]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - ITS/AliITSTrackleterSPDEff.cxx
AddTaskFemto for train update
[u/mrichter/AliRoot.git] / ITS / AliITSTrackleterSPDEff.cxx
index f09e12f39a17e8676a0e2aa14603e68005e9e2c7..617eb171054af9082e1fe7660ab70df4d0fccfc8 100644 (file)
 #include <TFile.h>
 #include <TTree.h>
 #include <TParticle.h>
+#include <TParticlePDG.h>
 #include <TSystem.h>
 #include <Riostream.h>
 #include <TClonesArray.h>
 
-#include "AliITSMultReconstructor.h"
+#include "AliTracker.h"
 #include "AliITSTrackleterSPDEff.h"
 #include "AliITSgeomTGeo.h"
 #include "AliLog.h"
 #include "AliITSPlaneEffSPD.h"
 #include "AliStack.h"
 #include "AliTrackReference.h"
-
+#include "AliRunLoader.h"
+#include "AliITSReconstructor.h"
+#include "AliITSRecPoint.h"
+#include "AliESDEvent.h"
+#include "AliESDVertex.h"
 //____________________________________________________________________
 ClassImp(AliITSTrackleterSPDEff)
 
 
 //____________________________________________________________________
 AliITSTrackleterSPDEff::AliITSTrackleterSPDEff():
-AliITSMultReconstructor(),
+AliTracker(),
+//
+fClustersLay1(0),
+fClustersLay2(0),
+fTracklets(0),
+fAssociationFlag(0),
+fNClustersLay1(0),
+fNClustersLay2(0),
+fNTracklets(0),
+fOnlyOneTrackletPerC2(0),
+fPhiWindowL2(0),
+fZetaWindowL2(0),
+fPhiOverlapCut(0),
+fZetaOverlapCut(0),
+fHistOn(0),
+fhClustersDPhiAcc(0),
+fhClustersDThetaAcc(0),
+fhClustersDZetaAcc(0),
+fhClustersDPhiAll(0),
+fhClustersDThetaAll(0),
+fhClustersDZetaAll(0),
+fhDPhiVsDThetaAll(0),
+fhDPhiVsDThetaAcc(0),
+fhDPhiVsDZetaAll(0),
+fhDPhiVsDZetaAcc(0),
+fhetaTracklets(0),
+fhphiTracklets(0),
+fhetaClustersLay1(0),
+fhphiClustersLay1(0),
+//
 fAssociationFlag1(0),
 fChipPredOnLay2(0),
 fChipPredOnLay1(0),
@@ -59,14 +93,19 @@ fPhiWindowL1(0),
 fZetaWindowL1(0),
 fOnlyOneTrackletPerC1(0),
 fUpdateOncePerEventPlaneEff(0),
+fMinContVtx(0),
 fChipUpdatedInEvent(0),
 fPlaneEffSPD(0),
+fPlaneEffBkg(0),
+fReflectClusterAroundZAxisForLayer0(kFALSE),
+fReflectClusterAroundZAxisForLayer1(kFALSE),
+fLightBkgStudyInParallel(kFALSE),
 fMC(0),
 fUseOnlyPrimaryForPred(0),
 fUseOnlySecondaryForPred(0), 
 fUseOnlySameParticle(0),
 fUseOnlyDifferentParticle(0),
-fUseOnlyStableParticle(0),
+fUseOnlyStableParticle(1),
 fPredictionPrimary(0),
 fPredictionSecondary(0),
 fClusterPrimary(0),
@@ -90,10 +129,25 @@ fhDPhiVsDThetaInterpAcc(0),
 fhDPhiVsDZetaInterpAll(0),
 fhDPhiVsDZetaInterpAcc(0),
 fhetaClustersLay2(0),
-fhphiClustersLay2(0)
+fhphiClustersLay2(0),
+fhClustersInChip(0),
+fhClustersInModuleLay1(0),
+fhClustersInModuleLay2(0)
 {
    // default constructor
-
+// from AliITSMultReconstructor
+  Init();
+}
+//______________________________________________________________________
+void AliITSTrackleterSPDEff::Init() {
+  SetPhiWindowL2();
+  SetZetaWindowL2();
+  SetOnlyOneTrackletPerC2();
+  fClustersLay1       = new Float_t*[300000];
+  fClustersLay2       = new Float_t*[300000];
+  fTracklets          = new Float_t*[300000];
+  fAssociationFlag    = new Bool_t[300000];
+//
   SetPhiWindowL1();
   SetZetaWindowL1();
   SetOnlyOneTrackletPerC1();
@@ -104,6 +158,12 @@ fhphiClustersLay2(0)
   fChipUpdatedInEvent = new Bool_t[1200];
 
   for(Int_t i=0; i<300000; i++) {
+    // from AliITSMultReconstructor
+    fClustersLay1[i]       = new Float_t[6];
+    fClustersLay2[i]       = new Float_t[6];
+    fTracklets[i]          = new Float_t[5];
+    fAssociationFlag[i]    = kFALSE;
+    //
     fAssociationFlag1[i]   = kFALSE;
   }
   for(Int_t i=0;i<1200; i++) fChipUpdatedInEvent[i] = kFALSE;
@@ -111,9 +171,40 @@ fhphiClustersLay2(0)
   if (GetHistOn()) BookHistos();
 
