]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - PHOS/AliPHOSAnalyze.cxx
Time of samples is read from raw data
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSAnalyze.cxx
index 0a262597ea6a7058dbfdcdf45d0327b47f39001a..d1c00684761fc915d1b76a3f34a435f0706bb3b9 100644 (file)
 /* $Id$ */
 
 //_________________________________________________________________________
-// Algorythm class to analyze PHOSv1 events:
-// Construct histograms and displays them.
-// Use the macro EditorBar.C for best access to the functionnalities
+// Algorythm class to analyze PHOS events. In this class we demostrate, 
+// how to handle reconstructed objects with AliPHSOIndexToObject.
+// As an example we propose sulotions for four most frequently used tasks:
+//    DrawRecon(...) - to draw reconstructed objects in the PHOS plane,
+//                     very usefull in the debuging
+//    InvarianMass(...) - to calculate "REAL" and "MIXED" photon pairs 
+//                        invariant mass distributions
+//    EnergyResoluition(...) -\ Energy and position resolutions of the 
+//    PositionResolution(...)-/ reconstructed photons
+//    Contamination(...) - calculates contamination of the photon spectrum and 
+//                         pobability of reconstruction of several primaries as 
+//                         kGAMMA,kELECTRON etc.
+////    User Case:
+//    root [0] AliPHOSAnalyze * a = new AliPHOSAnalyze("galice.root")
+//                    // set the file you want to analyse
+//    root [1] a->DrawRecon(1,3)
+//                    // plot RecObjects, made in event 1, PHOS module 3 
+//    root [2] a->DrawRecon(1,3,"PHOSRP","another PID")
+//                    // plot RecObjets made in the event 1, PHOS module 3,
+//                    // produced in the another reconstruction pass,
+//                    // which produced PHOS RecParticles ("PHOSRP") with 
+//                    // title "another PID".
+//    root [3] a->InvariantMass()
+//                    // Calculates "REAL" and "MIXED" invariant mass 
+//                    // distributions of kGAMMA and (kGAMMA+kNEUTRALEM)
+//                    // and APPENDS this to the file "invmass.root"
+//    root [4] a->PositionResolution()
+//                    // calculates two dimentional histos: energy of the primary
+//                    // photon vs distance betwin incedence point and reconstructed 
+//                    // poisition. One can analyse the produced file position.root 
+//                    // with macro PhotonPosition.C
+//    root [5] a->EnergyResolution()
+//                    // calculates two dimentional histos: energy of the primary
+//                    // photon vs energy of the reconstructed particle. One can 
+//                    // analyse the produced file energy.root 
+//                    // with macro PhotonEnergy.C
+//    root [6] a->Contamination()
+//                    // fills spectra of primary photons and several kinds of 
+//                    // reconstructed particles, so that analyzing them one can 
+//                    // estimate conatmination, efficiency of registration etc.
 //*--
-//*-- Author: Y. Schutz (SUBATECH) & Gines Martinez (SUBATECH)
+//*-- Author: Dmitri Peressounko (SUBATECH & RRC Kurchatov Institute)
 //////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
 
+
 // --- ROOT system ---
 
 #include "TFile.h"
 #include "TH1.h"
-#include "TPad.h"
+#include "TH2.h"
 #include "TH2.h"
 #include "TParticle.h"
 #include "TClonesArray.h"
-#include "TTree.h"
 #include "TMath.h"
-#include "TCanvas.h" 
-#include "TStyle.h" 
+#include "TROOT.h"
 
 // --- Standard library ---
 
-#include <iostream.h>
-#include <stdio.h>
-
 // --- AliRoot header files ---
 
-#include "AliRun.h"
+#include "AliLog.h"
+#include "AliStack.h"
+#include "AliPHOSGeometry.h"
 #include "AliPHOSAnalyze.h"
-#include "AliPHOSClusterizerv1.h"
-#include "AliPHOSTrackSegmentMakerv1.h"
-#include "AliPHOSPIDv1.h"
-#include "AliPHOSReconstructioner.h"
 #include "AliPHOSDigit.h"
+#include "AliPHOSSDigitizer.h"
+#include "AliPHOSEmcRecPoint.h"
+#include "AliPHOSCpvRecPoint.h"
 #include "AliPHOSTrackSegment.h"
 #include "AliPHOSRecParticle.h"
-#include "AliPHOSIndexToObject.h"
-#include "AliPHOSCPVHit.h"
-#include "AliPHOSCpvRecPoint.h"
+#include "AliPHOSLoader.h"
+
 
 ClassImp(AliPHOSAnalyze)
 
 //____________________________________________________________________________
-  AliPHOSAnalyze::AliPHOSAnalyze()
+AliPHOSAnalyze::AliPHOSAnalyze():
+  fCorrection(1.2),  //Value calculated for default parameters of reconstruction
+  fEvt(0),
+  ffileName(),
+  fRunLoader(0)
 {
   // default ctor (useless)
-  
-  fRootFile = 0 ; 
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-AliPHOSAnalyze::AliPHOSAnalyze(Text_t * name)
+AliPHOSAnalyze::AliPHOSAnalyze(Text_t * fileName):
+  fCorrection(1.05),  //Value calculated for default parameters of reconstruction   
+  fEvt(0),
+  ffileName(fileName),
+  fRunLoader(0)
 {
   // ctor: analyze events from root file "name"
-  
-  Bool_t ok = OpenRootFile(name)  ; 
-  if ( !ok ) {
-    cout << " AliPHOSAnalyze > Error opening " << name << endl ; 
-  }
-  else { 
-      //========== Get AliRun object from file 
-      gAlice = (AliRun*) fRootFile->Get("gAlice") ;
-
-      //=========== Get the PHOS object and associated geometry from the file      
-      fPHOS  = (AliPHOSv1 *)gAlice->GetDetector("PHOS") ;
-      fGeom  = AliPHOSGeometry::GetInstance( fPHOS->GetGeometry()->GetName(), fPHOS->GetGeometry()->GetTitle() );
-      //========== Initializes the Index to Object converter
-      fObjGetter = AliPHOSIndexToObject::GetInstance(fPHOS) ; 
-      //========== Current event number 
-      fEvt = -999 ; 
-
-  }
-  fDebugLevel = 0;
-  fClu = 0 ;
-  fPID = 0 ;
-  fTrs = 0 ;
-  fRec = 0 ;
-  ResetHistograms() ;
+  fRunLoader = AliRunLoader::Open(fileName,"AliPHOSAnalyze");
+  if (fRunLoader == 0x0)
+   {
+     AliError(Form("Error Loading session"));
+   }
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-AliPHOSAnalyze::AliPHOSAnalyze(const AliPHOSAnalyze & ana)
+AliPHOSAnalyze::AliPHOSAnalyze(const AliPHOSAnalyze & ana): 
+  TObject(ana),
+  fCorrection(0.),
+  fEvt(0),
+  ffileName(),
+  fRunLoader(0)
 {
   // copy ctor
   ( (AliPHOSAnalyze &)ana ).Copy(*this) ;
 }
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::Copy(TObject & obj)
-{
-  // copy an analysis into an other one
-  TObject::Copy(obj) ;
-  // I do nothing more because the copy is silly but the Code checkers requires one
-}
-
 //____________________________________________________________________________
 AliPHOSAnalyze::~AliPHOSAnalyze()
 {
   // dtor
 
-  if(fRootFile->IsOpen()) fRootFile->Close() ; 
-  if(fRootFile)   {delete fRootFile ; fRootFile=0 ;}
-  if(fPHOS)       {delete fPHOS     ; fPHOS    =0 ;}
-  if(fClu)        {delete fClu      ; fClu     =0 ;}
-  if(fPID)        {delete fPID      ; fPID     =0 ;}
-  if(fRec)        {delete fRec      ; fRec     =0 ;}
-  if(fTrs)        {delete fTrs      ; fTrs     =0 ;}
-
 }
-
 //____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::ActivePPSD(Int_t Nevents=1){
+void AliPHOSAnalyze::DrawRecon(Int_t Nevent,Int_t Nmod){
+  //Draws pimary particles and reconstructed 
+  //digits, RecPoints, RecPartices etc 
+  //for event Nevent in the module Nmod.
+
+  //========== Create ObjectLoader
+  if (fRunLoader == 0x0)
+   {
+     AliError(Form("Error Loading session"));
+     return;
+   }
   
-  fhEnergyCorrelations  = new TH2F("hEnergyCorrelations","hEnergyCorrelations",40,  0., 0.15, 30, 0., 3.e-5);
-  //========== Create the Clusterizer
-  fClu = new AliPHOSClusterizerv1() ; 
-  fClu->SetEmcEnergyThreshold(0.01) ; 
-  fClu->SetEmcClusteringThreshold(0.20) ; 
-  fClu->SetPpsdEnergyThreshold    (0.0000002) ; 
-  fClu->SetPpsdClusteringThreshold(0.0000001) ; 
-  fClu->SetLocalMaxCut(0.02) ;
-  fClu->SetCalibrationParameters(0., 0.00000001) ; 
-
-  Int_t ievent;
+  AliPHOSLoader* gime = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(fRunLoader->GetLoader("PHOSLoader"));
+  if ( gime == 0 ) 
+   {
+     AliError(Form("Could not obtain the Loader object !")); 
+     return ;
+   } 
+  
+  
+  if(Nevent >= fRunLoader->GetNumberOfEvents() ) {
+    AliError(Form("There is no event %d only %d events available", Nevent, fRunLoader->GetNumberOfEvents() )) ;
+    return ;
+  }
+  const AliPHOSGeometry * phosgeom = gime->PHOSGeometry() ; 
+  fRunLoader->GetEvent(Nevent);
+
+  Int_t nx = phosgeom->GetNPhi() ;
+  Int_t nz = phosgeom->GetNZ() ;
+  Float_t * cri= phosgeom->GetEMCAGeometry()->GetCrystalHalfSize() ;
+  Float_t x = nx*cri[0] ;
+  Float_t z = nz*cri[2] ;
+  Int_t nxCPV = (Int_t) (nx*phosgeom->GetPadSizePhi()/(2.*cri[0])) ;
+  Int_t nzCPV = (Int_t) (nz*phosgeom->GetPadSizeZ()/(2.*cri[2])) ;
+  
+  TH2F * emcDigits = (TH2F*) gROOT->FindObject("emcDigits") ;
+  if(emcDigits)
+    emcDigits->Delete() ;
+  emcDigits = new TH2F("emcDigits","EMC digits",  nx,-x,x,nz,-z,z);
+  TH2F * emcSdigits =(TH2F*) gROOT->FindObject("emcSdigits") ;  
+  if(emcSdigits)
+    emcSdigits->Delete() ;
+  emcSdigits = new TH2F("emcSdigits","EMC sdigits", nx,-x,x,nz,-z,z);
+  TH2F * emcRecPoints = (TH2F*)gROOT->FindObject("emcRecPoints") ; 
+  if(emcRecPoints)
+    emcRecPoints->Delete() ;
+  emcRecPoints = new TH2F("emcRecPoints","EMC RecPoints",nx,-x,x,nz,-z,z);
+  TH2F * cpvSdigits =(TH2F*) gROOT->FindObject("cpvSdigits") ;
+  if(cpvSdigits)
+    cpvSdigits->Delete() ;
+  cpvSdigits = new TH2F("cpvSdigits","CPV sdigits", nx,-x,x,nz,-z,z);
+  TH2F * cpvDigits = (TH2F*)gROOT->FindObject("cpvDigits") ;
+  if(cpvDigits)
+    cpvDigits->Delete() ;
+  cpvDigits = new TH2F("cpvDigits","CPV digits",   nxCPV,-x,x,nzCPV,-z,z) ;
+  TH2F * cpvRecPoints= (TH2F*)gROOT->FindObject("cpvRecPoints") ; 
+  if(cpvRecPoints)
+    cpvRecPoints->Delete() ;
+  cpvRecPoints = new TH2F("cpvRecPoints","CPV RecPoints",    nxCPV,-x,x,nzCPV,-z,z) ;
+
+  TH2F * phot = (TH2F*)gROOT->FindObject("phot") ;
+  if(phot)
+    phot->Delete() ;
+  phot = new TH2F("phot","Primary Photon",  nx,-x,x,nz,-z,z);
+  TH2F * recPhot = (TH2F*)gROOT->FindObject("recPhot") ; 
+  if(recPhot)
+    recPhot->Delete() ;
+  recPhot = new TH2F("recPhot","RecParticles with primary Photon",nx,-x,x,nz,-z,z);
+  
+  
+  //Plot Primary Particles
+  
+  if (fRunLoader->Stack() == 0x0) fRunLoader->LoadKinematics("READ");
   
-  for ( ievent=0; ievent<Nevents; ievent++)
-    {  
-      
-      //========== Event Number>         
-      if ( ( log10((Float_t)(ievent+1)) - (Int_t)(log10((Float_t)(ievent+1))) ) == 0. ) 
-       cout <<  "AnalyzeResolutions > " << "Event is " << ievent << endl ;  
-      
-      //=========== Connects the various Tree's for evt
-      gAlice->GetEvent(ievent);
-
-      //=========== Gets the Kine TTree
-      gAlice->TreeK()->GetEvent(0) ;
-      
-      //=========== Get the Digit Tree
-      gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
-      
-      //========== Creating branches ===================================       
-      AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** EmcRecPoints =  fPHOS->EmcRecPoints() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSEmcRP", EmcRecPoints ) ;
-      
-      AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** PpsdRecPoints = fPHOS->PpsdRecPoints() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSPpsdRP", PpsdRecPoints ) ;
-      
-      AliPHOSTrackSegment::TrackSegmentsList **  TrackSegmentsList = fPHOS->TrackSegments() ;
-      if( (*TrackSegmentsList) )
-       (*TrackSegmentsList)->Clear() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSTS", TrackSegmentsList ) ;
-      
-      AliPHOSRecParticle::RecParticlesList ** RecParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;
-      if( (*RecParticleList) )
-       (*RecParticleList)->Clear() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSRP", RecParticleList ) ;
-      
-      
-      //=========== Gets the Reconstraction TTree
-      gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
-            
-      AliPHOSPpsdRecPoint * RecPoint ;
-      Int_t relid[4] ; 
-      TIter nextRP(*fPHOS->PpsdRecPoints() ) ;
-      while( ( RecPoint = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextRP() ) )
-       {
-         if(!(RecPoint->GetUp()) ) {
-           AliPHOSDigit *digit ;
-           Int_t iDigit ;
-           for(iDigit = 0; iDigit < fPHOS->Digits()->GetEntries(); iDigit++) 
-             {
-               digit = (AliPHOSDigit *) fPHOS->Digits()->At(iDigit) ;
-               fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;    
-                if((relid[2]==1)&&(relid[3]==1)&&(relid[0]==RecPoint->GetPHOSMod())){
-                 Float_t ConvertorEnergy = fClu->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
-                 fhEnergyCorrelations->Fill(ConvertorEnergy,RecPoint->GetTotalEnergy() );  
-                 break ; 
-               } 
-             }
-           break ;
-         }
-       }
-    }
-  SaveHistograms() ;
-  fhEnergyCorrelations->Draw("BOX") ;
-}
-
-
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::AnalyzeManyEvents(Int_t Nevents, Int_t module)    
-{
-  // analyzes Nevents events in a single PHOS module  
-  // Events should be reconstructed by Reconstruct()
 
