]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - MUON/AliMUONVTrackReconstructor.cxx
DQM configure file
[u/mrichter/AliRoot.git] / MUON / AliMUONVTrackReconstructor.cxx
index 547e8990290353f4ee5bbfed4eb0b6ef3925522a..c4aa0e59b40852151d8e39d44e2fcb8282207878 100644 (file)
 /// * ValidateTracksWithTrigger to match tracker/trigger tracks
 ///
 /// Several options and adjustable parameters are available for both KALMAN and ORIGINAL
-/// tracking algorithms. They can be changed by using:
-/// AliMUONRecoParam *muonRecoParam = AliMUONRecoParam::GetLow(High)FluxParam();
-/// muonRecoParam->Set...(); // see methods in AliMUONRecoParam.h for details
-/// AliMUONReconstructor::SetRecoParam(muonRecoParam);
+/// tracking algorithms. They can be changed through the AliMUONRecoParam object
+/// set in the reconstruction macro or read from the CDB
+/// (see methods in AliMUONRecoParam.h file for details)
 ///
 /// Main parameters and options are:
 /// - *fgkSigmaToCutForTracking* : quality cut used to select new clusters to be
 #include "AliMUONVClusterServer.h"
 #include "AliMUONVTriggerStore.h"
 #include "AliMUONVTriggerTrackStore.h"
+#include "AliMUONRecoParam.h"
+
 #include "AliMpDEManager.h"
 #include "AliMpArea.h"
 
+#include "AliMpDDLStore.h"
+#include "AliMpVSegmentation.h"
+#include "AliMpSegmentation.h"
+#include "AliMpPad.h"
+
 #include "AliLog.h"
 #include "AliCodeTimer.h"
 #include "AliTracker.h"
 
 #include <Riostream.h>
 
+using std::cout;
+using std::endl;
 /// \cond CLASSIMP
 ClassImp(AliMUONVTrackReconstructor) // Class implementation in ROOT context
 /// \endcond
 
   //__________________________________________________________________________
-AliMUONVTrackReconstructor::AliMUONVTrackReconstructor(AliMUONVClusterServer& clusterServer)
-  : TObject(),
-    fRecTracksPtr(0x0),
-    fNRecTracks(0),
-  fClusterServer(clusterServer)
+AliMUONVTrackReconstructor::AliMUONVTrackReconstructor(const AliMUONRecoParam* recoParam,
+                                                       AliMUONVClusterServer* clusterServer)
+: TObject(),
+fRecTracksPtr(0x0),
+fNRecTracks(0),
+fClusterServer(clusterServer),
+fkRecoParam(recoParam),
+fMaxMCSAngle2(0x0)
 {
   /// Constructor for class AliMUONVTrackReconstructor
+  /// WARNING: if clusterServer=0x0, no clusterization will be possible at this level
   
   // Memory allocation for the TClonesArray of reconstructed tracks
   fRecTracksPtr = new TClonesArray("AliMUONTrack", 100);
   
   // set the magnetic field for track extrapolations
-  const AliMagF* kField = AliTracker::GetFieldMap();
-  if (!kField) AliFatal("No field available");
-  AliMUONTrackExtrap::SetField(kField);
+  AliMUONTrackExtrap::SetField();
+  
+  // set the maximum MCS angle in chamber from the minimum acceptable momentum
+  AliMUONTrackParam param;
+  Double_t inverseBendingP = (GetRecoParam()->GetMinBendingMomentum() > 0.) ? 1./GetRecoParam()->GetMinBendingMomentum() : 1.;
+  param.SetInverseBendingMomentum(inverseBendingP);
+  fMaxMCSAngle2 = new Double_t [AliMUONConstants::NTrackingCh()];
+  for (Int_t iCh=0; iCh<AliMUONConstants::NTrackingCh(); iCh++)
+    fMaxMCSAngle2[iCh] = AliMUONTrackExtrap::GetMCSAngle2(param, AliMUONConstants::ChamberThicknessInX0(iCh), 1.);
+  
 }
 
   //__________________________________________________________________________
@@ -115,6 +134,7 @@ AliMUONVTrackReconstructor::~AliMUONVTrackReconstructor()
 {
   /// Destructor for class AliMUONVTrackReconstructor
   delete fRecTracksPtr;
+  delete[] fMaxMCSAngle2;
 }
 
   //__________________________________________________________________________
@@ -131,102 +151,235 @@ void AliMUONVTrackReconstructor::EventReconstruct(AliMUONVClusterStore& clusterS
 {
   /// To reconstruct one event
   AliDebug(1,"");
-  AliCodeTimerAuto("");
+  AliCodeTimerAuto("",0);
   
   // Reset array of tracks
   ResetTracks();
   
-  // Look for candidates from clusters in stations(1..) 4 and 5
-  MakeTrackCandidates(clusterStore);
+  // Look for candidates from clusters in stations(1..) 4 and 5 (abort in case of failure)
+  if (!MakeTrackCandidates(clusterStore)) return;
   
-  // Look for extra candidates from clusters in stations(1..) 4 and 5
-  if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->MakeMoreTrackCandidates()) MakeMoreTrackCandidates(clusterStore);
+  // Look for extra candidates from clusters in stations(1..) 4 and 5 (abort in case of failure)
+  if (GetRecoParam()->MakeMoreTrackCandidates()) {
+    if (!MakeMoreTrackCandidates(clusterStore)) return;
+  }
   
   // Stop tracking if no candidate found
   if (fRecTracksPtr->GetEntriesFast() == 0) return;
   
-  // Follow tracks in stations(1..) 3, 2 and 1
-  FollowTracks(clusterStore);
+  // Follow tracks in stations(1..) 3, 2 and 1 (abort in case of failure)
+  if (!FollowTracks(clusterStore)) return;
   
   // Complement the reconstructed tracks
-  if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->ComplementTracks()) ComplementTracks(clusterStore);
+  if (GetRecoParam()->ComplementTracks()) {
+    if (ComplementTracks(clusterStore)) RemoveIdenticalTracks();
+  }
   
   // Improve the reconstructed tracks
-  if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->ImproveTracks()) ImproveTracks();
+  if (GetRecoParam()->ImproveTracks()) ImproveTracks();
   
-  // Remove double tracks
-  RemoveDoubleTracks();
+  // Remove connected tracks
+  RemoveConnectedTracks(3, 4, kFALSE);
+  RemoveConnectedTracks(2, 2, kFALSE);
+  if (GetRecoParam()->RemoveConnectedTracksInSt12()) RemoveConnectedTracks(0, 1, kFALSE);
   
   // Fill AliMUONTrack data members
   Finalize();
+  if (!GetRecoParam()->RemoveConnectedTracksInSt12()) TagConnectedTracks(0, 1, kTRUE);
   
   // Add tracks to MUON data container 
-  for (Int_t i=0; i<fNRecTracks; ++i) 
+  for (Int_t i=0; i<fNRecTracks; ++i)
   {
     AliMUONTrack * track = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->At(i);
-    track->SetUniqueID(i+1);
-    trackStore.Add(*track);
+    if (track->GetGlobalChi2() < AliMUONTrack::MaxChi2()) {
+      track->SetUniqueID(i+1);
+      trackStore.Add(*track);
+    } else AliWarning("problem occur somewhere during track refitting --> discard track");
   }
 }
 