   fPlaneEffSPD = new AliITSPlaneEffSPD();
+  SetLightBkgStudyInParallel();
 }
 //______________________________________________________________________
-AliITSTrackleterSPDEff::AliITSTrackleterSPDEff(const AliITSTrackleterSPDEff &mr) : AliITSMultReconstructor(mr),
+AliITSTrackleterSPDEff::AliITSTrackleterSPDEff(const AliITSTrackleterSPDEff &mr) :  
+AliTracker(mr),
+// from AliITSMultReconstructor
+fClustersLay1(mr.fClustersLay1),
+fClustersLay2(mr.fClustersLay2),
+fTracklets(mr.fTracklets),
+fAssociationFlag(mr.fAssociationFlag),
+fNClustersLay1(mr.fNClustersLay1),
+fNClustersLay2(mr.fNClustersLay2),
+fNTracklets(mr.fNTracklets),
+fOnlyOneTrackletPerC2(mr.fOnlyOneTrackletPerC2),
+fPhiWindowL2(mr.fPhiWindowL2),
+fZetaWindowL2(mr.fZetaWindowL2),
+fPhiOverlapCut(mr.fPhiOverlapCut),
+fZetaOverlapCut(mr.fZetaOverlapCut),
+fHistOn(mr.fHistOn),
+fhClustersDPhiAcc(mr.fhClustersDPhiAcc),
+fhClustersDThetaAcc(mr.fhClustersDThetaAcc),
+fhClustersDZetaAcc(mr.fhClustersDZetaAcc),
+fhClustersDPhiAll(mr.fhClustersDPhiAll),
+fhClustersDThetaAll(mr.fhClustersDThetaAll),
+fhClustersDZetaAll(mr.fhClustersDZetaAll),
+fhDPhiVsDThetaAll(mr.fhDPhiVsDThetaAll),
+fhDPhiVsDThetaAcc(mr.fhDPhiVsDThetaAcc),
+fhDPhiVsDZetaAll(mr.fhDPhiVsDZetaAll),
+fhDPhiVsDZetaAcc(mr.fhDPhiVsDZetaAcc),
+fhetaTracklets(mr.fhetaTracklets),
+fhphiTracklets(mr.fhphiTracklets),
+fhetaClustersLay1(mr.fhetaClustersLay1),
+fhphiClustersLay1(mr.fhphiClustersLay1),
+//
 fAssociationFlag1(mr.fAssociationFlag1),
 fChipPredOnLay2(mr.fChipPredOnLay2),
 fChipPredOnLay1(mr.fChipPredOnLay1),
@@ -122,8 +213,13 @@ fPhiWindowL1(mr.fPhiWindowL1),
 fZetaWindowL1(mr.fZetaWindowL1),
 fOnlyOneTrackletPerC1(mr.fOnlyOneTrackletPerC1),
 fUpdateOncePerEventPlaneEff(mr.fUpdateOncePerEventPlaneEff),
+fMinContVtx(mr.fMinContVtx),
 fChipUpdatedInEvent(mr.fChipUpdatedInEvent),
 fPlaneEffSPD(mr.fPlaneEffSPD),
+fPlaneEffBkg(mr.fPlaneEffBkg),
+fReflectClusterAroundZAxisForLayer0(mr.fReflectClusterAroundZAxisForLayer0),
+fReflectClusterAroundZAxisForLayer1(mr.fReflectClusterAroundZAxisForLayer1),
+fLightBkgStudyInParallel(mr.fLightBkgStudyInParallel),
 fMC(mr.fMC),
 fUseOnlyPrimaryForPred(mr.fUseOnlyPrimaryForPred),
 fUseOnlySecondaryForPred(mr.fUseOnlySecondaryForPred),
@@ -153,7 +249,10 @@ fhDPhiVsDThetaInterpAcc(mr.fhDPhiVsDThetaInterpAcc),
 fhDPhiVsDZetaInterpAll(mr.fhDPhiVsDZetaInterpAll),
 fhDPhiVsDZetaInterpAcc(mr.fhDPhiVsDZetaInterpAcc),
 fhetaClustersLay2(mr.fhetaClustersLay2),
-fhphiClustersLay2(mr.fhphiClustersLay2)
+fhphiClustersLay2(mr.fhphiClustersLay2),
+fhClustersInChip(mr.fhClustersInChip),
+fhClustersInModuleLay1(mr.fhClustersInModuleLay1),
+fhClustersInModuleLay2(mr.fhClustersInModuleLay2)
 {
   // Copy constructor
 }
@@ -168,7 +267,18 @@ AliITSTrackleterSPDEff& AliITSTrackleterSPDEff::operator=(const AliITSTrackleter
 //______________________________________________________________________
 AliITSTrackleterSPDEff::~AliITSTrackleterSPDEff(){
   // Destructor
-
+// from AliITSMultReconstructor
+ // delete arrays
+  for(Int_t i=0; i<300000; i++) {
+    delete [] fClustersLay1[i];
+    delete [] fClustersLay2[i];
+    delete [] fTracklets[i];
+  }
+  delete [] fClustersLay1;
+  delete [] fClustersLay2;
+  delete [] fTracklets;
+  delete [] fAssociationFlag;
+//
   // delete histograms
   DeleteHistos();
 
@@ -194,28 +304,49 @@ AliITSTrackleterSPDEff::~AliITSTrackleterSPDEff(){
 
   // delete PlaneEff
   delete fPlaneEffSPD;
+  fPlaneEffSPD=0;
+  if(fPlaneEffBkg) {
+    delete fPlaneEffBkg;
+    fPlaneEffBkg=0;
+
+  }
 }
 //____________________________________________________________________
 void
-AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*, AliStack *pStack, TTree *tRef) {
+AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(AliStack *pStack, TTree *tRef, Bool_t lbkg) {
   //
-  // - calls LoadClusterArray that finds the position of the clusters
-  //   (in global coord) 
-  // - convert the cluster coordinates to theta, phi (seen from the
-  //   interaction vertex). Find the extrapolation/interpolation point.
+  // - you have to take care of the following, before of using Reconstruct
+  //   1) call LoadClusters(TTree* cl) that finds the position of the clusters (in global coord)
+  //   and  convert the cluster coordinates to theta, phi (seen from the
+  //   interaction vertex). 
+  //   2) call SetVertex(vtxPos, vtxErr) which set the position of the vertex
+  // - Find the extrapolation/interpolation point.
   // - Find the chip corresponding to that
   // - Check if there is a cluster near that point  
   //
-
   // reset counters
-  fNClustersLay1 = 0;
-  fNClustersLay2 = 0;
+  if(lbkg && !GetLightBkgStudyInParallel()) {
+    AliError("You asked for lightBackground in the Reconstruction without proper call to SetLightBkgStudyInParallel(1)"); 
+    return;
+  }
+  AliITSPlaneEffSPD *pe;
+  if(lbkg) {
+    pe=fPlaneEffBkg;
+  } else {
+    pe=fPlaneEffSPD;
+  }
   fNTracklets = 0; 
-  fNSingleCluster = 0; 
-  // loading the clusters 
-  LoadClusterArrays(clusterTree);
-  if(fMC && !pStack) {AliError("You asked for MC infos but AliStack not properly loaded"); return;}
-  if(fMC && !tRef) {AliError("You asked for MC infos but TrackRef Tree not properly loaded"); return;}
+  // retrieve the vertex position
+  Float_t vtx[3];
+  vtx[0]=(Float_t)GetX();
+  vtx[1]=(Float_t)GetY();
+  vtx[2]=(Float_t)GetZ();
+  // to study residual background (i.e. contribution from TT' to measured efficiency) 
+  if(fReflectClusterAroundZAxisForLayer0 && !lbkg) ReflectClusterAroundZAxisForLayer(0);
+  if(fReflectClusterAroundZAxisForLayer1 && !lbkg) ReflectClusterAroundZAxisForLayer(1);
+  //
+  if(fMC && !pStack && !lbkg) {AliError("You asked for MC infos but AliStack not properly loaded"); return;}
+  if(fMC && !tRef   && !lbkg) {AliError("You asked for MC infos but TrackRef Tree not properly loaded"); return;}
   Bool_t found;
   Int_t nfTraPred1=0;  Int_t ntTraPred1=0;
   Int_t nfTraPred2=0;  Int_t ntTraPred2=0;
@@ -256,12 +387,13 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
     fChipPredOnLay2[iC1] = key;
     fAssociationFlag1[iC1] = kFALSE;
  
-    if (fHistOn) {
+    if (fHistOn && !lbkg) {
       Float_t eta=fClustersLay1[iC1][0];
       eta= TMath::Tan(eta/2.);
       eta=-TMath::Log(eta);
-      fhetaClustersLay1->Fill(eta);    
+      fhetaClustersLay1->Fill(eta);
       fhphiClustersLay1->Fill(fClustersLay1[iC1][1]);
+      fhClustersInChip->Fill(fhClustersInChip->GetBinCenter(key+1)); // if found=kFALSE -> overflow
     }      
   }
   // Loop on layer 2 : finding theta, phi and r   
@@ -288,12 +420,13 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
     fChipPredOnLay1[iC2] = key;
     fAssociationFlag[iC2] = kFALSE;
  
-    if (fHistOn) {
+    if (fHistOn && !lbkg) {
       Float_t eta=fClustersLay2[iC2][0];
       eta= TMath::Tan(eta/2.);
       eta=-TMath::Log(eta);
       fhetaClustersLay2->Fill(eta);
       fhphiClustersLay2->Fill(fClustersLay2[iC2][1]);
+      fhClustersInChip->Fill(fhClustersInChip->GetBinCenter(key+1)); // if found=kFALSE -> overflow
     }
   }  
   
@@ -317,7 +450,7 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
 
     // in any case, if MC has been required, store statistics of primaries and secondaries
     Bool_t primary=kFALSE; Bool_t secondary=kFALSE; // it is better to have both since chip might not be found
-    if (fMC) {
+    if (fMC && !lbkg) {
        Int_t lab1=(Int_t)fClustersLay1[iC1][3];
        Int_t lab2=(Int_t)fClustersLay1[iC1][4];
        Int_t lab3=(Int_t)fClustersLay1[iC1][5];
@@ -370,7 +503,7 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
        Float_t r2    = fClustersLay2[iC2][2]/TMath::Cos(fClustersLay2[iC2][0]);
         Float_t dZeta = TMath::Cos(fClustersLay1[iC1][0])*r2 - fClustersLay2[iC2][2];
 