-  if ( fRootFile == 0 ) 
-    cout << "AnalyzeManyEvents > " << "Root File not openned" << endl ;  
-  else
+  const TParticle * primary ;
+  Int_t iPrimary ;
+  for ( iPrimary = 0 ; iPrimary < fRunLoader->Stack()->GetNprimary() ; iPrimary++)
     {
-      //========== Booking Histograms
-      cout << "AnalyzeManyEvents > " << "Booking Histograms" << endl ; 
-      BookingHistograms();
-
-      Int_t ievent;
-      Int_t relid[4] ; 
-      AliPHOSDigit * digit ;
-      AliPHOSEmcRecPoint * emc ;
-      AliPHOSPpsdRecPoint * ppsd ;
-      //      AliPHOSTrackSegment * tracksegment ;
-      AliPHOSRecParticle * recparticle;
-
-      for ( ievent=0; ievent<Nevents; ievent++)
-       {  
-         //========== Event Number>         
-         if ( ( log10((Float_t)(ievent+1)) - (Int_t)(log10((Float_t)(ievent+1))) ) == 0. ) 
-           cout <<  "AnalyzeManyEvents > " << "Event is " << ievent << endl ;  
-
-         //=========== Connects the various Tree's for evt
-         gAlice->GetEvent(ievent);
-
-         //=========== Gets the Digit TTree
-         gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
-
-         //=========== Gets the number of entries in the Digits array 
-         TIter nextdigit(fPHOS->Digits()) ;
-         while( ( digit = (AliPHOSDigit *)nextdigit() ) )
-           {
-             fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;         
-             if (fClu->IsInEmc(digit)) fhEmcDigit->Fill(fClu->Calibrate(digit->GetAmp())) ; 
-             else    
-               {  
-                 if (relid[1]<17) fhVetoDigit->Fill(fClu->Calibrate(digit->GetAmp())); 
-                 if (relid[1]>16) fhConvertorDigit->Fill(fClu->Calibrate(digit->GetAmp()));
-               }
-           }
-         
-
-         //=========== Cluster in module
-         TIter nextEmc(*fPHOS->EmcRecPoints()  ) ;
-         while((emc = (AliPHOSEmcRecPoint *)nextEmc())) 
-           {
-             if ( emc->GetPHOSMod() == module )
-               {  
-                 fhEmcCluster->Fill(  emc->GetTotalEnergy()  ); 
-                 TIter nextPpsd( *fPHOS->PpsdRecPoints()) ;
-                 while((ppsd = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextPpsd())) 
-                   {
-                     if ( ppsd->GetPHOSMod() == module )
-                       {                         
-                         if (!ppsd->GetUp()) fhConvertorEmc->Fill(emc->GetTotalEnergy(),ppsd->GetTotalEnergy()) ;
-                       }
-                   } 
-               }
-           }
-
-         //=========== Cluster in module PPSD Down
-         TIter nextPpsd(*fPHOS->PpsdRecPoints() ) ;
-         while((ppsd = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextPpsd())) 
-           {
-             if ( ppsd->GetPHOSMod() == module )
-               { 
-                 if (!ppsd->GetUp()) fhConvertorCluster->Fill(ppsd->GetTotalEnergy()) ;
-                 if (ppsd->GetUp())  fhVetoCluster     ->Fill(ppsd->GetTotalEnergy()) ;
-               }
-           }
-
-         //========== TRackSegments in the event
-         TIter nextRecParticle(*fPHOS->RecParticles() ) ; 
-         while((recparticle = (AliPHOSRecParticle *)nextRecParticle())) 
-           {
-             if ( recparticle->GetPHOSTrackSegment()->GetPHOSMod() == module )
-               { 
-                 cout << "Particle type is " << recparticle->GetType() << endl ; 
-                 Int_t numberofprimaries = 0 ;
-                 Int_t * listofprimaries = recparticle->GetPrimaries(numberofprimaries) ;
-                 cout << "Number of primaries = " << numberofprimaries << endl ; 
-                 Int_t index ;
-                 for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++)
-                   cout << "    primary # " << index << " =  " << listofprimaries[index] << endl ;  
-               }
-           }
-       }   // endfor
-      SaveHistograms();
-    }       // endif
-}           // endfunction
+      primary = fRunLoader->Stack()->Particle(iPrimary);
+      
+      Int_t primaryType = primary->GetPdgCode();
+//       if( (primaryType == 211)||(primaryType == -211)||(primaryType == 2212)||(primaryType == -2212)
+//          ||(primaryType == 11)||(primaryType == -11) ) {
+//         Int_t moduleNumber ;
+//         Double_t primX, primZ ;
+//         phosgeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+//         if(moduleNumber==Nmod)
+//           charg->Fill(primZ,primX,primary->Energy()) ;
+//       }
+      if( primaryType == 22 ) {
+        Int_t moduleNumber ;
+        Double_t primX, primZ ;
+        phosgeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+        if(moduleNumber==Nmod) 
+          phot->Fill(primZ,primX,primary->Energy()) ;
+      }
+//       else{
+//         if( primaryType == -2112 ) {
+//           Int_t moduleNumber ;
+//           Double_t primX, primZ ;
+//           phosgeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+//           if(moduleNumber==Nmod)
+//             nbar->Fill(primZ,primX,primary->Energy()) ;
+//         }
+//       }
+    }  
 
-//____________________________________________________________________________
- void AliPHOSAnalyze::Reconstruct(Int_t Nevents,Int_t FirstEvent )    
-{     
-
-  // Performs reconstruction of EMC and CPV (GPS2 or IHEP)
-  // for events from FirstEvent to Nevents
-
-  Int_t ievent ;   
-  for ( ievent=FirstEvent; ievent<Nevents; ievent++) {  
-    if (ievent==FirstEvent) {
-      cout << "Analyze > Starting Reconstructing " << endl ; 
-      //========== Create the Clusterizer
-      fClu = new AliPHOSClusterizerv1() ; 
-      fClu->SetEmcEnergyThreshold(0.05) ; 
-      fClu->SetEmcClusteringThreshold(0.20) ; 
-      fClu->SetLocalMaxCut(0.03) ;
-      if      (strcmp(fGeom->GetName(),"GPS2") == 0) {
-       fClu->SetPpsdEnergyThreshold    (0.0000002) ; 
-       fClu->SetPpsdClusteringThreshold(0.0000001) ; 
+  
+  Int_t iSDigit ;
+  AliPHOSDigit * sdigit ;
+  const TClonesArray * sdigits = gime->SDigits() ;
+  Int_t nsdig[5] = {0,0,0,0,0} ;
+  if(sdigits){
+    for(iSDigit = 0; iSDigit < sdigits->GetEntriesFast() ; iSDigit++)
+      {
+       sdigit = (AliPHOSDigit *) sdigits->At(iSDigit) ;
+       Int_t relid[4];
+       phosgeom->AbsToRelNumbering(sdigit->GetId(), relid) ;
+       Float_t x,z ;
+       phosgeom->RelPosInModule(relid,x,z);
+       AliPHOSSDigitizer* sd = dynamic_cast<AliPHOSSDigitizer*>(gime->SDigitizer());
+       Float_t e = sd->Calibrate(sdigit->GetAmp()) ;
+       nsdig[relid[0]-1]++ ;
+       if(relid[0]==Nmod){
+         if(relid[1]==0)  //EMC
+           emcSdigits->Fill(x,z,e) ;
+         if( relid[1]!=0 )
+           cpvSdigits->Fill(x,z,e) ;
+       }
+      }
+  }
+  TString message ; 
+  message  = "Number of EMC + CPV SDigits per module: \n" ;
+  message += "%d %d %d %d %d\n"; 
+  AliInfo(Form(message.Data(), nsdig[0], nsdig[1], nsdig[2], nsdig[3], nsdig[4] )) ;
+
+  //Plot digits
+  Int_t iDigit ;
+  AliPHOSDigit * digit ;
+  const TClonesArray * digits = gime->Digits(); 
+  if(digits) {
+    for(iDigit = 0; iDigit < digits->GetEntriesFast(); iDigit++)
+      {
+       digit = (AliPHOSDigit *) digits->At(iDigit) ;
+       Int_t relid[4];
+       phosgeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
+       Float_t x,z ;
+       phosgeom->RelPosInModule(relid,x,z) ;
+       AliPHOSSDigitizer* sd = dynamic_cast<AliPHOSSDigitizer*>(gime->SDigitizer());
+       Float_t e = sd->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
+       if(relid[0]==Nmod){
+         if(relid[1]==0)  //EMC
+           emcDigits->Fill(x,z,e) ;
+         if( relid[1]!=0 )
+           cpvDigits->Fill(x,z,e) ;
+       }
       }
-      else if (strcmp(fGeom->GetName(),"IHEP") == 0) {
-       fClu->SetLocalMaxCutCPV(0.03) ;
-       fClu->SetLogWeightCutCPV(4.0) ;
-       fClu->SetPpsdEnergyThreshold    (0.09) ;
+  }
+  
+  
+  //Plot RecPoints
+  Int_t irecp ;
+  TVector3 pos ;
+  TObjArray * emcrp = gime->EmcRecPoints() ;
+  if(emcrp) {
+    for(irecp = 0; irecp < emcrp->GetEntriesFast() ; irecp ++){
+      AliPHOSEmcRecPoint * emc = (AliPHOSEmcRecPoint *) emcrp->At(irecp) ;
+      if(emc->GetPHOSMod()==Nmod){
+       emc->GetLocalPosition(pos) ;
+       emcRecPoints->Fill(pos.X(),pos.Z(),emc->GetEnergy());
       }
-      fClu->SetCalibrationParameters(0., 0.00000001) ; 
-      
-      //========== Creates the track segment maker
-      fTrs = new AliPHOSTrackSegmentMakerv1()  ;
-         //      fTrs->UnsetUnfoldFlag() ; 
-     
-      //========== Creates the particle identifier for GPS2 only
-      if      (strcmp(fGeom->GetName(),"GPS2") == 0) {
-       fPID = new AliPHOSPIDv1() ;
-       fPID->SetShowerProfileCuts(0.3, 1.8, 0.3, 1.8 ) ; 
-      }          
-      
-      //========== Creates the Reconstructioner
-      fRec = new AliPHOSReconstructioner(fClu, fTrs, fPID) ; 
-      if (fDebugLevel != 0) fRec -> SetDebugReconstruction(kTRUE);     
     }
-      
-    if (fDebugLevel != 0 ||
-       (ievent+1) % (Int_t)TMath::Power( 10, (Int_t)TMath::Log10(ievent+1) ) == 0)
-      cout <<  "======= Analyze ======> Event " << ievent+1 << endl ;
-    
-    //=========== Connects the various Tree's for evt
-    gAlice->GetEvent(ievent);
-    
-    //=========== Gets the Digit TTree
-    gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
-    
-    //=========== Do the reconstruction
-    fPHOS->Reconstruction(fRec);
   }
-
-  if(fClu)      {delete fClu      ; fClu     =0 ;}
-  if(fPID)      {delete fPID      ; fPID     =0 ;}
-  if(fRec)      {delete fRec      ; fRec     =0 ;}
-  if(fTrs)      {delete fTrs      ; fTrs     =0 ;}
   
-}
-
-//-------------------------------------------------------------------------------------
-void AliPHOSAnalyze::ReadAndPrintCPV(Int_t EvFirst, Int_t EvLast)
-{
-  //
-  // Read and print generated and reconstructed hits in CPV
-  // for events from EvFirst to Nevent.
-  // If only EvFirst is defined, print only this one event.
-  // Author: Yuri Kharlov
-  // 12 October 2000
-  //
-
-  if (EvFirst!=0 && EvLast==0) EvLast=EvFirst;
-  for ( Int_t ievent=EvFirst; ievent<=EvLast; ievent++) {  
-    
-    //========== Event Number>
-    cout << endl <<  "==== ReadAndPrintCPV ====> Event is " << ievent+1 << endl ;
-    
-    //=========== Connects the various Tree's for evt
-    Int_t ntracks = gAlice->GetEvent(ievent);
-
-    //========== Creating branches ===================================
-    AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** emcRecPoints = fPHOS->EmcRecPoints() ;
-    gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSEmcRP" , emcRecPoints  ) ;
-    
-    AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** cpvRecPoints = fPHOS->PpsdRecPoints() ;
-    gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSPpsdRP", cpvRecPoints ) ;
-
-    // Read and print CPV hits
-      
-    AliPHOSCPVModule cpvModule;
-    TClonesArray    *cpvHits;
-    Int_t           nCPVhits;
-    AliPHOSCPVHit   *cpvHit;
-    TLorentzVector   p;
-    Float_t          xgen, zgen;
-    Int_t            ipart;
-    Int_t            nGenHits = 0;
-    for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
-      //=========== Get the Hits Tree for the Primary track itrack
-      gAlice->ResetHits();
-      gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
-      for (Int_t iModule=0; iModule < fGeom->GetNModules(); iModule++) {
-       cpvModule = fPHOS->GetCPVModule(iModule);
-       cpvHits   = cpvModule.Hits();
-       nCPVhits  = cpvHits->GetEntriesFast();
-       for (Int_t ihit=0; ihit<nCPVhits; ihit++) {
-         nGenHits++;
-         cpvHit = (AliPHOSCPVHit*)cpvHits->UncheckedAt(ihit);
-         p      = cpvHit->GetMomentum();
-         xgen   = cpvHit->GetX();
-         zgen   = cpvHit->GetY();
-         ipart  = cpvHit->GetIpart();
-         printf("CPV hit in module %d: ",iModule+1);
-         printf(" p = (%f, %f, %f, %f) GeV,\n",
-                p.Px(),p.Py(),p.Pz(),p.Energy());
-         printf("                  (X,Z) = (%8.4f, %8.4f) cm, ipart = %d\n",
-                xgen,zgen,ipart);
-       }
+  TObjArray * cpvrp = gime->CpvRecPoints() ;
+  if(cpvrp) {
+    for(irecp = 0; irecp < cpvrp->GetEntriesFast() ; irecp ++){
+      AliPHOSRecPoint * cpv = (AliPHOSCpvRecPoint *) cpvrp->At(irecp) ;
+      if(cpv->GetPHOSMod()==Nmod){
+       cpv->GetLocalPosition(pos) ;
+       cpvRecPoints->Fill(pos.X(),pos.Z(),cpv->GetEnergy());
       }
     }
+  }
+    
+  //Plot RecParticles
+  AliPHOSRecParticle * recParticle ;
+  Int_t iRecParticle ;
+  TClonesArray * rp = gime->RecParticles() ;
+  TClonesArray * ts = gime->TrackSegments() ;
+  if(rp && ts && emcrp) {
+    for(iRecParticle = 0; iRecParticle < rp->GetEntriesFast() ; iRecParticle++ )
+      {
+       recParticle = (AliPHOSRecParticle *) rp->At(iRecParticle) ;
+       Int_t moduleNumberRec ;
+       Double_t recX, recZ ;
+       phosgeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), moduleNumberRec, recX, recZ) ;
+       if(moduleNumberRec == Nmod){
+         
+         Double_t minDistance = 5. ;
+         Int_t closestPrimary = -1 ;       
+
+         //extract list of primaries: it is stored at EMC RecPoints
+         Int_t emcIndex = ((AliPHOSTrackSegment *) ts->At(recParticle->GetPHOSTSIndex()))->GetEmcIndex() ;
+         Int_t numberofprimaries ;
+         Int_t * listofprimaries  = ((AliPHOSRecPoint*) emcrp->At(emcIndex))->GetPrimaries(numberofprimaries)  ;
+         Int_t index ;
+         const TParticle * primary ;
+         Double_t distance = minDistance ;
+         
+         for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++){
+           primary = fRunLoader->Stack()->Particle(listofprimaries[index]) ;
+           Int_t moduleNumber ;
+           Double_t primX, primZ ;
+           phosgeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+           if(moduleNumberRec == moduleNumber)
+             distance = TMath::Sqrt((recX-primX)*(recX-primX)+(recZ-primZ)*(recZ-primZ) ) ;
+           if(minDistance > distance)
+             {
+              minDistance = distance ;
+              closestPrimary = listofprimaries[index] ;
+             }
+         }
+         
+         if(closestPrimary >=0 ){
+           
+           Int_t primaryType = fRunLoader->Stack()->Particle(closestPrimary)->GetPdgCode() ;
+           
+           if(primaryType==22)
+             recPhot->Fill(recZ,recX,recParticle->Energy()) ;
+//            else
+//              if(primaryType==-2112)
+//               recNbar->Fill(recZ,recX,recParticle->Energy()) ; 
+         }
+       }
+      }
 
