
+         fCurrentModule->GetParOffset(sddLR = GetVDriftSDD()>0 ? 
+                                      AliITSAlignMille2Module::kDOFDVL : AliITSAlignMille2Module::kDOFDVR)>=0)
+        ) {
+      //
+      // assume for sensor local xloc = xloc0 + V0*dT0+dV*(T-T0)
+      // where V0 and T are the nominal drift velocity, time and time0
+      // and the dT0 and dV are the corrections:
+      // dX/dT0 = dX/dxloc * dxloc/dT0 = dX/dxloc * V0
+      // dX/dV  = dX/dxloc * dxloc/dV =  dX/dxloc * (T-T0)
+      // IMPORTANT: the geom derivatives are over the SENSOR LOCAL parameters
+      //
+      if (!dfDone[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0] ||  !dfDone[sddLR]) {
+       //
+       double dXdxlocsens=0., dZdxlocsens=0.;
+       //
+       // if the current module is the sensor itself and we work with local params, then 
+       // we can directly take dX/dxloc_sens dZ/dxloc_sens
+       if (!fUseGlobalDelta && fCurrentModule->GetVolumeID()==fCluster.GetVolumeID()) {
+         if (!dfDone[AliITSAlignMille2Module::kDOFTX]) {
+           CalcDerivatives(AliITSAlignMille2Module::kDOFTX,kFALSE); 
+           dfDone[AliITSAlignMille2Module::kDOFTX] = kTRUE;
+         }
+         dXdxlocsens = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFTX][0];
+         dZdxlocsens = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFTX][2];
+       }
+       //
+       else { // need to perform some transformations
+         // fetch the jacobian of the transformation from the sensors local frame to the frame
+         // where the parameters are defined:
+         // Global: dX/dxloc_sens = dX/dxgl*dxgl/dxloc_sens + ...dX/dphigl*dphigl/dxloc_sens
+         if (fUseGlobalDelta) fCurrentModule->CalcDerivGloLoc(fCluster.GetVolumeID(),
+                                                              AliITSAlignMille2Module::kDOFTX, jacobian);
+         // Local:  dX/dxloc_sens = dX/dxcurr*dxcurr/dxloc_sens +..+dX/dphicurr * dphicurr/dxloc_sens 
+         else                 fCurrentModule->CalcDerivCurLoc(fCluster.GetVolumeID(),
+                                                              AliITSAlignMille2Module::kDOFTX, jacobian);
+         //
+         for (int j=0;j<kNParChGeom;j++) {
+           // need global derivative even if the j-th param is locked
+           if (!dfDone[j]) {CalcDerivatives(j,kFALSE); dfDone[j] = kTRUE;}
+           dXdxlocsens += fDerivativeGlo[j][0] * jacobian[j];
+           dZdxlocsens += fDerivativeGlo[j][2] * jacobian[j];
+         }
+       }
+       //
+       if (zeroX) zeroX = IsZero(dXdxlocsens);
+       if (zeroZ) zeroZ = IsZero(dZdxlocsens);
+       //
+       double vdrift = GetVDriftSDD();
+       double tdrift = GetTDriftSDD();
+       //
+       fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][0] = dXdxlocsens*vdrift;
+       fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][2] = dZdxlocsens*vdrift;
+       dfDone[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0] = kTRUE;
+       //
+       double mltCorr = fIsSDDVDriftMult ? TMath::Abs(vdrift) : 1;
+       fDerivativeGlo[sddLR][0] = -dXdxlocsens*mltCorr*TMath::Sign(tdrift,vdrift);
+       fDerivativeGlo[sddLR][2] = -dZdxlocsens*mltCorr*TMath::Sign(tdrift,vdrift);
+       dfDone[sddLR] = kTRUE;
+       //
+      }
+      //
+      if (fCurrentModule->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)>=0) {
+       m.fDerGlo[ifill][kX] = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][0];
+       m.fDerGlo[ifill][kZ] = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][2];
+       m.fParMilleID[ifill++] = fCurrentModule->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0);      
+      }
+      //
+      if (fCurrentModule->GetParOffset(sddLR)>=0) {
+       m.fDerGlo[ifill][kX] = fDerivativeGlo[sddLR][0];
+       m.fDerGlo[ifill][kZ] = fDerivativeGlo[sddLR][2];
+       m.fParMilleID[ifill++] = fCurrentModule->GetParOffset(sddLR);      
+      }
+    }
+    //
+    m.fModuleID[m.fNModFilled++] = fCurrentModule->GetUniqueID();
+  } while( (fCurrentModule=fCurrentModule->GetParent()) );
+  //
+  if (nmodTested>0 && zeroX) {AliInfo("Skipping: zero global X derivatives!");return -1;}
+  if (nmodTested>0 && zeroZ) {AliInfo("Skipping: zero global Z derivatives!");return -1;}
+  //
+  // ok, can copy to m
+  AliDebug(2,Form("Adding local equation X with fMeas=%.6f  and fSigma=%.6f",(fMeasLoc[0]-fPintLoc0[0]), fSigmaLoc[0]));
+  m.fMeas[kX] = fMeasLoc[0]-fPintLoc0[0];
+  m.fSigma[kX] = fSigmaLoc[0];
+  //
+  AliDebug(2,Form("Adding local equation Z with fMeas=%.6f  and fSigma=%.6f",(fMeasLoc[2]-fPintLoc0[2]), fSigmaLoc[2]));
+  m.fMeas[kZ] = fMeasLoc[2]-fPintLoc0[2];
+  m.fSigma[kZ] = fSigmaLoc[2];
+  //
+  m.fNGlobFilled = ifill;
+  fCurrentModule = endModule;
+  //
+  status += Int_t(!zeroX && !zeroZ); // 0 - only locals, 1 locals + globals
+  return status;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::AddLocalEquationTPA(Mille2Data &m) 
+{
+  /// Define local equation for current cluster in X Y and Z coor.
+  /// and store them to memory
+  /// return -1 in case of failure to build some equation
+  ///         0 if no free global parameters were found but local eq is built
+  ///         1 if both local and global eqs are built
+  //
+  static int cnt = 0;
+  Bool_t dbg = kFALSE;//kTRUE;
+  if (++cnt>100000) dbg = kFALSE;
+
+  int curpoint = fCluster.GetUniqueID()-1;
+  TGeoHMatrix *tempHMat = GetSensorCurrMatrixSID(fCurrentSensID);// fCurrentModule->GetSensitiveVolumeMatrix(fCluster.GetVolumeID());
+  //
+  fTPAFitter->GetDResDParams(&fDerivativeLoc[0][0], curpoint);    // resid. derivatives over the track parameters 
+  if (fCurvFitWasConstrained && fFixCurvIfConstraned && !IsZero(fBField)) 
+    for (int i=3;i--;) fDerivativeLoc[AliITSTPArrayFit::kR0][i] = 0; //Fix curvarute
+  //
+  for (Int_t i=fNLocal; i--;) tempHMat->MasterToLocalVect(fDerivativeLoc[i],m.fDerLoc[i]); 
+  //
+  int status = 0;
+  // derivatives over the global parameters ---------------------------------------->>>
+  Double_t dGL[3];     // derivative of global position vs local X (for SDD)
+  Double_t dRdP[3][3]; // derivative of local residuals vs local position
+  Double_t dPdG[AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom][3]; // derivatives of local position vs global params
+  fTPAFitter->GetDResDPos(&fDerivativeGlo[0][0], curpoint);
+  if (fCurrentSensID!=kVtxSensID) for (int i=3;i--;) tempHMat->MasterToLocalVect(fDerivativeGlo[i],dRdP[i]);
+  else for (int i=3;i--;) for (int j=3;j--;) dRdP[i][j] = fDerivativeGlo[i][j];  // vertex constraint is in lab
+  //
+  if (dbg) {
+    printf("\nCurrentMod: %s Sens:%d\n",fCurrentModule->GetName(),fCurrentSensID); //RRR
+    printf("Module Matrix: ");
+    fCurrentModule->GetMatrix()->Print(); //RRR
+    for (int i=0;i<3;i++) {
+      printf("dRdP[M%d][resI] ",i); for (int j=0;j<3;j++) printf(":[%d] %+.3e ",j,dRdP[i][j]); printf("\n");
+    }//RRR
+    printf("Sensor Matrix: "); tempHMat->Print();
+  }
+  UInt_t ifill=0, dfDone = 0;
+  m.fNModFilled = 0;
+  // 
+  AliITSAlignMille2Module* endModule = fCurrentModule;
+  //
+  m.fModuleID[0] = fCurrentModule->GetUniqueID(); // always register id of the base module, even if it has no DOF
+  //
+  do {
+    if (fCurrentModule->GetNParFree()==0) continue;
+    status = 1;
+    if (!fUseGlobalDelta) dfDone = 0; // for local deltas the derivatives at diff. levels are different
+    Bool_t jacobOK = kFALSE;
+    //
+    for (Int_t i=0; i<kNParChGeom; i++) {              // common for all sensors: derivatives over geom params
+      if (fCurrentModule->GetParOffset(i)<0) continue; // this parameter is not explicitly fitted
+      //
+      if (!TestWordBit(dfDone,i)) {                    // need to calculate new derivative
+       if (!jacobOK) {
+         if (fCurrentSensID!=kVtxSensID) {
+           fCurrentModule->CalcDerivDPosDPar(fCluster.GetVolumeID(),fMeasLoc,&dPdG[0][0]); 
+           if (dbg) {
+             for (int i1=0;i1<3;i1++) {
+               printf("Jacob:dPdG[gpar%d][Mj]",i1); for (int j1=0;j1<3;j1++) printf(":[%d] %+.3e ",j1,dPdG[i1][j1]); printf("\n");//RRR
+             }
+           }
+         }
+         else {
+           // this is a vertex constraint: only lateral shifts are allowed, no rotations
+           for (int ip=AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom;ip--;) for (int jp=3;jp--;) dPdG[ip][jp] = (ip==jp) ? 1:0;   
+         }
+         jacobOK = kTRUE;
+       }       
+       // dRes_j/dGlo_i = \sum_{k=1:3}  dRes_j/dPos_k * dPos_k/dGlo_i
+       fDerivativeGlo[i][kX] = dRdP[kX][kX]*dPdG[i][kX] + dRdP[kY][kX]*dPdG[i][kY] + dRdP[kZ][kX]*dPdG[i][kZ];
+       fDerivativeGlo[i][kY] = dRdP[kX][kY]*dPdG[i][kX] + dRdP[kY][kY]*dPdG[i][kY] + dRdP[kZ][kY]*dPdG[i][kZ];
+       fDerivativeGlo[i][kZ] = dRdP[kX][kZ]*dPdG[i][kX] + dRdP[kY][kZ]*dPdG[i][kY] + dRdP[kZ][kZ]*dPdG[i][kZ];
+       SetWordBit(dfDone,i);
+      }
+      //
+      if (dbg) {
+       printf("Level %s DGlob[par%d][resJ] ",fCurrentModule->GetName(),i); //RRR
+       for (int k=0;k<3;k++) printf(":[%d] %+.3e ",k, fDerivativeGlo[i][k]); printf("\n");//RRR
+      }
+      m.fDerGlo[ifill][kX] = fDerivativeGlo[i][kX];
+      m.fDerGlo[ifill][kY] = fDerivativeGlo[i][kY];
+      m.fDerGlo[ifill][kZ] = fDerivativeGlo[i][kZ];
+      m.fParMilleID[ifill++] = fCurrentModule->GetParOffset(i);
+      //
+    }
+    //
+    if ( fCurrentModule->IsSDD() ) {     // specific for SDD
+      //
+      // assume for sensor local xloc = xloc0 + V0*dT0+dV*(T-T0)
+      // where V0 and T are the nominal drift velocity, time and time0
+      // and the dT0 and dV are the corrections:
+      // drloc_i/dT0 = sum_j drloc_i/dMeasGlo_j * dMeasGlo_j/dT0 = 
+      //             = sum_j drloc_i/dMeasGlo_j sum_k dMeasGlo_j/dMeasLoc_k * dMeasLoc_k/dT0