-       if (fHistOn) {
+       if (fHistOn && !lbkg) {
          fhClustersDPhiAll->Fill(dPhi);    
          fhClustersDThetaAll->Fill(dTheta);    
          fhClustersDZetaAll->Fill(dZeta);    
@@ -379,8 +512,8 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
        }
 
        // make "elliptical" cut in Phi and Zeta! 
-       Float_t d = TMath::Sqrt(dPhi*dPhi/fPhiWindow/fPhiWindow + 
-                                dZeta*dZeta/fZetaWindow/fZetaWindow);
+       Float_t d = TMath::Sqrt(dPhi*dPhi/fPhiWindowL2/fPhiWindowL2 + 
+                                dZeta*dZeta/fZetaWindowL2/fZetaWindowL2);
 
        if (d>1) continue;      
        
@@ -397,7 +530,7 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
     
     if (distmin<100) { // This means that a cluster in layer 2 was found that matches with iC1
 
-      if (fHistOn) {
+      if (fHistOn && !lbkg) {
        fhClustersDPhiAcc->Fill(dPhimin);
        fhClustersDThetaAcc->Fill(dThetamin);    
        fhClustersDZetaAcc->Fill(dZetamin);    
@@ -441,7 +574,7 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
         fTracklets[fNTracklets][3] = -2;
       }
 
-      if (fHistOn) {
+      if (fHistOn && !lbkg) {
        Float_t eta=fTracklets[fNTracklets][0];
        eta= TMath::Tan(eta/2.);
        eta=-TMath::Log(eta);
@@ -459,7 +592,7 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
       nfClu2+=(Int_t)found; // this for debugging purpose
       ntClu2++;             // to check efficiency of the method FindChip
       if(key<1200) { // the Chip has been found
-        if(fMC) { // this part only for MC
+        if(fMC && !lbkg) { // this part only for MC
           // Int_t labc1=(Int_t)fClustersLay2[iC2WithBestDist][3];
           // Int_t labc2=(Int_t)fClustersLay2[iC2WithBestDist][4];
           // Int_t labc3=(Int_t)fClustersLay2[iC2WithBestDist][5];
@@ -473,17 +606,17 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
 
         if (key==fChipPredOnLay2[iC1]) { // this control seems too loose: has to be checked !
                                         // OK, success
-                fPlaneEffSPD->UpDatePlaneEff(kTRUE,key); // success
+                pe->UpDatePlaneEff(kTRUE,key); // success
                 fChipUpdatedInEvent[key]=kTRUE; 
-                if(fMC) {
+                if(fMC && !lbkg) {
                   if(primary)   fSuccessP[key]++;
                   if(secondary) fSuccessS[key]++;
                 }
         }
         else {
-                fPlaneEffSPD->UpDatePlaneEff(kTRUE,key); // this should not be a failure
+                pe->UpDatePlaneEff(kTRUE,key); // this should not be a failure
                 fChipUpdatedInEvent[key]=kTRUE;          // (might be in the tracking tollerance)
-                if(fMC) {
+                if(fMC && !lbkg) {
                   if(primary)   fSuccessP[key]++;
                   if(secondary) fSuccessS[key]++;
                 }
@@ -494,9 +627,9 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
 
     } // if any cluster found --> increment statistics by 1 failure (provided you have chip prediction)
     else if (fChipPredOnLay2[iC1]<1200) {
-      fPlaneEffSPD->UpDatePlaneEff(kFALSE,fChipPredOnLay2[iC1]);
+      pe->UpDatePlaneEff(kFALSE,fChipPredOnLay2[iC1]);
       fChipUpdatedInEvent[fChipPredOnLay2[iC1]]=kTRUE;
-      if(fMC) {
+      if(fMC && !lbkg) {
         if(primary)   fFailureP[fChipPredOnLay2[iC1]]++;
         if(secondary) fFailureS[fChipPredOnLay2[iC1]]++;
       }
@@ -525,7 +658,7 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
 
     // in any case, if MC has been required, store statistics of primaries and secondaries
     Bool_t primary=kFALSE; Bool_t secondary=kFALSE;
-    if (fMC) {
+    if (fMC && !lbkg) {
        Int_t lab1=(Int_t)fClustersLay2[iC2][3];
        Int_t lab2=(Int_t)fClustersLay2[iC2][4];
        Int_t lab3=(Int_t)fClustersLay2[iC2][5];
@@ -580,7 +713,7 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
         Float_t dZeta = TMath::Cos(fClustersLay2[iC2][0])*r1 - fClustersLay1[iC1][2];
 
 
-       if (fHistOn) {
+       if (fHistOn && !lbkg) {
          fhClustersDPhiInterpAll->Fill(dPhi);    
          fhClustersDThetaInterpAll->Fill(dTheta);    
          fhClustersDZetaInterpAll->Fill(dZeta);    
@@ -606,7 +739,7 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
     
     if (distmin<100) { // This means that a cluster in layer 1 was found that matches with iC2
 
-      if (fHistOn) {
+      if (fHistOn && !lbkg) {
        fhClustersDPhiInterpAcc->Fill(dPhimin);
        fhClustersDThetaInterpAcc->Fill(dThetamin);    
        fhClustersDZetaInterpAcc->Fill(dZetamin);    
@@ -660,7 +793,7 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
       nfClu1+=(Int_t)found; // this for debugging purpose
       ntClu1++;             // to check efficiency of the method FindChip
       if(key<1200) {
-        if(fMC) { // this part only for MC
+        if(fMC && !lbkg) { // this part only for MC
           // Int_t labc1=(Int_t)fClustersLay1[iC1WithBestDist][3];
           // Int_t labc2=(Int_t)fClustersLay1[iC1WithBestDist][4];
           // Int_t labc3=(Int_t)fClustersLay1[iC1WithBestDist][5];
@@ -674,16 +807,16 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
 
         if (key==fChipPredOnLay1[iC2]) { // this control seems too loose: has to be checked !
                                         // OK, success
-                fPlaneEffSPD->UpDatePlaneEff(kTRUE,key); // success
+                pe->UpDatePlaneEff(kTRUE,key); // success
                 fChipUpdatedInEvent[key]=kTRUE;
-                if(fMC) {
+                if(fMC && !lbkg) {
                   if(primary)   fSuccessP[key]++;
                   if(secondary) fSuccessS[key]++;
                 }
         } else {
-                fPlaneEffSPD->UpDatePlaneEff(kTRUE,key); // this should not be a failure
+                pe->UpDatePlaneEff(kTRUE,key); // this should not be a failure
                 fChipUpdatedInEvent[key]=kTRUE;          // (might be in the tracking tollerance)
-                if(fMC) {
+                if(fMC && !lbkg) {
                   if(primary)   fSuccessP[key]++;
                   if(secondary) fSuccessS[key]++;
                 }
@@ -694,9 +827,9 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
 