-  //__________________________________________________________________________
+//__________________________________________________________________________
+Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::IsAcceptable(AliMUONTrackParam &trackParam)
+{
+  /// Return kTRUE if the track is within given limits on momentum/angle/origin
+  
+  const TMatrixD& kParamCov = trackParam.GetCovariances();
+  Int_t chamber = trackParam.GetClusterPtr()->GetChamberId();
+  Double_t z = trackParam.GetZ();
+  Double_t sigmaCut = GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking();
+  
+  // MCS dipersion
+  Double_t angleMCS2 = 0.;
+  Double_t impactMCS2 = 0.;
+  if (AliMUONTrackExtrap::IsFieldON() && chamber < 6) {
+    
+    // track momentum is known
+    for (Int_t iCh=0; iCh<=chamber; iCh++) {
+      Double_t localMCS2 = AliMUONTrackExtrap::GetMCSAngle2(trackParam, AliMUONConstants::ChamberThicknessInX0(iCh), 1.);
+      angleMCS2 += localMCS2;
+      impactMCS2 += AliMUONConstants::DefaultChamberZ(chamber) * AliMUONConstants::DefaultChamberZ(chamber) * localMCS2;
+    }
+    
+  } else {
+    
+    // track momentum is unknown
+    for (Int_t iCh=0; iCh<=chamber; iCh++) {
+      angleMCS2 += fMaxMCSAngle2[iCh];
+      impactMCS2 += AliMUONConstants::DefaultChamberZ(chamber) * AliMUONConstants::DefaultChamberZ(chamber) * fMaxMCSAngle2[iCh];
+    }
+    
+  }
+  
+  // ------ track selection in non bending direction ------
+  if (GetRecoParam()->SelectOnTrackSlope()) {
+    
+    // check if non bending slope is within tolerances
+    Double_t nonBendingSlopeErr = TMath::Sqrt(kParamCov(1,1) + angleMCS2);
+    if ((TMath::Abs(trackParam.GetNonBendingSlope()) - sigmaCut * nonBendingSlopeErr) > GetRecoParam()->GetMaxNonBendingSlope()) return kFALSE;
+    
+  } else {
+    
+    // or check if non bending impact parameter is within tolerances
+    Double_t nonBendingImpactParam = TMath::Abs(trackParam.GetNonBendingCoor() - z * trackParam.GetNonBendingSlope());
+    Double_t nonBendingImpactParamErr = TMath::Sqrt(kParamCov(0,0) + z * z * kParamCov(1,1) - 2. * z * kParamCov(0,1) + impactMCS2);
+    if ((nonBendingImpactParam - sigmaCut * nonBendingImpactParamErr) > (3. * GetRecoParam()->GetNonBendingVertexDispersion())) return kFALSE;
+    
+  }
+  
+  // ------ track selection in bending direction ------
+  if (AliMUONTrackExtrap::IsFieldON()) { // depending whether the field is ON or OFF
+    
+    // check if bending momentum is within tolerances
+    Double_t bendingMomentum = TMath::Abs(1. / trackParam.GetInverseBendingMomentum());
+    Double_t bendingMomentumErr = TMath::Sqrt(kParamCov(4,4)) * bendingMomentum * bendingMomentum;
+    if (chamber < 6 && (bendingMomentum + sigmaCut * bendingMomentumErr) < GetRecoParam()->GetMinBendingMomentum()) return kFALSE;
+    else if ((bendingMomentum + 3. * bendingMomentumErr) < GetRecoParam()->GetMinBendingMomentum()) return kFALSE;
+    
+  } else {
+    
+    if (GetRecoParam()->SelectOnTrackSlope()) {
+      
+      // check if bending slope is within tolerances
+      Double_t bendingSlopeErr = TMath::Sqrt(kParamCov(3,3) + angleMCS2);
+      if ((TMath::Abs(trackParam.GetBendingSlope()) - sigmaCut * bendingSlopeErr) > GetRecoParam()->GetMaxBendingSlope()) return kFALSE;
+      
+    } else {
+      
+      // or check if bending impact parameter is within tolerances
+      Double_t bendingImpactParam = TMath::Abs(trackParam.GetBendingCoor() - z * trackParam.GetBendingSlope());
+      Double_t bendingImpactParamErr = TMath::Sqrt(kParamCov(2,2) + z * z * kParamCov(3,3) - 2. * z * kParamCov(2,3) + impactMCS2);
+      if ((bendingImpactParam - sigmaCut * bendingImpactParamErr) > (3. * GetRecoParam()->GetBendingVertexDispersion())) return kFALSE;
+      
+    }
+    
+  }
+  
+  return kTRUE;
+  
+}
+
+//__________________________________________________________________________
 TClonesArray* AliMUONVTrackReconstructor::MakeSegmentsBetweenChambers(const AliMUONVClusterStore& clusterStore, Int_t ch1, Int_t ch2)
 {
   /// To make the list of segments from the list of clusters in the 2 given chambers.
-  /// Return a new TClonesArray of segments.
-  /// It is the responsibility of the user to delete it afterward.
+  /// Return a TClonesArray of new segments (segments made in a previous call of this function are removed).
   AliDebug(1,Form("Enter MakeSegmentsBetweenChambers (1..) %d-%d", ch1+1, ch2+1));
+  AliCodeTimerAuto("",0);
   
   AliMUONVCluster *cluster1, *cluster2;
   AliMUONObjectPair *segment;
-  Double_t nonBendingSlope = 0, bendingSlope = 0, impactParam = 0., bendingMomentum = 0.; // to avoid compilation warning
+  Double_t z1 = 0., z2 = 0., dZ = 0.;
+  Double_t nonBendingSlope = 0., nonBendingSlopeErr = 0., nonBendingImpactParam = 0., nonBendingImpactParamErr = 0.;
+  Double_t bendingSlope = 0., bendingSlopeErr = 0., bendingImpactParam = 0., bendingImpactParamErr = 0., bendingImpactParamErr2 = 0.;
+  Double_t bendingMomentum = 0., bendingMomentumErr = 0.;
+  Double_t bendingVertexDispersion2 = GetRecoParam()->GetBendingVertexDispersion() * GetRecoParam()->GetBendingVertexDispersion();
+  Double_t angleMCS2 = 0.; // maximum angular dispersion**2 due to MCS in chamber
+  Double_t impactMCS2 = 0.; // maximum impact parameter dispersion**2 due to MCS in chamber
+  for (Int_t iCh=0; iCh<=ch1; iCh++) {
+    angleMCS2 += fMaxMCSAngle2[iCh];
+    impactMCS2 += AliMUONConstants::DefaultChamberZ(iCh) * AliMUONConstants::DefaultChamberZ(iCh) * fMaxMCSAngle2[iCh];
+  }
+  Double_t sigmaCut = GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking();
   
   // Create iterators to loop over clusters in both chambers
   TIter nextInCh1(clusterStore.CreateChamberIterator(ch1,ch1));
   TIter nextInCh2(clusterStore.CreateChamberIterator(ch2,ch2));
   
   // list of segments
-  TClonesArray *segments = new TClonesArray("AliMUONObjectPair", 100);
+  static TClonesArray *segments = new TClonesArray("AliMUONObjectPair", 100);
+  segments->Clear("C");
   
   // Loop over clusters in the first chamber of the station
   while ( ( cluster1 = static_cast<AliMUONVCluster*>(nextInCh1()) ) ) {
+    z1 = cluster1->GetZ();
     
     // reset cluster iterator of chamber 2
     nextInCh2.Reset();
     
     // Loop over clusters in the second chamber of the station
     while ( ( cluster2 = static_cast<AliMUONVCluster*>(nextInCh2()) ) ) {
+      z2 = cluster2->GetZ();
+      dZ = z1 - z2;
       
-      // non bending slope
-      nonBendingSlope = (cluster1->GetX() - cluster2->GetX()) / (cluster1->GetZ() - cluster2->GetZ());
+      // ------ track selection in non bending direction ------
+      nonBendingSlope = (cluster1->GetX() - cluster2->GetX()) / dZ;
+      if (GetRecoParam()->SelectOnTrackSlope()) {
+       
+       // check if non bending slope is within tolerances
+       nonBendingSlopeErr = TMath::Sqrt((cluster1->GetErrX2() + cluster2->GetErrX2()) / dZ / dZ + angleMCS2);
+       if ((TMath::Abs(nonBendingSlope) - sigmaCut * nonBendingSlopeErr) > GetRecoParam()->GetMaxNonBendingSlope()) continue;
+       
+      } else {
+       
+       // or check if non bending impact parameter is within tolerances
+       nonBendingImpactParam = TMath::Abs(cluster1->GetX() - cluster1->GetZ() * nonBendingSlope);
+       nonBendingImpactParamErr = TMath::Sqrt((z1 * z1 * cluster2->GetErrX2() + z2 * z2 * cluster1->GetErrX2()) / dZ / dZ + impactMCS2);
+       if ((nonBendingImpactParam - sigmaCut * nonBendingImpactParamErr) > (3. * GetRecoParam()->GetNonBendingVertexDispersion())) continue;
+       
+      }
       