-    // Read and print CPV reconstructed points
-
-    //=========== Gets the Reconstruction TTree
-    gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
-    TIter nextRP(*fPHOS->PpsdRecPoints() ) ;
-    AliPHOSPpsdRecPoint *cpvRecPoint ;
-    Int_t nRecPoints = 0;
-    while( ( cpvRecPoint = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextRP() ) ) {
-      nRecPoints++;
-      TVector3  locpos;
-      cpvRecPoint->GetLocalPosition(locpos);
-      Int_t phosModule = cpvRecPoint->GetPHOSMod();
-      printf("CPV recpoint in module %d: (X,Z) = (%f,%f) cm\n",
-            phosModule,locpos.X(),locpos.Z());
-    }
-    printf("This event has %d generated hits and %d reconstructed points\n",
-          nGenHits,nRecPoints);
   }
+  
+  //Plot made histograms
+  emcSdigits->Draw("box") ;
+  emcDigits->SetLineColor(5) ;
+  emcDigits->Draw("boxsame") ;
+  emcRecPoints->SetLineColor(2) ;
+  emcRecPoints->Draw("boxsame") ;
+  cpvSdigits->SetLineColor(1) ;
+  cpvSdigits->Draw("boxsame") ;
+  
 }
-
 //____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::AnalyzeCPV(Int_t Nevents)
-{
-  //
-  // Analyzes CPV characteristics
-  // Author: Yuri Kharlov
-  // 9 October 2000
-  //
-
-  // Book histograms
-
-  TH1F *hDx   = new TH1F("hDx"  ,"CPV x-resolution@reconstruction",100,-5. , 5.);
-  TH1F *hDz   = new TH1F("hDz"  ,"CPV z-resolution@reconstruction",100,-5. , 5.);
-  TH1F *hDr   = new TH1F("hDr"  ,"CPV r-resolution@reconstruction",100, 0. , 5.);
-  TH1S *hNrp  = new TH1S("hNrp" ,"CPV rec.point multiplicity",      21,-0.5,20.5);
-  TH1S *hNrpX = new TH1S("hNrpX","CPV rec.point Phi-length"  ,      21,-0.5,20.5);
-  TH1S *hNrpZ = new TH1S("hNrpZ","CPV rec.point Z-length"    ,      21,-0.5,20.5);
-
-  cout << "Start CPV Analysis"<< endl ;
-  for ( Int_t ievent=0; ievent<Nevents; ievent++) {  
-      
-    //========== Event Number>         
-//      if ( (ievent+1) % (Int_t)TMath::Power( 10, (Int_t)TMath::Log10(ievent+1) ) == 0)
-      cout << endl <<  "==== AnalyzeCPV ====> Event is " << ievent+1 << endl ;
-    
-    //=========== Connects the various Tree's for evt
-    Int_t ntracks = gAlice->GetEvent(ievent);
-    
-    //========== Creating branches ===================================
-    AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** emcRecPoints = fPHOS->EmcRecPoints() ;
-    gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSEmcRP" , emcRecPoints  ) ;
-    
-    AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** cpvRecPoints = fPHOS->PpsdRecPoints() ;
-    gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSPpsdRP", cpvRecPoints ) ;
+void AliPHOSAnalyze::Ls(){
+  //lists branches and titles of PHOS-related branches of TreeR, TreeD, TreeS
+  
+  if (fRunLoader == 0x0)
+   {
+     AliError(Form("Error Loading session"));
+     return;
+   }
+  
+  AliPHOSLoader* gime = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(fRunLoader->GetLoader("PHOSLoader"));
+  if ( gime == 0 ) 
+   {
+     AliError(Form("Could not obtain the Loader object !")); 
+     return ;
+   } 
 
-    // Create and fill arrays of hits for each CPV module
-      
-    Int_t nOfModules = fGeom->GetNModules();
-    TClonesArray **hitsPerModule = new TClonesArray *[nOfModules];
-    for (Int_t iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++)
-      hitsPerModule[iModule] = new TClonesArray("AliPHOSCPVHit",100);
-
-    AliPHOSCPVModule cpvModule;
-    TClonesArray    *cpvHits;
-    Int_t           nCPVhits;
-    AliPHOSCPVHit   *cpvHit;
-    TLorentzVector   p;
-    Float_t          xzgen[2];
-    Int_t            ipart;
-
-    // First go through all primary tracks and fill the arrays
-    // of hits per each CPV module
-
-    for (Int_t itrack=0; itrack<ntracks; itrack++) {
-      // Get the Hits Tree for the Primary track itrack
-      gAlice->ResetHits();
-      gAlice->TreeH()->GetEvent(itrack);
-      for (Int_t iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++) {
-       cpvModule = fPHOS->GetCPVModule(iModule);
-       cpvHits   = cpvModule.Hits();
-       nCPVhits  = cpvHits->GetEntriesFast();
-       for (Int_t ihit=0; ihit<nCPVhits; ihit++) {
-         cpvHit   = (AliPHOSCPVHit*)cpvHits->UncheckedAt(ihit);
-         p        = cpvHit->GetMomentum();
-         xzgen[0] = cpvHit->GetX();
-         xzgen[1] = cpvHit->GetY();
-         ipart    = cpvHit->GetIpart();
-         TClonesArray &lhits = *(TClonesArray *)hitsPerModule[iModule];
-         new(lhits[hitsPerModule[iModule]->GetEntriesFast()]) AliPHOSCPVHit(*cpvHit);
-       }
-       cpvModule.Clear();
+
+  Int_t ibranch;
+  TObjArray * branches; 
+  
+  if (gime->TreeS() == 0x0) 
+   {
+     if (gime->LoadSDigits("READ"))
+      {
+        AliError(Form("Problems with loading summable digits"));
+        return;
       }
+   }
+  branches = gime->TreeS()->GetListOfBranches() ;
+  TString message ; 
+  message  = "TreeS:\n" ;
+  for(ibranch = 0;ibranch <branches->GetEntries();ibranch++){
+    TBranch * branch=(TBranch *) branches->At(ibranch) ;
+    if(strstr(branch->GetName(),"PHOS") ){
+      message += "       " ; 
+      message += branch->GetName() ; 
+      message += "     " ; 
+      message += branch->GetTitle() ;
+      message += "\n" ; 
     }
-    for (Int_t iModule=0; iModule < nOfModules; iModule++) {
-      Int_t nsum = hitsPerModule[iModule]->GetEntriesFast();
-      printf("Module %d has %d hits\n",iModule,nsum);
-    }
-
-    // Then go through reconstructed points and for each find
-    // the closeset hit
-    // The distance from the rec.point to the closest hit
-    // gives the coordinate resolution of the CPV
-
-    // Get the Reconstruction Tree
-    gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
-    TIter nextRP(*fPHOS->PpsdRecPoints() ) ;
-    AliPHOSCpvRecPoint *cpvRecPoint ;
-    Float_t xgen, zgen;
-    while( ( cpvRecPoint = (AliPHOSCpvRecPoint *)nextRP() ) ) {
-      TVector3  locpos;
-      cpvRecPoint->GetLocalPosition(locpos);
-      Int_t phosModule = cpvRecPoint->GetPHOSMod();
-      Int_t rpMult     = cpvRecPoint->GetDigitsMultiplicity();
-      Int_t rpMultX, rpMultZ;
-      cpvRecPoint->GetClusterLengths(rpMultX,rpMultZ);
-      Float_t xrec  = locpos.X();
-      Float_t zrec  = locpos.Z();
-      Float_t dxmin = 1.e+10;
-      Float_t dzmin = 1.e+10;
-      Float_t r2min = 1.e+10;
-      Float_t r2;
-
-      cpvHits = hitsPerModule[phosModule-1];
-      Int_t nCPVhits  = cpvHits->GetEntriesFast();
-      for (Int_t ihit=0; ihit<nCPVhits; ihit++) {
-       cpvHit = (AliPHOSCPVHit*)cpvHits->UncheckedAt(ihit);
-       xgen   = cpvHit->GetX();
-       zgen   = cpvHit->GetY();
-       r2 = TMath::Power((xgen-xrec),2) + TMath::Power((zgen-zrec),2);
-       if ( r2 < r2min ) {
-         r2min = r2;
-         dxmin = xgen - xrec;
-         dzmin = zgen - zrec;
-       }
+  }
+  if (gime->TreeD() == 0x0) 
+   {
+     if (gime->LoadDigits("READ"))
+      {
+        AliError(Form("Problems with loading digits"));
+        return;
       }
-      hDx  ->Fill(dxmin);
-      hDz  ->Fill(dzmin);
-      hDr  ->Fill(TMath::Sqrt(r2min));
-      hNrp ->Fill(rpMult);
-      hNrpX->Fill(rpMultX);
-      hNrpZ->Fill(rpMultZ);
+   }
+
+  branches = gime->TreeD()->GetListOfBranches() ;
+  
+  message += "TreeD:\n" ;
+  for(ibranch = 0;ibranch <branches->GetEntries();ibranch++){
+    TBranch * branch=(TBranch *) branches->At(ibranch) ;
+    if(strstr(branch->GetName(),"PHOS") ) {
+      message += "       "; 
+      message += branch->GetName() ; 
+      message += "     " ; 
+      message += branch->GetTitle() ; 
+      message +="\n" ;
     }
-    delete [] hitsPerModule;
   }
-  // Save histograms
-
-  Text_t outputname[80] ;
-  sprintf(outputname,"%s.analyzed",fRootFile->GetName());
-  TFile output(outputname,"RECREATE");
-  output.cd();
-
-  hDx  ->Write() ;
-  hDz  ->Write() ;
-  hDr  ->Write() ;
-  hNrp ->Write() ;
-  hNrpX->Write() ;
-  hNrpZ->Write() ;
-
-  // Plot histograms
-
-  TCanvas *cpvCanvas = new TCanvas("CPV","CPV analysis",20,20,800,400);
-  gStyle->SetOptStat(111111);
-  gStyle->SetOptFit(1);
-  gStyle->SetOptDate(1);
-  cpvCanvas->Divide(3,2);
-
-  cpvCanvas->cd(1);
-  gPad->SetFillColor(10);
-  hNrp->SetFillColor(16);
-  hNrp->Draw();
-
-  cpvCanvas->cd(2);
-  gPad->SetFillColor(10);
-  hNrpX->SetFillColor(16);
-  hNrpX->Draw();
-
-  cpvCanvas->cd(3);
-  gPad->SetFillColor(10);
-  hNrpZ->SetFillColor(16);
-  hNrpZ->Draw();
-
-  cpvCanvas->cd(4);
-  gPad->SetFillColor(10);
-  hDx->SetFillColor(16);
-  hDx->Fit("gaus");
-  hDx->Draw();
-
-  cpvCanvas->cd(5);
-  gPad->SetFillColor(10);
-  hDz->SetFillColor(16);
-  hDz->Fit("gaus");
-  hDz->Draw();
-
-  cpvCanvas->cd(6);
-  gPad->SetFillColor(10);
-  hDr->SetFillColor(16);
-  hDr->Draw();
-
-  cpvCanvas->Print("CPV.ps");
+  
+  if (gime->TreeR() == 0x0) 
+   {
+     if (gime->LoadRecPoints("READ"))
+      {
+        AliError(Form("Problems with loading rec points"));
+        return;
+      }
+   }
 
+  branches = gime->TreeR()->GetListOfBranches() ;
+  
+  message += "TreeR: \n" ;
+  for(ibranch = 0;ibranch <branches->GetEntries();ibranch++){
+    TBranch * branch=(TBranch *) branches->At(ibranch) ;
+    if(strstr(branch->GetName(),"PHOS") ) {
+      message += "       " ; 
+      message += branch->GetName() ; 
+      message += "     " ;
+      message += branch->GetTitle() ; 
+      message += "\n" ;
+    }
+  }
+  AliInfo(Form(message.Data())) ;  
 }
-
 //____________________________________________________________________________
- void AliPHOSAnalyze::InvariantMass(Int_t Nevents )    
+ void AliPHOSAnalyze::InvariantMass()
 {
   // Calculates Real and Mixed invariant mass distributions
-  const Int_t NMixedEvents = 4 ; //# of events used for calculation of 'mixed' distribution 
-  Int_t MixedLoops = (Int_t )TMath::Ceil(Nevents/NMixedEvents) ;
+  if (fRunLoader == 0x0)
+   {
+     AliError(Form("Error Loading session"));
+     return;
+   }
   
-  //========== Booking Histograms
-  TH2D * hRealEM   = new TH2D("hRealEM",   "Real for EM particles",      250,0.,1.,40,0.,4.) ;
-  TH2D * hRealPhot = new TH2D("hRealPhot", "Real for kPhoton particles", 250,0.,1.,40,0.,4.) ;
-  TH2D * hMixedEM  = new TH2D("hMixedEM",  "Mixed for EM particles",     250,0.,1.,40,0.,4.) ;
-  TH2D * hMixedPhot= new TH2D("hMixedPhot","Mixed for kPhoton particles",250,0.,1.,40,0.,4.) ;
+  AliPHOSLoader* gime = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(fRunLoader->GetLoader("PHOSLoader"));
+  if ( gime == 0 ) 
+   {
+     AliError(Form("Could not obtain the Loader object !")); 
+     return ;
+   } 
   
-  Int_t ievent;
-  Int_t EventInMixedLoop ;
+  gime->LoadRecParticles("READ");
+  
+  Int_t nMixedEvents = 4 ; //# of events used for calculation of 'mixed' distribution 
   
-  Int_t NRecParticles[NMixedEvents] ;
   
-  AliPHOSRecParticle::RecParticlesList * AllRecParticleList  = new TClonesArray("AliPHOSRecParticle", NMixedEvents*1000) ;
+  //opening file
+  TFile * mfile = new TFile("invmass.root","update");
+  
+  //========== Reading /Booking Histograms
+  TH2D * hRealEM = 0 ;
+  hRealEM = (TH2D*) mfile->Get("hRealEM") ;
+  if(hRealEM == 0) 
+    hRealEM = new TH2D("hRealEM",   "Real for EM particles",      250,0.,1.,40,0.,4.) ;
+  TH2D * hRealPhot = 0 ;
+
+  hRealPhot = (TH2D*)mfile->Get("hRealPhot");
+  if(hRealPhot == 0)
+    hRealPhot = new TH2D("hRealPhot", "Real for kPhoton particles", 250,0.,1.,40,0.,4.) ;
+
+  TH2D * hMixedEM = 0 ;
+  hMixedEM = (TH2D*) mfile->Get("hMixedEM") ;
+  if(hMixedEM == 0)
+    hMixedEM = new TH2D("hMixedEM",  "Mixed for EM particles",     250,0.,1.,40,0.,4.) ;
+
+  TH2D * hMixedPhot = 0 ;
+  hMixedPhot = (TH2D*) mfile->Get("hMixedPhot") ;
+  if(hMixedPhot == 0)
+    hMixedPhot = new TH2D("hMixedPhot","Mixed for kPhoton particles",250,0.,1.,40,0.,4.) ;
+  
+
+  //reading event and copyng it to TConesArray of all photons
+
+  TClonesArray * allRecParticleList  = new TClonesArray("AliPHOSRecParticle", 1000) ;
+  Int_t * nRecParticles = new Int_t[nMixedEvents] ; // to mark boundaries of each event in the total list
+  for(Int_t index = 0; index < nMixedEvents; index ++)
+    nRecParticles[index] = 0 ;
+  Int_t iRecPhot = 0 ;                // number of EM particles in total list
   
-  for(EventInMixedLoop = 0; EventInMixedLoop < MixedLoops; EventInMixedLoop++  ){
-    Int_t iRecPhot = 0 ;
+  //scan over all events
+  Int_t event ;
+  
+
+  if (fRunLoader->TreeE() == 0x0) fRunLoader->LoadHeader();
+  
+  
+  Int_t maxevent = (Int_t)fRunLoader->TreeE()->GetEntries();
+  //  for(event = 0; event < gime->MaxEvent(); event++  ){
+  
+  
+  
+  for(event = 0; event < maxevent; event++  ){
+    fRunLoader->GetEvent(event);  //will read only TreeR 
     
-    for ( ievent=0; ievent < NMixedEvents; ievent++){        
-      
-      Int_t AbsEventNumber = EventInMixedLoop*NMixedEvents + ievent ;
-      
-      //=========== Connects the various Tree's for evt
-      gAlice->GetEvent(AbsEventNumber);
-      
-      //=========== Get the Digit Tree
-      gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
+    //copy EM RecParticles to the "total" list        
+    const AliPHOSRecParticle * recParticle ;
+    Int_t iRecParticle ;
+    TClonesArray * rp = gime->RecParticles() ;
+    if(!rp){
+      AliError(Form("Can't find RecParticles")) ; 
+      return ;
+    }
+
+    for(iRecParticle = 0; iRecParticle < rp->GetEntriesFast(); iRecParticle++ )
+      {
+       recParticle = (AliPHOSRecParticle *) rp->At(iRecParticle) ;
+       if((recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMFAST)||
+          (recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMSLOW))
+         new( (*allRecParticleList)[iRecPhot++] ) AliPHOSRecParticle(*recParticle) ;
+      }
+    
+    Int_t mevent = event%nMixedEvents ; //event number in the "mixed" cicle
+    nRecParticles[mevent] = iRecPhot-1 ;  
+    
+    //check, if it is time to calculate invariant mass?
+    Int_t maxevent = (Int_t)gAlice->TreeE()->GetEntries() ; 
+    if((mevent == 0) && (event +1 == maxevent)){
       
-      //========== Creating branches ===================================       
+      //   if((mevent == 0) && (event +1 == gime->MaxEvent())){
       
