]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - ITS/AliITSSurveyToAlign.cxx
For Pythia with tune don't switch off MI in ConfigHeavyFlavor
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSSurveyToAlign.cxx
index 2939e26729dd9dcf47c33851169906a5af5e5f28..e51c28107b0e62bdec8f351a099359bd898b6945 100644 (file)
 //           Martin Poghosyan (Martin.Poghosyan@to.infn.it)
 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
-#include "Riostream.h"
-#include "TFile.h"
-#include "TSystem.h"
-#include "TClonesArray.h"
 #include "TGeoManager.h"
-#include "TGeoMatrix.h"
 #include "TGeoPhysicalNode.h"
 #include "TMatrixD.h"
 #include "TMath.h"
 
 #include "AliITSSurveyToAlign.h"
-#include "AliSurveyObj.h"
 #include "AliSurveyPoint.h"
 #include "AliAlignObjParams.h"
 #include "AliGeomManager.h"
 #include "AliLog.h"
 
 #include "AliCDBManager.h"
-#include "AliCDBEntry.h"
-#include "AliCDBStorage.h"
 
 #include "AliITSgeomTGeo.h"
 
+
+//#include "dataSDDladder.h"
 ClassImp(AliITSSurveyToAlign)
 
 const Double_t AliITSSurveyToAlign::fgkLocR[6][3]={{ 3.24,0.21905,-2.4},
@@ -63,19 +57,44 @@ const Double_t AliITSSurveyToAlign::fgkLocL[6][3]={{-3.24,0.21905, 2.4},
                                                   { 3.58,0.21905, 0. },
                                                   { 3.24,0.21905, 2.4}};
 
+const Double_t kRadToDeg = 180./TMath::Pi();
 
 //________________________________________________________________________
-AliITSSurveyToAlign::AliITSSurveyToAlign(Int_t run, Int_t repSDD, Int_t repVerSDD, Int_t repModSSD, Int_t repModVerSSD, Int_t repLaddSSD, Int_t repLaddVerSSD) :
-  //TObject(),
+AliITSSurveyToAlign::AliITSSurveyToAlign(Int_t run, Int_t repModSDD, Int_t repModVerSDD, Int_t repLadSDD, Int_t repLadVerSDD, Int_t repModSSD, Int_t repModVerSSD, Int_t repLaddSSD, Int_t repLaddVerSSD) :
   AliSurveyToAlignObjs(),
   fRun(run),
-  fSDDrepNumber(repSDD),
-  fSDDrepVersion(repVerSDD),
+  fSDDModuleRepNumber(repModSDD),
+  fSDDModuleRepVersion(repModVerSDD),
+  fSDDLadderRepNumber(repLadSDD),
+  fSDDLadderRepVersion(repLadVerSDD),
   fSSDModuleRepNumber(repModSSD),
   fSSDModuleRepVersion(repModVerSSD),
   fSSDLadderRepNumber(repLaddSSD),
   fSSDLadderRepVersion(repLaddVerSSD)
  {
+   // Standard constructor
+  for(Int_t i=0; i<260; i++)
+    {
+      fuidSDDm[i]= 0;
+      fsymnameSDDm[i]=TString("");
+      fxSDDm[i]=0;
+      fySDDm[i]=0;
+      fzSDDm[i]=0;
+      fpsiSDDm[i]=0;
+      ftetSDDm[i]=0;
+      fphiSDDm[i]=0;
+      if(i>35) continue;
+      fuidSDDl[i]=0;
+      fsymnameSDDl[i]=TString("");
+      fxSDDl[i]=0;
+      fySDDl[i]=0;
+      fzSDDl[i]=0;
+      fpsiSDDl[i]=0;
+      ftetSDDl[i]=0;
+      fphiSDDl[i]=0;
+    }
+
+   //   ftypeSDDlad=0;
   //
   //  default constructor
   //  Arguments are report numbers for survey data. 
@@ -85,11 +104,12 @@ AliITSSurveyToAlign::AliITSSurveyToAlign(Int_t run, Int_t repSDD, Int_t repVerSD
 
 //_________________________________________________________________________
 AliITSSurveyToAlign::AliITSSurveyToAlign(const AliITSSurveyToAlign &align) :
-  //  TObject(),
   AliSurveyToAlignObjs(align),
   fRun(align.fRun),
-  fSDDrepNumber(align.fSDDrepNumber),
-  fSDDrepVersion(align.fSDDrepVersion),
+  fSDDModuleRepNumber(align.fSDDModuleRepNumber),
+  fSDDModuleRepVersion(align.fSDDModuleRepVersion),
+  fSDDLadderRepNumber(align.fSDDLadderRepNumber),
+  fSDDLadderRepVersion(align.fSDDLadderRepVersion),
   fSSDModuleRepNumber(align.fSSDModuleRepNumber),
   fSSDModuleRepVersion(align.fSSDModuleRepVersion),
   fSSDLadderRepNumber(align.fSSDLadderRepNumber),
@@ -98,15 +118,37 @@ AliITSSurveyToAlign::AliITSSurveyToAlign(const AliITSSurveyToAlign &align) :
   //
   //  copy constructor 
   //
+  for(Int_t i=0; i<260; i++)
+    {
+      fuidSDDm[i]= align.fuidSDDm[i];
+      fsymnameSDDm[i]=TString(align.fsymnameSDDm[i]);
+      fxSDDm[i]=align.fxSDDm[i];
+      fySDDm[i]=align.fySDDm[i];
+      fzSDDm[i]=align.fzSDDm[i];
+      fpsiSDDm[i]=align.fpsiSDDm[i];
+      ftetSDDm[i]=align.ftetSDDm[i];
+      fphiSDDm[i]=align.fphiSDDm[i];
+      if(i>35) continue;
+      fuidSDDl[i]=align.fuidSDDl[i];
+      fsymnameSDDl[i]=TString(align.fsymnameSDDl[i]);
+      fxSDDl[i]=align.fxSDDl[i];
+      fySDDl[i]=align.fySDDl[i];
+      fzSDDl[i]=align.fzSDDl[i];
+      fpsiSDDl[i]=align.fpsiSDDl[i];
+      ftetSDDl[i]=align.ftetSDDl[i];
+      fphiSDDl[i]=align.fphiSDDl[i];
+    }
+
 }
 
 //__________________________________________________________________________
-AliITSSurveyToAlign & AliITSSurveyToAlign::operator =(const AliITSSurveyToAlign& /* align */) {
+AliITSSurveyToAlign & AliITSSurveyToAlign::operator =(const AliITSSurveyToAlign& align)  {
   //
-  // assignment operator - dummy
+  // assignment operator
   //
-
-  return (*this);
+  this->~AliITSSurveyToAlign();
+  new(this) AliITSSurveyToAlign(align);
+  return *this;
 }
 
 //__________________________________________________________________________
@@ -136,18 +178,27 @@ void AliITSSurveyToAlign::Run() {
 //______________________________________________________________________
 Bool_t AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjs() { 
   // Fill the array of alignment objects with alignment objects
-  // from surveyfor all three subdetectors
+  // from survey for all three subdetectors
   //
 
   //for SPD
   CreateAlignObjDummySPD();
 
+  ///////////////////////////
   // for SDD
-  if(!LoadSurveyFromAlienFile("ITS", fSDDrepNumber, fSDDrepVersion)){
-      AliError("Loading of alignment objects from survey for SDD failed!");
+  if(!LoadSurveyFromAlienFile("ITS", fSDDModuleRepNumber, fSDDModuleRepVersion)){
+      AliError("Loading of alignment objects from survey for SDD modules failed!");
+      return kFALSE;
+  }
+  CreateAlignObjSDDModules();
+
+  if(!LoadSurveyFromAlienFile("ITS", fSDDLadderRepNumber, fSDDLadderRepVersion)){
+      AliError("Loading of alignment objects from survey for SDD ladder failed!");
       return kFALSE;
   }
-  CreateAlignObjSDD();
+  CreateAlignObjSDDLadders();
+  if(!ApplyAlignObjSDD()) return kFALSE;
+
 
   // for SSD ladders
   if(!LoadSurveyFromAlienFile("ITS", fSSDLadderRepNumber, fSSDLadderRepVersion)){
@@ -184,9 +235,60 @@ void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjDummySPD(){
   }//module loop
 