-      // bending slope
-      bendingSlope = (cluster1->GetY() - cluster2->GetY()) / (cluster1->GetZ() - cluster2->GetZ());
+      // ------ track selection in bending direction ------
+      bendingSlope = (cluster1->GetY() - cluster2->GetY()) / dZ;
+      if (AliMUONTrackExtrap::IsFieldON()) { // depending whether the field is ON or OFF
+       
+       // check if bending momentum is within tolerances
+       bendingImpactParam = cluster1->GetY() - cluster1->GetZ() * bendingSlope;
+       bendingImpactParamErr2 = (z1 * z1 * cluster2->GetErrY2() + z2 * z2 * cluster1->GetErrY2()) / dZ / dZ + impactMCS2;
+       bendingMomentum = TMath::Abs(AliMUONTrackExtrap::GetBendingMomentumFromImpactParam(bendingImpactParam));
+       bendingMomentumErr = TMath::Sqrt((bendingVertexDispersion2 + bendingImpactParamErr2) /
+                                        bendingImpactParam / bendingImpactParam + 0.01) * bendingMomentum;
+       if ((bendingMomentum + 3. * bendingMomentumErr) < GetRecoParam()->GetMinBendingMomentum()) continue;
+       
+      } else {
+       
+       if (GetRecoParam()->SelectOnTrackSlope()) {
+         
+         // check if bending slope is within tolerances
+         bendingSlopeErr = TMath::Sqrt((cluster1->GetErrY2() + cluster2->GetErrY2()) / dZ / dZ + angleMCS2);
+         if ((TMath::Abs(bendingSlope) - sigmaCut * bendingSlopeErr) > GetRecoParam()->GetMaxBendingSlope()) continue;
+         
+       } else {
+         
+         // or check if bending impact parameter is within tolerances
+         bendingImpactParam = TMath::Abs(cluster1->GetY() - cluster1->GetZ() * bendingSlope);
+         bendingImpactParamErr = TMath::Sqrt((z1 * z1 * cluster2->GetErrY2() + z2 * z2 * cluster1->GetErrY2()) / dZ / dZ + impactMCS2);
+         if ((bendingImpactParam - sigmaCut * bendingImpactParamErr) > (3. * GetRecoParam()->GetBendingVertexDispersion())) continue;
+         
+       }
+       
+      }
       
-      // impact parameter
-      impactParam = cluster1->GetY() - cluster1->GetZ() * bendingSlope;
-     
-      // absolute value of bending momentum
-      bendingMomentum = TMath::Abs(AliMUONTrackExtrap::GetBendingMomentumFromImpactParam(impactParam));
+      // make new segment
+      segment = new ((*segments)[segments->GetLast()+1]) AliMUONObjectPair(cluster1, cluster2, kFALSE, kFALSE);
       
-      // check for non bending slope and bending momentum within tolerances
-      if (TMath::Abs(nonBendingSlope) < AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxNonBendingSlope() &&
-         bendingMomentum < AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxBendingMomentum() &&
-         bendingMomentum > AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetMinBendingMomentum()) {
-        
-       // make new segment
-        segment = new ((*segments)[segments->GetLast()+1]) AliMUONObjectPair(cluster1, cluster2, kFALSE, kFALSE);
-        
-       // Printout for debug
-       if (AliLog::GetGlobalDebugLevel() > 1) {
-          cout << "segmentIndex(0...): " << segments->GetLast() << endl;
-          segment->Dump();
-          cout << "Cluster in first chamber" << endl;
-          cluster1->Print();
-          cout << "Cluster in second chamber" << endl;
-          cluster2->Print();
-        }
-       
+      // Printout for debug
+      if (AliLog::GetGlobalDebugLevel() > 1) {
+       cout << "segmentIndex(0...): " << segments->GetLast() << endl;
+       segment->Dump();
+       cout << "Cluster in first chamber" << endl;
+       cluster1->Print();
+       cout << "Cluster in second chamber" << endl;
+       cluster2->Print();
       }
       
     }
@@ -239,23 +392,86 @@ TClonesArray* AliMUONVTrackReconstructor::MakeSegmentsBetweenChambers(const AliM
   return segments;
 }
 
+  //__________________________________________________________________________
+void AliMUONVTrackReconstructor::RemoveUsedSegments(TClonesArray& segments)
+{
+  /// To remove pairs of clusters already attached to a track
+  AliDebug(1,"Enter RemoveUsedSegments");
+  Int_t nSegments = segments.GetEntriesFast();
+  Int_t nTracks = fRecTracksPtr->GetEntriesFast();
+  AliMUONObjectPair *segment;
+  AliMUONTrack *track;
+  AliMUONVCluster *cluster, *cluster1, *cluster2;
+  Bool_t foundCluster1, foundCluster2, removeSegment;
+  
+  // Loop over segments
+  for (Int_t iSegment=0; iSegment<nSegments; iSegment++) {
+    segment = (AliMUONObjectPair*) segments.UncheckedAt(iSegment);
+    
+    cluster1 = (AliMUONVCluster*) segment->First();
+    cluster2 = (AliMUONVCluster*) segment->Second();
+    removeSegment = kFALSE;
+    
+    // Loop over tracks
+    for (Int_t iTrack = 0; iTrack < nTracks; iTrack++) {
+      track = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->UncheckedAt(iTrack);
+      
+      // skip empty slot
+      if (!track) continue;
+      
+      foundCluster1 = kFALSE;
+      foundCluster2 = kFALSE;
+      
+      // Loop over clusters
+      Int_t nClusters = track->GetNClusters();
+      for (Int_t iCluster = 0; iCluster < nClusters; iCluster++) {
+        cluster = ((AliMUONTrackParam*) track->GetTrackParamAtCluster()->UncheckedAt(iCluster))->GetClusterPtr();
+       
+       // check if both clusters are in that track
+       if (cluster == cluster1) foundCluster1 = kTRUE;
+       else if (cluster == cluster2) foundCluster2 = kTRUE;
+       
+       if (foundCluster1 && foundCluster2) {
+         removeSegment = kTRUE;
+         break;
+       }
+       
+      }
+      
+      if (removeSegment) break;
+      
+    }
+    
+    if (removeSegment) segments.RemoveAt(iSegment);
+      
+  }
+  
+  segments.Compress();
+  
+  // Printout for debug
+  AliDebug(1,Form("NSegments =  %d ", segments.GetEntriesFast()));
+}
+
   //__________________________________________________________________________
 void AliMUONVTrackReconstructor::RemoveIdenticalTracks()
 {
   /// To remove identical tracks:
   /// Tracks are considered identical if they have all their clusters in common.
   /// One keeps the track with the larger number of clusters if need be
-  AliMUONTrack *track1, *track2, *trackToRemove;
+  AliMUONTrack *track1, *track2;
+  Int_t nTracks = fRecTracksPtr->GetEntriesFast();
   Int_t clustersInCommon, nClusters1, nClusters2;
-  Bool_t removedTrack1;
   // Loop over first track of the pair
-  track1 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->First();
-  while (track1) {
-    removedTrack1 = kFALSE;
+  for (Int_t iTrack1 = 0; iTrack1 < nTracks; iTrack1++) {
+    track1 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->UncheckedAt(iTrack1);
+    // skip empty slot
+    if (!track1) continue;
     nClusters1 = track1->GetNClusters();
     // Loop over second track of the pair
-    track2 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track1);
-    while (track2) {
+    for (Int_t iTrack2 = iTrack1+1; iTrack2 < nTracks; iTrack2++) {
+      track2 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->UncheckedAt(iTrack2);
+      // skip empty slot
+      if (!track2) continue;
       nClusters2 = track2->GetNClusters();
       // number of clusters in common between two tracks
       clustersInCommon = track1->ClustersInCommon(track2);
@@ -264,27 +480,18 @@ void AliMUONVTrackReconstructor::RemoveIdenticalTracks()
         // decide which track to remove
         if (nClusters2 > nClusters1) {
          // remove track1 and continue the first loop with the track next to track1
-         trackToRemove = track1;
-         track1 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track1);
-          fRecTracksPtr->Remove(trackToRemove);
-         fRecTracksPtr->Compress(); // this is essential to retrieve the TClonesArray afterwards
+          fRecTracksPtr->RemoveAt(iTrack1);
          fNRecTracks--;
-         removedTrack1 = kTRUE;
          break;
        } else {
          // remove track2 and continue the second loop with the track next to track2
-         trackToRemove = track2;
-         track2 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track2);
-         fRecTracksPtr->Remove(trackToRemove);
-         fRecTracksPtr->Compress(); // this is essential to retrieve the TClonesArray afterwards
+         fRecTracksPtr->RemoveAt(iTrack2);
          fNRecTracks--;
         }
-      } else track2 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track2);
+      }
     } // track2
-    if (removedTrack1) continue;
-    track1 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track1);
   } // track1
-  return;
+  fRecTracksPtr->Compress(); // this is essential to retrieve the TClonesArray afterwards
 }
 
