]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - PHOS/AliPHOSAnalyze.cxx
the MIXT geometry (IHEP+GPS2) has been introduced
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSAnalyze.cxx
index b8c9a84a07ce9358985f659d8afa857798ed4635..5c1acbd5ceb0b7beda3676543996c3f0db8b7e28 100644 (file)
@@ -19,7 +19,7 @@
 // Algorythm class to analyze PHOSv1 events:
 // Construct histograms and displays them.
 // Use the macro EditorBar.C for best access to the functionnalities
-//
+//*--
 //*-- Author: Y. Schutz (SUBATECH) & Gines Martinez (SUBATECH)
 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
@@ -34,6 +34,7 @@
 #include "TTree.h"
 #include "TMath.h"
 #include "TCanvas.h" 
+#include "TStyle.h" 
 
 // --- Standard library ---
 
 #include "AliPHOSTrackSegment.h"
 #include "AliPHOSRecParticle.h"
 #include "AliPHOSIndexToObject.h"
+#include "AliPHOSHit.h"
+#include "AliPHOSCPVHit.h"
+#include "AliPHOSCpvRecPoint.h"
 
 ClassImp(AliPHOSAnalyze)
 
-
 //____________________________________________________________________________
   AliPHOSAnalyze::AliPHOSAnalyze()
 {
@@ -87,6 +90,7 @@ AliPHOSAnalyze::AliPHOSAnalyze(Text_t * name)
       fEvt = -999 ; 
 
   }
+  fDebugLevel = 0;
   fClu = 0 ;
   fPID = 0 ;
   fTrs = 0 ;
@@ -114,268 +118,527 @@ AliPHOSAnalyze::~AliPHOSAnalyze()
 {
   // dtor
 
-  if (fRootFile->IsOpen() ) 
-    fRootFile->Close() ; 
-  if(fRootFile)
-    delete fRootFile ;  
-
-  if(fPHOS)
-    delete fPHOS ; 
-
-  if(fClu)
-    delete fClu ; 
-
-  if(fPID)
-    delete fPID ; 
-
-  if(fRec)
-    delete fRec ; 
-
-  if(fTrs)
-    delete fTrs ; 
+  if(fRootFile->IsOpen()) fRootFile->Close() ; 
+  if(fRootFile)   {delete fRootFile ; fRootFile=0 ;}
+  if(fPHOS)       {delete fPHOS     ; fPHOS    =0 ;}
+  if(fClu)        {delete fClu      ; fClu     =0 ;}
+  if(fPID)        {delete fPID      ; fPID     =0 ;}
+  if(fRec)        {delete fRec      ; fRec     =0 ;}
+  if(fTrs)        {delete fTrs      ; fTrs     =0 ;}
 
 }
-
 //____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::ActivePPSD(Int_t Nevents=1){
-  
-  fhEnergyCorrelations  = new TH2F("hEnergyCorrelations","hEnergyCorrelations",40,  0., 0.15, 30, 0., 3.e-5);
+void AliPHOSAnalyze::DrawRecon(Int_t Nevent,Int_t Nmod){
+  //Draws pimary particles and reconstructed 
+  //digits, RecPoints, RecPartices etc 
+  //for event Nevent in the module Nmod.
+
+  TH2F * digitOccupancy  = new TH2F("digitOccupancy","EMC digits", 64,-71.,71.,64,-71.,71.);
+  TH2F * emcOccupancy    = new TH2F("emcOccupancy","EMC RecPoints",64,-71.,71.,64,-71.,71.);
+  TH2F * ppsdUp          = new TH2F("ppsdUp","PPSD Up digits",     128,-71.,71.,128,-71.,71.) ;
+  TH2F * ppsdUpCl        = new TH2F("ppsdUpCl","PPSD Up RecPoints",128,-71.,71.,128,-71.,71.) ;
+  TH2F * ppsdLow         = new TH2F("ppsdLow","PPSD Low digits",     128,-71.,71.,128,-71.,71.) ;
+  TH2F * ppsdLowCl       = new TH2F("ppsdLowCl","PPSD Low RecPoints",128,-71.,71.,128,-71.,71.) ;
+  TH2F * nbar            = new TH2F("nbar","Primary nbar",    64,-71.,71.,64,-71.,71.);
+  TH2F * phot            = new TH2F("phot","Primary Photon",  64,-71.,71.,64,-71.,71.);
+  TH2F * charg           = new TH2F("charg","Primary charged",64,-71.,71.,64,-71.,71.);
+  TH2F * recPhot         = new TH2F("recPhot","RecParticles with primary Photon",64,-71.,71.,64,-71.,71.);
+  TH2F * recNbar         = new TH2F("recNbar","RecParticles with primary Nbar",  64,-71.,71.,64,-71.,71.);
+
   //========== Create the Clusterizer
   fClu = new AliPHOSClusterizerv1() ; 
-  fClu->SetEmcEnergyThreshold(0.01) ; 
-  fClu->SetEmcClusteringThreshold(0.20) ; 
-  fClu->SetPpsdEnergyThreshold    (0.0000002) ; 
-  fClu->SetPpsdClusteringThreshold(0.0000001) ; 
-  fClu->SetLocalMaxCut(0.02) ;
-  fClu->SetCalibrationParameters(0., 0.00000001) ; 
 
-  Int_t ievent;
+  fClu->SetEmcEnergyThreshold(0.05) ;
+  fClu->SetEmcClusteringThreshold(0.20) ;
+  fClu->SetPpsdEnergyThreshold    (0.0000002) ;
+  fClu->SetPpsdClusteringThreshold(0.0000001) ;
+  fClu->SetLocalMaxCut(0.03) ;
+  fClu->SetCalibrationParameters(0., 0.00000001) ;
   
-  for ( ievent=0; ievent<Nevents; ievent++)
-    {  
-      
-      //========== Event Number>         
-      if ( ( log10((Float_t)(ievent+1)) - (Int_t)(log10((Float_t)(ievent+1))) ) == 0. ) 
-       cout <<  "AnalyzeResolutions > " << "Event is " << ievent << endl ;  
-      
-      //=========== Connects the various Tree's for evt
-      gAlice->GetEvent(ievent);
+  gAlice->GetEvent(Nevent);
+  
+  TClonesArray * primaryList  = gAlice->Particles();
+  
+  TParticle * primary ;
+  Int_t iPrimary ;
+  for ( iPrimary = 0 ; iPrimary < primaryList->GetEntries() ; iPrimary++)
+    {
+      primary = (TParticle*)primaryList->At(iPrimary) ;
+      Int_t primaryType = primary->GetPdgCode() ;
+      if( (primaryType == 211)||(primaryType == -211)||(primaryType == 2212)||(primaryType == -2212) ) {
+        Int_t moduleNumber ;
+        Double_t primX, primZ ;
+        fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+        if(moduleNumber==Nmod)
+          charg->Fill(primZ,primX,primary->Energy()) ;
+      }
+      if( primaryType == 22 ) {
+        Int_t moduleNumber ;
+        Double_t primX, primZ ;
+        fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+        if(moduleNumber==Nmod)
+          phot->Fill(primZ,primX,primary->Energy()) ;
+      }
+      else{
+        if( primaryType == -2112 ) {
+          Int_t moduleNumber ;
+          Double_t primX, primZ ;
+          fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+          if(moduleNumber==Nmod)
+            nbar->Fill(primZ,primX,primary->Energy()) ;
+        }
+      }
+    }  
 
-      //=========== Gets the Kine TTree
-      gAlice->TreeK()->GetEvent(0) ;
-            
-      //=========== Get the Digit Tree
-      gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
-      
-      //========== Creating branches ===================================       
-      AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** EmcRecPoints =  fPHOS->EmcRecPoints() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSEmcRP", EmcRecPoints ) ;
-      
-      AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** PpsdRecPoints = fPHOS->PpsdRecPoints() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSPpsdRP", PpsdRecPoints ) ;
-      
-      AliPHOSTrackSegment::TrackSegmentsList **  TrackSegmentsList = fPHOS->TrackSegments() ;
-      if( (*TrackSegmentsList) )
-       (*TrackSegmentsList)->Clear() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSTS", TrackSegmentsList ) ;
+  fPHOS->SetTreeAddress() ;
+
+  gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
+  gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
+  
+  TObjArray ** emcRecPoints =  fPHOS->EmcRecPoints() ;
+  TObjArray ** ppsdRecPoints = fPHOS->PpsdRecPoints() ;
+  TClonesArray ** recParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;
+  
+  Int_t iDigit ;
+  AliPHOSDigit * digit ;
+  
+  for(iDigit = 0; iDigit < fPHOS->Digits()->GetEntries(); iDigit++)
+    {
+      digit = (AliPHOSDigit *) fPHOS->Digits()->At(iDigit) ;
+      Int_t relid[4];
+      fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
+      Float_t x,z ;
+      fGeom->RelPosInModule(relid,x,z) ;
+      Float_t e = fClu->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
+      if(relid[0]==Nmod){
+        if(relid[1]==0)  //EMC
+          digitOccupancy->Fill(x,z,e) ;
+        if((relid[1]>0)&&(relid[1]<17))
+          ppsdUp->Fill(x,z,e) ;
+        if(relid[1]>16)
+          ppsdLow->Fill(x,z,e) ;
+      }
+    }
+  
+  Int_t irecp ;
+  TVector3 pos ;
+  
+  for(irecp = 0; irecp < (*emcRecPoints)->GetEntries() ; irecp ++){
+    AliPHOSEmcRecPoint * emc= (AliPHOSEmcRecPoint*)(*emcRecPoints)->At(irecp) ;
+    if(emc->GetPHOSMod()==Nmod){
+      emc->GetLocalPosition(pos) ;
+      emcOccupancy->Fill(pos.X(),pos.Z(),emc->GetEnergy());
+    }
+  }
+  
+  for(irecp = 0; irecp < (*ppsdRecPoints)->GetEntries() ; irecp ++){
+    AliPHOSPpsdRecPoint * ppsd= (AliPHOSPpsdRecPoint *)(*ppsdRecPoints)->At(irecp) ;
+    if(ppsd->GetPHOSMod()==Nmod){
+      ppsd->GetLocalPosition(pos) ;
+      if(ppsd->GetUp())
+        ppsdUpCl->Fill(pos.X(),pos.Z(),ppsd->GetEnergy());
+      else
+        ppsdLowCl->Fill(pos.X(),pos.Z(),ppsd->GetEnergy());
+    }
+  }
+  
+  AliPHOSRecParticle * recParticle ;
+  Int_t iRecParticle ;
+  for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*recParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ )
+    {
+      recParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*recParticleList)->At(iRecParticle) ;
       
