]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - MUON/AliMUON.cxx
- Welding section on absorber side (LHCVC2C_001)
[u/mrichter/AliRoot.git] / MUON / AliMUON.cxx
index 76078b0c178649d2754667d12ac5757368c645bd..2a6b1d70974dc685e2025ee260bca989736ec059 100644 (file)
  * about the suitability of this software for any purpose. It is          *
  * provided "as is" without express or implied warranty.                  *
  **************************************************************************/
-/*
-$Log$
-Revision 1.57  2002/10/14 14:57:29  hristov
-Merging the VirtualMC branch to the main development branch (HEAD)
-
-Revision 1.56.6.2  2002/07/24 10:07:20  alibrary
-Updating VirtualMC
-
-Revision 1.56.6.1  2002/06/10 15:10:14  hristov
-Merged with v3-08-02
-
-Revision 1.56  2001/11/22 11:26:28  jchudoba
-Proper deletion of arrays, deletion of unused variables (thanks to Rene Brun)
-
-Revision 1.55  2001/09/07 08:38:30  hristov
-Pointers initialised to 0 in the default constructors
-
-Revision 1.54  2001/08/30 09:52:12  hristov
-The operator[] is replaced by At() or AddAt() in case of TObjArray.
-
-Revision 1.53  2001/07/20 10:03:13  morsch
-Changes needed to work with Root 3.01 (substitute lhs [] operator). (Jiri Chudoba)
-
-Revision 1.52  2001/06/14 13:49:22  hristov
-Write a TreeD in SDigits2Digits method (needed to be compatible with alirun script)
-
-Revision 1.51  2001/05/31 10:19:52  morsch
-Fix for new AliRun::RunReco().
-
-Revision 1.50  2001/05/16 14:57:17  alibrary
-New files for folders and Stack
-
-Revision 1.49  2001/03/12 17:45:48  hristov
-Changes needed on Sun with CC 5.0
-
-Revision 1.48  2001/03/06 00:01:36  morsch
-Add  Digits2Reco() and FindClusters()
-Adapt call of cluster finder to new STEER.
-
-Revision 1.47  2001/03/05 08:38:36  morsch
-Digitization related methods moved to AliMUONMerger.
-
-Revision 1.46  2001/01/26 21:34:59  morsch
-Use access functions for AliMUONHit, AliMUONDigit and AliMUONPadHit data members.
-
-Revision 1.45  2001/01/26 20:00:49  hristov
-Major upgrade of AliRoot code
-
-Revision 1.44  2001/01/25 17:39:09  morsch
-Pass size of fNdch and fNrawch to CINT.
-
-Revision 1.43  2001/01/23 18:58:19  hristov
-Initialisation of some pointers
-
-Revision 1.42  2001/01/17 20:53:40  hristov
-Destructors corrected to avoid memory leaks
-
-Revision 1.41  2000/12/21 22:12:40  morsch
-Clean-up of coding rule violations,
-
-Revision 1.40  2000/11/29 20:32:26  gosset
-Digitize:
-1. correction for array index out of bounds
-2. one printout commented
-
-Revision 1.39  2000/11/12 17:17:03  pcrochet
-BuildGeometry of AliMUON for trigger chambers delegated to AliMUONSegmentationTriggerX (same strategy as for tracking chambers)
-
-Revision 1.38  2000/11/06 09:20:43  morsch
-AliMUON delegates part of BuildGeometry() to AliMUONSegmentation using the
-Draw() method. This avoids code and parameter replication.
-
-Revision 1.37  2000/10/26 09:53:37  pcrochet
-put back trigger chambers in the display (there was a problem in buildgeometry)
-
-Revision 1.36  2000/10/25 19:51:18  morsch
-Correct x-position of chambers.
-
-Revision 1.35  2000/10/24 19:46:21  morsch
-BuildGeometry updated for slats in station 3-4.
-
-Revision 1.34  2000/10/18 11:42:06  morsch
-- AliMUONRawCluster contains z-position.
-- Some clean-up of useless print statements during initialisations.
-
-Revision 1.33  2000/10/09 14:01:57  morsch
-Unused variables removed.
-
-Revision 1.32  2000/10/06 09:08:10  morsch
-Built geometry includes slat geometry for event display.
-
-Revision 1.31  2000/10/02 21:28:08  fca
-Removal of useless dependecies via forward declarations
-
-Revision 1.30  2000/10/02 16:58:29  egangler
-Cleaning of the code :
--> coding conventions
--> void Streamers
--> some useless includes removed or replaced by "class" statement
-
-Revision 1.29  2000/07/28 13:49:38  morsch
-SetAcceptance defines inner and outer chamber radii according to angular acceptance.
-Can be used for simple acceptance studies.
-
-Revision 1.28  2000/07/22 16:43:15  morsch
-Same comment as before, but now done correctly I hope (sorry it's Saturday evening)
-
-Revision 1.27  2000/07/22 16:36:50  morsch
-Change order of indices in creation (new) of xhit and yhit
-
-Revision 1.26  2000/07/03 11:54:57  morsch
-AliMUONSegmentation and AliMUONHitMap have been replaced by AliSegmentation and AliHitMap in STEER
-The methods GetPadIxy and GetPadXxy of AliMUONSegmentation have changed name to GetPadI and GetPadC.
-
-Revision 1.25  2000/06/29 12:34:09  morsch
-AliMUONSegmentation class has been made independent of AliMUONChamber. This makes
-it usable with any other geometry class. The link to the object to which it belongs is
-established via an index. This assumes that there exists a global geometry manager
-from which the pointer to the parent object can be obtained (in our case gAlice).
-
-Revision 1.24  2000/06/28 15:16:35  morsch
-(1) Client code adapted to new method signatures in AliMUONSegmentation (see comments there)
-to allow development of slat-muon chamber simulation and reconstruction code in the MUON
-framework. The changes should have no side effects (mostly dummy arguments).
-(2) Hit disintegration uses 3-dim hit coordinates to allow simulation
-of chambers with overlapping modules (MakePadHits, Disintegration).
-
-Revision 1.23  2000/06/28 12:19:17  morsch
-More consequent seperation of global input data services (AliMUONClusterInput singleton) and the
-cluster and hit reconstruction algorithms in AliMUONClusterFindRawinderVS.
-AliMUONClusterFinderVS becomes the base class for clustering and hit reconstruction.
-It requires two cathode planes. Small modifications in the code will make it usable for
-one cathode plane and, hence, more general (for test beam data).
-AliMUONClusterFinder is now obsolete.
-
-Revision 1.22  2000/06/28 08:06:10  morsch
-Avoid global variables in AliMUONClusterFinderVS by seperating the input data for the fit from the
-algorithmic part of the class. Input data resides inside the AliMUONClusterInput singleton.
-It also naturally takes care of the TMinuit instance.
-
-Revision 1.21  2000/06/27 08:54:41  morsch
-Problems with on constant array sizes (in hitMap, nmuon, xhit, yhit) corrected.
-
-Revision 1.20  2000/06/26 14:02:38  morsch
-Add class AliMUONConstants with MUON specific constants using static memeber data and access methods.
-
-Revision 1.19  2000/06/22 13:40:51  morsch
-scope problem on HP, "i" declared once
-pow changed to TMath::Power (PH, AM)
-
-Revision 1.18  2000/06/15 07:58:48  morsch
-Code from MUON-dev joined
-
-Revision 1.14.4.17  2000/06/14 14:36:46  morsch
-- add TriggerCircuit (PC)
-- add GlobalTrigger and LocalTrigger and specific methods (PC)
 