 }
+Bool_t AliITSSurveyToAlign::ApplyAlignObjSDD()
+{
+  // Apply alignment for SDD
+  Int_t applied=0;
+
+  for(Int_t iLadd=0; iLadd<36; iLadd++)
+    {
+      new((*fAlignObjArray)[240+iLadd]) AliAlignObjParams(fsymnameSDDl[iLadd].Data(), fuidSDDl[iLadd], 
+                                              fxSDDl[iLadd]  , fySDDl[iLadd]  , fzSDDl[iLadd]  , 
+                                              fpsiSDDl[iLadd], ftetSDDl[iLadd], fphiSDDl[iLadd], kFALSE);
+      //      new((*fAlignObjArray)[240+iLadd]) AliAlignObjParams(fsymnameSDDl[iLadd].Data(), fuidSDDl[iLadd], 
+      //                              fxSDDl[iLadd]  , fySDDl[iLadd]  , fzSDDl[iLadd]  , 
+      //                              0, 0, 0, kFALSE);
+
+      AliAlignObjParams* ap = dynamic_cast<AliAlignObjParams*> (fAlignObjArray->UncheckedAt(240+iLadd));
+      //      printf("%s  %f  %f  %f\n",fxSDDl[iLadd], fsymnameSDDl[iLadd].Data(), fySDDl[iLadd]  , fzSDDl[iLadd]);
+      //printf("%d  %f\n", iLadd, fzSDDl[iLadd]);
+
+      if(fsymnameSDDl[iLadd].Contains("SDD") && fsymnameSDDl[iLadd].Contains("Ladder"))
+       {
+         //      printf("%d  %s  %d\n",240+iLadd, fsymnameSDDl[iLadd].Data(),fuidSDDl[iLadd] );
+
+         if(!ap->ApplyToGeometry()) return kFALSE;
+         applied++;
+       }
+      else
+       {
+         AliError("SDD Ladder array is not initialized correctly");
+         return kFALSE;
+       }
+    }
+
+  for(Int_t iMod=0; iMod<260; iMod++)
+    {
+      new((*fAlignObjArray)[240+36+iMod]) AliAlignObjParams(fsymnameSDDm[iMod].Data(), fuidSDDm[iMod], 
+                                            fxSDDm[iMod], fySDDm[iMod], fzSDDm[iMod], 
+                                            fpsiSDDm[iMod], ftetSDDm[iMod], fphiSDDm[iMod], kFALSE);
+
+      //           printf("%d %s  %f  %f  %f\n",240+36+iMod, fsymnameSDDm[iMod].Data(),fxSDDm[iMod], fySDDm[iMod], fzSDDm[iMod] );
+
+          if(!fsymnameSDDm[iMod].Contains("SDD") || !fsymnameSDDm[iMod].Contains("Sensor"))
+           {
+         AliError("SDD Module array is not initialized correctly\n");
+         return kFALSE;
+           }
+
+    }
+
+  AliInfo(Form(" %d alignment objects for SDD ladders applied to geometry.",applied));
+  return kTRUE;
+}
 
 //______________________________________________________________________
-void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSDD(){
+void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSDDModules(){
   //
   // Create alignment objects for SDD
   // Called by Run()
@@ -203,7 +305,7 @@ void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSDD(){
 
   if (fSurveyPoints == 0 || fSurveyPoints->GetEntries() == 0) {
     AliWarning("SDD survey data are not available, using zero values");
-    CreateAlignObjDummySDD();
+    CreateAlignObjDummySDDModules();
     return;
   }
 
@@ -244,13 +346,28 @@ void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSDD(){
 
       if(nModules==2) CalcShiftSDD(x0,y0,z0);
       if(nModules>2)   CalcShiftRotSDD(tet, psi, phi, x0, y0, z0);
-      tet*=(180/TMath::Pi());
-      psi*=(180/TMath::Pi());
-      phi*=(180/TMath::Pi());
+      tet*=kRadToDeg;
+      psi*=kRadToDeg;
+      phi*=kRadToDeg;
 
 //    printf("%s  %d  %f  %f  %f  %f  %f  %f\n",symname, uid, x0/10., y0/10., z0/10., psi, tet, phi);
 //      cout << "Allocate alignobjparams " << imod << endl;
-      new((*fAlignObjArray)[iModuleIndex]) AliAlignObjParams(symname, uid, x0/10., y0/10., z0/10., psi, tet, phi, kFALSE);
+
+//      new((*fAlignObjArray)[iModuleIndex]) AliAlignObjParams(symname, uid, x0/10., y0/10., z0/10., psi, tet, phi, kFALSE);
+//       printf("INDEX:   Module: %d\n",iModuleIndex);
+
+      fsymnameSDDm[iModuleIndex-240]=TString(symname);
+      fuidSDDm[iModuleIndex-240]=uid;
+      fxSDDm[iModuleIndex-240]=x0/10.;
+      fySDDm[iModuleIndex-240]=y0/10.;
+      fzSDDm[iModuleIndex-240]=z0/10.;
+      fpsiSDDm[iModuleIndex-240]=psi;
+      ftetSDDm[iModuleIndex-240]=tet;
+      fphiSDDm[iModuleIndex-240]=phi;
+
+      //      new((*fAlignObjArray)[36+iModuleIndex]) AliAlignObjParams(fsymnameSDDm[iModuleIndex-240].Data(), fuidSDDm[iModuleIndex-240], 
+      //                                            fxSDDm[iModuleIndex-240], fySDDm[iModuleIndex-240], fzSDDm[iModuleIndex-240], 
+      //                                            fpsiSDDm[iModuleIndex-240], ftetSDDm[iModuleIndex-240], fphiSDDm[iModuleIndex-240], kFALSE);
 
       iModule0=iModule;
       iLayer0=iLayer;
@@ -264,7 +381,7 @@ void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSDD(){
 }
 
 //______________________________________________________________________
-void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjDummySDD(){
+void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjDummySDDModules(){
   // 
   // Create empty alignment objects
   // Used when fSurveySDD == 0
@@ -277,7 +394,16 @@ void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjDummySDD(){
     Int_t uid = AliGeomManager::LayerToVolUID(ilayer,imodule);
     const Char_t *symname = AliGeomManager::SymName(uid);
 
-    new((*fAlignObjArray)[imod+240]) AliAlignObjParams(symname, uid, 0., 0., 0., 0., 0., 0., kTRUE);
+      fsymnameSDDm[imod]=TString(symname);
+      fuidSDDm[imod]=uid;
+      fxSDDm[imod]=0.;
+      fySDDm[imod]=0.;
+      fzSDDm[imod]=0.;
+      fpsiSDDm[imod]=0.;
+      ftetSDDm[imod]=0.;
+      fphiSDDm[imod]=0.;
+
+    //    new((*fAlignObjArray)[imod+36+240]) AliAlignObjParams(symname, uid, 0., 0., 0., 0., 0., 0., kTRUE);
   }//module loop
 }
 
@@ -323,7 +449,7 @@ void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSSDModules(){
     // Minus sign to change local coordinate convention 
     Float_t theta = -(pt2->GetZ() - pt1->GetZ())*kMu2Cm/kSensLength;
 
-    theta *= 180./TMath::Pi();
+    theta *= kRadToDeg;
     Int_t iLayMod = imod - 500;
     if (iLayer == 6)
       iLayMod -= 748;
@@ -340,7 +466,7 @@ void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSSDModules(){
           << " theta " << theta << endl;
     }
     */
-    new((*fAlignObjArray)[imod]) AliAlignObjParams(symname, uid, sx, 0, sz, 0., theta, 0., kFALSE);
+    new((*fAlignObjArray)[imod+36]) AliAlignObjParams(symname, uid, sx, 0, sz, 0., theta, 0., kFALSE);
   } //module loop
 }
 
@@ -350,8 +476,8 @@ Bool_t AliITSSurveyToAlign::ApplyAlignObjSSDLadders(){
   //   Apply alignment objects for SSD ladders to geometry, needed to correctly
   //   build alignment objects for SSD modules
   // 
-  TClonesArray* tobeApplied = new TClonesArray("AliAlignObjParams",72);
-  Int_t ii=0;
+  Int_t applied=0;
+
   for(Int_t jj=0; jj<fAlignObjArray->GetEntriesFast(); jj++)
   {
       AliAlignObjParams* ap = dynamic_cast<AliAlignObjParams*> (fAlignObjArray->UncheckedAt(jj));
@@ -359,13 +485,253 @@ Bool_t AliITSSurveyToAlign::ApplyAlignObjSSDLadders(){
       {
          TString sName(ap->GetSymName());
          if(sName.Contains("SSD") && sName.Contains("Ladder"))
-             (*tobeApplied)[ii++] = (AliAlignObjParams*) fAlignObjArray->UncheckedAt(jj);
+         {
+             if(!ap->ApplyToGeometry()) return kFALSE;
+             applied++;
+         }
       }
   }
-  AliInfo(Form(" %d alignment objects for SSD ladders applied to geometry.",tobeApplied->GetEntriesFast()));
+  AliInfo(Form(" %d alignment objects for SSD ladders applied to geometry.",applied));
 