-      AliPHOSRecParticle::RecParticlesList ** RecParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;
-      if( (*RecParticleList) )
-       (*RecParticleList)->Clear() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSRP", RecParticleList ) ;
+      //calculate invariant mass:
+      Int_t irp1,irp2 ;
+      Int_t nCurEvent = 0 ;
       
-      //=========== Gets the Reconstraction TTree
-      gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
+      for(irp1 = 0; irp1 < allRecParticleList->GetEntries()-1; irp1++){
+       AliPHOSRecParticle * rp1 = (AliPHOSRecParticle *)allRecParticleList->At(irp1) ;
+       
+       for(irp2 = irp1+1; irp2 < allRecParticleList->GetEntries(); irp2++){
+         AliPHOSRecParticle * rp2 = (AliPHOSRecParticle *)allRecParticleList->At(irp2) ;
+         
+         Double_t invMass ;
+         invMass = (rp1->Energy()+rp2->Energy())*(rp1->Energy()+rp2->Energy())-
+           (rp1->Px()+rp2->Px())*(rp1->Px()+rp2->Px())-
+           (rp1->Py()+rp2->Py())*(rp1->Py()+rp2->Py())-
+           (rp1->Pz()+rp2->Pz())*(rp1->Pz()+rp2->Pz()) ;
+         
+         if(invMass> 0)
+           invMass = TMath::Sqrt(invMass);
+         
+         Double_t pt ; 
+         pt = TMath::Sqrt((rp1->Px()+rp2->Px() )*( rp1->Px()+rp2->Px() ) + 
+                        (rp1->Py()+rp2->Py() )*( rp1->Py()+rp2->Py() ) );
+         
+         if(irp1 > nRecParticles[nCurEvent])
+           nCurEvent++;
+         
+         if(irp2 <= nRecParticles[nCurEvent]){ //'Real' event
+           hRealEM->Fill(invMass,pt);
+           if((rp1->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMFAST)&&
+              (rp2->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMFAST) )
+             hRealPhot->Fill(invMass,pt);
+         }
+         else{
+           hMixedEM->Fill(invMass,pt);
+           if((rp1->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMFAST)&&
+              (rp2->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMFAST) )
+             hMixedPhot->Fill(invMass,pt);
+         } //real-mixed
+         
+      } //loop over second rp
+      }//loop over first rp
       
-      AliPHOSRecParticle * RecParticle ;
-      Int_t iRecParticle ;
-      for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*RecParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ )
-       {
-         RecParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*RecParticleList)->At(iRecParticle) ;
-         if((RecParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA)||
-            (RecParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEM)){ 
-           new( (*AllRecParticleList)[iRecPhot] ) AliPHOSRecParticle(*RecParticle) ;
-           iRecPhot++;
-         }
-       }
+      //Make some cleanings 
+      for(Int_t index = 0; index < nMixedEvents; index ++)
+       nRecParticles[index] = 0 ;
+      iRecPhot = 0 ;              
+      allRecParticleList->Clear() ;
       
-       NRecParticles[ievent] = iRecPhot-1 ;  
     }
-    
-    //Now calculate invariant mass:
-    Int_t irp1,irp2 ;
-    Int_t NCurEvent = 0 ;
-
-    for(irp1 = 0; irp1 < AllRecParticleList->GetEntries()-1; irp1++){
-      AliPHOSRecParticle * rp1 = (AliPHOSRecParticle *)AllRecParticleList->At(irp1) ;
-
-      for(irp2 = irp1+1; irp2 < AllRecParticleList->GetEntries(); irp2++){
-       AliPHOSRecParticle * rp2 = (AliPHOSRecParticle *)AllRecParticleList->At(irp2) ;
-           
-       Double_t InvMass ;
-       InvMass = (rp1->Energy()+rp2->Energy())*(rp1->Energy()+rp2->Energy())-
-         (rp1->Px()+rp2->Px())*(rp1->Px()+rp2->Px())-
-         (rp1->Py()+rp2->Py())*(rp1->Py()+rp2->Py())-
-         (rp1->Pz()+rp2->Pz())*(rp1->Pz()+rp2->Pz()) ;
-       
-       if(InvMass> 0)
-         InvMass = TMath::Sqrt(InvMass);
-       
-       Double_t Pt ; 
-       Pt = TMath::Sqrt((rp1->Px()+rp2->Px() )*( rp1->Px()+rp2->Px() ) +(rp1->Py()+rp2->Py())*(rp1->Py()+rp2->Py()));
-
-       if(irp1 > NRecParticles[NCurEvent])
-         NCurEvent++;
-           
-       if(irp2 <= NRecParticles[NCurEvent]){ //'Real' event
-         hRealEM->Fill(InvMass,Pt);
-         if((rp1->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA)&&(rp2->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA))
-           hRealPhot->Fill(InvMass,Pt);
-       }
-       else{
-         hMixedEM->Fill(InvMass,Pt);
-         if((rp1->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA)&&(rp2->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA))
-           hMixedPhot->Fill(InvMass,Pt);
-       } //real-mixed
-           
-      } //loop over second rp
-    }//loop over first rp
-    AllRecParticleList->Delete() ;
-  } //Loop over events
-  
-  delete AllRecParticleList ;
+  }
+  delete allRecParticleList ;
   
   //writing output
-  TFile output("invmass.root","RECREATE");
-  output.cd();
+  mfile->cd();
   
-  hRealEM->Write() ;
-  hRealPhot->Write() ;
-  hMixedEM->Write() ;
-  hMixedPhot->Write() ;
+  hRealEM->Write(0,kOverwrite) ;
+  hRealPhot->Write(0,kOverwrite) ;
+  hMixedEM->Write(0,kOverwrite) ;
+  hMixedPhot->Write(0,kOverwrite) ;
   
-  output.Write();
-  output.Close();
+  mfile->Write();
+  mfile->Close();
+  delete mfile ;
+  delete nRecParticles;
 
 }
 
 //____________________________________________________________________________
- void AliPHOSAnalyze::AnalyzeResolutions(Int_t Nevents )    
+ void AliPHOSAnalyze::EnergyResolution()
 {
-  // analyzes Nevents events and calculate Energy and Position resolution as well as
-  // probaility of correct indentifiing of the incident particle
+  //fills two dimentional histo: energy of primary vs. energy of reconstructed
 
-  //========== Booking Histograms
-  cout << "AnalyzeResolutions > " << "Booking Histograms" << endl ; 
-  BookResolutionHistograms();
+  TH2F * hAllEnergy = 0 ;  //all reconstructed with primary photon   
+  TH2F * hPhotEnergy= 0 ;  //kGamma  with primary photon   
+  TH2F * hEMEnergy  = 0 ;  //electromagnetic with primary photon   
 
-  Int_t Counter[9][5] ;     
-  Int_t i1,i2,TotalInd = 0 ;
-  for(i1 = 0; i1<9; i1++)
-    for(i2 = 0; i2<5; i2++)
-      Counter[i1][i2] = 0 ;
+  //opening file and reading histograms if any
+  TFile * efile = new TFile("energy.root","update");
+
+  hAllEnergy = (TH2F*)efile->Get("hAllEnergy") ;
+  if(hAllEnergy == 0)
+    hAllEnergy  = new TH2F("hAllEnergy",  "Energy of any RP with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
+
+  hPhotEnergy =(TH2F*) efile->Get("hPhotEnergy") ;
+  if(hPhotEnergy == 0)
+    hPhotEnergy = new TH2F("hPhotEnergy", "Energy of kGAMMA with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
+
+  hEMEnergy =(TH2F*) efile->Get("hEMEnergy");
+  if(hEMEnergy == 0)
+    hEMEnergy   = new TH2F("hEMEnergy",   "Energy of EM with primary photon",    100, 0., 5., 100, 0., 5.);
+
+
+  if (fRunLoader == 0x0)
+   {
+     AliError(Form("Error Loading session"));
+     return;
+   }
   
-  Int_t TotalPrimary = 0 ;
-  Int_t TotalRecPart = 0 ;
-  Int_t TotalRPwithPrim = 0 ;
+  AliPHOSLoader* gime = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(fRunLoader->GetLoader("PHOSLoader"));
+  if ( gime == 0 ) 
+   {
+     AliError(Form("Could not obtain the Loader object !")); 
+     return ;
+   } 
+
+
+  const AliPHOSGeometry * phosgeom = gime->PHOSGeometry();
+
   Int_t ievent;
+  Int_t maxevent = (Int_t)fRunLoader->TreeE()->GetEntries();
 
-  cout << "Start Analysing"<< endl ;
-  for ( ievent=0; ievent<Nevents; ievent++)
-    {  
-      
-      //========== Event Number>         
-      //      if ( ( log10((Float_t)(ievent+1)) - (Int_t)(log10((Float_t)(ievent+1))) ) == 0. ) 
-       cout <<  "AnalyzeResolutions > " << "Event is " << ievent << endl ;  
-      
-      //=========== Connects the various Tree's for evt
-      gAlice->GetEvent(ievent);
+  fRunLoader->LoadKinematics("READ");
+  gime->LoadTracks("READ");
+  
+  for ( ievent=0; ievent < maxevent ; ievent++){
 
-      //=========== Gets the Kine TTree
-      gAlice->TreeK()->GetEvent(0) ;
-      
-      //=========== Gets the list of Primari Particles
-      TClonesArray * PrimaryList  = gAlice->Particles();     
-
-      TParticle * Primary ;
-      Int_t iPrimary ;
-      for ( iPrimary = 0 ; iPrimary < PrimaryList->GetEntries() ; iPrimary++)
-       {
-         Primary = (TParticle*)PrimaryList->UncheckedAt(iPrimary) ;
-         Int_t PrimaryType = Primary->GetPdgCode() ;
-         if( PrimaryType == 22 ) {
-           Int_t ModuleNumber ;
-           Double_t PrimX, PrimZ ;
-           fGeom->ImpactOnEmc(Primary->Theta(), Primary->Phi(), ModuleNumber, PrimX, PrimZ) ;
-           if(ModuleNumber){
-             fhPrimary->Fill(Primary->Energy()) ;
-             if(Primary->Energy() > 0.3)
-               TotalPrimary++ ;
-           }
-         } 
-       }
-      
-      //=========== Get the Digit Tree
-      gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;
-      
-      //========== Creating branches ===================================       
-      AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** EmcRecPoints =  fPHOS->EmcRecPoints() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSEmcRP", EmcRecPoints ) ;
-      
-      AliPHOSRecPoint::RecPointsList ** PpsdRecPoints = fPHOS->PpsdRecPoints() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSPpsdRP", PpsdRecPoints ) ;
-      
-      AliPHOSTrackSegment::TrackSegmentsList **  TrackSegmentsList = fPHOS->TrackSegments() ;
-      if( (*TrackSegmentsList) )
-       (*TrackSegmentsList)->Clear() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSTS", TrackSegmentsList ) ;
+    //read the current event
+    fRunLoader->GetEvent(ievent) ;
+
+    const AliPHOSRecParticle * recParticle ;
+    Int_t iRecParticle ;
+    TClonesArray * rp = gime->RecParticles() ;
+    if(!rp) {
+      AliError(Form("Event %d,  Can't find RecParticles ", ievent)) ;  
+      return ;
+    }
+    TClonesArray * ts = gime->TrackSegments() ;
+    if(!ts) {
+      AliError(Form("Event %d,  Can't find TrackSegments", ievent)) ;  
+      return ;
+    }
+    TObjArray * emcrp = gime->EmcRecPoints() ;
+    if(!emcrp){
+      AliError(Form("Event %d,  Can't find EmcRecPoints")) ; 
+      return ;
+    }
       
-      AliPHOSRecParticle::RecParticlesList ** RecParticleList  = fPHOS->RecParticles() ;
-      if( (*RecParticleList) )
-       (*RecParticleList)->Clear() ;
-      gAlice->TreeR()->SetBranchAddress( "PHOSRP", RecParticleList ) ;
+    for(iRecParticle = 0; iRecParticle < rp->GetEntriesFast() ;iRecParticle++ ){
+      recParticle = (AliPHOSRecParticle *) rp->At(iRecParticle) ;
       
-      //=========== Gets the Reconstraction TTree
-      gAlice->TreeR()->GetEvent(0) ;
+      //find the closest primary
+      Int_t moduleNumberRec ;
+      Double_t recX, recZ ;
+      phosgeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), moduleNumberRec, recX, recZ) ;
       
