]> git.uio.no Git - u/mrichter/AliRoot.git/blobdiff - PHOS/AliPHOSReconstructor.cxx
Unused DAs removed.
[u/mrichter/AliRoot.git] / PHOS / AliPHOSReconstructor.cxx
index fce334c6575a751b196c852634f92aa2f02388de..8792cebcb528ba5ecfb8444400c522c7839a34ea 100644 (file)
@@ -16,8 +16,8 @@
 /* $Id$ */
 
 //_________________________________________________________________________
-//*--
-//*-- Yves Schutz (SUBATECH) 
+//--
+//-- Yves Schutz (SUBATECH) 
 // Reconstruction class. Redesigned from the old AliReconstructionner class and 
 // derived from STEER/AliReconstructor. 
 // 
 // --- Standard library ---
 
 // --- AliRoot header files ---
-#include "AliESD.h"
+#include "AliLog.h"
+#include "AliAltroMapping.h"
+#include "AliESDEvent.h"
+#include "AliESDCaloCluster.h"
+#include "AliESDCaloCells.h"
 #include "AliPHOSReconstructor.h"
 #include "AliPHOSClusterizerv1.h"
 #include "AliPHOSTrackSegmentMakerv1.h"
 #include "AliPHOSPIDv1.h"
-#include "AliPHOSGetter.h"
 #include "AliPHOSTracker.h"
-#include "AliRawReaderFile.h"
+#include "AliRawReader.h"
+#include "AliPHOSTrigger.h"
+#include "AliPHOSGeometry.h"
+#include "AliPHOSRecoParam.h"
+#include "AliPHOSRecoParamEmc.h"
+#include "AliPHOSRecoParamCpv.h"
+#include "AliPHOSDigit.h"
+#include "AliPHOSTrackSegment.h"
+#include "AliPHOSEmcRecPoint.h"
+#include "AliPHOSRecParticle.h"
+#include "AliPHOSRawDecoder.h"
+#include "AliPHOSRawDecoderv1.h"
+#include "AliPHOSRawDecoderv2.h"
+#include "AliPHOSRawDigiProducer.h"
+#include "AliPHOSPulseGenerator.h"
 
 ClassImp(AliPHOSReconstructor)
 
 Bool_t AliPHOSReconstructor::fgDebug = kFALSE ; 
+AliPHOSRecoParam* AliPHOSReconstructor::fgkRecoParamEmc =0;  // EMC rec. parameters
+AliPHOSRecoParam* AliPHOSReconstructor::fgkRecoParamCpv =0;  // CPV rec. parameters
+TClonesArray*     AliPHOSReconstructor::fgDigitsArray = 0;   // Array of PHOS digits
+TObjArray*        AliPHOSReconstructor::fgEMCRecPoints = 0;   // Array of EMC rec.points
 
 //____________________________________________________________________________
-  AliPHOSReconstructor::AliPHOSReconstructor() 
+AliPHOSReconstructor::AliPHOSReconstructor() :
+  fGeom(NULL),fClusterizer(NULL),fTSM(NULL),fPID(NULL)
 {
   // ctor
 
-} 
+  if (!fgkRecoParamEmc) {
+    AliWarning("The Reconstruction parameters for EMC nonitialized - Used default one");
+    fgkRecoParamEmc = AliPHOSRecoParamEmc::GetEmcDefaultParameters();
+  }
+
+  if (!fgkRecoParamCpv) {
+    AliWarning("The Reconstruction parameters for CPV nonitialized - Used default one");
+    fgkRecoParamCpv = AliPHOSRecoParamCpv::GetCpvDefaultParameters();
+  }
+
+  fGeom        = AliPHOSGeometry::GetInstance("IHEP","");
+  fClusterizer = new AliPHOSClusterizerv1      (fGeom);
+  fTSM         = new AliPHOSTrackSegmentMakerv1(fGeom);
+  fPID         = new AliPHOSPIDv1              (fGeom);
+  fgDigitsArray = new TClonesArray("AliPHOSDigit",100);
+  fgEMCRecPoints= new TObjArray(100) ;
+}
 
 //____________________________________________________________________________
   AliPHOSReconstructor::~AliPHOSReconstructor()
 {
   // dtor
-
+  delete fGeom;
+  delete fClusterizer;
+  delete fTSM;
+  delete fPID;
+  delete fgDigitsArray;
+  delete fgEMCRecPoints;
 } 
 
