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[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSPIDv1.cxx
index c5f0f084e6a2cabb26a001ba69229c5e69de44ef..2a296b724d70159d40696154d253d52c69afb907 100644 (file)
 
 // --- Standard library ---
 
-#include <Riostream.h>
 
 // --- AliRoot header files ---
 
-#include "AliRun.h"
 #include "AliGenerator.h"
 #include "AliPHOS.h"
 #include "AliPHOSPIDv1.h"
@@ -118,61 +116,41 @@ AliPHOSPIDv1::AliPHOSPIDv1():AliPHOSPID()
  
   InitParameters() ; 
   fDefaultInit = kTRUE ; 
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+AliPHOSPIDv1::AliPHOSPIDv1(const AliPHOSPIDv1 & pid ):AliPHOSPID(pid)
+{ 
+  // ctor
+  InitParameters() ; 
+  Init() ;
 
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-AliPHOSPIDv1::AliPHOSPIDv1(const char * headerFile,const char * name, const Bool_t toSplit)
-:AliPHOSPID(headerFile, name,toSplit)
+AliPHOSPIDv1::AliPHOSPIDv1(const TString alirunFileName, const TString eventFolderName):AliPHOSPID(alirunFileName, eventFolderName)
 { 
   //ctor with the indication on where to look for the track segments
  
   InitParameters() ; 
-
   Init() ;
   fDefaultInit = kFALSE ; 
-
 }
 
 //____________________________________________________________________________
 AliPHOSPIDv1::~AliPHOSPIDv1()
 { 
   // dtor
-  // fDefaultInit = kTRUE if PID created by default ctor (to get just the parameters)
-
-  delete [] fX ;    // Principal input 
-  delete [] fP ;    // Principal components
-  delete [] fPPi0 ; // Pi0 Principal components
-
-  if (!fDefaultInit) {  
-//    AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
-    // remove the task from the folder list
-//     gime->RemoveTask("P",GetName()) ;
-//     TString name(GetName()) ; 
-//     name.ReplaceAll("pid", "clu") ; 
-//     gime->RemoveTask("C",name) ;
-    
-//     // remove the data from the folder list
-//     name = GetName() ; 
-//     name.Remove(name.Index(":")) ; 
-//     gime->RemoveObjects("RE", name) ; // EMCARecPoints
-//     gime->RemoveObjects("RC", name) ; // CPVRecPoints
-//     gime->RemoveObjects("T", name) ;  // TrackSegments
-//     gime->RemoveObjects("P", name) ;  // RecParticles
-    
-//     // Delete gAlice
-//     gime->CloseFile() ; 
-    
-    fSplitFile = 0 ; 
-  }
-}
 
+  delete [] fX ;       // Principal input 
+  delete [] fPPhoton ; // Photon Principal components
+  delete [] fPPi0 ;    // Pi0 Principal components
+}
 //____________________________________________________________________________
 const TString AliPHOSPIDv1::BranchName() const 
 {  
-  TString branchName(GetName() ) ;
-  branchName.Remove(branchName.Index(Version())-1) ;
-  return branchName ;
+
+  return GetName() ;
 }
  
 //____________________________________________________________________________
@@ -181,153 +159,97 @@ void AliPHOSPIDv1::Init()
   // Make all memory allocations that are not possible in default constructor
   // Add the PID task to the list of PHOS tasks
 
-  if ( strcmp(GetTitle(), "") == 0 )
-    SetTitle("galice.root") ;
-
-  TString branchname(GetName()) ;
-  branchname.Remove(branchname.Index(Version())-1) ;    
-  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance(GetTitle(),branchname.Data(),fToSplit ) ; 
-
-  //  gime->SetRecParticlesTitle(BranchName()) ;
-  if ( gime == 0 ) {
-    Error("Init", "Could not obtain the Getter object !" ) ;  
-    return ;
-  } 
-
-  fSplitFile = 0 ;
-  if(fToSplit){
-    //First - extract full path if necessary
-    TString fileName(GetTitle()) ;
-    Ssiz_t islash = fileName.Last('/') ;
-    if(islash<fileName.Length())
-      fileName.Remove(islash+1,fileName.Length()) ;
-    else
-      fileName="" ;
-    fileName+="PHOS.RecData." ;
-    if((strcmp(branchname.Data(),"Default")!=0)&&(strcmp(branchname.Data(),"")!=0)){
-      fileName+=branchname.Data() ;
-      fileName+="." ;
-    }
-    fileName+="root" ;
-    fSplitFile = static_cast<TFile*>(gROOT->GetFile(fileName.Data()));   
-    if(!fSplitFile)
-      fSplitFile =  TFile::Open(fileName.Data(),"update") ;
-  }
-  
-  gime->PostPID(this) ;
-  // create a folder on the white board //YSAlice/WhiteBoard/RecParticles/PHOS/recparticlesName
-  gime->PostRecParticles(branchname) ; 
-  
+  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance(GetTitle(), fEventFolderName.Data()) ; 
+
+  if ( !gime->PID() ) 
+    gime->PostPID(this) ;
 }
 
 //____________________________________________________________________________
 void AliPHOSPIDv1::InitParameters()
 {
-//   fFrom               = "" ;
-//   fHeaderFileName     = GetTitle() ; 
-//   TString name(GetName()) ; 
-//   if (name.IsNull()) 
-//     name = "Default" ;
-//   fTrackSegmentsTitle = name ; 
-//   fRecPointsTitle     = name ; 
-//   fRecParticlesTitle  = name ;
-//   name.Append(":") ;
-//   name.Append(Version()) ; 
-//   SetName(name) ; 
+  // Initialize PID parameters
   fRecParticlesInRun = 0 ; 
   fNEvent            = 0 ;            
-  //  fClusterizer       = 0 ;      
-  //  fTSMaker           = 0 ;        
   fRecParticlesInRun = 0 ;
-  TString pidName( GetName()) ;
-  if (pidName.IsNull() ) 
-    pidName = "Default" ; 
-  pidName.Append(":") ; 
-  pidName.Append(Version()) ; 
-  SetName(pidName) ;
-  fPi0Analysis = kFALSE ;
   SetParameters() ; // fill the parameters matrix from parameters file
+  SetEventRange(0,-1) ;
 }
 
-//____________________________________________________________________________
-const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetCpvtoEmcDistanceCut(const Float_t e, const TString Axis) const
+//________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::Exec(Option_t *option)
 {
-  // Get CpvtoEmcDistance Cut depending on the cluster energy, axis and 
-  // Purity-Efficiency point 
+  // Steering method to perform particle reconstruction and identification
+  // for the event range from fFirstEvent to fLastEvent.
+  // This range is optionally set by SetEventRange().
+  // if fLastEvent=-1 (by default), then process events until the end.
 