-  return(AliGeomManager::ApplyAlignObjsToGeom(*tobeApplied));
+  return kTRUE;
 }
+//______________________________________________________________________
+/*
+Bool_t AliITSSurveyToAlign::ApplyAlignObjSDDLadders(){
+  //
+  //   Apply alignment objects for SDD ladders to geometry, needed to correctly
+  //   build alignment objects for SDD modules
+  // 
+  Int_t applied=0;
+
+  for(Int_t jj=0; jj<fAlignObjArray->GetEntriesFast(); jj++)
+  {
+      AliAlignObjParams* ap = dynamic_cast<AliAlignObjParams*> (fAlignObjArray->UncheckedAt(jj));
+      if(ap) 
+      {
+         TString sName(ap->GetSymName());
+//       printf("%s\n",sName.Data());
+         if(sName.Contains("SDD") && sName.Contains("Ladder"))
+         {
+             if(!ap->ApplyToGeometry()) return kFALSE;
+             applied++;
+         }
+      }
+  }
+  AliInfo(Form(" %d alignment objects for SDD ladders applied to geometry.",applied));
+
+  return kTRUE;
+}
+*/
+//______________________________________________________________________
+void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjDummySDDLadders()
+{
+  // 
+  // Create empty alignment objects
+  TString sddName = "ITS/SDD";
+  Int_t iLadd = 0;
+
+  for (Int_t ilayer =  0; ilayer <  2; ilayer ++)
+    {
+    Int_t nLadder = 14;              // layer SDD1
+    if (ilayer == 1)  nLadder = 22;  // layer SDD2
+    for (Int_t iLadder = 0; iLadder < nLadder; iLadder++) {
+      TString ladName = sddName;
+      ladName += (ilayer+2);      
+      ladName += "/Ladder";
+      ladName += iLadder;
+      fsymnameSDDl[iLadd]=TString(ladName);
+      fuidSDDl[iLadd]=0;
+      fxSDDl[iLadd]=0;
+      fySDDl[iLadd]=10;
+      fzSDDl[iLadd]=0;
+      fpsiSDDl[iLadd]=0;
+      ftetSDDl[iLadd]=0;
+      fphiSDDl[iLadd]=0;
+      iLadd++;
+    }  // Ladder loop
+  }  // Layer loop
+
+}
+
+
+
+void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSDDLadders(){
+  //
+  //   Alignment objects from survey for SDD ladders
+  // 
+  const Float_t kLaddLenz[2] ={500, 650};  // Layer 2,3: distance between mouting points along z (mm)
+  const Float_t kLaddLenx    = 28 ;        // Layer 2,3: distance between mouting points along x (mm)
+
+  TString sddName = "ITS/SDD";
+
+ TObjArray *ladderPoints = fSurveyPoints;  
+  if (ladderPoints == 0 || ladderPoints->GetEntries() == 0) {
+    AliWarning("No SDD Ladder alignment points found. Skipping");
+    return;
+  }
+  if (ladderPoints->GetEntries()!= 72) {
+    AliWarning(Form("Unexpected number of survey points %d, should be 72",ladderPoints->GetEntries())); 
+  }
+
+/*
+TAlien::Connect("alien://");
+gSystem->Load("libXMLParser.so");
+.x loadlibs.C 
+
+AliCDBManager *cdb = AliCDBManager::Instance();
+cdb->SetDefaultStorage("local://$ALICE_ROOT/OCDB");
+cdb->SetRun(0);
+AliGeomManager::LoadGeometry();
+AliITSSurveyToAlign *a = new AliITSSurveyToAlign(); 
+
+a->CreateAlignObjSDDLadders()                     
+a->ApplyAlignObjSDDLadders();
+
+a->LoadSurveyFromAlienFile("ITS", 845069, 1);
+a->CreateAlignObjSDD();
+
+a->CreateAlignObjs();
+*/
+
+//  Int_t type =0;
+  ////////////////////////////////////////////////////////////
+  // pRB2X[layer][ladder][dx,dy,dz]
+  Double_t pRB24[2][22][3]; //(mm)
+  Double_t pRB26[2][22][3]; //(mm)
+
+
+pRB24[0][0][2] = 0.0228; pRB26[0][0][2] = 0.0284; pRB24[0][0][0] =-0.0377; pRB26[0][0][0] =-0.0008; pRB24[0][0][1] =-0.0336; pRB26[0][0][1] = 0.0540;
+pRB24[0][1][2] =-0.0175; pRB26[0][1][2] =-0.0186; pRB24[0][1][0] =-0.0143; pRB26[0][1][0] = 0.0348; pRB24[0][1][1] =-0.0123; pRB26[0][1][1] = 0.0407;
+pRB24[0][2][2] = 0.1313; pRB26[0][2][2] = 0.0302; pRB24[0][2][0] = 0.2408; pRB26[0][2][0] = 0.1113; pRB24[0][2][1] =-0.0150; pRB26[0][2][1] =-0.0194;
+pRB24[0][3][2] = 0.0307; pRB26[0][3][2] = 0.0350; pRB24[0][3][0] = 0.1140; pRB26[0][3][0] = 0.0952; pRB24[0][3][1] =-0.0423; pRB26[0][3][1] =-0.0375;
+pRB24[0][4][2] =-0.0159; pRB26[0][4][2] = 0.0185; pRB24[0][4][0] = 0.0713; pRB26[0][4][0] = 0.0803; pRB24[0][4][1] =-0.1311; pRB26[0][4][1] =-0.1201;
+pRB24[0][5][2] =-0.0128; pRB26[0][5][2] =-0.0209; pRB24[0][5][0] = 0.0436; pRB26[0][5][0] = 0.0606; pRB24[0][5][1] =-0.1551; pRB26[0][5][1] =-0.0587;
+pRB24[0][6][2] =-0.0257; pRB26[0][6][2] =-0.0044; pRB24[0][6][0] = 0.0380; pRB26[0][6][0] = 0.0264; pRB24[0][6][1] =-0.1913; pRB26[0][6][1] =-0.1851;
+pRB24[0][7][2] = 0.0185; pRB26[0][7][2] = 0.1450; pRB24[0][7][0] =-0.0406; pRB26[0][7][0] =-0.0426; pRB24[0][7][1] = 0.1564; pRB26[0][7][1] = 0.2998;
+pRB24[0][8][2] = 0.0048; pRB26[0][8][2] = 0.0077; pRB24[0][8][0] = 0.0290; pRB26[0][8][0] = 0.0361; pRB24[0][8][1] = 0.1321; pRB26[0][8][1] = 0.1679;
+pRB24[0][9][2] = 0.0049; pRB26[0][9][2] = 0.0115; pRB24[0][9][0] = 0.0405; pRB26[0][9][0] = 0.1058; pRB24[0][9][1] = 0.0319; pRB26[0][9][1] = 0.2464;
+pRB24[0][10][2]=-0.0017; pRB26[0][10][2]= 0.0100; pRB24[0][10][0]= 0.0724; pRB26[0][10][0]= 0.1035; pRB24[0][10][1]= 0.0561; pRB26[0][10][1]= 0.0713;
+pRB24[0][11][2]=-0.0021; pRB26[0][11][2]= 0.0202; pRB24[0][11][0]= 0.0590; pRB26[0][11][0]= 0.0596; pRB24[0][11][1]=-0.0875; pRB26[0][11][1]=-0.0591;
+pRB24[0][12][2]=-0.0200; pRB26[0][12][2]= 0.0242; pRB24[0][12][0]= 0.0664; pRB26[0][12][0]= 0.0780; pRB24[0][12][1]=-0.0197; pRB26[0][12][1]=-0.0227;
+pRB24[0][13][2]=-0.0382; pRB26[0][13][2]=-0.0139; pRB24[0][13][0]=-0.0320; pRB26[0][13][0]=-0.0136; pRB24[0][13][1]=-0.0798; pRB26[0][13][1]=-0.0843;
+pRB24[1][0][2] = 0.0191; pRB26[1][0][2] = 0.0295; pRB24[1][0][0] =-0.0776; pRB26[1][0][0] =-0.0585; pRB24[1][0][1] =-0.0148; pRB26[1][0][1] = 0.0123;
+pRB24[1][1][2] = 0.0135; pRB26[1][1][2] = 0.0074; pRB24[1][1][0] =-0.0289; pRB26[1][1][0] =-0.0213; pRB24[1][1][1] = 0.0064; pRB26[1][1][1] = 0.0289;
+pRB24[1][2][2] = 0.0096; pRB26[1][2][2] = 0.0011; pRB24[1][2][0] = 0.0123; pRB26[1][2][0] = 0.0404; pRB24[1][2][1] =-0.0246; pRB26[1][2][1] =-0.0064;
+pRB24[1][3][2] = 0.0209; pRB26[1][3][2] =-0.0049; pRB24[1][3][0] = 0.0322; pRB26[1][3][0] = 0.0447; pRB24[1][3][1] = 0.0066; pRB26[1][3][1] = 0.0284;
+pRB24[1][4][2] = 0.0149; pRB26[1][4][2] =-0.0033; pRB24[1][4][0] = 0.0530; pRB26[1][4][0] = 0.0822; pRB24[1][4][1] =-0.0455; pRB26[1][4][1] =-0.0365;