-Revision 1.14.4.16  2000/06/09 21:20:28  morsch
-Most coding rule violations corrected
-
-Revision 1.14.4.15  2000/05/02 09:54:32  morsch
-RULE RN17 violations corrected
-
-Revision 1.14.4.12  2000/04/26 12:25:02  morsch
-Code revised by P. Crochet:
-- Z position of TriggerChamber changed according to A.Tournaire Priv.Comm.
-- ToF included in the method MakePadHits
-- inner radius of flange between beam shielding and trigger corrected
-- Trigger global volume updated (according to the new geometry)
-
-Revision 1.14.4.11  2000/04/19 19:42:08  morsch
-Some changes of variable names curing viols and methods concerning
-correlated clusters removed.
-
-Revision 1.14.4.10  2000/03/22 16:44:07  gosset
-Memory leak suppressed in function Digitise:
-p_adr->Delete() instead of Clear (I.Chevrot and A.Baldisseri)
-
-Revision 1.14.4.9  2000/03/20 18:15:25  morsch
-Positions of trigger chambers corrected (P.C.)
-
-Revision 1.14.4.8  2000/02/21 15:38:01  morsch
-Call to AddHitList introduced to make this version compatible with head.
-
-Revision 1.14.4.7  2000/02/20 07:45:53  morsch
-Bugs in Trigger part of BuildGeomemetry corrected (P.C)
-
-Revision 1.14.4.6  2000/02/17 14:28:54  morsch
-Trigger included into initialization and digitization
-
-Revision 1.14.4.5  2000/02/15 10:02:58  morsch
-Log messages of previous revisions added
-
-Revision 1.14.4.2  2000/02/04 10:57:34  gosset
-Z position of the chambers:
-it was the Z position of the stations;
-it is now really the Z position of the chambers.
-   !!!! WARNING: THE CALLS TO "AliMUONChamber::SetZPOS"
-   !!!!                   AND "AliMUONChamber::ZPosition"
-   !!!! HAVE TO BE CHANGED TO "AliMUONChamber::"SetZ"
-   !!!!                   AND "AliMUONChamber::Z"
-
-Revision 1.14.4.3  2000/02/04 16:19:04  gosset
-Correction for mis-spelling of NCH 
-
-Revision 1.14.4.4  2000/02/15 09:43:38  morsch
-Log message added
-
-*/
+/* $Id$ */
 
 
 ///////////////////////////////////////////////
 //  Manager and hits classes for set:MUON     //
 ////////////////////////////////////////////////
 
-#include <TTUBE.h>
+#include "Riostream.h"
+
+#include <AliPDG.h>
 #include <TBRIK.h>
-#include <TRotMatrix.h>
+#include <TCanvas.h>
+#include <TDirectory.h>
+#include <TFile.h>
 #include <TGeometry.h>
+#include <TMinuit.h>
 #include <TNode.h> 
-#include <TTree.h> 
-#include <TRandom.h> 
-#include <TObject.h>
-#include <TVector.h>
+#include <TNtuple.h>
 #include <TObjArray.h>
-#include <TMinuit.h>
+#include <TObject.h>
+#include <TObjectTable.h>
+#include <TPad.h>
 #include <TParticle.h>
 #include <TROOT.h>
-#include <TFile.h>
-#include <TNtuple.h>
-#include <TCanvas.h>
-#include <TPad.h>
-#include <TDirectory.h>
-#include <TObjectTable.h>
-#include <AliPDG.h>
+#include <TRandom.h> 
+#include <TRotMatrix.h>
 #include <TTUBE.h>
+#include <TTUBE.h>
+#include <TTree.h> 
+#include <TVector.h>
+#include <TVirtualMC.h>
 
+#include "AliConst.h" 
+#include "AliHeader.h"
+#include "AliHitMap.h"
+#include "AliLoader.h"
+#include "AliRunDigitizer.h"
+#include "AliMC.h"
+#include "AliRun.h"    
+#include "AliMUONLoader.h"
 #include "AliMUON.h"
+#include "AliMUONChamberTrigger.h"
+#include "AliMUONConstants.h"
+#include "AliMUONDigit.h"
 #include "AliMUONHit.h"
+#include "AliMUONHitMapA1.h"
+#include "AliMUONMerger.h"     
 #include "AliMUONPadHit.h"
-#include "AliMUONDigit.h"
-#include "AliMUONTransientDigit.h"
 #include "AliMUONRawCluster.h"
-#include "AliMUONLocalTrigger.h"
-#include "AliMUONGlobalTrigger.h"
+#include "AliMUONTransientDigit.h"
 #include "AliMUONTriggerCircuit.h"
-#include "AliHitMap.h"
-#include "AliMUONHitMapA1.h"
-#include "AliMUONChamberTrigger.h"
-#include "AliMUONConstants.h"
-#include "AliMUONClusterFinderVS.h"
-#include "AliMUONTriggerDecision.h"
-#include "AliRun.h"
-#include "AliHeader.h"
-#include "AliMC.h"
-#include "AliMUONClusterInput.h"
-#include "AliMUONMerger.h"     
-#include "Riostream.h"
-#include "AliConst.h" 
+#include "AliMUONVGeometryBuilder.h"   
+#include "AliMUONDigitizerv2.h"
+#include "AliMUONSDigitizerv1.h"
+
 
 // Defaults parameters for Z positions of chambers
 // taken from values for "stations" in AliMUON::AliMUON
@@ -287,7 +84,7 @@ Log message added
 //          for the first and second chambers in the station, respectively
 
 ClassImp(AliMUON)
-//___________________________________________
+//__________________________________________________________________
 AliMUON::AliMUON()
 {
 // Default Constructor
@@ -295,255 +92,123 @@ AliMUON::AliMUON()
     fNCh             = 0;
     fNTrackingCh     = 0;
     fIshunt          = 0;
-    fPadHits         = 0;
-    fNPadHits        = 0;
     fChambers        = 0;
-    fDchambers       = 0;
-    fTriggerCircuits = 0;  
-    fNdch            = 0;
-    fRawClusters     = 0;
-    fNrawch          = 0;
-    fGlobalTrigger   = 0;
-    fNLocalTrigger   = 0;
-    fLocalTrigger    = 0;
-    fNLocalTrigger   = 0;
+    fGeometryBuilders = 0; 
+    fTriggerCircuits = 0;
     fAccMin          = 0.;
     fAccMax          = 0.;   
     fAccCut          = kFALSE;
     fMerger          = 0;
-    fFileName        = 0;
+    fMUONData        = 0;
+    fSplitLevel      = 0;
 }
-//___________________________________________
+//__________________________________________________________________
 AliMUON::AliMUON(const char *name, const char *title)
-       : AliDetector(name,title)
+  : AliDetector(name,title)
 {
 //Begin_Html
 /*
 <img src="gif/alimuon.gif">
 */
 //End_Html
+  fMUONData  = 0x0;
+  fSplitLevel= 0;
+  fIshunt     =  0;
 