     } // if no cluster found --> increment statistics by 1 failure (provided you have chip prediction)
     else if (fChipPredOnLay1[iC2]<1200) {
-      fPlaneEffSPD->UpDatePlaneEff(kFALSE,fChipPredOnLay1[iC2]);
+      pe->UpDatePlaneEff(kFALSE,fChipPredOnLay1[iC2]);
       fChipUpdatedInEvent[fChipPredOnLay1[iC2]]=kTRUE;
-      if(fMC) {
+      if(fMC && !lbkg) {
         if(primary)   fFailureP[fChipPredOnLay1[iC2]]++;
         if(secondary) fFailureS[fChipPredOnLay1[iC2]]++;
       }
@@ -710,7 +843,7 @@ AliITSTrackleterSPDEff::Reconstruct(TTree* clusterTree, Float_t* vtx, Float_t*,
   AliDebug(1,Form(("Eff. of method FindChip for Cluster on lay 2 = %d / %d"),nfClu2,ntClu2));
 }
 //____________________________________________________________________
-Bool_t AliITSTrackleterSPDEff::FindChip(UInt_t &key, Int_t layer,  Float_t* vtx, 
+Bool_t AliITSTrackleterSPDEff::FindChip(UInt_t &key, Int_t layer,const  Float_t* vtx, 
                                   Float_t thetaVtx, Float_t phiVtx, Float_t zVtx) {
 //
 // Input: a) layer number in the range [0,1]
@@ -731,7 +864,10 @@ Bool_t AliITSTrackleterSPDEff::FindChip(UInt_t &key, Int_t layer,  Float_t* vtx,
   Double_t zAbs,phiAbs; // those are the polar coordinate, in the Absolute ALICE Reference 
                         // of the intersection of the tracklet with the pixel layer.  
   if (TMath::Abs(zVtx)<100) zAbs=zVtx + vtx[2]; // this is fine only for the cluster, not for the track prediction
-  else zAbs=r/TMath::Tan(thetaVtx) + vtx[2]; // this is the only way to do for the tracklet prediction
+  else {
+    if(TMath::Abs(thetaVtx)<1E-6) return kFALSE;
+    zAbs=r/TMath::Tan(thetaVtx) + vtx[2]; // this is the only way to do for the tracklet prediction
+  }
   AliDebug(1,Form("FindChip: vtx[0] = %f, vtx[1] = %f, vtx[2] = %f",vtx[0],vtx[1],vtx[2]));
   Double_t vtxy[2]={vtx[0],vtx[1]};
   if (vtxy[0]*vtxy[1]+vtxy[1]*vtxy[1]>0) { // this method holds only for displaced vertices 
@@ -880,7 +1016,7 @@ phi=TMath::ATan2(pP[1],pP[0]);
 return kTRUE;
 }
 //___________________________________________________________
-Bool_t AliITSTrackleterSPDEff::SetAngleRange02Pi(Double_t &angle) {
+Bool_t AliITSTrackleterSPDEff::SetAngleRange02Pi(Double_t &angle) const {
 //
 //  simple method to reduce all angles (in rad)
 //  in range [0,2pi[
@@ -900,7 +1036,7 @@ Bool_t AliITSTrackleterSPDEff::PrimaryTrackChecker(Int_t ipart,AliStack* stack)
 //  AliStack::IsPhysicalPrimary() (note that there also Sigma0 are considered as 
 //  a stable particle: it has no effect on this analysis). 
 //  This method can be called only for MC events, where Kinematics is available.
-//  if fUseOnlyStableParticle is kTRUE (via SetseOnlyStableParticle) then it 
+//  if fUseOnlyStableParticle is kTRUE (via SetUseOnlyStableParticle) then it 
 //  returns kTRUE if also AliITSTrackleterSPDEff::DecayingTrackChecker() return 0.
 //  The latter (see below) try to verify if a primary particle is also "detectable".
 //
@@ -1021,6 +1157,52 @@ for(Int_t i=0; i<1200; i++) {
 }
 return;
 }
+//_________________________________________________________________
+void AliITSTrackleterSPDEff::DeletePredictionMC() {
+//
+// this method deallocate memory for the MC related informations
+// all the counters are set to 0
+//
+//
+if(fMC) {AliInfo("This method works only if fMC=kTRUE"); return;}
+if(fPredictionPrimary) {
+  delete fPredictionPrimary; fPredictionPrimary=0;
+}
+if(fPredictionSecondary) {
+  delete fPredictionSecondary; fPredictionSecondary=0;
+}
+if(fClusterPrimary) {
+  delete fClusterPrimary; fClusterPrimary=0;
+}
+if(fClusterSecondary) {
+  delete fClusterSecondary; fClusterSecondary=0;
+}
+if(fSuccessPP) {
+  delete fSuccessPP; fSuccessPP=0;
+}
+if(fSuccessTT) {
+  delete fSuccessTT; fSuccessTT=0;
+}
+if(fSuccessS) {
+  delete fSuccessS; fSuccessS=0;
+}
+if(fSuccessP) {
+  delete fSuccessP; fSuccessP=0;
+}
+if(fFailureS) {
+  delete fFailureS; fFailureS=0;
+}
+if(fFailureP) {
+  delete fFailureP; fFailureP=0;
+}
+if(fRecons) {
+  delete fRecons; fRecons=0;
+}
+if(fNonRecons) {
+  delete fNonRecons; fNonRecons=0;
+}
+return;
+}
 //______________________________________________________________________
 Int_t AliITSTrackleterSPDEff::GetPredictionPrimary(const UInt_t key) const {
 //
@@ -1193,9 +1375,11 @@ void AliITSTrackleterSPDEff::PrintAscii(ostream *os)const{
     //   none.
     // Return:
     //   none.
-    *os << fPhiWindowL1 <<" "<< fZetaWindowL1 << " " << fPhiWindow <<" "<< fZetaWindow 
+    *os << fPhiWindowL1 <<" "<< fZetaWindowL1 << " " << fPhiWindowL2 <<" "<< fZetaWindowL2 
         << " " << fOnlyOneTrackletPerC1 << " " << fOnlyOneTrackletPerC2 
-        << " " << fUpdateOncePerEventPlaneEff ;
+        << " " << fUpdateOncePerEventPlaneEff << " " << fMinContVtx 
+        << " " << fReflectClusterAroundZAxisForLayer0
+        << " " << fReflectClusterAroundZAxisForLayer1;
     *os << " " << fMC;
     if(!fMC) {AliInfo("Writing only cuts, no MC info"); return;}
     *os << " " << fUseOnlyPrimaryForPred << " " << fUseOnlySecondaryForPred
@@ -1225,26 +1409,33 @@ void AliITSTrackleterSPDEff::ReadAscii(istream *is){
     // Return:
     //   none.
 