+      //             = sum_j drloc_i/dMeasGlo_j dMeasGlo_j/dMeasLoc_X * V0
+      //
+      // drloc_i/dV0 = sum_j drloc_i/dMeasGlo_j * dMeasGlo_j/dV0 = 
+      //             = sum_j drloc_i/dMeasGlo_j sum_k dMeasGlo_j/dMeasLoc_k * dMeasLoc_k/dV0
+      //             = sum_j drloc_i/dMeasGlo_j dMeasGlo_j/dMeasLoc_X * T0
+
+      // IMPORTANT: the geom derivatives are over the SENSOR LOCAL parameters
+      //
+      Bool_t jacOK = kFALSE;
+      //Int_t sddLR = fMeasLoc[kX]>0 ? AliITSAlignMille2Module::kDOFDVL : AliITSAlignMille2Module::kDOFDVR;
+      Int_t sddLR = GetVDriftSDD()>0 ? AliITSAlignMille2Module::kDOFDVL : AliITSAlignMille2Module::kDOFDVR;
+      if (fCurrentModule->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)>=0) {
+       if (!TestWordBit(dfDone, AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)) {
+         double vdrift = GetVDriftSDD();
+         JacobianPosGloLoc(kX,dGL);
+         jacOK = kTRUE;
+         fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][kX] = 
+           vdrift*(dRdP[kX][kX]*dGL[kX] + dRdP[kY][kX]*dGL[kY] + dRdP[kZ][kX]*dGL[kZ]);
+         fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][kY] = 
+           vdrift*(dRdP[kX][kY]*dGL[kX] + dRdP[kY][kY]*dGL[kY] + dRdP[kZ][kY]*dGL[kZ]);
+         fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][kZ] = 
+           vdrift*(dRdP[kX][kZ]*dGL[kX] + dRdP[kY][kZ]*dGL[kY] + dRdP[kZ][kZ]*dGL[kZ]);
+         //
+         SetWordBit(dfDone, AliITSAlignMille2Module::kDOFT0);
+       }
+       m.fDerGlo[ifill][kX] = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][kX];
+       m.fDerGlo[ifill][kY] = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][kY];
+       m.fDerGlo[ifill][kZ] = fDerivativeGlo[AliITSAlignMille2Module::kDOFT0][kZ];
+       m.fParMilleID[ifill++] = fCurrentModule->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0);      
+      }
+      //
+      if (fCurrentModule->GetParOffset(sddLR)>=0) {
+       if (!TestWordBit(dfDone, sddLR)) {
+         double tdrift = TMath::Sign(GetTDriftSDD(), GetVDriftSDD());
+         double vdrift = fIsSDDVDriftMult ? TMath::Abs(GetVDriftSDD()) : 1;
+         if (!jacOK) JacobianPosGloLoc(kX,dGL);
+         fDerivativeGlo[sddLR][kX] = 
+           -tdrift*vdrift*(dRdP[kX][kX]*dGL[kX] + dRdP[kY][kX]*dGL[kY] + dRdP[kZ][kX]*dGL[kZ]);
+         fDerivativeGlo[sddLR][kY] = 
+           -tdrift*vdrift*(dRdP[kX][kY]*dGL[kX] + dRdP[kY][kY]*dGL[kY] + dRdP[kZ][kY]*dGL[kZ]);
+         fDerivativeGlo[sddLR][kZ] = 
+           -tdrift*vdrift*(dRdP[kX][kZ]*dGL[kX] + dRdP[kY][kZ]*dGL[kY] + dRdP[kZ][kZ]*dGL[kZ]);
+         SetWordBit(dfDone, sddLR);
+       }
+       m.fDerGlo[ifill][kX] = fDerivativeGlo[sddLR][kX];
+       m.fDerGlo[ifill][kY] = fDerivativeGlo[sddLR][kY];
+       m.fDerGlo[ifill][kZ] = fDerivativeGlo[sddLR][kZ];
+       m.fParMilleID[ifill++] = fCurrentModule->GetParOffset(sddLR);      
+      }
+    }
+    //
+    m.fModuleID[m.fNModFilled++] = fCurrentModule->GetUniqueID();
+  } while( (fCurrentModule=fCurrentModule->GetParent()) );
+  //
+  // store first local residuals
+  fTPAFitter->GetResiduals(fPintLoc , curpoint);       // lab residuals
+  for (int i=3;i--;) fPintLoc[i] = -fPintLoc[i];
+  if   (fCurrentSensID!=kVtxSensID) tempHMat->MasterToLocalVect(fPintLoc,m.fMeas);       // local residuals 
+  else for (int i=3;i--;) m.fMeas[i] = fPintLoc[i];
+  if (dbg) {
+    printf("res(meas-loc) "); for (int k=0;k<3;k++) printf(":[%d] %+.3e ",k,m.fMeas[k]); printf("\n");
+    printf("Fin:%s %+e %+e\n",endModule->GetName(), fDerivativeGlo[kZ][kZ], fPintLoc[kZ]);
+  }//RRR
+  m.fSigma[kX] = fSigmaLoc[kX];
+  m.fSigma[kY] = fSigmaLoc[kY];
+  m.fSigma[kZ] = fSigmaLoc[kZ];
+  //
+  m.fNGlobFilled = ifill;
+  fCurrentModule = endModule;
+  //
+  return status;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::SetLocalEquations(const Mille2Data *marr, Int_t neq) 
+{
+  /// Set local equations with data stored in m
+  /// return 0 if success
+  //
+  Bool_t locPatt[kNLocal] = {0}; // pattern of lacal eq's to account
+  for (int i=fNLocal; i--;) {
+    if (locPatt[i]) continue; // already set
+    for (Int_t j=0; j<neq; j++) for (int ic=3;ic--;) if (!IsZero(marr[j].fDerLoc[i][ic])) locPatt[i]=kTRUE;
+  }
+  //
+  for (Int_t j=0; j<neq; j++) {
+    //
+    const Mille2Data &m = marr[j];
+    //
+    Bool_t filled = kFALSE;
+    for (int ic=3;ic--;) {
+      // for the diamond point (if any) the Y residual is accounted
+      if (ic==kY && !fUseLocalYErr && !(m.fModuleID[0]==fDiamondModID)) continue;
+      AliDebug(2,Form("setting local equation %c with fMeas=%.6f  and fSigma=%.6f",fgkXYZ[ic],m.fMeas[ic], m.fSigma[ic]));      
+      Int_t nzero = 0, naddl = 0;
+      for (int i=0;i<=fNLocal;i++) if (locPatt[i]) nzero += SetLocalDerivative(naddl++,m.fDerLoc[i][ic] );
+      if (nzero==fNLocal) { 
+       AliInfo(Form("Skipping %c residual due to the zero derivatives!",fgkXYZ[ic])); 
+       continue; 
+      }
+      for (int i=m.fNGlobFilled;i--;) SetGlobalDerivative( m.fParMilleID[i] , m.fDerGlo[i][ic] );
+      fMillepede->SetLocalEquation(fGlobalDerivatives, fLocalDerivatives, m.fMeas[ic], m.fSigma[ic]);  
+      filled = kTRUE;
+      //
+    }
+    //
+    if (filled) for (int i=m.fNModFilled;i--;) GetMilleModule(m.fModuleID[i])->IncNProcessedPoints();
+  }
+  //
+  double wgh = 1;
+  if (GetWeightPt() && fTPAFitter) {
+    wgh = fTPAFitter->GetPt();
+    if (wgh>10) wgh = 10.;
+    if (wgh<0) wgh = fTPAFitter->IsTypeCosmics() ? 7 : 0.5;
+    if (GetWeightPt()>0) wgh = TMath::Power(wgh,GetWeightPt());
+  }
+  fMillepede->SetRecordWeight(wgh*fTrackWeight);
+  fMillepede->SetRecordRun(fRunID);
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::GlobalFit()
+{
+  /// Call global fit; Global parameters are stored in parameters
+  if (!fIsMilleInit) Init();
+  //
+  ApplyPreConstraints();
+  int res = fMillepede->GlobalFit();
+  AliInfo(Form("%s fitting global parameters!",res ? "Done":"Failed"));
+  if (res) {
+    // fetch the parameters
+    for (int imd=fNModules;imd--;) {
+      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);
+      int nprocp = 0;
+      for (int ip=mod->GetNParTot();ip--;) {
+       int idp = mod->GetParOffset(ip);
+       if (idp<0) continue;    // was not in the explicit fit
+       mod->SetParVal(ip,fMillepede->GetFinalParam(idp));
+       mod->SetParErr(ip,fMillepede->GetFinalError(idp));
+       int np = fMillepede->GetProcessedPoints(idp);
+       if (TMath::Abs(np)>TMath::Abs(nprocp)) nprocp = np;
+      }
+      if (!mod->GetNProcessedPoints()) mod->SetNProcessedPoints(nprocp);
+    }
+
+  }
+  ApplyPostConstraints();
+  return res;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::PrintGlobalParameters() 
+{
+  /// Print global parameters
+  if (!fIsMilleInit) {
+    AliInfo("Millepede has not been initialized!");
+    return;
+  }
+  fMillepede->PrintGlobalParameters();
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::LoadSuperModuleFile(const Char_t *sfile)
+{ 
+  // load definitions of supermodules from a root file
+  // return 0 if success
+  AliInfo(Form("Loading SuperModule definitions from %s",sfile));
+  TFile *smf=TFile::Open(sfile);
+  if (!smf->IsOpen()) {
+    AliInfo(Form("Cannot open supermodule file %s",sfile));
+    return -1;
+  }
+
+  TClonesArray *sma=(TClonesArray*)smf->Get("ITSMilleSuperModules");
+  if (!sma) {
+    AliInfo(Form("Cannot find ITSMilleSuperModules array in file"));
+    return -2;  
+  }  
+  Int_t nsma=sma->GetEntriesFast();
+  AliInfo(Form("Array of SuperModules with %d entries\n",nsma));
+  //
+  // pepo200709
+  Char_t st[2048];
+  char symname[250];
+  // end pepo200709
+
+  UShort_t volid;
+  TGeoHMatrix m;
+  //
+  for (Int_t i=0; i<nsma; i++) {
+    AliAlignObjParams *a = (AliAlignObjParams*)sma->UncheckedAt(i);
+    volid=a->GetVolUID();
+    strncpy(st,a->GetSymName(),TMath::Min(sizeof(st),strlen(a->GetSymName())+1));
+    a->GetMatrix(m);
+    //
+    symname[0] = '\0';
+    sscanf(st,"%249s",symname);
+    //
+    // decode module list
+    char *stp=strstr(st,"ModuleList:");
+    if (!stp) return -3;
+    stp += 11;
+    int idx[2200];
+    char spp[200]; int jp=0;
+    char cl[20];
+    strncpy(st,stp,TMath::Min(sizeof(st),strlen(stp)+1));
+    int l=strlen(st);
+    int j=0;
+    int n=0;
+    //
+    while (j<=l) {
+      if (st[j]==9 || st[j]==32 || st[j]==10 || st[j]==0) {
+       spp[jp]=0;
+       jp=0;
+       if (strlen(spp)) {
+         int k=strcspn(spp,"-");
+         if (k<int(strlen(spp))) { // c'e' il -
+           strncpy(cl,&(spp[k+1]), TMath::Min(sizeof(cl),strlen(&spp[k+1])+1));
+           spp[k]=0;
+           int ifrom=atoi(spp); int ito=atoi(cl);
+           for (int b=ifrom; b<=ito; b++) {
+             idx[n]=b;
+             n++;
+           }
+         }
+         else { // numerillo singolo
+           idx[n]=atoi(spp);
+           n++;
+         }
+       }
+      }
+      else {
+       spp[jp]=st[j];
+       jp++;
+      }
+      j++;
+    }
+    UShort_t volidsv[2198];
+    for (j=0;j<n;j++) {
+      volidsv[j]=AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(idx[j]);
+      if (!volidsv[j]) {
+       AliInfo(Form("Index %d not valid (range 0->%d)",idx[j],kMaxITSSensID));
+       return -5;
+      }
+    }
+    Int_t smindex=int(2198+volid-14336); // virtual index
+    //
+    fSuperModule.AddAtAndExpand(new AliITSAlignMille2Module(smindex,volid,symname,&m,n,volidsv),fNSuperModules);
+    //
+    fNSuperModules++;
+  }
+  //
+  smf->Close();
+  //
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConstrainModuleSubUnitsMean(Int_t idm, Double_t val, UInt_t pattern)
+{
+  // require that sum of modifications for the childs of this module is = val, i.e.