-   fHits     = new TClonesArray("AliMUONHit",1000);
-   gAlice->AddHitList(fHits);
-   fPadHits = new TClonesArray("AliMUONPadHit",10000);
-   fNPadHits  =  0;
-   fIshunt     =  0;
-
-   fNCh             = AliMUONConstants::NCh(); 
-   fNTrackingCh     = AliMUONConstants::NTrackingCh();
-   fNdch            = new Int_t[fNCh];
-
-   fDchambers = new TObjArray(AliMUONConstants::NCh());
-
-   Int_t i;
-   
-   for (i=0; i<AliMUONConstants::NCh() ;i++) {
-       fDchambers->AddAt(new TClonesArray("AliMUONDigit",10000),i); 
-       fNdch[i]=0;
-   }
+  fNCh             = AliMUONConstants::NCh(); 
+  fNTrackingCh     = AliMUONConstants::NTrackingCh();
 
-   fNrawch      = new Int_t[fNTrackingCh];
-
-   fRawClusters = new TObjArray(AliMUONConstants::NTrackingCh());
-
-   for (i=0; i<AliMUONConstants::NTrackingCh();i++) {
-       fRawClusters->AddAt(new TClonesArray("AliMUONRawCluster",10000),i); 
-       fNrawch[i]=0;
-   }
-
-   fGlobalTrigger = new TClonesArray("AliMUONGlobalTrigger",1);    
-   fNGlobalTrigger = 0;
-   fLocalTrigger  = new TClonesArray("AliMUONLocalTrigger",234);    
-   fNLocalTrigger = 0;
-
-   SetMarkerColor(kRed);
-//
+  SetMarkerColor(kRed);//
 //
-//
-//
-
+// Creating List of Chambers
     Int_t ch;
-
     fChambers = new TObjArray(AliMUONConstants::NCh());
+    fGeometryBuilders = new TObjArray(AliMUONConstants::NCh());
 
     // Loop over stations
     for (Int_t st = 0; st < AliMUONConstants::NCh() / 2; st++) {
       // Loop over 2 chambers in the station
-       for (Int_t stCH = 0; stCH < 2; stCH++) {
-//
-//    
-//    Default Parameters for Muon Tracking Stations
-
-
-           ch = 2 * st + stCH;
-//
-           if (ch < AliMUONConstants::NTrackingCh()) {
-             fChambers->AddAt(new AliMUONChamber(ch),ch);
-           } else {
-             fChambers->AddAt(new AliMUONChamberTrigger(ch),ch);
-           }
-           
-        //PH       AliMUONChamber* chamber = (AliMUONChamber*) (*fChambers)[ch];
-           AliMUONChamber* chamber = (AliMUONChamber*) fChambers->At(ch);
-           
-           chamber->SetGid(0);
-           // Default values for Z of chambers
-           chamber->SetZ(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch));
-//
-           chamber->InitGeo(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch));
-//          Set chamber inner and outer radius to default
-           chamber->SetRInner(AliMUONConstants::Dmin(st)/2);
-           chamber->SetROuter(AliMUONConstants::Dmax(st)/2);
-//
-       } // Chamber stCH (0, 1) in 
+      for (Int_t stCH = 0; stCH < 2; stCH++) {
+       //
+       //    
+       //    Default Parameters for Muon Tracking Stations
+       ch = 2 * st + stCH;
+       if (ch < AliMUONConstants::NTrackingCh()) {
+         fChambers->AddAt(new AliMUONChamber(ch),ch);
+       } else {
+         fChambers->AddAt(new AliMUONChamberTrigger(ch),ch);
+       }
+       AliMUONChamber* chamber = (AliMUONChamber*) fChambers->At(ch);
+       //chamber->SetGid(0);
+       // Default values for Z of chambers
+       chamber->SetZ(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch));
+       //
+       chamber->InitGeo(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch));
+       //          Set chamber inner and outer radius to default
+       chamber->SetRInner(AliMUONConstants::Dmin(st)/2);
+       chamber->SetROuter(AliMUONConstants::Dmax(st)/2);
+       //
+      } // Chamber stCH (0, 1) in 
     }     // Station st (0...)
-//    fChambers->SetLast(AliMUONConstants::NCh());
-    fMaxStepGas=0.01; 
-    fMaxStepAlu=0.1; 
+    
+    // Negatives values are ignored by geant3 CONS200 in the calculation of the tracking parameters
+    fMaxStepGas=0.1; 
+    fMaxStepAlu=0.1;  
     fMaxDestepGas=-1;
     fMaxDestepAlu=-1;
-//
-   fMaxIterPad   = 0;
-   fCurIterPad   = 0;
-//
-   fAccMin          = 0.;
-   fAccMax          = 0.;   
-   fAccCut          = kFALSE;
-
-   // cp new design of AliMUONTriggerDecision
-   fTriggerCircuits = new TObjArray(AliMUONConstants::NTriggerCircuit());
-   for (Int_t circ=0; circ<AliMUONConstants::NTriggerCircuit(); circ++) {
-     fTriggerCircuits->AddAt(new AliMUONTriggerCircuit(),circ);     
-
-   }
-     fMerger = 0;
+    
+    fMaxIterPad   = 0;
+    fCurIterPad   = 0;
+    
+    fAccMin          = 0.;
+    fAccMax          = 0.;   
+    fAccCut          = kFALSE;
+    
+    // cp new design of AliMUONTriggerDecision
+    fTriggerCircuits = new TObjArray(AliMUONConstants::NTriggerCircuit());
+    for (Int_t circ=0; circ<AliMUONConstants::NTriggerCircuit(); circ++) {
+      fTriggerCircuits->AddAt(new AliMUONTriggerCircuit(),circ);          
+    }
+    fMerger = 0;
 }
-//___________________________________________
-AliMUON::AliMUON(const AliMUON& rMUON)
+//____________________________________________________________________
+AliMUON::AliMUON(const AliMUON& rMUON):AliDetector(rMUON)
 {
 // Dummy copy constructor
     ;
     
 }
-
+//____________________________________________________________________
 AliMUON::~AliMUON()
 {
 // Destructor
-    if(fDebug) printf("%s: Calling AliMUON destructor !!!\n",ClassName());
-    
-    fIshunt  = 0;
-    // Delete TObjArrays
-    if (fChambers){
-      fChambers->Delete();
-      delete fChambers;
-    }
-    if (fTriggerCircuits){
-      fTriggerCircuits->Delete();
-      delete fTriggerCircuits;
-    }
-    if (fDchambers){
-      fDchambers->Delete();
-      delete fDchambers;
-    }
-    if (fRawClusters){
-      fRawClusters->Delete();
-      delete fRawClusters;
-    }
+  if(fDebug) printf("%s: Calling AliMUON destructor !!!\n",ClassName());
+  fIshunt  = 0;
+  if (fMerger) delete fMerger;
 