-  Int_t i = -1;
-  if      (Axis.Contains("X")) i = 1;
-  else if (Axis.Contains("Z")) i = 2;
-  else
-    Error("GetCpvtoEmcDistanceCut"," Invalid axis option ");
-   
-  Float_t a = (*fParameters)(i,0) ;
-  Float_t b = (*fParameters)(i,1) ;
-  Float_t c = (*fParameters)(i,2) ;
+  if(strstr(option,"tim"))
+    gBenchmark->Start("PHOSPID");
+  
+  if(strstr(option,"print")) {
+    Print() ; 
+    return ; 
+  }
 
-  Float_t sig = a + TMath::Exp(b-c*e);
-  return sig;
-}
-//____________________________________________________________________________
 
-const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetTimeGate(const Int_t Eff_Pur) const
-{
-  // Get TimeGate parameter depending on Purity-Efficiency point 
+  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ; 
  
-   if(Eff_Pur>2 || Eff_Pur<0)
-    Error("GetTimeGate","Invalid Efficiency-Purity choice %d",Eff_Pur);
-    return (*fParameters)(3,Eff_Pur) ; 
-
+  if (fLastEvent == -1) 
+    fLastEvent = gime->MaxEvent() - 1 ;
+  else 
+    fLastEvent = TMath::Min(fLastEvent,gime->MaxEvent());
+  Int_t nEvents   = fLastEvent - fFirstEvent + 1;
+
+  Int_t ievent ; 
+  for (ievent = fFirstEvent; ievent <= fLastEvent; ievent++) {
+    gime->Event(ievent,"TR") ;
+    if(gime->TrackSegments() && //Skip events, where no track segments made
+       gime->TrackSegments()->GetEntriesFast()) {
+      MakeRecParticles() ;
+      WriteRecParticles();
+      if(strstr(option,"deb"))
+       PrintRecParticles(option) ;
+      //increment the total number of rec particles per run 
+      fRecParticlesInRun += gime->RecParticles()->GetEntriesFast() ; 
+    }
+  }
+  if(strstr(option,"tim")){
+    gBenchmark->Stop("PHOSPID");
+    Info("Exec", "took %f seconds for PID %f seconds per event", 
+        gBenchmark->GetCpuTime("PHOSPID"),  
+        gBenchmark->GetCpuTime("PHOSPID")/nEvents) ;
+  }
+  Unload();
 }
-//_____________________________________________________________________________
-const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetDistance(AliPHOSEmcRecPoint * emc,AliPHOSRecPoint * cpv, Option_t *  Axis)const
+
+//____________________________________________________________________________
+const TString AliPHOSPIDv1::GetFileNamePrincipal(TString particle) const
 {
-  // Calculates the distance between the EMC RecPoint and the PPSD RecPoint
-  
-  const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::GetInstance()->PHOSGeometry() ; 
-  TVector3 vecEmc ;
-  TVector3 vecCpv ;
-  if(cpv){
-    emc->GetLocalPosition(vecEmc) ;
-    cpv->GetLocalPosition(vecCpv) ; 
-    if(emc->GetPHOSMod() == cpv->GetPHOSMod()){      
-      // Correct to difference in CPV and EMC position due to different distance to center.
-      // we assume, that particle moves from center
-      Float_t dCPV = geom->GetIPtoOuterCoverDistance();
-      Float_t dEMC = geom->GetIPtoCrystalSurface() ;
-      dEMC         = dEMC / dCPV ;
-      vecCpv = dEMC * vecCpv  - vecEmc ; 
-      if (Axis == "X") return vecCpv.X();
-      if (Axis == "Y") return vecCpv.Y();
-      if (Axis == "Z") return vecCpv.Z();
-      if (Axis == "R") return vecCpv.Mag();
-  } 
-    
-    return 100000000 ;
-  }
-  return 100000000 ;
+  //Get file name that contains the PCA for a particle ("photon or pi0")
+  particle.ToLower();
+  TString name;
+  if      (particle=="photon") name = fFileNamePrincipalPhoton ;
+  else if (particle=="pi0"   ) name = fFileNamePrincipalPi0    ;
+  else    Error("GetFileNamePrincipal","Wrong particle name: %s (choose from pi0/photon)\n",particle.Data());
+  return name;
 }
+
 //____________________________________________________________________________
-const Int_t  AliPHOSPIDv1::GetCPVBit(AliPHOSEmcRecPoint * emc,AliPHOSRecPoint * cpv,const Int_t EffPur, const Float_t e) const
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetParameterCalibration(Int_t i) const 
 {
-  if(EffPur>2 || EffPur<0)
-    Error("GetCPVBit","Invalid Efficiency-Purity choice %d",EffPur);
-  
-  Float_t sigX = GetCpvtoEmcDistanceCut(e,"X");
-  Float_t sigZ = GetCpvtoEmcDistanceCut(e,"Z");
-  
-  Float_t deltaX = TMath::Abs(GetDistance(emc, cpv,  "X"));
-  Float_t deltaZ = TMath::Abs(GetDistance(emc, cpv,  "Z"));
-       
-  if((deltaX>sigX*(EffPur+1))|(deltaZ>sigZ*(EffPur+1)))
-    return 1;//Neutral
+  // Get the i-th parameter "Calibration"
+  Float_t param = 0.;
+  if (i>2 || i<0)
+    Error("GetParameterCalibration","Invalid parameter number: %d",i);
   else
-    return 0;//Charged
-  
+    param = (*fParameters)(0,i);
+  return param;
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetCalibratedEnergy(const Float_t e) const
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetCalibratedEnergy(const Float_t e) const
 {
 //      It calibrates Energy depending on the recpoint energy.
 //      The energy of the reconstructed cluster is corrected with 
@@ -335,386 +257,281 @@ const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetCalibratedEnergy(const Float_t e) const
 //      through the study of the reconstructed energy distribution of 
 //      monoenergetic photons.
  
-  Double_t p[]={0.,0.,0.};
-  Int_t i;
-  for(i=0;i<3;i++) p[i]= (*fParameters)(0,i);
-  Double_t  enerec = p[0] +  p[1]* e+ p[2] * e * e;
+  Float_t p[]={0.,0.,0.};
+  for (Int_t i=0; i<3; i++) p[i] = GetParameterCalibration(i);
+  Float_t enerec = p[0] +  p[1]*e + p[2]*e*e;
   return enerec ;
 
 }
-//____________________________________________________________________________
-const Int_t  AliPHOSPIDv1::GetPrincipalBit(const Double_t* P,const Int_t eff_pur, const Float_t E)const
-{
-  //Is the particle inside de PCA ellipse?
 