-      AliPHOSRecParticle * RecParticle ;
-      Int_t iRecParticle ;
-      for(iRecParticle = 0; iRecParticle < (*RecParticleList)->GetEntries() ;iRecParticle++ )
-       {
-         RecParticle = (AliPHOSRecParticle *) (*RecParticleList)->At(iRecParticle) ;
-         fhAllRP->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy())) ;
-         
-         Int_t ModuleNumberRec ;
-         Double_t RecX, RecZ ;
-         fGeom->ImpactOnEmc(RecParticle->Theta(), RecParticle->Phi(), ModuleNumberRec, RecX, RecZ) ;
-         
-         Double_t MinDistance = 2. ;
-         Int_t ClosestPrimary = -1 ;
-         
-         Int_t numberofprimaries ;
-         Int_t * listofprimaries  = RecParticle->GetPrimaries(numberofprimaries)  ;
-         Int_t index ;
-         TParticle * Primary ;
-         Double_t Distance = MinDistance ;
-         for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++){
-           Primary = (TParticle*)PrimaryList->UncheckedAt(listofprimaries[index]) ;
-           Int_t ModuleNumber ;
-           Double_t PrimX, PrimZ ;
-           fGeom->ImpactOnEmc(Primary->Theta(), Primary->Phi(), ModuleNumber, PrimX, PrimZ) ;
-           if(ModuleNumberRec == ModuleNumber)
-             Distance = TMath::Sqrt((RecX-PrimX)*(RecX-PrimX)+(RecZ-PrimZ)*(RecZ-PrimZ) ) ;
-           if(MinDistance > Distance)
-             {
-               MinDistance = Distance ;
-               ClosestPrimary = listofprimaries[index] ;
-             }
-         }
-         TotalRecPart++ ;
-
-         if(ClosestPrimary >=0 ){
-           TotalRPwithPrim++;
-           
-           Int_t PrimaryType = ((TParticle *)PrimaryList->At(ClosestPrimary))->GetPdgCode() ;
-//         TParticlePDG* PDGparticle = ((TParticle *)PrimaryList->At(ClosestPrimary))->GetPDG();
-//         Double_t charge =  PDGparticle->Charge() ;
-//         if(charge)
-//           cout <<"Primary " <<PrimaryType << " E " << ((TParticle *)PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy() << endl ;
-           Int_t PrimaryCode ;
-           switch(PrimaryType)
-             {
-             case 22:
-               PrimaryCode = 0;  //Photon
-               fhAllEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy()) ;
-               fhAllPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
-               break;
-             case 11 :
-               PrimaryCode = 1;  //Electron
-               break;
-             case -11 :
-               PrimaryCode = 1;  //positron
-               break;
-             case 321 :
-               PrimaryCode = 4;  //K+
-               break;
-             case -321 :
-               PrimaryCode = 4;  //K-
-               break;
-             case 310 :
-               PrimaryCode = 4;  //K0s
-               break;
-             case 130 :
-               PrimaryCode = 4;  //K0l
-               break;
-             case 211 :
-               PrimaryCode = 2;  //K0l
-               break;
-             case -211 :
-               PrimaryCode = 2;  //K0l
-               break;
-             case 2212 :
-               PrimaryCode = 2;  //K0l
-               break;
-             case -2212 :
-               PrimaryCode = 2;  //K0l
-               break;
-             default:
-               PrimaryCode = 3; //ELSE
-               break;
-             }
-           
-           switch(RecParticle->GetType())
-             {
-             case AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA:
-               if(PrimaryType == 22){
-                 fhPhotEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy() ) ; 
-                 fhEMEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy() ) ; 
-                 fhPPSDEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy() ) ; 
-
-                 fhPhotPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
-                 fhEMPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
-                 fhPPSDPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
-
-                 fhPhotReg->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-
-                 fhPhotPhot->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               }
-               if(PrimaryType == 2112){ //neutron
-                 fhNReg->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               }
-               
-               if(PrimaryType == -2112){ //neutron ~
-                 fhNBarReg->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 
-               }
-               if(PrimaryCode == 2){
-                 fhChargedReg->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               }
-               
-               fhAllReg->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhShape->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhVeto->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               Counter[0][PrimaryCode]++;
-               break;
-             case  AliPHOSFastRecParticle::kELECTRON:
-               if(PrimaryType == 22){ 
-                 fhPhotElec->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhEMEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy() ) ; 
-                 fhEMPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
-                 fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               }         
-               if(PrimaryType == 2112){ //neutron
-                 fhNEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               }
-               
-               if(PrimaryType == -2112){ //neutron ~
-                 fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 
-               }
-               if(PrimaryCode == 2){
-                 fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               }
-               
-               fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhShape->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               Counter[1][PrimaryCode]++;
-               break;
-             case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALHA:
-               if(PrimaryType == 22) 
-                 fhPhotNeuH->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-
-               fhVeto->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;           
-               Counter[2][PrimaryCode]++;
-               break ;
-             case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEM:
-               if(PrimaryType == 22){
-                 fhEMEnergy->Fill(((TParticle *)PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),RecParticle->Energy() ) ; 
-                 fhEMPosition->Fill(((TParticle *)PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance ) ;
-               
-                 fhPhotNuEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhPhotEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               }
-               if(PrimaryType == 2112) //neutron
-                 fhNEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               
-               if(PrimaryType == -2112) //neutron ~
-                 fhNBarEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               
-               if(PrimaryCode == 2)
-                 fhChargedEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               
-               fhAllEM->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhShape->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               fhVeto->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-
-               Counter[3][PrimaryCode]++;
-               break ;
-             case  AliPHOSFastRecParticle::kCHARGEDHA:
-               if(PrimaryType == 22) //photon
-                 fhPhotChHa->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               
-               Counter[4][PrimaryCode]++ ;
-               break ;
-             case  AliPHOSFastRecParticle::kGAMMAHA:
-                 if(PrimaryType == 22){ //photon
-                   fhPhotGaHa->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                   fhPPSDEnergy->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(), RecParticle->Energy() ) ; 
-                   fhPPSDPosition->Fill(((TParticle *) PrimaryList->At(ClosestPrimary))->Energy(),MinDistance) ;
-                   fhPhotPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 }
-                 if(PrimaryType == 2112){ //neutron
-                   fhNPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 }
-               
-                 if(PrimaryType == -2112){ //neutron ~
-                   fhNBarPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ; 
-                 }
-                 if(PrimaryCode == 2){
-                   fhChargedPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 }
-               
-                 fhAllPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhVeto->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 fhPPSD->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-                 Counter[5][PrimaryCode]++ ;
-                 break ;       
-             case  AliPHOSFastRecParticle::kABSURDEM:        
-               Counter[6][PrimaryCode]++ ;
-               fhShape->Fill(CorrectEnergy(RecParticle->Energy()) ) ;
-               break;
-             case  AliPHOSFastRecParticle::kABSURDHA:
-               Counter[7][PrimaryCode]++ ;
-               break;
-             default:
-               Counter[8][PrimaryCode]++ ;
-               break;
-             }
-         }
-       }  
-    }   // endfor
-  SaveHistograms();
-  cout << "Resolutions: Analyzed " << Nevents << " event(s)" << endl ;
-  cout << "Resolutions: Total primary       " << TotalPrimary << endl ;
-  cout << "Resoluitons: Total reconstracted " << TotalRecPart << endl ;
-  cout << "TotalReconstructed with Primarie " << TotalRPwithPrim << endl ;
-  cout << "                        Primary:   Photon   Electron   Ch. Hadr.  Neutr. Hadr  Kaons" << endl ; 
-  cout << "             Detected as photon       " << Counter[0][0] << "          " << Counter[0][1] << "          " << Counter[0][2] << "          " <<Counter[0][3] << "          " << Counter[0][4] << endl ;
-  cout << "           Detected as electron       " << Counter[1][0] << "          " << Counter[1][1] << "          " << Counter[1][2] << "          " <<Counter[1][3] << "          " << Counter[1][4] << endl ; 
-  cout << "     Detected as neutral hadron       " << Counter[2][0] << "          " << Counter[2][1] << "          " << Counter[2][2] << "          " <<Counter[2][3] << "          " << Counter[2][4] << endl ;
-  cout << "         Detected as neutral EM       " << Counter[3][0] << "          " << Counter[3][1] << "          " << Counter[3][2] << "          " <<Counter[3][3] << "          " << Counter[3][4] << endl ;
-  cout << "     Detected as charged hadron       " << Counter[4][0] << "          " << Counter[4][1] << "          " << Counter[4][2] << "          " <<Counter[4][3] << "          " << Counter[4][4] << endl ;
-  cout << "       Detected as gamma-hadron       " << Counter[5][0] << "          " << Counter[5][1] << "          " << Counter[5][2] << "          " <<Counter[5][3] << "          " << Counter[5][4] << endl ;
-  cout << "          Detected as Absurd EM       " << Counter[6][0] << "          " << Counter[6][1] << "          " << Counter[6][2] << "          " <<Counter[6][3] << "          " << Counter[6][4] << endl ;
-  cout << "      Detected as absurd hadron       " << Counter[7][0] << "          " << Counter[7][1] << "          " << Counter[7][2] << "          " <<Counter[7][3] << "          " << Counter[7][4] << endl ;
-  cout << "          Detected as undefined       " << Counter[8][0] << "          " << Counter[8][1] << "          " << Counter[8][2] << "          " <<Counter[8][3] << "          " << Counter[8][4] << endl ;
+      Double_t minDistance  = 100. ;
+      Int_t closestPrimary = -1 ;
       
-      for(i1 = 0; i1<9; i1++)
-       for(i2 = 0; i2<5; i2++)
-         TotalInd+=Counter[i1][i2] ;
-      cout << "Indentified particles            " << TotalInd << endl ;
+      //extract list of primaries: it is stored at EMC RecPoints
+      Int_t emcIndex = ((AliPHOSTrackSegment*) ts->At(recParticle->GetPHOSTSIndex()))->GetEmcIndex() ;
+      Int_t numberofprimaries ;
+      Int_t * listofprimaries  = ((AliPHOSEmcRecPoint*) emcrp->At(emcIndex))->GetPrimaries(numberofprimaries)  ;
       
-}           // endfunction
+      Int_t index ;
+      const TParticle * primary ;
+      Double_t distance = minDistance ;
+      Double_t dX, dZ; 
+      Double_t dXmin = 0.; 
+      Double_t dZmin = 0. ;
+      for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++){
+
+       primary = fRunLoader->Stack()->Particle(listofprimaries[index]) ;
+
+       Int_t moduleNumber ;
+       Double_t primX, primZ ;
+       phosgeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+       if(moduleNumberRec == moduleNumber) {
+         dX = recX - primX;
+         dZ = recZ - primZ;
+         distance = TMath::Sqrt(dX*dX + dZ*dZ) ;
+         if(minDistance > distance) {
+           minDistance = distance ;
+           dXmin = dX;
+           dZmin = dZ;
+           closestPrimary = listofprimaries[index] ;
+         }
+       }
+      }
 
+      //if found primary, fill histograms
+      if(closestPrimary >=0 ){
+       const TParticle * primary = fRunLoader->Stack()->Particle(closestPrimary) ;
+       if(primary->GetPdgCode() == 22){
+         hAllEnergy->Fill(primary->Energy(), recParticle->Energy()) ;
+         if(recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMFAST){
+           hPhotEnergy->Fill(primary->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
+           hEMEnergy->Fill(primary->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
+         }
+         else
+           if(recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMSLOW)
+             hEMEnergy->Fill(primary->Energy(), recParticle->Energy() ) ; 
+       }
+      }
+    }
+  }
 
-//____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSAnalyze::BookingHistograms()
-{
-  // Books the histograms where the results of the analysis are stored (to be changed)
-
-  delete fhEmcDigit  ;
-  delete fhVetoDigit  ;
-  delete fhConvertorDigit   ;
-  delete  fhEmcCluster   ;
-  delete fhVetoCluster   ;
-  delete fhConvertorCluster  ;
-  delete fhConvertorEmc  ;
-  
-  fhEmcDigit                = new TH1F("hEmcDigit",      "hEmcDigit",         1000,  0. ,  25.);
-  fhVetoDigit               = new TH1F("hVetoDigit",     "hVetoDigit",         500,  0. ,  3.e-5);
-  fhConvertorDigit          = new TH1F("hConvertorDigit","hConvertorDigit",    500,  0. ,  3.e-5);
-  fhEmcCluster              = new TH1F("hEmcCluster",    "hEmcCluster",       1000,  0. ,  30.);
-  fhVetoCluster             = new TH1F("hVetoCluster",   "hVetoCluster",       500,  0. ,  3.e-5);
-  fhConvertorCluster        = new TH1F("hConvertorCluster","hConvertorCluster",500,  0. ,  3.e-5);
-  fhConvertorEmc            = new TH2F("hConvertorEmc",  "hConvertorEmc",      200,  1. ,  3., 200, 0., 3.e-5);
+  //write filled histograms
+  efile->cd() ;
+  hAllEnergy->Write(0,kOverwrite) ;
+  hPhotEnergy->Write(0,kOverwrite) ;
+  hEMEnergy->Write(0,kOverwrite)  ;
+  //  efile->Write() ;
+  efile->Close() ;
+  delete efile ;
 
 }
 //____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSAnalyze::BookResolutionHistograms()
+void AliPHOSAnalyze::PositionResolution()
 {
-  // Books the histograms where the results of the Resolution analysis are stored
-
-//   if(fhAllEnergy)
-//     delete fhAllEnergy ;
-//   if(fhPhotEnergy)
-//     delete fhPhotEnergy ;
-//   if(fhEMEnergy)
-//     delete fhEMEnergy ;
-//   if(fhPPSDEnergy)
-//     delete fhPPSDEnergy ;
-
-
-  fhAllEnergy  = new TH2F("hAllEnergy",  "Energy of any RP with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
-  fhPhotEnergy = new TH2F("hPhotEnergy", "Energy of kGAMMA with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
-  fhEMEnergy   = new TH2F("hEMEnergy",   "Energy of EM with primary photon",    100, 0., 5., 100, 0., 5.);
-  fhPPSDEnergy = new TH2F("hPPSDEnergy", "Energy of PPSD with primary photon",  100, 0., 5., 100, 0., 5.);
-
-//   if(fhAllPosition)
-//     delete fhAllPosition ;
-//   if(fhPhotPosition)
-//     delete fhPhotPosition ;
-//   if(fhEMPosition)
-//     delete fhEMPosition ;
-//   if(fhPPSDPosition)
-//     delete fhPPSDPosition ;
-
-
-  fhAllPosition  = new TH2F("hAllPosition",  "Position of any RP with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
-  fhPhotPosition = new TH2F("hPhotPosition", "Position of kGAMMA with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
-  fhEMPosition   = new TH2F("hEMPosition",   "Position of EM with primary photon",    100, 0., 5., 100, 0., 5.);
-  fhPPSDPosition = new TH2F("hPPSDPosition", "Position of PPSD with primary photon",  100, 0., 5., 100, 0., 5.);
-
-//   if(fhAllReg)
-//     delete fhAllReg ;
-//   if(fhPhotReg)
-//     delete fhPhotReg ;
-//   if(fhNReg)
-//     delete fhNReg ;
-//   if(fhNBarReg)
-//     delete fhNBarReg ;
-//   if(fhChargedReg)
-//     delete fhChargedReg ;
-  
-  fhAllReg    = new TH1F("hAllReg",    "All primaries registered as photon",  100, 0., 5.);
-  fhPhotReg   = new TH1F("hPhotReg",   "Photon registered as photon",         100, 0., 5.);
-  fhNReg      = new TH1F("hNReg",      "N registered as photon",              100, 0., 5.);
-  fhNBarReg   = new TH1F("hNBarReg",   "NBar registered as photon",           100, 0., 5.);
-  fhChargedReg= new TH1F("hChargedReg", "Charged hadron registered as photon",100, 0., 5.);
-  
-//   if(fhAllEM)
-//     delete fhAllEM ;
-//   if(fhPhotEM)
-//     delete fhPhotEM ;
-//   if(fhNEM)
-//     delete fhNEM ;
-//   if(fhNBarEM)
-//     delete fhNBarEM ;
-//   if(fhChargedEM)
-//     delete fhChargedEM ;
-  
-  fhAllEM    = new TH1F("hAllEM",    "All primary registered as EM",100, 0., 5.);
-  fhPhotEM   = new TH1F("hPhotEM",   "Photon registered as EM", 100, 0., 5.);
-  fhNEM      = new TH1F("hNEM",      "N registered as EM",      100, 0., 5.);
-  fhNBarEM   = new TH1F("hNBarEM",   "NBar registered as EM",   100, 0., 5.);
-  fhChargedEM= new TH1F("hChargedEM","Charged registered as EM",100, 0., 5.);
-
-//   if(fhAllPPSD)
-//     delete fhAllPPSD ;
-//   if(fhPhotPPSD)
-//     delete fhPhotPPSD ;
-//   if(fhNPPSD)
-//     delete fhNPPSD ;
-//   if(fhNBarPPSD)
-//     delete fhNBarPPSD ;
-//   if(fhChargedPPSD)
-//     delete fhChargedPPSD ;
+  //fills two dimentional histo: energy vs. primary - reconstructed distance  
+
+
+
+  TH2F * hAllPosition  = 0;     // Position of any RP with primary photon
+  TH2F * hPhotPosition = 0;    // Position of kGAMMA with primary photon
+  TH2F * hEMPosition   = 0;      // Position of EM with primary photon
+
+  TH1F * hAllPositionX = 0;    // X-Position Resolution of photons with photon primary
+  TH1F * hAllPositionZ = 0;    // Z-Position Resolution of photons with photon primary
+
+
+  //opening file and reading histograms if any
+  TFile * pfile = new TFile("position.root","update");
+
+  hAllPosition = (TH2F*)pfile->Get("hAllPosition");
+  if(hAllPosition == 0)
+    hAllPosition  = new TH2F("hAllPosition",  
+                          "Position of any RP with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
+  hPhotPosition= (TH2F*)pfile->Get("hPhotPosition");
+  if(hPhotPosition == 0)
+    hPhotPosition = new TH2F("hPhotPosition", 
+                          "Position of kGAMMA with primary photon",100, 0., 5., 100, 0., 5.);
+  hEMPosition= (TH2F*)pfile->Get("hEMPosition") ;
+  if(hEMPosition == 0)
+    hEMPosition   = new TH2F("hEMPosition",   
+                          "Position of EM with primary photon",    100, 0., 5., 100, 0., 5.);
+  hAllPositionX = (TH1F*)pfile->Get("hAllPositionX") ;                        
+  if(hAllPositionX == 0)
+    hAllPositionX = new TH1F("hAllPositionX", 
+                          "Delta X of any RP with primary photon",100, -2., 2.);
+  hAllPositionZ =(TH1F*) pfile->Get("hAllPositionZ") ;
+  if(hAllPositionZ == 0)
+    hAllPositionZ = new TH1F("hAllPositionZ", 
+                          "Delta X of any RP with primary photon",100, -2., 2.);
+
+  if (fRunLoader == 0x0)
+   {
+     AliError(Form("Error Loading session"));
+     return;
+   }
   
-  fhAllPPSD    = new TH1F("hAllPPSD",    "All primary registered as PPSD",100, 0., 5.);
-  fhPhotPPSD   = new TH1F("hPhotPPSD",   "Photon registered as PPSD", 100, 0., 5.);
-  fhNPPSD      = new TH1F("hNPPSD",      "N registered as PPSD",      100, 0., 5.);
-  fhNBarPPSD   = new TH1F("hNBarPPSD",   "NBar registered as PPSD",   100, 0., 5.);
-  fhChargedPPSD= new TH1F("hChargedPPSD","Charged registered as PPSD",100, 0., 5.);
+  AliPHOSLoader* gime = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(fRunLoader->GetLoader("PHOSLoader"));
+  if ( gime == 0 ) 
+   {
+     AliError(Form("Could not obtain the Loader object !")); 
+     return ;
+   } 
   