-    if (fNrawch) delete [] fNrawch;
-    // Delete TClonesArrays
-    if (fPadHits){
-      fPadHits->Delete();
-      delete fPadHits;
-    }
-    if (fGlobalTrigger){
-      fGlobalTrigger->Delete();
-      delete fGlobalTrigger;
-    }
-    fNGlobalTrigger = 0;
-    
-    if (fLocalTrigger){
-      fLocalTrigger->Delete();
-      delete fLocalTrigger;
-    }
-    fNLocalTrigger = 0;
-
-    if (fHits) {
-      fHits->Delete();
-      delete fHits;
-    }
-
-    if (fMerger) delete fMerger;
-    if (fNdch) delete [] fNdch;
-
-}
-//___________________________________________
-void AliMUON::AddHit(Int_t track, Int_t *vol, Float_t *hits)
-{
-  TClonesArray &lhits = *fHits;
-  new(lhits[fNhits++]) AliMUONHit(fIshunt,track,vol,hits);
-}
-//___________________________________________
-void AliMUON::AddPadHit(Int_t *clhits)
-{
-   TClonesArray &lclusters = *fPadHits;
-   new(lclusters[fNPadHits++]) AliMUONPadHit(clhits);
-}
-//_____________________________________________________________________________
-void AliMUON::AddDigits(Int_t id, Int_t *tracks, Int_t *charges, Int_t *digits)
-{
-    //
-    // Add a MUON digit to the list
-    //
-
-  //PH    TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)(*fDchambers)[id]);
-    TClonesArray &ldigits = *((TClonesArray*)fDchambers->At(id));
-    new(ldigits[fNdch[id]++]) AliMUONDigit(tracks,charges,digits);
+  if (fGeometryBuilders){
+    fGeometryBuilders->Delete();
+    delete fGeometryBuilders;
+  }
+  if (fChambers){
+    fChambers->Delete();
+    delete fChambers;
+  }
+  if (fTriggerCircuits){
+    fTriggerCircuits->Delete();
+    delete fTriggerCircuits;
+  }
+  delete fMUONData;
 }
-
 //_____________________________________________________________________________
-void AliMUON::AddRawCluster(Int_t id, const AliMUONRawCluster& c)
+void AliMUON::AddGeometryBuilder(AliMUONVGeometryBuilder* geomBuilder)
 {
-    //
-    // Add a MUON digit to the list
-    //
+// Adds the geometry builder to the list
+// ---
 
-  //PH    TClonesArray &lrawcl = *((TClonesArray*)(*fRawClusters)[id]);
-    TClonesArray &lrawcl = *((TClonesArray*)fRawClusters->At(id));
-    new(lrawcl[fNrawch[id]++]) AliMUONRawCluster(c);
+  fGeometryBuilders->Add(geomBuilder);
 }
-
-//___________________________________________
-void AliMUON::AddGlobalTrigger(Int_t *singlePlus, Int_t *singleMinus,
-                              Int_t *singleUndef,
-                              Int_t *pairUnlike, Int_t *pairLike)
-{
-// add a MUON Global Trigger to the list (only one GlobalTrigger per event !)
-  TClonesArray &globalTrigger = *fGlobalTrigger;
-  new(globalTrigger[fNGlobalTrigger++]) 
-    AliMUONGlobalTrigger(singlePlus, singleMinus,  singleUndef, pairUnlike, 
-                        pairLike);
-}
-//___________________________________________
-void AliMUON::AddLocalTrigger(Int_t *localtr)
-{
-// add a MUON Local Trigger to the list
-  TClonesArray &localTrigger = *fLocalTrigger;
-  new(localTrigger[fNLocalTrigger++]) AliMUONLocalTrigger(localtr);
-}
-
-//___________________________________________
+//____________________________________________________________________
 void AliMUON::BuildGeometry()
 {
 // Geometry for event display
@@ -554,188 +219,33 @@ void AliMUON::BuildGeometry()
     }
   }
 }
-
-//___________________________________________
+//___________________________________________________________________
 Int_t AliMUON::DistancetoPrimitive(Int_t , Int_t )
 {
-   return 9999;
-}
-
-//___________________________________________
-void AliMUON::MakeBranch(Option_t* option, const char *file)
-{
-    //
-    // Create Tree branches for the MUON.
-    //
-    const Int_t kBufferSize = 4000;
-    char branchname[30];
-    sprintf(branchname,"%sCluster",GetName());
-    
-    AliDetector::MakeBranch(option,file);
-    
-    const char *cD = strstr(option,"D");
-    const char *cR = strstr(option,"R");
-    const char *cH = strstr(option,"H");
-
-    if (fPadHits   && gAlice->TreeH() && cH) {
-      MakeBranchInTree(gAlice->TreeH(), 
-                       branchname, &fPadHits, kBufferSize, file);
-    }
-    
-    if (cD) {
-      //
-      // one branch for digits per chamber
-      // 
-      Int_t i;
-    
-      for (i=0; i<AliMUONConstants::NCh() ;i++) {
-           sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);     
-           if (fDchambers   && gAlice->TreeD()) {
-            MakeBranchInTree(gAlice->TreeD(), 
-                             branchname, &((*fDchambers)[i]), kBufferSize, file);
-             printf("Making Branch %s for digits in chamber %d\n",branchname,i+1);
-        }
-         }     
-    }
-    
-    if (cR) {
-      //     
-      // one branch for raw clusters per chamber
-      //  
-      printf("Make Branch - TreeR address %p\n",gAlice->TreeR());
-      
-      Int_t i;
-
-      for (i=0; i<AliMUONConstants::NTrackingCh() ;i++) {
-           sprintf(branchname,"%sRawClusters%d",GetName(),i+1);        
-           if (fRawClusters   && gAlice->TreeR()) {
-              MakeBranchInTree(gAlice->TreeR(), 
-                               branchname, &((*fRawClusters)[i]), kBufferSize, file);
-             printf("Making Branch %s for raw clusters in chamber %d\n",branchname,i+1);
-           }   
-      }
-      //
-      // one branch for global trigger
-      //
-      sprintf(branchname,"%sGlobalTrigger",GetName());
-      if (fGlobalTrigger && gAlice->TreeR()) {  
-          MakeBranchInTree(gAlice->TreeR(), 
-                           branchname, &fGlobalTrigger, kBufferSize, file);
-           printf("Making Branch %s for Global Trigger\n",branchname);
-      }
-      //
-      // one branch for local trigger
-      //  
-      sprintf(branchname,"%sLocalTrigger",GetName());
-      if (fLocalTrigger && gAlice->TreeR()) {  
-          MakeBranchInTree(gAlice->TreeR(), 
-                           branchname, &fLocalTrigger, kBufferSize, file);
-           printf("Making Branch %s for Local Trigger\n",branchname);
-      }
-   }
-}
-
-//___________________________________________
-void AliMUON::SetTreeAddress()
-{
-  // Set branch address for the Hits and Digits Tree.
-  char branchname[30];
-  AliDetector::SetTreeAddress();
-
-  TBranch *branch;
-  TTree *treeH = gAlice->TreeH();
-  TTree *treeD = gAlice->TreeD();
-  TTree *treeR = gAlice->TreeR();
-
-  if (treeH) {
-    if (fPadHits) {
-      branch = treeH->GetBranch("MUONCluster");
-      if (branch) branch->SetAddress(&fPadHits);
-    }
-  }
-
-  if (treeD) {
-      for (int i=0; i<AliMUONConstants::NCh(); i++) {
-         sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);
-         if (fDchambers) {
-             branch = treeD->GetBranch(branchname);
-             if (branch) branch->SetAddress(&((*fDchambers)[i]));
-         }
-      }
-  }
-
-  // printf("SetTreeAddress --- treeR address  %p \n",treeR);
-
-  if (treeR) {
-      for (int i=0; i<AliMUONConstants::NTrackingCh(); i++) {
-         sprintf(branchname,"%sRawClusters%d",GetName(),i+1);
-         if (fRawClusters) {
-             branch = treeR->GetBranch(branchname);
-             if (branch) branch->SetAddress(&((*fRawClusters)[i]));
-         }
-      }
-
-      if (fLocalTrigger) {
-       branch = treeR->GetBranch("MUONLocalTrigger");
-       if (branch) branch->SetAddress(&fLocalTrigger);
-      }
-      if (fGlobalTrigger) {
-       branch = treeR->GetBranch("MUONGlobalTrigger");
-       if (branch) branch->SetAddress(&fGlobalTrigger);
-      }
+  return 9999;
+}
+//__________________________________________________________________
+void  AliMUON::SetTreeAddress()
+{
+  GetMUONData()->SetLoader(fLoader); 
+  //  GetMUONData()->MakeBranch("D,S,RC");
+  //  GetMUONData()->SetTreeAddress("H,D,S,RC");
+  GetMUONData()->SetTreeAddress("H");
+  if (fHits !=  GetMUONData()->Hits())  {
+    if ( gAlice->GetMCApp() )
+      if ( gAlice->GetMCApp()->GetHitLists() ) {
+       fHits = GetMUONData()->Hits();
+       gAlice->GetMCApp()->AddHitList(fHits); // For purifyKine, only necessary when Hit list is created in AliMUONData
+      }  
   }
-}
-//___________________________________________
-void AliMUON::ResetHits()
-{
-  // Reset number of clusters and the cluster array for this detector
-  AliDetector::ResetHits();
-  fNPadHits = 0;
-  if (fPadHits) fPadHits->Clear();
-}
-
-//____________________________________________
-void AliMUON::ResetDigits()
-{
-    //
-    // Reset number of digits and the digits array for this detector
-    //
-    for ( int i=0;i<AliMUONConstants::NCh();i++ ) {
-      //PH     if ((*fDchambers)[i])    ((TClonesArray*)(*fDchambers)[i])->Clear();
-       if ((*fDchambers)[i])    ((TClonesArray*)fDchambers->At(i))->Clear();
-       if (fNdch)  fNdch[i]=0;
-    }
-}
-//____________________________________________
-void AliMUON::ResetRawClusters()
-{
-    //
-    // Reset number of raw clusters and the raw clust array for this detector
-    //
-    for ( int i=0;i<AliMUONConstants::NTrackingCh();i++ ) {
-      //PH     if ((*fRawClusters)[i])    ((TClonesArray*)(*fRawClusters)[i])->Clear();
-       if ((*fRawClusters)[i])    ((TClonesArray*)fRawClusters->At(i))->Clear();
-       if (fNrawch)  fNrawch[i]=0;
-    }
-}
-
-//____________________________________________
-void AliMUON::ResetTrigger()
-{
-  //  Reset Local and Global Trigger 
-  fNGlobalTrigger = 0;
-  if (fGlobalTrigger) fGlobalTrigger->Clear();
-  fNLocalTrigger = 0;
-  if (fLocalTrigger) fLocalTrigger->Clear();
+  fHits = GetMUONData()->Hits(); // Added by Ivana to use the methods FisrtHit, NextHit of AliDetector    
 }
 
