]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - PHOS/AliPHOSPIDv1.cxx
Default branch name set to Default; Reading of TreeR delegated to AliPHOSGetter;...
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSPIDv1.cxx
index 8d95e39d3c904dc4e7715aef2d88db476b53a5f6..cb383bdefbe65876a29c88ac3718d52b355d08b2 100644 (file)
 
 //_________________________________________________________________________
 // Implementation version v1 of the PHOS particle identifier 
-// Identification is based on information from PPSD and EMC
+// Particle identification based on the 
+//     - CPV information, 
+//     - Preshower information (in MIXT or GPS2 geometries)
+//     - shower width.
+//
+// CPV or Preshower clusters should be closer in PHOS plane than fCpvEmcDistance (in cm).
+// This parameter can be set by method SetCpvtoEmcDistanceCut(Float_t cut)  
+//
+// One can set desirable ID method by the function SetIdentificationMethod(option).
+// Presently the following options can be used together or separately :
+//     - "disp": use dispersion cut on shower width 
+//               (width can be set by method SetDispersionCut(Float_t cut)
+//     - "ell" : use cut on the axis of the ellipse, drawn around shower 
+//       (this cut can be changed by SetShowerProfileCut(char* formula), 
+//        where formula - any function of two variables f(lambda[0],lambda[1]).
+//        Shower is considered as EM if f() > 0 )
+// One can visualize current cuts calling method PlotDispersionCuts().    
+//
+// use case:
+//  root [0] AliPHOSPIDv1 * p1 = new AliPHOSPIDv1("galice.root")
+//  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
+//  root [1] p1->SetIdentificationMethod("disp ellipse")
+//  root [2] p1->ExecuteTask()
+//  root [3] AliPHOSPIDv1 * p2 = new AliPHOSPIDv1("galice1.root","ts1")
+//  Warning in <TDatabasePDG::TDatabasePDG>: object already instantiated
+//                // reading headers from file galice1.root and TrackSegments 
+//                // with title "ts1"
+//  root [4] p2->SetRecParticlesBranch("rp1")
+//                // set file name for the branch RecParticles
+//  root [5] p2->ExecuteTask("deb all time")
+//                // available options
+//                // "deb" - prints # of reconstructed particles
+//                // "deb all" -  prints # and list of RecParticles
+//                // "time" - prints benchmarking results
 //                  
-//*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Gines Martinez (SUBATECH)
-
+//*-- Author: Yves Schutz (SUBATECH)  & Gines Martinez (SUBATECH) & 
+//            Dmitri Peressounko (SUBATECH & Kurchatov Institute)
+//            Complitely redesined by Dmitri Peressounko, March 2001
 
 // --- ROOT system ---
-
+#include "TROOT.h"
+#include "TTree.h"
+#include "TFile.h"
+#include "TF2.h"
+#include "TFormula.h"
+#include "TCanvas.h"
+#include "TFolder.h"
+#include "TSystem.h"
+#include "TBenchmark.h"
 // --- Standard library ---
 
 #include <iostream.h>
+#include <iomanip.h>
 
 // --- AliRoot header files ---
 
+#include "AliRun.h"
+#include "AliGenerator.h"
+#include "AliPHOS.h"
 #include "AliPHOSPIDv1.h"
+#include "AliPHOSClusterizerv1.h"
 #include "AliPHOSTrackSegment.h"
+#include "AliPHOSTrackSegmentMakerv1.h"
 #include "AliPHOSRecParticle.h"
-#include "AliPHOSIndexToObject.h"
+#include "AliPHOSGeometry.h"
+#include "AliPHOSGetter.h"
 
 ClassImp( AliPHOSPIDv1) 
 