-      AliPHOSRecParticle::RecParticlesList ** RecParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;
-      if( (*RecParticleList) )
-       (*RecParticleList)->Clear() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSRP", RecParticleList ) ;
+      Int_t moduleNumberRec ;
+      Double_t recX, recZ ;
+      fGeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), moduleNumberRec, recX, recZ) ;
+      if(moduleNumberRec == Nmod){
+       
+        Double_t minDistance = 5. ;
+        Int_t closestPrimary = -1 ;
+       
+        Int_t numberofprimaries ;
+        Int_t * listofprimaries  = recParticle->GetPrimaries(numberofprimaries)  ;
+        Int_t index ;
+        TParticle * primary ;
+        Double_t distance = minDistance ;
+         
+       for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++){
+         primary = (TParticle*)primaryList->At(listofprimaries[index]) ;
+         Int_t moduleNumber ;
+         Double_t primX, primZ ;
+         fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+         if(moduleNumberRec == moduleNumber)
+           distance = TMath::Sqrt((recX-primX)*(recX-primX)+(recZ-primZ)*(recZ-primZ) ) ;
+         if(minDistance > distance)
+           {
+             minDistance = distance ;
+             closestPrimary = listofprimaries[index] ;
+           }
+       }
+       
+        if(closestPrimary >=0 ){
+         
+          Int_t primaryType = ((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->GetPdgCode() ;
+         
+          if(primaryType==22)
+            recPhot->Fill(recZ,recX,recParticle->Energy()) ;
+          else
+            if(primaryType==-2112)
+              recNbar->Fill(recZ,recX,recParticle->Energy()) ; 
+        }
+      }
+    }
+  
+  
+  digitOccupancy->Draw("box") ;
+  emcOccupancy->SetLineColor(2) ;
+  emcOccupancy->Draw("boxsame") ;
+  ppsdUp->SetLineColor(3) ;
+  ppsdUp->Draw("boxsame") ;
+  ppsdLow->SetLineColor(4) ;
+  ppsdLow->Draw("boxsame") ;
+  phot->SetLineColor(8) ;
+  phot->Draw("boxsame") ;
+  nbar->SetLineColor(6) ;
+  nbar->Draw("boxsame") ;
+  
+}
+//____________________________________________________________________________
+ void AliPHOSAnalyze::Reconstruct(Int_t nevents,Int_t firstEvent )    
+{     
+
+  // Performs reconstruction of EMC and CPV (GPS2, IHEP or MIXT)
+  // for events from FirstEvent to Nevents
+
+  Int_t ievent ;   
+  for ( ievent=firstEvent; ievent<nevents; ievent++) {  
+    if (ievent==firstEvent) {
+      cout << "Analyze > Starting Reconstructing " << endl ; 
+      //========== Create the Clusterizer
+      fClu = new AliPHOSClusterizerv1() ; 
+      fClu->SetEmcEnergyThreshold(0.05) ; 
+      fClu->SetEmcClusteringThreshold(0.20) ; 
+      fClu->SetLocalMaxCut(0.03) ;
+      if      (strcmp(fGeom->GetName(),"GPS2") == 0 || strcmp(fGeom->GetName(),"MIXT") == 0) {
+       fClu->SetPpsdEnergyThreshold    (0.0000002) ; 
+       fClu->SetPpsdClusteringThreshold(0.0000001) ; 
+      }
+      else if (strcmp(fGeom->GetName(),"IHEP") == 0 || strcmp(fGeom->GetName(),"MIXT") == 0) {
+       fClu->SetLocalMaxCutCPV(0.03) ;
+       fClu->SetLogWeightCutCPV(4.0) ;
+       fClu->SetCpvEnergyThreshold(0.09) ;
+      }
+      fClu->SetCalibrationParameters(0., 0.00000001) ; 
       
+      //========== Creates the track segment maker
+      fTrs = new AliPHOSTrackSegmentMakerv1()  ;
+         //      fTrs->UnsetUnfoldFlag() ; 
+     
+      //========== Creates the particle identifier for GPS2 only
+      if      (strcmp(fGeom->GetName(),"GPS2") == 0 || strcmp(fGeom->GetName(),"MIXT") == 0) {
+       fPID = new AliPHOSPIDv1() ;
+       fPID->SetShowerProfileCuts(0.3, 1.8, 0.3, 1.8 ) ; 
+      }          
       
-      //=========== Gets the Reconstraction TTree
-      gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
-            
-      AliPHOSPpsdRecPoint * RecPoint ;
-      Int_t relid[4] ; 
-      TIter nextRP(*fPHOS->PpsdRecPoints() ) ;
-      while( ( RecPoint = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextRP() ) )
-       {
-         if(!(RecPoint->GetUp()) ) {
-           AliPHOSDigit *digit ;
-           Int_t iDigit ;
-           for(iDigit = 0; iDigit < fPHOS->Digits()->GetEntries(); iDigit++) 
-             {
-               digit = (AliPHOSDigit *) fPHOS->Digits()->At(iDigit) ;
-               fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;    
-                if((relid[2]==1)&&(relid[3]==1)&&(relid[0]==RecPoint->GetPHOSMod())){
-                 Float_t ConvertorEnergy = fClu->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
-                 fhEnergyCorrelations->Fill(ConvertorEnergy,RecPoint->GetTotalEnergy() );  
-                 break ; 
-               } 
-             }
-           break ;
-         }
-       }
+      //========== Creates the Reconstructioner
+      fRec = new AliPHOSReconstructioner(fClu, fTrs, fPID) ; 
+      if (fDebugLevel != 0) fRec -> SetDebugReconstruction(kTRUE);     
     }
-  SaveHistograms() ;
-  fhEnergyCorrelations->Draw("BOX") ;
-}
+      
+    if (fDebugLevel != 0 ||
+       (ievent+1) % (Int_t)TMath::Power( 10, (Int_t)TMath::Log10(ievent+1) ) == 0)
+      cout <<  "======= Analyze ======> Event " << ievent+1 << endl ;
+    
+    //=========== Connects the various Tree's for evt
+    Int_t tracks = gAlice->GetEvent(ievent);
 
+    fPHOS->Hit2Digit(tracks) ;
+        
+    //=========== Do the reconstruction
+    fPHOS->Reconstruction(fRec);    
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::AnalyzeManyEvents(Int_t Nevents, Int_t module)    
-{
-  // analyzes Nevents events in a single PHOS module  
-  // Events should be reconstructed by Reconstruct()
+  }
+  
+  if(fClu)      {delete fClu      ; fClu     =0 ;}
+  if(fPID)      {delete fPID      ; fPID     =0 ;}
+  if(fRec)      {delete fRec      ; fRec     =0 ;}
+  if(fTrs)      {delete fTrs      ; fTrs     =0 ;}
+  
+}
 
-  if ( fRootFile == 0 ) 
-    cout << "AnalyzeManyEvents > " << "Root File not openned" << endl ;  
-  else
-    {
-      //========== Booking Histograms
-      cout << "AnalyzeManyEvents > " << "Booking Histograms" << endl ; 
-      BookingHistograms();
-
-      Int_t ievent;
-      Int_t relid[4] ; 
-      AliPHOSDigit * digit ;
-      AliPHOSEmcRecPoint * emc ;
-      AliPHOSPpsdRecPoint * ppsd ;
-      //      AliPHOSTrackSegment * tracksegment ;
-      AliPHOSRecParticle * recparticle;
-
-      for ( ievent=0; ievent<Nevents; ievent++)
-       {  
-         //========== Event Number>         
-         if ( ( log10((Float_t)(ievent+1)) - (Int_t)(log10((Float_t)(ievent+1))) ) == 0. ) 
-           cout <<  "AnalyzeManyEvents > " << "Event is " << ievent << endl ;  
-
-         //=========== Connects the various Tree's for evt
-         gAlice->GetEvent(ievent);
-
-         //=========== Gets the Digit TTree
-         gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
-
-         //=========== Gets the number of entries in the Digits array 
-         TIter nextdigit(fPHOS->Digits()) ;
-         while( ( digit = (AliPHOSDigit *)nextdigit() ) )
-           {
-             fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;         
-             if (fClu->IsInEmc(digit)) fhEmcDigit->Fill(fClu->Calibrate(digit->GetAmp())) ; 
-             else    
-               {  
-                 if (relid[1]<17) fhVetoDigit->Fill(fClu->Calibrate(digit->GetAmp())); 
-                 if (relid[1]>16) fhConvertorDigit->Fill(fClu->Calibrate(digit->GetAmp()));
-               }
-           }
-         
+//-------------------------------------------------------------------------------------
+void AliPHOSAnalyze::ReadAndPrintCPV(Int_t EvFirst, Int_t EvLast)
+{
+  //
+  // Read and print generated and reconstructed hits in CPV
+  // for events from EvFirst to Nevent.
+  // If only EvFirst is defined, print only this one event.
+  // Author: Yuri Kharlov
+  // 12 October 2000
+  //
+
+  if (EvFirst!=0 && EvLast==0) EvLast=EvFirst;
+  for ( Int_t ievent=EvFirst; ievent<=EvLast; ievent++) {  
+    
+    //========== Event Number>
+    cout << endl <<  "==== ReadAndPrintCPV ====> Event is " << ievent+1 << endl ;
+    
+    //=========== Connects the various Tree's for evt
+    Int_t ntracks = gAlice->GetEvent(ievent);
 
-         //=========== Cluster in module
-         TIter nextEmc(*fPHOS->EmcRecPoints()  ) ;
-         while((emc = (AliPHOSEmcRecPoint *)nextEmc())) 
-           {
-             if ( emc->GetPHOSMod() == module )
-               {  
-                 fhEmcCluster->Fill(  emc->GetTotalEnergy()  ); 
-                 TIter nextPpsd( *fPHOS->PpsdRecPoints()) ;
-                 while((ppsd = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextPpsd())) 
-                   {
-                     if ( ppsd->GetPHOSMod() == module )
-                       {                         
-                         if (!ppsd->GetUp()) fhConvertorEmc->Fill(emc->GetTotalEnergy(),ppsd->GetTotalEnergy()) ;
-                       }
-                   } 
-               }
-           }
+    //========== Creating branches ===================================
+    AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** emcRecPoints = fPHOS->EmcRecPoints() ;
+    gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSEmcRP" , emcRecPoints  ) ;
+    
+    AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** cpvRecPoints = fPHOS->CpvRecPoints() ;
+    gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSCpvRP", cpvRecPoints ) ;
 
-         //=========== Cluster in module PPSD Down
-         TIter nextPpsd(*fPHOS->PpsdRecPoints() ) ;
-         while((ppsd = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextPpsd())) 
-           {
-             if ( ppsd->GetPHOSMod() == module )
-               { 
-                 if (!ppsd->GetUp()) fhConvertorCluster->Fill(ppsd->GetTotalEnergy()) ;
-                 if (ppsd->GetUp())  fhVetoCluster     ->Fill(ppsd->GetTotalEnergy()) ;
-               }
-           }
+    // Read and print CPV hits
+      
+    AliPHOSCPVModule cpvModule;
+    TClonesArray    *cpvHits;
+    Int_t           nCPVhits;
+    AliPHOSCPVHit   *cpvHit;
+    TLorentzVector   p;
+    Float_t          xgen, zgen;
+    Int_t            ipart;
+    Int_t            nGenHits = 0;
+    for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
+      //=========== Get the Hits Tree for the Primary track itrack
+      gAlice->ResetHits();
+      gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
+      Int_t iModule = 0 ;      
+      for (iModule=0; iModule < fGeom->GetNCPVModules(); iModule++) {
+       cpvModule = fPHOS->GetCPVModule(iModule);
+       cpvHits   = cpvModule.Hits();
+       nCPVhits  = cpvHits->GetEntriesFast();
+       for (Int_t ihit=0; ihit<nCPVhits; ihit++) {
+         nGenHits++;
+         cpvHit = (AliPHOSCPVHit*)cpvHits->UncheckedAt(ihit);
+         p      = cpvHit->GetMomentum();
+         xgen   = cpvHit->X();
+         zgen   = cpvHit->Y();
+         ipart  = cpvHit->GetIpart();
+         printf("CPV hit in module %d: ",iModule+1);
+         printf(" p = (%f, %f, %f, %f) GeV,\n",
+                p.Px(),p.Py(),p.Pz(),p.Energy());
+         printf("                  (X,Z) = (%8.4f, %8.4f) cm, ipart = %d\n",
+                xgen,zgen,ipart);
+       }
+      }
+    }
 
-         //========== TRackSegments in the event
-         TIter nextRecParticle(*fPHOS->RecParticles() ) ; 
-         while((recparticle = (AliPHOSRecParticle *)nextRecParticle())) 
-           {
-             if ( recparticle->GetPHOSTrackSegment()->GetPHOSMod() == module )
-               { 
-                 cout << "Particle type is " << recparticle->GetType() << endl ; 
-                 Int_t numberofprimaries = 0 ;
-                 Int_t * listofprimaries = recparticle->GetPrimaries(numberofprimaries) ;
-                 cout << "Number of primaries = " << numberofprimaries << endl ; 
-                 Int_t index ;
-                 for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++)
-                   cout << "    primary # " << index << " =  " << listofprimaries[index] << endl ;  
-               }
-           }
-       }   // endfor
-      SaveHistograms();
-    }       // endif
-}           // endfunction
+    // Read and print CPV reconstructed points
+
+    //=========== Gets the Reconstruction TTree
+    gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
+    printf("Recpoints: %d\n",(*fPHOS->CpvRecPoints())->GetEntries());
+    TIter nextRP(*fPHOS->CpvRecPoints() ) ;
+    AliPHOSCpvRecPoint *cpvRecPoint ;
+    Int_t nRecPoints = 0;
+    while( ( cpvRecPoint = (AliPHOSCpvRecPoint *)nextRP() ) ) {
+      nRecPoints++;
+      TVector3  locpos;
+      cpvRecPoint->GetLocalPosition(locpos);
+      Int_t phosModule = cpvRecPoint->GetPHOSMod();
+      printf("CPV recpoint in module %d: (X,Z) = (%f,%f) cm\n",
+            phosModule,locpos.X(),locpos.Z());
+    }
+    printf("This event has %d generated hits and %d reconstructed points\n",
+          nGenHits,nRecPoints);
+  }
+}
 