-//____________________________________________
+//____________________________________________________________________
 void AliMUON::SetPadSize(Int_t id, Int_t isec, Float_t p1, Float_t p2)
 {
 // Set the pad size for chamber id and cathode isec
     Int_t i=2*(id-1);
-    //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i])  ->SetPadSize(isec,p1,p2);
-    //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i+1])->SetPadSize(isec,p1,p2);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))  ->SetPadSize(isec,p1,p2);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i+1))->SetPadSize(isec,p1,p2);
 }
@@ -746,12 +256,10 @@ void AliMUON::SetChambersZ(const Float_t *Z)
   // Set Z values for all chambers (tracking and trigger)
   // from the array pointed to by "Z"
     for (Int_t ch = 0; ch < AliMUONConstants::NCh(); ch++)
-      //PH     ((AliMUONChamber*) ((*fChambers)[ch]))->SetZ(Z[ch]);
        ((AliMUONChamber*) fChambers->At(ch))->SetZ(Z[ch]);
     return;
 }
-
-//___________________________________________
+//_________________________________________________________________
 void AliMUON::SetChambersZToDefault()
 {
   // Set Z values for all chambers (tracking and trigger)
@@ -759,129 +267,141 @@ void AliMUON::SetChambersZToDefault()
   SetChambersZ(AliMUONConstants::DefaultChamberZ());
   return;
 }
-
-//___________________________________________
+//_________________________________________________________________
 void AliMUON::SetChargeSlope(Int_t id, Float_t p1)
 {
 // Set the inverse charge slope for chamber id
-    Int_t i=2*(id-1);
-    //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i])->SetChargeSlope(p1);
-    //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i+1])->SetChargeSlope(p1);
+    Int_t i=2*(id-1);    //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i])->SetSigmaIntegration(p1);
+    //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i+1])->SetSigmaIntegration(p1);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))->SetChargeSlope(p1);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i+1))->SetChargeSlope(p1);
 }
-
-//___________________________________________
+//__________________________________________________________________
 void AliMUON::SetChargeSpread(Int_t id, Float_t p1, Float_t p2)
 {
 // Set sigma of charge spread for chamber id
     Int_t i=2*(id-1);
-    //PH    ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))->SetChargeSpread(p1,p2);
-    //PH    ((AliMUONChamber*) fChambers->Ati+1])->SetChargeSpread(p1,p2);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))->SetChargeSpread(p1,p2);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i+1))->SetChargeSpread(p1,p2);
 }
-
-//___________________________________________
+//___________________________________________________________________
 void AliMUON::SetSigmaIntegration(Int_t id, Float_t p1)
 {
 // Set integration limits for charge spread
     Int_t i=2*(id-1);
-    //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i])->SetSigmaIntegration(p1);
-    //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i+1])->SetSigmaIntegration(p1);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))->SetSigmaIntegration(p1);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i+1))->SetSigmaIntegration(p1);
 }
 
