]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - PHOS/AliPHOSDigitizer.cxx
Improved the mechanism to divert SDigits into a separate file.
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSDigitizer.cxx
index fdaddacbb81996ba20497f86a2f986192715bb25..0ac1e94b6e1093041d959799730f26da8f136cb1 100644 (file)
@@ -61,6 +61,7 @@
 #include "TROOT.h"
 #include "TFolder.h"
 #include "TObjString.h"
+#include "TGeometry.h"
 #include "TBenchmark.h"
 
 // --- Standard library ---
@@ -69,6 +70,7 @@
 // --- AliRoot header files ---
 
 #include "AliRun.h"
+#include "AliHeader.h"
 #include "AliRunDigitizer.h"
 #include "AliPHOSDigit.h"
 #include "AliPHOS.h"
@@ -76,6 +78,7 @@
 #include "AliPHOSDigitizer.h"
 #include "AliPHOSSDigitizer.h"
 #include "AliPHOSGeometry.h"
+#include "AliPHOSTick.h"
 
 ClassImp(AliPHOSDigitizer)
 
@@ -85,16 +88,23 @@ ClassImp(AliPHOSDigitizer)
 {
   // ctor
 
-  fPinNoise           = 0.01 ;
-  fEMCDigitThreshold  = 0.01 ;
+  fPinNoise           = 0.004 ;
+  fEMCDigitThreshold  = 0.012 ;
   fCPVNoise           = 0.01;
   fCPVDigitThreshold  = 0.09 ;
-  fPPSDNoise          = 0.0000001;
-  fPPSDDigitThreshold = 0.0000002 ;  
+  fTimeResolution     = 0.5e-9 ;
+  fTimeSignalLength   = 1.0e-9 ;
   fDigitsInRun  = 0 ; 
-  fPedestal = 0.;                // Calibration parameters 
-  fSlope = 10000000. ;
-  fARD = 0 ;                     // We work in the standalong mode
+  fADCchanelEmc = 0.0015;        // width of one ADC channel in GeV
+  fADCpedestalEmc = 0.005 ;      //
+  fNADCemc = (Int_t) TMath::Power(2,16) ;  // number of channels in EMC ADC
+
+  fADCchanelCpv = 0.0012 ;          // width of one ADC channel in CPV 'popugais'
+  fADCpedestalCpv = 0.012 ;         // 
+  fNADCcpv = (Int_t) TMath::Power(2,12);      // number of channels in CPV ADC
+
+  fTimeThreshold = 0.001*10000000 ; //Means 1 MeV in terms of SDigits amplitude
+  fManager = 0 ;                        // We work in the standalong mode
 }
 
 //____________________________________________________________________________ 
@@ -103,41 +113,17 @@ AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer(const char *headerFile,const char * name)
   // ctor
   SetName(name) ;
   SetTitle(headerFile) ;
-  fPinNoise           = 0.01 ;
-  fEMCDigitThreshold  = 0.01 ;
-  fCPVNoise           = 0.01;
-  fCPVDigitThreshold  = 0.09 ;
-  fPPSDNoise          = 0.0000001;
-  fPPSDDigitThreshold = 0.0000002 ;  
-  fDigitsInRun  = 0 ; 
-  fPedestal = 0.;                // Calibration parameters 
-  fSlope = 10000000. ;
-  fARD = 0 ;                     // We work in the standalong mode
-
+  fManager = 0 ;                     // We work in the standalong mode
   Init() ;
   
 }
 
 //____________________________________________________________________________ 
-AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer(AliRunDigitizer * ard)
+AliPHOSDigitizer::AliPHOSDigitizer(AliRunDigitizer * ard):AliDigitizer(ard)
 {
   // ctor
-  fARD = ard ;
-  SetName("Default");
-  SetTitle("aliroot") ;
-
-  fPinNoise           = 0.01 ;
-  fEMCDigitThreshold  = 0.01 ;
-  fCPVNoise           = 0.01;
-  fCPVDigitThreshold  = 0.09 ;
-  fPPSDNoise          = 0.0000001;
-  fPPSDDigitThreshold = 0.0000002 ;  
-  fDigitsInRun  = 0 ; 
-  fPedestal = 0.;                // Calibration parameters 
-  fSlope = 10000000. ;
-
-  Init() ;
-  
+  SetName("");     //Will call init in the digitizing
+  SetTitle("aliroot") ;  
 }
 
 //____________________________________________________________________________ 
@@ -159,9 +145,6 @@ void AliPHOSDigitizer::Digitize(const Int_t event)
   // This design avoids scanning over the list of digits to add 
   // contribution to new SDigits only.
 
