Stupid bug fix in new superlight mode (from Zurich airport)
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSFindClustersV2.C
index 3859326..e8cba5a 100644 (file)
-#ifndef __CINT__
-  #include <iostream.h>
-
-  #include "AliRun.h"
-  #include "AliITS.h"
-  #include "AliITSgeom.h"
-  #include "AliITSRecPoint.h"
-  #include "AliITSclusterV2.h"
-
-  #include "TFile.h"
-  #include "TTree.h"
-  #include "TParticle.h"
-#endif
+#if !defined(__CINT__) || defined(__MAKECINT__)
+
+#include <Riostream.h>
+#include <TROOT.h>
+#include <TString.h>
+#include "AliRawReader.h"
+#include "AliRawReaderDate.h"
+#include "AliRawReaderRoot.h"
+#include "AliRun.h"
+#include "AliRunLoader.h"
+#include "AliITSInitGeometry.h"
+#include "AliITSgeom.h"
+#include "AliITSLoader.h"
+#include "AliCDBManager.h"
+#include "AliITSDetTypeRec.h"
+#include "AliGeomManager.h"
 
-Int_t AliITSFindClustersV2(Char_t SlowOrFast='f') {
-/****************************************************************
- *  This macro converts AliITSRecPoint(s) to AliITSclusterV2(s) *
- ****************************************************************/
-   cerr<<"AliITSRecPoint(s) -> AliITSclusterV2(s)...\n";
-
-   if (gAlice) {delete gAlice; gAlice=0;}
-
-   TFile *in=TFile::Open("galice.root");
-   if (!in->IsOpen()) { cerr<<"Can't open galice.root !\n"; return 1; }
-
-   if (!(gAlice=(AliRun*)in->Get("gAlice"))) {
-      cerr<<"Can't find gAlice !\n";
-      return 2;
-   }
-   gAlice->GetEvent(0);
-
-   AliITS *ITS  = (AliITS*)gAlice->GetModule("ITS");
-   if (!ITS) { cerr<<"Can't find the ITS !\n"; return 3; }
-   AliITSgeom *geom=ITS->GetITSgeom();
-   TFile *out=TFile::Open("AliITSclustersV2.root","new");
-   if (!out->IsOpen()) {
-      cerr<<"Delete old AliITSclustersV2.root !\n"; 
-      return 4;
-   }
-   geom->Write();
-
-   TClonesArray *clusters=new TClonesArray("AliITSclusterV2",10000);
-   TTree *cTree=new TTree("TreeC_ITS_0","ITS clusters");
-   cTree->Branch("Clusters",&clusters);
-
-   TTree *pTree=gAlice->TreeR();
-   if (!pTree) { cerr<<"Can't get TreeR !\n"; return 5; }
-   TBranch *branch = 0;
-   if (SlowOrFast=='f') {
-     branch = pTree->GetBranch("ITSRecPointsF");
-   }
-   else {
-     branch = pTree->GetBranch("ITSRecPoints");
-   }
-   if (!branch) { cerr<<"Can't get ITSRecPoints branch !\n"; return 6; }
-   TClonesArray *points=new TClonesArray("AliITSRecPoint",10000);
-   branch->SetAddress(&points);
-
-   TClonesArray &cl=*clusters;
-   Int_t nclusters=0;
-   Int_t nentr=(Int_t)branch->GetEntries();
-
-   cerr<<"Number of entries: "<<nentr<<endl;
-
-   Float_t lp[5]; Int_t lab[6]; //Why can't it be inside a loop ?
-
-   for (Int_t i=0; i<nentr; i++) {
-       points->Clear();
-       branch->GetEvent(i);
-       Int_t ncl=points->GetEntriesFast(); if (ncl==0){cTree->Fill();continue;}
-       Int_t lay,lad,det; geom->GetModuleId(i,lay,lad,det);
-       Float_t x,y,zshift; geom->GetTrans(lay,lad,det,x,y,zshift); 
-       Double_t rot[9];    geom->GetRotMatrix(lay,lad,det,rot);
-       Double_t yshift = x*rot[0] + y*rot[1];
-       Int_t ndet=(lad-1)*geom->GetNdetectors(lay) + (det-1);
-       nclusters+=ncl;
-
-       Float_t kmip=1; // ADC->mip normalization factor for the SDD and SSD 
-       if(lay==4 || lay==3){kmip=280.;};
-       if(lay==6 || lay==5){kmip=38.;};
-
-       for (Int_t j=0; j<ncl; j++) {
-          AliITSRecPoint *p=(AliITSRecPoint*)points->UncheckedAt(j);
-          //Float_t lp[5];
-          lp[0]=-p->GetX()-yshift; if (lay==1) lp[0]=-lp[0];
-          lp[1]=p->GetZ()+zshift;
-          lp[2]=p->GetSigmaX2();
-          lp[3]=p->GetSigmaZ2();
-          lp[4]=p->GetQ(); lp[4]/=kmip;
-          //Int_t lab[6]; 
-          lab[0]=p->GetLabel(0);lab[1]=p->GetLabel(1);lab[2]=p->GetLabel(2);
-          lab[3]=ndet;
-
-          Int_t label=lab[0];
-          if (label>=0) {
-             TParticle *part=(TParticle*)gAlice->Particle(label);
-             label=-3;
-             while (part->P() < 0.005) {
-                Int_t m=part->GetFirstMother();
-                if (m<0) {cerr<<"Primary momentum: "<<part->P()<<endl; break;}
-                label=m;
-                part=(TParticle*)gAlice->Particle(label);
-             }
-             if      (lab[1]<0) lab[1]=label;
-             else if (lab[2]<0) lab[2]=label;
-             else cerr<<"No empty labels !\n";
-         }
-
-          new(cl[j]) AliITSclusterV2(lab,lp);
-       }
-       cTree->Fill(); clusters->Delete();
-       points->Delete();
-   }
-   cTree->Write();
-
-   cerr<<"Number of clusters: "<<nclusters<<endl;
-
-   delete cTree; delete clusters; delete points;
-
-   delete gAlice; gAlice=0;
-
-   in->Close();
-   out->Close();
-
-   return 0;
+#endif
 