-//___________________________________________
+//__________________________________________________________________
 void AliMUON::SetMaxAdc(Int_t id, Int_t p1)
 {
 // Set maximum number for ADCcounts (saturation)
     Int_t i=2*(id-1);
-    //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i])->SetMaxAdc(p1);
-    //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[i+1])->SetMaxAdc(p1);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i))->SetMaxAdc(p1);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(i+1))->SetMaxAdc(p1);
 }
-
-//___________________________________________
+//__________________________________________________________________
 void AliMUON::SetMaxStepGas(Float_t p1)
 {
 // Set stepsize in gas
-     fMaxStepGas=p1;
+  fMaxStepGas=p1;
 }
-
-//___________________________________________
+//__________________________________________________________________
 void AliMUON::SetMaxStepAlu(Float_t p1)
 {
 // Set step size in Alu
     fMaxStepAlu=p1;
 }
-
-//___________________________________________
+//__________________________________________________________________
 void AliMUON::SetMaxDestepGas(Float_t p1)
 {
 // Set maximum step size in Gas
     fMaxDestepGas=p1;
 }
-
-//___________________________________________
+//__________________________________________________________________
 void AliMUON::SetMaxDestepAlu(Float_t p1)
 {
 // Set maximum step size in Alu
-    fMaxDestepAlu=p1;
+  fMaxDestepAlu=p1;
 }
-//___________________________________________
+//___________________________________________________________________
 void AliMUON::SetAcceptance(Bool_t acc, Float_t angmin, Float_t angmax)
 {
 // Set acceptance cuts 
-   fAccCut=acc;
-   fAccMin=angmin*TMath::Pi()/180;
-   fAccMax=angmax*TMath::Pi()/180;
-   Int_t ch;
-   if (acc) {
-       for (Int_t st = 0; st < AliMUONConstants::NCh() / 2; st++) {
-          // Loop over 2 chambers in the station
-          for (Int_t stCH = 0; stCH < 2; stCH++) {
-              ch = 2 * st + stCH;
-//         Set chamber inner and outer radius according to acceptance cuts
-              Chamber(ch).SetRInner(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch)*TMath::Tan(fAccMin));
-              Chamber(ch).SetROuter(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch)*TMath::Tan(fAccMax));
-          } // chamber loop
-       } // station loop
-   }
+  fAccCut=acc;
+  fAccMin=angmin*TMath::Pi()/180;
+  fAccMax=angmax*TMath::Pi()/180;
+  Int_t ch;
+  if (acc) {
+    for (Int_t st = 0; st < AliMUONConstants::NCh() / 2; st++) {
+      // Loop over 2 chambers in the station
+      for (Int_t stCH = 0; stCH < 2; stCH++) {
+       ch = 2 * st + stCH;
+       //         Set chamber inner and outer radius according to acceptance cuts
+       Chamber(ch).SetRInner(TMath::Abs(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch)*TMath::Tan(fAccMin)));
+       Chamber(ch).SetROuter(TMath::Abs(AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch)*TMath::Tan(fAccMax)));
+      } // chamber loop
+    } // station loop
+  }
 }
-//___________________________________________
+
+//____________________________________________________________________
+Float_t  AliMUON::GetMaxStepGas() const
+{
+// Return stepsize in gas
+  
+  return fMaxStepGas;
+}  
+
+//____________________________________________________________________
+Float_t  AliMUON::GetMaxStepAlu() const
+{
+// Return step size in Alu
+  
+  return fMaxStepAlu;
+}
+  
+//____________________________________________________________________
+Float_t  AliMUON::GetMaxDestepGas() const
+{
+// Return maximum step size in Gas
+  
+  return fMaxDestepGas;
+}
+  
+//____________________________________________________________________
+Float_t  AliMUON::GetMaxDestepAlu() const
+{
+// Return maximum step size in Gas
+  
+  return fMaxDestepAlu;
+}
+//____________________________________________________________________
 void   AliMUON::SetSegmentationModel(Int_t id, Int_t isec, AliSegmentation *segmentation)
 {
 // Set the segmentation for chamber id cathode isec
-  //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[id])->SetSegmentationModel(isec, segmentation);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(id))->SetSegmentationModel(isec, segmentation);
 
 }
-//___________________________________________
+//____________________________________________________________________
 void   AliMUON::SetResponseModel(Int_t id, AliMUONResponse *response)
 {
 // Set the response for chamber id
-  //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[id])->SetResponseModel(response);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(id))->SetResponseModel(response);
 }
-
-void   AliMUON::SetReconstructionModel(Int_t id, AliMUONClusterFinderVS *reconst)
-{
-// Set ClusterFinder for chamber id
-  //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[id])->SetReconstructionModel(reconst);
-    ((AliMUONChamber*) fChambers->At(id))->SetReconstructionModel(reconst);
-}
-
+//____________________________________________________________________
 void   AliMUON::SetNsec(Int_t id, Int_t nsec)
 {
 // Set number of segmented cathods for chamber id
-  //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[id])->SetNsec(nsec);
     ((AliMUONChamber*) fChambers->At(id))->SetNsec(nsec);
 }
-
-//___________________________________________
+//____________________________________________________________________
+AliDigitizer* AliMUON::CreateDigitizer(AliRunDigitizer* manager) const
+{
+  return new AliMUONDigitizerv2(manager);
+}
+//_____________________________________________________________________
 void AliMUON::SDigits2Digits()
 {
 