-  Int_t    prinbit  = 0 ;
-  Double_t A        = GetEllipseParameter("a", E); 
-  Double_t B        = GetEllipseParameter("b", E);
-  Double_t C        = GetEllipseParameter("c", E);
-  Double_t X_center = GetEllipseParameter("x0", E); 
-  Double_t Y_center = GetEllipseParameter("y0", E);
-  
-  Double_t R = TMath::Power((P[0] - X_center)/A,2) + 
-      TMath::Power((P[1] - Y_center)/B,2) +
-      C*(P[0] -  X_center)*(P[1] - Y_center)/(A*B) ;
-  //3 different ellipses defined
-  if((eff_pur==2)&&(R <1./2.)) prinbit= 1;
-  if((eff_pur==1)&&(R <2.   )) prinbit= 1;
-  if((eff_pur==0)&&(R <9./2.)) prinbit= 1;
-
-  if(R<0)
-    Error("GetPrincipalBit", "Negative square? R=%f \n",R) ;
-
-  return prinbit;
-
-}
 //____________________________________________________________________________
-const Int_t  AliPHOSPIDv1::GetPrincipalPi0Bit(const Double_t* P,const Int_t eff_pur, const Float_t E)const
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetParameterCpv2Emc(Int_t i, TString axis) const 
 {
-  //Is the particle inside de Pi0 PCA ellipse?
-
-  Int_t    prinbit  = 0 ;
-  Double_t A        = GetEllipseParameterPi0("a", E); 
-  Double_t B        = GetEllipseParameterPi0("b", E);
-  Double_t C        = GetEllipseParameterPi0("c", E);
-  Double_t X_center = GetEllipseParameterPi0("x0", E); 
-  Double_t Y_center = GetEllipseParameterPi0("y0", E);
-  
-  Double_t R = TMath::Power((P[0] - X_center)/A,2) + 
-      TMath::Power((P[1] - Y_center)/B,2) +
-      C*(P[0] -  X_center)*(P[1] - Y_center)/(A*B) ;
-  //3 different ellipses defined
-  if((eff_pur==2)&&(R <1./2.)) prinbit= 1;
-  if((eff_pur==1)&&(R <2.   )) prinbit= 1;
-  if((eff_pur==0)&&(R <9./2.)) prinbit= 1;
-
-  if(R<0)
-    Error("GetPrincipalPi0Bit", "Negative square?") ;
-
-  return prinbit;
-
+  // Get the i-th parameter "CPV-EMC distance" for the specified axis
+  Float_t param = 0.;
+  if(i>2 || i<0)
+    Error("GetParameterCpv2Emc","Invalid parameter number: %d",i);
+  else {
+    axis.ToLower();
+    if      (axis == "x") param = (*fParameters)(1,i);
+    else if (axis == "z") param = (*fParameters)(2,i);
+    else Error("GetParameterCpv2Emc","Invalid axis name: %s",axis.Data());
+  }
+  return  param;
 }
-//_____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::SetCpvtoEmcDistanceCutParameters(Float_t e, Int_t Eff_Pur, TString Axis,Float_t cut) 
-{
-  // Set the parameters to calculate Cpvto EmcDistanceCut depending on the cluster energy and 
-  // Purity-Efficiency point 
-
-  if(Eff_Pur>2 || Eff_Pur<0)
-     Error("SetCpvtoEmcDistanceCutParameters","Invalid Efficiency-Purity choice %d",Eff_Pur);
 
-  Int_t i = -1;
-  if     (Axis.Contains("X")) i = 1;
-  else if(Axis.Contains("Z")) i = 2;
-  else
-    Error("SetCpvtoEmcDistanceCutParameters"," Invalid axis option");
-  
-  (*fParameters)(i,Eff_Pur) = cut ;
-}
-//_____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::SetTimeGate(Int_t Eff_Pur, Float_t gate) 
+//____________________________________________________________________________
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetCpv2EmcDistanceCut(TString axis, Float_t e) const
 {
-  // Set the parameter TimeGate depending on the cluster energy and 
+  // Get CpvtoEmcDistance Cut depending on the cluster energy, axis and 
   // Purity-Efficiency point 
-  if(Eff_Pur>2 || Eff_Pur<0)
-    Error("SetTimeGate","Invalid Efficiency-Purity choice %d",Eff_Pur);
-  
-  (*fParameters)(3,Eff_Pur)= gate ; 
-} 
-//_____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::SetParameters() 
-{
-  // PCA : To do the Principal Components Analysis it is necessary 
-  // the Principal file, which is opened here
-  fX         = new double[7]; // Data for the PCA 
-  fP         = new double[7]; // Eigenvalues of the PCA
-  fPPi0      = new double[7]; // Eigenvalues of the Pi0 PCA
-
-  // Read photon principals from the photon file
-  
-  fFileName     = "$ALICE_ROOT/PHOS/PCA8pa15_0.5-100.root" ; 
-  TFile f( fFileName.Data(), "read" ) ;
-  fPrincipal = dynamic_cast<TPrincipal*> (f.Get("principal")) ; 
-  f.Close() ; 
-
-  // Read pi0 principals from the pi0 file
-
-  fFileNamePi0  = "$ALICE_ROOT/PHOS/PCA_pi0_40-120.root" ;
-  TFile fPi0( fFileNamePi0.Data(), "read" ) ;
-  fPrincipalPi0 = dynamic_cast<TPrincipal*> (fPi0.Get("principal")) ; 
-  fPi0.Close() ;
 
-  // Open parameters file and initialization of the Parameters matrix. 
-  // In the File Parameters.dat are all the parameters. These are introduced 
-  // in a matrix of 9x4  
-  // 
-  // All the parameters defined in this file are, in order of row: 
-  // -CpvtoEmcDistanceCut (2 row (x and z) and 3 columns, each one depending 
-  // on the parameter of the funtion that sets the cut in x or z.   
-  // -TimeGate, 1 row and 3 columns (3 efficiency-purty cuts) 
-  // -PCA, parameters of the functions that 
-  // calculate the ellipse parameters, x0,y0,a, b, c. These 5 parameters 
-  // (5 rows) depend on 4 parameters (columns). 
-  // -Finally there is a row with the energy calibration parameters, 
-  // 3 parameters. 
-
-  fFileNamePar = gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT/PHOS/Parameters.dat");
-  fParameters = new TMatrixD(14,4) ;
-  const Int_t maxLeng=255;
-  char string[maxLeng];
-
-  // Open a text file with PID parameters
-  FILE *fd = fopen(fFileNamePar.Data(),"r");
-  if (!fd)
-    Fatal("SetParameter","File %s with a PID parameters cannot be opened\n",
-         fFileNamePar.Data());
+  axis.ToLower();
+  Float_t p[]={0.,0.,0.};
+  for (Int_t i=0; i<3; i++) p[i] = GetParameterCpv2Emc(i,axis);
+  Float_t sig = p[0] + TMath::Exp(p[1] - p[2]*e);
+  return sig;
+}
 