-  if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
-    Init() ;
-
   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
   TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ; 
 
@@ -173,109 +156,227 @@ void AliPHOSDigitizer::Digitize(const Int_t event)
   Int_t nEMC = geom->GetNModules()*geom->GetNPhi()*geom->GetNZ();
   
   Int_t nCPV ;
-  Int_t nPPSD ;
   Int_t absID ;
   TString name      =  geom->GetName() ;
   
-  if ( name == "IHEP" || name == "MIXT" )    
-    nCPV =nEMC + geom->GetNumberOfCPVPadsZ()*geom->GetNumberOfCPVPadsPhi()*
-      geom->GetNCPVModules()*geom->GetNumberOfCPVLayers() ;
-  else
-    nCPV = nEMC; 
-  
-  if ( name == "GPS2" || name == "MIXT" )    
-    nPPSD =nCPV+2*geom->GetNPPSDModules()*geom->GetNumberOfModulesPhi()*geom->GetNumberOfModulesZ()*
-      geom->GetNumberOfPadsPhi()*geom->GetNumberOfPadsZ() ;
-  else
-    nPPSD = nCPV; 
-
-
-  digits->Expand(nPPSD) ;
+  nCPV = nEMC + geom->GetNumberOfCPVPadsZ()*geom->GetNumberOfCPVPadsPhi()*
+    geom->GetNModules() ;
 
+  digits->Expand(nCPV) ;
 
-  // sdigitize random gaussian noise and add it to all cells (EMCA+CPV+PPSD) 
   // get first the sdigitizer from the tasks list (must have same name as the digitizer)
   const AliPHOSSDigitizer * sDigitizer = gime->SDigitizer(GetName()); 
   if ( !sDigitizer) {
     cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::Digitize -> SDigitizer with name " << GetName() << " not found " << endl ; 
     abort() ; 
   }
-  for(absID = 1; absID <= nEMC; absID++){
-    Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fPinNoise) ; 
-    new((*digits)[absID-1]) AliPHOSDigit( -1,absID,sDigitizer->Digitize(noise) ) ;
-  }
-  
-  for(absID = nEMC+1; absID <= nCPV; absID++){
-    Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fCPVNoise) ; 
-    new((*digits)[absID-1]) AliPHOSDigit( -1,absID,sDigitizer->Digitize(noise) ) ;
-  }
-  
-  for(absID = nCPV+1; absID <= nPPSD; absID++){
-    Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fPPSDNoise) ; 
-    new((*digits)[absID-1]) AliPHOSDigit( -1,absID,sDigitizer->Digitize(noise) ) ;
-  }
-  
+    
   // loop through the sdigits posted to the White Board and add them to the noise
-  TCollection * folderslist = ((TFolder*)gROOT->FindObjectAny("YSAlice/WhiteBoard/SDigits/PHOS"))->GetListOfFolders() ; 
+  TCollection * folderslist = gime->SDigitsFolder()->GetListOfFolders() ; 
   TIter next(folderslist) ; 
   TFolder * folder = 0 ; 
   TClonesArray * sdigits = 0 ;
   Int_t input = 0 ;
-  while ( (folder = (TFolder*)next()) ) {
+  TObjArray * sdigArray = new TObjArray(2) ;
+  while ( (folder = (TFolder*)next()) ) 
     if ( (sdigits = (TClonesArray*)folder->FindObject(GetName()) ) ) {
+      TString fileName(folder->GetName()) ;
+      fileName.ReplaceAll("_","/") ;
       cout << "INFO: AliPHOSDigitizer::Digitize -> Adding SDigits " 
-          << GetName() << " from " << folder->GetName() << endl ; 
-      Int_t primaryoffset ;
-      if(fARD)
-       primaryoffset = fARD->GetMask(input) ; 
-      else
-       primaryoffset = 10000000*input ;
+          << GetName() << " from " << fileName << endl ; 
+      sdigArray->AddAt(sdigits, input) ;
+      input++ ;
+    }
+
+  //Find the first crystall with signal
+  Int_t nextSig = 200000 ; 
+  Int_t i;
+  for(i=0; i<input; i++){
+    sdigits = (TClonesArray *)sdigArray->At(i) ;
+    if ( !sdigits->GetEntriesFast() )
+      continue ; 
+    Int_t curNext = ((AliPHOSDigit *)sdigits->At(0))->GetId() ;
+     if(curNext < nextSig) 
+       nextSig = curNext ;
+  }
+
+  TArrayI index(input) ;
+  index.Reset() ;  //Set all indexes to zero
+
+  AliPHOSDigit * digit ;
+  AliPHOSDigit * curSDigit ;
+
+  TClonesArray * ticks = new TClonesArray("AliPHOSTick",1000) ;
+
+  //Put Noise contribution
+  for(absID = 1; absID <= nEMC; absID++){
+    Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fPinNoise) ; 
+    new((*digits)[absID-1]) AliPHOSDigit( -1,absID,sDigitizer->Digitize(noise), TimeOfNoise() ) ;
+    //look if we have to add signal?
+    digit = (AliPHOSDigit *) digits->At(absID-1) ;
  