+/*
+$Id$ 
+*/
+/***************************************************************
+ *  This macro performs the ITS local reconstruction           *
+ *  It is intended for special purposes and tests.             *
+ *  The reccomended way to reconstruct ITs is via the          *
+ *  class STEER/AliReconstruction                              *
+ *  Present version: M.Masera - Previous version: J. Belikov   *
+ ***************************************************************/
+
+void Reconstruct(AliRunLoader* runLoader,Option_t *opt);
+void Reconstruct(AliRunLoader* runLoader, AliRawReader *rawreader,Option_t *opt);
+
+Int_t AliITSFindClustersV2(char *inputRawData = NULL,TString filename="galice.root",Option_t *opt="All"){
+  // if kine tree is available MC labels are used for rec points
+  // set opt equal to "SPD" or to "SDD" or to "SSD" do build
+  // rec points for individual subdetectors 
+  if (gAlice) {
+    delete AliRunLoader::Instance();
+    delete gAlice;
+    gAlice = NULL;
+  }
+
+  // Get geometry
+  AliGeomManager::LoadGeometry("geometry.root");
+
+  //Get Run loader and ITS loader - set geometry
+  AliRunLoader* rl = AliRunLoader::Open(filename.Data());
+
+  AliITSInitGeometry initgeom;
+  AliITSgeom *geom = initgeom.CreateAliITSgeom();
+  printf("Geometry name: %s \n",(initgeom.GetGeometryName()).Data());
+  AliITSLoader* loader = static_cast<AliITSLoader*>(rl->GetLoader("ITSLoader"));
+  if (!loader) {
+    Error("Init", "ITS loader not found");
+    return -1;
+  }
+  loader->SetITSgeom(geom);
+
+  // Set OCDB if needed
+  AliCDBManager* man = AliCDBManager::Instance();
+  if (!man->IsDefaultStorageSet()) {
+    printf("Setting a local default storage and run number 0\n");
+    man->SetDefaultStorage("local://$ALICE_ROOT/OCDB");
+    man->SetRun(0);
+  }
+  else {
+    printf("Using deafult storage \n");
+  }
+
+  AliRawReader *rawreader = NULL;
+  TString fileRaw(inputRawData);
+  if(!fileRaw.IsNull()){
+    if (fileRaw.EndsWith(".root")) {
+      cout<<"Raw data format - ROOT file \n"; 
+      rawreader = new AliRawReaderRoot(fileRaw); // root format
+    }
+    else {
+      cout<<"Raw data format - DATE file \n";
+      rawreader = new AliRawReaderDate(fileRaw);  // DATE format
+    }
+    //    if (!fEquipIdMap.IsNull() && fRawReader)fRawReader->LoadEquipmentIdsMap(fEquipIdMap);
+    Reconstruct(rl,rawreader,opt);
+  }
+  else {
+    cout<< "Starting from DIGITS \n";
+    Reconstruct(rl,opt);
+  }
+
+  return 0;
 }
 
