]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - ITS/AliITSClusterFinder.h
Fixes for report #68312: Improper usage of TClonesArrays in ITS
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSClusterFinder.h
index 5e4ac22b9e37e5d6aacb0d2e5ed2e07f5e29fe9a..db36088727cabb53af95c9707523865998454bca 100644 (file)
 
 ////////////////////////////////////////////////
 //  ITS Cluster Finder Class                  //
+//                                            //
+//                                            //
 ////////////////////////////////////////////////
 
 #include <TObject.h>
 #include <TClonesArray.h>
+#include "AliLog.h"
 
 class AliITSMap;
 class AliITSresponse;
 class AliITSsegmentation;
-class AliITSRawCluster;
-class AliITS;
 class AliITSdigit;
 class AliITSRecPoint;
+class AliITSDetTypeRec;
+class AliRawReader;
 
 //----------------------------------------------------------------------
 class AliITSClusterFinder :public TObject{
- public:
 public:
     AliITSClusterFinder(); // Default constructor
-    AliITSClusterFinder(AliITSsegmentation *seg, AliITSresponse *resp,
-                       TClonesArray *digits);// Standard Constructor
+    // Standard Constructor
+    AliITSClusterFinder(AliITSDetTypeRec* dettyp);
+    AliITSClusterFinder(AliITSDetTypeRec* dettyp,TClonesArray *digits);// Standard+ Constructor
     virtual ~AliITSClusterFinder(); // Destructor
-    AliITSClusterFinder(const AliITSClusterFinder &source); // copy constructor
-    // assignment operator
-    AliITSClusterFinder& operator=(const AliITSClusterFinder &source);
-    virtual void SetResponse(AliITSresponse *response) {// set response
-       fResponse=response;}
-    virtual void SetSegmentation(AliITSsegmentation *segmentation) {
-       // set segmentation
-       fSegmentation=segmentation;}
-    virtual void SetDigits(TClonesArray *ITSdigits) {// set digits
-       fDigits=ITSdigits;fNdigits = fDigits->GetEntriesFast();}
+    //
+    // Do the Reconstruction.
+    virtual void FindRawClusters(Int_t /*mod*/)=0; // Finds cluster of digits.
+    virtual void RawdataToClusters(AliRawReader* /*rawReader*/) {
+      AliError("Method not implemented in this class ");
+    }
+
+    // Digit
+    virtual void SetDigits(TClonesArray *itsDigits) {// set digits
+        fDigits=itsDigits;fNdigits = fDigits->GetEntriesFast();}
     virtual AliITSdigit* GetDigit(Int_t i){ // Returns ith digit
-       return (AliITSdigit*) fDigits->UncheckedAt(i);}
-    virtual TClonesArray* Digits(){ // Gets fDigits
-       return fDigits;}
-    virtual Int_t   NDigits() const {// Get Number of Digits
-       return fNdigits;}
-    // Standard Getters.
-    virtual AliITSresponse * GetResp(){// Returns fResponse
-       return fResponse;}
-    virtual AliITSsegmentation * GetSeg(){// Returns fSegmentation
-       return fSegmentation;}
-    virtual Int_t GetNRawClusters(){ // returns fNRawClusters
-       return fNRawClusters;}
-    AliITSMap   *Map() {// map
-       return fMap;}
-    virtual Int_t GetNperMax(){ // returns fNperMax
-       return fNperMax;}
-    virtual Int_t GetDeclusterFlag(){ // returns fDeclusterFlag
-       return fDeclusterFlag;}
-    virtual Int_t GetClusterSize(){ // returns fClusterSize
-       return fClusterSize;}
-    virtual Int_t GetNPeaks(){ // returns fNPeaks
-       return fNPeaks;}
+        return (AliITSdigit*) fDigits->UncheckedAt(i);}
+    virtual TClonesArray* Digits(){return fDigits;}// Gets fDigits