-  Int_t i=0;
-  // Read parameter file line-by-line and skip empty line and comments
-  while (fgets(string,maxLeng,fd) != NULL) {
-    if (string[0] == '\n' ) continue;
-    if (string[0] == '!'  ) continue;
-    sscanf(string, "%lf %lf %lf %lf",
-          &(*fParameters)(i,0), &(*fParameters)(i,1), 
-          &(*fParameters)(i,2), &(*fParameters)(i,3));
-    i++;
+//____________________________________________________________________________
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetEllipseParameter(TString particle, TString param, Float_t e) const 
+{
+  // Calculates the parameter param of the ellipse
+
+  particle.ToLower();
+  param.   ToLower();
+  Float_t p[4]={0.,0.,0.,0.};
+  Float_t value = 0.0;
+  for (Int_t i=0; i<4; i++) p[i] = GetParameterToCalculateEllipse(particle,param,i);
+  if (particle == "photon") {
+    if      (param.Contains("a"))  e = TMath::Min((Double_t)e,70.);
+    else if (param.Contains("b"))  e = TMath::Min((Double_t)e,70.);
+    else if (param.Contains("x0")) e = TMath::Max((Double_t)e,1.1);
   }
-  fclose(fd);
-}
 
+  value = p[0]/TMath::Sqrt(e) + p[1]*e + p[2]*e*e + p[3];
+  return value;
+}
 
-//________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::SetEllipseParameter(TString Param, Int_t i, Double_t par) 
-{  
-  // Set the parameter "i" that is needed to calculate the ellipse 
-  // parameter "Param".
-  
-  Int_t p= -1;
-  if     (Param.Contains("a")) p=4; 
-  else if(Param.Contains("b")) p=5; 
-  else if(Param.Contains("c")) p=6; 
-  else if(Param.Contains("x0"))p=7; 
-  else if(Param.Contains("y0"))p=8;
-  if((i>4)||(i<0))
-    Error("SetEllipseParameter", "No parameter with index %d", i) ; 
-  else if(p==-1)
-     Error("SetEllipseParameter", "No parameter with name %s", Param.Data() ) ; 
-  else
-    (*fParameters)(p,i) = par ;
-} 
-//________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::SetEllipseParameterPi0(TString Param, Int_t i, Double_t par) 
-{  
-  // Set the parameter "i" that is needed to calculate the ellipse 
-  // parameter "Param".
-  if(!fPi0Analysis) Error("SetPi0EllipseParameter", "Pi 0 Analysis is off") ; 
-  Int_t p= -1;
-  if     (Param.Contains("a")) p=9; 
-  else if(Param.Contains("b")) p=10; 
-  else if(Param.Contains("c")) p=11; 
-  else if(Param.Contains("x0"))p=12; 
-  else if(Param.Contains("y0"))p=13;
-  if((i>4)||(i<0))
-    Error("SetPi0EllipseParameter", "No parameter with index %d", i) ; 
-  else if(p==-1)
-     Error("SetPi0EllipseParameter", "No parameter with name %s", Param.Data() ) ; 
-  else
-    (*fParameters)(p,i) = par ;
-} 
-//________________________________________________________________________
-const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetParameterToCalculateEllipse(const TString Param, const Int_t i) const
+//_____________________________________________________________________________
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetParameterPhotonBoundary (Int_t i) const
 { 
-  // Get the parameter "i" that is needed to calculate the ellipse 
-  // parameter "Param".
-
-  Int_t p= -1;
-  Double_t par = -1;
-
-  if     (Param.Contains("a")) p=4; 
-  else if(Param.Contains("b")) p=5; 
-  else if(Param.Contains("c")) p=6; 
-  else if(Param.Contains("x0"))p=7; 
-  else if(Param.Contains("y0"))p=8;
+  // Get the parameter "i" to calculate the boundary on the moment M2x
+  // for photons at high p_T
+  Float_t param = 0;
+  if (i>3 || i<0)
+    Error("GetParameterPhotonBoundary","Wrong parameter number: %d\n",i);
+  else
+    param = (*fParameters)(14,i) ;
+  return param;
+}
 
-  if((i>4)||(i<0))
-    Error("GetParameterToCalculateEllipse", "No parameter with index", i) ; 
-  else if(p==-1)
-    Error("GetParameterToCalculateEllipse", "No parameter with name %s", Param.Data() ) ; 
+//____________________________________________________________________________
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetParameterPi0Boundary (Int_t i) const
+{ 
+  // Get the parameter "i" to calculate the boundary on the moment M2x
+  // for pi0 at high p_T
+  Float_t param = 0;
+  if (i>2 || i<0)
+    Error("GetParameterPi0Boundary","Wrong parameter number: %d\n",i);
   else
-    par = (*fParameters)(p,i) ;
-  
-  return par;
+    param = (*fParameters)(15,i) ;
+  return param;
+}
 
-} 
 //____________________________________________________________________________
-const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetParameterToCalculatePi0Ellipse(const TString Param, const Int_t i) const
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetParameterTimeGate(Int_t i) const
+{
+  // Get TimeGate parameter depending on Purity-Efficiency i:
+  // i=0 - Low purity, i=1 - Medium purity, i=2 - High purity
+  Float_t param = 0.;
+  if(i>2 || i<0)
+    Error("GetParameterTimeGate","Invalid Efficiency-Purity choice %d",i);
+  else
+    param = (*fParameters)(3,i) ; 
+  return param;
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetParameterToCalculateEllipse(TString particle, TString param, Int_t i) const
 { 
   // Get the parameter "i" that is needed to calculate the ellipse 
-  // parameter "Param".
+  // parameter "param" for the particle "particle" ("photon" or "pi0")
 
-  if(!fPi0Analysis) Error("GetParameterToCalculatePi0Ellipse", "Pi 0 Analysis is off") ;
+  particle.ToLower();
+  param.   ToLower();
+  Int_t offset = -1;
+  if      (particle == "photon") offset=0;
+  else if (particle == "pi0")    offset=5;
+  else
+    Error("GetParameterToCalculateEllipse","Wrong particle name: %s (choose from pi0/photon)\n",particle.Data());
 
   Int_t p= -1;
-  Double_t par = -1;
+  Float_t par = 0;
 
-  if(Param.Contains("a")) p=9
-  if(Param.Contains("b")) p=10
-  if(Param.Contains("c")) p=11
-  if(Param.Contains("x0"))p=12
-  if(Param.Contains("y0"))p=13;
+  if     (param.Contains("a")) p=4+offset
+  else if(param.Contains("b")) p=5+offset
+  else if(param.Contains("c")) p=6+offset
+  else if(param.Contains("x0"))p=7+offset
+  else if(param.Contains("y0"))p=8+offset;
 