+  // the internal corrections moves the module as a whole by fixed value (0 by default).
+  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain
+  //
+  if (fIsMilleInit) {
+    AliInfo("Millepede has been already initialized: no constrain may be added!");
+    return;
+  }
+  if (!GetMilleModule(idm)->GetNChildren()) return;
+  TString nm = "cstrSUMean";
+  nm += GetNConstraints();
+  AliITSAlignMille2Constraint *cstr = new AliITSAlignMille2Constraint(nm.Data(),AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean,
+                                                                     idm,val,pattern);
+  cstr->SetConstraintID(GetNConstraints());
+  fConstraints.Add(cstr);
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConstrainModuleSubUnitsMedian(Int_t idm, Double_t val, UInt_t pattern)
+{
+  // require that median of the modifications for the childs of this module is = val, i.e.
+  // the internal corrections moves the module as a whole by fixed value (0 by default) 
+  // module the outliers.
+  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain
+  // The difference between the mean and the median will be transfered to the parent
+  if (fIsMilleInit) {
+    AliInfo("Millepede has been already initialized: no constrain may be added!");
+    return;
+  }
+  if (!GetMilleModule(idm)->GetNChildren()) return;
+  TString nm = "cstrSUMed";
+  nm += GetNConstraints();
+  AliITSAlignMille2Constraint *cstr = new AliITSAlignMille2Constraint(nm.Data(),AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMedian,
+                                                                     idm,val,pattern);
+  cstr->SetConstraintID(GetNConstraints());
+  fConstraints.Add(cstr);
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConstrainOrphansMean(Double_t val, UInt_t pattern)
+{
+  // require that median of the modifications for the supermodules which have no parents is = val, i.e.
+  // the corrections moves the whole setup by fixed value (0 by default) modulo the outliers.
+  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain
+  //
+  if (fIsMilleInit) {
+    AliInfo("Millepede has been already initialized: no constrain may be added!");
+    return;
+  }
+  TString nm = "cstrOMean";
+  nm += GetNConstraints();
+  AliITSAlignMille2Constraint *cstr = new AliITSAlignMille2Constraint(nm.Data(),AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean,
+                                                                     -1,val,pattern);
+  cstr->SetConstraintID(GetNConstraints());
+  fConstraints.Add(cstr);
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConstrainOrphansMedian(Double_t val, UInt_t pattern)
+{
+  // require that median of the modifications for the supermodules which have no parents is = val, i.e.
+  // the corrections moves the whole setup by fixed value (0 by default) modulo the outliers.
+  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain
+  //
+  if (fIsMilleInit) {
+    AliInfo("Millepede has been already initialized: no constrain may be added!");
+    return;
+  }
+  TString nm = "cstrOMed";
+  nm += GetNConstraints();
+  AliITSAlignMille2Constraint *cstr = new AliITSAlignMille2Constraint(nm.Data(),AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMedian,
+                                                                     -1,val,pattern);
+  cstr->SetConstraintID(GetNConstraints());
+  fConstraints.Add(cstr);
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConstrainLocal(const Char_t* name,Double_t *parcf,Int_t npar,Double_t val,Double_t err)
+{
+  // apply constraint on parameters in the local frame
+  if (fIsMilleInit) {
+    AliInfo("Millepede has been already initialized: no constrain may be added!");
+    return;
+  }
+  AliITSAlignMille2ConstrArray *cstr = new AliITSAlignMille2ConstrArray(name,parcf,npar,val,err);
+  cstr->SetConstraintID(GetNConstraints());
+  fConstraints.Add(cstr);
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ApplyGaussianConstraint(const AliITSAlignMille2ConstrArray* cstr)
+{
+  // apply the constraint on the local corrections of a list of modules
+  int nmod = cstr->GetNModules();
+  double jacobian[AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom][AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom];
+  //
+  // check if this not special SDDT0 constraint
+  if (cstr->GetPattern()==BIT(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)) {
+    for (int i=0;i<cstr->GetNModules()-1;i++) {
+      AliITSAlignMille2Module *mdI = GetMilleModule(cstr->GetModuleID(i));
+      if (!mdI->IsFreeDOF(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)) continue;
+      for (int j=i+1;j<cstr->GetNModules();j++) {
+       AliITSAlignMille2Module *mdJ = GetMilleModule(cstr->GetModuleID(j));
+       if (!mdJ->IsFreeDOF(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)) continue;
+       //
+       ResetLocalEquation();
+       fGlobalDerivatives[mdI->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)] = 1;
+       fGlobalDerivatives[mdJ->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)] =-1;
+       AddConstraint(fGlobalDerivatives, 0, 1.E-6);
+      }
+    }
+    return;
+  }
+
+  for (int imd=nmod;imd--;) {
+    int modID = cstr->GetModuleID(imd);
+    AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(modID);
+    ResetLocalEquation();
+    int nadded = 0;
+    double value = cstr->GetValue();
+    double sigma = cstr->GetError();
+    //
+    // in case the reference (survey) deltas were imposed for Gaussian constraints
+    // already accumulated corrections: they must be subtracted from the constraint value.
+    if (IsConstraintWrtRef()) {
+      //
+      Double_t precal[AliITSAlignMille2Module::kMaxParTot];
+      Double_t refcal[AliITSAlignMille2Module::kMaxParTot];
+      for (int ip=AliITSAlignMille2Module::kMaxParTot;ip--;) {precal[ip]=0; refcal[ip] = 0.;}
+      //
+      // check if there was a reference delta provided for this module
+      AliAlignObjParams* parref = GetConstrRefObject(mod->GetName());
+      if (parref) parref->GetPars(refcal, refcal+3);    // found reference delta
+      //
+      // extract already applied local corrections for this module
+      if (fPrealignment) {
+       //
+       AliAlignObjParams *preo = GetPrealignedObject(mod->GetName());
+       if (preo) {
+         TGeoHMatrix preMat,tmpMat = *mod->GetMatrix(); //  Delta_Glob * Delta_Glob_Par * M
+         preo->GetMatrix(preMat);                       //  Delta_Glob
+         preMat.MultiplyLeft( &tmpMat.Inverse() );      //  M^-1 * Delta_Glob_Par^-1 = (Delta_Glob_Par * M)^-1
+         tmpMat.MultiplyLeft( &preMat );                //  (Delta_Glob_Par * M)^-1 * Delta_Glob * Delta_Glob_Par * M = Delta_loc
+         AliAlignObjParams algob;
+         algob.SetMatrix(tmpMat);
+         algob.GetPars(precal,precal+3); // local corrections for geometry
+       }
+      }
+      //
+      // subtract the contribution to constraint from precalibration 
+      for (int ipar=cstr->GetNCoeffs();ipar--;) value += (refcal[ipar]-precal[ipar])*cstr->GetCoeff(ipar);
+      //
+    } 
+    //    
+    if (fUseGlobalDelta) mod->CalcDerivLocGlo(&jacobian[0][0]);
+    //
+    for (int ipar=cstr->GetNCoeffs();ipar--;) {
+      double coef = cstr->GetCoeff(ipar);
+      if (IsZero(coef)) continue;
+      //
+      if (!fUseGlobalDelta || ipar>= AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom) { // 
+       // we are working with local params or if the given param is not related to geometry, 
+       // apply the constraint directly
+       int parPos = mod->GetParOffset(ipar);
+       if (parPos<0) continue; // not in the fit
+       fGlobalDerivatives[parPos] += coef;
+       nadded++;
+      }
+      else { // we are working with global params, while the constraint is on local ones -> jacobian
+       for (int jpar=AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom;jpar--;) {
+         int parPos = mod->GetParOffset(jpar);
+         if (parPos<0) continue;
+         fGlobalDerivatives[parPos] += coef*jacobian[ipar][jpar];
+         nadded++;
+       }
+      }      
+    }
+    if (nadded) AddConstraint(fGlobalDerivatives, value, sigma);
+  }
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ApplyPreConstraints()
+{
+  // apply constriants which cannot be imposed after the fit
+  int nconstr = GetNConstraints();
+  for (int i=0;i<nconstr;i++) {
+    AliITSAlignMille2Constraint* cstr = GetConstraint(i);
+    //
+    if (cstr->GetType() == AliITSAlignMille2ConstrArray::kTypeGaussian) {
+      ApplyGaussianConstraint( (AliITSAlignMille2ConstrArray*)cstr);
+      continue;
+    } 
+    //
+    if (cstr->GetType() == AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMedian) continue; // post type constraint
+    //
+    if (!fUseGlobalDelta) continue; // mean/med constraints must be applied to global deltas
+    // apply constraint on the mean's before the fit
+    int imd = cstr->GetModuleID();
+    if (imd>=0) {
+      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);
+      UInt_t pattern = 0;
+      for (int ipar=mod->GetNParTot();ipar--;) {
+       if (!cstr->IncludesParam(ipar)) continue;
+       if (mod->GetParOffset(ipar)<0) continue; // parameter is not in the explicit fit -> post constraint
+       pattern |= 0x1<<ipar;
+       cstr->SetApplied(ipar);
+      }
+      ConstrainModuleSubUnits(imd,cstr->GetValue(),pattern);
+      //
+    }
+    else if (!PseudoParentsAllowed()) {
+      ConstrainOrphans(cstr->GetValue(),(UInt_t)cstr->GetPattern());
+      cstr->SetApplied(-1);
+    }
+  }
+  //
+  // do we need to tie the SDD left/right VDrift corrections
+  for (int imd=0;imd<fNModules;imd++) {
+    AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);
+    if (mod->IsSDD() && mod->IsVDriftLRSame()) TieSDDVDriftsLR(mod);
+  }
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ApplyPostConstraints()
+{
+  // apply constraints which can be imposed after the fit
+  int nconstr = GetNConstraints();
+  Bool_t convGlo      = kFALSE;
+  // check if there is something to do
+  int ntodo = 0;
+  for (int i=0;i<nconstr;i++) {
+    AliITSAlignMille2Constraint* cstr = GetConstraint(i);
+    if (cstr->GetType() == AliITSAlignMille2ConstrArray::kTypeGaussian) continue;
+    if (cstr->GetRemainingPattern() == 0) continue;
+    ntodo++;
+  }
+  if (!ntodo) return;
+  //
+  if (!fUseGlobalDelta) { // need to convert to global params
+    ConvertParamsToGlobal();
+    convGlo = kTRUE;
+  }
+  //
+  for (int i=0;i<nconstr;i++) {
+    AliITSAlignMille2Constraint* cstr = GetConstraint(i);
+    if (cstr->GetType() == AliITSAlignMille2ConstrArray::kTypeGaussian) continue;
+    //
+    int imd = cstr->GetModuleID();
+    //
+    if (imd>=0) {
+      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);
+      if (mod->IsNotInConf()) continue;
+      UInt_t pattern = 0;
+      for (int ipar=mod->GetNParTot();ipar--;) {
+       if (cstr->IsApplied(ipar))      continue;
+       if (!cstr->IncludesParam(ipar)) continue;
+       if (!mod->IsFreeDOF(ipar))      continue; // parameter is fixed, will not apply constraint
+       pattern |= 0x1<<ipar;
+       cstr->SetApplied(ipar);
+      }
+      if (pattern) PostConstrainModuleSubUnits(cstr->GetType(),cstr->GetModuleID(),cstr->GetValue(),pattern);
+      //
+    }
+    else if (PseudoParentsAllowed()) {
+      UInt_t pattern = (UInt_t)cstr->GetRemainingPattern();
+      PostConstrainOrphans(cstr->GetType(),cstr->GetValue(),pattern);
+      cstr->SetApplied(-1);
+    }
+  }
+  // if there was a conversion, rewind it
+  if (convGlo) ConvertParamsToLocal();
+  // 
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConstrainModuleSubUnits(Int_t idm, Double_t val, UInt_t pattern)
+{
+  // require that sum of modifications for the childs of this module is = val, i.e.