-      Int_t index ; 
-      AliPHOSDigit * curSDigit ; 
-      AliPHOSDigit * digit ; 
-      for ( index = 0 ; index < sdigits->GetEntriesFast(); index++) { 
-       curSDigit = (AliPHOSDigit*)sdigits->At(index) ; 
-       curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
-       digit = (AliPHOSDigit*)digits->At(curSDigit->GetId() - 1 ) ; 
-       *digit = *digit + *curSDigit ; 
+    if(absID==nextSig){
+      //Add SDigits from all inputs 
+      ticks->Clear() ;
+      Int_t contrib = 0 ;
+      Float_t a = digit->GetAmp() ;
+      Float_t b = TMath::Abs( a /fTimeSignalLength) ;
+      //Mark the beginnign of the signal
+      new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(digit->GetTime(),0, b);  
+      //Mark the end of the ignal     
+      new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(digit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b); 
+
+      //loop over inputs
+      for(i=0; i<input; i++){
+       if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
+         curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;         
+       else
+         curSDigit = 0 ;
+       //May be several digits will contribute from the same input
+       while(curSDigit && curSDigit->GetId() == absID){           
+         //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
+         Int_t primaryoffset ;
+         if(fManager)
+           primaryoffset = fManager->GetMask(i) ; 
+         else
+           primaryoffset = 10000000*i ;
+         curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
+         
+         a = curSDigit->GetAmp() ;
+         b = a /fTimeSignalLength ;
+         new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(curSDigit->GetTime(),0, b);  
+         new((*ticks)[contrib++]) AliPHOSTick(curSDigit->GetTime()+fTimeSignalLength, -a, -b); 
+
+         *digit = *digit + *curSDigit ;  //add energies
+
+         index[i]++ ;
+         if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
+           curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;       
+         else
+           curSDigit = 0 ;
+       }
+      }
+
+      //calculate and set time
+      Float_t time = FrontEdgeTime(ticks) ;
+      digit->SetTime(time) ;
+
+      //Find next signal module
+      nextSig = 200000 ;
+      for(i=0; i<input; i++){
+       sdigits = ((TClonesArray *)sdigArray->At(i)) ;
+       Int_t curNext = nextSig ;
+       if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] ){
+         curNext = ((AliPHOSDigit *) sdigits->At(index[i]))->GetId() ;
+         
+       }
+       if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
       }
     }
   }
   
-  //remove digits below thresholds
-  for(absID = 0; absID < nEMC ; absID++)
-    if(sDigitizer->Calibrate(((AliPHOSDigit*)digits->At(absID))->GetAmp()) < fEMCDigitThreshold)
-      digits->RemoveAt(absID) ;
+  ticks->Delete() ;
+  delete ticks ;
+
+
+  //Now CPV digits (different noise and no timing)
+  for(absID = nEMC+1; absID <= nCPV; absID++){
+    Float_t noise = gRandom->Gaus(0., fCPVNoise) ; 
+    new((*digits)[absID-1]) AliPHOSDigit( -1,absID,sDigitizer->Digitize(noise), TimeOfNoise() ) ;
+    //look if we have to add signal?
+    if(absID==nextSig){
+      digit = (AliPHOSDigit *) digits->At(absID-1) ;
+      //Add SDigits from all inputs
+      for(i=0; i<input; i++){
+       if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
+         curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;         
+       else
+         curSDigit = 0 ;
+
+       //May be several digits will contribute from the same input
+       while(curSDigit && curSDigit->GetId() == absID){           
+         //Shift primary to separate primaries belonging different inputs
+         Int_t primaryoffset ;
+         if(fManager)
+           primaryoffset = fManager->GetMask(i) ; 
+         else
+           primaryoffset = 10000000*i ;
+         curSDigit->ShiftPrimary(primaryoffset) ;
+
+         //add energies
+         *digit = *digit + *curSDigit ;  
+         index[i]++ ;
+         if(((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->GetEntriesFast() > index[i] )
+           curSDigit = (AliPHOSDigit*)((TClonesArray *)sdigArray->At(i))->At(index[i]) ;       
+         else
+           curSDigit = 0 ;
+       }
+      }
+
+      //Find next signal module
+      nextSig = 200000 ;
+      for(i=0; i<input; i++){
+       sdigits = (TClonesArray *)sdigArray->At(i) ;
+       Int_t curNext = nextSig ;
+       if(sdigits->GetEntriesFast() > index[i] )
+         curNext = ((AliPHOSDigit *) sdigits->At(index[i]))->GetId() ;
+       if(curNext < nextSig) nextSig = curNext ;
+      }
+      
+    }
+  }
+  delete sdigArray ; //We should not delete its contents
   