 //____________________________________________________________________________
-Float_t  AliPHOSPIDv1::GetDistanceInPHOSPlane(AliPHOSEmcRecPoint * emcclu,AliPHOSPpsdRecPoint * PpsdClu, Bool_t &toofar, Option_t *  Axis)
+AliPHOSPIDv1::AliPHOSPIDv1():AliPHOSPID()
+{ 
+  // default ctor
+  fFormula           = 0 ;
+  fDispersion        = 0. ; 
+  fCpvEmcDistance    = 0 ; 
+  fHeaderFileName    = "" ; 
+  fTrackSegmentsTitle= "" ; 
+  fRecPointsTitle    = "" ; 
+  fRecParticlesTitle = "" ; 
+  fIDOptions         = "" ; 
+  fRecParticlesInRun = 0 ; 
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+AliPHOSPIDv1::AliPHOSPIDv1(const char * headerFile,const char * name) : AliPHOSPID(headerFile, name)
+{ 
+  //ctor with the indication on where to look for the track segments
+
+  fFormula        = new TFormula("LambdaCuts","(x>1)*(x<2.5)*(y>0)*(y<x)") ;   
+  fDispersion     = 2.0 ; 
+  fCpvEmcDistance = 3.0 ;
+  fHeaderFileName     = GetTitle() ; 
+  fTrackSegmentsTitle = GetName() ; 
+  fRecPointsTitle     = GetName() ; 
+  fRecParticlesTitle  = GetName() ; 
+  fIDOptions          = "" ;
+  TString tempo(GetName()) ; 
+  tempo.Append(":") ;
+  tempo.Append(Version()) ; 
+  SetName(tempo) ; 
+  fRecParticlesInRun = 0 ; 
+   
+  Init() ;
+
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+AliPHOSPIDv1::~AliPHOSPIDv1()
+{ 
+  //dtor 
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+Bool_t AliPHOSPIDv1::ReadTrackSegments(Int_t event)
 {
-  // Calculates the distance between the EMC RecPoint and the PPSD RecPoint
+  // Reads TrackSegments an extracts the title of the RecPoints 
+  // branch from which TS were made of.
+  // Then reads both TrackSegments and RecPoints.
+
+  //Fist read Track Segment Branch and extract RecPointsBranch from fTSMaker
+
+  // Get TreeR header from file
+  if(gAlice->TreeR()==0){
+    cerr << "ERROR: AliPHOSPIDv1::ReadTrackSegments -> There is no Reconstruction Tree" << endl;
+    return kFALSE;
+  }
  
-  Float_t r;
-  TVector3 vecEmc ;
-  TVector3 vecPpsd ;
-  
-  emcclu->GetLocalPosition(vecEmc) ;
-  PpsdClu->GetLocalPosition(vecPpsd)  ; 
-  if(emcclu->GetPHOSMod() == PpsdClu->GetPHOSMod())
-    { 
-
-      // Correct to difference in CPV and EMC position due to different distance to center.
-      // we assume, that particle moves from center
-      Float_t dCPV = fGeom->GetIPtoOuterCoverDistance();
-      Float_t dEMC = fGeom->GetIPtoCrystalSurface() ;
-      dEMC         = dEMC / dCPV ;
-      vecPpsd = dEMC * vecPpsd  - vecEmc ; 
-      r = vecPpsd.Mag() ;
-      if (Axis == "X") r = vecPpsd.X();
-      if (Axis == "Y") r = vecPpsd.Y();
-      if (Axis == "Z") r = vecPpsd.Z();
-      if (Axis == "R") r = vecPpsd.Mag();
+  // Find TrackSegments
+  TBranch * tsbranch      = 0;
+  TBranch * tsmakerbranch = 0;
+  TObjArray * lob = (TObjArray*)gAlice->TreeR()->GetListOfBranches() ;
+  TIter next(lob) ; 
+  TBranch * branch = 0 ;  
+  Bool_t phostsfound = kFALSE, tsmakerfound = kFALSE ; 
+  
+  TString taskName(GetName()) ; 
+  taskName.ReplaceAll(Version(), "") ;
+
+  while ( (branch = (TBranch*)next()) && (!phostsfound || !tsmakerfound) ) {
+    if ( (strcmp(branch->GetName(), "PHOSTS")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), taskName.Data())==0) ) {
+      phostsfound = kTRUE ;
+      tsbranch    = branch ; 
+  
+    } else if ( (strcmp(branch->GetName(), "AliPHOSTrackSegmentMaker")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), taskName.Data())==0) ) {
+      tsmakerfound  = kTRUE ; 
+      tsmakerbranch = branch ;
+    }
+  }
+  if ( !phostsfound || !tsmakerfound ) {
+    cerr << "WARNING: AliPHOSPIDv1::ReadTrackSegments -> TrackSegments and/or TrackSegmentMaker branch with name " << taskName.Data() 
+        << " not found" << endl ;
+    return kFALSE ; 
+  }   
+  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
+  
+  TClonesArray * trackSegments = gime->TrackSegments() ;
+  trackSegments->Clear() ; 
+  tsbranch->SetAddress(&trackSegments) ;
+
+  AliPHOSTrackSegmentMaker * tsmaker = 0 ; 
+  tsmakerbranch->SetAddress(&tsmaker) ;
+  tsmakerbranch->GetEntry(0) ;
+  TString tsmakerName( fRecParticlesTitle ) ; 
+  tsmakerName.Append(tsmaker->Version()) ; 
+  tsmaker = gime->TrackSegmentMaker(tsmakerName) ; 
+
+  tsbranch->GetEntry(0) ;
+  tsmakerbranch->GetEntry(0) ;
+
+  fRecPointsTitle = tsmaker->GetRecPointsBranch() ;
+
+  // Find RecPoints
+  TBranch * emcbranch = 0;
+  TBranch * cpvbranch = 0;
+  TBranch * clusterizerbranch = 0;
+  lob = (TObjArray*)gAlice->TreeR()->GetListOfBranches() ;
+  TIter next2(lob) ; 
+  branch = 0 ;  
+  Bool_t phosemcfound = kFALSE, phoscpvfound = kFALSE, clusterizerfound = kFALSE ; 
+  
+  while ( (branch = (TBranch*)next2()) && (!phosemcfound || !phoscpvfound || !clusterizerfound) ) {
+    if ( (strcmp(branch->GetName(), "PHOSEmcRP")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), taskName.Data())==0) ) {
+      phosemcfound = kTRUE ;
+      emcbranch = branch ; 
+    }
+    
+    else if ( (strcmp(branch->GetName(), "PHOSCpvRP")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), taskName.Data())==0) ) {
+      phoscpvfound = kTRUE ;
+      cpvbranch = branch ; 
       