 //____________________________________________________________________________
-void AliPHOSReconstructor::Reconstruct(AliRunLoader* runLoader) const 
+void AliPHOSReconstructor::Reconstruct(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree) const
 {
-  // method called by AliReconstruction; 
+  // 'single-event' local reco method called by AliReconstruction; 
   // Only the clusterization is performed,; the rest of the reconstruction is done in FillESD because the track
-  // segment maker needs access to the AliESD object to retrieve the tracks reconstructed by 
+  // segment maker needs access to the AliESDEvent object to retrieve the tracks reconstructed by 
   // the global tracking.
-  TString headerFile(runLoader->GetFileName()) ; 
-  TString branchName(runLoader->GetEventFolder()->GetName()) ;  
-  
-  AliPHOSClusterizerv1 clu(headerFile, branchName);
-  clu.SetEventRange(0, -1) ; // do all the events
+
+  fClusterizer->SetInput(digitsTree);
+  fClusterizer->SetOutput(clustersTree);
   if ( Debug() ) 
-    clu.ExecuteTask("deb all") ; 
+    fClusterizer->Digits2Clusters("deb all") ; 
   else 
-    clu.ExecuteTask("") ;  
-
+    fClusterizer->Digits2Clusters("") ;
 }
 
 //____________________________________________________________________________
-void AliPHOSReconstructor::Reconstruct(AliRunLoader* runLoader, AliRawReader* rawreader) const 
+void AliPHOSReconstructor::FillESD(TTree* digitsTree, TTree* clustersTree, 
+                                  AliESDEvent* esd) const
 {
-  // method called by AliReconstruction; 
-  // Only the clusterization is performed,; the rest of the reconstruction is done in FillESD because the track
-  // segment maker needs access to the AliESD object to retrieve the tracks reconstructed by 
-  // the global tracking.
-  // Here we reconstruct from Raw Data
-  
-  rawreader->Reset() ; 
-  TString headerFile(runLoader->GetFileName()) ; 
-  TString branchName(runLoader->GetEventFolder()->GetName()) ;  
+  // This method produces PHOS rec-particles,
+  // then it creates AliESDtracks out of them and
+  // write tracks to the ESD
+
+
+  // do current event; the loop over events is done by AliReconstruction::Run()
+  fTSM->SetESD(esd) ; 
+  fTSM->SetInput(clustersTree);
+  if ( Debug() ) 
+    fTSM->Clusters2TrackSegments("deb all") ;
+  else 
+    fTSM->Clusters2TrackSegments("") ;
   
-  AliPHOSClusterizerv1 clu(headerFile, branchName);
-  clu.SetEventRange(0, -1) ; // do all the events
+  fPID->SetInput(clustersTree, fTSM->GetTrackSegments()) ; 
+  fPID->SetESD(esd) ; 
   if ( Debug() ) 
-    clu.ExecuteTask("deb all") ; 
+    fPID->TrackSegments2RecParticles("deb all") ;
   else 
-    clu.ExecuteTask("") ;  
+    fPID->TrackSegments2RecParticles("") ;
 
-}
+  TClonesArray *recParticles  = fPID->GetRecParticles();
+  Int_t nOfRecParticles = recParticles->GetEntriesFast();
+  
+  esd->SetNumberOfPHOSClusters(nOfRecParticles) ; 
+  esd->SetFirstPHOSCluster(esd->GetNumberOfCaloClusters()) ;
+  
+  AliDebug(2,Form("%d rec. particles, option %s",nOfRecParticles,GetOption()));
+  
+  // Read digits array
 
