fixed the tainted variables
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSPreprocessorSDD.cxx
index 569747b..4f1616a 100644 (file)
@@ -28,7 +28,6 @@
 #include "AliITSDriftSpeedSDD.h"
 #include "AliITSDriftSpeedArraySDD.h"
 #include "AliITSDCSAnalyzerSDD.h"
-#include "AliITSHLTforSDD.h"
 #include "AliShuttleInterface.h"
 #include "AliCDBEntry.h"
 #include "AliCDBMetaData.h"
@@ -79,8 +78,6 @@ UInt_t AliITSPreprocessorSDD::Process(TMap* dcsAliasMap){
   }else if(runType== "INJECTOR"){
     Log("Process FXS files from INJECTOR RUN");
     retcode=ProcessInjector(ddlmap);
-  }else if(runType== "PHYSICS"){
-    retcode=ProcessPhysics();
   }
   if(retcode!=0) return retcode;
 
@@ -91,25 +88,6 @@ UInt_t AliITSPreprocessorSDD::Process(TMap* dcsAliasMap){
 
 }
 //______________________________________________________________________
-UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessPhysics(){
-  // Get the HLT status for the PHYSICS run 
-  // needeed to define the raw data format  
-
-  AliITSHLTforSDD *hltSDD=new AliITSHLTforSDD();
-  TString hltMode = GetRunParameter("HLTmode");
-  TSubString firstChar = hltMode(0,1);
-  if (firstChar == "C") hltSDD->SetHLTmodeC(kTRUE);
-  else hltSDD->SetHLTmodeC(kFALSE);
-
-  AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
-  md->SetResponsible("Francesco Prino");
-  md->SetBeamPeriod(0);
-  md->SetComment("HLT mode C flag for PHYSICS run");
-  Bool_t retCode = Store("Calib","HLTforSDD",hltSDD,md);
-  if(retCode) return 0;
-  else return 1;
-}
-//______________________________________________________________________
 UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessPulser(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
   // Process FXS files from PULSER run (baseline, noise, gain)
   // returns 0 in case of success, 
@@ -143,6 +121,17 @@ UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessPulser(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
     ind++;
   }
   delete sourceList;
+  // Read ADC sampling frequency from fee.conf
+  Int_t amSamplFreq=40;
+  Int_t retfscf;
+  FILE* feefil=fopen("fee.conf","r");
+  if(feefil){
+    retfscf=fscanf(feefil,"%d \n",&amSamplFreq);
+    fclose(feefil);
+    Log(Form("AM sampling frequency = %d MHz",amSamplFreq));
+  }else{
+    Log("File fee.conf not found. AM sampling set at 40 MHz by default");
+  }
   