-    } 
-  else 
-    {
-      toofar = kTRUE ;
+    } else if ( (strcmp(branch->GetName(), "AliPHOSClusterizer")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), taskName.Data())==0) ) {
+      clusterizerfound = kTRUE ; 
+      clusterizerbranch = branch ;
     }
-  return r ;
+  }
+  if ( !phosemcfound || !phoscpvfound || !clusterizerfound ) {
+    cerr << "WARNING: AliPHOSTrackPIDv1::ReadTrackSegments -> emc(cpv)RecPoints and/or Clusterizer branch with name " << taskName.Data() 
+        << " not found" << endl ;
+    return kFALSE ; 
+  }   
+  TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints() ;
+  emcRecPoints->Clear() ; 
+  emcbranch->SetAddress(&emcRecPoints) ;
+  
+  TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints() ;
+  cpvRecPoints->Clear() ; 
+  cpvbranch->SetAddress(&cpvRecPoints) ;
+  
+  
+  AliPHOSClusterizer * clusterizer = 0 ; 
+  clusterizerbranch->SetAddress(&clusterizer) ;
+  clusterizerbranch->GetEntry(0) ;
+  TString clusterizerName( fTrackSegmentsTitle ) ; 
+  clusterizerName.Append(clusterizer->Version()) ; 
+  clusterizer = gime->Clusterizer(clusterizerName) ; 
+
+  emcbranch->GetEntry(0) ;
+  cpvbranch->GetEntry(0) ;
+  clusterizerbranch->GetEntry(0) ;
+  return kTRUE ;
+  
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+Float_t  AliPHOSPIDv1::GetDistance(AliPHOSEmcRecPoint * emc,AliPHOSRecPoint * cpv, Option_t *  Axis)const
+{
+  // Calculates the distance between the EMC RecPoint and the PPSD RecPoint
+  const AliPHOSGeometry * geom = AliPHOSGetter::GetInstance()->PHOSGeometry() ; 
+  TVector3 vecEmc ;
+  TVector3 vecCpv ;
+  
+  emc->GetLocalPosition(vecEmc) ;
+  cpv->GetLocalPosition(vecCpv) ; 
+  if(emc->GetPHOSMod() == cpv->GetPHOSMod()){ 
+    
+    // Correct to difference in CPV and EMC position due to different distance to center.
+    // we assume, that particle moves from center
+    Float_t dCPV = geom->GetIPtoOuterCoverDistance();
+    Float_t dEMC = geom->GetIPtoCrystalSurface() ;
+    dEMC         = dEMC / dCPV ;
+    vecCpv = dEMC * vecCpv  - vecEmc ; 
+    if (Axis == "X") return vecCpv.X();
+    if (Axis == "Y") return vecCpv.Y();
+    if (Axis == "Z") return vecCpv.Z();
+    if (Axis == "R") return vecCpv.Mag();
+  } 
+  return 100000000 ;
 }
 