-    *is >> fPhiWindowL1 >> fZetaWindowL1 >> fPhiWindow >> fZetaWindow 
+    Bool_t tmp= fMC;
+    *is >> fPhiWindowL1 >> fZetaWindowL1 >> fPhiWindowL2 >> fZetaWindowL2 
         >> fOnlyOneTrackletPerC1 >> fOnlyOneTrackletPerC2  
-        >> fUpdateOncePerEventPlaneEff ;
+        >> fUpdateOncePerEventPlaneEff >> fMinContVtx 
+        >> fReflectClusterAroundZAxisForLayer0
+        >> fReflectClusterAroundZAxisForLayer1;
+    //if(!fMC) {AliInfo("Reading only cuts, no MC info available");return;}
     *is >> fMC;
-    if(!fMC) {AliInfo("Reading only cuts, no MC info available");return;}
-    *is >> fUseOnlyPrimaryForPred >> fUseOnlySecondaryForPred
-        >> fUseOnlySameParticle   >> fUseOnlyDifferentParticle
-        >> fUseOnlyStableParticle;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fPredictionPrimary[i] ;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fPredictionSecondary[i] ;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fClusterPrimary[i] ;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fClusterSecondary[i] ;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fSuccessPP[i] ;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fSuccessTT[i] ;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fSuccessS[i] ;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fSuccessP[i] ;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fFailureS[i] ;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fFailureP[i] ;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fRecons[i] ;
-    for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fNonRecons[i] ;
+    if(!fMC) {AliInfo("Reading only cuts, no MC info"); if(tmp) SetMC(kFALSE); }
+    else {
+      if(!tmp) {AliInfo("Calling SetMC() to read this file wtih MC info"); SetMC();}
+      *is >> fUseOnlyPrimaryForPred >> fUseOnlySecondaryForPred
+          >> fUseOnlySameParticle   >> fUseOnlyDifferentParticle
+          >> fUseOnlyStableParticle;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fPredictionPrimary[i] ;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fPredictionSecondary[i] ;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fClusterPrimary[i] ;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fClusterSecondary[i] ;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fSuccessPP[i] ;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fSuccessTT[i] ;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fSuccessS[i] ;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fSuccessP[i] ;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fFailureS[i] ;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fFailureP[i] ;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fRecons[i] ;
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++) *is >> fNonRecons[i] ;
+    } 
     return;
 }
 //______________________________________________________________________
@@ -1279,7 +1470,7 @@ istream &operator>>(istream &is,AliITSTrackleterSPDEff &s){
 //______________________________________________________________________
 void AliITSTrackleterSPDEff::SavePredictionMC(TString filename) const {
 //
-// This Method write into an asci file (do not know why binary does not work)
+// This Method write into an either asci or root file 
 // the used cuts and the statistics  of the MC related quantities
 // The method SetMC() has to be called before 
 // Input TString filename: name of file for output (it deletes already existing 
@@ -1287,10 +1478,80 @@ void AliITSTrackleterSPDEff::SavePredictionMC(TString filename) const {
 // Output: none
 //
 //
- if(!fMC) {CallWarningMC(); return;}
- ofstream out(filename.Data(),ios::out | ios::binary);
- out << *this;
- out.close();
+ //if(!fMC) {CallWarningMC(); return;}
+ if (!filename.Contains(".root")) {
+   ofstream out(filename.Data(),ios::out | ios::binary);
+   out << *this;
+   out.close();
+   return;
+ }
+ else {
+    TFile* mcfile = TFile::Open(filename, "RECREATE");
+    TH1F* cuts = new TH1F("cuts", "list of cuts", 11, 0, 11); // TH1I containing cuts 
+    cuts->SetBinContent(1,fPhiWindowL1);
+    cuts->SetBinContent(2,fZetaWindowL1);
+    cuts->SetBinContent(3,fPhiWindowL2);
+    cuts->SetBinContent(4,fZetaWindowL2);
+    cuts->SetBinContent(5,fOnlyOneTrackletPerC1);
+    cuts->SetBinContent(6,fOnlyOneTrackletPerC2);
+    cuts->SetBinContent(7,fUpdateOncePerEventPlaneEff);
+    cuts->SetBinContent(8,fMinContVtx);
+    cuts->SetBinContent(9,fReflectClusterAroundZAxisForLayer0);
+    cuts->SetBinContent(10,fReflectClusterAroundZAxisForLayer1);
+    cuts->SetBinContent(11,fMC);
+    cuts->Write();
+    delete cuts;
+    if(!fMC) {AliInfo("Writing only cuts, no MC info");}
+    else {
+      TH1C* mc0 = new TH1C("mc0", "mc cuts", 5, 0, 5);
+      mc0->SetBinContent(1,fUseOnlyPrimaryForPred);
+      mc0->SetBinContent(2,fUseOnlySecondaryForPred);
+      mc0->SetBinContent(3,fUseOnlySameParticle);
+      mc0->SetBinContent(4,fUseOnlyDifferentParticle);
+      mc0->SetBinContent(5,fUseOnlyStableParticle);
+      mc0->Write();
+      delete mc0;
+      TH1I *mc1;
+      mc1 = new TH1I("mc1", "mc info PredictionPrimary", 1200, 0, 1200); 
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetPredictionPrimary(i)) ;
+      mc1->Write();
+      mc1 = new TH1I("mc2", "mc info PredictionSecondary", 1200, 0, 1200); 
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetPredictionSecondary(i)) ;
+      mc1->Write();
+      mc1 = new TH1I("mc3", "mc info ClusterPrimary", 1200, 0, 1200); 
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetClusterPrimary(i)) ;
+      mc1->Write();
+      mc1 = new TH1I("mc4", "mc info ClusterSecondary", 1200, 0, 1200);
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetClusterSecondary(i)) ;
+      mc1->Write();
+      mc1 = new TH1I("mc5", "mc info SuccessPP", 1200, 0, 1200);
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetSuccessPP(i)) ;
+      mc1->Write();
+      mc1 = new TH1I("mc6", "mc info SuccessTT", 1200, 0, 1200);
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetSuccessTT(i)) ;
+      mc1->Write();
+      mc1 = new TH1I("mc7", "mc info SuccessS", 1200, 0, 1200);
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetSuccessS(i)) ;
+      mc1->Write();
+      mc1 = new TH1I("mc8", "mc info SuccessP", 1200, 0, 1200);
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetSuccessP(i)) ;
+      mc1->Write();
+      mc1 = new TH1I("mc9", "mc info FailureS", 1200, 0, 1200);
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetFailureS(i)) ;
+      mc1->Write();
+      mc1 = new TH1I("mc10", "mc info FailureP", 1200, 0, 1200);
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetFailureP(i)) ;
+      mc1->Write();
+      mc1 = new TH1I("mc11", "mc info Recons", 1200, 0, 1200);
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetRecons(i)) ;
+      mc1->Write();
+      mc1 = new TH1I("mc12", "mc info NonRecons", 1200, 0, 1200);
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  mc1->SetBinContent(i+1,GetNonRecons(i)) ;
+      mc1->Write();
+      delete mc1;
+   }
+   mcfile->Close();
+ }
 return;
 }
 //____________________________________________________________________
@@ -1303,15 +1564,70 @@ void AliITSTrackleterSPDEff::ReadPredictionMC(TString filename) {
 // Output: none
 //
 //
- if(!fMC) {CallWarningMC(); return;}
//if(!fMC) {CallWarningMC(); return;}
  if( gSystem->AccessPathName( filename.Data() ) ) {
       AliError( Form( "file (%s) not found", filename.Data() ) );
       return;
    }
 
- ifstream in(filename.Data(),ios::in | ios::binary);
- in >> *this;
- in.close();
+ if (!filename.Contains(".root")) {
+   ifstream in(filename.Data(),ios::in | ios::binary);
+   in >> *this;
+   in.close();
+   return;
+ }
+ else {
+    Bool_t tmp= fMC;
+    TFile *mcfile = TFile::Open(filename);
+    TH1F *cuts = (TH1F*)mcfile->Get("cuts"); 
+    fPhiWindowL1=(Float_t)cuts->GetBinContent(1);
+    fZetaWindowL1=(Float_t)cuts->GetBinContent(2);
+    fPhiWindowL2=(Float_t)cuts->GetBinContent(3);
+    fZetaWindowL2=(Float_t)cuts->GetBinContent(4);
+    fOnlyOneTrackletPerC1=(Bool_t)cuts->GetBinContent(5);
+    fOnlyOneTrackletPerC2=(Bool_t)cuts->GetBinContent(6);
+    fUpdateOncePerEventPlaneEff=(Bool_t)cuts->GetBinContent(7);
+    fMinContVtx=(Int_t)cuts->GetBinContent(8);
+    fReflectClusterAroundZAxisForLayer0=(Bool_t)cuts->GetBinContent(9);
+    fReflectClusterAroundZAxisForLayer1=(Bool_t)cuts->GetBinContent(10);
+    fMC=(Bool_t)cuts->GetBinContent(11);
+    if(!fMC) {AliInfo("Reading only cuts, no MC info"); if(tmp) SetMC(kFALSE); }
+    else { // only if file with MC predictions 
+      if(!tmp) {AliInfo("Calling SetMC() to read this file wtih MC info"); SetMC();}
+      TH1C *mc0 = (TH1C*)mcfile->Get("mc0");
+      fUseOnlyPrimaryForPred=(Bool_t)mc0->GetBinContent(1);
+      fUseOnlySecondaryForPred=(Bool_t)mc0->GetBinContent(2);
+      fUseOnlySameParticle=(Bool_t)mc0->GetBinContent(3);
+      fUseOnlyDifferentParticle=(Bool_t)mc0->GetBinContent(4);
+      fUseOnlyStableParticle=(Bool_t)mc0->GetBinContent(5);
+      TH1I *mc1;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc1");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fPredictionPrimary[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc2");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fPredictionSecondary[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc3");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fClusterPrimary[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc4");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fClusterSecondary[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc5");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fSuccessPP[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc6");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fSuccessTT[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc7");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fSuccessS[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc8");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fSuccessP[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc9");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fFailureS[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc10");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fFailureP[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc11");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fRecons[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+      mc1 =(TH1I*)mcfile->Get("mc12");
+      for(Int_t i=0;i<1200;i++)  fNonRecons[i]=(Int_t)mc1->GetBinContent(i+1) ;
+    }
+   mcfile->Close();
+ }
  return;
 }
 //____________________________________________________________________
@@ -1323,7 +1639,23 @@ Bool_t AliITSTrackleterSPDEff::SaveHists() {
 
   if (!GetHistOn()) return kFALSE;
 