+pRB24[1][5][2] = 0.0395; pRB26[1][5][2] = 0.0094; pRB24[1][5][0] = 0.0633; pRB26[1][5][0] = 0.0933; pRB24[1][5][1] =-0.1133; pRB26[1][5][1] =-0.1070;
+pRB24[1][6][2] = 0.0288; pRB26[1][6][2] =-0.0002; pRB24[1][6][0] = 0.0692; pRB26[1][6][0] = 0.0916; pRB24[1][6][1] =-0.1670; pRB26[1][6][1] =-0.1670;
+pRB24[1][7][2] = 0.0238; pRB26[1][7][2] =-0.0090; pRB24[1][7][0] = 0.0625; pRB26[1][7][0] = 0.0607; pRB24[1][7][1] =-0.1592; pRB26[1][7][1] =-0.1678;
+pRB24[1][8][2] = 0.0196; pRB26[1][8][2] =-0.0738; pRB24[1][8][0] = 0.0639; pRB26[1][8][0] = 0.0686; pRB24[1][8][1] =-0.2050; pRB26[1][8][1] =-0.2056;
+pRB24[1][9][2] = 0.0029; pRB26[1][9][2] =-0.0051; pRB24[1][9][0] = 0.0178; pRB26[1][9][0] = 0.0170; pRB24[1][9][1] =-0.1042; pRB26[1][9][1] =-0.1159;
+pRB24[1][10][2]=-0.0108; pRB26[1][10][2]=-0.0023; pRB24[1][10][0]=-0.0005; pRB26[1][10][0]= 0.0119; pRB24[1][10][1]=-0.1353; pRB26[1][10][1]=-0.1461;
+pRB24[1][11][2]=-0.0131; pRB26[1][11][2]=-0.0233; pRB24[1][11][0]=-0.0202; pRB26[1][11][0]=-0.0242; pRB24[1][11][1]=-0.1883; pRB26[1][11][1]=-0.2031;
+pRB24[1][12][2]= 0.0028; pRB26[1][12][2]= 0.0036; pRB24[1][12][0]=-0.0066; pRB26[1][12][0]= 0.0011; pRB24[1][12][1]= 0.2024; pRB26[1][12][1]= 0.2382;
+pRB24[1][13][2]= 0.0111; pRB26[1][13][2]= 0.0029; pRB24[1][13][0]= 0.0283; pRB26[1][13][0]= 0.0287; pRB24[1][13][1]= 0.2057; pRB26[1][13][1]= 0.2384;
+pRB24[1][14][2]= 0.0140; pRB26[1][14][2]=-0.0657; pRB24[1][14][0]= 0.0682; pRB26[1][14][0]= 0.0825; pRB24[1][14][1]= 0.1650; pRB26[1][14][1]= 0.2545;
+pRB24[1][15][2]= 0.0263; pRB26[1][15][2]=-0.0013; pRB24[1][15][0]= 0.0909; pRB26[1][15][0]= 0.0709; pRB24[1][15][1]= 0.1093; pRB26[1][15][1]= 0.1321;
+pRB24[1][16][2]= 0.0025; pRB26[1][16][2]=-0.0045; pRB24[1][16][0]= 0.0672; pRB26[1][16][0]= 0.0955; pRB24[1][16][1]= 0.0745; pRB26[1][16][1]= 0.0901;
+pRB24[1][17][2]= 0.0060; pRB26[1][17][2]= 0.0035; pRB24[1][17][0]= 0.0664; pRB26[1][17][0]= 0.0739; pRB24[1][17][1]= 0.0471; pRB26[1][17][1]= 0.0598;
+pRB24[1][18][2]=-0.0124; pRB26[1][18][2]=-0.0168; pRB24[1][18][0]= 0.0710; pRB26[1][18][0]= 0.0866; pRB24[1][18][1]= 0.0123; pRB26[1][18][1]= 0.0237;
+pRB24[1][19][2]=-0.0125; pRB26[1][19][2]=-0.0178; pRB24[1][19][0]= 0.0433; pRB26[1][19][0]= 0.0535; pRB24[1][19][1]= 0.0234; pRB26[1][19][1]= 0.0262;
+pRB24[1][20][2]=-0.0021; pRB26[1][20][2]= 0.0100; pRB24[1][20][0]= 0.0213; pRB26[1][20][0]= 0.0394; pRB24[1][20][1]= 0.0734; pRB26[1][20][1]= 0.0677;
+pRB24[1][21][2]=-0.0490; pRB26[1][21][2]=-0.0222; pRB24[1][21][0]=-0.0269; pRB26[1][21][0]=-0.0039; pRB24[1][21][1]= 0.0160; pRB26[1][21][1]= 0.0076;
+
+
+
+  Int_t iLadd = 0;
+
+  for (Int_t ilayer =  0; ilayer <  2; ilayer ++)
+    {
+    Int_t nLadder = 14;              // layer SDD1
+    if (ilayer == 1)  nLadder = 22;  // layer SDD2
+
+    for (Int_t iLadder = 0; iLadder < nLadder; iLadder++) {
+      TString ladName = sddName;
+      ladName += (ilayer+2);      
+      ladName += "/Ladder";
+      ladName += iLadder;
+      Double_t drLoc[3];
+      //      for(Int_t i=0; i<3; i++) drLoc[i]=(pRB26[ilayer][iLadder][i]+pRB24[ilayer][iLadder][i])/20.; // average 
+
+
+      /////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+      AliSurveyPoint *p24 =  (AliSurveyPoint*) ladderPoints->FindObject(ladName+"/RB24");
+      AliSurveyPoint *p26 =  (AliSurveyPoint*) ladderPoints->FindObject(ladName+"/RB26");
+      if (p24 == 0) {
+       AliWarning(Form("Cannot find RB24 side point for ladder %s",ladName.Data()));
+       continue;
+      }
+      if (p26 == 0) {
+       AliWarning(Form("Cannot find RB26 side point for ladder %s",ladName.Data()));
+       continue;
+      }
+
+      TString tmpStr;
+      tmpStr.Insert(0,p24->GetName(),3);
+      Int_t ladder = tmpStr.Atoi();
+      tmpStr="";
+      tmpStr.Insert(0,p26->GetName(),3);
+      if (tmpStr.Atoi() != ladder) 
+       AliError(Form("Survey data file error. Expect pairs of RB24, RB26 points. Got ladders %d %d",ladder,tmpStr.Atoi()));
+
+      for(Int_t i=0; i<3; i++) drLoc[i]=pRB24[ilayer][iLadder][i]/10.;
+
+      Double_t x24, y24, z24;
+      Double_t x26, y26, z26;
+
+      x24=p24->GetX();
+      y24=p24->GetY();
+      z24=p24->GetZ();
+      x26=p26->GetX();
+      y26=p26->GetY();
+      z26=p26->GetZ();
+
+      // for top ladders: RS(local) = RS(global) + Y_shift 
+      // rot around z-axis
+      Double_t phi = 0;  // Not measured
+      // rot around y-axis
+      Double_t theta = 0;
+      // rot around x-axis
+      Double_t psi = 0;
+
+
+      psi=TMath::ATan((y26-y24)/(kLaddLenz[ilayer]+z24-z26));
+      Double_t tgtet0 = kLaddLenx/kLaddLenz[ilayer];
+      Double_t tgtet1 = (x24-x26+kLaddLenx)/(kLaddLenz[ilayer]+z24-z26);
+      theta=TMath::ATan((tgtet1-tgtet0)/(1+tgtet1*tgtet0));
+
+      Double_t x0=x24-theta*kLaddLenz[ilayer]/2;
+      Double_t y0=y24+psi*kLaddLenz[ilayer]/2;
+      Double_t z0=z24+theta*kLaddLenx/2;
+
+      theta*= kRadToDeg;
+      psi*= kRadToDeg;
+
+      AliDebug(1,Form("ladname %f %f %f %f %f %f ",drLoc[0],drLoc[1],drLoc[2],psi,theta,phi));  
+      // local delta transformation by passing 3 shifts (in centimeters) and 3 angles (expressed in degrees)    
+      //      new((*fAlignObjArray)[500+1698+144+iLadd]) AliAlignObjParams(ladName,0,drLoc[0],drLoc[1],drLoc[2],psi,theta,phi,kFALSE);
+      fsymnameSDDl[iLadd]=TString(ladName);
+      fuidSDDl[iLadd]=0;
+      fxSDDl[iLadd]=x0/10.;
+      fySDDl[iLadd]=y0/10.;
+      fzSDDl[iLadd]=z0/10.;
+      fpsiSDDl[iLadd]=psi;
+      ftetSDDl[iLadd]=theta;
+      fphiSDDl[iLadd]=phi;
+      //      new((*fAlignObjArray)[240+iLadd]) AliAlignObjParams(fsymnameSDDl[iLadd].Data(), fuidSDDl[iLadd], 
+      //                                              fxSDDl[iLadd]  , fySDDl[iLadd]  , fzSDDl[iLadd]  , 
+      //                                              fpsiSDDl[iLadd], ftetSDDl[iLadd], fphiSDDl[iLadd], kFALSE);
+      //       printf("INDEX:   Ladder: %d\n",iLadd);
+      iLadd++;
+    }  // Ladder loop
+  }  // Layer loop
+}
+////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+
+
 