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::Exec(Option_t * option) 
+{
+  //Steering method
+
+  if( strcmp(GetName(), "")== 0 ) 
+    Init() ;
+  
+  if(strstr(option,"tim"))
+    gBenchmark->Start("PHOSPID");
+  
+  if(strstr(option,"print")) {
+    Print("") ; 
+    return ; 
+  }
+  
+  gAlice->GetEvent(0) ;
+  //check, if the branch with name of this" already exits?
+  TObjArray * lob = (TObjArray*)gAlice->TreeR()->GetListOfBranches() ;
+  TIter next(lob) ; 
+  TBranch * branch = 0 ;  
+  Bool_t phospidfound = kFALSE, pidfound = kFALSE ; 
+  
+  TString taskName(GetName()) ; 
+  taskName.Remove(taskName.Index(Version())-1) ;
+  
+  while ( (branch = (TBranch*)next()) && (!phospidfound || !pidfound) ) {
+    if ( (strcmp(branch->GetName(), "PHOSPID")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), taskName.Data())==0) ) 
+      phospidfound = kTRUE ;
+    
+    else if ( (strcmp(branch->GetName(), "AliPHOSPID")==0) && (strcmp(branch->GetTitle(), taskName.Data())==0) ) 
+      pidfound = kTRUE ; 
+  }
+  
+  if ( phospidfound || pidfound ) {
+    cerr << "WARNING: AliPHOSPIDv1::Exec -> RecParticles and/or PIDtMaker branch with name " 
+        << taskName.Data() << " already exits" << endl ;
+    return ; 
+  }       
+  
+  Int_t nevents = (Int_t) gAlice->TreeE()->GetEntries() ;
+  Int_t ievent ;
+  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ;
+  
+  for(ievent = 0; ievent < nevents; ievent++){
+
+    gime->Event(ievent,"R") ;
 
+    //    if(!ReadTrackSegments(ievent)) //reads TrackSegments for event ievent
+    //  continue ;
 
+    MakeRecParticles() ;
 
+    WriteRecParticles(ievent);
+
+    if(strstr(option,"deb"))
+      PrintRecParticles(option) ;
+  }
+
+  if(strstr(option,"tim")){
+    gBenchmark->Stop("PHOSPID");
+    cout << "AliPHOSPID:" << endl ;
+    cout << "  took " << gBenchmark->GetCpuTime("PHOSPID") << " seconds for PID " 
+        <<  gBenchmark->GetCpuTime("PHOSPID")/nevents << " seconds per event " << endl ;
+    cout << endl ;
+  }
+
+}
 //____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::MakeParticles(AliPHOSTrackSegment::TrackSegmentsList * trsl, 
-                                 AliPHOSRecParticle::RecParticlesList * rpl)
+void AliPHOSPIDv1::Init()
 {
+  // Make all memory allocations that are not possible in default constructor
+  // Add the PID task to the list of PHOS tasks
+  
+  if ( strcmp(GetTitle(), "") == 0 )
+    SetTitle("galice.root") ;
+  
+  TString taskName(GetName()) ; 
+  taskName.Remove(taskName.Index(Version())-1) ;
+  
+  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance(GetTitle(), taskName.Data()) ; 
+  if ( gime == 0 ) {
+    cerr << "ERROR: AliPHOSPIDv1::Init -> Could not obtain the Getter object !" << endl ; 
+    return ;
+  } 
+   
+  //add Task to //YSAlice/tasks/Reconstructioner/PHOS
+  //  TTask * aliceRe  = (TTask*)gROOT->FindObjectAny("YSAlice/tasks/Reconstructioner") ; 
+  //  TTask * phosRe   = (TTask*)aliceRe->GetListOfTasks()->FindObject("PHOS") ;
+  //  phosRe->Add(this) ; 
+  gime->PostPID(this) ;
+  // create a folder on the white board //YSAlice/WhiteBoard/RecParticles/PHOS/recparticlesName
+  gime->PostRecParticles(taskName.Data() ) ; 
+  
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::MakeRecParticles(){
+
   // Makes a RecParticle out of a TrackSegment
+  TString taskName(GetName()) ; 
+  taskName.Remove(taskName.Index(Version())-1) ;
 