-  for(absID = nEMC; absID < nCPV ; absID++)
-    if(sDigitizer->Calibrate(((AliPHOSDigit*)digits->At(absID))->GetAmp()) < fCPVDigitThreshold)
-      digits->RemoveAt(absID) ;
   
-  for(absID = nCPV; absID < nPPSD ; absID++)
-    if(sDigitizer->Calibrate(((AliPHOSDigit *)digits->At(absID))->GetAmp()) < fPPSDDigitThreshold)
-      digits->RemoveAt(absID) ;
   
+  //remove digits below thresholds
+  for(i = 0; i < nEMC ; i++){
+    digit = (AliPHOSDigit*) digits->At(i) ;
+    if(sDigitizer->Calibrate( digit->GetAmp() ) < fEMCDigitThreshold)
+      digits->RemoveAt(i) ;
+    else
+      digit->SetTime(gRandom->Gaus(digit->GetTime(),fTimeResolution) ) ;
+  }
+
+
+  for(i = nEMC; i < nCPV ; i++)
+    if(sDigitizer->Calibrate(((AliPHOSDigit*)digits->At(i))->GetAmp()) < fCPVDigitThreshold)
+      digits->RemoveAt(i) ;
+    
   digits->Compress() ;  
   
   Int_t ndigits = digits->GetEntriesFast() ;
   digits->Expand(ndigits) ;
 
-  //Set indexes in list of digits
-  Int_t i ;
+  //Set indexes in list of digits and make true digitization of the energy
   for (i = 0 ; i < ndigits ; i++) { 
     AliPHOSDigit * digit = (AliPHOSDigit *) digits->At(i) ; 
     digit->SetIndexInList(i) ;     
+    Float_t energy = sDigitizer->Calibrate(digit->GetAmp()) ;
+    digit->SetAmp(DigitizeEnergy(energy,digit->GetId()) ) ;
   }
 
 }
-
+//____________________________________________________________________________
+Int_t AliPHOSDigitizer::DigitizeEnergy(Float_t energy, Int_t absId)
+{
+  Int_t chanel ;
+  if(absId <= fEmcCrystals){ //digitize as EMC 
+    chanel = (Int_t) TMath::Ceil((energy - fADCpedestalEmc)/fADCchanelEmc) ;       
+    if(chanel > fNADCemc ) chanel =  fNADCemc ;
+  }
+  else{ //Digitize as CPV
+    chanel = (Int_t) TMath::Ceil((energy - fADCpedestalCpv)/fADCchanelCpv) ;       
+    if(chanel > fNADCcpv ) chanel =  fNADCcpv ;
+  }
+  return chanel ;
+}
 //____________________________________________________________________________
 void AliPHOSDigitizer::Exec(Option_t *option) 
 { 
   // Managing method
 
-  if( strcmp(GetName(), "") == 0 )    
+  if(strcmp(GetName(), "") == 0 )   
     Init() ;
   
   if (strstr(option,"print")) {
@@ -292,8 +393,8 @@ void AliPHOSDigitizer::Exec(Option_t *option)
   
   TTree * treeD ;
   
-  if(fARD){
-    treeD = fARD->GetTreeD() ;
+  if(fManager){
+    treeD = fManager->GetTreeD() ;
     nevents = 1 ;    // Will process only one event
   }
   else {
@@ -301,46 +402,45 @@ void AliPHOSDigitizer::Exec(Option_t *option)
     nevents = (Int_t) gAlice->TreeE()->GetEntries() ;
     treeD=gAlice->TreeD() ;
   }
-  if(treeD == 0 ){
-    cerr << " AliPHOSDigitizer :: Can not find TreeD " << endl ;
-    return ;
-  }
+
 