 //____________________________________________________________________________
- void AliPHOSAnalyze::Reconstruct(Int_t Nevents,Int_t FirstEvent )    
-{     
-  Int_t ievent ;   
-  for ( ievent=FirstEvent; ievent<Nevents; ievent++)
-    {  
-      if (ievent==FirstEvent) 
-       {
-         cout << "Analyze > Starting Reconstructing " << endl ; 
-         //========== Create the Clusterizer
-         fClu = new AliPHOSClusterizerv1() ; 
-         fClu->SetEmcEnergyThreshold(0.03) ; 
-         fClu->SetEmcClusteringThreshold(0.20) ; 
-         fClu->SetPpsdEnergyThreshold    (0.0000001) ; 
-         fClu->SetPpsdClusteringThreshold(0.0000001) ;
-         fClu->SetLocalMaxCut(0.02) ;
-         fClu->SetCalibrationParameters(0., 0.00000001) ; 
-         
-         //========== Creates the track segment maker
-         fTrs = new AliPHOSTrackSegmentMakerv1()  ;
-         //      fTrs->UnsetUnfoldFlag() ; 
-         
-         //========== Creates the particle identifier
-         fPID = new AliPHOSPIDv1() ;
-         fPID->SetShowerProfileCuts(0.3, 1.8, 0.3, 1.8 ) ; 
-         fPID->SetDispersionCutOff(2.0) ;
-         fPID->SetRelativeDistanceCut(3.) ;
-         
-         //========== Creates the Reconstructioner  
-         fRec = new AliPHOSReconstructioner(fClu, fTrs, fPID) ; 
-         //              fRec -> SetDebugReconstruction(kTRUE);     
-
-       }
-      
-      //========== Event Number>         
-      //      if ( ( log10((Float_t)(ievent+1)) - (Int_t)(log10((Float_t)(ievent+1))) ) == 0. ) 
-       cout <<  "Reconstruct > Event is " << ievent << endl ;  
+void AliPHOSAnalyze::AnalyzeCPV(Int_t Nevents)
+{
+  //
+  // Analyzes CPV characteristics
+  // Author: Yuri Kharlov
+  // 9 October 2000
+  //
+
+  // Book histograms
+
+  TH1F *hDx   = new TH1F("hDx"  ,"CPV x-resolution@reconstruction",100,-5. , 5.);
+  TH1F *hDz   = new TH1F("hDz"  ,"CPV z-resolution@reconstruction",100,-5. , 5.);
+  TH1F *hDr   = new TH1F("hDr"  ,"CPV r-resolution@reconstruction",100, 0. , 5.);
+  TH1S *hNrp  = new TH1S("hNrp" ,"CPV rec.point multiplicity",      21,-0.5,20.5);
+  TH1S *hNrpX = new TH1S("hNrpX","CPV rec.point Phi-length"  ,      21,-0.5,20.5);
+  TH1S *hNrpZ = new TH1S("hNrpZ","CPV rec.point Z-length"    ,      21,-0.5,20.5);
+
+  cout << "Start CPV Analysis"<< endl ;
+  for ( Int_t ievent=0; ievent<Nevents; ievent++) {  
       
-      //=========== Connects the various Tree's for evt
-      gAlice->GetEvent(ievent);
+    //========== Event Number>         
+//      if ( (ievent+1) % (Int_t)TMath::Power( 10, (Int_t)TMath::Log10(ievent+1) ) == 0)
+      cout << endl <<  "==== AnalyzeCPV ====> Event is " << ievent+1 << endl ;
+    
+    //=========== Connects the various Tree's for evt
+    Int_t ntracks = gAlice->GetEvent(ievent);
+    
+    //========== Creating branches ===================================
+    AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** emcRecPoints = fPHOS->EmcRecPoints() ;
+    gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSEmcRP" , emcRecPoints  ) ;
+    
+    AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** cpvRecPoints = fPHOS->PpsdRecPoints() ;
+    gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSPpsdRP", cpvRecPoints ) ;
 
-      //=========== Gets the Digit TTree
-      gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
+    // Create and fill arrays of hits for each CPV module
+      
+    Int_t nOfModules = fGeom->GetNModules();
+    TClonesArray **hitsPerModule = new TClonesArray *[nOfModules];
+    Int_t iModule = 0;         
+    for (iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++)
+      hitsPerModule[iModule] = new TClonesArray("AliPHOSCPVHit",100);
+
+    AliPHOSCPVModule cpvModule;
+    TClonesArray    *cpvHits;
+    Int_t           nCPVhits;
+    AliPHOSCPVHit   *cpvHit;
+    TLorentzVector   p;
+    Float_t          xzgen[2];
+    Int_t            ipart;
+
+    // First go through all primary tracks and fill the arrays
+    // of hits per each CPV module
+
+    for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
+      // Get the Hits Tree for the Primary track itrack
+      gAlice->ResetHits();
+      gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
+      for (Int_t iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++) {
+       cpvModule = fPHOS->GetCPVModule(iModule);
+       cpvHits   = cpvModule.Hits();
+       nCPVhits  = cpvHits->GetEntriesFast();
+       for (Int_t ihit=0; ihit<nCPVhits; ihit++) {
+         cpvHit   = (AliPHOSCPVHit*)cpvHits->UncheckedAt(ihit);
+         p        = cpvHit->GetMomentum();
+         xzgen[0] = cpvHit->X();
+         xzgen[1] = cpvHit->Y();
+         ipart    = cpvHit->GetIpart();
+         TClonesArray &lhits = *(TClonesArray *)hitsPerModule[iModule];
+         new(lhits[hitsPerModule[iModule]->GetEntriesFast()]) AliPHOSCPVHit(*cpvHit);
+       }
+       cpvModule.Clear();
+      }
+    }
+    for (iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++) {
+      Int_t nsum = hitsPerModule[iModule]->GetEntriesFast();
+      printf("Module %d has %d hits\n",iModule,nsum);
+    }
 
-      //=========== Do the reconstruction
-      fPHOS->Reconstruction(fRec);
+    // Then go through reconstructed points and for each find
+    // the closeset hit
+    // The distance from the rec.point to the closest hit
+    // gives the coordinate resolution of the CPV
+
+    // Get the Reconstruction Tree
+    gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
+    TIter nextRP(*fPHOS->PpsdRecPoints() ) ;
+    AliPHOSCpvRecPoint *cpvRecPoint ;
+    Float_t xgen, zgen;
+    while( ( cpvRecPoint = (AliPHOSCpvRecPoint *)nextRP() ) ) {
+      TVector3  locpos;
+      cpvRecPoint->GetLocalPosition(locpos);
+      Int_t phosModule = cpvRecPoint->GetPHOSMod();
+      Int_t rpMult     = cpvRecPoint->GetDigitsMultiplicity();
+      Int_t rpMultX, rpMultZ;
+      cpvRecPoint->GetClusterLengths(rpMultX,rpMultZ);
+      Float_t xrec  = locpos.X();
+      Float_t zrec  = locpos.Z();
+      Float_t dxmin = 1.e+10;
+      Float_t dzmin = 1.e+10;
+      Float_t r2min = 1.e+10;
+      Float_t r2;
+
+      cpvHits = hitsPerModule[phosModule-1];
+      Int_t nCPVhits  = cpvHits->GetEntriesFast();
+      for (Int_t ihit=0; ihit<nCPVhits; ihit++) {
+       cpvHit = (AliPHOSCPVHit*)cpvHits->UncheckedAt(ihit);
+       xgen   = cpvHit->X();
+       zgen   = cpvHit->Y();
+       r2 = TMath::Power((xgen-xrec),2) + TMath::Power((zgen-zrec),2);
+       if ( r2 < r2min ) {
+         r2min = r2;
+         dxmin = xgen - xrec;
+         dzmin = zgen - zrec;
+       }
+      }
+      hDx  ->Fill(dxmin);
+      hDz  ->Fill(dzmin);
+      hDr  ->Fill(TMath::Sqrt(r2min));
+      hNrp ->Fill(rpMult);
+      hNrpX->Fill(rpMultX);
+      hNrpZ->Fill(rpMultZ);
     }
+    delete [] hitsPerModule;
+  }
+  // Save histograms
+
+  Text_t outputname[80] ;
+  sprintf(outputname,"%s.analyzed",fRootFile->GetName());
+  TFile output(outputname,"RECREATE");
+  output.cd();
 
-    fClu->Delete();
-    fClu=0 ;
-    fTrs->Delete();
-    fTrs = 0 ;
-    fPID->Delete();
-    fPID = 0 ;
-    fRec->Delete();
-    fRec = 0 ;
+  hDx  ->Write() ;
+  hDz  ->Write() ;
+  hDr  ->Write() ;
+  hNrp ->Write() ;
+  hNrpX->Write() ;
+  hNrpZ->Write() ;
+
+  // Plot histograms
+
+  TCanvas *cpvCanvas = new TCanvas("CPV","CPV analysis",20,20,800,400);
+  gStyle->SetOptStat(111111);
+  gStyle->SetOptFit(1);
+  gStyle->SetOptDate(1);
+  cpvCanvas->Divide(3,2);
+
+  cpvCanvas->cd(1);
+  gPad->SetFillColor(10);
+  hNrp->SetFillColor(16);
+  hNrp->Draw();
+
+  cpvCanvas->cd(2);
+  gPad->SetFillColor(10);
+  hNrpX->SetFillColor(16);
+  hNrpX->Draw();
+
+  cpvCanvas->cd(3);
+  gPad->SetFillColor(10);
+  hNrpZ->SetFillColor(16);
+  hNrpZ->Draw();
+
+  cpvCanvas->cd(4);
+  gPad->SetFillColor(10);
+  hDx->SetFillColor(16);
+  hDx->Fit("gaus");
+  hDx->Draw();
+
+  cpvCanvas->cd(5);
+  gPad->SetFillColor(10);
+  hDz->SetFillColor(16);
+  hDz->Fit("gaus");
+  hDz->Draw();
+
+  cpvCanvas->cd(6);
+  gPad->SetFillColor(10);
+  hDr->SetFillColor(16);
+  hDr->Draw();
+
+  cpvCanvas->Print("CPV.ps");
 
 }
+
 //____________________________________________________________________________
  void AliPHOSAnalyze::InvariantMass(Int_t Nevents )    
 {
   // Calculates Real and Mixed invariant mass distributions
-  Int_t NMixedEvents = 4 ; //# of events used for calculation of 'mixed' distribution 
-  Int_t MixedLoops = (Int_t )TMath::Ceil(Nevents/NMixedEvents) ;
+
+  const Int_t nMixedEvents = 4 ; //# of events used for calculation of 'mixed' distribution 
+  Int_t mixedLoops = (Int_t )TMath::Ceil(Nevents/nMixedEvents) ;
   
   //========== Booking Histograms
   TH2D * hRealEM   = new TH2D("hRealEM",   "Real for EM particles",      250,0.,1.,40,0.,4.) ;
@@ -384,95 +647,88 @@ void AliPHOSAnalyze::AnalyzeManyEvents(Int_t Nevents, Int_t module)
   TH2D * hMixedPhot= new TH2D("hMixedPhot","Mixed for kPhoton particles",250,0.,1.,40,0.,4.) ;
   
   Int_t ievent;
-  Int_t EventInMixedLoop ;
+  Int_t eventInMixedLoop ;
   
-  Int_t NRecParticles[NMixedEvents] ;
+  Int_t nRecParticles[4];//nMixedEvents] ;
   
-  AliPHOSRecParticle::RecParticlesList * AllRecParticleList  = new TClonesArray("AliPHOSRecParticle", NMixedEvents*1000) ;
+  AliPHOSRecParticle::RecParticlesList * allRecParticleList  = new TClonesArray("AliPHOSRecParticle", nMixedEvents*1000) ;
   
-  for(EventInMixedLoop = 0; EventInMixedLoop < MixedLoops; EventInMixedLoop++  ){
+  for(eventInMixedLoop = 0; eventInMixedLoop < mixedLoops; eventInMixedLoop++  ){
     Int_t iRecPhot = 0 ;
     
-    for ( ievent=0; ievent < NMixedEvents; ievent++){        
+    for ( ievent=0; ievent < nMixedEvents; ievent++){        
       