@@ -897,296 +417,45 @@ void AliMUON::SDigits2Digits()
     fMerger->Init();
     fMerger->Digitise();
     char hname[30];
-    sprintf(hname,"TreeD%d",gAlice->GetHeader()->GetEvent());
-    gAlice->TreeD()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
-    gAlice->TreeD()->Reset();
-}
-
-//___________________________________________
-void AliMUON::MakePadHits(Float_t xhit,Float_t yhit, Float_t zhit,
-                         Float_t eloss, Float_t tof,  Int_t idvol)
-{
-//
-//  Calls the charge disintegration method of the current chamber and adds
-//  the simulated cluster to the root treee 
-//
-    Int_t clhits[7];
-    Float_t newclust[6][500];
-    Int_t nnew;
-    
-    
-//
-//  Integrated pulse height on chamber
-
-    
-    clhits[0]=fNhits+1;
-//
-//
-//    if (idvol == 6) printf("\n ->Disintegration %f %f %f", xhit, yhit, eloss );
-    
-
-    //PH    ((AliMUONChamber*) (*fChambers)[idvol])
-    ((AliMUONChamber*) fChambers->At(idvol))
-       ->DisIntegration(eloss, tof, xhit, yhit, zhit, nnew, newclust);
-    Int_t ic=0;
-//    if (idvol == 6) printf("\n nnew  %d \n", nnew);
-//
-//  Add new clusters
-    for (Int_t i=0; i<nnew; i++) {
-       if (Int_t(newclust[3][i]) > 0) {
-           ic++;
-// Cathode plane
-           clhits[1] = Int_t(newclust[5][i]);
-//  Cluster Charge
-           clhits[2] = Int_t(newclust[0][i]);
-//  Pad: ix
-           clhits[3] = Int_t(newclust[1][i]);
-//  Pad: iy 
-           clhits[4] = Int_t(newclust[2][i]);
-//  Pad: charge
-           clhits[5] = Int_t(newclust[3][i]);
-//  Pad: chamber sector
-           clhits[6] = Int_t(newclust[4][i]);
-           
-           AddPadHit(clhits);
-       }
-    }
-}
-
-//___________________________________________
-void AliMUON::Trigger(Int_t nev){
-// call the Trigger Algorithm and fill TreeR
-
-  Int_t singlePlus[3]  = {0,0,0}; 
-  Int_t singleMinus[3] = {0,0,0}; 
-  Int_t singleUndef[3] = {0,0,0};
-  Int_t pairUnlike[3]  = {0,0,0}; 
-  Int_t pairLike[3]    = {0,0,0};
-
-  ResetTrigger();
-  AliMUONTriggerDecision* decision= new AliMUONTriggerDecision(1);
-  decision->Trigger();   
-  decision->GetGlobalTrigger(singlePlus, singleMinus, singleUndef,
-                            pairUnlike, pairLike);
-// add a local trigger in the list 
-  AddGlobalTrigger(singlePlus, singleMinus, singleUndef, pairUnlike, pairLike);
-  Int_t i;
-  
-  for (Int_t icirc=0; icirc<AliMUONConstants::NTriggerCircuit(); icirc++) { 
-      if(decision->GetITrigger(icirc)==1) {
-         Int_t localtr[7]={0,0,0,0,0,0,0};      
-         Int_t loLpt[2]={0,0}; Int_t loHpt[2]={0,0}; Int_t loApt[2]={0,0};
-         decision->GetLutOutput(icirc, loLpt, loHpt, loApt);
-         localtr[0] = icirc;
-         localtr[1] = decision->GetStripX11(icirc);
-         localtr[2] = decision->GetDev(icirc);
-         localtr[3] = decision->GetStripY11(icirc);
-         for (i=0; i<2; i++) {    // convert the Lut output in 1 digit 
-             localtr[4] = localtr[4]+Int_t(loLpt[i]*TMath::Power(2,i));
-             localtr[5] = localtr[5]+Int_t(loHpt[i]*TMath::Power(2,i));
-             localtr[6] = localtr[6]+Int_t(loApt[i]*TMath::Power(2,i));
-         }
-         AddLocalTrigger(localtr);  // add a local trigger in the list
-      }
+    //    sprintf(hname,"TreeD%d",fLoader->GetHeader()->GetEvent());
+    fLoader->TreeD()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
+    fLoader->TreeD()->Reset();
+}
+
+//_____________________________________________________________________
+void AliMUON::Hits2SDigits()
+{
+  // Adaption of AliMUONSDigitizerv1 to be excuted by the AliSimulation framework
+  AliRunLoader* runLoader = fLoader->GetRunLoader();
+  AliRunDigitizer   * manager = new AliRunDigitizer(1,1);
+  manager->SetInputStream(0,runLoader->GetFileName(),AliConfig::GetDefaultEventFolderName());
+  AliMUONDigitizer * dMUON   = new AliMUONSDigitizerv1(manager);
+  fLoader->LoadHits("READ");
+  for (Int_t iEvent = 0; iEvent < runLoader->GetNumberOfEvents(); iEvent++) {
+    runLoader->GetEvent(iEvent);
+    dMUON->Exec("");
   }
-  delete decision;
-
-  gAlice->TreeR()->Fill();
-  ResetTrigger();
-  char hname[30];
-  sprintf(hname,"TreeR%d",nev);
-  gAlice->TreeR()->Write(hname,TObject::kOverwrite);
-  gAlice->TreeR()->Reset();
-  printf("\n End of trigger for event %d", nev);
-}
-
-
-//____________________________________________
-void AliMUON::Digits2Reco()
-{
-  FindClusters();
-  Int_t nev = gAlice->GetHeader()->GetEvent();
-  gAlice->TreeR()->Fill();
-  char hname[30];
-  sprintf(hname,"TreeR%d", nev);
-  gAlice->TreeR()->Write(hname);
-  gAlice->TreeR()->Reset();
-  ResetRawClusters();        
-  printf("\n End of cluster finding for event %d", nev);
-}
-
-void AliMUON::FindClusters()
-{
-//
-//  Perform cluster finding
-//
-    TClonesArray *dig1, *dig2;
-    Int_t ndig, k;
-    dig1 = new TClonesArray("AliMUONDigit",1000);
-    dig2 = new TClonesArray("AliMUONDigit",1000);
-    AliMUONDigit *digit;
-//
-// Loop on chambers and on cathode planes
-//
-    ResetRawClusters();        
-    for (Int_t ich = 0; ich < 10; ich++) {
-      //PH     AliMUONChamber* iChamber = (AliMUONChamber*) (*fChambers)[ich];
-       AliMUONChamber* iChamber = (AliMUONChamber*) fChambers->At(ich);
-       AliMUONClusterFinderVS* rec = iChamber->ReconstructionModel();
-    
-       gAlice->ResetDigits();
-       gAlice->TreeD()->GetEvent(0);
-       TClonesArray *muonDigits = this->DigitsAddress(ich);
-       ndig=muonDigits->GetEntriesFast();
-       printf("\n 1 Found %d digits in %p %d", ndig, muonDigits,ich);
-       TClonesArray &lhits1 = *dig1;
-       Int_t n = 0;
-       for (k = 0; k < ndig; k++) {
-           digit = (AliMUONDigit*) muonDigits->UncheckedAt(k);
-           if (rec->TestTrack(digit->Track(0)))
-               new(lhits1[n++]) AliMUONDigit(*digit);
-       }
-       gAlice->ResetDigits();
-       gAlice->TreeD()->GetEvent(1);
-       muonDigits  = this->DigitsAddress(ich);
-       ndig=muonDigits->GetEntriesFast();
-       printf("\n 2 Found %d digits in %p %d", ndig, muonDigits, ich);
-       TClonesArray &lhits2 = *dig2;
-       n=0;
-       
-       for (k=0; k<ndig; k++) {
-           digit= (AliMUONDigit*) muonDigits->UncheckedAt(k);
-           if (rec->TestTrack(digit->Track(0)))
-           new(lhits2[n++]) AliMUONDigit(*digit);
-       }
-
-       if (rec) {       
-           AliMUONClusterInput::Instance()->SetDigits(ich, dig1, dig2);
-           rec->FindRawClusters();
-       }
-       dig1->Delete();
-       dig2->Delete();
-    } // for ich
-    delete dig1;
-    delete dig2;
-}
-#ifdef never
-void AliMUON::Streamer(TBuffer &R__b)
-{
-   // Stream an object of class AliMUON.
-      AliMUONChamber        *iChamber;
-      AliMUONTriggerCircuit *iTriggerCircuit;
-      AliSegmentation       *segmentation;
-      AliMUONResponse       *response;
-      TClonesArray          *digitsaddress;
-      TClonesArray          *rawcladdress;
-      Int_t i;
-      if (R__b.IsReading()) {
-         Version_t R__v = R__b.ReadVersion(); if (R__v) { }
-         AliDetector::Streamer(R__b);
-         R__b >> fNPadHits;
-         R__b >> fPadHits; // diff
-         R__b >> fNLocalTrigger;       
-         R__b >> fLocalTrigger;       
-         R__b >> fNGlobalTrigger;       
-         R__b >> fGlobalTrigger;   
-         R__b >> fDchambers;
-         R__b >> fRawClusters;
-         R__b.ReadArray(fNdch);
-         R__b.ReadArray(fNrawch);
-         R__b >> fAccCut;
-         R__b >> fAccMin;
-         R__b >> fAccMax; 
-         R__b >> fChambers;
-         R__b >> fTriggerCircuits;
-         for (i =0; i<AliMUONConstants::NTriggerCircuit(); i++) {
-             iTriggerCircuit=(AliMUONTriggerCircuit*) (*fTriggerCircuits)[i];
-             iTriggerCircuit->Streamer(R__b);
-         }
-// Stream chamber related information
-         for (i =0; i<AliMUONConstants::NCh(); i++) {
-             iChamber=(AliMUONChamber*) (*fChambers)[i];
-             iChamber->Streamer(R__b);
-             if (iChamber->Nsec()==1) {
-                 segmentation=iChamber->SegmentationModel(1);
-                 if (segmentation)
-                     segmentation->Streamer(R__b);
-             } else {
-                 segmentation=iChamber->SegmentationModel(1);
-                 if (segmentation)
-                     segmentation->Streamer(R__b);
-                 if (segmentation)
-                     segmentation=iChamber->SegmentationModel(2);
-                 segmentation->Streamer(R__b);
-             }
-             response=iChamber->ResponseModel();
-             if (response)
-                 response->Streamer(R__b);       
-             digitsaddress=(TClonesArray*) (*fDchambers)[i];
-             digitsaddress->Streamer(R__b);
-             if (i < AliMUONConstants::NTrackingCh()) {
-                 rawcladdress=(TClonesArray*) (*fRawClusters)[i];
-                 rawcladdress->Streamer(R__b);
-             }
-         }
-         
-      } else {
-         R__b.WriteVersion(AliMUON::IsA());
-         AliDetector::Streamer(R__b);
-         R__b << fNPadHits;
-         R__b << fPadHits; // diff
-         R__b << fNLocalTrigger;       
-         R__b << fLocalTrigger;       
-         R__b << fNGlobalTrigger;       
-         R__b << fGlobalTrigger; 
-         R__b << fDchambers;
-         R__b << fRawClusters;
-         R__b.WriteArray(fNdch, AliMUONConstants::NCh());
-         R__b.WriteArray(fNrawch, AliMUONConstants::NTrackingCh());
-         
-         R__b << fAccCut;
-         R__b << fAccMin;
-         R__b << fAccMax; 
-         
-         R__b << fChambers;
-         R__b << fTriggerCircuits;
-         for (i =0; i<AliMUONConstants::NTriggerCircuit(); i++) {
-             iTriggerCircuit=(AliMUONTriggerCircuit*) (*fTriggerCircuits)[i];
-             iTriggerCircuit->Streamer(R__b);
-         }
-         for (i =0; i<AliMUONConstants::NCh(); i++) {
-             iChamber=(AliMUONChamber*) (*fChambers)[i];
-             iChamber->Streamer(R__b);
-             if (iChamber->Nsec()==1) {
-                 segmentation=iChamber->SegmentationModel(1);
-                 if (segmentation)
-                     segmentation->Streamer(R__b);
-             } else {
-                 segmentation=iChamber->SegmentationModel(1);
-                 if (segmentation)
-                     segmentation->Streamer(R__b);
-                 segmentation=iChamber->SegmentationModel(2);
-                 if (segmentation)
-                     segmentation->Streamer(R__b);
-             }
-             response=iChamber->ResponseModel();
-             if (response)
-                 response->Streamer(R__b);
-             digitsaddress=(TClonesArray*) (*fDchambers)[i];
-             digitsaddress->Streamer(R__b);
-             if (i < AliMUONConstants::NTrackingCh()) {
-                 rawcladdress=(TClonesArray*) (*fRawClusters)[i];
-                 rawcladdress->Streamer(R__b);
-             }
-         }
-      }
-}
-#endif
-
+  fLoader->UnloadHits();
+}
+//_______________________________________________________________________
+AliLoader* AliMUON::MakeLoader(const char* topfoldername)
+{ 
+//builds standard getter (AliLoader type)
+//if detector wants to use castomized getter, it must overload this method
+
+ if (GetDebug())
+   Info("MakeLoader",
+        "Creating standard getter for detector %s. Top folder is %s.",
+         GetName(),topfoldername);
+ fLoader   = new AliLoader(GetName(),topfoldername);
+ fMUONData = new AliMUONData(fLoader,GetName(),GetName()); 
+ fMUONData->SetSplitLevel(fSplitLevel);
+ return fLoader;
+}
+//_______________________________________________________________________
 AliMUONPadHit* AliMUON::FirstPad(AliMUONHit*  hit, TClonesArray *clusters) 
 {
-//
+// to be removed
     // Initialise the pad iterator
     // Return the address of the first padhit for hit
     TClonesArray *theClusters = clusters;
@@ -1199,9 +468,10 @@ AliMUONPadHit* AliMUON::FirstPad(AliMUONHit*  hit, TClonesArray *clusters)
        return 0;
     }
 }
-
+//_______________________________________________________________________
 AliMUONPadHit* AliMUON::NextPad(TClonesArray *clusters) 
 {
+  // To be removed
 // Get next pad (in iterator) 
 //
     AliMUON::fCurIterPad++;
@@ -1211,16 +481,16 @@ AliMUONPadHit* AliMUON::NextPad(TClonesArray *clusters)
        return 0;
     }
 }
-
+//_______________________________________________________________________
 