+  // the internal corrections moves the module as a whole by fixed value (0 by default).
+  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain
+  //
+  //
+  AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(idm);
+  //
+  for (int ip=0;ip<kNParCh;ip++) {
+    if ( !((pattern>>ip)&0x1) /*|| !parent->IsFreeDOF(ip)*/) continue;
+    ResetLocalEquation();
+    int nadd = 0;
+    for (int ich=mod->GetNChildren();ich--;) {
+      int idpar = ((AliITSAlignMille2Module*)mod->GetChild(ich))->GetParOffset(ip);
+      if (idpar<0) continue;
+      fGlobalDerivatives[idpar] = 1.0;
+      nadd++;
+    }
+    //
+    if (nadd>0) {
+      AddConstraint(fGlobalDerivatives,val);
+      AliInfo(Form("Constrained param %d for %d submodules of module #%d: %s",ip,nadd,idm,mod->GetName()));
+    }
+  }
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConstrainOrphans(Double_t val, UInt_t pattern)
+{
+  // require that median of the modifications for the supermodules which have no parents is = val, i.e.
+  // the corrections moves the whole setup by fixed value (0 by default) modulo the outliers.
+  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain
+  //
+  for (int ip=0;ip<kNParCh;ip++) {
+    //
+    if ( !((pattern>>ip)&0x1) ) continue;
+    ResetLocalEquation();
+    int nadd = 0;
+    for (int imd=fNModules;imd--;) {
+      AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);
+      if (mod->IsNotInConf()) continue; // dummy module
+      AliITSAlignMille2Module* par = mod->GetParent();
+      while (par && par->IsNotInConf() ) par = par->GetParent(); // use only decalred parents
+      if (par) continue; // this is not an orphan
+      int idpar = mod->GetParOffset(ip);
+      if (idpar<0) continue;
+      fGlobalDerivatives[idpar] = 1.0;
+      nadd++;
+    }
+    if (nadd>0) {
+      AddConstraint(fGlobalDerivatives,val);
+      AliInfo(Form("Constrained param %d for %d orphan modules",ip,nadd));
+    }
+  }
+  //
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::PostConstrainModuleSubUnits(Int_t type,Int_t idm, Double_t val, UInt_t pattern)
+{
+  // require that median or mean of the modifications for the childs of this module is = val, i.e.
+  // the internal corrections moves the module as a whole by fixed value (0 by default) 
+  // module the outliers.
+  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain
+  // The difference between the mean and the median will be transfered to the parent
+  //
+  AliITSAlignMille2Module* parent = GetMilleModule(idm);
+  int nc = parent->GetNChildren();
+  //
+  double *tmpArr = new double[nc]; 
+  //
+  for (int ip=0;ip<kNParCh;ip++) {
+    int npc = 0;
+    if ( !((pattern>>ip)&0x1) || !parent->IsFreeDOF(ip)) continue;
+    // compute the mean and median of the deltas
+    int nfree = 0;
+    for (int ich=nc;ich--;) {
+      AliITSAlignMille2Module* child = parent->GetChild(ich);
+      //      if (!child->IsFreeDOF(ip)) continue; 
+      tmpArr[nfree++] = child->GetParVal(ip);
+    }
+    double median=0,mean=0;
+    for (int ic0=0;ic0<nfree;ic0++) {// order the deltas 
+      mean += tmpArr[ic0];
+      for (int ic1=ic0+1;ic1<nfree;ic1++) 
+       if (tmpArr[ic0]>tmpArr[ic1]) {double tv=tmpArr[ic0]; tmpArr[ic0]=tmpArr[ic1]; tmpArr[ic1]=tv;}
+    }
+    //
+    int kmed = nfree/2;
+    median = (tmpArr[kmed]+tmpArr[nfree-kmed-1])/2.;
+    if (nfree>0) mean /= nfree;
+    //
+    double shift = val - (type==AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean ? mean : median);
+    //
+    for (int ich=nc;ich--;) {
+      AliITSAlignMille2Module* child = parent->GetChild(ich);
+      //    if (!child->IsFreeDOF(ip)) continue; 
+      child->SetParVal(ip, child->GetParVal(ip) + shift);
+      npc++;
+    }
+    //
+    parent->SetParVal(ip, parent->GetParVal(ip) - shift);
+    AliInfo(Form("%s constraint: added %+f shift to param[%d] of %d children of module %d: %s",
+                type==AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean ? "MEAN" : "MEDIAN",shift,
+                ip,npc,idm,parent->GetName()));
+  }
+  delete[] tmpArr;  
+  //
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::PostConstrainOrphans(Int_t type,Double_t val, UInt_t pattern)
+{
+  // require that median or mean of modifications for the supermodules which have no parents is = val, i.e.
+  // the corrections moves the whole setup by fixed value (0 by default).
+  // pattern is the bit pattern for the parameters to constrain
+  //
+  int nc = fNModules;
+  //
+  int norph = 0;
+  for (int ich=nc;ich--;) {
+    AliITSAlignMille2Module *par= GetMilleModule(ich)->GetParent();    
+    while (par && par->IsNotInConf()) par = par->GetParent(); // use only decalred parents
+    if (!par) norph ++;
+  }
+  //
+  if (!norph) return;
+  double *tmpArr = new double[norph]; 
+  for (int i=norph;i--;) tmpArr[i] = 0;
+  //
+  for (int ip=0;ip<kNParCh;ip++) {
+    int npc = 0;
+    if ( !((pattern>>ip)&0x1)) continue;
+    // compute the mean and median of the deltas
+    int nfree = 0;
+    for (int ich=nc;ich--;) {
+      AliITSAlignMille2Module* child = GetMilleModule(ich);
+      if (child->IsNotInConf()) continue; // dummy module
+      //      if (child->GetParent() || !child->IsFreeDOF(ip)) continue; 
+      AliITSAlignMille2Module* par = child->GetParent();
+      while (par && par->IsNotInConf()) par = par->GetParent(); // count only declared parents
+      if (par) continue; 
+      tmpArr[nfree++] = child->GetParVal(ip);
+    }
+    double median=0,mean=0;
+    for (int ic0=0;ic0<nfree;ic0++) {// order the deltas 
+      mean += tmpArr[ic0];
+      for (int ic1=ic0+1;ic1<nfree;ic1++) 
+       if (tmpArr[ic0]>tmpArr[ic1]) {double tv=tmpArr[ic0]; tmpArr[ic0]=tmpArr[ic1]; tmpArr[ic1]=tv;}
+    }
+    //
+    int kmed = nfree/2;
+    median = (tmpArr[kmed]+tmpArr[nfree-kmed-1])/2.;
+    if (nfree>0) mean /= nfree;
+    //
+    double shift = val - (type==AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean ? mean : median);
+    //
+    for (int ich=nc;ich--;) {
+      AliITSAlignMille2Module* child = GetMilleModule(ich);
+      if (child->IsNotInConf()) continue; // dummy module
+      //      if (child->GetParent() || !child->IsFreeDOF(ip)) continue; 
+      AliITSAlignMille2Module* par = child->GetParent();
+      while (par && par->IsNotInConf()) par = par->GetParent(); // count only declared parents
+      if (par) continue; 
+      child->SetParVal(ip, child->GetParVal(ip) + shift);
+      npc++;
+    }
+    //
+    AliInfo(Form("%s constraint: added %+f shift to param[%d] of %d orphan modules",
+                type==AliITSAlignMille2Constraint::kTypeMean ? "MEAN" : "MEDIAN",shift,
+                ip,npc));
+  }
+  delete[] tmpArr;  
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Bool_t AliITSAlignMille2::IsParModConstrained(const AliITSAlignMille2Module* mod,Int_t par, Bool_t &meanmed, Bool_t &gaussian) const
+{
+  // check if par of the module participates in some constraint, and set the flag for their types
+  meanmed = gaussian = kFALSE;
+  //
+  if ( mod->IsParConstrained(par) ) gaussian = kTRUE;     // direct constraint on this param
+  //
+  for (int icstr=GetNConstraints();icstr--;) {
+    AliITSAlignMille2Constraint* cstr = GetConstraint(icstr);
+    //
+    if (!cstr->IncludesModPar(mod,par)) continue;
+    if (cstr->GetType()==AliITSAlignMille2ConstrArray::kTypeGaussian) gaussian = kTRUE;
+    else meanmed = kTRUE;
+    //
+    if (meanmed && gaussian) break; // no sense to check further
+  }
+  //
+  return meanmed||gaussian;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Bool_t AliITSAlignMille2::IsParModFamilyVaried(const AliITSAlignMille2Module* mod,Int_t par,Int_t depth) const
+{
+  // check if parameter par is varied for this module or its children up to the level depth
+  if (depth<0) return kFALSE;
+  if (mod->GetParOffset(par)>=0) return kTRUE;
+  for (int icld=mod->GetNChildren();icld--;) {
+    AliITSAlignMille2Module* child = mod->GetChild(icld);
+    if (IsParModFamilyVaried(child, par, depth-1)) return kTRUE;
+  }
+  return kFALSE;
+  //
+}
+
+/*
+//________________________________________________________________________________________________________
+Bool_t AliITSAlignMille2::IsParFamilyFree(AliITSAlignMille2Module* mod,Int_t par,Int_t depth) const
+{
+  // check if parameter par is varied and is not subjected to gaussian constraint for the children up to the level depth
+  if (depth<0) return kTRUE;
+  for (int icld=mod->GetNChildren();icld--;) {
+    AliITSAlignMille2Module* child = mod->GetChild(icld);
+    //if (child->GetParOffset(par)<0) continue;                  // fixed
+    Bool_t cstMM=kFALSE,cstGS=kFALSE;
+    // does this child have gaussian constraint ?
+    if (!IsParModConstrained(child,par,cstMM,cstGS) || !cstGS ) return kTRUE;
+    // check its children
+    if (!IsParFamilyFree(child,par,depth-1)) return kTRUE;
+  }
+  return kFALSE;
+  //
+}
+*/
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Bool_t AliITSAlignMille2::IsParFamilyFree(const AliITSAlignMille2Module* mod,Int_t par,Int_t depth) const
+{
+  // check if parameter par is varied and is not subjected to gaussian constraint for the children up to the level depth
+  if (depth<0) return kFALSE;
+  for (int icld=mod->GetNChildren();icld--;) {
+    AliITSAlignMille2Module* child = mod->GetChild(icld);
+    //if (child->GetParOffset(par)<0) continue;                  // fixed
+    Bool_t cstMM=kFALSE,cstGS=kFALSE;
+    // does this child have gaussian constraint ?