-//   if(fhPrimary)
-//     delete fhPrimary ;
-  fhPrimary= new TH1F("hPrimary", "hPrimary",  100, 0., 5.);
-
-//   if(fhAllRP)
-//     delete fhAllRP ;
-//   if(fhVeto)
-//     delete fhVeto ;
-//   if(fhShape)
-//     delete fhShape ;
-//   if(fhPPSD)
-//     delete fhPPSD ;
-
-  fhAllRP = new TH1F("hAllRP","All Reconstructed particles",  100, 0., 5.);
-  fhVeto  = new TH1F("hVeto", "All uncharged particles",      100, 0., 5.);
-  fhShape = new TH1F("hShape","All particles with EM shaower",100, 0., 5.);
-  fhPPSD  = new TH1F("hPPSD", "All PPSD photon particles",    100, 0., 5.);
-
-
-//   if(fhPhotPhot)
-//     delete fhPhotPhot ;
-//   if(fhPhotElec)
-//     delete fhPhotElec ;
-//   if(fhPhotNeuH)
-//     delete fhPhotNeuH ;
-//   if(fhPhotNuEM)
-//     delete fhPhotNuEM ;
-//   if(fhPhotChHa)
-//     delete fhPhotChHa ;
-//   if(fhPhotGaHa)
-//     delete fhPhotGaHa ;
-
-  fhPhotPhot = new TH1F("hPhotPhot","hPhotPhot", 100, 0., 5.);   //Photon registered as photon
-  fhPhotElec = new TH1F("hPhotElec","hPhotElec", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Electron
-  fhPhotNeuH = new TH1F("hPhotNeuH","hPhotNeuH", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Neutral Hadron
-  fhPhotNuEM = new TH1F("hPhotNuEM","hPhotNuEM", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Neutral EM
-  fhPhotChHa = new TH1F("hPhotChHa","hPhotChHa", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Charged Hadron
-  fhPhotGaHa = new TH1F("hPhotGaHa","hPhotGaHa", 100, 0., 5.);   //Photon registered as Gamma-Hadron
-
+  if (fRunLoader->TreeE() == 0x0) fRunLoader->LoadHeader();
 
-}
-//____________________________________________________________________________
-Bool_t AliPHOSAnalyze::Init(Int_t evt)
-{
-  // Do a few initializations: open the root file
-  //                           get the AliRun object
-  //                           defines the clusterizer, tracksegment maker and particle identifier
-  //                           sets the associated parameters
+  const AliPHOSGeometry * phosgeom = gime->PHOSGeometry() ; 
 
-  Bool_t ok = kTRUE ; 
-  
-   //========== Open galice root file  
-
-  if ( fRootFile == 0 ) {
-    Text_t * name  = new Text_t[80] ; 
-    cout << "AnalyzeOneEvent > Enter file root file name : " ;  
-    cin >> name ; 
-    Bool_t ok = OpenRootFile(name) ; 
-    if ( !ok )
-      cout << " AliPHOSAnalyze > Error opening " << name << endl ; 
-    else { 
-      //========== Get AliRun object from file 
+  Int_t ievent;
+  Int_t maxevent = (Int_t)fRunLoader->TreeE()->GetEntries() ; 
+  for ( ievent=0; ievent < maxevent ; ievent++){
+    
+    //read the current event
+    fRunLoader->GetEvent(ievent) ;
+    TClonesArray * rp = gime->RecParticles() ;
+    if(!rp) {
+      AliError(Form("Event %d,  Can't find RecParticles", ievent)) ;
+      return ;
+    }
+    TClonesArray * ts = gime->TrackSegments() ;
+    if(!ts) {
+      AliError(Form("Event %d,  Can't find TrackSegments", ievent)) ;
+      return ;
+    }
+    TObjArray * emcrp = gime->EmcRecPoints() ;
+    if(!emcrp){
+      AliError(Form("Event %d,  Can't find EmcRecPoints", ievent)) ;
+      return ;
+    }
+    
+    const AliPHOSRecParticle * recParticle ;
+    Int_t iRecParticle ;
+    for(iRecParticle = 0; iRecParticle < rp->GetEntriesFast(); iRecParticle++ ){
+      recParticle = (AliPHOSRecParticle *) rp->At(iRecParticle) ;
       
-      gAlice = (AliRun*) fRootFile->Get("gAlice") ;
+      //find the closest primary
+      Int_t moduleNumberRec ;
+      Double_t recX, recZ ;
+      phosgeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), moduleNumberRec, recX, recZ) ;
       
-      //=========== Get the PHOS object and associated geometry from the file 
+      Double_t minDistance  = 100. ;
+      Int_t closestPrimary = -1 ;
       
-      fPHOS  = (AliPHOSv1 *)gAlice->GetDetector("PHOS") ;
-      fGeom = fPHOS->GetGeometry();
-      //      fGeom  = AliPHOSGeometry::GetInstance( fPHOS->GetGeometry()->GetName(), fPHOS->GetGeometry()->GetTitle() );
+      //extract list of primaries: it is stored at EMC RecPoints
+      Int_t emcIndex = ((AliPHOSTrackSegment*) ts->At(recParticle->GetPHOSTSIndex()))->GetEmcIndex() ;
+      Int_t numberofprimaries ;
+      Int_t * listofprimaries  = ((AliPHOSEmcRecPoint *) emcrp->At(emcIndex))->GetPrimaries(numberofprimaries)  ;
 
-    } // else !ok
-  } // if fRootFile
-  
-  if ( ok ) {
-    
-    //========== Create the Clusterizer
-
-    fClu =  new AliPHOSClusterizerv1() ; 
-    fClu->SetEmcEnergyThreshold(0.030) ; 
-    fClu->SetEmcClusteringThreshold(0.20) ; 
-    fClu->SetPpsdEnergyThreshold    (0.0000002) ; 
-    fClu->SetPpsdClusteringThreshold(0.0000001) ; 
-    fClu->SetLocalMaxCut(0.03) ;
-    fClu->SetCalibrationParameters(0., 0.00000001) ;  
-    cout <<  "AnalyzeOneEvent > using clusterizer " << fClu->GetName() << endl ; 
-    fClu->PrintParameters() ; 
-    
-    //========== Creates the track segment maker
-    
-    fTrs = new AliPHOSTrackSegmentMakerv1() ;
-    cout <<  "AnalyzeOneEvent > using tack segment maker " << fTrs->GetName() << endl ; 
-    //   fTrs->UnsetUnfoldFlag() ;
-    
-    //========== Creates the particle identifier
-    
-    fPID = new AliPHOSPIDv1() ;
-    cout <<  "AnalyzeOneEvent > using particle identifier " << fPID->GetName() << endl ; 
-    //fPID->SetShowerProfileCuts(Float_t l1m, Float_t l1M, Float_t l2m, Float_t l2M) ; 
-    fPID->SetShowerProfileCuts(0.7, 2.0 , 0.6 , 1.5) ; 
-
-    //========== Creates the Reconstructioner  
-    
-    fRec = new AliPHOSReconstructioner(fClu, fTrs, fPID) ;
-//      fRec -> SetDebugReconstruction(kFALSE);     
-    fRec -> SetDebugReconstruction(kTRUE);     
-    
-    //=========== Connect the various Tree's for evt
-    
-    if ( evt == -999 ) {
-      cout <<  "AnalyzeOneEvent > Enter event number : " ; 
-      cin >> evt ;  
-      cout << evt << endl ; 
+      Int_t index ;
+      const TParticle * primary ;
+      Double_t distance = minDistance ;
+      Double_t dX = 1000; // incredible number
+      Double_t dZ = 1000; // for the case if no primary will be found
+      Double_t dXmin = 0.; 
+      Double_t dZmin = 0. ;
+      for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++){
+       primary = fRunLoader->Stack()->Particle(listofprimaries[index]) ;
+       Int_t moduleNumber ;
+       Double_t primX, primZ ;
+       phosgeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+       if(moduleNumberRec == moduleNumber) {
+         dX = recX - primX;
+         dZ = recZ - primZ;
+         distance = TMath::Sqrt(dX*dX + dZ*dZ) ;
+         if(minDistance > distance) {
+           minDistance = distance ;
+           dXmin = dX;
+           dZmin = dZ;
+           closestPrimary = listofprimaries[index] ;
+         }
+       }
+      }
+      
+      //if found primary, fill histograms
+      if(closestPrimary >=0 ){
+       const TParticle * primary = fRunLoader->Stack()->Particle(closestPrimary) ;
+       if(primary->GetPdgCode() == 22){
+         hAllPosition->Fill(primary->Energy(), minDistance) ;
+         hAllPositionX->Fill(primary->Energy(), dX) ;
+         hAllPositionZ->Fill(primary->Energy(), dZ) ;
+         if(recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMFAST){
+           hPhotPosition->Fill(primary->Energy(), minDistance ) ; 
+           hEMPosition->Fill(primary->Energy(), minDistance ) ; 
+         }
+         else
+           if(recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMSLOW)
+             hEMPosition->Fill(primary->Energy(), minDistance ) ; 
+       }
+      }
     }
-    fEvt = evt ; 
-    gAlice->GetEvent(evt);
-    
-    //=========== Get the Digit TTree
-    
-    gAlice->TreeD()->GetEvent(0) ;     
-    
-  } // ok
+  }
   
-  return ok ; 
-}
+  //Write output histgrams
+  pfile->cd() ;
+  hAllPosition->Write(0,kOverwrite) ;
+  hAllPositionX->Write(0,kOverwrite) ;
+  hAllPositionZ->Write(0,kOverwrite) ;
+  hPhotPosition->Write(0,kOverwrite) ;
+  hEMPosition->Write(0,kOverwrite) ;
+  pfile->Write() ;
+  pfile->Close() ;
+  delete pfile ;
 
 
+}
 //____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::DisplayKineEvent(Int_t evt)
-{
-  // Display particles from the Kine Tree in global Alice (theta, phi) coordinates. 
-  // One PHOS module at the time.
-  // The particle type can be selected.
+void AliPHOSAnalyze::Contamination(){
+// fills spectra of primary photons and several kinds of 
+// reconstructed particles, so that analyzing them one can 
+// estimate conatmination, efficiency of registration etc.
+
+  //define several general histograms
+  TH1F * hPrimary = 0;   //spectrum (P_t distribution) of primary photons         
+  TH1F * hAllRP   = 0;   //spectrum of all RecParticles in PHOS
+  TH1F * hPhot    = 0;   //spectrum of kGAMMA RecParticles
+  TH1F * hShape   = 0;   //spectrum of all EM RecParticles
+  TH1F * hVeto    = 0;   //spectrum of all neutral RecParticles
+
+  //Now separate histograms in accoradance with primary
+  //primary - photon
+  TH1F * hPhotReg = 0;   //Registeres as photon
+  TH1F * hPhotEM  = 0;   //Registered as EM       
+
+  //primary - n
+  TH1F * hNReg = 0;   //Registeres as photon          
+  TH1F * hNEM  = 0;   //Registered as EM            
+
+  //primary - nBar
+  TH1F * hNBarReg = 0;   //Registeres as photon
+  TH1F * hNBarEM  = 0;   //Registered as EM          
+
+  //primary - charged hadron (pBar excluded)
+  TH1F * hChargedReg = 0;   //Registeres as photon  
+  TH1F * hChargedEM  = 0;   //Registered as EM           
+
+  //primary - pBar
+  TH1F * hPbarReg = 0;   //Registeres as photon  
+  TH1F * hPbarEM  = 0;   //Registered as EM 
+
+
+  //Reading histograms from the file
+  TFile * cfile = new TFile("contamination.root","update") ;
+
+  //read general histograms
+  hPrimary = (TH1F*) cfile->Get("hPrimary") ;
+  if(hPrimary == 0)
+    hPrimary= new TH1F("hPrimary", "Primary photon spectrum", 100, 0., 5.);
+  hAllRP = (TH1F*)cfile->Get("hAllRP") ;
+  if(hAllRP == 0)
+    hAllRP = new TH1F("hAllRP","All Reconstructed particles", 100, 0., 5.);
+  hPhot  = (TH1F*)cfile->Get("hPhot") ;
+  if(hPhot == 0)
+    hPhot = new TH1F("hPhot","All kGAMMA RecParticles",100, 0., 5.);
+  hShape = (TH1F*) cfile->Get("hShape") ;
+  if(hShape == 0)
+    hShape = new TH1F("hShape","All particles with EM shower",100, 0., 5.);
+  hVeto= (TH1F*)cfile->Get("hVeto") ;
+  if(hVeto == 0) 
+    hVeto  = new TH1F("hVeto", "All uncharged particles",      100, 0., 5.);
+
+
+  //primary - photon
+  hPhotReg = (TH1F*)cfile->Get("hPhotReg");
+  if(hPhotReg == 0)
+    hPhotReg   = new TH1F("hPhotReg","Photon registered as photon",100, 0., 5.);
+  hPhotEM  =(TH1F*)cfile->Get("hPhotEM");
+  if(hPhotEM== 0)
+    hPhotEM   = new TH1F("hPhotEM",  "Photon registered as EM", 100, 0., 5.);
+
+  //primary - n
+  hNReg = (TH1F*)cfile->Get("hNReg");
+  if(hNReg== 0)
+   hNReg      = new TH1F("hNReg",   "N registered as photon",              100, 0., 5.);
+  hNEM  = (TH1F*)cfile->Get("hNEM"); 
+  if(hNEM== 0)
+    hNEM      = new TH1F("hNEM",    "N registered as EM",      100, 0., 5.);
+
+  //primary - nBar
+  hNBarReg =(TH1F*)cfile->Get("hNBarReg");
+  if(hNBarReg== 0)
+   hNBarReg   = new TH1F("hNBarReg", "NBar registered as photon",           100, 0., 5.);
+  hNBarEM  =(TH1F*)cfile->Get("hNBarEM"); 
+  if(hNBarEM== 0)
+    hNBarEM   = new TH1F("hNBarEM",  "NBar registered as EM",   100, 0., 5.);
+
+  //primary - charged hadron (pBar excluded)
+  hChargedReg = (TH1F*)cfile->Get("hChargedReg");
+  if(hChargedReg== 0)
+    hChargedReg= new TH1F("hChargedReg", "Charged hadron registered as photon",100, 0., 5.);
+  hChargedEM  = (TH1F*)cfile->Get("hChargedEM"); 
+  if(hChargedEM== 0)
+    hChargedEM= new TH1F("hChargedEM","Charged registered as EM",100, 0., 5.);
+  //primary - pBar
+  hPbarReg = (TH1F*)cfile->Get("hPbarReg");
+  if(hPbarReg== 0)
+    hPbarReg= new TH1F("hPbarReg", "pBar registered as photon",100, 0., 5.);
+  hPbarEM  = (TH1F*)cfile->Get("hPbarEM");
+  if(hPbarEM== 0)
+    hPbarEM= new TH1F("hPbarEM","Pbar registered as EM",100, 0., 5.);
   
-  if (evt == -999) 
-    evt = fEvt ;
-
-  Int_t module ; 
-  cout <<  "DisplayKineEvent > which module (1-5,  -1: all) ? " ; 
-  cin >> module ; cout << module << endl ; 
-
-  Int_t testparticle ; 
-  cout << " 22      : PHOTON " << endl 
-       << " (-)11   : (POSITRON)ELECTRON " << endl 
-       << " (-)2112 : (ANTI)NEUTRON " << endl  
-       << " -999    : Everything else " << endl ; 
-  cout  <<  "DisplayKineEvent > enter PDG particle code to display " ; 
-  cin >> testparticle ; cout << testparticle << endl ; 
-
-  Text_t histoname[80] ;
-  sprintf(histoname,"Event %d: Incident particles in module %d", evt, module) ; 
-
-  Double_t tm, tM, pm, pM ; // min and Max theta and phi covered by module   
-  fGeom->EmcModuleCoverage(module, tm, tM, pm, pM, AliPHOSGeometry::Degre() ) ;
-
-  Double_t theta, phi ; 
-  fGeom->EmcXtalCoverage(theta, phi, AliPHOSGeometry::Degre() ) ;
 
-  Int_t tdim = (Int_t)( (tM - tm) / theta ) ; 
-  Int_t pdim = (Int_t)( (pM - pm) / phi ) ; 
+  //Now make some initializations
 
-  tm -= theta ; 
-  tM += theta ; 
-  pm -= phi ; 
-  pM += phi ; 
-
-  TH2F * histoparticle = new TH2F("histoparticle",  histoname, 
-                                         pdim, pm, pM, tdim, tm, tM) ; 
-  histoparticle->SetStats(kFALSE) ;
-
-  // Get pointers to Alice Particle TClonesArray
-
-  TParticle * particle;
-  TClonesArray * particlearray  = gAlice->Particles();    
+  Int_t counter[8][5] ;      //# of registered particles 
+  Int_t i1,i2 ;
+  for(i1 = 0; i1<8; i1++)
+    for(i2 = 0; i2<5; i2++)
+      counter[i1][i2] = 0 ;
 
-  Text_t canvasname[80];
-  sprintf(canvasname,"Particles incident in PHOS/EMC module # %d",module) ;
-  TCanvas * kinecanvas = new TCanvas("kinecanvas", canvasname, 650, 500) ; 
 