-  if((i>4)||(i<0))
-    Error("GetParameterToCalculatePi0Ellipse", "No parameter with index", i) ; 
-  else if(p==-1)
-    Error("GetParameterToCalculatePi0Ellipse", "No parameter with name %s", Param.Data() ) ; 
+  if      (i>4 || i<0)
+    Error("GetParameterToCalculateEllipse", "No parameter with index", i) ; 
+  else if (p==-1)
+    Error("GetParameterToCalculateEllipse", "No parameter with name %s", param.Data() ) ; 
   else
     par = (*fParameters)(p,i) ;
   
   return par;
+}
+
 
-} 
 //____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::SetCalibrationParameter(Int_t i,Double_t param) 
+const Float_t  AliPHOSPIDv1::GetDistance(AliPHOSEmcRecPoint * emc,AliPHOSRecPoint * cpv, Option_t *  axis)const
 {
-  (*fParameters)(0,i) = param ;
+  // Calculates the distance between the EMC RecPoint and the PPSD RecPoint
+  
+  const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::Instance()->PHOSGeometry() ; 
+  TVector3 vecEmc ;
+  TVector3 vecCpv ;
+  if(cpv){
+    emc->GetLocalPosition(vecEmc) ;
+    cpv->GetLocalPosition(vecCpv) ; 
+    if(emc->GetPHOSMod() == cpv->GetPHOSMod()){      
+      // Correct to difference in CPV and EMC position due to different distance to center.
+      // we assume, that particle moves from center
+      Float_t dCPV = geom->GetIPtoOuterCoverDistance();
+      Float_t dEMC = geom->GetIPtoCrystalSurface() ;
+      dEMC         = dEMC / dCPV ;
+      vecCpv = dEMC * vecCpv  - vecEmc ; 
+      if (axis == "X") return vecCpv.X();
+      if (axis == "Y") return vecCpv.Y();
+      if (axis == "Z") return vecCpv.Z();
+      if (axis == "R") return vecCpv.Mag();
+    }
+    return 100000000 ;
+  }
+  return 100000000 ;
 }
 //____________________________________________________________________________
-const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetCalibrationParameter(const Int_t i) const 
+const Int_t  AliPHOSPIDv1::GetCPVBit(AliPHOSEmcRecPoint * emc,AliPHOSRecPoint * cpv,const Int_t effPur, Float_t e) const
 {
-  Float_t param = (*fParameters)(0,i);
-  return param;
+  if(effPur>2 || effPur<0)
+    Error("GetCPVBit","Invalid Efficiency-Purity choice %d",effPur);
+  
+  Float_t sigX = GetCpv2EmcDistanceCut("X",e);
+  Float_t sigZ = GetCpv2EmcDistanceCut("Z",e);
+  
+  Float_t deltaX = TMath::Abs(GetDistance(emc, cpv,  "X"));
+  Float_t deltaZ = TMath::Abs(GetDistance(emc, cpv,  "Z"));
+       
+  if((deltaX>sigX*(effPur+1))|(deltaZ>sigZ*(effPur+1)))
+    return 1;//Neutral
+  else
+    return 0;//Charged
 }
+
 //____________________________________________________________________________
-const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetEllipseParameter(const TString Param,Float_t E) const 
+const Int_t  AliPHOSPIDv1::GetPrincipalBit(TString particle, const Double_t* p,const Int_t effPur, Float_t e)const
 {
-  // Calculates the parameter Param of the ellipse
+  //Is the particle inside de PCA ellipse?
   
-  Double_t p[4]={0.,0.,0.,0.};
-  Double_t value = 0.0;
-  Int_t i;
+  particle.ToLower();
+  Int_t    prinbit  = 0 ;
+  Float_t a        = GetEllipseParameter(particle,"a" , e); 
+  Float_t b        = GetEllipseParameter(particle,"b" , e);
+  Float_t c        = GetEllipseParameter(particle,"c" , e);
+  Float_t x0 = GetEllipseParameter(particle,"x0", e); 
+  Float_t y0 = GetEllipseParameter(particle,"y0", e);
+  
+  Float_t r = TMath::Power((p[0] - x0)/a,2) + 
+              TMath::Power((p[1] - y0)/b,2) +
+            c*(p[0] -  x0)*(p[1] - y0)/(a*b) ;
+  //3 different ellipses defined
+  if((effPur==2) && (r<1./2.)) prinbit= 1;
+  if((effPur==1) && (r<2.   )) prinbit= 1;
+  if((effPur==0) && (r<9./2.)) prinbit= 1;
 
-  if(Param.Contains("a")){
-    for(i=0;i<4;i++)p[i]=(*fParameters)(4,i);
-    if(E>70.)E=70.;
-  }
-  
-  else if(Param.Contains("b")){
-    for(i=0;i<4;i++)p[i]=(*fParameters)(5,i);
-    if(E>70.)E=70.;
-  }
-  
-  else if(Param.Contains("c"))
-    for(i=0;i<4;i++)p[i]=(*fParameters)(6,i);
-  
-  else if(Param.Contains("x0")){
-    for(i=0;i<4;i++)p[i]=(*fParameters)(7,i);
-    if(E<1.)E=1.1;
-  }
-  else if(Param.Contains("y0"))
-    for(i=0;i<4;i++)p[i]=(*fParameters)(8,i);
-  
-  value = p[0]/TMath::Sqrt(E)+p[1]*E+p[2]*E*E+p[3];
-  return value;
-}
+  if(r<0)
+    Error("GetPrincipalBit", "Negative square?") ;
+
+  return prinbit;
 
+}
 //____________________________________________________________________________
-// const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetEllipseParameter(const TString Param,Float_t E) const 
-// {
-//   // Calculates the parameter Param of the pi0 ellipse
-  
-//   Double_t p[3]  = {0.,0.,0.};
-//   Double_t value = 0.0;
-//   Int_t    i;
-
-//   if(Param.Contains("a"))
-//     for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(4,i);
-//   else if(Param.Contains("b"))
-//     for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(5,i);
-//   else if(Param.Contains("c"))
-//     for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(6,i);
-//   else if(Param.Contains("x0"))
-//     for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(7,i);
-//   else if(Param.Contains("y0"))
-//     for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(8,i);
-  
-//   value = p[0] + p[1]*E + p[2]*E*E;
-//   return value;
-// }
+const Int_t  AliPHOSPIDv1::GetHardPhotonBit(AliPHOSEmcRecPoint * emc) const
+{
+  // Set bit for identified hard photons (E > 30 GeV)
+  // if the second moment M2x is below the boundary
+
+  Float_t e   = emc->GetEnergy();
+  if (e < 30.0) return 0;
+  Float_t m2x = emc->GetM2x();
+  Float_t m2xBoundary = GetParameterPhotonBoundary(0) *
+    TMath::Exp(-TMath::Power(e-GetParameterPhotonBoundary(1),2)/2.0/
+               TMath::Power(GetParameterPhotonBoundary(2),2)) +
+    GetParameterPhotonBoundary(3);
+  Info("GetHardPhotonBit","E=%f, m2x=%f, boundary=%f",e,m2x,m2xBoundary);
+  if (m2x < m2xBoundary)
+    return 1;// A hard photon
+  else
+    return 0;// Not a hard photon
+}
+
 //____________________________________________________________________________
-const Double_t  AliPHOSPIDv1::GetEllipseParameterPi0(const TString Param,Float_t E) const 
+const Int_t  AliPHOSPIDv1::GetHardPi0Bit(AliPHOSEmcRecPoint * emc) const
 {
-  // Calculates the parameter Param of the pi0 ellipse
-  
-  Double_t p[3]  = {0.,0.,0.};
-  Double_t value = 0.0;
-  Int_t    i;
-
-  if(Param.Contains("a"))
-    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(9,i);
-  else if(Param.Contains("b"))
-    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(10,i);
-  else if(Param.Contains("c"))
-    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(11,i);
-  else if(Param.Contains("x0"))
-    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(12,i);
-  else if(Param.Contains("y0"))
-    for(i=0;i<3;i++)p[i]=(*fParameters)(13,i);
-  
-  value = p[0] + p[1]*E + p[2]*E*E;
-  return value;
+  // Set bit for identified hard pi0  (E > 30 GeV)
+  // if the second moment M2x is above the boundary
+
+  Float_t e   = emc->GetEnergy();
+  if (e < 30.0) return 0;
+  Float_t m2x = emc->GetM2x();
+  Float_t m2xBoundary = GetParameterPi0Boundary(0) +
+                    e * GetParameterPi0Boundary(1);
+  Info("GetHardPi0Bit","E=%f, m2x=%f, boundary=%f",e,m2x,m2xBoundary);
+  if (m2x > m2xBoundary)
+    return 1;// A hard pi0
+  else
+    return 0;// Not a hard pi0
 }
+
 //____________________________________________________________________________
+TVector3 AliPHOSPIDv1::GetMomentumDirection(AliPHOSEmcRecPoint * emc, AliPHOSRecPoint * )const 
+{ 
+  // Calculates the momentum direction:
+  //   1. if only a EMC RecPoint, direction is given by IP and this RecPoint
+  //   2. if a EMC RecPoint and CPV RecPoint, direction is given by the line through the 2 recpoints 
+  //  However because of the poor position resolution of PPSD the direction is always taken as if we were 
+  //  in case 1.
 