+    if (!IsParModConstrained(child,par,cstMM,cstGS) || !cstGS ) return kTRUE;
+    // check its children
+    if (IsParFamilyFree(child,par,depth-1)) return kTRUE;
+  }
+  return kFALSE;
+  //
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Double_t AliITSAlignMille2::GetTDriftSDD() const 
+{
+  // obtain drift time corrected for t0
+  double t = fCluster.GetDriftTime();
+  return t - fDriftTime0[ fCluster.GetUniqueID()-1 ];
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Double_t AliITSAlignMille2::GetVDriftSDD() const 
+{
+  // obtain corrected drift speed
+  return fDriftSpeed[ fCluster.GetUniqueID()-1 ];
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Bool_t AliITSAlignMille2::FixedOrphans() const
+{
+  // are there fixed modules with no parent (normally in such a case 
+  // the constraints on the orphans should not be applied
+  if (!IsConfigured()) {
+    AliInfo("Still not configured");
+    return kFALSE;
+  }
+  for (int i=0;i<fNModules;i++) {
+    AliITSAlignMille2Module* md = GetMilleModule(i);
+    if (md->IsNotInConf()) continue;
+    if (md->GetParent()==0 && md->GetNParFree()==0) return kTRUE;
+  }
+  return kFALSE;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConvertParamsToGlobal()
+{
+  // convert params in local frame to global one
+  double pars[AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom];
+  for (int imd=fNModules;imd--;) {
+    AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);
+    if (mod->GeomParamsGlobal()) continue;
+    mod->GetGeomParamsGlo(pars);
+    mod->SetParVals(pars,AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom);
+    mod->SetGeomParamsGlobal(kTRUE);
+  }
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConvertParamsToLocal()
+{
+  // convert params in global frame to local one
+  double pars[AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom];
+  for (int imd=fNModules;imd--;) {
+    AliITSAlignMille2Module* mod = GetMilleModule(imd);
+    if (!mod->GeomParamsGlobal()) continue;
+    mod->GetGeomParamsLoc(pars);
+    mod->SetParVals(pars,AliITSAlignMille2Module::kMaxParGeom);
+    mod->SetGeomParamsGlobal(kFALSE);
+  }
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::SetBField(Double_t b)
+{
+  // set Bz value
+  if (IsZero(b,1e-5)) {
+    fBField = 0.0;
+    fBOn = kFALSE;
+    fNLocal = 4;
+  }
+  else {
+    fBField = b;
+    fBOn = kTRUE;
+    fNLocal = 5; // helices
+  }
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::ProcessUserInfo(TList* userInfo)
+{
+  // extract calibration information used for TrackPointArray creation from run info
+  //
+  if (!userInfo) { AliInfo("No UserInfo is provided"); return 0;}
+  //
+  TMap *cdbMap=0;
+  TList* cdbList=0;
+  TObjString *objStr,*objStr1,*keyStr;
+  TString cdbStr;
+  AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
+  man->SetCacheFlag(kFALSE);
+  //
+  int run = userInfo->GetUniqueID();
+  if (run>0) SetRunID(run);
+  AliInfo(Form("UserInfo corresponds to run#%d",run));
+  cdbMap  = (TMap*)userInfo->FindObject("cdbMap");
+  const TMap *curMap = man->GetStorageMap();
+  if (!cdbMap) {AliInfo("No CDB Map found in UserInfo");}
+  else {
+    if ((objStr=(TObjString*)cdbMap->GetValue("default"))) { // first set default CDB path    
+      if ((objStr1=(TObjString*)curMap->GetValue("default")) && objStr1->GetUniqueID()) {
+       AliInfo(Form("OCDB default path from UserInfo: %s is overriden by user setting %s",objStr->GetName(),objStr1->GetName()));
+      }
+      else {
+       cdbStr = objStr->GetString();
+       man->UnsetDefaultStorage();
+       if (man->GetRaw()) man->SetRaw(kFALSE);
+       if (cdbStr.BeginsWith("raw://")) cdbStr = "raw://";
+       AliInfo(Form("Default CDB Storage from UserInfo: %s",cdbStr.Data()));
+       man->SetDefaultStorage( cdbStr.Data() ); // this may be overriden later by configuration file
+      }
+    }
+    if (man->GetRaw() && run>0) man->SetRun(run);
+    //    
+    // set specific paths relevant for alignment
+    TIter itMap(cdbMap);
+    while( (keyStr=(TObjString*)itMap.Next()) ) {
+      TString keyS = keyStr->GetString();
+      if ( keyS == "default" ) continue;
+      //
+      TObjString* curPath = (TObjString*)curMap->GetValue(keyStr->GetName());
+      if (curPath && curPath->GetUniqueID()) {
+       AliInfo(Form("Storage for %s from UserInfo\n is overriden by user setting %s",keyS.Data(),curPath->GetName()));
+       continue;
+      }
+      man->SetSpecificStorage( keyS.Data(), cdbMap->GetValue(keyS)->GetName() );
+    }
+  }
+  //
+  cdbList = (TList*)userInfo->FindObject("cdbList");  
+  if (!cdbList) {AliInfo("No CDB List found in UserInfo");}
+  else {
+    // Objects used for TrackPointArray production
+    GetPathFromUserInfo(cdbList,"GRP/Geometry/Data",fIniGeomPath ,kSameInitGeomBit);
+    GetPathFromUserInfo(cdbList,"ITS/Align/Data"   ,fIniDeltaPath,kSameInitDeltasBit);
+    GetPathFromUserInfo(cdbList,"ITS/Calib/RespSDD",fIniSDDRespPath,kSameInitSDDRespBit);
+    GetPathFromUserInfo(cdbList,"ITS/Calib/DriftSpeedSDD",fIniSDDVDriftPath,kSameInitSDDVDriftBit);
+    GetPathFromUserInfo(cdbList,"ITS/Calib/MapsTimeSDD",fIniSDDCorrMapPath,kSameInitSDDCorrMapBit);
+    GetPathFromUserInfo(cdbList,"GRP/Calib/MeanVertexSPD",fDiamondPath,kSameDiamondBit);
+  }  
+  //
+  TList *bzlst = (TList*)userInfo->FindObject("BzkGauss");
+  if (bzlst && bzlst->At(0)) {
+    objStr = (TObjString*)bzlst->At(0);
+    SetBField( objStr->GetString().Atof() );
+    AliInfo(Form("Magnetic field from UserInfo: %+.2e",GetBField()));
+  }
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::GetPathFromUserInfo(TList* cdbList,const char* calib,TString& path, Int_t useBit)
+{
+  // extract the path for specific CDB path from user info. If it is the same as already loaded, set corresponing bit
+  TIter itList(cdbList);
+  if (useBit>=0) ResetBit(useBit);
+  TObjString* objStr;
+  while( (objStr=(TObjString*)itList.Next()) )
+    if (objStr->GetString().Contains(calib)) {
+      TString newpath = objStr->GetString();
+      AliInfo(Form("Found path in UserInfo: %s",newpath.Data()));
+      if ( useBit>=0 && (fUserProvided&useBit) ) {
+       AliInfo(Form("Will use the one provided in config: %s",path.Data()));
+       SetBit(useBit);       
+      }
+      else if ( useBit>=0 && (newpath == path) ) {
+       AliInfo(Form("Path %s is the same as already loaded",path.Data()));
+       SetBit(useBit);       
+      }
+      else path = newpath; 
+      //
+      return 0;
+    }
+  AliInfo(Form("Did not find path for %s in UserInfo",calib));
+  path = "";
+  return -1;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::LoadSDDResponse(TString& path, AliITSresponseSDD *&resp)
+{
+  // load SDD response
+  if (path.IsNull()) return 0;
+  AliInfo(Form("Loading SDD response from %s",path.Data()));
+  //
+  AliCDBEntry *entry = 0;
+  delete resp;
+  resp = 0;
+  //
+  while(1) {
+    if (path.BeginsWith("path: ")) { // must load from OCDB
+      entry = GetCDBEntry(path.Data());
+      if (!entry) break;
+      resp = (AliITSresponseSDD*) entry->GetObject();
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      //      AliCDBManager::Instance()->UnloadFromCache(path); // don't want cached object, read new copy
+      //      delete cdbId;
+      //      delete entry;
+      break;
+    }
+    //
+    if (gSystem->AccessPathName(path.Data())) break;
+    TFile* precf = TFile::Open(path.Data());
+    if (precf->FindKey("AliITSresponseSDD")) resp = (AliITSresponseSDD*)precf->Get("AliITSresponseSDD");
+    else if (precf->FindKey("AliCDBEntry") && (entry=(AliCDBEntry*)precf->Get("AliCDBEntry"))) {
+      resp = (AliITSresponseSDD*) entry->GetObject();
+      if (resp && resp->InheritsFrom(AliITSresponseSDD::Class())) entry->SetObject(NULL);
+      else resp = 0;
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      delete entry;
+    }
+    //
+    precf->Close();
+    delete precf;
+    break;
+  } 
+  //
+  if (!resp) {AliError(Form("Failed to load SDD response from %s",path.Data())); return -1;}
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::LoadSDDVDrift(TString& path, TObjArray *&arr)
+{
+  // load VDrift object
+  if (path.IsNull()) return 0;
+  AliInfo(Form("Loading SDD VDrift from %s",path.Data()));
+  //
+  AliCDBEntry *entry = 0;
+  delete arr;
+  arr = 0;
+  while(1) {
+    if (path.BeginsWith("path: ")) { // must load from OCDB
+      entry = GetCDBEntry(path.Data());
+      if (!entry) break;
+      arr = (TObjArray*) entry->GetObject();
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      //      AliCDBManager::Instance()->UnloadFromCache(path); // don't want cached object, read new copy
+      //      delete cdbId;
+      //      delete entry;
+      break;
+    }
+    //
+    if (gSystem->AccessPathName(path.Data())) break;
+    TFile* precf = TFile::Open(path.Data());
+    if (precf->FindKey("TObjArray")) arr = (TObjArray*)precf->Get("TObjArray");
+    else if (precf->FindKey("AliCDBEntry") && (entry=(AliCDBEntry*)precf->Get("AliCDBEntry"))) {
+      arr = (TObjArray*) entry->GetObject();
+      if (arr && arr->InheritsFrom(TObjArray::Class())) entry->SetObject(NULL);
+      else arr = 0;
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      delete entry;
+    }
+    //
+    precf->Close();
+    delete precf;
+    break;
+  } 
+  //
+  if (!arr) {AliError(Form("Failed to load SDD vdrift from %s",path.Data())); return -1;}
+  arr->SetOwner(kTRUE);
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::LoadSDDCorrMap(TString& path, AliITSCorrectSDDPoints *&map)
+{
+  // Load SDD correction map
+  //
+  if (path.IsNull()) return 0;
+  AliInfo(Form("Loading SDD Correction Maps from %s",path.Data()));
+  //
+  AliCDBEntry *entry = 0;
+  delete map;
+  map = 0;
+  TObjArray* arr = 0;
+  while(1) {
+    if (path.BeginsWith("path: ")) { // must load from OCDB
+      entry = GetCDBEntry(path.Data());
+      if (!entry) break;
+      arr = (TObjArray*) entry->GetObject();
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      //      AliCDBManager::Instance()->UnloadFromCache(path); // don't want cached object, read new copy