   //__________________________________________________________________________
@@ -295,46 +502,117 @@ void AliMUONVTrackReconstructor::RemoveDoubleTracks()
   /// which has the smaller number of clusters are in common with the other track.
   /// Among two identical tracks, one keeps the track with the larger number of clusters
   /// or, if these numbers are equal, the track with the minimum chi2.
-  AliMUONTrack *track1, *track2, *trackToRemove;
-  Int_t clustersInCommon, nClusters1, nClusters2;
-  Bool_t removedTrack1;
+  AliMUONTrack *track1, *track2;
+  Int_t nTracks = fRecTracksPtr->GetEntriesFast();
+  Int_t clustersInCommon2, nClusters1, nClusters2;
   // Loop over first track of the pair
-  track1 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->First();
-  while (track1) {
-    removedTrack1 = kFALSE;
+  for (Int_t iTrack1 = 0; iTrack1 < nTracks; iTrack1++) {
+    track1 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->UncheckedAt(iTrack1);
+    // skip empty slot
+    if (!track1) continue;
     nClusters1 = track1->GetNClusters();
     // Loop over second track of the pair
-    track2 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track1);
-    while (track2) {
+    for (Int_t iTrack2 = iTrack1+1; iTrack2 < nTracks; iTrack2++) {
+      track2 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->UncheckedAt(iTrack2);
+      // skip empty slot
+      if (!track2) continue;
       nClusters2 = track2->GetNClusters();
       // number of clusters in common between two tracks
-      clustersInCommon = track1->ClustersInCommon(track2);
+      clustersInCommon2 = 2 * track1->ClustersInCommon(track2);
       // check for identical tracks
-      if (((nClusters1 < nClusters2) && (2 * clustersInCommon > nClusters1)) || (2 * clustersInCommon > nClusters2)) {
+      if (clustersInCommon2 > nClusters1 || clustersInCommon2 > nClusters2) {
         // decide which track to remove
         if ((nClusters1 > nClusters2) || ((nClusters1 == nClusters2) && (track1->GetGlobalChi2() <= track2->GetGlobalChi2()))) {
          // remove track2 and continue the second loop with the track next to track2
-         trackToRemove = track2;
-         track2 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track2);
-         fRecTracksPtr->Remove(trackToRemove);
-         fRecTracksPtr->Compress(); // this is essential to retrieve the TClonesArray afterwards
+         fRecTracksPtr->RemoveAt(iTrack2);
          fNRecTracks--;
         } else {
          // else remove track1 and continue the first loop with the track next to track1
-         trackToRemove = track1;
-         track1 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track1);
-          fRecTracksPtr->Remove(trackToRemove);
-         fRecTracksPtr->Compress(); // this is essential to retrieve the TClonesArray afterwards
+          fRecTracksPtr->RemoveAt(iTrack1);
          fNRecTracks--;
-         removedTrack1 = kTRUE;
          break;
         }
-      } else track2 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track2);
+      }
     } // track2
-    if (removedTrack1) continue;
-    track1 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track1);
   } // track1
-  return;
+  fRecTracksPtr->Compress(); // this is essential to retrieve the TClonesArray afterwards
+}
+
+  //__________________________________________________________________________
+void AliMUONVTrackReconstructor::RemoveConnectedTracks(Int_t stMin, Int_t stMax, Bool_t all)
+{
+  /// Find and remove tracks sharing 1 cluster or more in station(s) [stMin, stMax].
+  /// For each couple of connected tracks, one removes the one with the smallest
+  /// number of clusters or with the highest chi2 value in case of equality.
+  /// If all=kTRUE: both tracks are removed.
+  
+  // tag the tracks to be removed
+  TagConnectedTracks(stMin, stMax, all);
+  
+  // remove them
+  Int_t nTracks = fRecTracksPtr->GetEntriesFast();
+  for (Int_t i = 0; i < nTracks; i++) {
+    if (((AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->UncheckedAt(i))->IsConnected()) {
+      fRecTracksPtr->RemoveAt(i);
+      fNRecTracks--;
+    }
+  }
+  
+  // remove holes in the array if any
+  fRecTracksPtr->Compress();
+}
+
+  //__________________________________________________________________________
+void AliMUONVTrackReconstructor::TagConnectedTracks(Int_t stMin, Int_t stMax, Bool_t all)
+{
+  /// Find and tag tracks sharing 1 cluster or more in station(s) [stMin, stMax].
+  /// For each couple of connected tracks, one tags the one with the smallest
+  /// number of clusters or with the highest chi2 value in case of equality.
+  /// If all=kTRUE: both tracks are tagged.
+  
+  AliMUONTrack *track1, *track2;
+  Int_t nClusters1, nClusters2;
+  Int_t nTracks = fRecTracksPtr->GetEntriesFast();
+  
+  // reset the tags
+  for (Int_t i = 0; i < nTracks; i++) ((AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->UncheckedAt(i))->Connected(kFALSE);
+    
+  // Loop over first track of the pair
+  for (Int_t iTrack1 = 0; iTrack1 < nTracks; iTrack1++) {
+    track1 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->UncheckedAt(iTrack1);
+    
+    // Loop over second track of the pair
+    for (Int_t iTrack2 = iTrack1+1; iTrack2 < nTracks; iTrack2++) {
+      track2 = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->UncheckedAt(iTrack2);
+      
+      // check for connected tracks and tag them
+      if (track1->ClustersInCommon(track2, stMin, stMax) > 0) {
+        
+       if (all) {
+         
+         // tag both tracks
+         track1->Connected();
+         track2->Connected();
+         
+       } else {
+         
+         // tag only the worst track
+         nClusters1 = track1->GetNClusters();
+         nClusters2 = track2->GetNClusters();
+         if ((nClusters1 > nClusters2) || ((nClusters1 == nClusters2) && (track1->GetGlobalChi2() <= track2->GetGlobalChi2()))) {
+           track2->Connected();
+         } else {
+           track1->Connected();
+         }
+         
+       }
+       
+      }
+      
+    }
+    
+  }
+  
 }
 