 //______________________________________________________________________
 void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSSDLadders(){
@@ -374,19 +740,19 @@ void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSSDLadders(){
   // 
   const Float_t kLaddLen5 = 90.27;  // Layer 5: distance between mouting points
   const Float_t kLaddLen6 = 102.0;  // Layer 6: distance between mouting points
-  const Float_t Z0 = 2.927;         // Distance between V mounting point and Zloc = 0
+  const Float_t zLag = 2.927;         // Distance between V mounting point and Zloc = 0
                                     // = half ladder length - nom z-position of ladder from gGeoManager
   const Float_t kMu2Cm = 1e-4;
 
   TString ssdName = "ITS/SSD";
 
-  TObjArray *ladd_points = fSurveyPoints;  
-  if (ladd_points == 0 || ladd_points->GetEntries() == 0) {
+  TObjArray *ladderPoints = fSurveyPoints;  
+  if (ladderPoints == 0 || ladderPoints->GetEntries() == 0) {
     AliWarning("No SSD Ladder alignment points found. Skipping");
     return;
   }
-  if (ladd_points->GetEntries()!= 2*(34+38)) {
-    AliWarning(Form("Unexpected number of survey points %d, should be 144",ladd_points->GetEntries())); 
+  if (ladderPoints->GetEntries()!= 2*(34+38)) {
+    AliWarning(Form("Unexpected number of survey points %d, should be 144",ladderPoints->GetEntries())); 
   }
   Int_t iLadd = 0;
   for (Int_t ilayer =  4; ilayer <=  5; ilayer ++) {
@@ -400,30 +766,30 @@ void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSSDLadders(){
       ladName += "/Ladder";
       ladName += iLadder;
 
-      AliSurveyPoint *v_point =  (AliSurveyPoint*) ladd_points->FindObject(ladName+"/V");
-      AliSurveyPoint *q_point =  (AliSurveyPoint*) ladd_points->FindObject(ladName+"/Q");
-      if (v_point == 0) {
+      AliSurveyPoint *vPoint =  (AliSurveyPoint*) ladderPoints->FindObject(ladName+"/V");
+      AliSurveyPoint *qPoint =  (AliSurveyPoint*) ladderPoints->FindObject(ladName+"/Q");
+      if (vPoint == 0) {
        AliWarning(Form("Cannot find V side point for ladder %s",ladName.Data()));
        continue;
       }
-      if (q_point == 0) {
+      if (qPoint == 0) {
        AliWarning(Form("Cannot find Q side point for ladder %s",ladName.Data()));
        continue;
       }
 
-      TString tmp_str;
-      tmp_str.Insert(0,v_point->GetName(),3);
-      Int_t ladder = tmp_str.Atoi();
-      tmp_str="";
-      tmp_str.Insert(0,q_point->GetName(),3);
-      if (tmp_str.Atoi() != ladder) 
-       AliError(Form("Survey data file error. Expect pairs of V,Q points. Got ladders %d %d",ladder,tmp_str.Atoi()));
+      TString tmpStr;
+      tmpStr.Insert(0,vPoint->GetName(),3);
+      Int_t ladder = tmpStr.Atoi();
+      tmpStr="";
+      tmpStr.Insert(0,qPoint->GetName(),3);
+      if (tmpStr.Atoi() != ladder) 
+       AliError(Form("Survey data file error. Expect pairs of V,Q points. Got ladders %d %d",ladder,tmpStr.Atoi()));
 
       // Note: file gives meas-nom in local offline coordinates, 
       // ie. local z = - global z and local x = - global x (for ladder 508, i.e. top ladder)
-      Double_t dx_loc = v_point->GetX() * kMu2Cm;
-      Double_t dy_loc = v_point->GetY() * kMu2Cm;
-      Double_t dz_loc = v_point->GetZ() * kMu2Cm;
+      Double_t dxLoc = vPoint->GetX() * kMu2Cm;
+      Double_t dyLoc = vPoint->GetY() * kMu2Cm;
+      Double_t dzLoc = vPoint->GetZ() * kMu2Cm;
 
       // rot around z-axis
       Double_t phi = 0;  // Not measured
@@ -436,30 +802,32 @@ void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjSSDLadders(){
       // V side is A side is large global z 
       // Q side is C side is large local z
 
+
       if (ladder >= 600) {
-       theta = TMath::ATan((q_point->GetX() - v_point->GetX())*kMu2Cm/kLaddLen6);
-       psi = TMath::ATan((v_point->GetY() - q_point->GetY())*kMu2Cm/kLaddLen6);
+       theta = TMath::ATan((qPoint->GetX() - vPoint->GetX())*kMu2Cm/kLaddLen6);
+       psi = TMath::ATan((vPoint->GetY() - qPoint->GetY())*kMu2Cm/kLaddLen6);
       }
       else {
-       theta = TMath::ATan((q_point->GetX() - v_point->GetX())*kMu2Cm/kLaddLen5);
-       psi = TMath::ATan((v_point->GetY() - q_point->GetY())*kMu2Cm/kLaddLen5);
+       theta = TMath::ATan((qPoint->GetX() - vPoint->GetX())*kMu2Cm/kLaddLen5);
+       psi = TMath::ATan((vPoint->GetY() - qPoint->GetY())*kMu2Cm/kLaddLen5);
       } 
 
       // Move along ladder to local Z = 0 point
-      dx_loc += Z0*theta;
-      dy_loc -= Z0*psi;
+      dxLoc += zLag*theta;
+      dyLoc -= zLag*psi;
 
       // Convert to degrees
-      theta *= 180./TMath::Pi();
-      psi *= 180./TMath::Pi();
-      AliDebug(1,Form("ladname %f %f %f %f %f %f ",dx_loc,dy_loc,dz_loc,psi,theta,phi));  
+      theta *= kRadToDeg;
+      psi *= kRadToDeg;
+      AliDebug(1,Form("ladname %f %f %f %f %f %f ",dxLoc,dyLoc,dzLoc,psi,theta,phi));  
       