-  AliITSMultReconstructor::SaveHists(); // this save the histograms of the base class
+//  AliITSMultReconstructor::SaveHists(); // this save the histograms of the base class
+  fhClustersDPhiAll->Write();
+  fhClustersDThetaAll->Write();
+  fhClustersDZetaAll->Write();
+  fhDPhiVsDThetaAll->Write();
+  fhDPhiVsDZetaAll->Write();
+
+  fhClustersDPhiAcc->Write();
+  fhClustersDThetaAcc->Write();
+  fhClustersDZetaAcc->Write();
+  fhDPhiVsDThetaAcc->Write();
+  fhDPhiVsDZetaAcc->Write();
+
+  fhetaTracklets->Write();
+  fhphiTracklets->Write();
+  fhetaClustersLay1->Write();
+  fhphiClustersLay1->Write();
 
   fhClustersDPhiInterpAll->Write();
   fhClustersDThetaInterpAll->Write();
@@ -1339,6 +1671,13 @@ Bool_t AliITSTrackleterSPDEff::SaveHists() {
 
   fhetaClustersLay2->Write();
   fhphiClustersLay2->Write();
+  fhClustersInChip->Write();
+  for (Int_t nhist=0;nhist<80;nhist++){
+    fhClustersInModuleLay1[nhist]->Write(); 
+  }
+  for (Int_t nhist=0;nhist<160;nhist++){
+    fhClustersInModuleLay2[nhist]->Write(); 
+  }
   return kTRUE;
 }
 //__________________________________________________________
@@ -1348,7 +1687,7 @@ Bool_t AliITSTrackleterSPDEff::WriteHistosToFile(TString filename, Option_t* opt
   // Also the histograms from the base class are saved 
   //
   if (!GetHistOn()) return kFALSE;
-  if (filename.Data()=="") {
+  if (!strcmp(filename.Data(),"")) {
      AliWarning("WriteHistosToFile: null output filename!");
      return kFALSE;
   }
@@ -1368,6 +1707,40 @@ void AliITSTrackleterSPDEff::BookHistos() {
 // layers are computed in the interpolation phase
 //
   if (! GetHistOn()) { AliInfo("Call SetHistOn(kTRUE) first"); return;}
+//
+  fhClustersDPhiAcc   = new TH1F("dphiacc",  "dphi",  100,0.,0.1);
+  fhClustersDPhiAcc->SetDirectory(0);
+  fhClustersDThetaAcc = new TH1F("dthetaacc","dtheta",100,-0.1,0.1);
+  fhClustersDThetaAcc->SetDirectory(0);
+  fhClustersDZetaAcc = new TH1F("dzetaacc","dzeta",100,-1.,1.);
+  fhClustersDZetaAcc->SetDirectory(0);
+
+  fhDPhiVsDZetaAcc = new TH2F("dphiVsDzetaacc","",100,-1.,1.,100,0.,0.1);
+  fhDPhiVsDZetaAcc->SetDirectory(0);
+  fhDPhiVsDThetaAcc = new TH2F("dphiVsDthetaAcc","",100,-0.1,0.1,100,0.,0.1);
+  fhDPhiVsDThetaAcc->SetDirectory(0);
+
+  fhClustersDPhiAll   = new TH1F("dphiall",  "dphi",  100,0.0,0.5);
+  fhClustersDPhiAll->SetDirectory(0);
+  fhClustersDThetaAll = new TH1F("dthetaall","dtheta",100,-0.5,0.5);
+  fhClustersDThetaAll->SetDirectory(0);
+  fhClustersDZetaAll = new TH1F("dzetaall","dzeta",100,-5.,5.);
+  fhClustersDZetaAll->SetDirectory(0);
+
+  fhDPhiVsDZetaAll = new TH2F("dphiVsDzetaall","",100,-5.,5.,100,0.,0.5);
+  fhDPhiVsDZetaAll->SetDirectory(0);
+  fhDPhiVsDThetaAll = new TH2F("dphiVsDthetaAll","",100,-0.5,0.5,100,0.,0.5);
+  fhDPhiVsDThetaAll->SetDirectory(0);
+
+  fhetaTracklets  = new TH1F("etaTracklets",  "eta",  100,-2.,2.);
+  fhetaTracklets->SetDirectory(0);
+  fhphiTracklets  = new TH1F("phiTracklets",  "phi",  100, 0., 2*TMath::Pi());
+  fhphiTracklets->SetDirectory(0);
+  fhetaClustersLay1  = new TH1F("etaClustersLay1",  "etaCl1",  100,-2.,2.);
+  fhetaClustersLay1->SetDirectory(0);
+  fhphiClustersLay1  = new TH1F("phiClustersLay1", "phiCl1", 100, 0., 2*TMath::Pi());
+  fhphiClustersLay1->SetDirectory(0);
+//
   fhClustersDPhiInterpAcc   = new TH1F("dphiaccInterp",  "dphi Interpolation phase",  100,0.,0.1);
   fhClustersDPhiInterpAcc->SetDirectory(0);
   fhClustersDThetaInterpAcc = new TH1F("dthetaaccInterp","dtheta Interpolation phase",100,-0.1,0.1);
@@ -1396,6 +1769,45 @@ void AliITSTrackleterSPDEff::BookHistos() {
   fhetaClustersLay2->SetDirectory(0);
   fhphiClustersLay2  = new TH1F("phiClustersLay2", "phiCl2", 100, 0., 2*TMath::Pi());
   fhphiClustersLay2->SetDirectory(0);
+  fhClustersInChip = new TH1F("fhClustersInChip", "ClustersPerChip", 1200, -0.5, 1199.5);
+  fhClustersInChip->SetDirectory(0);
+// each chip is divided 8(z) x 4(y), i.e. in 32 squares, each containing 4 columns and 64 rows.
+  Float_t bz[160]; const Float_t kconv = 1.0E-04; // converts microns to cm.
+  for(Int_t i=0;i<160;i++) bz[i] = 425.0; // most are 425 microns except below
+  bz[ 31] = bz[ 32] = 625.0; // first chip boundry
+  bz[ 63] = bz[ 64] = 625.0; // first chip boundry
+  bz[ 95] = bz[ 96] = 625.0; // first chip boundry
+  bz[127] = bz[128] = 625.0; // first chip boundry
+  Double_t xbins[41]; // each bin in x (Z loc coordinate) includes 4 columns
+  //xbins[0]=0;
+  Float_t xmn,xmx,zmn,zmx;