   //__________________________________________________________________________
@@ -344,32 +622,34 @@ void AliMUONVTrackReconstructor::AskForNewClustersInChamber(const AliMUONTrackPa
   /// Ask the clustering to reconstruct new clusters around the track candidate position
   
   // check if the current chamber is useable
-  if (!AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->UseChamber(chamber)) return;
+  if (!fClusterServer || !GetRecoParam()->UseChamber(chamber)) return;
   
   // maximum distance between the center of the chamber and a detection element
   // (accounting for the inclination of the chamber)
-  static const Double_t gkMaxDZ = 15.; // 15 cm
+  static const Double_t kMaxDZ = 15.; // 15 cm
   
   // extrapolate track parameters to the chamber
   AliMUONTrackParam extrapTrackParam(trackParam);
-  AliMUONTrackExtrap::ExtrapToZCov(&extrapTrackParam, AliMUONConstants::DefaultChamberZ(chamber));
+  if (!AliMUONTrackExtrap::ExtrapToZCov(&extrapTrackParam, AliMUONConstants::DefaultChamberZ(chamber))) return;
   
-  // build the searching area using the track resolution and the maximum-distance-to-track value
+  // build the searching area using the track and chamber resolutions and the maximum-distance-to-track value
   const TMatrixD& kParamCov = extrapTrackParam.GetCovariances();
-  Double_t errX2 = kParamCov(0,0) + gkMaxDZ * gkMaxDZ * kParamCov(1,1) + 2. * gkMaxDZ * TMath::Abs(kParamCov(0,1));
-  Double_t errY2 = kParamCov(2,2) + gkMaxDZ * gkMaxDZ * kParamCov(3,3) + 2. * gkMaxDZ * TMath::Abs(kParamCov(2,3));
-  Double_t dX = TMath::Abs(trackParam.GetNonBendingSlope()) * gkMaxDZ +
-               AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxNonBendingDistanceToTrack() +
-               AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() * TMath::Sqrt(errX2);
-  Double_t dY = TMath::Abs(trackParam.GetBendingSlope()) * gkMaxDZ +
-               AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxBendingDistanceToTrack() +
-               AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() * TMath::Sqrt(errY2);
-  TVector2 dimensions(dX, dY);
-  TVector2 position(extrapTrackParam.GetNonBendingCoor(), extrapTrackParam.GetBendingCoor());
-  AliMpArea area(position, dimensions);
+  Double_t errX2 = kParamCov(0,0) + kMaxDZ * kMaxDZ * kParamCov(1,1) + 2. * kMaxDZ * TMath::Abs(kParamCov(0,1)) +
+                   GetRecoParam()->GetDefaultNonBendingReso(chamber) * GetRecoParam()->GetDefaultNonBendingReso(chamber);
+  Double_t errY2 = kParamCov(2,2) + kMaxDZ * kMaxDZ * kParamCov(3,3) + 2. * kMaxDZ * TMath::Abs(kParamCov(2,3)) +
+                  GetRecoParam()->GetDefaultBendingReso(chamber) * GetRecoParam()->GetDefaultBendingReso(chamber);
+  Double_t dX = TMath::Abs(trackParam.GetNonBendingSlope()) * kMaxDZ +
+               GetRecoParam()->GetMaxNonBendingDistanceToTrack() +
+               GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() * TMath::Sqrt(2. * errX2);
+  Double_t dY = TMath::Abs(trackParam.GetBendingSlope()) * kMaxDZ +
+               GetRecoParam()->GetMaxBendingDistanceToTrack() +
+               GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() * TMath::Sqrt(2. * errY2);
+  AliMpArea area(extrapTrackParam.GetNonBendingCoor(), 
+                 extrapTrackParam.GetBendingCoor(),
+                 dX, dY);
   
   // ask to cluterize in the given area of the given chamber
-  fClusterServer.Clusterize(chamber, clusterStore, area);
+  fClusterServer->Clusterize(chamber, clusterStore, area, GetRecoParam());
   
 }
 
@@ -392,11 +672,11 @@ Double_t AliMUONVTrackReconstructor::TryOneCluster(const AliMUONTrackParam &trac
 /// return trackParamAtCluster
   
   // extrapolate track parameters and covariances at the z position of the tested cluster
+  // and set pointer to cluster into trackParamAtCluster
   trackParamAtCluster = trackParam;
-  AliMUONTrackExtrap::ExtrapToZCov(&trackParamAtCluster, cluster->GetZ(), updatePropagator);
-  
-  // set pointer to cluster into trackParamAtCluster
   trackParamAtCluster.SetClusterPtr(cluster);
+  if (!AliMUONTrackExtrap::ExtrapToZCov(&trackParamAtCluster, cluster->GetZ(), updatePropagator))
+    return 2.*AliMUONTrack::MaxChi2();
   
   // Set differences between trackParam and cluster in the bending and non bending directions
   Double_t dX = cluster->GetX() - trackParamAtCluster.GetNonBendingCoor();
@@ -406,17 +686,20 @@ Double_t AliMUONVTrackReconstructor::TryOneCluster(const AliMUONTrackParam &trac
   const TMatrixD& kParamCov = trackParamAtCluster.GetCovariances();
   Double_t sigmaX2 = kParamCov(0,0) + cluster->GetErrX2();
   Double_t sigmaY2 = kParamCov(2,2) + cluster->GetErrY2();
+  Double_t covXY   = kParamCov(0,2);
+  Double_t det     = sigmaX2 * sigmaY2 - covXY * covXY;
   
   // Compute chi2
-  return dX * dX / sigmaX2 + dY * dY / sigmaY2;
+  if (det == 0.) return 2.*AliMUONTrack::MaxChi2();
+  return (dX * dX * sigmaY2 + dY * dY * sigmaX2 - 2. * dX * dY * covXY) / det;
   
 }
 
   //__________________________________________________________________________
-Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::TryOneClusterFast(const AliMUONTrackParam &trackParam, AliMUONVCluster* cluster)
+Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::TryOneClusterFast(const AliMUONTrackParam &trackParam, const AliMUONVCluster* cluster)
 {
 /// Test the compatibility between the track and the cluster
-/// given the track resolution + the maximum-distance-to-track value
+/// given the track and cluster resolutions + the maximum-distance-to-track value
 /// and assuming linear propagation of the track:
 /// return kTRUE if they are compatibles
   
@@ -424,13 +707,13 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::TryOneClusterFast(const AliMUONTrackParam &tr
   Double_t dX = cluster->GetX() - (trackParam.GetNonBendingCoor() + trackParam.GetNonBendingSlope() * dZ);
   Double_t dY = cluster->GetY() - (trackParam.GetBendingCoor() + trackParam.GetBendingSlope() * dZ);
   const TMatrixD& kParamCov = trackParam.GetCovariances();
-  Double_t errX2 = kParamCov(0,0) + dZ * dZ * kParamCov(1,1) + 2. * dZ * kParamCov(0,1);
-  Double_t errY2 = kParamCov(2,2) + dZ * dZ * kParamCov(3,3) + 2. * dZ * kParamCov(2,3);
+  Double_t errX2 = kParamCov(0,0) + dZ * dZ * kParamCov(1,1) + 2. * dZ * kParamCov(0,1) + cluster->GetErrX2();
+  Double_t errY2 = kParamCov(2,2) + dZ * dZ * kParamCov(3,3) + 2. * dZ * kParamCov(2,3) + cluster->GetErrY2();
 
-  Double_t dXmax = AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() * TMath::Sqrt(errX2) +
-                   AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxNonBendingDistanceToTrack();
-  Double_t dYmax = AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() * TMath::Sqrt(errY2) +
-                  AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetMaxBendingDistanceToTrack();
+  Double_t dXmax = GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() * TMath::Sqrt(2. * errX2) +
+                   GetRecoParam()->GetMaxNonBendingDistanceToTrack();
+  Double_t dYmax = GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() * TMath::Sqrt(2. * errY2) +
+                  GetRecoParam()->GetMaxBendingDistanceToTrack();
   
   if (TMath::Abs(dX) > dXmax || TMath::Abs(dY) > dYmax) return kFALSE;
   