-      new((*fAlignObjArray)[500+1698+iLadd]) AliAlignObjParams(ladName,0,dx_loc,dy_loc,dz_loc,psi,theta,phi,kFALSE);
+      new((*fAlignObjArray)[500+36+1698+iLadd]) AliAlignObjParams(ladName,0,dxLoc,dyLoc,dzLoc,psi,theta,phi,kFALSE);
 
       iLadd++;
     }  // Ladder loop
   }  // Layer loop
 }
+////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
 //______________________________________________________________________
 void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjDummySSDModules(){
@@ -474,7 +842,7 @@ void AliITSSurveyToAlign::CreateAlignObjDummySSDModules(){
     Int_t uid = AliGeomManager::LayerToVolUID(ilayer,imodule);
     const Char_t *symname = AliGeomManager::SymName(uid);
 
-    new((*fAlignObjArray)[500+imod]) AliAlignObjParams(symname, uid, 0., 0., 0., 0., 0., 0., kTRUE);
+    new((*fAlignObjArray)[500+36+imod]) AliAlignObjParams(symname, uid, 0., 0., 0., 0., 0., 0., kTRUE);
   }//module loop
 }
 
@@ -491,9 +859,11 @@ void AliITSSurveyToAlign::GetIdPosSDD(Int_t uid, Int_t layer, Int_t module, Int_
   TString ladderPath(pne->GetTitle());
   if(ladderPath.EndsWith("/")) ladderPath.Remove(TString::kTrailing,'/');
   ladderPath.Remove(ladderPath.Last('/'));
-  ladderPath.Remove(ladderPath.Last('/'));
+  //  ladderPath.Remove(ladderPath.Last('/'));
   gGeoManager->cd(ladderPath.Data());
   TGeoHMatrix gLad = *gGeoManager->GetCurrentMatrix(); // global matrix of ladder
+
+
   TGeoHMatrix rel = gMod; // to equal relative matrix ladder to sensor.
   TGeoHMatrix invgLad = gLad.Inverse();
   rel.MultiplyLeft(&invgLad);
@@ -509,12 +879,23 @@ void AliITSSurveyToAlign::GetIdPosSDD(Int_t uid, Int_t layer, Int_t module, Int_
   if((layer==4)&&(module<4)) rel.LocalToMaster(fgkLocR[iPoint],fSDDidP[iPoint]);
   if((layer==4)&&(module>3)) rel.LocalToMaster(fgkLocL[iPoint],fSDDidP[iPoint]);
 
-  for(Int_t i=0; i<3; i++) fSDDidP[iPoint][i]*=10;
-
+  for(Int_t i=0; i<3; i++) fSDDidP[iPoint][i]*=10; 
+  fSDDidP[iPoint][2]-=0.5205;
+
+  //  if(ladderPath.Data(),"/ALIC_1/ITSV_1/ITSsddLayer3_1/ITSsddLadd_3");
+  //  if(ladderPath.Contains("ITSsddLayer3_1") && (ladderPath.Contains("ITSsddLadd_3")|| ladderPath.Contains("ITSsddLadd_10")))
+  //  {
+  ///ALIC_1/ITSV_1/ITSsddLayer4_1/ITSsddLadd_5
+  ///ALIC_1/ITSV_1/ITSsddLayer4_1/ITSsddLadd_16
+  //  gLad.Print();
+  //  printf("%s  : Module# %d  Point# %d\n",ladderPath.Data(), module, iPoint);
+  //  printf("ID   {%f, %f, %f}\n", fSDDidP[iPoint][0],fSDDidP[iPoint][1],fSDDidP[iPoint][2]);
+  //  printf("Me   {%f, %f, %f}\n", fSDDmeP[iPoint][0],fSDDmeP[iPoint][1],fSDDmeP[iPoint][2]);
+  //  }
 }
 
 //______________________________________________________________________
-void AliITSSurveyToAlign::ReadPointNameSDD(const char str[], Int_t &iLayer, Int_t &iLader, Int_t &iModul, Int_t &iPoint)
+void AliITSSurveyToAlign::ReadPointNameSDD(const char str[], Int_t &iLayer, Int_t &iLader, Int_t &iModul, Int_t &iPoint) const
 {
   // 
   //    Utility function used by CreateAlignObjSDD
@@ -550,6 +931,46 @@ void AliITSSurveyToAlign::ReadPointNameSDD(const char str[], Int_t &iLayer, Int_
   if(str[16]=='8') {iLader=10*iLader+8; ord=1;}
   if(str[16]=='9') {iLader=10*iLader+9; ord=1;}
 
+  /*
+  //tmp solution
+  Int_t module=-1;
+  if(str[23+ord]=='0') module=0;
+  if(str[23+ord]=='1') module=1;
+  if(str[23+ord]=='2') module=2;
+  if(str[23+ord]=='3') module=3;
+  if(str[23+ord]=='4') module=4;
+  if(str[23+ord]=='5') module=5;
+  if(str[23+ord]=='6') module=6;
+  if(str[23+ord]=='7') module=7;
+  if(str[23+ord]=='8') module=8;
+  if(str[23+ord]=='9') module=9;
+
+  if(iLayer==3)
+    {
+      if(module==0) iModul= 5;
+      if(module==1) iModul= 4;
+      if(module==2) iModul= 3;
+      if(module==3) iModul= 2;
+      if(module==4) iModul= 1;
+      if(module==5) iModul= 0;
+    }
+
+
+  if(iLayer==4)
+    {
+      if(module==0) iModul= 7;
+      if(module==1) iModul= 6;
+      if(module==2) iModul= 5;
+      if(module==3) iModul= 4;
+      if(module==4) iModul= 3;
+      if(module==5) iModul= 2;
+      if(module==6) iModul= 1;
+      if(module==7) iModul= 0;
+    }
+
+  if(module<0) {printf("ERROR MOULE\n"); iModul=0;}
+  */
+
   if(str[23+ord]=='0') iModul=0;
   if(str[23+ord]=='1') iModul=1;
   if(str[23+ord]=='2') iModul=2;
@@ -561,12 +982,15 @@ void AliITSSurveyToAlign::ReadPointNameSDD(const char str[], Int_t &iLayer, Int_
   if(str[23+ord]=='8') iModul=8;
   if(str[23+ord]=='9') iModul=9;
 
+
   if((str[25+ord]=='R')&&(str[26+ord]=='D')) iPoint=0;
   if((str[25+ord]=='R')&&(str[26+ord]=='C')) iPoint=1;
   if((str[25+ord]=='R')&&(str[26+ord]=='U')) iPoint=2;
   if((str[25+ord]=='L')&&(str[26+ord]=='U')) iPoint=3;
   if((str[25+ord]=='L')&&(str[26+ord]=='C')) iPoint=4;
   if((str[25+ord]=='L')&&(str[26+ord]=='D')) iPoint=5;
+
+
   return;
 }
 
@@ -578,19 +1002,21 @@ void AliITSSurveyToAlign::ConvertToRSofModulesAndRotSDD(Int_t Layer, Int_t Modul
   //    Utility function used by CreateAlignObjSDD
   // 
 
-  Double_t YmId;
-  Double_t ZmId;
+  Double_t ymId;
+  Double_t zmId;
 
-  Double_t YmMe;
-  Double_t ZmMe;
-  Double_t YmMeE;
-  Double_t ZmMeE;
+  Double_t ymMe;
+  Double_t zmMe;
+  Double_t ymMeE;
+  Double_t zmMeE;
 
   Double_t x0=fSDDidP[1][0];
-  Double_t z0=fSDDidP[1][2]-0.52;
+  Double_t z0=fSDDidP[1][2];//-0.5205;
+  //  Double_t z0=fSDDidP[1][2]-0.5;
   for(Int_t i=0; i<6; i++)
     {
-      fSDDidP[i][2]-=0.52;
+      //      fSDDidP[i][2]-=0.5205;
+      //      fSDDidP[i][2]-=0.5;
 
       if(!fSDDisMe[i]) continue; 
 
@@ -599,25 +1025,25 @@ void AliITSSurveyToAlign::ConvertToRSofModulesAndRotSDD(Int_t Layer, Int_t Modul
       fSDDmeP[i][0]-=x0;
       fSDDmeP[i][2]-=z0;
                                
-      YmId=fSDDidP[i][1];
-      ZmId=fSDDidP[i][2];
+      ymId=fSDDidP[i][1];
+      zmId=fSDDidP[i][2];
                        
       fSDDidP[i][2]=fSDDidP[i][0];
-      fSDDidP[i][0]=YmId;
-      fSDDidP[i][1]=ZmId;
+      fSDDidP[i][0]=ymId;
+      fSDDidP[i][1]=zmId;
                        