+  if(!fPlaneEffSPD->GetBlockBoundaries(0,xmn,xmx,zmn,zmx)) AliWarning("Could not book histo properly");
+  xbins[0]=(Double_t)zmn;
+  for(Int_t i=0;i<40;i++) {
+   xbins[i+1]=xbins[i] + (bz[4*i]+bz[4*i+1]+bz[4*i+2]+bz[4*i+3])*kconv; 
+  }
+  TString histname="ClustersLay1_mod_",aux;
+  fhClustersInModuleLay1 =new TH2F*[80];
+  for (Int_t nhist=0;nhist<80;nhist++){
+    aux=histname;
+    aux+=nhist;
+    //  
+    fhClustersInModuleLay1[nhist]=new TH2F("histname","histname",40,xbins,4,(Double_t)xmn,(Double_t)xmx); 
+    fhClustersInModuleLay1[nhist]->SetName(aux.Data());
+    fhClustersInModuleLay1[nhist]->SetTitle(aux.Data());
+    fhClustersInModuleLay1[nhist]->SetDirectory(0);
+  }
+  histname="ClustersLay2_mod_";
+  fhClustersInModuleLay2 =new TH2F*[160];
+  for (Int_t nhist=0;nhist<160;nhist++){
+    aux=histname;
+    aux+=nhist;
+    fhClustersInModuleLay2[nhist]=new TH2F("histname","histname",40,xbins,4,(Double_t)xmn,(Double_t)xmx);
+    fhClustersInModuleLay2[nhist]->SetName(aux.Data());
+    fhClustersInModuleLay2[nhist]->SetTitle(aux.Data());
+    fhClustersInModuleLay2[nhist]->SetDirectory(0);
+  }
+//
   return;
 }
 //____________________________________________________________
@@ -1403,6 +1815,22 @@ void AliITSTrackleterSPDEff::DeleteHistos() {
 //
 // Private method to delete Histograms from memory 
 // it is called. e.g., by the destructor.
+//
+// form AliITSMultReconstructor
+  if(fhClustersDPhiAcc) {delete fhClustersDPhiAcc; fhClustersDPhiAcc=0;}
+  if(fhClustersDThetaAcc) {delete fhClustersDThetaAcc; fhClustersDThetaAcc=0;}
+  if(fhClustersDZetaAcc) {delete fhClustersDZetaAcc; fhClustersDZetaAcc=0;}
+  if(fhClustersDPhiAll) {delete fhClustersDPhiAll; fhClustersDPhiAll=0;}
+  if(fhClustersDThetaAll) {delete fhClustersDThetaAll; fhClustersDThetaAll=0;}
+  if(fhClustersDZetaAll) {delete fhClustersDZetaAll; fhClustersDZetaAll=0;}
+  if(fhDPhiVsDThetaAll) {delete fhDPhiVsDThetaAll; fhDPhiVsDThetaAll=0;}
+  if(fhDPhiVsDThetaAcc) {delete fhDPhiVsDThetaAcc; fhDPhiVsDThetaAcc=0;}
+  if(fhDPhiVsDZetaAll) {delete fhDPhiVsDZetaAll; fhDPhiVsDZetaAll=0;}
+  if(fhDPhiVsDZetaAcc) {delete fhDPhiVsDZetaAcc; fhDPhiVsDZetaAcc=0;}
+  if(fhetaTracklets) {delete fhetaTracklets; fhetaTracklets=0;}
+  if(fhphiTracklets) {delete fhphiTracklets; fhphiTracklets=0;}
+  if(fhetaClustersLay1) {delete fhetaClustersLay1; fhetaClustersLay1=0;}
+  if(fhphiClustersLay1) {delete fhphiClustersLay1; fhphiClustersLay1=0;}
 //
     if(fhClustersDPhiInterpAcc) {delete fhClustersDPhiInterpAcc; fhClustersDPhiInterpAcc=0;}
     if(fhClustersDThetaInterpAcc) {delete fhClustersDThetaInterpAcc; fhClustersDThetaInterpAcc=0;}
@@ -1416,15 +1844,24 @@ void AliITSTrackleterSPDEff::DeleteHistos() {
     if(fhDPhiVsDZetaInterpAcc) {delete fhDPhiVsDZetaInterpAcc; fhDPhiVsDZetaInterpAcc=0;}
     if(fhetaClustersLay2) {delete fhetaClustersLay2; fhetaClustersLay2=0;}
     if(fhphiClustersLay2) {delete fhphiClustersLay2; fhphiClustersLay2=0;}
+    if(fhClustersInChip) {delete fhClustersInChip; fhClustersInChip=0;}
+    if(fhClustersInModuleLay1) {
+      for (Int_t i=0; i<80; i++ ) delete fhClustersInModuleLay1[i];
+      delete [] fhClustersInModuleLay1; fhClustersInModuleLay1=0;
+    }
+    if(fhClustersInModuleLay2) {
+      for (Int_t i=0; i<160; i++ ) delete fhClustersInModuleLay2[i];
+      delete [] fhClustersInModuleLay2; fhClustersInModuleLay2=0;
+    }
 }
 //_______________________________________________________________
 Bool_t AliITSTrackleterSPDEff::IsReconstructableAt(Int_t layer,Int_t iC,Int_t ipart,
-                                                   Float_t* vtx, AliStack *stack, TTree *ref) {
+                                                   const Float_t* vtx, const AliStack *stack, TTree *ref) {
 // This (private) method can be used only for MC events, where both AliStack and the TrackReference
 // are available. 
 // It is used to asses whether a tracklet prediction is reconstructable or not at the other layer
 // Input: 
-//      - Int_t layer (either 0 or 1): layer which you want to chech if the tracklete can be 
+//      - Int_t layer (either 0 or 1): layer which you want to check if the tracklete can be 
 //                                     reconstructed at
 //      - Int_t iC : cluster index used to build the tracklet prediction 
 //                   if layer=0 ==> iC=iC2 ; elseif layer=1 ==> iC=iC1
@@ -1485,8 +1922,8 @@ for(Int_t iref=0;iref<nref;iref++) { // loop over all the refs of the matching t
     Float_t dZeta = TMath::Cos(fClustersLay1[iC][0])*r2 - trefLayExtr[2];
 