-//____________________________________________________________________________
-void AliPHOSReconstructor::FillESD(AliRunLoader* runLoader, AliESD* esd) const
-{
-  // This function creates AliESDtracks from AliPHOSRecParticles
-  //         and
-  // writes them to the ESD
+  TBranch *branch = digitsTree->GetBranch("PHOS");
+  if (!branch) { 
+    AliError("can't get the branch with the PHOS digits !");
+    return;
+  }
+  branch->SetAddress(&fgDigitsArray);
+  branch->GetEntry(0);
+
+  // Get the clusters array
+
+  TBranch *emcbranch = clustersTree->GetBranch("PHOSEmcRP");
+  if (!emcbranch) { 
+    AliError("can't get the branch with the PHOS EMC clusters !");
+    return;
+  }
+
+  emcbranch->SetAddress(&fgEMCRecPoints);
+  emcbranch->GetEntry(0);
+
+  //#########Calculate trigger and set trigger info###########
+
+  AliPHOSTrigger tr ;
+  //   tr.SetPatchSize(1);//create 4x4 patches
+  tr.SetSimulation(kFALSE);
+  tr.Trigger(fgDigitsArray);
+  
+  Float_t maxAmp2x2  = tr.Get2x2MaxAmplitude();
+  Float_t maxAmpnxn  = tr.GetnxnMaxAmplitude();
+  Float_t ampOutOfPatch2x2  = tr.Get2x2AmpOutOfPatch() ;
+  Float_t ampOutOfPatchnxn  = tr.GetnxnAmpOutOfPatch() ;
+
+  Int_t iSM2x2      = tr.Get2x2SuperModule();
+  Int_t iSMnxn      = tr.GetnxnSuperModule();
+  Int_t iCrystalPhi2x2 = tr.Get2x2CrystalPhi();
+  Int_t iCrystalPhinxn = tr.GetnxnCrystalPhi();
+  Int_t iCrystalEta2x2 = tr.Get2x2CrystalEta();
+  Int_t iCrystalEtanxn = tr.GetnxnCrystalEta();
+
+  AliDebug(2, Form("Trigger 2x2 max amp %f, out amp %f, SM %d, iphi %d ieta %d",  
+                  maxAmp2x2, ampOutOfPatch2x2, iSM2x2,iCrystalPhi2x2, iCrystalEta2x2));
+  AliDebug(2, Form("Trigger 4x4 max amp %f , out amp %f, SM %d, iphi %d, ieta %d",
+                  maxAmpnxn, ampOutOfPatchnxn, iSMnxn,iCrystalPhinxn, iCrystalEtanxn));
+
+  // Attention! PHOS modules in order to calculate AbsId need to be 1-5 not 0-4 as returns trigger.
+  Int_t iRelId2x2 []= {iSM2x2+1,0,iCrystalPhi2x2,iCrystalEta2x2};
+  Int_t iAbsId2x2 =-1;
+  Int_t iRelIdnxn []= {iSMnxn+1,0,iCrystalPhinxn,iCrystalEtanxn};
+  Int_t iAbsIdnxn =-1;
+  TVector3    pos2x2(-1,-1,-1);
+  TVector3    posnxn(-1,-1,-1);
+  fGeom->RelToAbsNumbering(iRelId2x2, iAbsId2x2);
+  fGeom->RelToAbsNumbering(iRelIdnxn, iAbsIdnxn);
+  fGeom->RelPosInAlice(iAbsId2x2, pos2x2);
+  fGeom->RelPosInAlice(iAbsIdnxn, posnxn);
+
+  TArrayF triggerPosition(6);
+  triggerPosition[0] = pos2x2(0) ;   
+  triggerPosition[1] = pos2x2(1) ;   
+  triggerPosition[2] = pos2x2(2) ;  
+  triggerPosition[3] = posnxn(0) ;   
+  triggerPosition[4] = posnxn(1) ;   
+  triggerPosition[5] = posnxn(2) ;  
+
+  TArrayF triggerAmplitudes(4);
+  triggerAmplitudes[0] = maxAmp2x2 ;   
+  triggerAmplitudes[1] = ampOutOfPatch2x2 ;    
+  triggerAmplitudes[2] = maxAmpnxn ;   
+  triggerAmplitudes[3] = ampOutOfPatchnxn ;   
 
-  Int_t eventNumber = runLoader->GetEventNumber() ;
+  //esd->SetPHOSTriggerCells(triggerPosition);
+  esd->AddPHOSTriggerPosition(triggerPosition);
+  esd->AddPHOSTriggerAmplitudes(triggerAmplitudes);
+  
+
+  //########################################
+  //############# Fill CaloCells ###########
+  //########################################
+
+  Int_t nDigits = fgDigitsArray->GetEntries();
+  Int_t idignew = 0 ;
+  AliDebug(1,Form("%d digits",nDigits));
 