-  TIter next(trsl) ; 
-  AliPHOSTrackSegment * tracksegment ; 
+  AliPHOSGetter * gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
+  TObjArray * emcRecPoints = gime->EmcRecPoints(taskName) ; 
+  TObjArray * cpvRecPoints = gime->CpvRecPoints(taskName) ; 
+  TClonesArray * trackSegments = gime->TrackSegments(taskName) ; 
+  TClonesArray * recParticles  = gime->RecParticles(taskName) ; 
+  recParticles->Clear();
+  
+  TIter next(trackSegments) ; 
+  AliPHOSTrackSegment * ts ; 
   Int_t index = 0 ; 
   AliPHOSRecParticle * rp ; 
-  Bool_t tDistance;
-  Int_t type ; 
-  Int_t showerprofile;  // 0 narrow and 1 wide
-  Int_t cpvdetector;  // 1 hit and 0 no hit
-  Int_t pcdetector;  // 1 hit and 0 no hit
-
-  while ( (tracksegment = (AliPHOSTrackSegment *)next()) ) {
-    new( (*rpl)[index] ) AliPHOSRecParticle(tracksegment) ;
-    rp = (AliPHOSRecParticle *)rpl->At(index) ; 
-    AliPHOSEmcRecPoint * recp = tracksegment->GetEmcRecPoint() ;
-    AliPHOSPpsdRecPoint * rpcpv = tracksegment->GetPpsdUpRecPoint() ;
-    AliPHOSPpsdRecPoint * rppc  = tracksegment->GetPpsdLowRecPoint() ;
-//     Float_t * lambda = new Float_t[2]; 
-//     recp->GetElipsAxis(lambda) ; 
-
-//     // Looking at the lateral development of the shower
-//     if ( ( lambda[0] > fLambda1m && lambda[0] < fLambda1M ) && // shower profile cut
-//      ( lambda[1] > fLambda2m && lambda[1] < fLambda2M ) )         
-//       //    Float_t R ;
-//       //R=(lambda[0]-1.386)*(lambda[0]-1.386)+1.707*1.707*(lambda[1]-1.008)*(lambda[1]-1.008) ;
-//       //if(R<0.35*0.35)
-
-    Float_t Dispersion;
-    Dispersion = recp->GetDispersion();
-    if (Dispersion < fCutOnDispersion)
-      showerprofile = 0 ;   // NARROW PROFILE   
-    else      
-      showerprofile = 1 ;// WIDE PROFILE
   
-    // Looking at the photon conversion detector
-    if( tracksegment->GetPpsdLowRecPoint() == 0 )   
-      pcdetector = 0 ;  // No hit
-    else      
-      if (GetDistanceInPHOSPlane(recp, rppc, tDistance, "R")< fCutOnRelativeDistance)  pcdetector = 1 ;  // hit
+  Bool_t ellips = fIDOptions.Contains("ell",TString::kIgnoreCase ) ;
+  Bool_t disp   = fIDOptions.Contains("dis",TString::kIgnoreCase ) ;
   