-void  AliPHOSPIDv1::Exec(Option_t * option) 
-{
-  //Steering method
+  TVector3 dir(0,0,0) ; 
   
-  if( strcmp(GetName(), "")== 0 ) 
-    Init() ;
+  TVector3 emcglobalpos ;
+  TMatrix  dummy ;
   
-  if(strstr(option,"tim"))
-    gBenchmark->Start("PHOSPID");
+  emc->GetGlobalPosition(emcglobalpos, dummy) ;
   
-  if(strstr(option,"print")) {
-    Print("") ; 
-    return ; 
-  }
 
+  dir = emcglobalpos ;  
+  dir.SetZ( -dir.Z() ) ;   // why ?  
+  dir.SetMag(1.) ;
 
-  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
-  if(gime->BranchExists("RecParticles") )
-    return ;
-  Int_t nevents = gime->MaxEvent() ;  
-  Int_t ievent ;
+  //account correction to the position of IP
+  Float_t xo,yo,zo ; //Coordinates of the origin
+  gAlice->Generator()->GetOrigin(xo,yo,zo) ;
+  TVector3 origin(xo,yo,zo);
+  dir = dir - origin ;
 
-  for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
-    gime->Event(ievent,"R") ;
-    if(gime->TrackSegments() && //Skip events, where no track segments made
-       gime->TrackSegments()->GetEntriesFast()) {
-      MakeRecParticles() ;
-      WriteRecParticles(ievent);
-      if(strstr(option,"deb"))
-        PrintRecParticles(option) ;
-      //increment the total number of rec particles per run 
-      fRecParticlesInRun+=gime->RecParticles(BranchName())->GetEntriesFast() ; 
-    }
-  }
-  
-  if(strstr(option,"tim")){
-    gBenchmark->Stop("PHOSPID");
-    Info("Exec", "took %f seconds for PID %f seconds per event", 
-        gBenchmark->GetCpuTime("PHOSPID"),  
-        gBenchmark->GetCpuTime("PHOSPID")/nevents) ;
-  } 
+  return dir ;  
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::MakeRecParticles(){
-
+void  AliPHOSPIDv1::MakeRecParticles()
+{
   // Makes a RecParticle out of a TrackSegment
   
-  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
+  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ; 
   TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ; 
   TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ; 
   TClonesArray * trackSegments = gime->TrackSegments() ; 
@@ -751,7 +568,7 @@ void  AliPHOSPIDv1::MakeRecParticles(){
       Fatal("MakeRecParticles", "-> emc(%d) = %d", ts->GetEmcIndex(), emc ) ;
     }
 
-    Float_t    e = emc->GetEnergy() ;   
+    Float_t e = emc->GetEnergy() ;   
     
     Float_t  lambda[2] ;
     emc->GetElipsAxis(lambda) ;
@@ -776,51 +593,50 @@ void  AliPHOSPIDv1::MakeRecParticles(){
       fX[5] = Emaxdtotal ;  
       fX[6] = emc->GetCoreEnergy() ;  
       
-      fPrincipal->X2P(fX,fP);
-      if(fPi0Analysis)
-       fPrincipalPi0->X2P(fX,fPPi0);
+      fPrincipalPhoton->X2P(fX,fPPhoton);
+      fPrincipalPi0   ->X2P(fX,fPPi0);
 
     }
     else{
-      fP[0]=-100.0;  //We do not accept clusters with 
-      fP[1]=-100.0;  //one cell as a photon-like
-      if(fPi0Analysis){
-       fPPi0[0]=-100.0;
-       fPPi0[1]=-100.0;
-      }
+      fPPhoton[0]=-100.0;  //We do not accept clusters with 
+      fPPhoton[1]=-100.0;  //one cell as a photon-like
+      fPPi0[0]   =-100.0;
+      fPPi0[1]   =-100.0;
     }
     
     Float_t time =emc->GetTime() ;
     
     // Loop of Efficiency-Purity (the 3 points of purity or efficiency 
     // are taken into account to set the particle identification)
-    for(Int_t eff_pur = 0; eff_pur < 3 ; eff_pur++){
+    for(Int_t effPur = 0; effPur < 3 ; effPur++){
       
       // Looking at the CPV detector. If RCPV greater than CpvEmcDistance, 
       // 1st,2nd or 3rd bit (depending on the efficiency-purity point )
       // is set to 1
-      if(GetCPVBit(emc, cpv, eff_pur,e) == 1 )  
-       rp->SetPIDBit(eff_pur) ;
+      if(GetCPVBit(emc, cpv, effPur,e) == 1 )  
+       rp->SetPIDBit(effPur) ;
       
       // Looking the TOF. If TOF smaller than gate,  4th, 5th or 6th 
       // bit (depending on the efficiency-purity point )is set to 1             
-      if(time< (*fParameters)(2,eff_pur)) 
-       rp->SetPIDBit(eff_pur+3) ;                  
+      if(time< (*fParameters)(2,effPur)) 
+       rp->SetPIDBit(effPur+3) ;                   
       