   //Check, if this branch already exits
-  TObjArray * lob = (TObjArray*)treeD->GetListOfBranches() ;
-  TIter next(lob) ; 
-  TBranch * branch = 0 ;  
-  Bool_t phosfound = kFALSE, digitizerfound = kFALSE ; 
-  
-  while ( (branch = (TBranch*)next()) && (!phosfound || !digitizerfound) ) {
-    if ( (strcmp(branch->GetName(), "PHOS")==0) && 
-        (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) ) 
-      phosfound = kTRUE ;
+  if (treeD) { 
+    TObjArray * lob = (TObjArray*)treeD->GetListOfBranches() ;
+    TIter next(lob) ; 
+    TBranch * branch = 0 ;  
+    Bool_t phosfound = kFALSE, digitizerfound = kFALSE ; 
     
-    else if ( (strcmp(branch->GetName(), "AliPHOSDigitizer")==0) && 
-             (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) ) 
-      digitizerfound = kTRUE ; 
+    while ( (branch = (TBranch*)next()) && (!phosfound || !digitizerfound) ) {
+      if ( (strcmp(branch->GetName(), "PHOS")==0) && 
+          (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) ) 
+       phosfound = kTRUE ;
+      
+      else if ( (strcmp(branch->GetName(), "AliPHOSDigitizer")==0) && 
+               (strcmp(branch->GetTitle(), GetName())==0) ) 
+       digitizerfound = kTRUE ; 
+    }
+    
+    if ( phosfound ) {
+      cerr << "WARNING: AliPHOSDigitizer -> Digits branch with name " << GetName() 
+          << " already exits" << endl ;
+      return ; 
+    }   
+    if ( digitizerfound ) {
+      cerr << "WARNING: AliPHOSDigitizer -> Digitizer branch with name " << GetName() 
+          << " already exits" << endl ;
+      return ; 
+    }   
   }
 
-  if ( phosfound ) {
-    cerr << "WARNING: AliPHOSDigitizer -> Digits branch with name " << GetName() 
-        << " already exits" << endl ;
-    return ; 
-  }   
-  if ( digitizerfound ) {
-    cerr << "WARNING: AliPHOSDigitizer -> Digitizer branch with name " << GetName() 
-        << " already exits" << endl ;
-    return ; 
-  }   
-
   Int_t ievent ;
-
+  
   for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
-    
-    if(fARD){
+  
+    if(fManager){
       Int_t input ;
-      for(input = 0 ; input < fARD->GetNinputs(); input ++){
-       TTree * treeS = fARD->GetInputTreeS(input) ;
+      for(input = 0 ; input < fManager->GetNinputs(); input ++){
+       TTree * treeS = fManager->GetInputTreeS(input) ;
        if(!treeS){
          cerr << "AliPHOSDigitizer -> No Input " << endl ;
          return ;
@@ -357,6 +457,9 @@ void AliPHOSDigitizer::Exec(Option_t *option)
     
     if(strstr(option,"deb"))
       PrintDigits(option);
+    
+    //increment the total number of Digits per run 
+    fDigitsInRun += gime->Digits()->GetEntriesFast() ;  
   }
   
   if(strstr(option,"tim")){
@@ -369,34 +472,70 @@ void AliPHOSDigitizer::Exec(Option_t *option)
   
 }
 
+//____________________________________________________________________________ 
+Float_t AliPHOSDigitizer::FrontEdgeTime(TClonesArray * ticks) 
+{ // 
+  ticks->Sort() ; //Sort in accordance with times of ticks
+  TIter it(ticks) ;
+  AliPHOSTick * ctick = (AliPHOSTick *) it.Next() ;
+  Float_t time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;    
+
+  AliPHOSTick * t ;  
+  while((t=(AliPHOSTick*) it.Next())){
+    if(t->GetTime() < time)  //This tick starts before crossing
+      *ctick+=*t ;
+    else
+      return time ;
+
+    time = ctick->CrossingTime(fTimeThreshold) ;    
+  }
+  return time ;
+}
 //____________________________________________________________________________ 
 Bool_t AliPHOSDigitizer::Init()
 {
-  // Makes all memory allocations
-  // Adds Digitizer task to the folder of PHOS tasks
-   //============================================================= YS
-  //  The initialisation is now done by AliPHOSGetter
+  fPinNoise           = 0.004 ;
+  fEMCDigitThreshold  = 0.012 ;
+  fCPVNoise           = 0.01;
+  fCPVDigitThreshold  = 0.09 ;
+  fTimeResolution     = 0.5e-9 ;
+  fTimeSignalLength   = 1.0e-9 ;
+  fDigitsInRun  = 0 ; 
+  fADCchanelEmc = 0.0015;        // width of one ADC channel in GeV
+  fADCpedestalEmc = 0.005 ;      //
+  fNADCemc = (Int_t) TMath::Power(2,16) ;  // number of channels in EMC ADC
+
+  fADCchanelCpv = 0.0012 ;          // width of one ADC channel in CPV 'popugais'
+  fADCpedestalCpv = 0.012 ;         // 
+  fNADCcpv = (Int_t) TMath::Power(2,12);      // number of channels in CPV ADC
+
+  fTimeThreshold = 0.001*10000000 ; //Means 1 MeV in terms of SDigits amplitude
     