+      //      delete cdbId;
+      //      delete entry;
+      break;
+    }
+    //
+    if (gSystem->AccessPathName(path.Data())) break;
+    TFile* precf = TFile::Open(path.Data());
+    if (precf->FindKey("TObjArray")) arr = (TObjArray*)precf->Get("TObjArray");
+    else if (precf->FindKey("AliCDBEntry") && (entry=(AliCDBEntry*)precf->Get("AliCDBEntry"))) {
+      arr = (TObjArray*) entry->GetObject();
+      if (arr && arr->InheritsFrom(TObjArray::Class())) entry->SetObject(NULL);
+      else arr = 0;
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      delete entry;
+    }
+    //
+    precf->Close();
+    delete precf;
+    break;
+  } 
+  //
+  if (!arr) {AliError(Form("Failed to load SDD Correction Map from %s",path.Data())); return -1;}
+  arr->SetOwner(kTRUE);
+  map = new AliITSCorrectSDDPoints(arr);
+  
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::LoadDiamond(TString& path)
+{
+  // load vertex constraint
+  if (path.IsNull()) return 0;
+  AliInfo(Form("Loading Diamond Constraint from %s",path.Data()));
+  //
+  AliCDBEntry *entry = 0;
+  AliESDVertex *vtx = 0;
+  while(1) {
+    if (path.BeginsWith("path: ")) { // must load from OCDB
+      entry = GetCDBEntry(path.Data());
+      if (!entry) break;
+      vtx = (AliESDVertex*) entry->GetObject();
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      //      AliCDBManager::Instance()->UnloadFromCache(path); // don't want cached object, read new copy
+      //      delete cdbId;
+      //      delete entry;
+      break;
+    }
+    //
+    if (gSystem->AccessPathName(path.Data())) break;
+    TFile* precf = TFile::Open(path.Data());
+    if (precf->FindKey("AliESDVertex")) vtx = (AliESDVertex*)precf->Get("AliESDVertex");
+    else if (precf->FindKey("AliCDBEntry") && (entry=(AliCDBEntry*)precf->Get("AliCDBEntry"))) {
+      vtx = (AliESDVertex*) entry->GetObject();
+      if (vtx && vtx->InheritsFrom(AliESDVertex::Class())) entry->SetObject(NULL);
+      else vtx = 0;
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      delete entry;
+    }
+    //
+    precf->Close();
+    delete precf;
+    break;
+  } 
+  //
+  if (!vtx) {AliError(Form("Failed to load Diamond constraint from %s",path.Data())); return -1;}
+  //
+  double vtxXYZ[3];
+  vtx->GetXYZ(vtxXYZ);
+  for (int i=3;i--;) vtxXYZ[i] -= fCorrDiamond[i];
+  vtx->SetXYZ(vtxXYZ);
+  SetVertexConstraint(vtx);
+  AliInfo("Will use following Diamond Constraint (errors inverted):");
+  fDiamondI.Print("");
+  delete vtx;
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::LoadDeltas(TString& path, TClonesArray *&arr)
+{
+  // load ITS geom deltas
+  if (path.IsNull()) return 0;
+  AliInfo(Form("Loading Alignment Deltas from %s",path.Data()));
+  //
+  AliCDBEntry *entry = 0;
+  delete arr;
+  arr = 0;
+  while(1) {
+    if (path.BeginsWith("path: ")) { // must load from OCDB
+      entry = GetCDBEntry(path.Data());
+      if (!entry) break;
+      arr = (TClonesArray*) entry->GetObject();
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      //      AliCDBManager::Instance()->UnloadFromCache(path); // don't want cached object, read new copy
+      //      delete cdbId;
+      //      delete entry;
+      break;
+    }
+    //
+    if (gSystem->AccessPathName(path.Data())) break;
+    TFile* precf = TFile::Open(path.Data());
+    if (precf->FindKey("ITSAlignObjs")) arr = (TClonesArray*)precf->Get("ITSAlignObjs");
+    else if (precf->FindKey("AliCDBEntry") && (entry=(AliCDBEntry*)precf->Get("AliCDBEntry"))) {
+      arr = (TClonesArray*) entry->GetObject();
+      if (arr && arr->InheritsFrom(TClonesArray::Class())) entry->SetObject(NULL);
+      else arr = 0;
+      entry->SetObject(NULL);
+      entry->SetOwner(kTRUE);
+      delete entry;
+    }
+    precf->Close();
+    delete precf;
+    break;
+  } 
+  //
+  if (!arr) {AliError(Form("Failed to load Deltas from %s",path.Data())); return -1;}
+  //
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::CacheMatricesCurr()
+{
+  // build arrays for the fast access to sensor matrices from their sensor ID
+  //
+  TGeoHMatrix mdel;
+  AliInfo("Building sensors current matrices cache");
+  //
+  fCacheMatrixCurr.Delete();
+  for (int idx=0;idx<=kMaxITSSensID;idx++) {
+    int volID = AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(idx);
+    TGeoHMatrix *mcurr = new TGeoHMatrix();
+    AliITSAlignMille2Module::SensVolMatrix(volID, mcurr);
+    fCacheMatrixCurr.AddAtAndExpand(mcurr,idx);
+    //
+  }
+  //
+  TGeoHMatrix *mcurr = new TGeoHMatrix();
+  fCacheMatrixCurr.AddAtAndExpand(mcurr,kVtxSensID); // special unit matrix for diamond constraint
+  //
+  fCacheMatrixCurr.SetOwner(kTRUE);
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::CacheMatricesOrig()
+{
+  // build arrays for the fast access to sensor original matrices (used for production)
+  //
+  TGeoHMatrix mdel;
+  AliInfo("Building sensors original matrices cache");
+  //
+  /*if (fIniGeomPath!=fGeometryPath)*/ if (LoadGeometry(fIniGeomPath)) {AliInfo("Failed to re-load ideal geometry");exit(1);}
+  //
+  fCacheMatrixOrig.Delete();
+  if (!fIniDeltaPath.IsNull()) {
+    TClonesArray* prealSav = fPrealignment;
+    fPrealignment = 0;
+    if (LoadDeltas(fIniDeltaPath,fPrealignment) || ApplyToGeometry()) 
+      { AliError("Failed to load/apply initial deltas used to produce points"); return -1;}
+    delete fPrealignment; 
+    fPrealignment = prealSav; 
+  }
+  //
+  for (int idx=0;idx<=kMaxITSSensID;idx++) {
+    int volID = AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromIndex(idx);
+    TGeoHMatrix *morig = new TGeoHMatrix();
+    AliITSAlignMille2Module::SensVolMatrix(volID,morig);
+    fCacheMatrixOrig.AddAtAndExpand(morig,idx);
+  }
+  //
+  if (fConvertPreDeltas) { 
+    // in order to convert deltas from old to new geometry we need the final matrices for all alignable objects
+    int nmat = fGeoManager->GetNAlignable();
+    fConvAlgMatOld.Delete();
+    int nmatSel = 0;
+    for (int i=0;i<nmat;i++) {
+      TString nm = fGeoManager->GetAlignableEntry(i)->GetName();
+      if (!nm.BeginsWith("ITS")) continue;
+      TGeoHMatrix *mo = new TGeoHMatrix();
+      (*mo) = *(AliGeomManager::GetMatrix(nm));
+      fConvAlgMatOld.AddAtAndExpand(mo,nmatSel++);
+      mo->SetTitle(nm);
+      mo->SetName(nm);
+    }
+    ConvSortHierarchically(fConvAlgMatOld);
+  }
+  //
+  TGeoHMatrix *mcurr = new TGeoHMatrix();
+  fCacheMatrixOrig.AddAtAndExpand(mcurr,kVtxSensID); // special unit matrix for diamond constraint
+  //
+  fCacheMatrixOrig.SetOwner(kTRUE);
+
+  fUsePreAlignment = 0; 
+  LoadGeometry(fGeometryPath);   // reload target geometry
+  //
+  return 0;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::RemoveHelixFitConstraint()
+{
+  // suppress constraint
+  fConstrCharge = 0;
+  fConstrPT = fConstrPTErr = -1;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConstrainHelixFitPT(Int_t q,Double_t pt,Double_t pterr)
+{
+  // constrain q and pT of the helical fit of the track (should be set before process.track)
+  //
+  fConstrCharge = q==0 ? q:TMath::Sign(1,q);
+  fConstrPT = pt;
+  fConstrPTErr = pterr;
+  fCurvFitWasConstrained = kTRUE;
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConstrainHelixFitCurv(Int_t q,Double_t crv,Double_t crverr)
+{
+  // constrain charge and curvature of the helical fit of the track (should be set before process.track)
+  //
+  const double kCQConv = 0.299792458e-3;// R = PT/Bz/fgkCQConv with GeV,kGauss,cm
+  
+  fConstrCharge = q==0 ? q:TMath::Sign(1,q);
+  if (crv<0 || IsZero(crv)) {
+    fConstrPT    = -1;
+    fConstrPTErr = -1;
+    fCurvFitWasConstrained = kFALSE;
+  }
+  else {
+    fConstrPT    = TMath::Abs(1./crv*fBField*kCQConv);
+    fConstrPTErr = crverr>1e-10 ? TMath::Abs(fConstrPT/crv*crverr) : 0.;
+    fCurvFitWasConstrained = kTRUE;
+  }
+}
+
+//________________________________________________________________________________________________________
+TClonesArray* AliITSAlignMille2::CreateDeltas()
+{
+  // Create \Deltas for every explicitly or implicitly (via non-alignable volumes) varied
+  // or prealigned module.
+  // If the module has inded J in the hierarchy of alignable volumes (0 - the top, most 
+  // coarse level), then its Delta is expressed via MP2 \deltas (in global frame) and 
+  // prealignment \DeltaP's as:
+  // \Delta_J = Y X Y^-1
+  // where X = \delta_J * \DeltaP_J
+  // Y = Prod_{K=0,J-1} \delta_K
+  // Note that \delta_L accounts not only for its own correction but also of all non-alignable
+  // modules in the hierarchy chain from L up to the closest alignable: 
+  // while (parent && !parent->IsAlignable()) {
+  //   \delta_L->MultiplyLeft( \delta_parent ); 
+  //   parent = parent->GetParent();
+  // }
+  //  
+  Bool_t convLoc = kFALSE;
+  if (!GetUseGlobalDelta()) {
+    ConvertParamsToGlobal();
+    convLoc = kTRUE;
+  }
+  //
+  AliAlignObjParams tempAlignObj;
+  TGeoHMatrix tempMatX,tempMatY,tempMat1;
+  //
+  TClonesArray *array = new TClonesArray("AliAlignObjParams",10);
+  TClonesArray &alobj = *array;
+  int idx = 0;
+  //
+  TGeoManager* geoManager = AliGeomManager::GetGeometry();  
+  int nalgtot = geoManager->GetNAlignable();
+  //
+  for (int ialg=0;ialg<nalgtot;ialg++) {             // loop over all alignable entries
+    //
+    const char* algname = geoManager->GetAlignableEntry(ialg)->GetName();
+    //
+    AliITSAlignMille2Module* md     = GetMilleModuleBySymName(algname); // explicitly varied?
+    AliITSAlignMille2Module* parent = md ? md->GetParent(): GetMilleModuleIfContained(algname);
+    if (md && parent) {
+      TString mdName = md->GetName();
+      TString prName = parent->GetName();
+      // SPD Sector -> Layer parentship is fake, need special treatment
+      if ( mdName.CountChar('/')==2 && mdName.BeginsWith("ITS/SPD") && // SPD sector
+          prName.CountChar('/')==1 && mdName.BeginsWith("ITS/SPD") )  // SPD Layer
+       parent = parent->GetParent();//: GetMilleModuleIfContained(prName.Data());
+    }
+    //
+    AliAlignObjParams*       preob  = GetPrealignedObject(algname);  // was it prealigned ?