-      YmMe=fSDDmeP[i][1];
-      ZmMe=fSDDmeP[i][2];
+      ymMe=fSDDmeP[i][1];
+      zmMe=fSDDmeP[i][2];
                        
-      YmMeE=fSDDmeP[i][4];
-      ZmMeE=fSDDmeP[i][5];
+      ymMeE=fSDDmeP[i][4];
+      zmMeE=fSDDmeP[i][5];
                        
       fSDDmeP[i][2]=fSDDmeP[i][0];
-      fSDDmeP[i][0]=YmMe;
-      fSDDmeP[i][1]=ZmMe;
+      fSDDmeP[i][0]=ymMe;
+      fSDDmeP[i][1]=zmMe;
       fSDDmeP[i][5]=fSDDmeP[i][3];
-      fSDDmeP[i][3]=YmMeE;
-      fSDDmeP[i][4]=ZmMeE;
+      fSDDmeP[i][3]=ymMeE;
+      fSDDmeP[i][4]=zmMeE;
                        
 
       if(((Layer==3)&&(Module>2))||((Layer==4)&&(Module>3)))
@@ -632,31 +1058,34 @@ void AliITSSurveyToAlign::ConvertToRSofModulesAndRotSDD(Int_t Layer, Int_t Modul
 
 
 //______________________________________________________________________
-void AliITSSurveyToAlign::CalcShiftSDD(Double_t &x0,Double_t &y0,Double_t &z0)
+void AliITSSurveyToAlign::CalcShiftSDD(Double_t &x0,Double_t &y0,Double_t &z0) const
 {
-  Double_t Xid, Yid, Zid;
-  Double_t Xme, Yme, Zme, sX2, sY2, sZ2;
+    // Calculates the 3 shifts for the present SDD module
+    // and sets the three reference arguments
+    //
+  Double_t xId, yId, zId;
+  Double_t xMe, yMe, zMe, sX2, sY2, sZ2;
   Double_t aX=0., bX=0.;
   Double_t aY=0., bY=0.;
   Double_t aZ=0., bZ=0.;
   for(Int_t iP1=0; iP1<6; iP1++)
     {
       if(!fSDDisMe[iP1]) continue;
-      Xid=fSDDidP[iP1][0];
-      Yid=fSDDidP[iP1][1];
-      Zid=fSDDidP[iP1][2];
-      Xme=fSDDmeP[iP1][0];
-      Yme=fSDDmeP[iP1][1];
-      Zme=fSDDmeP[iP1][2];
+      xId=fSDDidP[iP1][0];
+      yId=fSDDidP[iP1][1];
+      zId=fSDDidP[iP1][2];
+      xMe=fSDDmeP[iP1][0];
+      yMe=fSDDmeP[iP1][1];
+      zMe=fSDDmeP[iP1][2];
       sX2 =fSDDmeP[iP1][3]*fSDDmeP[iP1][3];
       sY2 =fSDDmeP[iP1][4]*fSDDmeP[iP1][4];
       sZ2 =fSDDmeP[iP1][5]*fSDDmeP[iP1][5];
       aX+=(1./sX2);
-      bX+=((Xme-Xid)/sX2); 
+      bX+=((xMe-xId)/sX2); 
       aY+=(1./sY2);
-      bY+=((Yme-Yid)/sY2); 
+      bY+=((yMe-yId)/sY2); 
       aZ+=(1./sZ2);
-      bZ+=((Zme-Zid)/sZ2); 
+      bZ+=((zMe-zId)/sZ2); 
     }
   Double_t x1 = bX/aX;
   Double_t x2 = bY/aY;
@@ -671,162 +1100,119 @@ void AliITSSurveyToAlign::CalcShiftSDD(Double_t &x0,Double_t &y0,Double_t &z0)
 //______________________________________________________________________
 void AliITSSurveyToAlign::CalcShiftRotSDD(Double_t &tet,Double_t &psi,Double_t &phi,Double_t &x0,Double_t &y0,Double_t &z0)
 {
-  TMatrixD p1(6,6);
-  TMatrixD p2(6,6);
-  TMatrixD p3(6,6);
-  TMatrixD p4(6,6);
-  TMatrixD p5(6,6);
-  TMatrixD p6(6,6);
+    // Calculates the 3 shifts and 3 euler angles for the present SDD module
+    // and sets the six reference arguments
+    //
   TMatrixD pC(6,6);
 
-  Double_t a11 =0.;
-  Double_t a12 =0.;
-  Double_t a13 =0.;
-  Double_t a14 =0.;
-  Double_t a15 =0.;
-  Double_t a16 =0.;
-
-  Double_t a21 =0.;
-  Double_t a22 =0.;
-  Double_t a23 =0.;
-  Double_t a24 =0.;
-  Double_t a25 =0.;
-  Double_t a26 =0.;
-
-  Double_t a31 =0.;
-  Double_t a32 =0.;
-  Double_t a33 =0.;
-  Double_t a34 =0.;
-  Double_t a35 =0.;
-  Double_t a36 =0.;
-
-  Double_t a41 =0.;
-  Double_t a42 =0.;
-  Double_t a43 =0.;
-  Double_t a44 =0.;
-  Double_t a45 =0.;
-  Double_t a46 =0.;
-
-  Double_t a51 =0.;
-  Double_t a52 =0.;
-  Double_t a53 =0.;
-  Double_t a54 =0.;
-  Double_t a55 =0.;
-  Double_t a56 =0.;
-
-  Double_t a61 =0.;
-  Double_t a62 =0.;
-  Double_t a63 =0.;
-  Double_t a64 =0.;
-  Double_t a65 =0.;
-  Double_t a66 =0.;
-
-  Double_t c1 =0.;
-  Double_t c2 =0.;
-  Double_t c3 =0.;
-  Double_t c4 =0.;
-  Double_t c5 =0.;
-  Double_t c6 =0.;
-
-  Double_t Xid, Yid, Zid;
-  Double_t Xme, Yme, Zme, sX2, sY2, sZ2;
+  Double_t a[6][6];
+  for(Int_t ii=0; ii<6; ii++){
+      for(Int_t jj=0; jj<6; jj++){
+         a[ii][jj]=0.;
+      }
+  }
+
+  Double_t c[6];
+  for(Int_t ii=0; ii<6; ii++)
+      c[ii]=0.;
+
+  Double_t xId, yId, zId;
+  Double_t xMe, yMe, zMe, sX2, sY2, sZ2;
+
+  //  printf("\n");
 
   for(Int_t iP1=0; iP1<=6; iP1++)
     {
       if(!fSDDisMe[iP1]) continue;
 
-      Xid= fSDDidP[iP1][0];
-      Yid= fSDDidP[iP1][1];
-      Zid= fSDDidP[iP1][2];
+      //ideal x,y,z for fiducial mark iP1
+      xId= fSDDidP[iP1][0];
+      yId= fSDDidP[iP1][1];
+      zId= fSDDidP[iP1][2];
 
-      Xme= fSDDmeP[iP1][0];
-      Yme= fSDDmeP[iP1][1];
-      Zme= fSDDmeP[iP1][2];
+      //measured x,y,z for fiducial mark iP1
+      xMe= fSDDmeP[iP1][0];
+      yMe= fSDDmeP[iP1][1];
+      zMe= fSDDmeP[iP1][2];
 
+
+
+      //squared precisions of measured x,y,z for fiducial mark iP1
       sX2 = fSDDmeP[iP1][3]* fSDDmeP[iP1][3];
       sY2 = fSDDmeP[iP1][4]* fSDDmeP[iP1][4];
       sZ2 = fSDDmeP[iP1][5]* fSDDmeP[iP1][5];
 