-  if( strcmp(GetTitle(), "") == 0 )
-    SetTitle("galice.root") ;
+  if(fManager)
+    SetTitle("aliroot") ;
+  else if (strcmp(GetTitle(),"")==0) 
+   SetTitle("galice.root") ;
+
+  if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
+    SetName("Default") ;
   
-  // the SDigits name is stored by AliPHOSGetter as the name of the TClones Array 
-  // //YSAlice/WhiteBoard/SDigits/PHOS/headerFile/branchname and has branchTitle as title.    
-    
   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance(GetTitle(), GetName()) ; 
   if ( gime == 0 ) {
     cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::Init -> Could not obtain the Getter object !" << endl ; 
     return kFALSE;
   } 
-     
-  // create a folder on the white board //YSAlice/WhiteBoard/Digits/PHOS/headerFile/digitsTitle
+  
+  const AliPHOSGeometry * geom = gime->PHOSGeometry() ;
+  fEmcCrystals = geom->GetNModules() *  geom->GetNCristalsInModule() ;
+  
+  // Post Digits to the white board
   gime->PostDigits(GetName() ) ;   
   
-  //add Task to //YSAlice/tasks/Digitizer/PHOS
-    gime->PostDigitizer(this) ;
+  // Post Digitizer to the white board
+  gime->PostDigitizer(this) ;
   
   //Mark that we will use current header file
-  if(!fARD){
+  if(!fManager){
     gime->PostSDigits(GetName(),GetTitle()) ;
     gime->PostSDigitizer(GetName(),GetTitle()) ;
   }
@@ -421,15 +560,15 @@ void AliPHOSDigitizer::MixWith(const char* headerFile)
   if( strcmp(GetName(), "") == 0 )
     Init() ;
 
-  if(fARD){
+  if(fManager){
     cout << "Can not use this method under AliRunDigitizer " << endl ;
     return ;
   }
   
   // check if the specified SDigits do not already exist on the White Board:
-  // //YSAlice/WhiteBoard/SDigits/PHOS/headerFile/sDigitsTitle
+  // //Folders/RunMC/Event/Data/PHOS/SDigits/headerFile/sdigitsname
 
-  TString path = "YSAlice/WhiteBoard/SDigits/PHOS/" ; 
+  TString path = "Folders/RunMC/Event/Data/PHOS/SDigits" ; 
   path += headerFile ; 
   path += "/" ; 
   path += GetName() ;
@@ -453,6 +592,53 @@ void AliPHOSDigitizer::MixWith(const char* headerFile)
   
 }
 
+//__________________________________________________________________
+void AliPHOSDigitizer::SetSplitFile(const TString splitFileName) const
+{
+  // Diverts the Digits in a file separate from the hits file
+  
+  // I guess it is not going to work if we do merging
+  if (fManager) {
+    cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::SetSplitFile -> Not yet available in case of merging activated " << endl ;  
+    return ; 
+  }
+
+  TDirectory * cwd = gDirectory ;
+  TFile * splitFile = gAlice->InitTreeFile("D",splitFileName.Data());
+  splitFile->cd() ; 
+  if ( !splitFile->Get("gAlice") ) 
+    gAlice->Write();
+  
+  TTree *treeE  = gAlice->TreeE();
+  if (!treeE) {
+    cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::SetSplitFile -> No TreeE found "<<endl;
+    abort() ;
+  }      
+  
+  // copy TreeE
+  if ( !splitFile->Get("TreeE") ) {
+    AliHeader *header = new AliHeader();
+    treeE->SetBranchAddress("Header", &header);
+    treeE->SetBranchStatus("*",1);
+    TTree *treeENew =  treeE->CloneTree();
+    treeENew->Write();
+  }
+
+  // copy AliceGeom
+  if ( !splitFile->Get("AliceGeom") ) {
+    TGeometry *AliceGeom = static_cast<TGeometry*>(cwd->Get("AliceGeom"));
+    if (!AliceGeom) {
+      cerr << "ERROR: AliPHOSDigitizer::SetSplitFile -> AliceGeom was not found in the input file "<<endl;
+      abort() ;
+    }
+    AliceGeom->Write();
+  }
+  
+  cwd->cd() ; 
+  gAlice->MakeTree("D",splitFile);
+  cout << "INFO: AliPHOSDigitizer::SetSPlitMode -> Digits will be stored in " << splitFileName.Data() << endl ; 
+}
+
 //__________________________________________________________________
 void AliPHOSDigitizer::Print(Option_t* option)const {
   // Print Digitizer's parameters
@@ -461,7 +647,7 @@ void AliPHOSDigitizer::Print(Option_t* option)const {
     cout << "------------------- "<< GetName() << " -------------" << endl ;
     cout << "Digitizing sDigits from file(s): " <<endl ;
     