-      Int_t AbsEventNumber = EventInMixedLoop*NMixedEvents + ievent ;
+      Int_t absEventNumber = eventInMixedLoop*nMixedEvents + ievent ;
       
       //=========== Connects the various Tree's for evt
-      gAlice->GetEvent(AbsEventNumber);
-      
-      //=========== Get the Digit Tree
-      gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
-      
+      gAlice->GetEvent(absEventNumber);
+
       //========== Creating branches ===================================       
+      fPHOS->SetTreeAddress() ;
       
-      AliPHOSRecParticle::RecParticlesList ** RecParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;
-      if( (*RecParticleList) )
-       (*RecParticleList)->Clear() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSRP", RecParticleList ) ;
-      
-      //=========== Gets the Reconstraction TTree
+      gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
       gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
       
-      AliPHOSRecParticle * RecParticle ;
+      TClonesArray ** recParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;
+      
+            
+      AliPHOSRecParticle * recParticle ;
       Int_t iRecParticle ;
-      for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*RecParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ )
+      for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*recParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ )
        {
-         RecParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*RecParticleList)->At(iRecParticle) ;
-         if((RecParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA)||
-            (RecParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEM)){ 
-           new( (*AllRecParticleList)[iRecPhot] ) AliPHOSRecParticle(*RecParticle) ;
+         recParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*recParticleList)->At(iRecParticle) ;
+         if((recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA)||
+            (recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEM)){ 
+           new( (*allRecParticleList)[iRecPhot] ) AliPHOSRecParticle(*recParticle) ;
            iRecPhot++;
          }
        }
       
-       NRecParticles[ievent] = iRecPhot-1 ;  
+       nRecParticles[ievent] = iRecPhot-1 ;  
     }
     
-
     //Now calculate invariant mass:
     Int_t irp1,irp2 ;
-    Int_t NCurEvent = 0 ;
+    Int_t nCurEvent = 0 ;
 
-    for(irp1 = 0; irp1 < AllRecParticleList->GetEntries()-1; irp1++){
-      AliPHOSRecParticle * rp1 = (AliPHOSRecParticle *)AllRecParticleList->At(irp1) ;
+    for(irp1 = 0; irp1 < allRecParticleList->GetEntries()-1; irp1++){
+      AliPHOSRecParticle * rp1 = (AliPHOSRecParticle *)allRecParticleList->At(irp1) ;
 
-      for(irp2 = irp1+1; irp2 < AllRecParticleList->GetEntries(); irp2++){
-       AliPHOSRecParticle * rp2 = (AliPHOSRecParticle *)AllRecParticleList->At(irp2) ;
+      for(irp2 = irp1+1; irp2 < allRecParticleList->GetEntries(); irp2++){
+       AliPHOSRecParticle * rp2 = (AliPHOSRecParticle *)allRecParticleList->At(irp2) ;
            
-       Double_t InvMass ;
-       InvMass = (rp1->Energy()+rp2->Energy())*(rp1->Energy()+rp2->Energy())-
+       Double_t invMass ;
+       invMass = (rp1->Energy()+rp2->Energy())*(rp1->Energy()+rp2->Energy())-
          (rp1->Px()+rp2->Px())*(rp1->Px()+rp2->Px())-
          (rp1->Py()+rp2->Py())*(rp1->Py()+rp2->Py())-
          (rp1->Pz()+rp2->Pz())*(rp1->Pz()+rp2->Pz()) ;
        
-       if(InvMass> 0)
-         InvMass = TMath::Sqrt(InvMass);
+       if(invMass> 0)
+         invMass = TMath::Sqrt(invMass);
        
-       Double_t Pt ; 
-       Pt = TMath::Sqrt((rp1->Px()+rp2->Px() )*( rp1->Px()+rp2->Px() ) +(rp1->Py()+rp2->Py())*(rp1->Py()+rp2->Py()));
+       Double_t pt ; 
+       pt = TMath::Sqrt((rp1->Px()+rp2->Px() )*( rp1->Px()+rp2->Px() ) +(rp1->Py()+rp2->Py())*(rp1->Py()+rp2->Py()));
 
-       if(irp1 > NRecParticles[NCurEvent])
-         NCurEvent++;
+       if(irp1 > nRecParticles[nCurEvent])
+         nCurEvent++;
            
-       if(irp2 <= NRecParticles[NCurEvent]){ //'Real' event
-         hRealEM->Fill(InvMass,Pt);
+       if(irp2 <= nRecParticles[nCurEvent]){ //'Real' event
+         hRealEM->Fill(invMass,pt);
          if((rp1->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA)&&(rp2->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA))
-           hRealPhot->Fill(InvMass,Pt);
+           hRealPhot->Fill(invMass,pt);
        }
        else{
-         hMixedEM->Fill(InvMass,Pt);
+         hMixedEM->Fill(invMass,pt);
          if((rp1->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA)&&(rp2->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA))
-           hMixedPhot->Fill(InvMass,Pt);
+           hMixedPhot->Fill(invMass,pt);
        } //real-mixed
            
       } //loop over second rp
     }//loop over first rp
-
-
-    AllRecParticleList->Delete() ;
+    allRecParticleList->Delete() ;
   } //Loop over events
   
-  delete AllRecParticleList ;
+  delete allRecParticleList ;
   
   //writing output
   TFile output("invmass.root","RECREATE");
@@ -488,6 +744,263 @@ void AliPHOSAnalyze::AnalyzeManyEvents(Int_t Nevents, Int_t module)
 
 }
 
+//____________________________________________________________________________
+ void AliPHOSAnalyze::ReadAndPrintEMC(Int_t EvFirst, Int_t EvLast)    
+{
+  //
+  // Read and print generated and reconstructed hits in EMC
+  // for events from EvFirst to Nevent.
+  // If only EvFirst is defined, print only this one event.
+  // Author: Yuri Kharlov
+  // 24 November 2000
+  //
+
+  if (EvFirst!=0 && EvLast==0) EvLast=EvFirst;
+  Int_t ievent;
+  for (ievent=EvFirst; ievent<=EvLast; ievent++) {  
+    
+    //========== Event Number>
+    cout << endl <<  "==== ReadAndPrintEMC ====> Event is " << ievent+1 << endl ;
+
+    //=========== Connects the various Tree's for evt
+    Int_t ntracks = gAlice->GetEvent(ievent);
+    fPHOS->SetTreeAddress() ;
+    
+    gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
+    gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
+
+    // Loop over reconstructed particles
+      
+    TClonesArray ** recParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;     
+    AliPHOSRecParticle * recParticle ;
+    Int_t iRecParticle ;
+    Int_t *primList;
+    Int_t nPrimary;
+    for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*recParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ ) {
+      recParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*recParticleList)->At(iRecParticle) ;
+      Float_t recE = recParticle->Energy();
+      primList     = recParticle->GetPrimaries(nPrimary);
+      Int_t moduleNumberRec ;
+      Double_t recX, recZ ;
+      fGeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), moduleNumberRec, recX, recZ) ;
+      printf("Rec point: module %d, (X,Z) = (%8.4f,%8.4f) cm, E = %.3f GeV, primary = %d\n",
+            moduleNumberRec,recX,recZ,recE,*primList);
+    }
+
+    // Read and print EMC hits from EMCn branches
+      
+    AliPHOSCPVModule emcModule;
+    TClonesArray    *emcHits;
+    Int_t           nEMChits;
+    AliPHOSCPVHit   *emcHit;
+    TLorentzVector   p;
+    Float_t          xgen, zgen;
+    Int_t            ipart, primary;
+    Int_t            nGenHits = 0;
+    for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
+      //=========== Get the Hits Tree for the Primary track itrack
+      gAlice->ResetHits();
+      gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
+      Int_t iModule = 0 ;
+      for (iModule=0; iModule < fGeom->GetNModules(); iModule++) {
+       emcModule = fPHOS->GetEMCModule(iModule);
+       emcHits   = emcModule.Hits();
+       nEMChits  = emcHits->GetEntriesFast();
+       for (Int_t ihit=0; ihit<nEMChits; ihit++) {
+         nGenHits++;
+         emcHit = (AliPHOSCPVHit*)emcHits->UncheckedAt(ihit);
+         p      = emcHit->GetMomentum();
+         xgen   = emcHit->X();
+         zgen   = emcHit->Y();
+         ipart  = emcHit->GetIpart();
+         primary= emcHit->GetTrack();
+         printf("EMC hit A: module %d, ",iModule+1);
+         printf("    p = (%f .4, %f .4, %f .4, %f .4) GeV,\n",
+                p.Px(),p.Py(),p.Pz(),p.Energy());
+         printf("                     (X,Z) = (%8.4f, %8.4f) cm, ipart = %d, primary = %d\n",
+                xgen,zgen,ipart,primary);
+       }
+      }
+    }
+
+//      // Read and print EMC hits from PHOS branch
+
+//      for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
+//        //=========== Get the Hits Tree for the Primary track itrack
+//        gAlice->ResetHits();
+//        gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
+//        TClonesArray *hits = fPHOS->Hits();
+//        AliPHOSHit   *hit ;
+//        Int_t ihit;
+//        for ( ihit = 0 ; ihit < hits->GetEntries() ; ihit++ ) {
+//     hit = (AliPHOSHit*)hits->At(ihit) ;
+//     Float_t hitXYZ[3];
+//     hitXYZ[0]   = hit->X();
+//     hitXYZ[1]   = hit->Y();
+//     hitXYZ[2]   = hit->Z();
+//     ipart       = hit->GetPid();
+//     primary     = hit->GetPrimary();
+//     Int_t absId = hit->GetId();
+//     Int_t relId[4];
+//     fGeom->AbsToRelNumbering(absId, relId) ;
+//     Int_t module = relId[0];
+//     if (relId[1]==0 && !(hitXYZ[0]==0 && hitXYZ[2]==0))
+//       printf("EMC hit B: module %d, (X,Z) = (%8.4f, %8.4f) cm, ipart = %d, primary = %d\n",
+//              module,hitXYZ[0],hitXYZ[2],ipart,primary);
+//        }
+//      }
+
+  }
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+ void AliPHOSAnalyze::AnalyzeEMC(Int_t Nevents)
+{
+  //
+  // Read generated and reconstructed hits in EMC for Nevents events.
+  // Plots the coordinate and energy resolution histograms.
+  // Coordinate resolution is a difference between the reconstructed
+  // coordinate and the exact coordinate on the face of the PHOS
+  // Author: Yuri Kharlov
+  // 27 November 2000
+  //
+
+  // Book histograms
+
+  TH1F *hDx1   = new TH1F("hDx1"  ,"EMC x-resolution", 100,-5. , 5.);
+  TH1F *hDz1   = new TH1F("hDz1"  ,"EMC z-resolution", 100,-5. , 5.);
+  TH1F *hDE1   = new TH1F("hDE1"  ,"EMC E-resolution", 100,-2. , 2.);
+
+  TH2F *hDx2   = new TH2F("hDx2"  ,"EMC x-resolution", 100, 0., 10., 100,-5. , 5.);
+  TH2F *hDz2   = new TH2F("hDz2"  ,"EMC z-resolution", 100, 0., 10., 100,-5. , 5.);
+  TH2F *hDE2   = new TH2F("hDE2"  ,"EMC E-resolution", 100, 0., 10., 100, 0. , 5.);
+
+  cout << "Start EMC Analysis"<< endl ;
+  for (Int_t ievent=0; ievent<Nevents; ievent++) {  
+      
+    //========== Event Number>         
+    if ( (ievent+1) % (Int_t)TMath::Power( 10, (Int_t)TMath::Log10(ievent+1) ) == 0)
+      cout << "==== AnalyzeEMC ====> Event is " << ievent+1 << endl ;
+    
+    //=========== Connects the various Tree's for evt
+    Int_t ntracks = gAlice->GetEvent(ievent);
+
+    fPHOS->SetTreeAddress() ;
+    
+    gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
+    gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
+
+    // Create and fill arrays of hits for each EMC module
+      
+    Int_t nOfModules = fGeom->GetNModules();
+    TClonesArray **hitsPerModule = new TClonesArray *[nOfModules];
+    Int_t iModule;
+    for (iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++)
+      hitsPerModule[iModule] = new TClonesArray("AliPHOSCPVHit",100);
+
+    AliPHOSCPVModule emcModule;
+    TClonesArray    *emcHits;
+    Int_t           nEMChits;
+    AliPHOSCPVHit   *emcHit;
+
+    // First go through all primary tracks and fill the arrays
+    // of hits per each EMC module
+
+    for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
+      // Get the Hits Tree for the Primary track itrack
+      gAlice->ResetHits();
+      gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
+      for (Int_t iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++) {
+       emcModule = fPHOS->GetEMCModule(iModule);
+       emcHits   = emcModule.Hits();
+       nEMChits  = emcHits->GetEntriesFast();
+       for (Int_t ihit=0; ihit<nEMChits; ihit++) {
+         emcHit   = (AliPHOSCPVHit*)emcHits->UncheckedAt(ihit);
+         TClonesArray &lhits = *(TClonesArray *)hitsPerModule[iModule];
+         new(lhits[hitsPerModule[iModule]->GetEntriesFast()]) AliPHOSCPVHit(*emcHit);
+       }
+       emcModule.Clear();
+      }
+    }
+
+    // Loop over reconstructed particles
+      
+    TClonesArray ** recParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;     
+    AliPHOSRecParticle * recParticle ;
+    Int_t nEMCrecs = (*recParticleList)->GetEntries();
+    if (nEMCrecs == 1) {
+      recParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*recParticleList)->At(0) ;
+      Float_t recE = recParticle->Energy();
+      Int_t phosModule;
+      Double_t recX, recZ ;
+      fGeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), phosModule, recX, recZ) ;
+
+      // for this rec.point take the hit list in the same PHOS module
+
+      emcHits = hitsPerModule[phosModule-1];
+      Int_t nEMChits  = emcHits->GetEntriesFast();
+      if (nEMChits == 1) {
+       Float_t genX, genZ, genE;
+       for (Int_t ihit=0; ihit<nEMChits; ihit++) {
+         emcHit = (AliPHOSCPVHit*)emcHits->UncheckedAt(ihit);
+         genX   = emcHit->X();
+         genZ   = emcHit->Y();
+         genE   = emcHit->GetMomentum().E();
+       }
+       Float_t dx = recX - genX;
+       Float_t dz = recZ - genZ;
+       Float_t de = recE - genE;
+       hDx1  ->Fill(dx);
+       hDz1  ->Fill(dz);
+       hDE1  ->Fill(de);
+       hDx2  ->Fill(genE,dx);
+       hDz2  ->Fill(genE,dz);
+       hDE2  ->Fill(genE,recE);
+      }
+    }
+    delete [] hitsPerModule;
+  }
+  // Save histograms
+
+  Text_t outputname[80] ;
+  sprintf(outputname,"%s.analyzed",fRootFile->GetName());
+  TFile output(outputname,"RECREATE");
+  output.cd();
+
+  hDx1  ->Write() ;
+  hDz1  ->Write() ;
+  hDE1  ->Write() ;
+  hDx2  ->Write() ;
+  hDz2  ->Write() ;
+  hDE2  ->Write() ;
+
+  // Plot histograms
+
+  TCanvas *emcCanvas = new TCanvas("EMC","EMC analysis",20,20,700,300);
+  gStyle->SetOptStat(111111);
+  gStyle->SetOptFit(1);
+  gStyle->SetOptDate(1);
+  emcCanvas->Divide(3,1);
+
+  emcCanvas->cd(1);
+  gPad->SetFillColor(10);
+  hDx1->SetFillColor(16);
+  hDx1->Draw();
+
+  emcCanvas->cd(2);
+  gPad->SetFillColor(10);
+  hDz1->SetFillColor(16);
+  hDz1->Draw();
+
+  emcCanvas->cd(3);
+  gPad->SetFillColor(10);
+  hDE1->SetFillColor(16);
+  hDE1->Draw();
+
+  emcCanvas->Print("EMC.ps");
+
+}
+
 //____________________________________________________________________________
  void AliPHOSAnalyze::AnalyzeResolutions(Int_t Nevents )    
 {
@@ -498,15 +1011,15 @@ void AliPHOSAnalyze::AnalyzeManyEvents(Int_t Nevents, Int_t module)
   cout << "AnalyzeResolutions > " << "Booking Histograms" << endl ; 
   BookResolutionHistograms();
 