@@ -449,7 +732,7 @@ Double_t AliMUONVTrackReconstructor::TryTwoClustersFast(const AliMUONTrackParam
   
   // extrapolate linearly track parameters and covariances at the z position of the second cluster
   trackParamAtCluster2 = trackParamAtCluster1;
-  AliMUONTrackExtrap::LinearExtrapToZ(&trackParamAtCluster2, cluster2->GetZ());
+  AliMUONTrackExtrap::LinearExtrapToZCov(&trackParamAtCluster2, cluster2->GetZ());
   
   // set pointer to cluster2 into trackParamAtCluster2
   trackParamAtCluster2.SetClusterPtr(cluster2);
@@ -475,7 +758,7 @@ Double_t AliMUONVTrackReconstructor::TryTwoClustersFast(const AliMUONTrackParam
   // Compute chi2
   Double_t detX = sigma2X1 * sigma2X2 - covX1X2 * covX1X2;
   Double_t detY = sigma2Y1 * sigma2Y2 - covY1Y2 * covY1Y2;
-  if (detX == 0. || detY == 0.) return 1.e10;
+  if (detX == 0. || detY == 0.) return 2.*AliMUONTrack::MaxChi2();
   return   (dX1 * dX1 * sigma2X2 + dX2 * dX2 * sigma2X1 - 2. * dX1 * dX2 * covX1X2) / detX
         + (dY1 * dY1 * sigma2Y2 + dY2 * dY2 * sigma2Y1 - 2. * dY1 * dY2 * covY1Y2) / detY;
   
@@ -494,9 +777,9 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInChamber(AliMUONTrack &trac
   /// return kTRUE if new cluster(s) have been found (otherwise return kFALSE)
   AliDebug(1,Form("Enter FollowLinearTrackInChamber(1..) %d", nextChamber+1));
   
-  Double_t chi2WithOneCluster = 1.e10;
-  Double_t maxChi2WithOneCluster = 2. * AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() *
-                                       AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking(); // 2 because 2 quantities in chi2
+  Double_t chi2WithOneCluster = AliMUONTrack::MaxChi2();
+  Double_t maxChi2WithOneCluster = 2. * GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() *
+                                       GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking(); // 2 because 2 quantities in chi2
   Double_t bestChi2WithOneCluster = maxChi2WithOneCluster;
   Bool_t foundOneCluster = kFALSE;
   AliMUONTrack *newTrack = 0x0;
@@ -517,7 +800,7 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInChamber(AliMUONTrack &trac
   }
   
   // Add MCS effect
-  AliMUONTrackExtrap::AddMCSEffect(&trackParam,AliMUONConstants::ChamberThicknessInX0(),1.);
+  AliMUONTrackExtrap::AddMCSEffect(&trackParam,AliMUONConstants::ChamberThicknessInX0(trackParam.GetClusterPtr()->GetChamberId()),-1.);
   
   // Printout for debuging
   if ((AliLog::GetDebugLevel("MUON","AliMUONVTrackReconstructor") >= 1) || (AliLog::GetGlobalDebugLevel() >= 1)) {
@@ -535,7 +818,7 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInChamber(AliMUONTrack &trac
     
     // try to add the current cluster accuratly
     extrapTrackParamAtCluster = trackParam;
-    AliMUONTrackExtrap::LinearExtrapToZ(&extrapTrackParamAtCluster, cluster->GetZ());
+    AliMUONTrackExtrap::LinearExtrapToZCov(&extrapTrackParamAtCluster, cluster->GetZ());
     chi2WithOneCluster = TryOneCluster(extrapTrackParamAtCluster, cluster, extrapTrackParamAtCluster);
     
     // if good chi2 then consider to add cluster
@@ -549,13 +832,14 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInChamber(AliMUONTrack &trac
        cluster->Print();
       }
       
-      if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
+      if (GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
        // copy trackCandidate into a new track put at the end of fRecTracksPtr and add the new cluster
        newTrack = new ((*fRecTracksPtr)[fRecTracksPtr->GetLast()+1]) AliMUONTrack(trackCandidate);
-       if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->RequestStation(nextChamber/2))
+       if (GetRecoParam()->RequestStation(nextChamber/2))
          extrapTrackParamAtCluster.SetRemovable(kFALSE);
        else extrapTrackParamAtCluster.SetRemovable(kTRUE);
        newTrack->AddTrackParamAtCluster(extrapTrackParamAtCluster,*cluster);
+       newTrack->SetGlobalChi2(trackCandidate.GetGlobalChi2()+chi2WithOneCluster);
        fNRecTracks++;
        
        // Printout for debuging
@@ -575,12 +859,13 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInChamber(AliMUONTrack &trac
   }
   
   // fill out the best track if required else clean up the fRecTracksPtr array
-  if (!AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
+  if (!GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
     if (foundOneCluster) {
-      if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->RequestStation(nextChamber/2))
+      if (GetRecoParam()->RequestStation(nextChamber/2))
        bestTrackParamAtCluster.SetRemovable(kFALSE);
       else bestTrackParamAtCluster.SetRemovable(kTRUE);
       trackCandidate.AddTrackParamAtCluster(bestTrackParamAtCluster,*(bestTrackParamAtCluster.GetClusterPtr()));
+      trackCandidate.SetGlobalChi2(trackCandidate.GetGlobalChi2()+bestChi2WithOneCluster);
       
       // Printout for debuging
       if ((AliLog::GetDebugLevel("MUON","AliMUONVTrackReconstructor") >= 1) || (AliLog::GetGlobalDebugLevel() >= 1)) {
@@ -627,12 +912,12 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
     ch2 = 2*nextStation+1;
   }
   
-  Double_t chi2WithOneCluster = 1.e10;
-  Double_t chi2WithTwoClusters = 1.e10;
-  Double_t maxChi2WithOneCluster = 2. * AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() *
-                                       AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking(); // 2 because 2 quantities in chi2
-  Double_t maxChi2WithTwoClusters = 4. * AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() *
-                                        AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking(); // 4 because 4 quantities in chi2
+  Double_t chi2WithOneCluster = AliMUONTrack::MaxChi2();
+  Double_t chi2WithTwoClusters = AliMUONTrack::MaxChi2();
+  Double_t maxChi2WithOneCluster = 2. * GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() *
+                                       GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking(); // 2 because 2 quantities in chi2
+  Double_t maxChi2WithTwoClusters = 4. * GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking() *
+                                        GetRecoParam()->GetSigmaCutForTracking(); // 4 because 4 quantities in chi2
   Double_t bestChi2WithOneCluster = maxChi2WithOneCluster;
   Double_t bestChi2WithTwoClusters = maxChi2WithTwoClusters;
   Bool_t foundOneCluster = kFALSE;
@@ -662,7 +947,7 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
   }
   
   // Add MCS effect
-  AliMUONTrackExtrap::AddMCSEffect(&trackParam,AliMUONConstants::ChamberThicknessInX0(),1.);
+  AliMUONTrackExtrap::AddMCSEffect(&trackParam,AliMUONConstants::ChamberThicknessInX0(trackParam.GetClusterPtr()->GetChamberId()),-1.);
   
   // Printout for debuging
   if ((AliLog::GetDebugLevel("MUON","AliMUONVTrackReconstructor") >= 1) || (AliLog::GetGlobalDebugLevel() >= 1)) {
@@ -681,7 +966,7 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
     
     // try to add the current cluster accuratly
     extrapTrackParamAtCluster2 = trackParam;
-    AliMUONTrackExtrap::LinearExtrapToZ(&extrapTrackParamAtCluster2, clusterCh2->GetZ());
+    AliMUONTrackExtrap::LinearExtrapToZCov(&extrapTrackParamAtCluster2, clusterCh2->GetZ());
     chi2WithOneCluster = TryOneCluster(extrapTrackParamAtCluster2, clusterCh2, extrapTrackParamAtCluster2);
     