+    //
+    if (!preob && !md && (!parent || parent->IsAlignable())) continue; // noting to do 
+    //
+    // create matrix X (see comment) ------------------------------------------------->>>
+    // start from unity matrix
+    tempMatX.Clear();
+    if (preob) {   // account prealigngment
+      preob->GetMatrix(tempMat1);
+      tempMatX.MultiplyLeft(&tempMat1);
+    }
+    //
+    if (md) {
+      tempAlignObj.SetTranslation( md->GetParVal(0),md->GetParVal(1),md->GetParVal(2));
+      tempAlignObj.SetRotation(    md->GetParVal(3),md->GetParVal(4),md->GetParVal(5));
+      tempAlignObj.GetMatrix(tempMat1);
+      tempMatX.MultiplyLeft(&tempMat1);  // acount correction to varied module
+    }
+    //
+    // the corrections to all non-alignable modules from current on 
+    // till first alignable should add up to its matrix
+    while (parent && !parent->IsAlignable()) {
+      tempAlignObj.SetTranslation( parent->GetParVal(0),parent->GetParVal(1),parent->GetParVal(2));
+      tempAlignObj.SetRotation(    parent->GetParVal(3),parent->GetParVal(4),parent->GetParVal(5));
+      tempAlignObj.GetMatrix(tempMat1);
+      tempMatX.MultiplyLeft(&tempMat1);  // add matrix of non-alignable module
+      parent = parent->GetParent();
+    } 
+    // create matrix X (see comment) ------------------------------------------------<<<
+    //
+    // create matrix Y (see comment) ------------------------------------------------>>>
+    // start from unity matrix
+    tempMatY.Clear(); 
+    while ( parent ) {
+      tempAlignObj.SetTranslation( parent->GetParVal(0),parent->GetParVal(1),parent->GetParVal(2));
+      tempAlignObj.SetRotation(    parent->GetParVal(3),parent->GetParVal(4),parent->GetParVal(5));
+      tempAlignObj.GetMatrix(tempMat1);
+      tempMatY.MultiplyLeft(&tempMat1); 
+      parent = parent->GetParent();
+    }
+    // create matrix Y (see comment) ------------------------------------------------<<<
+    //
+    tempMatX.MultiplyLeft(&tempMatY);
+    tempMatX.Multiply(&tempMatY.Inverse());
+    //
+    if (tempMatX.IsIdentity()) continue; // do not store dummy matrices
+    UShort_t vid = AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromSymname(algname);
+    new(alobj[idx++]) AliAlignObjParams(algname,vid,tempMatX,kTRUE);
+    //
+  }
+  //
+  if (convLoc) ConvertParamsToLocal();
+  //
+  return array;
+  //
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+AliITSresponseSDD* AliITSAlignMille2::CreateSDDResponse()
+{
+  // create object with SDD repsonse (t0 and vdrift corrections) accounting for 
+  // eventual precalibration
+  //
+  // if there was a precalibration provided, copy it to new arrray
+  AliITSresponseSDD *precal = GetSDDPrecalResp();
+  if (!precal && fIniVDriftSDD)       precal = GetSDDInitResp();    // InitResp is used only when IniVDrift is provided
+  Bool_t isPreCalMult = precal&&precal->IsVDCorrMult() ? kTRUE : kFALSE; 
+  AliITSresponseSDD *calibSDD = new AliITSresponseSDD();
+  calibSDD->SetVDCorrMult(fIsSDDVDriftMult);
+  //
+  // copy initial values to the new object
+  if (precal) {
+    calibSDD->SetTimeOffset(precal->GetTimeOffset());
+    calibSDD->SetADC2keV(precal->GetADC2keV());
+    calibSDD->SetChargevsTime(precal->GetChargevsTime());
+    for (int ind=kSDDoffsID;ind<kSDDoffsID+kNSDDmod;ind++) {
+      calibSDD->SetModuleTimeZero(ind, precal->GetTimeZero(ind));
+      calibSDD->SetDeltaVDrift(ind, precal->GetDeltaVDrift(ind,kFALSE),kFALSE); // left
+      calibSDD->SetDeltaVDrift(ind, precal->GetDeltaVDrift(ind,kTRUE ),kTRUE);  // right
+      calibSDD->SetADCtokeV(ind,precal->GetADCtokeV(ind));
+    }
+  }
+  else for (int ind=kSDDoffsID;ind<kSDDoffsID+kNSDDmod;ind++) calibSDD->SetModuleTimeZero(ind,0);
+  //
+  Bool_t save = kFALSE;
+  for (int imd=GetNModules();imd--;) {
+    AliITSAlignMille2Module* md = GetMilleModule(imd);
+    if (!md->IsSDD()) continue;
+    if (md->IsFreeDOF(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0)  ||
+       md->IsFreeDOF(AliITSAlignMille2Module::kDOFDVL) ||
+       md->IsFreeDOF(AliITSAlignMille2Module::kDOFDVR)) save = kTRUE;
+       //
+    for (int is=0;is<md->GetNSensitiveVolumes();is++) {
+      int ind  = md->GetSensVolIndex(is);
+      float t0  = calibSDD->GetTimeZero(ind)      + md->GetParVal(AliITSAlignMille2Module::kDOFT0);
+      double dvL = md->GetParVal(AliITSAlignMille2Module::kDOFDVL);
+      double dvR = md->GetParVal(AliITSAlignMille2Module::kDOFDVR);
+      if (!calibSDD->IsVDCorrMult()) { // save as additive correction
+       dvL *= 1e4;
+       dvR *= 1e4;
+       //
+       double conv = 1;
+       if (isPreCalMult) conv = 6.4; // convert multiplicative precal correction to additive
+       dvL += calibSDD->GetDeltaVDrift(ind,kFALSE)*conv;
+       dvR += calibSDD->GetDeltaVDrift(ind,kTRUE)*conv;
+      }
+      else { // save as multipicative correction
+       double conv = 1;
+       if (!isPreCalMult) conv = 1./6.4; // convert additive precal correction to multiplicative
+       dvL += calibSDD->GetDeltaVDrift(ind,kFALSE)*conv;
+       dvR += calibSDD->GetDeltaVDrift(ind,kTRUE)*conv;
+      }
+      //
+      calibSDD->SetModuleTimeZero(ind, t0);
+      calibSDD->SetDeltaVDrift(ind, dvL, kFALSE); // left  side correction
+      calibSDD->SetDeltaVDrift(ind, dvR, kTRUE); // right side correction
+    }
+  }
+  //
+  if (!save) {
+    AliInfo("No free parameters for SDD calibration, nothing to save");
+    delete calibSDD;
+    calibSDD = 0;
+  }
+  //
+  return calibSDD;  
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::ReloadInitCalib(TList *userInfo)
+{
+  // Use provided UserInfo to
+  // load the initial calib parameters (geometry, SDD response...)
+  // Can be used if set of data was processed with different calibration
+  //
+  if (!userInfo) {
+    AliInfo("Reloading of the Calibration parameters was called with empty userInfo");
+    return 1;
+  }
+  if (ProcessUserInfo(userInfo)) {
+    AliInfo("Error in processing user info");
+    userInfo->Print();
+    exit(1);
+  }
+  return ReloadInitCalib();
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+Int_t AliITSAlignMille2::ReloadInitCalib()
+{
+  // Load the initial calib parameters (geometry, SDD response...)
+  // Can be used if set of data was processed with different calibration
+  //
+  // 1st cache original matrices
+  if (!(TestBit(kSameInitDeltasBit) && TestBit(kSameInitGeomBit))) { // need to reload geometry
+    //
+    if (CacheMatricesOrig()) {
+      AliInfo("Failed to cache new initial geometry");
+      exit(1);
+    }
+    // RS : commented because we don't need to reload prealignment deltas, they are already loaded
+    // then reload the prealignment geometry 
+    //    if (LoadDeltas(fPreDeltaPath,fPrealignment)) {
+    //      AliInfo(Form("Failed to reload the prealigned geometry %s",fPreDeltaPath.Data()));
+    //      exit(1);
+    //    }
+    //
+    if (fPrealignment && ApplyToGeometry()) {
+      AliInfo(Form("Failed re-apply prealigned geometry %s",fPreDeltaPath.Data()));
+      exit(1);
+    }
+    //
+    // usually no need to re-cache the prealignment geometry, it was not changed
+    if (fCacheMatrixCurr.GetEntriesFast() != fCacheMatrixOrig.GetEntriesFast()) {
+      //      CacheMatricesCurr();
+      AliInfo(Form("Failed to cache the prealigned geometry %s",fPreDeltaPath.Data()));
+      exit(1);
+    }
+  }
+  else ResetBit(kSameInitDeltasBit);
+  //
+  // reload initial SDD response
+  if (!TestBit(kSameInitSDDRespBit)) {
+    if (LoadSDDResponse(fIniSDDRespPath, fIniRespSDD) ) {
+      AliInfo(Form("Failed to load new SDD response %s",fIniSDDRespPath.Data()));
+      exit(1);
+    }
+  }
+  else ResetBit(kSameInitSDDRespBit);
+  //
+  // reload initial SDD vdrift
+  if (!TestBit(kSameInitSDDVDriftBit)) {
+    if (LoadSDDVDrift(fIniSDDVDriftPath, fIniVDriftSDD) ) {
+      AliInfo(Form("Failed to load new SDD VDrift %s",fIniSDDVDriftPath.Data()));
+      exit(1);
+    }
+  }
+  else ResetBit(kSameInitSDDRespBit);
+  //
+  // reload SDD corr.map
+  if (!TestBit(kSameInitSDDCorrMapBit)) {
+    if (LoadSDDCorrMap(fIniSDDCorrMapPath, fIniCorrMapSDD) ) {
+      AliInfo(Form("Failed to load new SDD Correction Map %s",fIniSDDCorrMapPath.Data()));
+      exit(1);
+    }
+  }
+  else ResetBit(kSameInitSDDRespBit);
+  //
+  // reload diamond info
+  if (!TestBit(kSameDiamondBit)) {
+    if (LoadDiamond(fDiamondPath) ) {
+      AliInfo(Form("Failed to load new Diamond constraint %s",fDiamondPath.Data()));
+      exit(1);
+    }
+  }
+  else ResetBit(kSameInitSDDRespBit);
+  //
+  return 0;
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::JacobianPosGloLoc(int locid,double* jacobian)
+{
+  // calculate the locid row of the jacobian for transformation of the local coordinate to global at current point
+  TGeoHMatrix* mat = GetSensorCurrMatrixSID(fCurrentSensID);
+  const Double_t dpar = 1e-2;
+  double sav = fMeasLoc[locid];
+  fMeasLoc[locid] += dpar;
+  mat->LocalToMaster(fMeasLoc,jacobian);
+  fMeasLoc[locid] = sav; // recover original value
+  for (int i=3;i--;) jacobian[i] = (jacobian[i]-fMeasGlo[i])/dpar; // the transformation is linear!!!
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::TieSDDVDriftsLR(AliITSAlignMille2Module* mod)
+{
+  // impose equality of Left/Right sides VDrift correction for SDD
+  ResetLocalEquation();
+  if ( (mod->IsFreeDOF(AliITSAlignMille2Module::kDOFDVL) + mod->IsFreeDOF(AliITSAlignMille2Module::kDOFDVR))==1) {
+    AliError("Left/Right VDrift equality is requested for SDD module with only one side VDrift free");
+    mod->Print();
+    return;
+  }
+  if (mod->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFDVL)>=0) SetGlobalDerivative(mod->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFDVL),  1.);
+  if (mod->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFDVR)>=0) SetGlobalDerivative(mod->GetParOffset(AliITSAlignMille2Module::kDOFDVR), -1.);
+  AddConstraint(fGlobalDerivatives, 0, 1e-12);
+  //
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ProcessSDDPointInfo(const AliTrackPoint* pnt,Int_t sID, Int_t pntID)
+{
+  // extract the drift information from SDD track point
+  //
+  fDriftTime0[pntID] = fIniRespSDD ? fIniRespSDD->GetTimeZero(sID) : 0.;
+  double tdif = pnt->GetDriftTime() - fDriftTime0[pntID];
+  if (tdif<0) tdif = 1;
+  //
+  // VDrift extraction
+  double vdrift=0,vdrift0=0;
+  Bool_t sddSide = kFALSE;
+  int sID0 = 2*(sID-kSDDoffsID);
+  double zanode = -999;
+  //
+  if (fIniVDriftSDD) { // SDD VDrift object is provided, use the vdrift from it
+    AliITSDriftSpeedArraySDD* drarr;
+    double vdR,vdL,xlR,xlL;
+    // sometimes xlocal on right side is negative due to the wrong calibration, need to test both hypothesis
+    double xlabs = TMath::Abs(fMeasLoc[kX]); 
+    drarr  = (AliITSDriftSpeedArraySDD*)fIniVDriftSDD->At(sID0); // left side, xloc>0
+    zanode = fSegmentationSDD->GetAnodeFromLocal(xlabs,fMeasLoc[kZ]);
+    vdL    = drarr->GetDriftSpeed(0, zanode);
+    if (fIniRespSDD) {
+      double corr = fIniRespSDD->GetDeltaVDrift(sID, kFALSE);
+      if (fIniRespSDD->IsVDCorrMult()) vdL *= (1+corr);
+      else vdL += corr;
+    }
+    xlL    = (fSegmentationSDD->Dx() - vdL*tdif)*1e-4;
+    //
+    drarr  = (AliITSDriftSpeedArraySDD*)fIniVDriftSDD->At(sID0+1); // right side, xloc<0
+    zanode = fSegmentationSDD->GetAnodeFromLocal(-xlabs,fMeasLoc[kZ]) - 256;
+    vdR    = drarr->GetDriftSpeed(0, zanode);
+    if (fIniRespSDD) {
+      double corr = fIniRespSDD->GetDeltaVDrift(sID, kTRUE);
+      if (fIniRespSDD->IsVDCorrMult()) vdR *= (1+corr);
+      else vdR += corr;
+    }
+    xlR    = -(fSegmentationSDD->Dx() - vdR*tdif)*1e-4;
+    //
+    if (TMath::Abs(xlL-fMeasLoc[kX])<TMath::Abs(xlR-fMeasLoc[kX])) {
+      sddSide = 0; // left side
+      vdrift  = vdL*1e-4;
+    }
+    else {         // right side
+      sddSide = 1;
+      vdrift  = vdR*1e-4;
+    }
+    //
+  }
+  else { // try to determine the vdrift from the xloc
+    vdrift = (fSegmentationSDD->Dx()*1e-4 - TMath::Abs(fMeasLoc[kX]))/tdif;
+    sddSide = fMeasLoc[kX]<0; // 0 = left (xloc>0) ; 1 = right (xloc<1)
+  }
+  //
+  if (fPreVDriftSDD) { // use imposed vdrift as a starting point
+    zanode = fSegmentationSDD->GetAnodeFromLocal(0.5-sddSide,fMeasLoc[kZ]);
+    if (sddSide) zanode -= 256;
+    vdrift = ((AliITSDriftSpeedArraySDD*)fPreVDriftSDD->At(sID0+sddSide))->GetDriftSpeed(0, zanode)*1e-4;
+  }
+  //
+  if (vdrift<0) vdrift = 0;
+  vdrift0 = vdrift;
+  // at this point we have vdrift and t0 used to create the original point.