+    virtual Int_t   NDigits() const {return fNdigits;}// Get Number of Digits
+
+    // Set fClusters up
+    virtual void SetClusters(TClonesArray *itsClusters){// set clusters
+        fClusters = itsClusters;}
+    // Get fCluters
+    virtual TClonesArray* Clusters(){return fClusters;}
+    // Returns the present number of enteries
+    virtual Int_t NClusters()const {return fClusters->GetEntriesFast();}
+
+    virtual void SetModule(Int_t module){fModule = module;}// Set module number
+    virtual Int_t GetModule()const {return fModule;}// Returns module number
+
+    void SetEvent(Int_t event) { fEvent=event; }
+
+    // Others
+    virtual void  SetMap(AliITSMap *m) {fMap=m;}// map
+    AliITSMap* Map(){return fMap;}// map
+    virtual Int_t GetNPeaks() const {return fNPeaks;}// returns fNPeaks
     //
-    virtual void AddCluster(Int_t branch, AliITSRawCluster *c);
-    virtual void AddCluster(Int_t branch, AliITSRawCluster *c,
-                           AliITSRecPoint &rp);
-    virtual void FindRawClusters(Int_t mod=0); // Finds cluster of digits.
-    // Determins if digit i has a neighbor and if so that neighor index is j.
     virtual Bool_t IsNeighbor(TObjArray *digs,Int_t i,Int_t j[]) const;
-    // Given a cluster of digits, creates the nessesary RecPoint. May also
-    // do some peak separation.
-    virtual void CreateRecPoints(TObjArray *,Int_t){};
-    virtual void FindCluster(Int_t,Int_t,AliITSRawCluster *) {}// find cluster
-    virtual void Decluster(AliITSRawCluster *) {}// Decluster
-    virtual void SetNperMax(Int_t npermax=3) {
-       // Set max. Number of cells per local cluster
-       fNperMax = npermax;
-    }
-    virtual void SetDeclusterFlag(Int_t flag=1) {
-       // Decluster ?
-       fDeclusterFlag =flag;
-    }
-    virtual void SetClusterSize(Int_t clsize=3) {
-       // Set max. cluster size ; bigger clusters will be rejected
-       fClusterSize = clsize;
-    }
-    virtual void CalibrateCOG() {
-       // Self Calibration of COG 
-    }
-    virtual void CorrectCOG(){
-       // correct COG
-    }
-    virtual Bool_t Centered(AliITSRawCluster *) const {// cluster
-       return kTRUE;
-    }
-    virtual void SplitByLocalMaxima(AliITSRawCluster *){}//split by local maxima
-    virtual void   FillCluster(AliITSRawCluster *,Int_t) {}// fiil cluster
-    virtual void   FillCluster(AliITSRawCluster *cluster) {// fill cluster
-       FillCluster(cluster,1);
-    }
-    // set the fitting methods in the derived classes
-    // data members
-
-    TClonesArray       *fDigits;       //! digits
-    Int_t              fNdigits;       //! num of digits
-
- protected:
-    AliITSresponse     *fResponse;     //! response
-    AliITSsegmentation *fSegmentation; //!segmentation
-    Int_t              fNRawClusters;  //! in case we split the cluster
-                                       // and want to keep track of 
-                                       // the cluster which was splitted
-    AliITSMap          *fMap;          //! map
-    Int_t              fNperMax;       //! NperMax
-    Int_t              fDeclusterFlag; //! DeclusterFlag
-    Int_t              fClusterSize;   //! ClusterSize
-    Int_t              fNPeaks;        //! NPeaks  
+        // Set max. cluster size ; bigger clusters will be rejected
+
+    // IO functions
+    void Print(ostream *os) const; // Class ascii print function
+    void Read(istream *os);  // Class ascii read function