-      a11+=(Zid*Zid/sX2+Xid*Xid/sZ2);
-      a12-=(Zid*Yid/sX2);
-      a13-=(Xid*Yid/sZ2);
-      a14-=(Zid/sX2);
-      a15 =0.;
-      a16+=(Xid/sZ2);
-      c1+=(Xid*(Zme-Zid)/sZ2-Zid*(Xme-Xid)/sX2); 
-
-      a21-=(Yid*Zid/sX2);
-      a22+=(Xid*Xid/sY2+Yid*Yid/sX2);
-      a23-=(Xid*Zid/sY2);
-      a24+=(Yid/sX2);
-      a25-=(Xid/sY2);
-      a26 =0.;
-      c2+=(Yid*(Xme-Xid)/sX2-Xid*(Yme-Yid)/sY2); 
-
-      a31-=(Yid*Xid/sZ2);
-      a32-=(Xid*Zid/sY2);
-      a33+=(Zid*Zid/sY2+Yid*Yid/sZ2);
-      a34 =0.;
-      a35+=(Zid/sY2);
-      a36-=(Yid/sZ2);
-      c3+=(Zid*(Yme-Yid)/sY2-Yid*(Zme-Zid)/sZ2); 
-
-      a41-=(Zid/sX2);
-      a42+=(Yid/sX2);
-      a43 =0.;
-      a44+=(1./sX2);
-      a45 =0.;
-      a46 =0.;
-      c4+=((Xme-Xid)/sX2); 
-
-      a51 =0.;
-      a52-=(Xid/sY2);
-      a53+=(Zid/sY2);
-      a54 =0.;
-      a55+=(1./sY2);
-      a56 =0.;
-      c5+=((Yme-Yid)/sY2); 
-
-      a61+=(Xid/sZ2);
-      a62 =0.;
-      a63-=(Yid/sZ2);
-      a64 =0.;
-      a65 =0.;
-      a66+=(1./sZ2);
-      c6+=((Zme-Zid)/sZ2); 
+      a[0][0]+=(zId*zId/sX2+xId*xId/sZ2);
+      a[0][1]-=(zId*yId/sX2);
+      a[0][2]-=(xId*yId/sZ2);
+      a[0][3]-=(zId/sX2);
+      a[0][4] =0.;
+      a[0][5]+=(xId/sZ2);
+      c[0]+=(xId*(zMe-zId)/sZ2-zId*(xMe-xId)/sX2); 
+
+      a[1][0]-=(yId*zId/sX2);
+      a[1][1]+=(xId*xId/sY2+yId*yId/sX2);
+      a[1][2]-=(xId*zId/sY2);
+      a[1][3]+=(yId/sX2);
+      a[1][4]-=(xId/sY2);
+      a[1][5] =0.;
+      c[1]+=(yId*(xMe-xId)/sX2-xId*(yMe-yId)/sY2); 
+
+      a[2][0]-=(yId*xId/sZ2);
+      a[2][1]-=(xId*zId/sY2);
+      a[2][2]+=(zId*zId/sY2+yId*yId/sZ2);
+      a[2][3] =0.;
+      a[2][4]+=(zId/sY2);
+      a[2][5]-=(yId/sZ2);
+      c[2]+=(zId*(yMe-yId)/sY2-yId*(zMe-zId)/sZ2); 
+
+      a[3][0]-=(zId/sX2);
+      a[3][1]+=(yId/sX2);
+      a[3][2] =0.;
+      a[3][3]+=(1./sX2);
+      a[3][4] =0.;
+      a[3][5] =0.;
+      c[3]+=((xMe-xId)/sX2); 
+
+      a[4][0] =0.;
+      a[4][1]-=(xId/sY2);
+      a[4][2]+=(zId/sY2);
+      a[4][3] =0.;
+      a[4][4]+=(1./sY2);
+      a[4][5] =0.;
+      c[4]+=((yMe-yId)/sY2); 
+
+      a[5][0]+=(xId/sZ2);
+      a[5][1] =0.;
+      a[5][2]-=(yId/sZ2);
+      a[5][3] =0.;
+      a[5][4] =0.;
+      a[5][5]+=(1./sZ2);
+      c[5]+=((zMe-zId)/sZ2); 
     }
 
   ///////////////////////////////////////////////////////////////
 
-  Double_t dataC[]={a11, a12, a13, a14, a15, a16, a21, a22, a23, a24, a25, a26,
-                   a31, a32, a33, a34, a35, a36, a41, a42, a43, a44, a45, a46,
-                   a51, a52, a53, a54, a55, a56, a61, a62, a63, a64, a65, a66};
-  Double_t data1[]={c1, a12, a13, a14, a15, a16, c2, a22, a23, a24, a25, a26,
-                   c3, a32, a33, a34, a35, a36, c4, a42, a43, a44, a45, a46,
-                   c5, a52, a53, a54, a55, a56, c6, a62, a63, a64, a65, a66};
-  Double_t data2[]={a11, c1, a13, a14, a15, a16, a21, c2, a23, a24, a25, a26,
-                   a31, c3, a33, a34, a35, a36, a41, c4, a43, a44, a45, a46,
-                   a51, c5, a53, a54, a55, a56, a61, c6, a63, a64, a65, a66};
-  Double_t data3[]={a11, a12, c1, a14, a15, a16, a21, a22, c2, a24, a25, a26,
-                   a31, a32, c3, a34, a35, a36, a41, a42, c4, a44, a45, a46,
-                   a51, a52, c5, a54, a55, a56, a61, a62, c6, a64, a65, a66};
-  Double_t data4[]={a11, a12, a13, c1, a15, a16, a21, a22, a23, c2, a25, a26,
-                   a31, a32, a33, c3, a35, a36, a41, a42, a43, c4, a45, a46,
-                   a51, a52, a53, c5, a55, a56, a61, a62, a63, c6, a65, a66};
-  Double_t data5[]={a11, a12, a13, a14, c1, a16, a21, a22, a23, a24, c2, a26,
-                   a31, a32, a33, a34, c3, a36, a41, a42, a43, a44, c4, a46,
-                   a51, a52, a53, a54, c5, a56, a61, a62, a63, a64, c6, a66};
-  Double_t data6[]={a11, a12, a13, a14, a15, c1, a21, a22, a23, a24, a25, c2,
-                   a31, a32, a33, a34, a35, c3, a41, a42, a43, a44, a45, c4,
-                   a51, a52, a53, a54, a55, c5, a61, a62, a63, a64, a65, c6};
-
-  p1.SetMatrixArray(data1);
-  p2.SetMatrixArray(data2);
-  p3.SetMatrixArray(data3);
-  p4.SetMatrixArray(data4);
-  p5.SetMatrixArray(data5);
-  p6.SetMatrixArray(data6);
-  pC.SetMatrixArray(dataC);
+  pC.SetMatrixArray(&(a[0][0]));
+  TMatrixD p1(pC);
+  TMatrixD p2(pC);
+  TMatrixD p3(pC);
+  TMatrixD p4(pC);
+  TMatrixD p5(pC);
+  TMatrixD p6(pC);
+
+  for(Int_t raw=0; raw<6; raw++)
+      p1[raw][0]=c[raw];
+  for(Int_t raw=0; raw<6; raw++)
+      p2[raw][1]=c[raw];
+  for(Int_t raw=0; raw<6; raw++)
+      p3[raw][2]=c[raw];
+  for(Int_t raw=0; raw<6; raw++)
+      p4[raw][3]=c[raw];
+  for(Int_t raw=0; raw<6; raw++)
+      p5[raw][4]=c[raw];
+  for(Int_t raw=0; raw<6; raw++)
+      p6[raw][5]=c[raw];
 
   // cout << "calculating determinants" << endl;
   Double_t det0=pC.Determinant();
@@ -837,27 +1223,27 @@ void AliITSSurveyToAlign::CalcShiftRotSDD(Double_t &tet,Double_t &psi,Double_t &
   Double_t x5 = p5.Determinant()/det0;
   Double_t x6 = p6.Determinant()/det0;
   //cout << "calculating determinants done" << endl;
-  if (x1 == 0) {
+  if (TMath::Abs(x1) < 1.e-10) {
     AliInfo("p1 singular ");
     p1.Print();
   }
-  if (x2 == 0) {
+  if (TMath::Abs(x2) < 1.e-10) {
     AliInfo("p2 singular ");
     p2.Print();
   }
-  if (x3 == 0) {
+  if (TMath::Abs(x3) < 1.e-10) {
     AliInfo("p3 singular ");
     p3.Print();
   }
-  if (x4 == 0) {
+  if (TMath::Abs(x4) < 1.e-10) {
     AliInfo("p4 singular ");
     p4.Print();
   }
-  if (x5 == 0) {
+  if (TMath::Abs(x5) < 1.e-10) {
     AliInfo("p5 singular ");
     p5.Print();
   }
-  if (x6 == 0) {
+  if (TMath::Abs(x6) < 1.e-10) {
     AliInfo("p6 singular ");
     p6.Print();
   }
@@ -871,5 +1257,3 @@ void AliITSSurveyToAlign::CalcShiftRotSDD(Double_t &tet,Double_t &psi,Double_t &
   z0=x6;
   return;
 }
-
-