+  while ( (ts = (AliPHOSTrackSegment *)next()) ) {
+    
+    new( (*recParticles)[index] ) AliPHOSRecParticle() ;
+    rp = (AliPHOSRecParticle *)recParticles->At(index) ; 
+    rp->SetTraskSegment(index) ;
+    
+    AliPHOSEmcRecPoint * emc = 0 ;
+    if(ts->GetEmcIndex()>=0)
+      emc = (AliPHOSEmcRecPoint *) emcRecPoints->At(ts->GetEmcIndex()) ;
+    
+    AliPHOSRecPoint    * cpv = 0 ;
+    if(ts->GetCpvIndex()>=0)
+      cpv = (AliPHOSRecPoint *)   cpvRecPoints->At(ts->GetCpvIndex()) ;
+    
+    AliPHOSRecPoint    * ppsd = 0 ;
+    if(ts->GetPpsdIndex()>=0)
+      ppsd= (AliPHOSRecPoint *)   cpvRecPoints->At(ts->GetPpsdIndex()) ;
+
+    //set momentum and energy first
+    Float_t    e = emc->GetEnergy() ;
+    TVector3 dir = GetMomentumDirection(emc,cpv,ppsd) ; 
+    dir.SetMag(e) ;
+
+    rp->SetMomentum(dir.X(),dir.Y(),dir.Z(),e) ;
+    rp->SetCalcMass(0);
+
+    //now set type (reconstructed) of the particle    
+    Int_t showerprofile = 0;  // 0 narrow and 1 wide
+    
+    if(ellips){
+      Float_t lambda[2] ;
+      emc->GetElipsAxis(lambda) ;
+      if(fFormula->Eval(lambda[0],lambda[1]) <= 0 )
+       showerprofile = 1 ;  // not narrow
+    }
+    
+    if(disp)
+      if(emc->GetDispersion() > fDispersion )
+       showerprofile = 1 ;  // not narrow
+    
+    
     // Looking at the photon conversion detector
-    if( tracksegment->GetPpsdUpRecPoint() == 0 )
-      cpvdetector = 0 ;  // No hit
-    else  
-      if (GetDistanceInPHOSPlane(recp, rpcpv, tDistance, "R")< fCutOnRelativeDistance) cpvdetector = 1 ;  // Hit
-     
-    type = showerprofile + 2 * pcdetector + 4 * cpvdetector ;
-    rp->SetType(type) ; 
+    Int_t pcdetector= 0 ;  //1 hit and 0 no hit
+    if(ppsd)
+      if(GetDistance(emc, ppsd, "R") < fCpvEmcDistance) 
+       pcdetector = 1 ;  
+    
+    // Looking at the CPV detector
+    Int_t cpvdetector= 0 ;  //1 hit and 0 no hit     
+    if(cpv)
+      if(GetDistance(emc, cpv,  "R") < fCpvEmcDistance) 
+       cpvdetector = 1 ;  
+    
+    Int_t type = showerprofile + 2 * pcdetector + 4 * cpvdetector ;
+    rp->SetType(type) ;
+    rp->SetIndexInList(index) ;
     index++ ; 
   }
-    
+  
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1:: Print(const char * opt) 
+void  AliPHOSPIDv1:: Print(Option_t * option) const
 {
   // Print the parameters used for the particle type identification
+    cout <<  "=============== AliPHOSPID1 ================" << endl ;
+    cout <<  "Making PID "<< endl ;
+    cout <<  "    Headers file:               " << fHeaderFileName.Data() << endl ;
+    cout <<  "    RecPoints branch title:     " << fRecPointsTitle.Data() << endl ;
+    cout <<  "    TrackSegments Branch title: " << fTrackSegmentsTitle.Data() << endl ;
+    cout <<  "    RecParticles Branch title   " << fRecParticlesTitle.Data() << endl;
+    cout <<  "with parameters: " << endl ;
+    cout <<  "    Maximal EMC - CPV (PPSD) distance (cm) " << fCpvEmcDistance << endl ;
+    if(fIDOptions.Contains("dis",TString::kIgnoreCase ))
+      cout <<  "                            dispersion cut " << fDispersion << endl ;
+    if(fIDOptions.Contains("ell",TString::kIgnoreCase )){
+      cout << "Eliptic cuts function: " << endl ;
+      cout << fFormula->GetTitle() << endl ;
+    }
+    cout <<  "============================================" << endl ;
+}
+
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::SetShowerProfileCut(char * formula)
+{
+  //set shape of the cut on the axis of ellipce, drown around shouer
+  //shower considered "narrow" if Formula(lambda[0],lambda[1]) > 0.
+  if(fFormula) 
+    delete fFormula; 
+  fFormula = new TFormula("Lambda Cut",formula) ;
+}
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSPIDv1::WriteRecParticles(Int_t event)
+{
+  AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
+  TString taskName(GetName()) ; 
+  taskName.Remove(taskName.Index(Version())-1) ;
+  TClonesArray * recParticles = gime->RecParticles(taskName) ; 
+  recParticles->Expand(recParticles->GetEntriesFast() ) ;
   
-  cout << "AliPHOSPIDv1 : cuts for the particle idendification based on the shower profile " << endl 
-       << fLambda1m << " < value1 < " << fLambda1M << endl 
-       << fLambda2m << " < value2 < " << fLambda2M << endl ;  
+  //Make branch in TreeR for RecParticles 
+  char * filename = 0;
+  if(gSystem->Getenv("CONFIG_SPLIT_FILE")!=0){   //generating file name
+    filename = new char[strlen(gAlice->GetBaseFile())+20] ;
+    sprintf(filename,"%s/PHOS.Reco.root",gAlice->GetBaseFile()) ; 
+  }
+  
+  TDirectory *cwd = gDirectory;
+  
+  //First rp
+  Int_t bufferSize = 32000 ;    
+  TBranch * rpBranch = gAlice->TreeR()->Branch("PHOSRP",&recParticles,bufferSize);
+  rpBranch->SetTitle(fRecParticlesTitle);
+  if (filename) {
+    rpBranch->SetFile(filename);
+    TIter next( rpBranch->GetListOfBranches());
+    TBranch * sb ;
+    while ((sb=(TBranch*)next())) {
+      sb->SetFile(filename);
+    }   
+    cwd->cd();
+  }
 