     // make "elliptical" cut in Phi and Zeta!
-    Float_t d = TMath::Sqrt(dPhi*dPhi/fPhiWindow/fPhiWindow +
-                              dZeta*dZeta/fZetaWindow/fZetaWindow);
+    Float_t d = TMath::Sqrt(dPhi*dPhi/fPhiWindowL2/fPhiWindowL2 +
+                              dZeta*dZeta/fZetaWindowL2/fZetaWindowL2);
     if (d<1) {ret=kTRUE; break;}
   }
   if(layer==0) { // try to see if it is reconstructable at the inner layer
@@ -1510,3 +1947,204 @@ for(Int_t iref=0;iref<nref;iref++) { // loop over all the refs of the matching t
 delete tcaRef;
 return ret;
 }
+//_________________________________________________________________________
+void AliITSTrackleterSPDEff::ReflectClusterAroundZAxisForLayer(Int_t ilayer){
+//
+// this method apply a rotation by 180 degree around the Z (beam) axis to all 
+// the RecPoints in a given layer to be used to build tracklets.
+// **************** VERY IMPORTANT:: ***************
+// It must be called just after LoadClusterArrays, since afterwards the datamember
+// fClustersLay1[iC1][0] and fClustersLay1[iC1][1] are redefined using polar coordinate 
+// instead of Cartesian
+//
+if(ilayer<0 || ilayer>1) {AliInfo("Input argument (ilayer) should be either 0 or 1: nothing done"); return ;}
+AliDebug(3,Form("Applying a rotation by 180 degree around z axiz to all clusters on layer %d",ilayer));
+if(ilayer==0) {
+  for (Int_t iC1=0; iC1<fNClustersLay1; iC1++) {
+    fClustersLay1[iC1][0]*=-1;
+    fClustersLay1[iC1][1]*=-1;
+  }
+}
+if(ilayer==1) {
+  for (Int_t iC2=0; iC2<fNClustersLay2; iC2++) {
+    fClustersLay2[iC2][0]*=-1;
+    fClustersLay2[iC2][1]*=-1;
+  }
+}
+return;
+}
+//____________________________________________________________________________
+Int_t AliITSTrackleterSPDEff::Clusters2Tracks(AliESDEvent *esd){
+// This method is used to find the tracklets. 
+// It is called from AliReconstruction
+// The vertex is supposed to be associated to the Tracker (i.e. to this) already
+// The cluster is supposed to be associated to the Tracker already
+// In case Monte Carlo is required, the appropriate linking to Stack and TrackRef is attempted 
+//
+  Int_t rc=1;
+  // apply cuts on the vertex quality
+  const AliESDVertex *vertex = esd->GetVertex();
+  if(vertex->GetNContributors()<fMinContVtx) return 0;
+  //
+  AliRunLoader* runLoader = AliRunLoader::Instance();
+  if (!runLoader) {
+    Error("Clusters2Tracks", "no run loader found");
+    return rc;
+  }
+  AliStack *pStack=0x0; TTree *tRefTree=0x0;
+  if(GetMC()) {
+    runLoader->LoadKinematics("read");
+    runLoader->LoadTrackRefs("read");
+    pStack= runLoader->Stack();
+    tRefTree= runLoader->TreeTR();
+  }
+  Reconstruct(pStack,tRefTree);
+
+  if (GetLightBkgStudyInParallel()) {
+    AliStack *dummy1=0x0; TTree *dummy2=0x0;
+    ReflectClusterAroundZAxisForLayer(1);
+    Reconstruct(dummy1,dummy2,kTRUE);
+  }
+  return 0;
+}
+//____________________________________________________________________________
+Int_t AliITSTrackleterSPDEff::PostProcess(AliESDEvent *){
+// 
+// It is called from AliReconstruction
+// 
+// 
+// 
+//
+  Int_t rc=0;
+  if(GetMC()) SavePredictionMC("TrackletsMCpred.root");
+  if(GetHistOn()) rc=(Int_t)WriteHistosToFile();
+  if(GetLightBkgStudyInParallel()) {
+    TString name="AliITSPlaneEffSPDtrackletBkg.root";
+    TFile* pefile = TFile::Open(name, "RECREATE");
+    rc*=fPlaneEffBkg->Write();
+    pefile->Close();
+  }
+  return rc;
+}
+//____________________________________________________________________
+void
+AliITSTrackleterSPDEff::LoadClusterArrays(TTree* itsClusterTree) {
+  // This method
+  // - gets the clusters from the cluster tree
+  // - convert them into global coordinates
+  // - store them in the internal arrays
+  // - count the number of cluster-fired chips
+
+  //AliDebug(1,"Loading clusters and cluster-fired chips ...");
+
+  fNClustersLay1 = 0;
+  fNClustersLay2 = 0;
+
+  TClonesArray* itsClusters = new TClonesArray("AliITSRecPoint");
+  TBranch* itsClusterBranch=itsClusterTree->GetBranch("ITSRecPoints");
+
+  itsClusterBranch->SetAddress(&itsClusters);
+
+  Int_t nItsSubs = (Int_t)itsClusterTree->GetEntries();
+  Float_t cluGlo[3]={0.,0.,0.};
+
+  // loop over the its subdetectors
+  for (Int_t iIts=0; iIts < nItsSubs; iIts++) {
+
+    if (!itsClusterTree->GetEvent(iIts))
+      continue;
+
+    Int_t nClusters = itsClusters->GetEntriesFast();
+
+    // number of clusters in each chip of the current module
+    Int_t layer = 0;
+
+    // loop over clusters
+    while(nClusters--) {
+      AliITSRecPoint* cluster = (AliITSRecPoint*)itsClusters->UncheckedAt(nClusters);
+
+      layer = cluster->GetLayer();
+      if (layer>1) continue;
+
+      cluster->GetGlobalXYZ(cluGlo);
+      Float_t x = cluGlo[0];
+      Float_t y = cluGlo[1];
+      Float_t z = cluGlo[2];
+
+      if (layer==0) {
+        fClustersLay1[fNClustersLay1][0] = x;
+        fClustersLay1[fNClustersLay1][1] = y;
+        fClustersLay1[fNClustersLay1][2] = z;
+
+        for (Int_t i=0; i<3; i++)
+                fClustersLay1[fNClustersLay1][3+i] = cluster->GetLabel(i);
+        fNClustersLay1++;
+        if(fHistOn) { 
+          Int_t det=cluster->GetDetectorIndex();
+          if(det<0 || det>79) {AliError("Cluster with det. index out of boundaries"); return;}
+          fhClustersInModuleLay1[det]->Fill((Double_t)cluster->GetDetLocalZ(),(Double_t)cluster->GetDetLocalX());
+        }
+      }
+      if (layer==1) {
+        fClustersLay2[fNClustersLay2][0] = x;
+        fClustersLay2[fNClustersLay2][1] = y;
+        fClustersLay2[fNClustersLay2][2] = z;
+
+        for (Int_t i=0; i<3; i++)
+                fClustersLay2[fNClustersLay2][3+i] = cluster->GetLabel(i);
+        fNClustersLay2++;
+        if(fHistOn) {
+          Int_t det=cluster->GetDetectorIndex();
+          if(det<0 || det>159) {AliError("Cluster with det. index out of boundaries"); return;}
+          fhClustersInModuleLay2[det]->Fill((Double_t)cluster->GetDetLocalZ(),(Double_t)cluster->GetDetLocalX());
+        }
+      }
+
+    }// end of cluster loop
+
+  } // end of its "subdetector" loop
+  if (itsClusters) {
+    itsClusters->Delete();
+    delete itsClusters;
+    itsClusters = 0;
+  }
+  AliDebug(1,Form("(clusters in layer 1 : %d,  layer 2: %d)",fNClustersLay1,fNClustersLay2));
+}
+//_________________________________________________________________________
+void
+AliITSTrackleterSPDEff::SetLightBkgStudyInParallel(Bool_t b) {
+//     This method:
+//  - set Bool_t fLightBackgroundStudyInParallel = b 
+//    a) if you set this kTRUE, then the estimation of the 
+//      SPD efficiency is done as usual for data, but in 
+//      parallel a light (i.e. without control histograms, etc.) 
+//      evaluation of combinatorial background is performed
+//      with the usual ReflectClusterAroundZAxisForLayer method.
+//    b) if you set this kFALSE, then you would not have a second 
+//      container for PlaneEfficiency statistics to be used for background 
+//      (fPlaneEffBkg=0). If you want to have a full evaluation of the 
+//      background (with all control histograms and additional data 
+//      members referring to the background) then you have to call the 
+//      method SetReflectClusterAroundZAxisForLayer(kTRUE) esplicitily
+  fLightBkgStudyInParallel=b; 
+  if(fLightBkgStudyInParallel) {
+    if(!fPlaneEffBkg) fPlaneEffBkg = new AliITSPlaneEffSPD();   
+  }
+  else {
+    delete fPlaneEffBkg;
+    fPlaneEffBkg=0;
+  }
+}
+//______________________________________________________________
+void AliITSTrackleterSPDEff::SetReflectClusterAroundZAxisForLayer(Int_t ilayer,Bool_t b){  
+//
+// method to study residual background:
+// Input b= KTRUE --> reflect the clusters 
+//      ilayer (either 0 or 1) --> which SPD layers should be reflected
+//
+    if(b) {AliInfo(Form("All clusters on layer %d will be rotated by 180 deg around z",ilayer));
+           SetLightBkgStudyInParallel(kFALSE);}
+    if(ilayer==0) fReflectClusterAroundZAxisForLayer0=b;                   // a rotation by 180degree around the Z axis  
+    else if(ilayer==1) fReflectClusterAroundZAxisForLayer1=b;              // (x->-x; y->-y) to all RecPoints on a 
+    else AliInfo("Nothing done: input argument (ilayer) either 0 or 1");   // given layer is applied. In such a way 
+  }