+//________________________________________________________________________
+void Reconstruct(AliRunLoader* runLoader,Option_t *opt){
+// reconstruct clusters starting from DIGITS
+// MC truth if available is used to label clusters according to the particles
+// originating them
+
+  AliITSLoader* loader = 
+                static_cast<AliITSLoader*>(runLoader->GetLoader("ITSLoader"));
+  if (!loader) {
+    Error("Reconstruct", "ITS loader not found");
+    return;
+  }
+  AliITSDetTypeRec* rec = new AliITSDetTypeRec();
+  rec->SetITSgeom(loader->GetITSgeom());
+  rec->SetDefaults();
+
+  runLoader->LoadKinematics();
+  TTree *trK=(TTree*)runLoader->TreeK();
+  if(trK){
+    cout<<"kine tree found - MC labels will be used in RP \n";
+    if(runLoader->LoadgAlice())gAlice = runLoader->GetAliRun();
+  }
+  else{
+    cout<<"kine tree not found - MC labels will not b used\n";
+  }
+
+  Int_t nEvents = runLoader->GetNumberOfEvents();
+  // loop on the events
+
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < nEvents; iEvent++) {
+    runLoader->GetEvent(iEvent);
+    cout<<">>>>>>>   Processing event number "<<iEvent+1<<endl;
+    loader->LoadRecPoints("update");
+    loader->CleanRecPoints();
+    loader->MakeRecPointsContainer();
+    loader->LoadDigits("read");
+    TTree *tR = loader->TreeR();
+    TTree *tD = loader->TreeD();
+    if(!tR){
+      cout<<"Tree R pointer not found - Abort \n";
+      break;
+    }
+    rec->SetTreeAddressD(tD);
+    rec->MakeBranch(tR,"R");
+    rec->SetTreeAddressR(tR);
+    rec->DigitsToRecPoints(tD,tR,0,opt,kTRUE);    
+    loader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
+    loader->UnloadRecPoints();
+    loader->UnloadDigits();
+    runLoader->UnloadKinematics();
+  }
 
+}
 
+void Reconstruct(AliRunLoader* runLoader, AliRawReader *rawreader,Option_t *opt){
+// reconstruct clusters starting from raw data (root or DATE format)
+// MC truth if available is used to label clusters according to the particles
+// originating them
+
+  AliITSLoader* loader = static_cast<AliITSLoader*>(runLoader->GetLoader("ITSLoader"));
+  if (!loader) {
+    Error("Reconstruct", "ITS loader not found");
+    return;
+  }
+  AliITSDetTypeRec* rec = new AliITSDetTypeRec();
+  rec->SetITSgeom(loader->GetITSgeom());
+  rec->SetDefaults();
+  // direct clusterfinding starting from raw data is implemented only 
+  // in AliITSClusterFinderV2
+  rec->SetDefaultClusterFindersV2(kTRUE);
+
+  runLoader->LoadKinematics();
+  TTree *trK=(TTree*)runLoader->TreeK();
+  if(trK){
+    cout<<"kine tree found - MC labels will be used in RP \n";
+    if(runLoader->LoadgAlice())gAlice = runLoader->GetAliRun();
+  }
+  Int_t nEvents = runLoader->GetNumberOfEvents();
+  rawreader->RewindEvents();
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < nEvents; iEvent++) {
+    rawreader->NextEvent();
+    runLoader->GetEvent(iEvent);
+    cout<<">>>>>>>   Processing event number: "<<iEvent<<endl;
+    loader->LoadRecPoints("update");
+    loader->CleanRecPoints();
+    loader->MakeRecPointsContainer();
+    TTree *tR = loader->TreeR();
+    if(!tR){
+      cout<<"Tree R pointer not found - Abort \n";
+      break;
+    }
+    rec->DigitsToRecPoints(rawreader,tR,opt);
+    rec->ResetRecPoints();
+    rec->ResetClusters();    
+    loader->WriteRecPoints("OVERWRITE");
+    loader->UnloadRecPoints();
+    loader->UnloadDigits();
+    runLoader->UnloadKinematics();
+  }
 
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+}