+  //second, pid
+  Int_t splitlevel = 0 ; 
+  AliPHOSPIDv1 * pid = this ;
+  TBranch * pidBranch = gAlice->TreeR()->Branch("AliPHOSPID","AliPHOSPIDv1",&pid,bufferSize,splitlevel);
+  pidBranch->SetTitle(fRecParticlesTitle);
+  if (filename) {
+    pidBranch->SetFile(filename);
+    TIter next( pidBranch->GetListOfBranches());
+    TBranch * sb ;
+    while ((sb=(TBranch*)next())) {
+      sb->SetFile(filename);
+    }   
+    cwd->cd();
+  }    
+  
+  rpBranch->Fill() ;
+  pidBranch->Fill() ;
+
+  gAlice->TreeR()->Write(0,kOverwrite) ;  
+  
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::SetShowerProfileCuts(Float_t l1m, Float_t l1M, Float_t l2m, Float_t l2M)
+void  AliPHOSPIDv1::PlotDispersionCuts()const
 {
-  // Modifies the parameters used for the particle type identification
-
-  fLambda1m = l1m ; 
-  fLambda1M = l1M ; 
-  fLambda2m = l2m ; 
-  fLambda2M = l2M ; 
+  // produces a plot of the dispersion cut
+  TCanvas*  lambdas = new TCanvas("lambdas","Cuts on the ellipse axis",200,10,700,500);
+  if(fIDOptions.Contains("ell",TString::kIgnoreCase ) ){
+    TF2 * ell = new TF2("Elliptic Cuts",fFormula->GetName(),0,3,0,3) ;
+    ell->SetMinimum(0.0000001) ;
+    ell->SetMaximum(0.001) ;
+    ell->SetLineStyle(1) ;
+    ell->SetLineWidth(2) ;
+    ell->Draw() ;
+  }
+  
+  if( fIDOptions.Contains("dis",TString::kIgnoreCase ) ){
+    TF2 * dsp = new TF2("dispersion","(y<x)*(x*x+y*y < [0]*[0])",0,3,0,3) ;
+    dsp->SetParameter(0,fDispersion) ;
+    dsp->SetMinimum(0.0000001) ;
+    dsp->SetMaximum(0.001) ;
+    dsp->SetLineStyle(1) ;
+    dsp->SetLineColor(2) ;
+    dsp->SetLineWidth(2) ;
+    dsp->SetNpx(200) ;
+    dsp->SetNpy(200) ;
+    if(fIDOptions.Contains("ell",TString::kIgnoreCase ) )
+      dsp->Draw("same") ;
+    else
+      dsp->Draw() ;
+  }
+  lambdas->Update();
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-void  AliPHOSPIDv1::SetRelativeDistanceCut(Float_t CutOnRelativeDistance)
+TVector3 AliPHOSPIDv1::GetMomentumDirection(AliPHOSEmcRecPoint * emc, AliPHOSRecPoint * cpv,AliPHOSRecPoint * ppsd)const 
+{ 
+  // Calculates the momentum direction:
+  //   1. if only a EMC RecPoint, direction is given by IP and this RecPoint
+  //   2. if a EMC RecPoint and one PPSD RecPoint, direction is given by the line through the 2 recpoints 
+  //   3. if a EMC RecPoint and two PPSD RecPoints, dirrection is given by the average line through 
+  //      the 2 pairs of recpoints  
+  // However because of the poor position resolution of PPSD the direction is always taken as if we were 
+  //  in case 1.
+
+  TVector3 dir(0,0,0) ; 
+  
+  TVector3 emcglobalpos ;
+  TMatrix  dummy ;
+  
+  emc->GetGlobalPosition(emcglobalpos, dummy) ;
+  
+  // The following commented code becomes valid once the PPSD provides 
+  // a reasonable position resolution, at least as good as EMC ! 
+  //   TVector3 ppsdlglobalpos ;
+  //   TVector3 ppsduglobalpos ;
+  //   if( fPpsdLowRecPoint ){ // certainly a photon that has concerted
+  //     fPpsdLowRecPoint->GetGlobalPosition(ppsdlglobalpos, mdummy) ; 
+  //     dir = emcglobalpos -  ppsdlglobalpos ; 
+  //     if( fPpsdUpRecPoint ){ // not looks like a charged       
+  //        fPpsdUpRecPoint->GetGlobalPosition(ppsduglobalpos, mdummy) ; 
+  //        dir = ( dir +  emcglobalpos -  ppsduglobalpos ) * 0.5 ; 
+  //      }
+  //   }
+  //   else { // looks like a neutral
+  //    dir = emcglobalpos ;  
+  //  }
+  
+  dir = emcglobalpos ;  
+  dir.SetZ( -dir.Z() ) ;   // why ?  
+  dir.SetMag(1.) ;
+
+  //account correction to the position of IP
+  Float_t xo,yo,zo ; //Coordinates of the origin
+  gAlice->Generator()->GetOrigin(xo,yo,zo) ;
+  TVector3 origin(xo,yo,zo);
+  dir = dir - origin ;
+
+  return dir ;  
+}
+//____________________________________________________________________________
+void AliPHOSPIDv1::PrintRecParticles(Option_t * option)
 {
-  // Modifies the parameters used for the particle type identification
+  // Print table of reconstructed particles
+
+  AliPHOSGetter *gime = AliPHOSGetter::GetInstance() ; 
+
+  TString taskName(GetName()) ; 
+  taskName.Remove(taskName.Index(Version())-1) ;
+  TClonesArray * recParticles = gime->RecParticles(taskName) ; 
 