-     TCollection * folderslist = ((TFolder*)gROOT->FindObjectAny("YSAlice/WhiteBoard/SDigits/PHOS"))->GetListOfFolders() ; 
+     TCollection * folderslist = ((TFolder*)gROOT->FindObjectAny("Folders/RunMC/Event/Data/PHOS/SDigits"))->GetListOfFolders() ; 
     TIter next(folderslist) ; 
     TFolder * folder = 0 ; 
     
@@ -478,14 +664,13 @@ void AliPHOSDigitizer::Print(Option_t* option)const {
     cout << "  Threshold  in EMC  (fEMCDigitThreshold) = " << fEMCDigitThreshold  << endl ; ;
     cout << "                 Noise in CPV (fCPVNoise) = " << fCPVNoise << endl ; 
     cout << "    Threshold in CPV (fCPVDigitThreshold) = " << fCPVDigitThreshold << endl ; 
-    cout << "               Noise in PPSD (fPPSDNoise) = " << fPPSDNoise << endl ;
-    cout << "  Threshold in PPSD (fPPSDDigitThreshold) = " << fPPSDDigitThreshold << endl ;
     cout << "---------------------------------------------------" << endl ;
   }
   else
     cout << "AliPHOSDigitizer not initialized " << endl ;
   
 }
+
 //__________________________________________________________________
 void AliPHOSDigitizer::PrintDigits(Option_t * option){
   // Print a table of digits
@@ -496,28 +681,53 @@ void AliPHOSDigitizer::PrintDigits(Option_t * option){
   cout << "AliPHOSDigitiser: event " << gAlice->GetEvNumber() << endl ;
   cout << "       Number of entries in Digits list " << digits->GetEntriesFast() << endl ;
   cout << endl ;
-  
-  fDigitsInRun +=  digits->GetEntriesFast() ; 
-
-  if(strstr(option,"all")){
+  if(strstr(option,"all")||strstr(option,"EMC")){
     
     //loop over digits
     AliPHOSDigit * digit;
-    cout << "Digit Id " << " Amplitude " <<  " Index "  <<  " Nprim " << " Primaries list " <<  endl;      
+    cout << "EMC digits (with primaries): " << endl ;
+    cout << "Digit Id     Amplitude   Index       Nprim  Primaries list " <<  endl;      
+    Int_t maxEmc = gime->PHOSGeometry()->GetNModules()*gime->PHOSGeometry()->GetNCristalsInModule() ;
     Int_t index ;
-    for (index = 0 ; index < digits->GetEntries() ; index++) {
+    for (index = 0 ; (index < digits->GetEntriesFast()) && 
+        (((AliPHOSDigit * )  digits->At(index))->GetId() <= maxEmc) ; index++) {
       digit = (AliPHOSDigit * )  digits->At(index) ;
-      cout << setw(8)  <<  digit->GetId() << " "  <<   setw(3)  <<  digit->GetAmp() <<   "  "  
-          << setw(6)  <<  digit->GetIndexInList() << "  "   
-          << setw(5)  <<  digit->GetNprimary() <<"  ";
+      if(digit->GetNprimary() == 0) continue;
+      cout << setw(6)  <<  digit->GetId() << "   "  <<         setw(10)  <<  digit->GetAmp() <<   "    "  
+          << setw(6)  <<  digit->GetIndexInList() << "    "   
+          << setw(5)  <<  digit->GetNprimary() <<"    ";
       