   for(Int_t iddl=0;iddl<kNumberOfDDL;iddl++){
     for(Int_t imod=0;imod<kModulesPerDDL;imod++){
@@ -150,10 +139,11 @@ UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessPulser(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
       if(modID==-1) continue;
       modID-=240; // to have SDD modules numbering from 0 to 260
       AliITSCalibrationSDD *cal = new AliITSCalibrationSDD("simulated");
-      cal->SetUseCorrectionMaps(0,0); // temporary disabling of maps
-      cal->SetAMAt20MHz();            // for runs > 51275 with clock at 20 MHz
+      if(amSamplFreq!=40) cal->SetAMAt20MHz();
       numOfBadChannels[modID]=0;
       Int_t badch[kNumberOfChannels];
+      Bool_t sid0ok=kTRUE;
+      Bool_t sid1ok=kTRUE;
       for(Int_t isid=0;isid<=1;isid++){
        TString inpFileName;
        inpFileName.Form("./SDDbase_ddl%02dc%02d_sid%d.data",iddl,imod,isid);
@@ -161,17 +151,36 @@ UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessPulser(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
        FILE* basFil = fopen(inpFileName,"read");
        if (basFil == 0) {
          Log(Form("File %s not found.",inpFileName.Data()));
-         cal->SetBad();
+         if(isid==0){
+           sid0ok=kFALSE;
+           for(Int_t iChip=0; iChip<4; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
+           cal->SetDeadChannels(cal->GetDeadChannels()+256);
+           for(Int_t iAnode=0; iAnode<256; iAnode++) cal->SetBadChannel(iAnode,iAnode);
+         }else{
+           sid1ok=kFALSE;
+           for(Int_t iChip=4; iChip<8; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
+           cal->SetDeadChannels(cal->GetDeadChannels()+256);
+           for(Int_t iAnode=0; iAnode<256; iAnode++) cal->SetBadChannel(iAnode,iAnode+256);
+         }
          continue;
        }
-       fscanf(basFil,"%d %d %d\n",&im,&is,&isgoodmod);
-       if(!isgoodmod) cal->SetBad();
-       fscanf(basFil,"%d\n",&th);
-       fscanf(basFil,"%d\n",&tl);
+
+       retfscf=fscanf(basFil,"%d %d %d\n",&im,&is,&isgoodmod);
+       if(!isgoodmod){
+         if(isid==0){
+           sid0ok=kFALSE;
+           for(Int_t iChip=0; iChip<4; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
+         }else{
+           sid1ok=kFALSE;
+           for(Int_t iChip=4; iChip<8; iChip++) cal->SetChipBad(iChip);
+         }
+       }
+       retfscf=fscanf(basFil,"%d\n",&th);
+       retfscf=fscanf(basFil,"%d\n",&tl);
        cal->SetZSLowThreshold(isid,tl);
        cal->SetZSHighThreshold(isid,th);
        for(Int_t ian=0;ian<(kNumberOfChannels/2);ian++){
-         fscanf(basFil,"%d %d %f %d %d %f %f %f %f\n",&i,&isgoodan,&baseline,&basmin,&basoff,&rawnoise,&cmn,&corn,&gain);
+         retfscf=fscanf(basFil,"%d %d %f %d %d %f %f %f %f\n",&i,&isgoodan,&baseline,&basmin,&basoff,&rawnoise,&cmn,&corn,&gain);
          Int_t ich=ian;
          if(isid==1) ich+=256;
          if(!isgoodan){ 
@@ -189,6 +198,7 @@ UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessPulser(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
        }
        fclose(basFil);
       }
+      if(!sid0ok && !sid1ok) cal->SetBad();
       Log(Form("Put calib obj for module %d (DDL %d  Carlos %d)",modID,iddl,imod));
       calSDD.AddAt(cal,modID);
     }
@@ -210,16 +220,18 @@ UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessInjector(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
   TObjArray vdrift(2*kNumberOfSDD);
   vdrift.SetOwner(kFALSE);
   Int_t evNumb,polDeg; 
-  UInt_t timeStamp;
+  UInt_t timeStamp,statusInj;
   Bool_t modSet[2*kNumberOfSDD]; // flag modules with good inj.
   for(Int_t ihyb=0; ihyb<2*kNumberOfSDD; ihyb++) modSet[ihyb]=0;
-  Double_t nPt = 0;
+  Double_t nPtLay3 = 0;
+  Double_t nPtLay4 = 0;
 
   Double_t param[4];    // parameters of poly fit
-  Double_t minValP0=4.; // min value for param[0]
-  Double_t maxValP0=9.; // max value for param[0]
+  Double_t minValP0=5.; // min value for param[0]
+  Double_t maxValP0=8.; // max value for param[0]
   Double_t minValP1=0.; // min value for param[1]
-  Double_t aveCoef[4]={0.,0.,0.,0.};  // average param for good mod.
+  Double_t aveCoefLay3[4]={0.,0.,0.,0.};  // average param for good mod.
+  Double_t aveCoefLay4[4]={0.,0.,0.,0.};  // average param for good mod.
   Double_t defCoef[4]={6.53227,0.00128941,-5.14493e-06,0};  // default values for param
   Float_t auxP;
 
@@ -242,7 +254,7 @@ UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessInjector(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
     ind++;
   }
   delete sourceList;
-
+  Int_t retfscf;
 
   for(Int_t iddl=0;iddl<kNumberOfDDL;iddl++){
     for(Int_t imod=0;imod<kModulesPerDDL;imod++){
@@ -256,28 +268,40 @@ UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessInjector(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
        FILE* injFil = fopen(inpFileName,"read");
        if (injFil == 0) {
          Log(Form("File %s not found.",inpFileName.Data()));
-         AliITSDriftSpeedSDD *dsp=new AliITSDriftSpeedSDD();
-         arr->AddDriftSpeed(dsp);
-         vdrift.AddAt(arr,2*modID+isid);
          continue;
        }
-       fscanf(injFil,"%d",&polDeg);
+       retfscf=fscanf(injFil,"%d",&polDeg);
        while (!feof(injFil)){
-         fscanf(injFil,"%d %u ",&evNumb,&timeStamp);
-         if(feof(injFil)) break;
-         for(Int_t ic=0;ic<4;ic++){ 
-           fscanf(injFil,"%f ",&auxP);
-           param[ic]=auxP;
-         }
+         retfscf=fscanf(injFil,"%d %u ",&evNumb,&timeStamp);
+         if(evNumb==-99){
+           statusInj=timeStamp;
+           arr->SetInjectorStatus(statusInj);
+         }else{
+           if(feof(injFil)) break;
+           for(Int_t ic=0;ic<4;ic++){ 
+             retfscf=fscanf(injFil,"%f ",&auxP);
+             param[ic]=auxP;
+           }
 