-  AliPHOSGetter::Instance()->Event(eventNumber, "P") ; 
-  TClonesArray *recParticles = AliPHOSGetter::Instance()->RecParticles();
-  Int_t nOfRecParticles = recParticles->GetEntries();
-  esd->SetNumberOfPHOSParticles(nOfRecParticles) ; 
-  esd->SetFirstPHOSParticle(esd->GetNumberOfTracks()) ; 
+  const Int_t knEMC = fGeom->GetNModules()*fGeom->GetNPhi()*fGeom->GetNZ();
+  AliESDCaloCells &phsCells = *(esd->GetPHOSCells());
+  phsCells.CreateContainer(nDigits);
+  phsCells.SetType(AliESDCaloCells::kPHOSCell);
+
+  // Add to CaloCells only EMC digits with non-zero energy 
+  for (Int_t idig = 0 ; idig < nDigits ; idig++) {
+    const AliPHOSDigit * dig = (const AliPHOSDigit*)fgDigitsArray->At(idig);
+    if(dig->GetId() <= knEMC && dig->GetEnergy() > 0 ){
+      //printf("i %d; id %d; amp %f; time %e\n",
+      //idignew,dig->GetId(),dig->GetEnergy(), dig->GetTime());
+      phsCells.SetCell(idignew,dig->GetId(), dig->GetEnergy(), dig->GetTime());   
+      idignew++;
+    }
+  }
+  phsCells.SetNumberOfCells(idignew);
+  phsCells.Sort();
+
+  //########################################
+  //############## Fill CaloClusters #######
+  //########################################
 
   for (Int_t recpart = 0 ; recpart < nOfRecParticles ; recpart++) {
-    AliPHOSRecParticle * rp = dynamic_cast<AliPHOSRecParticle*>(recParticles->At(recpart));
+    AliPHOSRecParticle  *rp    = dynamic_cast<AliPHOSRecParticle*>(recParticles->At(recpart));
     if (Debug()) 
       rp->Print();
-    AliESDtrack * et = new AliESDtrack() ; 
-    // fills the ESDtrack
-    Double_t xyz[3];
+    // Get track segment and EMC rec.point associated with this rec.particle
+    AliPHOSTrackSegment *ts    = static_cast<AliPHOSTrackSegment *>(fTSM->GetTrackSegments()
+                                                                   ->At(rp->GetPHOSTSIndex()));
+
+    AliPHOSEmcRecPoint  *emcRP = static_cast<AliPHOSEmcRecPoint *>(fgEMCRecPoints->At(ts->GetEmcIndex()));
+    AliESDCaloCluster   *ec    = new AliESDCaloCluster() ; 
+    
+    Float_t xyz[3];
     for (Int_t ixyz=0; ixyz<3; ixyz++) 
       xyz[ixyz] = rp->GetPos()[ixyz];
-    et->SetPHOSposition(xyz) ; 
-    et->SetPHOSsignal  (rp->Energy()) ; 
-    et->SetPHOSpid     (rp->GetPID()) ;
+    
+    AliDebug(2,Form("Global position xyz=(%f,%f,%f)",xyz[0],xyz[1],xyz[2]));
+   
+    // Create cell lists
+
+    Int_t     cellMult   = emcRP->GetDigitsMultiplicity();
+    Int_t    *digitsList = emcRP->GetDigitsList();
+    Float_t  *rpElist    = emcRP->GetEnergiesList() ;
+    UShort_t *absIdList  = new UShort_t[cellMult];
+    Double_t *fracList   = new Double_t[cellMult];
+
+    for (Int_t iCell=0; iCell<cellMult; iCell++) {
+      AliPHOSDigit *digit = static_cast<AliPHOSDigit *>(fgDigitsArray->At(digitsList[iCell]));
+      absIdList[iCell] = (UShort_t)(digit->GetId());
+      if (digit->GetEnergy() > 0)
+       fracList[iCell] = rpElist[iCell]/digit->GetEnergy();
+      else
+       fracList[iCell] = 0;
+    }
+
+    //Primaries
+    Int_t  primMult  = 0;
+    Int_t *primList =  emcRP->GetPrimaries(primMult);
+
+    Float_t energy;
+    if (fgkRecoParamEmc->Ecore2ESD())
+      energy = emcRP->GetCoreEnergy();
+    else
+      energy = rp->Energy();
+
+    // fills the ESDCaloCluster
+    ec->SetClusterType(AliESDCaloCluster::kPHOSCluster);
+    ec->SetPosition(xyz);                       //rec.point position in MARS
+    ec->SetE(energy);                           //total or core particle energy
+    ec->SetClusterDisp(emcRP->GetDispersion()); //cluster dispersion
+    ec->SetPid(rp->GetPID()) ;                  //array of particle identification
+    ec->SetM02(emcRP->GetM2x()) ;               //second moment M2x
+    ec->SetM20(emcRP->GetM2z()) ;               //second moment M2z
+    ec->SetNExMax(emcRP->GetNExMax());          //number of local maxima
+    ec->SetEmcCpvDistance(ts->GetCpvDistance("r")); //Only radius, what about separate x,z????
+    ec->SetClusterChi2(-1);                     //not yet implemented
+    ec->SetTOF(emcRP->GetTime()); //Time of flight
+
+    //Cells contributing to clusters
+    ec->SetNCells(cellMult);
+    ec->SetCellsAbsId(absIdList);
+    ec->SetCellsAmplitudeFraction(fracList);
+
+    //Distance to the nearest bad crystal
+    ec->SetDistanceToBadChannel(emcRP->GetDistanceToBadCrystal()); 
+  
+    //Array of MC indeces
+    TArrayI arrayPrim(primMult,primList);
+    ec->AddLabels(arrayPrim);
+
+    //Array of tracks uncomment when available in future
+    //TArrayS arrayTrackMatched(1);// Only one track, temporal solution.
+    //arrayTrackMatched[0]= (Short_t)(matchedTrack[iClust]);
+    //ec->AddTracksMatched(arrayTrackMatched);
+    
     // add the track to the esd object
-    esd->AddTrack(et);
-    delete et;
+
+    esd->AddCaloCluster(ec);
+    delete ec;   
+    delete [] fracList;
+    delete [] absIdList;
   }
+  fgDigitsArray ->Delete();
+  fgEMCRecPoints->Delete();
+  recParticles  ->Delete();
 }
 