     // if good chi2 then try to attach a cluster in the other chamber too
@@ -697,7 +982,7 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
       }
       
       // add MCS effect
-      AliMUONTrackExtrap::AddMCSEffect(&extrapTrackParamAtCluster2,AliMUONConstants::ChamberThicknessInX0(),1.);
+      AliMUONTrackExtrap::AddMCSEffect(&extrapTrackParamAtCluster2,AliMUONConstants::ChamberThicknessInX0(ch2),-1.);
       
       // reset cluster iterator of chamber 1
       nextInCh1.Reset();
@@ -725,13 +1010,14 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
            clusterCh1->Print();
          }
          
-         if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
+         if (GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
            // copy trackCandidate into a new track put at the end of fRecTracksPtr and add the new clusters
             newTrack = new ((*fRecTracksPtr)[fRecTracksPtr->GetLast()+1]) AliMUONTrack(trackCandidate);
            extrapTrackParamAtCluster1.SetRemovable(kTRUE);
            newTrack->AddTrackParamAtCluster(extrapTrackParamAtCluster1,*clusterCh1);
            extrapTrackParamAtCluster2.SetRemovable(kTRUE);
            newTrack->AddTrackParamAtCluster(extrapTrackParamAtCluster2,*clusterCh2);
+           newTrack->SetGlobalChi2(newTrack->GetGlobalChi2()+chi2WithTwoClusters);
            fNRecTracks++;
            
            // Tag clusterCh1 as used
@@ -758,13 +1044,14 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
       if (!foundSecondCluster) {
        foundOneCluster = kTRUE;
         
-       if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
+       if (GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
          // copy trackCandidate into a new track put at the end of fRecTracksPtr and add the new cluster
           newTrack = new ((*fRecTracksPtr)[fRecTracksPtr->GetLast()+1]) AliMUONTrack(trackCandidate);
-         if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->RequestStation(nextStation))
+         if (GetRecoParam()->RequestStation(nextStation))
            extrapTrackParamAtCluster2.SetRemovable(kFALSE);
          else extrapTrackParamAtCluster2.SetRemovable(kTRUE);
          newTrack->AddTrackParamAtCluster(extrapTrackParamAtCluster2,*clusterCh2);
+         newTrack->SetGlobalChi2(newTrack->GetGlobalChi2()+chi2WithOneCluster);
          fNRecTracks++;
          
          // Printout for debuging
@@ -787,7 +1074,7 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
   
   // look for candidates in chamber 1 not already attached to a track
   // if we want to keep all possible tracks or if no good couple of clusters has been found
-  if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->TrackAllTracks() || !foundTwoClusters) {
+  if (GetRecoParam()->TrackAllTracks() || !foundTwoClusters) {
     
     // Printout for debuging
     if ((AliLog::GetDebugLevel("MUON","AliMUONVTrackReconstructor") >= 1) || (AliLog::GetGlobalDebugLevel() >= 1)) {
@@ -795,10 +1082,10 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
     }
     
     //Extrapolate trackCandidate to chamber "ch2"
-    AliMUONTrackExtrap::LinearExtrapToZ(&trackParam, AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch2));
+    AliMUONTrackExtrap::LinearExtrapToZCov(&trackParam, AliMUONConstants::DefaultChamberZ(ch2));
     
     // add MCS effect for next step
-    AliMUONTrackExtrap::AddMCSEffect(&trackParam,AliMUONConstants::ChamberThicknessInX0(),1.);
+    AliMUONTrackExtrap::AddMCSEffect(&trackParam,AliMUONConstants::ChamberThicknessInX0(ch2),-1.);
     
     // reset cluster iterator of chamber 1
     nextInCh1.Reset();
@@ -815,7 +1102,7 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
       
       // try to add the current cluster accuratly
       extrapTrackParamAtCluster1 = trackParam;
-      AliMUONTrackExtrap::LinearExtrapToZ(&extrapTrackParamAtCluster1, clusterCh1->GetZ());
+      AliMUONTrackExtrap::LinearExtrapToZCov(&extrapTrackParamAtCluster1, clusterCh1->GetZ());
       chi2WithOneCluster = TryOneCluster(extrapTrackParamAtCluster1, clusterCh1, extrapTrackParamAtCluster1);
       
       // if good chi2 then consider to add clusterCh1
@@ -830,13 +1117,14 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
          clusterCh1->Print();
        }
        
-       if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
+       if (GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
          // copy trackCandidate into a new track put at the end of fRecTracksPtr and add the new cluster
          newTrack = new ((*fRecTracksPtr)[fRecTracksPtr->GetLast()+1]) AliMUONTrack(trackCandidate);
-         if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->RequestStation(nextStation))
+         if (GetRecoParam()->RequestStation(nextStation))
            extrapTrackParamAtCluster1.SetRemovable(kFALSE);
          else extrapTrackParamAtCluster1.SetRemovable(kTRUE);
          newTrack->AddTrackParamAtCluster(extrapTrackParamAtCluster1,*clusterCh1);
+         newTrack->SetGlobalChi2(newTrack->GetGlobalChi2()+chi2WithOneCluster);
          fNRecTracks++;
          
          // Printout for debuging
@@ -858,12 +1146,13 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
   }
   
   // fill out the best track if required else clean up the fRecTracksPtr array
-  if (!AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
+  if (!GetRecoParam()->TrackAllTracks()) {
     if (foundTwoClusters) {
       bestTrackParamAtCluster1.SetRemovable(kTRUE);
       trackCandidate.AddTrackParamAtCluster(bestTrackParamAtCluster1,*(bestTrackParamAtCluster1.GetClusterPtr()));
       bestTrackParamAtCluster2.SetRemovable(kTRUE);
       trackCandidate.AddTrackParamAtCluster(bestTrackParamAtCluster2,*(bestTrackParamAtCluster2.GetClusterPtr()));
+      trackCandidate.SetGlobalChi2(trackCandidate.GetGlobalChi2()+bestChi2WithTwoClusters);
       
       // Printout for debuging
       if ((AliLog::GetDebugLevel("MUON","AliMUONVTrackReconstructor") >= 1) || (AliLog::GetGlobalDebugLevel() >= 1)) {
@@ -872,10 +1161,11 @@ Bool_t AliMUONVTrackReconstructor::FollowLinearTrackInStation(AliMUONTrack &trac
       }
       
     } else if (foundOneCluster) {
-      if (AliMUONReconstructor::GetRecoParam()->RequestStation(nextStation))
+      if (GetRecoParam()->RequestStation(nextStation))
        bestTrackParamAtCluster1.SetRemovable(kFALSE);
       else bestTrackParamAtCluster1.SetRemovable(kTRUE);
       trackCandidate.AddTrackParamAtCluster(bestTrackParamAtCluster1,*(bestTrackParamAtCluster1.GetClusterPtr()));
+      trackCandidate.SetGlobalChi2(trackCandidate.GetGlobalChi2()+bestChi2WithOneCluster);
       
       // Printout for debuging
       if ((AliLog::GetDebugLevel("MUON","AliMUONVTrackReconstructor") >= 1) || (AliLog::GetGlobalDebugLevel() >= 1)) {
@@ -938,19 +1228,32 @@ void AliMUONVTrackReconstructor::ImproveTracks()
 //__________________________________________________________________________
 void AliMUONVTrackReconstructor::Finalize()
 {
-  /// Recompute track parameters and covariances at each attached cluster from those at the first one
+  /// Recompute track parameters and covariances at each attached cluster
+  /// Set the label pointing to the corresponding MC track
+  /// Remove the track if finalization failed
   
-  AliMUONTrack *track;
+  AliMUONTrack *track, *nextTrack;
+  Bool_t trackRemoved = kFALSE;
   
   track = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->First();
   while (track) {
     