-         if(param[0]>minValP0 && param[0]<maxValP0 && param[1]>minValP1){
-           for(Int_t ic=0;ic<4;ic++) aveCoef[ic]+=param[ic];
-           nPt++;
-           AliITSDriftSpeedSDD *dsp=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,polDeg,param);
-           arr->AddDriftSpeed(dsp);
-           modSet[2*modID+isid]=1;
+           if(param[0]>minValP0 && param[0]<maxValP0 && param[1]>minValP1){
+             if(polDeg==3){
+               if(modID<kNumberOfSDDLay3){ 
+                 for(Int_t ic=0;ic<4;ic++) aveCoefLay3[ic]+=param[ic];
+                 nPtLay3++;
+               }else{ 
+                 for(Int_t ic=0;ic<4;ic++) aveCoefLay4[ic]+=param[ic];
+                 nPtLay4++;
+               }
+             }
+             AliITSDriftSpeedSDD *dsp=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,polDeg,param);
+             arr->AddDriftSpeed(dsp);
+             modSet[2*modID+isid]=1;
+           }else{
+             Log(Form("Module %d side %d not accepted, degree=%d, params=%g %g %g %g",modID+240,isid,polDeg,param[0],param[1],param[2],param[3]));
+           }
          }
        }
+       fclose(injFil);
        Log(Form("Put calib obj for hybrid %d (DDL %d  Carlos %d)",2*modID+isid,iddl,imod));
        if(modSet[2*modID+isid]) vdrift.AddAt(arr,2*modID+isid);
       }
@@ -286,20 +310,33 @@ UInt_t AliITSPreprocessorSDD::ProcessInjector(AliITSDDLModuleMapSDD* ddlmap){
 
   // set drift speed for modules with bad injectors
   for(Int_t ic=0;ic<4;ic++){ 
-    if(nPt>0) aveCoef[ic]/=nPt; // mean parameters
-    else aveCoef[ic]=defCoef[ic]; // default parameters
+    if(nPtLay3>0) aveCoefLay3[ic]/=nPtLay3; // mean parameters
+    else aveCoefLay3[ic]=defCoef[ic]; // default parameters
+    if(nPtLay4>0) aveCoefLay4[ic]/=nPtLay4; // mean parameters
+    else aveCoefLay4[ic]=defCoef[ic]; // default parameters
   }
-  AliITSDriftSpeedSDD *avdsp=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,polDeg,aveCoef);
+  AliITSDriftSpeedSDD *avdsp3=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,polDeg,aveCoefLay3);
+  AliITSDriftSpeedSDD *avdsp4=new AliITSDriftSpeedSDD(evNumb,timeStamp,polDeg,aveCoefLay4);
 
-  for(Int_t ihyb=0; ihyb<2*kNumberOfSDD; ihyb++){
+  for(Int_t ihyb=0; ihyb<2*kNumberOfSDDLay3; ihyb++){
     if(modSet[ihyb]==0){ 
-      AliWarning(Form("No good injector events for mod. %d --> use average values",ihyb/2));
+      AliWarning(Form("No good injector events for mod. %d side %d --> use average values for layer 3",ihyb/2,ihyb%2));
       AliITSDriftSpeedArraySDD *arr=new AliITSDriftSpeedArraySDD();
-      arr->AddDriftSpeed(avdsp);
+      arr->AddDriftSpeed(avdsp3);
+      arr->SetInjectorStatus(0);
       vdrift.AddAt(arr,ihyb);
     }
   }
 
+  for(Int_t ihyb=2*kNumberOfSDDLay3; ihyb<2*kNumberOfSDD; ihyb++){
+    if(modSet[ihyb]==0){ 
+      AliWarning(Form("No good injector events for mod. %d side %d --> use average values for layer 4",ihyb/2,ihyb%2));
+      AliITSDriftSpeedArraySDD *arr=new AliITSDriftSpeedArraySDD();
+      arr->AddDriftSpeed(avdsp4);
+      arr->SetInjectorStatus(0);
+      vdrift.AddAt(arr,ihyb);
+    }
+  }
 
   AliCDBMetaData *md= new AliCDBMetaData();
   md->SetResponsible("Francesco Prino");