-  Int_t Counter[9][5] ;     
-  Int_t i1,i2,TotalInd = 0 ;
+  Int_t counter[9][5] ;     
+  Int_t i1,i2,totalInd = 0 ;
   for(i1 = 0; i1<9; i1++)
     for(i2 = 0; i2<5; i2++)
-      Counter[i1][i2] = 0 ;
+      counter[i1][i2] = 0 ;
   
-  Int_t TotalPrimary = 0 ;
-  Int_t TotalRecPart = 0 ;
-  Int_t TotalRPwithPrim = 0 ;
+  Int_t totalPrimary = 0 ;
+  Int_t totalRecPart = 0 ;
+  Int_t totalRPwithPrim = 0 ;
   Int_t ievent;
 
   cout << "Start Analysing"<< endl ;
@@ -524,265 +1037,268 @@ void AliPHOSAnalyze::AnalyzeManyEvents(Int_t Nevents, Int_t module)
       gAlice->TreeK()->GetEvent(0) ;
       
       //=========== Gets the list of Primari Particles
-      TClonesArray * PrimaryList  = gAlice->Particles();     
+      TClonesArray * primaryList  = gAlice->Particles();     
 
-      TParticle * Primary ;
+      TParticle * primary ;
       Int_t iPrimary ;
-      for ( iPrimary = 0 ; iPrimary < PrimaryList->GetEntries() ; iPrimary++)
+      for ( iPrimary = 0 ; iPrimary < primaryList->GetEntries() ; iPrimary++)
        {
-         Primary = (TParticle*)PrimaryList->UncheckedAt(iPrimary) ;
-         Int_t PrimaryType = Primary->GetPdgCode() ;
-         if( PrimaryType == 22 ) {
-           Int_t ModuleNumber ;
-           Double_t PrimX, PrimZ ;
-           fGeom->ImpactOnEmc(Primary->Theta(), Primary->Phi(), ModuleNumber, PrimX, PrimZ) ;
-           if(ModuleNumber){
-             fhPrimary->Fill(Primary->Energy()) ;
-             if(Primary->Energy() > 0.3)
-               TotalPrimary++ ;
+         primary = (TParticle*)primaryList->UncheckedAt(iPrimary) ;
+         Int_t primaryType = primary->GetPdgCode() ;
+         if( primaryType == 22 ) {
+           Int_t moduleNumber ;
+           Double_t primX, primZ ;
+           fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+           if(moduleNumber){
+             fhPrimary->Fill(primary->Energy()) ;
+             if(primary->Energy() > 0.3)
+               totalPrimary++ ;
            }
          } 
        }
       
-      //=========== Get the Digit Tree
-      gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
-      
-      //========== Creating branches ===================================       
-      AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** EmcRecPoints =  fPHOS->EmcRecPoints() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSEmcRP", EmcRecPoints ) ;
-      
-      AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** PpsdRecPoints = fPHOS->PpsdRecPoints() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSPpsdRP", PpsdRecPoints ) ;
-      
-      AliPHOSTrackSegment::TrackSegmentsList **  TrackSegmentsList = fPHOS->TrackSegments() ;
-      if( (*TrackSegmentsList) )
-       (*TrackSegmentsList)->Clear() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSTS", TrackSegmentsList ) ;
-      
-      AliPHOSRecParticle::RecParticlesList ** RecParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;
-      if( (*RecParticleList) )
-       (*RecParticleList)->Clear() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSRP", RecParticleList ) ;
+      fPHOS->SetTreeAddress() ;
       
-      //=========== Gets the Reconstraction TTree
+      gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
       gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
       
-      AliPHOSRecParticle * RecParticle ;
+      TClonesArray ** recParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;     
+      
+      AliPHOSRecParticle * recParticle ;
       Int_t iRecParticle ;
-      for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*RecParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ )
+      for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*recParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ )
        {
-         RecParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*RecParticleList)->At(iRecParticle) ;
-         fhAllRP->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy())) ;
+         recParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*recParticleList)->At(iRecParticle) ;
+         fhAllRP->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy())) ;
          
-         Int_t ModuleNumberRec ;
-         Double_t RecX, RecZ ;
-         fGeom->ImpactOnEmc(RecParticle->Theta(), RecParticle->Phi(), ModuleNumberRec, RecX, RecZ) ;
+         Int_t moduleNumberRec ;
+         Double_t recX, recZ ;
+         fGeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), moduleNumberRec, recX, recZ) ;
          
-         Double_t MinDistance = 5. ;
-         Int_t ClosestPrimary = -1 ;
+         Double_t minDistance  = 100. ;
+         Int_t closestPrimary = -1 ;
          
          Int_t numberofprimaries ;
-         Int_t * listofprimaries  = RecParticle->GetPrimaries(numberofprimaries)  ;
+         Int_t * listofprimaries  = recParticle->GetPrimaries(numberofprimaries)  ;
          Int_t index ;
-         TParticle * Primary ;
-         Double_t Distance = MinDistance ;
+         TParticle * primary ;
+         Double_t distance = minDistance ;
+         Double_t dX, dZ; 
+         Double_t dXmin = 0.; 
+         Double_t dZmin = 0. ;
          for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++){
-           Primary = (TParticle*)PrimaryList->UncheckedAt(listofprimaries[index]) ;
-           Int_t ModuleNumber ;
-           Double_t PrimX, PrimZ ;
-           fGeom->ImpactOnEmc(Primary->Theta(), Primary->Phi(), ModuleNumber, PrimX, PrimZ) ;
-           if(ModuleNumberRec == ModuleNumber)
-             Distance = TMath::Sqrt((RecX-PrimX)*(RecX-PrimX)+(RecZ-PrimZ)*(RecZ-PrimZ) ) ;
-           if(MinDistance > Distance)
-             {
-               MinDistance = Distance ;
-               ClosestPrimary = listofprimaries[index] ;
+           primary = (TParticle*)primaryList->UncheckedAt(listofprimaries[index]) ;
+           Int_t moduleNumber ;
+           Double_t primX, primZ ;
+           fGeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+           if(moduleNumberRec == moduleNumber) {
+             dX = recX - primX;
+             dZ = recZ - primZ;
+             distance = TMath::Sqrt(dX*dX + dZ*dZ) ;
+             if(minDistance > distance) {
+               minDistance = distance ;
+               dXmin = dX;
+               dZmin = dZ;
+               closestPrimary = listofprimaries[index] ;
              }
+           }
          }
-         TotalRecPart++ ;
+         totalRecPart++ ;
 
-         if(ClosestPrimary >=0 ){
-           TotalRPwithPrim++;
+         if(closestPrimary >=0 ){
+           totalRPwithPrim++;
            
-           Int_t PrimaryType = ((TParticle *)PrimaryList->At(ClosestPrimary))->GetPdgCode() ;
-           TParticlePDG* PDGparticle = ((TParticle *)PrimaryList->At(ClosestPrimary))->GetPDG();
-           Double_t charge =  PDGparticle->Charge() ;
-           Int_t PrimaryCode ;
-           switch(PrimaryType)
+           Int_t primaryType = ((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->GetPdgCode() ;
+//         TParticlePDG* pDGparticle = ((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->GetPDG();
+//         Double_t charge =  PDGparticle->Charge() ;
+//         if(charge)
+//           cout <<"Primary " <<primaryType << " E " << ((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->Energy() << endl ;
+           Int_t primaryCode ;
+           switch(primaryType)
              {
              case 22:
-               PrimaryCode = 0;  //Photon
-               fhAllEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy()) ;
-               fhAllPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
+               primaryCode = 0;  //Photon
+               fhAllEnergy   ->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy()) ;
+               fhAllPosition ->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), minDistance) ;
+               fhAllPositionX->Fill(dXmin);
+               fhAllPositionZ->Fill(dZmin);
                break;
              case 11 :
-               PrimaryCode = 1;  //Electron
+               primaryCode = 1;  //Electron
                break;
              case -11 :
-               PrimaryCode = 1;  //positron
+               primaryCode = 1;  //positron
                break;
              case 321 :
-               PrimaryCode = 4;  //K+
+               primaryCode = 4;  //K+
                break;
              case -321 :
-               PrimaryCode = 4;  //K-
+               primaryCode = 4;  //K-
                break;
              case 310 :
-               PrimaryCode = 4;  //K0s
+               primaryCode = 4;  //K0s
                break;
              case 130 :
-               PrimaryCode = 4;  //K0l
+               primaryCode = 4;  //K0l
+               break;
+             case 211 :
+               primaryCode = 2;  //K0l
+               break;
+             case -211 :
+               primaryCode = 2;  //K0l
+               break;
+             case 2212 :
+               primaryCode = 2;  //K0l
+               break;
+             case -2212 :
+               primaryCode = 2;  //K0l
                break;
              default:
-               if(charge)
-                 PrimaryCode = 2; //Charged hadron
-               else
-                 PrimaryCode = 3; //Neutral hadron
+               primaryCode = 3; //ELSE
                break;
              }
            