-AliTracker* AliPHOSReconstructor::CreateTracker(AliRunLoader* runLoader) const
+//____________________________________________________________________________
+AliTracker* AliPHOSReconstructor::CreateTracker() const
 {
-// creates the PHOS tracker
-  if (!runLoader) return NULL; 
-  return new AliPHOSTracker(runLoader);
+  // creates the PHOS tracker
+  return new AliPHOSTracker();
 }
 
+//____________________________________________________________________________
+void  AliPHOSReconstructor::ConvertDigits(AliRawReader* rawReader, TTree* digitsTree) const
+{
+  // Converts raw data to
+  // PHOS digits
+  // Works on a single-event basis
+
+  rawReader->Reset() ; 
+
+  AliPHOSRawDecoder * dc ;
+
+  const TObjArray* maps = AliPHOSRecoParamEmc::GetMappings();
+  if(!maps) AliFatal("Cannot retrieve ALTRO mappings!!");
+
+  AliAltroMapping *mapping[4];
+  for(Int_t i = 0; i < 4; i++) {
+    mapping[i] = (AliAltroMapping*)maps->At(i);
+  }
+
+  if(strcmp(fgkRecoParamEmc->DecoderVersion(),"v1")==0) 
+    dc=new AliPHOSRawDecoderv1(rawReader,mapping);
+  else 
+    if(strcmp(fgkRecoParamEmc->DecoderVersion(),"v2")==0) 
+      dc=new AliPHOSRawDecoderv2(rawReader,mapping);
+    else
+      dc=new AliPHOSRawDecoder(rawReader,mapping);
+
+  dc->SubtractPedestals(fgkRecoParamEmc->SubtractPedestals());
+  
+  TClonesArray *digits = new TClonesArray("AliPHOSDigit",1);
+  digits->SetName("DIGITS");
+  Int_t bufsize = 32000;
+  digitsTree->Branch("PHOS", &digits, bufsize);
+
+  AliPHOSRawDigiProducer pr(fgkRecoParamEmc,fgkRecoParamCpv);
+  pr.MakeDigits(digits,dc);
+
+  delete dc ;
+
+  //!!!!for debug!!!
+/*
+  Int_t modMax=-111;
+  Int_t colMax=-111;
+  Int_t rowMax=-111;
+  Float_t eMax=-333;
+  //!!!for debug!!!
+
+  Int_t relId[4];
+  for(Int_t iDigit=0; iDigit<digits->GetEntries(); iDigit++) {
+    AliPHOSDigit* digit = (AliPHOSDigit*)digits->At(iDigit);
+    if(digit->GetEnergy()>eMax) {
+      fGeom->AbsToRelNumbering(digit->GetId(),relId);
+      eMax=digit->GetEnergy();
+      modMax=relId[0];
+      rowMax=relId[2];
+      colMax=relId[3];
+    }
+  }
+
+  AliDebug(1,Form("Digit with max. energy:  modMax %d colMax %d rowMax %d  eMax %f\n\n",
+                 modMax,colMax,rowMax,eMax));
+*/
+  digitsTree->Fill();
+  digits->Delete();
+  delete digits;
+}