-  // get the KINE Tree
 
-  TTree * kine =  gAlice->TreeK() ; 
-  Stat_t nParticles =  kine->GetEntries() ; 
-  cout << "DisplayKineEvent > events in kine " << nParticles << endl ; 
+  if (fRunLoader == 0x0)
+   {
+     AliError(Form("Error Loading session"));
+     return;
+   }
   
-  // loop over particles
-
-  Double_t kRADDEG = 180. / TMath::Pi() ; 
-  Int_t index1 ; 
-  Int_t nparticlein = 0 ; 
-  for (index1 = 0 ; index1 < nParticles ; index1++){
-    Int_t nparticle = particlearray->GetEntriesFast() ;
-    Int_t index2 ; 
-    for( index2 = 0 ; index2 < nparticle ; index2++) {         
-      particle            = (TParticle*)particlearray->UncheckedAt(index2) ;
-      Int_t  particletype = particle->GetPdgCode() ;
-      if (testparticle == -999 || testparticle == particletype) { 
-       Double_t phi        = particle->Phi() ;
-       Double_t theta      = particle->Theta() ;
-       Int_t mod ; 
-       Double_t x, z ; 
-       fGeom->ImpactOnEmc(theta, phi, mod, z, x) ;
-       if ( mod == module ) {
-         nparticlein++ ; 
-         if (particle->Energy() >  fClu->GetEmcClusteringThreshold()  )
-           histoparticle->Fill(phi*kRADDEG, theta*kRADDEG, particle->Energy() ) ; 
-       } 
-      } 
+  AliPHOSLoader* gime = dynamic_cast<AliPHOSLoader*>(fRunLoader->GetLoader("PHOSLoader"));
+  if ( gime == 0 ) 
+   {
+     AliError(Form("Could not obtain the Loader object !")); 
+     return ;
+   } 
+  
+  if (fRunLoader->TreeE() == 0x0) fRunLoader->LoadHeader();
+  const AliPHOSGeometry * phosgeom = gime->PHOSGeometry() ; 
+  
+  Int_t ievent;
+  Int_t maxevent = (Int_t)fRunLoader->TreeE()->GetEntries() ; 
+  for ( ievent=0; ievent < maxevent ; ievent++){
+    
+    fRunLoader->GetEvent(ievent) ;
+    
+    TClonesArray * rp = gime->RecParticles() ;
+    if(!rp) {
+      AliError(Form("Event %d,  Can't find RecParticles", ievent)) ;
+      return ;
     }
-  }
-  kinecanvas->Draw() ; 
-  histoparticle->Draw("color") ; 
-  TPaveText *  pavetext = new TPaveText(294, 100, 300, 101); 
-  Text_t text[40] ; 
-  sprintf(text, "Particles: %d ", nparticlein) ;
-  pavetext->AddText(text) ; 
-  pavetext->Draw() ; 
-  kinecanvas->Update(); 
-
-}
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::DisplayRecParticles()
-{
-  // Display reconstructed particles in global Alice(theta, phi) coordinates. 
-  // One PHOS module at the time.
-  // Click on symbols indicate the reconstructed particle type. 
-
-  if (fEvt == -999) {
-    cout << "DisplayRecParticles > Analyze an event first ... (y/n) " ; 
-    Text_t answer[1] ; 
-    cin >> answer ; cout << answer ; 
-//     if ( answer == "y" ) 
-//       AnalyzeOneEvent() ;
-  } 
-    if (fEvt != -999) {
-      
-      Int_t module ; 
-      cout <<  "DisplayRecParticles > which module (1-5,  -1: all) ? " ; 
-      cin >> module ; cout << module << endl ;
-      Text_t histoname[80] ; 
-      sprintf(histoname,"Event %d: Reconstructed particles in module %d", fEvt, module) ; 
-      Double_t tm, tM, pm, pM ; // min and Max theta and phi covered by module   
-      fGeom->EmcModuleCoverage(module, tm, tM, pm, pM, AliPHOSGeometry::Degre() ) ;
-      Double_t theta, phi ; 
-      fGeom->EmcXtalCoverage(theta, phi, AliPHOSGeometry::Degre() ) ;
-      Int_t tdim = (Int_t)( (tM - tm) / theta ) ; 
-      Int_t pdim = (Int_t)( (pM - pm) / phi ) ; 
-      tm -= theta ; 
-      tM += theta ; 
-      pm -= phi ; 
-      TH2F * histoRparticle = new TH2F("histoRparticle",  histoname, 
-                                      pdim, pm, pM, tdim, tm, tM) ; 
-      histoRparticle->SetStats(kFALSE) ;
-      Text_t canvasname[80] ; 
-      sprintf(canvasname, "Reconstructed particles in PHOSmodule # %d", module) ;
-      TCanvas * rparticlecanvas = new TCanvas("RparticleCanvas", canvasname, 650, 500) ; 
-      AliPHOSRecParticle::RecParticlesList * rpl = *fPHOS->RecParticles() ; 
-      Int_t nRecParticles = rpl->GetEntries() ; 
-      Int_t nRecParticlesInModule = 0 ; 
-      TIter nextRecPart(rpl) ; 
-      AliPHOSRecParticle * rp ; 
-      cout << "DisplayRecParticles > " << nRecParticles << " reconstructed particles " << endl ; 
-      Double_t kRADDEG = 180. / TMath::Pi() ; 
-      while ( (rp = (AliPHOSRecParticle *)nextRecPart() ) ) {
-       AliPHOSTrackSegment * ts = rp->GetPHOSTrackSegment() ; 
-       if ( ts->GetPHOSMod() == module ) {
-         Int_t numberofprimaries = 0 ;
-         Int_t * listofprimaries = 0;
-         rp->GetPrimaries(numberofprimaries) ;
-         cout << "Number of primaries = " << numberofprimaries << endl ; 
-         Int_t index ;
-         for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++)
-           cout << "    primary # " << index << " =  " << listofprimaries[index] << endl ;  
-         
-         nRecParticlesInModule++ ; 
-         Double_t theta = rp->Theta() * kRADDEG ;
-         Double_t phi   = rp->Phi() * kRADDEG ;
-         Double_t energy = rp->Energy() ; 
-         histoRparticle->Fill(phi, theta, energy) ;
-       }
-      }
-      histoRparticle->Draw("color") ; 
-
-      nextRecPart.Reset() ; 
-      while ( (rp = (AliPHOSRecParticle *)nextRecPart() ) ) {
-       AliPHOSTrackSegment * ts = rp->GetPHOSTrackSegment() ; 
-       if ( ts->GetPHOSMod() == module )  
-         rp->Draw("P") ; 
-      }
-
-      Text_t text[80] ; 
-      sprintf(text, "reconstructed particles: %d", nRecParticlesInModule) ;
-      TPaveText *  pavetext = new TPaveText(292, 100, 300, 101); 
-      pavetext->AddText(text) ; 
-      pavetext->Draw() ; 
-      rparticlecanvas->Update() ; 
+    TClonesArray * ts = gime->TrackSegments() ;
+    if(!ts) {
+      AliError(Form("Event %d,  Can't find TrackSegments", ievent)) ;
+      return ;
     }
-}
-
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::DisplayRecPoints()
-{
-  // Display reconstructed points in local PHOS-module (x, z) coordinates. 
-  // One PHOS module at the time.
-  // Click on symbols displays the EMC cluster, or PPSD information.
-
-  if (fEvt == -999) {
-    cout << "DisplayRecPoints > Analyze an event first ... (y/n) " ; 
-    Text_t answer[1] ; 
-    cin >> answer ; cout << answer ; 
-//     if ( answer == "y" ) 
-//       AnalyzeOneEvent() ;
-  } 
-    if (fEvt != -999) {
-      
-      Int_t module ; 
-      cout <<  "DisplayRecPoints > which module (1-5,  -1: all) ? " ; 
-      cin >> module ; cout << module << endl ; 
-
-      Text_t canvasname[80];
-      sprintf(canvasname,"Digits in PHOS/EMC module # %d",module) ;
-      TCanvas * modulecanvas = new TCanvas("module", canvasname, 650, 500) ; 
-      modulecanvas->Draw() ;
-
-      //=========== Creating 2d-histogram of the PHOS module
-      // a little bit junkie but is used to test Geom functinalities
-
-      Double_t tm, tM, pm, pM ; // min and Max theta and phi covered by module   
-      
-      fGeom->EmcModuleCoverage(module, tm, tM, pm, pM); 
-      // convert angles into coordinates local to the EMC module of interest
-
-      Int_t emcModuleNumber ;
-      Double_t emcModulexm, emcModulezm ; // minimum local coordinate in a given EMCA module
-      Double_t emcModulexM, emcModulezM ; // maximum local coordinate in a given EMCA module
-      fGeom->ImpactOnEmc(tm, pm, emcModuleNumber, emcModulezm, emcModulexm) ;
-      fGeom->ImpactOnEmc(tM, pM, emcModuleNumber, emcModulezM, emcModulexM) ;
-      Int_t xdim = (Int_t)( ( emcModulexM - emcModulexm ) / fGeom->GetCrystalSize(0) ) ;  
-      Int_t zdim = (Int_t)( ( emcModulezM - emcModulezm ) / fGeom->GetCrystalSize(2) ) ;
-      Float_t xmin = emcModulexm - fGeom->GetCrystalSize(0) ; 
-      Float_t xMax = emcModulexM + fGeom->GetCrystalSize(0) ; 
-      Float_t zmin = emcModulezm - fGeom->GetCrystalSize(2) ; 
-      Float_t zMax = emcModulezM + fGeom->GetCrystalSize(2) ;     
-      Text_t histoname[80];
-      sprintf(histoname,"Event %d: Digits and RecPoints in module %d", fEvt, module) ;
-      TH2F * hModule = new TH2F("HistoReconstructed", histoname,
-                               xdim, xmin, xMax, zdim, zmin, zMax) ;  
-      hModule->SetMaximum(2.0);
-      hModule->SetMinimum(0.0);
-      hModule->SetStats(kFALSE); 
-
-      TIter next(fPHOS->Digits()) ;
-      Float_t energy, y, z;
-      Float_t etot=0.;
-      Int_t relid[4]; Int_t nDigits = 0 ;
-      AliPHOSDigit * digit ; 
-
-      // Making 2D histogram of the EMC module
-      while((digit = (AliPHOSDigit *)next())) 
-       {  
-         fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(), relid) ;
-         if (relid[0] == module && relid[1] == 0)  
-           {  
-             energy = fClu->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
-              cout << "Energy is " << energy << " and threshold is " << fClu->GetEmcEnergyThreshold() << endl; 
-             if (energy >  fClu->GetEmcEnergyThreshold()  ){
-               nDigits++ ;
-               etot += energy ; 
-               fGeom->RelPosInModule(relid,y,z) ;   
-               hModule->Fill(y, z, energy) ;
-             }
-           } 
-       }
-      cout <<"DrawRecPoints >  Found in module " 
-          << module << " " << nDigits << "  digits with total energy " << etot << endl ;
-      hModule->Draw("col2") ;
-
-      //=========== Cluster in module
-
-      //      TClonesArray * emcRP = fPHOS->EmcClusters() ; 
-      TObjArray * emcRP = *(fPHOS->EmcRecPoints()) ; 
+    TObjArray * emcrp = gime->EmcRecPoints() ;
+    if(!emcrp){
+      AliError(Form("Event %d,  Can't find EmcRecPoints", ievent)) ;
+      return ;
+    }
+    
+    
+    //=========== Make spectrum of the primary photons
+    const TParticle * primary ;
+    Int_t iPrimary ;
+    for( iPrimary = 0 ; iPrimary < fRunLoader->Stack()->GetNprimary() ; iPrimary++){
+      primary = fRunLoader->Stack()->Particle(iPrimary) ;
+      Int_t primaryType = primary->GetPdgCode() ;
+      if( primaryType == 22 ) {
+       //check, if photons folls onto PHOS
+       Int_t moduleNumber ;
+       Double_t primX, primZ ;
+       phosgeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+       if(moduleNumber)
+         hPrimary->Fill(primary->Energy()) ;
+       
+      }
       
-      etot = 0.; 
-      Int_t totalnClusters = 0 ; 
-      Int_t nClusters = 0 ;
-      TIter nextemc(emcRP) ;
-      AliPHOSEmcRecPoint * emc ;
-      while((emc = (AliPHOSEmcRecPoint *)nextemc())) 
-       {
-         //      Int_t numberofprimaries ;
-         //      Int_t * primariesarray = new Int_t[10] ;
-         //      emc->GetPrimaries(numberofprimaries, primariesarray) ;
-         totalnClusters++ ;
-         if ( emc->GetPHOSMod() == module )
-           { 
-             nClusters++ ; 
-             energy = emc->GetTotalEnergy() ;   
-             etot+= energy ;  
-             emc->Draw("M") ;
-           }
-       }
-      cout << "DrawRecPoints > Found " << totalnClusters << " EMC Clusters in PHOS" << endl ; 
-      cout << "DrawRecPoints > Found in module " << module << "  " << nClusters << " EMC Clusters " << endl ;
-      cout << "DrawRecPoints > total energy  " << etot << endl ; 
-
-      TPaveText *  pavetext = new TPaveText(22, 80, 83, 90); 
-      Text_t text[40] ; 
-      sprintf(text, "digits: %d;  clusters: %d", nDigits, nClusters) ;
-      pavetext->AddText(text) ; 
-      pavetext->Draw() ; 
-      modulecanvas->Update(); 
-      //=========== Cluster in module PPSD Down
-
-      //      TClonesArray * ppsdRP = fPHOS->PpsdClusters() ;
-      TObjArray * ppsdRP = *(fPHOS->PpsdRecPoints() );
-      etot = 0.; 
-      TIter nextPpsd(ppsdRP) ;
-      AliPHOSPpsdRecPoint * ppsd ;
-      while((ppsd = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextPpsd())) 
-       {
-         totalnClusters++ ;
-         if ( ppsd->GetPHOSMod() == module )
-           { 
-             nClusters++ ; 
-             energy = ppsd->GetEnergy() ;   
-             etot+=energy ;  
-             if (!ppsd->GetUp()) ppsd->Draw("P") ;
-           }
-       }
-      cout << "DrawRecPoints > Found " << totalnClusters << " Ppsd Down Clusters in PHOS" << endl ; 
-      cout << "DrawRecPoints > Found in module " << module << "  " << nClusters << " Ppsd Down Clusters " << endl ;
-      cout << "DrawRecPoints > total energy  " << etot << endl ; 
-
-      //=========== Cluster in module PPSD Up
-  
-      ppsdRP = *(fPHOS->PpsdRecPoints()) ;
-     
-      etot = 0.; 
-      TIter nextPpsdUp(ppsdRP) ;
-      while((ppsd = (AliPHOSPpsdRecPoint *)nextPpsdUp())) 
-       {
-         totalnClusters++ ;
-         if ( ppsd->GetPHOSMod() == module )
-           { 
-             nClusters++ ; 
-             energy = ppsd->GetEnergy() ;   
-             etot+=energy ;  
-             if (ppsd->GetUp()) ppsd->Draw("P") ;
-           }
-       }
-  cout << "DrawRecPoints > Found " << totalnClusters << " Ppsd Up Clusters in PHOS" << endl ; 
-  cout << "DrawRecPoints > Found in module " << module << "  " << nClusters << " Ppsd Up Clusters " << endl ;
-  cout << "DrawRecPoints > total energy  " << etot << endl ; 
+    }
     
-    } // if !-999
-}
-
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::DisplayTrackSegments()
-{
-  // Display track segments in local PHOS-module (x, z) coordinates. 
-  // One PHOS module at the time.
-  // One symbol per PHOS subsystem: EMC, upper PPSD, lower PPSD.
-
-  if (fEvt == -999) {
-    cout << "DisplayTrackSegments > Analyze an event first ... (y/n) " ; 
-    Text_t answer[1] ; 
-    cin >> answer ; cout << answer ; 
-//     if ( answer == "y" ) 
-//       AnalyzeOneEvent() ;
-  } 
-    if (fEvt != -999) {
-
-      Int_t module ; 
-      cout <<  "DisplayTrackSegments > which module (1-5,  -1: all) ? " ; 
-      cin >> module ; cout << module << endl ; 
-      //=========== Creating 2d-histogram of the PHOS module
-      // a little bit junkie but is used to test Geom functinalities
+    //========== Now scan over RecParticles            
+    const AliPHOSRecParticle * recParticle ;
+    Int_t iRecParticle ;
+    for(iRecParticle = 0; iRecParticle < rp->GetEntriesFast(); iRecParticle++ ){
+      recParticle = (AliPHOSRecParticle *) rp->At(iRecParticle) ;
+      //fill histo spectrum of all RecParticles
+      hAllRP->Fill(CorrectedEnergy(recParticle->Energy())) ;
       