-    FinalizeTrack(*track);
+    nextTrack = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track);
     
-    track = (AliMUONTrack*) fRecTracksPtr->After(track);
+    if (FinalizeTrack(*track)) track->FindMCLabel();
+    else {
+      fRecTracksPtr->Remove(track);
+      fNRecTracks--;
+      trackRemoved = kTRUE;
+    }
+    
+    track = nextTrack;
     
   }
   
+  // compress array of tracks if needed
+  if (trackRemoved) fRecTracksPtr->Compress();
+  
 }
 
 //__________________________________________________________________________
@@ -960,20 +1263,21 @@ void AliMUONVTrackReconstructor::ValidateTracksWithTrigger(AliMUONVTrackStore& t
                                                            const AliMUONTrackHitPattern& trackHitPattern)
 {
   /// Try to match track from tracking system with trigger track
-  AliCodeTimerAuto("");
+  AliCodeTimerAuto("",0);
 
   trackHitPattern.ExecuteValidation(trackStore, triggerTrackStore, triggerStore);
 }
 
-  //__________________________________________________________________________
+
+//__________________________________________________________________________
 void AliMUONVTrackReconstructor::EventReconstructTrigger(const AliMUONTriggerCircuit& circuit,
                                                          const AliMUONVTriggerStore& triggerStore,
                                                          AliMUONVTriggerTrackStore& triggerTrackStore)
 {
-  /// To make the trigger tracks from Local Trigger
+  /// Fill trigger track store from local trigger
   AliDebug(1, "");
-  AliCodeTimerAuto("");
-  
+  AliCodeTimerAuto("",0);
+
   AliMUONGlobalTrigger* globalTrigger = triggerStore.Global();
   
   UChar_t gloTrigPat = 0;
@@ -983,47 +1287,75 @@ void AliMUONVTrackReconstructor::EventReconstructTrigger(const AliMUONTriggerCir
     gloTrigPat = globalTrigger->GetGlobalResponse();
   }
   
+  AliMUONTriggerTrack triggerTrack;
+  
   TIter next(triggerStore.CreateIterator());
   AliMUONLocalTrigger* locTrg(0x0);
-
-  Float_t z11 = AliMUONConstants::DefaultChamberZ(10);
-  Float_t z21 = AliMUONConstants::DefaultChamberZ(12);
-      
-  AliMUONTriggerTrack triggerTrack;
   
   while ( ( locTrg = static_cast<AliMUONLocalTrigger*>(next()) ) )
   {
-    Bool_t xTrig=locTrg->IsTrigX();
-    Bool_t yTrig=locTrg->IsTrigY();
-    
-    Int_t localBoardId = locTrg->LoCircuit();
-    
-    if (xTrig && yTrig) 
+    if ( locTrg->IsTrigX() && locTrg->IsTrigY() ) 
     { // make Trigger Track if trigger in X and Y
       
-      Float_t y11 = circuit.GetY11Pos(localBoardId, locTrg->LoStripX()); 
-      // need first to convert deviation to [0-30] 
-      // (see AliMUONLocalTriggerBoard::LocalTrigger)
-      Int_t deviation = locTrg->GetDeviation(); 
-      Int_t stripX21 = locTrg->LoStripX()+deviation+1;
-      Float_t y21 = circuit.GetY21Pos(localBoardId, stripX21);       
-      Float_t x11 = circuit.GetX11Pos(localBoardId, locTrg->LoStripY());
-      
-      AliDebug(1, Form(" MakeTriggerTrack %d %d %d %d %f %f %f \n",locTrg->LoCircuit(),
-                       locTrg->LoStripX(),locTrg->LoStripX()+locTrg->LoDev()+1,locTrg->LoStripY(),y11, y21, x11));
-      
-      Float_t thetax = TMath::ATan2( x11 , z11 );
-      Float_t thetay = TMath::ATan2( (y21-y11) , (z21-z11) );
-      
-      triggerTrack.SetX11(x11);
-      triggerTrack.SetY11(y11);
-      triggerTrack.SetThetax(thetax);
-      triggerTrack.SetThetay(thetay);
-      triggerTrack.SetGTPattern(gloTrigPat);
-      triggerTrack.SetLoTrgNum(localBoardId);
-      
+      TriggerToTrack(circuit, *locTrg, triggerTrack, gloTrigPat);
+
       triggerTrackStore.Add(triggerTrack);
     } // board is fired 
   } // end of loop on Local Trigger
 }
 
+//__________________________________________________________________________
+void AliMUONVTrackReconstructor::TriggerToTrack(const AliMUONTriggerCircuit& circuit,
+                                                const AliMUONLocalTrigger& locTrg,
+                                                AliMUONTriggerTrack& triggerTrack,
+                                                UChar_t globalTriggerPattern)
+{
+  /// To make the trigger tracks from Local Trigger
+  const Double_t kTrigNonBendReso = AliMUONConstants::TriggerNonBendingReso();
+  const Double_t kTrigBendReso = AliMUONConstants::TriggerBendingReso();
+  const Double_t kSqrt12 = TMath::Sqrt(12.);
+  
+  TMatrixD trigCov(3,3);
+
+  Int_t localBoardId = locTrg.LoCircuit();
+      
+  Float_t y11 = circuit.GetY11Pos(localBoardId, locTrg.LoStripX()); 
+  Float_t z11 = circuit.GetZ11Pos(localBoardId, locTrg.LoStripX());
+  // need first to convert deviation to [0-30] 
+  // (see AliMUONLocalTriggerBoard::LocalTrigger)
+  Int_t deviation = locTrg.GetDeviation(); 
+  Int_t stripX21 = locTrg.LoStripX()+deviation+1;
+  Float_t y21 = circuit.GetY21Pos(localBoardId, stripX21);       
+  Float_t z21 = circuit.GetZ21Pos(localBoardId, stripX21);
+  Float_t x11 = circuit.GetX11Pos(localBoardId, locTrg.LoStripY());
+      
+  AliDebug(1, Form(" MakeTriggerTrack %3d %2d %2d %2d (%f %f %f) (%f %f)\n",locTrg.LoCircuit(),
+                   locTrg.LoStripX(),locTrg.LoStripX()+deviation+1,locTrg.LoStripY(),x11, y11, z11, y21, z21));
+      
+  Double_t deltaZ = z11 - z21;
+      
+  Float_t slopeX = x11/z11;
+  Float_t slopeY = (y11-y21) / deltaZ;
+      
+  Float_t sigmaX = circuit.GetX11Width(localBoardId, locTrg.LoStripY()) / kSqrt12;
+  Float_t sigmaY = circuit.GetY11Width(localBoardId, locTrg.LoStripX()) / kSqrt12;
+  Float_t sigmaY21 = circuit.GetY21Width(localBoardId, locTrg.LoStripX()) / kSqrt12;
+      
+  trigCov.Zero();
+  trigCov(0,0) = kTrigNonBendReso * kTrigNonBendReso + sigmaX * sigmaX;
+  trigCov(1,1) = kTrigBendReso * kTrigBendReso + sigmaY * sigmaY;
+  trigCov(2,2) = 
+    (2. * kTrigBendReso * kTrigBendReso + sigmaY * sigmaY + sigmaY21 * sigmaY21 ) / deltaZ / deltaZ;
+    trigCov(1,2) = trigCov(2,1) = trigCov(1,1) / deltaZ;
+      
+  triggerTrack.SetX11(x11);
+  triggerTrack.SetY11(y11);
+  triggerTrack.SetZ11(z11);
+  triggerTrack.SetZ21(z21);
+  triggerTrack.SetSlopeX(slopeX);
+  triggerTrack.SetSlopeY(slopeY);
+  triggerTrack.SetGTPattern(globalTriggerPattern);
+  triggerTrack.SetLoTrgNum(localBoardId);
+  triggerTrack.SetCovariances(trigCov);
+  triggerTrack.SetUniqueID(locTrg.GetUniqueID());
+}