 AliMUONRawCluster *AliMUON::RawCluster(Int_t ichamber, Int_t icathod, Int_t icluster)
 {
 //
 //  Return rawcluster (icluster) for chamber ichamber and cathode icathod
 //  Obsolete ??
-    TClonesArray *muonRawCluster  = RawClustAddress(ichamber);
+    TClonesArray *muonRawCluster  = GetMUONData()->RawClusters(ichamber);
     ResetRawClusters();
-    TTree *treeR = gAlice->TreeR();
+    TTree *treeR = fLoader->TreeR();
     Int_t nent=(Int_t)treeR->GetEntries();
     treeR->GetEvent(nent-2+icathod-1);
     //treeR->GetEvent(icathod);
@@ -1231,50 +501,49 @@ AliMUONRawCluster *AliMUON::RawCluster(Int_t ichamber, Int_t icathod, Int_t iclu
     
     return  mRaw;
 }
+//________________________________________________________________________
 void   AliMUON::SetMerger(AliMUONMerger* merger)
 {
 // Set pointer to merger 
     fMerger = merger;
 }
-
+//________________________________________________________________________
 AliMUONMerger*  AliMUON::Merger()
 {
 // Return pointer to merger
     return fMerger;
 }
-
-
-
-AliMUON& AliMUON::operator = (const AliMUON& rhs)
+//________________________________________________________________________
+AliMUON& AliMUON::operator = (const AliMUON& /*rhs*/)
 {
 // copy operator
 // dummy version
     return *this;
 }
-
-////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-void AliMUON::MakeBranchInTreeD(TTree *treeD, const char *file)
+//________________________________________________________________________
+void AliMUON::RemapTrackHitIDs(Int_t* map)
 {
-    //
-    // Create TreeD branches for the MUON.
-    //
-
-  const Int_t kBufferSize = 4000;
-  char branchname[30];
-    
-  //
-  // one branch for digits per chamber
-  // 
-  for (Int_t i=0; i<AliMUONConstants::NCh() ;i++) {
-    sprintf(branchname,"%sDigits%d",GetName(),i+1);    
-    if (fDchambers && treeD) {
-      MakeBranchInTree(treeD, 
-                      branchname, &((*fDchambers)[i]), kBufferSize, file);
-//      printf("Making Branch %s for digits in chamber %d\n",branchname,i+1);
-    }
-  }
-}
-
-//___________________________________________
+// Remaps the track numbers in the hits arrays, so that they correspond
+// to the entry indices in the Kine tree.
+// The correspondance is not direct. To get the real index into the Kine tree
+// compute the particle index as follows:
+//
+//   num_primaries = AliStack::GetNprimary();
+//   num_tracks = AliStack::GetNtracks();
+//   track = AliMUONHit::Track()
+//
+//   if (track < num_primaries)
+//       particleindex = track + num_tracks - num_primaries;
+//   else
+//       particleindex = track - num_primaries;
+       
+       // Remap the track numbers based on the specified map.
+       AliMUONData* data = GetMUONData();
+       TClonesArray* hits = data->Hits();
+       for (Int_t i = 0; i < hits->GetEntriesFast(); i++)
+       {
+               AliMUONHit* hit = static_cast<AliMUONHit*>( hits->At(i) );
+               hit->SetTrack( map[hit->Track()] );
+       };
+};