+  // see if precalibration was provided
+  if (fPreRespSDD) {
+    float t0Upd = fPreRespSDD->GetTimeZero(sID);
+    double corr = fPreRespSDD->GetDeltaVDrift(sID, sddSide);
+    if (fPreRespSDD->IsVDCorrMult()) vdrift *= 1+corr; // right side (xloc<0) may have different correction
+    else                             vdrift += corr*1e-4;
+    //
+    // if IniRespSDD was used, it should be subtracted back, since it is accounted in the PreResp
+    if (fIniVDriftSDD&&fIniRespSDD) {
+      double corr1 = fIniRespSDD->GetDeltaVDrift(sID, sddSide);
+      if (fIniRespSDD->IsVDCorrMult()) vdrift *= (1-corr1);
+      else vdrift -= corr1*1e-4;
+    }
+    tdif    = pnt->GetDriftTime() - t0Upd;
+    // correct Xlocal
+    fMeasLoc[0] = fSegmentationSDD->Dx()*1e-4 - vdrift*tdif;
+    if (sddSide) fMeasLoc[0] = -fMeasLoc[0];
+    fDriftTime0[pntID] =  t0Upd;
+  }
+  //
+  if (fPreCorrMapSDD) { // apply correction map
+    fMeasLoc[0] += fPreCorrMapSDD->GetCorrection(sID,fMeasLoc[2],fMeasLoc[0]);
+  }
+
+  // TEMPORARY CORRECTION (if provided) --------------<<<
+  fDriftSpeed[pntID]  = sddSide ? -vdrift  : vdrift;
+  fDriftSpeed0[pntID] = sddSide ? -vdrift0 : vdrift0;
+  //
+  //  printf("#%d: t:%+e x:%+e v:%+e: side:%d\n",pntID,fDriftTime0[pntID],fMeasLoc[0],fDriftSpeed[pntID],sddSide);
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+AliITSAlignMille2Module* AliITSAlignMille2::CreateVertexModule()
+{
+  // creates dummy module for vertex constraint
+  TGeoHMatrix mt;
+  AliITSAlignMille2Module* mod = new AliITSAlignMille2Module(kVtxSensID,kVtxSensVID,"VTX",&mt,0,0);
+  fMilleModule.AddAtAndExpand(mod,fNModules);
+  mod->SetGeomParamsGlobal(fUseGlobalDelta);
+  fDiamondModID = fNModules;
+  mod->SetUniqueID(fNModules++);
+  mod->SetNotInConf(kTRUE);
+  return mod;
+  //
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+AliCDBEntry* AliITSAlignMille2::GetCDBEntry(const char* path)
+{
+  // return object from the OCDB
+  AliCDBEntry *entry = 0;
+  AliInfo(Form("Loading object %s",path));
+  AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
+  AliCDBId* cdbId = AliCDBId::MakeFromString(path);
+  if (!cdbId) {
+    AliError("Failed to create cdbId");
+    return 0;
+  }
+  //
+  AliCDBStorage* stor = man->GetDefaultStorage();
+  if (!stor && !man->GetRaw()) man->SetDefaultStorage("raw://");
+  if (man->GetRaw()) man->SetRun(fRunID>0 ? fRunID : cdbId->GetFirstRun());
+  if (stor) {
+    TString tp = stor->GetType();
+    if (tp.Contains("alien",TString::kIgnoreCase) && !gGrid) TGrid::Connect("alien:"); 
+  } 
+  entry = man->Get(cdbId->GetPath(),cdbId->GetFirstRun(),cdbId->GetVersion(),cdbId->GetSubVersion());
+  //  entry = man->Get( *cdbId );
+  man->ClearCache();
+  //
+  delete cdbId;
+  return entry;
+  //
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::SetVertexConstraint(const AliESDVertex* vtx)
+{
+  // set vertex for constraint
+  if (!vtx) return;
+  //
+  double cmat[6];
+  float cmatF[6];
+  vtx->GetCovMatrix(cmat);
+  AliITSAlignMille2Module* diamMod = GetMilleModuleByVID(kVtxSensVID);
+  if (diamMod) {
+    cmat[0] *= diamMod->GetSigmaXFactor()*diamMod->GetSigmaXFactor();
+    cmat[2] *= diamMod->GetSigmaYFactor()*diamMod->GetSigmaYFactor();
+    cmat[5] *= diamMod->GetSigmaZFactor()*diamMod->GetSigmaZFactor();
+    cmat[1] *= diamMod->GetSigmaXFactor()*diamMod->GetSigmaYFactor();
+    cmat[3] *= diamMod->GetSigmaXFactor()*diamMod->GetSigmaZFactor();
+    cmat[4] *= diamMod->GetSigmaYFactor()*diamMod->GetSigmaZFactor();
+  }
+  cmatF[0] = cmat[0]; // xx
+  cmatF[1] = cmat[1]; // xy
+  cmatF[2] = cmat[3]; // xz
+  cmatF[3] = cmat[2]; // yy
+  cmatF[4] = cmat[4]; // yz
+  cmatF[5] = cmat[5]; // zz
+
+  fDiamond.SetXYZ(vtx->GetX(),vtx->GetY(),vtx->GetZ(), cmatF);
+  //
+  Double_t t0 = cmat[2]*cmat[5] - cmat[4]*cmat[4];
+  Double_t t1 = cmat[1]*cmat[5] - cmat[3]*cmat[4];
+  Double_t t2 = cmat[1]*cmat[4] - cmat[2]*cmat[3];
+  Double_t det = cmat[0]*t0 - cmat[1]*t1 + cmat[3]*t2;
+  if (TMath::Abs(det)<1e-36) {
+    vtx->Print();
+    AliFatal("Vertex constraint cov.matrix is singular");
+  }
+  cmatF[0] =  t0/det;
+  cmatF[1] = -t1/det;
+  cmatF[2] =  t2/det;
+  cmatF[3] =  (cmat[0]*cmat[5] - cmat[3]*cmat[3])/det;
+  cmatF[4] =  (cmat[1]*cmat[3] - cmat[0]*cmat[4])/det;
+  cmatF[5] =  (cmat[0]*cmat[2] - cmat[1]*cmat[1])/det;
+  fDiamondI.SetXYZ(vtx->GetX(),vtx->GetY(),vtx->GetZ(), cmatF);
+  fVertexSet = kTRUE;
+  //
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConvertDeltas()
+{
+  // convert prealignment deltas from old geometry to new one
+  // NOTE: the target geometry must be loaded at time this method is called
+  //
+  // NOTE: This method can be ONLY used when as a prealignment deltas those used for the production
+  // of trackpoints (e.g. extracted from the UserInfo).
+  // The prealignment deltas provided by user via config file must be already converted to target geometry:
+  // this can be done externally using the macro ConvertDeltas.C
+  //
+  // delta_j_new = delta_j_old * Xj_old * Xj_new^-1
+  // where X = Prod{delta_i,i=j-1:0} M_j
+  // with j - the level of the alignable volume in the hierarchy, M - corresponding ideal matrix
+  // Note that delta_j * Xj is equal to final (misaligned) matrix of corresponding geometry, G_j.
+  // Since this method is used ONLY in the case where the prealignment deltas are equal to production deltas,
+  // we have already loaded G_j_old in the fConvAlgMatOld (filled in the CacheMatricesOrig) 
+  // Hence, delta_j_new = G_j_old * Xj_new^-1
+  //
+  AliInfo("Converting deltas from initial to target geometry");
+  int nMatOld = fConvAlgMatOld.GetEntriesFast(); // number of alignable matrices
+  TClonesArray* deltArrNew = new TClonesArray("AliAlignObjParams",10);
+  //
+  TGeoHMatrix dmPar;
+  int nDelNew = 0;
+  //
+  for (int im=0;im<nMatOld;im++) {
+    TGeoHMatrix* mtGjold = (TGeoHMatrix*)fConvAlgMatOld[im];
+    TString algname = mtGjold->GetTitle();
+    UShort_t vID = AliITSAlignMille2Module::GetVolumeIDFromSymname(algname.Data());
+    //
+    // build X_new >>>
+    TGeoHMatrix* parent = mtGjold;
+    TGeoHMatrix xNew;
+    int parID;
+    while ( (parID=parent->GetUniqueID()-1)>=0 ) {
+      parent = (TGeoHMatrix*)fConvAlgMatOld[parID];
+      AliAlignObjParams* deltaPar = ConvFindDelta(deltArrNew,parent->GetTitle());
+      if (deltaPar) deltaPar->GetMatrix(dmPar); xNew *= dmPar;
+    }
+    AliGeomManager::GetOrigGlobalMatrix(algname,dmPar); // ideal matrix of new geometry
+    xNew *= dmPar;
+    // build X_new <<<
+    //
+    dmPar  = *mtGjold; 
+    dmPar *= xNew.Inverse();
+    new((*deltArrNew)[nDelNew++]) AliAlignObjParams(algname.Data(),vID,dmPar,kTRUE);
+    //
+  }
+  delete fPrealignment;
+  fPrealignment = deltArrNew;
+  //
+  // we don't need anymore old matrices
+  fConvAlgMatOld.Delete();
+  //
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+void AliITSAlignMille2::ConvSortHierarchically(TObjArray& matArr)
+{
+  // Used only for the deltas conversion from one geometry to another
+  // Sort the matrices according to hiearachy (coarse -> fine)
+  //
+  int nmat = matArr.GetEntriesFast();
+  //
+  for (int i=0;i<nmat;i++) {
+    for (int j=i+1;j<nmat;j++) {
+      TGeoHMatrix* matI = (TGeoHMatrix*) matArr[i];
+      TGeoHMatrix* matJ = (TGeoHMatrix*) matArr[j];
+      if (ConvIsJParentOfI(matI,matJ)) { // swap
+       matArr[i] = matJ;
+       matArr[j] = matI;
+      }
+    }
+  }
+  //
+  // set direct parent id's in the UniqueID's
+  for (int i=nmat;i--;) {
+    TGeoHMatrix* matI = (TGeoHMatrix*) matArr[i];
+    matI->SetUniqueID(0);
+    for (int j=i;j--;) {
+      TGeoHMatrix* matJ = (TGeoHMatrix*) matArr[j];
+      if (ConvIsJParentOfI(matI,matJ)) { matI->SetUniqueID(j+1); break; }
+    }
+  }
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+Bool_t AliITSAlignMille2::ConvIsJParentOfI(const TGeoHMatrix* matI,const TGeoHMatrix* matJ) const
+{
+  // Used only for the deltas conversion from one geometry to another
+  // True if matJ is higher in hierarchy than 
+  // 
+  TString nmI = matI->GetTitle();
+  TString nmJ = matJ->GetTitle();
+  //
+  int nlrI = nmI.CountChar('/');
+  int nlrJ = nmJ.CountChar('/');
+  if (nlrJ>=nlrI) return kFALSE;
+  //
+  // special case of SPD sectors
+  if (nmI.BeginsWith("ITS/SPD1") && nmJ.BeginsWith("ITS/SPD0") && nlrJ==2) nmJ.ReplaceAll("SPD0","SPD1");
+  return (nmI.BeginsWith(nmJ)) ? kTRUE:kFALSE;
+  //
+}
+
+//_______________________________________________________________________________________
+AliAlignObjParams* AliITSAlignMille2::ConvFindDelta(const TClonesArray* arrDelta,const TString& algname) const
+{
+  // find the delta for given module
+  if (!arrDelta) return 0;
+  AliAlignObjParams* delta = 0;
+  int nDeltas = arrDelta->GetEntries();
+  for (int id=0;id<nDeltas;id++) {
+    delta = (AliAlignObjParams*)arrDelta->At(id);
+    if (algname==delta->GetSymName()) break;
+    delta = 0;
+  }
+  return delta;
+}
+