       Int_t iprimary;
       for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++)
-       cout << setw(5)  <<  digit->GetPrimary(iprimary+1) << " ";
+       cout << setw(5)  <<  digit->GetPrimary(iprimary+1) << "    ";
       cout << endl;     
-    }
+    }    
+    cout << endl;
+  }
+
+  if(strstr(option,"all")||strstr(option,"CPV")){
     
+    //loop over CPV digits
+    AliPHOSDigit * digit;
+    cout << "CPV digits: " << endl ;
+    cout << "Digit Id     Amplitude   Index       Nprim  Primaries list " <<  endl;      
+    Int_t maxEmc = gime->PHOSGeometry()->GetNModules()*gime->PHOSGeometry()->GetNCristalsInModule() ;
+    Int_t index ;
+    for (index = 0 ; index < digits->GetEntriesFast(); index++) {
+      digit = (AliPHOSDigit * )  digits->At(index) ;
+      if(digit->GetId() > maxEmc){
+       cout << setw(6)  <<  digit->GetId() << "   "  <<        setw(10)  <<  digit->GetAmp() <<   "    "  
+            << setw(6)  <<  digit->GetIndexInList() << "    "   
+            << setw(5)  <<  digit->GetNprimary() <<"    ";
+       
+       Int_t iprimary;
+       for (iprimary=0; iprimary<digit->GetNprimary(); iprimary++)
+         cout << setw(5)  <<  digit->GetPrimary(iprimary+1) << "    ";
+       cout << endl;    
+      }    
+    }
   }
+
 }
 
 //__________________________________________________________________
@@ -529,6 +739,13 @@ void AliPHOSDigitizer::SetSDigitsBranch(const char* title)
 
   AliPHOSGetter::GetInstance()->SDigits()->SetName(title) ; 
  
+}
+//__________________________________________________________________
+Float_t AliPHOSDigitizer::TimeOfNoise(void)
+{  // Calculates the time signal generated by noise
+  //to be rewritten, now returns just big number
+  return 1. ;
+
 }
 //____________________________________________________________________________
 void AliPHOSDigitizer::Reset() 
@@ -557,56 +774,31 @@ void AliPHOSDigitizer::WriteDigits(Int_t event)
   //      and names of files, from which digits are made.
 
   AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
-  TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ; 
+  const TClonesArray * digits = gime->Digits(GetName()) ; 
+ TTree * treeD ;
 
-  TTree * treeD ;
+ if(fManager) 
+   treeD = fManager->GetTreeD() ;
+ else {
+   if (!gAlice->TreeD() ) 
+     gAlice->MakeTree("D");
+   treeD = gAlice->TreeD();
+ }
 
-  if(fARD)
-    treeD = fARD->GetTreeD() ;
- else
-    treeD = gAlice->TreeD();
-  
-  // create new branches
-  // -- generate file name if necessary
-  char * file =0;
-  if(gSystem->Getenv("CONFIG_SPLIT_FILE")){ //generating file name
-    file = new char[strlen(gAlice->GetBaseFile())+20] ;
-    sprintf(file,"%s/PHOS.Digits.root",gAlice->GetBaseFile()) ;
-  }
 
-  TDirectory *cwd = gDirectory;
   // -- create Digits branch
   Int_t bufferSize = 32000 ;    
   TBranch * digitsBranch = treeD->Branch("PHOS",&digits,bufferSize);
   digitsBranch->SetTitle(GetName());
-  if (file) {
-    digitsBranch->SetFile(file);
-    TIter next( digitsBranch->GetListOfBranches());
-    TBranch * sbr ;
-    while ((sbr=(TBranch*)next())) {
-      sbr->SetFile(file);
-    }   
-    cwd->cd();
-  } 
     
   // -- Create Digitizer branch
   Int_t splitlevel = 0 ;
   AliPHOSDigitizer * d = gime->Digitizer(GetName()) ;
   TBranch * digitizerBranch = treeD->Branch("AliPHOSDigitizer", "AliPHOSDigitizer", &d,bufferSize,splitlevel); 
   digitizerBranch->SetTitle(GetName());
-  if (file) {
-    digitizerBranch->SetFile(file);
-    TIter next( digitizerBranch->GetListOfBranches());
-    TBranch * sbr;
-    while ((sbr=(TBranch*)next())) {
-      sbr->SetFile(file);
-    }   
-    cwd->cd();
-  }
-  
-  digitsBranch->Fill() ;      
-  digitizerBranch->Fill() ;
 
-  treeD->Write(0,kOverwrite) ;  
+  digitsBranch->Fill() ;
+  treeD->AutoSave() ; 
  
 }