-           switch(RecParticle->GetType())
+           switch(recParticle->GetType())
              {
              case AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA:
-               if(PrimaryType == 22){
-                 fhPhotEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy() ) ; 
-                 fhEMEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy() ) ; 
-                 fhPPSDEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy() ) ; 
+               if(primaryType == 22){
+                 fhPhotEnergy->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
+                 fhEMEnergy->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
+                 fhPPSDEnergy->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
 
-                 fhPhotPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
-                 fhEMPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
-                 fhPPSDPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
+                 fhPhotPosition->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance) ;
+                 fhEMPosition->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance) ;
+                 fhPPSDPosition->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance) ;
 
-                 fhPhotReg->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+                 fhPhotReg->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
 
-                 fhPhotPhot->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+                 fhPhotPhot->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                }
-               if(PrimaryType == 2112){ //neutron
-                 fhNReg->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryType == 2112){ //neutron
+                 fhNReg->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhNEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                }
                
-               if(PrimaryType == -2112){ //neutron ~
-                 fhNBarReg->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryType == -2112){ //neutron ~
+                 fhNBarReg->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                  
                }
-               if(PrimaryCode == 2){
-                 fhChargedReg->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryCode == 2){
+                 fhChargedReg->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                }
                
-               fhAllReg->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhShape->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhVeto->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               Counter[0][PrimaryCode]++;
+               fhAllReg->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               fhShape->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               fhVeto->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               counter[0][primaryCode]++;
                break;
              case  AliPHOSFastRecParticle::kELECTRON:
-               if(PrimaryType == 22){ 
-                 fhPhotElec->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhEMEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy() ) ; 
-                 fhEMPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
-                 fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryType == 22){ 
+                 fhPhotElec->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhEMEnergy->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
+                 fhEMPosition->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance) ;
+                 fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                }         
-               if(PrimaryType == 2112){ //neutron
-                 fhNEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryType == 2112){ //neutron
+                 fhNEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                }
                
-               if(PrimaryType == -2112){ //neutron ~
-                 fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryType == -2112){ //neutron ~
+                 fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                  
                }
-               if(PrimaryCode == 2){
-                 fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryCode == 2){
+                 fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                }
                
-               fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhShape->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               Counter[1][PrimaryCode]++;
+               fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               fhShape->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               counter[1][primaryCode]++;
                break;
              case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALHA:
-               if(PrimaryType == 22) 
-                 fhPhotNeuH->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryType == 22) 
+                 fhPhotNeuH->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
 
-               fhVeto->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;           
-               Counter[2][PrimaryCode]++;
+               fhVeto->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;           
+               counter[2][primaryCode]++;
                break ;
              case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEM:
-               if(PrimaryType == 22){
-                 fhEMEnergy->Fill(((TParticle *)PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),RecParticle->Energy() ) ; 
-                 fhEMPosition->Fill(((TParticle *)PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance ) ;
+               if(primaryType == 22){
+                 fhEMEnergy->Fill(((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),recParticle->Energy() ) ; 
+                 fhEMPosition->Fill(((TParticle *)primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance ) ;
                
-                 fhPhotNuEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+                 fhPhotNuEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                }
-               if(PrimaryType == 2112) //neutron
-                 fhNEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryType == 2112) //neutron
+                 fhNEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                
-               if(PrimaryType == -2112) //neutron ~
-                 fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryType == -2112) //neutron ~
+                 fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                
-               if(PrimaryCode == 2)
-                 fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryCode == 2)
+                 fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                
-               fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhShape->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhVeto->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               fhShape->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+               fhVeto->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
 
-               Counter[3][PrimaryCode]++;
+               counter[3][primaryCode]++;
                break ;
              case  AliPHOSFastRecParticle::kCHARGEDHA:
-               if(PrimaryType == 22) //photon
-                 fhPhotChHa->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               if(primaryType == 22) //photon
+                 fhPhotChHa->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                
-               Counter[4][PrimaryCode]++ ;
+               counter[4][primaryCode]++ ;
                break ;
              case  AliPHOSFastRecParticle::kGAMMAHA:
-                 if(PrimaryType == 22){ //photon
-                   fhPhotGaHa->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                   fhPPSDEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy() ) ; 
-                   fhPPSDPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
-                   fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+                 if(primaryType == 22){ //photon
+                   fhPhotGaHa->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                   fhPPSDEnergy->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
+                   fhPPSDPosition->Fill(((TParticle *) primaryList->At(closestPrimary))->Energy(),minDistance) ;
+                   fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                  }
-                 if(PrimaryType == 2112){ //neutron
-                   fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+                 if(primaryType == 2112){ //neutron
+                   fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                  }
                
-                 if(PrimaryType == -2112){ //neutron ~
-                   fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ; 
+                 if(primaryType == -2112){ //neutron ~
+                   fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ; 
                  }
-                 if(PrimaryCode == 2){
-                   fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+                 if(primaryCode == 2){
+                   fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                  }
                
-                 fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhVeto->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-
-                 Counter[5][PrimaryCode]++ ;
+                 fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhVeto->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
+                 counter[5][primaryCode]++ ;
                  break ;       
              case  AliPHOSFastRecParticle::kABSURDEM:        
-               Counter[6][PrimaryCode]++ ;
-               fhShape->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
+               counter[6][primaryCode]++ ;
+               fhShape->Fill(CorrectEnergy(recParticle->Energy()) ) ;
                break;
              case  AliPHOSFastRecParticle::kABSURDHA:
-               Counter[7][PrimaryCode]++ ;
+               counter[7][primaryCode]++ ;
                break;
              default:
-               Counter[8][PrimaryCode]++ ;
+               counter[8][primaryCode]++ ;
                break;
              }
          }
@@ -790,24 +1306,24 @@ void AliPHOSAnalyze::AnalyzeManyEvents(Int_t Nevents, Int_t module)
     }   // endfor
   SaveHistograms();
   cout << "Resolutions: Analyzed " << Nevents << " event(s)" << endl ;
-  cout << "Resolutions: Total primary       " << TotalPrimary << endl ;
-  cout << "Resoluitons: Total reconstracted " << TotalRecPart << endl ;
-  cout << "TotalReconstructed with Primarie " << TotalRPwithPrim << endl ;
+  cout << "Resolutions: Total primary       " << totalPrimary << endl ;
+  cout << "Resoluitons: Total reconstracted " << totalRecPart << endl ;
+  cout << "TotalReconstructed with Primarie " << totalRPwithPrim << endl ;
   cout << "                        Primary:   Photon   Electron   Ch. Hadr.  Neutr. Hadr  Kaons" << endl ; 
-  cout << "             Detected as photon       " << Counter[0][0] << "          " << Counter[0][1] << "          " << Counter[0][2] << "          " <<Counter[0][3] << "          " << Counter[0][4] << endl ;
-  cout << "           Detected as electron       " << Counter[1][0] << "          " << Counter[1][1] << "          " << Counter[1][2] << "          " <<Counter[1][3] << "          " << Counter[1][4] << endl ; 
-  cout << "     Detected as neutral hadron       " << Counter[2][0] << "          " << Counter[2][1] << "          " << Counter[2][2] << "          " <<Counter[2][3] << "          " << Counter[2][4] << endl ;
-  cout << "         Detected as neutral EM       " << Counter[3][0] << "          " << Counter[3][1] << "          " << Counter[3][2] << "          " <<Counter[3][3] << "          " << Counter[3][4] << endl ;
-  cout << "     Detected as charged hadron       " << Counter[4][0] << "          " << Counter[4][1] << "          " << Counter[4][2] << "          " <<Counter[4][3] << "          " << Counter[4][4] << endl ;
-  cout << "       Detected as gamma-hadron       " << Counter[5][0] << "          " << Counter[5][1] << "          " << Counter[5][2] << "          " <<Counter[5][3] << "          " << Counter[5][4] << endl ;
-  cout << "          Detected as Absurd EM       " << Counter[6][0] << "          " << Counter[6][1] << "          " << Counter[6][2] << "          " <<Counter[6][3] << "          " << Counter[6][4] << endl ;
-  cout << "      Detected as absurd hadron       " << Counter[7][0] << "          " << Counter[7][1] << "          " << Counter[7][2] << "          " <<Counter[7][3] << "          " << Counter[7][4] << endl ;
-  cout << "          Detected as undefined       " << Counter[8][0] << "          " << Counter[8][1] << "          " << Counter[8][2] << "          " <<Counter[8][3] << "          " << Counter[8][4] << endl ;
+  cout << "             Detected as photon       " << counter[0][0] << "          " << counter[0][1] << "          " << counter[0][2] << "          " <<counter[0][3] << "          " << counter[0][4] << endl ;
+  cout << "           Detected as electron       " << counter[1][0] << "          " << counter[1][1] << "          " << counter[1][2] << "          " <<counter[1][3] << "          " << counter[1][4] << endl ; 
+  cout << "     Detected as neutral hadron       " << counter[2][0] << "          " << counter[2][1] << "          " << counter[2][2] << "          " <<counter[2][3] << "          " << counter[2][4] << endl ;
+  cout << "         Detected as neutral EM       " << counter[3][0] << "          " << counter[3][1] << "          " << counter[3][2] << "          " <<counter[3][3] << "          " << counter[3][4] << endl ;
+  cout << "     Detected as charged hadron       " << counter[4][0] << "          " << counter[4][1] << "          " << counter[4][2] << "          " <<counter[4][3] << "          " << counter[4][4] << endl ;
+  cout << "       Detected as gamma-hadron       " << counter[5][0] << "          " << counter[5][1] << "          " << counter[5][2] << "          " <<counter[5][3] << "          " << counter[5][4] << endl ;
+  cout << "          Detected as Absurd EM       " << counter[6][0] << "          " << counter[6][1] << "          " << counter[6][2] << "          " <<counter[6][3] << "          " << counter[6][4] << endl ;
+  cout << "      Detected as absurd hadron       " << counter[7][0] << "          " << counter[7][1] << "          " << counter[7][2] << "          " <<counter[7][3] << "          " << counter[7][4] << endl ;
+  cout << "          Detected as undefined       " << counter[8][0] << "          " << counter[8][1] << "          " << counter[8][2] << "          " <<counter[8][3] << "          " << counter[8][4] << endl ;
       
       for(i1 = 0; i1<9; i1++)
        for(i2 = 0; i2<5; i2++)
-         TotalInd+=Counter[i1][i2] ;
-      cout << "Indentified particles            " << TotalInd << endl ;
+         totalInd+=counter[i1][i2] ;
+      cout << "Indentified particles            " << totalInd << endl ;
       
 }           // endfunction
 
@@ -869,6 +1385,9 @@ void  AliPHOSAnalyze::BookResolutionHistograms()
   fhEMPosition   = new TH2F("hEMPosition",   "Position of EM with primary photon",    100, 0., 5., 100, 0., 5.);
   fhPPSDPosition = new TH2F("hPPSDPosition", "Position of PPSD with primary photon",  100, 0., 5., 100, 0., 5.);
 
+  fhAllPositionX = new TH1F("hAllPositionX", "#Delta X of any RP with primary photon",100, -2., 2.);
+  fhAllPositionZ = new TH1F("hAllPositionZ", "#Delta X of any RP with primary photon",100, -2., 2.);
+
 //   if(fhAllReg)
 //     delete fhAllReg ;
 //   if(fhPhotReg)
@@ -958,499 +1477,8 @@ void  AliPHOSAnalyze::BookResolutionHistograms()
   fhPhotNuEM = new TH1F("hPhotNuEM","hPhotNuEM", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Neutral EM
   fhPhotChHa = new TH1F("hPhotChHa","hPhotChHa", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Charged Hadron
   fhPhotGaHa = new TH1F("hPhotGaHa","hPhotGaHa", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Gamma-Hadron
-
-
 }
-//____________________________________________________________________________
-Bool_t AliPHOSAnalyze::Init(Int_t evt)
-{
-  // Do a few initializations: open the root file
-  //                           get the AliRun object
-  //                           defines the clusterizer, tracksegment maker and particle identifier
-  //                           sets the associated parameters
 