+      //Photon PCA
       //If we are inside the ellipse, 7th, 8th or 9th 
       // bit (depending on the efficiency-purity point )is set to 1 
-      if(GetPrincipalBit(fP,eff_pur,e) == 1) 
-       rp->SetPIDBit(eff_pur+6) ;
+      if(GetPrincipalBit("photon",fPPhoton,effPur,e) == 1) 
+       rp->SetPIDBit(effPur+6) ;
 
-      //Pi0 analysis
+      //Pi0 PCA
       //If we are inside the ellipse, 10th, 11th or 12th 
       // bit (depending on the efficiency-purity point )is set to 1 
-      if(fPi0Analysis){
-       if(GetPrincipalPi0Bit(fPPi0,eff_pur,e) == 1) 
-         rp->SetPIDBit(eff_pur+9) ;
-      }
+      if(GetPrincipalBit("pi0"   ,fPPi0   ,effPur,e) == 1) 
+       rp->SetPIDBit(effPur+9) ;
     }
-    
+    if(GetHardPhotonBit(emc))
+      rp->SetPIDBit(12) ;
+    if(GetHardPi0Bit   (emc))
+      rp->SetPIDBit(13) ;
     
     //Set momentum, energy and other parameters 
     Float_t  encal = GetCalibratedEnergy(e);
@@ -837,112 +653,36 @@ void  AliPHOSPIDv1::MakeRecParticles(){
     rp->SetPolarisation(0,0,0);
     index++ ; 
   }
-  
 }
-
+  
 //____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::Print()
+void  AliPHOSPIDv1::Print() const
 {
   // Print the parameters used for the particle type identification
 
-  TString message ; 
-    message  = "\n=============== AliPHOSPID1 ================\n" ;
-    message += "Making PID\n";
-    message += "    Pricipal analysis file from 0.5 to 100 %s\n" ; 
-    message += "    Name of parameters file     %s\n" ;
-    message += "    Matrix of Parameters: 14x4\n" ;
-    message += "        Energy Calibration  1x3 [3 parametres to calibrate energy: A + B* E + C * E^2]\n" ;
-    message += "        RCPV 2x3 rows x and z, columns function cut parameters\n" ;
-    message += "        TOF  1x3 [High Eff-Low Pur,Medium Eff-Pur, Low Eff-High Pur]\n" ;
-    message += "        PCA  5x4 [5 ellipse parametres and 4 parametres to calculate them: A/Sqrt(E) + B* E + C * E^2 + D]\n" ;
-    message += "    Pi0 PCA  5x3 [5 ellipse parametres and 3 parametres to calculate them: A + B* E + C * E^2]\n" ;
-    Info("Print", message.Data(), fFileName.Data(), fFileNamePar.Data() ) ; 
+    Info("Print", "=============== AliPHOSPIDv1 ================") ;
+    printf("Making PID\n") ;
+    printf("    Pricipal analysis file from 0.5 to 100 %s\n", fFileNamePrincipalPhoton.Data() )   ; 
+    printf("    Name of parameters file     %s\n", fFileNameParameters.Data() )  ;
+    printf("    Matrix of Parameters: 14x4\n") ;
+    printf("        Energy Calibration  1x3 [3 parametres to calibrate energy: A + B* E + C * E^2]\n") ;
+    printf("        RCPV 2x3 rows x and z, columns function cut parameters\n") ;
+    printf("        TOF  1x3 [High Eff-Low Pur,Medium Eff-Pur, Low Eff-High Pur]\n") ;
+    printf("        PCA  5x4 [5 ellipse parametres and 4 parametres to calculate them: A/Sqrt(E) + B* E + C * E^2 + D]\n") ;
+    Printf("    Pi0 PCA  5x3 [5 ellipse parametres and 3 parametres to calculate them: A + B* E + C * E^2]\n") ;
     fParameters->Print() ;
 }
 
-//____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::WriteRecParticles(Int_t event)
-{
-  AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
 
-  TClonesArray * recParticles = gime->RecParticles() ; 
-  recParticles->Expand(recParticles->GetEntriesFast() ) ;
-  TTree * treeR ;
-
-  if(fToSplit){
-    if(!fSplitFile)
-      return ;
-    fSplitFile->cd() ;
-    char name[10] ;
-    sprintf(name,"%s%d", "TreeR",event) ;
-    treeR = dynamic_cast<TTree*>(fSplitFile->Get(name)); 
-  }
-  else{
-    treeR = gAlice->TreeR();
-  }
-  
-  if(!treeR){
-    gAlice->MakeTree("R", fSplitFile);
-    treeR = gAlice->TreeR() ;
-  }
-  
-  //First rp
-  Int_t bufferSize = 32000 ;    
-  TBranch * rpBranch = treeR->Branch("PHOSRP",&recParticles,bufferSize);
-  rpBranch->SetTitle(BranchName());
-
-  
-  //second, pid
-  Int_t splitlevel = 0 ; 
-  AliPHOSPIDv1 * pid = this ;
-  TBranch * pidBranch = treeR->Branch("AliPHOSPID","AliPHOSPIDv1",&pid,bufferSize,splitlevel);
-  pidBranch->SetTitle(BranchName());
-  
-  rpBranch->Fill() ;
-  pidBranch->Fill() ; 
-  
-  treeR->AutoSave() ; //Write(0,kOverwrite) ;  
-  if(gAlice->TreeR()!=treeR){
-    treeR->Delete();
-  }
-}
 
-//____________________________________________________________________________
-TVector3 AliPHOSPIDv1::GetMomentumDirection(AliPHOSEmcRecPoint * emc, AliPHOSRecPoint * cpv)const 
-{ 
-  // Calculates the momentum direction:
-  //   1. if only a EMC RecPoint, direction is given by IP and this RecPoint
-  //   2. if a EMC RecPoint and CPV RecPoint, direction is given by the line through the 2 recpoints 
-  //  However because of the poor position resolution of PPSD the direction is always taken as if we were 
-  //  in case 1.
-
-  TVector3 dir(0,0,0) ; 
-  
-  TVector3 emcglobalpos ;
-  TMatrix  dummy ;
-  
-  emc->GetGlobalPosition(emcglobalpos, dummy) ;
-
-  dir = emcglobalpos ;  
-  dir.SetZ( -dir.Z() ) ;   // why ?  
-
-  //account correction to the position of IP
-  Float_t xo,yo,zo ; //Coordinates of the origin
-  gAlice->Generator()->GetOrigin(xo,yo,zo) ;
-  TVector3 origin(xo,yo,zo);
-  dir = dir - origin ;
-  dir.SetMag(1.) ;
-  return dir ;  
-}
 //____________________________________________________________________________
 void AliPHOSPIDv1::PrintRecParticles(Option_t * option)
 {
   // Print table of reconstructed particles
 
-  AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
+  AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::Instance() ; 
 
-  TClonesArray * recParticles = gime->RecParticles(BranchName()) ; 
+  TClonesArray * recParticles = gime->RecParticles() ; 
 
   TString message ; 
   message  = "\nevent " ;
@@ -968,5 +708,178 @@ void AliPHOSPIDv1::PrintRecParticles(Option_t * option)
   Info("Print", message.Data() ) ; 
 }
 