-      Double_t tm, tM, pm, pM ; // min and Max theta and phi covered by module   
+      //==========find the closest primary       
+      Int_t moduleNumberRec ;
+      Double_t recX, recZ ;
+      phosgeom->ImpactOnEmc(recParticle->Theta(), recParticle->Phi(), moduleNumberRec, recX, recZ) ;
       
-      fGeom->EmcModuleCoverage(module, tm, tM, pm, pM); 
-      // convert angles into coordinates local to the EMC module of interest
+      Double_t minDistance  = 100. ;
+      Int_t closestPrimary = -1 ;
       
-      Int_t emcModuleNumber ;
-      Double_t emcModulexm, emcModulezm ; // minimum local coordinate in a given EMCA module
-      Double_t emcModulexM, emcModulezM ; // maximum local coordinate in a given EMCA module
-      fGeom->ImpactOnEmc(tm, pm, emcModuleNumber, emcModulezm, emcModulexm) ;
-      fGeom->ImpactOnEmc(tM, pM, emcModuleNumber, emcModulezM, emcModulexM) ;
-      Int_t xdim = (Int_t)( ( emcModulexM - emcModulexm ) / fGeom->GetCrystalSize(0) ) ;  
-      Int_t zdim = (Int_t)( ( emcModulezM - emcModulezm ) / fGeom->GetCrystalSize(2) ) ;
-      Float_t xmin = emcModulexm - fGeom->GetCrystalSize(0) ; 
-      Float_t xMax = emcModulexM + fGeom->GetCrystalSize(0) ; 
-      Float_t zmin = emcModulezm - fGeom->GetCrystalSize(2) ; 
-      Float_t zMax = emcModulezM + fGeom->GetCrystalSize(2) ;     
-      Text_t histoname[80];
-      sprintf(histoname,"Event %d: Track Segments in module %d", fEvt, module) ; 
-      TH2F * histotrack = new TH2F("histotrack",  histoname, 
-                                  xdim, xmin, xMax, zdim, zmin, zMax) ;  
-      histotrack->SetStats(kFALSE); 
-      Text_t canvasname[80];
-      sprintf(canvasname,"Track segments in PHOS/EMC-PPSD module # %d", module) ;
-      TCanvas * trackcanvas = new TCanvas("TrackSegmentCanvas", canvasname, 650, 500) ; 
-      histotrack->Draw() ; 
-
-      AliPHOSTrackSegment::TrackSegmentsList * trsegl = *(fPHOS->TrackSegments()) ;
-      AliPHOSTrackSegment * trseg ;
-      Int_t nTrackSegments = trsegl->GetEntries() ;
+      //extract list of primaries: it is stored at EMC RecPoints
+      Int_t emcIndex = ((AliPHOSTrackSegment *) ts->At(recParticle->GetPHOSTSIndex()))->GetEmcIndex() ;
+      Int_t numberofprimaries ;
+      Int_t * listofprimaries  = ((AliPHOSEmcRecPoint *) emcrp->At(emcIndex))->GetPrimaries(numberofprimaries)  ;
       Int_t index ;
-      Float_t etot = 0 ;
-      Int_t nTrackSegmentsInModule = 0 ; 
-      for(index = 0; index < nTrackSegments ; index++){
-       trseg = (AliPHOSTrackSegment * )trsegl->At(index) ;
-       etot+= trseg->GetEnergy() ;
-       if ( trseg->GetPHOSMod() == module ) { 
-         nTrackSegmentsInModule++ ; 
-         trseg->Draw("P");
-       }
-      } 
-      Text_t text[80] ; 
-      sprintf(text, "track segments: %d", nTrackSegmentsInModule) ;
-      TPaveText *  pavetext = new TPaveText(22, 80, 83, 90); 
-      pavetext->AddText(text) ; 
-      pavetext->Draw() ; 
-      trackcanvas->Update() ; 
-      cout << "DisplayTrackSegments > Found " << trsegl->GetEntries() << " Track segments with total energy "<< etot << endl ;
-    
-   }
-}
-//____________________________________________________________________________
-Bool_t AliPHOSAnalyze::OpenRootFile(Text_t * name)
-{
-  // Open the root file named "name"
+      const TParticle * primary ;
+      Double_t distance = minDistance ;
+      Double_t dX, dZ; 
+      Double_t dXmin = 0.; 
+      Double_t dZmin = 0. ;
+      for ( index = 0 ; index < numberofprimaries ; index++){
+       primary = fRunLoader->Stack()->Particle(listofprimaries[index]) ;
+       Int_t moduleNumber ;
+       Double_t primX, primZ ;
+       phosgeom->ImpactOnEmc(primary->Theta(), primary->Phi(), moduleNumber, primX, primZ) ;
+       if(moduleNumberRec == moduleNumber) {
+         dX = recX - primX;
+         dZ = recZ - primZ;
+         distance = TMath::Sqrt(dX*dX + dZ*dZ) ;
+         if(minDistance > distance) {
+           minDistance = distance ;
+           dXmin = dX;
+           dZmin = dZ;
+           closestPrimary = listofprimaries[index] ;
+         }
+       }
+      }
+      
+      //===========define the "type" of closest primary
+      if(closestPrimary >=0 ){
+       Int_t primaryCode = -1;
+       const TParticle * primary = fRunLoader->Stack()->Particle(closestPrimary) ;
+       Int_t primaryType = primary->GetPdgCode() ;
+       if(primaryType == 22) // photon ?
+         primaryCode = 0 ;
+       else
+         if(primaryType == 2112) // neutron
+           primaryCode = 1 ; 
+         else
+           if(primaryType == -2112) // Anti neutron
+             primaryCode = 2 ;
+           else
+             if(primaryType == -2122) //Anti proton
+              primaryCode = 4 ;
+             else {
+              TParticle tempo(*primary) ; 
+              if(tempo.GetPDG()->Charge())
+                primaryCode = 3 ;
+             }
+
+       //==========Now look at the type of RecParticle
+       Float_t energy = CorrectedEnergy(recParticle->Energy()) ;
+       if(recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMFAST){
+         hPhot->Fill(energy ) ;        
+         switch(primaryCode){
+         case 0:
+           hPhotReg->Fill(energy ) ; 
+           break ;
+         case 1:
+           hNReg->Fill(energy ) ; 
+           break ;
+         case 2:
+           hNBarReg->Fill(energy ) ; 
+           break ;
+         case 3:
+           hChargedReg->Fill(energy ) ;
+           break ;
+         case 4:
+           hPbarReg->Fill(energy ) ;
+           break ;
+         default:
+           break ;
+         }
+       }
+       if((recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMFAST)||
+          (recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kCHARGEDEMFAST)||
+          (recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMSLOW)||
+          (recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kCHARGEDEMSLOW) ){ //with EM shower
+         hShape->Fill(energy ) ;
+         switch(primaryCode){
+         case 0:
+           hPhotEM->Fill(energy ) ; 
+           break ;
+         case 1:
+           hNEM->Fill(energy ) ; 
+           break ;
+         case 2:
+           hNBarEM->Fill(energy ) ; 
+           break ;
+         case 3:
+           hChargedEM->Fill(energy ) ; 
+           break ;
+         case 4:
+           hPbarEM->Fill(energy ) ; 
+           break ;
+         default:
+           break ;
+         }
+       }
+       
+       if((recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMFAST)||
+          (recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALHAFAST) ||
+          (recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEMSLOW) ||
+          (recParticle->GetType() == AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALHASLOW) ) //nuetral
+         hVeto->Fill(energy ) ;
+       
+       //fill number of primaries identified as ...
+       if(primaryCode >= 0) // Primary code defined
+         counter[recParticle->GetType()][primaryCode]++ ; 
+       
+      }
+      
+    } // no closest primary found
+  }     
   
-  fRootFile   = new TFile(name, "update") ;
-  return  fRootFile->IsOpen() ; 
-}
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::SaveHistograms()
-{
-  // Saves the histograms in a root file named "name.analyzed" 
-
-  Text_t outputname[80] ;
-  sprintf(outputname,"%s.analyzed",fRootFile->GetName());
-  TFile output(outputname,"RECREATE");
-  output.cd();
-
-  if (fhAllEnergy)    
-    fhAllEnergy->Write() ;
-  if (fhPhotEnergy)    
-    fhPhotEnergy->Write() ;
-  if(fhEMEnergy)
-    fhEMEnergy->Write()  ;
-  if(fhPPSDEnergy)
-    fhPPSDEnergy->Write() ;
-  if(fhAllPosition)
-    fhAllPosition->Write() ;
-  if(fhPhotPosition)
-    fhPhotPosition->Write() ;
-  if(fhEMPosition)
-    fhEMPosition->Write() ;
-  if(fhPPSDPosition)
-    fhPPSDPosition->Write() ;
-  if (fhAllReg) 
-    fhAllReg->Write() ;
-  if (fhPhotReg) 
-    fhPhotReg->Write() ;
-  if(fhNReg)
-    fhNReg->Write() ;
-  if(fhNBarReg)
-    fhNBarReg->Write() ;
-  if(fhChargedReg)
-    fhChargedReg->Write() ;
-  if (fhAllEM) 
-    fhAllEM->Write() ;
-  if (fhPhotEM) 
-    fhPhotEM->Write() ;
-  if(fhNEM)
-    fhNEM->Write() ;
-  if(fhNBarEM)
-    fhNBarEM->Write() ;
-  if(fhChargedEM)
-    fhChargedEM->Write() ;
-  if (fhAllPPSD) 
-    fhAllPPSD->Write() ;
-  if (fhPhotPPSD) 
-    fhPhotPPSD->Write() ;
-  if(fhNPPSD)
-    fhNPPSD->Write() ;
-  if(fhNBarPPSD)
-    fhNBarPPSD->Write() ;
-  if(fhChargedPPSD)
-    fhChargedPPSD->Write() ;
-  if(fhPrimary)
-    fhPrimary->Write() ;
-  if(fhAllRP)
-    fhAllRP->Write()  ;
-  if(fhVeto)
-    fhVeto->Write()  ;
-  if(fhShape)
-    fhShape->Write()  ;
-  if(fhPPSD)
-    fhPPSD->Write()  ;
-  if(fhPhotPhot)
-    fhPhotPhot->Write() ;
-  if(fhPhotElec)
-    fhPhotElec->Write() ;
-  if(fhPhotNeuH)
-    fhPhotNeuH->Write() ;
-  if(fhPhotNuEM)
-    fhPhotNuEM->Write() ;
-  if(fhPhotNuEM)
-    fhPhotNuEM->Write() ;
-  if(fhPhotChHa)
-    fhPhotChHa->Write() ;
-  if(fhPhotGaHa)
-    fhPhotGaHa->Write() ;
-  if(fhEnergyCorrelations)
-    fhEnergyCorrelations->Write() ;
   
-  output.Write();
-  output.Close();
-}
-//____________________________________________________________________________
-Float_t AliPHOSAnalyze::CorrectEnergy(Float_t ERecPart)
-{
-  return ERecPart/0.8783 ;
-}
+  //===================  SaveHistograms
+  cfile->cd() ;
+  hPrimary->Write(0,kOverwrite); 
+  hAllRP->Write(0,kOverwrite);  
+  hPhot->Write(0,kOverwrite);  
+  hShape->Write(0,kOverwrite); 
+  hVeto->Write(0,kOverwrite);  
+  hPhotReg->Write(0,kOverwrite); 
+  hPhotEM->Write(0,kOverwrite);   
+  hNReg ->Write(0,kOverwrite);  
+  hNEM  ->Write(0,kOverwrite); 
+  hNBarReg ->Write(0,kOverwrite); 
+  hNBarEM  ->Write(0,kOverwrite); 
+  hChargedReg ->Write(0,kOverwrite); 
+  hChargedEM  ->Write(0,kOverwrite); 
+  hPbarReg ->Write(0,kOverwrite); 
+  hPbarEM  ->Write(0,kOverwrite); 
+  
+  cfile->Write(0,kOverwrite); 
+  cfile->Close();
+  delete cfile ;
+  
+  //print Final Table
+  maxevent = (Int_t)gAlice->TreeE()->GetEntries() ; 
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSAnalyze::ResetHistograms()
-{
-   fhEnergyCorrelations = 0 ;     //Energy correlations between Eloss in Convertor and PPSD(2)
-
-   fhEmcDigit = 0 ;               // Histo of digit energies in the Emc 
-   fhVetoDigit = 0 ;              // Histo of digit energies in the Veto 
-   fhConvertorDigit = 0 ;         // Histo of digit energies in the Convertor
-   fhEmcCluster = 0 ;             // Histo of Cluster energies in Emc
-   fhVetoCluster = 0 ;            // Histo of Cluster energies in Veto
-   fhConvertorCluster = 0 ;       // Histo of Cluster energies in Convertor
-   fhConvertorEmc = 0 ;           // 2d Convertor versus Emc energies
-
-   fhAllEnergy = 0 ;       
-   fhPhotEnergy = 0 ;        // Total spectrum of detected photons
-   fhEMEnergy = 0 ;         // Spectrum of detected electrons with electron primary
-   fhPPSDEnergy = 0 ;
-   fhAllPosition = 0 ; 
-   fhPhotPosition = 0 ; 
-   fhEMPosition = 0 ; 
-   fhPPSDPosition = 0 ; 
-
-   fhPhotReg = 0 ;          
-   fhAllReg = 0 ;          
-   fhNReg = 0 ;          
-   fhNBarReg = 0 ;          
-   fhChargedReg = 0 ;          
-   fhPhotEM = 0 ;          
-   fhAllEM = 0 ;          
-   fhNEM = 0 ;          
-   fhNBarEM = 0 ;          
-   fhChargedEM = 0 ;          
-   fhPhotPPSD = 0 ;          
-   fhAllPPSD = 0 ;          
-   fhNPPSD = 0 ;          
-   fhNBarPPSD = 0 ;          
-   fhChargedPPSD = 0 ;          
-
-   fhPrimary = 0 ;          
-
-   fhPhotPhot = 0 ;
-   fhPhotElec = 0 ;
-   fhPhotNeuH = 0 ;
-   fhPhotNuEM = 0 ; 
-   fhPhotChHa = 0 ;
-   fhPhotGaHa = 0 ;
+  TString message ; 
+  message  = "Resolutions: Analyzed %d event(s)\n" ; 
+  message += "        Primary:    Photon  Neutron  Antineutron  Charged hadron   AntiProton\n" ; 
+  message += "--------------------------------------------------------------------------------\n" ;
+  message += "         kGAMMA: " ; 
+  message += "%d %d %d %d %d\n" ; 
+  message += "       kGAMMAHA: " ;
+  message += "%d %d %d %d %d\n" ; 
+  message += "     kNEUTRALEM: " ; 
+  message += "%d %d %d %d %d\n" ; 
+  message += "     kNEUTRALHA: " ; 
+  message += "%d %d %d %d %d\n" ;
+  message += "      kABSURDEM: ";
+  message += "%d %d %d %d %d\n" ;
+  message += "      kABSURDHA: " ;
+  message += "%d %d %d %d %d\n" ;
+  message += "      kELECTRON: " ;
+  message += "%d %d %d %d %d\n" ;
+  message += "     kCHARGEDHA: " ;  
+  message += "%d %d %d %d %d\n" ;
+   
+  message += "--------------------------------------------------------------------------------" ;
 
+  Int_t totalInd = 0 ;
+  for(i1 = 0; i1<8; i1++)
+    for(i2 = 0; i2<5; i2++)
+      totalInd+=counter[i1][i2] ;
+  message += "Indentified particles: %d" ; 
+  
+ AliInfo(Form(message.Data(), maxevent, 
+      counter[2][0], counter[2][1], counter[2][2], counter[2][3], counter[2][4], 
+      counter[3][0], counter[3][1], counter[3][2], counter[3][3], counter[3][4], 
+      counter[0][0], counter[0][1], counter[0][2], counter[0][3], counter[0][4], 
+      counter[1][0], counter[1][1], counter[1][2], counter[1][3], counter[1][4], 
+      counter[4][0], counter[4][1], counter[4][2], counter[4][3], counter[4][4], 
+      counter[5][0], counter[5][1], counter[5][2], counter[5][3], counter[5][4], 
+      counter[6][0], counter[6][1], counter[6][2], counter[6][3], counter[6][4], 
+      counter[7][0], counter[7][1], counter[7][2], counter[7][3], counter[7][4], 
+      totalInd )) ;
 
 }