-  Bool_t ok = kTRUE ; 
-  
-   //========== Open galice root file  
-
-  if ( fRootFile == 0 ) {
-    Text_t * name  = new Text_t[80] ; 
-    cout << "AnalyzeOneEvent > Enter file root file name : " ;  
-    cin >> name ; 
-    Bool_t ok = OpenRootFile(name) ; 
-    if ( !ok )
-      cout << " AliPHOSAnalyze > Error opening " << name << endl ; 
-    else { 
-      //========== Get AliRun object from file 
-      
-      gAlice = (AliRun*) fRootFile->Get("gAlice") ;
-      
-      //=========== Get the PHOS object and associated geometry from the file 
-      
-      fPHOS  = (AliPHOSv1 *)gAlice->GetDetector("PHOS") ;
-      fGeom = fPHOS->GetGeometry();
-      //      fGeom  = AliPHOSGeometry::GetInstance( fPHOS->GetGeometry()->GetName(), fPHOS->GetGeometry()->GetTitle() );
-
-    } // else !ok
-  } // if fRootFile
-  
-  if ( ok ) {
-    
-    //========== Create the Clusterizer
-
-    fClu =  new AliPHOSClusterizerv1() ; 
-    fClu->SetEmcEnergyThreshold(0.030) ; 
-    fClu->SetEmcClusteringThreshold(0.20) ; 
-    fClu->SetPpsdEnergyThreshold    (0.0000002) ; 
-    fClu->SetPpsdClusteringThreshold(0.0000001) ; 
-    fClu->SetLocalMaxCut(0.03) ;
-    fClu->SetCalibrationParameters(0., 0.00000001) ;  
-    cout <<  "AnalyzeOneEvent > using clusterizer " << fClu->GetName() << endl ; 
-    fClu->PrintParameters() ; 
-    
-    //========== Creates the track segment maker
-    
-    fTrs = new AliPHOSTrackSegmentMakerv1() ;
-    cout <<  "AnalyzeOneEvent > using tack segment maker " << fTrs->GetName() << endl ; 
-    //   fTrs->UnsetUnfoldFlag() ;
-    
-    //========== Creates the particle identifier
-    
-    fPID = new AliPHOSPIDv1() ;
-    cout <<  "AnalyzeOneEvent > using particle identifier " << fPID->GetName() << endl ; 
-    //fPID->SetShowerProfileCuts(Float_t l1m, Float_t l1M, Float_t l2m, Float_t l2M) ; 
-    fPID->SetShowerProfileCuts(0.7, 2.0 , 0.6 , 1.5) ; 
-
-    //========== Creates the Reconstructioner  
-    
-    fRec = new AliPHOSReconstructioner(fClu, fTrs, fPID) ;
-    fRec -> SetDebugReconstruction(kFALSE);     
-    
-    //=========== Connect the various Tree's for evt
-    
-    if ( evt == -999 ) {
-      cout <<  "AnalyzeOneEvent > Enter event number : " ; 
-      cin >> evt ;  
-      cout << evt << endl ; 
-    }
-    fEvt = evt ; 
-    gAlice->GetEvent(evt);
-    
-    //=========== Get the Digit TTree
-    
-    gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;     
-    
-  } // ok
-  
-  return ok ; 
-}
-
-
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::DisplayKineEvent(Int_t evt)
-{
-  // Display particles from the Kine Tree in global Alice (theta, phi) coordinates. 
-  // One PHOS module at the time.
-  // The particle type can be selected.
-  
-  if (evt == -999) 
-    evt = fEvt ;
-
-  Int_t module ; 
-  cout <<  "DisplayKineEvent > which module (1-5,  -1: all) ? " ; 
-  cin >> module ; cout << module << endl ; 
-
-  Int_t testparticle ; 
-  cout << " 22      : PHOTON " << endl 
-       << " (-)11   : (POSITRON)ELECTRON " << endl 
-       << " (-)2112 : (ANTI)NEUTRON " << endl  
-       << " -999    : Everything else " << endl ; 
-  cout  <<  "DisplayKineEvent > enter PDG particle code to display " ; 
-  cin >> testparticle ; cout << testparticle << endl ; 
-
-  Text_t histoname[80] ;
-  sprintf(histoname,"Event %d: Incident particles in module %d", evt, module) ; 
-
-  Double_t tm, tM, pm, pM ; // min and Max theta and phi covered by module   
-  fGeom->EmcModuleCoverage(module, tm, tM, pm, pM, AliPHOSGeometry::Degre() ) ;
-
-  Double_t theta, phi ; 
-  fGeom->EmcXtalCoverage(theta, phi, AliPHOSGeometry::Degre() ) ;
-
-  Int_t tdim = (Int_t)( (tM - tm) / theta ) ; 
-  Int_t pdim = (Int_t)( (pM - pm) / phi ) ; 
-
-  tm -= theta ; 
-  tM += theta ; 
-  pm -= phi ; 
-  pM += phi ; 
-
-  TH2F * histoparticle = new TH2F("histoparticle",  histoname, 
-                                         pdim, pm, pM, tdim, tm, tM) ; 
-  histoparticle->SetStats(kFALSE) ;
-
-  // Get pointers to Alice Particle TClonesArray
-
-  TParticle * particle;
-  TClonesArray * particlearray  = gAlice->Particles();    
-
-  Text_t canvasname[80];
-  sprintf(canvasname,"Particles incident in PHOS/EMC module # %d",module) ;
-  TCanvas * kinecanvas = new TCanvas("kinecanvas", canvasname, 650, 500) ; 
-
-  // get the KINE Tree
-
-  TTree * kine =  gAlice->TreeK() ; 
-  Stat_t nParticles =  kine->GetEntries() ; 
-  cout << "DisplayKineEvent > events in kine " << nParticles << endl ; 
-  
-  // loop over particles
-
-  Double_t kRADDEG = 180. / TMath::Pi() ; 
-  Int_t index1 ; 
-  Int_t nparticlein = 0 ; 
-  for (index1 = 0 ; index1 < nParticles ; index1++){
-    Int_t nparticle = particlearray->GetEntriesFast() ;
-    Int_t index2 ; 
-    for( index2 = 0 ; index2 < nparticle ; index2++) {         
-      particle            = (TParticle*)particlearray->UncheckedAt(index2) ;
-      Int_t  particletype = particle->GetPdgCode() ;
-      if (testparticle == -999 || testparticle == particletype) { 
-       Double_t phi        = particle->Phi() ;
-       Double_t theta      = particle->Theta() ;
-       Int_t mod ; 
-       Double_t x, z ; 
-       fGeom->ImpactOnEmc(theta, phi, mod, z, x) ;
-       if ( mod == module ) {
-         nparticlein++ ; 
-         if (particle->Energy() >  fClu->GetEmcClusteringThreshold()  )
-           histoparticle->Fill(phi*kRADDEG, theta*kRADDEG, particle->Energy() ) ; 
-       } 
-      } 
-    }
-  }
-  kinecanvas->Draw() ; 
-  histoparticle->Draw("color") ; 
-  TPaveText *  pavetext = new TPaveText(294, 100, 300, 101); 
-  Text_t text[40] ; 
-  sprintf(text, "Particles: %d ", nparticlein) ;
-  pavetext->AddText(text) ; 
-  pavetext->Draw() ; 
-  kinecanvas->Update(); 
-
-}
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::DisplayRecParticles()
-{
-  // Display reconstructed particles in global Alice(theta, phi) coordinates. 
-  // One PHOS module at the time.
-  // Click on symbols indicate the reconstructed particle type. 
-
-  if (fEvt == -999) {
-    cout << "DisplayRecParticles > Analyze an event first ... (y/n) " ; 
-    Text_t answer[1] ; 
-    cin >> answer ; cout << answer ; 
-//     if ( answer == "y" ) 
-//       AnalyzeOneEvent() ;
-  } 
-    if (fEvt != -999) {
-      
-      Int_t module ; 
-      cout <<  "DisplayRecParticles > which module (1-5,  -1: all) ? " ; 
-      cin >> module ; cout << module << endl ;
-      Text_t histoname[80] ; 
-      sprintf(histoname,"Event %d: Reconstructed particles in module %d", fEvt, module) ; 
-      Double_t tm, tM, pm, pM ; // min and Max theta and phi covered by module   
-      fGeom->EmcModuleCoverage(module, tm, tM, pm, pM, AliPHOSGeometry::Degre() ) ;
-      Double_t theta, phi ; 
-      fGeom->EmcXtalCoverage(theta, phi, AliPHOSGeometry::Degre() ) ;
-      Int_t tdim = (Int_t)( (tM - tm) / theta ) ; 
-      Int_t pdim = (Int_t)( (pM - pm) / phi ) ; 
-      tm -= theta ; 
-      tM += theta ; 
-      pm -= phi ; 
-      TH2F * histoRparticle = new TH2F("histoRparticle",  histoname, 
-                                      pdim, pm, pM, tdim, tm, tM) ; 
-      histoRparticle->SetStats(kFALSE) ;
-      Text_t canvasname[80] ; 
-      sprintf(canvasname, "Reconstructed particles in PHOSmodule # %d", module) ;
-      TCanvas * rparticlecanvas = new TCanvas("RparticleCanvas", canvasname, 650, 500) ; 
-      AliPHOSRecParticle::RecParticlesList * rpl = *fPHOS->RecParticles() ; 
-      Int_t nRecParticles = rpl->GetEntries() ; 
-      Int_t nRecParticlesInModule = 0 ; 
-      TIter nextRecPart(rpl) ; 
-      AliPHOSRecParticle * rp ; 
-      cout << "DisplayRecParticles > " << nRecParticles << " reconstructed particles " << endl ; 
-      Double_t kRADDEG = 180. / TMath::Pi() ; 
-      while ( (rp = (AliPHOSRecParticle *)nextRecPart() ) ) {
-       AliPHOSTrackSegment * ts = rp->GetPHOSTrackSegment() ; 
-       if ( ts->GetPHOSMod() == module ) {
-         Int_t numberofprimaries = 0 ;
-         Int_t * listofprimaries = 0;
-         rp->GetPrimaries(numberofprimaries) ;
-         cout << "Number of primaries = " << numberofprimaries << endl ; 
-         Int_t index ;
-         for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++)
-           cout << "    primary # " << index << " =  " << listofprimaries[index] << endl ;  
-         
-         nRecParticlesInModule++ ; 
-         Double_t theta = rp->Theta() * kRADDEG ;
-         Double_t phi   = rp->Phi() * kRADDEG ;
-         Double_t energy = rp->Energy() ; 
-         histoRparticle->Fill(phi, theta, energy) ;
-       }
-      }
-      histoRparticle->Draw("color") ; 
-
-      nextRecPart.Reset() ; 
-      while ( (rp = (AliPHOSRecParticle *)nextRecPart() ) ) {
-       AliPHOSTrackSegment * ts = rp->GetPHOSTrackSegment() ; 
-       if ( ts->GetPHOSMod() == module )  
-         rp->Draw("P") ; 
-      }
-
-      Text_t text[80] ; 
-      sprintf(text, "reconstructed particles: %d", nRecParticlesInModule) ;
-      TPaveText *  pavetext = new TPaveText(292, 100, 300, 101); 
-      pavetext->AddText(text) ; 
-      pavetext->Draw() ; 
-      rparticlecanvas->Update() ; 
-    }
-}
-
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::DisplayRecPoints()
-{
-  // Display reconstructed points in local PHOS-module (x, z) coordinates. 
-  // One PHOS module at the time.
-  // Click on symbols displays the EMC cluster, or PPSD information.
-
-  if (fEvt == -999) {
-    cout << "DisplayRecPoints > Analyze an event first ... (y/n) " ; 
-    Text_t answer[1] ; 
-    cin >> answer ; cout << answer ; 
-//     if ( answer == "y" ) 
-//       AnalyzeOneEvent() ;
-  } 
-    if (fEvt != -999) {
-      
-      Int_t module ; 
-      cout <<  "DisplayRecPoints > which module (1-5,  -1: all) ? " ; 
-      cin >> module ; cout << module << endl ; 
-
-      Text_t canvasname[80];
-      sprintf(canvasname,"Digits in PHOS/EMC module # %d",module) ;
-      TCanvas * modulecanvas = new TCanvas("module", canvasname, 650, 500) ; 
-      modulecanvas->Draw() ;
-
-      //=========== Creating 2d-histogram of the PHOS module