+    virtual void Print(Option_t *option="") const {TObject::Print(option);}
+    virtual Int_t Read(const char *name) {return TObject::Read(name);}
+
+    virtual void SetDetTypeRec(AliITSDetTypeRec* dtr) {fDetTypeRec=dtr;}
+    AliITSDetTypeRec* GetDetTypeRec() const {return fDetTypeRec;}
+
+    void InitGeometry(); 
+  protected:
+  class Ali1Dcluster {
+  public:
+    void SetY(Float_t y) {fY=y;}
+    void SetQ(Float_t q) {fQ=q;}
+    void SetNd(Int_t n)  {fNd=n;}
+    void SetLabels(Int_t *lab) {fLab[0]=lab[0];fLab[1]=lab[1];fLab[2]=lab[2];}
+    Float_t GetY() const {return fY;}
+    Float_t GetQ() const {return fQ;}
+    Int_t GetNd()const {return fNd;}
+    Int_t GetLabel(Int_t lab) const { return fLab[lab]; }
+  protected:
+    Float_t fY; //cluster position
+    Float_t fQ; //cluster charge
+    Int_t fNd;  //number of digits
+    Int_t fLab[3]; //track label
+  };
+  class AliBin {
+  public:
+    AliBin():fIndex(0),fMask(0xFFFFFFFE),fQ(0){}
+    void SetIndex(UInt_t idx) {fIndex=idx;}
+    void SetQ(UShort_t q)  {fQ=q;}
+    void SetMask(UInt_t m) {fMask=m;}
+    void Reset() {fIndex=0; fMask=0xFFFFFFFE; fQ=0;}
+
+    void Use() {fMask&=0xFFFFFFFE;}
+    Bool_t IsNotUsed() const {return (fMask&1);}
+    Bool_t IsUsed() const {return !(IsNotUsed());}
+
+    UInt_t   GetIndex() const {return fIndex;}
+    UShort_t GetQ()     const {return fQ;}
+    UInt_t   GetMask()  const {return fMask;}
+  protected:
+    UInt_t fIndex; //digit index
+    UInt_t fMask; //peak mask
+    UShort_t fQ;  //signal
+  };
+  void MakeCluster(Int_t k,Int_t max,AliBin *bins,UInt_t m,AliITSRecPoint &c);
+  static Bool_t IsMaximum(Int_t k, Int_t max, const AliBin *bins);
+  static void FindPeaks(Int_t k,Int_t m,AliBin*b,Int_t*idx,UInt_t*msk,Int_t&n);
+  static void MarkPeak(Int_t k, Int_t max, AliBin *bins, UInt_t m);
+  static void FindCluster(Int_t k,Int_t maxz,AliBin *bins,Int_t &n,Int_t *idx);
+
+  static void CheckLabels2(Int_t lab[10]);
+  static void AddLabel(Int_t lab[10], Int_t label);      
+
+  // data members      
+
+  Int_t              fModule;        //! Module number to be reconstuctted
+  TClonesArray       *fDigits;       //! digits 
+  Int_t              fNdigits;       //! num of digits 
+  
+  AliITSDetTypeRec* fDetTypeRec; //ITS object for reconstruction
+  TClonesArray       *fClusters;     //! Array of clusters
+  AliITSMap          *fMap;          //! map
+  Int_t              fNPeaks;        //! NPeaks  
+  // Data members needed to fill AliCluster objects
+  Int_t fNdet[2200];           // detector index  
+  Int_t fNlayer[2200];         // detector layer
   
-    ClassDef(AliITSClusterFinder,2) //Class for clustering and reconstruction of space points
+  Int_t fNModules;             // total number of modules    
+  Int_t fEvent;                //event number
+  Int_t fZmin;   // minimum channel in Zloc
+  Int_t fZmax;   // maximum channel in Zloc
+  Int_t fXmin;   // minimum channel in Xloc
+  Int_t fXmax;   // maximum channel in Xloc 
+  
+  AliITSClusterFinder(const AliITSClusterFinder &source); // copy constructor
+  // assignment operator
+  AliITSClusterFinder& operator=(const AliITSClusterFinder &source);
+  
+
+  ClassDef(AliITSClusterFinder,10) //Class for clustering and reconstruction of space points
 };
+// Input and output functions for standard C++ input/output.
+ostream &operator<<(ostream &os,AliITSClusterFinder &source);
+istream &operator>>(istream &os,AliITSClusterFinder &source);
 #endif