-  fCutOnRelativeDistance = CutOnRelativeDistance ; 
  
+  cout << "AliPHOSPIDv1: event "<<gAlice->GetEvNumber()  << endl ;
+  cout << "       found " << recParticles->GetEntriesFast() << " RecParticles " << endl ;
+
+  fRecParticlesInRun += recParticles->GetEntriesFast() ; 
+
+  if(strstr(option,"all")) {  // printing found TS
+    
+    cout << "  PARTICLE "   
+        << "  Index    "  << endl ;
+      //        << "  X        "     
+      //        << "  Y        " 
+      //        << "  Z        "    
+      //        << " # of primaries "          
+      //        << " Primaries list "    <<  endl;      
+    
+    Int_t index ;
+    for (index = 0 ; index < recParticles->GetEntries() ; index++) {
+      AliPHOSRecParticle * rp = (AliPHOSRecParticle * ) recParticles->At(index) ;       
+      
+      Text_t particle[11];
+      switch(rp->GetType()) {
+      case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALEM:
+       strcpy( particle, "NEUTRAL_EM");
+       break;
+      case  AliPHOSFastRecParticle::kNEUTRALHA:
+       strcpy(particle, "NEUTRAL_HA");
+       break;
+      case  AliPHOSFastRecParticle::kGAMMA:
+       strcpy(particle, "GAMMA");
+       break ;
+      case  AliPHOSFastRecParticle::kGAMMAHA: 
+       strcpy(particle, "GAMMA_H");
+       break ;
+      case  AliPHOSFastRecParticle::kABSURDEM:
+       strcpy(particle, "ABSURD_EM") ;
+       break ;
+      case  AliPHOSFastRecParticle::kABSURDHA:
+       strcpy(particle, "ABSURD_HA") ;
+       break ; 
+      case  AliPHOSFastRecParticle::kELECTRON:
+       strcpy(particle, "ELECTRON") ;
+       break ;
+      case  AliPHOSFastRecParticle::kCHARGEDHA:
+       strcpy(particle, "CHARGED_HA") ;
+       break ; 
+      }
+      
+      //    Int_t * primaries; 
+      //    Int_t nprimaries;
+      //    primaries = rp->GetPrimaries(nprimaries);
+      
+      cout << setw(15) << particle << "  "
+          << setw(3) <<  rp->GetIndexInList() << " "  ;
+       //         << setw(4) <<  nprimaries << "  ";
+       //      for (Int_t iprimary=0; iprimary<nprimaries; iprimary++)
+       //      cout << setw(4)  <<  primaries[iprimary] << " ";
+      cout << endl;     
+    }
+    cout << "-------------------------------------------" << endl ;
+  }
+  
 }
 
+
+