-      // a little bit junkie but is used to test Geom functinalities
-
-      Double_t tm, tM, pm, pM ; // min and Max theta and phi covered by module   
-      
-      fGeom->EmcModuleCoverage(module, tm, tM, pm, pM); 
-      // convert angles into coordinates local to the EMC module of interest
-
-      Int_t emcModuleNumber ;
-      Double_t emcModulexm, emcModulezm ; // minimum local coordinate in a given EMCA module
-      Double_t emcModulexM, emcModulezM ; // maximum local coordinate in a given EMCA module
-      fGeom->ImpactOnEmc(tm, pm, emcModuleNumber, emcModulezm, emcModulexm) ;
-      fGeom->ImpactOnEmc(tM, pM, emcModuleNumber, emcModulezM, emcModulexM) ;
-      Int_t xdim = (Int_t)( ( emcModulexM - emcModulexm ) / fGeom->GetCrystalSize(0) ) ;  
-      Int_t zdim = (Int_t)( ( emcModulezM - emcModulezm ) / fGeom->GetCrystalSize(2) ) ;
-      Float_t xmin = emcModulexm - fGeom->GetCrystalSize(0) ; 
-      Float_t xMax = emcModulexM + fGeom->GetCrystalSize(0) ; 
-      Float_t zmin = emcModulezm - fGeom->GetCrystalSize(2) ; 
-      Float_t zMax = emcModulezM + fGeom->GetCrystalSize(2) ;     
-      Text_t histoname[80];
-      sprintf(histoname,"Event %d: Digits and RecPoints in module %d", fEvt, module) ;
-      TH2F * hModule = new TH2F("HistoReconstructed", histoname,
-                               xdim, xmin, xMax, zdim, zmin, zMax) ;  
-      hModule->SetMaximum(2.0);
-      hModule->SetMinimum(0.0);
-      hModule->SetStats(kFALSE); 
-
-      TIter next(fPHOS->Digits()) ;
-      Float_t energy, y, z;
-      Float_t etot=0.;
-      Int_t relid[4]; Int_t nDigits = 0 ;
-      AliPHOSDigit * digit ; 
-
-      // Making 2D histogram of the EMC module
-      while((digit = (AliPHOSDigit *)next())) 
-       {  
-         fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
-         if (relid[0] == module && relid[1] == 0)  
-           {  
-             energy = fClu->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
-              cout << "Energy is " << energy << " and threshold is " << fClu->GetEmcEnergyThreshold() << endl; 
-             if (energy >  fClu->GetEmcEnergyThreshold()  ){
-               nDigits++ ;
-               etot += energy ; 
-               fGeom->RelPosInModule(relid,y,z) ;   
-               hModule->Fill(y, z, energy) ;
-             }
-           } 
-       }
-      cout <<"DrawRecPoints >  Found in module " 
-          << module << " " << nDigits << "  digits with total energy " << etot << endl ;
-      hModule->Draw("col2") ;
-
-      //=========== Cluster in module
-
-      //      TClonesArray * emcRP = fPHOS->EmcClusters() ; 
-      TObjArray * emcRP = *(fPHOS->EmcRecPoints()) ; 
-      
-      etot = 0.; 
-      Int_t totalnClusters = 0 ; 
-      Int_t nClusters = 0 ;
-      TIter nextemc(emcRP) ;
-      AliPHOSEmcRecPoint * emc ;
-      while((emc = (AliPHOSEmcRecPoint *)nextemc())) 
-       {
-         //      Int_t numberofprimaries ;
-         //      Int_t * primariesarray = new Int_t[10] ;
-         //      emc->GetPrimaries(numberofprimaries, primariesarray) ;
-         totalnClusters++ ;
-         if ( emc->GetPHOSMod() == module )
-           { 
-             nClusters++ ; 
-             energy = emc->GetTotalEnergy() ;   
-             etot+= energy ;  
-             emc->Draw("M") ;
-           }
-       }
-      cout << "DrawRecPoints > Found " << totalnClusters << " EMC Clusters in PHOS" << endl ; 
-      cout << "DrawRecPoints > Found in module " << module << "  " << nClusters << " EMC Clusters " << endl ;
-      cout << "DrawRecPoints > total energy  " << etot << endl ; 
-
-      TPaveText *  pavetext = new TPaveText(22, 80, 83, 90); 
-      Text_t text[40] ; 
-      sprintf(text, "digits: %d;  clusters: %d", nDigits, nClusters) ;
-      pavetext->AddText(text) ; 
-      pavetext->Draw() ; 
-      modulecanvas->Update(); 
-      //=========== Cluster in module PPSD Down
-
-      //      TClonesArray * ppsdRP = fPHOS->PpsdClusters() ;
-      TObjArray * ppsdRP = *(fPHOS->PpsdRecPoints() );
-      etot = 0.; 
-      TIter nextPpsd(ppsdRP) ;
-      AliPHOSPpsdRecPoint * ppsd ;
-      while((ppsd = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextPpsd())) 
-       {
-         totalnClusters++ ;
-         if ( ppsd->GetPHOSMod() == module )
-           { 
-             nClusters++ ; 
-             energy = ppsd->GetEnergy() ;   
-             etot+=energy ;  
-             if (!ppsd->GetUp()) ppsd->Draw("P") ;
-           }
-       }
-      cout << "DrawRecPoints > Found " << totalnClusters << " Ppsd Down Clusters in PHOS" << endl ; 
-      cout << "DrawRecPoints > Found in module " << module << "  " << nClusters << " Ppsd Down Clusters " << endl ;
-      cout << "DrawRecPoints > total energy  " << etot << endl ; 
-
-      //=========== Cluster in module PPSD Up
-  
-      ppsdRP = *(fPHOS->PpsdRecPoints()) ;
-     
-      etot = 0.; 
-      TIter nextPpsdUp(ppsdRP) ;
-      while((ppsd = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextPpsdUp())) 
-       {
-         totalnClusters++ ;
-         if ( ppsd->GetPHOSMod() == module )
-           { 
-             nClusters++ ; 
-             energy = ppsd->GetEnergy() ;   
-             etot+=energy ;  
-             if (ppsd->GetUp()) ppsd->Draw("P") ;
-           }
-       }
-  cout << "DrawRecPoints > Found " << totalnClusters << " Ppsd Up Clusters in PHOS" << endl ; 
-  cout << "DrawRecPoints > Found in module " << module << "  " << nClusters << " Ppsd Up Clusters " << endl ;
-  cout << "DrawRecPoints > total energy  " << etot << endl ; 
-    
-    } // if !-999
-}
-
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::DisplayTrackSegments()
-{
-  // Display track segments in local PHOS-module (x, z) coordinates. 
-  // One PHOS module at the time.
-  // One symbol per PHOS subsystem: EMC, upper PPSD, lower PPSD.
-
-  if (fEvt == -999) {
-    cout << "DisplayTrackSegments > Analyze an event first ... (y/n) " ; 
-    Text_t answer[1] ; 
-    cin >> answer ; cout << answer ; 
-//     if ( answer == "y" ) 
-//       AnalyzeOneEvent() ;
-  } 
-    if (fEvt != -999) {
-
-      Int_t module ; 
-      cout <<  "DisplayTrackSegments > which module (1-5,  -1: all) ? " ; 
-      cin >> module ; cout << module << endl ; 
-      //=========== Creating 2d-histogram of the PHOS module
-      // a little bit junkie but is used to test Geom functinalities
-      
-      Double_t tm, tM, pm, pM ; // min and Max theta and phi covered by module   
-      
-      fGeom->EmcModuleCoverage(module, tm, tM, pm, pM); 
-      // convert angles into coordinates local to the EMC module of interest
-      
-      Int_t emcModuleNumber ;
-      Double_t emcModulexm, emcModulezm ; // minimum local coordinate in a given EMCA module
-      Double_t emcModulexM, emcModulezM ; // maximum local coordinate in a given EMCA module
-      fGeom->ImpactOnEmc(tm, pm, emcModuleNumber, emcModulezm, emcModulexm) ;
-      fGeom->ImpactOnEmc(tM, pM, emcModuleNumber, emcModulezM, emcModulexM) ;
-      Int_t xdim = (Int_t)( ( emcModulexM - emcModulexm ) / fGeom->GetCrystalSize(0) ) ;  
-      Int_t zdim = (Int_t)( ( emcModulezM - emcModulezm ) / fGeom->GetCrystalSize(2) ) ;
-      Float_t xmin = emcModulexm - fGeom->GetCrystalSize(0) ; 
-      Float_t xMax = emcModulexM + fGeom->GetCrystalSize(0) ; 
-      Float_t zmin = emcModulezm - fGeom->GetCrystalSize(2) ; 
-      Float_t zMax = emcModulezM + fGeom->GetCrystalSize(2) ;     
-      Text_t histoname[80];
-      sprintf(histoname,"Event %d: Track Segments in module %d", fEvt, module) ; 
-      TH2F * histotrack = new TH2F("histotrack",  histoname, 
-                                  xdim, xmin, xMax, zdim, zmin, zMax) ;  
-      histotrack->SetStats(kFALSE); 
-      Text_t canvasname[80];
-      sprintf(canvasname,"Track segments in PHOS/EMC-PPSD module # %d", module) ;
-      TCanvas * trackcanvas = new TCanvas("TrackSegmentCanvas", canvasname, 650, 500) ; 
-      histotrack->Draw() ; 
-
-      AliPHOSTrackSegment::TrackSegmentsList * trsegl = *(fPHOS->TrackSegments()) ;
-      AliPHOSTrackSegment * trseg ;
-      Int_t nTrackSegments = trsegl->GetEntries() ;
-      Int_t index ;
-      Float_t etot = 0 ;
-      Int_t nTrackSegmentsInModule = 0 ; 
-      for(index = 0; index < nTrackSegments ; index++){
-       trseg = (AliPHOSTrackSegment * )trsegl->At(index) ;
-       etot+= trseg->GetEnergy() ;
-       if ( trseg->GetPHOSMod() == module ) { 
-         nTrackSegmentsInModule++ ; 
-         trseg->Draw("P");
-       }
-      } 
-      Text_t text[80] ; 
-      sprintf(text, "track segments: %d", nTrackSegmentsInModule) ;
-      TPaveText *  pavetext = new TPaveText(22, 80, 83, 90); 
-      pavetext->AddText(text) ; 
-      pavetext->Draw() ; 
-      trackcanvas->Update() ; 
-      cout << "DisplayTrackSegments > Found " << trsegl->GetEntries() << " Track segments with total energy "<< etot << endl ;
-    
-   }
-}
 //____________________________________________________________________________
 Bool_t AliPHOSAnalyze::OpenRootFile(Text_t * name)
 {
@@ -1459,6 +1487,7 @@ Bool_t AliPHOSAnalyze::OpenRootFile(Text_t * name)
   fRootFile   = new TFile(name, "update") ;
   return  fRootFile->IsOpen() ; 
 }
+
 //____________________________________________________________________________
 void AliPHOSAnalyze::SaveHistograms()
 {
@@ -1479,6 +1508,10 @@ void AliPHOSAnalyze::SaveHistograms()
     fhPPSDEnergy->Write() ;
   if(fhAllPosition)
     fhAllPosition->Write() ;
+  if(fhAllPositionX)
+    fhAllPositionX->Write() ;
+  if(fhAllPositionZ)
+    fhAllPositionZ->Write() ;
   if(fhPhotPosition)
     fhPhotPosition->Write() ;
   if(fhEMPosition)
@@ -1569,6 +1602,8 @@ void AliPHOSAnalyze::ResetHistograms()
    fhEMEnergy = 0 ;         // Spectrum of detected electrons with electron primary
    fhPPSDEnergy = 0 ;
    fhAllPosition = 0 ; 
+   fhAllPositionX = 0 ; 
+   fhAllPositionZ = 0 ; 
    fhPhotPosition = 0 ; 
    fhEMPosition = 0 ; 
    fhPPSDPosition = 0 ; 
@@ -1598,7 +1633,4 @@ void AliPHOSAnalyze::ResetHistograms()
    fhPhotChHa = 0 ;
    fhPhotGaHa = 0 ;
 
-
 }
-
-