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetParameters() 
+{
+  // PCA : To do the Principal Components Analysis it is necessary 
+  // the Principal file, which is opened here
+  fX       = new double[7]; // Data for the PCA 
+  fPPhoton = new double[7]; // Eigenvalues of the PCA
+  fPPi0    = new double[7]; // Eigenvalues of the Pi0 PCA
+
+  // Read photon principals from the photon file
+  
+  fFileNamePrincipalPhoton = "$ALICE_ROOT/PHOS/PCA8pa15_0.5-100.root" ; 
+  TFile f( fFileNamePrincipalPhoton.Data(), "read" ) ;
+  fPrincipalPhoton = dynamic_cast<TPrincipal*> (f.Get("principal")) ; 
+  f.Close() ; 
+
+  // Read pi0 principals from the pi0 file
+
+  fFileNamePrincipalPi0    = "$ALICE_ROOT/PHOS/PCA_pi0_40-120.root" ;
+  TFile fPi0( fFileNamePrincipalPi0.Data(), "read" ) ;
+  fPrincipalPi0    = dynamic_cast<TPrincipal*> (fPi0.Get("principal")) ; 
+  fPi0.Close() ;
+
+  // Open parameters file and initialization of the Parameters matrix. 
+  // In the File Parameters.dat are all the parameters. These are introduced 
+  // in a matrix of 16x4  
+  // 
+  // All the parameters defined in this file are, in order of row: 
+  // line   0   : calibration 
+  // lines  1,2 : CPV rectangular cat for X and Z
+  // line   3   : TOF cut
+  // lines  4-8 : parameters to calculate photon PCA ellipse
+  // lines  9-13: parameters to calculate pi0 PCA ellipse
+  // lines 14-15: parameters to calculate border for high-pt photons and pi0
+
+  fFileNameParameters = gSystem->ExpandPathName("$ALICE_ROOT/PHOS/Parameters.dat");
+  fParameters = new TMatrix(16,4) ;
+  const Int_t maxLeng=255;
+  char string[maxLeng];
+
+  // Open a text file with PID parameters
+  FILE *fd = fopen(fFileNameParameters.Data(),"r");
+  if (!fd)
+    Fatal("SetParameter","File %s with a PID parameters cannot be opened\n",
+         fFileNameParameters.Data());
+
+  Int_t i=0;
+  // Read parameter file line-by-line and skip empty line and comments
+  while (fgets(string,maxLeng,fd) != NULL) {
+    if (string[0] == '\n' ) continue;
+    if (string[0] == '!'  ) continue;
+    sscanf(string, "%f %f %f %f",
+          &(*fParameters)(i,0), &(*fParameters)(i,1), 
+          &(*fParameters)(i,2), &(*fParameters)(i,3));
+    i++;
+    //printf("line %d: %s",i,string);
+  }
+  fclose(fd);
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetParameterCalibration(Int_t i,Float_t param) 
+{
+  // Set parameter "Calibration" i to a value param
+  if(i>2 || i<0)
+    Error("SetParameterCalibration","Invalid parameter number: %d",i);
+  else
+    (*fParameters)(0,i) = param ;
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetParameterCpv2Emc(Int_t i, TString axis, Float_t cut) 
+{
+  // Set the parameters to calculate Cpv-to-Emc Distance Cut depending on 
+  // Purity-Efficiency point i
+
+  if(i>2 || i<0)
+    Error("SetParameterCpv2Emc","Invalid parameter number: %d",i);
+  else {
+    axis.ToLower();
+    if      (axis == "x") (*fParameters)(1,i) = cut;
+    else if (axis == "z") (*fParameters)(2,i) = cut;
+    else Error("SetParameterCpv2Emc","Invalid axis name: %s",axis.Data());
+  }
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetParameterPhotonBoundary(Int_t i,Float_t param) 
+{
+  // Set parameter "Hard photon boundary" i to a value param
+  if(i>4 || i<0)
+    Error("SetParameterPhotonBoundary","Invalid parameter number: %d",i);
+  else
+    (*fParameters)(14,i) = param ;
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetParameterPi0Boundary(Int_t i,Float_t param) 
+{
+  // Set parameter "Hard pi0 boundary" i to a value param
+  if(i>1 || i<0)
+    Error("SetParameterPi0Boundary","Invalid parameter number: %d",i);
+  else
+    (*fParameters)(15,i) = param ;
+}
+
+//_____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetParameterTimeGate(Int_t i, Float_t gate) 
+{
+  // Set the parameter TimeGate depending on Purity-Efficiency point i 
+  if (i>2 || i<0)
+    Error("SetParameterTimeGate","Invalid Efficiency-Purity choice %d",i);
+  else
+    (*fParameters)(3,i)= gate ; 
+} 
 
+//_____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetParameterToCalculateEllipse(TString particle, TString param, Int_t i, Float_t par) 
+{  
+  // Set the parameter "i" that is needed to calculate the ellipse 
+  // parameter "param" for a particle "particle"
+  
+  particle.ToLower();
+  param.   ToLower();
+  Int_t p= -1;
+  Int_t offset=0;
+
+  if      (particle == "photon") offset=0;
+  else if (particle == "pi0")    offset=5;
+  else
+    Error("SetParameterToCalculateEllipse","Wrong particle name: %s (choose from pi0/photon)\n",particle.Data());
+
+  if     (param.Contains("a")) p=4+offset; 
+  else if(param.Contains("b")) p=5+offset; 
+  else if(param.Contains("c")) p=6+offset; 
+  else if(param.Contains("x0"))p=7+offset; 
+  else if(param.Contains("y0"))p=8+offset;
+  if((i>4)||(i<0))
+    Error("SetEllipseParameter", "No parameter with index %d", i) ; 
+  else if(p==-1)
+    Error("SetEllipseParameter", "No parameter with name %s", param.Data() ) ; 
+  else
+    (*fParameters)(p,i) = par ;
+} 
+
+//____________________________________________________________________________
+void AliPHOSPIDv1::Unload() 
+{
+  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::Instance() ;  
+  gime->PhosLoader()->UnloadRecPoints() ;
+  gime->PhosLoader()->UnloadTracks() ;
+  gime->PhosLoader()->UnloadRecParticles() ;
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::WriteRecParticles()
+{
+  AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::Instance() ; 
+
+  TClonesArray * recParticles = gime->RecParticles() ; 
+  recParticles->Expand(recParticles->GetEntriesFast() ) ;
+  TTree * treeP =  gime->TreeP();
+  
+  //First rp
+  Int_t bufferSize = 32000 ;
+  TBranch * rpBranch = treeP->Branch("PHOSRP",&recParticles,bufferSize);
+  rpBranch->SetTitle(BranchName());
+  
+  rpBranch->Fill() ;
+  gime->WriteRecParticles("OVERWRITE");
+  gime->WritePID("OVERWRITE");
+}